JP7536085B2 - Lgr5及びegfrに結合する抗体とトポイソメラーゼi阻害剤との組合せを用いる癌の治療 - Google Patents
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Description
当該可変ドメインの重鎖可変領域は、図8に表されるMF3370MF3755;MF4280若しくはMF4289からなる群から選択されるEGFR特異重鎖可変領域の少なくともCDR3配列を含み、又は当該可変ドメインの重鎖可変領域は、図8に表されるMF3370;MF3755;MF4280若しくはMF4289からなる群から選択されるVHのCDR3配列と、最大3個、好ましくは最大2個、好ましくは1個のアミノ酸が異なる重鎖CDR3配列を含む。当該可変ドメインは、好ましくは、MF3370;MF3755;MF4280若しくはMF4289の少なくともCDR3配列を含む、重鎖可変領域を含む。
-図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;を含み、
LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖は、
-図8に表されるVH鎖MF5790のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF5790のアミノ酸配列を含む。
-図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;を含み、
LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖は、
-図8に表されるVH鎖MF5803のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF5803のアミノ酸配列を含む。
-図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;を含み、
LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖は、
-図8に表されるVH鎖MF5814のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF5814のアミノ酸配列を含む。
-図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;を含み、
LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖は、
-図8に表されるVH鎖MF5816のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF5816のアミノ酸配列を含む。
-図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;を含み、
LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖は、
-図8に表されるVH鎖MF5817のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF5817のアミノ酸配列を含む。
-図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列;を含み、
LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖は、
-図8に表されるVH鎖MF5818のアミノ酸配列;又は
-当該VHに対して、最大15個、好ましくは1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個、好ましくは1個、2個、3個、4個又は5個のアミノ酸挿入、欠失、置換又はこれらの組合せを有する、図8に表されるVH鎖MF5818のアミノ酸配列を含む。
細胞株:
フリースタイル293F細胞(カタログ番号p/n51-0029)をInvitrogenから入手し、293フリースタイル培地中で日常的に維持した。HEK293T(ATCC-CRL-11268)、及びCHO-K1(DSMZ ACC110)細胞株をATCCから購入し、L-グルタミン(Gibco)及びFBS(Lonza)を補充したDMEM/F12(Gibco)中で日常的に維持した。
二重特異性抗体を、二重特異性抗体の効率的なヘテロ二量体化及び形成を確実に行うために、独自のCH3遺伝子操作技術を用いて、異なるVHドメインを有するIgGをコードする2つのプラスミドを一過性共トランスフェクションすることによって生成した。共通軽鎖もまた、同じプラスミド又は別のプラスミド上のいずれかで同じ細胞に共トランスフェクションされる。本出願人らによる出願(例えば、国際公開第2013/157954号及び国際公開第2013/157953号、参照により本明細書に組み込まれる)では、単一の細胞から二重特異性抗体を産生するための方法及び手段を開示しており、これにより、単一特異性抗体の形成よりも二重特異性抗体の形成を有利にする手段が提供される。本発明では、これらの方法を好適に採用することができる。具体的には、二重特異性完全長IgG分子のみを基本的に生成するのに好ましい変異は、第1のCH3ドメイン中の351及び366位でのアミノ酸置換、例えばL351K及びT366K(EU番号付けに従っての番号付け)(「KK-変異体」重鎖)、及び第2のCH3ドメイン中の351及び368位でのアミノ酸置換、例えばL351D及びL368E(「DE-変異体」重鎖)、又はその逆である(図10d)及び図10e)を参照されたい)。これは、負に帯電したDE-変異体重鎖及び正に帯電したKK-変異体重鎖が優先的に対をなし、ヘテロ二量体を形成する(いわゆる「DEKK」二重特異性分子)ことが、言及した出願により以前に実証されている。DE-変異体重鎖のホモ二量体化(DE-DEホモ二量体)又はKK-変異体重鎖のホモ二量体化(KK-KKホモ二量体)は、同一の重鎖間のCH3-CH3界面における荷電残基間の強い反発力のために、ほとんど発生しない。
濾過を使用して、フィルタプレート中で、滅菌条件下で精製を行った。まず、培地のpHをpH8.0に調整し、続いて、IgG含有上清を、タンパク質AセファロースCL-4Bビーズ(50%v/v)(Pierce)と共に、振盪プラットフォーム上、600rpmで25℃にて2時間インキュベートした。次に、濾過によりビーズを採取した。ビーズをPBS pH7.4で2回洗浄した。次いで、結合したIgGを、0.1Mクエン酸緩衝液で、pH3.0にて溶出させ、溶出液を、トリスpH8.0を用いて直ちに中和した。マルチスクリーンUltracel 10マルチプレート(Millipore)を使用して、遠心分離により緩衝液交換を行った。試料を最後に、PBS pH7.4中で採取した。IgG濃度をOctetを用いて測定した。タンパク質試料を4℃で保存した。
精製したIgGの量を決定するために、全ヒトIgG(Sigma Aldrich、カタログ番号I4506)を標準として使用して、タンパク質Aバイオセンサ(Forte-Bio、供給元の推奨に従って)を用いてOctet分析により抗体の濃度を決定した。
注射用の単一細胞懸濁液へと脱凝集させる前に、大型の癌スフェロイド構造(Tumoroids)を7日間成長させた。全てのマウス試験について、6~8週齢のメスのNOD.CB17/AlhnRj-Prkdcscid/Rjマウス(Janvier Labs)を使用した。
結腸直腸癌試料から派生したオルガノイドを、2mMのGlutaMax(Invitrogen)、10mMのHEPES(Invitrogen)、1倍のB27レチノイン酸フリーサプリメント(Invitrogen)、50ng/mLのEGF(Peprotech)、0.1μg/mLのNoggin(Peprotech)、Rock阻害剤Y-27632(Sigma-Aldrich)、10nMのPGE2(Sigma-Aldrich)、3μmのSB202190(Sigma-Aldrich)、10nMのガストリン(Tocris)、1μg/mLのR-SPO1(自家製)、10mMのニコチノアミド(Sigma-Aldrich)、1.25mMのN-アセチル-システイン(Sigma-Aldrich)、0.5μMのA83-01(Tocris)を追加した進行DMEM/F12(Invitrogen)から構成される培地を用いて、100%の基底膜抽出物(BME、Amsbio)中、37℃、5%CO2で培養した。分析前日に、オルガノイドを単一細胞に脱凝集した。この目的のために、オルガノイドを、培地を除去することによってBMEから最初に遊離させ、細胞回収溶液(BD Biosciences)にBMEを再懸濁し、氷上で1時間インキュベートした。その後、オルガノイドを遠心分離した(全ての遠心分離工程は5分間、4℃で200g)。ペレットを1mLの50%トリプシン/EDTA溶液(TE)、50%PBSに再懸濁させ、上下にピペット操作し、単一細胞懸濁液を得るまで定期的に視覚的に評価した。TEを10mLのPBS中で希釈し、遠心分離した。細胞を10mLのPBS中で2回洗浄した後にBMEに再懸濁し、これを50μLに分割して予熱したプレート(37℃)に滴下した。BME液滴を15分間放置した後、1滴あたり500μLの培地を添加した。12時間後、細胞回収溶液を使用して、細胞をBMEから単離した。氷上で1時間後、細胞を遠心分離し、0.5%BSA及び0.5mMのEDTA(染色緩衝液)を含有する10mLのPBS中で1回洗浄した。次いで、ペレットを染色緩衝液に再懸濁し、カウントした。
3つの進行性CRC患者の肝臓転移に由来するPDXモデル(表1)を選択した。2つのモデルは、KRAS変異体(それぞれM005及びM001についてのG13D及びG12D)であり、そのM005もまた、APC及びPIK3CA112_112del変異体である。
図3Aに従い、残りの102匹を治療し、マイクロCTを用いて毎週撮像した。肝臓及び肺の組織学的評価(ヘマトキシリン及びエオシン染色(H&E)染色)により、転移性病変の頻度及びサイズもまた決定した。剖検時に巨視的に大腸癌腹膜播種を検出し、後に組織学によりこれを確認した。
モデルM001:M001 PDXモデルは、本出願にその全体が組み込まれる、Puig et al.,A Personalized Preclinical Model to Evaluate the Metastatic Potential of Patient-Derived Colon Cancer Initiating Cells,Clin Cancer Res;19(24),6787-6801(2013)に記載されるように基本的に生成された。変異PIK3C C420R(https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic、変異ID COSM757)を保有する18種類の組織型を備える、Sanger Institute(UK)を参照されたい。第2の同所性モデルでは、注射されたヒト腫瘍細胞は、KRAS G12D及びPIK3CA-C420Rといった変異を伴うCRC肝臓転移に元々は由来していた。腫瘍細胞の注射を上記と同様に行った。以下の18匹のマウスを除外した。すなわち、外科手術後に死亡したもの(#11)、原発性腫瘍を有しないもの(#2)、大きすぎる腫瘍を有するマウス(#2)、低体重(#1)、病気の一般的兆候(#2)といったものである。投与及び治療管理体制は図6Aに従った。
分析モデル M005
MF3755及びMF5816のみを含む二重特異性EGFR/LGR5で治療されたマウスにおける平均腫瘍体積は、溶媒を与えられたマウスよりも低いものであった。ただし、イリノテカンのみで治療されたマウスの平均腫瘍体積ほど低いものではなかった。驚くべきことに、MF3755及びMF5816+イリノテカン併用治療を含む、二重特異性EGFR/LGR5を受けるマウスは、他の群の全てのマウスと比較すると低い腫瘍体積を有した(図3B、図3C)。興味深いごとに、治療終了後、MF3755及びMF5816を含む二重特異性EGFR/LGR5は、腫瘍体積における倍率変化で確認されるようなイリノテカンの腫瘍増大遮断効果を延長させた(図4A)。
MF3755及びMF5816のみを含む二重特異性EGFR/LGR5で治療されたマウスにおける平均腫瘍体積は、イリノテカンのみで治療されたマウスの平均腫瘍体積と非常に類似していた。ただし、MF3755及びMF5816+イリノテカン併用治療を含む、二重特異性EGFR/LGR5を受けるマウスは、他の群の全てのマウスのいずれかよりも低い腫瘍体積を有した(図6B、図6C)。MF3755及びMF5816+イリノテカンを含む、二重特異性EGFR/LGR5の組合せを受けるマウスでは、毒性は観察されなかった(図7A)。
屠殺時の転移性病変を決定するための組織学的分析は、MF3755及びMF5816又はイリノテカンを単独又は組合せのいずれかで含む二重特異性EGFR/LGR5で治療されたマウスが、治療されていないマウスよりも転移が少なかったことを実証していた(図7B)。
Claims (22)
- EGFR及び/又はLGR5を発現する癌の治療に使用するための、
i)EGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分、並びに、
ii)トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤
を含む組み合わせ物。 - 前記癌が、結腸直腸癌、肺癌、胃腸癌又は卵巣癌である、請求項1に記載の組み合わせ物。
- 前記癌が結腸直腸癌である、請求項1又は2に記載の組み合わせ物。
- 前記抗体又はその機能性部分、及び、前記ヒトトポイソメラーゼI阻害剤が、対象に同時に投与される、請求項1~3のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記抗体又はその機能性部分が、前記ヒトトポイソメラーゼI阻害剤に先立って前記対象に投与される、請求項1~3のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- EGFRに結合する前記可変ドメインのVH鎖が、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列、又は最大15個、好ましくは多くて10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個、1個、好ましくは多くて5個、4個、3個、2個、1個の、前記VHに対する挿入、欠失、置換、又はこれらの組合せを含むアミノ酸修飾を有する、図8に表されるVH鎖MF3755のアミノ酸配列を含み、LGR5に結合する前記可変ドメインのVH鎖が、図8に表されるVH鎖MF5816のアミノ酸配列、又は最大15個、好ましくは多くて10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個、1個、好ましくは多くて5個、4個、3個、2個、1個の、前記VHに対する挿入、欠失、置換、又はこれらの組合せを含むアミノ酸修飾を有する、図8に表されるVH鎖MF5816のアミノ酸配列を含み、アミノ酸の挿入、欠失、及び置換が、CDR1、CDR2、及びCDR3領域に存在しない、請求項1~5のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記EGFRに結合する可変ドメインのVH鎖が、図8に表されるMF3755のVH鎖のアミノ酸配列を含み、及び、LGR5に結合する可変ドメインのVH鎖が、図8に表されるMF5816のVH鎖のアミノ酸配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記ヒトトポイソメラーゼI阻害剤が、カンプトテシンである、請求項1~7のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記ヒトトポイソメラーゼI阻害剤が、イリノテカン又はトポテカンである、請求項1~7のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記抗体がADCC増強型である、請求項1~9のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記抗体がアフコシル化されている、請求項1~10のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 細胞培養系でEGFR及びLGR5を発現する前記細胞の増殖を阻害するための方法であって、前記方法が、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤、並びにEGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分を有する系を提供することを含む、方法。
- 医薬組成物であって、EGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分、並びに、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤を含む、医薬組成物。
- EGFRの細胞外部分に結合する可変ドメイン及びLGR5の細胞外部分に結合する可変ドメインを含む前記抗体又はその機能性部分、並びに、ヒトトポイソメラーゼI阻害剤が、単剤で提供される、請求項13に記載の医薬組成物。
- EGFRの細胞外部分に結合する可変ドメイン及びLGR5の細胞外部分に結合する可変ドメインを含む前記抗体又はその機能性部分、並びに、ヒトトポイソメラーゼI阻害剤が、別個の製剤で提供される、請求項13に記載の医薬組成物。
- EGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む、抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤、並びにEGFR及び/又はLGR5を発現する癌の治療において前記抗体及び前記ヒトトポイソメラーゼI阻害剤を使用するための指示を含む、キット。
- 対象における胃腸癌の治療に使用するための、EGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分を含む組成物であって、前記抗体が、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤と共に、同時に、別々に又は連続投与され、前記癌がEGFR及び/又はLGR5を発現する、組成物。
- 対象における癌の治療のための薬剤の製造に使用するための、EGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分を含む組成物であって、前記癌がEGFR及び/又はLGR5を発現し、前記抗体が、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤と共に、同時に、別々に又は連続投与される、組成物。
- 結腸直腸癌、肺癌、胃腸癌、又は卵巣癌の治療のための、請求項18に記載の組成物。
- 結腸直腸癌の治療のための、請求項19に記載の組成物。
- トポテカン、イリノテカン、ギマテカン、カンプトテシン、9-ニトロ-カンプトテシン及びPNU-166148から選択されるヒトトポイソメラーゼI阻害剤と組み合わせて使用するための、癌を治療するための組成物であって、
EGFRの細胞外部分に結合する、配列番号17を有するCDR1、配列番号19を有するCDR2、及び配列番号21を有するCDR3を含む可変ドメイン、並びにLGR5の細胞外部分に結合する、配列番号69を有するCDR1、配列番号71を有するCDR2、及び配列番号73を有するCDR3を含む可変ドメインを含む抗体又はその機能性部分であって、アミノ酸配列QSISSYを含むLCDR1、アミノ酸配列AASを含むLCDR2、及びアミノ酸配列QQSYSTPを含むLCDR3を含む軽鎖を含む抗体又はその機能性部分を含み、前記癌がEGFR及び/又はLGR5を発現する、組成物。 - 抗体またはその機能性部分を含む組成物が、ヒトトポイソメラーゼI阻害剤と同時に、別々に又は連続投与されるためのものである、請求項21に記載の組成物。
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