JPWO2018190378A1 - ステビア由来ラムノース合成酵素及び遺伝子 - Google Patents
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Abstract
Description
ここで、用語「SrRHM1タンパク質」とは、3種の変異体SrRHM1#1、SrRHM1#2及びSrRHM1#3の各タンパク質を包括するものであり、用語「SrRHM2タンパク質」とは2種の変異体SrRHM2#1及びSrRHM2#2の各タンパク質を包括するものである。
ポリヌクレオチド及び酵素は、後述の実施例に記載した手法、公知の遺伝子工学的手法、公知の合成手法等によって取得することが可能である。
本発明は、以下の(a)〜(c)よりなる群より選ばれるいずれかに記載のタンパク質(以下、「本発明のタンパク質」という)を提供する。
(a)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質。
前記ラムノース生成反応は、一般に、1分〜12時間程度で終了する。
本発明のタンパク質が有する、グルコースからラムノースを生成する活性を利用することにより、ラムノースを容易かつ多量に製造することが可能である。
(a)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質。
ラムノースは、本発明のタンパク質を用いて細菌(大腸菌又は酵母など)、植物、微生物、昆虫、ヒトを除く哺乳動物などの細胞内で生成することもできる。本発明のタンパク質は、ステビアに由来する酵素又はその変異体であるため、細胞内環境においても高い活性を有することが期待されるからである。この場合、本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチド(後述する「本発明のポリヌクレオチド」を参照)と発現カセットとを含むベクターを、細菌、微生物、植物、昆虫、ヒトを除く哺乳動物などに由来する宿主細胞に導入して本発明のタンパク質を発現させ、本発明のタンパク質と、前記細胞内に存在するグルコース又はUDP-グルコースとを反応させることによりラムノース又はUDP-ラムノースを生成することができる。
(a)配列番号1、3、5、7又は9の塩基配列を含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
適切な発現ベクターは、通常、
(i)宿主細胞内で転写可能なプロモーター;
(ii)該プロモーターに結合した、本発明のポリヌクレオチド;及び
(iii)RNA分子の転写終結及びポリアデニル化に関し、宿主細胞内で機能するシグナルを構成要素として含む発現カセット
を含むように構成される。
発現ベクターの作製方法としては、プラスミド、ファージ又はコスミドなどを用いる方法が挙げられるが特に限定されない。
本発明はまた、別の実施形態において、上記の形質転換体の抽出物を提供する。本発明の形質転換体は、適切な基質を有する場合、もしくは、適切な基質を外部から添加した場合、その野生型と比べてラムノースの含有量が高いので、その抽出物には、ラムノース又はラムノース基を有するステビオール配糖体が高濃度で含まれると考えられる。
本発明の他の態様によれば、本発明のタンパク質とグルコースとを反応させてラムノースを得る工程と、ラムノースをステビオール又はステビオール配糖体に転移する工程と、
を含む、ステビオール配糖体の製造方法を提供する。具体的には、本発明のステビオール配糖体の製造方法は、以下の(a)〜(c)よりなる群より選ばれるいずれかに記載のタンパク質と、グルコースとを反応させてラムノースを得る工程と:
(a)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質
ラムノースをステビオール又はステビオール配糖体に転移する工程と、
を含む、ステビオール配糖体の製造方法である。
(a)(i)配列番号15の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号16のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の13位の水酸基にグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(b)(i)配列番号17の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号18のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の19位のカルボン酸にグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(c)(i)配列番号19の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号20のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の13位のグルコースの3位に1→3結合でグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(d)(i)配列番号11若しくは13の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号12若しくは14のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の19位のグルコースに、1→2結合でグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(e)(i)配列番号19の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号20のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の19位のグルコースに、1→3結合でグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
本発明は、ラムノース基を有するステビオール配糖体含有量に応じて植物体をスクリーニングする方法(以下、「本発明のスクリーニング方法」という)を提供する。ここで、「スクリーニング」とは、ラムノース基を有するステビオール配糖体含有量が所定量以上(もしくは以下)の植物体とそれ以外の植物体とを識別し、ラムノース基を有するステビオール配糖体含有量の高い(もしくは低い)植物体を選択することを意味する。具体的には、本発明のスクリーニング方法は、ラムノース基を有するステビオール配糖体含有量の高い植物体、ラムノース基を有するステビオール配糖体含有量の低い植物体、又はラムノース基を有するステビオール配糖体を含まない植物体をスクリーニングする方法である。したがって、本発明のスクリーニング法を用いることで、ラムノース基を有さず、グルコース基のみを含むステビオール配糖体の含有量の高い植物を選択することもできる。
被検植物体から、以下の(a)〜(d)よりなる群より選ばれるポリヌクレオチドを定量する工程、及び前記ポリヌクレオチド量を基準値と比較してポリヌクレオチド量に応じて被験植物体を選別する工程を含む方法である。
(a)配列番号1、3、5、7又は9の塩基配列を含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
被検植物体から、以下の(a’)〜(d’)よりなる群より選ばれるポリヌクレオチドを定量する工程、及び前記ポリヌクレオチド量を基準値と比較してポリヌクレオチド量に応じて被験植物体を選別する工程を含む方法が提供される。
(a’)配列番号7又は9の塩基配列を含有するポリヌクレオチド;
(b’)配列番号8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c’)配列番号8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d’)配列番号8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
前記ポリヌクレオチド量を基準値と比較してポリヌクレオチド量に応じて被験植物体を選別する第2の工程において、「基準値」は当業者であれば適宜設定することができる。例えば、基準値とは任意のステビア植物体の一部(葉、茎、根等)に含まれる当該ポリヌクレオチドの量と定め、選別においては被験植物体の対応する部分(葉、茎、根等)に含まれる当該ポリヌクレオチドの量が前記基準値よりも多い(少ない)場合に、当該被験植物体をラムノース基を有するステビオール配糖体含有量が高い(低い)植物体として選別することができる。
あるいは、基準値とは変動的であってもよい。例えば、複数の被験植物体を比較し、そのうち1番からn番目(nは1以上の整数)に当該ポリヌクレオチド量が多かった(少なかった)被験植物体をラムノース基を有するステビオール配糖体含有量が高い(低い)植物体として選別することが可能であり、この場合は、n+1番目に当該ポリヌクレオチド量が多かった被験植物体の当該ポリヌクレオチド量が基準値となる。
本実施例において用いる分子生物学的手法は、他で詳述しない限り、Molecular Cloning(Sambrookら, Cold Spring Harbour Laboratory Press, 2001)に記載の方法に従った。
SrRHM1-pET-FW (配列番号22)
TGCCGCGCGGCAGCCATATGGCTACTTACGTGCCAAAG
SrRHM1-pET-RV (配列番号23)
GTTAGCAGCCGGATCCTTAATGTTTTTTGTTAGGTTCGAATACG
SrRHM2Full-Fw (配列番号24)
TGCCGCGCGGCAGCCATATGACCAGTTATACACCTAAAAAC
SrRHM2Full-Rv (配列番号25)
GTTAGCAGCCGGATCCTTAGGTTGTCTTGTTGGGTGCAAATAC
ステビア葉cDNAについてはステビア葉からRNeasy Plant Miniキット(QIAGEN)を用いて総RNAを抽出し、そのうち0.5μgをRandom Oligo-dTプライマーで逆転写(RT)反応することによって得た。
本発明の酵素の生化学的な機能を明らかにするために、本発明の酵素を大腸菌において発現させた。上記で得られた3種のSrRHM1遺伝子及び2種のSrRHM2の大腸菌発現用プラスミドを用い定法に従って大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。得られた形質転換体を、50μg/mlのアンピシリンを含むLB培地(10 g/l typtone pepton,5 g/l yeast extract,1 g/l NaCl)4 mlにて、37℃で一晩振盪培養した。静止期に達した培養液4 mlを同組成の培地80 mlに接種し、37℃で振盪培養した。菌体濁度(OD600)がおよそ0.5に達した時点で終濃度0.5 mMのIPTGを添加し、18℃で20 hr振盪培養した。
標準的な酵素反応条件は以下の通りである。反応液(100 mM リン酸カリウムバッファー(pH 7.5)、5mM UDP-グルコース(基質)、2mM NADPH、5mM DTT、2mM EDTA、精製酵素溶液60μl)を蒸留水で100μlに調製し、30℃、24時間反応させた。酵素反応液5μlを下記の条件でLC-MS分析を行った。
LC condition
カラム : 東ソー TSKgel Amide-80 3μm (2.0 x 150 mm)
移動相:A: 10mM 酢酸アンモニウム水溶液,B: アセトニトリル
グラジエント:0 - 0.2 min (B conc 95% 一定),
0.2 - 14.0 min (B conc 95% → 30%),
14.0 - 14.2 min (B conc 30% → 95%)
20.0 min分析終了
流速:0.2 mL/min
カラムオーブン:40℃
MS condition
ESI (negative mode)
MRM測定(CE 25): m/z 565.1 → 323.0 (UDP-Glucose)
m/z 549.1 → 323.0 (UDP-Rhamnose)
次に、組換えSrRHM1#1、SrRHM1#2、及びSrRHM1#3タンパク質をそれぞれUDP-グルコースと反応させたところ、いずれの反応区においても顕著な UDP-ラムノースの合成が確認された(図4−3、4−4、及び4−5)。
同様にSrRHM2についても活性評価を行った。SrRHM2#1, SrRHM2#2タンパク質をそれぞれUDP-グルコースと反応させたところ、いずれの反応区においても顕著な UDP-ラムノースの合成が確認された(図4−6,4−7)。
次に、これらの組換えタンパク質の比活性を評価した。反応後の残存UDP-グルコース量と反応により生成したUDP-ラムノース量の合計を1と基準化した。その結果、本発明の組換えタンパク質(SrRHM1#1、SrRHM1#2、及びSrRHM1#3タンパク質並びにSrRHM2#1及びSrRHM2#2タンパク質)は、シロイヌナズナのAtRHM2の組換えタンパク質よりも高いラムノース生成活性を有することが確認された。また、SrRHM2系の方がSrRHM1系よりもラムノース生成量が高い傾向があること確認できた(図5)。
今回活性の見られた二つのSrRHM遺伝子の発現について、RebCを含有する独立したステビア植物体(1,2)およびRebCが検出されないステビア植物体(3,4)の葉において発現の有無をRT-PCR法によって解析した。
SrRHM1については配列番号22および23、SrRHM2については配列番号24、25のプライマーセットにより実施例1と同じ条件で、32サイクル増幅した。内部標準遺伝子としてステビアのアクチン遺伝子(SrACTIN)を用い、配列番号26および27のプライマーセットにより増幅した(23サイクル)。
SrRHM1-pET-FW (配列番号22)
TGCCGCGCGGCAGCCATATGGCTACTTACGTGCCAAAG
SrRHM1-pET-RV (配列番号23)
GTTAGCAGCCGGATCCTTAATGTTTTTTGTTAGGTTCGAATACG
SrRHM2Full-Fw (配列番号24)
TGCCGCGCGGCAGCCATATGACCAGTTATACACCTAAAAAC
SrRHM2Full-Rv (配列番号25)
GTTAGCAGCCGGATCCTTAGGTTGTCTTGTTGGGTGCAAATAC
SrACTIN-Fw (配列番号26)
ATGGCCGATACTGAGGATATTCAG
SrACTIN-Rv (配列番号27)
AGCACTTCCTGTGGACAATGGA
その結果、RebCが検出されないステビア植物体(3,4)において特異的にSrRHM2の遺伝子発現が減少していることが確認された(図6)。したがって、ステビア葉においてステビオール配糖体のラムノース転移に利用されているUDP-ラムノースは主にSrRHM2によって供給されていることが示された。
次に得られたSrRHM1およびSrRHM2を使って、酵母にてUDP‐ラムノースの合成ができるかを検討した。
UDP-ラムノース合成酵素遺伝子を酵母発現ベクターに組み込むために下記のプライマーセットを設計した。
StRHM1セット
Apa-SrRHM1-F(下線部ApaI認識部位):
5’- GGGCCCATGGCTACTTACGTGCCAAAG -3’ (配列番号28)
Xho- SrRHM1-R(下線部XhoI認識部位):
5’- CTCGAGTTAATGTTTTTTGTTAGGTTCGAATACG-3’ (配列番号29)
StRHM2セット
Bam-SrRHM2-F(下線部ApaI認識部位):
5’- GGATCCATGACCAGTTATACACCTAAAAACATCC -3’ (配列番号30)
Xho- SrRHM2-R(下線部XhoI認識部位):
5’- CTCGAGTTAGGTTGTCTTGTTGGGTGC -3’ (配列番号31)
・ プラスミドpESC-TRP-SrRHM1の構築
SrRHM1を制限酵素ApaIとXhoIで切り出し、ベクターpESC-TRP(ストラタジーン)を制限酵素ApaIと制限酵素XhoIで切断したものと連結して、プラスミドpESC-TRP-SrRHM1を得た。
・ プラスミドpESC-TRP-SrRHM2の構築
SrRHM2を制限酵素BamHIとXhoIで切り出し、ベクターpESC-TRP(ストラタジーン)を制限酵素BamHIと制限酵素XhoIで切断したものと連結して、プラスミドpESC-TRP-SrRHM2を得た。
Saccharomyces cerevisiae YPH499株(ura3-52 lys2-801amber ade2-101ochre trp1-Δ63 his3-Δ200 leu2-Δ1 a)を宿主として、酢酸リチウム法で、プラスミドpESC-TRP-SrRHM1、pESC-TRP-SrRHM2、により形質転換した。形質転換株として、SC-Trp寒天培地(1Lあたり、Yeast nitrogen baase without amino acids 6.7g、グルコース 20g、アミノ酸ミックスパウダー-Trp 1.3g、Bacto agar 20g)で生育するものを選抜した。なお、アミノ酸ミックスパウダー-Trpは、アデニン硫酸塩 2.5g、L-アルギニン塩酸塩 1.2g、L-アスパラギン酸 6.0g、L-グルタミン酸 6.0g、L-ヒスチジン 1.2g、L-ロイシン3.6g、L-リジン 1.8g、L-メチオニン 1.2g、L-フェニルアラニン 3.0g、L-セリン 22.5g、L-スレオニン12g、L-チロシン 1.8g、L-バリン 9.0g、ウラシル1.2gを混ぜて調製した。一方、ベクターpESC-TRPにより、上記と同様の方法で形質転換した株をコントロール株(C-1株)とした。
得られた形質転換株を以下の通り培養した。
まず、前培養としてSC-Trp液体培地(SC- Trp寒天培地のBacto agarを除く)10 mlに、それぞれの形質転換株を植菌し、30℃で1日間振とう培養した。次に、本培養として前培養液のうち、1 mlを10 mlのSG-Trp液体培地(1Lあたり、Yeast nitrogen baase without amino acids 6.7g、ガラクトース 20g、アミノ酸ミックスパウダー-Trp 1.3g)に植菌し、30℃で2日間振とう培養した。
トータルRNA 1μgをとり、スーパースクリプトII逆転写酵素(サーモフィッシャーサイエンティフィック)、ランダムヘキサマーをプライマーとして、cDNAを合成した。
SrRHM1発現確認用
SrRHM1-r1
5’- CGAGTTAGGTATTTGGACACCA-3’ (配列番号32)
SrRHM2発現確認用
SrRHM2-r1
5’- TACCGGGTCCTGAAAGATGAC-3’ (配列番号33)
GAL10p領域 (プロモーター領域)
PGAL10-f3:
5’-GATTATTAAACTTCTTTGCGTCCATCCA-3’ (配列番号34)
SrRHM1:SrRHM1-r1(配列番号32)とPGAL10-f3(配列番号34)
SrRHM2:SrRHM2-r1(配列番号33)とPGAL10-f3(配列番号34)
導入した遺伝子が発現していることが確認できた株をそれぞれSR1-1株、SR2-1株とした。
上記の発現解析についての操作と同様に培養して得られた10ml培養液より、遠心分離により回収した酵母菌体に、氷冷した1Mぎ酸(1−ブタノール飽和)を15ml添加し、4℃で1時間緩やかに撹拌した。遠心分離により菌体を除いた上清を凍結乾燥した。得られた凍結乾燥物を200μlの水に溶解し、HPLCに供した。
カラム:COSMOSIL(R) 5C18−ARII(4.6mml.D x 250mm)
カラム温度:40℃
移動相:20mM トリエチルアミンアセテート(pH7.0)、流速:1ml/min
検出:UV260
その結果、C-1株では、UDP-ラムノースの生成が確認できなかったのに対し、SR1-1株、SR2-1株ともに、UDP-ラムノースの生成が確認できた。
ステビア由来配糖化酵素遺伝子cDNAのクローニング
cDNAのクローニングには、それぞれ下記のプライマーセットを用いた。
UGT85C2遺伝子増幅用プライマーセット
CACC-NdeI-SrUGT85C2-Fw(下線部NdeI認識部位):
5’-CACCCATATGGATGCAATGGCTACAACTGAGAA-3’(配列番号35)
BglII-SrUGT85C2-Rv(下線部BglII認識部位):
5’-AGATCTCTAGTTTCTTGCTAGCACGGTGATTT-3’(配列番号36)
UGT91D2及びUGT91D2#16遺伝子増幅用プライマーセット
SrUGT91D2-pET15b-FW
5’-TGCCGCGCGGCAGCCATATGTACAACGTTACTTATCATC-3’(配列番号37)
SrUGT91D2-pET15b-RV
5’-GTTAGCAGCCGGATCCTTAACTCTCATGATCGATGGCAA-3’(配列番号38)
UGT74G1遺伝子増幅用プライマーセット
CACC-NdeI-SrUGT74G1-Fw(下線部NdeI認識部位):
5’-CACCCATATGGCGGAACAACAAAAGATCAAGAAAT-3’ (配列番号39)
BamHI-SrUGT74G1-Rv(下線部BamHI認識部位):
5’-GGATCCTTAAGCCTTAATTAGCTCACTTACAAATT-3’ (配列番号40)
UGT76G1遺伝子増幅用プライマーセット
CACC-NdeI-SrUGT76G1-Fw(下線部NdeI認識部位):
5’-CACCCATATGGAAAATAAAACGGAGACCA-3’ (配列番号41)
BamHI-SrUGT76G1-Rv(下線部BamHI認識部位):
5’-GGATCCTTACAACGATGAAATGTAAGAAACTA-3’ (配列番号42)
これらのUGT遺伝子およびUDP-ラムノース合成酵素遺伝子を酵母発現ベクターに組み込むために下記のプライマーセットを設計した。
SrUGT85C2セット
Bgl2-UGT85C2-F(下線部BglII認識部位):
5’-ACAGATCTATGGATGCAATGGCTACAACTGAGA-3’ (配列番号43)
Sal-UGT85C2-R(下線部SalI認識部位):
5’-TAGTCGACTAGTTTCTTGCTAGCACGGTGATTTC-3’ (配列番号44)
SrUGT91D2セット
NotI-UGT91DIL3-F(下線部NotI認識部位):
5’-AAGCGGCCGCATGTACAACGTTACTTATCATCAAAATTCAAA-3’ (配列番号45)
Pac-UGT91D1L3-R(下線部PacI認識部位):
5’-CGTTAATTAACTCTCATGATCGATGGCAACC-3’ (配列番号46)
SrUGT74G1セット
Not-UGT74G1-F(下線部NotI認識部位):
5’-AAGCGGCCGCATGGCGGAACAACAAAAGATCAAG-3’ (配列番号47)
Pac-UGT74G1-R(下線部PacI認識部位):
5’-CGTTAATTAAGCCTTAATTAGCTCACTTACAAATTCG-3’ (配列番号48)
SrUGT76G1セット
Bam-UGT76G1-F(下線部BamHI認識部位):
5’-AAGGATCCATGGAAAATAAAACGGAGACCACCG-3’ (配列番号49)
Sal-UGT76G1-R(下線部SalI認識部位):
5’-GCGTCGACTTACAACGATGAAATGTAAGAAACTAGAGACTCTAA-3’ (配列番号50)
(1)プラスミドpESC-URA-UGT56又はpESC-URA-UGT56Rの構築
UGT85C2を制限酵素BglIIと制限酵素SalIで切り出し、ベクターpESC-URA(ストラタジーン)を制限酵素BamHIと制限酵素SalIで切断したものと連結して、プラスミドpESC-URA-UGT-1を得た。このプラスミドpESC-URA-UGT-1を制限酵素NotIと制限酵素PacIで切断したものと、UGT91D2又はUGT91D2L#16を制限酵素NotIと制限酵素PacIで切り出したものを連結し、pESC-URA-UGT56又はpESC-URA-UGT56Rを得た。
(2)プラスミドpESC-HIS-UGT78の構築
UGT76G1を制限酵素BamHIと制限酵素SalIで切り出し、ベクターpESC-HIS(ストラタジーン)を同じ制限酵素で切断したものを連結し、プラスミドpESC-HIS-UGT-8を得た。このプラスミドpESC-HIS-UGT-8を制限酵素NotIと制限酵素PacIで切断したものと、UGT74G1をNotIとPacIで切り出したものを連結し、pESC-HIS-UGT78を得た。
Saccharomyces cerevisiae YPH499株(ura3-52 lys2-801amber ade2-101ochre trp1-Δ63 his3-Δ200 leu2-Δ1 a)を宿主として、酢酸リチウム法で、表1のプラスミドを導入した。形質転換株として、SC-Trp&Ura&His寒天培地(1Lあたり、Yeast nitrogen baase without amino acids 6.7g、グルコース 20g、アミノ酸ミックスパウダー-Trp&Ura&His 1.3g、Bacto agar 20g)で生育するものを選抜した。
得られた形質転換株を以下の通り培養した。
まず、前培養としてSC-Trp&Ura&His液体培地(SC- Trp&Ura&His寒天培地のBacto agarを除く)10 mlに、それぞれの形質転換株を植菌し、30℃で1日間振とう培養した。次に、本培養として前培養液のうち、1 mlを10 mlのSG-Trp&Ura&His液体培地(1Lあたり、Yeast nitrogen baase without amino acids 6.7g、ガラクトース 20g、アミノ酸ミックスパウダー-Trp&Ura&His 1.3g)に植菌し、30℃で2日間振とう培養した。
形質転換株で導入した遺伝子が発現したかどうかを確認するため、培養液から菌体を集め、RNeasy Mini Kitを用いて、トータルRNAを精製した。
トータルRNA 1μgをとり、スーパースクリプトII逆転写酵素(サーモフィッシャーサイエンティフィック)、ランダムヘキサマーをプライマーとして、cDNAを合成した。
UGT85C2発現確認用
UGT85C2-r1:
5’-CAAGTCCCCAACCAAATTCCGT-3’ (配列番号51)
UGT91D2およびUGT91D2L3#16発現確認用
UGT91D1L3-r1:
5’-CACGAACCCGTCTGGCAACTC-3’ (配列番号52)
UGT74G1発現確認用
UGT74G1-r1:
5’-CCCGTGTGATTTCTTCCACTTGTTC-3’ (配列番号53)
UGT76G1発現確認用
UGT76G1-r1:
5’-CAAGAACCCATCTGGCAACGG-3’ (配列番号54)
GAL10p領域 (プロモーター領域)
PGAL10-f3:
5’-GATTATTAAACTTCTTTGCGTCCATCCA-3’ (配列番号55)
GAL1p領域(プロモーター領域)
PGAL1-f3:
5’-CCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACC-3’ (配列番号56)
UGT85C2:UGT85C2-r1(配列番号51)とPGAL1-f3(配列番号56)
UGT91D2又はUGT91D2L3:UGT91D1L3-r1(配列番号52)とPGAL10-f3(配列番号55)
UGT74G1:UGT74G1-r1(配列番号53)とPGAL1-f3(配列番号56)
UGT76G1:UGT76G1-r1(配列番号54)とPGAL10-f3(配列番号55)
これにより、形質転換株で、導入した遺伝子が発現していることが確認できた。
培養は、SG-Trp&Ura&His液体培地に培地1 mlあたり2μgのステビオール(ChromaDex Inc.)を添加した以外は、上記実施例5と同様の条件で行った。培養終了後、培養液を遠心分離により、上清と菌体に分離した。培養上清を、アセトニトリルで洗浄後、水で平衡化したSep-Pak C18カラムに供し、20% アセトニトリルで洗浄後、80%アセトニトリルで溶出し、乾固後、少量の80% アセトニトリルに溶解して配糖体サンプルを調製した。この配糖体サンプルを以下の分析に供した。
得られたステビオール配糖体をHPLCによって分析した。条件は以下のとおりである。
カラム:コスモシール5C18−AR−II 4.6mmI.D.x250mm(ナカライテスク)
移動相:A;アセトニトリル、B;10mM リン酸ナトリウムバッファー(pH2.6)
B conc.70%→30% 40分 linear gradient
流速:1ml/分
温度:40℃
検出:UV 210nm
Claims (22)
- 以下の(a)〜(c)よりなる群より選ばれるいずれかに記載のタンパク質:
(a)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質。 - 前記グルコースがウリジン二リン酸グルコースの形態にある、請求項1に記載のタンパク質。
- 前記ラムノースがウリジン二リン酸ラムノースの形態にある、請求項1又は2に記載のタンパク質。
- 以下の(a)〜(d)よりなる群より選ばれるポリヌクレオチド。
(a)配列番号1、3、5、7又は9の塩基配列を含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。 - 前記グルコースがウリジン二リン酸グルコースの形態にある、請求項4に記載のポリヌクレオチド。
- 前記ラムノースがウリジン二リン酸ラムノースの形態にある、請求項4又は5に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項4〜6のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドと発現カセットとを含むベクター。
- 請求項7に記載のベクターが細胞内に導入された形質転換体。
- 前記細胞が細菌、微生物又は植物の細胞である、請求項8に記載の形質転換体。
- 請求項8又は9に記載の形質転換体の抽出物。
- 請求項10に記載の抽出物を含む、甘味料、飲食品又は医薬品。
- 以下の(a)〜(c)よりなる群より選ばれるいずれかに記載のタンパク質と、グルコースとを反応させる工程を含む、ラムノースの製造方法:
(a)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質。 - 前記グルコースがウリジン二リン酸グルコースの形態にある、請求項12に記載の方法。
- 前記ラムノースがウリジン二リン酸ラムノースの形態にある、請求項12又は13に記載の方法。
- 請求項12〜14のいずれか一項に記載の方法で製造されたラムノース又はウリジン二リン酸ラムノース。
- 請求項15に記載のラムノース又はウリジン二リン酸ラムノースを含む、甘味料、飲食品又は医薬品。
- 以下の(a)〜(c)よりなる群より選ばれるいずれかに記載のタンパク質と、グルコースとを反応させてラムノースを得る工程と:
(a)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質
前記ラムノースをステビオール又はステビオール配糖体に転移する工程と、
を含む、ステビオール配糖体の製造方法。 - 前記ラムノースがウリジン二リン酸ラムノースである、請求項17に記載の方法。
- 前記ラムノースをステビオール又はステビオール配糖体に転移する工程が、(i)配列番号11若しくは13の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号12若しくは14のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の13位に結合したグルコースに1→2結合でラムノースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを導入した非ヒト形質転換体を用いて行われる、請求項17又は18に記載の方法。
- 下記の(a)〜(e)の少なくとも1つのポリヌクレオチドを導入した非ヒト形質転換体を用いる工程をさらに含む、請求項17〜19のいずれか一項に記載の方法。
(a)(i)配列番号15の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号16のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の13位の水酸基にグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(b)(i)配列番号17の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号18のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の19位のカルボン酸にグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(c)(i)配列番号19の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号20のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の13位のグルコースの3位に1→3結合でグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(d)(i)配列番号11若しくは13の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号12若しくは14のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の19位のグルコースに、1→2結合でグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(e)(i)配列番号19の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、又は、(ii)配列番号20のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつ、ステビオール配糖体の19位のグルコースに、1→3結合でグルコースを付加する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド - 請求項17に記載の方法で製造された、ステビオール配糖体。
- ラムノース基を有するステビオール配糖体含有量に応じて植物体をスクリーニングする方法であって、
被検植物体から、以下の(a)〜(d)よりなる群より選ばれるポリヌクレオチドを定量する工程、及び前記ポリヌクレオチド量を基準値と比較してポリヌクレオチド量に応じて被験植物体を選別する工程を含む方法。
(a)配列番号1、3、5、7又は9の塩基配列を含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列において、1〜33個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d)配列番号2、4、6、8又は10のアミノ酸配列に対して、95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつグルコースからラムノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
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