JP7386167B2 - 分離によるマイクロ流体チップ内の核酸の精製 - Google Patents
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Description
技術分野
本明細書に説明される技術は、生物学的サンプル等のサンプルの処理、例えば、血液等の複合サンプルに由来する核酸の精製と併せた、例えば、基板上に含有される生物学的サンプルからの汚染物質の分離に関する。
核酸が、分析試験のために収集され得ることが周知である。例えば、血液からの核酸の収集における主要な課題は、生体サンプルが、極めて多くの場合、汚染物質を含有することである。したがって、核酸サンプル精製は、サンプル核酸の品質が下流用途での性能に影響を及ぼし得るため、実験ワークフローにおいて重要なステップになっている。
本技術の実施形態は、電場および/またはポリエーテル化合物等のゲルを使用し、基板上に含有される生物学的サンプルから生体被分析物を分離する。技術の第1の実施例によると、生体被分析物を分離するための方法は、マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップを含む。緩衝剤等の流体が、生物学的サンプルが入れられる第1のウェル内に提供される。磁気ビーズ、例えば、ポリビニルアルコールに基づく磁気粒子(M-PVA磁気ビーズ)が、次いで、第1のウェルの中に導入される。M-PVA磁気ビーズの表面は、多くの異なる基を用いて官能化され、個別に調整可能な装荷を用いて修飾されることができる。一実施例では、M-PVA磁気ビーズは、血液を含み得る生物学的サンプル内の核酸を単離するように調整されることができる。
本発明は、例えば、以下を提供する。
(項目1)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するための方法であって、
マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップと、
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内に流体を提供するステップと、
前記生物学的サンプルを前記第1のウェルの中に入れるステップと、
磁気ビーズを前記第1のウェルの中に導入するステップと、
前記生物学的サンプル内の標的分子を前記磁気ビーズに引き寄せるステップと、
前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するステップであって、前記電場は、前記汚染物質と相互作用する、ステップと、
磁場を発生させる磁石を前記第1のウェルの近傍に導入するステップであって、前記磁場は、前記磁気ビーズと相互作用する、ステップと、
前記マイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズは、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記電場は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記マイクロチャネルを通して移動するにつれて、前記マイクロチャネル内で前記汚染物質のうちの少なくともいくつかを維持するように、前記汚染物質に作用する、ステップと、
前記第2のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
を含む、方法。
(項目2)
前記第2のウェルから前記磁気ビーズを引き出すステップと、
前記磁気ビーズを、流体を含むコンテナの中に挿入するステップと、
前記標的分子を前記コンテナ内の前記流体の中に放出するように機能する、前記磁気ビーズを離調するステップと、
前記コンテナから前記磁気ビーズを除去するステップと
をさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記生物学的サンプルは、血液を含む、項目1~2のいずれか1項に記載の方法。
(項目4)
前記標的分子は、核酸を含む、項目1~3のいずれか1項に記載の方法。
(項目5)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目1~4のいずれか1項に記載の方法。
(項目6)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目7)
前記マイクロチャネルは、深度が50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目1~6のいずれか1項に記載の方法。
(項目8)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目1~7のいずれか1項に記載の方法。
(項目9)
前記マイクロチャネルは、前記マイクロチャネルの中に引き込まれる前記標的分子から任意の汚染物質をさらに分離するように機能する、緩衝剤を含む、項目1~8のいずれか1項に記載の方法。
(項目10)
第3のウェルおよび第2のマイクロチャネルを提供するステップであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、ステップと、
前記第2のマイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記第3のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
をさらに含む、項目1および3~9のいずれか1項に記載の方法。
(項目11)
前記流体の流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間の前記流体の体積差を生成するステップをさらに含む、項目1~10のいずれか1項に記載の方法。
(項目12)
前記磁石の移動は、自動化され、運動制御ハードウェアによって制御される、項目1~11のいずれか1項に記載の方法。
(項目13)
前記第1のウェル内に磁気攪拌器を提供するステップと、
前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを攪拌するステップと
をさらに含む、項目1~12のいずれか1項に記載の方法。
(項目14)
前記第1のウェルのための加熱器を提供するステップと、
前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを加熱するステップと
をさらに含む、項目1~13のいずれか1項に記載の方法。
(項目15)
温度センサと、コントローラとをさらに含み、前記コントローラは、前記温度センサから受信される温度信号に基づいて、前記加熱器を調節する、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記加熱器は、電圧が印加され得る、抵抗金属コーティングである、項目14~15のいずれか1項に記載の方法。
(項目17)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物である、項目16に記載の方法。
(項目18)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置する、項目1~17のいずれか1項に記載の方法。
(項目19)
前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するステップは、前記第1のウェル内に第1のプローブおよび前記第2のウェル内に第2のプローブを配置することを含み、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目1~18のいずれか1項に記載の方法。
(項目20)
前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルを提供するステップと、前記マイクロチャネルと連通する第4のウェルを提供するステップとをさらに含み、前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するステップは、前記第3のウェル内に第1のプローブおよび前記第4のウェル内に第2のプローブを配置することを含み、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目1~18のいずれか1項に記載の方法。
(項目21)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するためのシステムであって、
流体を含有し、前記生物学的サンプルを受容するように適合される、第1のウェルと、
流体を含有するように適合される、第2のウェルと、
前記第1のウェルと前記第2のウェルとの間に延在するマイクロチャネルであって、磁気ビーズは、前記第1のウェルの中に導入されるように適合され、前記磁気ビーズは、前記生物学的サンプル内の標的分子を引き付けるように調整される、マイクロチャネルと、
電力源および前記電力源に結合される2つのプローブであって、前記2つのプローブは、前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するように適合され、
電力が前記2つのプローブに印加されるときに、前記2つのプローブは、前記汚染物質が電場と相互作用するように、その間に電場を発生させるように適合される、電力源および2つのプローブと、
前記第1のウェルの近傍に移動されるように適合される、磁石であって、磁場を発生させ、前記磁気ビーズと相互作用するように適合される、磁石と
を含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズが、前記磁石の移動とともに前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記マイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるように適合され、
前記電場は、前記汚染物質のうちの少なくともいくつかが前記マイクロチャネル内で維持されるように、前記汚染物質と相互作用するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記第2のウェルに向かって移動するように適合される、システム。
(項目22)
前記生物学的サンプルは、血液を含み、前記標的分子は、核酸を含む、項目21に記載のシステム。
(項目23)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目21~22のいずれか1項に記載のシステム。
(項目24)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目21~23のいずれか1項に記載のシステム。
(項目25)
前記マイクロチャネルは、深度が50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目21~24のいずれか1項に記載のシステム。
(項目26)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目21~25のいずれか1項に記載のシステム。
(項目27)
第3のウェルと、
第2のマイクロチャネルであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、第2のマイクロチャネルと
をさらに含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記第2のマイクロチャネルに向かって移動するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記第3のウェルに向かって移動するように適合される、項目21~26のいずれか1項に記載のシステム。
(項目28)
前記流体の流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間に生成される前記流体の体積差をさらに含む、項目21~27のいずれか1項に記載のシステム。
(項目29)
前記電力源を制御するように適合されるコントローラをさらに含む、項目21~28のいずれか1項に記載のシステム。
(項目30)
前記コントローラは、前記磁石の移動を制御するように適合される、項目29に記載のシステム。
(項目31)
前記第1のウェルの内容物を攪拌するように適合される、磁気攪拌器と、
前記磁気攪拌器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目29~30のいずれか1項に記載のシステム。
(項目32)
前記第1のウェルを加熱するように適合される、加熱器と、
前記加熱器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目29~31のいずれか1項に記載のシステム。
(項目33)
前記コントローラに結合され、温度信号を発生させるように適合される、温度センサをさらに含み、
前記コントローラは、前記温度センサから受信される前記温度信号に基づいて、前記加熱器を制御するように適合される、項目32に記載のシステム。
(項目34)
前記加熱器は、抵抗金属コーティングを含む、項目32~33のいずれか1項に記載のシステム。
(項目35)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物を含む、項目34に記載のシステム。
(項目36)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置する、項目21~35のいずれか1項に記載のシステム。
(項目37)
前記2つのプローブのうちの第1のものは、前記第1のウェル内に配置され、前記2つのプローブのうちの第2のものは、前記第2のウェル内に配置され、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目21~36のいずれか1項に記載のシステム。
(項目38)
前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルと、前記マイクロチャネルと連通する第4のウェルとをさらに含み、前記2つのプローブのうちの第1のものは、前記第3のウェル内に配置され、前記2つのプローブのうちの第2のものは、前記第4のウェル内に配置され、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目21~36のいずれか1項に記載のシステム。
(項目39)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するための方法であって、
マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップと、
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内に流体を提供するステップと、
前記生物学的サンプルを前記第1のウェルの中に入れるステップと、
磁気ビーズを前記第1のウェルの中に導入するステップと、
前記生物学的サンプル内の標的分子を前記磁気ビーズに引き寄せるステップと、
磁場を発生させる磁石を前記第1のウェルの近傍に導入するステップであって、前記磁場は、前記磁気ビーズと相互作用する、ステップと、
前記マイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズは、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記マイクロチャネル内にゲルを提供するステップであって、前記ゲルは、前記汚染物質と相互作用する、ステップと、
前記第2のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記汚染物質が前記ゲル内で維持されるにつれて、前記汚染物質が前記標的分子から分離され、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
を含む、方法。
(項目40)
前記ゲルは、ポリエーテル化合物を含む、項目39に記載の方法。
(項目41)
前記ポリエーテル化合物は、ポリエチエレングリコールを含む、項目40に記載の方法。
(項目42)
前記生物学的サンプルは、血液を含む、項目39~41のいずれか1項に記載の方法。
(項目43)
前記標的分子は、核酸を含む、項目39~42のいずれか1項に記載の方法。
(項目44)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目39~43のいずれか1項に記載の方法。
(項目45)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目39~44のいずれか1項に記載の方法。
(項目46)
前記マイクロチャネルは、深さが50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目39~45のいずれか1項に記載の方法。
(項目47)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目39~46のいずれか1項に記載の方法。
(項目48)
前記第2のウェルから前記磁気ビーズを引き出すステップと、
前記磁気ビーズを、流体を含むコンテナの中に挿入するステップと、
前記標的分子を前記コンテナ内の前記流体の中に放出するように機能する、前記磁気ビーズを離調するステップと、
前記コンテナから前記磁気ビーズを除去するステップと
をさらに含む、項目39~47のいずれか1項に記載の方法。
(項目49)
第3のウェルおよび第2のマイクロチャネルを提供するステップであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、ステップと、
前記第2のマイクロチャネル内にゲルを提供するステップと、
前記第2のマイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記第3のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が、前記第2のマイクロチャネル内の前記ゲルを通して、前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
をさらに含む、項目39~47のいずれか1項に記載の方法。
(項目50)
前記第2のウェル内に前記ゲルを提供するステップをさらに含む、項目39~49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
前記第1のウェル内に前記ゲルを提供するステップをさらに含む、項目39~50のいずれか1項に記載の方法。
(項目52)
前記ゲルの流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェル内の前記ゲルおよび前記第1のウェル内の前記流体の体積差を生成するステップをさらに含む、項目39~51のいずれか1項に記載の方法。
(項目53)
前記磁石の移動は、自動化され、運動制御ハードウェアによって制御される、項目39~52のいずれか1項に記載の方法。
(項目54)
前記第1のウェル内に磁気攪拌器を提供するステップと、前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを攪拌するステップとをさらに含む、項目39~53のいずれか1項に記載の方法。
(項目55)
前記第1のウェルのための加熱器を提供するステップと、
前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを加熱するステップと
をさらに含む、項目39~54のいずれか1項に記載の方法。
(項目56)
温度センサと、コントローラとをさらに含み、前記コントローラは、前記温度センサから受信される温度信号に基づいて、前記加熱器を調節する、項目55に記載の方法。
(項目57)
前記加熱器は、電圧が印加され得る、抵抗金属コーティングである、項目55~56のいずれか1項に記載の方法。
(項目58)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物である、項目57に記載の方法。
(項目59)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置する、項目39~58のいずれか1項に記載の方法。
(項目60)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するためのシステムであって、
流体を含有し、前記生物学的サンプルを受容するように適合される、第1のウェルと、
流体を含有するように適合される、第2のウェルと、
前記第1のウェルと前記第2のウェルとの間に延在する、マイクロチャネルと、
前記マイクロチャネル内に位置するゲルであって、磁気ビーズは、前記第1のウェルの中に導入されるように適合され、前記磁気ビーズは、前記生物学的サンプル内の標的分子を引き付けるように調整される、ゲルと、
前記第1のウェルの近傍に移動されるように適合される、磁石であって、磁場を発生させ、前記磁気ビーズと相互作用するように適合される、磁石と
を含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズが前記磁石の移動とともに前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記マイクロチャネルに向かって移動されるように提供され、
前記ゲルは、前記磁気ビーズが前記ゲルを通して移動するときに、前記汚染物質のうちの少なくともいくつかが前記ゲル内で捕捉されるように、前記汚染物質と相互作用するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記第2のウェルに向かって移動するように適合される、システム。
(項目61)
前記ゲルは、ポリエーテル化合物を含む、項目60に記載のシステム。
(項目62)
前記ポリエーテル化合物は、ポリエチエレングリコールを含む、項目61に記載のシステム。
(項目63)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目60~62のいずれか1項に記載のシステム。
(項目64)
前記生物学的サンプルは、血液を含み、前記標的分子は、核酸を含む、項目60~63のいずれか1項に記載のシステム。
(項目65)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目60~64のいずれか1項に記載のシステム。
(項目66)
前記マイクロチャネルは、深さが50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目60~65のいずれか1項に記載のシステム。
(項目67)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目60~66のいずれか1項に記載のシステム。
(項目68)
第3のウェルと、
第2のマイクロチャネルであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続され、前記ゲルを含む、第2のマイクロチャネルと
をさらに含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれ、前記汚染物質のうちの少なくともいくつかが前記第2のマイクロチャネル内で前記ゲルによって捕捉されるように、前記第2のマイクロチャネルに向かって移動するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記第3のウェルに向かって移動するように適合される、項目60~67のいずれか1項に記載のシステム。
(項目69)
前記第2のウェルは、前記ゲルと、前記ゲルの流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェル内の前記ゲルの間に生成される前記第1のウェル内の前記流体の体積差とを含む、項目60~68のいずれか1項に記載のシステム。
(項目70)
前記磁石の移動を制御するように適合されるコントローラをさらに含む、項目60~69のいずれか1項に記載のシステム。
(項目71)
前記第1のウェルの内容物を攪拌するように適合される、磁気攪拌器と、
前記磁気攪拌器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目70に記載のシステム。
(項目72)
前記第1のウェルを加熱するように適合される、加熱器と、
前記加熱器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目70~71のいずれか1項に記載のシステム。
(項目73)
前記コントローラに結合され、温度信号を発生させるように適合される、温度センサをさらに含み、
前記コントローラは、前記温度センサから受信される前記温度信号に基づいて、前記加熱器を制御するように適合される、項目72に記載のシステム。
(項目74)
前記加熱器は、抵抗金属コーティングを含む、項目72~73のいずれか1項に記載のシステム。
(項目75)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物を含む、項目74に記載のシステム。
(項目76)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置される、項目60~75のいずれか1項に記載のシステム。
(項目77)
水平アクチュエータと、
前記水平アクチュエータに結合される、トレイと、
前記トレイに結合される、ウェルプレートと、
前記ウェルプレートに結合される、マイクロ流体チップと、
垂直アクチュエータと、
前記垂直アクチュエータに結合される、ピペットと、
前記ピペット内の流体の温度を制御するように前記ピペットに結合される、加熱器と、
前記ピペット内の流体の移動を制御するように前記ピペットに結合される、ポンプと、
前記トレイ、前記ウェルプレート、および前記マイクロ流体チップの水平移動を制御するように前記水平アクチュエータに通信可能に結合され、前記ピペットの垂直移動を制御するように前記垂直アクチュエータに通信可能に結合され、前記ポンプを制御するように前記ポンプに通信可能に結合され、前記加熱器を制御するように前記加熱器に通信可能に結合される、コントローラと
を含む、システム。
(項目78)
回転アクチュエータと、
前記回転アクチュエータに結合される磁石と
をさらに含み、
前記コントローラは、前記トレイの下の前記磁石の回転を制御するように前記回転アクチュエータに通信可能に結合される、項目77に記載のシステム。
(項目79)
前記ウェルプレートは、前記マイクロ流体チップの下に位置する複数の導電性リード線を含む、項目77~78のいずれか1項に記載のシステム。
(項目80)
前記ピペットは、支持アームによって垂直配向で保持されるピペット先端を含み、前記ピペット先端と反対側の前記ピペットの端部は、カートリッジ内で保持される、項目77~79のいずれか1項に記載のシステム。
(項目81)
前記加熱器は、静止側壁と、ヒンジによって前記静止側壁に回転可能に結合されるヒンジ連結側壁とを含む、項目77~80のいずれか1項に記載のシステム。
(項目82)
前記静止側壁は、第1の溝を含み、前記ヒンジ連結側壁は、第2の溝を含み、前記ピペットは、前記第1および第2の溝を通して前記静止側壁と前記ヒンジ連結側壁との間に延在する、項目81に記載のシステム。
(項目83)
前記静止側壁は、前記静止側壁の第1の側面の近傍の第1の場所において前記ピペットを挟締するように前記静止側壁から前記ヒンジ連結側壁に向かって外向きに移動可能な第1のバーと、前記静止側壁の第1の側面と反対側の前記静止側壁の第2の側面の近傍の第2の場所において前記ピペットを挟締するように前記静止側壁から前記ヒンジ連結側壁に向かって外向きに移動可能な第2のバーとを含む、項目81~82のいずれか1項に記載のシステム。
(項目84)
ウェルプレート内の第1のウェル内に生物学的サンプルを受容するステップと、
前記ウェルプレート内の第2のウェル内に別の試薬を受容するステップと、
ポンプを動作させ、前記ウェルプレートの第1のウェルからピペットの中に前記生物学的サンプルを引き込むステップと、
アクチュエータを動作させ、前記ウェルプレートの第1のウェルからマイクロ流体チップの第1のウェルまで前記ピペットを移動させるステップと、
前記ポンプを動作させ、前記ピペットから前記マイクロ流体チップの第1のウェルの中に前記生物学的サンプルを放出するステップと、
前記アクチュエータを動作させ、前記マイクロ流体チップの第1のウェルから前記マイクロ流体チップの第2のウェルまで前記ピペットを移動させるステップと、
前記ポンプを動作させ、前記マイクロ流体チップの第2のウェルから前記ピペットの中に前記生物学的サンプルを引き込むステップと、
前記アクチュエータを動作させ、前記マイクロ流体チップの第2のウェルから前記ウェルプレートの第2のウェルまで前記ピペットを移動させるステップと、
前記ポンプを動作させ、前記ウェルプレートの第2のウェルから前記ピペットの中に前記他の試薬を引き込むステップと、
加熱器を動作させ、前記ピペット内の前記生物学的サンプルおよび前記他の試薬を加熱するステップと、
前記ポンプを動作させ、前記ピペットから前記ウェルプレート内の第3のウェルの中に前記生物学的サンプルを放出するステップと
を含む、方法。
(項目85)
前記生物学的サンプルは、DNAを含む、項目84に記載の方法。
(項目86)
前記生物学的サンプルは、RNAを含む、項目84に記載の方法。
(項目87)
前記生物学的サンプルは、mRNAを含む、項目84に記載の方法。
(項目88)
前記生物学的サンプルは、タンパク質を含む、項目84に記載の方法。
(項目89)
汚染物質が、前記マイクロ流体チップ内の前記生物学的サンプルから除去される、項目84~88のいずれか1項に記載の方法。
(項目90)
ポリメラーゼ連鎖反応が、前記ピペット内で起こる、項目84~89のいずれか1項に記載の方法。
(項目91)
前記マイクロウェルプレートの上面に形成される複数のマイクロウェルと、
前記マイクロウェルプレートの上面に形成される空洞であって、マイクロ流体チップを受容するように定寸される、空洞と
を含む、マイクロウェルプレート。
(項目92)
前記空洞は、直四角柱を含む形状を有する、項目91に記載のマイクロウェルプレート。
(項目93)
前記空洞は、前記マイクロウェルプレートの縁まで延在し、それと一致する、項目91~92のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目94)
前記空洞内に位置される前記マイクロ流体チップをさらに含む、項目91~93のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目95)
前記空洞は、寸法の第1のセットを有し、前記マイクロ流体チップは、前記寸法の第1のセットに合致する寸法の第2のセットを有する、項目94に記載のマイクロウェルプレート。
(項目96)
前記空洞の底部境界を形成する前記マイクロウェルプレートの表面は、前記マイクロ流体チップの底面内のマイクロ流体チャネルに面し、前記マイクロ流体チャネルによって形成される経路の下側境界を形成する、項目94~95のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目97)
前記空洞の底部境界を形成する前記マイクロウェルプレートの表面に形成される複数のチャネルをさらに含む、項目91~95のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目98)
前記チャネルはそれぞれ、比較的に広い底端部分と、前記空洞の底部境界を形成する前記表面から前記比較的に広い底端部分まで延在する比較的に狭い上端部分とを含む、項目97に記載のマイクロ流体プレート。
(項目99)
前記チャネルのそれぞれの中に位置付けられ、それを通して延在する、個別の導電性リード線をさらに含む、項目97~98のいずれか1項に記載のマイクロ流体プレート。
(項目100)
前記マイクロウェルプレートの対向端から水平に外向きに延在する、複数の突出部をさらに含む、項目91~99のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目101)
マイクロピペットシステムであって、
第1のマイクロピペット先端と、第1のマイクロピペットの第1の長さに沿った前記第1のマイクロピペット先端と反対側の第1のマイクロピペットの第1の端部とを含む、第1のマイクロピペットと、
第2のマイクロピペット先端と、第2のマイクロピペットの第2の長さに沿った前記第2のマイクロピペット先端と反対側の第2のマイクロピペットの第2の端部とを含む、第2のマイクロピペットと、
垂直配向に前記第1および第2のマイクロピペット先端を伴って前記第1および第2のマイクロピペットを保持する、水平支持アームと
を含み、
前記水平支持アームは、中空であり、端部を有し、前記端部に開口部を有する、マイクロピペットシステム。
(項目102)
前記水平支持アームは、上面を有し、前記上面の中に下向きに延在する溝を含む、項目101に記載のマイクロピペットシステム。
(項目103)
外側フレームを含む、カートリッジをさらに含み、前記外側フレームは、流体コネクタの一部を有し、前記流体コネクタの一部は、第1の流体ポートと、第2の流体ポートとを含む、項目101~102のいずれか1項に記載のマイクロピペットシステム。
(項目104)
前記第1のマイクロピペットの第1の端部は、前記第1の流体ポートに結合され、前記第2のマイクロピペットの第2の端部は、前記第2の流体ポートに結合される、項目103に記載のマイクロピペットシステム。
(項目105)
前記カートリッジの外側フレームは、複数の開口部を含む、項目103~104のいずれか1項に記載のマイクロピペットシステム。
ここで、同様の参照番号が図の全体を通して対応する構造を指定する、図面を参照する。
Claims (14)
- 生物学的サンプルから1つまたは複数の汚染物質を除去するための方法であって、前記方法は、
マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供することであって、前記マイクロチャネルは、前記第1のウェルから前記第2のウェルまで一方向に延在する、ことと、
前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルおよび第4のウェルを提供することであって、第1のプローブが前記第3のウェル上に配置され、第2のプローブが前記第4のウェル上に配置される、ことと、
前記生物学的サンプルを前記第1のウェルの中に入れることと、
磁気ビーズを前記第1のウェルの中に導入し、前記生物学的サンプル内の標的分子を引き寄せることと、
前記第1のプローブおよび前記第2のプローブによって、前記第1のウェルから前記第2のウェルまで延在する前記一方向に交差する方向に前記マイクロチャネルを横断して電場を発生させることであって、前記電場は、前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかと相互作用するように適合される、ことと、
磁場を発生させる磁石を前記第1のウェルの近傍に導入することであって、前記磁場は、前記磁気ビーズと相互作用する、ことと、
前記磁石を移動させることによって、前記マイクロチャネルを通して前記第2のウェルに前記磁気ビーズを移動させることと
を含み、
前記電場は、前記磁気ビーズおよび引き寄せられた標的分子が前記マイクロチャネルを通して前記第2のウェルに移動するにつれて、前記マイクロチャネル内で前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかを維持するように、前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかに作用する、方法。 - 前記第2のウェルから前記磁気ビーズを引き出すことと、
前記磁気ビーズを、流体を含むコンテナの中に挿入することと、
前記磁気ビーズから前記標的分子を解放することと、
前記コンテナから前記磁気ビーズを除去することと
をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記マイクロチャネル内に緩衝剤を提供することをさらに含み、前記緩衝剤は、前記マイクロチャネル内の前記標的分子から前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかを分離する、請求項1に記載の方法。
- 第2のマイクロチャネルを提供することであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、ことと、
前記磁石を使用して、前記第2のマイクロチャネルを通して前記第3のウェルに前記磁気ビーズおよび標的分子を移動させることと
をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内に流体を提供することと、
前記流体の流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間の前記流体の体積差を生成することと
をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを攪拌することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを加熱することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、請求項1に記載の方法。
- 生物学的サンプルから1つまたは複数の汚染物質を除去するためのシステムであって、前記システムは、
前記生物学的サンプルから標的分子を引き寄せるように調整される磁気ビーズと、
前記生物学的サンプルおよび前記磁気ビーズを含有するように適合される第1のウェルと、
前記生物学的サンプルおよび前記磁気ビーズを含有するように適合される第2のウェルと、
前記第1のウェルから前記第2のウェルまで一方向に延在するマイクロチャネルと、
前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルと、
前記第3のウェル内に配置される第1のプローブと、
前記マイクロチャネルと連通する第4のウェルと、
前記第4のウェル内に配置される第2のプローブと、
前記第1のウェルの近傍に移動させられるように適合される磁石であって、前記磁石は、磁場を発生させ、前記磁気ビーズと相互作用するように適合され、前記磁石は、前記第1のウェルから前記マイクロチャネルを介して前記第2のウェルに前記磁気ビーズを移動させることがさらに可能である、磁石と、
電力源と
を含み、
前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、前記電力源に結合され、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、前記電力源が電力を提供するとき、前記第1のウェルから前記第2のウェルまで延在する前記一方向に交差する方向に前記マイクロチャネルを横断して電場を発生させるように適合され、その結果、前記電場は、前記磁気ビーズおよび引き寄せられた標的分子が前記第1のウェルから前記第2のウェルに移動するにつれて、前記マイクロチャネル内で前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかを維持するように、前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかと相互作用する、システム。 - 第2のマイクロチャネルであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、第2のマイクロチャネル
をさらに含み、
前記磁石は、前記第2のウェルから前記第2のマイクロチャネルに沿って前記第3のウェルに移動し、前記磁気ビーズおよび標的分子を前記第2のウェルから前記第3のウェルに移動させるように適合される、請求項9に記載のシステム。 - 前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内の流体と、
前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間の前記流体の体積差であって、前記流体の体積差は、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で前記流体の流動を提供するように適合される、流体の体積差と
をさらに含む、請求項9に記載のシステム。 - 前記第1のウェルの内容物を攪拌するように適合される磁気攪拌器をさらに含む、請求項9に記載のシステム。
- 前記第1のウェルを加熱するように適合される加熱器をさらに含む、請求項9に記載のシステム。
- 前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、請求項9に記載のシステム。
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