JP7650467B2 - 自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定方法、並びに炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤 - Google Patents

自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定方法、並びに炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤 Download PDF

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Description

本発明は、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定方法、並びに炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤に関する。
miRNA(micro RNA;マイクロRNA)とは、タンパク質に翻訳されない約17~24ヌクレオチドからなる非コードRNAである。ヒトのmiRNAは、現在2500種類以上が発見されている。このmiRNAは、自分自身と相補的な標的部位をもつ様々な遺伝子の翻訳を抑制する働きがあり、細胞の発生、分化、増殖、細胞死等の基本的な生物学的機能を制御している。このようにマイクロRNAは細胞内の多くの遺伝子の発現制御を行っているため、その発現の変化は疾患の発生や進行等に関連すると考えられており、マイクロRNAを疾患の診断、早期発見に利用しようという研究が行われている。
例えば、癌とmiRNAとの関連について、Calinらは、リンパ性白血病において、miR15及びmiR16が頻繁にダウンレギュレーションしていることを報告している(非特許文献1参照;Calin GA,Dumitru CD,Shimizu Mら,Proc Natl Acad Sci USA,2002,vol.99,p.15524-9)。また、Michaelらは、ヒト大腸癌においてmiR-143及びmiR-145の発現が低下していることを報告している(非特許文献2参照;Michael MZ, SM OC, van Holst Pellekaan NG,Young GP,James RJ,Mol Cancer Res,2003,vol.1,p.882-91)。組織がん細胞中に特定のmiRNAが存在しているという報告(特許文献1参照;特開2009-100687号公報)等もある。このように、miRNAは、がん等の疾病と深い関わりがあり、それらの診断、予後予測等に利用できる可能性があると考えられている。
一方、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)の診断や予後予測等にmiRNAを用いることができるという報告はない。SJSを始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の診断や予後予測等を高い確度で簡便に行う方法が強く求められている。
特開2009-100687号公報
Calin GA,Dumitru CD,Shimizu Mら,Proc Natl Acad Sci USA,2002,vol.99,p.15524-9 Michael MZ, SM OC, van Holst Pellekaan NG,Young GP,James RJ,Mol Cancer Res,2003,vol.1,p.882-91
本発明は、上述のような状況の中、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)を始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の罹患可能性、発症及び/又は重症化リスク、治療効果等の判定が可能な新規方法を提供することを目的とする。
本発明は、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)を始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の新規治療剤を提供することも目的とする。
前記課題を解決するために、本発明者が種々検討した結果、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)患者の手術時に摘出される結膜組織の結膜上皮組織等において、特定のマイクロRNAの発現パターンが、健常人と大きく異なっていることを見出し、これらのマイクロRNAを指標として、疾患の罹患可能性、重症度、発症及び/又は重症化リスク、治療効果等の判定を行う新規の判定方法を完成させた。また、これらのうちの特定のマイクロRNAの阻害剤が、疾患治療に有効であることを示す結果が得られ、新規治療剤としての可能性が強く示唆された。すなわち本発明の要旨は、以下の通りである。
[1]生体試料中のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、miR-548ac、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAを指標とする、被験者における自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定方法。
[2]被験者における自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の罹患可能性を判定する、[1]に記載の判定方法。
[3]被験者における自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の重症度を判定する、[1]に記載の判定方法。
[4]被験者における自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の発症及び/又は重症化リスクを判定する、[1]に記載の判定方法。
[5]被験者における自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の治療効果を判定する、[1]に記載の判定方法。
[6]上記生体試料が、被験者の上皮細胞、血液(血清、血漿、全血等)、涙液から成る群より選択される少なくとも1種である、[1]から[5]のいずれかに記載の判定方法。
[7]miR-455-3p阻害剤を有効成分とする、炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤。
[8]上記miR-455-3p阻害剤が、生体におけるmiR-455-3pの発現及び/又は機能を阻害する、[7]に記載の予防及び/又は治療剤。
[9]上記miR-455-3p阻害剤が、核酸オリゴ、低分子化合物、及びHsa-miR-455-3p抗体から成る群より選択される少なくとも1種である、[7]又は[8]に記載の予防及び/又は治療剤。
[10]上記miR-455-3p阻害剤が、核酸オリゴである、[9]に記載の予防及び/又は治療剤。
[11]上記核酸オリゴが、天然及び非天然のRNA又はDNAからなるオリゴである、[10]に記載の予防及び/又は治療剤。
[12]上記核酸オリゴが、miR-455-3pのアンチセンスオリゴである、[11]に記載の予防及び/又は治療剤。
[13]上記核酸オリゴが、修飾されている、[10]から[12]のいずれかに記載の予防及び/又は治療剤。
本発明によると、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)を始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の罹患可能性、重症度、発症及び/又は重症化リスク、治療効果等の判定が可能となる。具体的には、SJS疾患特異的に発現が変動するマイクロRNAは、医学的に有用な生物学的指標となり、また、疾患重症度と相関するマイクロRNAは、治療効果の評価を可能とする。本発明は、難治性眼表面疾患の結膜上皮組織を標的とする疾患特異的マイクロRNA発現プロファイリンクによる非侵襲的な診断技術の確立と治療法選択への活用という新しい医療技術の提供につながる。さらに本発明によると、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)を始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の新規治療剤を提供することもできる。
SJS患者と健常対照の結膜上皮細胞のmiRNA発現の比較結果(定量PCR)を示す。 SJS患者と健常対照の結膜上皮細胞のmiRNA発現の比較結果(定量PCR)を示す。 SJS患者と健常対照の結膜上皮細胞のmiRNA発現の比較結果(定量PCR)を示す。 ヒトmiRNAの測定系によるSJS患者と健常対照の結膜上皮細胞のmiRNA発現の比較結果(定量PCR)を示す。 miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞におけるANKRD1、CXCL8、CXCL2、GEM、PTGS2、RNASE8の定量PCRの結果を示す。 miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞におけるIL6、CXCL1、CCL20、KPRPの定量PCRの結果を示す。 miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞におけるSLITRK6の定量PCRの結果を示す。 miR-455-3pの発現が増強されたヒト培養結膜上皮細胞におけるPPP1R3C、CTGF、CCL20、CXCL2、PTGS2、CXCL8の定量PCRの結果を示す。 miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞におけるIL1RL1、CTGF、PPP1R3C、ADM、SERPINB2の定量PCRの結果を示す。 マウス接触性皮膚炎モデルにおけるANKRD1、CXCL2、PTGS2、IL-6、CXCL1、CCL20の定量PCRの結果を示す。 マウス接触性皮膚炎モデルにおけるIL1RL1、SERPINB2の定量PCRの結果を示す。
以下、本発明について詳細に説明する。なお、本明細書中で使用される用語は、特に言及しない限り、当該技術分野で通常用いられる意味で解釈される。
[自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定方法]
本発明の自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定方法は、生体試料中のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、miR-548ac、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNA(以下、「miRNA」と表記することもある)を指標とすることを特徴とする。本発明の判定方法は、被験者における、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の罹患可能性、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の重症度、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の発症及び/又は重症化リスク、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の治療効果を判定する方法である。
本発明におけるマイクロRNAの由来となる生物としては、ヒト、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ネコ、イヌ等の哺乳動物を好適に例示することができ、中でもヒト、マウスをより好適に例示することができ、特にヒトを好適に例示することができる。本発明のマイクロRNAであるmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、miR-548ac、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535-5pの各ヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号66~74に示される。マイクロRNAの配列は特に哺乳動物間では保存性が高く、ヒト以外の哺乳動物においてもヒトと同様の発現プロファイルを示す可能性が高い。
また、本発明におけるマイクロRNAには、配列番号66~74に示されるヌクレオチド配列において1若しくは2個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたRNAからなるマイクロRNAが含まれる。上記の「1若しくは2個以上」としては、1~5個が好ましく、1~3個がより好ましく、1~2個がさらに好ましく、1個が特に好ましい。なお、上記のヌクレオチド配列からなるRNAが、患者の試料においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するかどうかは、例えば後述のマイクロアレイ法や定量PCR法により容易に確認することができる。なお、ヒト以外の上記の各生物からの本件マイクロRNAの配列は、GenBank等のデータベースに登録されている情報に基づいて確認又は特定することができる。
本発明の判定方法が適用される自己免疫疾患としては、例えば、自己免疫性肝炎、自己免疫性アジソン病、自己免疫性溶血性貧血、内耳自己免疫疾患(AIED)、自己免疫性リンパ増殖症候群(ALPS)、自己免疫性血小板減少性紫斑病(ATP)、後天性免疫不全症候群(AIDS)、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質抗体症候群、ベーチェット病、心筋症、セリアックスプルー-ヘルペス状皮膚炎、慢性疲労免疫機能障害症候群(CFIDS)、慢性炎症性脱髄性多発神経炎(CIPD)、瘢痕性類天疱瘡、寒冷凝集素症、クレスト症候群、クローン病、デゴス病、若年性皮膚筋炎、円板状ループス、本態性混合型クリオグロブリン血症、実験的自己免疫型脳脊髄炎(EAE)、線維筋痛-線維筋炎、グレーヴス病、ギランバレー症候群、橋本甲状腺炎、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、IgA腎症、インスリン-依存型糖尿病(1型糖尿病、2型糖尿病)、若年性慢性関節炎(スティル病)、若年性関節リウマチ、メニエール病、混合性結合組織病、多発性硬化症、重症筋無力症、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)、悪性貧血、結節性多発性動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発性筋痛、多発性筋炎及び皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変症、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、リウマチ熱、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症(全身性進行性硬化症(PSS)、全身性硬化症(SS)としても公知)、シェーグレン症候群、スティッフパーソン症候群、全身性紅斑性狼瘡、高安動脈炎、側頭動脈炎/巨細胞性動脈炎、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、白斑及びヴェーゲナー肉芽腫症等が挙げられる。
本発明の判定方法が適用される炎症性疾患としては、例えば、スティーブンス・ジョンソン症候群、皮膚炎疾患(すなわち、乾癬、湿疹、火傷、皮膚炎)、関節炎(関節リウマチ、脊椎関節症、痛風関節炎、変性関節疾患(すなわち、変形性関節症)、全身性エリテマトーデス、シェーグレン症候群、強直性脊椎炎、未分化脊椎炎、ベーチェット病、溶血性自己免疫性貧血、多発性硬化症、筋萎縮性側索硬化症、穀粉症、急性肩痛、乾癬性関節炎、若年性関節炎を含む)、喘息、アテローム性動脈硬化、骨粗鬆症、気管支炎、腱炎、滑液包炎、遺尿症、好酸球性疾患、消化管疾患(炎症性腸疾患、消化性潰瘍、限局性腸炎、憩室炎、消化管出血、クローン病、胃炎、下痢症、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎を含む)、胃食道逆流症、好酸球性食道炎、胃不全麻痺(例えば、糖尿病性胃不全麻痺等)、食物不耐性、食物アレルギー、その他の機能性腸疾患(例えば、非潰瘍性消化不良、非心臓性胸痛等)等が挙げられる。これらのうち、本発明の判定方法が好適に適用される炎症性疾患としては、スティーブンス・ジョンソン症候群、皮膚炎疾患が好ましく、スティーブンス・ジョンソン症候群がより好ましい。
本発明の判定方法としては、
(A)被験者の生体試料中(上皮細胞、血液(血清、血漿、全血等)、涙液)及びコントロールとしての正常被検者の生体試料中のRNAを抽出する工程、
(B)抽出したRNA中の、特定のマイクロRNAの発現量を測定する工程、
(C)コントロールと被験者の生体試料におけるマイクロRNAの発現量を比較し、判定する工程
を備えている限り特に制限されない。なお、上記特定のマイクロRNAとは、miR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、miR-548ac、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAである。
被験者の生体試料におけるmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に、及び/又はmiR-125a-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患である、つまり自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患に罹患している可能性(罹患可能性)があると評価する。また、上記発現量の増加及び/又は低下の程度によって、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の重症度、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の発症及び/又は重症化リスクを判定することもできる。さらに、治療後のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、治療前よりも低下した場合、及び/又はmiR-125、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、治療前よりも増加した場合に、治療効果があったと判定し、変化なし、或いは上記と逆の変化を示した場合には、治療効果がなかった、或いは悪化したと判定する。なお、本発明の判定方法において、コントロールとしては、正常被検者、又は自己免疫疾患及び/若しくは炎症性疾患に罹患していない被験者の生体試料を用いる。本発明におけるマイクロRNAの発現量としては、サンプル間のばらつきを補正するために適切な内部標準遺伝子(RNU44、miR-149*等)又は外部標準遺伝子(miR-39等)で補正した相対発現量を用いることがより正確な判定を行なう観点から好ましい。
本発明において生体試料としては、特に限定されないが、例えば被験者の組織の細胞、血液等が挙げられ、具体的には、結膜上皮、皮膚等の表皮細胞、血清、血漿、全血、涙液等が好ましい生体試料として挙げられる。
上記(A)工程におけるRNAを抽出する方法としては、生体試料から、マイクロRNAを含むRNAを抽出できる方法である限り特に制限されないが、例えば、細胞・組織は、miRNeasy Mini Kit(QIAGEN社製)、血漿・血清は、miRNeasy Serum/Plasma Kit(QIAGEN社製)を添付のプロトコールにしたがって用いることによって、マイクロRNAを含むトータルRNAを抽出することができる。
上記(B)工程における特定のマイクロRNAの発現量を測定する方法としては、マイクロRNAを含むRNA中の上記特定のマイクロRNA量を同定し得る方法である限り特に制限されないが、例えば、上記特定のマイクロRNAの発現量を測定することができる、上記特定のマイクロRNAの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を備えたマイクロアレイを判定に使用するマイクロアレイ法;上記特定のマイクロRNAの配列を増幅し得るプライマーセットを判定に使用する定量PCR法;上記特定のマイクロRNAの配列を増幅し得るプライマーセットと、本件マイクロRNAの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含む蛍光プローブとを判定に使用する定量PCR法(蛍光プローブ法)等を例示することができる。
上記のマイクロアレイ法としては、上記特定のマイクロRNAの発現量を測定することが可能である限り特に制限されないが、組織から抽出したRNAをラベル(好ましくは蛍光ラベル)で標識し、そのRNAを、同定対象とするマイクロRNAに相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド(好ましくはDNA)又はその一部からなるプローブが固定されたマイクロアレイに接触させてハイブリダイゼーションを行った後、マイクロアレイを洗浄して、マイクロアレイ上に残ったマイクロRNAの発現量を測定する方法を例示することができる。
上記の核酸配列のヌクレオチドの種類としては、本発明における特定のマイクロRNAに特異的にハイブリダイズし得る限り特に制限されないが、安定性が高いことからDNAであることが好ましい。また、上記のポリヌクレオチドの一部の長さとしては、本発明における特定のマイクロRNAに特異的にハイブリダイズし得る限り特に制限されないが、ハイブリダイゼーションの安定性を確保する観点から、10~100merであることが好ましく、10~40merであることがより好ましい。なお、上記のポリヌクレオチド又はその一部は、当該技術分野において周知の方法を用いて化学合成等することにより取得することができる。
上記のポリヌクレオチド又はその一部を固定するアレイとしては、特に制限されないが、ガラス基板やシリコン基板等を好適に例示することができ、ガラス基板をより好適に例示することができる。上記のポリヌクレオチド又はその一部をアレイに固定する方法としては特に制限されず、公知の方法を用いることができる。また、上記アレイの他に、例えばRNAのラベル化反応に用いる試薬、ハイブリダイゼーション反応に用いる試薬、洗浄に用いる試薬、組織からのRNA抽出に用いる試薬等の、マイクロアレイ法に用いる試薬等の任意の要素をさらに用いてもよい。
上記の定量PCR法としては、上記特定のマイクロRNAの配列を増幅し得るプライマーセットを用いる方法であり、かつ、上記特定のマイクロRNAの発現量を測定することが可能である限り特に制限されず、アガロース電気泳動法、SYBRグリーン法、蛍光プローブ法等の通常の定量PCR法を用いることができる。
定量PCR法におけるプライマーセットとは、上記特定のマイクロRNAの配列を増幅し得るプライマー(ポリヌクレオチド)の組合せを意味する。上記プライマーとしては、上記特定のマイクロRNAの配列を増幅し得る限り特に制限されないが、本発明における特定のマイクロRNAの配列の5’側の一部の配列からなるプライマー(フォワードプライマー)と、そのマイクロRNAの配列の3’側の一部の配列に相補的な配列からなるプライマー(リバースプライマー)とからなるプライマーセットを例示することができる。ここで、5’側とは、成熟型マイクロRNAの配列において比較した場合に、リバースプライマーに対応する配列よりも、5’側であることを意味し、3’側とは、成熟型マイクロRNAの配列において比較した場合に、フォワードプライマーに対応する配列よりも、3’側であることを意味する。
上記の蛍光プローブとしては、上記特定のマイクロRNAの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含んでいる限り特に制限されず、TaqMan(登録商標)プローブ法(FRET原理を利用したものも含む)や、サイクリングプローブ法に用いうる蛍光プローブを好適に例示することができる。
上記プライマーセットや、上記の蛍光プローブは、その配列情報に基づき当該技術分野において周知の方法を用いて化学合成等することにより得ることができる。
上記(C)工程で、コントロールと被験者の生体試料におけるマイクロRNAの発現量を比較し、判定する場合、上記生体試料中、上記特定のマイクロRNAの発現量の増加や低下の程度としては、例えば、コントロールに対する割合として好ましくは50%以上、より好ましくは75%以上、さらに好ましくは100%以上の増加、又は50%以上、より好ましくは75%以上、さらに好ましくは90%以上の低下であることを挙げることができる。
[判定用キット]
本発明は、上述の本発明の判定方法において必要な試薬等を含む、自己免疫疾患及び/又は炎症性疾患の判定キットも含まれる。本発明の判定用キットは、測定対象又は測定原理等に応じた種々の構成をとることができる。本発明の判定用キットの構成要素として、例えば、上記特定のマイクロRNAの発現量を測定することができる、上記特定のマイクロRNAの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を備えたマイクロアレイ、上記特定のマイクロRNAの配列を増幅し得るプライマーセット、及びハイブリダイゼーション用のプローブを含むことができる。このようなmiRNAとしては、上述の本発明の判定方法において指標として採用するmiRNAが好ましい。具体的には、配列番号1~8の塩基配列からなるmiRNAである。
さらに、本発明の判定用キットには、その構成・使用目的等に応じて、当業者に公知の他の要素又は成分、例えば、各種試薬、酵素、緩衝液、反応プレート(容器)等が含まれる。なお、PCR反応後の検出を容易にするために、これらプライマーの少なくともいずれかの末端に、当業者に公知の任意の蛍光物質等の標識物質が結合させてもよい。
[炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤]
本発明は、miR-455-3p阻害剤を有効成分とする、炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤も含む。上記miR-455-3p阻害剤は、生体におけるmiR-455-3pの発現及び/又は機能を阻害するものであれば特に限定されないが、上記miR-455-3p阻害剤は、核酸オリゴ、低分子化合物、及びHsa-miR-455-3p抗体から成る群より選択される少なくとも1種であることが好ましいく、なかでも核酸オリゴであることがより好ましく、天然及び非天然のRNA又はDNAからなるオリゴであることがさらに好ましく、miR-455-3pのアンチセンスオリゴであることが特に好ましい。なお、上記核酸オリゴは、生体に投与された際の分解を抑制する目的、及び/又は疾患部位に特異的に結合させる目的等により、修飾されていることが好ましい。
本発明における「核酸オリゴ」は、天然及び非天然のRNAまたはDNAからなるオリゴであり、miR-455-3pの機能を制御する核酸のオリゴマーを意味する。本発明における核酸オリゴとしては、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマーが含まれる。
本発明における核酸オリゴとして好ましくは、siRNAまたはshRNAを挙げることができ、より好ましくは、siRNAを挙げることができる。siRNAは、細胞で毒性を示さない範囲の短鎖からなる二重鎖RNAを意味し、例えば15~49塩基対と、好適には15~35塩基対と、さらに好適には21~30塩基対とすることが出来る。また、shRNAは、一本鎖のRNAがヘアピン構造を介して二重鎖を構成しているRNAである。
siRNAおよびshRNAは、標的遺伝子と完全に同一である必要はないが、少なくとも70%以上、好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上の配列の相同性を有する。
siRNAおよびshRNAにおけるRNA同士が対合した二重鎖RNAの部分は、完全に対合しているものに限らず、ミスマッチ(対応する塩基が相補的でない)、バルジ(一方の鎖に対応する塩基がない)等により不対合部分が含まれていてもよい。本発明においてはdsRNAにおけるRNA同士が対合する二重鎖RNA領域中に、バルジおよびミスマッチの両方が含まれていてもよい。
本発明における炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤(薬剤)には、保存剤や安定剤等の製剤上許容しうる材料が添加されていてもよい。製剤上許容しうるとは、それ自体は上記の炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療効果を有する材料であってもよいし、当該治療効果を有さない材料であってもよく、上記治療剤とともに投与可能な製剤上許容される材料を意味する。また、治療効果を有さない材料であって、炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤と併用することによって相乗的効果もしくは相加的な安定化効果を有する材料であってもよい。
製剤上許容される材料としては、例えば滅菌水や生理食塩水、保存剤、安定剤、賦形剤、緩衝剤、防腐剤、界面活性剤、キレート剤(EDTA等)、結合剤等を挙げることができる。
本発明における薬剤を注射用の水溶液とする場合には、例えば生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液(例えば、D-ソルビトール、D-マンノース、D-マンニトール、塩化ナトリウムが挙げられる)、適当な溶解補助剤、例えばアルコール(エタノール等)、ポリアルコール(プロピレングリコール、PEG等)、非イオン性界面活性剤(ポリソルベート80、HCO-50)等と併用してもよい。所望によりさらに希釈剤、溶解補助剤、pH調整剤、無痛化剤、含硫還元剤、酸化防止剤等を含有してもよい。
また、必要に応じ、本発明における薬剤をマイクロカプセル(ヒドロキシメチルセルロース、ゼラチン、ポリ[メチルメタクリル酸]等のマイクロカプセル)に封入したり、コロイドドラッグデリバリーシステム(リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル等)としたりすることもできる。さらに、薬剤を徐放性の薬剤とする方法も公知であり、本発明に適用し得る。使用される製剤上許容しうる担体は、剤型に応じて上記の中から適宜あるいは組合せて選択されるが、これらに限定されるものではない。
本発明の炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤をヒトの医薬として使用する場合には、これらの物質自体を直接患者に投与する以外に、公知の製剤学的方法により製剤化して投与を行うことも可能である。製剤化する場合には、上記に記載の製剤上許容される材料を添加しても良い。
本発明におけるすべての薬剤は、医薬品の形態で投与することが可能であり、経口的または非経口的に全身あるいは局所的に投与することができる。例えば、点滴等の静脈内注射、筋肉内注射、腹腔内注射、皮下注射、坐薬、注腸、経口性腸溶剤等を選択することができ、患者の年齢、症状により適宜投与方法を選択することができる。有効投与量は、一回につき体重1kgあたり0.000001mgから1gの範囲で選ばれる。あるいは、患者あたり0.00001~100mg、好ましくは0.0001~50mgの投与量を選ぶことができる。
本発明は、miR-455-3p阻害剤を用いた、炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療方法も含む。miR-455-3p阻害剤、炎症性疾患、自己免疫疾患についての具体的な説明としては、上述の本発明の炎症性疾患及び/又は自己免疫疾患の予防及び/又は治療剤の項の説明を適用できる。
以下に本発明を実施例に基づいて更に詳細に説明するが、本発明はこれら実施例に限定されるものではない。
[Stevens-Johnson症候群(SJS)の病態に関わる結膜上皮のmiRNAについての解析]
1.マイクロアレイを用いた網羅的miRNA解析
SJS患者の眼表面再建術時に切除摘出された結膜組織から、ディスパーゼ(dispase)を用いて結膜上皮を分離後、市販の試薬(miRNeasy mini kit (Qiagen)のプロトコールに従いmiRNAを抽出した。その後、GeneChip miRNA 4.0 Array(Affimetrix社)を用い、網羅的miRNA解析を行った。コントロールとしては、結膜弛緩症患者の眼表面再建術時に切除摘出された結膜組織から分離した結膜上皮を用いた。それぞれ、SJS患者と対照コンロトールの数は、n=3で解析した。
網羅的miRNA解析の結果、約3万種類のmiRNAのうち表1に示す13種類のmiRNAの発現が、SJS患者においてコントロールの1/5以下に低下していた(ANOVA p-value<0.05)。また、表2に示す52種類のmiRNAの発現が、SJS患者においてコントロールの5倍以上に増加していた(ANOVA p-value<0.05)。表中のFold Changeの値は、SJSサンプル3つの各発現シグナルの平均を、コントロールサンプル3つの各発現シグナルの平均で割った値である。
Figure 0007650467000001
Figure 0007650467000002
Figure 0007650467000003
2.定量PCR
上記網羅的miRNA解析でSJS患者とコントロールとの間に有意な発現量の差が見られた複数のmiRNAについて、常法に従って定量PCRを行った。解析対象のmiRNAは、mmu-miR-31、odi-miR-31、ola-miR-31、crm-miR-72、bma-miR-72、bfl-miR-31、oan-miR-31、xtr-miR-31b、ggo-miR-125a、mml-miR-7193-5p、mmu-miR-455-3p、hsa-miR-1285、hsa-miR-4484、mmu-miR-455、mmu-miR-204、hsa-miR-193b、gga-miR-3535とした。SJS患者の結膜上皮サンプルはn=6、コントロールとしての結膜患者弛緩症の結膜上皮サンプはn=7とした。結果を図1に示す。
図1に示すとおり、SJS患者では、miR-31、miR-72、miR-455-3pの発現が顕著に増強していた。一方、miR-125aの発現は、SJS患者では有意に低下していた。これらのmiRNAは、SJSの罹患可能性、重症度、発症及び/又は重症化リスク、治療効果等の判定等の指標として用いることができると考えられた。以下で、これらについてhumanのmiRNAの測定系を使用した定量PCR試験を行った。
3.定量PCR(human)
上記の試験で、SJS患者とコントロールとで、発現量の有意な差が見出されたmiRNAについて、ヒトの定量PCR系を用いて、発現の確認を行った。miR-72については、定量PCR解析用のhumanのprobeが存在しないため、ここではhsa-miR-31、hsa-miR-455-3p、hsa-miR-125aについて定量PCRを行った。結果を図2に示す。
図2に示すとおり、hsa-miR-31、hsa-miR-455-3pは、SJS患者の結膜上皮において、コントロールと比較して有意に強発現していることが確認できた。hsa-miR-125aは、SJS患者の結膜上皮において、コントロールと比較して有意に発現が低下していた。これらのmiRNAは、SJSの罹患可能性、重症度、治療効果等の判定等の指標として有用であると考えられた。
[miR-455-3pの解析]
1.阻害試験
miR-455-3pが疾患治療のターゲットになり得るか否かを確認するために、プライマリー正常ヒト培養結膜上皮細胞(PHCjE)に対して、miR-455-3pのinhibitorの遺伝子導入による抑制試験を行った。
プライマリー正常ヒト培養結膜上皮細胞を、Cnt-PR培地中、5 X 10cells/wellで12 well プレートに播種した。
1wellにOpti-MEM(Gibco社製)50μL及びリポフェクタミン(Lipofectamin)2μLを添加し、別のwellにOpti-MEM50μL、miR-455-3pのinhibitor (mirVana(登録商標)miRNA inhibitor) 72pmolを添加し、その後、両方のwellの液を混合して室温で15分静置してinhibitorとリポフェクタミン複合体を形成させた。上記プライマリー正常ヒト培養結膜上皮細胞の各well(Cnt-PR 0.5mL/well)に100μLの複合体を添加して混合した。37℃、5%CO条件下、24時間培養後、培地交換を行い、さらに6時間培養してサンプルを回収した。miR-455-3pの発現が抑制されていることをPCRにより確認した。
次に、このmiR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞を用いて、網羅的遺伝子発現解析を行った。具体的には、高密度オリゴヌクレオチドプローブアレイ(GeneChip(登録商標)、HumanGene1.0 STアレイ(Affymetrix))を用いて遺伝子発現プロファイルを調べた。全RNAはQiagen RNeasy キット(Qiagen,Valencia,CA)を用いて抽出した。28,869個以上の遺伝子をカバーする約764,885個のプローブセットを使用した。プロセス全体を通して、Affymetrixのプロトコールに従った。スキャンしたマイクロアレイ画像は、GeneChip Scanner 3000 7G(Affymetrix)のフォルト設定で取得した。ハイブリダイゼーションのアーチファクトを検出するために画像を目視で検査した。
結果を表3、表4に示した。表3には、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞において、コントロールの1/3以下に発現が低下した遺伝子を、表4には、コントロールの3倍以上に発現が増加した遺伝子を示す。
Figure 0007650467000004
Figure 0007650467000005
Figure 0007650467000006
Figure 0007650467000007
Figure 0007650467000008
Figure 0007650467000009
Figure 0007650467000010
上記の網羅的遺伝子発現解析により、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞において発現が顕著に低下したことが示された遺伝子(表3)の内、炎症に関与することが知られている、ANKRD1、CXCL8、CXCL2、GEM、PTGS2、RNASE8、IL6、CXCL1、CCL20、KPRPについて、定量PCRを行った。その結果を図3に示す。
図3に示すとおり、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞では、コントロールの細胞と比較して、確かに、ANKRD1、CXCL8、CXCL2、GEM、PTGS2、RNASE8、IL6、CXCL1、CCL20、KPRPの遺伝子発現が低下していることが、定量PCRにおいても確認された。この結果から、miR-455-3pの発現を抑制することが、炎症の予防や治療に有効である可能性が示唆された。
上記の網羅的遺伝子発現解析により、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞において発現が顕著に増加したことが示された遺伝子(表4)の内、炎症に関与することが知られている、IFI44L、SLITRK6、TNFSF10、OAS2、MX1、OAS1について、定量PCRを行った。SLITRK6の定量PCRの結果を図4に示す。
図4に示すとおり、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞では、コントロールの細胞と比較して、SLITRK6の遺伝子発現が顕著に増加していることが、定量PCRにおいても確認された。しかし、これ以外のIFI44L、TNFSF10、OAS2、MX1、OAS1については、有意な発現の増加が認められなかった。
2.発現増強試験(Mimic試験)
miR-455-3pの機能を確認するために、プライマリー正常ヒト培養結膜上皮細胞(PHCjE)に対して、miR-455-3pの発現を増強する試験を行った。
プライマリー正常ヒト培養結膜上皮細胞(PHCjE)に対して、miR-455-3pのmimic(mirVana(登録商標)miRNA mimic)の遺伝子導入による発現増強試験を行った。プライマリー正常ヒト培養結膜上皮細胞を、Cnt-PR培地中、5 X 10cells/wellで12wellプレートに播種した。1wellにOpti-MEM(Gibco社製)50μL及びリポフェクタミン(Lipofectamin)2μLを添加し、別のwellにOpti-MEM50μL、miR-455-3pのmimic(mirVana(登録商標)miRNA mimic)18pmolを添加し、その後、両方のwellの液を混合して室温で15分静置してsiRNAとリポフェクタミン複合体を形成させた。miR-455-3pのmimicを正常ヒト培養結膜上皮細胞の各well(Cnt-PR 0.5mL/well)に100μLの複合体を添加して混合した。37℃、5%CO条件下、24時間培養後、培地交換を行い、さらに6時間培養してサンプルを回収した。miR-455-3p現が増強されていることをPCRにより確認した。
次に、このmiR-455-3pの発現が増強されたヒト培養結膜上皮細胞細胞を用いて、網羅的遺伝子発現解析を行った。網羅的遺伝子発現解析の具体的な方法は、上記阻害試験の際の方法と同様である。その結果、炎症に関与することが知られているPPP1R3C、CTGF、CCL20、CXCL2、PTGS2、CXCL8の発現が、コントロールに比べて増強していることがわかった。これらの結果は定量PCRでも確認できた(図5)。
3.SJS患者の結膜上皮細胞における遺伝子発現の網羅解析
SJS患者の眼表面再建術時に切除摘出された結膜組織から分離した結膜上皮細胞について、網羅的遺伝子発現解析を行った。その結果を、上記表3に示した阻害試験の結果、miR-455-3pのinhibitor処理によりmiR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞の網羅的遺伝子発現解析の結果と比較した。SJS患者の結膜上皮細胞において、コントロールと比較して発現が上昇していた遺伝子のうち、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞において、発現が顕著に低下した遺伝子を表5にリストアップした。
Figure 0007650467000011
上記表5に示した遺伝子のうち、IL1RL1、CTGF、PPP1R3C、ADM、SERPINB2について、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞を用いた定量PCRを行った。その結果を図6に示す。
図6に示すとおり、miR-455-3pの発現が抑制されたヒト培養結膜上皮細胞細胞では、コントロールの細胞と比較して、確かに、IL1RL1、CTGF、PPP1R3C、ADM、SERPINB2Pの遺伝子発現が低下していることが、定量PCRにおいても確認された。miR-455-3pの発現を抑制することで、SJS患者の結膜上皮細胞において発現が増強しており、かつ炎症に関与する遺伝子の発現を低下させることができた。このことから、miR-455-3pを阻害することがSJSの治療に効果を奏する可能性が示唆された。
4.マウス接触性皮膚炎モデル
miR-455-3p阻害で発現が抑制される遺伝子の、マウス接触性皮膚炎モデルの組織での動態についての解析を行った。
Balb/cマウスの腹部及び胸部に1%トリニトロクロロベソゼン(TNCB)を塗布した。7日目に、マウスの耳に1%TNCB又は溶媒のみ(アセトン:オリーブオイル=4:1)を塗布した。翌日(8日目)、耳介を採取しRNLaterに浸漬させ、6時間後に取り出し、-80℃に保存した。その後、ドライアイスで耳介を粉砕後、トリゾールで溶解し、エタノール沈殿を行い、RNAを抽出した。StepOne Plusを用いたSybrGreen法によりQ-PCRを行った。
ANKRD1、CXCL2、PTGS2、IL-6、CXCL1、CCL20、IL1RL1、SERPINB2は、マウス接触性皮膚炎モデルの組織において発現が増加していることがわかった。結果を図7に示す。これらの遺伝子は、ヒト培養結膜上皮細胞細胞を用いた上述の試験によりmiR-455-3p阻害で発現が抑制されることが判明しているものである。したがって、皮膚炎等の炎症、さらには、自己免疫疾患等に対しても、miR-455-3pを阻害する物質が、予防又は治療効果を奏する可能性が示唆された。
[Stevens-Johnson症候群(SJS)の病態に関わる血液(血漿)のmiRNAについての解析]
1.マイクロアレイを用いた網羅的miRNA解析
SJS患者の血液から血漿を分離し、市販の試薬(miRNeasy Serum/Plasma Kit(QIAGEN社製))のプロトコールに従いmiRNAを抽出した。その後、GeneChip miRNA 4.0 Array(Affimetrix社)を用い、網羅的miRNA解析を行った。コントロールとしては、健常ボランティアの血液を用いた。
網羅的miRNA解析の結果、SJS患者の血液中で、miR-628-3p、miR-548acがコントロールと比較して顕著に変化していることがわかった。これらについては、定量PCRによっても、SJS患者での発現増強が確認できた(データは省略)。
2.SJSの重症度と、患者血液中のmiR-628-3p及びmiR-548acの発現量との相関の解析
健常人、SJS軽症患者、SJS重症患者の血液中のmiR-628-3p及びmiR-548acの量を比較した。その結果を表6及び表7に示す。
Figure 0007650467000012
Figure 0007650467000013
表6及び7に示したとおり、SJSの重症度と、患者血液中のmiR-628-3p及びmiR-548acの発現量とは相関しており、血中のmiR-628-3p及びmiR-548acは、SJSの重症度の判定の指標として用いることが可能である。したがって、SJSの罹患可能性、重症度、治療効果等の判定等の指標として有用であると考えられた。
本発明によると、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)を始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の罹患可能性、発症及び/又は重症化リスク、治療効果等の判定が可能となる。具体的には、SJS疾患特異的に発現が変動するマイクロRNAは、医学的に有用な生物学的指標となり、また、疾患重症度と相関するマイクロRNAは、治療効果の評価を可能とする。本発明は、難治性眼表面疾患の結膜上皮組織を標的とする疾患特異的マイクロRNA発現プロファイリンクによる非侵襲的な診断技術の確立と治療法選択への活用という新しい医療技術の提供につながる。さらに本発明は、難治性眼表面疾患であるStevens-Johnson症候群(SJS)を始めとする炎症性疾患や、その他自己免疫疾患の新規治療方法を提供することもできる。

Claims (6)

  1. 被験者由来の結膜上皮組織中のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535、並びに被験者由来の血漿中のmiR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAを指標とし、
    miR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に、及び/又はmiR-125a-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に、Stevens-Johnson症候群(SJS)に罹患している可能性があると評価する、ここで、上記コントロールとしては、miR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAについては正常被検者由来の結膜上皮組織を用い、miR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAについては正常被験者由来の血漿を用いる、被験者におけるStevens-Johnson症候群(SJS)の罹患可能性の判定を補助する方法。
  2. 被験者由来の結膜上皮組織中のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535、並びに被験者由来の血漿中のmiR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAを指標とし、
    miR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に、及び/又はmiR-125a-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に、その増加及び/又は低下の程度によって、被験者におけるStevens-Johnson症候群(SJS)の重症度を判定する、ここで、上記コントロールとしては、miR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAについては正常被検者由来の結膜上皮組織を用い、miR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAについては正常被験者由来の血漿を用いる、被験者におけるStevens-Johnson症候群(SJS)の重症度の判定を補助する方法。
  3. 被験者由来の結膜上皮組織中のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535、並びに被験者由来の血漿中のmiR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAを指標とし、
    miR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に、及び/又はmiR-125a-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に、その増加及び/又は低下の程度によって、被験者におけるStevens-Johnson症候群(SJS)の発症及び/又は重症化リスクを判定する、ここで、上記コントロールとしては、miR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAについては正常被検者由来の結膜上皮組織を用い、miR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAについては正常被験者由来の血漿を用いる、被験者におけるStevens-Johnson症候群(SJS)の発症及び/又は重症化リスクの判定を補助する方法。
  4. Stevens-Johnson症候群(SJS)患者の被験者由来の結膜上皮組織中のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-125a-5p、miR-72-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535、並びにStevens-Johnson症候群(SJS)患者の被験者由来の血漿中のmiR-628-3p及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAを指標とし、
    治療後のmiR-455-3p、miR-31-5p、miR-72-5p、miR-628-3p、及びmiR-548acから成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、治療前と比較して低下している場合に、及び/又は治療後のmiR-125a-5p、miR-193b-5p、miR-204-3p及びmiR-3535から成る群より選択される少なくとも1種のマイクロRNAの発現量が、治療前と比較して増加している場合に、治療効果があったと判定し、変化なしの場合には治療効果がなかったと判定し、上記と逆の変化を示した場合には、悪化したと判定する、被験者におけるStevens-Johnson症候群(SJS)の治療効果の判定を補助する方法。
  5. miR-455-3pのアンチセンスオリゴヌクレオチドを有効成分とする、Stevens-Johnson症候群(SJS)の予防及び/又は治療剤。
  6. 上記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、修飾されている、請求項6に記載の予防及び/又は治療剤。
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