JPH0499487A - 恙虫病の遺伝子診断用試薬 - Google Patents

恙虫病の遺伝子診断用試薬

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JPH0499487A
JPH0499487A JP2214324A JP21432490A JPH0499487A JP H0499487 A JPH0499487 A JP H0499487A JP 2214324 A JP2214324 A JP 2214324A JP 21432490 A JP21432490 A JP 21432490A JP H0499487 A JPH0499487 A JP H0499487A
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tsutsugamushi
rickettsia
gilliam
rickettsia tsutsugamushi
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古屋 由美子
Akiyoshi Kawamura
明義 川村
Ken Tamura
多村 憲
Norio Ohashi
典男 大橋
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 〔産業上の利用分野〕 本発明は志虫病の遺伝子診断用試薬に関し、詳しくはリ
ケッチアツツガムシによる志虫病の迅速診断に利用でき
る試薬及び型特異性の少ないリケッチアDNAを合成す
るための試薬に関する。
〔従来の技術1発明か解決しようとする課題〕1980
年代からH本全国のみならずアジア諸国で多発している
志虫病患者の診断には、蛍光抗体法、酵素免疫測定法、
補体結合反応なとの免疫学的に抗原抗体反応を利用した
、いわゆるタンパク質を用いた方法か主に使われてきた
。また、病原体であるリケッチアの検出には、生きたマ
ウスを用い1〜3ケ月を要して分離、判定する方法か一
般的に行われている。
ところで、病原体であるリケッチアツツガムシ(Ric
kettsia tsutsugamushi)の遺伝
子配列は、大橋らにより、標準3株の1っであるGil
liam株の56にタンパク質をコート′する部分に対
して決定している。
したかって、この配列の一部を利用しでぶ虫病の遺伝子
診断を行う方法が確立されれば、迅速な診断が可能とな
り、この分野に与える影響は大きい。
〔課題を解決するための手段〕
前述のように、思上病の実態解明に免疫学的な手法が多
く利用されてきたが、この方法では患者の診断のために
、感染後早くても1週間が必要であった。この疾患の媒
介動物であるダニ(ツツガムシ)に感染している病原体
リケッチアを感度よく発見することは、予防対策上量も
重要なことである。
しかし、上記した従来法では技術上、限界かあり、結論
を得るのに多くの日数が必要である。そのため、病原体
リケッチアを効率よく高感度で迅速に検出する技術の開
発か強く望まれていた。
本発明は、かかる要望に応える思上病の遺伝子診断用試
薬の提供を目的としている。
本発明は、リケッチアツツガムシのGi 11 iam
、 Karp。
Katoの標準3株及びKawasaki、 Kuro
ki、 Shimokoshiのそれぞれの株のDNA
に相同性の高い、56にタンパク質をコードするリケッ
チアツツガムシのGilliam株の2 、 3 Kb
HindllI断片の5′末端第622番目から第69
9番目までの相補性DNAを合成するのに必要な1対の
プライマー並びに上記相補性DNAを鋳型として該プラ
イマーとDNA合成酵素を作用させて作製したリケッチ
アツツガムシDNAと特異的に結合するプローブに関す
る。
以下に本発明の詳細な説明する。
■Gilliam株の遺伝子より他のリケッチアツツガ
ムシ(Karp、 Kato、 Kawasaki、K
uroki、Shimokoshi)株のDNAに相同
性の高いプライマーの選別大橋らによって決定されたG
illiam株の56にタンパク質をコードするHin
dI[断片、2.3KbのDNA配列より複数の配列を
選別し、コンピューターでGCコンテンツを計算して最
もアニーリング温度の高いと思われる配列部分の5゛末
端より622番目から651番目と699番目から67
0番目までのそれぞれ30mer(ベース)のDNAを
合成した。
この1対のプライマーの塩基配列は下記の通りである。
プライマー1 : ATAGAATTGGGTGAGG
AAGGAGGATTAGAGプライマー2 : AC
CAGTAATCATTCCTCCAACGATTCC
AAC■プライマーを利用したリケッチアツツガムシの
検出と判定 上記■て合成したプライマーを使って、培養したリケッ
チアツツガムシDNAの検出を試みたところ、理論値で
ある78bのDNAが合成されることか確認できた。こ
のプライマーを使用してDNA増幅装置を利用すること
により、3〜4時間で病原体の検出ができる。一方、同
じリケッチア属である紅斑熱リケッチア、発疹熱リケッ
チア、さらにプロテウス菌、シゲラ菌、大腸菌なとでは
、このプライマーによって合成されるDNAは存在しな
かった。また、他の細菌なとでは全く交差反応が認めら
れなかったことから、思上病とほかの疾患との鑑別診断
に利用できるものと考えられる。
なお、思上病患者の血液の中には、抗体と共存の形でリ
ケッチアが存在することか知られており、本発明の試薬
を使用することにより、血液中のリケッチアを直接検出
することかできる。
■プローブの作製 制限酵素Hind I[Iで消化した精製Gillia
m株をアガロースゲル電気泳動で分離し、常法に従いフ
ラグメントを取り出した。これを鋳型として前記■て人
工的に作製したプライマーとDNA合成酵素を用い、市
販プライマーラベルシステムにより22Pをリケッチア
ツツガムシDNAに標識する。また、同様の方法でこの
プローブに予めビオチンやジゴキシゲニンを標識した合
成基剤を使用することにより、ラジオアイソトープを使
用することなく高感度にリケッチアツツガムシと特異的
に結合するDNAプローブを作製することができる。
■プローブを利用した思上病の診断 標識DNAプローブを利用してドツトハイブリダイゼー
ションおよびサザンブロットハイプリダイゼーション法
により固定化したナイロン股上のリケッチアツツガムシ
DNAを高感度に検出することかできた。
〔実施例〕
次に、実施例により本発明の詳細な説明する。
実施例1 1)恕虫病患者血液からリケッチアツツガムシDNAの
調製 ■リンパ球の分離 患者血液5m7’をFieollて密度勾配遠心し、リ
ンパ球画分を得た。このリンパ球画分をリン酸緩衝液で
2回洗浄した。
■DNAの抽出 DNA抽出用緩衝液(2%SDS、10■/μlブロテ
ナースに、  10mM EDTA、 100mM酢酸
ナトリウム)を500μl加え、56°Cで2時間反応
させた。
■フェノール抽出 上記反応液にフェノール/クロロホルム/イソアミル(
25/24/1)を等量加え、よく振り混ぜた後、10
.000rpmで5分間遠心し、上清を得た。この操作
を2回繰り返した。次いで、等量のクロロホ/Lム7・
′イソアミル(24/1)を加え、同様に処理した。
■エタノール沈澱 上記の上溝液にl/20量の3M酢酸ナトリウムを加え
、−70℃に冷やしたエタノールを2倍量添加してよく
混和し、−70℃で10分間静置後、10、00Orp
mで30分間遠心し、沈渣を得た。次いで、これを乾燥
後、50μlのTE緩衝液(10mM)リス−塩酸(p
H8,0) 、  1mM EDTA)に浮遊させて試
料とした。
調製試料 精製水 PCR用緩衝液9 1.25[[IM dNPT プライマー 1(0,00250D/μ Iりプライマ
ー 2(0,00250D/μ l)耐熱性ポリメラー
ゼ 6100mM )リス−塩酸(pH8 15[IIM MgCj’ !、 0.01%ゲラチン
」−記試料を混合し、94°Cで30秒、57°Cて1
0μ1 53、5μ1 10μ1 16μf 5μ! 5μ1 0、5μf 3) 、  500mM KCl。
2分、70°Cて2分を1サイクルとして30サイクル
反応させた。
PCR法で増殖させたDNAの一部は2%アガロース電
気泳動法・を行い、エチジウムブロマイド染色後、紫外
線照射により蛍光発色させて泳動位置の確認をし、判定
した。陰性である場合は、上記反応後に耐熱性ポリメラ
ーゼ0.5μlを加え、さらに30サイクル反応させた
。このようにしてリケソチアツツガムシDNAの検出を
行うことかできた。
実施例2 PCR法を用いたジゴキシゲニン標識プローブの製造 精製し・たリケッチアツツガムシGilliam株から
DNAを抽出し、試料とした。
試   糀               10μl精
製水            59,5μ1PCR用緩
衝液°         10μrブライ?−1(0,
00250D/  μ l! )          
 5  tt  lプライマー 2(0,00250D
/  μ A)           5  μ l耐
熱性ポリメラーゼ    05μl ” 100mM )リス−塩酸(pH8,3) 、 5
00mM K(J!。
15mM MgCA’ 2.0.01%ゲラチン上記試
料を混合して94°Cで30秒、57℃で2分、70°
Cて2分を1サイクルとして30ザイクル反応させた。
この反応液をプローブとした。
実施例3 実施例1の1)において調製したリケッチアツツガムシ
DNA試料を95°Cて10分間処理して変性させ、素
早く水浴中で冷却し、ナイロン膜に塗布後、よく風乾さ
せ、次いて紫外線でナイロン膜上のDNAを固定した。
この膜をソールFバック中に入れ、ハイブリダイゼーシ
ョン溶液(5xSSC(20XSSC二3M塩化ナトリ
ウム、 0.3Mクエン酸ナトリウム、pH7,0)、
 0.5%ブロッキング試薬、0゜1%N−ラウロイル
ザルコシン酸ナトリウム、 0.02%SDS)を加え
、68°Cで4時間プレハイブリダイゼーションを行い
、時々溶液を混和した。 次に、実施例2で作製したプ
ローブを直前に95°Cで10分間熱変性させ、ハイブ
リダイゼーション溶液に加え、シールドバック中の溶液
と交換した。シールドバックを68°Cで18時間反応
させ、時々混和した。室温で2 x SSC,0,1%
SDSを用いて膜を5分間2回洗浄した。次いで、同様
に68°Cで0.1x SSC,0,I%SDSを用い
て膜を5分間、2回洗浄した。
膜を緩衝液1 (100mM トリス−塩酸、150m
M  塩化ナトリウム、 pH7,5)で1分間洗浄し
た。次いで、緩衝液2(0,2%ブロッキング試薬/緩
衝液1)で30分間反応させた。これを再度緩衝液1で
洗浄した。次に、緩衝液1で標識抗体(抗ジゴキシゲニ
ン抗体)を150 m[J/r!Llに希釈し、膜を3
0分間反応させた。その後、緩衝液lで15分間、2回
洗浄し、未反応標識抗体を取り除いた。しかる後、膜を
緩衝液3 (100mM )リス−塩酸、100mM 
 塩化ナトリウム、 50mM塩化マグネシウム、 p
H9,5)て2分間平衡化した。
次に、暗所で発色液(45μmニトロブルー テトラゾ
リウム塩溶液、35μ15−ブロモ−4−クロロ3−イ
ンドリルホスフェート溶液/1〇−緩衝液3)と膜をシ
ールドバック中で反応させた。発色の停止には緩衝液4
 (10mM トリス−塩酸、 1mM EDTA、 
pH8)を用い、膜を5分間洗浄した。ナイロン膜上の
発色より目的のDNAの有無を判定した。
実施例4 サザンブロットハイプリダイゼーションによる患者の診
断 実施例1の1)において調製したリケッチアツツガムシ
DNA試料10μpに酵素反応液(50mMトリス−塩
酸、10mM塩化マグネシウム、 50mM塩化ナトリ
ウム) 2ul!、  10UHindI[1μff、
精製水7μmを加え、37°Cて2時間反応後、1%ア
ガロースゲル電気泳動を行う。その後、アガロースゲル
を適当な容器に移し、脱プリン溶液(250mM塩酸)
に浸した。次いで、脱プリン溶液を捨て精製水にて3回
洗浄後、アガロースゲルのDNAをナイロン膜に転写し
た。その後、ナイロン膜を0.5N水酸化ナトリウム、
1.5M塩化ナトリウム溶液に30秒浸し、続いて0.
5M)リス−塩酸(pH7,4)。
1.5M塩化ナトリウム溶液に2分間中和させ、よく風
乾させ、次いで紫外線でナイロン膜上のDNAを固定し
た。この膜をシールドバック中に入れ、ハイブリダイゼ
ーション溶液(5xSSC,0,5%ブロッキング試薬
、0,1%N−ラウロイルザルコシン酸ナトリウム、 
0.02%5DS)を加え、68℃で4時間プレハイブ
リダイゼーションを行い、時々溶液を混和した。
次に、実施例2で作製したプローブを直前に95°Cで
10分間熱変性させ、ハイブリダイゼーション溶液に加
え、シールドバック中の溶液と交換した。シールドバッ
クを68°Cで18時間反応させ、時々混和した。室温
て2 x SSC,0,1%SDSを用いて膜を5分間
、2回洗浄した。次いで、同様に68”CテO,I x
SSC,0,1%SDSを用イテ膜を5分間、2回洗浄
した。
膜を緩衝液1 (100mM トリス−塩酸、150m
M  塩化ナトリウム、 pH7,5)で1分間洗浄し
た。次いで、緩衝液2(0,2%ブロッキング試薬/緩
衝液1)で30分間反応させた。これを再度緩衝液lで
洗浄した。次に、緩衝液1て標識抗体(抗ジゴキシゲニ
ン抗体)を150mU/−に希釈し、膜を30分間反応
させた。その後、緩衝液1で15分間、2回洗浄し、未
反応標識抗体を取り除いた。しかる後、膜を緩衝液3 
(100mM )リス−塩酸、 100mM  塩化ナ
トリウム、 50mM塩化マグネシウム、 I)89.
5)で2分間平衡化した。
次に、暗所で発色液(45μlニトロブルー テトラゾ
リウム塩溶液、35μ15−ブロモ−4−クロロ3−イ
ンドリルホスフェート溶液/1〇−緩衝液3)と膜をシ
ールドバック中で反応させた。発色の停止には緩衝液4
(10mM)リス−塩酸、 In+M EDTA、 p
t(8)を用い、膜を5分間洗浄した。ナイロン膜上の
発色より目的のDNAの有無を判定した。
〔発明の効果〕
本発明によれば、未だ感染実態が解明されていない思上
病患者の診断に遺伝子診断技術を適用てきるため、正確
かつ迅速な診断が可能である。さらに、本発明の試薬を
用いることによりこの疾患の媒介動物であるダニ(ツツ
ガムシ)に感染している病原体リケッチアを感度よく検
出することができ、予防対策の上からも本発明は有用で
ある。

Claims (2)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)リケッチアツツガムシのGilliam、Kar
    p、Katoの標準3株及びKawasaki、Kur
    oki、Shimokoshiのそれぞれの株のDNA
    に相同性の高い、56Kタンパク質をコードするリケッ
    チアツツガムシのGilliam株の2.3KbHin
    dIII断片の5’末端第622番目から第699番目ま
    での相補性DNAを合成するのに必要な1対のプライマ
    ー。
  2. (2)1対のプライマーが下記の塩基配列を有するもの
    である請求項1記載のプライマー。 プライマー1:ATAGAATTGGGTGAGGAA
    GGAGGATTAGAGプライマー2:ACCAGT
    AATCATTCCTCCAACGATTCCAAC(
    3)請求項1記載の相補性DNAを鋳型とし請求項1記
    載のプライマーとDNA合成酵素を作用させて作製した
    リケッチアツツガムシDNAと特異的に結合するプロー
    ブ。
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Cited By (2)

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