JPH02231086A - 耐熱性アミノペプチダーゼをコードする遺伝子及びそれを含むプラスミド - Google Patents
耐熱性アミノペプチダーゼをコードする遺伝子及びそれを含むプラスミドInfo
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
[産業上の利用分野]
本発明は、高度好熱性細菌であるサーマス属に属する菌
株が生産する耐熱性アミノベブチダーゼをコードするD
NA配列に関するものである。このDNA配列でコード
されるアミノベブチダーゼは高い耐熱性をもち、75℃
〜80℃の高温で最も活性が高いという特徴を有してお
り、熱に対して極めて安定であり、産業上試薬用酵素,
バイオリアクター用酵素などとして極めて有用なもので
ある. [従来の技術] アミノベブチダーゼはタンパク買やベブチドのN一末端
からアミノ酸を順次遊離させる酵素で、微生物.植物及
び動物組織などに広く分布している.アミノベブチダー
ゼは酵素の分類学的にはα−アミノアシルペプチド ヒ
ドロラーゼ(α−Aminoacyl−peptide
hydrolase) EC3.4.11.に属す
る(NomencLature Committee
of theIntarnational Union
of Biochemistry. Enxya+e
Noa+enclature, 1984. Acad
esic Press.参照)。
株が生産する耐熱性アミノベブチダーゼをコードするD
NA配列に関するものである。このDNA配列でコード
されるアミノベブチダーゼは高い耐熱性をもち、75℃
〜80℃の高温で最も活性が高いという特徴を有してお
り、熱に対して極めて安定であり、産業上試薬用酵素,
バイオリアクター用酵素などとして極めて有用なもので
ある. [従来の技術] アミノベブチダーゼはタンパク買やベブチドのN一末端
からアミノ酸を順次遊離させる酵素で、微生物.植物及
び動物組織などに広く分布している.アミノベブチダー
ゼは酵素の分類学的にはα−アミノアシルペプチド ヒ
ドロラーゼ(α−Aminoacyl−peptide
hydrolase) EC3.4.11.に属す
る(NomencLature Committee
of theIntarnational Union
of Biochemistry. Enxya+e
Noa+enclature, 1984. Acad
esic Press.参照)。
しかし、アミノペプチダーゼはその基質特異性や性質の
違いから、様々な種類に分けられており、その分類基準
はやや不明瞭である。これまで知られているアミノペプ
チダーゼはほとんどが常温生物から得られたものである
。また、DNA配列が報告されているアミノベブチダー
ゼは少なく、大腸菌由来のアミノベブチダーゼN [M
cCaman,M.T.and J.D.Gabe,
Gene、48, 145−153(1986).Fo
glino, M.et al. Gene、49,
301−307(1986)]及び大腸菌由来のメチオ
ニンアミノベブチダーゼ[Ben−Bassat, A
,κ.et al. J.Bacteriol%169
,751−757 (1987) ]及びヒト由来のア
ミノペプチダーゼN [Olsen, J.et al
.、FEBS Letters, 238,307−3
14 (198B) ]などが報告されている。高度好
熱性細菌由来のアミノペプチダーゼに関してDNA配列
が報告された例はまだない。
違いから、様々な種類に分けられており、その分類基準
はやや不明瞭である。これまで知られているアミノペプ
チダーゼはほとんどが常温生物から得られたものである
。また、DNA配列が報告されているアミノベブチダー
ゼは少なく、大腸菌由来のアミノベブチダーゼN [M
cCaman,M.T.and J.D.Gabe,
Gene、48, 145−153(1986).Fo
glino, M.et al. Gene、49,
301−307(1986)]及び大腸菌由来のメチオ
ニンアミノベブチダーゼ[Ben−Bassat, A
,κ.et al. J.Bacteriol%169
,751−757 (1987) ]及びヒト由来のア
ミノペプチダーゼN [Olsen, J.et al
.、FEBS Letters, 238,307−3
14 (198B) ]などが報告されている。高度好
熱性細菌由来のアミノペプチダーゼに関してDNA配列
が報告された例はまだない。
[発明が解決しようとする課題]
本発明者らは、すでにサーマス属に属するサーマス・ア
クアティカスYT−1 (AT(:C 25104)か
ら高度に耐熱性を有するアミノベブチダーゼ(以下、A
P−Tと呼ぶ。)を精製する方法とその利用法について
明らかにしている[特開昭62−11092.及びMi
nagawa, E.et al.、Agric. B
iol. Chem. 52.1755−1763 (
1988) ]。一般にアミノベプチダーゼの菌体内で
の存在量は少なく、精製には操作が煩雑になり経済的に
も不利である。同様にAP−Tを効率的に生産し、精製
しやすくするためには、遺伝子工学的な生産が理想的で
あり、AP−TをコードするDNAの塩基配列の解析が
望まれた。
クアティカスYT−1 (AT(:C 25104)か
ら高度に耐熱性を有するアミノベブチダーゼ(以下、A
P−Tと呼ぶ。)を精製する方法とその利用法について
明らかにしている[特開昭62−11092.及びMi
nagawa, E.et al.、Agric. B
iol. Chem. 52.1755−1763 (
1988) ]。一般にアミノベプチダーゼの菌体内で
の存在量は少なく、精製には操作が煩雑になり経済的に
も不利である。同様にAP−Tを効率的に生産し、精製
しやすくするためには、遺伝子工学的な生産が理想的で
あり、AP−TをコードするDNAの塩基配列の解析が
望まれた。
[課題を解決するための千段]
本発明者らは、鋭意努力の結果、サーマス・アクアティ
カスYT−1のもつ染色体DNAからAP−Tをコード
するAP−T遺伝子を分離することに成功した。また、
AP−T遺怯子の性質について検討し、その全塩基配列
を決定することができた.その結果、AP−T遺伝子の
開始コドンがGTGであることも知った。また、オリゴ
ヌクレオチド ディレクテド ミュータジェネシス(O
ligonucleotideDirected Mu
tagenesfs)の手法[例えば、Zoller,
M.J. and M. Smith, Metho
ds inEnzyIIlol. 154. 329
〜349(1987) に詳しく紹介されている。]を
利用して開始コドンをATGに変異させ、合わせてこの
開始コドンが変異したAP−T遺伝子を発現ベクターに
組込むことに成功した.このようなAP−T遺伝子を組
み込んだプラスミドで形質転換された微生物を用いるこ
とによって、高度に耐熱性を有する^P−Tをきわめて
効率良く生産できることを見い出した。特に大腸菌など
の中温性細菌にAP−T遺伝子を導入して、AP−Tを
生産させた場合、大腸菌内で生産されたときでも、AP
−Tは天然のAP−Tと同様に高い耐熱性を有するので
、このような菌体を超音波等の手段で破砕した後、単に
70゜〜80℃程度の加熱を一定時間行なうだけで、A
P−T以外の大腸菌が元々もっている酵素やタンパク買
は熱変性して沈殿する.その結果、遠心分離後の上澄液
には、他の酵素活性を含まないほとんどAP−T活性の
みを有する溶液が得られることを見い出した。それ故、
極めて容易にAP−Tを精製することが可能である。本
発明はかかる知見により完成されたものである。
カスYT−1のもつ染色体DNAからAP−Tをコード
するAP−T遺伝子を分離することに成功した。また、
AP−T遺怯子の性質について検討し、その全塩基配列
を決定することができた.その結果、AP−T遺伝子の
開始コドンがGTGであることも知った。また、オリゴ
ヌクレオチド ディレクテド ミュータジェネシス(O
ligonucleotideDirected Mu
tagenesfs)の手法[例えば、Zoller,
M.J. and M. Smith, Metho
ds inEnzyIIlol. 154. 329
〜349(1987) に詳しく紹介されている。]を
利用して開始コドンをATGに変異させ、合わせてこの
開始コドンが変異したAP−T遺伝子を発現ベクターに
組込むことに成功した.このようなAP−T遺伝子を組
み込んだプラスミドで形質転換された微生物を用いるこ
とによって、高度に耐熱性を有する^P−Tをきわめて
効率良く生産できることを見い出した。特に大腸菌など
の中温性細菌にAP−T遺伝子を導入して、AP−Tを
生産させた場合、大腸菌内で生産されたときでも、AP
−Tは天然のAP−Tと同様に高い耐熱性を有するので
、このような菌体を超音波等の手段で破砕した後、単に
70゜〜80℃程度の加熱を一定時間行なうだけで、A
P−T以外の大腸菌が元々もっている酵素やタンパク買
は熱変性して沈殿する.その結果、遠心分離後の上澄液
には、他の酵素活性を含まないほとんどAP−T活性の
みを有する溶液が得られることを見い出した。それ故、
極めて容易にAP−Tを精製することが可能である。本
発明はかかる知見により完成されたものである。
すなわち、本発明は高度好熱性細菌サーマス属由来の耐
熱性を有するアミノペプチダーゼ(AP−T)をコード
するDNA配列及びそれを含むプラスミドに関するもの
である。
熱性を有するアミノペプチダーゼ(AP−T)をコード
するDNA配列及びそれを含むプラスミドに関するもの
である。
本発明のDNA配列の決定は次の方法によって行うこと
ができる. (1) AP−TをコードするAP−T遺伝子のクロー
ニング本発明にかかわるクローニングの基本的手法は、
例えばManiatis, T. et al. Mo
lecularcloning;^Laborator
y Manual, Gold SprlngHarb
or Laboratory, Cold Sprin
g Harbor,N.Y.,1982: Berge
r. S.L. and A.R. Kimmel(e
d.),Methods in Enzymo1.vo
l.l52(Guide toMolecular C
loning Techniques,(1987)及
びPerbal, B.A practical gu
id to molecularcloning(2n
d ed.), John Wiley & Sons
,(1988)に詳しく紹介されている。
ができる. (1) AP−TをコードするAP−T遺伝子のクロー
ニング本発明にかかわるクローニングの基本的手法は、
例えばManiatis, T. et al. Mo
lecularcloning;^Laborator
y Manual, Gold SprlngHarb
or Laboratory, Cold Sprin
g Harbor,N.Y.,1982: Berge
r. S.L. and A.R. Kimmel(e
d.),Methods in Enzymo1.vo
l.l52(Guide toMolecular C
loning Techniques,(1987)及
びPerbal, B.A practical gu
id to molecularcloning(2n
d ed.), John Wiley & Sons
,(1988)に詳しく紹介されている。
本発明のサーマス・アクアテイカスYT−1(Ther
mus旦」工匡■YT−1)はすでにアメリカン・タイ
プ・カルチャー コレクションに寄託番号ATCC25
104で寄託されており、何人も人手可能である(Th
e American Type Culture C
ollectionCatalogue of Str
ains 14th Edition 1980.参照
)。サーマス・アクアテイカスYT−1株を培養し、菌
体を回収後、Saito−Miura法[Biochi
m.Biophys.^cta、72, 619(19
63)] などにより染色体DNAを抽出する。この染
色体DNAを制限酵素で切断する。切断された染色体D
NAを、アガロースゲル電気泳動した後、メンプランフ
ィルター(例えば、ニトロセルロースメンブラン,ナイ
ロンメンブランなど)に例えばサザンの方法[Sout
hern, E, M. J. Biol. Chea
a. 98, 508−517(1975)] で移行
させる(以降、サザントランスファーと呼ぶ).この染
色体DNAの制限酵素分解断片が結合したメンプランに
対して合成オリゴヌクレオチドをブローブとしてハイブ
リダイゼーションを実施する.これに用いるオリゴヌク
レオチドは、サーマス・アクアティカスYT−1から精
製されたAP−Tを化学分析して決定されたアミノ酸配
列から、それをコードするDNA配列を推定し、DNA
合成装置で合成する.プローブとして用いるオリゴヌク
レオチドの設計は、多様な可能性があるが、例えばブル
ースらの考え方[Bruth, R.etal. M
ethods in Enzymol., 15
2,432−443(198フ)】が参考になる。合成
オリゴヌクレオチドは5′末端を[γ一”P]ATPと
T4ボリヌクレオチドキナーゼを用いて常法[例えば、
Maniatis,T. et al. Molecu
lar cloning: a laboratory
manual. Cold Spring Harbo
r, N.Y.(1982) P.122参照]により
放射性ラベル化する。このラベルされたオリゴヌクレオ
チドを用いて、前述したメンプランのハイブリダイゼー
ションを実施する。パイプリダイゼーションの手法とし
てはHarnes, B.D. and S.J.Hi
ggins(ed.)、Nucleicacid hy
bridisation; a practical
approach,IRL PRESS、(1985)
などが参考となる。パイプリダイゼーシミン後、オート
ラジオグラフィーにより検出する。合成オリゴヌクレオ
チドと特異的にパイプリダイズするバンドが見い出され
たならば、それに用いた制限酵素を用いて、再度サーマ
ス・アクアティカスの染色体DNAを分解し、アガロー
スゲル電気泳勅を実施し、ハイブリダイズしたDNA断
片の大きさに相当するDNA断片をアガロースゲルから
切り出した後、抽出する。抽出した断片を市販のベクタ
ーの役割をするプラスミドを制限酵素で消化したものと
りガーゼで連結する。この連結したDNAを用いて標準
的な方法で宿主となりつる細菌を形質転換し、得られた
形質転換株のうち、コロニーハイプリダイゼーションに
より前記のオリゴヌクレオチドブローブに特異的にパイ
プリダイズするコロニーあるいはAP−Tの活性を示す
コロニーを鈎菌し、これらの中から八P−T遺伝子を含
有すると予想されるプラスミドを抽出する。プラスミド
に組み込まれたDNA断片中のAP−T遺伝子の位置は
次のようにして決定できる。AP−T遺伝子を含んでい
ると予想されるDNA断片あるいはプラスミドを各種制
限酵素で分解し、アガロースゲノレ電気冫永勤あるいは
ポリアクリルアミド電気泳勅などで分解物の各断片の大
きさを算出する。この結果を前記のA practic
alguide to molecular c
loning(2nd ad.)(1988)9.3
63−367 .などに一般的に示されている考え方で
制限酵素地図を作成する。一方、これらの分解したDN
A断片をアガロースゲル電気泳勅し、メンプランにサザ
ントランスファーし、このメンプランを用いてオリゴヌ
クレオチドブローブに特異的にハイブリダイズするバン
ドを検出する。プローブにハイブリダイズしたバンドを
制限酵素地図より特定する。
mus旦」工匡■YT−1)はすでにアメリカン・タイ
プ・カルチャー コレクションに寄託番号ATCC25
104で寄託されており、何人も人手可能である(Th
e American Type Culture C
ollectionCatalogue of Str
ains 14th Edition 1980.参照
)。サーマス・アクアテイカスYT−1株を培養し、菌
体を回収後、Saito−Miura法[Biochi
m.Biophys.^cta、72, 619(19
63)] などにより染色体DNAを抽出する。この染
色体DNAを制限酵素で切断する。切断された染色体D
NAを、アガロースゲル電気泳動した後、メンプランフ
ィルター(例えば、ニトロセルロースメンブラン,ナイ
ロンメンブランなど)に例えばサザンの方法[Sout
hern, E, M. J. Biol. Chea
a. 98, 508−517(1975)] で移行
させる(以降、サザントランスファーと呼ぶ).この染
色体DNAの制限酵素分解断片が結合したメンプランに
対して合成オリゴヌクレオチドをブローブとしてハイブ
リダイゼーションを実施する.これに用いるオリゴヌク
レオチドは、サーマス・アクアティカスYT−1から精
製されたAP−Tを化学分析して決定されたアミノ酸配
列から、それをコードするDNA配列を推定し、DNA
合成装置で合成する.プローブとして用いるオリゴヌク
レオチドの設計は、多様な可能性があるが、例えばブル
ースらの考え方[Bruth, R.etal. M
ethods in Enzymol., 15
2,432−443(198フ)】が参考になる。合成
オリゴヌクレオチドは5′末端を[γ一”P]ATPと
T4ボリヌクレオチドキナーゼを用いて常法[例えば、
Maniatis,T. et al. Molecu
lar cloning: a laboratory
manual. Cold Spring Harbo
r, N.Y.(1982) P.122参照]により
放射性ラベル化する。このラベルされたオリゴヌクレオ
チドを用いて、前述したメンプランのハイブリダイゼー
ションを実施する。パイプリダイゼーションの手法とし
てはHarnes, B.D. and S.J.Hi
ggins(ed.)、Nucleicacid hy
bridisation; a practical
approach,IRL PRESS、(1985)
などが参考となる。パイプリダイゼーシミン後、オート
ラジオグラフィーにより検出する。合成オリゴヌクレオ
チドと特異的にパイプリダイズするバンドが見い出され
たならば、それに用いた制限酵素を用いて、再度サーマ
ス・アクアティカスの染色体DNAを分解し、アガロー
スゲル電気泳勅を実施し、ハイブリダイズしたDNA断
片の大きさに相当するDNA断片をアガロースゲルから
切り出した後、抽出する。抽出した断片を市販のベクタ
ーの役割をするプラスミドを制限酵素で消化したものと
りガーゼで連結する。この連結したDNAを用いて標準
的な方法で宿主となりつる細菌を形質転換し、得られた
形質転換株のうち、コロニーハイプリダイゼーションに
より前記のオリゴヌクレオチドブローブに特異的にパイ
プリダイズするコロニーあるいはAP−Tの活性を示す
コロニーを鈎菌し、これらの中から八P−T遺伝子を含
有すると予想されるプラスミドを抽出する。プラスミド
に組み込まれたDNA断片中のAP−T遺伝子の位置は
次のようにして決定できる。AP−T遺伝子を含んでい
ると予想されるDNA断片あるいはプラスミドを各種制
限酵素で分解し、アガロースゲノレ電気冫永勤あるいは
ポリアクリルアミド電気泳勅などで分解物の各断片の大
きさを算出する。この結果を前記のA practic
alguide to molecular c
loning(2nd ad.)(1988)9.3
63−367 .などに一般的に示されている考え方で
制限酵素地図を作成する。一方、これらの分解したDN
A断片をアガロースゲル電気泳勅し、メンプランにサザ
ントランスファーし、このメンプランを用いてオリゴヌ
クレオチドブローブに特異的にハイブリダイズするバン
ドを検出する。プローブにハイブリダイズしたバンドを
制限酵素地図より特定する。
(2) AP−T遺伝子の塩基配列の決定AP−T遺伝
子を含んでいると予測される領域について、そのDNA
断片の全塩基配列をSangerのシデオキシ法[Sc
ience, 214. 1205(1981)]など
の方法を用いて決定する。このように決定された塩基配
列からそのコードするアミノ酸配列を推定し、それをA
P−Tを化学分析することによフて得られたアミノ酸配
列と比較することによって、どの部分がAP−Tのタン
パクをコードしているかがわかる。
子を含んでいると予測される領域について、そのDNA
断片の全塩基配列をSangerのシデオキシ法[Sc
ience, 214. 1205(1981)]など
の方法を用いて決定する。このように決定された塩基配
列からそのコードするアミノ酸配列を推定し、それをA
P−Tを化学分析することによフて得られたアミノ酸配
列と比較することによって、どの部分がAP−Tのタン
パクをコードしているかがわかる。
このようにして得られたAP−T遺伝子配列の知見とD
NA断片中の位置から、AP−T遺伝子部分を切り出し
て、適当な市販の発現ベクターに組み込み、AP−Tを
遺伝子工学的に生産することが可能となる。
NA断片中の位置から、AP−T遺伝子部分を切り出し
て、適当な市販の発現ベクターに組み込み、AP−Tを
遺伝子工学的に生産することが可能となる。
(3)AP−T遺伝子の発現
本発明のAP−TをコードするDNAの配列を含むDN
A断片を適当なプラスミドに組込んで大腸菌などの適当
な生物を形質転換し、AP−Tを生産することができる
。また、AP−T遺伝子の開始コドンあるいは終止コド
ンをその宿主に合った別の配列のコドンに変更しても良
い。遺伝子のコドン利用率は生物によフてその利用率が
異なるので、宿主に用いる生物に最適になるように、A
P−T遺伝子中のアミノ酸をコードする配列を同じアミ
ノ酸をコードする別の配列のコドンに変更しても良い.
DNA配列中の一部の塩基を他の塩基で置換することは
、例えばOligonucleotide direc
tedmutagenesisの手法を用いれば容易に
実施できる。
A断片を適当なプラスミドに組込んで大腸菌などの適当
な生物を形質転換し、AP−Tを生産することができる
。また、AP−T遺伝子の開始コドンあるいは終止コド
ンをその宿主に合った別の配列のコドンに変更しても良
い。遺伝子のコドン利用率は生物によフてその利用率が
異なるので、宿主に用いる生物に最適になるように、A
P−T遺伝子中のアミノ酸をコードする配列を同じアミ
ノ酸をコードする別の配列のコドンに変更しても良い.
DNA配列中の一部の塩基を他の塩基で置換することは
、例えばOligonucleotide direc
tedmutagenesisの手法を用いれば容易に
実施できる。
本発明においてクローニング.サブクローニングに用い
られる宿主としては、エッシェリヒア(Escheri
chia)属細菌、例えばエツシエリヒア・コリ(Es
cherichia coli)MV1184 (宝酒
造製)等が用いられる。ベクターとして用いられるプラ
スミドとしては、pUC系のベクター(例えばpU[:
18 ,pU[;19, pllc118, pjlG
119など)やpKK223−3など多くのプラスミド
が容易に市販品として人手できる。本発明で行ったクロ
ーニングや遺伝子組換えあるいは塩基配列の決定に用い
る器具や試薬,酵素類.菌株等についても容易に市販品
を人手できる。
られる宿主としては、エッシェリヒア(Escheri
chia)属細菌、例えばエツシエリヒア・コリ(Es
cherichia coli)MV1184 (宝酒
造製)等が用いられる。ベクターとして用いられるプラ
スミドとしては、pUC系のベクター(例えばpU[:
18 ,pU[;19, pllc118, pjlG
119など)やpKK223−3など多くのプラスミド
が容易に市販品として人手できる。本発明で行ったクロ
ーニングや遺伝子組換えあるいは塩基配列の決定に用い
る器具や試薬,酵素類.菌株等についても容易に市販品
を人手できる。
上述したことから明らかなごとく、本発明のAP−T遺
伝子の解明によって初めて可能となったAP−Tの遺伝
子工学的な生産により、耐熱性の非常に高いAP一丁を
効率良く生産できるので、本発明は産業上極めて有用な
ものである。
伝子の解明によって初めて可能となったAP−Tの遺伝
子工学的な生産により、耐熱性の非常に高いAP一丁を
効率良く生産できるので、本発明は産業上極めて有用な
ものである。
[実施例]
以下、実施例を挙げて本発明をさらに具体的に説明する
。
。
実施例1 サーマス・アクアティカスYT−1からの染
色体DNAの抽出 サーマス・アクアティカスYT−1 (ATCC250
14)株を特公昭62−11092号公報に記載の方法
と同様な方法で培養した。培養後、菌体を遠心分離で回
収した。得られた菌体6g(湿物重)からSaitO−
Miura法(前出)に従って染色体DNAを得た.実
施例2 オリゴヌクレオチドプローブの作製^P−T遺
伝子を染色体DNAの制限酵素分解断片中から検出する
ためにオリゴヌクレオチドをブローブとして用いた。サ
ーマス・アクアティカスYT−1の菌体より抽出、精製
されたAP−Tの化学的分析により、すてにN一末端側
の一部のアミノ酸配列が、すでに明らかとなっている[
Minagawa, E.et al.,^gric.
Biol. Chem., 52. 1755−17
63(1988)]。このアミノ酸配列より、それをコ
ードするDNAの配列を推定し、第1図に示した混合オ
リゴヌクレオチドを合成した.合成にはバイオサーチ社
(Biosearch. INC.)のサイクロン(C
yclone) D N A合成機を用いた。合成オ
リゴヌクレオチドの5′末端側の水酸基を次のようにし
て放射性リンでラベルした。すなわち、合成オリゴヌク
レオチド20pmoR(ピコモル) 0.75μf.
10xカイネーションバッファ一(κlnation
buffer)[50mM Tris−}1cj)(1
187.5), 10mM Mg(1:j’z,5
mMジチオスレイトール( D T T ) , 0.
1mMスペルミジン(Spermidine), 0.
1M E D T A 3 2.5μ1.10μCi
/μR[γ−”P] ATP 5.0μR.820
15.75μ2T4キナーゼ(宝酒造製)1.0μ
pをエッペンドルフチェーブ内で混合し、37℃で1時
間反応させた.65℃で10分間加熱し、T4キナーゼ
を失活させた。この反応混液は未反応の[γ−32PI
ATPを含むので、セップパック(Sep−Pak)
(ウォーターズ社製, PARTNo.51910)
を用いて精製し、遊離の[γ一”PIATPを除いた。
色体DNAの抽出 サーマス・アクアティカスYT−1 (ATCC250
14)株を特公昭62−11092号公報に記載の方法
と同様な方法で培養した。培養後、菌体を遠心分離で回
収した。得られた菌体6g(湿物重)からSaitO−
Miura法(前出)に従って染色体DNAを得た.実
施例2 オリゴヌクレオチドプローブの作製^P−T遺
伝子を染色体DNAの制限酵素分解断片中から検出する
ためにオリゴヌクレオチドをブローブとして用いた。サ
ーマス・アクアティカスYT−1の菌体より抽出、精製
されたAP−Tの化学的分析により、すてにN一末端側
の一部のアミノ酸配列が、すでに明らかとなっている[
Minagawa, E.et al.,^gric.
Biol. Chem., 52. 1755−17
63(1988)]。このアミノ酸配列より、それをコ
ードするDNAの配列を推定し、第1図に示した混合オ
リゴヌクレオチドを合成した.合成にはバイオサーチ社
(Biosearch. INC.)のサイクロン(C
yclone) D N A合成機を用いた。合成オ
リゴヌクレオチドの5′末端側の水酸基を次のようにし
て放射性リンでラベルした。すなわち、合成オリゴヌク
レオチド20pmoR(ピコモル) 0.75μf.
10xカイネーションバッファ一(κlnation
buffer)[50mM Tris−}1cj)(1
187.5), 10mM Mg(1:j’z,5
mMジチオスレイトール( D T T ) , 0.
1mMスペルミジン(Spermidine), 0.
1M E D T A 3 2.5μ1.10μCi
/μR[γ−”P] ATP 5.0μR.820
15.75μ2T4キナーゼ(宝酒造製)1.0μ
pをエッペンドルフチェーブ内で混合し、37℃で1時
間反応させた.65℃で10分間加熱し、T4キナーゼ
を失活させた。この反応混液は未反応の[γ−32PI
ATPを含むので、セップパック(Sep−Pak)
(ウォーターズ社製, PARTNo.51910)
を用いて精製し、遊離の[γ一”PIATPを除いた。
これをオリゴヌクレオチドプローブとして使用した。
実施例3 サザンハイプリダイゼーション実施例1で得
られた染色体DNA約100μgをHindlll (
市ffi品.ベーリンガーマンハイム製)100Uで完
全に分解後、常法によりアガロース電気泳勤する。この
ゲルをサザンの方法(前出)に従って、ナイロンメンブ
ラン(Hybond N , アマシャム社製)にトラ
ンスファーした。この膜に紫外線を照射して固定化した
。このメンプランをプレパイプリダイゼーション溶液(
6 X S S C ,5 x Denhardt溶
液, 50mM sodium phosphate
buffer(pH6.5), 250μg/mRのs
onicated salmontestesD N
A [S1gma, typelll Na Salt
y)中に浸漬し、65℃で3時間ブレパイプリダイゼー
ション反応後、そのメンプランをさらにパイプリダイゼ
ーション溶液(実施例2で調製した放射性オリゴヌクレ
オチドブローブ溶液200μ2を含む、6 X S S
C, I XDenhardt溶液, 50mM
Sodiumphosphate buffer(p
H8.5),looμg/mi)のsonicated
salmon testes D N A [Sigm
a. typelll Na Salt])中に浸漬し
、60℃にて16時間反応させた.メンプランの洗浄は
、洗浄液I (2XSSC,Q.1%SDS)で室温に
て15分洗浄後、洗浄液!1(0.IXSSC,0.5
%SDS)で50℃にて30分間洗浄して行った。メン
プランは水を切ったのち、フィルムカセットに入れ、−
70℃で増感紙存在下でオートラジオグラフィーを実施
した。この結果、約5.0κb (キロベース)付近の
DNA断片が、オリゴヌクレオチドブローブと特異的に
結合することが判明した。
られた染色体DNA約100μgをHindlll (
市ffi品.ベーリンガーマンハイム製)100Uで完
全に分解後、常法によりアガロース電気泳勤する。この
ゲルをサザンの方法(前出)に従って、ナイロンメンブ
ラン(Hybond N , アマシャム社製)にトラ
ンスファーした。この膜に紫外線を照射して固定化した
。このメンプランをプレパイプリダイゼーション溶液(
6 X S S C ,5 x Denhardt溶
液, 50mM sodium phosphate
buffer(pH6.5), 250μg/mRのs
onicated salmontestesD N
A [S1gma, typelll Na Salt
y)中に浸漬し、65℃で3時間ブレパイプリダイゼー
ション反応後、そのメンプランをさらにパイプリダイゼ
ーション溶液(実施例2で調製した放射性オリゴヌクレ
オチドブローブ溶液200μ2を含む、6 X S S
C, I XDenhardt溶液, 50mM
Sodiumphosphate buffer(p
H8.5),looμg/mi)のsonicated
salmon testes D N A [Sigm
a. typelll Na Salt])中に浸漬し
、60℃にて16時間反応させた.メンプランの洗浄は
、洗浄液I (2XSSC,Q.1%SDS)で室温に
て15分洗浄後、洗浄液!1(0.IXSSC,0.5
%SDS)で50℃にて30分間洗浄して行った。メン
プランは水を切ったのち、フィルムカセットに入れ、−
70℃で増感紙存在下でオートラジオグラフィーを実施
した。この結果、約5.0κb (キロベース)付近の
DNA断片が、オリゴヌクレオチドブローブと特異的に
結合することが判明した。
実施例4 AP−T遺伝子を含むDNA断片の回収実
施例3で染色体DNAの旧n d III断片のうち、
約5.OKbの断片がAP−TのN一末端近くの配列に
相当するDNA配列をもっていることが示唆されたので
、新たに染色体D N A 200tLgをHindl
l1で完全に分解し、アガロースゲル電気沫動により分
離した。約5.OKbに相当する部分をゲルから切り出
して、Maniatisら(前出)の方法に従って、ゲ
ルからDNA断片を電気泳勤抽出法により抽出した。
施例3で染色体DNAの旧n d III断片のうち、
約5.OKbの断片がAP−TのN一末端近くの配列に
相当するDNA配列をもっていることが示唆されたので
、新たに染色体D N A 200tLgをHindl
l1で完全に分解し、アガロースゲル電気沫動により分
離した。約5.OKbに相当する部分をゲルから切り出
して、Maniatisら(前出)の方法に従って、ゲ
ルからDNA断片を電気泳勤抽出法により抽出した。
抽出されたDNA断片をフェノール・クロロフォルムに
よる精製(Maniatisら、前出、9.460)後
、20alのTE.バッフy − ( lomhl T
ris−41Cil(pH7.4) .1 mME D
T A )に溶解した。
よる精製(Maniatisら、前出、9.460)後
、20alのTE.バッフy − ( lomhl T
ris−41Cil(pH7.4) .1 mME D
T A )に溶解した。
実施例5 マルチクローニングサイトをもち、アンビシ
リン耐性を有するpUcl18プラスミドベクターの回
収 あらかじめpUc118をルビジウム法( Mania
tisら、前出、9.252)でコンビテント化したE
. coltMVILa4を用いてptlc11Bプラ
スミド(宝酒造製)を用いて形質転換した。このpUc
118をもつE. coliMV1184株をL一プロ
ス(トリブトン1%.酵母エキス0.5%, NaCJ
O.5%.グルコース0.2%、pH7.0 ,アン
ビシリン50μg71入り)で一昼夜培養後、菌体を遠
心して回収し、アルカリ溶菌法(前出)で菌体からプラ
スミドを回収した。次いで、H i n d II1で
完全に分解し、バクテリアルーアルカリフオスファター
ゼで処理(Maniatisら、前出, +1.133
〜l34》することにより、5′末端のリン酸基を除去
し、ベクターとした。
リン耐性を有するpUcl18プラスミドベクターの回
収 あらかじめpUc118をルビジウム法( Mania
tisら、前出、9.252)でコンビテント化したE
. coltMVILa4を用いてptlc11Bプラ
スミド(宝酒造製)を用いて形質転換した。このpUc
118をもつE. coliMV1184株をL一プロ
ス(トリブトン1%.酵母エキス0.5%, NaCJ
O.5%.グルコース0.2%、pH7.0 ,アン
ビシリン50μg71入り)で一昼夜培養後、菌体を遠
心して回収し、アルカリ溶菌法(前出)で菌体からプラ
スミドを回収した。次いで、H i n d II1で
完全に分解し、バクテリアルーアルカリフオスファター
ゼで処理(Maniatisら、前出, +1.133
〜l34》することにより、5′末端のリン酸基を除去
し、ベクターとした。
実施例6 AP−T遺伝子を含むDNA断片のベクタ
ーへの組込みと形質転換 実施例4で回収したH i n d II1断片0.1
μgを実施例5で作製したベクターpU(:118の旧
n d III断片0 . 5agと混合し、50mM
Tris−}ICj)(pH7.4), 10mM
Mgcg2.10mMD T T , 1 mMスベ
ルミジン.lmMATP,0.1+ng/M+ B
S A Cウシ血清アルブミン)溶液20μp中で、3
50UのT4ソガーゼを加えて室温で2時間反応させた
。このうち1 0Bを形質転換に用いた。
ーへの組込みと形質転換 実施例4で回収したH i n d II1断片0.1
μgを実施例5で作製したベクターpU(:118の旧
n d III断片0 . 5agと混合し、50mM
Tris−}ICj)(pH7.4), 10mM
Mgcg2.10mMD T T , 1 mMスベ
ルミジン.lmMATP,0.1+ng/M+ B
S A Cウシ血清アルブミン)溶液20μp中で、3
50UのT4ソガーゼを加えて室温で2時間反応させた
。このうち1 0Bを形質転換に用いた。
形質転換は宿主としてE. coli MV1184株
を用いた。E. co目MV 11&4株は前述のルビ
ジウム法に従ってコンビテント化した。E. colt
MVll84のコンビテントセル溶液100μ2に、
上記DN,18’t110μpを加え、0℃にて30分
おいたのち43,5℃で30秒間加熱し、ヒートショッ
クを加えたのち1mj+のL−ブロスを加え、振とうし
ながら37℃で1時間培養した。この培養液を表面にナ
イロンメンブラン(l{ybond−N ,アマシャム
社!!!}を敷いたH−プレート寒天培地(1%バクト
トリブトン,0.8%NaC1, 1.2%寒天, 0
.05+nM isopropyl −β −D−th
iogalactopyranoside ( I
P T G )50μg/mRアンビシリン
, 50μg/mp 5−bromo−4−ch1or
o−3−indolyl−β−D−galactosi
de (X−gal)含有)のメンプラン表面に6枚に
分けて接種し、コンラージ棒で分けて37℃で培養した
。培養後、コロニーが肉眼で見える程度の大きさまで生
長したとき(約0.1〜0.5mm径)、無菌的にメン
プランをプレートから取り出し、同じ大きさのナイロン
メンブランをコロニー面に重ねて無菌的にプレスし、レ
プリカをとった。オリジナルとレプリカのメンプランを
それぞれH−プレート表面にのせて、さらに培養を続け
た。培養後、総数として776個のコロニーが生じ、そ
のうち763個がX−galを分解しない白いコロニー
(すなわち、ベクターにDNA断片が挿入されたもの)
であった。コロニーが十分生長したとき(約8時間培養
後)、オリジナルプレートは冷蔵し、レプリカメンブラ
ンをコロニーパイプリダイゼーションに用いた。コロニ
ーが生育したこのレプリカメンブランを風乾後、0.5
N NaOH, 1.5M NaGi fI液に5分
間2回浸み込ませ、次に1.5 M NaCj! ,
I M Tris−}ICR(p}17.5) l液
に5分間2回浸漬して中和し、次いで3 X S S
C (p}17.2)で10分間浸漬した。十分風乾後
、紫外線を照射してDNAをメンプランに固定した。こ
のメンプランを実施例3で述べたと同様に65℃で3時
間ブレハイブリダイゼーション後、オリゴヌクレオチド
ブローブを含むハイブリダイゼーション溶液に浸漬し、
65℃で20時間反応させた。次に、2XSSC,0.
1%SDSで室温.にて10分間洗浄後、0.I X
S S C, Q.5%SDSで40℃にて3分間洗浄
した。増感紙を入れて−70℃でオートラジオグラフィ
ーを行った。その結果、合計776個のコロニーのうち
、6個がオリゴヌクレオチドプローブと強くハイブリダ
イズすることが判明した。これらのコロニーと対応する
コロニーをオリジナルメンブランのコロニーから鈎菌し
、L−グロスで培養、アルカリ溶菌法でプラスミドを抽
出した。これらのブラスミトをH i n d III
で分解し、アガロースゲル電気泳勅を実施した。その結
果、これらの6株はすべて約5.OKbの}l i n
d Il1断片が挿入されていることが確誌された。
を用いた。E. co目MV 11&4株は前述のルビ
ジウム法に従ってコンビテント化した。E. colt
MVll84のコンビテントセル溶液100μ2に、
上記DN,18’t110μpを加え、0℃にて30分
おいたのち43,5℃で30秒間加熱し、ヒートショッ
クを加えたのち1mj+のL−ブロスを加え、振とうし
ながら37℃で1時間培養した。この培養液を表面にナ
イロンメンブラン(l{ybond−N ,アマシャム
社!!!}を敷いたH−プレート寒天培地(1%バクト
トリブトン,0.8%NaC1, 1.2%寒天, 0
.05+nM isopropyl −β −D−th
iogalactopyranoside ( I
P T G )50μg/mRアンビシリン
, 50μg/mp 5−bromo−4−ch1or
o−3−indolyl−β−D−galactosi
de (X−gal)含有)のメンプラン表面に6枚に
分けて接種し、コンラージ棒で分けて37℃で培養した
。培養後、コロニーが肉眼で見える程度の大きさまで生
長したとき(約0.1〜0.5mm径)、無菌的にメン
プランをプレートから取り出し、同じ大きさのナイロン
メンブランをコロニー面に重ねて無菌的にプレスし、レ
プリカをとった。オリジナルとレプリカのメンプランを
それぞれH−プレート表面にのせて、さらに培養を続け
た。培養後、総数として776個のコロニーが生じ、そ
のうち763個がX−galを分解しない白いコロニー
(すなわち、ベクターにDNA断片が挿入されたもの)
であった。コロニーが十分生長したとき(約8時間培養
後)、オリジナルプレートは冷蔵し、レプリカメンブラ
ンをコロニーパイプリダイゼーションに用いた。コロニ
ーが生育したこのレプリカメンブランを風乾後、0.5
N NaOH, 1.5M NaGi fI液に5分
間2回浸み込ませ、次に1.5 M NaCj! ,
I M Tris−}ICR(p}17.5) l液
に5分間2回浸漬して中和し、次いで3 X S S
C (p}17.2)で10分間浸漬した。十分風乾後
、紫外線を照射してDNAをメンプランに固定した。こ
のメンプランを実施例3で述べたと同様に65℃で3時
間ブレハイブリダイゼーション後、オリゴヌクレオチド
ブローブを含むハイブリダイゼーション溶液に浸漬し、
65℃で20時間反応させた。次に、2XSSC,0.
1%SDSで室温.にて10分間洗浄後、0.I X
S S C, Q.5%SDSで40℃にて3分間洗浄
した。増感紙を入れて−70℃でオートラジオグラフィ
ーを行った。その結果、合計776個のコロニーのうち
、6個がオリゴヌクレオチドプローブと強くハイブリダ
イズすることが判明した。これらのコロニーと対応する
コロニーをオリジナルメンブランのコロニーから鈎菌し
、L−グロスで培養、アルカリ溶菌法でプラスミドを抽
出した。これらのブラスミトをH i n d III
で分解し、アガロースゲル電気泳勅を実施した。その結
果、これらの6株はすべて約5.OKbの}l i n
d Il1断片が挿入されていることが確誌された。
さらに、このアガロースゲルをダイレクトゲルハイブリ
ダイゼーション法により確かにブローブが特異的にパイ
プリダイズすることを次のようにして確認した。
ダイゼーション法により確かにブローブが特異的にパイ
プリダイズすることを次のようにして確認した。
電気泳勅後得られたゲルを0.5 N−NaOH, 0
.15N NaCR溶液で1時間浸漬しアルカリ変性
した後、0.5 M Tris.HCI2(pH8.
0) 150mM NaCilで30分洗浄し、ベーバ
ータオルにはさみ、圧縮して水分をできるだけ除いた。
.15N NaCR溶液で1時間浸漬しアルカリ変性
した後、0.5 M Tris.HCI2(pH8.
0) 150mM NaCilで30分洗浄し、ベーバ
ータオルにはさみ、圧縮して水分をできるだけ除いた。
このようにして約1 mmの厚さになったゲルをワット
マン3MMペーパーに穆し、市販のゲル乾燥装置を用い
60℃で30分乾燥して完全に膜状にした.このメンプ
ランを実施例1〜3で示した方法と同じ方法でハイブリ
ダイゼーションを実施した.この結果、上述の6株のト
ランスフォーマントはすべてブローブにハイブリダイズ
するH i n d III断片を含んでいることが示
された。これらのプラスミドを各種の制限酵素で分解し
、アガロース電気沫動でパターンを比較することにより
、これらがすべて同じDNA断片を含むことが示された
。
マン3MMペーパーに穆し、市販のゲル乾燥装置を用い
60℃で30分乾燥して完全に膜状にした.このメンプ
ランを実施例1〜3で示した方法と同じ方法でハイブリ
ダイゼーションを実施した.この結果、上述の6株のト
ランスフォーマントはすべてブローブにハイブリダイズ
するH i n d III断片を含んでいることが示
された。これらのプラスミドを各種の制限酵素で分解し
、アガロース電気沫動でパターンを比較することにより
、これらがすべて同じDNA断片を含むことが示された
。
これらのうち、ベクターのI)U(:118のβaCプ
ロモーターの方向に対して互いに逆向きにB i n
d II!断片が挿入されているプラスミドをそれぞれ
pAT15A, pAT15Gと命名し、以降の実験に
用いた。
ロモーターの方向に対して互いに逆向きにB i n
d II!断片が挿入されているプラスミドをそれぞれ
pAT15A, pAT15Gと命名し、以降の実験に
用いた。
実施例7 組換え体プラスミドpAT15^, pA7
15Gの制限酵素地図の作成 pAT15A及びpAT15Gをそれぞれ、pUc11
8においてマルチクローニングサイト部分以外を切断し
ない酵素で分解し、その電気泳勤パターンから制限酵素
地図を作成した。
15Gの制限酵素地図の作成 pAT15A及びpAT15Gをそれぞれ、pUc11
8においてマルチクローニングサイト部分以外を切断し
ない酵素で分解し、その電気泳勤パターンから制限酵素
地図を作成した。
また、これらの制限酵素分解物をアガロースゲルで電気
沫動し、実施例6と同様にアガロースダイレクトパイプ
リダイゼーションを行うことによってブローブが制限酵
素地図中でどこにハイブリダイズするかを特定できた。
沫動し、実施例6と同様にアガロースダイレクトパイプ
リダイゼーションを行うことによってブローブが制限酵
素地図中でどこにハイブリダイズするかを特定できた。
このようにして得られた制限酵素地図を第2図に示した
。なお、この制限酵素地図にはκpnl , Sph
I , XhoI ,H i n d II1のサイ
トのみを示してある。
。なお、この制限酵素地図にはκpnl , Sph
I , XhoI ,H i n d II1のサイ
トのみを示してある。
実施例8 ^P−T遺伝子の塩基配列の決定挿入された
DNA断片中のAP−T遺伝子の配列を決定するために
、制限酵素SphI , KpnISmal ,
Xholでそれぞれ分解しpUc118あるいはptl
c119のベクターのマルチクローニングサイトにサブ
クローニングした。
DNA断片中のAP−T遺伝子の配列を決定するために
、制限酵素SphI , KpnISmal ,
Xholでそれぞれ分解しpUc118あるいはptl
c119のベクターのマルチクローニングサイトにサブ
クローニングした。
これらの新たに構築されたプラスミドの挿入断片のうち
AP−T遺伝子の断片を含むプラスミドについて塩基配
列の決定を行った。ptlc118及びpLIc119
はファージM13KO7を感染させることにより一本1
iDNAを生産することができるベクターで、そのため
容易にSangerのジデオキシ法[Dideoxyc
hain termination method;
Sanger et al.Proceedings
of the National Academy o
fScience, U.S.^., 74. 546
3−5467(1967)参照]のテンプレートとして
利用できる。すなわちこれらのプラスミドをM13KO
7を用いてそれぞれの一本釦を生産した.これをテンプ
レートとして、[a−”P] dCTP (アマシャム
社製) , deaza−d/dd d X T P
シークエンシングキット(ベーリンガー製)及びM13
ユニバーサルブライマー(宝酒造)を用いてシークエン
シングを実施した。
AP−T遺伝子の断片を含むプラスミドについて塩基配
列の決定を行った。ptlc118及びpLIc119
はファージM13KO7を感染させることにより一本1
iDNAを生産することができるベクターで、そのため
容易にSangerのジデオキシ法[Dideoxyc
hain termination method;
Sanger et al.Proceedings
of the National Academy o
fScience, U.S.^., 74. 546
3−5467(1967)参照]のテンプレートとして
利用できる。すなわちこれらのプラスミドをM13KO
7を用いてそれぞれの一本釦を生産した.これをテンプ
レートとして、[a−”P] dCTP (アマシャム
社製) , deaza−d/dd d X T P
シークエンシングキット(ベーリンガー製)及びM13
ユニバーサルブライマー(宝酒造)を用いてシークエン
シングを実施した。
シークエンシング用の電気泳勅用ゲルの作製はベルバル
の方法(前出)に従った。ゲルの大きさは40x 20
x 0.035cmで、8M尿素を含む8%ポリアクリ
ルアミドゲルを主に用いた。泳勅は2000 Vで行っ
た。サーマス属のDNAはG.+C含量が高く、バンド
のコンブレッションが問題となる。それ故泳動は出来る
だけ60t以上で実施した。また、ユニバーサルブライ
マーでシークエンシングをして得られた塩基配列をもと
に、実施例2で示したと同様な方法で17−marのオ
リゴヌクレオチドを合成し、これをシークエンシングブ
ライマーとして、シークエンシングを行った。このよう
にしてAP−T遺伝子を含むと考えられる領域1,5
8 2 b I)の全塩基配列を決定した。第3図にシ
ークエンシングの戦略を示した。また、AP−T遺伝子
を含む全領域の塩基配列を第4−1図及び第4−2図に
わたって示した。
の方法(前出)に従った。ゲルの大きさは40x 20
x 0.035cmで、8M尿素を含む8%ポリアクリ
ルアミドゲルを主に用いた。泳勅は2000 Vで行っ
た。サーマス属のDNAはG.+C含量が高く、バンド
のコンブレッションが問題となる。それ故泳動は出来る
だけ60t以上で実施した。また、ユニバーサルブライ
マーでシークエンシングをして得られた塩基配列をもと
に、実施例2で示したと同様な方法で17−marのオ
リゴヌクレオチドを合成し、これをシークエンシングブ
ライマーとして、シークエンシングを行った。このよう
にしてAP−T遺伝子を含むと考えられる領域1,5
8 2 b I)の全塩基配列を決定した。第3図にシ
ークエンシングの戦略を示した。また、AP−T遺伝子
を含む全領域の塩基配列を第4−1図及び第4−2図に
わたって示した。
塩基配列を決定したことにより、AP−T遺伝子が第4
−1図から第4−2図に示した塩基配列のうち第177
番目のGからコードされていることが判明した。第17
7番目から始まるコドンGTGは原核生物の開始コドン
として知られており、このGTGからのオープンリーデ
ングフレームは1401番目から始まる終止コドンTA
Aまで続いていた。また、このオープンリーディングフ
レームから推定されるアミノ酸配列は、精製AP−Tの
N一末端部分のアミノ酸配列及びプロモシアン分解物の
アミノ酸配列の分析値と良く一致した(第4−1図〜第
4−2図中、下線で示した。) 終止コドンの下流の1421N1444番目の塩基の部
分にインバーテッドリピート配列があり、これは典型的
なターミネーター構造を示していた。また177番目〜
1400番目のオープンリーディングフレームがコード
するアミノ酸組成は、表1に示したように、天然物のア
ミノ酸組成ときわめて良く一致した.また、遺伝子配列
から推定されるAP−Tの相対分子量は44,820で
あり、精製したAP−TのSDS−ディスク電気泳勤か
ら推定された千ノマーの相対分子量48,000 [皆
川らの推定による、Minagawa, E. et
al., Agric. Biol. Chem.,5
2.1755−1763 (1988) ]とも良い近
似を示した。
−1図から第4−2図に示した塩基配列のうち第177
番目のGからコードされていることが判明した。第17
7番目から始まるコドンGTGは原核生物の開始コドン
として知られており、このGTGからのオープンリーデ
ングフレームは1401番目から始まる終止コドンTA
Aまで続いていた。また、このオープンリーディングフ
レームから推定されるアミノ酸配列は、精製AP−Tの
N一末端部分のアミノ酸配列及びプロモシアン分解物の
アミノ酸配列の分析値と良く一致した(第4−1図〜第
4−2図中、下線で示した。) 終止コドンの下流の1421N1444番目の塩基の部
分にインバーテッドリピート配列があり、これは典型的
なターミネーター構造を示していた。また177番目〜
1400番目のオープンリーディングフレームがコード
するアミノ酸組成は、表1に示したように、天然物のア
ミノ酸組成ときわめて良く一致した.また、遺伝子配列
から推定されるAP−Tの相対分子量は44,820で
あり、精製したAP−TのSDS−ディスク電気泳勤か
ら推定された千ノマーの相対分子量48,000 [皆
川らの推定による、Minagawa, E. et
al., Agric. Biol. Chem.,5
2.1755−1763 (1988) ]とも良い近
似を示した。
このように決定されたsph rからXho Iサイト
までの1,5 8 2 b p内に、AP−Tをコード
する全塩基配列が含まれていることが確認できた。また
、pA715Gはベクターのlacプロモーターに対し
て正向きに、pAT15Aは逆向きに、AP−T遺伝子
が組込まれていることが明らかとなった。ここで明らか
になったAP−T遺伝子から推定されるAP−Tの一次
構造、すなわちアミノ酸配列は、タンパク質データベー
スを用いたコンピューターによるホモロジー検索の結果
、高いホモロジーをもつ既知のタンパク質は存在しなか
った。使用したデータベースはNBRF−f’DB(N
ational Biomedical Resear
chFundation, Protein Data
Base) (1988年、3月)であった.また、
すでにDNA配列の知られている大腸菌のアミノペプチ
ダーゼN [Mc(:aman,M.T.. and
J.D. Gabe,Gane 41S, 145−1
53(1986)]及びメチオニンアミノベブチダーゼ
Ban−Bassat,A.κ. at al.. J
. Bacteriol., 169. 751−75
7(1987)] 及びヒト由来のアミノペプチダーゼ
N[01sen, J. et al.,FEB
S Latters, 238, 307−31
4(1988)] とはホモロジーは低かった。それ故
、AP−Tは全く新規なアミノベブチダーゼと考えられ
た. 表I AP−Tのアミノ酸組成 スレオニン セリン l9 l4 l8 l0 ブロリン グリシン アラニン システイン パリン メチオニン イソロイシン ロイシン チロシン フェニルアラニン リジン ヒスチジン アルギニン 実施例9 AP−T遺伝子の大腸菌内での発現pAT
l5A, pAT15GはAP−Tの遺伝子を全配列を
含むことが明らかとなった。これらのプラスミドを保有
するE. colt MV1184、すなわちE. c
oli MV1184(pAT15A) , E.匹坦
MV1184 (pAT15G)がAP−Tの活性をも
つかどうか試験するために、次のような実験を行った,
E. colt MV1184(pAT15A),
E. coilMV1184 (+)ATL5Gl &
びAP−T遺伝子をもたないLcoli MV1184
(pLIc118)をL−ブロス(10m1.50μg
/mffiアンピシリン入り)に接種し、37℃で振と
り培養し、I PTGを加えるものはOD55。一約0
.5のときに、0.1mMになるようI PTGを添加
し、さらに約20時間培養した。遠心分離により菌体を
回収し、50mM Tris−HCj) (pH8.5
)で菌体を懸濁し、再度遠心した。50mM Tris
−}1ci’ (pHa.5)に再懸濁後、超音波破砕
し、次に70℃の温渇中で1時間加熱した.遠心して変
性したタンパクを除去し、上澄液を回収した。合成基質
であるLeucin−4一Nitro− anilid
eを加え、70℃で16時間反応させた。反応停止には
10%トリクロ口酢酸溶液を加え、除タンパク後、上澄
液の41Or++nにおける吸光度を測定した。その結
果を表2に示した。この結果から、このAP−T遺伝子
を含むDNA断片は^P−T遺伝子がベクターのNac
プロモーターに対して正向きに組み込まれていても、逆
向きに挿入されていても活性を示すことがわかクた。
までの1,5 8 2 b p内に、AP−Tをコード
する全塩基配列が含まれていることが確認できた。また
、pA715Gはベクターのlacプロモーターに対し
て正向きに、pAT15Aは逆向きに、AP−T遺伝子
が組込まれていることが明らかとなった。ここで明らか
になったAP−T遺伝子から推定されるAP−Tの一次
構造、すなわちアミノ酸配列は、タンパク質データベー
スを用いたコンピューターによるホモロジー検索の結果
、高いホモロジーをもつ既知のタンパク質は存在しなか
った。使用したデータベースはNBRF−f’DB(N
ational Biomedical Resear
chFundation, Protein Data
Base) (1988年、3月)であった.また、
すでにDNA配列の知られている大腸菌のアミノペプチ
ダーゼN [Mc(:aman,M.T.. and
J.D. Gabe,Gane 41S, 145−1
53(1986)]及びメチオニンアミノベブチダーゼ
Ban−Bassat,A.κ. at al.. J
. Bacteriol., 169. 751−75
7(1987)] 及びヒト由来のアミノペプチダーゼ
N[01sen, J. et al.,FEB
S Latters, 238, 307−31
4(1988)] とはホモロジーは低かった。それ故
、AP−Tは全く新規なアミノベブチダーゼと考えられ
た. 表I AP−Tのアミノ酸組成 スレオニン セリン l9 l4 l8 l0 ブロリン グリシン アラニン システイン パリン メチオニン イソロイシン ロイシン チロシン フェニルアラニン リジン ヒスチジン アルギニン 実施例9 AP−T遺伝子の大腸菌内での発現pAT
l5A, pAT15GはAP−Tの遺伝子を全配列を
含むことが明らかとなった。これらのプラスミドを保有
するE. colt MV1184、すなわちE. c
oli MV1184(pAT15A) , E.匹坦
MV1184 (pAT15G)がAP−Tの活性をも
つかどうか試験するために、次のような実験を行った,
E. colt MV1184(pAT15A),
E. coilMV1184 (+)ATL5Gl &
びAP−T遺伝子をもたないLcoli MV1184
(pLIc118)をL−ブロス(10m1.50μg
/mffiアンピシリン入り)に接種し、37℃で振と
り培養し、I PTGを加えるものはOD55。一約0
.5のときに、0.1mMになるようI PTGを添加
し、さらに約20時間培養した。遠心分離により菌体を
回収し、50mM Tris−HCj) (pH8.5
)で菌体を懸濁し、再度遠心した。50mM Tris
−}1ci’ (pHa.5)に再懸濁後、超音波破砕
し、次に70℃の温渇中で1時間加熱した.遠心して変
性したタンパクを除去し、上澄液を回収した。合成基質
であるLeucin−4一Nitro− anilid
eを加え、70℃で16時間反応させた。反応停止には
10%トリクロ口酢酸溶液を加え、除タンパク後、上澄
液の41Or++nにおける吸光度を測定した。その結
果を表2に示した。この結果から、このAP−T遺伝子
を含むDNA断片は^P−T遺伝子がベクターのNac
プロモーターに対して正向きに組み込まれていても、逆
向きに挿入されていても活性を示すことがわかクた。
表2 大腸菌, E. colt MV1184におけ
るAP−T遺伝子の発現例 pUc118 (対照) 0.15pAT
15^ l.04
pATl5八十 rPTG
O.92pAT15G
1.13pAT15G+ IPTG
1.08◆ロイシン−4−ニトロアニ
リドを基質として70℃で測定 実施例10 オリゴヌクレオチド ディレクテッドミ
ュータジネシスを用いたAP−T遺伝子の発現プラスミ
ドの構築 実施例9で示したようにAP−T遺伝子を含む1)AT
15A, pAT15Gでも発現するが、あまり効率的
ではなかった。これは、このAP−T遺伝子の開始コド
ンが大腸菌では使用頻度の少ないGTGであること、ま
たベクターがもつプロモーター領域とかなり離れてAP
−T遺伝子が存在することが主な理由と考えられた。そ
こで、次のようにして大腸菌でのAP−Tの大量発産を
目指した。まず、スタートコドンのGTGをATGに変
更し、合わせてクローニングされたsph Iサイトか
らスタートコドンの前の176bpまでの余分な配列(
この部分はサーマス・アクアティカスYT−1のAP−
T遺伝子のプロモーター領域を含むと考えられた。)を
除去(デリーション)し、tacプロモーターのEco
R Iサイトに直接連結することにした。手法としては
オリゴヌクレオチド ディレクテッド ミュータジェネ
シスと呼ばれる技法によるもので、クンケルの方法[K
unkel, T.A. Proc. Na口.
八cad. Sci. USA,82, 488
−492(1985)]をゾーラーとスミスの方法[Z
ollar. M.J. and M.Smith.
Methods Enzymol.154. 329−
350(1987)] に従って改変して行った。
るAP−T遺伝子の発現例 pUc118 (対照) 0.15pAT
15^ l.04
pATl5八十 rPTG
O.92pAT15G
1.13pAT15G+ IPTG
1.08◆ロイシン−4−ニトロアニ
リドを基質として70℃で測定 実施例10 オリゴヌクレオチド ディレクテッドミ
ュータジネシスを用いたAP−T遺伝子の発現プラスミ
ドの構築 実施例9で示したようにAP−T遺伝子を含む1)AT
15A, pAT15Gでも発現するが、あまり効率的
ではなかった。これは、このAP−T遺伝子の開始コド
ンが大腸菌では使用頻度の少ないGTGであること、ま
たベクターがもつプロモーター領域とかなり離れてAP
−T遺伝子が存在することが主な理由と考えられた。そ
こで、次のようにして大腸菌でのAP−Tの大量発産を
目指した。まず、スタートコドンのGTGをATGに変
更し、合わせてクローニングされたsph Iサイトか
らスタートコドンの前の176bpまでの余分な配列(
この部分はサーマス・アクアティカスYT−1のAP−
T遺伝子のプロモーター領域を含むと考えられた。)を
除去(デリーション)し、tacプロモーターのEco
R Iサイトに直接連結することにした。手法としては
オリゴヌクレオチド ディレクテッド ミュータジェネ
シスと呼ばれる技法によるもので、クンケルの方法[K
unkel, T.A. Proc. Na口.
八cad. Sci. USA,82, 488
−492(1985)]をゾーラーとスミスの方法[Z
ollar. M.J. and M.Smith.
Methods Enzymol.154. 329−
350(1987)] に従って改変して行った。
具体的には次のように実施した。pA715G 200
μgをsph Iで完全分解し、次にXho Iを加え
て部分分解し、AP−T遺伝子を全て含むSph 1
−Xho I断片(1,582M)を得た.これをpt
lc119のSph I −Sal Iサイトにライゲ
ーションしプラスミドpG1を得た(第5図),pG1
をEcoR IとH i n d II1で分解し、A
P−T遺伝子を含むEcoR I − }1indll
!断片(これをフラグメントHと呼ぶ)を得た。一方発
現ベクターとしてはtacプロモーターをもつpEXP
7を用いた(第5図) .pEXP7はpKK223−
3 ( 7 7 ルマシ7社製)のSca Iサイトか
らsph Iサイト(ここにはtacプロモーター領域
.マルチクローニングサイト及びrrBT+’hターミ
ネーター領域が含まれる.)をDNAポリメラーゼ■の
3′エキソヌクレアーゼ活性を利用して断片の末端を常
法により平滑化して911(:119のPvu H −
Pvu IIフラグメント(この断片にはアンピシリン
耐性、M13κ07ファージのインタージェニツク領域
(intergenic region)÷セ今゛
が含まれる)とを連結して構 築されたプラスミドである。このpEXP7はpUc1
18やputtq と同様にM13κ07ファージを感
染させることにより一本鎖D N Aを回収でき、しか
もpκκ223−3由来のtacプロモーターをもった
発現ベクターである, pEXP7をSma Iで消化
し、アルカリフォスファターゼ処理した。一方、フラグ
メントHは末端としてEcoR Iと旧n d III
末端をもつ断片で、常法によりKlenowフラグメン
トとdNTPを用いて、3′末端伸長を行って平滑末端
にし、pEXP7のSma Iサイトにライゲーション
した。クローニングして得られたプラスミドのうち、制
限酵素分解によるパターンからtacプロモーターの向
きに対して正向きにAP−T遺伝子が挿入されているプ
ラスミドを選び出しpE13と命名した(第5図参照)
。次に、pE13を用いて大腸菌E. coli BW
313(宝酒造製)をトランスフォーメーションしたO
L凹BW313はF0,鏝.出 の株で、dUTPas
e とUracil−DNA−glycosylase
(Ung) を欠く[クンケル,前出参照]。それ
故、pE13をもったE. coli BW313 に
M13KO7ファージを感染させ、ところどころT(チ
ミン)がU(ウラシル)に置換されたpEJ3の一本鎖
DNAを得ることが出来た。
μgをsph Iで完全分解し、次にXho Iを加え
て部分分解し、AP−T遺伝子を全て含むSph 1
−Xho I断片(1,582M)を得た.これをpt
lc119のSph I −Sal Iサイトにライゲ
ーションしプラスミドpG1を得た(第5図),pG1
をEcoR IとH i n d II1で分解し、A
P−T遺伝子を含むEcoR I − }1indll
!断片(これをフラグメントHと呼ぶ)を得た。一方発
現ベクターとしてはtacプロモーターをもつpEXP
7を用いた(第5図) .pEXP7はpKK223−
3 ( 7 7 ルマシ7社製)のSca Iサイトか
らsph Iサイト(ここにはtacプロモーター領域
.マルチクローニングサイト及びrrBT+’hターミ
ネーター領域が含まれる.)をDNAポリメラーゼ■の
3′エキソヌクレアーゼ活性を利用して断片の末端を常
法により平滑化して911(:119のPvu H −
Pvu IIフラグメント(この断片にはアンピシリン
耐性、M13κ07ファージのインタージェニツク領域
(intergenic region)÷セ今゛
が含まれる)とを連結して構 築されたプラスミドである。このpEXP7はpUc1
18やputtq と同様にM13κ07ファージを感
染させることにより一本鎖D N Aを回収でき、しか
もpκκ223−3由来のtacプロモーターをもった
発現ベクターである, pEXP7をSma Iで消化
し、アルカリフォスファターゼ処理した。一方、フラグ
メントHは末端としてEcoR Iと旧n d III
末端をもつ断片で、常法によりKlenowフラグメン
トとdNTPを用いて、3′末端伸長を行って平滑末端
にし、pEXP7のSma Iサイトにライゲーション
した。クローニングして得られたプラスミドのうち、制
限酵素分解によるパターンからtacプロモーターの向
きに対して正向きにAP−T遺伝子が挿入されているプ
ラスミドを選び出しpE13と命名した(第5図参照)
。次に、pE13を用いて大腸菌E. coli BW
313(宝酒造製)をトランスフォーメーションしたO
L凹BW313はF0,鏝.出 の株で、dUTPas
e とUracil−DNA−glycosylase
(Ung) を欠く[クンケル,前出参照]。それ
故、pE13をもったE. coli BW313 に
M13KO7ファージを感染させ、ところどころT(チ
ミン)がU(ウラシル)に置換されたpEJ3の一本鎖
DNAを得ることが出来た。
一方、tacプロモーターの配列とAP−TのN一末端
の配列の相補鎖に相当する配列(ただし、開始コドンの
GTGをATGに変更してある。)をもつ36−mar
の変異用のオリゴヌクレオチド( 5 ’−T TCC
GTGAAGGCGTCCATGAATTCTGTTT
CCTGTGT−3’)及び第4−2図中のAP−T遺
伝子の塩基配列中1476番目〜1492番目の塩基配
列の梠補鎮に相当する配列をもつ17−marのオリゴ
ヌクレオチド( 5 ’−T A T T C G C
A CACAAAAGCAC−3’)を合成した。こ
の36−nerの変異用オリゴヌクレオチドの5′末端
のOH基はT4ボリヌクレオチドキナーゼとATPによ
りリン酸化した.以上の2つのオリゴヌクレオチドをと
ころどころウラシルを含むpE13の一木鎖DNAに次
のようにしてアニールした。一末娘DNA2μ1 (0
.5pmoi+)を、5′一をリン酸化した変異用36
−marのオリゴヌクレオチド1 μ!! (10pm
oj))及び17−merのオリゴヌクレオチド1 μ
j! (10pmof’)と混ぜ、IOXのバッフy−
A (0.2M Tris−HCil, 0.1MMg
CRz. 0.5M NaCR. 10mM D
T T (pH7.5)) 1 ttl!を加え、さ
らに水を4μ!加えて合計10μρとする.55℃で5
分問おいたのち、室温で5分おき、これに25μ2のE
xtensionバッファ−(宝酒造製、ミュータンK
キット),xμpのA T P ( 6 mg/mj!
)を加え、ざらにT4リガーゼ1μp ( 6 uni
t)とκlenowフラグメント1 uR(2.5un
it) を加えた。lO℃±2℃で20時問おいたのち
、0.2MEDTA3μpを加え、65℃で5分間加熱
した.この混合液を実施例4と同様に調製したE. c
oliIAVll84のコンビテントセル溶液100μ
gに全量加えた.O℃中に30分静置後、42℃で30
秒加温し、次に1 mRのし一ブロスを加え、1時間振
どう培養した.次に、この培養液をLB寒天培地(1%
バクトトリブトン,0.5%バクトイーストエクストラ
クト.O、5%NaCIl, pH7.0、15oμg
/mjアンピシリン入り)6枚に分けて接種し、37℃
で一畳夜培養した。その結果、合計608個のコロニー
が生じたこれらのコロニーのうち54個を鈎菌し、し−
グロスで培養後、プラスミドを抽出し、制限酵素Bam
H Iで分解した。その結果、24株がAP−T遺伝子
の上流のPstlから開始コドンまでの178bρに相
当する長さのデリーションが起っていることが判明した
。そのうちいくつかの株についてプラスミドを抽出し、
実施例8に述べたと同様にダイオキシーシークエンシン
グにより塩基配列を決定した。その結果、それらのプラ
スミドがAP−T遺伝子のうちの開始コドンのG T
a 7!l< A T aに変異し、tacプロモータ
ーのEcoR Iサイトに直結していることが明らかと
なった(第5図)。このうちの1株を選び出し、そのプ
ラスミドをpKL4と命名した(第5図)。
の配列の相補鎖に相当する配列(ただし、開始コドンの
GTGをATGに変更してある。)をもつ36−mar
の変異用のオリゴヌクレオチド( 5 ’−T TCC
GTGAAGGCGTCCATGAATTCTGTTT
CCTGTGT−3’)及び第4−2図中のAP−T遺
伝子の塩基配列中1476番目〜1492番目の塩基配
列の梠補鎮に相当する配列をもつ17−marのオリゴ
ヌクレオチド( 5 ’−T A T T C G C
A CACAAAAGCAC−3’)を合成した。こ
の36−nerの変異用オリゴヌクレオチドの5′末端
のOH基はT4ボリヌクレオチドキナーゼとATPによ
りリン酸化した.以上の2つのオリゴヌクレオチドをと
ころどころウラシルを含むpE13の一木鎖DNAに次
のようにしてアニールした。一末娘DNA2μ1 (0
.5pmoi+)を、5′一をリン酸化した変異用36
−marのオリゴヌクレオチド1 μ!! (10pm
oj))及び17−merのオリゴヌクレオチド1 μ
j! (10pmof’)と混ぜ、IOXのバッフy−
A (0.2M Tris−HCil, 0.1MMg
CRz. 0.5M NaCR. 10mM D
T T (pH7.5)) 1 ttl!を加え、さ
らに水を4μ!加えて合計10μρとする.55℃で5
分問おいたのち、室温で5分おき、これに25μ2のE
xtensionバッファ−(宝酒造製、ミュータンK
キット),xμpのA T P ( 6 mg/mj!
)を加え、ざらにT4リガーゼ1μp ( 6 uni
t)とκlenowフラグメント1 uR(2.5un
it) を加えた。lO℃±2℃で20時問おいたのち
、0.2MEDTA3μpを加え、65℃で5分間加熱
した.この混合液を実施例4と同様に調製したE. c
oliIAVll84のコンビテントセル溶液100μ
gに全量加えた.O℃中に30分静置後、42℃で30
秒加温し、次に1 mRのし一ブロスを加え、1時間振
どう培養した.次に、この培養液をLB寒天培地(1%
バクトトリブトン,0.5%バクトイーストエクストラ
クト.O、5%NaCIl, pH7.0、15oμg
/mjアンピシリン入り)6枚に分けて接種し、37℃
で一畳夜培養した。その結果、合計608個のコロニー
が生じたこれらのコロニーのうち54個を鈎菌し、し−
グロスで培養後、プラスミドを抽出し、制限酵素Bam
H Iで分解した。その結果、24株がAP−T遺伝子
の上流のPstlから開始コドンまでの178bρに相
当する長さのデリーションが起っていることが判明した
。そのうちいくつかの株についてプラスミドを抽出し、
実施例8に述べたと同様にダイオキシーシークエンシン
グにより塩基配列を決定した。その結果、それらのプラ
スミドがAP−T遺伝子のうちの開始コドンのG T
a 7!l< A T aに変異し、tacプロモータ
ーのEcoR Iサイトに直結していることが明らかと
なった(第5図)。このうちの1株を選び出し、そのプ
ラスミドをpKL4と命名した(第5図)。
実施例11 AP−T遺伝子を組込んだpKL4によ
る大腸菌でのAP−Tの大量生産 プラスミドpKL4をもつ大腸菌E.. coli M
V1184株を10mjのし一ブロス( 50μg/m
f!アンビシリン)に入れ、37℃にて一畳夜振どう培
養した。これをlmj!とり、if)OwRのし−ブロ
ス( soμg/mRアンビシリン入り)に接種、十分
振とうしながら37℃で培養した。菌が生育して550
r+mにおける吸光度が0.1のときに、I PTGを
1 mMになるように加えた。さらに、16時間培養後
、遠心分離により菌体を回収した。回収した菌体を50
mM Tris−}ICj)(pH8.5)で懸濁し、
合計51となるようにした。
る大腸菌でのAP−Tの大量生産 プラスミドpKL4をもつ大腸菌E.. coli M
V1184株を10mjのし一ブロス( 50μg/m
f!アンビシリン)に入れ、37℃にて一畳夜振どう培
養した。これをlmj!とり、if)OwRのし−ブロ
ス( soμg/mRアンビシリン入り)に接種、十分
振とうしながら37℃で培養した。菌が生育して550
r+mにおける吸光度が0.1のときに、I PTGを
1 mMになるように加えた。さらに、16時間培養後
、遠心分離により菌体を回収した。回収した菌体を50
mM Tris−}ICj)(pH8.5)で懸濁し、
合計51となるようにした。
これを超音波破砕装置で十分菌体が破砕されるまで処理
し、次に70℃のウォーターバスで70℃にて30分加
熱した.加熱後、遠心分離(15000rpm) L/
て上澄液を得た。全く同様の過程でI+AT15Gある
いはpE13をもつ大腸菌についても試験した。それぞ
れのAP−T活性を示したのが表3である.活性の測定
は皆川らの方法[Minagawa, E. et a
l. Agric.Biol. Chem. 52.
1755−1763(1988)]に従った。
し、次に70℃のウォーターバスで70℃にて30分加
熱した.加熱後、遠心分離(15000rpm) L/
て上澄液を得た。全く同様の過程でI+AT15Gある
いはpE13をもつ大腸菌についても試験した。それぞ
れのAP−T活性を示したのが表3である.活性の測定
は皆川らの方法[Minagawa, E. et a
l. Agric.Biol. Chem. 52.
1755−1763(1988)]に従った。
pKL4をもつ大腸菌では、上澄液に1500007+
i)以上のAP−Tの活性があることが示された。
i)以上のAP−Tの活性があることが示された。
表3 大腸菌によるAP−Tの生産例
pAT15G B6.52
16.93pE13
37.08 6.45p
κし4 15925.86
2911.49l)ロイシン−4−ニト
ロアニリドを基質として、70℃における活性、1ユニ
ットは1分間に1マククロモルのニトロアニリンが遊離
する酵素量と定義. 2)加熱処理後の上澄液m1当り 3)タンパク貿m8当りの比活性 実施例12SOS−ポリアクリルアミド電気株勅による
生産されたAP−Tの確認 実施例11で示したように、AP−T遺伝子をもつプラ
スミドpKL4を用いて大腸菌で生産させたAP−ψビ
ムリーの方法[Laem+nli, u.κ., Na
ture(London]227, 680−685.
(1970)] で、SDS−ポリアクリルアミド電
気泳勤により確記した.上澄液各5μρをレムリ一の方
法に従って各レーンにロードした.濃縮ゲルは6%アク
リルアミド,2.7%N,N’−ビスメチレンアクリル
アミド, 0.125 MTris−HCR(pH6.
8). 0.1%SDSであった。分藺ゲルは10%ア
クリルアミド,2.7%N,N’−ビスメチレンアクリ
ルアミド, OJ75 M Tris−HCj(pH
8.8) , 0.1%SDSであった.分子量を比較
するために、分子量マーカータンバク質としてリボヌク
レアーゼA (13,700),キモトリプシノーゲン
A <25,000),オボアルブミン(43,000
)および牛血清アルブミン(67,000)の混合物を
用いた。結果を第6図に示す。なお、第6図の各レーン
の説明は次のとおりである。
16.93pE13
37.08 6.45p
κし4 15925.86
2911.49l)ロイシン−4−ニト
ロアニリドを基質として、70℃における活性、1ユニ
ットは1分間に1マククロモルのニトロアニリンが遊離
する酵素量と定義. 2)加熱処理後の上澄液m1当り 3)タンパク貿m8当りの比活性 実施例12SOS−ポリアクリルアミド電気株勅による
生産されたAP−Tの確認 実施例11で示したように、AP−T遺伝子をもつプラ
スミドpKL4を用いて大腸菌で生産させたAP−ψビ
ムリーの方法[Laem+nli, u.κ., Na
ture(London]227, 680−685.
(1970)] で、SDS−ポリアクリルアミド電
気泳勤により確記した.上澄液各5μρをレムリ一の方
法に従って各レーンにロードした.濃縮ゲルは6%アク
リルアミド,2.7%N,N’−ビスメチレンアクリル
アミド, 0.125 MTris−HCR(pH6.
8). 0.1%SDSであった。分藺ゲルは10%ア
クリルアミド,2.7%N,N’−ビスメチレンアクリ
ルアミド, OJ75 M Tris−HCj(pH
8.8) , 0.1%SDSであった.分子量を比較
するために、分子量マーカータンバク質としてリボヌク
レアーゼA (13,700),キモトリプシノーゲン
A <25,000),オボアルブミン(43,000
)および牛血清アルブミン(67,000)の混合物を
用いた。結果を第6図に示す。なお、第6図の各レーン
の説明は次のとおりである。
レーン 試 料
1 pEXP7をもつ犬腸菌菌体
2 pK14をもつ大腸菌菌体(IPTGで話導し
ていないもの) 3 pKL4をもつ大腸菌菌体(I PTGで誘導
したもの) 4 pKL4をもつ大陽菌菌体の超音波破砕抽出物
(I PTGで話導、加熱処理せず)5 pKL4
をもつ大腸菌菌体の超音波破砕後、70℃で30分加熱
処理した抽出物 (I PTGで誘導) 6 レーン5と同様、ただし80℃、30分加熱処理 7 レーン5と同様なサンプルを逆相系HPHCで精
製し、活性を確認した画分 mは分子量マーカーを示す。
ていないもの) 3 pKL4をもつ大腸菌菌体(I PTGで誘導
したもの) 4 pKL4をもつ大陽菌菌体の超音波破砕抽出物
(I PTGで話導、加熱処理せず)5 pKL4
をもつ大腸菌菌体の超音波破砕後、70℃で30分加熱
処理した抽出物 (I PTGで誘導) 6 レーン5と同様、ただし80℃、30分加熱処理 7 レーン5と同様なサンプルを逆相系HPHCで精
製し、活性を確認した画分 mは分子量マーカーを示す。
第6図から明らかなように、pKL4をI PTGで誘
導した大腸菌は約43000の分子量のところにAP−
Tと考えられる新しいタンパクが出現していた.これは
加熱しても変性せずに上澄液に残ることが明らかとなっ
た。またHPLCで精製したこの画分は耐熱性のアミノ
ベブチダーゼ活性をもつことが確認された.このように
pKL4をもった大腸菌でAP−Tを生産した場合、菌
体破砕物を加熱し、遠心するだけで、極めて効率良<A
P一丁を精製できることが明らかとなフた。
導した大腸菌は約43000の分子量のところにAP−
Tと考えられる新しいタンパクが出現していた.これは
加熱しても変性せずに上澄液に残ることが明らかとなっ
た。またHPLCで精製したこの画分は耐熱性のアミノ
ベブチダーゼ活性をもつことが確認された.このように
pKL4をもった大腸菌でAP−Tを生産した場合、菌
体破砕物を加熱し、遠心するだけで、極めて効率良<A
P一丁を精製できることが明らかとなフた。
[発明の効果]
本発明によって、サーマス属に属するサーマス・アクア
ティカスYT−1が有する極めて耐熱性の強いアミノペ
プチダーゼをコードする遺伝子の配列及びそのアミノ酸
配列が明らかとなった.また、遺伝子工学的に耐熱性ア
ミノベブチダーゼを大量に生産する製造方法を提供した
.本発明により、サーマス属の菌体から精製するよりも
極めて経済的に天然のものと同等の耐熱性を有するアミ
ノベプチダーゼを生産することが可能となった.
ティカスYT−1が有する極めて耐熱性の強いアミノペ
プチダーゼをコードする遺伝子の配列及びそのアミノ酸
配列が明らかとなった.また、遺伝子工学的に耐熱性ア
ミノベブチダーゼを大量に生産する製造方法を提供した
.本発明により、サーマス属の菌体から精製するよりも
極めて経済的に天然のものと同等の耐熱性を有するアミ
ノベプチダーゼを生産することが可能となった.
第1図は、本発明の耐熱性アミノペプチダーゼであるA
P−TのN一末端部分のアミノ酸配列と、合成したオリ
ゴヌクレオチドプローブの配列を示す。 第2図は、プラスミドpAT15AとpAT15Gの制
限酵素地図を示す。AP−T遺伝子の位置は黒い矢印で
示してある。 第3図は、AP−T遺伝子の塩基配列決定のための戦略
を示す。白ヌキの矢印はAP−T遺伝子を示す。 黒丸のついた矢印はユニバーサルシークエンシングプラ
イマーを用いて塩基配列を決定した方向と領域を示す。 白丸のついた矢印は合成オリゴヌクレオチドをシークエ
ンシングブライマーとして用いて塩基配列を決定した領
域と方向を示す.GTGは開始コドン,TAAは終止コ
ドンを示す, Hiは旧ndlll, Spは sp
hr . Kpは κpnl.XhはXhoI , S
mはSma iサイトを示す。 第4−1図〜第4−2図は、塩基配列を決定した全塩基
配列と、^P−Tをコードする部分の推定されるアミノ
酸配列を示す。アミノ酸配列部分の下線は、精製AP−
Tの化学的分析でも確認された配列を示す。***は終
止コドンを示す。一一はターミネーターと考えられるイ
ンバーテッド リピートを示す。 第5図は、AP−Tを大腸菌で大量発現するためのプラ
スミドpKL4の構築方法を示す。PtacはpKκ2
23−3由来のtacプロモーター, rrnBTtT
zはpKκ223−3由来のターミネーターを示す.H
iはHindlll , Spは Sphl , Sm
は Smal,Kpは κpnI,Xhは Xhol
, EcはEcoRI , BaはDam}II
, SaはSacl . Psは PstIサイトを
示す。S/Dはtacプロモーターのシャイン ダルガ
口 (ShineDalgaro)配列を示す. 第6図は、pKL4をもつ大腸菌菌体抽出液のSDS−
ポリアクリルアミド電気泳動の結果を示す。 各レーンの試料は次のとおりである. レーン 試 料 pEXP7をもつ大腸菌 pKL4をもつ大膓菌菌体(I PTGで誘導していな
いもの) pKL4をもつ大腸菌菌体(I PTG”C銹導したも
の) pKL4をもつ大腸菌菌体の超音波破砕抽出物(I P
TOで誘導、加熱処理せず)pKL4をもつ大腸菌菌体
の超音波破砕後、70℃で30分加熱処理した抽出物 (I PTGで話導) レーン5と同様、ただし80℃で30分加熱処理 レーン5と同様なサンプルを逆相系HPLCで精製し、
活性を確認した画分 分子量マーカー 特許出願人 よつ葉乳業株式会社 代 理 人 弁理士 久保田 藤 郎第4−1図 第4−2図 ■ 手続補正書動劃 平成1年6月7 日
P−TのN一末端部分のアミノ酸配列と、合成したオリ
ゴヌクレオチドプローブの配列を示す。 第2図は、プラスミドpAT15AとpAT15Gの制
限酵素地図を示す。AP−T遺伝子の位置は黒い矢印で
示してある。 第3図は、AP−T遺伝子の塩基配列決定のための戦略
を示す。白ヌキの矢印はAP−T遺伝子を示す。 黒丸のついた矢印はユニバーサルシークエンシングプラ
イマーを用いて塩基配列を決定した方向と領域を示す。 白丸のついた矢印は合成オリゴヌクレオチドをシークエ
ンシングブライマーとして用いて塩基配列を決定した領
域と方向を示す.GTGは開始コドン,TAAは終止コ
ドンを示す, Hiは旧ndlll, Spは sp
hr . Kpは κpnl.XhはXhoI , S
mはSma iサイトを示す。 第4−1図〜第4−2図は、塩基配列を決定した全塩基
配列と、^P−Tをコードする部分の推定されるアミノ
酸配列を示す。アミノ酸配列部分の下線は、精製AP−
Tの化学的分析でも確認された配列を示す。***は終
止コドンを示す。一一はターミネーターと考えられるイ
ンバーテッド リピートを示す。 第5図は、AP−Tを大腸菌で大量発現するためのプラ
スミドpKL4の構築方法を示す。PtacはpKκ2
23−3由来のtacプロモーター, rrnBTtT
zはpKκ223−3由来のターミネーターを示す.H
iはHindlll , Spは Sphl , Sm
は Smal,Kpは κpnI,Xhは Xhol
, EcはEcoRI , BaはDam}II
, SaはSacl . Psは PstIサイトを
示す。S/Dはtacプロモーターのシャイン ダルガ
口 (ShineDalgaro)配列を示す. 第6図は、pKL4をもつ大腸菌菌体抽出液のSDS−
ポリアクリルアミド電気泳動の結果を示す。 各レーンの試料は次のとおりである. レーン 試 料 pEXP7をもつ大腸菌 pKL4をもつ大膓菌菌体(I PTGで誘導していな
いもの) pKL4をもつ大腸菌菌体(I PTG”C銹導したも
の) pKL4をもつ大腸菌菌体の超音波破砕抽出物(I P
TOで誘導、加熱処理せず)pKL4をもつ大腸菌菌体
の超音波破砕後、70℃で30分加熱処理した抽出物 (I PTGで話導) レーン5と同様、ただし80℃で30分加熱処理 レーン5と同様なサンプルを逆相系HPLCで精製し、
活性を確認した画分 分子量マーカー 特許出願人 よつ葉乳業株式会社 代 理 人 弁理士 久保田 藤 郎第4−1図 第4−2図 ■ 手続補正書動劃 平成1年6月7 日
Claims (8)
- (1)高度好熱性細菌サーマス属由来の耐熱性を有する
アミノペプチダーゼをコードしているDNA配列。 - (2)DNAが下記のアミノ酸配列またはそれと実質的
に同一の機能を有するアミノ酸配列をコードするもので
ある請求項1記載のDNA配列。 【遺伝子配列があります。】 - (3)DNAが下記の塩基配列中、第177番目から第
1400番目に相当する塩基配列またはそれと実質的に
同一の機能をもつ塩基配列を有するものである請求項1
記載のDNA配列。 【遺伝子配列があります。】 - (4)請求項3記載のDNAのうち開始コドンであるG
TG(請求項3記載の塩基配列のうち177番目から1
79番目に対応)をATGに変更した塩基配列を有する
請求項3記載のDNA配列。 - (5)DNAが請求項2記載のアミノ酸配列またはそれ
と実質的に同一の機能を有するアミノ酸配列をコードし
、かつその上流にプロモーター、その下流にターミネー
ターを有する請求項1記載のDNA配列。 - (6)請求項2記載のDNA配列を含むプラスミド。
- (7)請求項3記載のDNA配列を含むプラスミド。
- (8)請求項4記載のDNA配列を含むプラスミド。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP5187789A JPH02231086A (ja) | 1989-03-06 | 1989-03-06 | 耐熱性アミノペプチダーゼをコードする遺伝子及びそれを含むプラスミド |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP5187789A JPH02231086A (ja) | 1989-03-06 | 1989-03-06 | 耐熱性アミノペプチダーゼをコードする遺伝子及びそれを含むプラスミド |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH02231086A true JPH02231086A (ja) | 1990-09-13 |
Family
ID=12899111
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP5187789A Pending JPH02231086A (ja) | 1989-03-06 | 1989-03-06 | 耐熱性アミノペプチダーゼをコードする遺伝子及びそれを含むプラスミド |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPH02231086A (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1998027827A1 (en) * | 1996-12-23 | 1998-07-02 | Dsm N.V. | Method for producing a protein hydrolysate |
US6297039B1 (en) * | 1997-09-18 | 2001-10-02 | Smithkline Beecham Corporation | Amps from Streptococcus pneumoniae |
US6855899B2 (en) | 2003-01-07 | 2005-02-15 | Pentax Corporation | Push button device having an illuminator |
-
1989
- 1989-03-06 JP JP5187789A patent/JPH02231086A/ja active Pending
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1998027827A1 (en) * | 1996-12-23 | 1998-07-02 | Dsm N.V. | Method for producing a protein hydrolysate |
US6297039B1 (en) * | 1997-09-18 | 2001-10-02 | Smithkline Beecham Corporation | Amps from Streptococcus pneumoniae |
US6855899B2 (en) | 2003-01-07 | 2005-02-15 | Pentax Corporation | Push button device having an illuminator |
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