JPWO2012086772A1 - 分析用デバイスおよび分析方法 - Google Patents
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Abstract
Description
前記基板に、前記核酸素子および前記検出部が配置され、
前記核酸素子は、第1核酸分子および第2核酸分子を含み、
前記第1核酸分子は、ターゲットに結合可能な核酸分子であり、
前記第2核酸分子は、ストレプトアビジンに結合可能な核酸分子であり、
前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合していない場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能が不活性化され、
前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合した場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能が活性化され、
前記検出部は、前記第2核酸分子と前記ストレプトアビジンとの結合を検出する検出部であることを特徴とする。
前記分析用デバイスに試料およびストレプトアビジンを添加する工程、および、
前記検出部で前記第2核酸分子と前記ストレプトアビジンとの結合を検出することによって、ターゲットを検出する工程を含むことを特徴とする。
本発明において、前記核酸素子は、前述のように、前記第1核酸分子および前記第2核酸分子を含む。前記第1核酸分子は、ターゲットと結合可能な核酸分子である。前記第2核酸分子は、ストレプトアビジンに結合可能な核酸分子であり、前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合していない場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能は不活性化され、前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合した場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能は活性化される核酸分子である。
(a)配列番号1〜10のいずれかで表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチド
(b)前記(a)の前記塩基配列において、1または複数の塩基が、置換、欠失、付加および/または挿入された塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
(c)前記(a)の前記塩基配列との同一性が50%以上の塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
(d)前記(a)の前記塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
配列番号1(85)
taatacgact cactatagca atggtacggt acttcccgac gcaccgatcg caggttcggg acaaaagtgc acgctacttt gctaa
配列番号2(18)
AC GCACCGATCG CAGGTT
配列番号3(20)
GAC GCACCGATCG CAGGTTC
配列番号4(22)
CGAC GCACCGATCG CAGGTTCG
配列番号5(24)
CCGAC GCACCGATCG CAGGTTCGG
配列番号6(26)
CCCGAC GCACCGATCG CAGGTTCGGG
配列番号7(28)
TCCCGAC GCACCGATCG CAGGTTCGGG A
配列番号8(60_3-10)
GCA ATGGTACGGT ACTTCCCGAC GCACCGATCG CAGGTTCGGG ACAAAAG
配列番号9(60_5-10)
GGT ACTTCCCGAC GCACCGATCG CAGGTTCGGG ACAAAAGTGC ACGCTAC
配列番号10(60)
GCA ATGGTACGGT ACTTCCCGAC GCACCGATCG CAGGTTCGGG ACAAAAGTGC ACGCTAC
(a)配列番号1〜10のいずれかで表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチド
前記n1と前記n2が0の場合、例えば、前記「(N1)n1−A」は「A」、前記「T−(N2)n2」は「T」であり、前記一般式(1)の配列は、配列番号2で表わされ、前記ステム構造は1塩基対となる。
前記n1と前記n2が1の場合、例えば、前記「(N1)n1−A」は「GA」、前記「T−(N2)n2」は「TC」であり、前記一般式(1)の配列は、配列番号3で表わされ、前記ステム構造は2塩基対である。
前記n1と前記n2が2の場合、例えば、前記「(N1)n1−A」は「CGA」、前記「T−(N2)n2」は「TCG」であり、前記一般式(1)の配列は、配列番号4で表わされ、前記ステム構造は3塩基対である。
前記n1と前記n2が3の場合、例えば、前記「(N1)n1−A」は「CCGA」、前記「T−(N2)n2」は「TCGG」であり、前記一般式(1)の配列は、配列番号5で表わされ、前記ステム構造は4塩基対である。
前記n1と前記n2が4の場合、例えば、前記「(N1)n1−A」は「CCCGA」、前記「T−(N2)n2」は「TCGGG」であり、前記一般式(1)の配列は、配列番号6で表わされ、前記ステム構造は5塩基対である。
前記n1と前記n2が5の場合、例えば、前記「(N1)n1−A」は「TCCCGA」、前記「T−(N2)n2」は「TCGGGA」であり、前記一般式(1)の配列は、配列番号7で表わされ、前記ステム構造は6塩基対である。
(b)前記(a)の前記塩基配列において、1または複数の塩基が、置換、欠失、付加および/または挿入された塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
(c)前記(a)の前記塩基配列との同一性が50%以上の塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
(d)前記(a)の前記塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
本発明の分析用デバイスは、前述のように、基板、核酸素子およびシグナルの検出部を含み、
前記基板に、前記核酸素子および前記検出部が配置され、
前記核酸素子は、第1核酸分子および第2核酸分子を含み、
前記第1核酸分子は、ターゲットと結合可能な核酸分子であり、
前記第2核酸分子は、ストレプトアビジンに結合可能な核酸分子であり、
前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合していない場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能が不活性化され、前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合した場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能が活性化され、
前記検出部は、前記第2核酸分子と前記ストレプトアビジンとの結合を検出する検出部であることを特徴とする。本発明において、前記核酸素子は、前述の通りである。
本発明の分析方法は、前述のように、前記本発明の分析用デバイスを用い、
前記分析用デバイスに試料およびストレプトアビジンを添加する工程、および、
前記検出部で前記第2核酸分子と前記ストレプトアビジンとの結合を検出することによって、ターゲットを検出する工程を含むことを特徴とする。
10 基板
20 電極
40 核酸素子
41 第1核酸分子
42 第2核酸分子
43 介在リンカー
44 第1の付加リンカー
45 第2の付加リンカー
50 ターゲット
Claims (22)
- 基板、核酸素子およびシグナルの検出部を含み、
前記基板に、前記核酸素子および前記検出部が配置され、
前記核酸素子は、第1核酸分子および第2核酸分子を含み、
前記第1核酸分子は、ターゲットと結合可能な核酸分子であり、
前記第2核酸分子は、ストレプトアビジンに結合可能な核酸分子であり、
前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合していない場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能が不活性化され、前記第1核酸分子に前記ターゲットが結合した場合、前記第2核酸分子の前記ストレプトアビジンに対する結合能が活性化され、
前記検出部は、前記第2核酸分子と前記ストレプトアビジンとの結合を検出する検出部であることを特徴とする分析用デバイス。 - 前記第1核酸分子は、前記ターゲットの結合により構造変化する核酸分子であり、
前記第2核酸分子は、前記第1核酸分子の構造変化により構造変化する核酸分子である、請求の範囲1記載の分析用デバイス。 - 前記第1核酸分子および前記第2核酸分子は、アプタマーである、請求の範囲1または2記載の分析用デバイス。
- 前記第2核酸分子は、下記(a)、(b)または(c)のいずれかのポリヌクレオチドを含む核酸分子である、請求の範囲1から3のいずれか一項に記載の分析用デバイス。
(a)配列番号1〜10のいずれかで表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチド
(b)前記(a)の前記塩基配列において、1または複数の塩基が、置換、欠失、付加および/または挿入された塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド
(c)前記(a)の前記塩基配列との同一性が50%以上の塩基配列からなり、且つ、ストレプトアビジンに結合可能なポリヌクレオチド - 前記核酸素子は、前記第1核酸分子と前記第2核酸分子とが連結した一本鎖の核酸分子である、請求の範囲1から4のいずれか一項に記載の分析用デバイス。
- 前記核酸素子は、さらに、リンカーを有する、請求の範囲1から5のいずれか一項に記載の分析用デバイス。
- ストレプトアビジンが、標識物質が結合した標識化ストレプトアビジンであり、
前記シグナルが、前記標識物質由来のシグナルである、請求の範囲1から6のいずれか一項に記載の分析用デバイス。 - 前記標識物質が、シグナルを発生する標識物質である、請求の範囲7記載の分析用デバイス。
- 前記標識物質が、酸化還元反応を触媒する酵素である、請求の範囲7記載の分析用デバイス。
- 前記標識物質が、酸化還元反応を触媒する酵素であり、
前記シグナルが、前記酸化還元反応による基質からのシグナルである、請求の範囲9記載の分析用デバイス。 - さらに、試薬部を有し、
前記試薬部が、前記酸化還元反応の基質を含む、請求の範囲10記載の分析用デバイス。 - 前記シグナルが電気化学的シグナルである、請求の範囲7から11のいずれか一項に記載の分析用デバイス。
- 前記検出部が、電極を有する、請求の範囲1から12のいずれか一項に記載の分析用デバイス。
- 前記核酸素子が、前記検出部に配置されている、請求の範囲1から13のいずれか一項に記載の分析用デバイス。
- 二種類以上の前記核酸素子を有し、
前記二種類以上の核酸素子が、それぞれ、結合可能なターゲットが異なる前記第1核酸分子を有する、請求の範囲1から14のいずれか一項に記載の分析用デバイス。 - 請求の範囲1から15のいずれか一項に記載の分析用デバイスを用い、
前記分析用デバイスに試料およびストレプトアビジンを添加する工程、および、
前記検出部で前記第2核酸分子と前記ストレプトアビジンとの結合を検出することによって、ターゲットを検出する工程を含むことを特徴とするターゲットの分析方法。 - 前記ストレプトアビジンが、標識物質が結合した標識化ストレプトアビジンである、請求の範囲16記載の分析方法。
- 前記標識物質が、シグナルを発生する標識物質である、請求の範囲17記載の分析方法。
- 前記標識物質が、酸化還元反応によりシグナルを発生する標識物質である、請求の範囲18記載の分析方法。
- 前記標識物質が、酸化還元反応を触媒する酵素である、請求の範囲19記載の分析方法。
- 前記酸化還元反応の基質の存在下、前記検出工程を行う、請求の範囲20記載の分析方法。
- 検出工程における検出が、電気シグナルの検出である、請求の範囲18から21のいずれか一項に記載の分析方法。
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