JP7278259B2 - ワクチン及び標的としてのプラスモジウムスポロゾイトnpdpペプチド、新規マラリアワクチン、及びそれに結合する抗体 - Google Patents
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Description
第1の態様において、本発明は、配列番号1に係るアミノ酸を含む又はからなるペプチドを提供する。
NPDP
[配列番号1]
このモチーフは、領域IのC末端側とNANPリピートのN末端側のプラスモジウムスポロゾイト周囲タンパク質に見られる。驚くべきことに、配列番号1に係るモチーフに結合する抗体は非常に強力であり、in vivoで(プラスモジウムスポロゾイトの)肝臓寄生体の負荷量を大幅に低減することが分かった。このことは、そのような抗体が、(i)スポロゾイトの侵入及び(ii)in vivoでの肝臓ステージでの寄生体増殖を強力に阻害できることを示す。本発明に係るペプチドは、そのような強力な抗体を生じさせることができるので、例えば、マラリアに対する強力なワクチンの生成に有用であり、これは、(i)スポロゾイト侵入及び(ii)in vivoにおける肝臓ステージでの寄生体増殖の阻害をもたらす。それにより、個体における疾患を予防及び/又は治療できるだけでなく、集団における疾患の広がりも抑制することができる。
NPDPN
[配列番号2]
NPDPNA
[配列番号3]
NPDPNAN
[配列番号4]
NPDPNANP
[配列番号5]
NPDPNANPN
[配列番号6]
GNPDPNANP
[配列番号7]
GNPDPNANPN
[配列番号8]
DGNPDPNANP
[配列番号9]
NPDPNANPNK
[配列番号10]
DGNPDPNANPN
[配列番号11]
GNPDPNANPNK
[配列番号12]
DGNPDPNANPNK
[配列番号13]
ADGNPDPNANPN
[配列番号14]
QPADGNPDPNANPNK
[配列番号15]
ADGNPDPNANPNK
[配列番号16]
PADGNPDPNANPNK
[配列番号17]
ADGNPDPNANPNKN
[配列番号18]
PADGNPDPNANPNKN
[配列番号19]
QPADGNPDPNANPNKN
[配列番号20]
PADGNPDPNANPNKNN
[配列番号21]
QPADGNPDPNANPNKNN
[配列番号22]
KQPADGNPDPNANPNKNN
[配列番号23]
更なる態様において、本発明は、本発明に係るペプチドを含むタンパク質を提供する。したがって、タンパク質は、本発明に係るペプチドからなり得る。しかし、タンパク質は、好ましくは、(i)本発明に係るペプチド及び(ii)好ましくはタンパク質に相乗的機能及び/又は追加的機能を提供する追加のアミノ酸配列を含む。換言すれば、そのような追加のアミノ酸配列は、ペプチドの機能(免疫原/抗原としての)に加えて、好ましくはペプチドの機能(免疫原/抗原としての)に対して相乗的である機能を提供できることが好ましい。そのような機能の非限定的な例としては、(i)例えば以下に説明されるターゲティング、及び(ii)例えば以下に説明される免疫原性が挙げられる。
B型肝炎ウイルス(HBV)は、(i)3つの関連する表面タンパク質(B型肝炎表面抗原、HBsAg)と脂質とを含むエンベロープ、及び(ii)ウイルスDNAゲノムとDNAポリメラーゼを囲む正二十面体のヌクレオカプシドからなる。HBVカプシドは、RNAプレゲノム複製複合体のパッケージング中に感染細胞のサイトゾルにおいて形成され、粒子の内腔のプレゲノムの逆転写によってウイルスDNAゲノムの合成中に放出される能力を獲得する。3つのHBVエンベロープタンパク質S-HBsAg、M-HBsAg、及びL-HBsAgは、小胞体で複雑な膜貫通折り畳みを形成し、ジスルフィド結合したホモダイマー及びヘテロダイマーを形成する。
MENITSGFLGPLLVLQAGFFLLTRILTIPQSLDSWWTSLNFLGGTTVCLGQNSQSPTSNHSPTSCPPTCPGYRWMCLRRFIIFLFILLLCLIFLLVLLDYQGMLPVCPLIPGSSTTSTGPCRTCMTTAQGTSMYPSCCCTKPSDGNCTCIPIPSSWAFGKFLWEWASARFSWLSLLVPFVQWFVGLSPTVWLSVIWMMWYWGPSLYSILSPFLPLLPIFFCLWVYI
(配列番号319)
MMRKLAILSVSSFLFVEALFQEYQCYGSSSNTRVLNELNYDNAGTNLYNELEMNYYGKQENWYSLKKNSRSLGENDDGNNEDNEKLRKPKHKKLKQPADGNPDP
(配列番号320)
KKLKQPA
(配列番号321)
HKKLKQPAD
(配列番号322)
KHKKLKQPADG
(配列番号323)
KHKKLKQP
(配列番号324)
RKPKHKKLKQP
(配列番号325)
PKHKKLKQPADGN
(配列番号326)
KPKHKKLKQPADGNP
(配列番号327)
RKPKHKKLKQPADGNPD
(配列番号328)
NEKLRKPKHKKLKQP
(配列番号329)
NEKLRKPKHKKLKQPADG
(配列番号330)
フェリチンポリペプチド:
MLSKDIIKLLNEQVNKEMNSSNLYMSMSSWCYTHSLDGAGLFLFDHAAEEYEHAKKLIVFLNENNVPVQLTSISAPEHKFEGLTQIFQKAYEHEQHISESINNIVDHAIKGKDHATFNFLQWYVAEQHEEEVLFKDILDKIELIGNENHGLYLADQYVKGIAKSRKS
(配列番号331)
エンカプスリンポリペプチド:
MEFLKRSFAPLTEKQWQEIDNRAREIFKTQLYGRKFVDVEGPYGWEYAAHPLGEVEVLSDENEVVKWGLRKSLPLIELRATFTLDLWELDNLERGKPNVDLSSLEETVRKVAEFEDEVIFRGCEKSGVKGLLSFEERKIECGSTPKDLLEAIVRALSIFSKDGIEGPYTLVINTDRWINFLKEEAGHYPLEKRVEECLRGGKIITTPRIEDALVVSERGGDFKLILGQDLSIGYEDREKDAVRLFITETFTFQVVNPEALILLKF
(配列番号332)
本発明に係るペプチドへの抗体結合
更なる態様では、本発明は、本発明に係るペプチドに(特異的に)結合する抗体又はその抗原結合断片を提供する。換言すれば、本発明に係る抗体又はその抗原結合断片は、本発明に係るペプチドに対応するエピトープ、特にCSPエピトープを認識することができる。したがって、本発明に係る抗体は、CSPの機能的に重要な領域Iの近傍の、CSPのN末端とNANPリピート領域との間の接合部に位置するCSPエピトープに結合する。
(i)少なくとも1つの重鎖CDRH1は、配列番号64、82、136、154、206、224、258、276、及び294のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つの重鎖CDRH2は、配列番号65、83、137、155、207、225、259、277、及び295のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つの重鎖CDRH3は、配列番号66、84、138、156、208、226、260、278、及び296のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つの重鎖CDRH1は、配列番号64、82、136、206、224、及び276のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つの重鎖CDRH2は、配列番号65、83、137、207、225、及び277のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つの重鎖CDRH3は、配列番号66、84、138、208、226、及び278のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つの重鎖CDRH1は、配列番号64又は配列番号224で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つの重鎖CDRH2は、配列番号65又は配列番号225で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つの重鎖CDRH3は、配列番号66又は配列番号226で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つの重鎖CDRH1は、配列番号206又は配列番号276で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つの重鎖CDRH2は、配列番号207又は配列番号277で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つの重鎖CDRH3は、配列番号208又は配列番号278で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つの重鎖CDRH1は、配列番号82又は配列番号136で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つの重鎖CDRH2は、配列番号83又は配列番号137で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つの重鎖CDRH3は、配列番号84又は配列番号138で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号67、85、139、157、209、227、261、279、及び297のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号68、69、86、87、140、141、158、159、210、211、228、229、262、263、280、281、298、及び299のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号70、88、142、160、212、230、264、282、及び300のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号67、85、139、209、227、及び279のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号68、69、86、87、140、141、210、211、228、229、280、及び281のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号70、88、142、212、230、及び282のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号67で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号68又は69で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号70で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号209で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号210又は211で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号212で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号227で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号228又は229で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号230で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号279で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号280又は281で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号282で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号139で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号140又は141で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号142で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号85で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号86又は87で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号88で表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
更なる態様では、本発明はP.ファルシパルムスポロゾイトに(特異的に)結合する抗体又はその抗原結合断片を提供する。より好ましくは、本発明に係る抗体又はその抗原結合断片は、プラスモジウムスポロゾイト周囲タンパク質、最も好ましくは配列番号24に係るプラスモジウムスポロゾイトタンパク質に(特異的に)結合する。換言すれば、本発明に係る抗体又はその抗原結合断片は、エピトープ、特にCSPエピトープを認識することができる。
(i)少なくとも1つの重鎖CDRH1は、配列番号28、46、64、82、100、118、136、154、172、188、206、224、242、258、276、及び294のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRH2は、配列番号29、47、65、83、101、119、137、155、173、189、207、225、243、259、277、及び295のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つの重鎖CDRH3は、配列番号30、48、66、84、102、120、138、156、174、190、208、226、260、244、278、及び296のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
(i)少なくとも1つのCDRL1は、配列番号31、49、67、85、103、121、139、157、175、191、209、227、245、261、279、及び297のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;
(ii)少なくとも1つのCDRL2は、配列番号32、33、50、51、68、69、86、87、104、105、122、123、140、141、158、159、176、192、193、210、211、228、229、246、262、263、280、281、298、及び299のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含み;及び/又は
(iii)少なくとも1つのCDRL3は、配列番号34、52、70、88、106、124、142、160、177、194、212、230、247、264、282、及び300のいずれかで表されるアミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び/又は配列番号249で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも88%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体。
本発明の抗体(即ち、P.ファルシパルムスポロゾイトに結合する抗体、及び本発明のペプチドに結合する抗体)及びその抗原結合断片は、例えば、治療部位に送達するために薬物に結合させてもよく、対象となる細胞を含む部位のイメージングを容易にするために検出可能な標識に結合させてもよい。薬物及び検出可能な標識に抗体を結合させる方法は、検出可能な標識を使用するイメージング方法等、当技術分野において周知である。標識された抗体は、広範な標識を使用する広範なアッセイで使用することができる。例えば、本発明の抗体と対象となるエピトープとの間又は本発明に係るペプチド又はタンパク質と抗体との間の抗体-抗原複合体の形成の検出は、検出可能な物質を抗体に結合させることによって容易になり得る。好適な検出手段としては、放射性核種、酵素、補酵素、蛍光物質、化学発光物質、色素原、酵素物質又は補因子、酵素阻害剤、補欠分子族複合体、フリーラジカル、粒子、色素等の標識の使用が挙げられる。好適な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、又はアセチルコリンステラーゼが挙げられ;好適な補欠分子族複合体の例としては、ストレプトアビジン/ビオチン及びアビジン/ビオチンが挙げられ;好適な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリド、又はフィコエリトリンが挙げられ;発光物質の例は、ルミノールであり;生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、及びエクオリンが挙げられ;好適な放射活性物質の例としては、125I、131I、35S、又は3Hが挙げられる。かかる標識された試薬は、例えば、ラジオイムノアッセイ、酵素イムノアッセイ、例えば、ELISA、蛍光イムノアッセイ等の様々な周知のアッセイで使用することができる。したがって、本発明に係る標識された抗体は、例えば、米国特許第3,766,162号、同第3,791,932号、同第3,817,837号、及び同第4,233,402号に記載の通り、かかるアッセイにおいて使用することができる。
本発明に係る抗体は、当技術分野において公知の任意の方法によって作製することができる。例えば、ハイブリドーマ技術を使用してモノクローナル抗体を作製するための一般的な方法論は、周知である(Kohler,G.and Milstein,C,.1975;Kozbar et al.1983)。
別の態様では、本発明は、また、前記の本発明に係る抗体又はその抗原結合断片をコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子を提供する。別の態様では、本発明は、また、前記の本発明に係るペプチド又は前記の本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子を提供する。
更なる態様では、本発明は、以下のうちの1以上を含む医薬組成物を提供する。
(i)本発明に係るペプチド;
(ii)本発明に係るタンパク質;
(iii)本発明に係るタンパク質又はペプチドをコードする核酸;
(iv)本発明に係るウイルス様粒子;
(v)本発明に係るタンパク質ナノ粒子;
(vi)本発明に係る抗体又はその抗体断片;
(vii)本発明に係る抗体又は抗体断片をコードする核酸;
(viii)本発明に係る核酸を含むベクター;及び/又は
(ix)本発明に係る抗体又はペプチドを発現する、又は本発明に係るベクターを含む細胞。
医学的処置
更なる態様では、本発明は、医薬としての以下の使用を提供する:
(i)本発明に係るペプチド;
(ii)本発明に係るタンパク質;
(iii)本発明に係るタンパク質又はペプチドをコードする核酸;
(iv)本発明に係るウイルス様粒子;
(v)本発明に係るタンパク質ナノ粒子;
(vi)本発明に係る抗体又はその抗体断片;
(vii)本発明に係る抗体又は抗体断片をコードする核酸;
(viii)本発明に係る核酸を含むベクター;
(ix)本発明に係る抗体又はペプチドを発現する、又は本発明に係るベクターを含む細胞;及び/又は
(x)本発明に係る医薬組成物。
好ましくは、
(i)本発明に係るペプチド;
(ii)本発明に係るタンパク質;
(iii)本発明に係るタンパク質又はペプチドをコードする核酸;
(iv)本発明に係るウイルス様粒子;
(v)本発明に係るタンパク質ナノ粒子;
(vi)本発明に係る抗体又はその抗体断片;
(vii)本発明に係る抗体又は抗体断片をコードする核酸;
(viii)本発明に係る核酸を含むベクター;
(ix)本発明に係る抗体又はペプチドを発現する、又は本発明に係るベクターを含む細胞;及び/又は
(x)本発明に係る医薬組成物は、
マラリアの予防及び/又は処置における使用のためのものである。
(i)本発明に係るペプチド;
(ii)本発明に係るタンパク質;
(iii)本発明に係るタンパク質又はペプチドをコードする核酸;
(iv)本発明に係るウイルス様粒子;
(v)本発明に係るタンパク質ナノ粒子;
(vi)本発明に係る抗体又はその抗体断片;
(vii)本発明に係る抗体又は抗体断片をコードする核酸;
(viii)本発明に係る核酸を含むベクター;
(ix)本発明に係る抗体又はペプチドを発現する、又は本発明に係るベクターを含む細胞;及び/又は
(x)本発明に係る医薬組成物。
この方法の好ましい実施形態は、前記した医学的使用の好ましい実施形態に対応する。
更なる態様において、本発明は、また、前記ワクチンの抗原が正しい立体構造で特定のエピトープを含むことをチェックすることにより、抗マラリアワクチンの品質をモニターするための、本発明に係る抗体又はその抗体断片、又は本発明に係る医薬組成物の使用を提供する。チェックされる抗マラリアワクチンに含まれる好ましい抗原には、前記した本発明に係るペプチドが含まれる。
(i)本発明に係るペプチド;
(ii)本発明に係るタンパク質;
(iii)本発明に係るタンパク質又はペプチドをコードする核酸;
(iv)本発明に係るウイルス様粒子;
(v)本発明に係るタンパク質ナノ粒子;
(vi)本発明に係る抗体又はその抗体断片;
(vii)本発明に係る抗体又は抗体断片をコードする核酸;
(viii)本発明に係る核酸を含むベクター;
(ix)本発明に係る抗体又はペプチドを発現する、又は本発明に係るベクターを含む細胞;及び/又は
(x)本発明に係る医薬組成物。
(i)本発明に係るペプチド;
(ii)本発明に係るタンパク質;
(iii)本発明に係るタンパク質又はペプチドをコードする核酸;
(iv)本発明に係るウイルス様粒子;
(v)本発明に係るタンパク質ナノ粒子;
(vi)本発明に係る抗体又はその抗体断片;
(vii)本発明に係る抗体又は抗体断片をコードする核酸;
(viii)本発明に係る核酸を含むベクター;
(ix)本発明に係る抗体又はペプチドを発現する、又は本発明に係るベクターを含む細胞;及び/又は
(x)本発明に係る医薬組成物。
特に定義しない限り、本明細書で使用する全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する分野の当業者に一般的に理解されている意味と同じ意味を有する。本明細書に記載するものと類似又は等価な方法及び材料を本発明の実施又は試験で用いることができるが、好適な方法及び材料を以下に記載する。本明細書に記載する全ての刊行物、特許出願、特許、及び他の参照文献は、その全体が参照によって援用される。矛盾する場合、定義を含む本明細書が優先する。更に、材料、方法、及び実施例は、単なる例示であり、限定を意図するものではない。
マラリアによる攻撃から保護したタンザニア人の4名のドナー(ドナーG、H、U、及びVとして識別)を、ヒトモノクローナル抗体の単離のために選択した。このため、この4名のドナーの血液試料から末梢血単核細胞(PBMC)を単離した。IgG記憶B細胞を、磁気細胞ソーティングにより凍結末梢血単核細胞(PBMC)から単離した。B細胞を、0.5μg/mLの抗CD19-PECy7抗体と共に氷上で20分間インキュベートした後、マウス抗PEマイクロビーズと共に氷上で30分間インキュベートした。次に、細胞を3.75μg/mLのヤギAlexa Fluor 647コンジュゲート抗ヒトIgGで氷上にて20分間染色し、FACSで選別した。Traggiai et al.(2004)Nat Med.10,871-875に既に記載されているように、選別されたB細胞をエプスタイン-バーウイルス(EBV)で不死化し、CpG及び照射されたPBMCフィーダー細胞の存在下で単一細胞培養液にプレートした。14日間後、スポロゾイトを染色する能力について、ハイスループットフローサイトメーターを使用して培養上清をスクリーニングした。このアッセイでは、スポロゾイトを6.25×SYBR Green Iで標識し、1/2希釈でB細胞培養上清と共に室温にて30分間インキュベートした。洗浄工程なしで、スポロゾイトを1μg/mLのヤギAlexa Fluor 647コンジュゲート抗ヒトIgGと4℃で1時間インキュベートし、フローサイトメトリーで分析した。
プラスモジウムの生活環の肝臓ステージにおいて、スポロゾイトはしばしば標的肝細胞の生産的侵入の前に肝細胞を通過する。例示的なモノクローナル抗体MGG1、MGG2、MGG3、MGG4、MGG8、MGH1、MGH2、及びMGH3(配列番号については表1及び2を参照)を、スポロゾイトの通過及び肝細胞への侵入を阻害する能力についてin vitroで試験した。この目的のために、定量的フローサイトメトリーベースのアッセイを使用した。これは、Kaushansky A, Rezakhani N, Mann H, Kappe SH, 2012: Development of a quantitative flow cytometry-based assay to assess infection by Plasmodium falciparum sporozoites. Mol Biochem Parasitol. 183(1):100-3に記載されている。このアッセイの概要を図2Aに示す。簡単に言えば、このアッセイでは、肝細胞HC04細胞株にFITC-デキストランの存在下でP.ファルシパルムスポロゾイトを感染させた。スポロゾイトの通過は、通過中に膜が損傷した肝細胞に入ることができるFITC-デキストランの取り込みによって測定した。スポロゾイト侵入は、肝細胞中のスポロゾイトを抗スポロゾイト周囲タンパク質(抗CSP)抗体で染色することにより測定した。対照として、スポロゾイト周囲タンパク質のNANPリピート領域を標的とするマウスモノクローナル抗体2A10(Zavala F. et al., 1983, J. Exp. Med. 157: 1947 - 1957; Wirtz R.A. et al., 1987, Bulletin of the World Health Organization 65(1): 39 - 45)を使用した。
プラスモジウムスポロゾイト周囲タンパク質(CSP)は、スポロゾイト表面全体を被覆し、スポロゾイト機能に重要な役割を果たす免疫優性タンパク質である。図4Aに示すように、このタンパク質は、シグナルペプチド(SP)で始まり、領域I(RI)で終わるN末端セグメントを含む。領域Iは、肝細胞及び蚊の唾液腺に対する結合に関与するペンタペプチド(KLKQP;配列番号25)である。CSPにおいて、領域Iの後に、抗体の免疫優性部位であるNANPリピート領域と、T細胞エピトープを含むC末端トロンボスポンジン様ドメインが続く(図4A)。図4Bは、P.ファルシパルム単離体NF54のスポロゾイト周囲タンパク質の例示的な配列(配列番号24)を示す。
モノクローナル抗体の標的となるCSPの正確な領域を同定するために、選択された抗体の線状エピトープマッピングをCSPに対して行った(PEPperMAP(登録商標)、PEPperPRINT GmbH、ハイデルベルク、独国)。この目的のために、抗体MGV3、MGG4、MGU5、及びMGG1を、タンパク質全体を覆う15-aaのCSPペプチドのアレイ(1つのアミノ酸分シフト)への結合について試験した(図6)。簡単に説明すれば、スポロゾイト周囲タンパク質(CSP)の配列を、トランケートされたペプチドを避けるために、C及びN末端で中性GSGSGSGリンカー(配列番号28)によって伸長した。伸長した抗原配列を、14アミノ酸のペプチド-ペプチドオーバーラップを有する線状15アミノ酸ペプチドに翻訳した(図6)。得られたCSPペプチドマイクロアレイには、重複してプリントされた457個の異なるペプチド(914ペプチドスポット)、更なるカスタム対照ペプチド(各対照2スポット)、c-Myc対照(2スポット)、及びHA対照ペプチドのフレーム(82スポット)が含まれた。CSPペプチドマイクロアレイを、インキュベーションバッファー中の濃度1μg/ ml、10μg/ml、及び100μg/mlの抗体試料と共にインキュベートした後、二次抗体と対照抗体で染色し、LI-COR Odyssey Imaging Systemで読み取った。スポット強度の定量化とペプチドアノテーションは、PepSlide(登録商標)Analyzerを使用して行った。
次に、モノクローナル抗体MGG1、MGG4、MGU5、及びMGU3が、インタクトなスポロゾイトへのMGV3の結合を阻害できるかどうかを、ブロッキングオブバインディング(blocking-of-binding)(BOB)アッセイで試験した。このアッセイでは、スポロゾイトを3.3×SYBR Green Iで染色し、滴定モノクローナル抗体(0.1~100μg/mL)と共に室温で20分間インキュベートした。洗浄せずに、続いて、スポロゾイトを10μg/mLのビオチン標識MGV3と共に室温で20分間インキュベートした。スポロゾイトを2回洗浄し、Alexa Fluor 647にコンジュゲートしたストレプトアビジンと共に室温で20分間インキュベートし、フローサイトメトリーで分析した。Alexa Fluor 647チャネルの蛍光強度のメジアン(メジアンFI)の減少を用いて、ビオチン化MGV3の結合の阻害の程度を測定した。
実施例3(図5)のデータは、試験された全ての抗体の中で、抗体MGU3だけがCSPのC末端結合部位に結合することを示唆するので、各種抗体を、CSPのC末端に結合する能力についてを試験した。
Claims (20)
- P.ファルシパルムスポロゾイト(P.falciparum sporozoites)に結合する抗体又はその抗原結合断片であって、
前記抗体又はその抗原結合断片が、以下に示すCDRH1、CDRH2、及びCDRH3アミノ酸配列、及びCDRL1、CDRL2、及びCDRL3アミノ酸配列を含むことを特徴とする抗体又はその抗原結合断片:
(i)配列番号64~68及び70;又は
(ii)配列番号64~67、69、及び70;又は
(iii)配列番号82~86及び88;又は
(iv)配列番号82~85、87、及び88;又は
(v)配列番号136~140及び142;又は
(vi)配列番号136~139、141、及び142;又は
(vii)配列番号206~210及び212;又は
(viii)配列番号206~209、211、及び212;又は
(ix)配列番号224~228及び230;又は
(x)配列番号224~227、229、及び230;又は
(xi)配列番号276~280及び282;又は
(xii)配列番号276~279、281、及び282;又は
(xiii)配列番号242~247。 - 前記抗体又はその抗原結合断片が、プラスモジウムスポロゾイト周囲タンパク質に結合する請求項1に記載の抗体又はその抗原結合断片。
- 前記抗体又はその抗原結合断片が、配列番号24で表されるプラスモジウムスポロゾイト周囲タンパク質に結合する請求項2に記載の抗体又はその抗原結合断片。
- 前記抗体又はその抗原結合断片が、以下を含む請求項1から3のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片:
(i)配列番号71で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番号72で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;又は
(ii)配列番号89で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番号90で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;又は
(iii)配列番号143で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番号144で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;又は
(iv)配列番号213で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番214で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;又は
(v)配列番号231で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番号232で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;又は
(vi)配列番号283で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番号284で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;又は
(vii)配列番号248で表される重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体、及び配列番号249で表される軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列、又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体。 - 前記抗体又はその抗原結合断片が、精製抗体、単鎖抗体、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、又はscFvである請求項1から4のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片。
- 医薬として使用するための請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片。
- マラリアの予防及び/又は処置において使用するための請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片。
- 請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片をコードするポリヌクレオチドを含むことを特徴とする核酸分子。
- ポリヌクレオチド配列が、配列番号73~81、91~99、145~153、215~223、233~241、250~257、285~293のいずれかに記載の核酸配列;又は少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む又はからなる請求項8に記載の核酸分子。
- 請求項8から9のいずれかに記載の核酸分子を含むことを特徴とするベクター。
- 請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片を発現する;又は請求項10に記載のベクターを含むことを特徴とする細胞。
- 請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片、請求項8から9のいずれかに記載の核酸分子、請求項10に記載のベクター、及び/又は請求項11に記載の細胞を含むことを特徴とする医薬組成物。
- 薬学的に許容し得る賦形剤、希釈剤、又は担体を更に含む請求項12に記載の医薬組成物。
- マラリアの予防及び/又は処置において使用するための請求項8から9のいずれかに記載の核酸分子。
- マラリアの予防及び/又は処置において使用するための請求項10に記載のベクター。
- マラリアの予防及び/又は処置において使用するための請求項11に記載の細胞。
- マラリアの予防及び/又は処置において使用するための請求項12から13のいずれかに記載の医薬組成物。
- ワクチンの抗原が正しい立体構造で特定のエピトープを含むことをチェックすることにより、抗マラリアワクチンの品質をモニターするための請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片、請求項8から9のいずれかに記載の核酸分子、請求項10に記載のベクター、請求項11に記載の細胞、又は請求項12から13のいずれかに記載の医薬組成物の使用。
- マラリアのインビトロ診断における請求項1から5のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合断片、請求項8から9のいずれかに記載の核酸分子、請求項10に記載のベクター、請求項11に記載の細胞、又は請求項12から13のいずれかに記載の医薬組成物の使用。
- 請求項1から5のいずれかに記載の少なくとも1つの抗体又はその抗原結合断片、請求項8から9のいずれかに記載の少なくとも1つの核酸分子、請求項10に記載の少なくとも1つのベクター、請求項11に記載の少なくとも1つの細胞、又は請求項12から13のいずれかに記載の少なくとも1つの医薬組成物を含むことを特徴とするキットオブパーツ。
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