JPWO2018180012A1 - 情報処理装置、情報処理システム、及び情報処理方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本技術に係る情報処理装置では、前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の面積の変化量に基づくものとしてもよい。
また、本技術に係る情報処理装置では、前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の周囲長の変化量に基づくものとしてもよい。
更に、本技術に係る情報処理装置では、前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の真円度の変化量に基づくものとしてもよい。
加えて、本技術に係る情報処理装置では、前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の体積の変化量に基づくものとしてもよい。
また、本技術に係る情報処理装置では、前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞が生成する構造物の動きの変化量に基づくものとしてもよい。
更に、本技術に係る情報処理装置では、前記解析部は、更に、前記細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を前記評価の際に用いてもよい。
加えて、本技術に係る情報処理装置では、前記解析部は、更に、前記評価の結果に応じて、各細胞内を色分けしてもよい。この場合、前記解析部は、更に、前記色分け後、前記細胞の分布を定量化してもよい。また、この場合、前記解析部は、更に、前記色分け後、前記細胞から特定のポピュレーションを抽出してもよい。
また、本技術に係る情報処理装置では、前記解析部は、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内のATP濃度を算出してもよい。
更に、本技術に係る情報処理装置では、前記解析部は、更に、前記評価の値に閾値を設定し、前記細胞が生細胞であるか死細胞であるかを判定してもよい。
加えて、本技術に係る情報処理装置では、前記細胞は、浮遊細胞であってもよい。この場合、前記浮遊細胞は、白血球細胞、白血球細胞の前駆細胞、白血球由来の腫瘍細胞、及び血液循環腫瘍細胞からなる群のうち少なくとも一種を含んでいてもよい。
本技術に係る情報処理方法では、前記解析手順では、更に、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を前記評価の際に用いてもよい。
1.情報処理システム1
(1)撮像装置11
(2)情報処理装置12
2.情報処理装置12
(1)解析部121
(2)撮像制御部122
(3)画像取得部123
(4)表示制御部124
(5)情報処理装置12のハードウェア構成
3.情報処理方法
(1)情報処理例1
(2)情報処理例2
図1は、本技術に係る情報処理システム1の構成の一例を示す模式図である。本技術に係る情報処理システム1は、撮像装置11と、後述する情報処理装置12と、を少なくとも備える。また、必要に応じて、その他の装置を備えていてもよい。なお、図1には、観察対象である細胞Sも示しているが、細胞Sは本技術に必ずしも包含されるものではない。以下、各装置について、詳細に説明する。
撮像装置11は、観察対象である細胞Sを経時的に撮像し、画像を生成することが可能な装置とすることができる。具体的には、例えば、顕微鏡光学系やイメージセンサを備える顕微鏡などとすることができ、所定の撮像間隔(例えば、1フレーム/秒以上)で画像(静止画)を撮像できるものであってもよく、連続的な画像(動画)を撮像できるものであってもよい。また、撮像装置11は、後述する情報処理装置12によって、撮像範囲や撮像間隔に対する制御を受けるものとすることができる。
情報処理装置12は、撮像装置11によって撮像された撮像画像を取得し、処理することが可能な装置とすることができる。具体的には、例えば、パーソナルコンピュータなどとすることができる。なお、本技術において、情報処理装置12は、撮像装置11に一体的に構成されていてもよく、撮像装置11とは独立した装置であってもよい。また、撮像装置11と情報処理装置12とは、ネットワークを介して接続されていてもよい。情報処理装置12については、「2.情報処理装置12」にて詳細に説明する。
本技術に係る情報処理装置12は、解析部121、を少なくとも備える。また、必要に応じて、図1に示すように、撮像制御部122、画像取得部123、表示制御部124などの、その他の部位を備えていてもよい。なお、以下、各部位について、詳細に説明する。
解析部121では、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する。
β:細胞内構造の動き量の相関係数
α2:形態変化量2の相関係数
β:細胞内構造の動き量の相関係数
本技術に係る情報処理装置12は、必要に応じて、撮像制御部122を備えていてもよい。撮像制御部122は、前述した撮像装置11の撮像間隔や撮像範囲を決定し、撮像装置11に撮像画像を撮像させる。
本技術に係る情報処理装置12は、必要に応じて、画像取得部123を備えていてもよい。画像取得部123は、撮像画像を取得する。また、画像取得部123は、撮像装置11から直接に、又は、ストレージやネットワークを介して撮像画像を取得するものとすることができる。そして、画像取得部123は、取得した撮像画像を解析部121に供給する。
本技術に係る情報処理装置12は、必要に応じて、表示制御部124を備えていてもよい。表示制御部124は、解析部121から提供された、前記細胞内の代謝状態の評価の結果や、前記形態変化量、これらに関する情報などをディスプレイ等に出力し、ユーザーに提示する。
前述した情報処理装置12の機能的構成は、以下に示すハードウェア構成によって実現することが可能である。
本技術に係る情報処理方法は、解析手順、を少なくとも行う。解析手順で行う具体的な方法は、前述した情報処理装置12の解析部121で行われる解析手順と同一であるため、ここでは説明を割愛する。以下、本技術に係る情報処理方法を用いた情報処理例について、図3及び4を参照しながら、詳細に説明する。
図3は、本技術に係る情報処理方法における情報処理例1を示す工程図である。
図4は、本技術に係る情報処理方法における情報処理例2を示す工程図である。
1%DMSOを加え1週間培養を行うことで分化刺激を行ったHL60細胞を、対物レンズの拡大倍率60倍、撮像間隔27フレーム/秒、撮像時間60秒の条件で、経時的に位相差顕微鏡で画像(動画)を撮像した。図5は、実施例1に係る、細胞の境界認識と追跡の様子を示す画像である。図5に示すように、最初の画像(フレーム)において、機械学習ベースのオブジェクト認識により細胞の境界を認識し、境界に実線(白色の線)を描写した。その後、描写された実線を次の画像にマッチングさせることにより細胞の境界を追尾した。そして、連続画像に対してマッチングを繰り返すことで、連続画像中の細胞領域を追尾した。
前述した実施例1と同様の方法により、CCCPを、0.01μM、0.1μM、1μM、及び10μMのぞれぞれの濃度で添加した場合の形態変化量(面積変化量及び周囲長変化量)を算出した。また、同様の条件における動きベクトルを約1μm間隔で算出し、細胞毎の単位時間当たりの動き量(動き速度)の時空間的平均を算出し、カラーマップを作成した。図7の上図は、実施例2に係る、細胞内構造の動き量(ベクトル解析)、面積変化量、及び周囲長変化量を示す図面代用グラフであり、図7の下図は、実施例2に係る、CCCPが添加された細胞に対するカラーマップである。図7の下図は、作成されたカラーマップの様子を、CCCPの濃度毎に示している。
前述した実施例1及び2と同様の方法により、細胞内構造の動き量、形態変化量(面積変化量及び周囲長変化量)を測定後、細胞を破砕してATP濃度を測定した。ATP濃度の測定には、プロメガ社製のCellTiter-gloを用いた。図8は、実施例3に係る、細胞内構造の動き量(ベクトル解析)、面積変化量、及び周囲長変化量を示す図面代用グラフである。
前述した実施例1と同様の方法により、アクチン重合阻害剤であるCytochalasin Dを200nM添加した場合の形態変化量(面積変化量及び周囲長変化量)を算出した。図10の上図は、実施例4に係る、面積変化量及び周囲長変化量を示す図面代用グラフであり、図10の下図は、実施例4に係る、ControlとCytochalasin Dが添加された場合の細胞の境界認識と追跡の様子を示す画像である。
前述した実施例1及び2と同様の方法により、ATPを利用して細胞内の動力として働くモータータンパク質である、キネシン阻害剤であるMonastrolを500μM、ダイニン阻害剤であるCiliobrevin Dを500μM、それぞれ添加した場合の形態変化量(面積変化量及び周囲長変化量)、及び細胞内構造の動き量を算出した。図11は、実施例5に係る、細胞内構造の動き量(ベクトル解析)、面積変化量、及び周囲長変化量を示す図面代用グラフである。
(1)
細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する解析部、を少なくとも備える情報処理装置。
(2)
前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の面積の変化量に基づくものである、(1)に記載の情報処理装置。
(3)
前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の周囲長の変化量に基づくものである、(1)又は(2)に記載の情報処理装置。
(4)
前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の真円度の変化量に基づくものである、(1)から(3)のいずれかに記載の情報処理装置。
(5)
前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の体積の変化量に基づくものである、(1)から(4)のいずれかに記載の情報処理装置。
(6)
前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞が生成する構造物の動きの変化量に基づくものである、(1)から(5)のいずれかに記載の情報処理装置。
(7)
前記解析部は、更に、前記細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を前記評価の際に用いる、(1)から(6)のいずれかに記載の情報処理装置。
(8)
前記解析部は、更に、前記評価の結果に応じて、各細胞内を色分けする、(1)から(7)のいずれかに記載の情報処理装置。
(9)
前記解析部は、更に、前記色分け後、前記細胞の分布を定量化する、(8)に記載の情報処理装置。
(10)
前記解析部は、更に、前記色分け後、前記細胞から特定のポピュレーションを抽出する、(8)又は(9)に記載の情報処理装置。
(11)
前記解析部は、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内のATP濃度を算出する、(1)から(10)のいずれかに記載の情報処理装置。
(12)
前記解析部は、更に、前記評価の値に閾値を設定し、前記細胞が生細胞であるか死細胞であるかを判定する、(1)から(11)のいずれかに記載の情報処理装置。
(13)
前記細胞は、浮遊細胞である、(1)から(12)のいずれかに記載の情報処理装置。
(14)
前記浮遊細胞は、白血球細胞、白血球細胞の前駆細胞、白血球由来の腫瘍細胞、及び血液循環腫瘍細胞からなる群のうち少なくとも一種を含む、(13)に記載の情報処理装置。
(15)
撮像装置と、
前記撮像装置により細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する解析部、を少なくとも備える情報処理装置と、
を少なくとも備える情報処理システム。
(16)
細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する解析手順と、
を少なくとも行う情報処理方法。
(17)
前記解析手順では、更に、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を前記評価の際に用いる、(16)に記載の情報処理方法。
11:撮像装置
12:情報処理装置
121:解析部
122:撮像制御部
123:画像取得部
124:表示制御部
101:CPU
102:GPU
103:メモリ
104:ストレージ
105:入出力部(I/O)
106:バス
Claims (17)
- 細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する解析部、を少なくとも備える情報処理装置。
- 前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の面積の変化量に基づくものである、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の周囲長の変化量に基づくものである、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の真円度の変化量に基づくものである、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞の体積の変化量に基づくものである、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記形態変化量は、単位時間当たりの前記細胞が生成する構造物の動きの変化量に基づくものである、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記解析部は、更に、前記細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を前記評価の際に用いる、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記解析部は、更に、前記評価の結果に応じて、各細胞内を色分けする、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記解析部は、更に、前記色分け後、前記細胞の分布を定量化する、請求項8に記載の情報処理装置。
- 前記解析部は、更に、前記色分け後、前記細胞から特定のポピュレーションを抽出する、請求項8に記載の情報処理装置。
- 前記解析部は、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内のATP濃度を算出する、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記解析部は、更に、前記評価の値に閾値を設定し、前記細胞が生細胞であるか死細胞であるかを判定する、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記細胞は、浮遊細胞である、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記浮遊細胞は、白血球細胞、白血球細胞の前駆細胞、白血球由来の腫瘍細胞、及び血液循環腫瘍細胞からなる群のうち少なくとも一種を含む、請求項13に記載の情報処理装置。
- 撮像装置と、
前記撮像装置により細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する解析部、を少なくとも備える情報処理装置と、
を少なくとも備える情報処理システム。 - 細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞の形態変化量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞の形態変化量に基づいて、前記細胞内の代謝状態を評価する解析手順と、
を少なくとも行う情報処理方法。 - 前記解析手順では、更に、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を算出し、前記単位時間当たりの前記細胞内構造の動き量を前記評価の際に用いる、請求項16に記載の情報処理方法。
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