JP7488774B2 - 化合物 - Google Patents
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Description
本出願は、2018年6月25日(25.06.2018)に出願されたUS62/689602の利益及び優先権を主張するものであり、これらの内容は、本明細書中に参考文献としてその全てが援用される。
式(I)の化合物は下式:
-X-は、-C(O)-を表し;
-R1は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、フェニルアラニン、ロイシン、ノルロイシン、バリン又はノルバリン残基であり;
-R2は、1個のヒドロキシル基で所望により置換されているC1~4アルキルであり;
-R3は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、トレオニン残基であり;
-R4は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、L-DapなどのDapであり;
-R8は、水素又はメチルであり;
-R15は、基:
-R16は、水素であり;
-R17は、水素であり;
-L-は、共有結合又はメチレン(-CH2-)であり;
-Arは、置換フェニルなどの所望により置換されているアリールである]
のように表される。
-R1、-R2、-R8及び-Arは、上記と同じ意味を有する]
のように表され、更に、その医薬的に受容可能な塩、溶媒和物、保護された形態及びプロドラッグ形態である。
更なる一つの側面において、治療又は予防の方法において使用するための、式(I)の化合物、又は式(I)の化合物を含んでなる医薬組成物を提供する。
本発明はまた、それを必要とする被験者に式(I)の化合物、又は式(I)の化合物を含んでなる医薬組成物を投与するステップを含む、治療の方法を提供する。上記方法は微生物感染を治療するための方法であり得る。
本発明のこれら及び他の側面及び態様を下記で更に詳細に記載する。
ポリミキシン化合物
式(I)の化合物は、ポリミキシンノナペプチドシリーズの化合物のN末端誘導体である。式(I)の化合物の核は、3位におけるアミノ酸残基がDapで置換されているポリミキシンBノナペプチド(PMBN、ポリミキシンB2-10)などのノナペプチドの誘導体である。所望により、6位及び/又は7位におけるアミノ酸残基が、本明細書に記載のものなどの別のアミノ酸で置換されている。式(I)の化合物は、ポリミキシン核のN末端において基-X-R15を有する。これを下記で詳細に記載する。
基-R1は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、ポリミキシンシリーズの化合物での6位におけるアミノ酸残基に対応する。
-R2
基-R2は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、ポリミキシンシリーズの化合物での7位におけるアミノ酸残基に対応する。
一つの態様において、-R2は、C1~4アルキルである。この基は、置換されていない。
7位における基、アミノ酸残基は、ポリミキシンB及びコリスチンの7位におけるアミノ酸残基と同じであってもよい。すなわち、R2は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、L-Leu残基であってもよい。
一つの態様において、-R2は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、L-ロイシン、L-トレオニン又はL-Abuなどのロイシン、トレオニン又はアミノ酪酸(Abu)残基である。
-R3
基-R3は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、ポリミキシンシリーズの化合物での10位におけるアミノ酸残基に対応する。
-R4
基-R4は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、ポリミキシンシリーズの化合物での3位におけるアミノ酸残基に対応する。
式(I)の化合物では、Dap側鎖内のアミノ基は保護されていてもよく、例えば、そのアミノ基はBocで保護されていてもよい。
基-R8は、カルボニル基及びこれが、ヒドロキシメチレンスペーサー(-CH(OH)-)を介して接続している炭素に対してベータにある窒素と一緒に、ポリミキシンシリーズの化合物での2位におけるアミノ酸残基に対応する。
一つの態様において、-R8は、メチルである。従って、得られるアミノ酸はThrである。
典型的には、-R8は、メチルである。
基-X-は、-C(O)-*である。
星印は、NH、ポリミキシンノナペプチド核のアミノ末端、2位におけるアミノ酸などへの接続点を示している。基-X-の左側は、-R15への接続点である。
基-R15は、-X-と一緒に、ポリミキシン核のN末端の修飾部である。
本発明の化合物は、N末端部分、-R15でのγ-アミノプロピル基のβ位において立体中心を含有する。立体異性体の一つが、より低い細胞傷害性及びより低い腎臓中薬物レベルと関連していることが見出されている。この立体異性体は、本出願の実例で詳細に記載するとおり、逆相クロマトグラフィーで、より早く溶離する立体異性体である。
この立体型は、逆相クロマトグラフィーにおいて、より早く溶離する立体型である。
別法では、基-R15は:
この立体型は、より遅く溶離する立体型である。
一つの態様において、基-R15は:
一つの態様において、基-R15は:
-R15内の例示的な基を以下に提示する。
-R16及び-R17
基-R16及び-R17は両方とも水素である。
-L-
この基は、共有結合メチレン(-CH2-)であってもよい。
-Ar
基-Arは、カルボアリール又はヘテロアリール基などのアリール基である。アリール基は所望により置換されている。
基-Arは、フェニルであってもよく、これは所望により置換されており、例えば置換されている。一つの態様において、-Arは、非置換フェニルである。
ハロ基は、フルオロ、クロロ、ブロモ及びヨードから選択されてよく、フルオロ及びクロロ、例えばクロロから選択され得る。
アルキル基は、C1~6アルキル、例えばC1~4アルキル、例えばC1~3アルキル、例えばC3アルキルであってもよい。
アルキル基は、i-プロピルであってもよい。
-RSがアリール基である場合、これはカルボアリール又はヘテロアリールであってもよい。アリールは、C5~6アリール、例えばC5アリールであってもよい。C5アリールは、チオフェニル、フラニル、ピロリル、ピラゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、オキサゾリル及びイソオキサゾリルから選択され得る。C6アリールはフェニルであってもよい。
アリール基はそれ自体、1、2又は3個の-RAr基、例えば1又は2個の基、例えば1個の基(一置換)で所望により置換されていてもよい。各基-RArは独立に、ハロ、アルキル、ハロアルキル及びアリール、例えばハロ及びアルキルから選択される。これらの基は、アリール基が置換されていないことを除いて、上記の基と同じ意味を有してもよい。
ハロフェニルは、2-クロロフェニルなどの2-ハロフェニル、3-クロロフェニルなどの3-ハロフェニル、及び4-クロロフェニルなどの4-ハロフェニルから選択され得る。
基-Arは、2-クロロフェニルであってもよい。
選択される-R15基
基-R15は、以下:
基-R15は、以下:
基-R15は、以下:
式(I)の化合物に関連する態様
幾つかの態様において、式(I)の化合物は、以下に図示するとおりのR1、R2、R3、及びR4部分の配向を有する式(Ia):
の化合物又はその医薬的に受容可能な塩、溶媒和物、保護された形態若しくはプロドラッグ形態である。
-R1が、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、D-フェニルアラニン、D-ロイシン又はD-ノルロイシンであり;
-R2が、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、L-ロイシン、L-アミノブチラート、又はL-トレオニン残基であり;
-R3が、L-トレオニンであり;
-R4が、L-Dapであり;
-R8が、メチルであり;
R15-X-が、
化合物(II)及び化合物(III)
式(I)の化合物は、以下に示すとおりの式(II):
式(I)の化合物は、以下に示すとおりの式(IIa):
式(I)の化合物は、以下に示すとおりの式(IIb):
式(I)の化合物は、以下に示すとおりの式(III):
式(I)の化合物は、以下に示すとおりの式(III):
ポリミキシン化合物
本出願で使用するための化合物は、ポリミキシンBノナペプチド及びコリスチンノナペプチドなどの既知のポリミキシン化合物の修飾形態に基づく。
に示す構造を有する。
本発明の化合物の調製は、当業者には、特に、修飾ポリミキシンノナペプチドを調製するためのWO2015/135976に記載の方法について知識がある当業者にはよく分かるであろう。本出願で用いられる新規のN末端基を考慮して、当技術分野に記載の方法を本出願の化合物の調製において使用するために容易に適合させることができる。
本発明の更なる一つの側面において、式(X):
-R16は、水素であり;
-R17は、水素であり;
-L-は、共有結合又はメチレンであり;
-Arは、置換フェニルなどの所望により置換されているアリールである]
の化合物並びにその塩、溶媒和物、保護された形態及び活性化形態を提供する。
典型的には、基-NR16R17であるアミノ官能基を保護する。
基-R1、-R2、-R3、-R4及び-R8に関して式(I)の化合物で選択された態様が、式(XI)の化合物にも当てはまる。
式(X)のカルボン酸は、標準的な活性化剤、例えば、DIC(N,N’-ジイソプロピルカルボジイミド)又はEDCI(水溶性カルボジイミド;1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド)などのカルボジイミドの反応によって活性化させることができる。上記酸の活性化形態は、O-アシルイソ尿素である。
保護された形態
式(I)の化合物、(II)及び(III)の化合物などの本発明の化合物は、保護された形態で提供することができる。ここで、反応性官能基、例えばアミノ官能基は、合成工程中のその反応を防止するために遮蔽することができる。保護基は、反応性官能基を遮蔽するために提供され、この保護基は、本来の反応基の官能基を明らかにするために合成の後の段階で除去することができる。
側基保護を、所望によってアミノ及びカルボキシ保護と一緒に有するアミノ酸は、商業的に入手可能である。従って、保護されたポリミキシン化合物は、適当に保護されたアミノ酸出発物質から調製することができる。
一つの態様において、保護基は、酸に不安定、塩基に不安定であるか、又は還元条件下で除去可能である。
一つの態様において、アミノ官能基のための保護基は、Boc、ivDde、CbZ、Bn並びにFmoc及びHSO3-Fmocから選択される。
Boc保護を、5、8及び9位に、及び所望により3位に存在するアミノ酸残基の側鎖に存在するアミノ官能基に与えてもよい。
一つの態様において、ヒドロキシル官能基のための保護基はtBuである。
幾つかの態様において、幾つかの種類の官能基のみが保護される。例えば、アミノ基を、例えばアミノ酸残基の側鎖のアミノ基のみを保護してもよい。
LogP
式(I)、(II)又は(III)の化合物などの本発明の化合物は、ある特定の限界内のLogP値として表されるような分配係数を有し得る。分配係数は、化合物の親油性の指標を与え得る。
例えば、LogPに対する言及は、本明細書中に参考文献としてその全てが援用されるGhose et al.J.Phys.Chem.A,1998,102,3762~3772に記載の方法を使用して決定され得るALogPに対する言及であり得る。従って、ALogPは、LogPでのGhose/Crippen基寄与推定値である。
式(I)、(II)又は(III)の化合物は、それぞれ、第2の活性剤と一緒に使用することができる。本発明人等は、このような組合せが、両方の化合物の個々の活性から予測されるものであるものより大きい生物学的活性を有することを見出している。式(I)、(II)又は(III)の化合物は、第2の活性剤の活性を増強するために使用することができる。特に、式(I)、(II)又は(III)の化合物は、薬剤の、例えばグラム陰性細菌に対する抗菌活性を向上するために第2の活性剤と一緒に使用することができる。
一つの態様において、第2の活性剤は、特定の微生物、例えばグラム陰性細菌に対する、4より大きい、8より大きい、16より大きい、又は32マイクログラム/mLより大きい測定されたMIC値を有する活性剤である。この態様において、第2の活性剤は、グラム陽性細菌に対して活性であることができる。例えば、第2の活性剤は、特定のグラム陽性細菌に対する、10より小さい、5より小さい又は1マイクログラム/mLより小さい測定されたMIC値を有する活性剤である。ここで、式(I)、(II)又は(III)の化合物は、グラム陰性細菌の細胞への第2の活性剤の取込みを容易にするために作用する。従って、第2の活性剤は、グラム陰性細菌の細胞内の標的に作用することが可能であり、この標的は、グラム陽性細菌の細胞中の第2の活性剤の標的と同じであることができる。
塩、溶媒和物及び他の形態
式(I)、(II)及び(III)の化合物の塩の例は、全ての医薬的に受容可能な塩、例えば、制約されるものではないが、強無機酸の酸付加塩、例えばHCl及びHBr塩、並びに強有機酸の付加塩、例えばメタンスルホン酸塩を含む。塩の更なる例は、硫酸塩及び酢酸塩、例えばトリフルオロ酢酸塩又はトリクロロ酢酸塩を含む。
式(I)、(II)若しくは(III)の化合物、又は本明細書に記載のいずれかの他の化合物に対する言及は、更にこの化合物の溶媒和物に対する言及でもある。溶媒和物の例は、水和物を含む。
一つの態様において、実質的に精製された形態は、少なくとも50重量%、例えば少なくとも60重量%、例えば少なくとも70重量%、例えば少なくとも80重量%、例えば少なくとも90重量%、例えば少なくとも95重量%、例えば少なくとも97重量%、例えば少なくとも98重量%、例えば少なくとも99重量%である。
式(I)、(II)又は(III)の化合物、又はこれらの化合物を含有する医薬的製剤は、治療及び予防の方法における使用のために適している。化合物は、それを必要とする被験者に投与することができる。化合物は、活性剤(“第2の活性剤”)、例えば第2の活性剤、即ち、抗細菌剤と一緒の使用のために適している。
微生物感染は、細菌感染、例えばグラム陰性菌感染であることができる。
活性剤は、微生物に対して活性を有する薬剤であり得る。活性剤は、グラム陰性菌に対して活性であり得る。活性剤は、上に示されたリストから選択される微生物に対して活性であり得る。
リファンピシン、リファブチン、リファラジル、リファペンチン、及びリファキシミン;
オキサシリン、メチシリン、アンピシリン、クロキサシリン、カルベニシリン、ピペラシリン、トリカルシリン、フルクロキサシリン、及びナフシリン;
アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、テリスロマイシン、セスロマイシン、及びソリスロマイシン;
アズトレオナム及びBAL30072;
メロペネム、ドリペネム、イミペネム、エルタペネム、ビアペネム、トモペネム、及びパニペネム;
チゲサイクリン、オマダサイクリン、エラバサイクリン、ドキシサイクリン、及びミノシクリン;
シプロフロキサシン、レボフロキサシン、モキシフロキサシン、及びデラフロキサシン;
フシジン酸;
ノボビオシン;
テイコプラニン、テラバンシン、ダルババンシン、及びオリタバンシン、
並びにその医薬的に受容可能な塩及び溶媒和物;
が含まれる。
用語“治療”は、症状を治療する文脈において本明細書中で使用される場合、ヒト又は動物(例えば獣医学的適用)であるかに関わらず、一般的に、幾つかの所望の治療効果、例えば、症状の進行の阻害が達成される治療及び療法に関係し、進行の速度の減少、進行の速度の停止、症状の徴候の軽減、症状の回復、及び症状の治癒を含む。予防的手段(即ち予防法)としての治療も更に含まれる。例えば、症状をいまだ発症していないが、しかし症状を発症する危険性を持つ患者に伴う使用は、用語“治療”に包含される。
式(I)、(II)又は(III)の化合物は、活性剤と併せて投与することができる。
投与の方法及び様式は、式(I)、(II)又は(III)の化合物及び第2の活性剤の薬物動態に依存するものである。
“別個”投与によって、式(I)、(II)又は(III)の化合物及び第2の薬剤が、同時に起こる二つの異なった経路の投与によって被験者に投与されることを意味する。これは、例えば一つの薬剤が注入によって投与され、他方が注入の過程中に経口投与される場合に起こり得る。
被験者に投与される式(I)、(II)又は(III)の化合物の量は、最終的に、被験者の特質及び治療される疾病に依存するものである。同様に、被験者に投与される活性剤の量は、最終的に、被験者の特質及び治療される疾病に依存するものである。
一つの側面において、本発明は、式(I)、(II)又は(III)の化合物を、医薬的に受容可能な担体と一緒に含んでなる医薬組成物を提供する。医薬組成物は、第2の活性剤を更に含んでなることができる。別の態様において、第2の活性剤が療法のために提供される場合、第2の活性剤は、式(I)、(II)又は(III)の化合物と別個に処方することができる。従って、式(I)、(II)又は(III)の化合物に関して以下で行われる解説は、別個に処方される場合、第2の活性剤にも適用することができる。
製剤は、適当には、液体、溶液(例えば、水性、非水性)、懸濁液(例えば、水性、非水性)、乳液(例えば、水中油、油中水)、エリキシル、シロップ、舐剤、口腔洗浄剤、ドロップ、錠剤(例えば、被覆錠剤を含む)、顆粒、粉末、ロゼンジ、トローチ、カプセル(例えば、硬質及び軟質ゼラチンカプセルを含む)、カシェー、丸薬、アンプル、ボーラス、座薬、ペッサリー、チンキ、ゲル、ペースト、軟膏、クリーム、ローション、油、泡、噴霧、霧、又はエアゾールの形態であることができる。
口腔粘膜経由投与のために適した製剤は、液体、溶液(例えば、水性、非水性)、懸濁液(例えば、水性、非水性)、乳液(例えば、水中油、油中水)、口腔洗浄剤、ロゼンジ、トローチ、並びに貼布、絆創膏、デポー、及びリザーバーを含む。
錠剤は、慣用的手段、例えば、所望によって一つ又は複数の補助成分と共に、圧縮又は成形することによって製造することができる。圧縮錠剤は、自由流動形態、例えば粉末又は顆粒の化合物を、所望によって一つ又は複数の結合剤(例えば、ポビドン、ゼラチン、アラビアゴム、ソルビトール、トラガカントゴム、ヒドロキシピロピルメチルセルロース);充填剤又は希釈剤(例えば、ラクトース、微結晶セルロース、リン酸水素カルシウム);潤滑剤(例えば、ステアリン酸マグネシウム、タルク、シリカ);崩壊剤(例えば、グリコール酸デンプンナトリウム、架橋ポビドン、架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム);表面活性或いは分散又は湿潤剤(例えば、ラウリル硫酸ナトリウム);保存剤(例えば、p-ヒドロキシ安息香酸メチル、p-ヒドロキシ安息香酸プロピル、ソルビン酸);芳香剤、芳香向上剤、及び甘味剤と共に混合し、適した機械で圧縮することによって調製することができる。成形錠剤は、不活性液体希釈剤で湿潤化された粉末の化合物の混合物を、適した機械で成形することによって製造することができる。錠剤は、所望によって被覆し、又は刻み目を入れることができ、例えば、所望の放出特性を提供するために、各種の比率のヒドロキシプロピルメチルセルロースを使用して、その中の化合物の緩慢又は制御放出を提供するように処方することができる。錠剤は、所望によって被覆、例えば、放出に影響するために、例えば胃ではなく腸の一部における放出を提供するための腸溶性被覆を伴って提供することができる。
クリームは、典型的には、化合物及び水中油クリーム基剤から調製される。所望する場合、クリーム基剤の水相は、例えば、少なくとも30重量/重量%の多価アルコール、即ち、二つ又はそれより多いヒドロキシル基を有するアルコール、例えばプロピレングリコール、ブタン-1,3-ジオール、マンニトール、ソルビトール、グリセロール及びポリエチレングリコール並びにこれらの混合物を含むことができる。局所製剤は、好ましくは、皮膚又は影響された他部位を通る化合物の吸収又は浸透を向上する化合物を含むことができる。このような皮膚透過向上物質の例は、ジメチルスルホキシド及び関連する類似体を含む。
直腸投与のために適した製剤は、例えば天然の又は硬化された油、ワックス、脂肪、半液体又は液体ポリオール、例えば、ココアバター又はサリチル酸塩を含んでなる適した基剤を伴う座薬として;或いは浣腸による治療のための溶液又は懸濁液として提示することができる。
一般的に、本発明の方法は、抗細菌効果を提供するために、有効な量の式(I)、(II)又は(III)の化合物を被験者に投与することを含んでなることができる。式(I)、(II)又は(III)の化合物は、第2の活性剤の活性を増強するために十分な量で投与することができる。第2の活性剤は、抗細菌効果を提供するように有効な量で被験者に投与される。
本発明の一つの側面は、例えば、典型的には適した容器中で及び/又は適した包装を伴って提供される(a)式(I)、(II)又は(III)の化合物、又は式(I)、(II)又は(III)のいずれか一つにおいて定義されるような化合物を含んでなる組成物;及び(b)化合物又は組成物を投与する方法に対する使用のための指示、例えば文書の指示を含んでなるキットに関する。
一つの態様において、キットは、更に(c)第2の活性剤、又は第2の活性剤を含んでなる組成物を含んでなる。ここで、文書の指示は、更に式(I)、(II)又は(III)の化合物と一緒の第2の活性剤が、治療のために適している適応症のリストを含むことができる。
式(I)、(II)又は(III)の化合物、第2の活性剤、又は式(I)、(II)若しくは(III)の化合物又は第2の活性剤を含んでなる医薬組成物は、全身的に/末梢的に又は局所的に(即ち、所望の作用の部位において)を問わず、いずれもの慣用的な投与の経路によって被験者に投与することができる。
被験者/患者は、脊索動物、脊椎動物、哺乳動物、有胎盤哺乳動物、有袋類(例えば、カンガルー、ウオンバット)、齧歯類(例えば、モルモット、ハムスター、ラット、マウス)、ネズミ(例えば、マウス)、ウサギ(例えば、兎)、鳥類(例えば、鳥)、イヌ(例えば、犬)、ネコ(例えば、猫)、ウマ(例えば、馬)、ブタ(例えば、豚)、ヒツジ(例えば、羊)、ウシ(例えば、牛)、霊長動物、サル(例えば、猿又は類人猿)、サル(例えば、マーモセット、ヒヒ)、類人猿(例えば、ゴリラ、チンパンジー、オランウータン、手長猿)、又はヒトであることができる。更に、被験者/患者は、その成長の形態のいずれか、例えば胎児であることができる。
本発明が、微生物感染を有する非ヒト動物に対して実行することができることも更に想定されている。非ヒトの哺乳動物は、齧歯類であることができる。齧歯類は、研究所の研究に使用される、ラット、マウス、モルモット、チンチラ及び他の類似のサイズの小さい齧歯類を含む。
先に記載した態様のそれぞれの及びあらゆる適合性の組合せは、それぞれの及びあらゆる組合せが、個々に、明確に引用されているように、本明細書中に明確に開示される。
“及び/又は”は、本明細書中で使用される場合、二つの具体的な特徴又は成分のそれぞれの、他方を伴う、又は伴わない具体的な開示と解釈されるものである。例えば、“A及び/又はB”は、(i)A、(ii)B並びに(iii)A及びBのそれぞれの、単にそれぞれが本明細書中に個々に記述されたような、具体的な開示と解釈される。
N末端酸の合成
本作業において、3-置換4-アミノブタン酸を適切に保護された形態で使用した。非標準アミノ酸の合成を、鏡像異性体分離のための方法と一緒に下記で詳述する。
1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 2.71-2.79 (2H, m), 3.66(3H, s), 3.93-4.01 (1H, m), 4.62及び4.73 (2H, ABq, 見かけ上2x dd , J 12.8, 8.0 Hz), 7.11-7.28 (4H, m).
(ii)4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸メチル
4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸メチル(4.80g)、二炭酸ジ-tert-ブチル(5.28g)及びジクロロメタン(100mL)の混合物を18時間、室温で撹拌した。混合物を乾燥状態まで蒸発し、残渣をシリカで、石油エーテル40-60及び酢酸エチル(0~100%)で溶離して精製した。適切な画分を合わせ、乾燥状態まで蒸発し、Boc-保護された4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸メチルエステルをクリーム状の固体(2.59g)として生成した。
(iv)標題化合物 - 異性体の分離 - 方法1
4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸(2.09g)を60mg/mLまでメタノール中に溶解し、次いで、下記の条件(分取分離条件1)を用いるSFCによって精製した。富化した異性体1(早く流出)及び異性体2(遅く流出)を含有する合わせた画分を合わせ、濃縮し、それぞれを個々に、同じクロマトグラフィー条件下で再精製した。
白色の固体、883mg、95.6%ee。分析システム1で保持時間2.89分
4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸(異性体2)
白色の固体、876mg、98.6%ee。分析システム1で保持時間3.29分
分取分離条件1:
Berger Multigram II SFC
カラム詳細:Lux A1(Phenomenex、21.2mm×250mm、5μm)
カラム温度:40℃
流速:50mL/分
BPR:125BarG
検出器波長:210nm
注入体積:300μL(18mg)
定組成条件:12:88 EtOH:CO2(0.1%v/vNH3)
分析条件1:
Waters UPC2
カラム詳細:Lux C4(Phenomenex、4.6mm×250mm、5μm)
カラム温度:40℃
流速:4mL/分
検出器波長:210~400nm
注入体積:1.0μL
BPR:125BarG
定組成条件:10:90 EtOH:CO2(0.1%v/vNH3)
(v)標題化合物 - 異性体の分離 -方法2
4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸を、下記の条件(分取分離条件2)を用いるSFCによって精製した。分離後に、画分を、回転蒸発器を介して浴温度40℃で乾燥して、所望の分離された鏡像異性体を得た。より遅く流出した鏡像異性体を同じカラムで、20%Bで溶離して更に精製した。
機器:Thar200分取SFC(SFC-10)
カラム:ChiralPak AY、300×50mm内径、10μm
移動相:AはCO2及びBはIPA
勾配:B25%
流速:200mL/分
背圧:100バール
カラム温度:38℃
波長:220nm
循環時間:約4.5分
分析条件2:
機器:Waters UPC2分析用SFC(SFC-H)
カラム:ChiralPak AY、150×4.6mm内径、3μm
移動相:AはCO2及びBはIPA(0.05%DEA)
勾配:B5~40%
流速:2.5mL/分
背圧:100バール
カラム温度:40℃
波長:220nm
4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸(異性体1)。
保持時間2.796分。下記の異性体(2)との比較によって、(R)-立体化学を指定した。
保持時間3.264分。下記のとおりのBOC-保護された物質の小分子結晶学によって、(S)-立体化学を指定した。
(S)-4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸のトリフルオロ酢酸塩
ジクロロメタン(20ml)中の4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸異性体2(分析方法2で保持時間3.264分)(1.5g、4.78mmol)の冷却された氷水溶液に、トリフルオロ酢酸(5mL)を添加した。添加の後に、混合物を4時間、この温度で撹拌した。次いで、反応混合物を濃縮した。粗製の混合物を水(10mL)中に溶解し、凍結乾燥して、生成物;(S)-4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸のTFA塩(1.5g、収率95%)を得た。LC-MS:m/z214(M+H)+
(S)-4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸
水(10mL)中の(S)-4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸のトリフルオロ酢酸塩(0.5g、1.53mmol)の溶液に、pHが7に達するまで希水酸化アンモニウム水溶液を添加した。得られた溶液を、開放した25mLフラスコで貯蔵し、一日、室温で放置した。結晶化したら、母液をデカンテーションし、固体の結晶をX線回折研究にかけた。
X線回折条件:
Bruker APEX-II CCD回折計を使用した。
m/z 314(MH+)、C15H2OClNO4の正確な質量は、313.11。
m/z 294(MH+)、C16H23NO4の正確な質量は、293.16。
m/z316、318(MH+)。C12H14BrNO4は315.01を要する。
m/z286及び288(MH+)、C12H16BrNO2の正確な質量は、285.04。
m/z386及び388(MH+)、C17H24BrNO4の正確な質量は、385.09。
m/z364(MH+)。C21H33NO4の正確な質量は、363.24。
1,4-ジオキサン(3mL)及び水(3mL)中の4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-(3-イソブチルフェニル)ブタン酸エチル(74mg、0.2mmol)及び水酸化リチウム(15mg、0.6mmol)の混合物を16時間、室温で撹拌した。混合物を乾燥状態まで蒸発し、残渣を酢酸エチル及び水間で分配した。有機相を分離し、廃棄した。水相(aqueous)を1M HCl(水溶液)で酸性化し、酢酸エチル(×2)で抽出した。有機抽出物を合わせ、MgSO4で乾燥し、濾過し、乾燥状態まで蒸発して、4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-イソブチルフェニル)ブタン酸を無色の油状物(65mg)として生成した。m/z336(MH+)C19H29NO4の正確な質量は、335.21。
m/z328(MH+)。C16H22ClNO4の正確な質量は、327.12。
m/z356(MH+)。C21H25NO4の正確な質量:355.18。
m/z258及び260(MH+) C10H12BrNO2の正確な質量:257.01.
(ii)3-(3-ブロモフェニル)-4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ブタン酸
m/z357.5及び359.4(MH+)。C15H20BrNO4の正確な質量:357.06。
1,4-ジオキサン(130mL)中の3-(3-ブロモフェニル)-4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ブタン酸(2.69g、7.51mmol)、フェニルボロン酸(2.3g、18.8mmol)、酢酸パラジウム(II)(84mg、0.38mmol)、Xphos(716mg、1.5mmol)及び第三リン酸カリウム(4781.9mg、22.53mmol)の混合物を2時間、100℃で窒素雰囲気下で撹拌した。次いで、混合物を室温に冷却し、セライトに通して濾過し、酢酸エチルで洗浄し、乾燥状態まで蒸発した。残渣をシリカで、石油エーテル及び酢酸エチル(0~100%)で溶離して精製した。適切な画分を合わせ、乾燥状態まで蒸発し、所望の生成物1.44gを灰色の固体(収率42%)として生成した。
実測値m/z355(M+)。C21H25NO4の正確な質量:355.18。
4-([1,1’-ビフェニル]-3-イル)-3-(((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)メチル)ブタン酸(1.44g)を30mg/mLまでMeOH中に溶解し、次いで、下記の方法を用いるSFCによって精製した。次いで、異性体1(早く流出)及び異性体2(遅く流出)のそれぞれの合わせた画分を、回転蒸発器を用いてほぼ乾燥状態まで蒸発し、DCMを含む最終容器に移し、これを圧縮空気流下で40℃で除去し、その後、真空炉内で40℃及び5mbarで、恒量まで貯蔵した。
Berger Multigram II SFC
カラム詳細:Lux A1(Phenomenex、21.2mm×250mm、5μm)
カラム温度:40℃
流速:50mL/分
BPR:100BarG
検出器波長:215nm
注入体積:1,000μL(30mg)
定組成条件:15:85 EtOH:CO2(0.2%v/v NH3)
分析条件3:
Waters UPC2
カラム詳細:Amy-C(YMC Gmbh、4.6mm×250mm、5μm)
カラム温度:40℃
流速:4mL/分
検出器波長:210~400nm
注入体積:1.0μL
BPR:125BarG
定組成条件:15:85 EtOH:CO2(0.2%v/v NH3)
4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-メチルフェニル)ブタン酸
4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3,5-ジクロロフェニル)ブタン酸
m/z348.(MH+)。C15H19Cl2NO4の正確な質量は、347.07。
m/z362(MH+)。C19H23NO4Sの正確な質量は、361.13。
中間体1:H-Thr(O-tBu)-Dap(BOC)-シクロ[Dab-Dab(BOC)-DPhe-Leu-Dab(BOC)-Dab(BOC)-Thr]
WO2015/135976において中間体11 - テトラ-(N-Boc)-L-Thr(O-tBu)-L-Dap-ポリミキシンBヘプタペプチドとして以前に記載された。
WO2015/135976において中間体14 - テトラ-(N-Boc)-L-Thr(O-tBu)-L-Dap-ポリミキシンEヘプタペプチドとして以前に記載された。
直鎖ペプチドCBZ-Thr(O-tBu)-Dap(Boc)-Dab(ivDde)-Dab(Boc)-Dleu-L-Abu-Dab(Boc)-Dab(Boc)-Thr(O-tBu)を樹脂上で、Fmoc化学を用いる固相ペプチド合成によって、上記の一般的方法3の方法を用いて調製した。配列は塩化クロロトリチル(CTC)-樹脂(2.0g)で開始し、Fmoc-Thr(tBu)-OHを0.75mmol/gの負荷量で先に負荷した。樹脂結合ペプチド(3.93g、1.5mmolに対応)を500mL円錐フラスコに入れ、DMF中4%ヒドラジン(100mL)で処理した。混合物を振盪機上に設置し、30分間、穏やかに振盪した。混合物を焼結カラムに注ぎ入れ、次いで、DMF(3×100mL)で洗浄した。圧縮空気を施与して最終の痕跡量のDMFを除去した。次いで、手順をTHF及びDCMで繰り返した。
m/z1552、C73H126N14O22は1550.92を要する。
粗製のCBZ-Thr(O-tBu)-Dap(Boc)-Dab-Dab(Boc)-DLeu-L-Abu-Dab(Boc)-Dab(Boc)-Thr(O-tBu)-OH(724mg、0.466mmol)をDMF(75mL)中に溶解し、ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)(361mg、0.49mL、2.8mmol)で処理し、次いで、氷浴内で冷却した。ジフェニルリン酸アジド(256mg、0.2mL、0.93mmol)を滴下添加し、次いで、混合物を2時間、氷浴で冷却しながら撹拌した。氷浴を取り外し、溶液を更に2時間、室温で撹拌した。溶媒を蒸発し、残渣をSiO2 ISCOカラム(40g)に施与し、DCM中0~10%MeOHでクロマトグラフィー処理した。生成物含有画分を合わせ、蒸発して白色の泡にした。418mg(58%)を得た。
m/z1534、C73H124N14O21は1532.91を要する。
CBZ-Thr(O-tBu)-Dap(Boc)-シクロ[Dab-Dab(Boc)-DLeu-L-Abu-Dab(Boc)-Dab(Boc)-Thr(O-tBu)](531mg、0.346mmol)をメタノール(50mL)中に溶解し、ギ酸アンモニウム(545mg、8.6mmol)及び10%Pd/C(173mg)で処理した。終夜室温で撹拌した後に、反応混合物をセライトに通して濾過し、残渣をMeOHで洗浄した。溶媒を蒸発し、残渣を、MeOH10%を含有するEtOAc中に溶解し、水×3で洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥した。溶媒を蒸発すると白色の固体が残った。痕跡量のギ酸塩を全て除去するために、固体をメタノール(160mL)中に溶解し、30分間、Ambersep900樹脂(12mL)と共に振盪した。混合物を濾過し、乾燥状態まで蒸発して、白色の固体464mg(96%)を得た。
m/z1400、C65H118N14O19は1398.87を要する。
ポリミキシンノナペプチド誘導体の全合成を下記のとおり実施した。
環化に関与するDab残基のγ-アミノ基のオルトゴナルな保護を伴う直鎖ペプチドを樹脂上で構築し、その際、C末端アミノ酸(典型的にはThr)が固相に接続している。環化に関与するDab(ポリミキシンナンバリングシステムにおける残基4)の部分的脱保護、続く、樹脂からの取り外しの後に、得られた直鎖ペプチドを樹脂から外して(off-resin)環化した。下記のとおりの二つの一般的方法を使用した。
保護された直鎖ペプチド(残基2~10及びN末端基)の合成を、標準的なFmoc固相ペプチド化学を用いる自動ペプチドシンセサイザーで実施した。具体的には、合成を、Fmoc-Thr(tBu)-PEG-PS樹脂を出発物質として使用して行った。Fmoc-アミノ酸のカップリングと末端アミノ基上でのCBZ保護とを、DMF中の5モル当量(樹脂負荷に対して)のFmocアミノ酸及びHATUを使用して行い、その際、in situでの活性化を伴い、10モル当量のDIPEAを使用した。Fmoc脱保護を、ジメチルホルムアミド中20%ピペリジンを用いて行った。BOCを、環化に関与するDab上のオルトゴナルな保護基として使用した。
一般的方法2:アミン基のBoc保護を用いての全合成
保護された直鎖ペプチド(残基2~10及びN末端基)の合成を、標準的なFmoc固相ペプチド化学を用いる自動ペプチドシンセサイザーで実施した。具体的には、合成を、塩化クロロトリチル(CTC)-樹脂を使用して行い、Fmoc-Thr(tBu)-OH(約0.78mmol/gを負荷)を0.05~0.1mmolスケールで予め負荷した。Fmoc-アミノ酸のカップリングを、DMF中の5モル当量(樹脂負荷に対して)のFmocアミノ酸及びHATUを使用して行い、その際、in situでの活性化を伴い、10モル当量のDIPEAを使用した。Fmoc脱保護を、ジメチルホルムアミド中20%ピペリジンを用いて行った。ivDde保護基を、環化に関与するDab残基上のオルトゴナルな保護基として使用した。
ノナペプチドのN末端をアミノ酸にカップリングするための方法を実施例化合物5及び6に関して以下に記載する。記載の条件は、ノナペプチド及びアミノ酸の他の組合せにも適合させることができる。
H-Thr(O-tBu)-Dap(BOC)-シクロ[Dab-Dab(BOC)-DPhe-Leu-Dab(BOC)-Dab(BOC)-Thr](中間体1)(0.07mmol)をジクロロメタン(4mL)中に溶解し、4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸(ポリミキシン基質に対して1.5当量)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(3.0当量)、続いて、HATU(2.0当量)で処理した。16時間後に、LCMSによって反応の完了を確認し、反応混合物を乾燥状態まで蒸発した。水(約10mL)を添加し、混合物を摩砕し、次いで、1時間、激しく撹拌した。得られた沈澱物を濾取し、終夜、真空中で乾燥した。
ステップ1からのBoc-保護された誘導体をジクロロメタン(3mL)中に溶解し、TFA(1mL)で処理した。反応混合物を、LCMSによって完全な脱保護が確認されるまで室温で撹拌した。溶媒を蒸発し、残渣を、分取HPLC条件4に示されている条件を用いる分取HPLCによってクロマトグラフィー処理して、ジアステレオマーを分離した。早く流出するジアステレオマーを含有する画分を合わせ、低体積まで蒸発し、凍結乾燥して実施例5をTFA塩として得た。遅く流出するジアステレオマーを含有する画分を合わせ、低体積まで蒸発し、凍結乾燥して実施例6をTFA塩として得た。
分取HPLC条件4:
カラム:Waters Sunfire C18 OBD 5μm×19mm×150mm
移動相:A:水/アセトニトリル 90/10、v/v、0.15%TFA。
流速:10mL/分
勾配:時間(分) 移動相A%
0 100%
3 100%
8 85%
13.5 85%
15 75%
18 0%
23 100%
25 100%
検出:210nm
分析用HPLC条件4:
カラム:Phenomenex Hyperclone C18 BDS 5μm×4.6mm×150mm
移動相:A:水/アセトニトリル 90/10、v/v、0.15%TFA。
流速:1mL/分
勾配:時間(分) 移動相A%
0 100%
20 40%
21 0%
23 0%
23.5 100
25 100
検出:210、254nm
注入体積:20μL
一般的方法3b:ノナペプチドへの個々の鏡像異性体のカップリング
鏡像異性的に純粋なアミノ酸を、鏡像異性的に混合されたアミノ酸のために一般的方法3aにおいて上記したのと同じ条件を用いてノナペプチド化合物のN末端にカップリングした。
一般的方法3aの条件下での4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸(異性体2)(保持時間3.46分、分析方法1又は3.264分、分析方法2)のカップリング、続く、脱保護によって、実施例5を得た。実施例(5)を、4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸(異性体2)から得られた4-アミノ-3-(3-クロロフェニル)ブタン酸の絶対配置のX線決定に従って、(S)立体化学と指定した。
AG1-X2樹脂(Bio-Rad Laboratories Ltd)酢酸塩形態200-4-メッシュを、10%酢酸水溶液、続いて、1%酢酸水溶液で洗浄することによって再生し、焼結カートリッジに入れた。水中のTFA塩としての化合物の溶液を、TFA塩1gに対して樹脂30gの負荷を用いてカラムに施与し、カラムを、重力下で水で溶離してドリップした。生成物含有画分を合わせ、白色の固体に凍結乾燥した。
酢酸塩としての実施例5及び6の化合物での例示的な分析用データを以下に示す。
実施例6:(遅い方の異性体)酢酸塩の1H NMR (400 MHz, D2O): δ(ppm) 0.60- 0.67 (6 H, m), 0.69 - 0.84 (4 H, m), 1.16 (3H, d, J 6.4Hz), 1.33-1.50 (2 H, m), 1.76-2.04 (19 H, m, 1.88, s, OAcを含む), 2.06-2.26 (4 H, m), 2.67-2.86 (4 H, m), 3.00-3.46 (14 H, m), 3.98-4.04 (1 H, m) 4.14-4.30 (7H, m), 4.45 (1 H, dd, J 5.6, 9.0 Hz), 4.54 (1 H,見かけ上t, J 8.3 Hz), 4.72 (1 H, dd, J 5.0, 8.9 Hz), 7.20-7.40 (9 H, m). m/z 1145 [MH+], 573[M+2H]2+.
全ての実施例において、早く溶離する異性体での1.13ppmから、遅く溶離する異性体での約0.65ppmへと移動するThr残基の化学シフトと共に、HPLC保持時間(早く、及び遅く溶離する異性体)に基づき、ジアステレオマーを指定した。
表1に、本発明の実施例化合物を列挙する。これらは、以下:
基Rは、本発明の化合物における-X-R15に対応し、この基は表に、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒になった場合に、それぞれ基-R1及び-R2に対応する6及び7位におけるアミノ酸残基(ポリミキシンナンバリングシステムを用いて、それぞれAA-6及びAA-7)と一緒に示されている。
実施例1~6及び15~33において、この決定は、ジアステレオマーの相対保持時間及び1H NMRスペクトルの比較によって成された(例えば、2位におけるThr残基の化学シフトを考慮した)。
表は、実施例化合物でのHPLC保持時間を示している。分析で使用されたHPLC条件を以下に示す。
カラム:Phenomenex Hyperclone BDS C18、4.6mm×150mm、5μm
流速:1mL/分
溶離液:
A=AcN10%/水90%/TFA0.15%
B=AcN90%/水10%/TFA0.15%
勾配:分 A% B%
0 100 0
20 40 60
21 0 100
23 0 100
23.5 100 0
25 100 0
決定:210、254nm
本発明の化合物を試験し、結果を、当技術分野で以前に報告された化合物を含む比較例と比較した。
接種物を、単離されたコロニー(18-24時間のMueller-Hinton寒天プレートから選択)の直接懸濁液を製造することによって、マクファーランド標準の0.5に調節して調製した。MIC試験を、滅菌の96ウェルマイクロタイタープレート中のカチオン調節されたMueller-Hintonブロス中の抗生物質の一連の2倍希釈によって、170μL(抗細菌剤を含有する150μLのブロス、20μLの接種物)の全体積で行った。アッセイを二重で行った。プレートを、振盪せずに18~20時間、35℃で好気的にインキュベートし、MICを、目に見える増殖を防止した薬物の最低濃度と定義した。幾つかの化合物は多数回の試験にかけられ、このような場合、表示のMICは、得られた中央値である。MIC値はμg/mLで示されている。
次のプロトコルに従って、in vitro腎臓細胞毒性アッセイを行った。
HK-2細胞を、5ng/mLの上皮成長因子(EGF)及び50μg/mLのウシ下垂体抽出物(BPE)を補充された角質細胞-SFM培地中で維持し、アッセイした。細胞を1ウェルあたり7,500細胞で96ウェルプレートに播種し、終夜、付着させた。ポリミキシンB(PMB)及び試験化合物を水中10%DMSO中に溶解して、それぞれ20及び60mg/mLのストック溶液を得た。試験化合物を半対数希釈で3,000又は1,000μg/mLの最高濃度が得られるように希釈して、9ポイントの濃度範囲とビヒクル対照とを得た。PMBも、半対数希釈で1,000μg/mlの最高濃度が得られるように希釈した。水及びDMSOレベルは、それぞれ5%及び0.5%で一定に維持した。試験化合物を細胞と共に24時間、37℃、5%CO2で、加湿雰囲気下でインキュベートした。CellTiter-BlueをPBS中で希釈し(1:4)、20%(v/v)添加し、37℃で2時間インキュベートし、その後、蛍光生成物を検出した。
4時間目の腎臓中レベル測定
化合物を、遊離塩基17.2mg/kgでマウス(n=2又は3)に皮下投与した。投与から4時間後に、動物を安楽死させ、腎臓を取り出し、脂肪及び結合組織を除去し、秤量し、直ちに急速凍結した。室温で解凍した後に、各動物からの腎臓対を、予め秤量しておいたセリア安定化酸化ジルコニウムビーズを含有する2mL円錐管に入れた。トリフルオロ酢酸、TFA(0.25mL、水中0.15%v/v)を添加し、管をFastPrep-24ホモジナイザー(MP Biomedicals Europe)に装填し、それぞれ6m/秒の速度で30秒のサイクルに三回かけた。ホモジネートのアリコット(200μL)を、計算された体積のTFA溶液(水中0.15%v/v)で希釈して、腎臓0.167グラム/ホモジネートグラムの最終濃度を得た。
腎臓毒性の比較 - 実施例5並びに参照例D77及び38
マウス(n=6)に、ポリミキシンB、硫酸コリスチン、参照例D77、参照例38又は実施例5を遊離塩基17.2mg/kgで一日三回皮下投与した。四日目の初回の投与直後に開始して、マウスを個々の代謝ケージに移し、続く24時間にわたって尿を収集して、バイオマーカーレベル(アルブミン、シスタチンC、KIM-1)を決定した。幾何平均バイオマーカーレベルを以下の表に示す:
尿におけるアルブミン、シスタチンC又はKIM-1の上昇は、腎臓損傷の徴候である。実施例5は、腎臓毒性の三つ全てのバイオマーカーで最低レベルを示した。
腎臓毒性の比較 - 実施例5、9及び17
マウス(n=6)に、8時間間隔で四回の投与でPMB、実施例5、実施例9又は実施例17を遊離塩基25mg/kgで皮下投与した。四回目の投与後に、動物を個々の代謝ケージに移し、尿を24時間、収集して、尿バイオマーカーを決定した。尿の収集後に、マウスを安楽死させ、組織病理学のために腎臓を採取した。
雄のカニクイザル(n=3)に一日三回、七日間、実施例5を20mg/kg/用量で1時間かけて静脈内注入によって投与した。別の実験において、雄のサル(n=3)に同じ期間、PMBを4mg/kg/用量で投与した。両方の実験で、対照動物に一日三回、生理食塩水を投与した。
好中球減少性にした後(シクロフォスファミド150mg/kg d-4、100mg/kg d-1)、CD-1マウス(n=5)に、各大腿において約105cfuのE.coli ATCC25922を接種した。マウスに、0.125、0.5、及び3mg/kgの硫酸PMB又は試験化合物(同等重量の遊離塩基)を感染から1、3.5及び6時間後にIV投与した。感染後9時間目に、マウスを安楽死させ、大腿をコロニーカウントのために準備した。
K.Pneumoniae ATCC 43816に感染した好中球減少性マウス大腿モデルにおける化合物の有効性
好中球減少性にした後(シクロフォスファミド150mg/kg d-4、100mg/kg d-1)、CD-1マウス(n=5)に、各大腿において約105cfuのK.Pneumoniae ATCC 43816を接種した。マウスに、適切な用量の硫酸PMB又は試験化合物(同等重量の遊離塩基)を感染から2、6及び10時間後にIV投与した。感染後16時間目に、マウスを安楽死させ、大腿をコロニーカウントのために準備した。
A.baumannii NCTC13301に感染した好中球減少性マウス大腿モデルにおける化合物の有効性
好中球減少性にした後(シクロフォスファミド150mg/kg d-4、100mg/kg d-1)、CD-1マウス(n=5)に、各大腿において約105cfuのA.baumannii NCTC13301を接種した。マウスに、0.125、0.5、1及び4mg/kgの硫酸PMB又は試験化合物(同等重量の遊離塩基)を感染から2、6及び10時間後にIV投与した。感染後16時間目に、マウスを安楽死させ、大腿をコロニーカウントのために準備した。
A.baumannii NCTC13301に感染した好中球減少性マウス肺モデルにおける化合物の有効性
好中球減少性にした後(シクロフォスファミド200mg/kg d-4、150mg/kg d-1)、CD-1マウス(n=8)に、肺あたり約107cfuのA.baumannii NCTC13301を鼻腔内接種した。マウスに、硫酸PMB(20mg/kg)又は適切な用量の試験化合物(同等重量の遊離塩基)を感染から2、6及び10時間後にSC投与した。感染後16時間目に、マウスを安楽死させ、肺をコロニーカウントのために準備した。
好中球減少性にした後(シクロフォスファミド200mg/kg d-4、150mg/kg d-1)、CD-1マウス(n=8)に、肺あたり104~105cfuのP.aeruginosa ATCC27853を鼻腔内接種した。マウスに、適切な用量の硫酸PMB又は試験化合物(同等重量の遊離塩基)を感染から2、6及び10時間後にSC投与した。感染後16時間目に、マウスを安楽死させ、肺をコロニーカウントのために準備した。
リファンピシンの存在下での実施例5のMIC値
PMB及び実施例5は両方とも、ポリミキシンに対して低い感受性を有する菌株に対しても、リファンピシンとの強力な相乗作用を示している。
本発明の化合物は、N末端部分におけるγ-アミノプロピル基のβ位において立体中心を含有する。驚くべきことに、この位置における立体異性体のうちの1種が通常、より低い細胞傷害性及びより低い腎臓中薬物レベルと関連することが見出された。これは、逆相クロマトグラフィーでより早く溶離する立体異性体である。
薬物レベルは、マウスモデルにおける17.2mg/kgのsc投与後4時間目に腎臓で見出された化合物の量(μg/g)を指す。
実施例24の腎臓毒性を、マウスにおける四回の投与後にPMBと比較した
雄のCD-1マウス群(n=5)に、遊離塩基12.5若しくは25mg/kgのポリミキシンB(PMB)、又は遊離塩基25、50若しくは75mg/kgの実施例24の化合物のいずれかを8時間間隔で四回、皮下投与した。四回目の投与直後に、マウスを代謝ケージに移し、尿を24時間収集して、尿バイオマーカーを決定した。尿の収集後に、マウスを腎臓組織病理学のために、と殺した。平均バイオマーカーレベルを以下の表4に示す。
5種全てのバイオマーカーで、50mg/kgの実施例24での表示は、25mg/kgのPMBよりも少なく、5種のバイオマーカーのうちの2種(Kim-1、NGAL)で、75mg/kg用量での表示は、25mg/kgでのPMBよりも少なかった。
[態様1]
式(I):
-X-は、-C(O)-を表し;
-R1は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、フェニルアラニン、ロイシン、ノルロイシン、バリン又はノルバリン残基であり;
-R2は、1個のヒドロキシル基で所望により置換されているC1~4アルキルであり;
-R3は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、トレオニン残基であり;
-R4は、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、Dapであり;
-R8は、水素又はメチルであり;
-R15は、基:
-R16は、水素であり;
-R17は、水素であり;
-L-は、共有結合又はメチレンであり;
-Arは、置換フェニルなどの所望により置換されているアリールである]
の化合物並びにその塩、溶媒和物及び保護された形態。
[態様2]
-R1が、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、フェニルアラニン又はロイシン残基である、態様1又は2に記載の化合物。
[態様3]
-R2が、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、ロイシン、アミノブチラート、イソ-ロイシン、トレオニン、バリン又はノル-バリン残基である、態様1又は2に記載の化合物。
[態様4]
-R2が、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、ロイシン又はアミノブチラート残基である、態様3に記載の化合物。
[態様5]
-R4が、カルボニル基及びこれが接続している炭素に対してアルファにある窒素と一緒に、L-Dapである、態様1ないし4のいずれか一項に記載の化合物。
[態様6]
-R8がメチルである、態様1ないし5のいずれか一項に記載の化合物。
[態様7]
-R15が:
[態様8]
-L-が共有結合である、態様1ないし7のいずれか一項に記載の化合物。
[態様9]
-L-がメチレンである、態様8に記載の化合物。
[態様10]
-Arが所望により置換されているフェニルである、態様1ないし9のいずれか一項に記載の化合物。
[態様11]
前記フェニルが1又は2個の基-RSで置換されており、各-RSが独立に、ハロ、アルキル、ハロアルキル及びアリールから選択される、態様10に記載の化合物。
[態様12]
前記フェニルが1又は2個の基-RSで置換されており、各-RSが独立に、クロロ、プロピル、フェニル及びチオフェニルから選択される、態様10に記載の化合物。
[態様13]
式(II):
[態様14]
式(II):
[態様15]
態様1ないし14のいずれか一項に記載の化合物を、所望により1種又は複数の医薬的に受容可能な担体と一緒に含んでなる、医薬組成物。
[態様16]
治療又は予防の方法で使用するための、態様1ないし14のいずれか一項に記載の化合物又は態様15に記載の医薬組成物。
[態様17]
微生物感染を治療する方法において使用するための、態様1ないし14のいずれか一項に記載の化合物又は態様15に記載の医薬組成物。
[態様18]
前記感染が細菌感染である、態様17に記載の化合物又は医薬組成物。
[態様19]
前記細菌感染がグラム陰性菌感染である、態様18に記載の化合物又は医薬組成物。
[態様20]
前記グラム陰性菌感染が、Escherichia spp.、Klebsiella spp.、Enterobacter spp.、Salmonella spp.、Shigella spp.、Citrobacter spp.、Morganella morganii、Yersinia pseudotuberculosis及び他の腸内細菌科、Pseudomonas spp.、Acinetobacter spp.、Moraxella、Helicobacter、Stenotrophomonas、Bdellovibrio、酢酸菌、Legionella並びにアルファプロテオバクテリアから選択される、態様19に記載の化合物又は医薬組成物。
参照文献
本明細書に記載の文献は全て、本明細書中に参考文献としてその全てが援用される。
Claims (7)
- 式(II):
- 前記化合物が、式:
- 前記化合物が、式:
- 請求項1ないし3のいずれか一項に記載の化合物を、所望により1種又は複数の医薬的に受容可能な担体と一緒に含んでなる、医薬組成物。
- 治療又は予防の方法で使用するための、請求項4に記載の医薬組成物。
- 微生物感染、例えば、細菌感染を治療する方法において使用するための、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記微生物感染がグラム陰性菌感染である、例えば、Escherichia spp.、Klebsiella spp.、Enterobacter spp.、Salmonella spp.、Shigella spp.、Citrobacter spp.、Morganella morganii、Yersinia pseudotuberculosis及び他の腸内細菌科、Pseudomonas spp.、Acinetobacter spp.、Moraxella、Helicobacter、Stenotrophomonas、Bdellovibrio、酢酸菌、Legionella並びにアルファプロテオバクテリアから選択される、グラム陰性菌による感染である、請求項6に記載の医薬組成物。
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