JPS63313589A - マイクロモノスポラのための遺伝子系 - Google Patents

マイクロモノスポラのための遺伝子系

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JPS63313589A
JPS63313589A JP63049897A JP4989788A JPS63313589A JP S63313589 A JPS63313589 A JP S63313589A JP 63049897 A JP63049897 A JP 63049897A JP 4989788 A JP4989788 A JP 4989788A JP S63313589 A JPS63313589 A JP S63313589A
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JP
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strain
dna
complex
plasmid
cells
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JP63049897A
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デビツド・マイケル・ロススタイン
スーザン・フイテニ・ラブ
エレン・ズコスフスキイ・バウム
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American Cyanamid Co
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は、LL−E33288複合体と呼ぶ抗菌および
抗腫瘍剤を生産する、新規な放線菌(A ct ino
mycete)マイクロモノスポラeエキノスポラ(M
 icromonosupora  echinosp
ora)種カリケンシス(calichensis) 
 (以後、M icromonosupora  ec
hinosporallcalichensisと呼ぶ
)の遺伝子操作に関する。このような抗菌および抗腫瘍
剤は、1987年1月30日提出された同時係属米国特
許出願第009.321号に記載されており、この出願
は1985年lO月17日に提出された同時継続米国特
許出願第787,066号の一部継続出願であり、後者
の出願は1984年11月16日に提出されかつ現在放
棄された米国特許出願第672.031号の一部継続出
願である。
LL−E33288複合体の種々の誘導体生成物は、両
者共1987年1月30日に提出された同時係属米国特
許出願筒004.154号および米国特許出願第004
.153号に記載されている。
すべてのこのような出願の開示は引用によってここに加
える。抗菌および抗腫瘍LL−E33288複合体は、
M icromonosupora  echinos
pora種calichensisの新規な菌株の制御
された条件下の培養の間に生産される。この微生物は、
アメリカン・サイアナミド・カンパニーの医学研究部(
Medical  Re5earch  Divisi
on、 AmericanCyanamid  Co+
1pany、 P earl  R1ver、 N e
wY ork)の培養物収集物中に培養物番号LL−E
33288として維持されている。この新規な微生物の
生存しうる培養物は、米国農務省の北部研究センターの
培養物収集研究所(CultureCollectio
n  Laboratory、 Northern  
Regional  Re5earch  Cente
r、 U、 S、 Departmentof  Ag
riculture、 Peoria、 l1lino
is)に1984年8月9日に受託されており、その永
久収集物に加えられている。それは、このような保管機
関によって、菌株表示NRRL−15839を与えられ
ている。このような培養物の利用は、米国特許出願第0
09.321号の係属中、それに対して権限を与えられ
た特許および商標の局長によって、37  C,F、R
,@1.14および35  U、S、C,口122の規
定に従い決定され、そしてこのような培養物についての
公衆への利用に対するすべての制限は米国特許出願第0
09゜321号が許されたとき最終的に排除される。
われわれは、゛菌株NRRL−15839を突然変異化
(mutagenize) L/、そして検出可能な生
産物を生産しないか、あるいは生産物の変更したパター
ンを生産する誘導体の菌株についてスクリーニングする
有効な方法を開発した。プラスミドで菌株NRRL−1
5839を形質転換させる、プロトプラスト化(pro
toplasting)および再生の養生法(regi
men)を開発した。さらに、菌株NRRL−1583
9からのDNA断片を分離し、そして分析した。このD
NA断片は、主としてLL−E 33288複合体が生
産されるNRRL−15839の生命環の段階で、プロ
モーター活性を含有する。これらの遺伝子および生化学
の進歩を利用することによって、改良された特性(すな
わち、毒性が減少した化合物の生産)を有する菌株NR
RL−15839の新規な誘導体を生産することができ
、そして生成物の収率を増大することができる。ヨウド
ーLL−E33288複合体の収率はプロモーLL−E
33288複合体より高いので、ヨウドーLL−E33
288複合体をわれわれの研究においてもっばら使用し
た。
菌株NRRL−15839は、菌糸体とよぶ多細胞の形
態として成長する。成長する培養物の多細胞の性質は突
然変異誘発のための1つの問題である;劣性突然変異を
含有する細胞は野生型細胞の集塊中に検出されないであ
ろう。胞子の突然変異誘発、有機体の成長しない単細胞
の形態、または成長する細胞の突然変異誘発に頼らなく
てはならず、次いで引続いてこれらをプロトプラスト化
(細胞壁の消化)または音波処理(細胞壁の機械的剪断
)によって処理する。プロトプラストまたは音波処理し
た菌糸体を調製することによって、単細胞のまたは単細
胞に近い遺伝子単位を人工的に発生させる。われわれは
、菌株NRRL−15839の断片化菌糸体をニトロソ
グアニジンおよび紫外線で突然変異誘発することを包含
する有効なプロトコールを記載する。
組換えDNAを生産性有機体中に転移するためには、プ
ロトプラストが一般に外因性DNAを取込み、これに対
して菌糸体または成長しない胞子な取込まないので、プ
ロトプラスト化−再生系を開発することが必須であった
。われわれは、プロトプラスト化および再生は繊細な手
順であるように思えたので、これらの手順のすべての詳
細を含めた。また、プロトプラストの融合による菌株間
の遺伝子物質の転移のための手順の詳細を含めた。
遺伝子を菌株NRRL−15839中にクローニングす
るために、有機体中で複製することのできるベクターを
発生させることが必要である。プラスミドplJ486
の誘導体、カナマイシン耐性遺伝子のための菌株NRR
L−15839からのプロモーターを含有するストレプ
トマイセス(S treptomyces)  (以後
、S treptomycesと呼ぶ)のプラスミド(
J、M、ワード(Ward)も、モレキュラー・アンド
・ジェネラル・ジエネティツクス(Molecular
  and  General  Genetics)
、1986.468−478ページ]を使用して菌株N
RRL−15839を形質転換した。内因性プラスミド
は菌株NRRL−15839において観察されなかった
。しかしながら、これより大きいプラスミドは検出でき
いであろう。
生合成経路を操作するためにわれわれだ取ったアローチ
は、いくつかの面において、ストレプトマイセス・7ラ
ジエ(Streptomyces  fradiae)
中のチロシンの生産またはストレプトマイセス・エリト
レウス(S treptomyces  erythr
eus)中のエリスロマイシンの生産の研究に類似する
[セノ(Seno) 、 E、 T、およびC,R,7
チンソン(Hutchinson)、1986、「細菌
(The  Bacteria) J 、Vol、 I
 XSS 、 W、クイーナー(Queener) 、
 L 、 C+ディ(D ay)編;アカデミツク・プ
レス・インコーホレーテッド(A caden+ic 
 P ress  I nco、ニューヨーク、231
−279ページ〕。これらの研究は、抗生物質の生産を
遮断された突然変異の分離、および抗生物質の生合成に
関係する遺伝子のクローニングを包含した。LL−E3
3288複合体の生産においてとくに遮断される突然変
異は、薬物の生合成経路を確立するとき有用でることが
ある。L L −E’33288複合体の生合成に関係
する遺伝子のクローニングは1.薬物の収率の増加およ
び新規な誘導体の生産において大きい価値をもつことが
できる。
われわれは、LL−E33288複合体の生産を遮断さ
れた突然変異を分離した。遮断突然変異のいつかの対は
活性生産物を同時合成(co−synthesize)
する。ある対の一方の突然変異は、他方の突然変異がL
L−E 33288複合体に変換できる中間体を分泌す
る。遮断突然変異によってつくられる中間体を分離およ
び同定することによって、われわれはLL−E3328
8複合体分子の前駆体成分を決定することができる。変
換する菌株に供給される成分または中間体を変更するこ
とによって、「生変換(bioconversion)
 JによってLL−E33288複合体の新規な誘導体
を潜在的に発生することができる〔シアー(Shier
) +W、T、 、K、L、ジュニア−(Jr、)ライ
ンハート(R1nehart)およびり、ゴツトリーブ
(G ottlieb)、1969、プロシーデインダ
ス・オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サイエンシ
ズ(Proc、  Natl、  Acad、  Sc
i、 ) 63 :198−204]。LL−E332
88複合体の場合において、生変換は、LL−E332
88複合体の種々の成分が複雑な不安定な構造であるた
めに、新規な生産物を生産するために、LL−E332
88複合体の化学的変法よりも容易な方法である。
遮断突然変異の特性づけの他の手段は、培養物にLL−
E33288複合体の既知の成分を供給することを包含
する。1つのこのような成分はシュードアグリコン(p
seudaglycone) 、すなわち、ラムノース
部分およびアミノ糖を欠<LL−E33288複合体分
解生成物である。アミノ糖の損失は、生物学的活性の1
00倍の大きい減少を生ずる。シュードアグリコンをL
L−E 33288複合体に変換する遮断突然変異の能
力は、遮断突然変異が遺伝子欠陥のためにシュードアグ
リコンの形成のために必須な反応を実施できないことを
示す。断片、例えば、シュードアグリコンを変更するこ
とによって、再び、生変換によって新規な生成物を生産
することが可能である。
また、遮断突然変異は形質転換におけるプラスミドDN
Aの受容体としてはたらくことができる。
野生型DNAのインサートを有するプラスミドDNAで
遮断突然変異を補体化(complement ing
)することによって、生合成遺伝子をクローニングにす
ることが可能である。また、生合成遺伝子を他の有機体
中にクローニングすることが可能である。ストレプトマ
イセス・リビダンス(S trept。
myces  1ividans)  (以後S 、 
1ividansと呼ぶ)は、いくつかの有用なりロー
ユングベクターの複製を支持する、よく特徴づけられた
宿主であるLホブウッド(Hopwood) 、D、 
A、ら、1985、ストレプトマイセスの遺伝子操作(
G enet icManipulation  of
  5treptoseyces) ;実験室のマニュ
アル(A  L aboratory  M anua
l) %ザ争ジョン・インズ・ファンディジョン(Th
eJohnI nnes  F oudation) 
、英国ノーウィッチ]0プラスミドDNA中に結合され
たM icromonosporaDNA断片のライブ
ラリーを調製し、S 、 l 1vidansを形質転
換し、そしてLL−E33288複合体を合成する形質
転換体についてスクリーニングすることができる。しか
しながら、単一のDNA断片上です生合成遺伝子のすべ
てをクローニングし、そして発現することは不可能であ
ることが明らかにされた。異質宿主中のLL−E332
88複合体の生産は、また、致死的であろう。前駆体分
子の遺伝情報を指定する遺伝子を同定することによって
、遮断突然変異がLL−E33288複合体に変換する
経路の部分をクローニングすることはいっそう容易であ
ることがある。生合成遺伝子をS。
1ividansまたは大腸菌(以後E、coliと呼
ぶ)中にクローニングする他の手段は、薬物耐性が生合
成遺伝子に結合されうるので、LL−E33288複合
体に対する耐性を選択することを包含する。
ポリケチドの生合成に関係することが知られている遺伝
子からのDNAプローブ[マルパルチダ(Malpar
tida) 、 R、ら、1986、工業微生物の遺伝
学に関する第5回国際シンポジウムのアブストラクト(
A bstr、   F 1fth  I ntern
at。
Symp、  on  the  Genet、  o
f  (ndustrialM icroorgani
sms)、163ページ]を、また、使用して菌株NR
RL−15839におけるのと同様な機能をもつ遺伝子
を同定することができる。
生合成遺伝子を直接同定できない場合、LL−E332
88複合体が合成される生命環の時にのみ存在する転写
体についてスクリーニングすることができる;このよう
な転写体はLL−E33288複合体の生合成経路の酵
素の遺伝情報を指定できる。このアプローチの変更は、
LL−E33288複合体の生合成の時にのみ活性であ
るプロモーターを探し、プロモーターのプローブのプラ
スミドを利用することを包含する。最後に、LL−E3
3288複合体の生合成に関係する蛋白質を同定するこ
とが可能であり、そしてこの蛋白質を配列決定すること
によって、生合成遺伝子を含有するDNAをスクリーニ
ングするためのわれわれ自身のプローブを設計すること
ができるであろう。
このような遺伝子のクローニングおよび発現は、経路を
明らかにし、そして究極的にそれをわれわれの利益のた
めに操作することを表わす。LL−E33288複合体
の生合成経路の律速酵素の遺伝情報を指定する遺伝子を
クローニングしかつ発現することによって、例えば、生
産物の収率を増加することができるであろう。S tr
epto■yces属内のアクチノルホジン(acti
norhodin)の誘導体について報告されているよ
うに[ホブウッド(Hopwood) 、D、 /l 
ら、1985、ネイチャー (Nature) 314
 : 642−6441 、このような遺伝子を他の微
生物に転移することによって、LL−E33288複合
体の新規な形態を生産することが可能であろう。LL−
E33288複合体の生合成遺伝子をクローニングしか
つ転移することによって、ある有機体が、抗腫瘍機能を
保持するが毒性が低い薬物の新規な形態を生産すること
ができたならば、重要は進歩であろう。
われわれの計画の1つの重要な面は、有機体の生命環に
おける適切な時間において遺伝子を発現する能力である
。例えば、指数的成長相の間のLL−E33288複合
体の生合成遺伝子の発現は致死的であることがある。ク
ローニングした遺伝子の発現を調節する1つの方法は、
転写のレベルにおいて、LL−E33288複合体が、
また、つくられる時間においてプロモーターとしてはじ
めて活性であるlまたは2以上の遺伝子より前に存在す
るDNA配列を利用することである。したがって、この
ようなプロモーターの分離は、Micromonosp
oraまたはS trepto+1ycesにおける発
現系の確立において1つの重要な工程である。
E、coliの操作した菌株におけるDNAの損傷に応
答するβ−ガラクトシダーゼの誘導を含む感受性の生物
学的誘導アッセイ(B I A) 、およびLL−E3
3288複合体の異なる成分を分割する薄層クロマトグ
ラフィー系を、LL−E33288複合体の活性の検出
のために利用した。これらの系は、変更した性質をもつ
ものについて、多数の突然変異化した細胞をスクリーニ
ングしかつ特性づけるために必須であった。
菌株NRRL−15839の突然変異誘発問題の突然変
異を分離するために、菌株NRRL−15839を突然
変異化することが必須であった。放線菌(A citi
nomycetes)のための普通の突然変異誘発の養
生法は、胞子を紫外線またはニトロソグアニジンのよう
な因子を処理することである〔デリック(Delic)
 、 V、 、D、 A、ホブウッド(Hopwood
)およびE、J、−7レンド(F riend)、19
70、突然変異の研究(Mut。
Res、)9:167 182]−われわれは、胞子で
なく菌糸体の成長する培養物をこれらの因子で突然変異
化した。一般に、N−ニトロ−N−メチルーN−ニトロ
ソグアニジン(NTG)(これはDNAの複製フォーク
に最も強(作用する)を使用する突然変異誘発は、成長
する細胞中で増大される[ミラー(Miller) 、
  J 、H−,1972、分子遺伝学における実験(
E xpreimentsin  Mo1ecular
  Genetics) 、コールド番スプリング・ハ
ーバ−・ラボラトリ−(Cold  Spring  
Harbor  Laboratories) 、ニュ
ーヨーク、コールド・スプリング・ハーバ−〕。劣劣性
遺伝的節を有する突然変異の検出を保証するため、菌糸
体を、突然変異誘発および自然成長(outgrowt
h)後、音波処理(機械的剪断)して、単一の遺伝子単
位を得た。
突然変異誘発のための成長培地は、GER[キム(Ki
ll) 、 K、 S、およびり、Y、 リュー(Ry
u)、1983、酵素および微生物の技術(Enz、 
 Mic、  Technol、 ) 5 : 273
−280]であり、100ミリモルのTES(N−トリ
ス[ヒドロキシメチル]メチルー2−アミノエタンスル
ホン酸)を含有するNRRL−15839の比較的急速
な成長を支持する富んだ培地、pH7,6、であった。
この緩衝液はNTGの添加のとき比較的高いpi(を−
持するなめに添加した。このNTGはpH8付近におい
てより有効な突然変異厚である[デリック(Delic
) * V、、D、 1.ホブウッド(Hopwood
)およびE、J。
フレンド(F riend)、1970、突然変異の研
究(Mut、Res、)9 :167−1821−指数
的成長相の間、オレンジ色顔料の生成前および菌糸体の
凝集前に、細胞密度をクレットーサンマーソン(K 1
ett −S ummerson)比色計で監視するこ
とができた。菌株NRRL−15839の培養物は、通
気が成長を改良するので、それらせ板を有するクレット
フラスコ中で成長させ、そして培養物は、また、菌糸体
の塊を破壊するために3個のガラスピーズ(4mm)を
含有した。
菌株NRRL−15839の凍結した種子培養物を、G
ER培地の25m1の培養物に添加した。
細胞は32℃において300 rpmにセットした二ニ
ー・ブルンスウ(ツク(N ew  B runswi
ck) G 76振盪水浴中でインキュベーションした
。初期の接種は15クレット単位(Klett  Un
it)  (緑のフィルター)であった。約28時間後
、細胞は118クレット単位、または中指数的成長相に
成長した。細胞を遠心によって収穫し、そしてll1g
/mlのNTG、70%のGERおよび100ミリモル
のTESを含有するl OmL pH7,6、中の再懸
濁した。この培養物を水浴中でインキュベーションし、
そして培養物のアリコートを遠心し、GER培地で3回
洗浄し、2つのGER平板、および65−15培地[6
5−15培地g/lニゲルコースlog、デキストリン
20g1酵母エキス5g5N”アミンA5g; CaC
O5(ミシシッピーライン(Mississippi 
 Line) ) Igs寒天15g5pH6,7−7
,0−水道水で構成した]または酵母デキストロース培
地[酵母デキストロース培地g/l:酵母菌エキス10
g1グルコースlOg。
寒天15g、 Aph6 、8−水道水で構成した1の
各々の1つの斜面上に接種することによって成長させた
培養物の2+++1の試料を2.8分(2,8″)にお
いて取り出し、そして2本のミクロ遠心管内で遠心した
。試料を3回洗浄してNTGを除去した。
他の試料を培養物から35分、91分および164分に
おいて取り出した。
菌糸体凝集体の多くの細胞の間で劣性突然変異を発現さ
せるために、発芽後成長(outgrowth)が必要
であった。われわれは斜面を接種した、なぜなら斜面は
単細胞の胞子の発育を支持するからである。突然変異化
胞子を究極的に使用して、遮断突然変異についてスクリ
ーニングした。胞子は形成するために数週間を要したの
で、われわれは、また、2GER平板で突然変異化試料
を同様によく生長させた。GER平板上で生長したいく
つかの細菌が発生した後、突然変異は多分分割して、菌
糸体内に小さい、遺伝的に相同な集塊を形成する。単一
の遺伝単位である菌糸体の断片を得るために、このよう
な菌糸体のl+mlを氷でジャケットしたミクロ遠心管
中のGERブロス中に再懸濁し、14〜25秒間音波処
理[MSEソニプレプ(Soniprep) l 50
音波処理装置、振幅16ミクロン]し、そして菌糸体を
、顕微鏡観察で決定して、2〜3細胞の大きさに減少し
た。コロニー形成単位の測定は、また、音波処理時間の
最適化において有効であった;音波処理はコロニーを形
成するためのより多い単位を生成したが、また多少の断
片を殺した。音波処理時間の関数としてコロニー形成単
位の数を決定した;14〜25秒の範囲は最大のコロニ
ー形成単位の時間を越えていた。
2.8分および35分からの菌糸体を4日間生長させ、
そして菌糸体の断片を調製し、そして1000%に希釈
後GER平板上に接種した。音波処理した細胞またはし
ない細胞の残部をグリセロールで20%の希釈し、そし
て−70℃で貯蔵した。30℃で4日間インキュベーシ
ョンした後、クローンをつまようじで最少培地の平板ま
たはGER平板上に複製した。菌株NRRL−1583
9の価値ある栄養要求変異株の検出が得られるが、また
、これらのデータから突然変異誘発の頻度を測定するこ
とができた。最初に使用した最少培地に、1リツトルに
つき20gのスクロース、1gの硫酸アンモニウム、O
,IgのFe50.” 7HxOsO02gのM g 
S O4・7 )1 z 015gのCaC0,(ミシ
シッピ・ライム)、0.05gのに、HPOいおよび2
0gの寒天から成り、pH7,5に調節したリン酸塩を
添加した。後に、クローンを変性最少培地(Aux培地
)中で試験することが、より容易であることを発見した
。この培地は、ミシシッピ・ライムの代わりにl/I 
O容量のTES  1MpH7,5および7−73g(
’)CaC1z・2HzOを使用し、コロニーを不明瞭
にする培地に不透明のグレーの色を与える。われわれの
結果は、栄養の汚染を含まないノウプル(N oble
)寒天(Oxoid)をディ7コ(D 1rco)寒天
の代わり使用したとき、より明確であった。
第3NTG時点について、発芽後成長する細胞を、コロ
ニーが合理的な大きさになるまで、8日間インキュベー
ションした。NTGによる91分の処理は培養物につい
てより長い回収時間を生じた。非常に多数のものが殺さ
れた(下を参照)ので、コロニーを発芽後成長した菌糸
体の平板から直接複製し、次いで前述のように平板の培
養物を集めそして音波処理した。少なくともあるコロニ
ーについて、1つのみの細胞が平板培養した菌糸体の集
塊から生き残ったであろうことがもっともらしいと思わ
れた。小さい離散したコロニーのみを取り上げた。平板
から直接取り上げた集団は、生長しない突然変異ならび
にGER平板上の野生型について富んでおり、それゆえ
より小さく、そして8日間のインキュベージジンの間離
数してとどまる可能性が存在した。個々のクローニング
を取り上げた後、上に概説したように、平板培養物を収
穫し、そして音波処理した。
NTG突然変異誘発の結果 NTGによる突然変異誘発の頻度は、一般に、殺微生物
作用(killing)と相関関係をもつ[ミラー(M
 i l rer)、J、H,,1972、分子遺伝学
における実験(Expreiments  in  M
olecular  Genetics) 、コールド
嗜スプリング・ハーバ−・ラボラトリ−(Cold  
S pring  HarborL aborator
ies) 、ニューヨーク、コールド令スプリング・ハ
ーバ−]。殺菌の劇的な増加はNTG処理の時間の増加
とともに起こることが明らかであった。30℃において
4日の生長後、2゜8分の試料から平板培養した細胞は
GER平板上に菌叢を形成した;約5000コロニーは
35分のNTG処理後収穫した試料を含有する平板上で
生長し、約300のコロニーは91分の試料から生長し
、そしてちょうど3コロニーは164分の試料から生長
した。
栄養要求変異株のスクリーンの予備分析は、また、非常
に首尾よい突然変異誘発を示唆した。最少培地またはG
ER培地を含有する平板上のクローンの複製および再試
験後、最少培地上で生長できなかった突然変異を1系列
の平板上で試験して、栄養要求体を決定した[ディビス
(Davis) 、R−W、 、D、ホトスティン(1
30tstein)およびJ。
R,ロス(Roth)、1980、アドバンスト・バク
チリアル・ジエネチツクス(A dvanced  B
 acterial  Genetics) 、コール
ド・スプリング・ハ+ t<−mラボラトリ−(Col
d  Spring  Harb6r  Labora
tories) 、ニューヨーク、コールド・スプリン
グ・ハーバ−1゜種々の時点からの栄養要求変異株を下
に列挙する。
2.8     4/349 1.1%    芳香族
アミノ酸(Aro)(2)、トリプトファン(1)、 ヒスチジン(1) 35     55/7657.2%    Aro(
44)、ウラシル中アルギニン(4)、アデニン (1)、トリプトファン(1)、 不定(5) 91      94/40023.5%    Ar
o(66)、トリプトファン(9)、不定(2)、試験
せず(15) 91”      12/10012.0%    A
ro(11)、リジン(1)突然変異誘発の結果は、N
TGM理の時間とともに増加した高い突然変異の頻度を
示した。単一の突然変異の選択と一致する大抵の突然変
異を明らかにすることができた。しかしながら、ウェル
は事実突然変異の顕著な集塊形成を観察した。より高度
に突然変異誘発されると、観察される突然変異のスペク
トルはより狭くなった。芳香族アミノ酸(A ro)の
生合成に影響を及ぼす突然変異は、はるかに主要なりラ
スであった。NTGは突然変異の「ホットスポット」を
、ことにDNA複製起源付近に、有することができるこ
とが知られている[グエロラ(Guerola) 、N
、 J 、 L、イングラハム(I ngraham)
およびE、セルダーオルメド(Cerda −01me
do)、1971.ネイチャー(Nature) 、2
30 : l 22] aわれわれは、A ro突然変
異の高い比率が突然変異の分布におけるこのような非対
称を反映したことに関心をもった。したがって、われわ
れは遺伝子の欠陥を誘発する第2の方法として紫外線を
使用しt;。
紫外線を使用する突然変異誘発 このグロトコールは、紫外線からの細胞の遮断を最小に
して、その突然変異誘発作用を減衰するように案出した
。細胞は透明溶液中に再懸濁し、ここで透明溶液は細胞
のすべてを暴露できるために十分に浅かった( 2 m
mより小の深さ)。菌糸体内の他の細胞による細胞のか
げを克服するために、音波処理により菌糸体の集塊を2
〜3個の細胞の大きさに破壊した。別法は抱子の突然変
異誘発[ホブウッド(Hopvood) 、D、 A、
ら、1985、ストレプトマイセスの遺伝子操作(G 
enet icMnipulation  of  S
 treptomyces) ;実験室のマニュアル(
A  Laboratory  Manual)、ザ囃
ジョン◆インズ・ファンディジョン(TheJohnI
 nnes  F oundation) 、英国ノー
ウ(7チ:デリック(Delic) 、D、 A、ホブ
ウッド(Hopwood)およびE、J、7レンド(F
 riend)、1970、突然変異の研究(Mut、
 Re5= ) 、9 :167−1821またはプロ
トプラストの突然変異誘発であった。突然変異誘発後、
培養をいくつかの細胞分割のための生長させて、劣性遺
伝的欠陥を含有する突然変異に菌糸体内の小さい細胞集
塊を形成させた。発芽後成長した培養を、再び音波処理
して単一の遺伝子単位を生成させ、そして栄養要求変異
株について試験した。
GER培地中の菌株NRRL−15839の生長する培
養から約5XIO’の細胞を1000%のスクロース中
で洗浄し、前述のように音波処理し、ペトリ皿中の20
%のグリセロールのlOn+1中に再懸濁し、2 、4
3/m”/秒の紫外線(256nm)に暴露した。60
.90および120秒において、2.8mlの細胞を細
胞懸濁液から取り、そして細胞を希釈し、そして発芽後
成長のためGER平板上に接種した。紫外線処理した細
胞の未使用の部分を一70℃において貯蔵した。グロト
コールの他の変法は音波処理しない細胞の紫外線突然変
異誘発を包含した。グリシンの存在下に生長する細胞は
より小さい菌糸体を含有することが観察されたので(多
分細胞壁へのグリシオンの作用のため)、0.15%の
グリシンを含有するGER培地中で生長した細胞を、ま
た、紫外線で処理した。4日後、コロニ形成単位を、次
に示すように、決定した。
6(12−9XIO’ 4XlO@2XlO’  4X
lO’v 90秒8XlO’  lXl0’  lXl0’  2
.3XIO”v 120秒 2XlO”   lXl0’   1.6X
IO’  1.5XlO’■IV 生存曲線を第1図に示す。音波処理した細胞について、
対数関係は生存について紫外線への暴露時間の関数とし
て観察し、そして殺微生物は非常に広い範囲に及んだ。
紫外線処理前の音波処理しなかった菌糸体について、殺
微生物作用は、多分かげ(shading)のため、そ
れほど広い範囲にわたらなかった。より速い時点につい
て、音波処理しない菌糸体の生存は推定値を越えること
ある:菌糸体の集塊内の1つの細胞さえ生存する場合、
殺微生物作用は検出されない。
紫外線による殺微生物作用は突然変異誘発としばしば相
関関係をもつ[ミラー(Miller) 、 J 。
H,,1972、分子遺伝学における実験(E xpr
eiments  in  Mo1ecular  G
enetics) 、コールド・スプリング・ハーバ−
・ラボラトリ−(Cold  S pring  Ha
rbor  L aboratories)、ニューヨ
ーク、コールド・スプリング・バーバー]ので、これら
の集団は突然変異を含有するように思われた。各々につ
いての平板培養物を、発芽後成長した菌糸体をGER培
地中にこすり落すことによって収穫した。紫外線処理前
に音波処理した細胞懸濁液について、90秒間紫外線に
露出した細胞を使用した:紫外線で120秒間処理した
断片化しない菌糸体を収穫した。すべての場合において
、発芽後成長した菌糸体は音波処理によって断片した。
GER平板上で4日間インキュベーションした後、コロ
ニーをつまようじで最少寒天平板およびGER平板上に
移すことによって生長についてスクリーニングした。4
つの突然変異化培養物について、次の栄養要求変異株の
比率が観察された=GER中の生長および紫外線の音波
処理なし、O/370 (0,3%より少ない栄養要求
変異株)、GER中の生長および音波処理、3/285
(1%の栄養要求変異株)、GER+グリシン中の生長
および音波処理なし、0/388 (0゜3%より少な
い栄養要求変異株)、およびGER+グリシン中の生長
および音波処理、l/312(0,3%の栄養要求変異
株)。
音波処理は殺微生物作用および紫外線による突然変異誘
発の双方を増大したので、GER中で生長した細胞の突
然変異化培養物をスクリーニングい、そして紫外線前に
音波処理した。スクリーニングした1820の38栄養
要求変異株の合計、または2.1%を観察した。栄養要
求変異株は33のシスティンまたはメチオニン要求体、
3のヒスチジン要求体、lのスレオニン要求体、および
lの明らかにされない突然変異を示した。再び、突然変
異、この時有機イオウ(システィンまたはメチオニン)
の要求体のの集塊化が観察された。
栄養要求変異株および顔料突然変異の要約補充物質を含
むおよび含まない液状Aux培地中ですべてのクラスを
表わす栄養要求変異株を生長させ、そしてすべての栄養
要求体を確証した。GER平板からの新鮮なコロニーを
洗浄し、5mlのブロス中に再懸濁させ、そして28℃
において通気のすぐれたローラードラムを使用してイン
キュベーションした。2つの突然変異誘発手順を一緒に
すると、紫外線誘発突然変異およびNTG誘発突然変異
の間の栄養要求変異株の唯一の重複はヒスチジン要求体
であった。
栄養要求変異株の使用は次を包含する。2つのクラス(
Aro、およびウラシル−アルギニン要求体)は、後述
するプロトプラスト数台実験において使用した。C栄養
要求変異株の対立遺伝子は、所定の菌株またはコロニー
をマークし、そして汚染体から区別可能であることを保
証するとき価値がある。プラスミド上の栄養要求変異株
の突然変異を保証する野生型遺伝子をクローニングする
こおよび維持は、最少培地上で形質転換体を生長される
ことによって選択できた。有機イオウを要求する突然変
異は、LL−E33288複合体の各成分が4個のイオ
ウ原子を含有するので、LL−E33288複合体を標
識するために有用であることがある。
突然変異の広いスペクトルは、非致死突然変異がわれわ
れの突然変異化集団中に見出されうるであろうことを示
唆した。ある種の栄養要求変異株、例えば、NTG処理
した細胞のAro突然変異が主要比率を占める理由は確
かでなはない。と9領域はNTGのための突然変異のホ
ットスポット部位であろう。また、aro突然変異がN
TG処理または発芽後成長の間に選択的利点を与えるこ
とがあ 。
りうる。あるいは、%領域は、arg G位置がStr
eptomyces中に存在するように、菌株NRRL
−15839において高度に突然変異誘発性でありうる
[J、アルテンプフナ−(A 1 tenbuchne
r)ら、1984、モレキュラー・アンド・ジェネラル
・ジエネティックス(Molec、 Gen、 Gen
et、)、195.134−138ページ]。また、栄
養要求変異株のクラスについて逆選択することが可能で
ある。少なくともAros)リプドアアン、ヒスチジン
、スレオニンおよびリジンの栄養要求変異株について、
すべての補助物質を含有するAux培地と反対に、必須
補助物質のみを含有するAux培地中で細胞はより速く
生長した。多分、非必須アミノ酸は必須アミノ酸の摂取
を妨害し、生長を阻害するのであろう。スレオニンおよ
びヒスチジンの要求体は、野生型に比較して、GER培
地上の生長が非常に劣った。いずれの場合においても、
NTG処理培養物および紫外線TR培養物の双方 ゛を
他の所望の突然変異、例えば、遮断突然変異について試
験することが合理的であると思われた。
NTGJ&理細胞から観察された突然変異の1つの他の
クラスは顔料突然変異であった。菌株NRRL−158
39の野生型コロニーは、GER平板上の数日間インキ
ュベーション後、オレンジ色をつくる。いくつかのコロ
ニーが、それ以上オレンジ顔料を生成しないNTG処理
細胞から観察さンジ顔料を生成しないNTG処理細胞か
ら観察された。ある突然変異コロニーは白色であり、そ
しであるものは黄色であった。このような突然変異にお
けるわれわれの初期の関心は、野生型培養物における顔
料の生成がほぼLL=E33288複合体が生産される
時間に起こったという観察から由来した。しかしながら
、それ以上の実験は、顔料を生成する能力と薬物を生産
する能力との間に緊密な関係は存在しないことを示した
。なぜなら、これらの顔料突然変異はLL−E3328
8複合  。
体を生産する能力を維持したからである。これらの突然
変異は、野生型M icromonosporaのDN
Aの挿入のために、顔料をつくる能力を回復したプラス
ミドの形質転換における受容体として有用であろう。顔
料の生成は一時的に制御されるので、このような遺伝子
からの調節部位の分離は調節された発現系を確立すると
き有用であろう。
遮断突然変異を分離するために、多くのコロニ−を迅速
にスクリーニングできるように、発酵条件を小型化した
。コロニーは1.5mlの73−3夏培地[73−31
培地=1リツトルにつき20゜0gのスクロース、0.
1gのF eS 04 ” 7 Hzo zo、2g(
7)MgSO,・7Ht0,2−5g(1)CaCOs
(ミシシッピ・ライム)2.0gのマルコル・ペプトン
(Marcor  Peptone) 、5.0gの糖
蜜、0.1gのKl、水道水で構成した]中に、24ウ
エル(well)の平板(Corning)を使用して
直接接種した。クイックスクリーン(quick  5
creen)ニツイて、E、coliテスター菌株を接
種しであるBIA平板上に、3μlまたはlOμlの培
養ブロスをスポツティングした。BIA活性物質が野生
型培養物から3日以内に同定された。接種物は均一でな
かったので、培養物は1週耐全体にわたってインキュベ
ーションしてアーチファクトを排除した。
LL−E33288複合体の特定の成分を観察するため
に、抽出法は、また、能率的にしなくてはならなかった
。クイックスクリーンによってBIA活性物質について
陽性であった培養物について、0.8mlの培養物を3
25μlのアセトン/酢酸エチル混合物(8容量のアセ
トン15容量の酢酸エチル)とマイクロ遠心管内で混合
し、多管ポルテクサ−(Vortexer)  (Sc
ientific  Manufacturing  
I ndustries)で2分間渦形成した。
遠心後、l OμlをTLC(Kieselgel  
60F254、E M  S cience)上にスポ
ツティングし、そして前述のようにクロマトグラフィー
にかけたが、ただしその時間はちょうど20分であった
。TLC後、BIA平板上でLL−E33288複合体
の成分を検出するために十分な活性物質は、有機相の小
さい体積内に抽出できた。突然変異を貯蔵するために、
すべての培養物の60μlの試料を96ウエルの平板の
ウェル中で、40μlの50%のグリセロールに添加し
、そして−70℃で凍結した。
BIA活性についてクローンをスクリーニングすること
によって、いくつかの潜在的に興味ある非生産性誘導体
が得られた(第2図)。劣った生長または二次代謝に影
響を及ぼす多面発現に関係する外因的理由で、LL−E
33288複合体を生産できなかった突然変異を迅速に
排除しようと゛ した。顔料突然変異がBIA活性生成
物をつくったので、オレンジ顔料の生産はLL−E33
288複合体の生産と緊密に関連性がないことをわれわ
れは既に決定した。しかしながら、顔料の生産は、野生
型において、LL−E33288複合体と同時に起こる
。全面生長に生長できない、および/またはオレンジ顔
料をつくることのできない、非生産性体を廃棄した。3
5分間NTGで突然変異化しそして音波処理した細胞か
ら誘導し、試験した240クローンの全面生長に生長し
たlOの非生産性突然変異を分離した。35分間NTG
で突然変異化し、次いで胞子形成した細胞の、試験した
240クローンから、6つの非生産性体が得られ、そし
て紫外線で突然変異化した480から1つが得られた。
LL−E 33288複合体の成分の変更したプBIA
活性物質を生産したクローンを、上に概説したTLC板
を使用するスクリーニングによって、LL−E3328
8複合体の成分について試験した。LL−E 3328
8複合体の成分の変更したプロフィルを表わす突然変異
の収集のTLCを第3図に示す。
DR414と呼ぶ菌株NRRL−15839の1つの突
然変異は、NRRL−15839からのデルタ成分と同
時に移動するただ1つの可視の成分を生産する。他のも
の(DR1122)は、菌株NRRL−15839によ
って生産される主要成分であるベータ成分をつくらない
。いくつかのもの(DR823、DR1310%DR1
523)は、菌株NRRL−15839より速く移動す
る成分のよりかなり多くを生産する。これらの突然変異
の4つは、発芽後成長後音波処理したNTG突然変異化
細胞からのものであり、そして他のものは胞子形成した
NTG突然変異化細胞からのものである。これらの突然
変異がLL−E33288複合体の新規な誘導体を生産
するかどうか、あるいは菌株NRRL−15839がま
た生産する少量成分のより多くをつくるかどうかを、わ
れわれは知らない。新規な生成物が1または2以上の突
然変異によってつくられる場合、それらは非常に価値が
ある種類の特性(すなわち、減少した毒性)を示しうる
であろう。それらが特定の成分、例えば、DR414に
ついてデルタを強調する場合、それらはこの成分を分離
するとき有用でありうるであろう。
遮断突然変異によるLL−E33288複合体の同時合
成 所定の突然変異がLL−E 33288複合体の経路に
おいて特異的に遮断されることを立証するために、混合
した培養物からの生産物についてアッセイした。2つの
突然変異がBIA活性物質を同時合成することができた
場合、1つの突然変異は第2突然変異の欠陥を克服する
前駆体を提供できるであろう。下の線図は直線の生合成
の経路である: 酵素1    酵素2    酵素3 化合物A−−化合物B−−−化合物C−→酵素4 化合物D −L L −E 33288突然変異D46
は酵素2中に欠陥を含有し、したがって活性生産物をつ
くることができないであろう。DR43が酵素l中に遺
伝的欠陥、この経路におけるより速い段階、を含有する
と仮定する。
菌株DR46が中間体を生産し、そしてそれを生長培地
中に分泌する場合、菌株DR43は酵素2.3および4
を含有するので、菌株DR43は中間体を取り上げ、そ
れを最終生成物に変換するであろう。化合物Bを取り上
げることによって、DR43はその遺伝的に欠陥のある
遺伝子生産物(酵素l)をバイパスする。
2つの突然変異の菌株によるBIA活性物質の同時合成
は、各々がLL−E33288複合体の生合成通路にお
いて特異的に遮断されることを、明白に立証しない。突
然変異は、例えば、実際に栄養的欠陥を含有するが、栄
養要求変異株の大部分のクラスは少なくとも多少の生産
物をつくる。
(アデニン要求体および2つのクラスの明らかにされな
い突然変異のみが試験した栄養要求変異株のBIA活性
物質を生産できなかった。)他の可能性は、1つの突然
変異がLL−E 33288複合体の必須糖成分を生産
することができないということである。このような欠陥
は栄養要求変異株としてはっきり現われないが、欠陥は
生長培地にLL−E33288複合体に対して特異的で
ある化合物よりはむしろ糖を補充することによって、軽
減できるであろう。しかしながら、LL−E33288
複合体の経路において特異的に遮断される突然変異は、
不安定な中間体、あるいは分泌または摂取されないもの
を生産する場合、同時合成できないであろう。
われわれは、各突然変異をGER培地中で飽和に生長さ
せ、洗浄し、モして5×濃縮培養物を一70℃において
20%のグリセロール中で貯蔵することによって、前記
突然変異の接種物を調製した。次いで、5μlの所定の
突然変異に5μlの他の突然変異を接種するか、あるい
は1Oplの単一の突然変異を24ウエルの平板中の7
3−31生産培地のウェル中に接種した。1週後、培養
物 ゛をBIA平板上にスポツティングしてLL−E3
3288複合体を検出した。突然変異DR43の同時合
成の1例を第4図に示す。単独で生長した菌株DR43
はBIA活性物質を生産しないが、いくつかの他の突然
変異とともに生長した菌株DR43はLL−E3328
8複合体を同時合成し  ・た。同時合成の要約を第5
図に示す。2つの突然変異が同時合成する場合、それら
は明確な補体化群中に存在する;それらが同時合成でき
ない場合、それらは経路において同一の段階に影響を及
ぼす突然変異を含有するか、あるいは異なる機能に影響
を及ぼすが、前述の理由で補足することができないであ
ろう。
同時合成の結果は、すべての非前駆体が少なくとも2つ
の他の突然変異とともに同時合成することを示した。1
7の突然変異のうちで、突然変異の音波処理する能力に
基づいて、あるいは他の突然変異との明確な同時合成パ
ターンに基づいて、11の補体化群を観察した。期待さ
れるように、LL−E33288複合体中に存在するよ
うな複雑な分子について、少なくとも40の生化学的段
階が含まれるであろう。
究極的には、われわれは興味ある突然変異に焦点を合わ
せた。い(つかの突然変異は漏出突然変異(DR91,
DR58、DR112、DR194)であることを明ら
かにし、そして漏出突然変異によって生産されれる活性
物質の少量は引続く実験を妨害したので、それらの漏出
突然変異を追跡しなかった。さらに、DR172は栄養
要求性であったので、広範には検査しなかった。4つの
菌株は同一の大きい補体化群のもの、であっt;ので、
直接の考慮から除外し、そしてそれらを容易に区別する
ことができなかった。
液体培養における同時合成実験は、1対のどの突然変異
がある化合物を分泌し、そしてどの突然変異が化合物を
活性生成物に変換するかを決定できなかった。分泌体お
よび変換体を区別するために、細胞は0.5%の低融点
アガロース(S eakem)を含有する半固体マトリ
ックス中の生産培地上にスポツティングして、最大の拡
散を可能とした。
突然変異の培養物を対で互いに隣接させてスポツティン
グした。1週の生長後、各スポットは寒天表面からコロ
ニーを剥し落すことのよって収穫し、そして細胞を20
μlのアセトン−酢酸エチル(1/ l Sv/ v)
で処理した。3μlの酢酸エチル相をBIA平板上にス
ポツティングした。より強いシグナルを生産した対の突
然変異は変換体であり、そして他方の菌株は分泌体であ
ると思われた。LL−E33288複合体は寒天中で拡
散するので、結果は明確ではない。平板上のすべてのコ
ロニーが検出可能な物質を同時合成するわけはない。な
お、われわれは次の対の突然変異を予備的に決定するこ
とができた: 分泌体     変換体 DR210DR43 DR118DR43 DR58DR43 DR1712DR43 DR1316、DR43 DR46DR43 DR43DR1510 DR123DR46 DR58DR46 DR1712DR46 DR1316DR46 DR123DR1316 DR118DR1510 変換する菌株が分泌する突然変異より速く遮断されると
仮定すると、遺伝的順序を生合成経路について確立する
ことができる。LL−E3328B複合体の経路の仮の
地図は、それらの遮断に従つう突然変異の順序は次の通
りである。
DR1510→ DR43→DR46→ DR1316→ DRIO14→ DR58→DR1712→ DR210−・ ・ ・ ・ LL−E 33288複合体 突然変異DR43は、詳細に検査するためにとくすぐれ
た候補であることが明らかになった。それはいくつかの
異なる突然変異と同時合成し、実験は突然変異DR43
が通常変換する菌株であることを示唆した。したがって
、DR43は、多分、経路において早期の遺伝的欠陥を
含有する。DR43(変換体)およびDR46(分泌体
)が同時生長するとき、平板上に最も明瞭な輪郭が観察
された。  ′ 突然変異の菌株DR46の生存しうる培養物は、アメリ
カン・サイアナミド・カンパニーの医学研究部(Med
ical  Re5eachDivision、Ame
ricanCyanamid  C0m1)anY、l
P earl  R1ver、 N ewY ork)
によって維持されている。さらに、アメリカン・タイプ
・カルチャー・コレクション(American  T
ype  Cu1ture  Co11ection。
12301   Parklawn  Drive、 
 Rockville。
Maryland、 U、 S 、 A、 20852
)に1987年3月6日に受託されており、そしてその
永久収集物に加えられている。このような受託所によて
、それは表示ATCC−53591を割当てられている
。このような培養物の利用は、本願の係属中、それに対
して権限を与えられた特許および商標の局長によって、
37  C,F、R,@l。
14および35  U、S、CIJ122の規定に従い
決定され、そしてこのような培養物についての公衆への
利用に対するすべての制限は本願が許されたとき最終的
に排除される。
LL−E33288複合体の生合成の中間体の特性づけ 突然変異DR46は突然変異DR43がBIA活性物質
に変換する中間体を分泌すると思われたので、中間体の
少なくと多少は菌株DR46の培養物の上澄み中に見出
されるであろう。次いで、菌株DR46からの細胞不合
補助物質を加え戻し、菌株DR43に活性物質を生産さ
ることが可能であろう。このような実験の成功は中間体
の安定性に依存する;それが非常の安定である場合、菌
株DR43およびDR46を一緒に生長させて同時合成
を検出することが必要であろう。
推定上の中間体は菌株DR46の培養物の上澄み中に見
出されるであろう。あるいは、それは主として細胞の内
側に存在することがある。菌株DR46培養物の異なる
成分を菌株DR43の培養物に補充して、これらの可能
性を区別することを決定した。中間体の分泌時間は未知
であるので、菌株DR46の5つ時間を決めた培養物の
混合物を調製した。73−31生産培地中で1,2.3
.4および6日の生長後、5つの5嘗lの培養物を収穫
した。上澄みと細胞沈殿物との混合物を調製した。細胞
沈殿物の混合物を10m1のH,O中に再懸濁し、そし
て合計17分間音波処理した(15秒/分の音波気運、
氷のジャケット付き、MSESoniprep  l 
50.15ミクロン)。はんのわずかの細胞は無傷にと
どまった。音波旭理物を遠心して破片を除去し、そして
ろ過滅菌した。LL−E33288複合体はほとんど酢
酸エチル抽出液中に見出され、そして水中に非常には可
溶性でないので、沈殿物を酢酸エチルで抽出する。酢−
酸エチル抽出物を乾燥し、そしてエタノール中に再懸濁
した。
菌株DR46の培養物を24ウエルの平板中に接種し、
1.2または3日後、菌株DR46混合培養物の成分を
添加した。4日の生長後、BIA活性は培養物をスポツ
ティングすることによって試験した。(大きい体積の菌
株DR46培養物の上澄みをウェルに添加するとき、一
定体積を維持するために・、等体積の菌株DR43培養
物を遠心し、そして沈殿物を加え戻した。)DR43に
よるBIA活性物質への変換後、菌株DR46の150
μlの上澄みは検出すべき十分な補体化物質を含有した
。菌株DR46からの上澄みの750μlは、少なくと
もDR43およびDR46の同時合成と同程度によく、
菌株DR43を補足した。
1.7nalの等価量(equivalent)の細胞
の音波旭理物はほぼ150μlの上澄みと同程度によく
補足し、中間体は主として培養物の上澄み中に存在し、
そして細胞の内側には存在しないことを示した。菌株D
R46細胞の8■lの等価量からの酢酸エチル抽出物(
10μlの濃縮抽出物)は検出可能に補足しなかった。
菌株DR46によって生産される補体化因子(comp
lementing  factor)は主とし培養物
の上澄み中に見出されたので、われわれの努力をそこに
集中させた。菌株DR46培養物からの上澄みの1.3
■lを1または2日間インキュベーションし、菌株46
培養物からの130μlの上澄みを3.4および6日間
インキュベーションし、ウェル中で2日間生長後の菌株
DR43の培養物に添加し戻した。第4日に、試料をB
IA平板上にスポツティングして、補体化因子が上澄み
中に存在するかどうかを決定した(第6図′)。BIA
の応答を精確に観察するために、未希釈、l/3に希釈
、およびl/l Oに希釈した培養の試料の3μlをB
IA平板に適用した。補体化因子はインキュベーション
したDR46培養物からの130μlの上澄み中に検出
されず、因子は第1日からの菌株DR46の上澄みから
検出され、そして第2日までに肉眼で検出可能な量の補
体化因子が検出された。上澄み中の補体化因子の濃度は
、第3日までに実質的に増加し、そして第4EIにピー
クに到達した。菌株DR46培養物の上澄み中の補体化
因子の出現は、野生型においてつくられるLL−E33
288複合体の出現と並行する。野生型におけるLL−
E33288複合体の場合におけるように、補体化因子
は生長の終り後の生命環において合成される(下を参照
)。一時的な合致は、補体化因子がLL−E33288
複合体の特異的前駆体であり、そして、例えば、生長お
よび飽和期の間に合成される糖でない、という概念と一
致する。さらに、73−3I培地(ヒスチジンおよびロ
イシンを添加した)中で生長させたS、1ividan
s  T K 54からの上澄みは、菌株DR43に補
体化因子を提供しない。
補体化因子の化学的性質は、また、それが単糖ではなく
、むしろ疏水性領域と親水性領域とをもつ前駆体である
ことを示す。補体化因子は、酢酸エチルの添加後、有機
相中に分配されず、等体積の第2ブタノールを上澄みに
添加したとき、補体化因子の約1/2は第2ブタノール
相中に入った。
n−ブタノールを上澄み七混合したとき、補体化因子の
約1/3はn−ブタノール中に見出された。
われわれは、菌株DR46の大きい培養物から補体化因
子を分離するために使用できる方法を開発した。補体化
因子はアンバーソーブ(ambersorb)XAD−
2ビーズ(Roh+s  and  Haas)に吸着
する。それは80%のメタノールでほとんど完全に溶離
される。この方法の規模を300リツトルの発酵器から
補体化因子を分離できるまで大きくした。菌株DR46
の培養物をろ過し、そして発酵の上澄みをXAD−2ビ
ーズの30リツトルのカラムに適用する。補体化因子の
大部分はカラムに保持され、次いでこれを50%の水−
メタノールの混合物で溶離する。凍結乾燥後、補体化因
子を逆相カラムクロマトグラフィーにより、LH20ま
たは018マトリツクスを使用して、さらに精製した。
菌株DR43およびDR46が同時生長したとき、LL
−E33288複合体のベータ成分のみがつくられた(
第7@参照)。菌株DR43の培養物に補体化因子を補
充したとき、同一の結果が観察された。これらの観察お
よび補体化因子の化学的性質に基づき、われわれは補体
化因子が、糖、ならびにベンゼン環(疎水性領域に寄与
する)を含有すると推測する。
LL−E33288のシュードアグリコン(pseud
oaglycone)断片は、ラムノース誘導体および
アミノ糖を欠く。アミノ糖の損失は、生物学的活性の1
00倍の損失を生ずる。精製されたシュードアグリコン
を3つの遮断突然変異、菌株DR43、DR46および
DR1316、の73−31培地に、60時間の培養後
、添加した。各場合において、遮断突然変異は、第7図
に示すように、シュードアグリコンをLL−E3328
8複合体に変換することができた。こうして、各菌株は
アミノ糖誘導体およびラムノース誘導体をつくり、そし
てそれらをシュードアグリコン断片(またはシュードア
グリコンの一部)に結合する能力を保持した。各突然変
異について、シュードアグリコンは遺伝的遮断をバイパ
スするか、あるいはそれを克服した。
プロトプラスト化、再生および遺伝子の転移プロトプラ
スト化(protoplasting)は、一般に、細
胞壁をリソチームで消化することによって達成される。
生長培地ヘゲリシンを添加すると、多分細胞壁のペプチ
ドグリカン中へのグリシンの取り込みのため、アクチノ
ミセテス(A ct inomycetes)のプロト
プラスト化をしばしば促進する。
プロトプラスト化の手順の例は参考書に収集されている
[ホブウッド(Hopwood) % D 、 A 、
ら、1985、ストレプトマイセスの遺伝子操作(Ge
netic  Mn1pulation  of St
reptomyces);実験室のマニュアル(A L
aboratory Manual)、ザ・ジョン・イ
ンズ・ファンディジョン(TheJ ohn  I n
nes  F oundation) 、英国ノーウ(
7チ]。
菌株NRRL−15839をプロトプラスト化するため
に、−70℃で20%のグリセロール中で貯蔵した、1
夜の5×濃縮の細胞の250〜500μlを、0.15
%のグリシンおよび20ミリモルのCaC1tを含有す
るGER培地(lリットルにつき、3gの牛肉エキス、
5gのトリプトン、Igのデキストロース、24gの可
溶性澱粉および5gの酵母エキス、pH7,6[キム(
Kin) 、K。
S、およびり、Y、リュー(Ryu)、1983、酵素
および微生物の技術(E nz、  and  M i
c。
TechnoL ) 5 : 273−280] )に
28℃において接種した。細胞を48〜60時間生長さ
せ、そしてオレンジ色の顔料が現わ、れた後8時間まで
インキュベーションを続けた。すぐれたプロトプラスト
化には激しい通気が必須であることがわかったので、細
胞は20 Orpmにセットした床振盪器上の250m
1のバッフル付きビーカー内テ生長させた。3個のガラ
スピーズ(約4m■の直径)の添加は塊状化を防止し、
そして培養物の生長およびプロトプラスト化を促進した
細胞を320 Orpmで10分間遠心することによっ
て収穫した。沈殿を50o+1の10.3%のスクロー
スで洗浄し、そして再び遠心した。沈殿を2mg/ax
のリゾチーム(CalbiochemまたはS igm
a)を含有するプロトプラスト化緩衝液の4+ml中に
再懸濁した。プロトプラスト化緩衝液は、pHが7゜6
であった以外、L緩衝液[ホブウッド(Hopv。
od) 、D、 A、ら、1985、ストレプトマイセ
スの遺伝子操作(Genetic  Mn1pulat
ion  of3 treptomyces) ;実験
室のマニュアル(A  Laboratory  Ma
nual) 、ザ争ジ3ンーインズ・ファンディジョン
(The  J ohn  I nnes  Foun
dation) 、英国ノーウィッチ]に類似した。P
緩衝液【キム(Ki■)、K、S、およびり、Y、 リ
ュー(Ryu)、1983、酵素および微生物の技術(
Enz、  and  Mic、  Technol、
 ) 5 : 273−2801の変更した形態を、ま
た、使用した:MgC1,は25ミリモルであり、モし
てCaC1,を50ミリモルにし、そして再びpHを7
.6にした。細胞は1〜2時間30℃でインキュベージ
腸ンした。プロトプラスト化の程度は相対照顕微鏡(p
hase  contrast  +i+1crosc
ope)で監視した。
菌糸体はプロトプラストの発現を阻害することがあるの
で、リゾチーム処理した培養物のほとんど大部分がプロ
トプラスト化してしまうまで待つごとが有利であった。
われわれは一般に95%より多いプロトプラスト化を観
察した;細胞の80%より少なくかプロトプラストであ
った場合、培養物を使用しなかった。プロトプラスト化
時間が2時間を越えた場合、われわれは有効な再生(r
egenerat 1on)を観察しなかった。すべて
の場合において、プロトプラスト化後、MgC1,およ
びCaCl2の最終濃度を、それぞれ、25ミリモルお
よび50ミリモルに調節し、そして体積をわれわれの変
更したP緩衝液中で3+ilにした。プロトプラストを
菌糸体から分離するために、記載されるように[ホブウ
ッド(Hopvood) 、D、 A、ら、1985、
ストレプトマイセスの遺伝子操作(Genetic  
Mn1pulation  of  Streptom
yces);実験室のマニュアル(A  Labora
tory  Manual)、ザ・ジョン・インズ・フ
ァンディジョン(TheJ ohn  I nnes 
 F oundation) 、英国ノーウ(−/チ]
、調製物をまず変更したP緩衝液ですすいだ後、綿を通
してろ過した。あるいは、変性P緩衝液ですすいだ後、
孔大きさ5ミクロンのシュレイヒア−(5chleic
her)およびシュネル・スパータン(Schnell
  5partan)フィルターを通してろ過した。
プロトプラストは再生培地上に接種することによって再
生し〔キム(Kin) 、K、S、およびり。
Y、リ−L−(Ryu)、1983、酵素および微生物
の技術(Enz、  and  Mic、  Tech
nol、)5 : 273−2801 、ただしスクロ
ースの最適濃度は0.15モルであることがわかった。
軟質寒天中にプロトプラストを重ねることによって、再
生効率は改良された。プロトプラストは、30℃で10
日ないし2週のインキュベーション後に、再生して可視
のコロニーを形成した。
再生条件の変更をいくつか試みたが、成功しなかった。
菌糸体はスクシネートおよびグリセロールG: 高イ濃
度で耐えることができないので、スクシネートおよびグ
リセロールは浸透圧安定剤として無効であった。好まし
い炭素源であるスクロースは浸透圧安定剤として必要で
あったので、別の単素源の存在は、多分、再生培地中に
おける炭素の利用を変更しないであろう。他の窒素源、
0゜5%の酵母エキスまたは0.5%のNZアミンをア
スパラギンの代わりに使用した。アスパラギンを含有す
るわれわれの再生培地に比較して、合理的な頻度にもか
かわらず、ムコイドのコロニーのみが観察された。コロ
ニーは、顕微鏡において、L形態を含有するが、菌糸体
を含有しないことが明らかであった。さらに、コロニー
は浸透圧安定剤を含有する培地上で複製しなかった。明
らかに、プロトプラストの再生は、生長制限窒素源を含
有する培地において増大した。われわれは、また、浸透
圧安定剤としてスクロースを含有するGER培地上でプ
ロトプラストを再生する試みをし、そして多少の無機質
を添加した。再び、ムコイドのコロニーが合理的頻度で
生長したが、それらは、また、L形態であることがわか
った。
次は典型的な成功した実験である。細胞を、前述のよう
に、収穫し、そしてリゾチームで処理した。30℃で1
.5時間後、顕微鏡観察によって推定して、細胞の約9
5%はプロトプラストであった。ペトロッ7−ハウザー
(P etroff −Houser)計数室を使用し
て、プロトプラストの濃度は2゜9 X 10 ’/m
lであると決定された。培養物を5ミクロンのフィルタ
ーによっておだやかにろ過した。プロトプラストのみ、
および約1%の小さい菌糸体の断片が顕微鏡で観察され
た。プロトプラストの力価は2.35XlO’/mlで
あった。プロトプラストを変更P緩衝液中で希釈し、そ
して再生培地上に配置した。培養物を、また、スクロー
スを欠く再生培地上に配置して、プロトゲラスト化しな
かった細胞を測定した。なぜなら、プロトプラストは浸
透圧安定剤の不存在下に溶菌するであろからである。3
日後、数個のコロニーは希釈率が低い接種物について、
0.15モルのスクロースを含む平板または含まない平
板について見ることができた。これらのコロニーは、多
分、プロトプラスト化されていない細胞を表わすであろ
う、、1週後、より多くのコロニーはプロトプラストの
再生のために見ることができた。11日後、はとんどす
べての生存すφプロトプラストは可視のコロニーを形成
した。
0.2モルの 豊艶  コロニー コロニー  ’lJ
%スクロース         /ya(1−5X 1
0−’   394  8X 10’     0.3
%−5X to−’    12  2X 10’  
   0.9%+  5X 10−”   3240 
 6.5X 10’    2.8%+  5xlO−
1501xlO’     4.2%0.2モルのスク
ロースが菌糸体の生長を阻害してさえ、スクロースの添
加はプロトプラスト培養物の生存を増大した。したがっ
て、スクロースを含有する培地中の生存の増大はプロト
プラストの再生の増大のためである。われわれの1〜4
%の再生の頻度は形質転換系について合理的である。
菌株NRRL−15839の誘導体間の遺伝子の交換を
立証するために、2つの栄養要求変異株間のプロトプラ
ストの融合を試みた。菌株DR226は生長のためにウ
ラシルおよびアルギニンを要求し、これに対して菌株D
R146は芳香族アミノ酸、パラ−アミノ安息香酸およ
びパラ−ヒドロキシ安息香酸を要求する。両者の突然変
異は1つの生化学的反応(ウラシル−アルギニン要求体
についてカルバモイルホスフェートの生産および芳香族
アミノ酸の要求体についてシキミ酸の経路の生産)に影
響を及ぼす単一の遺伝的欠陥を含有することがある。2
つの突然変異のプロトプラストを融合することによって
、われわれは野生型細胞の再生を観察しようとした。
細胞を前述のようにプロトプラスト化した。100μl
のDR226をマイクロ遠心管中で100μlのDR1
46と混合した。10秒間の遠心後、上澄みを注ぎ出し
、そしてプロトプラストを上澄みの残りの滴の中におだ
やかに再懸濁した。
0.8mlの50%のプロピレングリコール溶液(PE
G  1000、B aker)を、前述の変更したP
緩衝液に添加した。プロトトロ−7について選択するた
めに、0.01%のカサミ酸を欠く最少再生培地を使用
した。なぜなら、再生の頻度はカサミ酸の存在下または
不存在下にほぼ同一であることがわかなからである。浸
透圧安定剤を含有しないか、あるいは0.2モルのスク
ロースを含有する最少再生寒天培地上に50μlの融合
したプロトプラストを載せた。また、対照としてプロト
プラスト化前の培地の等体積を配置した。4週後、次の
コロニーが観察された。
DR146菌糸体   0 DR226菌糸体   l DRl 46および DR226菌糸体   1      30菌糸体の中
のプロトトロープの数は事実上0であり、これに対して
プロトプラスト化、2回の培養および融合後、小さいが
有意な量のプロトトロープが再生した(観察された最大
の再生頻度は4%である)つ栄養要求変異株のプロトト
ロープへの融合は、NRRL−15839の誘導体内で
遺伝子を転移する能力を立証する。今や、突然変異を1
つの菌株から他の菌株へ転移させることが可能である。
われわれは、NRRL−15839内の内因性プラスミ
ドを検出しなかった。M icromonospora
はS treptomycesに関係づけられ、そして
いくつかのS treptomycesのプラスミドを
入手することができる。したがって、われわれは、S 
treptomVC6Sのよく特徴づけられたプラスミ
ドが菌株NRRL−15839中で、また、複製するで
あろうという希望をもって、その誘導体を構成すること
を決定した。
S treptomycesのプロモーターのグローブ
プラスミドplJ486は、多コピーグラスミド上にチ
オストレプトン耐性遺伝子を含有する。そのレプリコン
はS treptomyces内に広い宿主範囲を有す
るpI J I Olから誘導するので、plJ486
はM icromonosporaのプラスミドのため
のすぐれた出発点であると思われた。菌株LL−E33
288はGER培地または最少寒天培地中で少なくとも
500μg/mlのチオストレグトンに対して部分的に
抵抗性であるので、チオストレプトン耐性遺伝子は有用
ではなかった。しかしながら、plJ486は、また、
他の潜在的に有用な遺伝子、すなわち、aphllと呼
ぶトランスボゾンtn5からのカナマイシン耐性遺伝子
を含有する。しかしながら、aphl I遺伝子はプロ
モーターを欠き、それゆえ非常に低いレベルで発現され
る。プロモーターは、aphllのための解読領域より
上流のポリリンカー中に断片をクローニングし、S。
11vidansを形質転換し、そしてカナマイシン耐
性について選択またはスクリーニングすることによって
同定できる。aphll遺伝子を「活性化」するために
、2つの理由で菌株NRRL−15839からのDNA
断片を挿入した0M icromonosporaから
誘導されたプロモーターは、グラスミド誘導体がS、 
1ividansから菌株NRRL−15839中に転
移されるとき、aphllの発現を推進するほとんどの
機会を与えるであろう。また、Micr。
qonosporaから誘導されたDNA配列は、プラ
スミドのレプリコンが菌株NRRL−15839中で機
能できなかった場合、相同的再組換えによって、プラス
ミド誘導体の維持の別のモードを可能とするであろう。
プラスミドは、記載されているように〔ホブウッド(H
opvood) 、D、 A、ら、1985、ストレプ
トマイセスの遺伝子操作(Genetic  Mn1p
ulation  of  S treptowayc
es) ;実験室のマニュアル(A  Laborat
ory  Manual) 、ザ・ジョン鳴インズ・フ
ァンディジョン(T he  J ohn  I nn
esF oundation) 、英国ノーウィッチ]
、S、1ividans  T K 54 /pi J
 486から、Na0H−SDSを使用するアルカリ性
溶菌および酸性にアセテートを使用する中和によって、
次いでCsC1密度勾配遠心[マニアチス(Mania
tis) 、T、、E、F、7リトシ(F ritsc
h)およびJ、サムブロック(S ambrock)、
1982、分子クローニング(Molecular  
Cloning) 、:!−/l/ドー2プリング・ハ
ーバ−・ラボラトリ−(Cold  Spring  
Harbor  Laboratories) 、ニュ
ーヨーク州、コールド・スプリング・ハーバ−〕によっ
て調製した。次いで、精製したプラスミドを独特Bam
HI  ’部位で消化し、フェノールで抽出し、そして
酢酸アンモニウムおよびエタノールで沈殿させた。線状
プラスミド分子を子牛腸アルカリ性ホスファターゼで処
理して、ベクターとベクター末端との結合を防止した。
酵素を加熱キリング(ki l l ing)およびフ
ェノール抽出によって不活性化な。酸性化Naアセテー
トおよびエタノールで沈殿させた後、ベクターをTE緩
衝液(10モリモルのトリスpH8,1ミリモルのED
TA)中に再懸濁して結合のために準備した。すべての
酵素はベーリンガー◆マンハイム(B oehring
er  Mannheim)からのものであり、そして
すべての反応はペーリンガー・マンハイムが推奨するよ
うにして実施した。M icromonosporaの
染色体のDNAを、記載されるように[ホブウッド(H
opwood) 、D、 A。
ら、1985、ストレプトマイセスの遺伝子操作(Ge
netic  Mn1pulation  of St
reptomyces);実験室のマニュアル(A  
Laboratory  Manual)、ザ・ジョン
・インズ・ファンディジョン(TheJ ohn  I
 nnes  F oundation) 、英国ノー
ウィッチ]、リゾチーム−EDTA、プロイテナーゼに
1SDS、およびフェノール−クロロホルム抽出を用い
て分離した。イソプロパツール沈殿後、DNA調製物を
1mlのTE中に再懸濁させた。培養物のストリーク(
streak)はそれが純粋であることを明らかにした
菌株NRRL−15839から調製した染色体DNAを
BamHIおよび5au3Alで消化し、そして断片を
0.5μmの直線化pIJ486ベクターに結合した。
インサート対ベクターのモル比は3であった。16℃で
1夜結合した(ベーリンガー・マンハイムの酵素および
方法)後、このDNAを記載するように使用してS、1
ividans菌株TK54を形質転換した。5au3
A1インサートに結合したpIJ486について、結合
したDNAの0.25μgをTK54のプロトプラスト
に添加し、これらをR5平板上に接種し、そして28℃
で30時間インキュベーションした。平板をl/lO体
積の100μg/mlのカナマイシンを含有するR5軟
質寒天で覆った。BamHIインサートに結合したpI
J48Bについて、結合したDNAの0.5μgをTK
54のプロトプラストに添加し、そしてアリコートを2
つの平板上に接種した。示されているように、一方をカ
ナマイシンで覆い、そして他方をオーバーレイ(ove
r 1ay)中の500μg/+nlのチオストレプト
ンで覆った。
後者の平板について、チオストレプトンの添加後、71
のコロニーが生長した。カナマイシンで覆った平板につ
いて、細胞の菌叢は平板のほとんどの上で生長した。平
板のパッチ(pitch)から、単一のコロニーを分離
した。示した薬物を含有する最少培地上にコロニーを複
製したとき、次の結果が観察された。
BamHI断片 Bag)(I断片 カナマイシンで直接選択したコロニーの多くは、アーチ
ファクトであった。形質転換体Aにおいて、わずかに5
つのコロニーがチオストレプトンに対して抵抗性であっ
た。チオストレプトン感受性コロニーは真の形質転換体
でないと、われわれは推定した。形質転換体Bはより有
効であった。45の推定上のカナマイシン耐性形質転換
体のうちで、43はまたチオストレプトンに対して耐性
であった。チオストレプトンで選択した56のコロニー
(形質転換体C)のうちで、54は再試験したときチオ
ストレプトン耐性であることが示され、これらのうちで
、34は少なくとも限界的にカナマイシン耐性であり、
はとんどのインサートがaphIIの発現を命令するプ
ロモーターを含有することを示唆した。
カナマイシンおよびチオストレプトンに対して抵抗性の
コロニーがプラスミドを含有することを示すために、2
0μg/mlのカナマイシンを含有する平板上のコロニ
ーの大きさによって判定して、最もカナマイシン耐性で
あった17のコロニーからプラスミドを分離した。10
は形質転換体Aからのものであり、1はは形質転換体B
からのものであり、そして6はは形質転換体Cからのも
のであった。プラスミドのミニプレプ(minipre
p)はプラスミドの調製について前述したように調製し
たが、ただしミニブレプは記載するように規模を小さく
した。プラスミドは各調製物においてアガロースゲルの
電気泳動によって観察した。コロニーの少なくとも14
はplJ486の対照より大きいプラスミドを含有し、
カナマイシン耐性がaphll遺伝子の前のM icr
omonosporaのDNAインサートのためである
ことを示唆した。インサートの大きさは、5つのクロー
ンについて、制限分析によって、15Kbp(プラスミ
ドpPP4)、1.8Kbp(プラスミドpPP8) 
、0.7Kbp。
0.7Kbpおよび0.4Kbp(プラスミドpPP1
4)であると決定された。カナマイシンに対してして最
も耐性であり、プラスミドpP P 4、pPP8およ
びpPP14を有する、3つのクローンを、200μg
/mlのカナマイシンおよびチオストレプトンを含有す
るR5寒天培地上で、および20μg/mlのカナマイ
シンを含有する最少平板上で生長させた。
これらの3つのプラスミド中のMicromonosp
oraのインサートの存在は、シュレイヒア−(S c
hleicher)およびシュエル(s chuetl
)におけるようにして、サザン分析によって確証された
(第8図) @ MicromonosporaのDN
AおよびS−1ividansTK54の染色体DNA
をBamHIで消化し、0.5%のアガロースゲルに適
用し、そしてアルカリ中で変性した。DNAをニトロセ
ルロースのフィルターに移し、これをニック翻訳(NE
Nニック翻訳キット)によってα−3!P−dCTPで
標識した精製したpP P 8のDNAのプローブ(0
,5μg)とハイブリダイゼーションした。
約10 ’cpI11のプローブをフィルターと42℃
においてハイブリダイゼーションさせた。最後の洗浄は
55℃において0.lX5scによって実施した。レー
ンlは対照であり、BamHlで制限したpPP8の1
50μgへのプローブのハイブリダイゼーションを示す
。プローブは2つの帯にハイブリダイゼーションする;
l−8Kbpのインサートの帯、および6−2Kbpで
ある、直線のplJ486を表わすより大きい帯。レー
ン2において、BamHIで制限した2、5μgのM 
icromonosporaのDNAを適用した。1.
8Kbpの帯は明瞭に見ることができ、M icrom
onosporaの染色体中のその存在を示す。S 、
 1ividansのDNAを含有するレーン3はシグ
ナルを与えず、1.gKbp+ts。
1ividansのゲノムから誘導されないことを示し
ている。pPP4を使用して同様な実験を実施した。
プローブをBamHIで消化したM icromono
sporaのDNAヘハイブリダイゼーシッンしたトキ
、2つのBamHIの帯が観察され、そしてS、 1i
vidansのDNAでは帯は観察されず、pPP4が
8゜5Kbpまで付加したM icromonospo
raからのBaIIH1断片の2つを含有することを示
している。
pPP14をプローブとして使用したとき、BavaH
lで切断したM icromonosporaのDNA
をプロービングしたときにのみ、帯が再び観察され、S
1ividansのDNAでは観察されなかった。した
がって、すべての3つの場合において、aphll遺伝
子の発現を活性化するDNAインサートは、菌株NRR
L−15839から誘導された。
プラスミドpPP4、pP P 4、pp P 8およ
びpPP14を宿主S、 1ividans  TK5
4中に配置し、そして1987年3月6日にアメリカン
・タイプ・カルチャー・コレクシ理ン(A meric
anType  CuHure  Co11ectio
n、  l 2301Parklawn  Drive
、Rockville、Maryland、IJ。
S、A、20852)に受託され、そしてその永久収集
物に加えられた。pp P 4は、このような受託所に
よって、菌株表示ATCC−67343を割当てられ、
そしてpPP14は、このような受託所によって、菌株
表示ATCC−67341を割当てられた。このような
培養物の利用は、本願の係属中、それに対して権限を与
えられた特許および商標の局長によって、37  C,
F、R。
91.14および35  U、S、C,目122の規定
に従い決定され、そしてこのような培養物についての公
衆への利用に対するすべての制限は本願が許されたとき
最終的に排除される。
菌株LL−E33288の形質転換 プラスミドpP P 8はカナマイシンに対する耐性を
付与しかつ相当の大きさく1.8kbp)のインサート
を含有するので、これを使用してNRRL−15839
のプロトプラストを形質転換した。
われわれの原理的説明は次の通りであった。prJ48
6のレプリコンは菌株NRRL−15839中で複製す
ることができなかった場合、プラスミドはなおM ic
romonosporaの染色体中への相同組換えによ
って維持されうるであろう。より小さいインサートをも
つグラスミド(すなわち、pPP14)は組換えを行う
傾向がより少ないであろう。プラスミドpp P 4の
インサート(8,5Kbp)はそのプラスミドの大きさ
を劇的に増加したので、プラスミドpP P 4は魅力
的選択に劣るように思われt;。M icromono
sporaが未修飾の異質DNAを消化量ることができ
ない制限系を含有する場合、それは多分pp P 8よ
りいっそう厳しくこのような大きいプラスミドを制限す
るであろう。
菌株NRRL−15839のプロトプラストを、前述の
ように、リゾチーム処理に従い5ミクロンのフィルター
を使用して調製した。プロトプラストは、S trep
tomycesの形質転換について使用したもの〔ホブ
ウッド(Hopwood) 、D 、 A 、ら、19
85、ストレプトマイセスの遺伝子操作(Geneti
c  Mn1pulation  of 5trept
o+myces);実験車のマニュアル(A  Lab
oratory  Manual) 1ザ、ジョン、イ
ンズ・7アンデイシ3ン(TheJ ohn  I n
nes  F oundation) 、英国ノーウ(
−/チ]に類似するプロトコールを使用して、pPP8
のプラスミドDNAを使用して形質転換した。
3.4XlO”のプロトプラストを含有する100μl
を10秒間遠心(マイクロ遠心機)し、沈殿物をデカン
テーションし、そしてプロトプラストを上澄みの残留す
る滴中に注意して再懸濁した。
18μlのpPP8(4μg)を添加し、次いで100
μlのT緩衝液中の255のPEG  1000を添加
した。対照を平板培養して再生の頻度を示し、そして形
質転換混合物の大部分を0.15モルのスクロースを有
する4RM平板上にオーバーレイした。
形質転換体は、150μg/mlのカナマイシンを軟質
寒天の1/10体積で平板をオーバーレイ(over 
1ay)することによって選択した。しかしながら、薬
物をいつ添加すべきかは不明瞭であった。薬物耐性が良
好に発現される前におよび/または脆いプロトプラスト
が再生する前に、カナマイシンを速く添加し過ぎる場合
、形質転換体は生存しえないであろう。カナマイシンを
最適な時間後に添加した場合、プラスミドが菌株NRR
L−15839中で安定に維持されえない場合、あるい
は菌糸体がプロトプラストの再生を阻害する場合、形質
転換体は検出されえないであろう。したがって、われわ
れは2回でカナマイシンのオーバーレイ(over 1
ay)を添加することを決定した;28℃における1日
のインキュベーション後、および6日後。6つのコロニ
ーを1日後にオーバーレイした平板から生長し、そして
平板を6日後にオーバーレイしたとき、127コロニー
が生長した。コロニーは、カナマイシンを含有しないか
、あるいは1または5μg/mlのカナマイシンを含有
するGER平板上で複製させた。カナマイシンの存在下
に良好に生長した17のコロニーを、50.15および
5μg/mlの薬物を有する平板で再試験し、そしてカ
ナマイシンに対するそれらの耐性はそれらがプラスミド
を含有しうろことを示唆した。さらに、これらのコロニ
ーはチオストレプトン(GER平板中で500 Pg/
ml)にわずかにより抵抗性であるように見えた:カナ
マイシン耐性のクローンは、野生盤コロニーより1日前
にチオストレプトンの存在下の生長しt;。
50μg/mlのカナマイシンの存在下に生長した6つ
のコロニーのために、プラスミドのミニプレプを5μg
/mlのカナマイシンを含有するGER平板培養物から
つくった。25μmのプラスミドの調製物のlOμlを
0.7%のアガロースゲルに適用した。われわれのミニ
プレプにおける染色体の帯は顕著であったが、プラスミ
ドの帯が存在するかどうかを述べることは困難であった
。プラスミドのpP P 8はわれわれのカナマイシン
耐性菌株中に存在したが、コピーの数はS、 1ivi
dansにおけるよりも低いことが考えら、れた。また
、バクテリアの染色体中に組込んだ後、プラスミドの配
列が維持されることがありえた。われわれの検出の可能
性を増加しかつこれらの2つの可能性を区別するために
、サザン転移(S outhern  transfe
r)を実施し[シュレイヒアー(S chleiche
r)およびシュエル(S chuell)法1を実施し
、そして親プラスミド、pIJ486、をプローブとし
て使用した。
サザンハイプリダイゼーションを第9図に示す。
レーンlおよび2は、フィルターの固定された、pP 
P 8精製プラスミドおよびS、 1ividans菌
株TK54/pPP8  DNAのミニプレプを含有す
るニブローブにハイブリダイゼーションした2つのDN
A帯が存在し、これらは共有的に閉じた円の形態および
ニツクド(nicked)プラスミドの形態に対応する
。着色したゲルを検査すると、転移前に、スーパーコイ
ルド(5uperco i 1ed)プラスミド帯より
明瞭に上に存在する、染色体DNA帯の位置が示された
。レーン3において、われわれの推定上のS trep
tomycesの形質転換体からの主要なシグナルは、
S 、 1ividansからのpP P 3の共有的
に閉じた円と同一の位置に存在する。こうして、pp 
P 8は菌株NRRL−15839中で自律的に複製し
、そして組込まれない。
M icromonosporaのプラスミドのミニプ
レプを、また、BaTo)Itで制限し、これは1.8
Kbpのインサートを解放し、plJ486の線状の形
態を生ずるであろう。そのゲルのサザンは第1O図に示
されている。レーンlは、BamHIで切断し、そして
標識したplJ486でプロービングした、pPP8の
精製したプラスミド調製物を示す。レーン2は、菌株N
RRL−15839のDNAをこのゲル中で展開したと
きのシグナルを示さない。
レーン3において、M icromonosporaの
ミニプレプからのDNAを、ゲル電気泳動前に、Bam
HIで切断した。このプローブはplJ486に相当す
る帯とハイブリダイゼーションし、形質転換体中のプラ
スミドの存在を確証する。
M icromonosporaの形質転換体からの他
のプラスミドのミニプレプを使用して、S、 1ivi
dansTK54をチオストレプトン耐性に形質転換し
た。
3つのチオストレズトン耐性コロニーが得られた。
プラスミドを1つのクローンから調製し、そしてアガロ
ースゲルの電気泳動はpP P 8の大きさのプラスミ
ドを明らかにした。チオストレプトンおよびカナマイシ
ンの耐性を与えるM icromonosporaから
のプラスミドの回収は、われわれが形質転換体を分離し
たことを、独立に確証する。
け われわれの本来の目標は、M icromonospo
raから誘導された、前述のプロモーターを明らかにす
ること、および菌株NRRL−15839によってされ
た開始部位が、比較的よく特性づけられた、有機体であ
るS treptomyces  1ividansの
それに類似するかどうかを示すことであった。予期され
ない、潜在的に非常に有用な性質を有する1つのDNA
配列がM icromonosporaから得られたこ
とが、だんだん明らかになった。このDNA断片は、2
つのタイプの多数のプロモーターを含有する。
一方のプロモーターは生長する細胞中で主として活性で
あり、活性はカナマイシン耐性を要求することによって
選択した。さらに、この断片は3つのプロモーターのク
ラスター(cluster)を含有し、これらのプロモ
ーターは、細胞が休止期(stationary  p
hase)に入った時および薬物LL−E33288複
合体が生産される時、最も活性である。ここで、われわ
れは、プロモーターを有する断片より下流に所定の構造
遺伝子、またはそのより小さい誘導体を配置することに
よって、生命環の特定の時に遺伝子を発現するように、
遺伝子の発現を調節することができる。ある種の遺伝子
を休止期の間においてのみ発現することは有利であろう
。なぜなら、対数期の間にある遺伝子が発現される場合
、それは致命的でありうるからである。例えば、LL−
E33288複合体の生合成経路の一部である酵素の遺
伝情報を指定する構造遺伝子は、薬物がつくられる時に
のみ、その酵素の活性が現われるように、われわれのD
NA配列の後に配置できるであろう。
プラスミドpP P 4、pP P 8およびpPP1
4のすべては、aphll遺伝子の前に挿入された、菌
株NRRL−15839から誘導されたDNAを含有す
ることが、サザン分析によって示された(第8図)、D
NAの配列はS、 1ividans中のaphll遺
伝子の発現を促進するので、菌株NRRL−15839
からRNAを分離し、そして転写を測定することによっ
て、M icromonospora中のそれらのプロ
モーターの活性を検査することを決定した。
細胞の凍結した種子培養物を50m1のGER培地(3
/1000希釈)中に接種し、60時間インキュベージ
aシン後培養物を凍結した培地と混合し、3分間100
00 rpn+で遠心し、そして細胞の沈殿物を使用す
るまで一70℃で貯蔵した。
RNAの劣化を防止するために、細胞は急速に収穫しそ
して急冷した。沈殿物をグアニジウムイソチオシアネー
ト(guanidium  1sothiacyana
te)溶液中に再懸濁し[チルブライン(Chirgw
in)、J、M、ら、1979、生化学(B ioch
em、 ) 18 : 5294−5299] 、そし
てソニプレプ(S oniprep) 150 (M 
S E )中で16ミクロンのパワー(power)で
合計1〜2分間音波旭理した;細胞の少なくとも90%
が微視的観察によって溶解された。RNAはCsC1の
クッシ腫ン(cushion)を通す遠心によって分離
し[ターペン(Turpen) 、T、 H,およびO
,M、グリy4ス(G riffith)、1986、
生物技術(B 1otechniques) 、4 :
 l l −151、フェノール−クロロホルムで抽出
し、エタノール沈殿させ、そしてエタノール沈殿物とし
て一20℃において、あるいは水中で一70℃において
貯蔵した。pPP4、pp P 8およびpPP14の
インサートによってコード(code)される内因性転
写体を同定するために、菌株NRRL−15839から
のRNAをホルムアルデヒドを含有するアガロースゲル
に適用し[マニアチス(Maniatis) 、T、 
、E 。
F、フリトシ(F ritsch)およびJ、サムブo
 −7り(S ambrock)、1982、分子クロ
ーニング(Molecular  Ctoning) 
、コールド・スプリング・ハーバ−・ラボラトリ−(C
old  S pringHarbor  Labor
atories) 、ニューヨーク州、コールド・スプ
リング・ノ\−バー1、フィルターに移し、そして標識
したpPP4、pPP8およびpPP14に対してハイ
ブリダイゼーションした(ノザン分析)。
第11図は最初のノザン実験である。2つの転写体、4
50および375塩基長さ、はpPP14のプローブに
対してハイブリダイゼーションする。pPP14は2つ
の明確な転写体に対してハイブリダイゼーションしたの
で、転写の調節に関係する、少なくとも2つのシグナル
がM icromon。
5poraのDNAインサート内に存在したように思わ
れた。この断片は2またはそれよい多いプロモーター(
転写の開始に必須な部位)、またはプロモーターおよび
転写停止部位を含有しえたであろう。
0.4KbpのM icromonosporaのDN
Aインサート内の転写開始部位を精確に同定するために
、次に、l系列のSlヌクレアーゼ転写マピイングの研
究を開始した。0.4KbpのインサートをpUC19
、E、coliのベクター、中にサブクローニングした
。ここで、ポリリンカーのBamHII■部位、および
aphllに隣接するBamH1部位を利用し、そして
E、coli菌株JM83(NewE ngland 
 B 1olabs)をアンピシリン耐性に形質転換し
た。(Sau3A1断片をpIJ486のBamH1部
位中に結合したとき、1つのBamHI部位を再びつく
った。)得られる断片、pp E C14と表示する、
を引続く標識実験のための使用した。断片をBamHI
部位のキナーゼ処理によって標識しくベーリンガー・マ
ンハイムの酵素および反応条件)、そしてBamHI 
11酵素で消化し、そして一本領のプローブを分離した
[マニアチス(Maniatis) 、T 、 、E 
、 F 、フリトシ(F ritsch)およびJ、サ
ムブロック(S ambrock)、1982、分子ク
ローニング(M olecular  Cl。
ning) 、コールド拳スゲリング拳ハーバ−・ラボ
ラトリ−(Cold  S pring  Harbo
r  L aborat。
ries) 、ニューヨーク州、コールド・スプリング
・ハーバ−]。過剰のプローブを菌株NRRL−158
39から、あるいはS 、1ividans  T K
 54/pP P l 4からのRNALf)IOμg
とハイブリダイゼーションし、そしてハイブリダイゼー
ションした試料を、概説されいるように[ブロシウス(
B rosius)、J、、R,L、ケイト(Cate
)、R,バールムラター(P erlmutter)、
1982、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミス
トリー (J 、  Biol、  Chem、 )、
157 : 9250−92101.300単位/ml
の最終濃度でSlヌクレアーゼ(ペーリンガー・マンハ
イム)で処理した。エタノール沈殿した後、試料をゲル
の電気泳動およびオートラジオグラフィーによって分析
した。
第12図は、菌株NRRL−15839のGER培養か
らのRNAがハイブリダイゼーションし、モしてSlヌ
クレアーゼ消化からのプローブを保護することを示す。
4つの明らかな開始部位が検出された;Bam)II末
端からほぼ150bpの1つの開始部位、およびBan
+H1末端から約225bpの3つの開始部位のクラス
ター。明らかなように、このM icromonosp
oraD N A断片内に同一方向の転写のための多数
の開始部位が存在する。RNAを、また、S、 1iv
idans  TK54/pPP14のGER培養らら
調製し、グローブに対してハイブリダイゼーションさせ
、そして転写マツピング分析すると、開始部位は2つの
種において同一でであることが示された。1つの追加の
開始部位は、明らかに、S、 1ividans中で発
生し、これはMicromonosporaにおいて検
出されず、siヌクレアーゼ部位から約170bpに存
在する。転写のパターンは2つの種において非常に類似
するので、s。
1ividansにおけるプロモーターの活性を選択す
るアプローチは有効である。
転写の開始部位ならびに有用な制限部位を示す、0−4
Kbpの地図は第13図に示されている。下流のプロモ
ーター(P2と表示する)と3つの上流のプロモーター
(PlaS FibおよびPlcと表示する)との間の
間隔は、ノザン分析を用いて観察されたRNA間の間隔
(第11図)とほぼ同一であった。こうして、0.4k
bpの断片は共通の3″末端を有する転写のだめのいく
つかの開始部位を含有するように思われた。他の鎖を標
識し、そしてS 、 1ividansのRNAとハイ
ブリダイゼーションしたとき、検出可能な転写は検出さ
れず、発散する方向におけるプロモーター活性は示され
なかった。
PiおよびP2からの転写をノザン分析によって観察さ
れた2つの帯と関係づけるために、次の実験を実施した
。0.4kbpのインサートの中央において5stll
部位を利用することによって、pUC1Q中への0.4
kbpの配列の下位断片(subfragment)を
含有するpPEc14の誘導体を構成した。上流部分C
Piクラスターを含有する)は、Pstlおよび5st
llで消化し、T4DNAポリメラーゼ(ベーりンガー
・マンハイム)でプランティング(blunting)
 L、 [マニアチス(Maniatis) 、T 、
 、E 、 F 、フリトシ(Fritsch)および
J、サムブロック(S a+nbrock)、1982
、分子クローニング(M olecular  Ct。
ning) 、コールド・スプリング・ハーバ−・ラボ
ラトリ−(Cold  Spring  Harbor
  L aborat。
rles)、ニューヨーク州、コールド・スプリング・
ハーバ−]、そして結合してpP E C2を形成する
ことによって欠失させた。0.4 kbpの断片の下流
部分(P2を含有する)は、pEc14を5stllお
よびS ma Iで消化し、次いでプランティングおよ
び結合してpPEClを形成することによって欠失させ
た(第13図)。予測は、Plを含有するpPEolは
ノザンにおいてより大きい転写体とのみハイブリダイゼ
ーションするであろうということであった。P2を含有
するpP E C2は両者の転写体にハイブリダイゼー
ションするであろう。2つの転写体が重複しない場合、
pPEclおよびpp E C2の各々は1つの帯にの
みハイブリダイゼーションするであろう。事実、ノザン
を実施するとき、標識したpP E C2は両者の転写
体に対してハイブリダイゼーションし、そしてpPEc
lはまさにより大きい転写体に対してハイブリダイゼー
ションした。こうして、すべてのデータは重複する転写
体と一致する。
より大きい転写が、Pla、PlbおよびPlcからの
開始と一致する、RNAの調製における多数の帯を実際
に含有するかどうかを見るために、高い分解能のノザン
実験を実施した。M icromon。
5poraからのRNAの試料を、7モルの尿素を含有
する5%のアクリルアミド10.27%のビスゲルに適
用した。電気泳動後、RNAをニトロセルロース上に電
気ブロッティングし、そして標識したpPP14のDN
Aでプロービングした。第14図は、プローブpPP1
4に対してハイブリダイゼーションするより大きい転写
体を1より多い成分に分解できることを示す。多数の大
きい転写体はRNA調製において検出可能であるので、
多数のプロモーター、Pla、PlbおよびPlc。
はS1ヌクレアーゼの消化のアーチファクトであると思
われない。
Pla、PlbおよびPlcのための開始部位の位置を
説明するために、DNAをP2より下流のA va 1
部位から、マクサム−ギルバートの方法[マクサム(M
axa+m) 、A、 M、およびW、ギルバート(G
 i 1bert)、1980、M ethods  
E nzysiol、 、65 : 499 5601
によって配列決定した。PIの分析のため、DNAをH
paII/NciI部位から配列決定した。DNAを読
鎖についてキナーゼ処理し、そして解読鎖についてDN
Aポリメラーゼのクレノー断片(ベーリンガー・マンハ
イムの酵素および反応条件)を充填することによって標
識した。PIおよびP2の開始部位は、配列決定ゲルに
よるSl消化から保護された断片を一直線にすることに
よって明らかにした(第15図)。0.4kbp断片の
配列の一部を、プラスミドpEclおよびpEC2のサ
ンガー(Sanger)の配列決定(IBIキット)に
よって決定した。
多数のプロモーターを使用して同一の下流のRNAを転
写したので、これらのプロモーターの異なる利用がM 
icromonosporaの生長環の明確の時期の起
こるかどうかを決定した。菌株NRRL−15839を
添加したホスフェート(K、HPO4を0.05%に)
を含有する73−31培地中で生長させ、そして生長を
DNAアッセイによりヘキスト(Hoecht) 33
258試薬(Calbiochem)を使用して記載さ
れているようにして監視した[マクコイ(McCoy)
 、KW、F、およびLB。
H,オルソン(O1son)、1985、アプライド・
アンド・エンバイロメンタル・マイクロバイオロジー(
A pり1 、  E nviron−M 1crob
iol 、 )、49:811−8173゜[同様な生
長曲線は、蛋白質を測定し、バイオ−ラドCB I 0
−RAD■)を使用することによって得られた。]菌株
NRRL−15839の培養物を、また、われわれが開
発した最少生産培地中で生長させた(Aux、に2HP
O,を0.05%に添加し、Klを0.01%に添加し
、そしてTES緩衝液のpHは7.0であった)。
培養物の生長曲線は第16図に示されている。
この図面に示されているように、対数的生長相の終了徒
歩なくとも6時間まで、BIA活性は検出されなかった
。標識したpPEcl4をグローブとして使用した、こ
れらの時点についてのRNAのノザン分析は、第17図
に示されている。第ル−ンは、対数的に生長する細胞か
ら分離したRNAを含有するiPlから出発したより大
きい形質転換体の非常にわずかが検出され、モしてP2
からの375塩基の形質転換体のわずかかが検出された
。細胞を休止期において漸進的に遅く収穫するとき、P
lからのより大きい転写体はかなりいっそう顕著となり
、これに対してP2からの375塩基の転写体はわずか
に減少した(レーン2〜3)。興味あることには、Pl
から由来する転写体の卓越性は生長培地中のLL−E3
3288複合体の出現と並行する。最少生産培地中で生
長する細胞からのステイシド(staged) RN 
Aを使用して(第17図)、あるいはステイシドRNA
のS1ヌクレアーゼ転写のマツピングの研究から実質的
に同一の結果が観察されt;。PLから由来する発現の
増加は、対数期に比較して、休止期の間において少なく
とも10倍であると、われわれは推定する。
P2プロモーターは、また、調節を受けるように思われ
る。菌株NRRL−15839の細胞をGER培地中で
生長させるとき、P2の発現は、対数的生長相の間にお
いて、73−3I培地または最少生産培地中で生長させ
た細胞についてより顕著であった(データは示されてい
ない)。GER培地中の定常期間、P2からの転写は増
加し、これに対してP2かもの転写は生産培地中で生長
した細胞について減少した(第17図)。GER中で冨
んだ窒素を含有する補助物質は、生産培地に比較して、
菌株NRRL−15839においてP2からの発現のこ
れらの差を説明できる。
P2のプロモーターは、これらの生産培地中で生長する
菌株NRRL−15839について、対数生長相の間に
おいてのみ転写に有意に寄与するので、われわれはPI
のみあるいはP2のみを含有するプラスミドを構成する
ことを決定した。プラスミドpPEC1をHaelll
およびEcoRIで消化し、そしてPla、Plbおよ
びPlcを含有する断片をplJ486、S trep
tomycesからのプロモーター−プローブプラスミ
ド、中に、そのHaeI I IおよびEcoR1部位
を使用して挿入し、このプラスミドをpsLlと表示す
る。同様に、pp E C2をBamHIおよびHae
l I Iで切断し、そしてpIJ486のBamHI
およびHael11部位中に結合することによって、P
2を含有する断片を得、このプラスミドをpSL2と表
示する。
これらの構成体をつくることによって、PIおよびP2
からのプロモーターの活性を評価した。
aphll遺伝子の前における下位断片の挿入はカナマ
イシン耐性(RM平板上で40μg/mlまで)をS 
、 1ividans  T K 54宿主に与えるこ
とを発見した。St転写マツピング分析は、この構成体
中のP2の開始部位がpPP14のP2開始部位と同一
であることを示す。
P2のみを含有するインサートは有意のプロモーター活
性を有するという事実は、より短い転写体がPIから由
来する転写体の処理から生ずるという可能性を排除する
。、定常相の間の誘導がなお10倍であるかどうかを見
るためにP2の不存在下のPiのプロモーター活性を決
定する。データは、菌株NRRL−15839において
、および3−1iVidansの形質転換体において、
P1プロモーターが一時的に調節されることを示す。
E、coli中の菌株NRRL−15839ゲノムグー E、coli中でNRRL−15839のDNAの2つ
のゲノムのライブラリーを構成した。ゲノムのDNAを
菌株NRRL−15839から調製し、モジて5au3
Al制限エンドヌクレアーゼ(べ一リンガー・マンハイ
ム)で部分的に消化した。消化したDNAを大きさで分
画して、クローニングにおける大きいインサートについ
て最大にした(>10kb)。スクロース勾配の遠心に
よって分画したDNAをプラスミドpBR322(Ne
wE ngland  B 1labs)のBa+++
H1部位中に結合し、モしてE、coli菌株K 80
2 (New  EnglandB 1labs)をア
ンピシリン耐性に形質転換した。
E、coli宿主菌株の選択は、形質転換の高い頻度を
保証するために極めて重要であることが発見された。3
000の組換えクローンが得られ、平均のインサートの
大きさは14kbpであっtこ。
あるいは、菌株NRRL−15839からのDNAをア
ガロースゲルの電気泳動によって大きさで分画し、そし
てこのDNAをプラスミドpKK233−2の誘導体(
P harmacia)のBg111部位中に結合し、
前記プラスミドはポリリンカーの挿入によって修飾した
。このベクターは誘導可能なtrcプロモーターを含有
し、そしてE、coli中のM icromonosp
oraのDNAの発現を可能とする。
平均インサート大きさが10kbであるプラスミドを含
有するほぼ3000のクローンが得られた。
菌株NRRL−15839のDNAを分離し、BamH
I制限酵素で消化し、そしてアガロースゲル上でサザン
ハイプリダイゼーション分析のため分画した。 S、 
coelicolor  A3 (,2)のact I
およびact I I遺伝子から誘導したポリヶチドの
プローブ、PIJ2345およびplJ2346[F、
マルバーチダ(Malpartida)ら、1986、
モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジェネテイツクス
(Molec、  Gen、  Genet、 ) 、
205.66−73ページ]を、ニック翻訳によって標
識した。約2.5kbpのBamHI断片はact1プ
ローブと交差ハイブリダイゼーションした。
生理学的研究 LL−E 33288複合体の生産を支持する規定培地
の開発は、薬物の生産に影響を及ぼす生理学的因子を研
究するための機会を提供する。菌株NRRL−1583
9の生長のために好適な炭素源はスクロースまたはグル
コースである。好適な窒素源はアンモニウムである。最
少培地を交換し、そしてそれが別の炭素源および窒素源
を含有するとき、薬物の生産が観察された。と(にアン
モニウムの濃度が低いとき、細胞の質量につき、より多
くの薬物が生産された。アンモニウム、プロリンまたは
アルギニンに比較したとき、グルタメート(1%まで)
は薬物の生産のためによりすぐれた窒素源であった。し
たがって、窒素源の性質はLL−E33288複合体の
生産において重要な役割を演する。炭素源の性質は重要
生に劣る。
発明者らはS、ルカニア(L ucania)氏[二ニ
ージャーシイ州ニューブルンスウィック、E、1スクイ
ツグ(S quibb) ]にチオストレグトンの提供
に対して感謝する。
【図面の簡単な説明】
第1図は、菌株NRRL−15839の集団の生存を紫
外線処理の関数として示し、次の凡例を使用する:(・
);−生長培地中のグリシン/子紫外線処理前の音波処
理、(0);+グリシン/子音波処理、(×);−グリ
シン/−音波処理、(△):+グリシン/−音波処理。 第2図は、非生産性突然変異のスクリーニングを示し、
ここでクローンを1.5mlの73−31生長培地中に
接種し、そして28℃で1週間インキュベーションし、
発酵ブロスの各々のlOμlをBIA板上にスポツティ
ングし、そして矢印は非生産性発酵のスポットを指す。 第3図は、菌株NRRL−15839の突然変異誘導体
によって生産されたLL−E33288複合体のTLC
およびバイオオートグラフィーを示す。 第4図は、菌株NRRL−15839の遮断突然変異に
よるLL−E33288複合体の同時合成を示し、ここ
で突然変異菌株DR43を73−3夏生長培地中で単独
で生長させるか、あるいは他の突然変異誘導体と同時生
長させ、そして発酵ブロスをBIA活性について試験し
た。 第5図は、菌株NRRL−15839の17の遮断突然
変異によるLL−E33288複合体の同時合成を示し
、次の凡例を使用する:(+)、LL−E33288複
合体の同時合成:(−)、検出可能な同時合成の不存在
; (+/−) 、LL−E33288複合体のわずか
に検出可能な生産、補体群は垂直の実線で示されている
。 第6図は、突然変異菌株DR46の培養によって生産さ
れた補体因子の時間過程を示し、ここで菌株DR46の
73−31培養の無菌の上澄みを示した時間に調製し、
このような上澄みの1.3m1(第1日および第2日)
または130μl(第3日、第4日および第6日)を菌
株DR43の73−3■培養に添加し戻し、LL−E3
3288複合体への補体因子の変換をDR43の3μl
の試料をBIA板上にスポツティングすることによって
測定した。 第7図は、遮断突然変異によるLL−E33288複合
体のシュードアグリコン断片のLL−E33288複合
体の補体への変換を示し、ここでシュードアグリコン(
Pa)を73−31生長培地中で2日間インキユベーシ
ミンした後示す菌株へ添加し戻し、さらに1日後、LL
−E33288複合体を抽出し、補体をTLCによって
分離し、そしてバイオオートグラフィーによってアッセ
イした(PaおよびLL−E33288複合体の種々補
体の位置を示す)。 第8図は、サザーンハイブリダイゼーションによるM 
icromonosporaインサートの検出を示し、
ここでアガロースゲルの電気泳動(0,8%、TBE緩
衝液)後、次の試料をニトロセルロース紙上に固定し、
そして標識プラスミドpPP8でプロービングし、次の
凡例を使用した:レーン1、BamHIで消化したS 
、 1ividans染色体DNA 。 レーン2、Ba+nHIで消化したLL−E33288
染色体DNA ;レーン3、BamHlで消化したpP
P8;サザンプロットをpPP8でプロービングし、そ
して1.8kbpのインサートがNRRL−15839
DNAからのものであることを示す。 第9図は、サザンハイプリダイゼーションによるNRR
L−15839のカナマイシン耐性の形質転換体中の自
律的プラスミドpPP8の検出を示し、次の凡例を使用
した:レーン1、カナマイシン耐性形質転換体のプラス
ミドのミニプレグDNA:レーン2、S、 1ivid
ansからのプラスミドのミニプレグDNA 、レーン
3、S 、 1ividansからのCsC1精製した
プラスミドのプレグDNA。 プラスミドのDNAは、アガロースゲルの電気泳動(0
,7%、TBE)後、標識プラスミドprJ486でハ
イブリダイゼーションすることによって検出した。 第10図は、Ba+mHI制限酵素で消化後における、
菌株NRRL−15839のカナマイシン耐性形質転換
体中のプラスミドの配列の検出を示し、ここでDNA試
料をBamHlで制限し、そしてアガロ−・スゲルの電
気泳動(0,7%、TBE)後、プラスミドplJJ8
6とノhイブリダイゼーシ這ンし、次の凡例を使用した
:レーン11カナマイシン耐性形質転換体菌株NRRL
−15839からのDNA 、レーン2、菌株NRRL
−15839のDNA 、およびレーン3、S、 1i
vidans  TK54/pPP8のDNA。 第11図は、M 1cron+onospora菌株N
RRL−15839のノザーン分析を示し、ここで合計
のRNAを、ここに記載するように、GER培地中で6
0時間生長させたM icromonosporaから
分離し、lOpgのRNAをホルムアルデヒド−アガロ
ースゲル中で電気泳動し、ニトロセルロースに移いニッ
ク翻訳したpPF’14でプロービングし、2つの主要
な転写体、450ntおよび370nt、を検出し、そ
して、さらに、リポソームのRNAへのバックグラウン
ドのノXイブリダイゼーションを観察する。 第12図は、Slヌクアーゼ保護によるpPP14中の
転写開始部位のマツピングを示し、ここでRNAをBa
mHI部位において標識したpPEC14からの一本領
グローブに71イプリダイゼーシヨンし、そして試料を
Slヌクレアーゼで消化し、次いで8%のアクリルアミ
ド/7モルの尿素の配列決定ゲル上で電気泳動し、次の
凡例を使用した:レーン11未消化のプローブ;レーン
2、RNAなし:レーン3.4.5:それぞれ13およ
び102gのM icromonosporaのRNA
 、レーン6.7.8:形質転換しないか、あるいはp
iJ486またはpPP14で形質転換したS tre
ptomyces  1ividans  T K 5
4から分離したRNAのlOpg;およびレーンAおよ
びBはHaellIまたはHinf Iで切断したph
i−x174DNAの分子量マーカーである。 第13図は、pp P 14中に含有されるMicro
monospora  D N Aのインサートの制限
地図、Slヌクレアーゼ保護によって決定した転写開始
部位の位置を示す。 第14図は、pP、Ec14にハイブリダイゼ−ジョン
する転写体の高い分離能力のノザーン分析を示し、ここ
でM icromonosporaP  RN A (
10μg)を5%のアクリルアミド/7モルの尿素を含
有する0、27%のビスアクリルアミドゲル上で分画し
、ジーン・スクリーン・プラス膜(G ene  S 
creen  P lus  +aembrane) 
 (= ニー−イングランド・ニュークリア)に製造業
者が推奨するエレクトロブロッティングによって移した
。 第15図は、pPP14のためのプロモーターを含有す
るM icromonosporaのDNA断片の存在
しうるDNA配列を示し、ここでDNA配列はマクシマ
ムおよびビルバートの方法およびサンガーにより決定し
、そしてマクシマムーギルバートの配列決定に使用しか
つ同一ゲル上で電気泳動した同−DNA断片のSLヌク
レアーゼ保護によって、プロモーターの位置を決定した
。 第16図は、菌株NRRL−15839の生長曲線およ
びLL−E33288複合体の出現を示し、ここで細胞
の塊は、73−31培地(・)または最小生産培地(X
)中で生長した菌株NRRL−15839の培養におけ
るDNAの蓄積についてアッセイすることによって測定
し、矢印はLL−E33288複合体の最初の出現を示
す。 第17図は、pPEc14ヘハイブリダイゼーションす
る転写体の進展的発現を示し、ここでMicromon
ospora培養から分離したRNAのlOμgを、第
11図に記載するように、ノザーンプロッティングによ
って分析した。Aニア3−31培地、試料は17.30
.4153.70および92時間に採取した(レーン1
〜6);B:最小培地、試料は30.41,53.70
および92時間に採取した(レーン1〜5);およびC
:GER培地、試料は19.28.43および51時間
に採取した(レーン1〜4)。 特許出願人 アメリカン・サイアナミド・カンパニー7
面の浄7!y(内容にt−更なし) −〇      ソリ      +zリ 抄FIG、
 8 FIG、9 FIG、IO A111$416F1m FIG、I2 −馨 GAπ↑式αμTGTQTGC就CCロJπロ礒GCA
CGQCTTG AT匡就TαIに鳥x10礒υ^「π
Tαvwt caa叡真迫aa cccccにjfic
 TCCATCm flGc伐TT (iGcGTcc
AGc GGCTTfiTAQA5tll 町論■ 出 GAI:GA匡繻r閤冨ムに砿儲1絋α国になEに就就
就CαN論鴎釘質Eα〜1臨鴬1[T        
       A鴨!ATI;AAeGGTti C1
;hEcKWac AATGCT@C国mTαsum。 1adl ム 1!1.層 11848  略 S、1中 lff1141 cm atlK 手続補正書彷幻 昭和63年6月9日 特許庁長官 小 川 邦 夫 殿 1、事件の表示 昭和63年特許願第49897号 2、発明の名称 マイクロモノスポラのための遺伝子系 3、補正をする者 事件との関係    特許出願人 名称 アメリカン・サイアナミド・カンパニー4、代理
人 〒107 5、補正命令の日付 昭和63年5月31日(発送日)
6、補正の対象 図面の簡単な説明の欄及び図面 7、補正の内容 (1)明細書第101頁第12行に「を示し、」とある
を「を示す写真であり、」と訂正する。 (2)明細書第101頁末行に「示す。」とあるを「を
示す写真である。」と訂正する。 (3)明細書第102頁第3行に「を示し、」とあるを
「を示す写真であり、」と訂正する。 (4)明細書第102頁第15行に「を示し、」とある
をrを示す写真であり、」と訂正する。 (5)明細書第103頁第6行に「を示し、」とあるを
「を示す写真であり、」と訂正する。 (6)明細書第103頁第15行に「を示し、」とある
を「を示す写真であり、」と訂正する。 (7)明細書第104頁第9行に「を示し、」とあるを
rを示す写真であり、」と訂正する。 (8)明細書率104頁末行に「を示し、」とあるを「
を示す写真であり、」と訂正する。 (9)明細書第105頁第1θ行に「を示し、」とある
を「を示す写真であり、」と訂正す番。 (lO)明細書第106頁第1行に「を示し、」とある
を「を示す写真であり、」と訂正する。 (11)明細書第107頁第2行に「を示し、」とある
を「を示す写真であり、」と訂正する。 (12)明細書第108頁第5行に「を示し、」とある
を「を示す写真であり、」と訂正する。 以上

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、プラスミドpPP4(ATCC−67343)、 2、プラスミドpPP8(ATCC−67342)、 3、プラスミドpPP14(ATCC−67341)、 4、炭素、窒素、ヨウ素および無機塩類の適当な源を含
    有する水性培地中で、¥マイクロモノスポラ・エキノス
    ポラ(Micromonosupora echino
    spora)¥種¥カリケンシス(calichens
    is)¥DR46(ATCC−53591)を好気的に
    発酵し、そしてそれから補体因子を分離するによって生
    産されたことを特徴とする補体因子。 5、炭素、窒素、ヨウ素および無機塩類の同化可能な源
    を含有する水性培地中で好気的に発酵しとき、補体因子
    を回収可能な量で生産できることを特徴とする、微生物
    ¥マイクロモノスポラ・エキノスポラ(Micromo
    nosupora echinospora)種カリケ
    ンシス(calichensis)¥DR46(ATC
    C−53591)を含む培地。
JP63049897A 1987-03-06 1988-03-04 マイクロモノスポラのための遺伝子系 Pending JPS63313589A (ja)

Applications Claiming Priority (2)

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US022455 1987-03-06
US07/022,455 US5024948A (en) 1985-10-17 1987-03-06 Genetic system for micromonospora

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KR (1) KR880011338A (ja)
IL (1) IL85181A (ja)

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IL85181A (en) 1992-11-15
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