JPH075180A - 反応管カバーの平面アレー - Google Patents

反応管カバーの平面アレー

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JPH075180A
JPH075180A JP6001201A JP120194A JPH075180A JP H075180 A JPH075180 A JP H075180A JP 6001201 A JP6001201 A JP 6001201A JP 120194 A JP120194 A JP 120194A JP H075180 A JPH075180 A JP H075180A
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 特にポリメラーゼ鎖反応(PCR)を実施す
るための装置で使用される、所定の立体配置で配置され
た複数の反応管をシールするために構成された反応管カ
バーの平面アレーを提供する。 【構成】 該平面アレーは、該アレーがウエブによって
相互に所定の立体関係で保持された複数の小塊からな
り、該小塊のそれぞれが前記反応管の1つの解放端部内
に嵌合しかつ該解放端部をシールするように形成されて
おり、該小塊のそれぞれが前記一方端部に嵌合する下方
部分と、該下方部分の上の上向きの凸面状の上方部分と
を有する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、一般的には化学反応
管、詳言すれば、好ましくはポリメラーゼ鎖反応(PC
R)を実施するための装置で使用される、二次元的アレ
ーのためのカバーに関する。
【0002】この出願は、1990年11月29日に公
告された米国特許出願第07/620606号、及び1
991年3月14日に公告された米国特許第07/67
0545号の一部継続出願であり、これらはそれぞれ本
願発明の譲渡人に譲渡されている。
【0003】
【従来の技術】多数の試料で同時にPCRを実施するた
めの自動化された熱サイクラーは、前記の特許明細書及
び米国特許第5,038,852号明細書に記載されて
いる。要約すれば、PCRは少量の特異的DNA配列を
比較的短時間内で著しく増幅することができる酵素方法
である。該方法は、反対ストランドに対して交雑しかつ
ターゲットDNAにおける勢力範囲を攻撃する2つのオ
リゴヌクレオチドプライマーを利用する。鋳型変性、プ
ライマーアニーリング、及びDNAポリメラーゼによっ
てアニールしたプライマーの延長を含む熱サイクルの反
復系列は、その末端がプライマーの5′端部によって決
定される特異的DNAフラグメントの指数関数型蓄積を
生じる。
【0004】増幅すべきターゲットDNA、オリゴヌク
レオチドプライマー、緩衝液、ヌクレオチドトリホスフ
ェート及び有利にはTagポリメラーゼのような熱安定
性酵素からなる反応混合物を合しかつ反応管に入れる。
次いで、管内に収容された反応混合物を、増幅したター
ゲットDNAを生じるために熱サイクラーでのPCRプ
ロトコールとして公知の多数の熱トランジッション及び
ソーク処理する。
【0005】反応管のアレーは、典型的にはそれぞれ1
つのトレー中の6×8アレー又は8×12アレーに配置
された48又は96管のいずれかからなる。該管のアレ
ーを、それぞれの管の下方部分がブロックと均一に熱接
触するするように金属熱サイクラーブロックに入れる。
次いで、該ブロックの温度を所定の数のサイクルのため
にPCRプロトコールの所定の温度/時間プロフィール
に関連して変動させる。
【0006】PCRプロフィールの変性工程は、二本鎖
のDNAを一本鎖に分離するために反応混合物を約95
℃に加熱しかつ維持する。この高温では、蒸発が問題と
なる。PCRプロセス中の管内容物の蒸発を阻止するた
めに、ロウ又は油の層をそれぞれの管内の混合物の上面
に配置するか、またはキャップを加熱カバーと共にそれ
ぞれの管にはめる。
【0007】キャップの方が油又はロウ層より有利であ
る。それというのも、このような層の適用は時間がかか
り、めんどうでありかつ混合物汚染をまねく。これらの
キャップは分離された個別のキャップであってもよく、
管に対して一体結合されていてもよい。
【0008】選択的に、一連のプラスチックキャップを
一緒に8又は12個の線状ストリップに連結することも
できる。キャップのそれぞれは、管状の下方部分及びか
つ上向きにドーム状の上方区分を有する。キャップのス
トリップを形成するように、一体タブによってキャップ
を一緒に結合する。
【0009】反応管のトレーには、典型的には適当な試
料液体を充填し、単一ストリップ内のそれぞれの個々の
キャップを、ドーム状部分が上になりかつ管状部分が反
応管の内側に嵌合しシールするように、管に挿入する。
該キャップは、反応管が保持装置によってトレー内部に
保持されているので、個々のキャップストリップの一方
端部を引き上げることにより取り外すことができる。こ
のようなキャップの反応管への取り付けは、比較的面倒
であり、かつそれぞれ個々の管内へのそれぞれのキャッ
プの管状部分の特殊な挿入には時間のかかる処理が必要
である。
【0010】キャップをした反応管のトレーを熱サイク
ラーブロックに挿入し、加熱板カバーをブロック上に下
降する、その際ドーム状キャップを圧し下げて反応管の
全てに一様に着座しかつそれぞれの管と熱サイクラーブ
ロックとの間の良好な熱的接触を保証する。加熱板は熱
サイクラーブロック上に突出する管の上方部分上の閉鎖
環境を提供する。この加熱板カバーは、両者とも熱サイ
クラーブロックの本体上に突出する管の上方部分内部又
はキャップの下の蒸気凝縮を阻止するために、熱サイク
リング中のどの熱サイクリング温度よりも高い温度に維
持される。従って、蒸発損失はキャップによって防止さ
れ、かつ内部蒸気凝縮は板状カバーの下の高められた温
度により防止される。
【0011】また、熱平板カバーは、反応管内部の試料
の温度に影響を及ぼす還流も防止する。還流は反応管内
部の試料上の密閉空間内での循環する蒸発及び凝縮であ
る。還流は熱サイクリングプロトコール中の試料温度を
低くする。
【0012】熱サイクリングプロトコールが完了した後
に、キャップをした反応管のトレーを熱サイクラーから
取り出し、かつ室温に戻すことができる。次いで、キャ
ップのストリップを管から、各々の管間の交差汚染を防
止するために、慎重に管から取り除き、アレーをPCR
産物検出又はその他の処理のために移動させる。
【0013】個々のドーム状キャップのストリップから
なるプラスチックキャップの配置は、高い処理量が必要
とされない小型PCRのためには極めて好適である。こ
の設計は、それぞれの個々の反応管を隔離する利点を提
供するが、適所への位置決め及び取り外しがめんどうで
ある。
【0014】
【発明が解決しようとする課題】従って、ユーザに対し
て、管の全アレーのシールの簡単かつ確実な方法並びに
PCRプロセスの終了時に管への容易な、より効果的な
アクセスを可能にする全面カバーもしくはブランケット
を提供することである。
【0015】
【課題を解決するための手段】本発明によるカバーは、
所定の立体配置で配置された複数の反応管をシールする
ための好適である反応管カバーの平面アレーである。こ
の最も簡単な態様においては、本発明によるカバーは、
複数の貫通口を有し、該貫通孔の間に、所定の立体配置
の反応管のそれぞれのためのカバー部分のアレーを形成
するフレキシブルなプラスチック材料からなる平面シー
トである。この平面シートは、貫通孔が管と、個々の管
の上面上のカバー部分との間に位置するように反応管の
平面アレーの上面上に位置する。加熱板を反応管上のカ
バー上に下降させると、加熱板は該カバー及び管を押圧
して熱サイクラーブロックと固定接触させ、次いでPC
R法を実施する。加熱板を取り除くと、カバーは簡単に
最短の時間消費を必要とするに過ぎない1回の動作で持
ち上げられる。
【0016】この本発明のカバーの最も簡単な態様は、
反応管のそれぞれの上方リップの回り単一の上面シール
を行う。カバー内のカバー部分間の貫通孔は、加熱され
た空気を管間をかつ加熱板から下向きに熱サイクラーブ
ロックに向かって循環させ、熱サイクラーブロックの上
に延びる反応管の部分内の蒸気凝縮を防止する。
【0017】第2の、より有利な実施態様は、カバー部
分がウエブによって互いに所定の間隔で保持されたフレ
キシブルなプラスチック小塊であるシートカバーからな
る。該小塊のそれぞれは、反応管の解放端部に嵌合して
二重のシールを行うように形成されている。小塊のそれ
ぞれは、下向きの凸面状下方部分を有し、かつ該下方部
分の直接上に上向きの凸面状部分を有する。小塊のそれ
ぞれを連結するウエブは、小塊の間に間隔を置いて該ウ
エブを貫通する貫通孔を有し、カバーの下及び上の熱循
環を行う。
【0018】間隔を置いた相対関係が長方形のトレー内
に保持される反応管の平面的長方形アレーをカバーする
ために利用される平面アレーである場合には、小塊は間
隔を置いた直線的横列及び縦列に整列し、有利には該小
塊の間に対角線方向に貫通孔を有する。小塊の間の貫通
孔は、加熱板と、熱サイクラーブロック上に延びる反応
管の上側との間を空気を循環させる。
【0019】それぞれの小塊は、中央シート又はウエブ
の面から延びる外側に向かって延びる外側に向いた凸面
状の上方部分及び下方部分を有する。小塊のそれぞれの
下方部分は、有利には半球形の形状を有し、該形状は反
応管の口の内径に等しいか又はそれよりも小さい直径を
有する。この半球形形状は、小塊のそれぞれを2つの形
式で管の1つに嵌合させかつ中心的にシールする。第1
に、半球形部分は、口に隣接した管の内側表面の回りに
環状シールを形成するように管に下向きに嵌合する。第
2に、半球形の下方部分の外周又は底の回りのウエブ
は、管の口の上表面に対して環状の平面なシールを形成
する。
【0020】小塊の上方部分は、上向きの凸面を有し、
かつ有利には上向きの凸面状部分から上向きに延びる中
心ニップルを有する。このニップルは、円筒状突起の
形、又はより有利には上方の凸面状部分の上に鉛直方向
に延びる平滑な、湾曲した、ドーム状の突起であってよ
い。
【0021】パーキンエルマー社の GeneAmp(R)PCRシス
テム熱サイクラーで本発明によるカバーを使用した試験
で、試料分解を呈することなく前記の通常の個々のキャ
ップストリップを用いた管と同じPCR結果が得られ
た。本発明のカバーは、あらゆる液体又は蒸気漏洩を阻
止するための管の効果的シールを提供する。小塊の上方
部分のニップルが、加熱板蓋に粘着せず、かつ反応管の
全てが熱サイクラーブロック内に確実にシールされるこ
とを保証する有効な下降力をもたらす。
【0022】
【実施例】次に図示の実施例につき本発明を詳細に説明
する。
【0023】本発明に基づくカバーの第1実施例は、図
1に上面図で示されており、かつ図2の熱サイクラーブ
ロックに配置された反応管のアレーに設置される。カバ
ー10は、トレー内に保持された反応管の相応する平面
アレーの中心に相応する所定の長方形の立体配置で配置
された反応管カバー部分12の平面アレーからなる、有
利にはシリコーンゴムのフラットシートである。代表的
数のカバー部分が、図1に鎖線で示されている。多数の
孔14がカバー部分12の間に設けられている。
【0024】図2は、熱サイクラーブロック20中に延
びる反応管18のトレーを含む熱サイクラーの部分的断
面図を示す。管18のそれぞれは、有利には熱サイクラ
ーブロック20の上表面より高くない液面まで反応混合
物22を収容し、かつ解放端部24を有する。
【0025】カバー10は、管18の解放端部24と、
トレーアセンブリー16の上表面26との間の距離より
も僅かに大きい厚さを有する。従って、加熱板28をト
レーアセンブリー16の上表面へ下降させると、カバー
10は反応管18の上面に向かって押し込まれ、該上面
を熱サイクラーブロック20と固定接触させる。同時
に、カバー10は、それぞれの管18の解放端部24の
環状上面に対して押圧されることにより管18のそれぞ
れの解放端部24全体をシールする。
【0026】加熱板28は、管の上部分内での蒸気凝縮
を防止するためにブロック30の上に延びる反応管18
の部分の周囲の空気を加熱するように設計されている。
シリコーンゴムカバー10は熱バリヤーであり、孔14
は加熱板28の下の空気を循環させるために重要であ
る。加熱板をトレー16の上縁部に対して係止させる
と、密閉空間は急速に、孔14を経る輻射及び滞留熱に
よる熱サイクラーブロックの温度よりも高い温度に急速
に加熱されかつ維持される。従って、本発明による第1
実施例に基づくカバー10は、アレー内のそれぞれの管
の解放端部の回りに単一の環状シールを生じる。カバー
10の厚さは、トレー16の上端部26の上に突出する
ために十分であるべきである。しかしながら、該厚さ
は、カバー部分の下側での蒸気凝縮を防止するために、
環状のシール部分の内側のシルコーンゴムカバーによる
熱伝達を低下させるほど大きいべきでない。管の解放端
部24とトレー16の上表面26との間の距離よりも約
1/8インチ大きい厚さが、ほぼ最適であると見なされ
る。
【0027】中心距離9mmの反応管の典型的8×12
アレーのためには、貫通孔は有利にはほぼ4mmの直径
を有するべきである。カバーの厚さは、板カバーを下降
させると、アレー内のそれぞれの管のために適切なシー
ルをもたらす適切な厚さを提供すべきであるが、可能な
限り薄いべきである。
【0028】フレキシブルなプラスチックシート材料
は、有利にはシリコーンゴムである。しかしながら、高
温抵抗能力及び35〜65ジュロメータの範囲内、有利
には約50ジュロメータのジュロメータを有する任意の
フレキシブルなプラスチック材料が有利である。この類
型の材料は、高温で長い寿命を有する。シート材料は、
反応管内容物にさらされるカバーの下での凝縮を防止す
る、0.001W/cm・゜K、有利には0.002〜
0.004W/cm・゜Kの範囲内の熱伝導率を有し、
かつPCR法と相容性である。
【0029】本発明によるカバーの第2実施例は、図3
に上面図、及び図4に部分的側面図で示されている。カ
バー50は、トレー内に保持された反応管の相応する平
面アレーの中心の相応する所定の長方形の立体配置で配
置された個々の反応管カバーもしくは小塊52からなる
平面アレーである。個々のカバーもしくは小塊52のそ
れぞれは、フレキシブルなプラスチック材料からなりか
つ互いに所定の相対間隔で一体ウエブ54によって保持
されている。ウエブ54は小塊52と一体であってよ
く、かつ成形された又は適当な位置にウエブ54に接着
された小塊52を有する同じ材料又は異なった材料から
製造されていてもよい。
【0030】図4に最良に示されているように、小塊5
2のそれぞれは、別の形状を使用することもできるが、
有利には下向きの凸面、例えばドーム状に形成された下
方部分56を有する。小塊52は下方部分56上に上向
きに凸面の上方部分58を有する。上方部分58から上
向きに、一体ニップル60が延びている。ニップル60
は図4に示されているように全体的に丸味を帯びた円錐
形突起であってよく、又は丸味を帯びた先端を有する円
筒形柱状であってもよい。ニップル60上の丸味を帯び
た先端の目的は、熱板64を力Fでカバー50上に下降
させた際に、ニップルが図5に示されている熱板64の
下表面に付着するのを阻止することである。
【0031】図5は、熱サイクラーブロック70内へ延
びる反応管68のトレー66を収容する熱サイクラーの
部分的断面図を示す。加熱板64をトレー66上に下降
させると、ニップル60は下向きに押圧され、管68内
に着座しかつシールし、かつ一方管68を熱サイクラー
ブロック70内に固定接触させる。
【0032】ニップル60の丸味を帯びた上方先端は、
PCRプロトコールの完了後にトレー66との係合から
取り外した場合、熱板64の下側に向かう吸引作用が発
生するのを阻止する。このことはカバー52が板64と
一緒に意図せずに持ち上がるのを防止する。
【0033】加熱板64は、管68の上方部分内での蒸
気凝縮を防止するために、ブロック70上に延びる反応
管68の部分の回りの空気を加熱するように設計されて
いる。本発明に基づくシリコーンゴムカバーは断熱体で
あるので、小塊52の縦列と横列の間に貫通孔72が設
けられている。これらの貫通孔は、加熱板64の下及び
ブロック70の表面に上の空気の放射熱伝達及び対流循
環を可能にする。従って、熱板64はトレー66の上端
部に対して載るので、その間に密閉空間が形成され、該
空間はブロック70の温度よりも高い温度に急速に加熱
されかつ維持される。
【0034】本発明によるカバーの第2実施例は、それ
ぞれの反応管上の2つの分離されたシールを行う。その
第1のシールは、管68の口の上方表面76と、小塊5
2の底部の回りのウエブ54の部分との間で行われる。
第2のシールは、半球状の下方部分56の環状部分と反
応管68の口の回りの内側表面74との間で行われる。
別の実施例では、この第2のシールは、該シールのため
の大きな接触表面を形成するように、凸面状下方部分の
円筒状延長部によって構成されていてもよい。
【0035】力Fを加熱板から取り除きかつ板を、トレ
ー66を取り外すことができるように持ち上げると、カ
バーは管68のアレー上の適所に残る。管68のアレー
全体は、1つの運動でカバー10を持ち上げることによ
り簡単に取り外すことができる。従って、カバーの取り
付け及び取り外しは、最短時間を要し、適切なシーリン
グを保証し、操作時間を最短にし、よって分析のための
コスト低下をもたらす簡単な処置である。
【0036】カバー部分12又は小塊50は、96個の
反応管の標準アレーに相応して9mmの中心距離の間隔
を有する。該貫通孔は、直径が約4mmである。もちろ
ん、反応管トレー設計に基づき別の間隔及び寸法を利用
することができる。有利なシリコーンゴムは、希硝酸、
希水酸化ナトリウム、次亜塩素酸ナトリウム(ブリ−
チ)及びエタノールに対して化学的抵抗性を有し、ショ
アーA50の硬度を有するべきであり、かつオートクレ
ーブ処理可能であるべきである。この適用において、P
CR生成物及び試薬の対して不活性であり、オートクレ
ーブ処理可能であり、かつ実質的に有害な効果を伴わず
に次亜塩素酸塩溶液中で洗浄可能であるので、有利であ
る。好適なシリコーンゴムは、High Tech Rubber Compa
ny, Anaheim, CA から市販されている。
【0037】フレキシブルであり、使用される試薬との
反応に対して不活性であり、かつ100℃を越える温度
に対して繰り返し熱サイクリングに対して耐えることが
できる限り、別の材料を使用することもできる。また、
小塊はそれぞれ、加熱板から小塊を介する全体的熱伝達
を増大させるために金属“B−B”のような高い熱伝導
性材料の内部充填物を有することができる。本発明によ
るカバー10及び50は、反応管の全部のトレーと共に
使用する必要がない。例えば、横列8個と縦列12個、
計96個の管を有するアレーを、有効に本発明によるカ
バーと共に使用することができる。しかしながら、任意
の数の管を含む試料トレーが、本発明によるカバーのい
ずれでも適切にシールされる。従って、本発明によるカ
バーは、常用のキャップストリップを有効に交換するこ
とができ、従って処理中に著しい時間が節約される。
【0038】カバーの全実施例は、管のそれぞれを極め
て良好に密封しかつ漏洩を防止し、管が油不在のままで
あるように操作し、熱板から取り除のが容易であり、か
つ加熱板に粘着しない。
【0039】本発明をその特殊な実施例に関して記載し
たが、ここに開示した本発明の技術思想から逸脱するこ
となく、多くの変化、改変及び変更を行うことができる
ことは自明である。例えば、カバー10及び50の図示
の実施例は、長方形のアレーである。該アレーは、トレ
ー配置に基づき、円形、他の多角形又は環状配列であっ
てもよい。更に、貫通孔は、図1及び図3に示されてい
るように、直線的に隣接した小塊の間又は小塊の間に対
角線方向に配置されていてもよい。これらはまたスロッ
ト又はカバー部分が連結されるような長さの別の設計で
あってよい。従って、特許請求の範囲に記載の技術思想
及び広義の範囲内に含まれる全ての変化、改変及び変更
も本発明に包含される。本発明の明細書に引用した全て
の特許出願、特許及びその他の刊行物も、それらの全て
が包含される。
【図面の簡単な説明】
【図1】本発明の1実施例に基づくカバーの上面図であ
る。
【図2】反応管に設置した図1に示したカバーを有する
熱サイクラー及び反応管トレーの部分的断面図である。
【図3】本発明の第2実施例に基づくカバーの上面図で
ある。
【図4】図3に示した本発明による方法の第2実施例の
部分的拡大側面図である。
【図5】熱サイクラーアセンブリーと本発明の第2実施
例に基づくカバーを使用する反応管トレーの部分的断面
図である。
【符号の説明】
10,50 カバー、 12 カバー部分、 14,7
2 貫通孔、 16,66 トレー、 18,68
管、 20,70 熱サイクラーブロック、 22 反
応混合物、 24 解放端部、 28,64 加熱板、
52 小塊、54 ウエブ、 60 ニップル
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ロバート ラグーザ アメリカ合衆国 コネチカット ニュータ ウン ウィリー レーン 3 (72)発明者 ラルフ キース アメリカ合衆国 コネチカット トランブ ル オークランド ドライヴ 14

Claims (13)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 所定の立体配置で配置された反応管をシ
    ールするために構成された反応管カバーの平面アレーに
    おいて、該アレーが複数のウエブによって相互に所定の
    立体関係で保持された複数の小塊からなり、該小塊のそ
    れぞれが前記反応管の1つの解放端部内に嵌合しかつ該
    解放端部をシールするように形成されており、該小塊の
    それぞれが前記一方端部に嵌合する下方部分と、該下方
    部分の上の上向きの凸面状の上方部分とを有することを
    特徴とする、反応管カバーの平面アレー。
  2. 【請求項2】 前記部分が前記ウエブに一体に接合され
    ている、請求項1記載のアレー。
  3. 【請求項3】 前記ウエブが前記小塊の間に間隔を置い
    た複数の貫通孔を有する、請求項1記載のアレー。
  4. 【請求項4】 前記アレーが一体のゴム成形体である、
    請求項1記載のアレー。
  5. 【請求項5】 前記成形体がシリコーンゴムである、請
    求項4記載のアレー。
  6. 【請求項6】 前記下方部分が中実のほぼ半球形の形状
    を有する、請求項1記載のアレー。
  7. 【請求項7】 所定の立体配置で配置された複数の反応
    管をシールするために構成された反応管カバーの平面ア
    レーにおいて、該アレーがウエブによって相互に所定の
    立体関係で接合された複数のフレキシブルなプラスチッ
    ク小塊からなり、該小塊のそれぞれが前記反応管の1つ
    の解放端部内に嵌合しかつ該解放端部をシールするよう
    に形成されており、該小塊のそれぞれは下向きの凸面状
    の下方部分と、該下方部分に上の上向きの凸面状の上方
    部分とを有し、ニップルが上向きの凸面状の上方部分か
    ら上方に向かって延びていることを特徴とする、反応管
    カバーの平面アレー。
  8. 【請求項8】 前記ウエブが前記小塊の間に間隔を置い
    た複数の貫通孔を有する、請求項7記載のアレー。
  9. 【請求項9】 前記アレーがシリコーンゴムからなる一
    体成形体である、請求項7記載のアレー。
  10. 【請求項10】 前記ニップルが前記上方及び下方部分
    の上の中心にあり、かつドーム状の形状を有する、請求
    項9記載のアレー。
  11. 【請求項11】 前記下方部分がほぼ半球形の形状を有
    する、請求項7記載のアレー。
  12. 【請求項12】 複数の反応管をシールするように構成
    された反応管カバーのアレーにおいて、複数のフレキシ
    ブルなプラスチック小塊を有する一体成形体からなり、
    前記小塊のそれぞれが複数の貫通孔を有する一体ウエブ
    によって横列及び縦列に互いに所定の平面的相対関係で
    フレキシブルに保持されており、前記小塊のそれぞれが
    前記ウエブから延びる下向きの凸面状のほぼ半球形の下
    方部分と、前記下方部分の上に前記ウエブから延びる上
    向きの凸面状の上方部分と、前記上向きの凸面状部分か
    ら延びる中心ドーム状のニップルとを有することを特徴
    とする、反応管カバーの平面アレー。
  13. 【請求項13】 所定の立体配置で配置された複数の反
    応管をシールするように構成された反応管カバーの平面
    アレーにおいて、該アレーが前記立体配置に相応するよ
    うに配置された複数の間隔を置いたカバー部分を有する
    プラスチックのフレキシブルな弾性シートからなること
    を特徴とする、反応管カバーの平面アレー。
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