JPH0220298A - アルツハイマー病の診断 - Google Patents
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
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Description
【発明の詳細な説明】
本発明は、ヒト患者におけるアルツハイマー病(Alz
heimer Disease)の診断に関する。本
発明、さらに、この病気を発生する症候前の(p r
e s ymp t oma t i c)個体の素因
を評価することにに関する。さらに詳しくは、本発明は
、アルツハイマー病に関係する遺伝子の変更を検出する
核酸プローブに関する。
heimer Disease)の診断に関する。本
発明、さらに、この病気を発生する症候前の(p r
e s ymp t oma t i c)個体の素因
を評価することにに関する。さらに詳しくは、本発明は
、アルツハイマー病に関係する遺伝子の変更を検出する
核酸プローブに関する。
アルツハイマー病は、特異的神経学的病変によって特徴
づけられる、中枢神経系の漸進的退化性の病気である。
づけられる、中枢神経系の漸進的退化性の病気である。
多くの神経の細胞質は、神経細線維のもつれ(N F
T)の蓄積を含有し、これは対になった螺旋状フィラメ
ント(PIF)から構成されている。神経細線維のもつ
れは、アミロイドのプラクのコア(plaque c
ores)中の細胞外凝集体およびコンゴフィリック(
c o n gophilic)血管障害の脳血管の病
変において見いだされるアミロイドと構造的に異なるタ
ンバク質を含有する。同様なアミロイドの病変は、この
ような病理学的状態において、ダウン症候群、ゲルスト
マンーストレウスラーーシェイン力=(Gerstma
nn−3traeussler−3cheinker)
症候群、クール−において、およびタレウラフェルト−
ジャコブ(Cre、utzfeldt−Jakob)病
をもつ患者の大部分において起こる。
T)の蓄積を含有し、これは対になった螺旋状フィラメ
ント(PIF)から構成されている。神経細線維のもつ
れは、アミロイドのプラクのコア(plaque c
ores)中の細胞外凝集体およびコンゴフィリック(
c o n gophilic)血管障害の脳血管の病
変において見いだされるアミロイドと構造的に異なるタ
ンバク質を含有する。同様なアミロイドの病変は、この
ような病理学的状態において、ダウン症候群、ゲルスト
マンーストレウスラーーシェイン力=(Gerstma
nn−3traeussler−3cheinker)
症候群、クール−において、およびタレウラフェルト−
ジャコブ(Cre、utzfeldt−Jakob)病
をもつ患者の大部分において起こる。
遺伝子の成分は、4世代の1oÅ以上の構成員が70オ
前にアルツハイマー病の痴呆を発生した、家系図の大規
模な研究によって示される。このような場合において、
異常な遺伝子は常染色体優性として伝えられるように思
われる。アルツハイマー病のほとんどの場合は80才を
越える人々において起こり、そして85才を越えるコー
カーサス人の305まではこの病気を有すると計算され
た。
前にアルツハイマー病の痴呆を発生した、家系図の大規
模な研究によって示される。このような場合において、
異常な遺伝子は常染色体優性として伝えられるように思
われる。アルツハイマー病のほとんどの場合は80才を
越える人々において起こり、そして85才を越えるコー
カーサス人の305まではこの病気を有すると計算され
た。
アルツハイマー病は現在米国において2百万人の老人に
影響を及ぼしていると推定される。この疾患は通常遅く
開始するので、影響を受けた個体の数は老人の人口の数
が増加するにつれて大きくなり続ける。米国において6
5才を越える人の数は現在25xlO’人以−Fであり
、そしてこの数は2025年までに2倍を越えるであろ
う。
影響を及ぼしていると推定される。この疾患は通常遅く
開始するので、影響を受けた個体の数は老人の人口の数
が増加するにつれて大きくなり続ける。米国において6
5才を越える人の数は現在25xlO’人以−Fであり
、そしてこの数は2025年までに2倍を越えるであろ
う。
アルツハイマー病の患者の大脳皮質における主な生化学
的症候の1つは、アイイドのプラクのコア(A P C
)タンパク質として知られているタンパク質のプラクお
よび血管の蓄積の出現である。
的症候の1つは、アイイドのプラクのコア(A P C
)タンパク質として知られているタンパク質のプラクお
よび血管の蓄積の出現である。
このタンパク質は、相対的分子量4,500の不溶性の
高度に凝集性の小さいポリペプチドである。
高度に凝集性の小さいポリペプチドである。
APCは40〜42アミノ酸を有すると理解されてきて
おり、そして現在長さ40アミノ酸であると信じられて
いる。このポリペプチドは、また、トリソミーをもつ比
較的平をとった個体の脳中に析出する(ダウン症候群)
。カング(K a n g)ら、ネイチャー(Natu
re)、325.731−736.1987は、アイイ
ドタンパク質が神経由来であり、そしてより大きい前駆
体タンパク質の一部分であることを提案している。この
前駆体を同定するために、APCタンパク質の遺伝情報
を指定する全長の相補的DNAクローンを分離し、そし
て配列決定した。推定された前駆体は、695残基から
成り、そしてグリコジル化細胞表面受容体に特徴的な面
を含有する。このcDNA配列は、染色体21中のその
遺伝子の局在化と緒に、アルツハイマー病および老年の
ダウン症候群において蓄積した脳アミロイドは、細胞表
面の受容体の異常な異化によって、あるいはそのmRN
Aの異常な合成または処理によって引き起こされる。脳
における遺伝子の発現のパターンを決定するために、A
PCのcDNAをマウスの神経系の組織区画に交雑させ
た。アミロイド前駆体タンパク質mRNAは、中枢神経
系および末梢神経系において検出された。
おり、そして現在長さ40アミノ酸であると信じられて
いる。このポリペプチドは、また、トリソミーをもつ比
較的平をとった個体の脳中に析出する(ダウン症候群)
。カング(K a n g)ら、ネイチャー(Natu
re)、325.731−736.1987は、アイイ
ドタンパク質が神経由来であり、そしてより大きい前駆
体タンパク質の一部分であることを提案している。この
前駆体を同定するために、APCタンパク質の遺伝情報
を指定する全長の相補的DNAクローンを分離し、そし
て配列決定した。推定された前駆体は、695残基から
成り、そしてグリコジル化細胞表面受容体に特徴的な面
を含有する。このcDNA配列は、染色体21中のその
遺伝子の局在化と緒に、アルツハイマー病および老年の
ダウン症候群において蓄積した脳アミロイドは、細胞表
面の受容体の異常な異化によって、あるいはそのmRN
Aの異常な合成または処理によって引き起こされる。脳
における遺伝子の発現のパターンを決定するために、A
PCのcDNAをマウスの神経系の組織区画に交雑させ
た。アミロイド前駆体タンパク質mRNAは、中枢神経
系および末梢神経系において検出された。
アルツハイマー病の早期のかつ正確な診断のための手段
は、痴呆の研究の進歩に大きい衝撃を有するであろう。
は、痴呆の研究の進歩に大きい衝撃を有するであろう。
アルツハイマー病のための末梢の生化学的マーカーは発
見されてきていないので、この疾患の明確な診断は、組
織学的確証が脳のバイオプシーまたは剖検の実施によっ
て得られる場合にのみ、可能となる。アルツハイマー病
は本質的に処置不可能であるという事実にかかわらず、
アルツハイマー病の症候をもつ個体が実際にこの病気を
有する否かを知ることは有意な価値がであるであろう。
見されてきていないので、この疾患の明確な診断は、組
織学的確証が脳のバイオプシーまたは剖検の実施によっ
て得られる場合にのみ、可能となる。アルツハイマー病
は本質的に処置不可能であるという事実にかかわらず、
アルツハイマー病の症候をもつ個体が実際にこの病気を
有する否かを知ることは有意な価値がであるであろう。
ある数の処置可能な状態は、アルツハイマー病をもつ患
者において見いだされるものに類似する症候によって特
徴づけられる。このような処置可能な状態は、脳腫瘍、
甲状腺および他の内分泌の機能障害、ψ病、感染、ビタ
ミンおよび有機物の欠乏、代謝疾患、認識されない損傷
、および投薬の副作用である。医学的文献は、医師に、
完全な検査、医学的履歴を実施し、そして処置不可能な
アルツハイマー病の状態を診断する前に可逆的な疾患を
除外するための試験をすすめている。
者において見いだされるものに類似する症候によって特
徴づけられる。このような処置可能な状態は、脳腫瘍、
甲状腺および他の内分泌の機能障害、ψ病、感染、ビタ
ミンおよび有機物の欠乏、代謝疾患、認識されない損傷
、および投薬の副作用である。医学的文献は、医師に、
完全な検査、医学的履歴を実施し、そして処置不可能な
アルツハイマー病の状態を診断する前に可逆的な疾患を
除外するための試験をすすめている。
本発明は、このような個体における正常DNAまたはm
RNAにおける変更の存在の決定に基づいて、症候をも
つ個体におけるアルツハイマー病を診断し、あるいは症
候前の個体におけるこの病気を発生する素因を評価する
方法を提供する。問題の遺伝子部域は、preAPc遺
伝子のAPC解読配列の末端において、あるいは対応す
るm RNAの正常配列において、現れる24塩基対の
配列である。核酸交雑技術を使用して、このような24
塩基の配列における変更の存在または特異的変更の存在
は検出可能であり、そしてアルツハイマー病の診断を促
進する。
RNAにおける変更の存在の決定に基づいて、症候をも
つ個体におけるアルツハイマー病を診断し、あるいは症
候前の個体におけるこの病気を発生する素因を評価する
方法を提供する。問題の遺伝子部域は、preAPc遺
伝子のAPC解読配列の末端において、あるいは対応す
るm RNAの正常配列において、現れる24塩基対の
配列である。核酸交雑技術を使用して、このような24
塩基の配列における変更の存在または特異的変更の存在
は検出可能であり、そしてアルツハイマー病の診断を促
進する。
本発明によれば、アルツハイマー病に関係があるAPC
タンパク質の産生は、ペプチドのカルボキシ末端をエン
コードする遺伝子の部域における突然変異の結果である
。その部域におけるフレームシフト突然変異は、pre
APC遺伝子におけるAPCタンパク質解読部域の末端
に隣接して、2つの翻訳停止シグナルを導入こととして
見られる。さらに、強い翻訳開始部位はAPCタンパク
質解読配列の直前の遺伝子の部域に見られるので、密接
に隣接したフレームシフトの導入はAPCタンパク質対
応する前駆体タンパク質のちょうどその部域の反復した
翻訳を生ずる。これはアルツハイマー病で侵された患者
におけるAPCタンパク質の過剰産生を説明するであろ
う。
タンパク質の産生は、ペプチドのカルボキシ末端をエン
コードする遺伝子の部域における突然変異の結果である
。その部域におけるフレームシフト突然変異は、pre
APC遺伝子におけるAPCタンパク質解読部域の末端
に隣接して、2つの翻訳停止シグナルを導入こととして
見られる。さらに、強い翻訳開始部位はAPCタンパク
質解読配列の直前の遺伝子の部域に見られるので、密接
に隣接したフレームシフトの導入はAPCタンパク質対
応する前駆体タンパク質のちょうどその部域の反復した
翻訳を生ずる。これはアルツハイマー病で侵された患者
におけるAPCタンパク質の過剰産生を説明するであろ
う。
preAPC遺伝子の既知の配列から、正常配列は、変
更された場合、フレームシフト突然変異を導入し、次の
24塩基の配列・ 5’ GGCGGT GTT GTCATAGC
G ACA GTQ 3’ を有意なりNA−末鎖として(以後正常センス配列と呼
ぶ)を構成し、そして 5” CACTGT CGCTAT GACAAC
ACCGCC3’ をアンチセンスストランド(以後正常アンチエセンス配
列と呼ぶ)を構成する。相補的mRNA配列は、5’
GGCGGU GUU GUCAUA GC
G ACA GUQ 3’ であり、以後正常相
補的RNA配列と呼ぶ。これらの正常なりNAおよびR
NA配列のいずれかの配列における変更の検出を可能と
する交雑技術は、本発明に適用可能である。
更された場合、フレームシフト突然変異を導入し、次の
24塩基の配列・ 5’ GGCGGT GTT GTCATAGC
G ACA GTQ 3’ を有意なりNA−末鎖として(以後正常センス配列と呼
ぶ)を構成し、そして 5” CACTGT CGCTAT GACAAC
ACCGCC3’ をアンチセンスストランド(以後正常アンチエセンス配
列と呼ぶ)を構成する。相補的mRNA配列は、5’
GGCGGU GUU GUCAUA GC
G ACA GUQ 3’ であり、以後正常相
補的RNA配列と呼ぶ。これらの正常なりNAおよびR
NA配列のいずれかの配列における変更の検出を可能と
する交雑技術は、本発明に適用可能である。
第1図は、APCタンパク質の遺伝情報を指定する部域
を包含するpreAPC遺伝子配列の一部分を示す。以
後の記載は、このような解読配列の末端における24塩
基の配列中のフレームシフト突然変異の翻訳効果を説明
する。
を包含するpreAPC遺伝子配列の一部分を示す。以
後の記載は、このような解読配列の末端における24塩
基の配列中のフレームシフト突然変異の翻訳効果を説明
する。
第2図は、APCタンパク質のための解読配列の直後の
停止コドンを発生させる+1および一2フレームシフト
を示す。
停止コドンを発生させる+1および一2フレームシフト
を示す。
preAPCcDNAのクローンのDNA配列の分析[
カンノ(K a n g)ら、ネイチャー(Natur
e)、325.733−736.1987]、および突
然変異した薬物抵抗性遺伝子でトランスフェクションし
た細胞におけるタンパク質合成の研究からの情報[トマ
ス(Thomas)およびカペッチ(Capecchi
)、ネイチャー (Nature)、324.34−3
8.1986]に基づいて、本発明はpreAPCmR
NAからのAPCタンパク質の合成を、遺伝子のAPC
解読部分におけるフレームシフト突然変異として見る。
カンノ(K a n g)ら、ネイチャー(Natur
e)、325.733−736.1987]、および突
然変異した薬物抵抗性遺伝子でトランスフェクションし
た細胞におけるタンパク質合成の研究からの情報[トマ
ス(Thomas)およびカペッチ(Capecchi
)、ネイチャー (Nature)、324.34−3
8.1986]に基づいて、本発明はpreAPCmR
NAからのAPCタンパク質の合成を、遺伝子のAPC
解読部分におけるフレームシフト突然変異として見る。
このフレームシフトは、オリゴヌクレオチドのプローブ
によって検出可能であり、アルツハイマー病についての
症候の前および後の診断試験を提供する。
によって検出可能であり、アルツハイマー病についての
症候の前および後の診断試験を提供する。
ペプチドのカルボキシ末端をエンコードする遺伝子の部
域における突然変異は、APCタンパク質を産生させる
であろう。その部域における−1または+2のフレーム
シフトは、APCタンパク質の末端に対してちょうど3
′に2つの翻訳停止シグナルを導入する。第1図は、2
つの停止コドンがこのような突然変異の結果導入される
方法を明らかにする。各対の上の線は、メツセンジャR
NAにおける三文字コドンであり、そして下の線はアミ
ノ酸配列である。Asp番号1はAPCタンパク質の第
1アミノ酸であり、そしてVa1番号40は現在APC
の最後のアミノ酸と考えられる。preAPCmRNA
からのAPCの産生は、APC解読部域の末端またはそ
の付近において、翻訳停止コドンをpreAPCリーデ
ィングフレーム中に動かすという作用を有する、小さい
欠失または挿入突然変異を含む。APCの合成における
翻訳の潜在的ターミネータ−である、2つのフレーム外
の停止コドンは、下線をほどこしよびUGAをリーディ
ングフレームに入れる単の塩基の欠失の可能な部位は、
下のケース(case)の文字aおよびbで示されてい
る;同一の作用を有する2つの塩基の挿入の可能な部位
は、下のケースの文字すで示されている。第2図は、p
reAPCmRNA中に早熟停止コドンを導入する、第
1図に示す、a、bおよびCに相当する、特異的フレー
ムシフト突然変異を示す。
域における突然変異は、APCタンパク質を産生させる
であろう。その部域における−1または+2のフレーム
シフトは、APCタンパク質の末端に対してちょうど3
′に2つの翻訳停止シグナルを導入する。第1図は、2
つの停止コドンがこのような突然変異の結果導入される
方法を明らかにする。各対の上の線は、メツセンジャR
NAにおける三文字コドンであり、そして下の線はアミ
ノ酸配列である。Asp番号1はAPCタンパク質の第
1アミノ酸であり、そしてVa1番号40は現在APC
の最後のアミノ酸と考えられる。preAPCmRNA
からのAPCの産生は、APC解読部域の末端またはそ
の付近において、翻訳停止コドンをpreAPCリーデ
ィングフレーム中に動かすという作用を有する、小さい
欠失または挿入突然変異を含む。APCの合成における
翻訳の潜在的ターミネータ−である、2つのフレーム外
の停止コドンは、下線をほどこしよびUGAをリーディ
ングフレームに入れる単の塩基の欠失の可能な部位は、
下のケース(case)の文字aおよびbで示されてい
る;同一の作用を有する2つの塩基の挿入の可能な部位
は、下のケースの文字すで示されている。第2図は、p
reAPCmRNA中に早熟停止コドンを導入する、第
1図に示す、a、bおよびCに相当する、特異的フレー
ムシフト突然変異を示す。
前述した状態は、APCタンパク質のC−末端に相当す
るp r eAPC遺伝子の末端におけるmRNA翻訳
の停止を説明するであろう。E、c。
るp r eAPC遺伝子の末端におけるmRNA翻訳
の停止を説明するであろう。E、c。
1iおよび培養した哺乳動物細胞の両者についての研究
[ヨハンセン(Johansen)ら、ブロシーデイン
ダス・オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サイエン
シズ(Proc、Na t l。
[ヨハンセン(Johansen)ら、ブロシーデイン
ダス・オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サイエン
シズ(Proc、Na t l。
Acad、Sci、)USA、81,76987702
.1984iリウ(L i u)ら、ネイチャ(Nat
ure)、309.82−85.1984;トマス(T
homas)およびカペッチ(Capecch i)
、ネイチャ (Nature)、324.31−38
.1986] は、翻訳停止のとき、リポソームが付近
のAUGについて前後に走査し、そしてその点における
翻訳を再開できることを示唆している。APCタンパク
質の直前に強い開始部位か存在するので(第1図)、フ
レームソフトの導入はAPCタンパク質をちょうどエン
コードする前駆体の部域の反復した翻訳を生ずる。
.1984iリウ(L i u)ら、ネイチャ(Nat
ure)、309.82−85.1984;トマス(T
homas)およびカペッチ(Capecch i)
、ネイチャ (Nature)、324.31−38
.1986] は、翻訳停止のとき、リポソームが付近
のAUGについて前後に走査し、そしてその点における
翻訳を再開できることを示唆している。APCタンパク
質の直前に強い開始部位か存在するので(第1図)、フ
レームソフトの導入はAPCタンパク質をちょうどエン
コードする前駆体の部域の反復した翻訳を生ずる。
したがって、APCのカルボキシ末端の遺伝情報を指定
するp r eAPC遺伝子配列の部分またはその付近
における−1または+2タイプのフレムシフト突然変異
の効果は、1つまたは2つにインフレーム翻訳停止シグ
ナルの導入であり、ここで一方はAPCのアミノ酸41
においてであり、そして他方はアミノ酸44においてで
あろう。これらの停止の付近におけるpreAPCmR
NAのリポソームの走査は、停止シグナルより約125
ヌクレオチドだけ上流にあるAUGを同定するであろう
。このメチオニンのAUGコドンは、アミロイドのプラ
クのコアタンパク質のN−末端アミノ酸のためのコドン
よりすぐ前に存在するトリプレットである。真核生物の
タンパク質合成は、通常、タンパク質から引き続いて除
去されるメチオニンで開始されるので、本発明は、3.
4kbのmRNAにおける大きいオープンリーディング
フレーム内からのAPC産生の「フレームシフト停止−
再開」を包含する。
するp r eAPC遺伝子配列の部分またはその付近
における−1または+2タイプのフレムシフト突然変異
の効果は、1つまたは2つにインフレーム翻訳停止シグ
ナルの導入であり、ここで一方はAPCのアミノ酸41
においてであり、そして他方はアミノ酸44においてで
あろう。これらの停止の付近におけるpreAPCmR
NAのリポソームの走査は、停止シグナルより約125
ヌクレオチドだけ上流にあるAUGを同定するであろう
。このメチオニンのAUGコドンは、アミロイドのプラ
クのコアタンパク質のN−末端アミノ酸のためのコドン
よりすぐ前に存在するトリプレットである。真核生物の
タンパク質合成は、通常、タンパク質から引き続いて除
去されるメチオニンで開始されるので、本発明は、3.
4kbのmRNAにおける大きいオープンリーディング
フレーム内からのAPC産生の「フレームシフト停止−
再開」を包含する。
さらに、Metコドンのヌクレオチド配列の関係AAG
AUG G)はコザク(Kozak)[細胞(C
el+)、44.283−292.1986]従い最も
好適な真核生物の翻訳開始部位を構成することが知られ
ており、彼は最適な関係が位置−3にAおよび位置+4
にGを有することを発見した。この状態は問題のATJ
Gにおいて満たされ、そして事実preAPC遺伝子の
開始コドンにおいて満たされない。
AUG G)はコザク(Kozak)[細胞(C
el+)、44.283−292.1986]従い最も
好適な真核生物の翻訳開始部位を構成することが知られ
ており、彼は最適な関係が位置−3にAおよび位置+4
にGを有することを発見した。この状態は問題のATJ
Gにおいて満たされ、そして事実preAPC遺伝子の
開始コドンにおいて満たされない。
前述のフレームシフト突然変異が起こると考えられるp
reAPC遺伝子の部分は、カング(Kang)ら、ネ
イチャー(Nature)、325.733−736.
1987によって発表され1ま たcDNA配列のヌクレオチド1897および1921
の間である。番号1921は一1フレームのナンセンス
トリプレットの対の下流の構成員の第3位置であり、そ
してこの点を越えた挿入または欠失は既知のAPCタン
パク質より長いポリペプチドの発現を生ずるであろう。
reAPC遺伝子の部分は、カング(Kang)ら、ネ
イチャー(Nature)、325.733−736.
1987によって発表され1ま たcDNA配列のヌクレオチド1897および1921
の間である。番号1921は一1フレームのナンセンス
トリプレットの対の下流の構成員の第3位置であり、そ
してこの点を越えた挿入または欠失は既知のAPCタン
パク質より長いポリペプチドの発現を生ずるであろう。
番号1897はAPCタンパク質のアミノ酸37の第1
位置であり、これはタンパク質配列の結果が不明瞭であ
った、6つのカルボキシ末端アミノ酸の第1である;番
号37より上流のアミノ酸配列は明瞭であり、そして正
常脳preAPCcDNA配列から逆翻訳されたアミノ
酸配列と完全に一致する。
位置であり、これはタンパク質配列の結果が不明瞭であ
った、6つのカルボキシ末端アミノ酸の第1である;番
号37より上流のアミノ酸配列は明瞭であり、そして正
常脳preAPCcDNA配列から逆翻訳されたアミノ
酸配列と完全に一致する。
したがって、診断的意味をもつpreAPC解読配列中
の変更は、グリシン37で開始しそして位置43におけ
るコドンで終わる、24塩基の配列中に現れるであろう
(参照、第1図)。正常のセンスおよびアンチセンスD
NA配列、および相補的mRNA配列の組成は、上に記
載した通りである。したがって、本発明は、正常アンチ
センスDNA配列、すなわち、 5’ CACTGT CGCTAT G
ACAACACCGCC3’ またはその正常相補的センス配列またはその正常相補的
RNA配列(翻訳されたmRNA配列)中の変更の存在
を決定する工程からなる。
の変更は、グリシン37で開始しそして位置43におけ
るコドンで終わる、24塩基の配列中に現れるであろう
(参照、第1図)。正常のセンスおよびアンチセンスD
NA配列、および相補的mRNA配列の組成は、上に記
載した通りである。したがって、本発明は、正常アンチ
センスDNA配列、すなわち、 5’ CACTGT CGCTAT G
ACAACACCGCC3’ またはその正常相補的センス配列またはその正常相補的
RNA配列(翻訳されたmRNA配列)中の変更の存在
を決定する工程からなる。
核酸交雑の分野において明らかなように、ある数の異な
るアプローチおよび方法を、問題の24塩基の配列中の
変更の決定に適用することができる。配列中の特定の突
然変異の存在または配列のいずれかの突然変異の存在を
決定する技術は、本発明に適用することができる。
るアプローチおよび方法を、問題の24塩基の配列中の
変更の決定に適用することができる。配列中の特定の突
然変異の存在または配列のいずれかの突然変異の存在を
決定する技術は、本発明に適用することができる。
APCの過剰産生の原因となる突然変異のDNAまたは
RNAの試料を単にかつ正確にスクリーニングだめの特
に好ましいアプローチは、正常の個体からのDNAと交
雑する正常preAPc遺伝子プローブが、塩基対塩基
で試料中の相補的配列と完全にアニールし、こうして、
ある種の核酸消化酵素の作用に対して不感受性であると
いう原理に基づく。他方において、試料中にpreAP
C遺伝子の突然変異のアレルが存在する場合、プローブ
は不完全に交雑し、プローブをヌクレアーゼ酵素による
検出可能な程度の消化に対して感受性とする、不一致の
塩基対を残すであろう。
RNAの試料を単にかつ正確にスクリーニングだめの特
に好ましいアプローチは、正常の個体からのDNAと交
雑する正常preAPc遺伝子プローブが、塩基対塩基
で試料中の相補的配列と完全にアニールし、こうして、
ある種の核酸消化酵素の作用に対して不感受性であると
いう原理に基づく。他方において、試料中にpreAP
C遺伝子の突然変異のアレルが存在する場合、プローブ
は不完全に交雑し、プローブをヌクレアーゼ酵素による
検出可能な程度の消化に対して感受性とする、不一致の
塩基対を残すであろう。
アルツハイマー病は優性遺伝子の作用の結果であると理
解されるので、正常アレルの存在下に突然変異したアレ
ルの存在を区別できる、分析手順を応用することが必要
である。受容的遺伝疾患の場合におけるように、使用す
る技術が存在するすべてのアレルが検出されることを保
証しない限り、正常アレルの存在について試料を分析す
ることは考えられない。したがって、一般に、突然変異
したアレルの検出に集中することが好ましい。なぜなら
、このようなアレルの存在は優性の効果かへテロ接合ま
たはホモ接合のいずれの個体においてであるかを示すか
らである。
解されるので、正常アレルの存在下に突然変異したアレ
ルの存在を区別できる、分析手順を応用することが必要
である。受容的遺伝疾患の場合におけるように、使用す
る技術が存在するすべてのアレルが検出されることを保
証しない限り、正常アレルの存在について試料を分析す
ることは考えられない。したがって、一般に、突然変異
したアレルの検出に集中することが好ましい。なぜなら
、このようなアレルの存在は優性の効果かへテロ接合ま
たはホモ接合のいずれの個体においてであるかを示すか
らである。
正常遺伝子配列中の突然変異を検出する直接のアプロー
チは、正常遺伝子配列を表す、プローブ、通常オリゴヌ
クレオチドのグローブを使用して、挿入または欠失突然
変異のために、プローブと不完全相同性である配列がD
NAまたはメツセンジャRNAの試料中に存在かどうか
決定する。このアプローチは、特定の突然変異の知識を
必要とせず、そしてまた、多数の非常に類似するプロー
ブを含むよりも感受性であろう。
チは、正常遺伝子配列を表す、プローブ、通常オリゴヌ
クレオチドのグローブを使用して、挿入または欠失突然
変異のために、プローブと不完全相同性である配列がD
NAまたはメツセンジャRNAの試料中に存在かどうか
決定する。このアプローチは、特定の突然変異の知識を
必要とせず、そしてまた、多数の非常に類似するプロー
ブを含むよりも感受性であろう。
このような方法において、患者からの試料のDNAまた
はRNAを一本鎖の形態で取り、すなわち、二本鎖DN
Aは適当にかつ普通に変性されるが、これに対してmR
NAはすでに一本鎖の形態で存在し、そして4つの配列
の1つまたは組み合わせからなるオリゴヌクレオチドの
プローブと交雑する:正常センスまたはアンチセンスD
NA配列または2つの対応するRNA配列。その後、得
られる雑種を不完全な相同性について分析する。
はRNAを一本鎖の形態で取り、すなわち、二本鎖DN
Aは適当にかつ普通に変性されるが、これに対してmR
NAはすでに一本鎖の形態で存在し、そして4つの配列
の1つまたは組み合わせからなるオリゴヌクレオチドの
プローブと交雑する:正常センスまたはアンチセンスD
NA配列または2つの対応するRNA配列。その後、得
られる雑種を不完全な相同性について分析する。
このような方法におけるプローブは、好ましくは、正常
センスまたはアンチセンスDNA配列または対応するR
NA配列の正確に24塩基の配列から成るが、約30ま
たは約50までのヌクレオチド長さであり、そして使用
すべき分析法と合致するヌクレオチド含量をもつことが
できる。逆に、プローブは交雑に選択した分析法を使用
する不完全】6 な相同性ついての精確な分析に要求されるのと同一に少
ないヌクレオチドから成ることができるが、ただし24
塩基の配列中の突然変異部域がプロービングされること
を条件とし、例えば、約10以上、好ましくは12、よ
り好ましくは17〜19以上の塩基であることができる
。不完全な相同性を遺伝性アルツハイマー病の診断の目
的に検出できる方法は、次のものを包含する= (1)
−末鎖の特異的ヌクレアーゼ、例えば、SLヌクレアー
ゼまたはヤエナリヌクレアーゼに暴露することによる標
識プローブと試料DNAとの間の雑種の分析、(2)完
全なおよび不完全なりNA雑種の示差熱溶融、(3)標
識プローブと試料DNAとの間の雑種のヌクレアーゼ分
析、および(4)問題のゲノム配列を表す核酸の直接配
列決定。
センスまたはアンチセンスDNA配列または対応するR
NA配列の正確に24塩基の配列から成るが、約30ま
たは約50までのヌクレオチド長さであり、そして使用
すべき分析法と合致するヌクレオチド含量をもつことが
できる。逆に、プローブは交雑に選択した分析法を使用
する不完全】6 な相同性ついての精確な分析に要求されるのと同一に少
ないヌクレオチドから成ることができるが、ただし24
塩基の配列中の突然変異部域がプロービングされること
を条件とし、例えば、約10以上、好ましくは12、よ
り好ましくは17〜19以上の塩基であることができる
。不完全な相同性を遺伝性アルツハイマー病の診断の目
的に検出できる方法は、次のものを包含する= (1)
−末鎖の特異的ヌクレアーゼ、例えば、SLヌクレアー
ゼまたはヤエナリヌクレアーゼに暴露することによる標
識プローブと試料DNAとの間の雑種の分析、(2)完
全なおよび不完全なりNA雑種の示差熱溶融、(3)標
識プローブと試料DNAとの間の雑種のヌクレアーゼ分
析、および(4)問題のゲノム配列を表す核酸の直接配
列決定。
アルツハイマー病についての遺伝的症候前または素因の
試験のためのDNA試料は、体の組織から得ることがで
きる。なぜなら、遺伝した突然変異はすべての細胞核中
に存在するからである。しかしながら、試料は最小の侵
略的方法、例えば、白血球DNAのために数mQの血液
の収集によって得ることが好ましいであろう。
試験のためのDNA試料は、体の組織から得ることがで
きる。なぜなら、遺伝した突然変異はすべての細胞核中
に存在するからである。しかしながら、試料は最小の侵
略的方法、例えば、白血球DNAのために数mQの血液
の収集によって得ることが好ましいであろう。
(1)核酸の分析
DNA試料中の変更したAPC配列についての最も簡単
なかつ最も感受性のアッセイは、次のものである: (
1)試料DNAを変性し、次いで末端標識正常遺伝子の
オリゴヌクレオチドのプローブと交雑させ;(ii)こ
の混合物をヌクレアーゼで処理して、交雑しなかったグ
ローブを破壊し、かつ部分的に交雑したプローブを、試
料DNAとのできるだけ少量の単一の塩基対の不一致が
存在する点において切り;次いで(iii)この混合物
を変性し、そして高い分解能のアクリルアミドゲルの電
気泳動またはHPLCにかけて標識したプローブを分析
する。
なかつ最も感受性のアッセイは、次のものである: (
1)試料DNAを変性し、次いで末端標識正常遺伝子の
オリゴヌクレオチドのプローブと交雑させ;(ii)こ
の混合物をヌクレアーゼで処理して、交雑しなかったグ
ローブを破壊し、かつ部分的に交雑したプローブを、試
料DNAとのできるだけ少量の単一の塩基対の不一致が
存在する点において切り;次いで(iii)この混合物
を変性し、そして高い分解能のアクリルアミドゲルの電
気泳動またはHPLCにかけて標識したプローブを分析
する。
完全に交雑した正常遺伝子のプローブは、ヌクレアーゼ
消化に対して不感受性であり、そして24ヌクレオチド
長さを保持するであろう;交雑しなかったプローブは酵
素によって分解し、そして標識はモノヌクレオチド中に
存在するであろう:遺伝子の突然変異体アレルに不完全
に交雑したプローブは、プローブの結合に沿って存在す
る場合でも、不一致の点において切断され、そしてこれ
は、例えば、末端標識されら要素の電気泳動の移動度の
シフトにおいて反映されるであろう。正常DNAを包含
する交雑/ヌクレアーゼ処理の放射性生成物は24マー
であるが、1つの正常遺伝子および1つのアルツハイマ
ー病のアレルをもつ個体からのDNAを包含する手順の
生成物は24マーであり、そして多少より短い長さのオ
リゴヌクレオチドは、プローブの5′標識末端と不一致
を生ずる突然変異の精確な部位との間の距離を反映する
であろう。
消化に対して不感受性であり、そして24ヌクレオチド
長さを保持するであろう;交雑しなかったプローブは酵
素によって分解し、そして標識はモノヌクレオチド中に
存在するであろう:遺伝子の突然変異体アレルに不完全
に交雑したプローブは、プローブの結合に沿って存在す
る場合でも、不一致の点において切断され、そしてこれ
は、例えば、末端標識されら要素の電気泳動の移動度の
シフトにおいて反映されるであろう。正常DNAを包含
する交雑/ヌクレアーゼ処理の放射性生成物は24マー
であるが、1つの正常遺伝子および1つのアルツハイマ
ー病のアレルをもつ個体からのDNAを包含する手順の
生成物は24マーであり、そして多少より短い長さのオ
リゴヌクレオチドは、プローブの5′標識末端と不一致
を生ずる突然変異の精確な部位との間の距離を反映する
であろう。
(2)示差的溶融(differentiamelti
ng) (1)オリゴヌクレオチドおよびゲノムDNA中の相補
的配列を包含する、完全に一致した雑種と、(ii)1
または2以上の塩基対が不適切に一致した雑種とを、(
i)および(11)が分解する温度を比較することによ
って、区別することが可能である。完全に一致した雑種
は、多少の塩基が不対であるもよりも熱安定性であり、
そしてこれは前者のより高いTm(溶融曲線の中点)に
おいて反映される。主として、アルツハイマー病のオリ
ゴヌクレオチドのプローブと正常個体からのDNAとの
間の雑種の溶融曲線は、オリゴヌクレオチドのグローブ
とアルツハイマー病のアレルを有する個体からDNAと
の間の雑種の溶融曲線と区別することができるであろう
。しかしながら、ペテロ接合体が病気を発現するという
事実は、雑種の半分が正常のプロフィルをもって溶融し
、そしてこれは示差的溶融に基づくアッセイの感度を制
限しうろことを意味する。
ng) (1)オリゴヌクレオチドおよびゲノムDNA中の相補
的配列を包含する、完全に一致した雑種と、(ii)1
または2以上の塩基対が不適切に一致した雑種とを、(
i)および(11)が分解する温度を比較することによ
って、区別することが可能である。完全に一致した雑種
は、多少の塩基が不対であるもよりも熱安定性であり、
そしてこれは前者のより高いTm(溶融曲線の中点)に
おいて反映される。主として、アルツハイマー病のオリ
ゴヌクレオチドのプローブと正常個体からのDNAとの
間の雑種の溶融曲線は、オリゴヌクレオチドのグローブ
とアルツハイマー病のアレルを有する個体からDNAと
の間の雑種の溶融曲線と区別することができるであろう
。しかしながら、ペテロ接合体が病気を発現するという
事実は、雑種の半分が正常のプロフィルをもって溶融し
、そしてこれは示差的溶融に基づくアッセイの感度を制
限しうろことを意味する。
(3)メツセンジャーRNA試料の家族の欠失(fam
ilial defect)についてのスクリーニン
グ APC産生の下に横たわる配列の変更についての探索に
おけるDNAの分析の別法は、細胞2〇− 質RNA中のpreAPCmRNAへのオリゴヌクレオ
チドのプローブの交雑である。このアプローチは、入手
容易な細胞、例えば、白血球がpreAPCmRNAを
発現することを要求する。なぜなら、RNAのために神
経物質を得ることは実際的ではないと思われるからであ
る。これに関して、p r eAPC遺伝子は多くの種
類の組織において発現され、そして脳においてはそれほ
ど発現というすぐれた証拠が存在する。preAPC遺
伝子それ自体よりも突然変異についてpreAPCmR
NAを検査することにおいて興味ある理由は、preA
PCmRNAの早期の翻訳停止および脳におけるAPC
の蓄積を引き起こす突然変異が、RNAレベルで遺伝的
に指令されたDNA処理の欠陥、例えば、異常なきり継
ぎによって導入されるということが、また、考えられる
ことにある。
ilial defect)についてのスクリーニン
グ APC産生の下に横たわる配列の変更についての探索に
おけるDNAの分析の別法は、細胞2〇− 質RNA中のpreAPCmRNAへのオリゴヌクレオ
チドのプローブの交雑である。このアプローチは、入手
容易な細胞、例えば、白血球がpreAPCmRNAを
発現することを要求する。なぜなら、RNAのために神
経物質を得ることは実際的ではないと思われるからであ
る。これに関して、p r eAPC遺伝子は多くの種
類の組織において発現され、そして脳においてはそれほ
ど発現というすぐれた証拠が存在する。preAPC遺
伝子それ自体よりも突然変異についてpreAPCmR
NAを検査することにおいて興味ある理由は、preA
PCmRNAの早期の翻訳停止および脳におけるAPC
の蓄積を引き起こす突然変異が、RNAレベルで遺伝的
に指令されたDNA処理の欠陥、例えば、異常なきり継
ぎによって導入されるということが、また、考えられる
ことにある。
preAPCmRNAのこのような遺伝的作用は、pr
eAPC遺伝子それ自体において必ずしも検出可能であ
る必要はない。オリゴヌクレオチドのプローブを使用す
るmRNAの検査の手順は、DNA分析、とくにヌクレ
アーゼ感受性分析についてと本質的に同一である。
eAPC遺伝子それ自体において必ずしも検出可能であ
る必要はない。オリゴヌクレオチドのプローブを使用す
るmRNAの検査の手順は、DNA分析、とくにヌクレ
アーゼ感受性分析についてと本質的に同一である。
標識したプローブを使用するが、標識は普通に知られて
いるものであるか、あるいは以後この分野において開発
されるものであることができる。
いるものであるか、あるいは以後この分野において開発
されるものであることができる。
通常な標識は放射性同位元素、蛍光体、化学光体、また
は特異的結合可能な配位子、例えば、適当に標識した抗
体んたは他の結合性タンパク質、例えば、アビジンによ
って検出可能であるハプテンまたはビオチンである。
は特異的結合可能な配位子、例えば、適当に標識した抗
体んたは他の結合性タンパク質、例えば、アビジンによ
って検出可能であるハプテンまたはビオチンである。
正常配列と同一の核酸をプロービングするための別法は
、24塩基の配列中の特異的突然変異について分析する
ことである。再び、種々の技術は当業者にとって明らか
であろう。突然変異の部位の知識に依存して、個体の可
能な突然変異アレルを表す、24までの異なるプローブ
をイエスまたはノーDNA交雑アッセイにおいて使用し
て、部域を正常と異なる塩基対ついて走査することがで
きる。もちろん、特定の突然変異を同定するために単一
のみのプローブを必要するだけである。このアプローチ
において使用するオリゴヌクレオチドのプローブは、少
なくともIOのヌクレオチドから本質的に成り、その塩
基配列は24塩基の正常配列またはその相補的DNAま
たはRNA配列中に突然変異を有するpreAPC遺伝
子のDNA配列と相同性である。このプローブは分析技
術によって最適化されたまたは可能とされた長さを有し
、そして成熟した24塩基の配列それ自体から本質的に
成ることができる。
、24塩基の配列中の特異的突然変異について分析する
ことである。再び、種々の技術は当業者にとって明らか
であろう。突然変異の部位の知識に依存して、個体の可
能な突然変異アレルを表す、24までの異なるプローブ
をイエスまたはノーDNA交雑アッセイにおいて使用し
て、部域を正常と異なる塩基対ついて走査することがで
きる。もちろん、特定の突然変異を同定するために単一
のみのプローブを必要するだけである。このアプローチ
において使用するオリゴヌクレオチドのプローブは、少
なくともIOのヌクレオチドから本質的に成り、その塩
基配列は24塩基の正常配列またはその相補的DNAま
たはRNA配列中に突然変異を有するpreAPC遺伝
子のDNA配列と相同性である。このプローブは分析技
術によって最適化されたまたは可能とされた長さを有し
、そして成熟した24塩基の配列それ自体から本質的に
成ることができる。
(4)直接核酸配列決定
核酸の配列の情報を得るための前の間接のアプローチに
対する別法は、標準の配列決定プロトコルを使用して、
関連する遺伝子部域を生体外で増幅し、そして増幅した
核酸を直接配列決定することである。増幅は種々の方法
、例えば、原核細胞のベクター中のサブクローニングま
たはポリメラーゼ鎖の反応の実施によって達成すること
ができる。
対する別法は、標準の配列決定プロトコルを使用して、
関連する遺伝子部域を生体外で増幅し、そして増幅した
核酸を直接配列決定することである。増幅は種々の方法
、例えば、原核細胞のベクター中のサブクローニングま
たはポリメラーゼ鎖の反応の実施によって達成すること
ができる。
次の実施例によって本発明を説明するが、これらの実施
例は限定を意図しない。
例は限定を意図しない。
裏簾を
域1897−1921の正常遺伝子のヌクレオチド配列
は、 5’ GGCGGT GTT GTCATAG
CG ACA GTQ 3’ (#l)で
あり、モして相補的配列は、 3’ CCG CCA CAA CAG T
ATCGCTGT CAC5’ (#2)であ
る。(#l)または(#2)のいずれも化学的に合成し
たオリゴヌクレオチドのプローブの好ましい組成である
。標識するため、プローブは32Pでポリヌクレオチド
キナーゼを使用して末端で標識するかWallice、
Co1d Spring Harbor Sym
p、Biol、、51.257−261 1986)か
、あるいはプローブを合成し、そして同位元素でプライ
マー延長反応において標識する(Dattagupta
ら、BioTech、5.38−43.1987)する
ことができるであろう。プローブは、また、非同位元素
的に標識することができるであろう(Jablonsk
iら、Ncl、Ac1ds Res、、14.611
5−6128.1986)。
は、 5’ GGCGGT GTT GTCATAG
CG ACA GTQ 3’ (#l)で
あり、モして相補的配列は、 3’ CCG CCA CAA CAG T
ATCGCTGT CAC5’ (#2)であ
る。(#l)または(#2)のいずれも化学的に合成し
たオリゴヌクレオチドのプローブの好ましい組成である
。標識するため、プローブは32Pでポリヌクレオチド
キナーゼを使用して末端で標識するかWallice、
Co1d Spring Harbor Sym
p、Biol、、51.257−261 1986)か
、あるいはプローブを合成し、そして同位元素でプライ
マー延長反応において標識する(Dattagupta
ら、BioTech、5.38−43.1987)する
ことができるであろう。プローブは、また、非同位元素
的に標識することができるであろう(Jablonsk
iら、Ncl、Ac1ds Res、、14.611
5−6128.1986)。
2、試料DNAの調製: DNAは白血球から最も容易
に入手可能であり、そして数mQ以下の血液は分析ため
に十分なりNAを提供する。DNAを組織から標準の手
順、例えば、細胞の洗浄剤の溶解、および酵素の消化に
よるタンパク質の除去および/または有機溶媒によるリ
ゼイトの処理によって抽出される(RaeおよびFra
nke。
に入手可能であり、そして数mQ以下の血液は分析ため
に十分なりNAを提供する。DNAを組織から標準の手
順、例えば、細胞の洗浄剤の溶解、および酵素の消化に
よるタンパク質の除去および/または有機溶媒によるリ
ゼイトの処理によって抽出される(RaeおよびFra
nke。
Chrmosoma 39.443−456.197
2)。DNAを抽出液の水性相からエタノール沈澱によ
って回収し、次いで水またはトリス−EDTA溶液中に
溶解する。
2)。DNAを抽出液の水性相からエタノール沈澱によ
って回収し、次いで水またはトリス−EDTA溶液中に
溶解する。
3、試料DNAの変性、プローブの添加、およびアニー
ル:約5μgの試料DNAを約50ngの標識したオリ
ゴヌクレオチドのプローブと20Pgの体積のH,O中
で混合し、5分間沸騰させて試料DNAを変成し、次い
でlOμQの0.1モルのトリス、pH8,3モルのN
aClを添加する。この混合物を50°Cにおいて交雑
のため2時間インキュベーションする。
ル:約5μgの試料DNAを約50ngの標識したオリ
ゴヌクレオチドのプローブと20Pgの体積のH,O中
で混合し、5分間沸騰させて試料DNAを変成し、次い
でlOμQの0.1モルのトリス、pH8,3モルのN
aClを添加する。この混合物を50°Cにおいて交雑
のため2時間インキュベーションする。
4、ヌクレアーゼによる処理:交雑しないプローブを完
全に分解し、かつグローブと試料との間の塩基対の不一
致の部位において切断により、部分的に交雑したグロー
ブの長さを調節するために、核酸試料の間の相同性の部
域をマツピングする、次の1つの手順を使用する(Ko
hornおよびRae、Proc、Nat 1.Aca
d、Sci。
全に分解し、かつグローブと試料との間の塩基対の不一
致の部位において切断により、部分的に交雑したグロー
ブの長さを調節するために、核酸試料の間の相同性の部
域をマツピングする、次の1つの手順を使用する(Ko
hornおよびRae、Proc、Nat 1.Aca
d、Sci。
USA、80.3265−3268.1983): (
1)交雑物を30ミリモルのNa0Ac、5ミリモルの
Zn5O,、pH9,5中で250μQに希釈し、(i
1)50〜300U(7)S、ヌクレアーゼを添加し
、そして反応混合物を室温において1時間インキュベー
ションL、(iii)50μQの0.5モルのトリス、
pH9,5,0゜1モルのEDTAの添加により消化を
停止し、そして、担体として20pgのE、coli
tRNAの添加後、生存する核酸をエタノール中で沈
澱させる。
1)交雑物を30ミリモルのNa0Ac、5ミリモルの
Zn5O,、pH9,5中で250μQに希釈し、(i
1)50〜300U(7)S、ヌクレアーゼを添加し
、そして反応混合物を室温において1時間インキュベー
ションL、(iii)50μQの0.5モルのトリス、
pH9,5,0゜1モルのEDTAの添加により消化を
停止し、そして、担体として20pgのE、coli
tRNAの添加後、生存する核酸をエタノール中で沈
澱させる。
5、ゲル電気泳動または薄層クロマトグラフィは、変性
して交雑グローブの解放後、ヌクレアーゼ処理のプロフ
ィルを表示する:例えば、沈澱物を3〜5μaのO,1
モルのNaOH,1ミリモルのEDTA中に懸濁させた
後、薄い20%の変性アクリルアミドゲルの電気泳動の
ため、等しい体積の80%のホルムアミド、0.03%
のブロモフェノールブルー、0.03%のキシレンシア
ツールを添加し、完全な長さのプローブ士より短い長さ
のプローブ分子を探す: ホモ接合 へテロ接合体 ホモ接合 疋虜 八D AD 24マー + 十 く24マー−+十 6、放射性プローブの艶は、オートラジオグラフィーま
たはシンチレーション分光光度測定によって実施するこ
とができる。非同位元素的に標識したプローブは、例え
ば、比色または化学光によって検出することができる。
して交雑グローブの解放後、ヌクレアーゼ処理のプロフ
ィルを表示する:例えば、沈澱物を3〜5μaのO,1
モルのNaOH,1ミリモルのEDTA中に懸濁させた
後、薄い20%の変性アクリルアミドゲルの電気泳動の
ため、等しい体積の80%のホルムアミド、0.03%
のブロモフェノールブルー、0.03%のキシレンシア
ツールを添加し、完全な長さのプローブ士より短い長さ
のプローブ分子を探す: ホモ接合 へテロ接合体 ホモ接合 疋虜 八D AD 24マー + 十 く24マー−+十 6、放射性プローブの艶は、オートラジオグラフィーま
たはシンチレーション分光光度測定によって実施するこ
とができる。非同位元素的に標識したプローブは、例え
ば、比色または化学光によって検出することができる。
RNA中の突然変異停止コドンの位置は前述したのと同
一の部域に必然的に存在するであろうので、試料DNA
をプロービングするために使用したのと同一のオリゴヌ
クレオチドを使用して試料mRNAをプロービングする
(しかしながら、オリゴ#2のみ、それは−木調RNA
に対して相同性であるものであるので)。
一の部域に必然的に存在するであろうので、試料DNA
をプロービングするために使用したのと同一のオリゴヌ
クレオチドを使用して試料mRNAをプロービングする
(しかしながら、オリゴ#2のみ、それは−木調RNA
に対して相同性であるものであるので)。
2、試料RNAの調製: RNAは白血球から最も容易
に入手可能であり、そして数mα以下の血液は分析ため
に十分なRNAを提供する。RNAを組織から標準の手
順、例えば、細胞の洗浄剤の溶解、および酵素の消化に
よるDNAおよびタンパク質の除去および有機溶媒によ
るリゼイトの処理によって抽出される(Mi+rtif
およびRa6% Proc、Na t’1.Acad、
Sc i、USA、、13.3221−3239.19
85)。
に入手可能であり、そして数mα以下の血液は分析ため
に十分なRNAを提供する。RNAを組織から標準の手
順、例えば、細胞の洗浄剤の溶解、および酵素の消化に
よるDNAおよびタンパク質の除去および有機溶媒によ
るリゼイトの処理によって抽出される(Mi+rtif
およびRa6% Proc、Na t’1.Acad、
Sc i、USA、、13.3221−3239.19
85)。
RNAを抽出液の水性相からエタノール沈澱によって回
収し、次いで水中に再溶解する。
収し、次いで水中に再溶解する。
3、プローブの添加、およびアニール:交雑のため、R
NA (一般に、約3μg)および標識したオリゴヌク
レオチドのプローブ(一般に、約50、OOOcpm)
を30μαの40%のホルムアミド、4xssc、33
ミリモルのN a 2HPO、−K H2P Oい p
H7,0中で一緒にし、そして37°Cにおいて少なく
とも8時間インキユベションする。
NA (一般に、約3μg)および標識したオリゴヌク
レオチドのプローブ(一般に、約50、OOOcpm)
を30μαの40%のホルムアミド、4xssc、33
ミリモルのN a 2HPO、−K H2P Oい p
H7,0中で一緒にし、そして37°Cにおいて少なく
とも8時間インキユベションする。
本発明の主な特徴および態様は、次の通りである。
11個体のDNAまたはRNAの試料中の、正常DNA
塩基配列 5’ CACTGT CGCTAT GACAA
CACCGCC3’ またはその正常相補的DNAまたはRNA配列における
変更の存在を決定する工程からなることを特徴とする、
個体におけるアルツハイマー病またはアルツハイマー病
を発生させる素因を診断する方法。
塩基配列 5’ CACTGT CGCTAT GACAA
CACCGCC3’ またはその正常相補的DNAまたはRNA配列における
変更の存在を決定する工程からなることを特徴とする、
個体におけるアルツハイマー病またはアルツハイマー病
を発生させる素因を診断する方法。
2、前記個体はアルツハイマー病の症候前をもち、そし
て前記正常DNA塩基配列またはその正常相補的DNA
またはRNA配列中の変更の存在は、前記個体か前記病
気を発生ずるであろうという危険を示す上記第1項記載
の方法。
て前記正常DNA塩基配列またはその正常相補的DNA
またはRNA配列中の変更の存在は、前記個体か前記病
気を発生ずるであろうという危険を示す上記第1項記載
の方法。
3、前記正常配列中の変更の存在は、前記個体から試料
のDNAまたはRN Aを一本鎖の形態で取り、前記−
木調の試料のDNAまたはRNAを前記DNA塩基配列 5″ CACTGT CGCTAT GACAAC
ACCGCC3’ またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列からなるオリゴヌクレオチ
ドのプローブと交雑させ、そして得られる雑種を不完全
な相同性について分析することによって決定する、上記
第1項記載の方法。
のDNAまたはRN Aを一本鎖の形態で取り、前記−
木調の試料のDNAまたはRNAを前記DNA塩基配列 5″ CACTGT CGCTAT GACAAC
ACCGCC3’ またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列からなるオリゴヌクレオチ
ドのプローブと交雑させ、そして得られる雑種を不完全
な相同性について分析することによって決定する、上記
第1項記載の方法。
4、前記オリゴヌクレオチドのプローブは、50より少
ないヌクレオチドから成り、そして24ヌクレオチドの
DNA塩基配列 5″ CACTGT CGCTAT GACAA
CACCGCC3’ またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列を含む、上記第3項記載の
方法。
ないヌクレオチドから成り、そして24ヌクレオチドの
DNA塩基配列 5″ CACTGT CGCTAT GACAA
CACCGCC3’ またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列を含む、上記第3項記載の
方法。
5、前記オリゴヌクレオチドのプローブは30より少な
いヌクレオチドから本質的に成る上記第4項記載の方法
。
いヌクレオチドから本質的に成る上記第4項記載の方法
。
6、前記オリゴヌクレオチ1へのプローブは前記24ヌ
クレオチド塩基配列のみから本質的に成る上記第4項記
載の方法。
クレオチド塩基配列のみから本質的に成る上記第4項記
載の方法。
7、前記得られる雑種における不完全な相同性は、前記
外種を一本鎖特異的ヌクレアーゼに暴露し、そして雑種
の断片の存在または不存在を検出することによって決定
する、」二記第3項記載の方法。
外種を一本鎖特異的ヌクレアーゼに暴露し、そして雑種
の断片の存在または不存在を検出することによって決定
する、」二記第3項記載の方法。
8、前記正常配列における変更の存在は、前記個体から
試料のDNAまたはRNAを一本鎖の形態て取り、前記
−木調の試料のDNAまたはRNAをオリゴヌクレオチ
ドのプローブと交雑させ、前記オリゴヌクレオチドのプ
ローブは、前記正常DNA塩基配列またはその相補的D
NAまたはRNA配列中に突然変異を有するpreAP
C遺伝子のDNA配列と相同性の少なくとも10ヌクレ
オチドの塩基配列を有し、そして得られる雑種を完全な
相同性について分析することによって決定する、上記第
1項記載の方法。
試料のDNAまたはRNAを一本鎖の形態て取り、前記
−木調の試料のDNAまたはRNAをオリゴヌクレオチ
ドのプローブと交雑させ、前記オリゴヌクレオチドのプ
ローブは、前記正常DNA塩基配列またはその相補的D
NAまたはRNA配列中に突然変異を有するpreAP
C遺伝子のDNA配列と相同性の少なくとも10ヌクレ
オチドの塩基配列を有し、そして得られる雑種を完全な
相同性について分析することによって決定する、上記第
1項記載の方法。
9 前記オリゴヌクレオチドのプローブは、前記正常D
NA塩基配列またはその相補的DNAまたはRNA配列
の突然変異した形態の塩基配列に対応する24までのヌ
クレオチドから本質的に成る、上記第8項記載の方法。
NA塩基配列またはその相補的DNAまたはRNA配列
の突然変異した形態の塩基配列に対応する24までのヌ
クレオチドから本質的に成る、上記第8項記載の方法。
10、試料はゲノムDNAである上記第1項記載の方法
。
。
11、試料はmRNAである上記第1項記載の方法。
12.50より少ないヌクレオチドから本質的に成り、
そして24ヌクレオチドのDNA塩基配列 5’ CACTGT CGCTAT GA
CAACACCGCC3″ またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列を含むことを特徴とする、
アルツハイマー病またはアルツハイマー病を発生させる
素因の診断において使用するだめのオリゴヌクレオチド
のプローブ。
そして24ヌクレオチドのDNA塩基配列 5’ CACTGT CGCTAT GA
CAACACCGCC3″ またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列を含むことを特徴とする、
アルツハイマー病またはアルツハイマー病を発生させる
素因の診断において使用するだめのオリゴヌクレオチド
のプローブ。
1.3.30より少ないヌクレオチドから本質的に成る
上記第12項記載のプローブ。
上記第12項記載のプローブ。
14、前記24ヌクレオチド塩基配列のみから本質的に
成る上記第12項記載のプローブ。
成る上記第12項記載のプローブ。
15、標識をさらに含む上記第12項記載のプローブ。
16、前記標識は放射性同位元素、蛍光体、化学光体、
または特異的結合可能な配位子である上記第15項記載
のプローブ。
または特異的結合可能な配位子である上記第15項記載
のプローブ。
17、少なくとも10ヌクレオチドから本質的に成り、
その塩基配列は24ヌクレオチド配列5″ CACT
GT CGCTAT GACAACACCGCC3
’ またはその相補的DNAまたはRNA配列中に突然変異
を有するpreAPC遺伝子のDNA配列と相同性であ
ることを特徴とする、アルツハイマー病またはアルツハ
イマー病を発生させる素因の診断において使用するため
のオリゴヌクレオチドのプローブ。
その塩基配列は24ヌクレオチド配列5″ CACT
GT CGCTAT GACAACACCGCC3
’ またはその相補的DNAまたはRNA配列中に突然変異
を有するpreAPC遺伝子のDNA配列と相同性であ
ることを特徴とする、アルツハイマー病またはアルツハ
イマー病を発生させる素因の診断において使用するため
のオリゴヌクレオチドのプローブ。
18、前記突然変異したDNA配列またはその相補的D
NAまたはRNA配列の塩基配列に対応する24までの
ヌクレオチドから本質的に成る、上記第17項記載のグ
ローブ。
NAまたはRNA配列の塩基配列に対応する24までの
ヌクレオチドから本質的に成る、上記第17項記載のグ
ローブ。
19、標識をさらに含む上記第17項記載のグローブ。
20、前記標識は放射性同位元素、蛍光体、化学光体、
または特異的結合可能な配位子である上記第17項記載
のプローブ。
または特異的結合可能な配位子である上記第17項記載
のプローブ。
第1図は、APCタンパク質の遺伝情報を指定する部域
を包含するp r eAPC遺伝子配列の部分を示す。 第2図は、APCタンパク質のための解読配列の直後の
停止コドンを発生させる+1および一2フレームシフト
を示す。 GAA GUG AAG AυGMeセ GAU GCA GAA UUCCGA CA
D GACUCA GGA LIAt)GAAAs
p Ala Glu ?heArg Hls Asp
Ser Gly Tyr G1*Phe Ala
GILI Asp Val Gly Ser
Asn入AA GGLI GCA ALICA
U(J GGA CUC八LIG fLys G
ly Ala Ile Ile Giy Leu Me
t ’GUG A(ICGIJCAtJCACC1j
LIG GL!G ALIG COG八AG AA
G AA八 第1 図 4σ 第2図
を包含するp r eAPC遺伝子配列の部分を示す。 第2図は、APCタンパク質のための解読配列の直後の
停止コドンを発生させる+1および一2フレームシフト
を示す。 GAA GUG AAG AυGMeセ GAU GCA GAA UUCCGA CA
D GACUCA GGA LIAt)GAAAs
p Ala Glu ?heArg Hls Asp
Ser Gly Tyr G1*Phe Ala
GILI Asp Val Gly Ser
Asn入AA GGLI GCA ALICA
U(J GGA CUC八LIG fLys G
ly Ala Ile Ile Giy Leu Me
t ’GUG A(ICGIJCAtJCACC1j
LIG GL!G ALIG COG八AG AA
G AA八 第1 図 4σ 第2図
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、個体のDNAまたはRNAの試料中の、正常DNA
塩基配列 【遺伝子配列があります】 またはその正常相補的DNAまたはRNA配列における
変更の存在を決定する工程からなることを特徴とする、
個体におけるアルツハイマー病またはアルツハイマー病
を発生させる素因を診断する方法。 2、50より少ないヌクレオチドから本質的に成り、そ
して24ヌクレオチドのDNA塩基配列【遺伝子配列が
あります】 またはその対応するRNA塩基配列、またはそれらの相
補的DNAまたはRNA配列を含むことを特徴とする、
アルツハイマー病またはアルツハイマー病を発生させる
素因の診断において使用するためのオリゴヌクレオチド
のプローブ。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US07/194,053 US5015570A (en) | 1988-05-13 | 1988-05-13 | Molecular diagnosis of Alzheimer Disease |
US194053 | 1988-05-13 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH0220298A true JPH0220298A (ja) | 1990-01-23 |
Family
ID=22716106
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP1120224A Pending JPH0220298A (ja) | 1988-05-13 | 1989-05-12 | アルツハイマー病の診断 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5015570A (ja) |
EP (1) | EP0341491B1 (ja) |
JP (1) | JPH0220298A (ja) |
CA (1) | CA1338704C (ja) |
DE (1) | DE68916693T2 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
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