JP7335643B2 - メタン酸化活性を有する新規な酵素ナノ粒子 - Google Patents
メタン酸化活性を有する新規な酵素ナノ粒子 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7335643B2 JP7335643B2 JP2021558597A JP2021558597A JP7335643B2 JP 7335643 B2 JP7335643 B2 JP 7335643B2 JP 2021558597 A JP2021558597 A JP 2021558597A JP 2021558597 A JP2021558597 A JP 2021558597A JP 7335643 B2 JP7335643 B2 JP 7335643B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- protein
- active site
- nanoparticles
- nucleic acid
- acid encoding
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
- C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/96—Stabilising an enzyme by forming an adduct or a composition; Forming enzyme conjugates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y114/00—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
- C12Y114/13—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14) with NADH or NADPH as one donor, and incorporation of one atom of oxygen (1.14.13)
- C12Y114/13025—Methane monooxygenase (1.14.13.25)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/79—Transferrins, e.g. lactoferrins, ovotransferrins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N11/00—Carrier-bound or immobilised enzymes; Carrier-bound or immobilised microbial cells; Preparation thereof
- C12N11/02—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N11/00—Carrier-bound or immobilised enzymes; Carrier-bound or immobilised microbial cells; Preparation thereof
- C12N11/02—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier
- C12N11/04—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier entrapped within the carrier, e.g. gel or hollow fibres
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0071—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0071—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
- C12N9/0073—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14) with NADH or NADPH as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 1.14.13
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y114/00—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
- C12Y114/18—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14) with another compound as one donor, and incorporation of one atom of oxygen (1.14.18)
- C12Y114/18003—Methane monooxygenase (particulate) (1.14.18.3)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/20—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Description
以下、実施例を用いて本発明をより詳細に説明する。これらの実施例は単に本発明を例示するためのもので、本発明の範囲がこれら実施例によって制限されるものと解釈されないことは、当業界で通常の知識を有する者にとって自明なことである。
下記表1に示すベクターの模式図に基づいて、PCRによってpmoB12、ferritin-pmoB1、pMMO-mimics(pMMO-m1~pMMO-m4)、site-A mutant of pMMO-m3(pMMO-m3のサイト-Aミュータント)、site-B mutant of pMMO-m3(pMMO-m3のサイト-Bミュータント)、pmoB-free huHF particles with His6(His6を有するpmoB-フリーhuHF粒子)、pmoB-free huHF particles without His6(His6を有さないpmoB-フリーhuHF粒子)を作製した。作製されたすべてのプラスミド発現ベクターは、アガロースゲルで精製した後、完全なDNAシークエンシングによって配列を確認した。
大腸菌菌株BL21(DE3)[F-ompThsdSB(rB-mB-)]を、前記作製された発現ベクターでそれぞれ形質転換した。特に、pMMO-m2、pMMO-m3、site-A mutant of pMMO-m3、site-B mutant of pMMO-m3、pMMO-m4は大腸菌菌株BL21に2つの発現ベクターを同時に形質転換し、アンピシリンとカナマイシンに抵抗性を有する形質転換体を選択した。形質転換された大腸菌を50mLのルリア-ベルターニ(Luria-Bertani(LB))培地(100mg L-1のアンピシリンと100mg L-1のカナマイシン、0.2mM CuSO4を含有)を含有するフラスコ(250mL三角フラスコ(Erlenmeyer flasks)、37℃、150rpm)で培養した。それを除いた残りのタンパク質ナノ粒子(ferritin-pmoB1、pMMO-m1、pmoB-free huHF particles with His6、pmoB-free huHF particles without His6)は、アンピシリンに抵抗性を有する形質転換体を選択した。形質転換された大腸菌を50mLのLuria-Bertani(LB)培地(100mg L-1のアンピシリン、0.2mM CuSO4を含有)を含有するフラスコ(250mL Erlenmeyer flasks、37℃、150rpm)で培養した(図2)。培地の濁度(O.D.600)が約0.6に達したとき、IPTG(Isopropyl-β-D-thiogalactopyranosid)(1mM)を添加して、遺伝子の発現を誘導した。20℃で14時間培養した後、培養した大腸菌を5,000rpmで5分間遠心分離して菌体沈殿物を回収した後、5mLの破砕溶液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、10mM イミダゾール(imidazole)、0.2mM CuSO4、pH8.0)に懸濁し、超音波破砕機(Branson Ultrasonics Corp.,Danbury、CT、USA)を用いて破砕した。破砕した後、13,000rpmで10分間遠心分離した後、上澄み液と不溶性凝集体を分離した。分離された上澄み液を先に組換えタンパク質に融合発現されたヒスチジンとニッケルの結合を用いたNi2+-NTAアフィニティー・クロマトグラフィーを行った後、組換えタンパク質を濃縮し、バッファー交換を行って、精製された組換えタンパク質を得ることができた。各ステップの詳細は以下の通りである。
組換えタンパク質を精製するために、前述の方法と同様の方法で培養された大腸菌を回収し、その細胞ペレットを5mLの破砕溶液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、10mM イミダゾール、0.2mM CuSO4、pH8.0)に再浮遊し、超音波破砕機を用いて細胞を破砕した。破砕された細胞液を13,000rpmで10分間遠心分離し、その上澄み液のみを分離した後、各組換えタンパク質をNi2+-NTAカラム(Quiagen、Hilden、Germany)を用いてそれぞれ分離した(洗浄バッファー:50mM NaH2PO4、300mM NaCl、10mM イミダゾール、pH8.0/溶出バッファー:50mM NaH2PO4、300mM NaCl、250mM イミダゾール、pH8.0)。
Ni2+-NTAアフィニティー・クロマトグラフィーを経て溶出された2mLの組換えタンパク質を超遠心分離器のフィルター(ultracentrifugal filter(Amicon Ultra 100K、Millipore、Billerica、MA))に投入し、カラムの上に1mlの溶液が残るまで5,000rpmで遠心分離を行った。その後、トリス(Tris)バッファー(20mM Tris-HCl、250mM NaCl、pH8.0)でバッファー交換を行った。
大腸菌菌株BL21(DE3)[F-ompThsdSB(rB-mB-)]を前記作製された発現ベクターでそれぞれ形質転換し、アンピシリンに抵抗性を有する形質転換体を選択した。形質転換された大腸菌を50mLのLuria-Bertani(LB)培地(100mg L-1のアンピシリンを含有)を含有するフラスコ(250mL Erlenmeyer flasks、37℃、150rpm)で培養した。培地の濁度(O.D.600)が約0.6に達したとき、IPTG(Isopropyl-β-D-thiogalactopyranosid)(1mM)を添加して遺伝子の発現を誘導した。37℃で6時間培養した後、培養した大腸菌を5,000rpmで5分間遠心分離して菌体沈殿物を回収した後、5mLの破砕溶液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、10mM イミダゾール、0.2mM CuSO4、pH8.0)に懸濁し、超音波破砕機(Branson Ultrasonics Corp.,Danbury、CT、USA)を用いて破砕した。破砕後、13,000rpmで10分間遠心分離した後、上澄み液と不溶性凝集体を分離した。分離された不溶性凝集体を先に組換えタンパク質に融合発現されたヒスチジンとニッケルの結合を用いたNi2+-NTAアフィニティー・クロマトグラフィーを行った後、組換えタンパク質を透析によってリフォールディングした。リフォールディングされた組換えタンパク質を濃縮して、精製された組換えタンパク質を得ることができた。各ステップの詳細は、以下の通りである。
組換えタンパク質pmoB12を精製するために、前述の方法と同様の方法で培養された大腸菌を回収し、その細胞ペレットを5mLの破砕溶液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、10mM イミダゾール、0.2mM CuSO4、pH8.0)に再浮遊し、超音波破砕機を用いて細胞を破砕した。破砕された細胞液を13,000rpmで10分間遠心分離し、その不溶性凝集体のみを分離した後、5mLの変性溶液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、6M Gdn-HCl、pH8.0)に1時間再浮遊し、13,000rpmで20分間遠心分離してその上澄み液のみを分離した。その後、組換えタンパク質pmoB12をNi2+-NTAカラム(Quiagen、Hilden、Germany)を用いてそれぞれ分離した(洗浄バッファー:50mM NaH2PO4、300mM NaCl、6M Gdn-HCl、pH6.3/溶出バッファーA:50mM NaH2PO4、300mM NaCl、6M Gdn-HCl、pH5.9/溶出バッファーB:50mM NaH2PO4、300mM NaCl、6M Gdn-HCl、pH4.5)。
Ni2+-NTAアフィニティー・クロマトグラフィーを経て溶出された4mLの組換えタンパク質溶液からタンパク質の変性を誘導するGdn-HClを徐々に除去するために、段階的な透析プロセスを適用してpmoB12のリフォールディングを行った。つまり、緩衝溶液(20mM Tris-HCl、250mM NaCl、1mM CuSO4、6M Gdn-HCl、pH8.0)に組換えタンパク質を4℃で3時間透析プロセスを行った。合計6回の間、段階ごとにGdn-HClの濃度を1Mずつ下げ、最後の段階では、Gdn-HClのない緩衝溶液(20mM Tris-HCl、250mM NaCl、1mM CuSO4、pH8.0)を用いて3回の透析プロセスを繰り返して、Gdn-HClを完全に除去した。最後に、リフォールディングされたpmoB12は遠心分離(13,000rpm、20分、4℃)によってタンパク質凝集体を完全に除去した後に回収した。
透析プロセスによって得られたリフォールディングされたpmoB12をultracentrifugal filter(Amicon Ultra 100K、Millipore、Billerica、MA)に投入し、カラムの上に1mlの溶液が残るまで5,000rpmで遠心分離を行った。
前記プロセスを経た後、精製された組換えタンパク質ナノ粒子の発現率および細胞質溶解度をSDS-PAGEで分析した。pMMO-mimicsを含む組換えタンパク質の破砕された細胞ペレット溶液(lysate)、破砕された細胞液を遠心分離して得られた上澄み液(soluble fraction、sol)と不溶性凝集体(insoluble fraction、insol)、精製またはリフォールディングされた組換えタンパク質を12%Tris-グリシンプレキャストゲル(glycine precast gel)(Invitrogen、California、U.S.A.)を用いてSDS-PAGEを行った。そして、ゲルをクマシーブルー染色液で染色し、染色されたタンパク質バンドをデンシトメーター(densitometer)(GS-800 Calibrated Densitometer、Bio-Rad、California、U.S.A.)を用いて、各組換えタンパク質の発現率および細胞質溶解度を分析した(図3)。
前記プロセスを経た後、精製された組換えタンパク質ナノ粒子の構造を分析するために透過電子顕微鏡(TEM)で撮影を行った。タンパク質ナノ粒子の染色画像を得るために、自然乾燥されたサンプルを含む電子顕微鏡グリッドを2%(w/v)水性ウラニルアセテート溶液と共に室温で1時間インキュベートした。タンパク質ナノ粒子の画像を200kVで動作するTecnai20(FEI、Hillsboro、Oreon、U.S.A.)電子顕微鏡を用いて観察した結果、球状のナノ粒子が形成されたことを確認した。そして、DLS(dynamic light scattering)分析によって、pMMO-m1は26.3±3.1nm、pMMO-m2は20.8±3.3nm、pMMO-m3は23.9±3.3nm、pMMO-m4は21.9±3.3nm、pmoB-free huHF particle with His6は12.8±2.1nmのサイズを有する球状ナノ粒子を形成することを確認した。さらに、HiLoadTM 16/600 superdexTM 200pg column(GE Healthcare、Illinois、U.S.A.)が装着されているSEC(size-exclusion chromatography)分析によって、pMMO-m3が、直径約12nmのhuFH粒子よりは大きく、直径約32nmのHBVC粒子よりは小さいサイズを有することを確認した。pMMO-m3の2次構造と融点を分析するために、円偏光二色性分光計(Circular dichroism(CD)spectrometer(Jasco、Tokyo、Japan))を用いた。CDスペクトルは、200~250nm(1nm帯域幅、100nm/minスキャン速度)で測定し、20℃で測定されたCDスペクトルを基準にpMMO-m3の2次構造を分析した。pMMO-m3の融点(Tm)は、他の温度(30、40、50、60、70、80、90℃)で測定されたCDスペクトルを用いて算出した(図4)。
精製された組換えタンパク質ナノ粒子のメタンガス酸化活性を検証するために、20mLのセプタムでシールされたバイアル(septa-sealed vial(catalogue no.5182-0837、Agilent))に還元剤であるデュロキノール(duroquinol)(0.35mM)を含む1mLの組換えタンパク質溶液を注入した。注入されたpmoB12(4.8μM)、フェリチン-pmoB1(0.2μM)、pMMO-m1(0.2μM)、pMMO-m2(0.4μM)、pMMO-m3(0.4μM)、site-A mutant of pMMO-m3(0.4μM)、site-B mutant of pMMO-m3(0.4μM)、pMMO-m4(0.4μM)は、すべて同じモル数の触媒活性部位(pmoB1、pmoB2)を含んでいる。組換えタンパク質によるメタン酸化反応のために、19mLのヘッドスペース(headspace)の空気を注射器を用いて除去し、15mLのメタンガスと4mLの空気を注入することによって開始された。その後、すぐにバイアル(vial)を45℃のインキュベーターで最大20時間まで酵素反応を行った。そして、酵素反応によって生成された酸化生成物であるメタノールの量をガスクロマトグラフィー(7890B GC、Agilent)を用いて測定し、累積生産量と転換数(turnover number)を計算した(図5)。
銅塩(CuSO4、0.0~0.3mM)及び/又は鉄塩(FeSO4、0.2mM)を補充した大腸菌培養物中で、実施例6から確認された最適のメタン酸化活性を示すpMMO-m3を合成した。各培養条件で合成されたpMMO-m3によるメタノール生産量、およびpMMO-m3中の銅及び鉄の含有量を測定した。銅及び鉄の含有量は、ICP-MSによって測定した(図6b~c)。
前記実施例6から確認された最適のメタン酸化活性を示すpMMO-m3を利用して、3次元多孔性のハイドロゲルに固定化して新しい反応システムを構築し、ハイドロゲル内の水分含有によって酵素ナノ粒子の活性が長期間維持されて繰り返し使用できるかどうかを以下の実験により証明した。
まず、10mgのpMMO-m3をトリス・バッファー(20mM Tris-HCl、250mM NaCl、pH8.0)に溶解されているN-スクシンイミジルアセテート(N-succinimidyl acrylate)(NSA、0.01mg)と37℃で1時間反応して、ビニル化(vinylated)pMMO-m3を得た。反応せずに残っているNSAは、ultracentrifilterationシステム(Amicon Ultra 100K、Millipore、Billerica、MA)を用いて除去した。次に、709μLのビニル化(vinylated)pMMO-m3(1.69μM)を150μLの30%アクリルアミド(acrylamide)(29:1 w/w acrylamde:bis-acrylamide、BioRad、U.S.A.)、130μlの1M Tris-HCl(pH6.5)、10μlの10%(w/v)過硫酸アンモニウム(ammonium persulfate)(APS)、1μlの0.8Mテトラメチルエチレンジアミン(tetramethylethylenediamine)(TEMED)と混合した後、すぐにその混合物を透明な384ウェルプレートに25μLずつ分けて入れた。そして、それを25℃で16時間置いて混成重合(copolymerization)した。これにより、pMMO-m3が固定化されたアクリルアミドベースのハイドロゲルを作った。pMMO-m3が固定化されたハイドロゲルは、Ptコーティングを経た後、FE-SEM(Quanta 250 FEG、FEI、Oregon、U.S.A.)により、多孔性の構造及びハイドロゲル内におけるpMMO-m3の分布を確認した。ハイドロゲル内におけるpMMO-m3の分布は、金ナノ粒子がラベリングされたヒスチジン抗体(anti-H6 antibody、Santa Cruz、Texas、U.S.A.)を2時間処理し、銀増感キット(silver enhancement kit、Sigma Aldrich)を用いて、金ナノ粒子のサイズを増加させた後、PtコーティングしてFE-SEMで分析した。
前記プロセスを経て作成されたpMMO-m3が固定化されたハイドロゲルのメタン酸化活性を検証するために、デュロキノール(duroquinol)を還元剤として使用した。20個のpMMO-m3が固定化されたハイドロゲル(pMMO-m3の6x10-4μmoles)を含む2mLのトリス・バッファー(20mM Tris-HCl、250mM NaCl、pH8.0)とデュロキノール(0.35mM)を20mLのsepta-sealed vial(catalogue no.5182-0837、Agilent)に注入した。メタン酸化反応のために、18mLの ヘッドスペース(headspace)の空気を注射器を用いて除去し、14.5mLのメタンガスと4.5mLの空気を注入することにより開始された。その後、すぐにバイアル(vial)を45℃のインキュベーターで20時間酵素反応を行った。酵素反応によって生成された酸化生成物であるメタノールの量をガスクロマトグラフィー(7890B GC、Agilent)を用いて測定し、累積生産量を確認した。反復的なメタン酸化反応を検証するために、20時間の反応後、バイアルの蓋を開けてガスを除去した後、20個のpMMO-m3が固定化されたハイドロゲルを回収し、トリス・バッファーに3回洗浄した。洗浄された20個のpMMO-m3が固定化されたハイドロゲルは、再び20mLのsepta-sealed vialに投入し、同様の方法でメタン酸化反応を行った。これにより、約120時間の間、約6回の反復的な使用が可能なことを確認した(図7)。
Claims (15)
- 細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質の表面にメタン酸化酵素の第1活性部位と第2活性部位が融合・発現されたものであり、
前記メタン酸化酵素は、pMMOであり、
前記第1活性部位はpmoB1又はその変異体であり、前記第2活性部位はpmoB2であり、
前記第1活性部位は、配列番号2の配列を含み、前記第2活性部位は、配列番号3の配列を含み、
前記変異体は、H48N及びH72Nからなる群より選択される一つ以上を含むことを特徴とする、メタン酸化酵素(MMO)活性を有する酵素ナノ粒子。 - 前記タンパク質は、フェリチン(ferritin)、フェリチン様タンパク質(ferritin-like protein)、マグネトソーム(magnetosome)構成タンパク質、大腸菌DNA結合タンパク質(Escherichia coli DNA binding protein)、ヒトα-トコフェロール伝達タンパク質(Human α-Tocopherol transfer protein)、ヒトPERKシャペロン(Human PERK chaperone)またはB型肝炎ウイルスカプシドタンパク質(Hepatitis B virus capsid)、プロテアソーム(proteasome)、タバコモザイクウイルスコートタンパク質(Tobacco mosaic virus coat protein)であることを特徴とする、請求項1に記載の酵素ナノ粒子。
- 前記タンパク質は、フェリチン重鎖タンパク質であることを特徴とする、請求項1に記載の酵素ナノ粒子。
- 細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質の表面にメタン酸化酵素の第1活性部位と第2活性部位が融合・発現された、MMO活性を有するナノ粒子を生成するステップと、前記生成されたナノ粒子を回収するステップとを含み、
前記メタン酸化酵素は、pMMOであり、
前記第1活性部位はpmoB1又はその変異体であり、前記第2活性部位はpmoB2であり、
前記第1活性部位は、配列番号2の配列を含み、前記第2活性部位は、配列番号3の配列を含み、
前記変異体は、H48N及びH72Nからなる群より選択される一つ以上を含むことを特徴とする酵素ナノ粒子の製造方法。 - i)細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする核酸と、
ii)メタン酸化酵素の第1活性部位をコードする核酸と、
iii)メタン酸化酵素の第2活性部位をコードする核酸とが導入されており、
ナノ粒子タンパク質の表面に前記第1活性部位と前記第2活性部位を融合・発現させたものであり、
前記メタン酸化酵素は、pMMOであり、
前記第1活性部位はpmoB1又はその変異体であり、前記第2活性部位はpmoB2であり、
前記第1活性部位は、配列番号2の配列を含み、前記第2活性部位は、配列番号3の配列を含み、
前記変異体は、H48N及びH72Nからなる群より選択される一つ以上を含むことを特徴とする、メタン酸化酵素(MMO)活性を示す酵素ナノ粒子生成能を有する組換え微生物。 - 前記タンパク質は、フェリチン(ferritin)、フェリチン様タンパク質(ferritin-like protein)、マグネトソーム(magnetosome)構成タンパク質、大腸菌DNA結合タンパク質(Escherichia coli DNA binding protein)、ヒトα-トコフェロール伝達タンパク質(Human α-Tocopherol transfer protein)、ヒトPERKシャペロン(Human PERK chaperone)またはB型肝炎ウイルスカプシドタンパク質(Hepatitis B virus capsid)、プロテアソーム(proteasome)、タバコモザイクウイルスコートタンパク質(Tobacco mosaic virus coat protein)であることを特徴とする、請求項5に記載の組換え微生物。
- 前記タンパク質は、フェリチン重鎖タンパク質であることを特徴とする、請求項5に記載の組換え微生物。
- i)細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする核酸と、
ii)メタン酸化酵素の第1活性部位をコードする核酸と、
iii)メタン酸化酵素の第2活性部位をコードする核酸とが作動可能に連結されたベクターが導入されたことを特徴とする、請求項5に記載の組換え微生物。 - (a)i)細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする核酸、および、ii)メタン酸化酵素の第1活性部位をコードする核酸が作動可能に連結された第1ベクターと、
(b)i)細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする核酸、および、iii)メタン酸化酵素の第2活性部位をコードする核酸が作動可能に連結された第2ベクターとが導入されていることを特徴とする、請求項5に記載の組換え微生物。 - i)細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする核酸と、ii)メタン酸化酵素の第1活性部位をコードする核酸との間;または
ii)メタン酸化酵素の第1活性部位をコードする核酸と、iii)メタン酸化酵素の第2活性部位をコードする核酸との間に、ペプチドリンカーをコードする核酸をさらに含むことを特徴とする、請求項8または9に記載の組換え微生物。 - 前記細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする前記核酸の上流にタグを含むことを特徴とする、請求項8に記載の組換え微生物。
- 前記第1ベクターまたは前記第2ベクター中の前記細胞内で自己組織化してナノ粒子を形成できるタンパク質をコードする前記核酸の上流にタグを含むことを特徴とする、請求項9に記載の組換え微生物。
- 請求項1に記載の酵素ナノ粒子が担体に担持された固定化酵素ナノ粒子。
- 前記担体は、キトサン、ゼラチン、コラーゲン、ポリ-L-リシン、ポリ-L-ヒスチジン、ポリ-L-アルギニン、ヒアルロン酸、ポリガンマグルタミン酸、アルギネート、カルボキシメチルセルロース、グリコーゲン、アミロース、デキストラン、ポリアクリル酸、ポリアクリルアミド、ポリメタアクリル酸、ポリヒドロキシエチルメタクリレートフルラン、ベータグルカン、スターチ、ヒドロキシエチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ポリビニルピロンドン共重合体、ポリエチレングリコール、ポリビニルアルコール、ポリビニルアルキルエーテル、ポリジメチルアミノエチルメタアクリレート、ポリN,N-エチルアミノエチルメタクリレート、ポリ乳酸、グリグリコール酸、ポリラクチクグリコール酸、またはポリカプロラクトンであることを特徴とする、請求項13に記載の酵素ナノ粒子。
- 請求項1に記載の酵素ナノ粒子、請求項5に記載の組換え微生物、又は請求項13に記載の固定化酵素ナノ粒子を用いて、メタンをメタノールに変換する方法。
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR10-2019-0036923 | 2019-03-29 | ||
| KR1020190036923A KR102801976B1 (ko) | 2019-03-29 | 2019-03-29 | 메탄 산화 활성을 지닌 신규한 효소 나노입자 |
| PCT/KR2020/003841 WO2020204425A1 (ko) | 2019-03-29 | 2020-03-20 | 메탄 산화 활성을 지닌 신규한 효소 나노입자 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2022528241A JP2022528241A (ja) | 2022-06-09 |
| JP7335643B2 true JP7335643B2 (ja) | 2023-08-30 |
Family
ID=72666407
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2021558597A Active JP7335643B2 (ja) | 2019-03-29 | 2020-03-20 | メタン酸化活性を有する新規な酵素ナノ粒子 |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US12442022B2 (ja) |
| EP (1) | EP3957730A4 (ja) |
| JP (1) | JP7335643B2 (ja) |
| KR (1) | KR102801976B1 (ja) |
| WO (1) | WO2020204425A1 (ja) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR102574959B1 (ko) * | 2021-04-30 | 2023-09-04 | 고려대학교 산학협력단 | 메탄 산화 활성을 갖는 신규 단백질 |
| KR102642506B1 (ko) * | 2021-04-30 | 2024-02-28 | 고려대학교 산학협력단 | 메탄 또는 부탄 산화 활성을 갖는 신규 단백질 |
| CN116240231A (zh) * | 2022-12-19 | 2023-06-09 | 中国科学院电工研究所 | 一种纳米酶级联反应系统及其制备方法和应用 |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2005095002A (ja) | 2000-10-30 | 2005-04-14 | Katsutoshi Okubo | メタンをメタノールに変換する酵素タンパク質の製造方法 |
Family Cites Families (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2001275653A (ja) * | 2000-03-29 | 2001-10-09 | Osaka Gas Co Ltd | 膜結合型アルカン酸化酵素を固定化したアルカノール製造リアクターおよび該リアクターを用いるアルカノールの製造方法 |
| WO2003008563A2 (en) * | 2001-07-20 | 2003-01-30 | California Institute Of Technology | Improved cytochrome p450 oxygenases |
| US20070231856A1 (en) * | 2003-05-30 | 2007-10-04 | Pei Ye | Recombinant Protein and Polypeptide Production Using Methylotropic or Ethylotropic Microorganisms with a Dilute Methanol or Ethanol Feeding |
| US8715988B2 (en) * | 2005-03-28 | 2014-05-06 | California Institute Of Technology | Alkane oxidation by modified hydroxylases |
| WO2012012786A2 (en) * | 2010-07-22 | 2012-01-26 | Brigham Young University | Process, composition and method for anion deposition into ferritin for therapeutic and other use |
| CN104822824A (zh) * | 2012-10-15 | 2015-08-05 | 凯利斯塔公司 | 用于烃的生物氧化的遗传工程改造的微生物 |
| KR101836921B1 (ko) * | 2013-05-10 | 2018-03-12 | 고려대학교 산학협력단 | 표적 지향성 펩타이드를 포함하는 재조합 자기조립성 단백질 및 그의 용도 |
| KR20160094550A (ko) * | 2015-01-30 | 2016-08-10 | 동국대학교 산학협력단 | 단일사슬항체조각과 페리틴을 포함하는 융합단백질 및 그의 용도 |
| KR101835940B1 (ko) * | 2015-08-27 | 2018-03-08 | 건국대학교 산학협력단 | 돌연변이로 활성이 개선된 메틸로시너스 트리코스포륨 OB3b 유래 메탄산화 효소 |
| KR101888675B1 (ko) * | 2015-09-02 | 2018-08-14 | 경북대학교 산학협력단 | 인간 유래 페리틴 모노머 단편 및 이를 이용한 융합폴리펩티드 |
| JP2020137469A (ja) * | 2019-02-28 | 2020-09-03 | 国立大学法人京都大学 | 活性発現する炭化水素酸化生体触媒 |
-
2019
- 2019-03-29 KR KR1020190036923A patent/KR102801976B1/ko active Active
-
2020
- 2020-03-20 JP JP2021558597A patent/JP7335643B2/ja active Active
- 2020-03-20 US US17/599,153 patent/US12442022B2/en active Active
- 2020-03-20 WO PCT/KR2020/003841 patent/WO2020204425A1/ko not_active Ceased
- 2020-03-20 EP EP20783549.7A patent/EP3957730A4/en active Pending
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2005095002A (ja) | 2000-10-30 | 2005-04-14 | Katsutoshi Okubo | メタンをメタノールに変換する酵素タンパク質の製造方法 |
Non-Patent Citations (5)
| Title |
|---|
| ACS Nano, 2015 Oct 2, vol. 9, no. 11, pp. 10852-10860 |
| Angew Chem Int Ed, 2017 SEP 13, vol. 56, no. 47, pp. 14933-14936 |
| Appl Microbiol Biotechnol, 2007 Feb 14, vol. 75, no. 2, pp. 347-355 |
| J Mater Chem, 2011 Oct 3, vol. 21, pp. 17468-17475 |
| Korean J Chem Eng, 2013, vol. 30, no. 5, pp. 977-987 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP3957730A1 (en) | 2022-02-23 |
| EP3957730A4 (en) | 2022-12-28 |
| KR20200114723A (ko) | 2020-10-07 |
| WO2020204425A1 (ko) | 2020-10-08 |
| US20220170051A1 (en) | 2022-06-02 |
| US12442022B2 (en) | 2025-10-14 |
| JP2022528241A (ja) | 2022-06-09 |
| KR102801976B1 (ko) | 2025-04-28 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Uchida et al. | Modular self-assembly of protein cage lattices for multistep catalysis | |
| Jordan et al. | Self-assembling biomolecular catalysts for hydrogen production | |
| US12442022B2 (en) | Enzyme nanoparticles with methane oxidation activity | |
| KR102089516B1 (ko) | Co 수화효소 및 이를 이용한 개미산의 제조방법 | |
| CN106191025B (zh) | 一种利用氧化石墨烯-金属离子配位固定化酶的方法 | |
| Jin et al. | Magnetic nanoplatforms for covalent protein immobilization based on spy chemistry | |
| Liao et al. | Co-immobilization of two-component hydroxylase monooxygenase by functionalized magnetic nanoparticles for preserving high catalytic activity and enhancing enzyme stabilty | |
| Kraj et al. | Polymer coatings on virus-like particle nanoreactors at low ionic strength—charge reversal and substrate access | |
| CN105624128B (zh) | 一种固定化单胺氧化酶及其在合成手性氮杂双环化合物中的应用 | |
| CN103898073B (zh) | 一种含有更多丝氨酸的谷胱甘肽过氧化物酶gpx1突变体及其制备方法 | |
| Zhou et al. | Peptide-inspired one-step synthesis of surface-functionalized Fe3O4 magnetic nanoparticles for oriented enzyme immobilization and biocatalytic applications | |
| CN111378695A (zh) | 合成r-3-(2-氯-1-羟基乙基)苯酚的方法、去氧肾上腺素、滴眼剂 | |
| JP2015529075A (ja) | セバシン酸を調製するための方法 | |
| CN107858384B (zh) | 一种利用活性包涵体制备光学纯l-叔亮氨酸的方法 | |
| Cheng et al. | Maltodextrin-modified hyperoxic graphene oxide as potential matrix for one-step purification and immobilization of MBP-tagged proteins | |
| Luo et al. | A SiO2 microcarrier with an opal-like structure for cross-linked enzyme immobilization | |
| CN113061590B (zh) | 藻毒素降解酶及复合材料与应用 | |
| Zhang et al. | Tailoring protein–polymer conjugates as efficient artificial enzymes for aqueous asymmetric aldol reactions | |
| CN113846040A (zh) | 协同两类腈水合酶高效催化烟酰胺及丙烯酰胺生物合成的方法 | |
| WO2020237552A1 (zh) | 转氨酶突变体及其应用 | |
| CN112266905B (zh) | 一种多肽修饰氨基酸脱氢酶及其制备和固定化方法 | |
| CN110684703A (zh) | 一种胞内外分泌4-α-糖基转移酶的基因工程菌及其发酵方法和应用 | |
| KR102642506B1 (ko) | 메탄 또는 부탄 산화 활성을 갖는 신규 단백질 | |
| Beaufils et al. | From Enzyme Stability to Enzymatic Bioelectrode Stabilization Processes. Catalysts 2021, 11, 497 | |
| JP2007068424A (ja) | 二機能性ホルムアルデヒド固定酵素遺伝子 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20210929 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220920 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221219 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230314 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230612 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20230808 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230810 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7335643 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |