JPH06504909A - 結核の診断及び抑制に用いるマイコバクテリウムポリペプチド及びそれをコードする核酸 - Google Patents

結核の診断及び抑制に用いるマイコバクテリウムポリペプチド及びそれをコードする核酸

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JPH06504909A JP4503952A JP50395292A JPH06504909A JP H06504909 A JPH06504909 A JP H06504909A JP 4503952 A JP4503952 A JP 4503952A JP 50395292 A JP50395292 A JP 50395292A JP H06504909 A JPH06504909 A JP H06504909A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 結核の診断及び抑制に用いるマイコバクテリウムポリペプチド及びそれをコード する核酸本発明は、結核の診断に用いることの出来るポリペプチド及びペプチド 、特に組換えポリペプチド及びペプチドに関する。
又、本発明は、結核に対するワクチンの製造に於いて有効成分の一つとして用い ることの出来る生物学的純度状態にある上記ポリペプチド及びペプチドの製造法 に関する。
又、本発明は、当該ポリペプチド及びペプチドをコードする核酸に関する。
更に、本発明は、上記ポリペプチド及びペプチドを用いたインビトロ診断法及び キット及び、結核に対する有効成分として上記ポリペプチド及びペプチドを含有 するワクチンに関する。
“組換えポリペプチド及びペプチド”は、有効な細胞宿主内での適当な規制要素 の制御下、対応するDNA配列の転写及び翻訳を介する遺伝子工学により製造さ れ得るポリペプチド鎖を有する分子に関すると理解されたい。従って、本明細書 に於いて用いるような“組換えポリペプチド”という表現は、グリコジル化基の 如き他の基をも含むポリペプチドの可能性を排除しない。
“組換え”とは、ポリペプチドが遺伝子工学により製造された事実を意味し、詳 しくは、細胞宿主中に用いられる発現ベクター中に既に導入されている対応する 核酸配列の細胞宿主内での発現の結果生起することを意味する。
しかしながら、この表現は、異なる方法、例えば、蛋白質合成に於いて用いられ る方法による古典的化学合成又は、より大きい分子の蛋白質分解によって製造さ れるポリペプチドの可能性を排除しない。
“生物学的に純粋”又は“生物学的純度”とは、一方に於いて、組替えポリペプ チドをワクチン組成物の製造に用いることが出来るような等級の純度を意味し、 他方に於いて、夾雑物、更に詳しくは天然の夾雑物がないことを意味する。
結核は、開発途上国に於いて主要な疾病として残っている。
この状況は、ある地方、特にエイズ患者の中での結核の高い発生率がこの疾病の 新拡散源を示す地方に於いて劇的である。
結核は、細胞を介する免疫機構がこの疾病に対する防御及び抑制の両者に必須の 役割を果たす慢性伝染病である。
BCGワクチン及びいくつかの有効な薬剤にもかかわらず、結核は、主要な地球 全体の問題を残している。この疾病のスクリーニングに大量に用いられるツベル クリンPPD (蛋白質精製誘導体)を用いる皮膚試験は、他の病原性マイコバ クテリア又は環境非病原性マイコバクテリアとの交叉反応性のために特異性が小 さい。
更に、ツベルクリンPPDは、血清試験(ELISA)に用いる場合、BCGワ クチン接種を受けた患者及び既に感染したことのある患者から、進行性結核が現 れている及び、結核の初期の且つ迅速な診断が要求される患者を識別することが 不可能である。
分子量32−kDaを有する蛋白質は、既に亜鉛欠乏しBCGの32−kDa蛋 白質抗原の精製、部分的特徴付は及び同定” Microb、 Pr1bofe ++、 2:351 )として同定された。そのNl’12−末端アミノ酸配列 (Phe−8er−Arg−1’to−G17−Let)は、M、 bow’s 凹(Wiker、H,G、等、、 1986年、”MPBS9. Mycob口 cleriisB)蛋白質について報告されたものと同一である。抗原85−複 合体は、マイコバクテリアの種々の菌株中に存在する(Delrw!I1.等、 、1989年、 mマイコバクテリアの培養濾液中の2種類の免疫優性蛋白質抗 原(32−に、Da及び55− kDa)出現についての亜鉛欠乏の効果’ J 、 Ge++ Mietobiol、135ニア91゜これは、通常のツートン 培養濾液中に主要蛋白質として生存細菌により分泌され、結核の血清学的診断( Tirneer M、等、。
1988年、′ヒト結核に於ける体液性免疫反応: M7cob*ejer+a mプリンG、A及びM’ J、 Cl1n、 Microbiol、 26:1 714)及びハシセン病の血清学的診断(Rwmschl*HH,S、等、、  1ul1年、”M7cob*cler+as Iabercwlos口の30キ ロダルトン、31キロダルトン及び32キロダルトン抗原に対するらい腫及び結 核ハシセン病患者の血清学的反応’ J、 Cl1n、 Microbiol、  26:220G)に有用である。更に、結核患者(HaFfe口に2等、、  1988年、 °結核活動期患者に於ける特異的リンパ球増殖、γ−インターフ ェロン産生及び、32− kDaマイコバクテリア性抗原(P 32)に対する 血清免疫グロブリンG’ Sc*nd、 I、lmm1no1.27:L87) 及びハシセン病患者及び、PPD陽性及びレプロミン陽性の健康人由来の、末梢 血白血球に於ける32− kDa蛋白質に誘導される特異的リンパ球増殖及びイ ンターフェロン−γ(IFN−γ)産生。最近の研究は、BCG−感作マウスひ 鷹細胞中の32kDa蛋白質誘導IFN−γの量がおそら(H−2制御下にある ことを示している(FIslHe* K、等、、19119年。
”M7cob1clerimm bowis bscillit Ct1me目 e−Gwttimの32−キロダルトン抗原(P 32)との反応の於けるイン ビトロγ−インターフェロン産生のH−2に関連した抑制”It)sct、Im s。
56:3196)。最後に、マイコバクテリアのフィブロネクチンに対する高親 和性は、抗原85−複合体の蛋白質に関連している(^bow−Xeid C, 等、、19811年、”Mycobtejer+wm 1wbere++Ios +z及びMycob*eleriwm bowit BCGによって放出される フィブロネクチン結合性抗原の特徴付け” 1alecL Its、 56:3 f146)。
Wiker等(Wiktr H,G、等、、 1990年、′マイコバクテリア 性抗原85複合体蛋白質をコードする3種類の別個の遺伝子の証拠”Infec t luml、 58:272)は、最近、M、 bovit BCG培養濾液 から分離した抗原85A、85Bおよび85Cが、それらのN H2末端領域中 にいくつかのアミノ酸置換を有し、従ってこれらの蛋白質をコードする複数の遺 伝子の存在が強く示唆されることを示した。しかしながら、M、boマロBCG の抗原85Cを示すデータは、その明確な同定及びその構造的要素及び機能的要 素の特徴付けを可能にするには不十分である。
α−抗原遺伝子(M、 bowロBCG亜株Tok7oの85B遺伝子、)(M *1tao K、 等、、 1988年、 “細胞外α−抗原のM7cob麿c jerium同性を示す5M7eobxcterias libercalog is由来の85A抗原をコードする遺伝子について述べられている(Botre +uas L、等、。
1989年、’1Jycob1cferius 1abcrealos口の32 −キロダルトン蛋白質遺伝子のクローニング、配列決定及び発現”Infect 。
白質ゲノムクローンが分離され配列決定された。この遺伝子の完全な配列は、ひ とつのサイレントヌクレオチド変換を除いてM7cob*cfe+in+a t uberculosisの85A遺伝子由来のそれと同一である(De wit  L、等、、 1990年、”M7cobtcfcriws boy目BCGの 32kDa蛋白質遺伝子(抗原85A)のヌクレオチド配列”それぞれ抗原85 A及び85Bをコードする少なくとも2種類の遺伝子を含有する可能性はあるが 証明されたわけではなかった。l!7cob*cje自us l+berc++ Ios口及び11. bowisののゲノムに関して、それぞれ85A及び85 Bをコードする遺伝子以外には新しい遺伝子の存在はなんら証明されなかった。
本発明の態様の一つは結核の検出及び抑制に用いることの出来る新規な蛋白質及 びポリペプチドをコードする新規な核酸群を提供することである。
本発明の別の態様は、大量調製が可能な生物学的に純粋な組換えポリペプチドの ペプチド鎖をコードする核酸を提供することである。
本発明の別の態様は、−結核のインビトロ迅速診断試験としての血清学的試験に 於いて又は、皮膚試験に於いて、−又はワクチンの免疫原性成分として用いるこ との出来る抗原を提供することである。
本発明の別の態様は、BCGに対するワクチン接種を受けた人又は既に感染して いる人と進行性結核にかかっている患者との識別を可能にする、結核用迅速イン ビトロ診断方法を提供することである。
本発明の別の態様は、結核用インビトロ診断試薬及び、M 1wbercslo r+sを他のマイコバクテリア菌株から識別同定するインビトロ診断試薬として 用いることの出来る核酸プローブを提供することである。
本発明の核酸は、 中間1に示す1番目のヌクレオチドにより構成される末端から149番目のヌク レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列を含有する、 *又は、次のペプチド又はポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のうち少 なくとも1つを含有するニー図1に示す一46番目のアミノ酸により構成される 末端から一1番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のもの、又は 一図1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のもの、又は −5QSNGQNY、又は −PMVQ I PRLVA、 又[−GLTLR TNQTFRDTYAADGGRNG、又は−PPAAPAAPAA。
*又はニ ー上記ヌクレオチド配列又はその相補体とハイブリッド形成したヌクレオチド配 列、 一上記ヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列、又は−上記ヌクレオチド 配列のTをUで置き換えることの出来るヌクレオチド配列を含有する、 *又は上記ヌクレオチド配列により構成される。
5QSNGQNYは、図1に示す8SC配列の84番目から91番目までのそれ に対応する配列である。
PMVQ I PRLVAは、図1に示す8SC配列の191番目から200番 目までの配列に対応する配列である。
GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNGは、図1に示す8SC配列の2 29番目から250番目までの配列に対応する配列である。
PPAAPAAPAAは、図1に示す8SC配列の285番目から294番目ま での配列に対応する配列である。
ハイブリダイゼーションは、次の条件下で行うニーハイブリダイゼーション及び 洗浄培地:*好ましいハイブリダイゼーション培地は、約3xSSC[5SC− 0,15M塩化ナトリウム、0.015Mクエン酸ナトリウム、pH7]、約2 5mMの燐酸緩衝液pH7,1及び20%脱イオンホルムアミド、0.02%フ ィコール、0.02%BSA、0.02%ポリビニルピロリドン及び約0.1m g/ml剪断変性サケ精子DNAを含有する、*好ましい洗浄培地は、約3xS SC,約25mMの燐酸緩衝液pH7,1及び20%脱イオンホルムアミドを含 有する一一ハイブリダイゼーシクン温度(HT)及び洗浄温度(WT)は、45 ℃から65℃であり; 一図1に示す1番目のヌクレオチドにより構成される末端から149番目のヌク レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列のHT=WT=6 5℃であり、ポリペプチドx−y : ・図1に示すX番目のアミノ酸により構成される末端からY番目のアミノ酸によ り構成される末端までの範囲の配列;・図1に示す一46番目のアミノ酸により 構成される末端から一1番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲の配列 をコードすると定義した本発明の核酸のHT=WT=65℃であり、 ・図1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲の配列をコードすると定義した本発明の核酸 のHT=WT=60℃であり、 ・次の配列により表されるポリペプチドをコードすると定義した核酸のHT = WTは、 ・5QSNGQNY HT−WT−45℃ニーPMVQIPRLVA HT−W T−55℃;−GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNGHT=WT=6 5℃; ・PPAAPAAPAA HT=WT=65℃である。
上記温度は、約±5℃として表される。
本発明の好ましい核酸は、少なくとも次のヌクレオチド配列を含有するニ ー図1の150番目のヌクレオチドにより構成される末端から287番目のヌク レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 一図1の224番目のヌクレオチドにより構成される末端から287番目のヌク レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 −図1の537番目のヌクレオチドにより構成される末端から560番目のヌク レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 一図1の858番目のヌクレオチドにより構成される末端から887番目のヌク レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 一図1の972番目のヌクレオチドにより構成される末端から1037番目のヌ クレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 一図1の1140番目のヌクレオチドにより構成される末端から1169番目の ヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 又は次のヌクレオチド配列を含有するニー上記ヌクレオチド配列とハイブリッド 形成するヌクレオチド配列又は、 一上記ヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列又は、−上記ヌクレオチド 配列のTをUで置き換えることができる、又は上記ヌクレオチド配列により構成 されるヌクレオチド配列。
ハイブリダイゼーションは、次の条件下で行うニーハイブリダイゼーション及び 洗浄培地は、先に明確にした通りである; −x−y、即ち、図1に示すX番目のヌクレオチドにより構成される末端からY 番目のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列により 定義した本発明の核酸のハイブリダイゼーション温度(HT)及び洗浄温度(W T)は:(150)−(287)HT=WT=65℃(224)−(287)H T=WT−80℃(537)−(560)HT−WT=45℃(858)−(8 87)HT=WT−55℃(972)−(1037)HT=WT=85℃(11 40)−(1169)HT=WT−65℃。
本発明の核酸の好ましい群は、次のペプチド:5QSNGQNY をコードするヌクレオチド配列を含有、あるいは次のペプチド:FSRPGLP VEYLQVP をコードするヌクレオチド配列を含有し、次のヌクレオチド配列: CGGCTGGGAC(又はT)ATCAACACCCCGGCとハイブリッド 形成しやすく、 GCCTGCGGCAAGGCCGGTTGCCAG。
GCCTGCGGTAAGGCTGGCTGCCAG又は、GCCTGCGGC AAGGCCGGCTGCACGのいずれともハイブリッド形成しに(いか又は 上記のハイブリダイゼーションするヌクレオチド配列により構成される。
上記ハイブリダイゼーションは、ハイブリダイゼーション及び洗浄培地が前記の 如くでありハイブリダイゼーション及び洗浄温度が52℃の条件で行うことがで きる。“ハイブリッドしにくい”とは、本発明の核酸分子が、先に定義ダした3 種のプローブと52℃の上記培地中でハイブリッド形成するヌクレオチド部分を 含有しないことを意味する。
本発明の好ましい核酸は、上記ヌクレオチド配列の少なくとも一つを含有するか 又は、上記ヌクレオチド配列により構成され、更に次のポリペプチド番コードす るオーブンリーディングフレームを含有するニ ー結核患者特に進行性結核が現れている患者由来のヒト血清と選択的に反応し易 いポリペプチド、 −又は、図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のア ミノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列をも認識する抗体によっ て認識され易いポリペプチド、 −又は、図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のア ミノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列をも認識する抗体を生じ せしめ易いポリペプチド。
上記抗体による上記の294個のアミノ酸から成る配列(又は本発明のポリペプ チド)の認識は、上記配列が上記抗体の一つと複合体を形成することを意味する 。
抗原(即ち、294個のアミノ酸の配列又は本発明のポリペプチド)と抗体との 複合体形成及び、形成された複合体の存在の検出は、古典的技法(放射性同位元 素で標識したトレーサー又は酵素を用いたものの如き)により行うことが出来る 。
以下に、結核患者特に進行性結核が現れている患者から得たヒト血清と抗原との 選択的な反応を試験する方法について限定することなく説明する。
この試験は、本発明のポリペプチドが組換え技術により得られた場合イムノプロ ティング(ウェスタンブロッティング)法である。又、この試験は、異なる調製 法により得られる本発明のポリペプチドについても用いることが出来る。本発明 のポリペプチドは、ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動 後、Tovbia H,等、1979年、 “ポリアクリルアミドゲルからニト ロセルロースシートへの蛋白質の電気泳動移動:手法と応用”Proc、 Nu ll、 Ac1d、 Sei、 USA 76:4350−4354によβ−ガ ラクトシダーゼと融合した本発明のポリペプチドの発現は、ポリクローナルウサ ギ抗−抗原85血清(1: 1.000)の結合により又はモノクローナル抗− β−ガラクトシダーゼ抗体(プロメガ社)を用いることにより視覚化される。箪 二抗体(それぞれ、アルカリ7オスフアターゼ抗−ウサギイムノグロブリンG結 合体及び抗−マウスアルカリフォスファターゼイムノグロブリンG結合体)は、 発売元(プロメガ社)により推奨される如く希釈する。
本発明のポリペプチド及び本発明の融合蛋白質のヒト結核血清による選択的識別 同定の目的で、ニトロセルロースシートをこれらの血清(1: 50)と共に一 晩インキユベートする(非特異的蛋白質結合部位をブロッキング後)。ニトロセ ルロースシート上の反応領域を、パーオキシダーゼ結合ヤギ抗ヒトイムノグロブ リンG抗体(Dikops口S社、デンマーク、コペンハーゲン)(1:200 )と共に4時間インキュベートすることにより明らかにする。洗浄を繰り返した 後、パーオキシダーゼ及び過酸化水素の存在下、パーオキシダーゼ基買(α−ク ロロナフトール) (Bio−Rsd LIbortfori@t、カリフォル ニア州、リッチモンド)を加えることによって発色させる。
本発明の好ましい核酸は、上記ヌクレオチド配列を含有するか又はそれによって 構成され、オーブンリーディングフレームを含有し、約30kDから約35kD までの成熟ポリペプチドをコードし、シグナル配列をコードする配列を含有する 。
本発明の好ましい核酸は、次のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の少 な(とも一つを含有するニー図1に示す一46番目のアミノ酸により構成される 末端から一1番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、 又は 一図1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のポリペプチダ、又は 一図1に示す一46番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、又は 一図1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、又は 一図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミノ酸 により構成される末端までの範囲のポリペプチド、 又は次のヌクレオチド配列を含有するニー上記ヌクレオチド配列とハイブリッド 形成するヌクレオチド配列又は、 一上記ヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列又は、−上記ヌクレオチド 配列のTをUに置き換えることが出来るか、又は上記ヌクレオチド配列により構 成されるヌクレオチド配列。
ハイブリダイゼーシヨンは、次の条件下で行うニーハイブリダイゼーション及び 洗浄培地は、先に明確にしたとおりである、 一コード化ポリペプチドX−Y、即ち図1に示すX番目のアミノ酸により構成さ れる末端からY番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のコード化配列 により定義した本発明の核酸のハイブリダイゼーシタン温度(HT)及び洗浄温 度(WT)は: (−46)−(−1)HT=WT=65℃(−21)−(−1)HT=WT=6 0℃(−46)−(294)HT=WT=70℃(−21)−(294)HT= WT=70℃(1)−(294)HT=WT=70℃本発明の好ましい核酸は、 次のヌクレオチド配列の少なくとも一つを含有するニ ー図1に示す150番目のヌクレオチドにより構成される末端から287番目の ヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す224番目のヌクレオチドにより構成される末端から287番目の ヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す1番目のヌクレオチドにより構成される末端から1169169番 目レオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は −図1に示す150番目のヌクレオチドにより構成される末端から1169番目 のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す224番目のヌクレオチドにより構成される末端から1169番目 のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す288番目のヌクレオチドにより構成される末端から1169番目 のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す1番目のヌクレオチドにより構成される末端から1211番目のヌ クレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す150番目のヌクレオチドにより構成される末端から1211番目 のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す224番目のヌクレオチドにより構成される末端から1211番目 のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、又は 一図1に示す288番目のヌクレオチドにより構成される末端から1211番目 のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列、 又は次のヌクレオチド配列を含有するニー上記ヌクレオチド配列とハイブリッド 形成するヌクレオチド配列又は、 一上記ヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列又は、−上記ヌクレオチド 配列のTをUに置き換えることが出来るか、又は上記ヌクレオチド配列の少なく とも一つにより構成されるヌクレオチド配列。
ハイブリダイゼーシ薔ンは、次の条件下で行う:−ハイプリダイゼーシ碧ン及び 洗浄培地は、先に明確にしたとおりである、 −x−y、即ち図1に示すX番目のヌクレオチドにより構成される末端からY番 目のヌクレオチドにより構成される末端までの範囲の配列により定義した本発明 の核酸のハイブリダイゼーシッン温度(HT)及び洗浄温度(WT)は:(15 0)−(287)HT=WT=65℃(224)−(287)HT−WT=60 ℃(150) −(1169) HT=WT−70℃(1)−(1169)HT =WT=70℃(224) −(1169)HT=WT=70℃(288) − (1169)HT=WT=70℃。
又、本発明は、先に定義グした本発明の核酸によってコードされたポリペプチド に関する。
本発明の好ましいポリペプチドは、そのポリペプチド鎖中に次のアミノ酸配列の 少なくとも一つを含有するニー図1に示す一46番目のアミノ酸により構成され る末端から一1番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のもの、又は 一図1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のもの、又は −5QSNGQNY、又は −PMVQ I PRLVA、又は −GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNG、又は−PPAAPAAPA A、又は上記ポリペプチド配列により構成される。
又、本発明は、そのポリペプチド鎖中に、アミノ酸配列:5QSNGQNY 或はアミノ酸配列: GWD I NTPA 或はアミノ酸配列: FSRPGLPVEYLQVP を含をし且つ、 アミノ酸配列: ACGKAGCQ 及びアミノ酸配列: ACGKAGCT を含有しないポリペプチドに関する。
本発明の好ましいポリペプチドは、そのポリペプチド鎖中に、次のアミノ酸配列 : 5QSNGQNY1 GWDINTPA。
FSRPGLPVEYLQVP 及び、次のアミノ酸配列: PMVQ f PRLVA。
GtTLRTNQTFRDTYAADGGRNG。
PPAAPAAPAA の内生なくとも一つを含有し、 アミノ酸配列: ACGKAGCQ 及びアミノ酸配列: ACGKAGCT を含有しない。
次のポリペプチドは、新規である: 5QSNGQNY。
PMVQ I PRLVA。
GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNG。
PPAAPAAPAA。
本発明の好ましいポリペプチドは、結核患者特に進行性結核が現れている患者か ら得たヒト血清と選択的に反応し易いか又は、図1に示す1番目のアミノ酸によ り構成される末端から294番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲の ポリペプチド配列をも認識する抗体によって認識され易いか又は、図1に示す1 番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミノ酸により構成され る末端までの範囲のポリペプチド配列を認識する抗体を生じせしめ易い。
又、本発明は、先に定義したポリペプチド及びペプチド中の1個又は数個のアミ ノ酸の置換及び/又は付加及び/又は欠失による改変によって次の性質、すなわ ち結核患者特に進行性結核が現れている患者から得たヒト血清との選択的反応性 、及び/又は図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目 のアミノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列に対する抗体との反 応性が変らない限りこの改変から生じるペプチド配列をも含む。
本発明の好ましいポリペプチドは、上記ポリペプチド配列の一つを含有するか又 はそれにより構成され、約30kDから約35kDであり、シグナルペプチドに より先導される。
本発明の好ましいポリペプチドは、そのポリペプチド鎖中に次のアミノ酸配列の 少なくとも一つを含むか又はそのアミノ酸配列により構成されるニ 一部1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミノ酸 により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 一部1に示す一46番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 一部1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 一部1に示す一46番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 一部1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列。
本発明のポリペプチドの構成の一部であるアミノ酸中に存在する遊離の反応性官 能基、竺に、一方はGlu又はAsp基により又はC−末端アミノ酸により保有 される遊離のカルボキシル基及び/又は、他方はN−末端アミノ酸により又はペ プチド鎖中のアミノ酸例えばLysにより保有される遊離のNH2基は、改変に よってポリペプチドの上記性質が変わらない限り改変することが出来ることは言 うまでもない。
このように改変した分子は、当然本発明に含まれる。上記のカルボキシル基はア シル化又はエステル化することが出来る。
又、他の改変も本発明の一部である。詳しくは、アミン官能基又はエステル官能 基又は両末端アミノ酸は、他のアミノ酸との結合に関わることが出来る。例えば 、N−末端アミノ酸は、他のペプチドのC−末端領域の一部と対応する1個から 数個のアミノ酸から成る配列と結合することが出来る。
本発明によるポリペプチドは、Asn−X−3er又はAs n−X−Th r  (Xはアミノ酸を表す)型のグリコジル化部位に於いてグリコジル化すること も出来るし又はグリコジル化しないことも出来る。
本発明の他の好ましいポリペプチドは、次のアミノ酸配列の一つに存するニ 一部1に示す一46番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 −又は図1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のア ミノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列。
これらのポリペプチドは、その合成部位から細胞膜まで蛋白質の転位を開始する 役割をにない転位中に切断されるシグナルペプチドとして用いることが出来る。
本発明の好ましいポリペプチドは、下記のものにより構成されるニ ー 5QSNGQNY。
−PMVQ I PRLVA。
−GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNG。
−PPAAPAAPAA。
一部1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミノ酸 により構成される末端までの範囲のポリペプチド、 一部1に示す一46番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、 一部1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、 一部1に示す一46番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、 一部1に示す一21番目のアミノ酸により構成される末端から一1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド。
これら全てのポリペプチドは、新規である。
M、tube+calo+is 、 M、 bowis及びM、k*n5xsi iの抗原85A185B及び85Cの既に既知の配列に共通する他の好ましいポ リペプチド(図2A参照)は、 GWD[NTPA。
及び F 5RPGLPVEYLQVPである。
上記ポリペプチドは、次の例で説明する如き、−M7eob*cle+ium  tuberculosisによって分泌される33kDaの蛋白質をコードする ヌクレオチド配列又は−M、bov口BCGによって分泌される33kDaの蛋 白質をコードする部分的ヌクレオチド配列又は −以下85C遺伝子と称するところの、関連ヌクレオチド配列から誘導されるD NAの発現産物り・ら誘q7れる二と乙衿紀する。
又、本発明は、上記ポリペプチドにより構成されるアミノ酸配列及び蛋白質又は 当該ポリペプチドに関して異種配列に関する。ここで、当該蛋白質又は異種配列 は、例えば約1個から約1000個のアミノ酸から成るものを言う。これらのア ミノ酸配列を融合蛋白質と称する。
本発明の好ましい融合蛋白質に於ける異種蛋白質は、β−ガラクトシダーゼであ る。
又、本発明は、異種核酸中に挿入された本発明の核酸の少なくとも一つを含有す る組換え核酸に関する。
更に詳しくは、本発明は、本発明のヌクレオチド配列が、当該ヌクレオチド配列 の転写を操作し易くするところのプロモーター(詳しくは誘導可能なプロモータ ー)によって先導され、必要に応じて転写終結シグナルをコードする配列によっ て随伴されるような組換え核酸に関する。
又、本発明は、本発明のポリペプチド及び必要に応じてのシグナルペプチドをも コードする核酸配列が次の抑制因子と共に組み込まれている組換え核酸に関し、 該抑制因子は、マイコバクテリアゲノム中で通常それらが関与しているものとの 関連に於いて異種であり、更に詳しくはそれらの生産のために選択された細胞宿 主中でのそれらの発現の調節に関わる抑制因子である。
又、本発明は、組換えベクターに関し、特にベクター配列、とりわけ常用のプラ スミド、コスミド、ファージDNA又はウィルスDNAのようなベクター配列及 びその複製にとって非必須部位の一つに挿入された本発明の組換え核酸から成る ところのクローニング及び/又は発現のための組換えベクターに関する。
本発明の好ましい態様によれば、組換えベクターは、その複製にとって非必須部 位の一つに、細胞宿主中での本発明によるポリペプチドの発現を促進する必要因 子、特に細胞宿主のRNAポリメラーゼにより認識されるプロモーター、なかん ずく誘導可能プロモーター、必要に応じての転写終結シグナルをコードする配列 、又はシグナル配列及び/又はアンカー配列を含有する。 本発明の別の態様に よれば、組換えベクターは、ベクター内に挿入された本発明の核酸のE、eol iによる発現を可能にする因子、特にβ−ガラクトシダーゼ遺伝子又はその一部 の発現を可能にする因子を含有する。
又、本発明は、本発明による組換えベクターによって形質転換される細胞宿主に 関し、この宿主は該宿主中での本発明のポリペブ′チドをコードするヌクレオチ ド配列の発現を可能にする抑制因子を含有する。
又、本発明は、E、coliの如き細菌中から選択され先に定義した如きベクタ ーにより形質転換されるか又は、CHO細胞又は昆虫細胞の如き真核生物中から 選択され先に定義した如きベクターにより形質転換される細胞宿主に関する。
本発明は、本発明による形質転換細胞宿主によって発現される核酸の発現産物に 関する。
又、本発明は、M7cobscjeriwm boyiz IICGワクチン菌 株中の外来エピトープ(本発明のポリペプチドに関して異種のポリペプチド配列 のエピトープ)のキャリア抗原としての、本発明の分泌ポリペプチドの使用に関 する。
用いるM7eob*clerism botis 8CGワクチン菌株は、Pg slear研究所(パリ)から1173P2の名称で入手することが出来る。
本発明のポリペプチドをコードする核酸及び先に規定した如き外来エピトープを コードする核酸から成る組換えDNAは、本発明の当該ポリペプチドのプロモー ター配列、当該ポリペプチドのシグナル配列、おそらくは当該ポリペプチドをコ ードする部分、及び外来エピトープをコードする核酸を含有することが出来、当 該外来エピトープの核酸は、例えば、−シグナル配列の後に位置するか又は、本 発明のポリペプチドをコードする部分が存在する場合、本発明のポリペプチドを コードする部分より上流に位置する、 −又は、本発明のポリペプチドをコードする部分より下流に位置する、 −又は、本発明のポリペプチドをコードする部分中に位置する。
先に明確にした如き組換えDNAは、組換え蛋白質抗原の発現及び分泌をもたら すワクチン菌株BCG中に形質転換することが出来る。
本発明の核酸からプローブ(即ち、クローン化又は合成オリゴヌクレオチド)を 推測することが出来る。
これらのプローブは、選択される核酸の15個から最大数のヌクレオチドであっ ても良い。又、これらのオリゴヌクレオチドは、特異的酵素的に増幅した断片を 生じせしめるためのPCR技法(PCR,MslliIsfid Flloon s、 11ejb+dt i@EntY■oloB、yet、155. p、3 35. 1987)に於ける増幅プライマーとして、及び/又は挟みこむオリゴ ヌクレオチドプライマー間で増幅された断片を検出するプローブとしてどちらに も用いることが出来る。
PCRを用いたハイブリダイゼーシジン分析の特異性は、異なる水準で抑制する ことが出来る。
増幅法又は検出法又はその両者は、特異的であっても良い。
高特異性である後者のケースが好ましい。
又、本発明は、次の工程から成る本発明によるポリペプチドの製造法に関するニ 一本発明の核酸を含有する好ましいベクターによって既に形質転換された細胞宿 主の好ましい培地中での培養、−上記形質転換細胞宿主により産生されたポリペ プチドの上記培養液からの回収、及び 一最後に固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィー(I MA C) の方法による産生じたポリペプチドの精製。
本発明のポリペプチドは、ペプチド合成分野に於ける古典的技法により製造する ことが出来る。
合成は、均−系溶液又は固相中で行うことが出来る。
例えば、用いることの出来る均一系溶液に於ける合成技法は、Howbenvs 71により記載(著書名’Methods der orBniscbeaCh emis” (11slThod of orgaIlic chemis)r r) E、 1eash II、 wet。
15−1 el II、 THIEME、 5lfi目!Irt1974)のも のである。
又、本発明のポリペプチドは、Ather++++及び5hep*+dにより記 載(著書名“5olid ph*tCpepjid!57filhesis”( IRL Press。
0xford、 Nsv Work、 Tok7o、 19891(D方法ニヨ ル固相中ニ於イテ製造することも出来る。
又、本発明は、本発明による核酸の製造方法に関する。
一本鎖核酸(本発明のヌクレオチドを多くて100個含有)の化学的製造に好ま しい方法は、次の工程から成るニーBiooB*nic ChesistrY4 ; (04−325,106)に記載のβ−シアノエチルホスホアミダイ自動合 成法を用いたDNA合成。
一本鎖DNAの場合、DNA合成の終了時に得られる物質は、そのまま用いるこ とが出来る。
二本鎖核酸(本発明のヌクレオチドを多くて100bp含有)の化学的製造に好 ましい方法は、次の工程から成るニーBioorggaie Cheg+is+ ry 4; (274−325,1986)に記載のβ−シアノエチルホスホア ミダイト自動合成法を用いた1個のセンスオリゴヌクレオチドのDNA合成、及 び上記β−シアノエチルホスホアミダイト自動合成法を用いた1個のアンチセン スオリゴヌクレオチドのDNA合成、 −DNA二重鎖を形成するためのハイブリダイゼーションによるセンスオリゴヌ クレオチドとアンチセンスオリゴヌクレオチドの結合、 −得られたDNA二重鎖の好ましいプラスミドベクター中へのクローニング及び 、制限酵素消化及びアガロースゲル電気泳動の如き古典的方法によるDNAの回 収。
鎖長100個以上のヌクレオチド鎖の核酸(又は、二重鎖核酸の場合塩基対)の 化学的製造法は、次の工程から成るニーその末端に異なる制wi部位を備え、そ の配列が天然のペプチド中のアミノ酸配列と一致するところの化学的に合成した オリゴヌクレオチドの、P+oc、 Ni1. Ac1d、 Sei、 USA  80; 7461−7465、 190に記載の原則に従った組み立て、−斯 く得られたDNAの好ましいプラスミド中へのクローニング及び、制限酵素消化 及びアガロースゲル電気泳動の如き古典的方法による好ましい核酸の回収。
又、本発明は、本発明によるポリペプチドに対して形成される抗体自体に関する 。
この生産は、ポリクローナル抗体に限定されるものではないことは言うまでもな い。
又、本発明は、一方に於いて本発明の精製したポリペプチドに対して免疫した動 物、特にマウス又はラットのヒ臓細胞、また他方に於いて骨随腫細胞系の細胞か ら古典的方法により形成され易く、動物の免疫のために初めに用いられたポリペ プチドを認識してモノクローナル抗体を産生ずるその能力により選択され易いハ イブリドーマによって生産されるモノクローナル抗体に関する。
又、本発明は、酵素型、けい元型又は放射型の好ましい標識によって標識された 本発明の抗体に関する。
抗体、特にモノクローナル抗体の生産に好ましく用いられるペプチドは、表1に 示したものである(図1参照):表1 38 112N−DGLllAQ[IDYNGW[1INTI’AFE−COO Ii 5778 H2N−TDWYQPSQSNGQllYTYl’1ET−C ool 97174 H2N−ANSMWGPSSDPAWKRNDPMV−C OOII 193204 !l2N−RIWVYCGNGTPSDLGGDNI P−Cool 223235 H2N−NQTFRDTTAADGGRNGVF NF−COOH254250H2N−GVFNFPPNGTIISWPYWNE QL−COOII 269215H2N−DIQIIVLNGATPPAAPA APAA−COOII 294アミノ酸配列は、−文字記号で示す。
表1に示したペプチドは、その意図する用途により変形することが出来る。例え ば、ペプチドを抗血清調製に用いるつもりならば、ペプチドはシスティン残基を 更に追加して合成することが出来る。この追加するシスティン残基は、好ましく はアミノ末端に付加され、小さいペプチドを免疫原性にするために必要なキャリ ア蛋白へのペプチドのカップリングを容易にする。
ペプチドを、ラジオイムノアッセイに用いるために標識しようとする場合、沃素 化を容易にすべくアミノ末端又はカルボキシル末端のいずれかに結合したチロシ ンを有する蛋白質を合成するのが好ましい。従って、これらのペプチドは表1に 列挙したペプチドの一次配列をもつが、その唯一の機能がペプチドに好ましい化 学特性を賦与し、かつ蛋白質の一次配列中に見当らない付加的アミノ酸をも有す る。
又、本発明は、酵素型、けい元型又は放射型の好ましい標識によって標識された 本発明のポリペプチドに関する。
又、本発明は、結核に関連した抗体を含む可能性のあるヒト生物学的検体に於け る結核関連抗体をインビトロで検出する方法に関する。この方法は、 一ポリペプチドと生物学的検体中に存在する可能性のある抗体とのインビトロ免 疫学的反応が可能である条件下での生物学的検体と本発明によるポリペプチド又 はペプチドとの接触及び、−形成された可能性のある抗原/抗体複合体のインビ トロ検出から成る。
好ましくは生物学的培地はヒト血清によって構成される。
検出は、古典的方法によって行うことが出来る。
例えば、好ましい方法は、ELISAおよび免疫蛍光法による免疫酵素学的方法 、放射免疫(RI A)法などを利用する。
結核に関連のある抗体をインビトロで検出するかかる方法は、例えば次の工程か ら成るニ ータイトレージョンマイクロプレートのウェルへの本発明のポリペプチド組成物 の一定量の付着、 −診断しようとする血清希釈物の当該ウェルへの導入、−マイクロプレートのイ ンキュベーシッン、−マイクロプレートの繰り返し洗浄、 −血液免疫グロブリンに対する標識抗体の、マイクロプレートのウェルへの導入 、 一少なくとも所定の波長で基質の放射の吸収を改変す石ことによって基質を加水 分解することの出来るものの中から選ばれる酵素の活性に基づくこれら抗体の標 識、−加水分解された基質の量の対照標準との比較による検出。
の検出同定方法に関する。この方法はニ一本発明の抗体と生物学的検体中に存在 する可能性のあるある条件下での生物学的検体と本発明の好ましい抗体との接触 及び、形成された可能性のある抗原/抗体複合体のインビトロ検出から成る。
好ましくは、生物学的培地は、たん、膨水、気管支肺胞洗浄液、尿、生検又は検 死物質によって構成される。
又、本発明は、1lI7cobIc+c++am jnbetcmlos口に感 染した可能性のある患者に於ける結核の更なるインビトロ診断法に関し、この方 法は、次の工程から成るニ ー先に定義した如きDNAプライマーの方法による、当該患者から採取した生物 学的検体中に含まれると思われる本発明のヌクレオチド配列の量の前もっての増 幅、−当該プローブと当該ヌクレオチド配列とで形成されるハイブリダイゼーシ ョン複合体の産生が可能である条件下での、上記生物学的検体と本発明のヌクレ オチドプローブとの接触、−形成された可能性のある上記ハイブリダイゼーショ ン複合体の検出。
先に明確にした如< M7cobscjeriws 1wbercwlosi+ に感染した可能性のある患者に於ける結核のインビトロ診断法を行うに当り、次 の必需品又はキットを用いることが出来、当該必需品又はキットはニ ー一定量の本発明のヌクレオチドプローブ、−好ましくは検出しようとする配列 と上記プローブとのハイブリダイゼーション反応の生起に好ましい培地、−好ま しくは、ハイブリダイゼーション反応中に、ヌクレオチド配列とプローブとで形 成されたハイブリダイゼーション複合体の検出が可能な試薬から成る。
又、本発明は、M7eob*cjerias tIbercIlosisに感染 したと思われる患者に於ける結核の更なるインビトロ診断法に関し、この方法は ニ 一本発明のポリペプチド又はペプチドと生物学的検体中に存在する可能性のある 抗体とのインビトロ免疫学的反応が可能である条件下での、患者から採取した生 物学的検体と本発明のポリペプチド又はペプチドとの接触及び、 −形成された可能性のある抗原/抗体複合体のインビトロ検出から成る。
M7cob*cte+iws tuberculosisに感染したと思われる 患者に於ける結核のインビトロ診断法を行うに当り、次の必需品又はキットを用 いることが出来、当該必需品又はキットはニ一本発明によるポリペプチド又はペ プチド、−免疫学的反応にとって好ましい培地調製のための試薬、−免疫学的反 応により産生された抗原/抗体複合体の検出を可能にする試薬、更に詳しくは上 記ポリペプチド又はペプチドが標識されていない場合当該試薬が標識を有するか 又は標識された別の試薬によって認識され易い試薬から成る。
又、本発明は、M、+abe+ewlo+i+に感染したと思われる患者に於け る結核の更なるインビトロ診断法に関し、この方法は次の工程から成るニ 一本発明の抗体と生物学的検体中に存在する可能性のあるある条件下での生物学 的検体と本発明の好ましい抗体との接触及び、形成された可能性のある抗原/抗 体複合体のインビトロ検出から成る。
M7cob*ejeriem +wbercmlotisに感染したと思われる 患者に於ける結核のインビトロ診断法を行うに当り、次の必需品又はキットを用 いることが出来、当該必需品又はキットはニ一本発明の抗体、 一免疫学的反応にとって好ましい培地調製のための試薬、−免疫学的反応により 産生された抗原/抗体複合体の検出を可能にする試薬、更に詳しくは上記抗体が 標識されていない場合当該試薬が標識を有するか又は標識された別の試薬によっ て認識され易い試薬から成る。
結核のインビトロ診断にとって好ましいキットはニー少なくとも適当な固相シス テム、例えば、インビトロ診断しようとする生物学的検体をその上に付着させる ためのマイクロタイタープレート、 一本発明のモノクローナル抗体の一つを含有する調製物、−当該セックローナル 抗体用特異的検出システム、−一方に於いて生物学的検体と当該モノクローナル 抗体との免疫学的反応、及び他方に於いて結合したモノクローナル抗体と検出シ ステムの反応を行うための好ましい緩衝溶液から成る。
又、本発明は、本発明のポリペプチド又はペプチドの内の1つの調製物をも含む 上記キットに関し、本発明の当該抗原は、競合投与法に用いるキット用にめられ る抗原に関して標準物質(求められるM twbe+culot+sの抗原の定 量分析用)又は競合物質のいずれかである。
又、本発明は、M、1lbercalolilに既に接触した被検者の診断用必 需品又はキットに関し、当該必需品又はキットは本発明のポリペプチド又はペプ チドの内の少なくとも一つの調製物を含有し、当該調製物は患者が既にM、l+ +bercalos口に接触していた場合、患者に皮肉注射した後、注射部位に 遅延型過敏反応をインビボに導入することが出来る。
この必需品又はキットを皮膚試験と称する。
のポリペプチド又はペプチドを含有する免疫原性組成物に関する。
又、本発明は、他の免疫原性成分のうち、本発明のポリペプチド又はペプチド、 又は本発明の発現産物のいずれか一つを含有し、該ポリペプチド又はペプチド、 又は発現産物は、細胞を活性化することによるインビボでの細胞免疫応答を誘導 可能とする結合体とするために、好ましくは、天然蛋白質又は充分な分子量を持 つ合成ポリペプチドと結合していてもよいことを特徴とするワクチン組成物に関 する。
免疫原性成分として好ましく用いられる本発明のペプチドは、表1に記載のもの である。
以下に本発明の他の特性及び有利性を実施例及び図によって具体的に説明する。
図の説明 クレオチド配列及びアミノ酸配列を示す。
既に同定した成熟蛋白質の28−残基NH2末端アミノ酸配列は、二重下線で示 す。150番目のATGの下流に位置する1個の更なるATGコドンは下線で示 す。シグナル配列の正確な長さを決定できなかったことから、ここでとった選択 はATG15oに対応する46アミノ酸シグナルペプチドを示す。推定シグナル ペプチド配列をイタリック体の大文字で示す。初めの図は配列決定手順を示す。
矢印は、ブルースフリブ(Blue 5cribe) M H+中で二重鎖DN Aとして又は、m p 18M 13ベクター中で一本鎖DNAとしてサブクロ ーン化されたDNAに於けるジデオキシ法による配列決定の方向を示す。
全体の配列は、図中で灰色四角で示した合成オリゴヌクレオチドを用いて決定し た。図2: 図2は、M、tuberculosisの抗原85及び85C抗原の既知のヌク レオチド配列及びアミノ酸配列間の相同性を示す:A−抗原85A、B及びCの DNA配列の比較:DNA配列は、複数の配列を視覚化する“整列(A!iga l”プログラムによって一列に並べた。このプレゼンテーションに於いて配列の 相違を概説する: (・)は同一の残基を示し:(−)はギャップ(gip)を示し;(文字)は置 換を示す。
全ての配列を初めのライン(遺伝子85A)のそれと比較し整列させた。
85 A−T U B : M、 jabe+cwlotisから得たDNA配 列(Ilorrems+s L、等、、 1989年、”M7cob*cler ias l*berc++Iotisの32キロダルトン蛋白質遺伝子のクロー ニング、配列決定及び発現″Iafec1. twain、 57:3123) 。
85 B −B CG : lJyeobscteriam boyit (菌 株Tok7o )のα−抗原から得たDNA配列(Msjsso K、等、、1 988年、 “細胞外α−抗原のM7cob*cle+imm boyiSBC G遺伝子のクローニング及び発現” J、 B慇elerio1. 17L38 47)。
85C−TUB : (本発明の) M7cob1c+eti*m 1mbet cwlogis由来の抗原85Cから得たDNA配列。
Infeel 11111111.58:55G )。
85C−BCG: (本発明の) Mlcobsclerism boyit  BCG菌株1173P2から得た部分的DNA配列。この配列は、クローン化し たPCR増幅DNA断片から得た。
(↓)は、成熟蛋白質の初めのフェニルアラニン残基を示す。
(・)は、各遺伝子の終止コドンを示す。
P78及びP79は、PCR増幅に用いたセンスプライマー及びアンチセンスプ ライマーである。
特異的合成オリゴヌクレオチドプローブの合成に用いた85A、85B、85C 配列をフレームで示す。
指示した制限部位は、3種の型特異的プローブの調製に用いた(図4A参照)。
B−抗原85A、B及びCのプレ蛋白質配列の比較:DNA配列は、複数の配列 を視覚化する“整列°プログラムによって一列に並べた。このプレゼンテーシタ ンに於いて配列の相違を概説する: (・)は同一の残基を示し;(−)はギャップを示し; (文字)は置換を示す 。
全ての配列を初めのライン(遺伝子85A)のそれと比較し整列させた。
85 A : M、1wbercalosisから得た蛋白質配列(Borre sxas L、等、、19119年、”M7cob*cjeriws 1wbe rc@los■の32キロダルトン蛋白質遺伝子のクローニング、配列決定及び 発現”Infect、Isw++n、 57:3L23)。
85 B : Mycobscjetiwm bowis (菌株Toky・) のα−抗原から得た蛋白質配列(MIIl16 E等、、 1988年、“細胞 外α−抗原の原85Cから得た蛋白質配列。
1*fsc1. 1m5wm、51:SSO) 。
85C−BCG: (本発明の) Mycobtcjztiwm basis  BCG菌株1173P2から得た部分的蛋白質配列。
“C”の特徴的モチーフをフレームで示す。
kDa (抗原85A)、BCGのα−抗原(抗原85B)及び抗原85Cのア ミノ酸配列のヒトロバシー(b7drBslkr)パターンを示す: 三種のプレ蛋白質(推定されるシグナルペプチドシグナルを含む)の配列を、8 個のアミノ酸のウィンドーを用いてカイト&た。軸上の各棒線は50個のアミノ 酸を表す。シグナル配列の長さは僅かに異なる(3種の蛋白質85A、85B、 85Cのそれぞれ残基数43.40.46)ので、パターンは、3種の成熟蛋白 質の初めの残基に合わせた。疎水性のピークを実線で示し、親水性のピークを破 線で示した。
図4A及び4B: 図4Aは、3種類の遺伝子85A、85B及び85Cの制限エンドヌクレアーゼ 地図を示す:型持異性プローブを<−−−>によって印を付けた。
遺伝子85Aの地図は、Borr等(Ilotres*ns L、等、、198 9年。
3123)から引用した。85Bの地図は、本発明者等のM7cobtcler ius bowi+ BCG 1173P2 2g11組換えライブラリーから 誘導されるクローン5.1から得た(De WN L、 等、、 1990年。
“M7cob*cjeriwg+ bowis BCGの32kDa蛋白質遺伝 子(抗原Tok7o)の公表されたそれと同一である(Msjsso K、 等 、、1isaB抗原のコード領域は、M[swo [、等に従って位置決定され ている(M!jzio K、等、、1988年、′細胞外α−抗原のM7cob 1cjtrum bowis BCG遺伝子のクローニング及び発現′1゜Bx cjeriol、 170:3847)。
85Cの地図は、R,YotBから入手したM 、1wbercwlos+sλ gjl1組換えライブラリーから得たクローン11.2の制限地図に対応する( YotB R,A、等、、 1985年、“組換えDNAを用いたM7eob* cjeriws 1Ilbe+c++1osis抗原の詳細な検討” Ptoc 、 N5jl。
Ac1d、 Sci、 USA 82:2583) (材料及び方法)。サザン 分析に用いた特異的5’ DNA制限断片の位置は、各地図上に両端矢印た全ゲ ノムDNAのサザン分析を示す:15μgの消化したDNAをレーン毎に供した 。材料及び方法に記載の条件下でオリゴヌクレオチドプローブA、B、Cとのハ イブリダイゼーションを行った(図2Aに示す如く)。ハイブリダイゼーション したバンドの分子量は、標準との比較により算出した。
11fi 4 Cハ、M、 boyis BCG 1173 P2カら得た全ゲ ノムDNAのサザン分析を示す。図4Bで説明した手法を用いた。
しかしながら、3種のプローブは、大きいDNA制限断片であった(図4Aに示 した如く)。
85A及び85μ部分は一つのフィルターから得たのに対し85Cは別のものか ら得た。
図5: 図5は、M7cobtcjetiwm 1wbs+ewlotisD N Aの パルスフィールド電気泳動を示す: Mycobscletiwm tlbercIlosisの3種の菌株から得た DNAをDtslで消化し、材料及び方法に記載の如くバクテリオファージλD NA rラダー(1adder) Jと共にアガロースゲル上にパルスフィール ド電気泳動によって分離した。ナイロンフィルターに移した後、3種のプローブ 85A、85B、85Cとのハイブリダイゼーシヨンを、図4Aに示す如く行っ た。ハイブリダイゼーションしたバンドの分子量は、λDNA rラダー」のそ れと比較することにより算出した。
材料及び方法 1、ゲノムDNAの調製(Thole J、等、、 1985年。
31100) : M、 boマis BCGは、ツートン培地中で37℃で培養し、対数増殖期の 終りに加えた1%グリシンの存在下で18時間更なる培養をした後、回収した。
この細菌をリゾチーム及びプロティナーゼにで処理し、ドデシル硫酸ナトリウム で溶菌せしめ、フェノールで抽出してエタノールで沈澱せしめた。
2、ゲノムライブラリー二 M、jwberCwlosi* (E+dmxa菌株)のゲノムDNAから構築 した11111組換えライブラリーを、マstag等から入手した(マo*B  R,A、等、、 1985年、”組換えDNAを用い;/:M boマis B CGから得たゲノムDNAを用いて二番目のλHtl1組換えライブラリーを調 製した(Dt WN L、等、、 1990年。
”M7cobscjeriam boyis BCGの32kDa蛋白質遺伝子 (抗原85A)のヌクレオチド配列” Nwel、 Ae、Res、18:39 95)。
3、オリゴヌクレオチド: オリゴヌクレオチドを、アプライドバイオシステムズ社のDNAシンセサイザー モデル381人上で合成し、OPCカートリッジ(アブライドバイオシステムズ )上で精製し、凍結乾燥せしめ、TE緩衝液(10mM)リス−HCl、pH7 ,4)中に溶解せしめた。
オリゴヌクレオチドの32P標識は、S*mbrook J、等、、 1989 年、 ′モレキュラークローニング:ラボラトリ−マニュアル”Co1d 5p rial Harbor L*bo+5jor7. Co1d Sprig H arbor、 N、 Y。
に記載のとおりである。
4、PCR: 1xPCR緩衝液(アマジャム社)、200μMのd NT P。
センスP78 (5’ −CCGGAATTCATGGGCCGTGACATC AAG)オリゴヌクレオチドプライマー及びアンACTTGTAAGT)オリゴ ヌクレオチドブライマー(これら2種類のプライマーの位置を図2Aに示す。両 者のオリゴヌクレオチドに3個の更なるヌクレオチドによって先導されたEco RI配列を加えた。)各1gM、及び2単位のTaqDNAポリメラーゼを含む 反応混合液50μl中でM7cob*cjeri*mbowiIBCGのDNA 5Qfigを増幅した。94℃で90秒間の変性後、93℃で1分間(変性)、 55℃で90秒間(アニーリング)、72℃で2分間(伸長)から成る40サイ クルの反応、続いて72℃で5分間の最後の伸長に供した。150μIのクロロ ホルムで抽出した後、増幅したDNAをCealric++n−30を用い、0 .75m1のJOと混合して5orvsll SS 34 o −ター中でfi 500 tp−で6分間遠沈することにより3回洗浄した。
EcoRIで消化した後、このDNAを、EcoRIで消化しフォスファターゼ 処理したB15ssczb*−MU+ベクター中にライゲーシッンした。011 5α E、 coli (GibCo−BRL)を形質転換し、H7b+++d −Nフィルター上でプレート培養した。32P標識したオリゴヌクレオチドプロ ーブーA (5’ −TCGCCCGCCCTGTACCTGI及びオリゴヌク レオチドプローブーB (5’ −TCACCTGCGGτTTATCTG)を 用いたハイブリダイゼーションによりコロニーを選択した。オリボヌクレオチド のハイブリダイゼーシヨン及び洗浄条件は、Jscob易等により記載の通りで ある( Isc++bs等、、 1988年、 ゛オリゴヌクレオチド二重鎖の 熱安定性はテトラアルキルアンモニウム塩溶液中では配列非依存性である:組換 DNAクローン同定部換えDNAライブラリーのスクリーニング:この二つのλ ttt+組換えライブラリーを、遺伝子85Aと85Bとを区別しない(図2A 及び4A参照)前もってクローン化した遺伝子85 A (llorr*m*a s L、等、、 19119年。
“Mycobscjezam l*bere+Ios+sの32キロダルトン蛋 白質遺伝子ノクローニンク、配列決定及C1発1A” I++ecL l5mw ++、 57+3123) +7) 800 b p l’1indlll断片 を用イタコロニー11イフリタイゼーシ1ン(S*mbroek J、等、、1 989年、 ′モレキュラークローニング:ラボラトリ−マニュアル@Co1d  5ptiB HarborLsbo+[er7. C+ld Spring  H*rbor、 N、 Y、)によりスクリーニングした。12個の陽性M、1 abe+calotis及び12個のM7c山山ri++e bo山BCGプラ ークを保持し、上記の如<32P標識したオリゴヌクレオチドプローブーC(5 ’−TCGCAGAGCAACGGCCAGAACTAC)を用いたハイブリダ イゼーシIンによりスクリーニングした。
し、その5kbpインサートをB1w@tCr+l+*−MU+中にサブクロー ン化した。112と命名されたこの組換えプラスミドから得たL500bp B r1lll−EcoRI断片をMu−++p1g及びMU−mplG中にサブク ローン化した(S*mbtook J、 等、、1989年、 aモレキュラー クローニング:ラボラトリ−マニュアル” C+ld 5priB Harbo rLibot*1ory、Co1d Spt:B Ltbar、 N、 T、) 。
6、組換えDNA分析: これは、BorrssxmIL、等、、1989年、”M7cob畠cler+ wmlabercwlogisの32キロダルトン蛋白質遺伝子のクローニング 、配列決定及び発現” Infect、l園−in、 57:3123に記載の 通りである。
7、配列決定: Blwescnbe−M13+ベクター(Ckea E、1.等、、19115 年、 ′超らせん配列決定ニブラスミドDNAを配列決定する迅速簡便法”異的 断片をサブクローン化した後、5ea(er等(S■ger F、 等、。
!977年、 1チエインターミネーシタンインヒビターを用いた太き(妨害さ れる。従って、配列決定反応は、製造元の使用説明書により数種のDNAポリメ ラーゼと共に行った。すなわち、T7 DNAポリメラーゼ(”5eqnen* s* ” USB ) 、T7 DNAポリメラーゼ(ファルマシア社)、及び T畠QD N Aポリメラーゼ(プロメガ社) 、dGTPの代りに7−de* ts−dGTPを用いた。数種のオリゴデオキシヌクレオチドを合成し、配列の あいまいな領域に焦点を合わせるのに用いた。配列決定の手順を図1にまとめた 。
8、配列の比較と分析: 核酸配列及び推定されたアミノ酸配列の一般的なコンピューターを用いた分析を 、Btllon B、、1988年1 “核酸及び蛋白質配列分析用アップルマ ツキントラシュプログラム”Nucleie^eid Res、16:1837 から得たLGBCプログラムを用いて行った。
相同性の調査には、Pextson W、 R,等、、1988年、 “生物学 的配列の比較のための改善された手法”Is口、^cod、Sei、 USA  85 : 。
2444から得たFAST^プログラム、及びEM!IL−@ertsr施設か ら得た種々のDNA及び蛋白質データバンクを用いた。”Alieml、01”  (科学的教育的ソフトウェア−)を用いて複数の配列を得た。
9、サザンプロット分析: M7cob暑cjeri++m bowis BCGから得たゲノムDNAを  5phl、Ec、oRI又は−Kpalで完全に消化し、1%アガロースゲル上 に電気泳動せしめ、変性及び中和化した後、Hykoud−Nフィルター(アマ ジャム社)に移し、32P標識したオリゴヌクレオチドプローブ(A、B、C’ )を用いItcobr等、、108年、 “オリゴヌクレオチド二重鎖の熱安定 性はテトラアルキルアンモニウム塩溶液中では配列非依存性である二組換DNA クローン同定への応用” Nwcl、 Ac1d、 Res、L6:4637に 記載の条件でハイブリダイゼーシッンを行うか、又は3種の遺伝子85A、85 B及び85Cを区別することが分かった32P標識したDNA制限断片をランダ ムプライムした。
プローブ85Aは、プラスミドBT−5から得た230bpjsb*t’ewl osisの32キロダルトン蛋白質遺伝子のクローニング、配列決定及び発現”  Infect、Isswa、 57:H23及び図2A)。
プローブ85Bは、本発明者等のM7cob*cterias bowis B CGλgillライブラリーから誘導された5、1と命名された85B組換えプ ラスミドから得た4oobps■息1−KcaRV断片であり、その地図を図4 Aに示した(elH2Aも参照のこと)。プa −ブ85Cは、プラスミド11 .2から得た280bpユと1−Kt11断片である(図4A及び2Aも参照の こと)。
これらのDNA断片は、低融点アガロースゲル上の電気泳動、続いて製造元の使 用説明書に従ってQigHs* (WItbwB社製1オランダ)(チップ5) 上で迅速精製することにより調製し、α−” P−dCTPの存在下、標識した (FeraberHA、 P、等、、 1983年。
”DNA制限エンドヌクレアーゼ断片を高比活性に放射性標識する方法”^n* 1. Biocbem、132:6 )。
10、パルスフィールド電気泳動によるDNA分離:DNA調製、制限酵素消化 及びパルスフィールドゲル電気泳動をマ1nceej Lev7−Freb*i ll ’i、等、、 1990年により記載の如く行つた(“フィールドインパ ージタンゲル電気泳動により分析したMICob*el!r+ae p&口tu bercIllosis、”モリバトマイコバクテリア”及び関連のマイコバク テリアに於けるDNA多形性“1゜C11a、 Mic+obio1.27:2 723 ) o新たな培養液から得り細胞を1%低融点アガロース(V / V  )と混合し、プロティナーゼK (BoehriaHr GmbH,Mgnn heim、 Ge+ii++y)の存在下、チモラーゼ(生化学工業)、リゾチ ーム及びドデシル硫酸ナトリウムで連続的に処理せしめた。フッ化フェニルメチ ルスルホニル(Bio−Red L*b+ttl++ies )を用いてプロテ ィナーゼKを失活させた後、アガロースブロックを50UのDt麿1(Bio− 11Jd L麿borsrorie*)を用いて一晩消化した。しかる後、ブロ ックを、調製した1%アガロースゲルにのせ0.66TBE(トリス−硼酸−E DTA)中で電気泳動を行った。Dags(srPulse (DIls*jJ r、 USA)の装置を用いてフィールドインパージタンゲル電気泳動を行った 。前進及び後進パルスは、泳動の初めには0.33sec及び0.11tscに セットし、泳動の終りには展開しようとする分子量帯により60 sec及び2 0tee(又は3 Q tec及び10 sec )にセットした。泳動時間は 36時間にセットし、用いた電圧は100vで、約325mA、温度は18℃を 維持した。ラムダコンカテマーを分子量マーカーとして用いた。M*a+s目s  T、等、、1982年、 1モレキュラークローニング:ラボラトリ−マニュ アル’ Co1d 5prtB HarborLgbor*toB、 Co1d  Spring [Itrbo+、 N、 Y、545ppに従って、泳動の終 りに、ゲルをエチジュームブロマイドで染色し、Uv先光下写真をとりナイロン 膜上に移した。
結果 1、 M、1wbercwlotisの85C遺伝子のクローニング:遺伝子8 5A及び遺伝子85Bと広い相同関係を有すると思われる85C又は関連の抗原 を特異的に検出するための特異的プローブ又はモノクローナル抗体が入手できな かったことから、このスクリーニングは、新しい手法の開発を要求された。用い た手順は、抗原A及びBの配列を一列に並べた(図2AのプライマーP78及び P79参照)場合高度に保存されたDNA配列によって両末端が囲まれているこ とから、選ばれた成熟抗原85Aのアミノ酸18−98をコードする245bp DNA断片のPCR増幅に基づく。斯くて、同じ領域中の抗原85Cの配列との 同等の相同性が存在するであろうと思われる。
M7cobtcteriwm bowロBCGゲノミックDNAから245bp DNA断片を容易に得た。この後者を精製し、EcoRIで消化した後、Blw stcribe MU+ベクター中にサブクローン化した。約80個の組換えプ ラスミド含有コロニーをナイロンフィルター上に平板培養することにより試験し 、厳密な条件下で配列85 A f5’−TCGCCCGCCCTGTACCT G)又は配列85B(5’−TCACC丁GCGGTTTATCTG)のいずれ かを認識する標識された合成オリゴヌクレオチドと、PCR増幅断片内でハイブ リダイゼーションせしめた(図2A参照)。各オリゴヌクレオチドプローブとハ イブリダイゼーシロンしたいくつかのクローンを配列決定したところ、その配列 は、オリゴプローブAとハイブリダイゼーションするクローン中の配列85A及 び、オリゴヌクレオチドプローブBとパイプリダイゼーシロンするそれらの配列 85Bと同じであった。残ったクローンのいくつかを配列決定したところ、それ らは全て、配列A及びBと全体的に全く別個のものである24−ヌクレオチド部 分に及ぶ85A及び85Bとの明かな配列の相違点を示した(図2A、四角印c )(この領域に於ける配列Bとの相同性は33%にすぎない)。これらの挿入物 が85C遺伝子の増幅された断片でありこの24ヌクレオチド配列が推定される 85C遺伝子に特有であると仮定して、この配列に基づくオリゴヌクレオチドプ ローブ(オリゴ85C)を合成した。
後者のプローブを32Pで標識し、前もってクローンした遺伝子85Aの800 bp非特異的■14111 D N A断片とのハイブリダイゼーシ習ンにより 本発明者等のM llbtrcllGgll及びM7cob*cje+iws  bowis BCG λ1目1ライブラリーに於イテ選ばれた24個の1111 1組換えファージのコレクシランをスクリーニングするのに用いた。
1個のハイブリダイゼーシジンλHjl1M、1mbstcwlos+s組換え 体を保有し、制限地図を作ることにより特徴づけ、配列決定種々の配列決定され た断片から誘導された1211ヌクレオチド配列を図1に示す。このDNA配列 は、150番目から始まり1170170番目Aコドンで終る1、020− t )p−鎖長オープンリーディングフレームを含む。抗原85蛋白質の通常のNH 2末端アミノ酸配列、Pl+e−3er−ArH−Pro−G17−Lee(D e BrB++ J、等、、 1987年、 “M7cobwcjeriwm  bov口BCGの32kDI蛋白質抗原の精製、部分的特徴付は及び同定”Mi crob。
F@Il+oIea、 2:3Sl )は、288番目のTTCコドンで始まる ヌクレオチド配列由来のこのオープンリーディングフレーム内に位置することが 出来る(図1)。従って、この配列から上流のDNA領域は、この抗原の分泌に とって必要とされるシグナルペプチドをコードすると思われる。この完全な蛋白 質は、算定分子両32,021に相当する294個のアミノ酸残基から成る。
興味深いことには、この完全な蛋白質のN−末端配列は、通常の85B及び85 A配列との相違点が成熟蛋白質の16番目のプロリンがアラニンであるにすぎな い、Wiker H,G、等、。
1990年1 °マイコバクテリア抗原85複合体蛋白質をコードする3種類の 別個の遺伝子の証拠”l+Iecj、I■mwa、N:272により記載の26 アミノ酸配列(pke−se t−*B−B++−(ly−1e*−pro−w s 1−11 wiyr−few−Hl u−wx I−pro−se t−t  I t−we t−at 1−HI3−* rH−*B| ile−17s−ysl−H1a−ph@)を含有する。二つのATGコドンが 、同じリーディングフレーム内の288番目のヌクレオチドの位置にあるTTC フェニルアラニンコドンを先導することが分かった(図1)。これら二つのAT Gの使用により21個又は46個のアミノ酸残基のいずれかのシグナルペプチド の合成をもたらす(以下に示した理由により後者の状況を図1に示した)。
抗原85C遺伝子の塩基組成は、64.57%の全体的なG−C組成及び3番目 のコドン内でのG又はCに対する強い選択性(平均85%)の点で85A遺伝子 のそれと同一である。
3個のシスティンを含む抗原85A及び85Bと対照的に抗原85Cの配列は、 254番目に唯一のシスティン残基を示す。
事実、この2個の置換されたシスティンは、最も大きいダイバージエンド配列ブ ロックを含む完全な85C蛋白質の領域内に位置する(図2 B )(SQSN GQNY) (対応するDNA配列をオリゴヌクレオチドプローブC”を合成す るのに用いた(上記参照))。驚くには当らないが、3種の抗原のヒトロバシー プロットを比較した場合この親水性領域が最もダイバージエンドであり、従って 全ての85−抗原の種々の“エピトープ及び/又はM、b+wis BCG由来 の抗原85C中にもそれが見い出されたことから抗原85Cに特有のエピトープ のいずれであってもよい(図2B15行目)。
抗原85Cに特有の他の特徴は、分子のカルボキシ末端の希な疎水性反復プロリ ンアラニンモチーフPPAAPAAPAAの存在である。
3、ヒトロバシーパターン: イト&ドーリットル法(Kite J、等、、190年、 “蛋白質のヒトロバ シーパターンを示す簡単な方法” J、 Mat、 Rial、157:105 )により測定した。このオクタペプチドのプロフィールを抗原85A及び85B と比較した(図3)。アミノ酸配列から予想した如く、3種の抗原のパターンは 、領域84−92に於ける又この3種の蛋白質のカルボキシ末端部分に於けるい くつかの主な違いを除いて大まかな点で類似している。
4、配列相同性: 抗原85 A (Botremsas L、等、、 1989年、”M7cob *ct@tIsstuberculosisの32キロダルトン蛋白質遺伝子の クローニング、配列決定及び発現″Infect、Ims++n、 57:31 23;De Wit Ll等、。
1990年、 “M7eob亀cjeriws bowit BCGの32kD s蛋白質遺伝子(抗原85A)ヌクレオチド配列” N*c1. Ac、 Rt @、18 :3995) 、85 B (M@+sw++ K、等、、 198 8年、“細胞外α−抗原のM7cobscjerias bowi@BCG遺伝 子のクローニング及び発現”J、Bgcferiol、170:3847 ;  M*tswo K、等、、190年、“(配列を直線的に配置した。3種のDN A配列の直線配列を図2A’l:示す。DNAレベルに於いて、3種の完全な蛋 白質をコードする領域間の相同性は最大である。この領域に於けるA及び8間の 相同性は77.5%であるのに対して、それぞれ、遺伝子A及びCをコードする 領域間では70.8%、B及び0間では71.9%にすぎない。配列85Aのヌ クレオチド1369を超える領域、及び475番目のヌクレオチドより上流の領 域(即ち、シグナル配列及びプロモーター領域内)には、3種の配列間に実質的 相同性はない。G!aB*nkEMBLの最も最近のライブラリー中に存在する 他のDNA配列との顕著な相同性は検出されなかった。
アミノ酸レベルの相同性は、図2Bの配列中に存在し、再度、配列A及び8間( 80,4%)の方がB/C間、又はA/C間よりも高い相同性を示している。
85C抗原及び全5vissProt−NBIIFデータバンク間の他の比較は 、85C抗原アミノ酸配列との顕著な相同性を検出できなかった。85A抗原に 関しては、85C配列は、フィブロネクチン結合蛋白のRGDモチーフを含まな いし、既知のフィブロネクチン受容体との相同性又はHxph71+cocc1 *w+eat由来のフィブロネクチン結合蛋白との相同性もない。
M、 k+wis BCG 1173 P2の85C遺伝子の部分的PCil誘 導DNA配列とM7cebscjer+++m jwbercslos口のそれ との比較は、合成オリゴヌクレオチドCに対応する特徴的領域を含む完全な一致 を示す(図2A参照)。
5、ゲノム特性: 抗原85複合体をコードする異なる遺伝子の存在を確認すC)プローブとのハイ ブリダイゼーション後、放射性シグナルの分布をサザンプロットに於いて試験し た(材料及び方法及び図2A参照)。3種の明かに異なるパターンが得られ、こ れらのプローブの特異性を確認した。類似の型特異性プロフィールを、三種のD NAのプロモーターシグナル配列内に選択される三種のランダムブライミングす る標識したDNA制限断片(プローブ85A、230bp ; 85B、400 bp ; 85C。
280bp)によって得ることが出来る(図2A及び4A)。
これらの三種のDNA制限断片によって、明らかに他の2種の遺伝子に対するプ ローブのクロスハイブリダイゼーションに対応する更なる弱い結合も観察される 。プローブ85Cとによって、C−オリゴヌクレオチドプローブとハイブリダイ ゼーと考えられる。更に、この観察された制限断片のサイズは、必ずしも対応す るクローンした遺伝子の制限地図から予想されるものとは限らない。これらの不 一致は、それぞれM、 beマロト巧−株、M、 boyis BCG (菌株 Tok7o)及びM jwbsrcalos+sの菌株間の非コードDNA領域 (抗原85をコードするDNAの外側)に於ける何らかの少数配列の相違(制限 多形性)に相当する可能性がある。
6、 M、1tbercalotitゲノムDNAのパルスフィールド分析:入 手し得る最も大きい85AクローンBY−5をオリゴヌクレオチドプローブBと ハイブリダイゼーションした(図4A)際に、陽性のシグナルは検出されなかっ たのに対し、オリゴヌクレオチドプローブAは陽性のハイブリダイゼーションを 示した(図示していない)。これは、遺伝子Bが遺伝子Aの5′の2−2.5k b及び3′端の4.Okb内に位置していないことを示している(図4A)。こ の結果を確認し増長するために、パルスフ厳密な条件下で更にプローブ(85A 、85B及び85C)として三種の特異的DNA制限断片とハイブリダイゼーシ ョンさるパターンを示した。その内の三つを図5に示す。試験したほとんどの菌 株では、三種のプローブは異なるサイズの断片にハイブリダイゼーションした。
例えば、M、1wbs+cwlotis H37Rsに於いて、プローブ85A 、B及びCとハイブリダイゼーションする一Drtl断片の各サイズは、菌株H 3711sでは約242 kb。
02kl+及び225kb 、菌株11371マでは403kb 、 H2kb 及び104kb 。
・ 菌株“1025”では355kb 、 104kb及び153kbである。
種々の菌株は制限エンドヌクレアーゼート」1で切断した制限断片鎖長多形性を 示すが、これらの結果の最も簡単な解釈は、三種の抗原85遺伝子はマイコバク テリアのゲノム内に隔たって位置する(>100kb)ということである。
AGGTGTCCGG GCCGACGCTG AATCGTTAGCCAAC CGCGAT 40CTCGCGCTGCGGCCACGACA TTCGAA CTGA GCGTCCTCGG 80TGTGTTTCACTCGCCCAG AA CAGATTCGACCGCGTCGTGC120GCAGATGAGA  GTTGGGATTG GTAGTAGCT ATG ACG TTC158 at I/lrβを TTCGAA CAG GTG CGA AGG TTG CGG AGCGC A GCG191ACA ACCCTG CCG CGCCGCGTG GCT  ATCGCG GCT 224ACCTTCGGCGGG CCG GCCA CCGCG GGCGCA TTC290GTG CCA TCCGCG TC G ATG GGCCGCGACATCAAG 356GTCCAG TTCC AG GGCGGCGGA CCG CACGCG GTC389TACCTG  CTCGACGGT CTG CGG GCCCAG GAT GAC422 TACAACGGCTGG GACATCAACACCCCG GCCTTC4 55GAG GAG TACTACCAG TCA GGG TTG TCG  GTG ATC488ATG CCCGTG GGCGGCCAA TCCAG T TTCTACACC521GACTGG TAT CAG CCCTCG  CAG AGCAACGGCCAG 554Figure 1 (続 き2) AACTACACCTACAAG TGG GAG ACCTTCCTT AC C587AGA GAG ATG CCCGCCTGG CTA CAG GC CAACAAG 620GGCGTG TCCCCG ACA GGCAACG CG GCG GTG GGT 653Gly Val Ser Pro Th r Gly Asn Ala Ala Val Glyllo 120 CTT TCG ATG TCG GGCGGT TCCGCG CTG AT CCTG 686GCCGCG TACTACCCG CAG CAG TTC CCG TACGCC719GCG TCG TTG TCG GGCTTCC TCAACCCG TCCGAG 752GGCTGG TGG CCG AC G CTG ATCGGCCTG GCG ATG 785Figure 1  (続き4) TGG GGT CCG TCCAGCGACCCG GCCTGG AAG  CGC851AACGACCCA ATG GTT CAG ATT CCCC GCCTG GTC884Asn Aspρro Met Val Gln I le Pro Arg Leu Va1GCCAACAACACCCGG AT CTGG GTG TACTGCGGT 917Ala Asn Asn Th r Arg Ile Trp Val Tyr Cys GlyAACGGCA CA CCCAGCGACCTCGGCGGCGACAAC950Asn Gl y Thr Pro Ser Asp Leu Gly Gly Asp As nATA CCG GCG AAG TTCCTG GAA GGCCTCAC CCTG 98311e Pro Ala Lys Phe Leu Glu  Gly Leu Thr LeuCGCACCAACCAG ACCTTCCG G GACACCTACGCG 11016Ar Thr Asn Gln T hr Phe Arg Asp Thr Tyr AlaGCCGACGGT  GGA CGCAACGGG GTG TTT AACTTC1049Ala  Asp Gly Gly Arg Asn Gly Val Phe Asn  PheCCG CCCAACGGA ACA CACTCG TGG CCCT ACTGG 1082AACGAG CAG CTG GTCGCCATG A AG GCCGAT ATC1115Asn Glu Gln Leu Val  Ala Met Lys Ala Asp l1eCAG CAT GTG  CTCAACGGCGCG ACA CCCCCG GCC1148Gln H is Val Leu Asn Gly Ala Thr Pro Pro A laGCCCCT GCT GCG CCG GCCGCCTGA GCCAG CAAGC11B2Ala Pro Ala Ala Pro Ala Ala  TERFigure 1 (続 き5) 疎水性 親水性 Figure 3 85−A 85−8 85−C 国際調査報告 。I−Y/CD。、7カ、え。
フロントページの続き (51)Int、C1,5識別記号 庁内整理番号A61K 39/395 R 9284−4CCO7K 7106 Z 8318−4HC12N 1/21  7236−48 C12P 21102 C8214−4BC12Q 1/68 A 7823− 4BGOIN 33153 D 8310−2J331569 F 9015− 2J //(C12N 1/21 C12R1:19) (Cl3F 21102 C12R1:19) CO7K 99:00 (72)発明者 ドウ・ブリュン、ジャクリーヌベルギー国、ベー・1650・ ベールセル、リュ・ドウ・オングリ−・192 I

Claims (31)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.*図1に示す1番目のヌクレオチドにより構成される末端から149番目の ヌクレオチドにより構成される末端までの範囲のヌクレオチド配列を含有する、 *又は、次のペプチド又はポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のうち少 なくとも1つを含有する:−図1に示す−46番目のアミノ酸により構成される 末端から−1番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のもの、又は −図1に示す−21番目のアミノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のもの、又は −SQSNGQNY、又は −PMVQIPRLVA、又は −GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNG、又は−PPAAPAAPA A、 *又は: −上記ヌクレオチド配列又はその相補体とハイブリッド形成するヌクレオチド配 列、 −上記ヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列、又は−上記ヌクレオチド 配列のTをUで置き換えることの出来るヌクレオチド配列を含有する ことを特徴とする核酸。
  2. 2.次のペプチド: 【配列があります】 をコードするヌクレオチド配列を含有し、及び必要に応じて次のペプチド: 【配列があります】 をコードするヌクレオチド配列を含有し、次のヌクレオチド配列: CGGCTGGGAC(又はT)ATCAACACCCCGGCとハイブリッド 形成しやすく、かつ、【配列があります】又は、 【配列があります】又は、 【配列があります】のいずれ ともハイブリッド形成しにくい、請求項1に記載の核酸。
  3. 3.次のポリペプチド: −結核患者特に進行性結核を発症している患者由来のヒト血清と選択的に反応し 易いポリペプチド、 −又は、図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のア ミノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列をも認識する抗体によっ て認識され易いポリペプチド、 −又は、図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のア ミノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列をも認識する抗体を生じ せしめ易いポリペプチドをコードするオープンリーディングフレームを含有する 、請求項1又は2に記載の核酸。
  4. 4.オープンリーディングフレームを含有し、約30kDaから約35kDaの 成熟ポリペプチドをコードし、シグナル配列をコードする配列を含有する、請求 項1から3のいずれか一項に記載の核酸。
  5. 5.次のポリペプチド: −図1に示す−46番目のアミノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、又は −図1に示す−21番目のアミノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、又は −図1に示す−46番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、又は −図1に示す−21番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド、又は −図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミノ酸 により構成される末端までの範囲のポリペプチド をコードする核酸を含有する、請求項1に記載の核酸。
  6. 6.請求項1から5のいずれか一項に記載の核酸によってコードされるポリペプ チド。
  7. 7.そのポリペプチド鎖中に次のアミノ酸配列:−図1に示す−46番目のアミ ノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ酸により構成される末端までの 範囲のもの、又は −図1に示す−21番目のアミノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のもの、又は −SQSNGQNY、又は −PMVQIPRLVA、又は −GLTLRTNQTFRDTYAADGGRNG、又は−PPAAPAAPA A の少なくとも一つを含有する、請求項6に記載のポリペプチド。
  8. 8.そのポリペプチド鎖中に、次のアミノ酸配列:SQSNGQNY 及び必要に応じてアミノ酸配列: GWDINTPA 及び必要に応じてアミノ酸配列: 【配列があります】 を含有し、且つ、 アミノ酸配列ACGKAGCQ及びアミノ酸配列ACGKAGCTを含有しない 、 請求項7に記載のポリペプチド。
  9. 9.結核患者特に進行性結核を発症している患者から得たヒト血清と選択的に反 応し易いか又は、図1に示す1番目のアミノ酸により構成される末端から294 番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプチド配列をも認識す る抗体によって認識され易いか又は、図1に示す1番目のアミノ酸により構成さ れる末端から294番目のアミノ酸により構成される末端までの範囲のポリペプ チド配列を認識する抗体を生じせしめ易い、請求項7又は8に記載のポリペプチ ド。
  10. 10.シグナルペプチドによって先導され且つ約30kDaから約35kDaで ある、請求項7から9のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  11. 11.そのポリペプチド鎖中に次のアミノ酸配列:−図1に示す1番目のアミノ 酸により構成される末端から294番目のアミノ酸により構成される末端までの 範囲のアミノ酸配列、 −図1に示す−46番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 −図1に示す−21番目のアミノ酸により構成される末端から294番目のアミ ノ酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 −図1に示す−46番目のアミノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列、 −図1に示す−21番目のアミノ酸により構成される末端から−1番目のアミノ 酸により構成される末端までの範囲のアミノ酸配列 の少なくとも一つを含む、請求項7に記載のポリペプチド。
  12. 12.請求項6から11のいずれか一項に記載のポリペプチドと、蛋白質又は該 ポリペプチドに関して異種の配列とによって構成されるアミノ酸配列であって、 該蛋白質又は異種配列は約1個から約1,000個のアミノ酸から成り、該異種 蛋白質は好ましくはβ−ガラクトシダーゼである、ことを特徴とするアミノ酸配 列。
  13. 13.異種核酸中に挿入される、請求項1から5のいずれか一項に記載のヌクレ オチド配列の少なくとも一つを含有する組換え核酸。
  14. 14.組換えベクターであって、特にベクター配列、とりわけ常用のプラスミド 、コスミド、ファージDNA又はウィルスDNAのようなベクター配列及び、そ の複製にとって非必須部位の一つに挿入された請求項1から5のいずれか一項に 記載の組換え核酸を含有する、クローニング及び/又は発現のための組換えベク ター。
  15. 15.その複製にとって非必須部位の一つに、細胞宿主中での請求項6から11 のいずれか一項に記載のポリペプチドの発現を促進する必要要素、とりわけ細胞 宿主のRNAポリメラーゼにより認識されるプロモーター、特に誘導可能プロモ ーター、及び必要に応じての転写終結シグナルをコードする配列、及び必要に応 じてのシグナル配列及び/又はアンカー配列を含有する、請求項14に記載の組 換えベクター。
  16. 16.ベクター内に挿入された請求項1から5のいずれか一項に記載の核酸のE .coliによる発現を可能にする要素、特にβ−ガラクトシダーゼ遺伝子又は その一部の発現を可能にする要素を含有する、請求項15に記載の組換えベクタ ー。
  17. 17.請求項14から16のいずれか一項に記載の組換えベクターによって形質 転換され、且つ、宿主中で請求項6から11のいずれか一項に記載のポリペプチ ドをコードするヌクレオチド配列の発現を可能にする制御要素を含有する細胞宿 主。
  18. 18.E.coliの如き細菌中から選択され、請求項14から16のいずれか 一項に記載のベクターにより形質転換されるか又は真核生物中から選択され、請 求項14又は15に記載のベクターにより形質導入される、請求項17に記載の 細胞宿主。
  19. 19.請求項17又は18に記載の形質転換細胞宿主によって発現される核酸の 発現産物。
  20. 20.請求項6から11のいずれか一項に記載の組換えポリペプチドに対して向 けられる事実によって特徴付けられる抗体。
  21. 21.請求項1から5のいずれか一項に記載の核酸の一つと、又はそれらの相補 的配列とハイブリダイズするヌクレオチド性プローブ。
  22. 22.次の工程: −請求項1から5のいずれか一項に記載の核酸を含有する適切なベクターによっ て予め形質転換された細胞宿主の適切な培地中での培養、 −上記形質転換細胞宿主により産生されたポリペプチドの上記培養液からの回収 を包含する請求項6から11のいずれか一項に記載の組換えポリペプチドの製造 法。
  23. 23.Mycobacterium tuberculosisに感染した可能 性のある患者に於ける結核のインビトロ診断法であって、−請求項6から11の いずれか一項に記載のポリペプチドと生物学的検体中に存在する可能性のある抗 体とのインビトロ免疫学的反応が可能である条件下での、患者から採取した生物 学的検体と当該ポリペプチドとの接触及び、−形成された可能性のある抗原/抗 体複合体のインビトロ検出を包含することを特徴とする方法。
  24. 24.M.tuberculosisに感染した可能性のある患者に於ける結核 のインビトロ診断法であって、次の工程:−請求項20に記載の適切な抗体と生 物学的検体中に存在する可能性のあるM.tuberculosisの抗原との インビトロ免疫学的反応が可能である条件下での、生物学的検体と該抗体との接 触及び、 −形成された可能性のある抗原/抗体複合体のインビトロ検出を包含することを 特徴とする方法。
  25. 25.請求項23に記載のMycobacterium tuberculos isに感染したと思われる患者に於ける結核のインビトロ診断法のための必需品 又はキットであって、 −請求項6から11のいずれか一項に記載のポリペプチド、−免疫学的反応にと って好ましい培地調製のための試薬、−免疫学的反応により産生された抗原/抗 体複合体の検出を可能にする試薬、特に上記ポリペプチドが標識されていない場 合該試薬が必要により標識を有するか又は標識された別の試薬によって認識され 易い試薬 から成ることを特徴とする必需品又はキット。
  26. 26.請求項24に記載のMycobacterium tuberculos isに感染したと思われる患者に於ける結核のインビトロ診断法のための必需品 又はキットであって、 −請求項20に記載の抗体、 −免疫学的反応にとって好ましい培地調製のための試薬、−免疫学的反応により 産生された抗原/抗体複合体の検出を可能にする試薬、特に上記抗体が標識され ていない場合該試薬が必要により標識を有するか又は標識された別の試薬によっ て認識され易い試薬 から成ることを特徴とする必需品又はキット。
  27. 27.請求項6から11のいずれか一項に記載のポリペプチドを、医薬上許容し 得る担体と組み合わせて含むことを特徴とする免疫原性組成物。
  28. 28.他の免疫原性成分のうち、請求項6から11のいずれか一項に記載のポリ ペプチド又は請求項19に記載の発現産物のいずれか一つを含有し、該ポリペプ チド又はペプチド、又は発現産物は、Mycobacterium tuber culosisを中和する抗体のインビボでの産生を誘導可能にするか、又はM ycobacterium tuberculosis抗原に応答するT細胞を 活性化することによるインビボでの細胞免疫応答を誘導可能にする結合体とする ために、必要により、天然蛋白質又は充分な分子量を持つ合成ポリペプチドと結 合している、ことを特徴とするワクチン組成物。
  29. 29.好ましくは次のアミノ酸配列(図1参照):【配列があります】 を有することを特徴とする、抗体、特にモノクローナル抗体の産生に好ましく用 いられる請求項6に記載のペプチド。
  30. 30.請求項6から11のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする組換 えDNA配列であって、必要により、該ポリペプチドのプロモーター配列、及び 、該ポリペプチドに関して異種のポリペプチド配列のエピトープを含む組換えD NA配列によって形質転換されたMycobacterium bovis B CGワクチン菌株。
  31. 31.M.tmberculosisに既に接触した患者の診断用必需品又はキ ットであって、該必需品又はキットは請求項6から12のいずれか一項に記載の ポリペプチド又はペプチドの内の少なくとも一つの調製物を含有し、該調製物は 患者が既にM.tmberculosisに接触していた場合、患者に皮内注射 した後、注射部位に遅延型過敏反応をインビボに導入することが出来ることを特 徴とする必需品又はキット。
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