JPWO2018056305A1 - L−システインの製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
(1)好熱菌/超好熱菌に由来する耐熱性酵素遺伝子を大腸菌のような汎用的かつ中温性の微生物宿主内で発現させる。
(2)得られた組換え菌体又は菌体からの抽出液を60〜90℃程度の熱処理に供し、宿主由来の酵素を失活させるとともに、宿主の細胞構造を部分的に破壊することで基質/生産物の透過性を高めた触媒モジュールとする。
(3)これらのモジュールを組み合わせ、in vitro人工代謝経路を構築する。
また、O−ホスホセリンの合成については、異種菌株由来のPGDHとホスホセリンアミノトランスフェラーゼ(以下、原則「PSAT」)を組み合わせることによって活性を見出すことができた。O−ホスホセリンの合成は、PGDHとPSATは単独では機能しないが、組み合わせることによって活性を示すことを明らかにした。
このように本発明は、従来の発酵法に代わる新たなL−システインを製造する方法を提供することを課題とする。より具体的には、耐熱性酵素の組み合わせにより、L−システインの製造方法を提供する。特に、3PGからHPVを経由してL−システインの前駆体であるO−ホスホセリンを製造する方法を見出した。
(1)3−ホスホグリセリン酸(3PG)に、好熱菌由来の3ホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼ(PGDH)及びホスホセリンアミノトランスフェラーゼ(PSAT)を作用させて、O−ホスホセリンを生成させる、O−ホスホセリンの製造方法、
(2)L−システインを製造する方法であって、(1)の製造工程を含む、L−システインの製造方法、
(3)(2)の製造方法において、さらにグルタミン酸デヒドロゲナーゼ(GDH)又はNADHオキシダーゼ(以下「NOX」)を添加して製造することを特徴とする、L−システインの製造方法。
※ Ninh PH, Honda K, Sakai T, et al. (2015) Assembly and multiple gene expression of thermophilic enzymes in Escherichia coli for in vitro metabolic engineering. Biotechnol Bioeng 112, 189-196
・酵素液の調製
組換え大腸菌の湿菌体を200 mg wet cells/mlとなるように50 mM HEPES-NaOH (pH8.0)に懸濁した。懸濁液を超音波破砕処理に供することにより菌体を破砕、無細胞抽出液を得た。無細胞抽出液に対し、70℃、30分間の熱処理を施し、宿主由来タンパク質の変性操作を行った。遠心分離により細胞残さと変性タンパク質を取り除いた上清を粗酵素液として活性測定に用いた。
S. tokodaii (St) 由来のPGDHおよびPSATは合成DNAをpET21aに連結し、T7プロモーター制御下で発現させた。一方で、Thermoproteus tenax (Tt) とThermotoga maritima (Tm) 、T. kodakarensis (Tk) 、Thermosynechococcus elongates (Te) 由来のPGDHとPSATは各微生物のゲノムDNAよりPCR増幅した当該遺伝子をpET21aに連結し、T7プロモーター制御下で発現させた。これらの遺伝子発現ベクターは全てNovagen社製Rosetta 2 (DE3) pLysSに導入した。Rosetta2 (DE3) pLysSでは100 mg/Lのアンピシリンと34 mg/LのクロラムフェニコールをLuria-Bertani培地に添加し、37℃で好気的に培養した。対数増殖後期に培養液に0.2 mM IPTGの添加し、目的酵素遺伝子の誘導を行った。
3PGを除いた表2の組成で反応液を作製した。70℃で1分間保温した後に、3PGを加えることで反応を開始させた。反応はPGDHで生成されるNADHの濃度を340nmにおける吸光をモニターすることによって測定した。結果を図2にて記載する。なお、NADHの濃度は340 nmの分子吸光係数6.3×103 mol-1 L-1 cm-1にて算出した。これよりPSATを加えることによってPGDHの反応が進むことが明らかになった。
PGDHは単独の酵素では活性を示さなかった。PSATにおいても同様に活性を示すか検討した。しかし、PSATはNADHを用いる反応ではないので、単独での評価はできない。よってNAD(H)依存型glutamate dehydrogenase (TteGDH)とカップリングさせることで反応が進むか検討した。まずは、表3の条件1にてTteGDHに活性があることを確認した。続いて、条件2のようにTkPSATとTteGDHをカップリングさせることによって、TkPSATが機能するか検証した。結果を図3に記載するが、ここではNADHの消費量を340 nmの分子吸光係数6.3×103 mol-1 L-1 cm-1であることに基づき算出した。これより、TkPGDHと同様にTkPSATも単独で機能しないことが明らかになった。
各々が単独では酵素活性を示さないことは上記より明らかになった。しかし、上記の手法ではNADHでの挙動のみを追跡しているため、PSATが実際に機能しているとは限らない。よって、PGDHとPSATをカップリングさせることで、PSATの生産物の一つであるα-KGが生産するか検討した。表4の反応組成で作成したものでNADHの活性を測定した。
吸光度計の条件は、波長340nm、60℃、2分間でBlank測定し、基質添加後5, 10, 15分後の吸光度の値およびα-KGを※2の文献を一部改変してHPLCにて測定した。具体的には、50μlをサンプリングし40μlの2M HClを加え遠心分離した上清に等量の1mg/ml o-Phenylenediamine in 3M HClを加え80℃で60分間インキュベーションし氷冷し遠心分離したものをHPLC分析に供しα-KGを測定した。測定条件はEluent:Acetic acid / water / methanol (1:54:45, v/v) 、Flow Rate:0.4 ml/min、Column: COSMOSIL Packed Column 5C18-AR-II 4.6IDx250mm、Column Temp.: 35℃、Detection: Exc: 336 nm, Emi:420nm)、Sample cooler: 4℃で行った。図4にNADH生成量およびα-KG生成量を示した。この結果よりNADHとα-KGは同様の結果を示した。従って、PGDHとPSATは連動して反応していることが明らかになった。
※2:Muhling J, Fuchs M, Campos ME, Gonter J, Engel JM, Sablotzki A, Menges T, Weiss S, Dehne MG, Krull M, Hempelmann G. (2003) Quantitative determination of free intracellular α-keto acids in neutrophils. J Chromatogr B 789:383-392
上記より、T. kodakarensis由来のPGDHおよびPSATは両者が共存するときに機能する。そこで、異なる好熱菌アーキアや細菌でも表5の組成で同様にPGDHおよびPSATでも組み合わせて機能するか表6の組み合わせにて検討した。これらの酵素でも同様に単独では機能しないが、PGDHとPSATを組み合わせることによって活性を確認することができた (図5) 。また、6、7にて異種菌株由来のPGDHとPSATを組み合わせることによっても活性を示すことが明らかになった。
Tt:Thermus thermophilus
Tm:Thermotoga maritima
Tk:Thermococcus kodakarensis
Te:Thermosynechococcus elongates
[材料と手法]
・使用酵素遺伝子、菌株、培養
表7に本研究で用いた酵素遺伝子のリストを示す。Thermus thermophilus HB8由来のフルクトース-1,6-ビスリン酸アルドラーゼ(TtFBA)、Thermoproteus tenax由来のグリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ (TteGAPN)、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ (TteGDH) とThermococcus kodakarensis KOD1由来の3-ホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼ (TkPGDH)、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ (TkPSAT) は、各微生物のゲノムDNAよりPCR増幅した当該遺伝子を、Aeropyrum pernix由来のO-ホスホセリンスルフヒドラーゼ (AmCysS) とThermococcus profundus由来のNADHオキシダーゼ (TpNOX) は合成DNAをpET21aに連結し、T7プロモーター制御下で発現させた。これらの遺伝子発現ベクターは全てNovagen社製Rosetta 2 (DE3) pLysSに導入した。T. thermophilus HB8由来のグルコキナーゼ (TtGK)、グルコースリン酸イソメラーゼ (TtGPI)、ホスホフルクトキナーゼ (TtPFK)、トリオースリン酸イソメラーゼ (TtTIM) とT. thermophilus HB27由来のポリリン酸キナーゼ (TtPPK)は合成DNAをpRCI のlamnbda PRプロモーター制御下に連結し、E. coli DH5α株に導入した。E. coli DH5αでは100 mg/Lのアンピシリンを、Rosetta 2 (DE3) pLysSでは100 mgのアンピシリンと34 mg/LのクロラムフェニコールをLuria-Bertani培地に添加し、37℃で好気的に培養した。対数増殖後期に培養液に0.2 mM IPTGの添加もしくは熱誘導 (42℃) にて目的酵素遺伝子の誘導を行った。
組換え大腸菌の湿菌体を200 mg wet cells/mlとなるように50 mM HEPES-NaOH (pH8.0)に懸濁した。懸濁液を超音波破砕処理に供することにより菌体を破砕、無細胞抽出液を得た。無細胞抽出液に対し、70℃、30分間の熱処理を施し、宿主由来タンパク質の変性操作を行った。遠心分離により細胞残さと変性タンパク質を取り除いた上清を粗酵素液として活性測定に用いた。
活性測定には100 mM HEPES-NaOH (pH8.0)を使用し、反応は全て70℃で実施した。TtGKは下流のTteGAPNまでの経路とカップリングさせることによって生じるNADHの濃度を340 nmにおける吸光をモニターすることによって測定した。TtGPI、TtPFK、TtFBA、TtTIM、TteGAPNも同様の手法で測定した。TkPGDHはTkPSATとカップリングさせることで生じるNADHの濃度を340 nmにおける吸光をモニターすることによって測定した。ApCysSは反応液と等量の20%トリクロロ酢酸を加えることによってタンパク質を変性させ、反応を停止させた後に、※4のニンヒドリン試験を行うことでL-システインの濃度を測定した。TtPPKはGKとグルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ(G6PDH)(株式会社耐熱性酵素研究所社製)のカップリングによって反応を実施した。TpNOXは反応によって減少するNADHの濃度を340 nmの吸光をモニターすることによって測定した。TteGDHは反応によって蓄積するNADHの濃度を340 nmの吸光をモニターによって測定した。これらの測定結果より、必要量の粗酵素液を添加することによってグルコースを基質にL-システインの生産量を測定した。なおL-システインの定量はニンヒドリン試験にて実施した。
※4: Gaitonde MK (1967) A spectrophotometric method for the direct determination of cysteine in the presence of other naturally occurring amino acids. Biochem J. 104(2):627-633
酵素活性によって測定した結果に基づき、必要量の粗酵素液を添加することによってグルコースからL-システインの生産性を測定した。反応組成は100 mM HEPES、5 mM MgCl2、0.5 mM MnCl2、10 mM NAD+、1 mM ATP、1 mM G1P、2.5 mM グルコース、5 mM グルタミン酸、5 mM 硫化ナトリウム、32 mM 酢酸アンモニウム、1 mM ポリリン酸 (平均鎖長60) からなる反応液中で実施した。ニンヒドリン試験にてL-システインを定量した。
実施例での使用酵素はTtGK、TtGPI、TtPFK、TtFBA、TtTIM、TteGAPN、TkPGDH、TkPSAT、ApCysSである。反応組成は表8の条件1の組成とし、70℃で実施した。グルコースを除いた反応液に前記全ての酵素を加えたものに、グルコースを加え反応を開始させた。反応開始15分後にL-システインの定量を行った。その結果、17.3 mg/LのL-システインを確認することができた。
L-システインの合成経路には補酵素であるNAD+を用いている。GDHやNOXを供し、NADHを還元させることでL-システインの生産速度を向上させることを目的として検討を行った。表8の反応組成で70℃にて実施した。反応開始15分後にシステインの定量を行った。この結果、図6のように、反応液にTteGDHやTpNOXを加えた方が、生産量が高く、更に両者を加えた方が、一層生産量が高くなることが明らかになった。
L-システインの生産試験の経時変化を取った。今回の試験の使用酵素はTtGK、TtGPI、TtPFK、TtFBA、TtTIM、TteGAPN、TkPGDH、TkPSAT、ApCysS、TtPPK、TpNOX、TteGDHである。グルコースを除いた反応液に全ての酵素を加えたものに、グルコースを加え反応を開始させた。反応開始5、10、15、20分後にサンプリングを行い、L-システインの定量を行った。反応組成を表9に示し、70℃で反応を実施した。その結果を図7にて示す。これより、TteGDHやTpNOXを加えた方が生産速度が上がることが明らかになった。一方で表9の3,4,5では反応開始15分以降で定常状態となった。また、表9の2でも生産量は伸びているが、速度は緩やかになっている。その反面、表9の1では継時的に生産されており、2に比べてもそれほど生産速度は低下していない。よって長時間反応を行うためにはTtPPKによってADPをATPに再生することが重要であることが示唆された。
Claims (3)
- 3-ホスホグリセリン酸(3PG)に、好熱菌由来のホスホセリンアミノトランスフェラーゼ(PSAT)及び3ホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼ(PGDH)を作用させて、O−ホスホセリンを生成させる、O−ホスホセリンの製造方法。
- L−システインを製造する方法であって、請求項1の製造工程を含む、L−システインの製造方法。
- 請求項2の製造方法において、さらにグルタミン酸デヒドロゲナーゼ又はNADHオキシダーゼを添加して製造することを特徴とする、L−システインの製造方法。
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