JP7386167B2 - 分離によるマイクロ流体チップ内の核酸の精製 - Google Patents

分離によるマイクロ流体チップ内の核酸の精製 Download PDF

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Description

背景
技術分野
本明細書に説明される技術は、生物学的サンプル等のサンプルの処理、例えば、血液等の複合サンプルに由来する核酸の精製と併せた、例えば、基板上に含有される生物学的サンプルからの汚染物質の分離に関する。
関連技術の説明
核酸が、分析試験のために収集され得ることが周知である。例えば、血液からの核酸の収集における主要な課題は、生体サンプルが、極めて多くの場合、汚染物質を含有することである。したがって、核酸サンプル精製は、サンプル核酸の品質が下流用途での性能に影響を及ぼし得るため、実験ワークフローにおいて重要なステップになっている。
多数の一般的な核酸精製技法は、遠心分離、化学分離、または固相ベースの分離を含む。しかしながら、これらの技法は、時間および労働集約的であり、極めて多くの場合、特殊機器の使用を要求する。
生物学的および化学サンプルの分析におけるマイクロ流体の使用が、周知である。1つのそのような使用は、マイクロ流体チップ(時として、「ラボオンチップ」と称される)を利用して、1つまたはそれを上回るサンプルを取得し、測定のためにサンプルを処理し、次いで、組成を評価する、システムを伴う。しかしながら、サンプルは、汚染物質を除去し、下流用途の品質を確実にするように精製されなければならない。
したがって、当技術分野では、高価な高度特殊機器を必要とすることなく、生物学的サンプルを精製するプロセスを改良する必要性がある。
簡単な要旨
本技術の実施形態は、電場および/またはポリエーテル化合物等のゲルを使用し、基板上に含有される生物学的サンプルから生体被分析物を分離する。技術の第1の実施例によると、生体被分析物を分離するための方法は、マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップを含む。緩衝剤等の流体が、生物学的サンプルが入れられる第1のウェル内に提供される。磁気ビーズ、例えば、ポリビニルアルコールに基づく磁気粒子(M-PVA磁気ビーズ)が、次いで、第1のウェルの中に導入される。M-PVA磁気ビーズの表面は、多くの異なる基を用いて官能化され、個別に調整可能な装荷を用いて修飾されることができる。一実施例では、M-PVA磁気ビーズは、血液を含み得る生物学的サンプル内の核酸を単離するように調整されることができる。
M-PVA磁気ビーズは、生物学的サンプル内の核酸を単離し、標的分子をM-PVA磁気ビーズに引き寄せる。緩衝剤内の負に荷電される汚染物質と相互作用する電場が、次いで、第1のウェルに印加される。第1のウェルの外部の磁石が、次いで、第1のウェルに近接させられる。磁石は、磁石がマイクロチャネルに向かって外部に移動されるときに、M-PVA磁気ビーズが、それに引き付けられた標的分子とともに、マイクロチャネルに向かって、かつその中に引動されるように、M-PVA磁気ビーズを引き付けるように機能する。しかしながら、負に荷電される汚染物質の殆どは、電場とのそれらの相互作用に起因して、第1のウェル内で維持される。磁石は、第2のウェルに向かったマイクロチャネル内のその経路に沿って、M-PVA磁気ビーズおよび標的分子を第2のウェルの中に引動し続ける。マイクロチャネルはまた、緩衝剤も含有し、マイクロチャネル内の緩衝剤を通したM-PVA磁気ビーズの移動はさらに、M-PVA磁気ビーズが第2のウェルに到達する時間までに、標的分子が本質的に汚染物質を含まないように、標的分子から汚染物質を排出するように機能する。
本時点で、M-PVA磁気ビーズは、標的分子が依然として付着した第2のウェルから引き出され、チャンバの中に入れられることができ、そこで、M-PVA磁気ビーズは、標的分子を排出するように離調され、次いで、除去されることができる。結果は、本質的に汚染物質を含まない、非常にきれいな生物学的サンプルである。遠心分離、化学分離、または固相ベースの分離のために必要とされるような費用または特殊機能の必要性はない。むしろ、本技法は、わずかな可動部品および広範な電力要件の必要性を伴って単純なマイクロ流体チップ形式で実装されることができる。
いくつかの実施例では、第3のウェルが、第2のマイクロチャネルを介して第2のウェルと接続されることができる。本構成では、いったん磁石が、標的分子を伴うM-PVA磁気ビーズを第2のウェルの中に移動させると、磁石は、次いで、第2のマイクロチャネルに向かって移動され、それによって、第2のウェルから第2のマイクロチャネルの中にM-PVA磁気ビーズを引動し得る。磁石は、次いで、M-PVA磁気ビーズが第3のウェルの中に引動されるように、第3のウェルに向かって移動され得る。本構成は、それを要求する用途のために、別の清浄段階を生物学的サンプルに提供する。
いくつかの実施例では、生物学的サンプルの付加的清浄化は、第2のウェルから第1のウェルに向かって緩衝剤の流動を生成することによって達成され得ることが考慮される。これは、ウェルの間の単純な流体体積差によって達成され得る。一実施例では、第2のウェルは、第1のウェル内に提供されるよりも大きい体積の流体を提供され得る。例えば、望ましい流速を生成し得る、20%~50%の範囲内の流体体積差が、提供され得る。本付加的体積は、第2のウェルからマイクロチャネルを通した第1のウェルの中への流体の流動が、第1のウェルから第2のウェルまでのM-PVA磁気ビーズの移動中に起こるように、生物学的サンプルが第1のウェルの中に挿入された後に追加され得る。本流体の流動は、マイクロチャネルから出て第1のウェルの中に戻るように第1のウェルから逃散した任意の汚染物質を運搬するように機能するであろう。
いくつかの実施例では、電場が、第1および第2の電気導体の適用によって第1のウェルまたはチャンバに印加される。電力源が、導体の間に電位エネルギーの差を生成するために第1および第2の電気導体に接続される。加えて、ソフトウェアが、導体の間に所望の電圧を生じるように、電力源を制御するために使用されることができる。ソフトウェアは、導体を横断して電圧の規模を能動的に制御し得ることが考慮される。
いくつかの実施例では、本システムはさらに、第1の電気導体に結合され、第1のウェルの中および外に第1の電気導体を移動させるように適合される、モータを含んでもよい。同様に、本システムはさらに、第2の電気導体に結合され、第1のウェルの中および外に第2の電気導体を移動させるように適合される、モータを含んでもよい。
いくつかの実施例では、本システムは、第1のウェルの中へのM-PVA磁気ビーズの挿入のため、および第1のウェルからマイクロチャネルの中ならびに第2のウェルの中にM-PVA磁気ビーズを引動するように機能する磁石の全自動移動のために、送達システムに結合されるモータを含んでもよい。同様に、本システムはさらに、第2のウェルからM-PVA磁気ビーズを引き出すため、およびチャンバの中に挿入するために磁石に結合されるモータを含んでもよい。
いくつかの実施例では、M-PVA磁気ビーズは、デオキシリボ核酸を引き付けるように調整される一方で、他の実施例では、M-PVA磁気ビーズは、リボ核酸を引き付けるように調整される。
一実施例では、マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップと、第1のウェル、第2のウェル、およびマイクロチャネル内に流体を提供するステップとを含む、生物学的サンプルから汚染物質を除去するための方法が、提供される。本方法はさらに、生物学的サンプルを第1のウェルの中に入れるステップと、磁気ビーズを第1のウェルの中に導入するステップと、生物学的サンプル内の標的分子を磁気ビーズに引き寄せるステップとを含む。本方法はなおもさらに、電場を第1のウェルに印加するステップであって、電場は、汚染物質と相互作用する、ステップと、磁場を発生させる磁石を第1のウェルの近傍に導入するステップであって、磁場は、磁気ビーズと相互作用する、ステップと、マイクロチャネルに向かって磁石を移動させるステップであって、磁気ビーズは、磁気ビーズおよび標的分子がマイクロチャネルの中に引き込まれるように、磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップとを含む。本方法は、磁気ビーズおよび標的分子がマイクロチャネルを通して移動するにつれて、電場が、第1のウェル内で汚染物質を維持するように、汚染物質に作用するように、提供される。最後に、本方法は、第2のウェルに向かって磁石を移動させるステップであって、磁気ビーズおよび標的分子は、磁気ビーズおよび標的分子が第2のウェルの中に引き込まれるように、磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップを含む。
別の実施例では、流体を含有し、生物学的サンプルを受容するように適合される、第1のウェルと、流体を含有するように適合される、第2のウェルと、第1のウェルと第2のウェルとの間に延在するマイクロチャネルとを含む、生物学的サンプルから汚染物質を除去するためのシステムが、提供される。本システムは、磁気ビーズが、第1のウェルの中に導入されるように適合され、磁気ビーズが、生物学的サンプル内の標的分子を引き付けるように調整されるように、提供される。本システムはさらに、電力源および電力源に結合される2つのプローブを含み、2つのプローブは、電場を第1のウェルに印加するように適合される。本システムは、電力が2つのプローブに印加されるときに、2つのプローブが、電場と相互作用する汚染物質を伴って、その間に電場を発生させるように適合されるように、提供される。本システムはなおもさらに、第1のウェルの近傍に移動されるように適合される磁石を含み、磁石は、磁場を発生させ、磁気ビーズと相互作用するように適合される。本システムはさらに、磁気ビーズが磁石の移動とともにマイクロチャネルの中に引き込まれるように、磁石がマイクロチャネルに向かって移動されるように提供されるように、提供される。加えて、電場は、汚染物質が第1のウェル内で維持されるように、汚染物質と相互作用するように適合され、磁石は、磁気ビーズおよび標的分子が第2のウェルの中に引き込まれるように、第2のウェルに向かって移動するように適合される。
M-PVA磁気ビーズは、生物学的サンプル内の核酸を単離し、標的分子をM-PVA磁気ビーズに引き寄せる。第1のウェルの外部の磁石が、次いで、第1のウェルに近接させられる。磁石は、磁石がマイクロチャネルに向かって移動されるときに、M-PVA磁気ビーズが、それに引き付けられた標的分子とともに、マイクロチャネルに向かって、かつその中に引動されるように、M-PVA磁気ビーズを引き付けるように機能する。マイクロチャネルは、その分子量に応じて、ポリエチレンオキシドまたはポリオキシエチレンとしても公知のポリエチエレングリコール(PEG)等のポリエーテル化合物で充填される。汚染物質は、負に荷電される粒子である。負に荷電される汚染物質が、PEGの中に引き込まれるとき、PEGは、マイクロチャネルを通したこれらの負に荷電される種の進行を阻止するように機能する。
磁石は、第2のウェルに向かったマイクロチャネル内のその経路に沿って、M-PVA磁気ビーズおよび標的分子を第2のウェルの中に引動し続ける。M-PVA磁気ビーズが第2のウェルに到達する時間までに、標的分子は、PEG内で排出された汚染物質を本質的に含まない。
本時点で、M-PVA磁気ビーズは、標的分子が依然として付着した第2のウェルから引き出され、チャンバの中に入れられることができ、そこで、M-PVA磁気ビーズは、標的分子を排出するように離調され、次いで、除去されることができる。結果は、本質的に汚染物質を含まない、非常にきれいな生物学的サンプルである。遠心分離、化学分離、または固相ベースの分離のために必要とされるような費用または特殊機能の必要性はない。むしろ、本技法は、わずかな可動部品および広範な電力要件の必要性を伴って単純なマイクロ流体チップ形式で実装されることができる。
いくつかの実施例では、第3のウェルが、第2のマイクロチャネルを介して第2のウェルと接続されることができる。本構成では、いったん磁石が、標的分子を伴うM-PVA磁気ビーズを第2のウェルの中に移動させると、磁石は、次いで、第2のマイクロチャネルに向かって移動され、それによって、第2のウェルから第2のマイクロチャネルの中にM-PVA磁気ビーズを引動し得る。第2のマイクロチャネルはまた、PEGを含むこともできる。磁石は、次いで、M-PVA磁気ビーズが第3のウェルの中に引動されるように、第3のウェルに向かって移動され得る。本構成は、それを要求する用途のために、別の清浄段階を生物学的サンプルに提供する。
なおもさらに、第1のウェルおよび第2のウェルは、生物学的サンプルをなおもさらに清浄化するように機能するであろう、PEG等のゲルを含み得ることが予想される。
いくつかの実施例では、生物学的サンプルの付加的清浄化は、第2のウェルから第1のウェルに向かってゲルの流動を生成することによって達成され得ることが考慮される。これは、ウェルの間のゲルの単純な流体体積差によって達成され得る。一実施例では、第2のウェルは、第1のウェル内に提供されるよりも大きい体積のゲルを提供され得る。本付加的体積は、第2のウェルからマイクロチャネルを通した第1のウェルの中へのゲルの流動が、第1のウェルから第2のウェルまでのM-PVA磁気ビーズの移動中に起こるように、生物学的サンプルが第1のウェルの中に挿入された後に追加され得る。本流体の流動は、マイクロチャネルから出て第1のウェルの中に戻るように第1のウェルから逃散した任意の汚染物質を運搬するように機能するであろう。
いくつかの実施例では、本システムは、第1のウェルの中へのM-PVA磁気ビーズの挿入のため、および第1のウェルからマイクロチャネルの中ならびに第2のウェルの中にM-PVA磁気ビーズを引動するように機能する磁石の全自動移動のために、送達システムに結合されるモータを含んでもよい。同様に、本システムはさらに、第2のウェルからM-PVA磁気ビーズを引き出すため、およびチャンバの中に挿入するために磁石に結合されるモータを含んでもよい。
いくつかの実施例では、M-PVA磁気ビーズは、デオキシリボ核酸を引き付けるように調整される一方で、他の実施例では、M-PVA磁気ビーズは、リボ核酸を引き付けるように調整される。
一実施例では、マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップと、第1のウェル、第2のウェル、およびマイクロチャネル内に流体を提供するステップと、生物学的サンプルを第1のウェルの中に入れるステップとを含む、生物学的サンプルから汚染物質を除去するための方法が、提供される。本方法はさらに、磁気ビーズを第1のウェルの中に導入するステップと、生物学的サンプル内の標的分子を磁気ビーズに引き寄せるステップと、磁場を発生させる磁石を第1のウェルの近傍に導入するステップであって、磁場は、磁気ビーズと相互作用する、ステップとを含む。本方法はなおもさらに、マイクロチャネルに向かって磁石を移動させるステップであって、磁気ビーズは、磁気ビーズおよび標的分子がマイクロチャネルの中に引き込まれるように、磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、マイクロチャネル内にゲルを提供するステップであって、ゲルは、汚染物質と相互作用する、ステップとを含む。本方法は、ゲルが汚染物質と相互作用するように、提供される。本方法は、最後に、第2のウェルに向かって磁石を移動させるステップであって、磁気ビーズおよび標的分子は、汚染物質がゲル内で維持されるにつれて、汚染物質が標的分子から分離され、磁気ビーズおよび標的分子が第2のウェルの中に引き込まれるように、磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップを含む。
別の実施例では、流体を含有し、生物学的サンプルを受容するように適合される、第1のウェルと、流体を含有するように適合される、第2のウェルと、第1のウェルと第2のウェルとの間に延在する、マイクロチャネルと、マイクロチャネル内に位置するゲルとを含む、システムが、生物学的サンプルから汚染物質を除去するために提供される。本システムは、磁気ビーズが、第1のウェルの中に導入されるように適合され、磁気ビーズが、生物学的サンプル内の標的分子を引き付けるように調整されるように、提供される。本システムはさらに、第1のウェルの近傍に移動されるように適合される、磁石であって、磁場を発生させ、磁気ビーズと相互作用するように適合される、磁石を含む。本システムはさらに、磁石が、マイクロチャネルに向かって移動されるように提供され、磁気ビーズが、磁石の移動とともにマイクロチャネルの中に引き込まれ、ゲルが、磁気ビーズがゲルを通して移動するときに、汚染物質のうちの少なくともいくつかがゲル内で捕捉されるように、汚染物質と相互作用するように適合されるように、提供される。最後に、本システムは、磁石が第2のウェルに向かって移動し、磁気ビーズおよび標的分子が第2のウェルの中に引き込まれるように、提供される。
システムが、水平アクチュエータと、水平アクチュエータに結合される、トレイと、トレイに結合される、ウェルプレートと、ウェルプレートに結合される、マイクロ流体チップと、垂直アクチュエータと、垂直アクチュエータに結合される、ピペットと、ピペット内の流体の温度を制御するようにピペットに結合される、加熱器と、ピペット内の流体の移動を制御するようにピペットに結合される、ポンプと、トレイ、ウェルプレート、およびマイクロ流体チップの水平移動を制御するように水平アクチュエータに通信可能に結合され、ピペットの垂直移動を制御するように垂直アクチュエータに通信可能に結合され、ポンプを制御するようにポンプに通信可能に結合され、加熱器を制御するように加熱器に通信可能に結合される、コントローラとを含むものとして、要約され得る。
本システムはさらに、回転アクチュエータと、回転アクチュエータに結合される磁石とを含んでもよく、コントローラは、トレイの下の磁石の回転を制御するように回転アクチュエータに通信可能に結合される。ウェルプレートは、マイクロ流体チップの下に位置する複数の導電性リード線を含んでもよい。ピペットは、支持アームによって垂直配向で保持されるピペット先端を含んでもよく、ピペット先端と反対側のピペットの端部は、カートリッジ内で保持されてもよい。加熱器は、静止側壁と、ヒンジによって静止側壁に回転可能に結合されるヒンジ連結側壁とを含んでもよい。静止側壁は、第1の溝を含んでもよく、ヒンジ連結側壁は、第2の溝を含んでもよく、ピペットは、第1および第2の溝を通して静止側壁とヒンジ連結側壁との間に延在してもよい。静止側壁は、静止側壁の第1の側面の近傍の第1の場所においてピペットを挟締するように静止側壁からヒンジ連結側壁に向かって外向きに移動可能な第1のバーと、静止側壁の第1の側面と反対側の静止側壁の第2の側面の近傍の第2の場所においてピペットを挟締するように静止側壁からヒンジ連結側壁に向かって外向きに移動可能な第2のバーとを含んでもよい。
方法が、ウェルプレート内の第1のウェル内に生物学的サンプルを受容するステップと、ウェルプレート内の第2のウェル内に別の試薬を受容するステップと、ポンプを動作させ、ウェルプレートの第1のウェルからピペットの中に生物学的サンプルを引き込むステップと、アクチュエータを動作させ、ウェルプレートの第1のウェルからマイクロ流体チップの第1のウェルまでピペットを移動させるステップと、ポンプを動作させ、ピペットからマイクロ流体チップの第1のウェルの中に生物学的サンプルを放出するステップと、アクチュエータを動作させ、マイクロ流体チップの第1のウェルからマイクロ流体チップの第2のウェルまでピペットを移動させるステップと、ポンプを動作させ、マイクロ流体チップの第2のウェルからピペットの中に生物学的サンプルを引き込むステップと、アクチュエータを動作させ、マイクロ流体チップの第2のウェルからマイクロ流体チップの第2のウェルまでピペットを移動させるステップと、ポンプを動作させ、ウェルプレートの第2のウェルからピペットの中に他の試薬を引き込むステップと、加熱器を動作させ、ピペット内の生物学的サンプルおよび他の試薬を加熱するステップと、ポンプを動作させ、ピペットからウェルプレート内の第3のウェルの中に生物学的サンプルを放出するステップとを含むものとして、要約され得る。
生物学的サンプルは、DNA、RNA、mRNA、またはタンパク質を含んでもよい。汚染物質が、マイクロ流体チップ内で生物学的サンプルから除去されてもよい。ポリメラーゼ連鎖反応が、ピペット内で起こってもよい。
本発明は、例えば、以下を提供する。
(項目1)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するための方法であって、
マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップと、
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内に流体を提供するステップと、
前記生物学的サンプルを前記第1のウェルの中に入れるステップと、
磁気ビーズを前記第1のウェルの中に導入するステップと、
前記生物学的サンプル内の標的分子を前記磁気ビーズに引き寄せるステップと、
前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するステップであって、前記電場は、前記汚染物質と相互作用する、ステップと、
磁場を発生させる磁石を前記第1のウェルの近傍に導入するステップであって、前記磁場は、前記磁気ビーズと相互作用する、ステップと、
前記マイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズは、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記電場は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記マイクロチャネルを通して移動するにつれて、前記マイクロチャネル内で前記汚染物質のうちの少なくともいくつかを維持するように、前記汚染物質に作用する、ステップと、
前記第2のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
を含む、方法。
(項目2)
前記第2のウェルから前記磁気ビーズを引き出すステップと、
前記磁気ビーズを、流体を含むコンテナの中に挿入するステップと、
前記標的分子を前記コンテナ内の前記流体の中に放出するように機能する、前記磁気ビーズを離調するステップと、
前記コンテナから前記磁気ビーズを除去するステップと
をさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記生物学的サンプルは、血液を含む、項目1~2のいずれか1項に記載の方法。
(項目4)
前記標的分子は、核酸を含む、項目1~3のいずれか1項に記載の方法。
(項目5)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目1~4のいずれか1項に記載の方法。
(項目6)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目7)
前記マイクロチャネルは、深度が50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目1~6のいずれか1項に記載の方法。
(項目8)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目1~7のいずれか1項に記載の方法。
(項目9)
前記マイクロチャネルは、前記マイクロチャネルの中に引き込まれる前記標的分子から任意の汚染物質をさらに分離するように機能する、緩衝剤を含む、項目1~8のいずれか1項に記載の方法。
(項目10)
第3のウェルおよび第2のマイクロチャネルを提供するステップであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、ステップと、
前記第2のマイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記第3のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
をさらに含む、項目1および3~9のいずれか1項に記載の方法。
(項目11)
前記流体の流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間の前記流体の体積差を生成するステップをさらに含む、項目1~10のいずれか1項に記載の方法。
(項目12)
前記磁石の移動は、自動化され、運動制御ハードウェアによって制御される、項目1~11のいずれか1項に記載の方法。
(項目13)
前記第1のウェル内に磁気攪拌器を提供するステップと、
前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを攪拌するステップと
をさらに含む、項目1~12のいずれか1項に記載の方法。
(項目14)
前記第1のウェルのための加熱器を提供するステップと、
前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを加熱するステップと
をさらに含む、項目1~13のいずれか1項に記載の方法。
(項目15)
温度センサと、コントローラとをさらに含み、前記コントローラは、前記温度センサから受信される温度信号に基づいて、前記加熱器を調節する、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記加熱器は、電圧が印加され得る、抵抗金属コーティングである、項目14~15のいずれか1項に記載の方法。
(項目17)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物である、項目16に記載の方法。
(項目18)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置する、項目1~17のいずれか1項に記載の方法。
(項目19)
前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するステップは、前記第1のウェル内に第1のプローブおよび前記第2のウェル内に第2のプローブを配置することを含み、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目1~18のいずれか1項に記載の方法。
(項目20)
前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルを提供するステップと、前記マイクロチャネルと連通する第4のウェルを提供するステップとをさらに含み、前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するステップは、前記第3のウェル内に第1のプローブおよび前記第4のウェル内に第2のプローブを配置することを含み、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目1~18のいずれか1項に記載の方法。
(項目21)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するためのシステムであって、
流体を含有し、前記生物学的サンプルを受容するように適合される、第1のウェルと、
流体を含有するように適合される、第2のウェルと、
前記第1のウェルと前記第2のウェルとの間に延在するマイクロチャネルであって、磁気ビーズは、前記第1のウェルの中に導入されるように適合され、前記磁気ビーズは、前記生物学的サンプル内の標的分子を引き付けるように調整される、マイクロチャネルと、
電力源および前記電力源に結合される2つのプローブであって、前記2つのプローブは、前記マイクロチャネルを横断して電場を印加するように適合され、
電力が前記2つのプローブに印加されるときに、前記2つのプローブは、前記汚染物質が電場と相互作用するように、その間に電場を発生させるように適合される、電力源および2つのプローブと、
前記第1のウェルの近傍に移動されるように適合される、磁石であって、磁場を発生させ、前記磁気ビーズと相互作用するように適合される、磁石と
を含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズが、前記磁石の移動とともに前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記マイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるように適合され、
前記電場は、前記汚染物質のうちの少なくともいくつかが前記マイクロチャネル内で維持されるように、前記汚染物質と相互作用するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記第2のウェルに向かって移動するように適合される、システム。
(項目22)
前記生物学的サンプルは、血液を含み、前記標的分子は、核酸を含む、項目21に記載のシステム。
(項目23)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目21~22のいずれか1項に記載のシステム。
(項目24)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目21~23のいずれか1項に記載のシステム。
(項目25)
前記マイクロチャネルは、深度が50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目21~24のいずれか1項に記載のシステム。
(項目26)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目21~25のいずれか1項に記載のシステム。
(項目27)
第3のウェルと、
第2のマイクロチャネルであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、第2のマイクロチャネルと
をさらに含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記第2のマイクロチャネルに向かって移動するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記第3のウェルに向かって移動するように適合される、項目21~26のいずれか1項に記載のシステム。
(項目28)
前記流体の流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間に生成される前記流体の体積差をさらに含む、項目21~27のいずれか1項に記載のシステム。
(項目29)
前記電力源を制御するように適合されるコントローラをさらに含む、項目21~28のいずれか1項に記載のシステム。
(項目30)
前記コントローラは、前記磁石の移動を制御するように適合される、項目29に記載のシステム。
(項目31)
前記第1のウェルの内容物を攪拌するように適合される、磁気攪拌器と、
前記磁気攪拌器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目29~30のいずれか1項に記載のシステム。
(項目32)
前記第1のウェルを加熱するように適合される、加熱器と、
前記加熱器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目29~31のいずれか1項に記載のシステム。
(項目33)
前記コントローラに結合され、温度信号を発生させるように適合される、温度センサをさらに含み、
前記コントローラは、前記温度センサから受信される前記温度信号に基づいて、前記加熱器を制御するように適合される、項目32に記載のシステム。
(項目34)
前記加熱器は、抵抗金属コーティングを含む、項目32~33のいずれか1項に記載のシステム。
(項目35)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物を含む、項目34に記載のシステム。
(項目36)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置する、項目21~35のいずれか1項に記載のシステム。
(項目37)
前記2つのプローブのうちの第1のものは、前記第1のウェル内に配置され、前記2つのプローブのうちの第2のものは、前記第2のウェル内に配置され、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目21~36のいずれか1項に記載のシステム。
(項目38)
前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルと、前記マイクロチャネルと連通する第4のウェルとをさらに含み、前記2つのプローブのうちの第1のものは、前記第3のウェル内に配置され、前記2つのプローブのうちの第2のものは、前記第4のウェル内に配置され、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、項目21~36のいずれか1項に記載のシステム。
(項目39)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するための方法であって、
マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供するステップと、
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内に流体を提供するステップと、
前記生物学的サンプルを前記第1のウェルの中に入れるステップと、
磁気ビーズを前記第1のウェルの中に導入するステップと、
前記生物学的サンプル内の標的分子を前記磁気ビーズに引き寄せるステップと、
磁場を発生させる磁石を前記第1のウェルの近傍に導入するステップであって、前記磁場は、前記磁気ビーズと相互作用する、ステップと、
前記マイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズは、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記マイクロチャネル内にゲルを提供するステップであって、前記ゲルは、前記汚染物質と相互作用する、ステップと、
前記第2のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記汚染物質が前記ゲル内で維持されるにつれて、前記汚染物質が前記標的分子から分離され、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
を含む、方法。
(項目40)
前記ゲルは、ポリエーテル化合物を含む、項目39に記載の方法。
(項目41)
前記ポリエーテル化合物は、ポリエチエレングリコールを含む、項目40に記載の方法。
(項目42)
前記生物学的サンプルは、血液を含む、項目39~41のいずれか1項に記載の方法。
(項目43)
前記標的分子は、核酸を含む、項目39~42のいずれか1項に記載の方法。
(項目44)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目39~43のいずれか1項に記載の方法。
(項目45)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目39~44のいずれか1項に記載の方法。
(項目46)
前記マイクロチャネルは、深さが50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目39~45のいずれか1項に記載の方法。
(項目47)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目39~46のいずれか1項に記載の方法。
(項目48)
前記第2のウェルから前記磁気ビーズを引き出すステップと、
前記磁気ビーズを、流体を含むコンテナの中に挿入するステップと、
前記標的分子を前記コンテナ内の前記流体の中に放出するように機能する、前記磁気ビーズを離調するステップと、
前記コンテナから前記磁気ビーズを除去するステップと
をさらに含む、項目39~47のいずれか1項に記載の方法。
(項目49)
第3のウェルおよび第2のマイクロチャネルを提供するステップであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、ステップと、
前記第2のマイクロチャネル内にゲルを提供するステップと、
前記第2のマイクロチャネルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと、
前記第3のウェルに向かって前記磁石を移動させるステップであって、前記磁気ビーズおよび標的分子は、前記磁気ビーズおよび前記標的分子が、前記第2のマイクロチャネル内の前記ゲルを通して、前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記磁石の移動とともに引き寄せられる、ステップと
をさらに含む、項目39~47のいずれか1項に記載の方法。
(項目50)
前記第2のウェル内に前記ゲルを提供するステップをさらに含む、項目39~49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
前記第1のウェル内に前記ゲルを提供するステップをさらに含む、項目39~50のいずれか1項に記載の方法。
(項目52)
前記ゲルの流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェル内の前記ゲルおよび前記第1のウェル内の前記流体の体積差を生成するステップをさらに含む、項目39~51のいずれか1項に記載の方法。
(項目53)
前記磁石の移動は、自動化され、運動制御ハードウェアによって制御される、項目39~52のいずれか1項に記載の方法。
(項目54)
前記第1のウェル内に磁気攪拌器を提供するステップと、前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを攪拌するステップとをさらに含む、項目39~53のいずれか1項に記載の方法。
(項目55)
前記第1のウェルのための加熱器を提供するステップと、
前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを加熱するステップと
をさらに含む、項目39~54のいずれか1項に記載の方法。
(項目56)
温度センサと、コントローラとをさらに含み、前記コントローラは、前記温度センサから受信される温度信号に基づいて、前記加熱器を調節する、項目55に記載の方法。
(項目57)
前記加熱器は、電圧が印加され得る、抵抗金属コーティングである、項目55~56のいずれか1項に記載の方法。
(項目58)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物である、項目57に記載の方法。
(項目59)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置する、項目39~58のいずれか1項に記載の方法。
(項目60)
生物学的サンプルから汚染物質を除去するためのシステムであって、
流体を含有し、前記生物学的サンプルを受容するように適合される、第1のウェルと、
流体を含有するように適合される、第2のウェルと、
前記第1のウェルと前記第2のウェルとの間に延在する、マイクロチャネルと、
前記マイクロチャネル内に位置するゲルであって、磁気ビーズは、前記第1のウェルの中に導入されるように適合され、前記磁気ビーズは、前記生物学的サンプル内の標的分子を引き付けるように調整される、ゲルと、
前記第1のウェルの近傍に移動されるように適合される、磁石であって、磁場を発生させ、前記磁気ビーズと相互作用するように適合される、磁石と
を含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズが前記磁石の移動とともに前記マイクロチャネルの中に引き込まれるように、前記マイクロチャネルに向かって移動されるように提供され、
前記ゲルは、前記磁気ビーズが前記ゲルを通して移動するときに、前記汚染物質のうちの少なくともいくつかが前記ゲル内で捕捉されるように、前記汚染物質と相互作用するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のウェルの中に引き込まれるように、前記第2のウェルに向かって移動するように適合される、システム。
(項目61)
前記ゲルは、ポリエーテル化合物を含む、項目60に記載のシステム。
(項目62)
前記ポリエーテル化合物は、ポリエチエレングリコールを含む、項目61に記載のシステム。
(項目63)
前記汚染物質は、負に荷電される、項目60~62のいずれか1項に記載のシステム。
(項目64)
前記生物学的サンプルは、血液を含み、前記標的分子は、核酸を含む、項目60~63のいずれか1項に記載のシステム。
(項目65)
前記第1のウェルは、直径が約2mmである、項目60~64のいずれか1項に記載のシステム。
(項目66)
前記マイクロチャネルは、深さが50~200pmに及び、長さが2~3cmに及ぶ、項目60~65のいずれか1項に記載のシステム。
(項目67)
前記マイクロチャネルは、深さが約100pmであり、長さが約2.5cmである、項目60~66のいずれか1項に記載のシステム。
(項目68)
第3のウェルと、
第2のマイクロチャネルであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続され、前記ゲルを含む、第2のマイクロチャネルと
をさらに含み、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第2のマイクロチャネルの中に引き込まれ、前記汚染物質のうちの少なくともいくつかが前記第2のマイクロチャネル内で前記ゲルによって捕捉されるように、前記第2のマイクロチャネルに向かって移動するように適合され、
前記磁石は、前記磁気ビーズおよび標的分子が前記第3のウェルの中に引き込まれるように、前記第3のウェルに向かって移動するように適合される、項目60~67のいずれか1項に記載のシステム。
(項目69)
前記第2のウェルは、前記ゲルと、前記ゲルの流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェル内の前記ゲルの間に生成される前記第1のウェル内の前記流体の体積差とを含む、項目60~68のいずれか1項に記載のシステム。
(項目70)
前記磁石の移動を制御するように適合されるコントローラをさらに含む、項目60~69のいずれか1項に記載のシステム。
(項目71)
前記第1のウェルの内容物を攪拌するように適合される、磁気攪拌器と、
前記磁気攪拌器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目70に記載のシステム。
(項目72)
前記第1のウェルを加熱するように適合される、加熱器と、
前記加熱器を制御するように適合される、前記コントローラと
をさらに含む、項目70~71のいずれか1項に記載のシステム。
(項目73)
前記コントローラに結合され、温度信号を発生させるように適合される、温度センサをさらに含み、
前記コントローラは、前記温度センサから受信される前記温度信号に基づいて、前記加熱器を制御するように適合される、項目72に記載のシステム。
(項目74)
前記加熱器は、抵抗金属コーティングを含む、項目72~73のいずれか1項に記載のシステム。
(項目75)
前記抵抗金属コーティングは、インジウムスズ酸化物を含む、項目74に記載のシステム。
(項目76)
前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネルは、チップ上に位置される、項目60~75のいずれか1項に記載のシステム。
(項目77)
水平アクチュエータと、
前記水平アクチュエータに結合される、トレイと、
前記トレイに結合される、ウェルプレートと、
前記ウェルプレートに結合される、マイクロ流体チップと、
垂直アクチュエータと、
前記垂直アクチュエータに結合される、ピペットと、
前記ピペット内の流体の温度を制御するように前記ピペットに結合される、加熱器と、
前記ピペット内の流体の移動を制御するように前記ピペットに結合される、ポンプと、
前記トレイ、前記ウェルプレート、および前記マイクロ流体チップの水平移動を制御するように前記水平アクチュエータに通信可能に結合され、前記ピペットの垂直移動を制御するように前記垂直アクチュエータに通信可能に結合され、前記ポンプを制御するように前記ポンプに通信可能に結合され、前記加熱器を制御するように前記加熱器に通信可能に結合される、コントローラと
を含む、システム。
(項目78)
回転アクチュエータと、
前記回転アクチュエータに結合される磁石と
をさらに含み、
前記コントローラは、前記トレイの下の前記磁石の回転を制御するように前記回転アクチュエータに通信可能に結合される、項目77に記載のシステム。
(項目79)
前記ウェルプレートは、前記マイクロ流体チップの下に位置する複数の導電性リード線を含む、項目77~78のいずれか1項に記載のシステム。
(項目80)
前記ピペットは、支持アームによって垂直配向で保持されるピペット先端を含み、前記ピペット先端と反対側の前記ピペットの端部は、カートリッジ内で保持される、項目77~79のいずれか1項に記載のシステム。
(項目81)
前記加熱器は、静止側壁と、ヒンジによって前記静止側壁に回転可能に結合されるヒンジ連結側壁とを含む、項目77~80のいずれか1項に記載のシステム。
(項目82)
前記静止側壁は、第1の溝を含み、前記ヒンジ連結側壁は、第2の溝を含み、前記ピペットは、前記第1および第2の溝を通して前記静止側壁と前記ヒンジ連結側壁との間に延在する、項目81に記載のシステム。
(項目83)
前記静止側壁は、前記静止側壁の第1の側面の近傍の第1の場所において前記ピペットを挟締するように前記静止側壁から前記ヒンジ連結側壁に向かって外向きに移動可能な第1のバーと、前記静止側壁の第1の側面と反対側の前記静止側壁の第2の側面の近傍の第2の場所において前記ピペットを挟締するように前記静止側壁から前記ヒンジ連結側壁に向かって外向きに移動可能な第2のバーとを含む、項目81~82のいずれか1項に記載のシステム。
(項目84)
ウェルプレート内の第1のウェル内に生物学的サンプルを受容するステップと、
前記ウェルプレート内の第2のウェル内に別の試薬を受容するステップと、
ポンプを動作させ、前記ウェルプレートの第1のウェルからピペットの中に前記生物学的サンプルを引き込むステップと、
アクチュエータを動作させ、前記ウェルプレートの第1のウェルからマイクロ流体チップの第1のウェルまで前記ピペットを移動させるステップと、
前記ポンプを動作させ、前記ピペットから前記マイクロ流体チップの第1のウェルの中に前記生物学的サンプルを放出するステップと、
前記アクチュエータを動作させ、前記マイクロ流体チップの第1のウェルから前記マイクロ流体チップの第2のウェルまで前記ピペットを移動させるステップと、
前記ポンプを動作させ、前記マイクロ流体チップの第2のウェルから前記ピペットの中に前記生物学的サンプルを引き込むステップと、
前記アクチュエータを動作させ、前記マイクロ流体チップの第2のウェルから前記ウェルプレートの第2のウェルまで前記ピペットを移動させるステップと、
前記ポンプを動作させ、前記ウェルプレートの第2のウェルから前記ピペットの中に前記他の試薬を引き込むステップと、
加熱器を動作させ、前記ピペット内の前記生物学的サンプルおよび前記他の試薬を加熱するステップと、
前記ポンプを動作させ、前記ピペットから前記ウェルプレート内の第3のウェルの中に前記生物学的サンプルを放出するステップと
を含む、方法。
(項目85)
前記生物学的サンプルは、DNAを含む、項目84に記載の方法。
(項目86)
前記生物学的サンプルは、RNAを含む、項目84に記載の方法。
(項目87)
前記生物学的サンプルは、mRNAを含む、項目84に記載の方法。
(項目88)
前記生物学的サンプルは、タンパク質を含む、項目84に記載の方法。
(項目89)
汚染物質が、前記マイクロ流体チップ内の前記生物学的サンプルから除去される、項目84~88のいずれか1項に記載の方法。
(項目90)
ポリメラーゼ連鎖反応が、前記ピペット内で起こる、項目84~89のいずれか1項に記載の方法。
(項目91)
前記マイクロウェルプレートの上面に形成される複数のマイクロウェルと、
前記マイクロウェルプレートの上面に形成される空洞であって、マイクロ流体チップを受容するように定寸される、空洞と
を含む、マイクロウェルプレート。
(項目92)
前記空洞は、直四角柱を含む形状を有する、項目91に記載のマイクロウェルプレート。
(項目93)
前記空洞は、前記マイクロウェルプレートの縁まで延在し、それと一致する、項目91~92のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目94)
前記空洞内に位置される前記マイクロ流体チップをさらに含む、項目91~93のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目95)
前記空洞は、寸法の第1のセットを有し、前記マイクロ流体チップは、前記寸法の第1のセットに合致する寸法の第2のセットを有する、項目94に記載のマイクロウェルプレート。
(項目96)
前記空洞の底部境界を形成する前記マイクロウェルプレートの表面は、前記マイクロ流体チップの底面内のマイクロ流体チャネルに面し、前記マイクロ流体チャネルによって形成される経路の下側境界を形成する、項目94~95のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目97)
前記空洞の底部境界を形成する前記マイクロウェルプレートの表面に形成される複数のチャネルをさらに含む、項目91~95のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目98)
前記チャネルはそれぞれ、比較的に広い底端部分と、前記空洞の底部境界を形成する前記表面から前記比較的に広い底端部分まで延在する比較的に狭い上端部分とを含む、項目97に記載のマイクロ流体プレート。
(項目99)
前記チャネルのそれぞれの中に位置付けられ、それを通して延在する、個別の導電性リード線をさらに含む、項目97~98のいずれか1項に記載のマイクロ流体プレート。
(項目100)
前記マイクロウェルプレートの対向端から水平に外向きに延在する、複数の突出部をさらに含む、項目91~99のいずれか1項に記載のマイクロウェルプレート。
(項目101)
マイクロピペットシステムであって、
第1のマイクロピペット先端と、第1のマイクロピペットの第1の長さに沿った前記第1のマイクロピペット先端と反対側の第1のマイクロピペットの第1の端部とを含む、第1のマイクロピペットと、
第2のマイクロピペット先端と、第2のマイクロピペットの第2の長さに沿った前記第2のマイクロピペット先端と反対側の第2のマイクロピペットの第2の端部とを含む、第2のマイクロピペットと、
垂直配向に前記第1および第2のマイクロピペット先端を伴って前記第1および第2のマイクロピペットを保持する、水平支持アームと
を含み、
前記水平支持アームは、中空であり、端部を有し、前記端部に開口部を有する、マイクロピペットシステム。
(項目102)
前記水平支持アームは、上面を有し、前記上面の中に下向きに延在する溝を含む、項目101に記載のマイクロピペットシステム。
(項目103)
外側フレームを含む、カートリッジをさらに含み、前記外側フレームは、流体コネクタの一部を有し、前記流体コネクタの一部は、第1の流体ポートと、第2の流体ポートとを含む、項目101~102のいずれか1項に記載のマイクロピペットシステム。
(項目104)
前記第1のマイクロピペットの第1の端部は、前記第1の流体ポートに結合され、前記第2のマイクロピペットの第2の端部は、前記第2の流体ポートに結合される、項目103に記載のマイクロピペットシステム。
(項目105)
前記カートリッジの外側フレームは、複数の開口部を含む、項目103~104のいずれか1項に記載のマイクロピペットシステム。
図1は、本技術の一実施例の説明図である。 図2は、精製されるべき生物学的サンプルを含む、図1による拡大図である。 図3は、標的分子を引き付けるように機能する磁気ビーズを伴う、図2による図である。 図4は、汚染物質を引き付けるように機能する電場を生物学的サンプルに印加する電極を伴う、図3による図である。 図4Aは、図4に示されるものに類似するが、電極が図4に示されるものと異なるウェル内に配置される、図である。 図5は、汚染物質と相互作用する電場の説明図である。 図6は、ビーズを引き付けるように機能する、磁気ビーズの近傍に導入される磁石を伴う、図4による図である。 図7は、磁気ビーズがマイクロチャネルの中に移動される、図6による図である。 図8は、磁気ビーズがマイクロチャネルを通して第2のウェルの中に移動される、図7による図である。 図9は、図8による、精製された生物学的サンプルの図である。 図10は、図1~8による、技術の動作のシーケンスを示すフロー図である。 図11は、図10による、付加的なさらなるステップを図示するフロー図である。 図12は、図11による、図である。 図13は、コントローラ、攪拌器、加熱器、および温度センサを伴う、図3による図である。 図14は、ビーズを引き付けるように機能する、磁気ビーズの近傍に導入される磁石を伴う、図13による図である。 図15は、磁気ビーズがマイクロチャネルの中に移動される、図14による図である。 図16は、磁気ビーズがマイクロチャネルを通して第2のウェルの中に移動される、図15による図である。 図17は、図16による、精製された生物学的サンプルの図である。 図18は、図1による、本技術の一実施例の説明図である。 図19は、図1~3および13~17による、技術の動作のシーケンスを示すフロー図である。 図20は、図19による、付加的なさらなるステップを図示するフロー図である。 図21は、図20による方法を採用する、チップの図である。 図22は、生物学的サンプルを処理するためのマイクロ流体システムの後面、上面、および左側面斜視図を図示する。 図23は、図22のマイクロ流体システムの正面、底面、および右側面斜視図を図示する。 図24は、図22のマイクロ流体システムの左側面図を図示する。 図25は、図22のマイクロ流体システムの右側面図を図示する。 図26は、図22のマイクロ流体システムの上面図を図示する。 図27は、図22のマイクロ流体システムの底面図を図示する。 図28は、図22のマイクロ流体システムの後面図を図示する。 図29は、図22のマイクロ流体システムの正面図を図示する。 図30は、その筐体が除去された、図22のマイクロ流体システムの正面、上面、および左側面斜視図を図示する。 図31は、その筐体が除去された、図22のマイクロ流体システムの正面、底面、および左側面斜視図を図示する。 図32は、その筐体が除去された、図22のマイクロ流体システムの正面、上面、および右側面斜視図を図示する。 図33は、その筐体が除去された、図22のマイクロ流体システムの後面、上面、および左側面斜視図を図示する。 図34は、その筐体が除去された、図22のマイクロ流体システムの後面、上面、および右側面斜視図を図示する。 図35は、図22のマイクロ流体システムのマイクロ流体プレートまたはチップの底面斜視図を図示する。 図36は、図35のマイクロ流体チップが除去された、図22のマイクロ流体システムの一部の斜視図を図示する。 図37は、図22のマイクロ流体システムのマイクロウェルプレートの上面斜視図を図示する。 図38は、図35のマイクロ流体チップおよび図37のマイクロウェルプレートが除去された、図22のマイクロ流体システムの一部の斜視図を図示する。 図39は、そのマイクロ流体チップ、マイクロウェルプレート、および伝導リード線が除去された、図22のマイクロ流体システムの一部の斜視図を図示する。 図40は、そのマイクロ流体チップ、マイクロウェルプレート、伝導リード線、およびトレイが除去された、図22のマイクロ流体システムの斜視図を図示する。 図41は、付加的構成要素が除去された、図40に図示されるようなマイクロ流体システムの斜視図を図示する。 図42は、図22のマイクロ流体システムの垂直作動システムの一部の斜視図を図示する。 図43は、図22のマイクロ流体システムのマイクロピペットシステムの斜視図を図示する。 図44は、そのヒンジ連結ドアが除去された、図22のマイクロ流体システムのクレードルの斜視図を図示する。 図45は、図22のマイクロ流体システムのクレードルのヒンジ連結ドアの斜視図を図示する。 図46は、図22のマイクロ流体システムのシリンジポンプシステムを図示する。
詳細な説明
ここで、同様の参照番号が図の全体を通して対応する構造を指定する、図面を参照する。
本技術の実施形態は、磁気ビーズおよび電場を介してサンプルから生物学的物質を分離するためのシステムおよび方法を伴う。技術の実施形態は、概して、デオキシリボ核酸(DNA)および/またはリボ核酸(RNA)の形態の核酸を含む、血液等の複合サンプルと併用するために非常に適している。
図1は、核酸を精製するための磁気電気泳動分離用のシステム100を図示する。本実施例は、第1のウェルまたはリザーバ104と、マイクロチャネル106と、第2のウェルまたはリザーバ108とを含む、マイクロ流体チップ102を利用する。第1および第2のウェル104、108は、正方形として図示されるが、それらは、円形または卵形等の事実上いかなる所望の形状も含み得ることが、当業者によって理解されるであろう。
一実施例では、約2mmの直径を有する、第1のウェル104が、提供されてもよい。加えて、一実施例では、マイクロチャネル106は、長さが約2~3cmであり、約100pmの深度を有し、幅が約50~200pmであってもよい。
ここで、図2および3を参照すると、第1のウェル104は、標的分子110および汚染物質112の両方を含む、生物学的サンプルをその中に伴って図示される。生物学的サンプルは、血液を含み得、第1のウェル104は、生物学的サンプルが入れられる流体または緩衝剤を提供されることに留意されたい。
M-PVA磁気ビーズ(図3)等の磁気ビーズ114が、次いで、第1のウェル104の中に導入される。磁気ビーズ114は、血液のような複合サンプルから核酸等の標的分子を収集するように共役される。図3に示されるように、標的分子110が、磁気ビーズ114に引き寄せられる一方で、汚染物質112は、引き寄せられない。本結果は、図示されるように、標的分子110を個々の磁気ビーズ114の周囲にクラスタ化させる。
いくつかの実施例では、生物学的サンプルは、例えば、磁気ビーズが、標的分子の適切な接着のためのサンプルの混合を確実にするように、生物学的サンプルの中に入れられるときに、緩やかに磁気的に攪拌されることができる。同様に、生物学的サンプルが局所的に加熱され得ることが考慮される。
図4および5は、コントローラ118aによって制御される電気エネルギー源116aの使用を含む、システム100aの実施例を図示する。コントローラ118aは、所望に応じて電圧源116aを制御するようにプログラムされる、任意のタイプのコンピュータであってもよい。
コントローラ118aはまた、磁気攪拌器117aおよび加熱器119aを制御し得ることも考慮される。加熱器はまた、例えば、抵抗金属コーティングを含み得る。抵抗金属コーティングは、ウェルまたはリザーバを裏打ちする、インジウムスズ酸化物(ITO)であり得る。加熱器119aは、ウェルの外側に示されているが、コーティングは、ウェルの内側または外側を裏打ちし得ることを理解されたい。同様に、コントローラ118aは、直接制御を金属コーティングに提供し得る、または0~12ボルト信号を加熱器に印加するように適合される中間コントローラが、提供され得る。さらに、温度センサ121aが、フィードバック情報を与え、設定点で温度を維持するように提供され得ることを理解されたい。種々の部品および構成要素が、接続を示すように接続線を伴って図示されるが、これらは、図式的にすぎず、接続は、配線接続または無線接続を含み得ることを理解されたい。
また、図4には、正電荷を有するように構成される第1のプローブ120aおよび負電荷を有するように構成される第2のプローブ122aも含まれる。第1および第2のプローブ120a、122aの間で生じられる電圧差の規模は、電力源に依存する。
図5に図示されるように、電場124aが、第1および第2のプローブ120a、122aの間で発生される。電場は、負に荷電される汚染物質112aと相互作用する力線(鎖線として示される)を伴って図示される。電場124aは、負に荷電される汚染物質112aと比較的に強く相互作用するように発生されるが、本質的に磁気ビーズ114aまたは標的分子110aと相互作用しない。
図6は、第1のウェル104aの近傍に導入される磁石126aの導入を図示する。磁石126aは、磁気ビーズ114aを引き付けるように設計される。一実施例では、磁石126aは、第1のウェル104aの一方の端部に位置付けられ、磁気ビーズ114aおよび関連付けられる標的分子110aがマイクロチャネル106aに向かって移動されるように、マイクロチャネル106aに向かって第1のウェル104aを横断するように移動されてもよい。しかしながら、電場124aは、電場124aとの相互作用に起因して定位置で負に荷電される汚染物質112aを保持するように機能するであろうことが、当業者によって理解されるであろう。
図6に図示されるように、磁石126aおよび磁気ビーズ114aは、マイクロチャネル106aに向かって移動されるが、汚染物質112aの殆どは、第1のウェル104a内に残される。しかしながら、少数の汚染物質112aが、マイクロチャネルに向かって標的分子110aとともに引動され得ることに留意されたい。
さらに、磁石126aの移動は、コントローラ118aによって制御され得、ソフトウェアプログラムによる、全自動運動を含み得ることに留意されたい。移動は、単純に直線状であり得る、またはプログラムされ得る複雑な移動の任意の組み合わせであり得る。
図7は、磁気ビーズ114aおよび標的分子110aがそれに沿って引動される、マイクロチャネル106aの中に移動する磁石126aを図示する。マイクロチャネル106aは、(例えば、ミリメートル/秒規模の)流体を通した磁気ビーズ114aの比較的に高速の移動が、標的分子110aとともに引動された任意の汚染物質112aをマイクロチャネル内で排出させるであろうように、流体(例えば、緩衝剤)で充填されるであろう。これは、マイクロチャネルの反対端を通して第2のウェル108aの中に移動する磁石126aを示す、図8に図示される。
本時点で、標的分子110aとともに引動されている場合がある汚染物質112aのうちのいずれかは、マイクロチャネル106a内の流体内に残されている。
磁石126aは、次いで、所望に応じて任意の運動または一連の移動で第2のウェル108aの中に移動され、コントローラ118aにプログラムされてもよい。磁気ビーズ114aは、次いで、第2のウェル108a内の流体から除去され、別個のコンテナ128a(図9)の中に入れられてもよい。磁気ビーズ114aは、次いで、標的分子110aがもはや磁気ビーズ114aに向かって引き寄せられず、これは、次いで、コンテナ128aから除去され得るように、離調されることができる。
結果は、緩衝溶液と、汚染物質112aを本質的に含まない標的分子110aとを含む、コンテナ128aである。本プロセスは、高価または高度に精巧な機器を必要とすることなく、単純であり、実施することが容易である。
ここで図4Aを参照すると、その中に示されるシステムは、第1および第2のプローブ120a、122aが、第1および第2のウェル104a、108a内に配置されるのではなく、第1および第2のプローブ120a、122aが、マイクロチャネル106aとも連通する別個の第3および第4のウェル105a、109a内に配置されることを除いて、図4に示されるシステムに実質的に類似し、それと同様に動作する。本構成を用いると、磁石126aは、(上記に説明されるように)第1のウェル104aから第2のウェル108aに物質を引き寄せ、その中に配置されたプローブ120a、122aを伴う、第3および第4のウェル105a、109aの存在は、磁気ビーズ114aが横断するマイクロチャネル106aを横断して、電場124aを発生させる。
このように、上記に議論されるものと同様に、マイクロチャネル106aは、(例えば、ミリメートル/秒規模の)流体を通した磁気ビーズ114aの比較的に高速の移動が、標的分子110aとともに引動された任意の汚染物質112aをマイクロチャネル106a内で排出させるであろうように、流体(例えば、緩衝剤)で充填されるであろう。したがって、先の実施例と同様に、マイクロチャネル106aは、ビーズ運動を介した液体の相対運動および印加された電場を介した電力を提供し、サンプルを精製する。
ここで図10を参照すると、プロセス200aのフロー図が、提供される。最初に、精製されるべき生物学的サンプルが、ラボオンチップを含み得るウェルの中に堆積される201a。次に、磁気ビーズが、第1のウェル内に含有される生物学的サンプルの中に導入される202a。前述で記述されたように、一実施例では、磁気ビーズは、標的分子を引き付けるように調整されるM-PVA磁気ビーズであり得る。なおもさらに、標的分子は、核酸であり得る。磁気ビーズは、次いで、標的分子の誘引を可能にするように、ある時間周期(「インキュベーション」周期)にわたって生物学的サンプル内で維持される。一実施例では、時間周期は、例えば、1分未満であり得る。
インキュベーション周期はさらに、生物学的サンプルの混合または攪拌周期で補完され得、これはさらに、標的分子の結合を支援するであろう。一実施例では、磁気攪拌器が、例えば、ビーズ/分子相互作用率を増加させ、したがって、同じ結合効率に関して全体的時間を短縮するために、緩やかな混合のためにウェル/リザーバの内側で使用されることができる。
これらのプロセスステップの利益のうちの1つは、方法が高速分離のために大量のサンプルを一意に処理するように、標的分子の捕捉/結合がウェル/リザーバ内で起こることである。以前から公知の方法は、サンプルあたり複数の洗浄を採用しなければならない一方で、本方法の実施形態は、1分の時系列で1つのステップにおいて全ての余分な分子からビーズ結合分子を除去することができる。これは、スループット容量の増加を可能にする。
いったん選択された時間周期が経過すると、電場が、生物学的サンプルに印加されることができる204a。これは、電力源に結合されるリード線の適用によって遂行されることができる。電場の印加もまた、磁場を発生されるであろうことが、当業者によって理解されるであろう。生物学的サンプル内の汚染物質は、負に荷電され、電場内でこれらの汚染物質を「保持」または維持するように機能する、電場と相互作用するであろう。
汚染物質が電場内で保持されていると、磁石が、次いで、磁気ビーズに近接させられる206a。磁石は、磁石が第1のウェルの近傍で移動されると、磁気ビーズが磁石の移動とともに引き寄せられるであろうように、磁気ビーズを引き付けるように機能するであろう。磁石の移動は、全自動化され得、事前プログラムされた様式で移動することができる。
磁石は、次いで、第1のウェルに接続されるマイクロチャネルに向かって磁気ビーズを引き寄せるように、移動されてもよい208a。磁気ビーズがマイクロチャネルに向かって移動している間に、汚染物質が、第1のウェル内の流体内で定位置に保持されるように電場と相互作用しているように、電場が本時点で印加されるであろうことを理解されたい。これは、引き付けられた標的分子を伴う磁気ビーズが汚染物質の大部分から離れるように移動することを効果的に可能にする。
磁石は、次いで、磁気ビーズがマイクロチャネルの中に引き込まれ、それを通して移動するように、移動する210a。これは、例えば、ミリメートル/秒規模で、比較的に高速で行われることができる。マイクロチャネル内に流体(緩衝剤)があるため、流体を通した磁気ビーズの移動は、第1のウェルから標的分子とともに不注意に引動された、いずれの不要な汚染物質も排出するように機能するであろう。
磁石は、次いで、マイクロチャネルの反対端に位置される第2のウェルの中に磁気ビーズを引き込み続ける212a。結果は、標的分子のみがラボオンチップ上の第2のウェルの中に移動された、精製された生物学的サンプルである。
上記に説明されるプロセスの別の利益は、いずれの膜またはポンプの使用も要求することなく、高効率の分離を可能にすることである。これは、資源が限定された設定のために有利である。
本時点から、精製された生物学的サンプル(例えば、標的核酸)が、次いで、第2のウェルから除去され、コンテナの中に入れられることができ214a、その後、磁気ビーズは、標的分子が磁気ビーズから非結合状態になるように離調されることができる216a。最後に、磁気ビーズは、コンテナから除去され、破棄されることができる。
本時点で、精製された標的分子は、別個のコンテナ内に位置し、下流プロセスの準備ができている。第2のウェルから精製された生物学的サンプルを除去するステップは、随意であることに留意されたい。例えば、第1のウェルは、排出され得、第2のウェル内の精製されたサンプルは、チップ上の増幅/検出の準備ができた状態であり得る。代替として、精製された生物学的サンプルは、別個のコンテナ内のチップ外の増幅/検出の準備ができた状態であり得る。
図11は、精製の向上が所望される場合に、いくつかの付加的プロセスステップを含む、代替実施例を示す。例えば、ステップ212aでは、関連付けられる標的分子を伴う磁気ビーズを除去するのではなく、本システムは、第2のマイクロチャネルと、第3のウェルとを含み得ることが考慮される。本実施例では、磁石は、第2のマイクロチャネルに向かって移動され、第2のマイクロチャネル220aを通して移動される218a。本移動は、第1のマイクロチャネルを通した移動に関連して議論されたように、比較的に高速で行われることができる。同様に、磁石の移動は、磁石が、事前プログラムされたソフトウェアプログラムに従って移動される、全自動化され得る。
磁気ビーズは、次いで、第2のマイクロチャネルの反対端に位置される第3のウェルの中に移動されることができ222a、磁気ビーズは、次いで、除去され、新しいコンテナの中に入れられることができる224a。前述で説明されたように、磁気ビーズは、次いで、離調され、除去されることができる226a。
他の実施例では、第2のウェル内で提供される流体は、体積が、任意の汚染物質または非結合分子を第1のウェルの中に運搬するように機能する、第2のウェルから第1のウェルまでの流体の流動を生成するようなものであり得る。第2のマイクロチャネルおよび第3のウェルを利用した実施例では、流体は、第3のウェル内で提供される体積が、第3のウェルから第2のウェルまで、および第2のウェルから第1のウェルまでの流動を生成するように、提供されることができる。マイクロチャネルを通した磁気ビーズの比較的に高速の移動と組み合わせられる、本流体の流動は、第1のウェルから不注意に引き出され得る、さらに多くの非結合分子を除去するように機能する。
他の実施例では、本方法はさらに、例えば、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)等の熱駆動型プロセスを可能にするために、生物学的サンプルの局所加熱を提供し得る。これは、抵抗金属コーティングを含むインジウムスズ酸化物(ITO)に0~12ボルトを印加することによって、提供され得る。加熱は、チップの他の領域を過熱することなく、サンプルに関して局所的に温度を維持し得る。
種々の機能および方法が、一連のステップで説明および提示されたが、一連は、1つの有利な実施形態の例証として提供されたにすぎず、図示される具体的順序でこれらの機能を果たす必要はないことに留意されたい。さらに、これらのステップのうちのいずれかが、他のステップのうちのいずれかに対して移動される、および/または組み合わせられ得ることが考慮される。加えて、なおもさらに、用途に応じて、本明細書に説明される機能の全てまたは任意の部分を利用することが有利であり得ることが考慮される。
ここで図12を参照すると、代替実施例が、核酸を精製するための磁気電気泳動分離用のラボオンチップに関して図示される。本実施例は、第1のウェルまたはリザーバ304aと、第1のマイクロチャネル306aと、第2のウェルまたはリザーバ308aとを含む、マイクロ流体チップ302aを利用する。第1のマイクロチャネル306aは、第1のウェル304aから第2のウェル308aまで延在する。
加えて、本実施例は、第2のマイクロチャネル310aおよび第3のウェルまたはリザーバ312aを利用する。第2のマイクロチャネル310aは、第2のウェル308aから第3のウェル312aまで延在する。前述で記述されたように、第1、第2、および第3のウェル304a、308a、312aは、ここでは正方形として図示されるが、それらは、円形または卵形等の事実上いかなる所望の形状も含み得ることが、当業者によって理解されるであろう。
ポリエチエレングリコール(PEG)、ポリエチレンオキシド(PEO)、またはポリオキシエチレン(POE)は、エチレンオキシドのオリゴマーまたはポリマーを指す。PEGの構造は、一般的にH-(0-CH2-CH2)n-OHとして表される。PEGは、液体であり、本明細書ではゲルと称される。異なる形態のPEGもまた、重合プロセスに使用される開始剤に応じて利用可能である。1つの一般的な開始剤は、単官能メチルエーテルPEG、またはmPEGと短縮されるメトキシポリ(エチエレングリコール)である。低分子量PEGもまた、単分散と称される、より純粋なオリゴマーとして利用可能である。
図13は、コントローラ118bを含む、システム100bの実施例を図示する。コントローラ118bは、マイクロチップに関連して使用される機器を制御するようにプログラムされる、任意のタイプのコンピュータであってもよい。コントローラ118bは、磁気攪拌器117bおよび加熱器119bを制御し得ることが考慮される。加熱器は、例えば、抵抗金属コーティングを含み得る。抵抗金属コーティングは、ウェルまたはリザーバを裏打ちするインジウムスズ酸化物(ITO)であり得る。加熱器119bがウェルの外側に示されているが、コーティングは、ウェルの内側または外側を裏打ちし得ることを理解されたい。同様に、コントローラ118bは、直接制御を金属コーティングに提供し得る、または0~12ボルト信号を加熱器に印加するように適合される中間コントローラが、提供され得る。さらに、温度センサ121bが、フィードバック情報を与え、設定点で温度を維持するように提供され得ることを理解されたい。種々の部品および構成要素が、接続を示すように接続線を伴って図示されるが、これらは、図式的にすぎず、接続は、配線接続または無線接続を含み得ることを理解されたい。
図14は、第1のウェル104bの近傍に導入される磁石126bの導入を図示する。磁石126bは、磁気ビーズ114bを引き付けるように設計される。一実施例では、磁石126bは、第1のウェル104bの一方の端部に位置付けられ、磁気ビーズ114bおよび関連付けられる標的分子110bがマイクロチャネル106bに向かって移動されるように、マイクロチャネル106bに向かって第1のウェル104bを横断するように移動されてもよい。
磁石126bおよび磁気ビーズ114bは、第1のウェル104b内に汚染物質112bのうちのいくつかを残して、マイクロチャネル106bに向かって移動される。しかしながら、いくつかの汚染物質112bが、マイクロチャネルに向かって標的分子110bとともに引動され得ることに留意されたい。
さらに、磁石126bの移動は、コントローラ118bによって制御され得、ソフトウェアプログラムによる、全自動運動を含み得ることに留意されたい。移動は、単純に直線状であり得る、またはプログラムされ得る複雑な移動の任意の組み合わせであり得る。
図15は、磁気ビーズ114bおよび標的分子110bがそれに沿って引動される、マイクロチャネル106bの中に移動する磁石126bを図示する。マイクロチャネル106bは、マイクロチャネル106b内の鎖線として図示される、ゲル107b(例えば、PEG)で充填されるであろう。負に荷電される汚染物質112bは、磁気ビーズ114bおよび標的分子110bがマイクロチャネル106bを通して前進されるにつれて、汚染物質112bがゲル107b内で定位置に保持されるように、ゲル107bと相互作用する。
一実施例では、ゲル107bを通した磁気ビーズ114bの移動は、比較的に高速であり(例えば、ミリメートル/秒規模)、これは、標的分子110bとともに引動された任意の汚染物質112bを、マイクロチャネル106b内のゲル107b内で排出させる。これは、マイクロチャネルの反対端を通して第2のウェル108bの中に移動する磁石126bを示す、図16に図示される。
本時点で、標的分子110bとともに引動された汚染物質112bの少なくとも有意な部分が、マイクロチャネル106b内のゲル107b内に残されている。
磁石126bは、次いで、所望に応じて任意の運動または一連の移動で第2のウェル108bの中に移動され、コントローラ118bにプログラムされてもよい。磁気ビーズ114bは、次いで、第2のウェル108b内の流体から除去され、別個のコンテナ128b(図17)の中に入れられてもよい。磁気ビーズ114bは、次いで、標的分子110bがもはや磁気ビーズ114bに向かって引き寄せられず、これは、次いで、コンテナ128bから除去され得るように、離調されることができる。
結果は、緩衝溶液と、汚染物質112bを本質的に含まない標的分子110bとを含む、コンテナ128bである。本プロセスは、高価または高度に精巧な機器を必要とすることなく、単純であり、実施することが容易である。
図18は、全てゲル107bを含む、第1のウェル104b、マイクロチャネル106b、および第2のウェル108bを図示する。ゲル107bは、マイクロチャネルの中のみに設置され得ることに留意されたい。代替として、ゲル107bは、マイクロチャネル106bおよび第1のウェル104bの両方の中に入れられ得る。概念は、汚染物質がゲル107bによって保持され、磁気ビーズ114bが、標的分子110bとともに、汚染物質112bから離れるように移動され、それから分離されることを可能にするように、負に荷電される汚染物質112bがゲル107bと相互作用するであろうことである。
ここで図19を参照すると、プロセス200bのフロー図が、提供される。最初に、精製されるべき生物学的サンプルが、ラボオンチップを含み得るウェルの中に堆積される201b。次に、磁気ビーズが、第1のウェル内に含有される生物学的サンプルの中に導入される202b。前述で記述されたように、一実施例では、磁気ビーズは、標的分子を引き付けるように調整されるM-PVA磁気ビーズであり得る。なおもさらに、標的分子は、核酸であり得る。磁気ビーズは、次いで、標的分子の誘引を可能にするように、ある時間周期(「インキュベーション」周期)にわたって生物学的サンプル内で維持される。一実施例では、時間周期は、例えば、1分未満であり得る。
インキュベーション周期はさらに、生物学的サンプルの混合または攪拌周期で補完され得、これはさらに、標的分子の結合を支援するであろう。一実施例では、磁気攪拌器が、緩やかな混合のためにウェル/リザーバの内側で使用されることができる。
これらのプロセスステップの利益のうちの1つは、方法が高速分離のために大量のサンプルを一意に処理するように、標的分子の捕捉/結合がウェル/リザーバ内で起こることである。
次のステップは、磁気ビーズに近接して磁石を設置することである206b。磁石は、磁石が第1のウェルの近傍で移動されると、磁気ビーズが磁石の移動とともに引き寄せられるであろうように、磁気ビーズを引き付けるように機能するであろう。磁石の移動は、全自動化され得、事前プログラムされた様式で移動することができる。
磁石は、次いで、第1のウェルに接続されるマイクロチャネルに向かって磁気ビーズを引き寄せるように、移動されてもよい208b。磁石は、磁気ビーズがマイクロチャネルの中に引き込まれるように移動する210b。マイクロチャネルは、負に荷電される汚染物質と相互作用するように機能するであろう211b、PEG等のゲルで充填されることを理解されたい。本相互作用は、磁石が、マイクロチャネルに沿って、したがって、ゲルを通して磁気ビーズを引動し、負に荷電される汚染物質がマイクロチャネル内のゲル内で排出されることを意味する。これは、サンプルがマイクロチャネルを通して移動するにつれて、それを精製するように機能する。
さらに、マイクロチャネルを通した磁気ビーズの移動は、例えば、ミリメートル/秒規模等の比較的に高速で行われ得ることが考慮される。ゲルを通した磁気ビーズの移動は、負に荷電される汚染物質と相互作用するPEGに起因するだけではなく、第1のウェルから標的分子とともに引動された汚染物質を排出することに役立つ流体抵抗にも起因して、不要な汚染物質を排出するように機能するであろう。
磁石は、次いで、マイクロチャネルの反対端に位置される第2のウェルの中に磁気ビーズを引き込み続ける212b。結果は、標的分子のみがラボオンチップ上の第2のウェルの中に移動された、精製された生物学的サンプルである。
上記に説明されるプロセスの別の利益は、いずれの膜またはポンプの使用も要求することなく、高効率の分離を可能にすることである。これは、資源が限定された設定のために有利である。
本時点から、精製された生物学的サンプル(例えば、標的核酸)が、次いで、第2のウェルから除去され、コンテナの中に入れられることができ214b、その後、磁気ビーズは、標的分子が磁気ビーズから非結合状態になるように離調されることができる216b。最後に、磁気ビーズは、コンテナから除去され、破棄されることができる。
本時点で、精製された標的分子は、別個のコンテナ内に位置し、下流プロセスの準備ができている。第2のウェルから精製された生物学的サンプルを除去するステップは、随意であることに留意されたい。例えば、第1のウェルは、排出され得、第2のウェル内の精製されたサンプルは、チップ上の増幅/検出の準備ができた状態であり得る。代替として、精製された生物学的サンプルは、別個のコンテナ内のチップ外の増幅/検出の準備ができた状態であり得る。
図20は、向上された精製が所望される場合の随意の付加的プロセスステップである。例えば、ステップ212bでは、関連付けられる標的分子を伴う磁気ビーズを除去するのではなく、本システムは、第2のマイクロチャネルと、第3のウェルとを含み得ることが考慮される。本実施例では、磁石は、第2のマイクロチャネルに向かって移動され218b、第2のマイクロチャネルを通して移動される220b。本移動は、第1のマイクロチャネルを通した移動に関連して議論されたように、比較的に高速で行われることができる。同様に、磁石の移動は、磁石が、事前プログラムされたソフトウェアプログラムに従って移動される、全自動化され得る。
磁気ビーズは、次いで、第2のマイクロチャネルの反対端に位置される第3のウェルの中に移動されることができ222b、磁気ビーズは、次いで、除去され、新しいコンテナの中に入れられることができる224b。前述で説明されたように、磁気ビーズは、次いで、離調され、除去される226bことができる。
他の実施例では、第2のウェル内で提供される流体は、図18に関連して図示されるようにゲルを含み得る。一実施例では、体積が、任意の汚染物質または非結合分子を第1のウェルの中に運搬するようにさらに機能する、第2のウェルから第1のウェルまでのゲルの流動を生成するように、ゲルが提供されることができる。第2のマイクロチャネルおよび第3のウェルを利用する実施例(図21)では、ゲルは、第3のウェル内で提供される体積が、第3のウェルから第2のウェルまで、および第2のウェルから第1のウェルまでの流体の流動を生成するように、提供されることができる。ゲルとの汚染物質の直接相互作用およびマイクロチャネルを通した磁気ビーズの比較的に高速の移動と組み合わせられる、本ゲルの流動は、第1のウェルから引き出され得る、さらに多くの非結合分子を除去するように機能する。
他の実施例では、本方法はさらに、生物学的サンプルの局所加熱を提供し得る。これは、例えば、抵抗金属コーティングを含むインジウムスズ酸化物(ITO)に0~12ボルトを印加することによって、提供され得る。加熱は、チップの他の領域を過熱することなく、サンプルに関して局所的に温度を維持し得る。
種々の機能および方法が、一連のステップで説明および提示されたが、一連は、1つの有利な実施形態の例証として提供されたにすぎず、図示される具体的順序でこれらの機能を果たす必要はないことに留意されたい。さらに、これらのステップのうちのいずれかが、他のステップのうちのいずれかに対して移動される、および/または組み合わせられ得ることが考慮される。加えて、なおもさらに、用途に応じて、本明細書に説明される機能の全てまたは任意の部分を利用することが有利であり得ることが考慮される。
ここで図21を参照すると、実施例が、図20による、さらなる随意の向上された精製プロセスを採用する、核酸の精製のためのラボオンチップに関して図示される。本実施例は、第1のウェルまたはリザーバ304bと、第1のマイクロチャネル306bと、第2のウェルまたはリザーバ308bとを含む、マイクロ流体チップ302bを利用する。第1のマイクロチャネル306bは、第1のウェル304bから第2のウェル308bまで延在する。
加えて、本実施例は、第2のマイクロチャネル310bおよび第3のウェルまたはリザーバ312bを利用する。第2のマイクロチャネル310bは、第2のウェル308bから第3のウェル312bまで延在する。前述で記述されたように、第1、第2、および第3のウェル304b、308b、312bは、ここでは正方形として図示されるが、それらは、円形または卵形等の事実上いかなる所望の形状も含み得ることが、当業者によって理解されるであろう。
ゲル307bが、第1のマイクロチャネル306b内で最小限に提供される。しかしながら、ゲル307bはまた、随意に、第2のマイクロチャネル310b内にあるものとして図示される。さらに、ゲルは、所望に応じて、第1、第2、または第3のウェル304b、308b、312bのうちのいずれかの中で提供され得ることを理解されたい。同様に、ゲル307bの体積および設置は、所望に応じて第1のウェル304bに向かった流速を生成するように選択されることができる。
図22は、生物学的物質を処理するための、その筐体402を含む、マイクロ流体システム400の後面、上面、および左側面斜視図を図示する。図23は、筐体402の正面、底面、および右側面斜視図を図示する。図24は、筐体402の左側面図を図示する。図25は、筐体402の右側面図を図示する。図26は、筐体402の上面図を図示する。図27は、筐体402の底面図を図示する。図28は、筐体402の後面図を図示する。図29は、筐体402の正面図を図示する。
本明細書で使用されるように、「前部」、「前方」、「後部」、「後方」、「背後」、および他の類似用語等の用語は、マイクロ流体システム400との関連で使用されるときに、視認者が典型的にはシステム400と相互作用し、それを動作させることが予期される、システム400の脇に位置する視認者に関して使用される。したがって、ある場合には、「前部」、「前方」、および他の類似用語が、そのような視認者の方向に位置している特徴を指す一方で、「後部」、「後方」、「背後」、および他の類似用語等の言葉は、反対方向に位置している特徴を指す。本明細書で使用されるように、「上部」、「底部」、「上側」、「下側」、「上方」、「下方」、「上」、および「下」等の比高の用語は、マイクロ流体システム400との関連で使用されるときに、それらの通常の意味で、すなわち、重力が物体を下に引動するように、重力の方向に対して使用される。本明細書で使用されるように、「右」および「左」等の用語は、マイクロ流体システム400との関連で使用されるときに、マイクロ流体システム400の前部に向かって視認されるような場所を指す。
図22~29は、マイクロ流体システム400の筐体402が、筐体402の底面全体を横断して跨架し、システム400および筐体402の種々の他の構成要素が結合され得る、基部または基礎を提供する、底部分または底部プレート404を図示する。筐体402はまた、底部プレート404にしっかりと結合され、それと一体的に形成され得る、後部分406も含む。後部分406は、その中に形成された開口部を除いて筐体402の後面全体を横断し、かつ筐体402の上面、左側面、および右側面の後部分を横断して、跨架する。筐体402はまた、その中に形成された開口部を被覆するように後部分406に除去可能に配設および結合される、パネル408も含む。パネル408は、空気が筐体402の中および外に流動することを可能にするようにその中に形成されるスロット410と、通信および/または電力を運搬するため等のワイヤまたはケーブルが筐体402の中および外に延在することを可能にするようにその中に形成されるポート412とを含む。ある場合には、パネル408はまた、オペレータまたは技術者が、後部分406に形成される開口部を通して、点検または修理のため等に筐体402の内側の構成要素にアクセスすることを可能にするように、筐体402の他の部分から除去されてもよい。
筐体402はまた、前部分414が、筐体402を開放し、オペレータまたは技術者がマイクロ流体システム400の内部構成要素と相互作用することを可能にするために、後部分406から離れるように回転され得るように、後部分406にヒンジ連結される等、回転可能に結合される、前部分414も含む。前部分414は、筐体402の前面全体を横断し、かつ筐体402の上面、左側面、および右側面の前部分を横断して、跨架する。前部分414の底端または縁は、底部プレート404の外縁に対して当接することができ、前部分414の後縁は、前部分414がその閉鎖位置にあるときに、後部分406の前縁に対して当接することができる。いくつかの実装では、前部分414は、前部分414が、筐体402の上面に沿って上向きに、システム400の他の部分から離れて延在する水平軸を中心として回転し、筐体402の内側の残りの構成要素へのアクセスを提供し得るように、1つまたはそれを上回るヒンジによって等、後部分406の上部に回転可能に結合される。他の実装では、前部分414は、前部分414が、筐体402の左または右表面に沿って側方に外向きに、システム400の他の部分から離れて垂直軸を中心として回転し、筐体402の内側の残りの構成要素へのアクセスを提供し得るように、1つまたはそれを上回るヒンジによって等、後部分406の左または右側面に回転可能に結合される。
筐体402はまた、オペレータまたは技術者がマイクロ流体システム400と手動で相互作用することを可能にし得る、単一の外部物理的ボタン416も含む。いくつかの実装では、オペレータは、その前部分414を移動させることによって筐体402を開放することができ、生物学的サンプルおよび/または他の物質を筐体402の内側のウェルまたはマイクロウェルのセットに供給し、その前部分414を移動させることによって筐体402を閉鎖し、次いで、ボタン416を押下または押動し、マイクロ流体システム400の動作およびその中の生物学的サンプルまたは他の物質の処理を開始することができる。いくつかの実装では、オペレータまたは技術者はまた、例えば、緊急または他の不測の状況もしくは事態が生じる場合において、ボタン416を押下し、処理の完了に先立ってマイクロ流体システム400の動作を停止または中断してもよい。
図30~34は、その筐体402がその内部構成要素を図示するように除去された、マイクロ流体システム400の種々の斜視図を図示する。図30~34に図示されるように、マイクロ流体システム400は、内側で生物学的サンプルまたは他の物質が処理され得る、マイクロ流体チップまたはマイクロ流体プレート418を含む。マイクロ流体システム400はまた、マイクロウェルプレート420がマイクロ流体チップ418を運搬し得るように、複数のマイクロウェルと、マイクロ流体チップ418を受容するための陥凹またはスロットもしくは空洞とを有する、マイクロウェルプレート420も含む。マイクロ流体システム400はまた、マイクロウェルプレート420が固着または結合され得る、キャリッジまたはトレイ422も含む。マイクロ流体システム400はまた、トレイ422が結合され得る、水平作動システム424も含む。動作時に、水平作動システム424は、水平方向に、トレイ422、およびそれとともにマイクロウェルプレート420ならびにマイクロ流体チップ418を、前後および左右に移動させることができる。
図30~34に図示されるように、マイクロ流体チップ418は、その上面から、チップ418の厚さを通して垂直に、その底面まで延在する、複数のウェル418aを含む。図35は、マイクロ流体チップ418の裏面または底面の斜視図を図示する。図35に図示されるように、マイクロ流体チップ418は、複数のマイクロチャネル418bと、その底面に形成される他の特徴とを含む。マイクロチャネル418bおよび他の特徴は、ウェル418aの間に延在する複数のチャンバおよび経路を形成するように、相互およびウェル418aと相互接続される。システム400が使用時であるとき、マイクロチャネル418bおよびチップ418の底面に形成される他の特徴は、本明細書に説明されるマイクロ流体システムの実施形態のうちのいずれかに従って等、ウェル418aのうちの第1のものからウェル418aのうちの第2のものまで等、経路に沿って流体、生物学的サンプル、または他の物質を指向することができる。
図36は、マイクロ流体チップ418がマイクロウェルプレート420の付加的特徴を図示するように除去された、マイクロ流体システム400の一部を図示する。例えば、図36は、マイクロウェルプレート420が、その右側に空洞426を含み、その前端からその後端まで空洞426の底端を横断して水平に延在する、導電性トラックまたはリード線428のセットを含むことを図示する。図37は、マイクロ流体システム400の他の部分から単離されたマイクロウェルプレート420の後面斜視図を図示する。図37に図示されるように、マイクロウェルプレート420は、その右側に空洞426と、その左側に複数のマイクロウェル430のアレイとを含む。
空洞426は、直四角柱を含む幾何学的形状を有し、マイクロ流体チップ418の対応する寸法に合致する、それと同一である、またはそれと同じである、垂直深度、水平長、および水平幅を含む、寸法を有する。図37に図示されるように、空洞426の前端は、プレート420の前端に対して後方に設定され、空洞426の右端は、プレート420の右端に対して内向きに設定され、空洞426の後端は、プレート420の後端まで延在し、それと一致し、空洞426の左端は、プレートの右端からプレートの左端に向かってプレート420の幅を横断する距離の3分の1から2分の1の間に位置する。したがって、空洞は、その後端からその前端に向かってプレート420の中に延在する、スロットまたは拡大した溝を形成する。使用時に、マイクロ流体チップ418は、空洞426の底面が、チップ418の底面内のマイクロ流体チャネル418bに面し、チャンバの底部または下側境界、およびマイクロ流体チャネル418bによって形成される経路を画定または形成するように、空洞426内に位置されることができる。
図37はまた、プレート420が空洞426の底端または底面に形成される複数のチャネル432を含むことも図示する。図示される実装では、プレート420は、4つのそのようなチャネル432を含む。チャネル432はそれぞれ、空洞426の床面または底面から、より大きくより広い底端部分までプレート420の中に下向きに延在する、比較的に狭い上端部分を含む。図示される実装では、チャネル432のそれぞれの上端部分は、断面が長方形であり、チャネル432のそれぞれの底端部分は、断面が正方形であるが、代替実装では、特徴は、異なる形状を有し得る。チャネル432はそれぞれ、プレート420の前端に近接し、そこから後方に設定される場所から、プレート420の後端まで、プレート420を通して前から後に水平に延在する。
複数のマイクロウェル430のアレイは、任意の好適な数の個々のマイクロウェル430を含んでもよい。図示される実装では、マイクロウェル430のアレイは、前から後に延在する等しく離間された14行、およびプレート420を横断して側面から側面に延在する等しく離間された8列に配列される、112個のマイクロウェル430を含む。図37に図示されるように、マイクロウェル430のアレイの前端は、プレート420の前端に対して後方に設定され、マイクロウェル430のアレイの左端は、プレート420の左端に対して内向きに設定され、マイクロウェル430のアレイの後端は、プレート420の後端に対して前方に設定され、マイクロウェル430のアレイの左端は、プレート420の左端からプレート420の右端に向かってプレート420の幅を横断する距離の3分の2から2分の1の間に位置する。
図37はまた、プレート420が、それぞれ、プレート420の前および後端から水平に前方および後方に延在する、複数のアームまたはノブもしくは突出部434を含むことも図示する。図示される実装では、プレート420は、プレート420の後端から後方に延在する2つの突出部434と、プレート420の前端から前方に延在する2つの突出部434とを含む。
図38は、マイクロ流体チップ418およびマイクロウェルプレート420が、トレイ422および導電性リード線428の付加的特徴を図示するように除去された、マイクロ流体システム400の一部を図示する。例えば、図38は、トレイ422が、側面から側面および左右に延在し、水平作動システム424に結合される第1の垂直脚部分440aと、第1の垂直脚部分440aに対して直角で配列される第2の水平脚部分440bとを有する、角ブラケット440を含むことを図示する。トレイ422はまた、ブラケット440の水平脚部分440bの前端の上面に結合される前レール436と、ブラケット440の水平脚部分440bの後端の上面に結合される後レール438とを含む。前および後レール436、438は、平行であり、ブラケット440の上面に沿って側面から側面および左右に延在する。
図38に図示されるように、前および後レール436、438はそれぞれ、プレート420の突出部と噛合し、プレート420を前および後レール436ならびに438の間のブラケット440の上面に係止または固着するように構成される、複数の陥凹または溝442を含む。例えば、後レール438は、その前面から部分的にレール438の中に後方に延在する、2つの溝442を含む。図示される実装では、後レール438内の溝442はまた、それぞれ、その上端からその底端まで、次いで、レール438の底端に沿って左から右に、レール438の中に、およびそれを通して下に延在する。別の実施例として、前レール436は、その後面から部分的にレール436の中に前方に延在する、2つの溝442を含む。図示される実装では、前レール436内の溝442はまた、それぞれ、その上端からその底端まで、次いで、レール436の底端に沿って左から右に、レール436の中に、およびそれを通して下に延在する。
プレート420をトレイ422に固着するために、プレート420は、その突出部434が溝442と整合されるように、トレイ422にわたって位置される。プレート420は、次いで、プレート420の底面がトレイ422のブラケット440の水平脚440bの上面上に静置するまで、突出部434が溝442を通して下に進行するにつれて、前および後レール436、438の間でトレイ422上の定位置まで下降されることができる。プレート420は、次いで、突出部434が溝442を通して右に進行し、それによって、プレート420をトレイ422に固着するように、右に移動される。
図38はまた、プレート420およびチップ418がトレイ422に固着されるときの導電性トラックまたはリード線428の場所も図示する。伝導性リード線428はそれぞれ、リード線428の上端から、そのより大きくより広い底端部分まで、下向きに延在する、比較的に狭い上端部分を含む。伝導性リード線428のそれぞれの上端部分は、断面が長方形であり、チャネル432の上端部分のサイズおよび形状に対応するサイズおよび形状を有し、伝導性リード線428のそれぞれの底端部分は、断面が正方形であり、チャネル432の底端部分のサイズおよび形状に対応するサイズおよび形状を有する。したがって、各伝導性リード線428は、チャネル432のうちの個別のものの内側に、密着して等、位置されることができる。伝導性リード線428はそれぞれ、前レール436の後端に近接し、そこから後方に設定される場所から、後レール438の前端まで、前および後レール436ならびに438の間で前から後に水平に延在する。使用時に、伝導性リード線428は、典型的には、プレート420が存在することなく図38に図示される位置に位置しないが、伝導性リード線428は、明確性および例証の目的のためにプレート420が除去された、図38のそのような位置に図示される。
図39は、マイクロ流体チップ418、マイクロウェルプレート420、および伝導リード線428が、トレイ422の付加的特徴を図示するように除去された、マイクロ流体システム400の一部を図示する。例えば、図39は、トレイ422が、それぞれ、後レール438内に搭載され、後レール438内のばねによって等、後レール438から前方に付勢される、伝導性ボールを含み得る、導電性端子444のセットを含むことを図示する。端子444は、制御システムが伝導性リード線428のそれぞれに供給される電圧および/または電流を制御し得るように、マイクロ流体システム400を動作するように構成される制御システムに電気的に結合されることができる。
図36および37に図示されるように、伝導性リード線428は、プレート420を通して延在し、プレート420内の空洞426に暴露される。したがって、伝導性リード線428はまた、ウェル418aのうちの1つまたはそれを上回るものおよび/またはマイクロ流体チップ418のマイクロチャネル418bのうちの1つまたはそれを上回るものに暴露されてもよい。制御システムは、したがって、本明細書に説明されるマイクロ流体システムの実施形態のうちのいずれかに従って等、マイクロ流体チップ418内の流体、生物学的サンプル、および/または他の物質の処理を制御するため等に、伝導性リード線428に供給される電圧ならびに/もしくは電流を制御するように構成されることができる。
図39はまた、マイクロ流体システム400が、電気モータ、サーボモータ、または電力から等のトルクを発生させ得る任意の他の好適なアクチュエータ、ならびに角ブラケット448および磁石450を含み得る、第1のアクチュエータ446を含む、回転作動システムを含むことも図示する。第1のアクチュエータ446は、例えば、トレイ422の下方、プレート420がトレイ422に固着されるときにプレート420の下方、およびチップ418がプレート420内の空洞426内に位置付けられ、プレート420がトレイ422に固着されるときにチップ418の下方の場所において、筐体402の底部プレート404の上面にしっかりと固着されてもよい。
第1のアクチュエータ446の出力または駆動型ロッドは、第1のアーム448aと、その第1のアーム448a等の第1のアーム448aと垂直な第2のアーム448bとを含む、角ブラケット448にしっかりと結合される。第1のアクチュエータ446は、第1のアーム448aがアクチュエータ446の出力の右に延在する、図39に示される第1の位置から、第1のアーム448aがアクチュエータ446の出力から上向きに延在する、第2の位置まで、第1のアーム448aがアクチュエータ446の出力の左に延在する、第3の位置まで、再び戻って前から後に延在する、またはそのような進行の範囲のあるより小さい部分を通して延在する、水平軸を中心として回転するように、第1のアーム448aを回転させる、トルクを発生させることができる。
角ブラケット448の第2のアーム448bは、後方に延在するように、直角で第1のアーム448aに固着されることができる。したがって、第1のアーム448が上向きに延在するとき、第2のアーム448bは、アクチュエータ446の直接上方に後方に、かつトレイ422の下で前から後に水平に、プレート420がトレイ422に固着されるときにプレート420の下に、チップ418がプレート420内の空洞426内に位置付けられ、プレート420がトレイ422に固着されるときにチップ418の下に延在する。磁石450は、角ブラケット448がアクチュエータ446から上向きに延在するときに、磁石450が第2のアーム448bの上方にあり、トレイ422に隣接するように、角ブラケット448の第2のアーム448bに固着される。
回転作動システムおよびその第1のアクチュエータ446は、プレート420およびチップ418がトレイ422に固着されるときに、制御システムが、アクチュエータ446、トレイ422、プレート420、およびチップ418に対して磁石450の回転を制御し得るように、第1のアクチュエータ446を動作させるように構成され得る、制御システムに電気的または別様に通信可能に結合されることができる。したがって、制御システムは、本明細書に説明されるマイクロ流体システムの実施形態のうちのいずれかに従って等、マイクロ流体チップ418内の流体、生物学的サンプル、および/または他の物質の処理を制御するため等に、磁石450の移動および磁石450によって発生される磁場を制御するように構成されることができる。
図40は、マイクロ流体チップ418、マイクロウェルプレート420、伝導リード線428、およびトレイ422が、水平作動システム424を含む他の構成要素をより詳細に図示するように除去された、マイクロ流体システム400の斜視図を図示する。図40に図示されるように、水平作動システム424は、電気モータ、サーボモータ、または電力から等のトルクを発生させ得る任意の他の好適な第2のアクチュエータ452を含む。水平作動システム424はまた、第2のアクチュエータ452にしっかりと固着および結合され、側面から側面およびアクチュエータ452から右に延在する、伸長ガイドレール454も含む。第2のアクチュエータ452およびガイドレール454は、例えば、トレイ422の下方の場所において筐体402の底部プレート404の上面にしっかりと固着されてもよい。
水平作動システム424はまた、第2のアクチュエータ452の出力または駆動型ロッドに結合される、ねじ山付きロッド456も含む。第2のアクチュエータ452は、第2のアクチュエータ452から右に向かってトレイ422下に側面から側面に延在する水平軸である、その独自の中心長手軸を中心としてねじ山付きロッド456を回転させる、トルクを発生させることができる。水平作動システム424はまた、進行ブロック458がガイドレール454の長さに沿って左右に直線状に進行し得るように、ガイドレール454に固着され、その上に搭載される、進行ブロック458も含む。例えば、進行ブロック458は、そのアンダーカット部分を伴って等、1つまたはそれを上回る溝を含んでもよく、ガイドレール454は、隆起が進行ブロック458をガイドレール454に固着するために溝内に位置付けられ得るように、溝のものに対応する形状を有する、1つまたはそれを上回る隆起を含んでもよい。別の実施例として、ガイドレール454は、そのアンダーカット部分を伴って等、1つまたはそれを上回る溝を含んでもよく、進行ブロック458は、隆起が進行ブロック458をガイドレール454に固着するために溝内に位置付けられ得るように、溝のものに対応する形状を有する、1つまたはそれを上回る隆起を含んでもよい。
図40に図示されるように、ねじ山付きロッド456は、進行ブロック458を通して延在する導管を通して延在する。いくつかの実装では、進行ブロック458を通して延在する導管は、ねじ山付きロッド456のねじ山に対応する導管のねじ山を伴ってねじ山付きであり、導管のねじ山は、ねじ山付きロッド456のねじ山と係合および相互係止されてもよい。したがって、これらのねじ山の係合およびガイドレール454との進行ブロック458の係合に起因して、アクチュエータ452がトルクを発生させ、ねじ山付きロッド456の回転を誘発するとき、ねじ山付きロッド456の回転は、側面から側面にガイドレール454の長さに沿って進行ブロック458の直線状移動を誘発する。時計回りまたは反時計回り等の第1の方向にねじ山付きロッド456を旋回させることによって、ねじ山付きロッド456は、右または左等の第1の方向に進行ブロック458を進行させることができる。時計回りまたは反時計回り等の第1の方向と反対の第2の方向にねじ山付きロッド456を旋回させることによって、ねじ山付きロッド456は、右または左等の第1の方向と反対の第2の方向に進行ブロック458を進行させることができる。
図39および40に図示されるように、トレイ422は、接着剤またはねじもしくはボルト460等の複数の機械的締結具によって等、進行ブロック458にしっかりと結合および固着されることができる。したがって、進行ブロック458の移動は、トレイ422、したがって、マイクロウェルプレート420およびマイクロ流体チップ418の対応または合致する移動を誘発することができる。したがって、アクチュエータ452は、システム400内で側面から側面および左右にマイクロウェルプレート420およびマイクロ流体チップ418を移動させるために、本明細書に説明されるように使用されることができる。水平作動システム424およびその第2のアクチュエータ452は、プレート420およびチップ418がトレイ422に固着されるときに、制御システムが、マイクロウェルプレート420およびマイクロ流体チップ418の水平および側面から側面の移動を制御し得るように、第2のアクチュエータ452を動作させるように構成され得る、制御システムに電気的または別様に通信可能に結合されることができる。
図41は、回転作動システムおよび水平作動システム424を含む、付加的構成要素が、他の構成要素をより明確に図示するように除去された、図40に図示されるようなマイクロ流体システム400の斜視図を図示する。図41に図示されるように、マイクロ流体システム400は、垂直作動システム462と、マイクロピペットシステム464と、マイクロピペットシステム464の一部を封入するクレードル466と、マイクロピペットシステム464の動作の少なくとも一部を制御するように構成されるポンプシステム468とを含む。図41に図示されるように、垂直作動システム462は、電気モータ、サーボモータ、または電力から等のトルクを発生させ得る任意の他の好適な第3アクチュエータ470を含む。垂直作動システム462はまた、第2のアクチュエータ470にしっかりと固着および結合され、上下およびアクチュエータ470から上向きに延在する、伸長ガイドレール472も含む。第2のアクチュエータ470は、例えば、水平作動システム424の背後の場所において筐体402の底部プレート404の上面にしっかりと固着されてもよい。
垂直作動システム462はまた、第3のアクチュエータ470の出力または駆動型ロッドに結合される、ねじ山付きロッド474も含む。第3のアクチュエータ470は、第3のアクチュエータ470から上向きに上下に延在する垂直軸である、その独自の中心長手軸を中心としてねじ山付きロッド474を回転させる、トルクを発生させることができる。垂直作動システム462はまた、進行ブロック476がガイドレール472の長さに沿って上下に直線状に進行し得るように、ガイドレール472に固着され、その上に搭載される、進行ブロック476も含む。例えば、進行ブロック476は、そのアンダーカット部分を伴って等、1つまたはそれを上回る溝を含んでもよく、ガイドレール472は、隆起が進行ブロック476をガイドレール472に固着するために溝内に位置付けられ得るように、溝のものに対応する形状を有する、1つまたはそれを上回る隆起を含んでもよい。別の実施例として、ガイドレール472は、そのアンダーカット部分を伴って等、1つまたはそれを上回る溝を含んでもよく、進行ブロック476は、隆起が進行ブロック476をガイドレール472に固着するために溝内に位置付けられ得るように、溝のものに対応する形状を有する、1つまたはそれを上回る隆起を含んでもよい。
図41に図示されるように、ねじ山付きロッド474は、進行ブロック476を通して延在する導管を通して延在する。いくつかの実装では、進行ブロック476を通して延在する導管は、ねじ山付きロッド474のねじ山に対応する導管のねじ山を伴ってねじ山付きであり、導管のねじ山は、ねじ山付きロッド474のねじ山と係合および相互係止されてもよい。したがって、これらのねじ山の係合およびガイドレール472との進行ブロック476の係合に起因して、アクチュエータ470がトルクを発生させ、ねじ山付きロッド474の回転を誘発するとき、ねじ山付きロッド474の回転は、上下にガイドレール472の長さに沿って進行ブロック476の直線状移動を誘発する。時計回りまたは反時計回り等の第1の方向にねじ山付きロッド474を旋回させることによって、ねじ山付きロッド474は、上または下等の第1の方向に進行ブロック476を進行させることができる。時計回りまたは反時計回り等の第1の方向と反対の第2の方向にねじ山付きロッド474を旋回させることによって、ねじ山付きロッド474は、上または下等の第1の方向と反対の第2の方向に進行ブロック476を進行させることができる。
図42は、より明確にするためにシステム400の他の構成要素が除去された、垂直作動システム462の構成要素を図示する。図42に図示されるように、進行ブロック476は、ガイドレール472およびねじ山付きロッド474に結合される本体と、本体から前方に延在するバーまたはアーム478とを含む。図42に図示されるように、進行ブロック476はまた、アーム478の上端面に回転可能に結合されるラッチ480も含む。ラッチ480は、その第1の後端に拡大したパドル480aと、その第2の前端に歯480bとを含む。ラッチ480は、パドル480aがアーム478の上端面から離れるように回転するように、および歯480bがアーム478の上端面に向かって回転するように回転するために、ばねによって等、付勢されることができる。動作時に、オペレータまたは技術者は、パドル480aを下向きに押下し、付勢を克服し、アーム478の上端面に向かってパドル480aを回転させ、アーム478の上端面から離れるように歯480bを回転させることができる。
図43は、より明確にするためにシステム400の他の構成要素が除去された、マイクロピペットシステム464を図示する。図43に図示されるように、マイクロピペットシステム464は、それぞれ、個別のマイクロピペット導管482bに結合される個別のマイクロピペット先端482aを含む、複数の個々のマイクロピペット482を含む。図43に図示されるように、マイクロピペットシステム464はまた、そのマイクロピペット先端482a等のマイクロピペット482がそれぞれ、それを通して延在する、水平に延在する支持バーまたはアーム484も含む。支持アーム484は、垂直配向でマイクロピペット先端482aを維持することができ、側面から側面に延在する等しく離間された8行と、支持アーム484を横断して前から後に延在する等しく離間された2列とを有する、アレイまたはグリッド内でマイクロピペット先端482aを保持することができる。
図43に図示されるように、支持アーム484は、中空であり、その後端に開口部486を有する。開口部486は、アーム478が、開口部486の中に、および中空支持アーム484の中への開口部486を通して挿入され得るようなサイズおよび寸法を有する。支持アーム484はまた、開口部486の上方のその後端に、支持アーム484の上端面の中に下向きに延在する陥凹、くぼみ、または小さい溝488も含む。したがって、垂直作動システム462上にマイクロピペットシステム464を配設するために、オペレータまたは技術者は、ラッチ480のパドル480aを押下し、中空支持アーム484の中への開口部486の中にアーム478を挿入し、次いで、パドル480aを解放し、ラッチ480の歯480bが溝488の中に移動し、その内側に据え付けられることを可能にし、それによって、マイクロピペットシステム464の支持アーム484を垂直作動システム462のアーム478に固着および係止することができる。
したがって、進行ブロック476の移動は、支持アーム484、したがって、マイクロピペット先端482aの対応または合致する移動を誘発することができる。したがって、アクチュエータ470は、システム400内で上下にマイクロピペット先端482aを移動させるために、本明細書に説明されるように使用されることができる。図30~34に図示されるように、マイクロピペットシステム464は、マイクロピペット先端482aが、トレイ422の直接上方に、および/またはマイクロ流体チップ418内のウェル418aもしくはマイクロウェルプレート430内のウェル430のアレイの直接上方に位置されるように、システム400内に配設されることができる。垂直作動システム462およびそのアクチュエータ470は、マイクロピペットシステム464がシステム400内に配設され、支持アーム484がアーム478に結合されるときに、制御システムが、マイクロピペット先端482aの垂直移動を制御し得るように、アクチュエータ470を動作させるように構成され得る、制御システムに電気的または別様に通信可能に結合されることができる。
図43はまた、マイクロピペットシステム464が、全体的な正方形または長方形を有し得る、外側フレーム492を含む、カートリッジ490を含むことも図示する。図43に図示されるように、外側フレーム492は、流体コネクタ494のオス型部分、ならびに別の構成要素の突出部またはノブが、カートリッジ490をそれに固着するように、それを通して挿入され得る、複数の開口部496を含む。個別のマイクロピペット先端482aと反対側のマイクロピペット導管482bのそれぞれの端部は、カートリッジ490の中に、かつそれを通して延在し、流体コネクタ494のオス型部分の個別のポートにおいて終端する。
図41および44に図示されるように、「加熱アセンブリ」とも称され得る、クレードル466は、クレードル466の種々の他の構成要素が支持され得る、アームまたは支柱もしくはスタンド498を含む。クレードル466のスタンド498は、実施例として、トレイ422の背後、プレート420の背後、および/またはチップ418の背後を含む、水平作動システム424の背後の場所において等、水平作動システム424のガイドレール454の後端面にしっかりと固着されてもよい。また、図41および44に図示されるように、スタンド498は、接着剤またはねじもしくはボルト500等の複数の機械的締結具によって等、ガイドレール454にしっかりと結合および固着されることができる。
図41および44に図示されるように、クレードル466は、上向きおよび前から後に延在する、静止プレートまたは側壁502と、側壁502の底端に位置し、側壁502の右に向かって延在し、それに面する、ヒンジの構成要素504とを含む。クレードル466はまた、チャネル508のそれぞれが、半円形の断面形状を有する、それを通して水平および前から後に延在する、16個の個々の溝またはチャネル508を含む、熱伝達ブロック506も含む。クレードル466はまた、側壁502の右向きの表面から出て右に延在し、側壁502の右向きの表面を通してそれらの独自の個別の中心長手軸に沿って垂直および上下に延在する、一対のバー510も含む。
また、図41および44に図示されるように、クレードル466は、バー510に結合され、側壁502に対して側面から側面および左右に、かつ側壁502の右向きの表面の中または外に移動するように、バー510を作動させるように構成される、複数のソレノイドアクチュエータ512を含む。また、図41および44に図示されるように、クレードル466は、熱伝達ブロック506から離れるように左向きに面するタインまたは歯を伴うヒートシンク514を含む。クレードル466はまた、熱伝達ブロック506と統合される、ヒートシンク514と統合される、または熱伝達ブロック506とヒートシンク514との間に位置付けられ得る、1つまたはそれを上回る加熱システムを含んでもよい。いくつかの実装では、加熱システムは、ソリッドステートヒートポンプまたは熱電ヒートポンプ等のヒートポンプ、ペルチェデバイス、ペルチェ加熱器、もしくはペルチェ熱ポンプを含んでもよい。熱伝達ブロック506は、銅または他の高熱伝導性材料から作製されてもよい。
図41および45は、クレードル466のヒンジ連結ドアまたはヒンジ連結側壁516の斜視図を図示する。図41および45に図示されるように、ヒンジ連結側壁516は、上向きおよび前から後に延在し、側壁516の底端に位置し、側壁516の左に向かって延在し、それに面する、ヒンジの構成要素518を含む。構成要素518は、ヒンジ連結側壁516が、ヒンジの構成要素504および518を通して前から後に延在する水平軸を中心として、左に、かつ静止側壁502に向かって内向きに、または右に、かつ静止側壁502から離れるように外向きに回転し得るように、完全なヒンジを形成するために構成要素504と結合されることができる。ヒンジ連結側壁516はまた、チャネル520のそれぞれが、半円形の断面形状を有する、それを通して水平および前から後に延在する、16個の個々の溝またはチャネル520も含む。
また、図45に図示されるように、ヒンジ連結側壁516は、ノブ522が、カートリッジ490をヒンジ連結側壁516に固着するために開口部496の中に挿入され得るように、開口部496のものに対応する形状を有する、複数の突出部またはノブもしくはペグ522を含む。また、図45に図示されるように、ヒンジ連結側壁516は、それぞれ、流体コネクタ494のオス型部分のポートのうちの個別のものに流体的に結合され得る、複数のポートを提供する、流体コネクタ524のメス型部分を含む。図41に図示されるように、マイクロピペットシステム464は、カートリッジ490が、クレードル466内に、かつ静止側壁502とヒンジ連結側壁516との間に位置されるように、システム400内に配設されることができる。
図46は、より明確にするためにシステム400の他の構成要素が除去された、ポンプシステム468を図示する。ポンプシステム468は、油圧または空気圧ポンプシステムであってもよく、「空気処理システム」とも称され得る。図46に図示されるように、ポンプシステム468は、ポンプシステム468の他の構成要素が結合され得る、静止フレーム526を含む。フレーム526は、例えば、水平作動システム424の背後の場所において筐体402の底部プレート404の上面にしっかりと固着されてもよい。図46に図示されるように、ポンプシステム468はまた、電気モータ、サーボモータ、または電力から等のトルクを発生させ得る任意の他の好適な第4のアクチュエータ528も含む。ポンプシステム468はまた、第4のアクチュエータ528の出力または駆動型ロッドに結合される、ねじ山付きロッド530も含む。第4のアクチュエータ528は、第4のアクチュエータ528から上下および上向きに延在する垂直軸である、その独自の中心長手軸を中心としてねじ山付きロッド530を回転させる、トルクを発生させることができる。
ポンプシステム468はまた、進行ブロック532がフレーム526の部分に沿って上下に直線状に進行し得るように、フレーム526に固着され、その上に搭載される、進行ブロックまたはプレート532も含む。例えば、進行プレート532は、その中に1つまたはそれを上回る孔もしくは開口部を含んでもよく、フレーム526は、カラムが進行プレート532をフレーム526に固着するために開口部内に位置付けられ得るように、開口部のものに対応する断面形状を有する、1つまたはそれを上回る支柱もしくはカラムを含んでもよい。ねじ山付きロッド530は、進行プレート532を通して延在する導管または開口部を通して延在する。いくつかの実装では、進行プレート532を通して延在する導管は、ねじ山付きロッド530のねじ山に対応する導管のねじ山を伴ってねじ山付きであり、導管のねじ山は、ねじ山付きロッド530のねじ山と係合および相互係止されてもよい。
したがって、これらのねじ山の係合およびフレーム526との進行プレート532の係合に起因して、アクチュエータ528がトルクを発生させ、ねじ山付きロッド530の回転を誘発するとき、ねじ山付きロッド530の回転は、フレーム526のカラムの高さに沿って上下に、進行プレート532の直線状移動を誘発する。時計回りまたは反時計回り等の第1の方向にねじ山付きロッド530を旋回させることによって、ねじ山付きロッド530は、上または下等の第1の方向に進行プレート532を進行させることができる。時計回りまたは反時計回り等の第1の方向と反対の第2の方向にねじ山付きロッド530を旋回させることによって、ねじ山付きロッド530は、上または下等の第1の方向と反対の第2の方向に進行プレート532を進行させることができる。
図46に図示されるように、ポンプシステム468はまた、それぞれ、個別のポンプバレル534aと、個別のポンプバレル534aの中に延在する個別のポンププランジャ534bとを含む、複数の(例えば、8つの)シリンジポンプ534も含む。したがって、ポンプシステム468はまた、「8つのチャネルシリンジポンプ」とも称されることができる。ポンププランジャ534bはそれぞれ、上向きの進行プレート532の移動が、ポンププランジャを上向きに引動し、個別のポンプバレル534aから外にポンププランジャ534bを後退させるように、および下向きの進行プレート532の移動が、ポンププランジャを下向きに押動し、個別のポンプバレル534aの中にポンププランジャ534bを延在させるように、進行プレート532に結合される。図46はまた、ポンプシステム468が、シリンジポンプ534毎に個別の対の導管536を含み、各対の導管536の入口が、双方向切替弁によって等、シリンジポンプ534のうちの個別のものの出口に流体的に結合され、導管536のそれぞれの出口が、流体コネクタ524のメス型部分のポートのうちの個別のものに流体的に結合されることも図示する。
マイクロ流体システム400を動作させるために、オペレータまたは技術者は、システム400に接近し、筐体402の他の部分から離れるように筐体402の前部分414を回転させることによって、筐体402を開放することができる。技術者は、次いで、マイクロウェルプレート420内の空洞426の中にマイクロ流体チップ418を位置付けることによって、次いで、下向きに、次いで、溝442に沿って、かつそれを通して水平に突出部434を摺動させることによって、マイクロウェルプレート420をトレイ422に固着することによって、マイクロ流体チップ418およびマイクロウェルプレート420bを配設することができる。技術者は、次いで、行われるべき処理に依存するが、生物学的サンプルおよびPCR試薬等のおよび他の物質を、マイクロウェルプレート420のマイクロウェル430のアレイの中に、および/またはマイクロ流体チップ418のウェル418aの中に装填することができる。いくつかの実装では、これらの物質は、qPCR、ゲル電気泳動、または本明細書に説明される他の処理技法のうちのいずれかを促進するための物質を含むことができる。いくつかの具体的実装では、これらの物質は、RNAポリメラーゼまたはDNAポリメラーゼを含むことができ、「TAQポリメラーゼ」とも称され得る、PCRで使用される好熱性生物の種々のDNAポリメラーゼのうちのいずれかを含んでもよい。
技術者は、次いで、マイクロピペットシステム464を配設することができる。マイクロピペットシステム464を配設するステップは、静止側壁502から離れるように外向きにクレードル466のヒンジ連結側壁516を回転させ、次いで、カートリッジ490内の開口部496の中に側壁502のノブ522を挿入することによって、およびその流体ポートを含む、流体コネクタ524のメス型部分内に、その流体ポートを含む、流体コネクタ494のオス型部分を固着することによって、カートリッジ490をヒンジ連結側壁516に固着するステップと、次いで、静止側壁502に向かって内向きにクレードル466のヒンジ連結側壁516を回転させ、マイクロピペット導管482bが、熱伝達ブロック506の溝508とヒンジ連結側壁516の溝520との間で支えられるように、静止側壁502とヒンジ連結側壁516との間でカートリッジを固着するステップとを含むことができる。マイクロピペットシステム464を配設するステップはまた、ラッチ480のパドル480aを押下するステップと、中空支持アーム484の中への開口部486の中にアーム478を挿入するステップと、次いで、パドル480aを解放し、ラッチ480の歯480bが、溝488の中に移動し、その内側に据え付けられることを可能にし、それによって、マイクロピペットシステム464の支持アーム484を垂直作動システム462のアーム478に固着および係止するステップとを含むこともできる。
いったんこれらのアクションが完了すると、技術者は、筐体402の他の部分に向かって筐体402の前部分414を回転させることによって、システム400を閉鎖することができる。技術者は、次いで、正確に、および一度だけ等、ボタン416を押下または押動し、マイクロ流体システム400の動作およびその中の生物学的サンプルまたは他の物質の処理を開始することができる。いくつかの実装では、オペレータまたは技術者はまた、例えば、緊急または他の不測の状況もしくは事態が生じる場合において、ボタン416を押下し、処理の完了に先立ってマイクロ流体システム400の動作を停止または中断してもよい。
いったん技術者がボタン416を押下し、マイクロ流体システム400の動作を開始すると、マイクロ流体システム400は、その中の構成要素の移動および動作を自動的に制御し、規定された方法で物質を処理することができる。例えば、いくつかの実装では、システム400は、水平作動システム424を使用し、マイクロピペット先端482aが、所望の物質を含有するマイクロウェルプレート420内のマイクロウェル430の直接上方に位置するまで、トレイ422を水平に移動させることができる。システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロウェルプレート420内のマイクロウェル430の所望の物質内に位置するまで、マイクロピペット先端482aを下向きに移動させることができる。システム400は、次いで、第4のアクチュエータ528を使用して、シリンジポンプ534を駆動し、マイクロピペット導管482bの中に所望の物質を引き上げることができる。一般に、このような第4のアクチュエータ528の動作は、一斉に8つのシリンジポンプ534のそれぞれを駆動する。
システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロウェルプレート420の上方に位置するまで、マイクロピペット先端482aを上向きに移動させることができる。システム400は、次いで、水平作動システム424を使用し、マイクロピペット先端482aが、物質の処理が開始するものである、マイクロ流体チップ418内のウェル418aの直接上方に位置するまで、トレイ422を水平に移動させることができる。システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロ流体チップ418の所望のウェル418a内に位置するまで、マイクロピペット先端482aを下向きに移動させることができる。システム400は、次いで、第4のアクチュエータ528を使用して、シリンジポンプ534を駆動し、マイクロピペット導管482bからウェル418aの中に物質を放出することができる。本プロセスは、マイクロウェルプレート420のマイクロウェル430からマイクロ流体チップ418内のウェル418aの中に所望と同じ数の物質を移動させるように繰り返されることができる。
いったん物質がこのようにウェル418aに供給されると、物質は、本明細書の他の場所でのそのような処理の説明に従って等、そのような物質から汚染物質を分離または除去するため等に、マイクロ流体チップ418内で種々の処理ステップを受けることができる。そのような処理中に、導電性リード線428は、電場を生成するように通電されることができる、および/または磁石450は、処理されている物質と相互作用し、それによって、マイクロ流体チップ418内のそれらの挙動に影響を及ぼし、マイクロ流体チップ418内のこれらの物質の処理を支援する、磁場を提供するように移動されることができる。いったんそのような処理が完了すると、十分な物質が、PCR処理で使用するため等のさらなる処理のために利用可能であることを確認するように、品質管理チェックが、実施されてもよい。そのような品質管理チェックは、システム400の内側または外側で行われ得る。
システム400は、次いで、水平作動システム424を使用し、マイクロピペット先端482aが、所望の物質を含有するマイクロ流体チップ418内のウェル418aの直接上方に位置するまで、トレイ422を水平に移動させることができる。システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロ流体チップ418のウェル418aの所望の物質内に位置するまで、マイクロピペット先端482aを下向きに移動させることができる。システム400は、次いで、第4のアクチュエータ528を使用して、シリンジポンプ534を駆動し、マイクロピペット導管482bの中に所望の物質を引き上げることができる。
システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロウェルプレート420の上方に位置するまで、マイクロピペット先端482aを上向きに移動させることができる。システム400は、次いで、水平作動システム424を使用し、マイクロピペット先端482aが、PCR試薬等の付加的な所望の物質が位置する、マイクロウェルプレート420内のマイクロウェル430の直接上方に位置するまで、トレイ422を水平に移動させることができる。システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロウェルプレート420の所望のマイクロウェル430内に位置するまで、マイクロピペット先端482aを下向きに移動させることができる。システム400は、次いで、第4のアクチュエータ528を使用して、シリンジポンプ534を駆動し、所望の物質が導管482bの内側で相互と混合され、カートリッジ490の内側の導管482bの部分内に位置するまで等、PCR試薬等の所望の物質をマイクロピペット導管482bの中に引き込むことができる。
いったん所望の物質がカートリッジ490の内側のマイクロピペット導管482bの部分内に位置すると、ソレノイドアクチュエータは、バー510が、2つの場所でマイクロピペット導管482bのそれぞれを挟締し、いずれの物質もカートリッジ490の内側に位置するマイクロピペット導管482bの部分から逃散しないように防止するまで、側壁502の右向きの表面から出て右に、かつヒンジ連結側壁516に向かってバー510を移動させるために、使用されることができる。クレードル466内の加熱器は、次いで、カートリッジ490の内側の導管482bの部分内に保持される物質を加熱し、その中で化学反応または他の処理ステップを促進するために、使用されることができる。ある場合には、これは、加熱器を使用し、導管482bへの一定の熱流を発生させるステップを含む一方で、他の場合では、これは、加熱器を循環させ、循環熱流を導管482bに提供するステップを含む。いくつかの実装では、導管482bは、熱を伝導し、物質をより効果的に加熱するように、熱伝導性プラスチックから作製される。
実施例として、熱は、カートリッジ490の内側の導管482bの部分内で起こるPCR反応を促進することができる。いったん本処理が完了すると、クレードル466内の加熱器は、カートリッジ490の内側の導管482bの部分内で保持される物質を加熱することを止めるようにオフにされることができ、ソレノイドアクチュエータは、バー510がもはやマイクロピペット導管482bを挟締しなくなるまで、側壁502の右向きの表面の中へ右に、かつヒンジ連結側壁516から離れるようにバー510を移動させるために、使用されることができる。いったんそのような処理が完了すると、PCR処理等の処理が成功した、またはある性能標準を満たしたことを確認するように、品質管理チェックが、実施されてもよい。そのような品質管理チェックは、システム400の内側または外側で行われ得る。
システム400は、次いで、水平作動システム424を使用し、マイクロピペット先端482aが、マイクロ流体プレート420内のウェル430の直接上方に位置するまで、トレイ422を水平に移動させることができる。システム400は、次いで、垂直作動システム462を使用し、マイクロウェルプレート430内の所望のウェル430内に位置するまで、マイクロピペット先端482aを下向きに移動させることができる。システム400は、次いで、第4のアクチュエータ528を使用して、シリンジポンプ534を駆動し、マイクロピペット導管482bからウェル430の中に物質を放出することができる。
いったんそのような処理が完了すると、技術者は、筐体402の他の部分から離れるように筐体402の前部分414を回転させることによって、筐体を開放することができる。技術者は、次いで、マイクロピペットシステム464を除去することができる。マイクロピペットシステム464を除去するステップは、静止側壁502から離れるように外向きにクレードル466のヒンジ連結側壁516を回転するステップと、次いで、カートリッジ490内の開口部496から外に側壁502のノブ522を移動させることによって、およびその流体ポートを含む、流体コネクタ524のメス型部分から、その流体ポートを含む、流体コネクタ494のオス型部分を除去することによって、ヒンジ連結側壁516からカートリッジ490を除去するステップとを含むことができる。マイクロピペットシステム464を除去するステップはまた、ラッチ480のパドル480aを押下するステップと、開口部486および中空支持アーム484からアーム478を除去するステップと、次いで、パドル480aを解放するステップとを含むこともできる。
技術者はまた、水平に、次いで、溝442に沿って、かつそれを通して上向きに、突出部434を摺動させることによって、トレイ422からマイクロ流体チップ418およびマイクロウェルプレート420を除去することができる。技術者は、次いで、マイクロウェルプレート420内のウェル430から処理された物質を除去することができる。いったんこれらの物質が除去され、他の場所に貯蔵されると、マイクロピペットシステム464、マイクロウェルプレート420、およびマイクロ流体チップ418は、廃棄物として破棄されることができる。後続の処理は、新しいマイクロピペットシステム464、新しいマイクロウェルプレート420、および新しいマイクロ流体チップ418を使用することができる。いくつかの実装では、本明細書に説明されるシステム400のマイクロ流体チップ418、マイクロウェルプレート420、および/または任意の他の構成要素は、具体的構成要素を識別し、そのような構成要素のより大きい集合内のそれらの場所を追跡することを支援するためのRFIDチップまたはタグを含んでもよい。
本明細書に説明される処理は、マイクロウェルプレート430からマイクロ流体チップ418まで、次いで、マイクロ流体チップ418からクレードル466まで、次いで、クレードル466からマイクロウェルプレート430に戻るように、物質を移動させることによって進む。そのような処理は、生物学的サンプルおよびDNA、RNA、mRNA、または種々のアミノ酸ベースのタンパク質を含む種々のタンパク質等のその所望の成分から、汚染物質を除去し、次いで、生物学的サンプルにPCRを実施する役割を果たすことができる。しかしながら、代替実装では、処理は、所望の処理によって要求されるアクションに応じて、任意の回数で任意の構成要素から任意の他の構成要素まで物質を移動させることによって、進むことができる。代替実装の一実施例では、本明細書に説明される処理は、マイクロウェルプレート430からクレードル466まで、次いで、クレードル466からマイクロ流体チップ418まで、次いで、マイクロ流体チップ418からマイクロウェルプレート420に戻るように、物質を移動させることによって進んでもよい。そのような処理は、生物学的サンプルおよびDNA、RNA、mRNA、または種々のアミノ酸ベースのタンパク質を含む種々のタンパク質等のその所望の成分にPCRを実施し、次いで、生物学的サンプルから汚染物質を除去する役割を果たすことができる。
2018年1月24日に出願された米国特許出願第15/879,141号、2018年1月30日に出願された米国特許出願第62/623,712号、および2018年11月7日に出願された米国特許出願第62/757,074号は、それらの全体として参照することによって本明細書に組み込まれる。上記に説明される種々の実施形態は、さらなる実施形態を提供するように、組み合わせられることができる。これらおよび他の変更は、上記に詳述される説明を踏まえて、実施形態に行われることができる。一般に、以下の請求項では、使用される用語は、請求項を本明細書および請求項に開示される具体的実施形態に限定するように解釈されるべきではなく、そのような請求項に与えられる均等物の全範囲とともに、全ての可能性として考えられる実施形態を含むように解釈されるべきである。故に、請求項は、本開示によって限定されない。

Claims (14)

  1. 生物学的サンプルから1つまたは複数の汚染物質を除去するための方法であって、前記方法は、
    マイクロチャネルを介して相互に接続される第1のウェルおよび第2のウェルを提供することであって、前記マイクロチャネルは、前記第1のウェルから前記第2のウェルまで一方向に延在する、ことと、
    前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルおよび第4のウェルを提供することであって、第1のプローブが前記第3のウェル上に配置され、第2のプローブが前記第4のウェル上に配置される、ことと、
    前記生物学的サンプルを前記第1のウェルの中に入れることと、
    磁気ビーズを前記第1のウェルの中に導入し、前記生物学的サンプル内の標的分子を引き寄せることと、
    前記第1のプローブおよび前記第2のプローブによって、前記第1のウェルから前記第2のウェルまで延在する前記一方向に交差する方向に前記マイクロチャネルを横断して電場を発生させることであって、前記電場は、前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかと相互作用するように適合される、ことと、
    磁場を発生させる磁石を前記第1のウェルの近傍に導入することであって、前記磁場は、前記磁気ビーズと相互作用する、ことと、
    前記磁石を移動させることによって、前記マイクロチャネルを通して前記第2のウェルに前記磁気ビーズを移動させることと
    を含み、
    前記電場は、前記磁気ビーズおよび引き寄せられた標的分子が前記マイクロチャネルを通して前記第2のウェルに移動するにつれて、前記マイクロチャネル内で前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかを維持するように、前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかに作用する、方法。
  2. 前記第2のウェルから前記磁気ビーズを引き出すことと、
    前記磁気ビーズを、流体を含むコンテナの中に挿入することと、
    前記磁気ビーズから前記標的分子を解放することと、
    前記コンテナから前記磁気ビーズを除去することと
    をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記マイクロチャネル内に緩衝剤を提供することをさらに含み、前記緩衝剤は、前記マイクロチャネル内の前記標的分子から前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかを分離する、請求項1に記載の方法。
  4. 2のマイクロチャネルを提供することであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、ことと、
    前記磁石を使用して、前記第2のマイクロチャネルを通して前記第3のウェルに前記磁気ビーズおよび標的分子を移動させることと
    をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  5. 前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内に流体を提供することと、
    前記流体の流動が、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で生成されるように、前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間の前記流体の体積差を生成することと
    をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  6. 前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを攪拌することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
  7. 前記第1のウェル内の前記生物学的サンプルを加熱することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
  8. 記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、請求項1に記載の方法。
  9. 生物学的サンプルから1つまたは複数の汚染物質を除去するためのシステムであって、前記システムは、
    前記生物学的サンプルから標的分子を引き寄せるように調整される磁気ビーズと、
    前記生物学的サンプルおよび前記磁気ビーズを含有するように適合される第1のウェルと、
    前記生物学的サンプルおよび前記磁気ビーズを含有するように適合される第2のウェルと、
    前記第1のウェルから前記第2のウェルまで一方向に延在するマイクロチャネルと、
    前記マイクロチャネルと連通する第3のウェルと、
    前記第3のウェル内に配置される第1のプローブと、
    前記マイクロチャネルと連通する第4のウェルと、
    前記第4のウェル内に配置される第2のプローブと、
    前記第1のウェルの近傍に移動させられるように適合される磁石であって、前記磁石は、磁場を発生させ、前記磁気ビーズと相互作用するように適合され、前記磁石は、前記第1のウェルから前記マイクロチャネルを介して前記第2のウェルに前記磁気ビーズを移動させることがさらに可能である、磁石と、
    電力源
    を含み、
    前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、前記電力源に結合され、前記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、前記電力源が電力を提供するとき、前記第1のウェルから前記第2のウェルまで延在する前記一方向に交差する方向に前記マイクロチャネルを横断して電場を発生させるように適合され、その結果、前記電場は、前記磁気ビーズおよび引き寄せられた標的分子が前記第1のウェルから前記第2のウェルに移動するにつれて、前記マイクロチャネル内で前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかを維持するように、前記1つまたは複数の汚染物質のうちの少なくともいくつかと相互作用するシステム。
  10. 2のマイクロチャネルであって、前記第3のウェルは、前記第2のマイクロチャネルを介して前記第2のウェルに接続される、第2のマイクロチャネ
    をさらに含み、
    前記磁石は、前記第2のウェルから前記第2のマイクロチャネルに沿って前記第3のウェルに移動し、前記磁気ビーズおよび標的分子を前記第2のウェルから前記第3のウェルに移動させるように適合される、請求項に記載のシステム。
  11. 前記第1のウェル、前記第2のウェル、および前記マイクロチャネル内の流体と、
    前記第2のウェルと前記第1のウェルとの間の前記流体の体積差であって、前記流体の体積差は、前記第2のウェルから前記第1のウェルに向かって前記マイクロチャネル内で前記流体の流動を提供するように適合される、流体の体積差と
    をさらに含む、請求項に記載のシステム。
  12. 前記第1のウェルの内容物を攪拌するように適合される磁気攪拌器をさらに含む、請求項に記載のシステム。
  13. 前記第1のウェルを加熱するように適合される加熱器をさらに含む、請求項に記載のシステム。
  14. 記第1のプローブおよび前記第2のプローブは、反対極性を有する、請求項に記載のシステム。
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