JPH08272848A - 物質構造の表示方法 - Google Patents

Abstract

(57)【要約】 （修正有） 【目的】 物質構造のグラフィック表示と文字表示との
関連付けを行い、操作性を向上させる。 【構成】 物質の立体構造データが複数登録されたデー
タベース２０を参照し、物質の立体的なグラフィック表
示及び文字表示を行う。データベース２０を参照して得
た立体構造データを表示属性の設定領域が設けられた表
示用バッファ２５に格納し、表示用バッファ２５の表示
属性の設定に対応した表示形態でグラフィック表示を行
うと共に、バッファ３０の表示属性の設定に対応した表
示形態で文字表示を行う。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【産業上の利用分野】本発明はタンパク質立体構造の表
示方法に関し、特にタンパク質立体構造をグラフィック
表示及び文字表示する物質構造の表示方法に関する。物
理・化学の分野では、新しい（未知の）物質の性質を調
べたり、新しい物質を人工的に創成するために、分子構
造を分析し、物質が持つ機能の発現メカニズムを解明す
る研究が行われている。これまでの研究成果により、物
質の持つ機能と立体構造との間には密接な関係があるこ
とが知られており、構造的に類似した部分（あるいは特
異的な部分）が物質の機能に大きく関与すると考えられ
ている。このため、Ｘ線結晶解析装置やＮＭＲなどによ
って物質の立体構造を決定し、その結果明らかになった
立体構造のデータベース化が図られている。

【０００２】例えば、このデータベースから立体構造中
の類似部分を計算機で自動的に抽出したり、検索したり
することができれば、従来研究者が行ってきた一連の作
業を軽減することができる。

【０００３】

【従来の技術】物理・化学の分野では、新しい（未知
の）物資の性質を調べたり、新しい物質を人工的に創成
するために、Ｘ線結晶解析装置やＮＭＲ等の手法で物質
の立体構造を決定し、決定された立体構造の情報をデー
タベースに蓄積することが行われている。代表的なデー
タベースとして、タンパク質のＸ線結晶解析により明ら
かになったタンパク質等の立体構造を登録したプロテイ
ン・データ・バンク（ＰＤＢ：Protein Data Bank)が広
く知られており、世界的に用いられている。また、化学
物質が登録されているデータベースとして、ケンブリッ
ジ・ストラクチャー・データベース（ＣＳＤ：Cambridg
e Structural Database)が知られている。

【０００４】タンパク質は複数のアミノ酸が一本の鎖の
ように連結し、この鎖が生体内で折りたたまることによ
って立体構造を形成し、各種の機能を発現するようにな
っている。各アミノ酸はＮ端末からＣ端末に向けて１か
ら順に番号付けることによって表現される。これらの番
号はアミノ酸番号、アミノ酸配列番号またはアミノ酸残
基番号などと呼ばれている。また、各アミノ酸はその種
類に応じて複数の原子より構成される。したがって、上
記ＰＤＢには、タンパク質の名前，管理番号，タンパク
質を形成するアミノ酸番号，各アミノ酸を構成する各原
子の種類と三次元座標等の情報が登録されている。

【０００５】これまでの化学的な研究成果から、物質の
立体構造とその機能との間には密接な関係があること知
られており、物質の改変や新しい機能を持つ物質を創成
するために、化学的な実験を通じて立体構造と機能の関
係が解明されつつある。その中でも、同じ機能を持つ物
質間で構造的に類似した部分（あるいは特異的な部分）
が物質の機能に大きく関与すると考えられるため、立体
構造中に共通に存在する類似な構造を探し出すことは必
要不可欠である。

【０００６】本出願人は、先に特開平６−１８０７３７
号等により、タンパク質の立体構造データが登録された
データベースを有し、このデータベースから読み込んだ
タンパク質の２つの立体構造データに基づき、アミノ酸
配列番号によりタンパク質を構成する各アミノ酸を順序
集合としてとらえ、それらの各要素を対応付ける際に、
幾何学的な関係による候補の絞り込み、所定のしきい値
条件による候補の絞り込み、またはアミノ酸の属性によ
る候補の絞り込みを行って、これらを満たす要素の組合
せを生成し、生成された組合せの中で各要素間の距離の
平均が小さくなるアミノ酸の順序集合間の対応付けを探
し、上記タンパク質の２つの立体構造の最もよく一致す
る重ね合わせのための位置と方向を算出し、この結果に
基づいてタンパク質の立体構造同士を重ね合わせて表示
する装置を提案している。

【０００７】このような、タンパク質の立体構造同士の
重ね合わせの前段階として、データベースから読み出し
たタンパク質構造データを立体的にグラフィック表示し
たり、また、タンパク質を構成する各アミノ酸を１文字
で表現することによりタンパク質構造データを文字列で
表わす文字表示が従来から行われている。

【０００８】

【発明が解決しようとする課題】従来においては、タン
パク質構造のグラフィック表示と、文字表示との間には
表示上の関連付けはされておらず、例えばグラフィック
表示されたタンパク質構造の所望の範囲のアミノ酸を指
定したとしても、文字表示ではどの範囲が指定されたの
かを知ることができず、利用者の熟練度が低い場合には
操作性が悪いという問題があった。

【０００９】本発明は上記の点に鑑みなされたもので、
物質構造のグラフィック表示と文字表示との関連付けを
行い、操作性を向上させる物質構造の表示方法を提供す
ることを目的とする。

【００１０】

【課題を解決するための手段】請求項１に記載の発明
は、物質の立体構造データが複数登録されたデータベー
スを参照し、物質の立体的なグラフィック表示及び文字
表示を行う物質構造の表示方法において、上記データベ
ースを参照して得た立体構造データを表示属性の設定領
域が設けられた表示用バッファに格納し、上記バッファ
の表示属性の設定に対応した表示形態でグラフィック表
示を行うと共に、上記バッファの表示属性の設定に対応
した表示形態で文字表示を行う。

【００１１】請求項２に記載の発明は、請求項１記載の
物質構造の表示方法において、表示する物質はタンパク
質であり、前記表示用のバッファはアミノ酸残基単位の
表示単位バッファの集合体である。請求項３に記載の発
明は、請求項２記載の物質構造の表示方法において、前
記グラフィック表示は形状、色、線幅、線種により表示
形態を変化させ、前記文字表示はフォント、反転、色に
より表示形態を変化させる。

【００１２】請求項４に記載の発明は、請求項１記載の
物質構造の表示方法において、表示する物質は核酸であ
り、前記表示用のバッファは塩基単位の表示単位バッフ
ァの集合体である。請求項５に記載の発明は、請求項１
記載の物質構造の表示方法において、表示する物質はヘ
テロアトムであり、前記表示用のバッファはヘテロアト
ム単位の表示単位バッファの集合体である。

【００１３】

【作用】請求項１に記載の発明においては、表示用のバ
ッファに表示属性を設定する領域が設けられ、このバッ
ファにデータベースを参照して得た立体構造データを格
納し、上記バッファの表示属性の設定に応じてグラフィ
ック表示及び文字表示を行うため、グラフィック表示と
文字表示とを関連付けた形態で行うことができる。

【００１４】請求項２に記載の発明においては、表示用
のバッファをアミノ酸残基単位の表示単位バッファの集
合とすることにより、表示単位バッファに格納されたア
ミノ酸残基の立体構造データの集合によりタンパク質の
グラフィック表示と文字表示とを関連付けて行うことが
できる。

【００１５】請求項３に記載の発明においては、グラフ
ィック表示での形状、色、線幅、線種の変化に対応し
て、文字表示でのフォント、反転、色が変化し、グラフ
ィック表示と文字表示との関連付けを行うことができ
る。請求項４に記載の発明においては、表示用のバッフ
ァを塩基単位のバッファの集合とすることにより、表示
単位バッファに格納された塩基の立体構造データの集合
により核酸のグラフィック表示と文字表示とを関連付け
て行うことができる。

【００１６】請求項５に記載の発明においては、表示用
のバッファをヘテロアトム単位のバッファの集合とする
ことにより、表示単位バッファに格納されたヘテロアト
ムの立体構造データの集合によりヘテロアトム質のグラ
フィック表示と文字表示とを関連付けて行うことができ
る。

【００１７】

【実施例】図１は本発明方法を適用したシステムの一実
施例の構成図を示す。同図中、データベース２０内には
ＰＤＢ２１が格納されている。タンパク質実験支援シス
テム２４はＰＤＢ２１をアクセスして所望のタンパク質
の立体構造データを読み出し、システム内の表示用バッ
ファ２５に展開する。また、この表示用バッファ２５か
らデータを読み出してＣＲＴ２６にタンパク質構造の立
体的なグラフィック表示、及び文字表示を行う。

【００１８】ここで、ＰＤＢ２１には図２に示す如き、
立体構造データが登録されており、タンパク質を構成す
る原子を各行で表わしている。各行は、原子の番号４
０、原素記号４１、アミノ酸残基名４２、アミノ酸残基
番号４３、Ｘ座標４４、Ｙ座標４５、Ｚ座標４６、存在
確率４７、温度因子４８、タンパク質ＩＣ４９、タンパ
ク質内のレコード番号５０から構成されている。

【００１９】図３は表示用バッファ２５の構造を示す。
表示用バッファ２５はアミノ酸残基単位の表示単位バッ
ファを複数リンクした構造である。表示単位バッファ３
０はアミノ酸残基名３１、アミノ酸残基番号３２、原子
情報ポインタ３３、他のアミノ酸残基との結合情報３
４、表示属性設定ビット３５、表示属性値３６、アミノ
酸残基解析データ３７、前リンクポインタ３８、次リン
クポインタ３９から構成されている。

【００２０】原子情報ポインタ３３はアミノ酸残基を構
成する原子毎に設けられた原子バッファの開始アドレス
を指示する。他のアミノ酸残基との結合情報３４は当該
アミノ酸残基に結合する他のアミノ酸残基を指示する。
表示属性設定ビット３５は４ビットで、表示形態を表わ
す表示属性、つまりタイプ、色、線種、線幅の夫々が設
定されているか否かを表わす。表示属性値３６はタイプ
３６ａ，色３６ｂ、線種３６ｃ、線幅３６ｄ夫々の値が
設定される。

【００２１】つまり、タンパク質実験支援システム２４
はＰＤＢ２１から図２に示す構造の立体構造データを読
み出して、そのアミノ酸残基毎に図３に示す構造の表示
単位バッファ３０を形成することにより、表示用バッフ
ァ２５に表示用データが展開される。 上記の表示用バ
ッファ２５内の表示単位バッファ３０における表示属性
設定ビット３５及び表示属性値３６は、表示単位バッフ
ァ３０単位で設定が可能とされている。残基解析データ
３７は当該アミノ酸の解析データが設定される。前リン
クポインタ３８には前にリンクされる表示単位バッファ
３０の開始アドレスが格納され、次リンクポインタ３８
には後にリンクされる表示単位バッファ３０の開始アド
レスが格納される。

【００２２】原子情報ポインタ３３でリンクされる原子
バッファ５０は当該アミノ酸残基を構成する原子数だけ
設けられる。各原子バッファ５０には原子名５１、原子
の番号５２、座標値５３（Ｘ座標、Ｙ座標、Ｚ座標）、
結合情報ポインタ５４、色情報５５、原子毎に持つ解析
データ５６から構成されている。上記の結合情報ポイン
タ５４は当該原子に結合する相手原子のポインタ６１
と、結合のタイプ（一重結合、二重結合等）６２とを対
で格納する結合バッファ６０の開始アドレスを指示す
る。色情報５５は当該原子を表示する色が設定される。
解析データ５６は当該原子の温度因子が設定される。

【００２３】図４，図５夫々はタンパク質実験支援シス
テムにおける表示属性変更メニューを示す。表示属性は
描画上の属性であるスタイルと、解析上必要な属性であ
るコンテンツとに大別され、図４はスタイル変更メニュ
ーを示し、図５はコンテンツ変更メニューを示す。

【００２４】図４において、欄７１を選択すると設定さ
れた表示属性を解除して指定されたアミノ酸残基の通常
表示を指示する。欄７２を選択すると指定されたアミノ
酸残基をワイヤフレームの表示モデルを指示する。欄７
３は指定されたアミノ酸残基の表示タイプを指定する。
この中の欄７３ａを選択するとアミノ酸残基内の側鎖が
結合する炭素原子Ｃαだけを表示し、欄７３ｂを選択す
ると炭素原子Ｃαとこれに結合する側鎖を表示し、欄７
３ｃを選択するとアミノ酸残基の主鎖だけを表示し、欄
７３ｄを選択すると主鎖及び側鎖、つまりアミノ酸残基
全体を表示する。欄７４ではアミノ酸残基を表示する色
を指定する。欄７４内の欄７５を選択するとアミノ酸残
基を構成する原子がその種類により予め定められた色、
例えば炭素は赤色、酸素は黄色等で表示される。欄７４
内の欄７６を選択するとアミノ酸酸基がその種類により
予め定められた色、例えばアニリンは緑、グリシンは青
等で表示される。

【００２５】また、欄７７を選択すると、欄７８が表示
され、ここで表示する線幅を１ポイント〜４ポイントの
間で選択できる。欄７９を選択すると、欄８０が表示さ
れ、ここで表示する線種を実線とするか、又は破線とす
るかを選択できる。図５において、欄８５は切り抜き用
の範囲を設定する。この中の欄８５ａを選択すると、指
定範囲の切り抜きを指示し、欄８５ｂを選択すると、指
定範囲の解除を指示し、欄８５ｃを選択すると指定範囲
以外の解除を指示する。

【００２６】欄８６は比較用の範囲を設定する。この中
の欄８６ａを選択すると、指定範囲を比較対象に設定す
ることを指示し、欄８６ｂを選択すると、指定範囲を比
較対象から解除することを指示する。ここで比較とは特
開平６−１８０７３７号に開示されたようにタンパク質
の立体構造同士を重ね合わせて表示するための比較であ
る。

【００２７】欄８７は指定範囲の表示を可視／不可視の
いずれにするかを設定する。この中の欄８７ａを選択す
ると、指定範囲の可視表示を指示する。欄８７ｂを選択
すると、指定範囲の不可視表示を指示し、欄８７ｃを選
択すると、指定範囲以外の不可視表示を指示する。

【００２８】本発明方法を適用したタンパク質実験支援
システムでは表示用バッファ２５に格納されている表示
用データを用いて、タンパク質又はその一部のアミノ酸
の立体構造を立体的にグラフィック表示すると共に、ア
ミノ酸残基を１文字で表現する文字列表示を行う。

【００２９】この場合、例えばアミノ酸残基、アラニン
（ＡＬＡ）を「Ａ」で表わし、アルジニン（ＡＲＧ）を
「Ｒ」で表わし、リジン（ＬＹＳ）を「Ｋ」で表わし、
ロイシン（ＬＥＵ）を「Ｌ」で表わし、グリシン（ＧＬ
Ｙ）を「Ｇ」で表わし、アスパラギン（ＡＳＮ）を
「Ｎ」で表わし、システィン（ＣＹＳ）を「Ｃ」で表わ
す。

【００３０】また、グラフィック表示と文字表示とはウ
ィンドウは異なるもののマルチウィンドウ表示できる。
また、グラフィック表示と文字表示とを対応させ、図４
の欄７１でスタンダードを選択するとグラフィック表示
では通常表示を行い、文字表示では文字の書体をクーリ
エとして表示する。また欄７１を選択してない場合はグ
ラフィック表示では欄７２又は７３で指示された表示を
行い、文字表示では文字の書体をボールドとして表示す
る。

【００３１】また、欄７４で色を指定すると、グラフィ
ック表示、文字表示共に指定された色で表示を行う。な
お、この場合、文字表示をモノクロームで表示しても良
い。また、図５の欄８７ａ〜８７ｃのいずれかが選択さ
れている場合、グラフィック表示では指定範囲を他の部
分より１ポイント太く表示し、文字表示では文字の書体
をイタリックとして表示する。また欄８５ａ〜８５ｃの
いずれかで切り抜きが指定されると、グラフィック表示
では指定範囲の線の太さを他の部分より１ポイント太く
表示し、文字表示では指定範囲をアウトライン（文字の
境界だけを表示する白抜きの表示）で表示する。欄８６
ａ，８６ｂで比較対象が指定された場合、グラフィック
表示では指定範囲を他の部分より１ポイント太く表示
し、文字表示では指定範囲にアンダーラインを引いて表
示する。

【００３２】このようにマウスドラッグ等により範囲を
指定すると、グラフィック表示では指定範囲を他の部分
より１ポイントだけ線幅を太く表示するが、文字表示で
は上記指定範囲の文字を反転表示する。図６はタンパク
質実験支援システムが行う表示処理のフローチャートを
示す。同図中、ステップＳ１０では、グラフィック表示
ウィンドウ又は文字表示ウィンドウに表示されているタ
ンパク質における表示属性を変更しようとする属性設定
部分のアミノ酸残基を指定する。この指定は１つの残基
又は複数残基の範囲であっても良い。次にステップＳ１
２で図４又は図５に示すメニューを用いて表示属性を指
定する。

【００３３】これによって、システムはステップＳ１４
に進み、指定されたアミノ酸残基の酸基バッファ３０上
の表示属性設定ビット３５を上記表示属性の指定に従っ
て設定する。また、ステップＳ１６で上記表示単位バッ
ファ３０上の表示属性値３６を表示属性の指定に従って
設定する。

【００３４】上記のステップＳ１４，Ｓ１６は指定され
たアミノ酸残基の全ての表示単位バッファ３０について
実行され、ステップＳ１８において全ての表示単位バッ
ファ３０設定が判別されるとステップＳ２０に進んで表
示ウィンドウの再描画（リドロー）を行い、処理を終了
する。

【００３５】図７はステップＳ２０で実行される表示ウ
ィンドウの再描画の詳細なフローチャートを示す。同図
中、ステップＳ２２ではグラフィック表示ウィンドウに
表示するタンパク質立体構造を表示属性が変更された表
示単位バッファ３０を用いて再描画する。次にステップ
Ｓ２４で文字表示に用いるフォントを、表示属性が変更
された表示単位バッファ３０を用いて設定する。

【００３６】次にステップＳ２６で文字表示ウィンドウ
が現在表示されているか否かを判別する。これが現在表
示されていなければ処理を終了し、現在表示されていれ
ばステップＳ２８に進み、先にステップＳ２４で設定さ
れたフォントを用いて文字表示ウィンドウを表示し、処
理を終了する。

【００３７】次に、本発明方法による表示例を図面と共
に説明する。図８は通常表示状態、つまり図４のメニュ
ーにおいて欄７１を選択した状態である。グラフィック
表示ウィンドウ１００にはタンパク質の立体表示１０１
ａ，１０１ｂが行われ、文字表示ウィンドウ１１０には
タンパク質の文字表示１１１ｂ（１０１ｂに対応）が行
われる。この文字表示では全てのフォントは通常表示を
表わすクーリエである。

【００３８】図９はグラフィック表示ウィンドウ１００
のタンパク質の立体表示１０１ａ内の部分１０２を範囲
指定し、表示属性変更メニューで欄７３ｂを選択して炭
素原子Ｃα側鎖を表示した状態である。部分１０２はタ
ンパク質１０１ａの他の部分より１ポイント太く表示さ
れ側鎖１０３〜１０６が表示されている。

【００３９】また、文字表示ウィンドウ１１０における
タンパク質の文字表示１１１ａ（１０１ａに対応）では
部分１１２（１０２に対応）がボールドのフォントを用
いて反転表示されている。図１０は図９の状態からグラ
フィック表示ウィンドウ１００のタンパク質の立体表示
１０１ａ内の部分１０７を範囲指定し、表示属性変更メ
ニューで欄８７ｂを選択し部分１０７を不可視とした状
態である。これによって部分１０７の表示は行われな
い。

【００４０】また、文字表示ウィンドウ１１０における
タンパク質の文字表示１１１ａでは部分１１２がボール
ドで表示され、部分１１３（１０７に対応）がイタリッ
クのフォントを用いて反転表示されている。図１１は図
１０の状態から文字表示ウィンドウ１１０のタンパク質
の文字表示１１１ａ内の部分１１４を指定し、表示属性
変更メニューで欄８５ａを選択し部分１１４の切り抜き
を指示した状態である。

【００４１】この状態では部分１１４がアウトラインの
フォントを用いて表示され、グラフィック表示ウィンド
ウ１００では図１０に対して変化はない。しかし、表示
ウィンドウ１１０のボタン１０８を選択して画面の切り
換えを行うと部分１１４に対応する部分がグラフィック
表示ウィンドウ１００の全面に立体的に表示される。

【００４２】図１２は図８の状態からグラフィック表示
ウィンドウ１００のタンパク質の立体表示１０１ｂ内の
部分１０９を範囲指定し、表示属性変更メニューで欄７
７及び７８を選択し部分１０９の線幅を太くした状態で
ある。これによって部分１０９の線幅が太くされて表示
される。

【００４３】また、文字表示ウィンドウ１１０における
タンパク質の文字表示１１１ｂでは、部分１１５（１０
９に対応）がボールドのフォントを用いて反転表示され
ている。このように、グラフィック表示と文字表示とが
関連付けされているため、グラフィック表示と文字表示
とのいずれか一方における範囲の指定及び表示属性の設
定が他方にも反映され、双方の表示で範囲指定や属性設
定の注目部位を一目で確認でき、利用者のコンピュータ
の知識が少ない場合でも簡単に操作することができる。

【００４４】特に、例えば論文や文献にタンパク質の文
字表現が記載されているとき、この文字表現の部分を文
字表示上で範囲指定すると、グラフィック表示によりそ
の立体構造の範囲指定された部分を他の部分と明瞭に区
別した状態で見ることができ視覚による直観的な解析を
行うことができる。

【００４５】なお、本発明では核酸やヘテロアトムのグ
ラフィック表示及び文字表示をタンパク質と同様に行う
ことができる。ここで、核酸とは、ＤＮＡやＲＮＡであ
る。ヘテロアトムとはタンパク質や核酸と相互作用する
物質であり、イオン分子や、水分子、補酵素、ＨＥＭＥ
（鉄・プロトポルフィリン錯体）、基質等である。

【００４６】図１３においてはグラフィック表示ウィン
ドウ１００に核酸の立体表示が行われ、文字表示ウィン
ドウ１１０に核酸を構成する塩素を１文字で表わした核
酸の文字表示が行われる。この場合、表示単位バッファ
３０は核酸単位で作成される。

【００４７】図１４においては、グラフィック表示ウィ
ンドウ１００にヘテロアトムの立体表示が行われ、文字
表示ウィンドウ１１０に各ヘテロアトムを文字で表わし
たヘテロアトムの文字表示が行われている。この場合、
表示単位バッファ３０はヘテロアトム単位で作成され
る。

【００４８】

【発明の効果】上述の如く、請求項１に記載の発明によ
れば、表示用のバッファに表示属性を設定する領域が設
けられ、このバッファにデータベースを参照して得た立
体構造データを格納し、上記バッファの表示属性の設定
に応じてグラフィック表示及び文字表示を行うため、グ
ラフィック表示と文字表示とを関連付けた形態で行うこ
とができる。

【００４９】また、請求項２に記載の発明によれば、表
示用のバッファを表示単位バッファの集合とすることに
より、表示単位バッファに格納されたアミノ酸残基の立
体構造データの集合によりタンパク質のグラフィック表
示と文字表示とを関連付けて行うことができる。

【００５０】また、請求項３に記載の発明によれば、グ
ラフィック表示での形状、色、線幅、線種の変化に対応
して、文字表示でのフォント、反転、色が変化し、グラ
フィック表示と文字表示との関連付けを行うことができ
る。。

【００５１】また、請求項４に記載の発明によれば、表
示用のバッファを塩基単位のバッファの集合とすること
により、表示単位バッファに格納された塩基の立体構造
データの集合により核酸のグラフィック表示と文字表示
とを関連付けて行うことができる。

【００５２】また、請求項５に記載の発明によれば、表
示用のバッファをヘテロアトム単位のバッファの集合と
することにより、表示単位バッファに格納されたヘテロ
アトムの立体構造データの集合によりヘテロアトム質の
グラフィック表示と文字表示とを関連付けて行うことが
でき、実用上きわめて有用である。

【図面の簡単な説明】

【図１】本発明方法を適用したシステムの構成図であ
る。

【図２】ＰＤＢの構造を示す図である。

【図３】表示用バッファの構造を示す図である。

【図４】表示用属性変更メニューを示す図である。

【図５】表示用属性変更メニューを示す図である。

【図６】表示処理のフローチャートである。

【図７】表示処理のフローチャートである。

【図８】本発明方法の表示例を示す図である。

【図９】本発明方法の表示例を示す図である。

【図１０】本発明方法の表示例を示す図である。

【図１１】本発明方法の表示例を示す図である。

【図１２】本発明方法の表示例を示す図である。

【図１３】本発明方法の表示例を示す図である。

【図１４】本発明方法の表示例を示す図である。

【符号の説明】

２０ データベース ２１ ＰＤＢ ２４ タンパク質実験支援システム ２５ 表示用バッファ ２６ ＣＲＴ ３０ 表示単位バッファ ５０ 原子バッファ

フロントページの続き (72)発明者 松澤 史子 神奈川県川崎市中原区上小田中1015番地 富士通株式会社内

Claims (5)

【特許請求の範囲】
1. 【請求項１】 物質の立体構造データが複数登録された
   データベースを参照し、物質の立体的なグラフィック表
   示及び文字表示を行う物質構造の表示方法において、 上記データベースを参照して得た立体構造データを表示
   属性の設定領域が設けられた表示用バッファに格納し、 上記バッファの表示属性の設定に対応した表示形態でグ
   ラフィック表示を行うと共に、 上記バッファの表示属性の設定に対応した表示形態で文
   字表示を行うことを特徴とする物質構造の表示方法。
2. 【請求項２】 請求項１記載の物質構造の表示方法にお
   いて、 表示する物質はタンパク質であり、前記表示用のバッフ
   ァはアミノ酸残基単位の表示単位バッファの集合体であ
   ることを特徴とする物質構造の表示方法。
3. 【請求項３】 請求項２記載の物質構造の表示方法にお
   いて、 前記グラフィック表示は形状、色、線幅、線種により表
   示形態を変化させ、 前記文字表示はフォント、反転、色により表示形態を変
   化させることを特徴とする物質構造の表示方法。
4. 【請求項４】 請求項１記載の物質構造の表示方法にお
   いて、 表示する物質は核酸であり、前記表示用のバッファは塩
   基単位の表示単位バッファの集合体であることを特徴と
   する物質構造の表示方法。
5. 【請求項５】 請求項１記載の物質構造の表示方法にお
   いて、 表示する物質はヘテロアトムであり、前記表示用のバッ
   ファはヘテロアトム単位の表示単位バッファの集合体で
   あることを特徴とする物質構造の表示方法。