JP7376564B2 - 特定の自己免疫疾患を治療するためのｃｄ６標的キメラ抗原受容体 - Google Patents

Description

［０００１］１型糖尿病（Ｔ１Ｄ）は、膵ベータ細胞の自己免疫攻撃から沈降することで、機能的ベータ細胞量が喪失される。機能的ベータ細胞量は、ベータ細胞の数と大きさが増加する過程により正の影響を受け、細胞数が減少する過程（すなわち、アポトーシス、壊死、及び細胞死の他の態様）により負の影響を受ける。さらに、ベータ細胞の分泌機能及び分泌能は、機能的ベータ細胞量の実質的な決定因子である。

［０００２］Ｔ１Ｄ患者では、成人及びヒトの膵島の増殖及び再生の可能性は低い。したがって、自己免疫攻撃およびその結果としてのベータ細胞の破壊を防止または遅延させることが重要であり、機能的なベータ細胞量の回復に細胞修復機構を関与させることを含む、ベータ細胞量の拡大を促進し、ベータ細胞の生存を高め、及び／又は既存／残存するベータ細胞の機能を増強する方法を確立することが重要である。しかし、機能的なベータ細胞量の保護と補充と共に、膵島浸潤リンパ球を同時に標的とすることを目的とする治療戦略は限られている。本明細書では、当該技術分野におけるこれら及び他の課題に対する解決策が提供される。

［０００３］本明細書では、ＣＤ６を標的とするキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）について記載する。ＣＤ６ ＣＡＲは、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇｓ）において発現され、１型糖尿病（Ｔ１Ｄ）患者の炎症誘発性Ｔ細胞で過剰発現したＣＤ６分子を標的とする。本アプローチは、膵島にさらなる損傷を誘発しうる、ベータ細胞抗原を標的とするアプローチとは対照的である。いくつかの例では、現在のアプローチは、イトリズマブ（Itolizumab）由来のｓｃＦｖ、免疫調節性抗ＣＤ６モノクローナル抗体（米国特許第６，５７２，８５７号）を含むＣＡＲを用いる。ＣＤ６ ＣＡＲは、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ－４）細胞質ドメイン（ＣＤ３ゼータに加えて）で用いられ、形質導入された宿主細胞で抑制性シグナル伝達を誘導し、ＣＡＲ－Ｔｒｅｇｓの免疫調節活性を強化する。当該ＣＤ６のＣＤ６に対する親和性は比較的低い。これにより、養子細胞の過剰な活性化を回避し、生存を延ばすことができる場合がある。ＣＡＲはＴｒｅｇｓのＣＤ６ｌｏｗ／－サブセットで発現される場合もある。ＣＤ６ ＣＡＲはＣＤ４＋、ＣＤ２５ｈｉ、ＣＤ１２７ｌｏｗ／－、ＣＤ６ｌｏｗ／－Ｔ細胞で発現する場合もある。Ｔｒｅｇで発現されたＣＤ６ ＣＡＲは、安全性プロファイルがより良好である場合があるが、それは、有害サイトカイン放出症候群を誘発する可能性がＴエフェクター細胞（Ｔｅｆｆ）で発現されたＣＡＲと比較して、低いからである。さらに、Ｔｒｅｇは、ＩＤＯ、ＴＧＦ－ベータ及びＩＬ－１０等の抗炎症分子を産生しうる。ある場合、Ｔｒｅｇで発現されるＣＤ６ ＣＡＲはリンパ球枯渇に対する感受性が低く、その結果、持続性が高まり、養子免疫療法の有効性が向上する。

［０００４］本明細書で提供されるのは、とりわけ、自己免疫疾患のための細胞、核酸、タンパク質、方法、及び組成物である。実施形態では、当該自己免疫疾患は、膵島細胞（例えば、ベータ細胞）の機能、生存能、又は生存の低下と関連する。実施形態では、当該自己免疫疾患は、被験体の膵島細胞（例えば、ベータ細胞）を攻撃する被験体の免疫系を含む。また、本明細書で提供されるのは、とりわけ、特定の自己免疫疾患の治療に有用な組成物である。実施形態では、ヒトＣＤ６分子を標的とする新規ＣＡＲ－Ｔ細胞が提供される。実施形態では、ＣＤ６分子に対する親和性が異なる範囲のキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）は、遺伝子工学により、Ｔ調節細胞（Ｔｒｅｇｓ）を含む異なるタイプのヒトＴ細胞で発現される。

［０００４］一態様では、ＣＤ６を標的とする一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）及び膜貫通ドメインを含むタンパク質をコードする単離された核酸が提供される。

［０００５］一態様では、その実施形態を含む、本明細書で提供される核酸を含む、ベクターが提供される。

［０００６］一態様では、その実施形態を含む、本明細書で提供される、ベクターを含む、Ｔリンパ球、好ましくは、Ｔｒｅｇ細胞が提供される。

［０００７］一態様では、その実施形態を含む、ＣＤ６を標的とする一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）及び膜貫通ドメインを含む組換えタンパク質が提供される。

［０００８］一態様では、その実施形態を含む、本明細書で提供される組換えタンパク質を含む、Ｔリンパ球、好ましくは、Ｔｒｅｇ細胞、が提供される。

［０００９］一態様では、自己免疫疾患を治療する方法が提供される。実施形態では、本方法は、その実施形態を含む、本明細書で提供される、有効量の、Ｔ－リンパ球、好ましくはＴｒｅｇ細胞を、それを必要とする被験体に投与することを含む。

［００１１］ｐＦ０３４９６－ＣＤ６ｓｃＦｖｏｐ（ＶＨ＿ＶＬ）－ＩｇＧ４（Ｌ２３５Ｅ，Ｎ２９７Ｑ）ｏｐ－ＣＴＬＡ４－ゼータｏｐにより発現されるＣＤ６ ＣＡＲのアミノ酸配列を示す図であり、様々なドメインが記印される。シグナル配列（ＭＬＬＬＶＴＳＬＬＬＣＥＬＰＨＰＡＦＬＬＩＰ；配列番号７０）欠損の成熟ＣＡＲは配列番号８３である。未成熟配列は配列番号８４である。 ［００１２］ｐＦ０３４９７－ＣＤ６ｓｃＦｖｏｐ（ＶＬ＿ＶＨ）－ＩｇＧ４（Ｌ２３５Ｅ，Ｎ２９７Ｑ）ｏｐ－ＣＴＬＡ４－ゼータｏｐにより発現されるＣＤ６ ＣＡＲのアミノ酸配列を示す図であり、様々なドメインが記印される。シグナル配列（ＭＬＬＬＶＴＳＬＬＬＣＥＬＰＨＰＡＦＬＬＩＰ；配列番号７０）欠損の成熟ＣＡＲは配列番号８５である。未成熟配列は配列番号８６である。 ［００１３］ｐＦ０３４８８－ＣＤ６ｓｃＦｖ（ＶＨ－ＶＬ）－ＩｇＧ４ｏｐ（Ｌ２３５Ｅ、Ｎ２９７Ｑ）－４１ＢＢ－ゼータｏｐにより発現されるＣＤ６ ＣＡＲのアミノ酸配列を示す図であり、様々なドメインが記印される。シグナル配列（ＭＬＬＬＶＴＳＬＬＬＣＥＬＰＨＰＡＦＬＬＩＰ；配列番号７０）欠損の成熟ＣＡＲは配列番号８７である。未成熟配列は配列番号８８である。 ［００１４］ｐＦ０３４９１－ＣＤ６ｓｃＦｖ（ＶＬ－ＶＨ）－ＩｇＧ４ｏｐ（Ｌ２３５Ｅ，Ｎ２９７Ｑ）－４１ＢＢ－ゼータｏｐにより発現されるＣＤ６ ＣＡＲのアミノ酸配列を示す図であり、様々なドメインが記印される。シグナル配列（ＭＬＬＬＶＴＳＬＬＬＣＥＬＰＨＰＡＦＬＬＩＰ；配列番号７０）欠損の成熟ＣＡＲは配列番号８９である。未成熟配列は配列番号９０である。 ［００１５］Ｔｒｅｇｓの調製の概略図である。ＣＤ２５＋細胞をＰＢＭＣから単離する。次いで、ＦＡＣＳソーティングを用いて、ＣＤ４＋／ＣＤ２５^ｈｉｇｈ／ＣＤ１２７^{ｌｏｗ／－}を濃縮する。得られた細胞はＴｒｅｇｓが高度に濃縮される。場合によっては、さらなる工程を用いて、ＴｒｅｇｓのＣＤ６^{ｌｏｗ／－}サブセットを濃縮しうる。 ［００１６］従来型ＣＤ４＋ＣＤ２５ｈｉＣＤ１２７ｌｏｗ／－Ｔ調節細胞（Ｔｒｅｇｓ）宿主において発現される、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）又はＣＤ１５２（ＣＴＬＡ－４）細胞質ドメインを含む抗ＣＤ６ ＣＡＲによるエフェクターＴ細胞（Ｔｅｆｆ）増殖（ＩＣ５０）の阻害を示すグラフである。丸印は、従来型Ｔｒｅｇ－ＭＯＣＫ：Ｔｅｆｆ－ＭＯＣＫ（ＩＣ５０＝７３６０３）を示し、角印は、従来型Ｔｒｅｇ－ＣＡＲ（抗ＣＤ６／４１ＢＢ）：Ｔｅｆｆ－ＭＯＣＫ（ＩＣ５０＝４３８０７）、ダイヤ印は、従来型Ｔｒｅｇ－ＣＡＲ（抗ＣＤ６／ＣＴＬＡ４）：Ｔｅｆｆ－ＭＯＣＫ（ＩＣ５０＝１４２８６）を示す。濃い単一で空白の正方形は、Ｔｅｆｆ－ＭＯＣＫであり、薄い単一で空白の正方形は、Ｔｅｆｆ－ＭＯＣＫ（抗ＣＤ３ ＯＫＴ３ ｍＡｂ）を示す。 ［００１７］Tｅｆｆ増殖に対する特定のＣＤ６ ＣＡＲの影響を示す実験結果を示すグラフである。 ［００１８］特定のＣＤ６ ＣＡＲを発現するＴｒｅｇによるサイトカイン発現を検討する実験結果を示すグラフである。 ［００１９］ＣＴＬＡ４シグナル伝達ドメインがあるＣＤ６ ＣＡＲを発現するＴｒｅｇｓが、Ｔｅｆｆの存在下で培養でき、かつ、枯渇マーカーの発現は比較的低いレベルであることを示す実験結果を示すグラフである。 ［００２０］本明細書（配列番号７３）に記載のＣＡＲで用いる他のＣＤ６ ｓｃＦｖのアミノ酸配列ドメイン及び突然変異を示す図である。

［００１０］驚くべきことに、親和性が低いＣＡＲは、接種したＣＡＲ－Ｔ細胞の枯渇を遅らせ、遅延させ、又は軽減し、その結果、半減期が長くなり、養子免疫療法の有効性が改善される。実施形態では、本明細書で提供される組成物は、罹患臓器（例えば、Ｔ１Ｄの場合は膵臓）でＣＤ６＋Ｔ－及びＢ－リンパ球を標的とするＣＡＲ－Ｔ細胞を含む。実施形態では、本明細書で提供されるＣＡＲの親和性は、ＣＤ６分子（すなわち、タンパク質）に対してＫＤ１３０ｎＭ以上である。本明細書で提供されるＣＡＲ－Ｔ細胞は、ヒト自己免疫疾患（例えば、１型糖尿病、多発性硬化症、炎症性腸疾患、又は移植片対宿主病）の治療に関連すると考えられる。

［００１１］本発明の様々な実施形態及び態様は本明細書に示され説明されるが、当業者には、当該実施形態及び態様が単なる例示として提供されることは明らかであろう。当業者であれば、本発明から逸脱しない範囲で、数々の変化、変更、置換を行う。本願明細書で説明した本発明の実施形態の様々な代替物を選択して、本発明を実施しうることは明らかである。

［００１２］特段の定めがない限り、本明細書中で用いられる技術及び科学用語は、当業者が一般的に理解するのと同等の意味である。例えば、Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎら著「微生物学及び分子生物学辞書第２版」Ｊ．Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ（ＮｅｗＹｏｒｋ，ＮＹ１９９４）；Ｓａｍｂｒｏｏｋら著「分子生物学クローニング実験室マニュアル」（ＣｏｌｄＳｐｒｉｎｇｓＨａｒｂｏｒ，ＮＹ１９８９）を参照されたい。本明細書に記載されたものと同様又は同等のいかなる方法、装置及び材料も、本発明の実施で用いうる。以下の定義は、本明細書で頻繁に用いられる特定の用語の理解を容易にするために提供され、本開示の範囲の限定を意図するものではない。本明細書中で用いられる略語は、化学及び生物学の技術分野で慣用的な意味がある。本明細書で用いられる項目見出しは、構成目的のためで、説明される主題を限定すると解釈すべきでない。特許、特許出願、物品、書籍、マニュアル及び論文を含み、これらに限定されない、本出願で引用されたすべての文書又は文書の部分は、いかなる目的のためにも、その全体が参照により本明細書に明示的に援用される。

［００１３］本明細書で用いられる用語「約」は、特定の値を含む値の範囲を意味し、当業者であれば、特定の値と合理的に類似すると考えるであろう。実施形態では、用語「約」は、当該技術分野で一般的に許容される測定を用いた、標準偏差内の値をいう。実施形態では、「約」は、特定の値の＋／１０％に及ぶ範囲をいう。実施形態では、「約」は、指定値をいう。

［００１４］本明細書中で用いられる用語「ａ」又は「ａｎ」（原文）は、１又はそれ以上をいう。

［００１５］移行語「含む（including）」、「含む（containing）」、「を特徴とする（characterized by）」と同義の移行語「を含む（comprising）」は、包含的又は非限定的で、（方法の工程又は成分等の）引用されていない要素を除外するものではないが、移行句「からなる（consisting of）」は、請求項に記載されていない要素を除外し、移行句「本質的にからなる（consisting essentially of）」は、請求項の範囲を、特定の材料又は工程「並びに請求項に係る発明の基本的及び新規な特性に実質的に影響を及ぼさないもの」に限定し、移行語「consisting」を用いて方法及び組成物が開示される場合、移行句「consisting of」及び「consisting essentially of」を用いた、対応する方法及び組成物もまた開示されることが理解される。

［００１６］パラメータ範囲が提供される場合、その範囲内の全ての整数、及びその１０分の１も本発明により提供される。例えば、「０．２～５ｍｇ」は、５．０ｍｇまでを含む０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、０．５ｍｇ、０．６ｍｇ等が開示される。

［００１７］本明細書及び特許請求の範囲の記載で、句「少なくとも１つの」又は「１又はそれ以上の」等が、要素又は特徴の結合リストの後に続く場合がある。用語「及び／又は」は、２又はそれ以上の要素又は特徴のリスト中にも存在しうる。当該用語が用いられる文脈と暗示的又は明示的に矛盾しない限り、当該フレーズは、列挙された要素又は特徴のいずれかを個別に、又は列挙された要素又は特徴のいずれかを、他の列挙された要素又は特徴のいずれかと組み合わせることが意図される。例えば、句「Ａ及びＢの少なくとも１つ」、「Ａ及びＢの１又はそれ以上」、及び「Ａ及び／又はＢ」は各々、「Ａ単独、Ｂ単独、又はＡ及びＢを合わせて」をいうことを意図する。同様の解釈は、３又はそれ以上の項目を含むリストに対しても意図される。例えば、句「Ａ、Ｂ、及びＣの少なくとも１つ」、「Ａ、Ｂ、及びＣの１又はそれ以上」、及び「Ａ、Ｂ、及び／又はＣ」は各々、「Ａ単独、Ｂ単独、Ｃ単独、Ａ及びＢともに、Ａ及びＣともに、Ａ及びＣともに、Ｂ及びＣともに、又はＡ及びＢ及びＣともに」をいうことを意図する。

［００１８］「核酸」は、デオキシリボヌクレオチド又はリボヌクレオチド及び一本鎖又は二本鎖形態のそれらのポリマー、並びにそれらの相補物をいう。用語「ポリヌクレオチド」は、ヌクレオチドの直鎖状配列をいう。用語「ヌクレオチド」は、通常、ポリヌクレオチドの単一単位、すなわち、モノマーをいう。ヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、又はその修飾体でありうる。本明細書で意図されるポリヌクレオチドの例としては、一本鎖ＤＮＡ及び二本鎖ＤＮＡ、一本鎖及び二本鎖ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡを含む）、及び一本鎖ＤＮＡ及び二本鎖ＤＮＡ及びＲＮＡの混合物を有するハイブリッド分子があげられる。本明細書で用いる核酸はまた、天然核酸と同じ基本的な化学構造を有する核酸をいう。当該類似体は、修飾された糖及び／又は修飾された環置換基を有するが、天然核酸と同じ基本的な化学構造を保持する。「核酸模倣物」は、核酸の一般的な化学構造とは異なるものの、天然核酸に類似の態様で機能する構造を有する化合物をいう。当該類似体の例としては、ホスホロチオレート、ホスホロアミデート、メチルホスホネート、キラル－メチルホスホネート、２－Ｏ－メチルリボヌクレオチド、及びペプチド－核酸があげられるが、これらに限定されない。

［００１９］用語「アミノ酸」は、天然アミノ酸及び合成アミノ酸、並びに天然アミノ酸と同様に機能するアミノ酸類似体及びアミノ酸模倣物をいう。天然アミノ酸は、遺伝暗号によりコードされるアミノ酸、並びに後修飾されるアミノ酸、例えばヒドロキシプロリン、γ－カルボキシグルタミン酸、及びＯ－ホスホセリンである。「アミノ酸類似体」は、天然のアミノ酸と同じ基本的な化学構造、すなわち、水素、カルボキシル基、アミノ基、及びＲ基に結合したα炭素、例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウムを有する化合物をいう。当該類似体には、修飾されたＲ基（例えば、ノルロイシン）又は修飾されたペプチド骨格があるが、天然アミノ酸と同じ基本的な化学構造を保持する。「アミノ酸模倣物」とは、アミノ酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然アミノ酸と同様に機能する化合物をいう。

［００２０］アミノ酸は、ＩＵＰＡＣ－ＩＵＢ生化学命名委員会が推奨する、一般的に知られる３文字記号又は１文字記号のいずれかで本明細書で記載しうる。ヌクレオチドも同様に、一般に受容される一文字表記法で表しうる。

［００２１］用語「単離された」は、核酸又はタンパク質に適用される場合、核酸又はタンパク質が天然状態で会合している他の細胞成分を本質的に含まないことをいう。これは、例えば、均一状態でありえ、乾燥体又は水溶液のいずれかであってよい。純度及び均質性は、通常、分析化学技術、例えば、ポリアクリルアミドゲル電気泳動又は高性能液体クロマトグラフィーを用いて測定される。調製物中に存在する主要な種であるタンパク質は、実質的に精製される。

［００２２］「保存的に修飾された変異体」は、アミノ酸配列及び核酸配列ともに適用する。特定の核酸配列に関して、保存的に修飾された変異体とは、同一の又は本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸、又は核酸がアミノ酸配列をコードしない場合は、本質的に同一の配列をいう。遺伝暗号の縮重のため、機能的に同一な核酸配列の多くは、いかなる所定のアミノ酸残基をもコードする。例えば、コドンＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、及びＧＣＵはすべてアミノ酸アラニンをコードする。つまり、アラニンがコドンにより特定される各位置で、コードされたポリペプチドを改変せずに、コドンを、記載されたいかなる対応するコドンにも改変しうる。当該核酸変異は、保存的に修飾された変異の１種である「サイレント変異」である。ポリペプチドをコードする本明細書中の各核酸配列は、当該核酸のあらゆる可能なサイレント変異をも記載する。当業者は、核酸中の各コドン（通常、メチオニンの唯一のコドンであるＡＵＧ及び通常、トリプトファンの唯一のコドンであるＴＧＧを除く）を修飾して、機能的に同一の分子を獲得しうることを認識するであろう。従って、ポリペプチドをコードする核酸の各サイレント変異は、発現産物に関して記載された各配列においては暗示的であるが、実際のプローブ配列に関しては暗示的ではない。

［００２３］アミノ酸配列に関して、当業者は、コードされた配列中の単一アミノ酸又は低比率のアミノ酸を改変、付加、又は欠失させる核酸、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質配列に対する個々の置換、欠失、又は付加は「保存的に修飾された変異体」であることを認識する。実施形態では、当該改変は、結果としてアミノ酸を化学的に類似のアミノ酸で置換する。機能的に類似するアミノ酸をもたらす保存的置換表は、当該技術分野で周知である。当該保存的に修飾された変異体は、これらに限定されない、本発明の多型変異体、種間同族体、及び対立遺伝子に加えられる。

［００２４］以下の８つの基：１）アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）；２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；４）アルギニン（Ｒ）、リジン（Ｋ）；５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）；７）セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）；及び８）システイン（Ｃ）、メチオニン（Ｍ）（例えば、Creighton，Proteins(1984)参照）は各々、互いに保存的置換であるアミノ酸を含む。

［００２５］アミノ酸又はヌクレオチド塩基の「位置」は、Ｎ末端（又は５’末端）に対するその位置に基づいて、対照配列中の各アミノ酸（又はヌクレオチド塩基）を連続的に識別する番号で表される。最適アラインメントの決定で考慮されうる欠失、挿入、切断、融合等のため、一般に、Ｎ末端から単純計測して決定される試験配列中のアミノ酸残基数は、参照配列中の対応する位置の数と必ずしも同一ではない。例えば、アラインメントされた対照配列に対して変異体に欠失がある場合、その変異体中には、対照配列中の欠失部位の位置に対応するアミノ酸は存在しない。アラインメントされた対照配列に挿入がある場合、その挿入は、対照配列中の番号付きアミノ酸位置に対応しない。切断又は融合の場合、参照配列又はアラインメントされた配列のいずれか中のアミノ酸の伸長がありえ、対応する配列中のアミノ酸に対応しない。

［００２６］所与のアミノ酸又はポリヌクレオチド配列の番号付けの文脈において用いられる、用語「参照番号付き（numbered with reference to）」又は「対応する」は、所与のアミノ酸又はポリヌクレオチド配列を参照配列と比較する場合の、特定の参照配列の残基の番号付けをいう。タンパク質中のアミノ酸残基は、それが所与の残基と同一タンパク質内の主要な構造位置を占める場合、所与の残基に「対応する」。例えば、選択された抗体（又は抗原結合ドメイン）中の選択された残基は、選択された残基が、カバット（Kabat）位置４０における軽鎖トレオニンと同一の本質的な空間的又は他の構造的関係を占める場合、カバット位置４０における軽鎖トレオニンに対応する。いくつかの実施形態では、選択されたタンパク質が、抗体（又は抗原結合ドメイン）の軽鎖と最大限の相同性でアラインされる場合、アラインされた選択されたタンパク質における、トレオニン４０とアラインする位置は、トレオニン４０に対応するという。一次配列アラインメントの代わりに、三次元構造アラインメントを用いてよい。例えば、選択されたタンパク質の構造が、カバット位置４０における軽鎖トレオニンと最大対応するようにアラインメントされ、全体の構造が比較される。この場合、構造モデルでトレオニン４０と同一の必須位置を占めるアミノ酸は、トレオニン４０残基に対応するという。

［００２７］「配列同一性の比率」は、比較ウインドウ上で最適にアラインされた２つの配列を比較して決定され、ここで、比較ウインドウ中のポリヌクレオチド又はポリペプチド配列の部分は、２つの配列の最適アラインメントのため、参照配列（付加又は欠失がない）と比較して、付加又は欠失（すなわち、ギャップ）を含みうる。当該比率は、両配列に占める同一の核酸塩基又はアミノ酸残基の位置の数を測定することにより算出し、比較ウインドウ内の位置の総数で一致した位置数を除した後、当該結果に１００をかけて、一致した位置数を獲得する。

［００２８］用語「同一」又は比率の「同一性」は、比較ウインドウ上、又は配列比較アルゴリズム、若しくは手動アラインメント及び視覚検査を用いて測定した指定領域上での最大対応を比較及びアラインメントした場合に、２又はそれ以上の核酸又はポリペプチド配列の文脈において、同一か又は同一であるアミノ酸残基若しくはヌクレオチドが特定比率（例えば、本発明のポリペプチド配列全体又は本発明のポリペプチドの個々ドメインの５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、８５％、９５％、９８％、又は９９％の同一性）である２又はそれ以上の配列又は部分配列をいう。同一性が少なくとも約８０％である当該配列は「実質的に同一である」という。ある実施形態では、２つの配列は１００％同一である。ある実施形態では、２つの配列は、１つの配列（例えば、長さが異なる２つの配列のうち短い方）の全長にわたり１００％同一である。様々な実施形態では、同一性は、試験配列の相補物であってよい。いくつかの実施形態では、同一性は、アミノ酸又はヌクレオチドの長さが少なくとも約１０から約１００、約２０から約７５、約３０から約５０のである領域にわたって存在する。ある実施形態では、当該同一性は、ヌクレオチドの長さが約１０である領域上に存在し、より好ましくは、長さが２０～５０、１００～５００、又は１０００又はそれ以上である領域上に存在する。ある実施形態では、当該同一性は、アミノ酸長が少なくとも約５０個の領域上に存在し、より好ましくはアミノ酸長が１００～５００個、１００～２００個、１５０～２００個、１７５～２００個、１７５～２２５個、１７５～２５０個、２００～２２５個、２００～２５０個以上の領域上に存在する。

［００２９］配列比較には、通常、１つの配列が参照配列として機能し、試験配列と比較される。配列比較アルゴリズムを用いる場合、試験配列と参照配列がコンピュータに入力され、必要ならば、部分配列座標が指定され、配列アルゴリズムプログラムパラメータが指定される。好ましくは、デフォルトのプログラムパラメータを用いてよく、あるいは他のパラメータを指定しうる。次いで、配列比較アルゴリズムは、プログラムパラメータに基づいて、参照配列に対する試験配列の比率配列同一性を計算する。

［００３０］「比較ウインドウ」とは、連続した位置の数（例えば、少なくとも約１０～約１００、約２０～約７５、約３０～約５０、１００～約５００、１００～２００、１５０～２００、１７５～２００、１７５～２２５、１７５～２５０、２００～２２５、２００～２５０、２００～２５０）のうちのいかなる１つのセグメントをいい、当該セグメントにおいて、配列は、２つの配列が最適にアラインされた後、同じ数の連続した位置の参照配列と比較されうる。様々な実施形態では、当該比較ウインドウは、２つのアラインされた配列の一方又は両方の全長である。いくつかの実施形態では、比較される２つの配列の長さは異なってよく、当該比較ウインドウは２つの配列の長い方又は短い方の全長である。異なる長さの２つの配列に関する特定の実施形態では、当該比較ウインドウは、２つの配列のうち短い方の全長を含む。異なる長さの２つの配列に関するいくつかの実施形態では、当該比較ウインドウは、２つの長い方の配列の全長を含む。

［００３１］配列のアラインメントの比較方法は、当業界で周知である。配列の最適なアラインメントの比較は、例えば、Smith and Waterman(1970)Adv.Appl.Math.2:482cの局所相同性アルゴリズム、Needleman and Wunsch(1970)J.Mol.Biol.48:443の相同性アラインメントアルゴリズム、Pearson and Lipman(1988)Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA85:2444の類似性法の探索、これらのアルゴリズムの電算化された実装（Wisconsin Genetics Software Package,Genetics Computer Group,575 Science Dr.Madison,WI.のＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ及びＴＦＡＳＴＡ）、又は手動による位置合わせ及び視覚検査（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら「分子生物学の最近のプロトコル」（１９９５supplement）で行うことができる。

［００３２］配列同一性及び配列類似性の比率の決定に適したアルゴリズムの例は各々、Altschul et al. (1977) Nuc. Acids Res. 25:3389-3402及びAltschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410に記載されるＢＬＡＳＴ及びＢＬＡＳＴ ２．０アルゴリズムである。ＢＬＡＳＴ及びＢＬＡＳＴ ２．０を、本明細書に記載されたパラメータとともに用いて、核酸及びタンパク質の配列同一性比率を決定しうる。ＢＬＡＳＴ分析を実施するためのソフトウェアは、当該分野で公知のように、National Center for Biotechnology Information（ＮＣＢＩ）を通じて公に入手可能である。ＢＬＡＳＴ解析を行うためのソフトウェアは、米国国立バイオテクノロジー情報センター（ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）を通じて一般に入手可能である。当該アルゴリズムは、最初に、データベース配列内で同じ長さのワードとアラインされた場合、いくつかの正値閾値スコアＴに一致するか、又は満たす、長さＷの短いワードをクエリー配列内で同定することによる、高スコアリング配列ペア（ＨＳＰ）の同定を含む。Ｔは、近傍単ワードスコア閾値（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、前出）という。これらの初期近傍ワードヒットは、その中に含まれるより長いＨＳＰのサーチの検索を開始するシードとして機能する。当該ワードヒットを、その累積アラインメントスコアが上昇する限り、各配列に沿って両方向に拡張していく。累積スコアは、ヌクレオチド配列について、パラメータＭ（一致する残基のペアに対する報酬スコア；常に＞０）及びＮ（不一致残基に対するペナルティスコア；常に＜０）を用いて計算される。アミノ酸配列は、スコアリング行列を用いて累積スコアを算出する。各方向におけるワードヒットの拡張は、以下の場合に停止される：累積アラインメントスコアがその最大達成値から量Ｘだけ下がる；累積スコアが、１又はそれ以上の負のスコア残基アラインメントの累積のためにゼロ以下になる；又は、いずれかの配列の末端に到達する。ＢＬＡＳＴアルゴリズムパラメータＷ、Ｔ、及びＸは、アラインメントの感度及び速度を決定する。特定の実施形態では、ＮＣＢＩ ＢＬＡＳＴＮ又はＢＬＡＳＴＰプログラムを用いて配列をアラインメントする。特定の実施形態では、ＢＬＡＳＴＮ又はＢＬＡＳＴＰプログラムは、ＮＣＢＩで用いられるデフォルトを用いる。特定の実施形態では、ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列の場合）は、デフォルトとして、ワードサイズ（Ｗ）２８；期待閾値（Ｅ）１０；０に設定されたクエリー範囲での最大一致；１、～２の一致／不一致スコア；線形ギャップコスト；用いられる低複雑性領域用フィルター；及び用いられるルックアップテーブルのみのマスクを用いる。特定の実施形態では、ＢＬＡＳＴＰプログラム（アミノ酸配列について）は、デフォルトとして、ワードサイズ（Ｗ）３；期待閾値（Ｅ）１０；０に設定されたクエリー範囲における最大一致；ＢＬＯＳＵＭ６２マトリックス（Henikoff & Henikoff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915 (1992)参照）；存在のギャップコスト：１１及び拡張：１；並びに条件付き組成スコアマトリックス調整を用いる。

［００３３］ＢＬＡＳＴアルゴリズムはまた、２つの配列間の類似性の統計解析も行う（例えば、Karlin and Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787参照）。ＢＬＡＳＴアルゴリズムにより提供される類似性の１つの尺度は最小和確率（Ｐ（Ｎ））であり、これは２つのヌクレオチド又はアミノ酸配列間の一致が偶然に起こる確率を示す。例えば、核酸は、試験核酸の対照核酸に対する比較における最小和の確率が約０．２未満、より好ましくは約０．０１未満、最も好ましくは約０．００１未満である場合、対照配列に類似すると考えられる。

［００３４］特定の実施形態では、２つの核酸配列又はポリペプチドが実質的に同一であるという指標は、第１核酸でコードされるポリペプチドが、以下に記載するように、第２核酸でコードされるポリペプチドに対して生じた抗体と免疫学的に交差反応性であることをいう。従って、ポリペプチドは、通常、第２ポリペプチドと実質的に同一であり、例えば、２つのペプチドは、保存的置換のみが異なる。２つの核酸配列が実質的に同一であることを示すもう１つの指標は、２つの分子又はそれらの相補体が、以下に記載されるようなストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズすることである。２つの核酸配列が実質的に同一であることのさらなる他の指標は、配列の増幅に同一プライマーを用いうることである。

［００３５］本明細書中の用語「ポリペプチド」、「ペプチド」及び「タンパク質」は、アミノ酸残基のポリマーをいうのに相互に交換可能に用いることができ、ここで、当該ポリマーは、場合によっては、アミノ酸からならない部分に結合されてよい。当該用語は、１又はそれ以上のアミノ酸残基が、対応する天然アミノ酸の人工的化学模倣物であるアミノ酸ポリマー、並びに天然アミノ酸ポリマー及び非天然アミノ酸ポリマーに適用される。「融合タンパク質」は、組換えにより単一部分として発現される２又はそれ以上の別個のタンパク質配列をコードするキメラタンパク質をいう。

［００３６］「標識」又は「検出可能な部分」は、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、化学的、又は他の物理的手段により検出可能な組成物である。例えば、有用な標識には、^３２Ｐ、蛍光色素、電子密度の高い試薬、酵素（例えば、ＥＬＩＳＡで一般的に用いられる）、ビオチン、ジゴキシゲニン、又はハプテン及びタンパク質、又は標的ペプチドと特異的に反応するペプチド又は抗体に放射性標識を組み込むことにより検出させうる他の物質が含まれる。抗体を標識に結合させる当業界当で公知のいかなる適当な方法を、例えば、Hermanson,Bioconjugate Techniques1996,AcademicPress,Inc.,San Diegoに記載の方法を用いて用いうる。

［００３７］「標識されたタンパク質又はポリペプチド」とは、標識されたタンパク質又はポリペプチドに結合した標識の存在を検出して、標識されたタンパク質又はポリペプチドの存在を検出しうるように、リンカー又は化学結合を介して共有結合的に、又は非共有結合的に、イオン性、ファンデルワールス結合、静電結合、又は水素結合を介して、標識されたタンパク質又はポリペプチドに結合したものである。あるいは、高親和性相互作用を用いる方法は、一対の結合パートナーの一方が他方、例えばビオチン、ストレプトアビジンに結合する場合と同じ結果を達成しうる。

［００３８］「抗体」とは、免疫グロブリン遺伝子のフレームワーク領域又はその断片を含み、抗原を特異的に結合し認識する、ポリペプチドをいう。認識される免疫グロブリン遺伝子としては、κ、λ、α、γ、δ、ε、及びμの定常領域遺伝子、並びに無数の免疫グロブリン可変領域遺伝子があげられる。軽鎖は、カッパ又はラムダのいずれかに分類される。重鎖は、ガンマ、ミュー、アルファ、デルタ、又はイプシロンに分類され、これらは各々免疫グロブリンクラス、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ及びＩｇＥを定義する。通常、抗体の抗原結合領域は、結合の特異性及び親和性の決定に重要な役割を果たす。ある実施形態では、抗体又は抗体の断片は、ヒト、マウス、ラット、ハムスター、ラクダ等を含む異なる生物に由来しうる。本発明の抗体は、抗体の所望の機能（例えば、グリコシル化、発現、抗原認識、エフェクター機能、抗原結合、特異性等）を改善又は調節するために１又はそれ以上のアミノ酸位置で修飾又は変異された抗体を含みうる。

［００３９］抗体は、複雑な内部構造をもつ複雑な高分子（分子量約１５０，０００又は約１３２０アミノ酸）である。天然の抗体分子は、２組の同一ポリペプチド鎖対を含み、各対には１つの軽鎖と１つの重鎖がある。軽鎖と重鎖は各々、標的抗原との結合に関与する可変領域（「Ｖ」）と免疫系の他の構成要素と相互作用する定常部（「Ｃ」）の２つの領域からなる。軽鎖と重鎖の可変領域は３次元空間に集合して抗原と結合する可変領域（例えば、細胞表面の受容体）を形成する。軽鎖又は重鎖の可変領域には各々、相補性決定領域（「ＣＤＲ」）という３つの短い領域（平均１０アミノ酸長）がある。抗体可変ドメイン内の６つのＣＤＲ（軽鎖から３つ、重鎖から３つ）は、３次元空間内でともに折り畳まれて、標的抗原に結合する実際の抗体結合部位を形成する。ＣＤＲの位置及び長さは、Kabat,E.et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,U.S. Department of Health and Human Services,1983,1987でより正確に特定されている。ＣＤＲに含まれない可変領域の部分はフレームワーク（ＦＲ）といい、ＣＤＲの環境を形成する。

［００４０］例示的な免疫グロブリン（抗体）の構造単位は、四量体を含む。四量体は各々、二つの同一ポリペプチド鎖対からなり、各対には「軽鎖」（約２５ｋＤ）と「重鎖」（約５０～７０ｋＤ）がある。各鎖のＮ末端は、抗原認識に重要な役割を果たす約１００～１１０個以上のアミノ酸からなる可変領域である。用語「可変軽鎖」（ＶＬ）と「可変重鎖」（ＶＨ）は、各々これらの軽鎖と重鎖をいう。Ｆｃ（すなわち、断片結晶化可能領域）は、免疫グロブリンの「塩基」又は「尾部」であり、通常、抗体のクラスに応じて、２つ又は３つの定常ドメインを供与する２つの重鎖から構成される。Ｆｃ領域は、特定のタンパク質に結合することで、各抗体が特定抗原に対して適当な免疫応答を確実に誘導する。Ｆｃ領域はまた、Ｆｃ受容体等の様々な細胞受容体、及び補体タンパク質等の他の免疫分子に結合する。

［００４１］本明細書中で提供される用語「抗原」は、抗体結合部位に結合しうる分子をいう。

［００４２］抗体は、例えば、未処理の免疫グロブリンとして、又は様々なペプチダーゼによる消化により産生される多数のよく特徴付けられた断片として存在する。例えば、ペプシンは、抗体をヒンジ領域のジスフィルド結合の下で消化して、Ｆ（ａｂ）’２（ジスルフィド結合によるＦａｂ（ＶＨ－ＣＨ１に連結された軽鎖）の二量体）を生成する。Ｆ（ａｂ）’２は、ヒンジ領域のジスフィルド結合を壊す穏和な条件下で還元でき、二量体のＦ（ａｂ）’２は、Ｆａｂ’モノマーへ変換される。Ｆａｂ’モノマーは、本質的に、ヒンジ領域の部分を有する抗原結合部分である（基礎免疫学（Paul ed.,3d ed.1993）参照）。未処理抗体の消化の観点から、様々な抗体断片が特定されるが、当業者は、化学的に又は組換えＤＮＡ法を用いて当該断片を新たに合成できることを認識すると考えられる。したがって、本明細書に用いられる抗体という用語にはまた、全抗体の改変により生成された抗体断片、又は組換えＤＮＡ法を用いて、新たに合成された断片（例えば一本鎖Ｆｖ）、あるいはファージディスプレーライブラリーを用いて同定された断片（例えば、McCafferty et al.,Nature 348:552-554(1990)を参照）が含まれる。

［００４３］単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）は、通常、免疫グロブリンの重鎖（ＶＨ）及び軽鎖（ＶＬ）の可変領域の融合タンパク質であり、リンカーペプチド（例えば、１０～約２５アミノ酸の短いリンカーペプチド）と結合する。実施形態では、当該リンカーは、柔軟性に関するグリシン、並びに溶解性に関するセリン又はトレオニンに富む。当該リンカーはＶＨのＮ末端をＶＬのＣ末端に結合させうるし、その逆も可能である。

［００４４］ｍＡｂのエピトープは、ｍＡｂが結合する抗原の領域である。互いに競合的に相手方の抗原への結合を阻害（ブロック）する場合、２つの抗体が同一エピトープ又は重複したエピトープに結合する。すなわち、１つの抗体が１×、５×、１０×、２０×又は１００×過剰な場合、競合結合アッセイで測定すると、他方の抗体の結合を少なくとも３０％、好ましくは５０％、７５％、９０％又は９９％阻害する（例えば、Junghans et al.,Cancer Res.50:1495,1990参照）。あるいは、２つの抗体は、一方の抗体の結合を低下させるか又は除去する抗原におけるい実質的に全てのアミノ酸突然変異が、他方の抗体の結合を低下させるか又は除去する場合、同一エピトープを有する。２つの抗体は、一方の抗体の結合を低下させるか又は除去するいくつかのアミノ酸変異が他方の抗体の結合を低下させるか又は除去する場合、重複するエピトープを有する。

［００４５］適当な抗体の調製には、当業界で公知の多くの技術を用いうる（例えば、Kohler & Milstein, Nature 256:495-497 (1975); Kozbor et al., Immunology Today 4: 72 (1983); Cole et al., pp. 77-96 in Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc. (1985); Coligan, Current Protocols in Immunology (1991); Harlow & Lane, Antibodies, A Laboratory Manual (1988);及びGoding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice (2d ed. 1986)を参照）。関心対象の抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子を、細胞からクローニングでき、例えば、モノクローナル抗体をコードする遺伝子をハイブリドーマからクローニングし、組換えモノクローナル抗体の作製に用いうる。モノクローナル抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子ライブラリーはまた、ハイブリドーマ又は形質細胞から作製しうる。重鎖及び軽鎖遺伝子産物のランダムな組み合わせにより、抗原特異性が異なる抗体の大きなプールが作製される（例えば、Ｋｕｂｙ著「免疫学」（第３版、１９９７年）を参照）。一本鎖抗体又は組換え抗体の産生技術（米国特許第４，９４６，７７８号、米国特許第４，８１６，５６７号）を、本発明のポリペプチドに対する抗体の作製に応用しうる。また、トランスジェニックマウス、又は他の哺乳動物等の他の生物を用いて、ヒト化抗体又はヒト抗体を発現させてよい（例えば、米国特許第５，５４５，８０７号；第５，５４５，８０６号；第５，５６９，８２５号；第５，６２５，１２６号；第５，６３３，４２５号；第５，６６１，０１６号、Marksら、Bio/Technology10:779-783(1992);Lonbergら、Nature368:856-859(1994);Morrisonら、Nature368:812-13(1994);Fishwildら、Nature Biotechnology14:845-51(1996);Neuberger、Nature Biotechnology14:826(1996);及びLonberg&Huszar,Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995))。あるいは、ファージディスプレイ技術を用いて、選択された抗原に特異的に結合する抗体及びヘテロマーＦａｂ断片を同定しうる（例えば、McCaffertyら、Nature348:552-554(1990);Marksら、Biotechnology10:779-783(1992)参照）。抗体はまた、二重特異性であってよく、すなわち、２つの異なる抗原を認識しうる（例えば、国際公開第９３／０８８２９号、Trauneckerら、EMBO J.10:3655-3659(1991);及びSureshら、Methods in Enzymology121:210(1986)を参照）。抗体はまた、ヘテロ結合体、例えば、２つの共有結合された抗体、又は免疫毒素でありうる（例えば、米国特許第４，６７６，９８０号、国際公開第９１／００３６０号；国際公開第９２／２００３７３号；及び欧州特許第０３０８９号を参照）。

［００４６］非ヒト抗体又はｓｃＦｖをヒト化又は霊長類化する方法は、当業界で周知である（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号；第５，５３０，１０１号；第５，８５９，２０５号；第５，５８５，０８９号；第５，６９３，７６１号；第５，６９３，７６２号；第５，７７７，０８５号；第６，１８０，３７０号；第６，２１０，６７１号；及び第６，３２９，５１１号；国際公開第８７／０２６７１号；欧州特許第０１７３４９４号；Jonesら(1986)Nature321:522;及びVerhoyenら(1988)Science239:1534)。ヒト化抗体は、例えば、Winter及びMilstein(1991)Nature349:293にさらに記載される。一般的に、ヒト化抗体には、非ヒト由来の１又はそれ以上のアミノ酸残基が導入される。当該非ヒトアミノ酸残基は「インポート」残基といわれることがあり、通常「インポート」可変ドメイン由来である。ヒト化は、基本的に、Ｗｉｎｔｅｒらの方法により、ヒト抗体の対応する配列をげっ歯類のＣＤＲ又はＣＤＲ配列に置換することにより、行いうる（例えば、Morrisonら、PNAS USA,81:6851-6855(1984)、Jonesら、Nature321:522-525(1986);Riechmannら、Nature332:323-327(1988);Morrison及びOi,Adv.Immunol.、44:65-92(1988)、Verhoeyenら、Science 239:1534-1536(1988)及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593-596(1992),Padlan,Molec.Immun.,28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immun.、31(3):169-217(1994)を参照）。従って、当該ヒト化抗体はキメラ抗体（米国特許第４，８１６，５６７号）であり、ここで、実質的に完全なヒト可変ドメインより短いものが、非ヒト種由来の対応する配列により置換される。実際、ヒト化抗体は通常、いくつかのＣＤＲ残基と可能性のあるいくつかのＦＲ残基とが齧歯類抗体の中の同様の部位に由来する残基で置換されるヒト抗体である。例えば、ヒト化免疫グロブリンフレームワーク領域をコードする第１配列、及び所望の免疫グロブリン相補性決定領域をコードする第２配列のセットを含むポリヌクレオチドは、合成的に、又は適当なｃＤＮＡ及びゲノムＤＮＡセグメントを組み合わせて製造しうる。ヒト定常領域ＤＮＡ配列は、様々なヒト細胞から周知の手順により単離しうる。

［００４７］「キメラ抗体」とは、（ａ）定常領域、又はその部分が、改変、置換、又は交換されて、抗原結合部位（可変領域）が、異なる若しくは変化したクラス、エフェクター機能及び／若しくは種、又はキメラ抗体に新規な特性を付与する全く異なる分子の定常領域（例えば、酵素、毒素、ホルモン、成長因子、薬物等）に連結される、；又は（ｂ）可変領域、又はその部分が、抗原特異性が異なる若しくは変化した可変領域で改変、置換、又は交換される、抗体分子である。本発明による好ましい抗体としては、ヒト化及び／又はキメラモノクローナル抗体があげられる。

［００４８］本明細書中で提供される「治療用抗体」とは、がん、自己免疫疾患、移植拒絶反応、心血管疾患、又は本明細書中に記載される他の疾患又は状態の治療に用いられるいかなる抗体又はその機能的断片をいう。

［００４９］治療薬を抗体に結合させる技術は周知である（例えば、Arnon et al.,“Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy”,in Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy,Reisfeld et al.(eds.),pp.243-56(Alan R.Liss,Inc.1985);Hellstrom et al.,“Antibodies For Drug Delivery”in Controlled Drug Delivery(2nd Ed.),Robinson et al.(eds.),pp.623-53(Marcel Dekker,Inc.1987);Thorpe,“Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy:A Review”in Monoclonal Antibodies‘84:Biological And Clinical Applications, Pinchera et al.(eds.),pp.475-506(1985);and Thorpe et al.,“The Preparation And Cytotoxic Properties Of Antibody-Toxin Conjugates”,Immunol. Rev.,62:119-58(1982)を参照）。「ＡＤＣ」とは、抗体に結合した、又はそうでなければ共有結合した治療剤をいう。本明細書中で用いられる「治療剤」は、自己免疫疾患等の疾患の治療又は予防に有用な組成物である。

［００５０］本明細書中で用いられる用語「抗ＣＤ６抗体」とは、抗体ＣＤＲ配列を介してＣＤ６に結合しうる抗体をいう。従って、抗ＣＤ６抗体としては、ＣＤ６に特異的に結合するＣＤＲｓＣＤＲｓ（例えば、ＶＬ－ＣＤＲ１、ＶＬ－ＣＤＲ２、ＶＬ－ＣＤＲ３、ＶＨ－ＣＤＲ１、ＶＨ－ＣＤＲ２、ＶＨＣＤＲ３）で構成される抗体結合部位があげられる。

［００５１］本明細書で用いられる「ＣＤ６」は、ＴＰ１２０としても知られるが、ＣＤ６活性（例えば、ＣＤ６と比較した活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％以内である）を維持する、いかなる分化６（ＣＤ６）タンパク質又はその変異体又はその相同体のクラスターの組換え型又は天然型を含む。態様では、変異体又は相同体は、天然ＣＤ６タンパク質と比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＤ６タンパク質は、ＵｎｉＰｒｏｔ参照番号Ｐ３０２０３で同定されるタンパク質又はそれと実質的に同一性がある変異体若しくは相同体と実質的に同一である。ある場合、ＣＤ６はヒトのＣＤ６タンパク質である。ある場合、ＣＤ６タンパク質の変異体又は突然変異体（mutant）は、天然ＣＤ６タンパク質と比較して５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ６タンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ６タンパク質と比較して５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ６タンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ６タンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ６タンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ６タンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ６タンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ６タンパク質と比較して保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ６は、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００６７１６．３で同定されるタンパク質又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体である。ある場合、ＣＤ６は、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１２４１６７９．１で同定されるタンパク質又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体である。ある場合、ＣＤ６は、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１２４１６８０．１で同定されるタンパク質又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体である。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ６アミノ酸配列の非限定例は、以下の通りである：

［００５２］本明細書で提供される用語「ＣＤ２８膜貫通ドメイン」は、ＣＤ２８膜貫通ドメイン活性（例えば、ＣＤ２８膜貫通ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持する、ＣＤ２８の膜貫通ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体若しくは相同体を含む。ある場合、変異体又は相同体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、当該ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ヒトＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１２３０００６．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ．００１２３０００７．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００６１３０．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインアミノ酸配列は、ＲＳＫＲＲＧＨＧＨＳＤＹＭＮＭＴＰＲＰＴＲＰＴＲＫＹＱＰＹＡＰＰＰＲＤＦＡＹＲＳの配列（配列番号７）を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインアミノ酸配列は配列番号７の配列である。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインアミノ酸配列は、ＲＳＫＲＲＲＬＬＬＨＳＤＹＭＮＭＴＰＲＰＴＲＰＴＲＫＹＱＹＰＹＡＰＰＰＲＤＦＡＹＲＳの配列（配列番号８）を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインアミノ酸配列は配列番号８の配列である。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ２８アミノ酸配列の非限定的な例は以下の通りである：

［００５３］ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１２４３０７７．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１２４３０７８．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿ ００６１３９．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００５４］本明細書中で提供される用語「ＣＤ４膜貫通ドメイン」は、ＣＤ４膜貫通ドメイン活性（例えば、ＣＤ４膜貫通ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持する、ＣＤ４の膜貫通ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体若しくは相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインアミノ酸配列は、ＭＡＬＩＶＬＧＧＶＡＧＬＬＦＩＧＬＧＩＦＦ（配列番号２３）の配列を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインアミノ酸配列は配列番号２３の配列である。ＣＤ４膜貫通ドメインをコードするヌクレオチド配列の非限定的な例は、ＡＴＧＣＣＣＴＧＡＴＴＧＴＴＧＣＴＧＧＧＧＧＣＧＣＧＴＣＧＴＣＣＣＴＣＴＴＣＴＴＣＴＴＡＴＴＧＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＴＣＡＴＴＴＴＴＴＴ（配列番号２４）である。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインはヒトＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿０００６０７．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４３．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４４．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４５．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４６．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ４アミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：

［００５５］ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿０００６１６．４で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１１９５０１４．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１１９５０１５．２で同定されるの全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１１９５０１６．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１１９５０１７．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ４膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００５６］本明細書で提供される用語「ＣＤ８膜貫通ドメイン」は、ＣＤ８膜貫通ドメイン活性（例えば、ＣＤ８膜貫通ドメインと比較して、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９６％、９８％、９８％、９９％又は１００％活性）を維持する、ＣＤ８の膜貫通ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体若しくは相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインアミノ酸配列は、ＩＹＩＷＡＰＬＡＧＴＣＧＶＬＬＳＬＶＩＴの配列（配列番号２５）を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインアミノ酸配列は配列番号２５の配列である。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインはＣＤ８Ａ膜貫通ドメインである。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインはＣＤ８Ｂ膜貫通ドメインである。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインはヒトＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然に生じるＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質と比較して５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１３９３４５．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４３．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４４．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１８１９４５．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿７４１９６９．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１７５９．３で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＸＰ＿０１１５３１４６６．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１１７１５７１．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿７５７３６２．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿７４２１００．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿７４２０９９．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００４９２２．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ８アミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：

［００５７］ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＲ＿０２７３５３．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１１４５８７３．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１７６８．６で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１７１８２７．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＸＭ＿０１１５３３１６４．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１１７８１００．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００４９３１．４で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１７２１０２．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１７２１０１．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１７２２１３．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００５８］本明細書で提供される用語「ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン」は、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン活性（例えば、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持する、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体又は相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインはヒトＣＤ３ゼータ膜貫通ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿０００７２５．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿９３２１７０．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ３－ゼータアミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：

［００５９］ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿０００７３４．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１９８０５３．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３－ゼータ膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００６０］本明細書で提供される用語「ＣＤ２８共刺激ドメイン」は、ＣＤ２８共刺激ドメイン活性（例えば、ＣＤ２８共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持する、ＣＤ２８の共刺激ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体若しくは相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインアミノ酸配列は、ＲＳＫＲＲＲＧＨＧＨＧＨＳＤＹＭＮＭＴＰＲＰＴＲＰＴＲＫＹＱＰＹＡＰＰＰＲＤＦＡＹＲＳの配列（配列番号７）を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインアミノ酸配列は、ＲＳＫＲＳＲＲＬＬＬＨＳＤＹＭＮＭＴＰＲＰＴＲＰＧＰＲＰＲＰＴＲＫＹＰＹＡＰＰＲＤＦＡＹＲＳの配列である（配列番号８）。

［００９４］ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインはヒトＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１２３０００６．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１２３０００７．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００６１３０．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ２８アミノ酸配列の非限定的な例は以下の通りである：

［００６１］ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１２４３０７７．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくは変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１２４３０７８．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくは変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００６１３９．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８膜貫通ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ２８共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００６２］本明細書中で提供される用語「４－１ＢＢ共刺激ドメイン」は、４－１ＢＢの共刺激ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又は４－１ＢＢの共刺激ドメイン活性（例えば、４－１ＢＢ共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持するその変異体又は相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続アミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインはヒトの４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２又は１以下の欠失を含む。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２又は１個以下の挿入を含む。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質は、アミノ酸配列ＫＲＧＲＫＫＬＬＹＩＦＫＱＰＦＭＲＰＶＱＴＴＱＥＥＤＧＣＲＦＥＥＥＧＧＣＥＬ（配列番号１４）を含む。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインタンパク質アミノ酸配列は、配列番号１４に対して少なくとも又は約５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の同一性を有する。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１５５２．２で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒト４－１ＢＢアミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：
[０１００] ＮＰ＿００１５５２．２

［００６３］ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１５６１．５で同定される核酸配列の全部又は部分、又はアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくは変異体によりコードされる。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２又は１以下の欠失を含む。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然４－１ＢＢ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００６４］本明細書で提供される用語「ＩＣＯＳ共刺激ドメイン」は、ＩＣＯＳ共刺激ドメイン活性（例えば、ＩＣＯＳ共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持する、ＩＣＯＳの共刺激ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体若しくは相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインアミノ酸配列は、ＣＷＬＴＫＫＫＹＳＳＳＶＮＧＥＹＰＮＧＥＹＰＮＧＥＹＰＮＴＡＶＮＴＡＫＫＳＲＬＴＤＶＴＬの配列（配列番号３１）を含む。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインは、ヒトＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然のＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質と比較して５、４、３、２又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然のＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然のＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿０３６２２４．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＩＣＯＳアミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：

［００６５］ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿０１２０９２．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＩＣＯＳ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００６６］本明細書で提供される用語「ＯＸ－４０共刺激ドメイン」は、ＯＸ－４０共刺激ドメインの組換え型若しくは天然型のいずれか、又はＯＸ－４０共刺激ドメイン活性（例えば、ＯＸ－４０共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持するその変異体若しくは相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続アミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインアミノ酸配列は、ＡＬＹＬＬＲＲＤＱＲＬＰＰＤＡＨＫＰＰＧＧＳＧＧＳＦＲＴＰＩＱＡＨＳＴＬＡＫＩの配列（配列番号３２）を含む。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインはヒトＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００３３１８．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＯＸ－４０アミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：
［０１０６］ ＮＰ＿００３３１８．１

［００６７］ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００３３２７．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＯＸ－４０共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００６８］本明細書中で提供される用語「ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン」は、ＣＴＬＡ－４の共刺激ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン活性（例えば、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持するその変異体又は相同体を含む。ある態様では、変異体若しくは相同体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体若しくは配列の部分（例えば、５０、１００、１５０若しくは２００の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％若しくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は、ヒトＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインは、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は欠失がない。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は挿入がない。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は、配列ＡＶＳＬＳＫＭＬＫＭＬＫＲＳＫＰＬＴＴＶＹＶＭＰＰＴＥＰＥＥＣＥＫＱＦＱＰＹＦＩＰＩＮ（配列番号１７）を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質は配列番号１７である。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインアミノ酸配列は、配列番号１７に対して少なくとも又は約５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の配列が同定される。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインは、ヒトＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００１０３２７２０．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００５２０５．２で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＴＬＡ－４アミノ酸配列の非限定的な例は、以下の通りである：

［００６９］ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００１０３７６３１．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくは変異体によりコードされる。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００５２１４．５で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくは変異体によりコードされる。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２又は１以下の挿入を含む。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＴＬＡ－４共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００７０］本明細書で提供される用語「ＰＤ－１共刺激ドメイン」は、ＰＤ－１の共刺激ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はＰＤ－１の共刺激ドメイン活性（例えば、ＰＤ－１共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持するその変異体又は相同体を含む。ある態様では、変異体若しくは相同体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体若しくは配列の部分（例えば、５０、１００、１５０若しくは２００の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％若しくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＰＤ－Ｉ共刺激ドメインアミノ酸配列は、ＣＳＲＡＡＲＧＴＩＧＡＲＲＧＲＴＧＰＬＫＥＤＰＳＡＶＰＶＦＳＶＤＹＧＥＬＤＦＱＷＲＥＫＴＰＥＰＶＰＣＶＰＥＱＴＥＡＴＩＶＰＳＧＭＧＭＴＳＳＰ ＡＲＲＧＳＡＤＧＰＲＳＡＱＰＬＲＰＥＤＧＨＣＳＷＰＬ（配列番号３３）の配列を含む。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインは、ヒトＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。場合によっては、ＰＤ－１共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿０００９．２で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＰＤ－１アミノ酸配列の非限定的な例は以下の通りである：

［００７１］ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００５０１８．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくは変異体によりコードされる。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２、又は１以下の欠失を含む。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２又は１以下の挿入を含む。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＰＤ－１共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００７２］本明細書で提供される用語「ＧＩＴＲ共刺激ドメイン」は、ＧＩＴＲの共刺激ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はＧＩＴＲ共刺激ドメイン活性（例えば、ＧＩＴＲ共刺激ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持するその変異体又は相同体を含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続アミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインアミノ酸配列は、ＱＬＧＬＨＩＷＱＬＲＳＱＲＳＱＣＭＷＰＲＥＴＱＬＬＥＶＰＰＥＳＴＥＤＡＲＱＦＰＥＥＲＥＲＧＥＲＳＡＥＫＧＲＬＧＤＬＷＶ（配列番号６７）の配列を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ヒトＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質である。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質と比較して５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然のＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然のＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然のＧＩＴＲ共刺激ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿００４１８６．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿６８３６９９．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿６８３７００．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参考文献に基づいて入手可能なヒトＧＩＴＲアミノ酸配列の非限定的な例は以下の通りである：

［０１１９］ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１４８９０２．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿００４１９５．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１４８９０１．１で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列と比較して５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列と比較した挿入がない。ある場合、ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＧＩＴＲ共刺激ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００７３］本明細書中に提供される用語「ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン」は、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインの組換え型又は天然型のいずれか、又はその変異体若しくは相同体であって、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン活性（例えば、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインと比較して、その活性が、少なくとも５０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、１００％の範囲内である）を維持するものを含む。ある態様では、変異体又は相同体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインポリペプチドと比較して、配列全体又は配列の部分（例えば、５０、１００、１５０又は２００個の連続したアミノ酸部分）にわたり、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％のアミノ酸配列同一性を有する。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、ヒトＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質である。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１以下の欠失しか含まない。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインタンパク質と比較して、保存的置換である置換を含む。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿０００７２５．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＰ＿９３２１７０．１で同定されるタンパク質の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体を含む。ＮＣＢＩ配列参照の下で利用可能なヒトＣＤ３－ゼータアミノ酸配列の非限定的な例は、上記で同定される。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿０００７３４．３で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、ＮＣＢＩ配列参照ＮＭ＿１９８０５３．２で同定される核酸配列の全部若しくは部分、又はそのアイソフォーム若しくはその天然突然変異体若しくはその変異体によりコードされる。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内シグナル伝達ドメインの核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内シグナル伝達ドメインの核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内シグナル伝達ドメインの核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内シグナル伝達ドメインの核酸配列と比較して、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインの核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインの核酸配列と比較して、欠失がない。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインの核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインの核酸配列と比較して、挿入がない。ある場合、ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン核酸配列の変異体又は突然変異体は、天然ＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン核酸配列と比較して、保存的置換である置換を含む。

［００７４］用語「特異的に（又は選択的に）抗体に結合する」又は「特異的に（又は選択的に）免疫反応性がある（を有する）」は、タンパク質又はペプチドをいう場合、しばしばタンパク質及び他の生物の不均一な集団において、タンパク質の存在を決定する結合反応をいう。従って、所定の免疫アッセイ条件下で、特定の抗体は、バックグラウンドの少なくとも２倍、より典型的には、バックグラウンドの１０～１００倍を超える特定のタンパク質に結合する。当該条件下での抗体への特異的結合は、通常、特定のタンパク質に対するその特異性について選択される抗体が必要である。例えば、ポリクローナル抗体は、選択された抗原と特異的に免疫反応性があるが、他のタンパク質とは免疫反応性でない抗体のサブセットのみを得るように選択しうる。当該選択は、他の分子と交差反応する抗体を差し引くことにより達成しうる。様々な免疫アッセイフォーマットを用いて、特定のタンパク質と特異的に免疫反応性の抗体を選択しうる。例えば、固相ＥＬＩＳＡイムノアッセイは、タンパク質と特異的に免疫反応性のある抗体の選択の常套手段である（例えば、特異的免疫反応性の決定に用いうる免疫アッセイフォーマット及び条件の記載は、Harlow&Lane,Using Antibodies,A Laboratory Manual(1998)を参照）。

［００７５］「リガンド」とは、受容体に結合しうる物質、例えば、ポリペプチド又は他の分子をいう。

［００７６］用語「組換え」が、例えば、細胞、核酸、タンパク質、又はベクターに関連して用いられる場合、細胞、核酸、タンパク質、又はベクターが実験室手法により修飾されたこと、又はその結果を示す。従って、例えば、組換えタンパク質は、実験室手法により産生されるタンパク質を含む。組換えタンパク質は、そのタンパク質の天然（非組換え）型には見出されないアミノ酸残基を含んでよく、又は修飾された、例えば、標識されたアミノ酸残基を含んでよい。

［００７７］用語「異種性」は、核酸の部分に関して用いられる場合、核酸が、天然では互いに同一の関係で見出されない２又はそれ以上の部分配列を含むことを示す。例えば、当該核酸は、通常、組換え的に産生され、例えば、ある供給源由来プロモーター及び別の供給源由来のコード領域等の、新規な機能的核酸を作製するように調整された無関係の遺伝子由来の２又はそれ以上の配列を有する。同様に、異種タンパク質は、当該タンパク質が、天然では互いに同じ関係で見出されない２又はそれ以上の部分配列（例えば、融合タンパク質）を含むことを示す。

［００７８］本明細書中で用いられる「細胞」とは、そのゲノムＤＮＡを保存又は複製するのに十分な代謝機能又は他の機能を実現する細胞をいう。細胞は、例えば、未処理の膜の存在、特定の色素による染色、生殖能力、又は、配偶子の場合、第２配偶子と結合するして、生存可能な子孫を産生する機能を含む、当業界で周知の方法により同定しうる。細胞は、原核細胞及び真核細胞を含みうる。原核細胞には、細菌が含まれるが、これらに限定されない。真核細胞としては、酵母細胞及び植物及び動物由来の細胞、例えば哺乳動物（例えば、ヒト）及び昆虫（例えば、スポドプテラ）細胞があげられるが、これらに限定されない。細胞は、元来非接着性である場合、又は例えばトリプシン処理により表面に接着しないように処理された場合、有用でありうる。

［００７９］ある遺伝子に関して本明細書中で用いられる用語「発現」又は「発現された」は、その遺伝子の転写産物及び／又は翻訳産物をいう。細胞内のＤＮＡ分子の発現レベルは、細胞内に存在する対応するｍＲＮＡの量、又は細胞により産生されるＤＮＡによりコードされるタンパク質の量のいずれかに基づいて決定しうる。非コード核酸分子（例えば、ｓｉＲＮＡ）の発現のレベルは、標準的なＰＣＲ又は当技術分野で周知のノーザンブロット法により検出しうる。Ｓａｍｂｒｏｏｋら著「分子生物学クローニング実験室マニュアル」（ＣｏｌｄＳｐｒｉｎｇｓＨａｒｂｏｒ，ＮＹ１９８９）１８．１－１８．８８参照。

［００８０］用語「プラスミド」、「ベクター」又は「発現ベクター」は、遺伝子の発現に必要な遺伝子及び／又は調節エレメントをコードする核酸分子をいう。プラスミドからの遺伝子の発現はシス又はトランスで起こりうる。ある遺伝子がシスに発現すると、その遺伝子と調節エレメントは同じプラスミドにコードされる。ｔｒａｎｓでの発現は、遺伝子と調節エレメントが別々のプラスミドによりコードされる場合をいう。

［００８１］用語「トランスフェクション」、「形質導入」、「トランスフェクションする」又は「形質導入する」は、互換的に用いてよく、核酸分子又はタンパク質を細胞に導入するプロセスとして定義される。核酸は、非ウイルス系又はウイルス系の方法を用いて細胞に導入される。核酸分子は、完全タンパク質又はその機能的部分をコードする遺伝子配列でありうる。トランスフェクションの非ウイルス系方法としては、核酸分子を細胞に導入する送達システムとしてウイルスＤＮＡ又はウイルス粒子を用いないいかなる適当なトランスフェクション方法があげられる。例示的な非ウイルストランスフェクション方法としては、リン酸カルシウムトランスフェクション、リポソームトランスフェクション、ヌクレオフェクション、ソノポレーション、熱ショックトランスフェクション、磁化及びエレクトロポレーションがあげられる。いくつかの実施形態では、核酸分子は、当技術分野で周知の標準的手順によりエレクトロポレーションを用いて細胞に導入される。ウイルス系トランスフェクション方法としては、本明細書に記載された方法において、いかなる有用なウイルスベクターを用いてよい。ウイルスベクターの例としては、レトロウイルス、アデノウイルス、レンチウイルス及びアデノ随伴ウイルスベクターがあげられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、核酸分子は、当該分野で周知の標準的な手順により、レトロウイルスベクターを用いて細胞に導入される。用語「トランスフェクション」又は「形質導入」はまた、外部環境から細胞にタンパク質を導入することをいう。通常、タンパク質の形質導入又はトランスフェクションは、細胞膜を目的のタンパク質に通過しうるペプチド又はタンパク質の接着に依存する。例えば、Fordら(2001)Gene Therapy8:1-4及びProchiantz(2007)Nat Methods4:119-20を参照のこと。

［００８２］トランスフェクトされた遺伝子の発現は、細胞内で一時的に、又は安定して生じうる。「一過性発現」では、トランスフェクションされた遺伝子は細胞分裂の間に娘細胞に伝達されない。当該発現はトランスフェクトされた細胞に限定され、遺伝子の発現は経時的に消失する。その一方で、トランスフェクトされた遺伝子の安定化発現は、当該遺伝子を、トランスフェクトされた細胞に選択上の利点を供与する他の遺伝子とコトランスフェクトした場合に生じる。当該選択利点は、細胞に提示される特定の毒素に対する耐性でありうる。トランスフェクションされた遺伝子の発現は、トランスポゾンを介した宿主ゲノムへの挿入によりさらに達成しうる。トランスポゾン介在挿入では、遺伝子は、宿主ゲノムへの挿入及びその後の切り出しが可能になる２つのトランスポゾンリンカー配列の間で予測可能な方法で配置される。トランスフェクトされた遺伝子の安定化発現は、細胞にレンチウイルスベクターを感染させることによりさらに達成しうるが、これは、感染後に細胞ゲノムの部分を形成（組み込まれ）することで、遺伝子の安定化発現をもたらす。

［００８３］「接触する」は、その単純な通常の意味により用いられるが、少なくとも２つの異なる種（例えば、生体分子又は細胞を含む化合物）が反応、相互作用又は物理的接触するのに十分に近位になりうるプロセスをいう。得られた反応生成物は、添加された試薬間の反応から直接的に、又は反応混合物中で生成されうる１又はそれ以上の添加された試薬からの中間体から生成されうることが理解されるべきである。

［００８４］用語「接触する」は、２つの種が反応する、相互作用する、又は物理的に接触することを可能にすることを含み得、ここで、当該２つの種は、例えば、本明細書に記載されるペプチド化合物及び抗原結合部位でありうる。

［００８５］用語「調節（modulation）」、「調節する（modulate）」又は「調節因子（modulator）」は、それらの単純な通常の意味により用いられ、１又はそれ以上の特性を変化又は変化させる行為をいう。「調節因子」は、標的分子のレベル、標的分子の機能、又は分子の標的の物理的状態を増加又は低下させる組成物をいう。「調節」は、１又はそれ以上の特性を変化又は変化させるプロセスをいう。例えば、生物学的標的に対する調節因子の作用に適用されるように、生物学的標的の特性若しくは機能、又は生物学的標的量を増加又は低下させて変化させる調節因子の手段を調節する。

［００８６］本明細書中で定義される用語「阻害」、「阻害する」、「阻害すること」等は、タンパク質－阻害化因子（例えば、アンタゴニスト）相互作用に関して、阻害剤の非存在下でのタンパク質の活性又は機能に対するタンパク質の活性又は機能に負の影響（例えば、低下）を及ぼすことをいう。ある場合、抑制とは、疾患又は疾患の症状の軽減をいう。従って、ある場合、阻害としては、少なくとも部分的に又は全面的に刺激を遮断し、活性化を低下させ、妨げ、又は遅延させ、又はシグナル伝達若しくは酵素活性又はタンパク質の量を不活性化し、減感作し、又は下方制御することがあげられる。ある場合、阻害の量は、アンタゴニストの非存在下での対照と比較して、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％以下でありうる。ある場合、阻害は、アンタゴニストの非存在下での発現又は活性よりも、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、又はそれより大きい。

［００８７］状況に応じて、用語「活性化」、「活性化する」、「活性化すること」等は、タンパク質－活性化因子（例えば、アゴニスト）相互作用に関して、活性化因子の非存在下で、タンパク質の活性又は機能に関連する活性又は機能に正の影響を及ぼす（例えば、増加させる）ことをいう（例えば、本明細書に記載の組成物）。従って、ある場合、活性化は、少なくとも部分的に、又は全体的に、刺激を高め、活性化を高め、又は可能にし、又はシグナル伝達若しくは酵素活性を活性化し、感作し、又は情報制御し、又は疾患において低下したタンパク質量を含みうる。活性化量は、アゴニストの非存在下での対照と比較して、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、Ｉ００％以上でありうる。ある場合、活性化は、アゴニストの非存在下での発現又は活性よりも、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、又はより大きい。

［００８８］本明細書中で用いられる用語「異常な」は、正常とは異なることをいう。酵素活性の記載に用いられる場合、異常活性とは、正常対照又は正常非罹患対照試料の平均より大きいか又は小さい活性をいう。異常活性とは、疾患をもたらす活性量をいってよく、ここで、（例えば、本明細書に記載される方法を用いることにより）異常活性を正常又は非疾患関連量に戻すと、疾患又は１又はそれ以上の疾患症状が低下する。

［００８９］状況に応じて、用語「生物学的試料」又は「試料」とは、被験体又は患者から得られた、又はそれに由来する材料をいう。ある場合、生物学的試料は、生検試料及び剖検試料等の組織切片、及び組織学的目的のために採取された凍結切片を含む。試料の非限定的な例としては、血液及び血液画分又は製品（例えば、血清、血漿、血小板、赤血球等）の血液流体、喀痰、組織、培養細胞（例えば、初代培養、外植片、及び形質転換細胞）、糞便、尿、滑液、関節組織、滑膜組織、滑膜組織、滑膜細胞、線維芽細胞様滑膜細胞、マクロファージ様滑膜細胞、免疫細胞、造血細胞、線維芽細胞、マクロファージ、Ｔ細胞等があげられる。生物学的試料は、通常、真核生物、例えば、哺乳類、例えば、霊長類、例えば、チンパンジー又はヒト；ウシ；イヌ；ネコ；齧歯類、例えば、モルモット、ラット、マウス；ウサギ；又は鳥類；爬虫類；又は魚類から得られる。ある場合、被験体由来の生物学的試料（例えば、血液）は、対照と比較して異常なＣＤ６発現及び／又は機能を有する。ある場合、被験体由来の生物学的試料（例えば、血液）には、異常な免疫細胞活性又は増殖（例えば、異常数のＣＤ６＋免疫細胞又は異常活性を有するＣＤ６＋細胞）がある。

［００９０］「対照」試料又は値とは、試験試料と比較する参照であって、通常は既知の参照、として供する試料をいう。例えば、試験試料は、例えば試験化合物の存在下で試験条件から採取し、例えば試験化合物の非存在下（陰性対照）又は既知化合物の存在下（陽性対照）で、既知条件から採取した試料と比較しうる。対照は、複数の試験又は結果から収集された平均値を表してよい。当業者は、対照は、いかなる数のパラメータの評価に設計されうることを認識するであろう。例えば、薬理学的データ（例えば、半減期）又は治療的手段（例えば、副作用の比較）に基づく治療的利益の比較に対照を設置しうる。当業者は、所与の状況において、どの対照に価値があるかを理解し、対照値との比較に基づいてデータを分析しうる。対照は、データの重要性の判断にも有用である。例えば、あるパラメータ値が対照群で広く変動する場合、試験試料の変動は有意とはみなされない。

［００９１］「患者」又は「それを必要とする被験体」とは、示された疾患に罹患している、又は罹患する可能性のある動物界の生体メンバーをいう。ある場合、被験体は、本来的に当該疾患に罹患している個体を含む種のメンバーである。ある場合、被験体は、本明細書中に提供される組成物又は医薬組成物の投与により治療しうる疾患又は状態に罹患するか又は罹患する傾向にある生体である。非限定的な例は、ヒト、他の哺乳動物、ウシ、ラット、マウス、イヌ、サル、ヤギ、ヒツジ、ウシ、シカ、及び他の非哺乳動物である。ある実施形態では、患者は、ヒトである。

［００９２］用語「疾患」又は「状態」とは、本明細書中に提供される化合物、医薬組成物、又は方法で治療しうる患者又は被験体の状態又は健康状態をいう。ある場合、疾患は自己免疫疾患（例えば、Ｉ型糖尿病、移植片対宿主病）である。場合によっては。

［００９３］本明細書中で用いられる「自己免疫疾患」とは、被験体の免疫系による、例えば、被験体の体内に常存する物質組織及び／又は細胞に対する、変化した免疫反応から生じる疾患又は障害をいう。自己免疫疾患としては、関節炎、関節リウマチ、乾癬性関節炎、若年性特発性関節炎、強皮症、全身性強皮症、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、重症筋無力症、若年発症糖尿病、１型糖尿病、ギラン－バレー症候群、橋本脳炎、橋本甲状腺炎、強直性脊椎炎、乾癬、シェーグレン症候群、血管炎、糸球体腎炎、自己免疫性甲状腺炎、ベーチェット病、クローン病、潰瘍性大腸炎、水疱性類天疱瘡、サルコイドーシス、乾癬、魚鱗癬、グレーブス眼症、炎症性腸疾患、アジソン病、白斑、喘息、移植片対宿主病、及びアレルギー性喘息があげられるが、これらに限定されない。

［００９４］本明細書中で用いられる「炎症性疾患」とは、異常又は変化した炎症に関連する疾患又は障害をいう。炎症は、病原体、損傷を受けた細胞、組織、又は刺激物に応答する治癒過程の部分として免疫系により開始される生物学的応答である。慢性炎症は様々な疾患を誘発しうる。炎症性疾患としては、アテローム性動脈硬化症、アレルギー、喘息、関節リウマチ、移植拒絶反応、セリアック病、慢性前立腺炎、炎症性腸疾患、骨盤内炎症性疾患、及び炎症性ミオパシーがあげられるが、これらに限定されない。

［００９５］ある疾患（例えば、自己免疫疾患）に関連する物質又は物質の活性若しくは機能に関連する用語「関連した」又は「に関連する」は、当該疾患が、その物質又は物質の活性若しくは機能の全部又は部分により惹起される、又はその疾患の症状が、その物質又は物質の活性若しくは機能により惹起されることをいう。

［００９６］用語「治療する」又は「治療」とは、傷害、疾患、病理又は状態の治療又は改善における成功の徴候のいずれかをいい、症状の軽減又は傷害、病理又は状態を患者にとってより許容しやすいものにする、症状の軽減又は損傷、病理又は状態を軽減する、変性又は衰弱の速度を遅延させる、変性の最終点を減弱させない、患者の身体的又は精神的幸福を改善する等の客観的又は主観的パラメータを含む。症状の治療又は改善は、身体診察、神経精神医学的検査及び／又は精神医学的評価の結果を含む客観的又は主観的パラメータに基づいてよい。用語「治療する」及びその活用形は、傷害、病理、状態、又は疾患の予防を包含する。ある場合、「治療する」は、自己免疫疾患の治療をいう。

［００９７］「有効量」とは、化合物が、化合物の不在に関連した、所定の目的を達成するのに十分な量（例えば、投与される効果を達成する、疾患を治療する、酵素活性を低下させる、酵素活性を高める、シグナル伝達経路を低下させる、又は疾患若しくは状態の１つ若しくは複数の症状を低下させる）をいう。「治療有効量」の例は、疾患の症状若しくは症状の治療、予防、又は低下に寄与するのに十分な量であり、これは「治療有効量」ともいう。症状若しくは症状の「低下」（及びこの語句の文法上の等価物）とは、症状の重症度若しくは頻度を低下させる、又は症状を消失させることをいう。正確な量は、治療の目的によるが、当業者は、公知技術を用いて確認しうる（例えば、Pharmaceutical Dosage Forms(vols.1-3,1992);Lloyd,The Art,Science and Technology of Pharmaceutical Compounding(1999);Pickar,Dosage Calculations(1999);及びRemington:The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition,2003,Gennaro,Ed.,Lippincott,Williams&Wilkins参照）。

［００９８］「医薬的に許容される賦形剤」及び「医薬的に許容される担体」とは、被験体への活性剤の投与及び被験体による吸収を補助する物質をいい、本発明の組成物に含まれうるが、患者に重大な有害な毒性学的影響を誘発しない。医薬的に許容される賦形剤の非限定的な例としては、水、ＮａＣｌ、生理食塩水、乳酸リンゲル液、通常のスクロース、通常のグルコース、結合剤、充填剤、崩壊剤、滑沢剤、コーティング剤、甘味料、フレーバー、（リンゲル液等の）塩溶液、アルコール、油、ゼラチン、炭水化物、例えばラクトース、アミロース又はデンプン、脂肪酸エステル、ヒドロキシメチルセルロース、ポリビニルピロリジン、及び着色剤等があげられる。当該製剤は、滅菌でき、所望であれば、本発明の化合物と有害に反応しない、潤滑剤、保存剤、安定剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧に影響する塩、緩衝剤、着色剤、及び／又は芳香物質等の補助剤と混合しうる。当業者は、他の医薬賦形剤が本発明において有用であることを認識するであろう。

［００９９］用語「調製（物）」は、活性成分が他の担体を伴う又は伴わない担体に囲まれたカプセルを提供する担体としてのカプセル化材料を有する活性化合物の処方を含むことが意図され、つまり、担体に関連する。同様に、カシェ剤やトローチ剤も含まれる。錠剤、散剤、カプセル剤、丸剤、カシェ剤及びトローチ剤は、経口投与に適した固体投与形態として用いられうる。

［０１００］ある場合、用語「投与する」は、被験体への経口投与、坐剤としての投与、局所接触、静脈内、非経口、腹腔内、筋肉内、病変内、髄腔内、鼻腔内又は皮下投与、又は遅延放出装置、例えばミニ－浸透圧ポンプの移植を含む。ある場合、非経口及び経粘膜（例えば、頬、舌下、口蓋、歯肉、鼻、膣、直腸、又は経皮）を含むいかなる経路による投与である。非経口投与としては、例えば、静脈内、筋肉内、細動脈内、皮内、皮下、腹腔内、脳室内及び頭蓋内があげられる。他の送達形態としては、リポソーム製剤、静脈内注入、経皮パッチ等の使用があげられるが、これらに限定されない。

［０１０１］医薬組成物は、活性成分（例えば、本明細書に記載の化合物、実施形態又は例を含む）が、治療有効量、すなわち、その意図された目的を達成するのに有効な量で含まれる組成物を含んでよい。特定の用途に有効な実際の量は、特に、治療される状態による。疾患を治療する方法で投与される場合、当該組成物は、所望の結果を達成するのに有効な量の活性成分を含有し、例えば、標的分子の活性を調節し、及び／又は疾患症状の進行を減少させ、除去し、又は遅延させる。

〔組換えタンパク質とＣＡＲ Ｔ－細胞〕
［０１０２］一態様では、本明細書で提供される組換えタンパク質は、本明細書で提供される単離された核酸により発現されるタンパク質を含み、その実施形態を含む。従って、ある態様では、ＣＤ６を標的とする一本鎖可変断片及び膜貫通ドメインを含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）のような組換えタンパク質が提供される。ある態様では、本明細書では、膜貫通ドメインがないＣＤ６を標的とするｓｃＦｖが提供される。ある態様では、本明細書では、ＣＡＲを発現するように操作された細胞（例えば、免疫エフェクター細胞の集団等の細胞の集団）であって、ＣＡＲが抗原結合ドメイン及び膜貫通ドメインを含む、細胞が提供される。ある場合、抗原結合ドメインは、ＣＤ６を標的とする抗体断片又は変異体を含む。ある場合、抗原結合ドメインはＣＤ６を標的とする一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）である。ある場合、ＣＡＲは、細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。ある場合、ＣＡＲを発現する細胞はＴリンパ球（ＣＡＲ Ｔ細胞）又はＮＫ細胞である。ある場合、ＣＡＲを発現する細胞はＴリンパ球（ＣＡＲ Ｔ細胞）又はＮＫ細胞である。ある場合、細胞はＣＤ４＋ Ｔ細胞又はＣＤ８＋ Ｔ細胞である。ある場合、Ｔ細胞は調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。

［０１０３］ある場合、抗原結合ドメインは、モノクローナル抗体のＣＤＲ、モノクローナル抗体の可変領域、及び／又はそれらの抗原結合断片を含みうる。ある場合、当該断片は、抗原特異的抗体のいかなる数の異なる抗原結合ドメインでありうる。ある場合、当該抗原結合ドメインは、抗ＣＤ６抗体のＣＤ６結合断片を含む。ある場合、当該抗原結合ドメインは、抗ＣＤ６抗体のＣＤＲを含む。ある場合、当該抗原結合ドメインは、抗ＣＤ６抗体のＶＨ及びＶＬ鎖を含む。ある場合、当該抗原結合ドメインは、抗ＣＤ６抗体のＣＤＲを含むｓｃＦｖを含む。ある場合、当該抗原結合ドメインは、抗ＣＤ６抗体のＶＨ及びＶＬ鎖を含むｓｃＦｖを含む。ある場合、当該抗ＣＤ６抗体はモノクローナル抗体である。ある場合、当該モノクローナル抗体はヒト又はヒト化モノクローナル抗体である。ある場合、当該モノクローナル抗体はイトリズマブである。ある場合、当該断片は、ヒト細胞での発現でヒトコドンを用いるために最適化された配列によりコードされる抗原特異的ｓｃＦｖである。ある場合、当該モノクローナル抗体はキメラモノクローナル抗体である。ある場合、当該モノクローナル抗体はイトリズマブである。ある場合、当該モノクローナル抗体はＴｌ２．１である。ある場合、当該モノクローナル抗体はＵＭＣＤ６である。ある場合、モノクローナル抗体はＭＥＭ９８である。ある場合、モノクローナル抗体はＭＴ６０５である。ある場合、モノクローナル抗体は、Ｇａｎｇｅｍｉら（１９８９）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ１４３（８）：２４３９－４７又は米国特許第６，５７２，８５７号に記載される抗体であり、これらの各々の内容は全て、参照により本明細書に援用される。ある場合、当該断片は、ヒト細胞での発現でヒトコドンを用いるために最適化された配列によりコードされる抗原特異的ｓｃＦｖである。ある場合、抗原結合ドメインは、以下のＶＨ配列又はその変異体を含む：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＬＫＬＳＣＡＡＳＧＦＫＦＳＲＹＡＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＲＬＥＷＶＡＴＩＳＳＧＧＳＹＩＹＹＰ
ＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＶＫＮＴＬＹＬＱＭＳＳＬＲＳＥＤＴ
ＡＭＹＹＣＡＲＲＤＹＤＬＤＹＦＤＳＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号３５）。ある場合、抗原結合ドメインは、以下のＶＬ配列、又はその変異体を含む：ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＫＡＳＲＤＩＲＳＹＬＴＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＴＬＩＹＹＡＴＳＬＡＤＧＶＰＳＲＦ
ＳＧＳＧＳＧＱＤＹＳＬＴＩＳＳＬＥＳＤＤＴＡＴＹＹＣＬＱＨＧＥＳＰＦＴＦＧＳＧＴＫＬＥＩＫＲＡ（配列番号３４）。ある場合、抗原結合ドメインは、以下のＶＨ配列又はその変異体を含む：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬ
ＶＫＰＧＧＳＬＫＬＳＣＡＡＳＧＦＫＦＳＲＹＡＭＳＷＶＲＱＴＰＥＫＲＬＥＷＶＡＴＩＳＳＧＧＳＹＩＹＹＰＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＶＫＮＴＬＹＬＱＭＳＳＬＲＳＥＤＴＡＭＹＹＣＡＲＲＤＹＤＬＤＹＦＤＳＷＧＱＧＴＴＬＴＶＳＳ（配列番号６８）。ある場合、抗原結合ドメインは、以下のＶＬ配列又はその変異体を含む：
ＤＩＫＭＴＱＳＰＳＳＭＹＡＳＬＧＥＲＶＴＩＴＣＫＡＳＲＤＩＲＳＹＬＴＷＹＱＱＫＰＷＫＳＰＫＴＬＩＹＹＡＴＳＬＡＤＧＶＰＳＲＦ
ＳＧＳＧＳＧＱＤＹＳＬＴＩＳＳＬＥＳＤＤＴＡＴＹＹＣＬＱＨＧＥＳＰＦＴＦＧＳＧＴＫＬＥＩＫＲＡ（配列番号６９）。ある場合、ＶＬは、以下の配列又はその変異体を含む：ＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＫＡＳＲＤＩＲＳＹＬＴＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＴＬＩＹＹＡＴＳＬＡＤＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＱ（配列番号７５）。ある場合、ＶＬは、ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＫＡＳＲＤＩＲＳＹ（配列番号７６）の配列又はその変異体を含む。ある場合、ＶＬは、以下の配列又はその変異体を含む：ＬＴＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＴＬＩＹＹＡＴＳＬＡＤＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＱＤＹＳＬＴＩＳＳＬＥＳＤＤＴＡＴＹＹＣＬＱＨＧＥＳＰＦＴ（配列番号７７）。ある場合、ＶＬは、以下の配列又はその変異体を含む：ＦＧＳＧＴＫＬＥＩＫＲＡ（配列番号７８）。ある場合、ＶＨは、以下の配列又はその変異体：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＬＫＬＳＣＡＡＳＧＦＫＦＳＲＹＡＭＳ（配列番号７９）を含む。ある場合、ＶＨは、以下の配列又はその変異体：ＷＶＲＱＡＰＧＫＲＬＥＷＶＡＴＩＳＳＧＧ（配列番号８０）を含む。ある場合、ＶＨは、以下の配列又はその変異体：ＳＹＩＹＹＰＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＶＫＮＴＬＹＬＱＭＳＳＬＲＳＥＤＴＡＭＹＹＣＡＲＲＤＹＤＬＤＹＦＤＳ（配列番号８１）を含む。ある場合、ＶＨは、以下の配列又はその変異体を含む：ＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号８２）。ある場合、本明細書で提供されるＶＨ又はＶＬ配列の変異体は、当該配列と比較して５、４、３、２、１、又は０の欠失がある。ある場合、本明細書で提供されるＶＨ又はＶＬ配列の変異体は、当該配列と比較して５、４、３、２、１、又は０の挿入がある。ある場合、本明細書中で提供されるＶＨ又はＶＬ配列の変異体は、配列と比較して５、４、３、２、１、又は０の置換がある。実施形態では、本明細書で提供されるＶＨ又はＶＬ配列の変異体は、当該配列と比較して１０、９、８、７、６、５、４、３、２、又は１の置換がある。ある場合、置換の１又はそれ以上又は全てが保存的置換である。

表１：抗原結合ドメイン及び軽鎖及び重鎖可変領域の例示的配列

［０１０４］ある場合、配置は、ダイアボディ又は多量体等の多量体であってよい。ある場合、多量体は、軽鎖及び重鎖の可変領域をいわゆるダイアボディに交差対合することで形成される可能性がとても高い。ある場合、構築物のヒンジ部分は、完全欠失されるか、第１システインは保持されるか、セリン置換ではなくプロリン置換であるか、第１システインまで切断されるといった、複数の選択肢がありうる。ある場合、Ｆｃ部分を削除しうる。ある場合、安定なタンパク質や二量体化したタンパク質がこの目的に機能しうる。ある場合、ＣＡＲは、Ｆｃドメインの１つ、例えば、ヒト免疫グロブリン由来のＣＨ２又はＣＨ３ドメインのいずれかを含む。ある場合、ＣＡＲは、二量体化の改良のために修飾されたヒト免疫グロブリンのヒンジ、ＣＨ２及びＣＨ３領域を用いる。ある場合、免疫グロブリンのヒンジ部分だけが用いられる。ある場合、発現されると、抗原結合ドメインは、ＣＡＲの細胞膜への発現を指向するシグナルペプチドを含む。ある場合、シグナルペプチドが細胞の表面上にあると、ＣＡＲに存在しない。ある場合、シグナルペプチドは、抗原結合ドメインのＣＤＲを有する抗体からのシグナルペプチドと同一であるか、又は異なる。

［０１０５］ある場合、抗原結合ドメイン（例えば、ＣＡＲの部分であるｓｃＦｖ）の親和性（ＫＤ）は、ＣＤ６に対して比較的が、ＣＤ６に対しては特異的である。ある場合、親和性は、約１×１０^－４Ｍ～約１×１０^－６Ｍ、約１×１０^－８Ｍ～約１×１０^－７Ｍ、約１×１０^－８Ｍ～約１×１０^－６Ｍ、約１×１０^－９Ｍ～約１×１０^－７Ｍ、約１．５×１０^－８Ｍ～約１．５×１０^－７Ｍ、又は約１×１０^－７Ｍ、２×１０^－７Ｍ、３×１０^－７Ｍ、４×１０^－７Ｍ、５×１０^－７Ｍ、６×１０^－７Ｍ、７×１０^－７Ｍ、８×１０^－７Ｍ、９×１０^－７Ｍ、約１×１０^－８Ｍ、２×１０^－８Ｍ、３×１０^－８Ｍ、４×１０^－８Ｍ、５×１０^－８Ｍ、６×１０^－８Ｍ、７×１０^－８Ｍ、８×１０^－８Ｍ、又は９×１０^－８Ｍである。当業者は、抗体のＫＤを容易に検出しうる。非限定的な例では、親和性は、例えば、酵母表面ディスプレイにより検出されうる。当該アプローチは、候補タンパク質の産生、分泌、及び捕捉が介在する遺伝子型－表現型連鎖戦略である。候補タンパク質は、親和性及び安定性を含む複数の選択圧がある複数の戦略の組み合わせを用いて分類しうる。例えば、Feldhaus et al.(2003)Flow-cytometric isolation of human antibodies from a nonimmune Saccharomyces cerevisiae surface display library.Nature biotechnology.21:163-170;及びZorniak et al.(207)を参照されたい。酵母ディスプレイバイオパニングは、膠芽腫幹細胞様細胞を標的とするヒト抗体を同定する。Scientific Reports.7:15840はその全内容が各々参照により本明細書に援用される。
［０１０６］ある場合、ｓｃＦｖは、特定の配向（例えば、Ｎ末端からＣ末端へのＶ_Ｈ－Ｖ_Ｌ又はＶ_Ｌ－Ｖ_Ｈ）を有するように設計されうる。ある場合、ｓｃＦｖのＶ_ＨとＶ_ＬはＮ末端からＣ末端へＶ_Ｈ－Ｖ_Ｌと配向する。ある場合、ｓｃＦｖのＶ_ＨとＶ_Ｌは、Ｎ末端からＣ末端へＶ_Ｌ－Ｖ_Ｈと配向する。ある場合、発現されたタンパク質のＶ_Ｈ部分とＶ_Ｌ部分は、その配向に依存して立体配座がわずかに異なる。ある場合、Ｖ_ＨとＶ_Ｌの関係の配向によりリガンド（例えば、ＣＤ６）に対する親和性が異なる場合がある。ある場合、ある配向と他の配向との間の差次的な親和性は、１桁又はそれ以上である。

［０１０７］ある場合、ｓｃＦｖのＶ_Ｈ部分とＶ_Ｌ部分は直接隣接し、互いに隣接する。あるいは、ｓｃＦｖのＶ_Ｈ及びＶ_Ｌは、リンカー（例えば、可撓性リンカー）により分離されてよい。ある場合、リンカーはポリペプチドリンカーである。ある場合、ポリペプチドリンカーは可撓性リンカーである。ある場合、ｓｃＦｖのＶ_Ｈ及びＶ_Ｌ（いずれかの配向）は、大きさが異なり、例えば、１８アミノ酸、１９アミノ酸、又は２０アミノ酸を有する可撓性リンカーを介して融合され得；ｓｃＦｖのＶ_Ｈ及びＶ_Ｌが天然型に折りたたまれ、抗原結合特性が保存されうる。ある場合、リンカーはグリシン及び／又はセリン残基を含む。ある場合、リンカーのアミノ酸配列は、ＧＳＴＳＧＧＧＳＧＧＧＳＧＧＧＧＳＳ（配列番号３６）である。ある場合、リンカーのアミノ酸配列は、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）である。ある場合、リンカーは約１８アミノ酸長である。ある場合、リンカーは１８アミノ酸長である。ある場合、リンカーは約１９アミノ酸長である。ある場合、リンカーは１９個のアミノ酸長である。ある場合、リンカーは約２０アミノ酸長である。ある場合、リンカーは２０個のアミノ酸長である。ある場合、リンカー配列は、発現されたｓｃＦｖが天然型に折りたたまれうるのに十分な長さである。ある場合、リンカー配列は、発現されたｓｃＦｖがその抗原結合特性を維持するのに十分な長さである。タンパク質の折り畳みを評価する技術としては、ＮＭＲ、Ｘ線結晶学、円偏光二色性、蛍光分光法、二重偏光干渉法、及び当業界で周知の他の技術があげられるが、これらに限定されない。抗原結合挙動を評価する技術としては、共鳴（ＳＰＲ）上の表面プラスム、様々なリガンド結合アッセイ、及び当技術分野で周知の他の技術があげられるが、これらに限定されない。

［０１０８］ある場合、その実施形態を含む本明細書中に提供される組換えタンパク質は、さらに、ＣＡＲのさらなる成分を含んでよい。当該付加的な成分を含むＣＡＲ、及び当該ＣＡＲを発現する細胞も含まれる。

［０１０９］ある場合、その実施形態を含む本明細書に提供される（例えば、単離された、又は細胞の表面上で発現された）組換えタンパク質（ＣＡＲ等）は、さらに、その実施形態を含む本明細書に記載されるような膜貫通ドメイン、その実施形態を含む本明細書に記載されるようなヒンジ領域、実施形態を含む本明細書に記載されるような細胞内シグナル伝達ドメイン（Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン等）、及び／又は実施形態を含む本明細書に記載されるような共刺激ドメインを含んでよい。

［０１１０］ある場合、本明細書に提供されるｓｃＦｖは、膜貫通ドメインに直接連結（例えば、共有結合）されてもよく、又はヒンジ領域を介して膜貫通ドメインに連結（例えば、共有結合）されてよい。

［０１１１］本明細書で提供される「ヒンジ領域」は、抗原結合部位ドメイン（すなわち、ｓｃＦｖ）を膜貫通ドメインに連結するポリペプチドである。ｓｃＦｖを膜貫通ドメインに接続しうるいかなるヒンジ領域が、本明細書中で意図される。ある場合、ヒンジ領域はポリペプチドヒンジ領域である。ある場合、ポリペプチドのヒンジ領域は可撓性ヒンジ領域である。ある場合、ヒンジ領域はグリシン及び／又はセリン残基を含む。ある場合、ヒンジ領域は、抗体ヒンジ領域又はその部分であるか、又はそれらを含む。ある場合、ヒンジ領域は、抗体Ｆｃドメイン又はその部分（例えば、ヒンジ領域を含む部分）を含む。本明細書で意図される適当なヒンジ領域の非限定的な例としては、ＩｇＧ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ＩｇＧ４ Ｆｃ、及びヒトＩｇＧ４ Ｆｃ、又はその部分（すなわち、ヒンジ領域を含むその部分）があげられる。ある場合、ヒンジ領域は、ＩｇＧ Ｆｃ又はその部分である。ある場合、ヒンジ領域は、ヒトＩｇＧ Ｆｃ又はその部分である。ある場合、ヒンジ領域は、ＩｇＧ１ Ｆｃ又はその部分である。ある場合、ヒンジ領域はヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、又はその部分である。ある場合、ヒンジ領域は、ＩｇＧ４ Ｆｃ又はその部分である。ある場合、ヒンジ領域はヒトＩｇＧ４ Ｆｃ、又はその部分である。ある場合、ＩｇＧ Ｆｃヒンジを用いて、結合部位ドメインをＣＡＲ骨格に連結する。ある場合、ＩｇＧ１又はＩｇＧ４ヒトＦｃ、又はヒンジ領域を含むその部分には、１又はそれ以上の変異を含み、対応するＦｃ受容体への結合を低減又は妨げる。ある場合、ＩｇＧ１又はＩｇＧ４ヒトＦｃ、又はヒンジ領域を含むその部分には、対応するＦｃ受容体への結合を低減又は妨げる変異は含まれない。ある場合、Ｆｃドメインの部分の長さは、２２９アミノ酸、１２９アミノ酸、又はそれ未満でありうる。

［０１１２］ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２９アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２２９アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１２９アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは１２９アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１２９～約２２９アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２９アミノ酸未満である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２２９アミノ酸未満である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１２９アミノ酸未満である。ある場合、ヒンジ領域の長さは１２９アミノ酸未満である。ある場合、ヒンジ領域の長さは少なくとも２２アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２２アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２５、５０、７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２２５、又は２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約７５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１００アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１７５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２００アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは７５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは１００アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは１２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは１５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは１７５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２００アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは２５０アミノ酸である。

［０１１３］ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２５～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約５０～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約７５～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１００～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１２５～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１５０～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約１７５～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２００～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２５～約２５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約２２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約２００アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約１７５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約１５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約１２５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約１００アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約７５アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約５０アミノ酸である。ある場合、ヒンジ領域の長さは約２２～約２５アミノ酸である。

［０１１４］ある場合、ヒンジ領域は、Ｆｃドメインを含む。ある場合、ヒンジ領域は、ＩｇＧ Ｆｃドメインを含む。ある場合、ヒンジ領域は、ＩｇＧ１ Ｆｃ又はその断片である。ある場合、ヒンジ領域は、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ又はその断片である。ある場合、ヒンジ領域は、ＩｇＧ４ Ｆｃ又はその断片である。ある場合、ヒンジ領域はヒトＩｇＧ４ Ｆｃ又はその断片である。

［０１１５］ある場合、ヒンジ領域は、変異したヒンジ領域であってよい。ある場合、変異したヒンジ領域（例えば、Ｆｃ）は、例えば、Ｆｃのその同族Ｆｃ受容体への結合阻害に有用でありうる。ある場合、ヒンジ領域（例えば、ＩｇＧ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ、ＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ＩｇＧ４ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃ）は、５、４、３、２、又は１個以下の欠失を含む。ある場合、ヒンジ領域（例えば、ＩｇＧ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ、ＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ＩｇＧ４ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃ）は、５、４、３、２、又は１個以下の挿入を含む。ある場合、ヒンジ領域（例えば、ＩｇＧ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ、ＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ＩｇＧ４ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃ）には欠失がない。ある場合、ヒンジ領域（例えば、ＩｇＧ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ、ＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ＩｇＧ４ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃ）には挿入がない。ある場合、ヒンジ領域（例えば、ＩｇＧ、ヒトＩｇＧ Ｆｃ、ＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ＩｇＧ４ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃ）は、保存的置換である置換を含む。

［０１１６］ある場合、本明細書中に提供される膜貫通ドメインは、生物膜（例えば、スパニング）の部分を形成するポリペプチドをいう。ある場合、本明細書中に提供される膜貫通ドメインは、生体膜（例えば、細胞膜）を膜の一方の側から膜の他方の側へ拡張しうる。ある場合、膜貫通ドメインは膜の部分にのみ及ばないが、抗原結合ドメインの膜への固定には十分である。ある場合、膜貫通ドメインは細胞膜の細胞内側から細胞外側に及ぶ。ある場合、膜貫通ドメインは、生物学的膜（例えば、Ｔ細胞の細胞膜）中の、その実施形態を含む本明細書で提供されるタンパク質を固定する非極性の疎水性残基を含んでよい。その実施形態を含む本明細書で提供されるタンパク質を固定しうるいかなる膜貫通ドメインが考えられる。膜貫通ドメインの非限定的な例としては、ＣＤ２８、ＣＤ８、ＣＤ４、又はＣＤ３－ゼータ（ＣＤ３ζ）の膜貫通ドメインがあげられる。

［０１１７］ある場合、膜貫通ドメインとしては、ＣＤ４膜貫通ドメイン若しくはその変異体、ＣＤ８膜貫通ドメイン若しくはその変異体、ＣＤ２８膜貫通ドメイン若しくはその変異体、又はＣＤ３ζ膜貫通ドメイン若しくはその変異体があげられる。ある場合、ＣＡＲ（例えば、ＣＡＲを発現する細胞）のような組換えタンパク質としては、細胞内の共刺激ドメイン及び／又は細胞内のＴ細胞シグナル伝達ドメインがあげられる。

［０１１８］ある場合、膜貫通ドメインとしては、ＣＤ４膜貫通ドメイン又はその変異体があげられる。ある場合、膜貫通ドメインとしては、ＣＤ８膜貫通ドメイン又はその変異体があげられる。ある場合、膜貫通ドメインとしては、ＣＤ２８膜貫通ドメイン又はその変異体があげられる。ある場合、膜貫通ドメインとしては、ＣＤ３ζ膜貫通ドメイン又はその変異体があげられる。

［０１１９］ある場合、膜貫通ドメインは、ｓｃＦｖの重鎖可変領域に共有結合する。ある場合、膜貫通ドメインはｓｃＦｖの軽鎖可変領域に共有結合する。ある場合、膜貫通ドメインは、ヒンジ領域を介して、ｓｃＦｖの重鎖可変領域に共有結合的に結合する。ある場合、膜貫通ドメインは、ヒンジ領域を介してｓｃＦｖの軽鎖可変領域に共有結合する。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、Ｖ_Ｌ、及び膜貫通ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、Ｖ_Ｈ、及び膜貫通ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、リンカー、Ｖ_Ｌ、及び膜貫通ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、リンカー、Ｖ_Ｈ、及び膜貫通ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、リンカー、Ｖ_Ｌ、ヒンジ領域、及び膜貫通ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、リンカー、Ｖ_Ｈ、ヒンジ領域、及び膜貫通ドメインを含む。本段落で言及するＶＨ、ＶＬ、リンカー、ヒンジ領域、及び膜貫通ドメインは、その実施形態を含む本明細書に開示されたものをいう。

［０１２０］ある場合、抗原結合ドメイン（例えば、ｓｃＦｖ）は、イトリズマブのＣＤＲ配列を含む。ある場合、ＣＤＲは、配列番号２８、２９、３０、３１、３２、及び３３で表されるアミノ酸配列を含む。ある場合、ＣＤＲは、配列番号２８、２９、３０、３１、３２、及び３３で表されるアミノ酸配列である。ある場合、ＣＤＲはＣＤ６と特異的に結合する。ある場合、ＣＤＲは約１×１０^－６～１×１０^－８の間の親和性でＣＤ６と特異的に結合する。ある場合、ＣＤＲは、約１×１０^－６又は１×１０^－７以下の親和性でＣＤ６と特異的に結合する。

［０１２１］本明細書中に提供される「細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン」、「共刺激シグナル伝達ドメイン」又は「細胞内共刺激ドメイン」は、その実施形態を含む本明細書中に提供される組換えタンパク質（例えばＣＡＲ）の抗原結合ドメインへの抗原の結合に応答して共刺激シグナル伝達を提供しうるアミノ酸配列を包含する。ある場合、共刺激シグナル伝達ドメインのシグナル伝達は、サイトカインの産生及び組換えタンパク質（例えば、ＣＡＲ）を発現する細胞（例えば、Ｔ細胞）の増殖をもたらす。

［０１２２］ある場合、共刺激ドメインは、ＣＤ２８細胞内共刺激ドメイン若しくはその変異体、４－１ＢＢ細胞内共刺激ドメイン若しくはその変異体、ＩＣＯＳ細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体、ＯＸ－４０細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体、ＣＴＬＡ－４細胞内共刺激ドメイン若しくはその変異体、ＰＤ－１細胞内共刺激ドメイン若しくはその変異体、又はＧＩＴＲ共刺激ドメイン若しくはその変異体である。ある場合、共刺激ドメインは、ＣＤ２８細胞内共刺激ドメイン（配列番号７又は８）又はその変異体である。ある場合、４－１ＢＢ細胞内共刺激ドメイン（配列番号１４）又はその変異体である。ある場合、共刺激ドメインは、ＩＣＯＳ細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン又はその変異体である。ある場合、共刺激ドメインは、ＯＸ－４０細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン又はその変異体である。ある場合、共刺激ドメインは、ＣＴＬＡ－４細胞内共刺激ドメイン（配列番号１７）又はその変異体である。ある場合、共刺激ドメインは、ＰＤ－１細胞内共刺激ドメイン又はその変異体である。ある場合、共刺激ドメインは、ＧＩＴＲ共刺激ドメイン又はその変異体である。

［０１２３］ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、Ｖ_Ｌ、膜貫通ドメイン、及び共刺激ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、Ｖ_Ｈ、膜貫通ドメイン、及び共刺激ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、リンカー、Ｖ_Ｌ、膜貫通ドメイン、及び共刺激ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、リンカー、Ｖ_Ｈ、膜貫通ドメイン、及び共刺激ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、リンカー、Ｖ_Ｌ、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、及び共刺激ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、リンカー、Ｖ_Ｈ、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、及び共刺激ドメインを含む。ＶＨ、ＶＬ、リンカー、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、及び本段落で言及する共刺激ドメインは、その実施形態を含む、本明細書に開示されたものをいう。

［０１２４］本明細書で提供される「細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン」は、その実施形態を含む本明細書で提供される組換えタンパク質（例えば、ＣＡＲ）の抗原結合ドメインへの抗原の結合に応答して一次シグナル伝達を提供しうる、その実施形態を含む本明細書で提供されるアミノ酸配列を含む。ある場合、細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインのシグナル伝達により、同じＴ細胞を発現するＴ細胞が活性化される。ある場合、細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインのシグナル伝達により、組換えタンパク質（例えば、ＣＡＲ）を発現する細胞（例えば、Ｔ細胞）が増殖（細胞分裂）される。ある場合、細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインのシグナル伝達により、活性化Ｔ細胞の特徴として当該分野で公知のタンパク質（例えば、ＣＴＬＡ－４、ＰＤ－１、ＣＤ２８、ＣＤ６９）がＴ細胞により発現される。

［０１２５］ある場合、細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインはＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインである。

［０１２６］ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、Ｖ_Ｌ、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、Ｖ_Ｈ、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、リンカー、Ｖ_Ｌ、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、リンカー、Ｖ_Ｈ、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｈ、リンカー、Ｖ_Ｌ、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む。ある場合、本明細書で提供される組換えタンパク質（ＣＡＲ等、例えば、細胞の表面上の）は、Ｎ末端からＣ末端まで、Ｖ_Ｌ、リンカー、Ｖ_Ｈ、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む。ＶＨ、ＶＬ、リンカー、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及び本段落で言及される細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、本明細書に開示されるものをいい、その実施形態を含む。

［０１２７］ある場合、Ｔリンパ球は調節性Ｔリンパ球（Ｔｒｅｇ）である。エフェクターＴ細胞のカテゴリーは広く、共刺激等の刺激に積極的に反応する様々なＴ細胞を含む。エフェクターＴ細胞には、ヘルパーＴ細胞、キラーＴ細胞、調節性Ｔ細胞、その他のＴ細胞がある。調節性Ｔ細胞は、以前はサプレッサーＴ細胞として知られていたが、免疫系を調節し、自己抗原に対する寛容を維持し、自己免疫疾患を予防するＴ細胞の亜集団である。Ｔｒｅｇは免疫抑制性であり、一般にエフェクターＴ細胞の誘導及び増殖を抑制又は下方制御する。ある場合、エフェクターＴリンパ球はヘルパーＴ細胞である。ある場合、エフェクターＴリンパ球はキラーＴ細胞である。ある場合、エフェクターＴリンパ球はＴｒｅｇである。

［０１２８］ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４ｐｏｓｉｔｉｖｅＣＤ２５ｈｉｇｈ発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ＣＤ２５ｈｉｇｈ－ＣＤ１２７ｌｏｗ又はｎｅｇａｔｉｖｅの発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ＣＤ２５ｈｉｇｈ－ＣＤ６ｌｏｗ又はｎｅｇａｔｉｖｅの発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ＣＤ２５ｈｉｇｈ－ＣＤ１２７ｌｏｗ又はｎｅｇａｔｉｖｅ－ＣＤ６ｌｏｗ又はｎｅｇａｔｉｖｅの発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ３ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ＣＤ６ｌｏｗ又はｎｅｇａｔｉｖｅの発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ＣＤ６ｌｏｗ又はｎｅｇａｔｉｖｅの発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ８ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ＣＤ２８ｌｏｗ発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４５ＲＡ＋発現を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＣＤ４５ＲＡ＋発現を含まないＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＦＯＸＰ３の脱メチル化を含むＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＦＯＸＰ３の脱メチル化を含まないＴｒｅｇである。ある場合、ＩＬ－２及び／又はラパマイシン及び／又はレチノイン酸で拡張されうるＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇは、ＩＬ－２及び／又はラパマイシン及び／又はレチノイン酸で拡張されうるＴｒｅｇである。ある場合、ＴｒｅｇはＩＬ－２で拡張されうるＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇはラパマイシンで拡張されうるＴｒｅｇである。ある場合、Ｔｒｅｇはレチノイン酸で拡張されうるＴｒｅｇである。

［０１２９］「ｈｉｇｈ（高い）」及び「ｌｏｗ（低い）」発現の決定は、当業界で周知である。上記マーカーの高発現及び低発現、並びに高発現及び低発現の決定及び定量の説明は、例えば、以下の：

といった全内容は各々、全体として、かつ、あらゆる目的のために、参照により本明細書に援用される文献に記載がある。

［０１３０］ある場合、ｓｃＦｖ（例えば、ＣＡＲ）は、配列番号３４で表される軽鎖可変領域を含む。ある場合、ｓｃＦｖは、配列番号３５で表される重鎖可変領域を含む。ある場合、ｓｃＦｖは配列番号３８で表される配列配列を含む。ある場合、ｓｃＦｖは配列番号３９で表される配列配列を含む。

［０１３１］ある場合、ｓｃＦｖ（例えば、ＣＡＲ）は、Ｎ末端に軽鎖可変領域の次に重鎖可変領域が配向される。あるいは、ある場合、ｓｃＦｖは、Ｎ末端に重鎖可変領域の次に軽鎖可変領域が配向される。

［０１３２］ある場合、ｓｃＦｖの軽鎖可変領域（ＶＬ）及び重鎖可変領域（ＶＨ）は、リンカーにより分離される。ある場合、リンカーは配列番号３６で表される配列配列を含む。ある場合、リンカーは配列番号３７で表される配列配列を含む。

［０１３３］ある場合、ｓｃＦｖアミノ酸配列は配列番号３８で表される配列配列を含む。ある場合、ｓｃＦｖアミノ酸配列は配列番号３９で表される配列配列を含む。ある場合、ｓｃＦｖアミノ酸配列は、配列番号４０で表される配列配列を含む。ある場合、ｓｃＦｖアミノ酸配列は配列番号４１で表される配列配列を含む。

［０１３４］ある場合、軽鎖可変領域は、ヒンジ領域を介して膜貫通領域に共有結合する。ある場合、重鎖可変領域は、ヒンジ領域を介して膜貫通領域に共有結合する。

［０１３５］ある場合、ヒンジ領域は、ヒトＩｇＧ Ｆｃである。ある場合、ヒトＩｇＧ Ｆｃは、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃである。ある場合、ヒトＩｇＧ Ｆｃは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃである。

［０１３６］ある場合、共刺激ドメインは、ＣＤ２８細胞内共刺激ドメイン若しくはその変異体、４－１ＢＢ細胞内共刺激ドメイン若しくはその変異体、ＩＣＯＳ細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体、ＯＸ－４０細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体、ＣＴＬＡ－４細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体、ＰＤ－１細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体、又はＧＩＴＲ細胞内共刺激シグナル伝達ドメイン若しくはその変異体である。

［０１３７］ある場合、細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインはＣＤ３ζ細胞内Ｔ細胞シグナル伝達ドメインである。

［０１３８］ある場合、ｓｃＦｖは、配列番号２８、２９、３０、３１、３２、及び３３で表されるＣＤＲ配列を含む。

［０１３９］一態様では、その実施形態を含む本明細書に記載の組換えタンパク質を含むＴリンパ球が提供される。ある場合、Ｔリンパ球は、その実施態様を含む本明細書に記載される調節性Ｔリンパ球である。ＣＡＲ Ｔ細胞は、当技術分野で周知の方法を用いて産生されうる。例えば、被験体（例えば、患者）又はドナー（例えば、健康な被験体）から単離されたＴリンパ球を、ＣＡＲをコードする核酸で形質導入しうる。ＣＡＲをコードする核酸の導入は、記載されるように、ウイルス又は非ウイルス方法により達成しうる。ドナーから得られたＴリンパ球（すなわち、同種異系Ｔリンパ球）は、免疫原性タンパク質（例えば、天然Ｔ細胞受容体）を除去するために、当該技術分野で周知の遺伝子編集技術（例えば、ＣＲＩＳＰＲ）を用いて遺伝子編集を行いうることを認識されたい。形質導入の後、Ｔリンパ球は、例えば、人工抗原提示細胞（ＡＰＣ；例えば、操作された細胞系又は抗体コートされた磁性ビーズ）を用いて活性化されうる。いったん活性化されると、Ｔリンパ球は、例えばサイトカインの特異的な混合物等で処理することにより、特殊なＴ細胞サブタイプ（例えば、Ｔ調節細胞）に分化するよう誘導されうる。最後に、ＣＡＲ Ｔ細胞集団は、当技術分野で周知の技術を用いて拡張しうる。

［０１４０］ある場合、その実施形態を含む本明細書に記載された組換えタンパク質を含むＴリンパ球は、自己Ｔリンパ球（すなわち、被験体から採取されたもの）である。ある場合、その実施形態を含む本明細書に記載された組換えタンパク質を含むＴリンパ球は、同種異系Ｔリンパ球（すなわち、被験体から得られたのではないＴリンパ球）である。ある場合、同種Ｔリンパ球は、遺伝子編集処理される。ある場合、同種Ｔリンパ球は、未処理のＴ細胞受容体タンパク質の発現を排除するように遺伝子編集される。

［０１４１］ある態様では、ＣＤ６に標的化された一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）及び膜貫通ドメインを含むタンパク質（例えば、ＣＡＲ）をコードする単離された核酸が提供される。

［０１４２］ある態様では、その実施形態を含む本明細書で提供される核酸（例えば、単離された核酸）を含むベクターが提供される。ある場合、ベクターは、単離された核酸を含み、単離された核酸を細胞内に送達するのに用いうる物質の組成物である。線状ポリヌクレオチド、イオン性又は両親媒性化合物と会合したポリヌクレオチド、プラスミド、及びウイルスを含むが、これらに限定されない多数のベクターが当技術分野で公知である。ある場合、ベクターは自己複製するプラスミド又はウイルスである。ある場合、細胞への核酸の移動を容易にする化合物、例えば、ポリリジン化合物、リポソーム等が用いられる。ウイルス移送ベクターの例としては、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター等があげられるが、これらに限定されない。ある場合、ベクターはプラスミドである。ある場合、ベクターは染色体外のものである。ある場合、ベクターは細胞のゲノムに組み込まれる。ある場合、ベクターはウイルスベクターである。ある場合、ウイルスはレンチウイルスやオンコレトロウイルスである。ある場合、ウイルスはレンチウイルスである。ある場合、ウイルスはオンコレトロウイルスである。本明細書で提供される核酸（例えば、単離された核酸）を含むベクターの細胞への送達用のいずれかの適当なウイルスが意図される場合、ベクターは、発現されるヌクレオチド配列に機能的に連結された発現制御配列を含む組換えポリヌクレオチドを含む。用語「レンチウイルス」は、レトロウイルス科の属をいう。レンチウイルスは、非分裂細胞に感染できる点でレトロウイルスの中でもユニークであり、宿主細胞のＤＮＡに大量の遺伝情報を送達しうるので、遺伝子送達ベクターの最も効率的な方法の１つである。ＨＩＶ、ＳＩＶ、及びＦＩＶは全て、レンチウイルスの例である。用語「レンチウイルスベクター」は、レンチウイルスゲノムの少なくとも部分に由来するベクターをいい、特に、Milone et al.,Mol.Ther.17(8):1453-1464(2009)により提供される自己不活化レンチウイルスベクターを含む。臨床で用いられうるレンチウイルスベクターの他の例としては、例えば、Ｏｘｆｏｒｄ ＢｉｏＭｅｄｉｃａ製ＬＥＮＴＩＶＥＣＴＯＲ（登録商標）遺伝子送達技術、レンチゲン製ＬＥＮＴＩＭＡＸ（商標）ベクターシステム等があげられるが、これらに限定されない。非臨床系レンチウイルスベクターも利用可能であり、かつ、それらは当業者には公知であろう。

［０１４３］一態様では、本明細書で提供されるベクターを含むＴリンパ球が提供され、その実施形態を含む。

処置方法
［０１４４］その実施形態を含む本明細書で提供される組成物は、自己免疫疾患の有効な治療として企図される。すなわち、ある態様では、自己免疫疾患（例えば、Ｉ型糖尿病、移植片対宿主病、ループス）を治療する方法が提供され、その方法は、その実施形態を含む本明細書において提供される有効量のＴリンパ球（例えば、ＣＡＲＴ細胞）を、それを必要とする被験体に投与することを含む。

［０１４５］ある場合、自己免疫疾患は、膵島細胞（例えば、ベータ細胞）の機能、生存能、又は生存の低下と関連する。ある場合、自己免疫疾患はＩ型糖尿病である。ある場合、自己免疫疾患は移植片対宿主病である。ある場合、自己免疫疾患は、被験体の膵島細胞（例えば、ベータ細胞）を攻撃する被験体の免疫系を含む。

［０１４６］ある場合、その実施形態を含む本明細書中に提供されるＴ－リンパ球は、ＣＤ６＋ Ｔ－リンパ球を抑制する。ある場合、その実施形態を含む本明細書中に提供されるＴリンパ球は、ＣＤ６＋ Ｂリンパ球を抑制する。
〔実施例〕
［０１４７］以下の実施例は、本開示の特定の実施形態をさらに例示することを意図する。当該実施例は、当業者に提供するように示され、その範囲を限定することを意図するものではない。

ＴＲＥＧで発現されるＣＤ６を標的とするＣＡＲ
［０１４８］イトリズマブから誘導されたｓｃＦｖを含む様々なＣＡＲを図１～図４に示す。各々は、ＶＬ又はＶＨ配向のｓｃＦｖに加えて、特定の変異を有するＩｇＧ４の部分に由来するスペーサー、ＣＤ４膜貫通ドメイン、ＣＴＬＡ４又は４－１ＢＢシグナル伝達ドメイン、及びＣＤ３ゼータシグナル伝達ドメインを含む。酵母表面ディスプレイ技術により、すでに、ＶＨ－ＶＬ ｓｃＦｖのヒトＣＤ６に対する親和性は、イトリズマブのヒトＣＤ６に対する親和性に類似するが、ＶＬ－ＶＨ ｓｃＦｖはヒトＣＤ６に対する親和性は低いことが示唆されるため（Garner et al.(2018)Immunology155:273）、ＶＨ－ＶＬ又はＶＬ－ＶＨ配向のｓｃＦｖを用いてＣＡＲを調製した。図５は、ＣＤ６^{ｌｏｗ／－}であるＴｒｅｇｓ及びＴｒｅｇｓの単離に用いられる方法の概略図である。Ｔｒｅｇは、いかなる適当な方法を用いて単離しうる（Fuchs et al.(2018)Front Immunol.8:1844;Duggleby et al.)2018)Front Immunol. 9:252）。Ｔｒｅｇの比較、ＣＤ６ ＣＡＲ（ＣＴＬＡ４）及びＣＤ６ ＣＡＲ（４－１ＢＢ）を発現するＴｒｅｇ、は、ＣＴＬＡ４シグナル伝達ドメインを有するＣＤ６ ＣＡＲが、Ｔｅｆｆ（ＣＤ４＋）増殖を低下させるのに優れていることを示す（図６）。さらに、ＣＴＬＡ４シグナル伝達ドメインを有するＣＤ６ ＣＡＲは、標的Ｔｅｆｆ増殖を低下させるのに優れる（図７）。ＣＤ６を発現するＴｒｅｇは抗炎症性サイトカインを誘導した（図８）。図１０に示すように、ＣＴＬＡ４シグナル伝達ドメインを有するＣＤ６ ＣＡＲを発現するＴｒｅｇは、Ｔｅｆｆの存在下で培養することができ、比較的低いレベルの枯渇マーカーを発現する。

ＣＤ６－標的化ＣＡＲの発現
［０１９６］ＣＤ６標的ＣＡＲはレンチウイルスベクターを用いてＴｒｅｇｓで発現させることができる。適当なレンチウイルスベクターは、国際公開第２０１６／０４４８１１号に記載される。ＣＡＲを発現するヌクレオチド配列は、Ｔ２Ａをコードする配列（ＬＥＧＧＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰＲ；配列番号７１）及び切断されたＣＤ１９受容体であって、以下の配列番号７３：

をコードする配列を有するフレーム内でありうる。このようにして発現させると、ＣＡＲは切断されたＣＤ１９と協調発現される。これにより、容易に入手可能なＣＤ１９抗体を用いたＣＡＲ発現細胞の定量化が容易になる。

［０１９７］図１０は、図１～４に示される構築物のいずれかにおいてｓｃＦｖを置換しうる他のＣＤ６ ｓｃＦｖのアミノ酸配列を示す。

非公式部分配列リスト

Claims (10)

1. 配列番号８３～９０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むキメラ抗原受容体をコードする、単離された核酸。
2. 配列番号８３～９０からなる群から選択されるアミノ酸配列からなるキメラ抗原受容体をコードする、請求項１に記載の単離された核酸。
3. 請求項１又は２に記載の核酸を含む、ベクター。
4. ベクターは、ウイルスベクターである、請求項３に記載のベクター。
5. 請求項３に記載のベクター、又は、請求項１に記載の核酸を含む、調節性Ｔ細胞。
6. 自己免疫疾患の治療に用いるための、有効量の請求項５に記載の調節性Ｔ細胞を含む、医薬組成物。
7. 調節性Ｔ細胞は、自己調節性Ｔ細胞又は同種調節性Ｔ細胞である、請求項６に記載の医薬組成物。
8. 自己免疫疾患は、Ｉ型糖尿病である、請求項６に記載の医薬組成物。
9. 自己免疫疾患は、移植片対宿主病である、請求項６に記載の医薬組成物。
10. 請求項３に記載のベクター、又は、請求項１に記載の核酸を含む、調節性Ｔ細胞の集団。

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