JP7097465B2 - キメラ抗原受容体細胞療法と併用するil-10剤の組成およびその使用方法 - Google Patents

キメラ抗原受容体細胞療法と併用するil-10剤の組成およびその使用方法 Download PDF

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Description

本発明は、疾患、障害、および病態の治療または予防における免疫応答を調節するために、キメラ抗原受容体細胞療法と併用してIL-10剤を使用する方法に関する。具体的には、本開示は、キメラ抗原受容体-T細胞(CAR-T細胞)療法と併用したIL-10剤の使用を記載する。
序論
インターロイキン-10(IL-10)は、T細胞、B細胞、マクロファージ、および抗原提示細胞(APC)に対する作用を通して多数の免疫応答を制御する、多面的サイトカインである。その多面的活性の結果として、IL-10は、炎症性病態、免疫関連障害、線維性障害、代謝障害、および癌を含む、幅広い疾患、障害、および病態に関連付けられている。いくつかのそのような疾患、障害、および病態に対するIL-10による臨床および前臨床評価は、様々なヒト治療への用途での治療におけるその治療潜在性を実証している。IL-10活性を保持する、天然に存在するおよび合成の両方の様々なIL-10誘導体、バリアント、および類似体が生成されてきた。ヒトIL-10(hIL-10)は、2つのIL-10ポリペプチドのホモ二量体であり、各単量体は178アミノ酸を含み、最初の18アミノ酸は、細胞発現中に切除され、成熟IL-10分子の一部を形成しないシグナルペプチドを含む。IL-10ポリペプチドは、非共有結合して、二量体IL-10分子を形成する。特に、ペグ化型のIL-10は、ある特定の治療環境において、活性の改善、半減期の延長、および有用性を有することが示されている。
CAR-T細胞療法は、特にB細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫の治療における癌の新たな治療法を表す。CAR-T細胞療法は、養子細胞移植(ACT)の使用を含み、これは、キメラ抗原受容体(または「CAR」)と呼ばれる合成T細胞受容体(「TCR」)を発現するために組換えDNA技術を使用して改変される対象自身のT細胞を使用するプロセスは、操作されたT細胞を標的細胞に結合させるために、T細胞の生来の向性を変化させる。CARは、典型的には、CARが相互作用するように操作されたリガンドに接触すると、CAR-T細胞が活性化されるように、合成T細胞受容体を提供する操作された融合ポリタンパク質である。キメラ抗原受容体は、典型的には、多数の機能ドメイン、典型的には、CARをコードする発現ベクターで形質転換されたT細胞の外面上に発現する標的化外部ドメインを含む単一のポリペプチドである。CARは、細胞膜にまたがる膜貫通ドメインと、外部ドメインがその標的に結合すると細胞内シグナル伝達を提供する化学反応を媒介する細胞質内エンドドメインと、をさらに含む。例えば、CARの外部ドメインは、標的細胞上に存在する既知の抗原に特異的であり得る。多くの場合、CARは、腫瘍細胞の表面上に発現するマーカーに結合するように操作される。
CAR-T細胞療法の典型的な実践では、T細胞は、アフェリシス(apherisis)によって対象から単離され、単離されたT細胞を、CARをコードする組換えベクターでエクスビボでトランスフェクトして、組換え改変されたCAR-T細胞の集団をもたらすことによってCARを発現するように遺伝子操作される。CAR-T細胞は、しばしば、CARを発現するように組換え改変された患者由来のメモリCD8+T細胞を使用して生成される。エクスビボ増幅に続いて、CAR-T細胞は、典型的には、CARの外部ドメインがその標的結合リガンドに遭遇し、標的細胞集団に対する選択的免疫応答をもたらすまで、CAR-T細胞が循環する場合には、注入して患者に戻す。
以下でさらに考察されるように、CAR-T細胞療法は、標的抗原を発現する正常組織を標的とするCAR-T細胞による抗原特異的毒性の誘導およびCAR-T細胞治療の極端な効力の両方によって部分的に制限されてきた。これらの毒性は、生命を脅かすサイトカイン放出症候群を引き起こすことが観察されている。特に、有意な抗原負荷を伴う高親和性T細胞受容体相互作用は、活性化誘導細胞死につながり得ることが観察されている。本発明は、より低用量のCAR-T細胞の使用を容易にし、それによってCAR-T細胞療法に関連する有害事象を最小限に抑える、操作されたCAR-T細胞の増強された活性を提供する組成物および方法を提供する。
本開示は、対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節するために、IL-10剤と併用してCAR-T細胞療法を使用する組成物および方法を企図する。
本開示のある特定の実施形態において、本開示は、対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、
(a)対象からの複数のT細胞を得ることと、
(b)単離された複数のT細胞を組換えベクターと接触させることであって、組換えベクターは、T細胞において機能的な発現制御配列に作動可能に連結されたキメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、接触は、複数のT細胞による核酸配列の取り込みを可能にする条件である、接触させることと、
(c)キメラ抗原受容体(CAR-T細胞)をコードする核酸配列を発現する組換えベクターと接触した複数のT細胞からそれらのT細胞を単離することと、
(d)対象に、治療上有効な量のIL-10剤と併用して、治療量のステップ(c)の単離されたCAR-T細胞を投与することと、を含む、方法を提供する。
本開示のある特定の実施形態において、本開示は、対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介免疫応答を調節する方法であって、対象に、
(a)治療上有効な量のCARを発現するCAR T細胞であって、その抗原認識ドメインは、標的細胞集団に結合することができる、CAR T細胞と、
(b)治療上有効な量のIL-10剤と、を投与することを含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、治療上有効な量のIL-10剤を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、IL-10剤は、対象に、治療上有効な量のCAR-T細胞の投与前に、投与と同時に、または投与後に投与され、CAR-T細胞のCARの抗原認識ドメインは、疾患、障害、または病態に特徴的な標的細胞集団の細胞表面分子に結合することができる、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、治療上有効な量のCAR-T細胞の投与を含み、CAR-TのCARの抗原認識ドメインは、疾患、障害、または病態に特徴的な標的細胞集団の細胞表面分子に結合することができ、(a)一定期間、CAR-T細胞をIL-10剤とエクスビボで接触させるステップと、(b)対象に、治療上有効な量のステップ(a)のCAR-T細胞を投与するステップと、を含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、治療上有効な量のCAR-T細胞の投与を含み、CAR-TのCARの抗原認識ドメインは、疾患、障害、または病態に特徴的な標的細胞集団の細胞表面分子に結合することができ、(a)一定期間、CAR-T細胞をIL-10剤とエクスビボで接触させるステップと、(b)IL-10剤(対象に投与されるIL-10剤は、投与前にCAR-T細胞を処理するために使用されるIL-10剤と同じであるかまたは異なる)と併用して、対象に、治療上有効な量のステップ(a)のCAR-T細胞を投与するステップと、を含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CAR-T細胞の集団の細胞毒性活性を増強する方法であって、CAR-T細胞がエクスビボでIL-10剤と接触する、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CAR-T細胞の集団の免疫調節活性を増強する方法であって、CAR-T細胞がエクスビボでIL-10剤と接触する、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CAR-T細胞が、対象にそれらを投与する前に、IL-10剤でエクスビボで処理されるCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、CAR-T細胞療法を用いて、CAR-T細胞が、対象にそれらを投与し、続いて、対象に、IL-10剤(対象に投与されるIL-10剤は、投与前にCAR-T細胞を処理するために使用されるIL-10剤と同じであるかまたは異なる)と併用してIL-10で処理したCAR-T細胞を投与する前に、IL-10剤を用いてエクスビボで処理される、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、CAR-T細胞療法を用いて、CAR-T細胞が、対象にそれらを投与する前に、IL-10剤を用いてエクスビボで処理され、CAR-T細胞が、CARおよびIL-10剤をコードする組換えベクターでトランスフェクトされ、ベクターでコードされたIL-10剤が、投与前に、この細胞をエクスビボで処理するために使用されるIL-10剤と同じであるかまたは異なる、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CAR-T細胞療法で疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、CARは、腫瘍性細胞に存在する癌抗原を特異的に認識し、結合する抗原特異的ドメイン(ASD)を含む、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用したCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、IL-10剤が、活性化メモリCD8+T細胞の機能を増強する、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用したCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、IL-10剤は、CAR-T細胞の細胞毒性機能を増強するのに十分な量で対象に投与される、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用したCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、IL-10剤は、一定期間にわたって、少なくとも1ng/mlのIL-10血清中トラフ濃度を維持するのに十分な量で対象に投与される、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用してCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、IL-10剤は、対象に皮下投与される、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用したCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、IL-10剤は、IL-10剤を発現するように遺伝子改変された細胞の対象への導入と併せて、対象における疾患、障害、または病態(例えば、癌関連障害)の治療または予防のために対象に投与される、方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用したCAR-T細胞療法を用いて、疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、投与が、対象における標的細胞集団へのT細胞媒介性免疫応答を調節し、対象に、a)キメラ抗原受容体であって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的化領域を含む、キメラ抗原受容体と、b)治療上有効な量のIL-10剤と、を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を対象に導入することを含む、方法を提供する。
CAR-T細胞がIL-10剤を発現するように改変されるいくつかの実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤は、同じベクターによって発現されるが、他の実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤は、異なるベクターによって発現される。
特定の実施形態において、治療上有効な複数の細胞は、治療上有効な量がCAR-T細胞の細胞毒性機能を増強するのに十分な量である、治療上有効な量でIL-10剤を発現するベクターでトランスフェクトされる。ベクターは、例えば、プラスミドまたはウイルスベクターであり得る。特定の実施形態において、IL-10剤の発現は、発現制御要素によって調節される。特定の実施形態において、IL-10剤の発現は、約0.1ng/ml、0.5ng/ml、1ng/ml、1.5ng/ml、2ng/ml、3ng/ml、5ng/ml以上のIL-10剤の血清中トラフ濃度、またはIL-10剤のEC50を維持するために、発現制御要素によって調節される。
特定の実施形態において、複数の細胞が対象から得られ、エクスビボで遺伝子改変される。複数の細胞は、アフェレーシスによって対象から得られ得る。いくつかの実施形態において、複数の細胞は、メモリCD8+T細胞である。いくつかの実施形態において、複数の細胞は、対象由来のCD8+T細胞を含む。いくつかの実施形態において、細胞は、投与される対象に由来しない。
ある特定の実施形態において、本開示は、IL-10剤の投与と併用したCAR-T細胞療法で疾患、障害、または病態に罹患している対象を治療する方法であって、対象に、a)キメラ抗原受容体を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第1の複数の細胞であって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、治療上有効な第1の複数の細胞と、b)治療上有効な量のIL-10剤を発現し、任意に分泌するように遺伝子改変された第2の複数の細胞と、を導入することを含む、方法を提供する。特定の実施形態において、治療上有効な第2の複数の細胞は、CAR-T細胞の細胞毒性機能を増強するのに十分な量でIL-10剤を発現するベクターでトランスフェクトされる。特定の実施形態において、治療上有効な第2の複数の細胞は、IL-10剤を発現するベクターでトランスフェクトされた患者由来のCD8+T細胞を含む。
特定の実施形態において、第1の複数の細胞は、対象から得られ、エクスビボで遺伝子改変され、他の実施形態において、第2の複数の細胞は、対象から得られ、エクスビボで遺伝子改変される。本開示は、第1の複数の細胞および第2の複数の細胞が、アフェレティック(aphaeretic)プロセスによって対象から得られる実施形態を企図する。いくつかの実施形態において、第1の複数の細胞は、メモリCD8+T細胞であり、第2の複数の細胞は、ナイーブCD8+T細胞である。いくつかの実施形態において、第1の複数の細胞および第2の複数の細胞は、自己の腫瘍細胞である。
本開示はまた、IL-10剤(例えばPEG-IL-10)の投与またはIL-10剤を発現するベクターの導入と併用して、対象における疾患、障害、または病態(例えば、癌関連障害)の治療または予防のためのCAR-T細胞療法の使用も企図する。
特定の実施形態は、癌関連の疾患、障害、または病態(例えば、腫瘍)を有する対象を治療する方法であって、a)キメラ抗原受容体を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を対象に導入することであって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団の標的細胞の表面に存在する抗原に特異的に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的ドメインを含む、導入することと、b)対象に、治療上有効な量のIL-10剤を投与することと、を含む、方法を含む。
本開示のある特定の実施形態において、そのような方法は、対象における癌関連疾患、障害、または病態の予防のための治療プロトコルで使用され、他の実施形態において、そのような方法は、免疫関連障害の予防のための治療プロトコルで使用される。IL-10剤の投薬パラメータおよびレジメン、ならびにそのような薬剤の例示的なタイプを含む、上記の方法のさらなる態様は、本明細書の別の箇所に記載されている。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-10剤をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。いくつかの実施形態において、CARは、腫瘍抗原に向けられ、IL-10剤は、hIL-10である。いくつかの実施形態において、ベクターは、CARをコードする第1の核酸配列およびIL-10剤をコードする第2の核酸配列を含み、第1および第2の核酸配列は、それぞれ、第1および第2の発現制御要素に作動可能に連結され、第1および第2の発現制御要素は、同じであるかまたは異なる。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-10剤をコードする核酸配列を含む、組換えベクターであって、このベクターは、CARをコードする第1の核酸配列およびIL-10剤をコードする第2の核酸配列を含むポリシストロン性核酸を含み、ポリシストロン性核酸配列は、発現制御要素に作動可能に連結され、ポリシストロン性核酸は、任意に、第2の核酸配列(例えば、IRESまたはFMVD2A配列)の発現を増強する介在配列を提供する、組換えベクターを提供する。ある特定の実施形態において、ベクターは、ウイルスベクターである。ある特定の実施形態において、ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-7剤をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-12剤をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-15剤をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-18剤をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびITIM阻害剤をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-7受容体をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-10受容体をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-12受容体をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-15受容体をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、CARおよびIL-18受容体をコードする核酸配列を含む組換えベクターおよびそれらの使用方法を提供する。
本開示の追加の実施形態は、癌関連疾患、障害、または病態を有する対象を治療する方法であって、対象に、a)キメラ抗原受容体であって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的化領域を含む、キメラ抗原受容体と、b)IL-10剤と、を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を導入することを含む、方法を企図する。いくつかの実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤は、同じベクターによって発現され、他の実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤は、異なるベクターによって発現される。
特定の実施形態において、治療上有効な複数の細胞は、T細胞の細胞毒性機能を増強するのに十分な量でIL-10剤を発現するベクターでトランスフェクトされる。ベクターは、例えば、非ウイルスベクターまたはウイルスベクターであり得る。本開示はまた、IL-10剤を発現する任意の他の手段の使用も企図する。特定の実施形態において、IL-10剤の発現は、発現制御要素によって調節される。特定の実施形態において、発現制御要素は、調節可能なプロモーターである。特定の実施形態において、発現制御要素は、組織特異的プロモーターである。
上記の実施形態において、複数の細胞は、対象から得られ、エクスビボで遺伝子改変され得る。本開示のいくつかの実施形態によれば、複数の細胞は、増殖後、投与前のある期間、少なくとも1つのIL-10剤で処理されたアフェレティックプロセスによって対象から得られ、ある期間は、対象への投与前の約48時間未満、約36時間未満、約24時間未満、約18時間未満、約12時間未満、約6時間未満、約4時間未満、約2時間未満、または約1時間未満である。複数の細胞は、特定の実施形態において、メモリCD8+T細胞を含み、他の実施形態において、自己の腫瘍細胞を含む。
本開示のさらにさらなる実施形態は、癌関連の疾患、障害、または病態を有する対象を治療する方法であって、対象に、a)キメラ抗原受容体を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第1の複数の細胞であって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的化領域を含む、治療上有効な第1の複数の細胞と、b)IL-10剤を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第2の複数の細胞と、を導入することを含む、方法を企図する。
ある特定の実施形態において、上記の方法は、対象における癌または免疫関連の疾患、障害、または病態を含む、疾患、障害、または病態の予防のための治療プロトコルにおいて使用される。
特定の実施形態において、治療上有効な第1の複数の細胞は、細胞毒性機能を増強するのに十分な量でIL-10剤を発現するベクターでトランスフェクトされる。さらに他の実施形態において、治療上有効な第2の複数の細胞は、IL-10剤を発現するベクターでトランスフェクトされたCD8+T細胞を含む。
特定の実施形態において、第1の複数の細胞は、対象から得られ、エクスビボで遺伝子改変され、他の実施形態において、第2の複数の細胞は、対象から得られ、エクスビボで遺伝子改変される。本開示は、第1の複数の細胞および第2の複数の細胞が、アフェレティック(aphaeretic)プロセスによって対象から得られる実施形態を企図する。いくつかの実施形態において、第1の複数の細胞は、メモリCD8+T細胞であり、第2の複数の細胞は、ナイーブCD8+T細胞である。さらに他の実施形態において、第1の複数の細胞および第2の複数の細胞は、自己の腫瘍細胞である。
前述の実施形態の各々において、標的細胞集団は、腫瘍抗原を含み得、その例は、本明細書の別の箇所で記載される。
本開示は、本明細書に記載のIL-10剤をコードする核酸分子を企図する。ある特定の実施形態において、IL-10剤(複数可)をコードする核酸分子は、DNA分子で形質転換された細胞においてIL-10剤をコードする核酸分子の発現を与える発現制御要素に作動可能に連結される。いくつかの実施形態において、ベクター(例えば、プラスミドまたはウイルスベクター)は、核酸分子を含む。IL-10剤を発現する形質転換細胞または宿主細胞も本明細書で企図される。
本開示は、追加の化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤を含む免疫調節分子、サイトカイン剤、サイトカインバリアント薬剤、サイトカイン類似体剤、ならびにそのようなサイトカイン剤の融合タンパク質およびそのペグ化形態を特異的に含む修飾されたサイトカイン剤の投与を含むが、これらに限定されない、追加の治療法と併用する前述の薬剤および方法の使用を企図する。
一実施形態において、本発明は、腫瘍性疾患に罹患している哺乳動物対象を治療する方法であって、
a.患者由来のT細胞の試料を得ることと、
b.試料中のT細胞の一部をベクターで形質導入することであって、ベクターが、キメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、核酸配列が、1つ以上の制御要素と作動可能に会合して、T細胞内のキメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列の転写および翻訳をもたらして、CARを発現するT細胞の集団を生成する、形質導入することと、
c.CARを発現するT細胞(CAR-T細胞)を単離することと、
d.IL-10剤の存在下でCAR-T細胞をエクスビボで培養することと、
e.哺乳動物対象に、ステップ(d)からのCAR-T細胞を投与することと、を含む、方法を提供する。
一実施形態において、本発明は、(f)対象に、治療上有効な量のIL-10剤を含む医薬製剤を投与するさらなるステップを提供する。一実施形態において、ステップ(d)のIL-10剤およびステップ(f)の医薬製剤のIL-10剤は、同じIL-10剤である。一実施形態において、ステップ(d)のIL-10剤およびステップ(f)の医薬製剤のIL-10剤は、異なるIL-10剤である。一実施形態において、ステップ(d)のIL-10剤は、rhIL-10であり、ステップ(f)のIL-10剤の医薬製剤は、ペグ化IL-10剤を含む。一実施形態において、医薬製剤は、モノペグ化IL-10剤を含む。一実施形態において、医薬製剤は、モノペグ化IL-10剤とジペグ化IL-10剤との混合物を含む。一実施形態において、IL-10剤を含む医薬製剤の投与は、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.01ng/ml、あるいは少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.05ng/ml、あるいは少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.1ng/ml、あるいは少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.5ng/mlの対象におけるIL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である。
一実施形態において、本開示は、対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、
a)対象に、キメラ抗原受容体(CAR)を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を導入することであって、キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、導入することと、
b)対象に、治療上有効な量のIL-10剤を投与することであって、IL-10剤の投与が、少なくとも0.01ng/mlの血清中トラフレベルをもたらす、投与することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態において、IL-10剤は、モノペグ化IL-10剤であるか、またはモノペグ化IL-10剤とジペグ化IL-10剤との混合物である。いくつかの実施形態において、対象へのIL-10剤の投与は、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.03ng/ml、あるいは少なくとも0.06ng/ml、あるいは少なくとも0.1ng/ml、あるいは少なくとも0.5ng/ml、あるいは少なくとも1ng/ml、あるいは少なくとも2ng/ml、あるいは少なくとも5ng/mlの対象におけるIL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である。
本開示は、さらに、対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、対象に、
a)キメラ抗原受容体(CAR)であって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、キメラ抗原受容体と、
b)IL-10剤と、を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を導入し、
それにより、T細胞性免疫反応を調節することを含む、方法を提供する。
別の実施形態において、本開示は、対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、対象に、
a)キメラ抗原受容体(CAR)を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第1の複数の細胞であって、当該キメラ抗原受容体が、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、治療上有効な第1の複数の細胞と、
b)IL-10剤を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第2の複数の細胞と、を導入することを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、遺伝子改変された細胞によるIL-10剤の発現は、少なくとも0.005ng/ml、あるいは少なくとも0.01ng/ml、あるいは少なくとも0.05ng/ml、あるいは少なくとも0.1ng/ml、あるいは少なくとも0.2ng/ml、あるいは少なくとも0.5ng/ml、あるいは少なくとも1ng/ml、またはあるいは少なくとも2ng/mlの標的細胞微小環境において、局所IL-10剤濃度を提供する。
別の実施形態において、本開示は、T細胞を有効量のIL-10剤と接触させることによって、CAR-T細胞中のアポトーシスを阻害する方法を提供する。いくつかの実施形態において、本方法は、エクスビボで実施され、IL-10剤の量は、約0.005ng/mlを超える、あるいは少なくとも0.01ng/ml、あるいは少なくとも0.05ng/ml、あるいは少なくとも0.1ng/ml、あるいは少なくとも0.2ng/ml、あるいは少なくとも0.5ng/ml、あるいは少なくとも1ng/ml、またはあるいは少なくとも2ng/mlのIL-10剤の濃度を有する緩衝液中で提供される。いくつかの実施形態において、本方法は、対象においてインビボで実施され、対象に投与されるIL-10剤の量は、少なくとも24時間の期間にわたって、少なくとも0.03ng/ml、あるいは少なくとも0.06ng/ml、あるいは少なくとも0.1ng/ml、あるいは少なくとも0.5ng/ml、あるいは少なくとも1ng/ml、あるいは少なくとも2ng/ml、またはあるいは少なくとも5ng/mlの対象におけるIL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である。
いくつかの実施形態において、使用されるCAR-T細胞は、抗原認識ドメイン(ARD)であって、CARのARDが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、抗原認識ドメイン(ARD)を提供する。いくつかの実施形態において、CARの抗原認識ドメインは、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載されるように使用されるCAR-T細胞は、細胞内シグナル伝達ドメインであって、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、細胞内シグナル伝達ドメインを提供する。一実施形態において、本方法の実施に使用されるCAR-T細胞について、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを提供する。前述の方法は、化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤、IL-2剤、IL-7剤、IL-12剤、IL-15剤、およびIL-18剤を含み、特に、免疫チェックポイント調節剤が、PD1調節剤、PDL1調節剤、CTLA4調節剤、LAG-3調節剤、TIM-3調節剤、ICOS調節剤、OX40調節剤、cd-27調節剤、CD-137調節剤、HVEM調節剤、CD28調節剤、CD226調節剤、GITR調節剤、BTLA調節剤、A2A調節剤、IDO調節剤、およびVISTA調節剤からなる群から選択される、1つ以上の補助剤の対象への投与と組み合わせられ得る。
一実施形態において、本開示は、組換えベクターであって、IL-10剤、CAR、およびサイトカインをコードする核酸配列を含み、核酸配列は、発現制御配列に作動可能に連結されている、組換えベクターを提供する。いくつかの実施形態において、組換えベクターは、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドをコードし、特に、CARの抗原認識ドメインは、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される。他の実施形態において、組換えベクターは、CARをコードし、CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含み、任意にまたは加えて、ポリペプチドは、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞内シグナル伝達ドメインに由来する1つ以上の共刺激ドメインに由来するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ベクターによってコードされるサイトカインは、IL-7、IL-12、IL-15、およびIL18、ならびにそれらのバリアントからなる群から選択される。いくつかの実施形態において、ベクターは、レンチウイルスベクターを含むウイルスベクターである。
本開示は、さらに、前述のベクターで形質転換された改変T細胞を提供する。
本開示は、さらに、IL-10剤がペグ化されている場合を含む、CAR-T細胞およびIL-10剤を含む医薬製剤を提供する。
他の実施形態は、本開示の教示に基づいて当業者には明らかであろう。本開示は、一般に、癌の治療のためにCAR-T細胞療法を使用するという文脈で説明されているが、そのような療法はさほど限定されないことを理解されたい。
A.一般的解釈および構築:
本開示についてさらに記載する前に、本開示が、本明細書に明記される特定の実施形態に限定されないことが理解されるべきであり、本明細書で使用される用語は、特定の実施形態の記載を目的とするに過ぎず、限定的であることは意図されないこともまた理解されるべきである。
値の範囲が提供される場合、別段文脈が明確に指示しない限り、下限の単位の10分の1までの、その範囲の上限と下限との間の各介在値、および任意の他の述べられた範囲またはその述べられた範囲内の介在値が、包含されることが理解される。これらのより小さな範囲の上限および下限は独立して、より小さな範囲に含めることができ、それらもまた、述べられた範囲内のあらゆる具体的に除外される限度を条件として、本発明に包含される。述べられた範囲が、限度の一方または両方を含む場合、それらの含まれる限度の一方または両方を除外する範囲もまた、本発明に含まれる。
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「a(1つの)」、「an(1つの)」、および「the(その)」は、別段文脈が明確に指示しない限り、複数の参照物を含むことに留意しなくてはならない。さらに、特許請求の範囲は、いかなる任意の要素を除外するように起草されてもよいことに留意されたい。したがって、この陳述は、特許請求要素の引用に関連して、「単独で」および「唯一の」などの排他的な用語を使用するための、または「否定的な」限定を使用するための、先行基準として機能することが意図される。
別段示されない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度は摂氏(℃)であり、圧力は大気圧または大気圧付近でのものである。以下、bp=塩基対(複数可)、kb=キロベース(複数可)、pl=ピコリットル(複数可)、sまたはsec=秒(複数可)、min=分(複数可)、hまたはhr=時間(複数可)、aa=アミノ酸(複数可)、kb=キロベース(複数可)、nt=ヌクレオチド(複数可)、pg=ピコグラム、ng=ナノグラム、μg=マイクログラム、mg=ミリグラム、g=グラム、kg=キログラム、dlまたはdL=デシリットル、μlまたはμL=マイクロリットル、mlまたはmL=ミリリットル、lまたはL=リットル、μM=マイクロモル、mM=ミリモル、M=モル、kDa=キロダルトン、i.m.=筋肉内(に)、i.p.=腹腔内(に)、SCまたはSQ=皮下(に)、QD=1日1回、BID=1日2回、QW=1週間に1回、QM=1ヶ月に1回、HPLC=高速液体クロマトグラフィー、BW=体重、U=単位、ns=統計的に有意ではない、PBS=リン酸緩衝食塩水、PCR=ポリメラーゼ連鎖反応、NHS=N-ヒドロキシスクシンイミド、HSA=ヒト血清アルブミン、MSA=マウス血清アルブミン、DMEM=ダルベッコ変法イーグル培地、GC=ゲノムコピー、EDTA=エチレンジアミン四酢酸を含む、標準的な略語が使用される。
分子生物学における標準的な方法は、科学文献に記載されている(例えば、Sambrook and Russell(2001)Molecular Cloning,3rd ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.、ならびに細菌細胞内でのクローニングおよびDNA変異誘発(Vol.1)、哺乳動物細胞および酵母におけるクローニング(Vol.2)、複合多糖およびタンパク質発現(Vol.3)、ならびに生物情報学(Vol.4)について記載する、Ausubel,et al.(2001)Current Protocols in Molecular Biology,Vols.1-4,John Wiley and Sons,Inc.New York,N.Y.を参照されたい)。科学文献は、免疫沈降、クロマトグラフィー、電気泳動、遠心分離、および結晶化を含む、タンパク質精製、ならびに化学分析、化学修飾、翻訳後修飾、融合タンパク質の産生、およびタンパク質のグリコシル化のための方法について記載している(例えば、Coligan,et al.(2000)Current Protocols in Protein Science,Vols.1-2,John Wiley and Sons,Inc.,NYを参照されたい)。
本開示全体にわたって、アミノ酸は1文字表記または3文字表記に従って言及されることが理解される。読者の便宜のため、1文字および3文字表記を以下に提供する:
Figure 0007097465000001
別段示されない限り、以下の用語は、以下に明記される意味を有することが意図される。他の用語は、本明細書全体を通して別の箇所で定義される。別段定義されない限り、本明細書で使用される技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有すると解釈されるべきである。
B.定義:
活性:本明細書で使用される場合、「活性」という用語は、分子に関して使用され、システム(例えば、試験システムまたは生物学的機能、例えば、分子の別の分子への結合の程度、生物学的因子の触媒活性、遺伝子発現または細胞シグナル伝達、分化、または成熟を調節する能力、免疫応答などの免疫学的活性を調節する能力などに関する分子の特性を説明する。「活性」は、触媒活性(カタール)、結合活性(mol-1/L)、特定の活性、例えば、[触媒活性]/[mgタンパク質]、または[免疫学的活性]/[mgタンパク質]、国際単位(IU)、プラーク形成単位(pfu)、生物学的区画内の濃度などとして表され得る。「増殖活性」という用語は、例えば、細胞分裂、ならびに腫瘍性疾患、線維症、異形成、細胞形質転換、転移、および血管新生で観察されるような調節不全の細胞分裂を増強、促進する、それに必要であるか、またはそれと特異的に関連する、活性を包含する。
投与する/投与:「投与」および「投与する」という用語は、対象の細胞、組織、臓器、または体液をインビトロ、インビボ、またはエキソビボで薬剤(例えば、IL-10剤、CAR-T細胞、化学療法剤、抗体、チェックポイント経路調節剤、または前述のものを含む医薬製剤)と接触させることを含む、対象と接触する作用を指すために本明細書では互換的に使用される。薬剤の投与は、局所、静脈内(静脈内注入を含む)、皮内、皮下、筋肉内、腹腔内、頭蓋内、腫瘍内、皮下、経皮、経粘膜、リンパ内、胃内、前立腺内、血管内(静脈内、動脈内を含む)、膀胱内(例えば、膀胱へ)、イオン泳動、肺、眼内、腹腔内、病巣内、卵巣内、脳内、および脳室内注射(ICVI)などを含むが、これらに限定されない、様々な当該技術分野で認められた方法のいずれかを通して達成することができる。「投与」という用語は、薬剤を細胞に接触させること、および薬剤を流体(この流体は、細胞と接触している)に接触させることを含む。
有害事象:本明細書で使用される場合、「有害事象」という用語は、患者における治療剤または治療法の使用に関連する任意の望ましくない経験を指す。有害事象は、投与された薬剤によって引き起こされる必要はない。有害事象は、軽度、中等度、または重度であり得る。腫瘍性疾患の治療に関して本明細書で使用される有害事象の分類は、米国保健福祉省の国立衛生研究所国立癌研究所によって発行された、2017年11月27日付けの有害事象の一般用語基準v5.0(CTCAE)に準拠している。
親和性:本明細書で使用する「親和性」という用語は、その標的に分子(例えば、TCR、CAR、ARD、または抗体)の特異的結合の程度を指し、分子とその標的の間の解離定数(Koff)および分子とその標的の間の結合定数(Kon)の比率、Kとして表される結合反応速度によって測定される。本明細書で使用される場合、「高親和性」という用語は、K<10-7を有する分子に関して使用される。本発明の好ましいCARは、25℃で約100pM以下の標的抗原1に対するKを有する。本発明のより好ましいCARは、25℃で約10pM以下の腫瘍抗原に対する結合親和性を有する。
薬剤:本明細書で使用される場合、「薬剤」という用語は、識別可能な特徴を有し、インビトロまたはインビボで生物学的または化学的活性を示す分子(例えば、小分子もしくはポリペプチド)または治療法(例えば、外部ビーム放射線および内部放射線療法)を指す。
アゴニスト:本明細書で使用される場合、「アゴニスト」または「アクチベーター」という用語は、標的と相互作用して、標的の活性または標的へのリガンドの結合に関連する効果の増加を促進する、増強する、容易にするか、または引き起こす分子を指すために本明細書では互換的に使用される。アゴニストまたはアクチベーターの作用の非限定的な例には、核酸配列の転写および/または翻訳の増加、酵素の活性の増加、抗体のその標的への結合の動力学またはエネルギーの増加、TCRのその標的への結合、またはCARのその標的への結合が含まれ得る。
アンタゴニスト:本明細書で使用される場合、「アンタゴニスト」または「阻害剤」という用語は、例えば、遺伝子、タンパク質、リガンド、受容体、生物学的経路(免疫チェックポイント経路を含む)を、低下、遮断、予防、その活性化を遅延、不活性化、脱感作、または下方制御する分子を指すために本明細書では互換的に使用される。一態様では、アンタゴニストは、アゴニストの活性を防止、低減、阻害、または中和する。別の態様では、アンタゴニストは、特定されたアゴニストが存在しない場合でさえ、標的、例えば、標的受容体の活性を防止、阻害、または低減する。
抗体:本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は集合的に、(a)標的分子に特異的に結合するグリコシル化および非グリコシル化免疫グロブリン(哺乳動物免疫グロブリンクラスIgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4を含むがこれらに限定されない)、ならびに(b)標的分子への結合について、それが由来する免疫グロブリンと競合する、IgG(1-4)デルタC2、F(ab’)、Fab、ScFv、V、V、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、dsFv、F(ab’)、scFv-Fc、および(scFv)を含むがこれらに限定されない、免疫グロブリン誘導体を指す。抗体という用語は、任意の特定の哺乳動物種に由来する免疫グロブリンに制限されず、マウス、ヒト、ウマ、ラクダ、抗体、およびヒト抗体を含む。「抗体」という用語は、天然源から単離可能な天然に存在する抗体、ならびにモノクローナル抗体、二重特異性抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、CDR移植、ベニア、または(例えば、T細胞エピトープを除去するための)脱免疫化抗体を含む、操作された抗体を包含する。「抗体」という用語は、任意の特定の合成手段に限定されるものと解釈されるべきではなく、天然源から単離可能な天然に存在する抗体、ならびにヒト免疫グロブリン遺伝子またはそれらから調製されたハイブリドーマについてトランスジェニックであるトランスジェニック動物から単離された抗体、抗体の発現をもたらす核酸構築物で形質転換された宿主細胞から単離された抗体、ファージ提示ライブラリを含むコンビナトリアル抗体ライブラリから単離された抗体を含む、「組換え」手段によって得られる操作された抗体分子を含む。一実施形態において、「抗体」は、結合およびエフェクター機能を提供する可変ドメインおよび定常ドメインを含む「完全長抗体」である、哺乳動物免疫グロブリンである。ほとんどの場合、完全長抗体は、2つの軽鎖および2つの重鎖を含み、各軽鎖は、可変領域および定常領域を含む。一実施形態において、抗体は、2つの軽鎖および2つの重鎖を含む「完全長抗体」であり、各軽鎖は、結合およびエフェクター機能を提供する可変領域および定常領域を含む。好ましい実施形態において、定常領域および可変領域は、「ヒト」である(すなわち、ヒト免疫グロブリンに特徴的なアミノ酸配列を有する)。
CARまたはキメラ抗原受容体:本明細書で使用される場合、「キメラ抗原受容体」および「CAR」という用語は、配列のアミノ末端からカルボキシ末端に配置された多数の機能ドメインを含むポリタンパク質を指すために互換的に使用される:(a)シグナルペプチド配列、(b)細胞外抗原認識ドメイン(ARD)、(c)膜貫通ドメイン(TSD)、(d)前述のドメイン(a)~(d)が任意に1つ以上の(e)スペーサードメインによって連結され得る1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメイン(ISD)。「CAR」という用語はまた、シグナルペプチド配列の翻訳後の切断に続いて細胞中で発現されるポリタンパク質を指すためにも使用され、CARは、配列のアミノ末端からカルボキシ末端に配置された多数の機能ドメインを含む:(a)細胞外抗原認識ドメイン(ARD)、(b)膜貫通ドメイン(TSD)、(c)前述のドメイン(a)~(d)が任意に1つ以上のスペーサードメインによって連結され得る1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメイン(ISD)。
CAR-T細胞:本明細書で使用される場合、「キメラ抗原受容体T細胞」および「CAR-T細胞」という用語は、CARを発現するように組換え改変されたT細胞を指すために互換的に使用される。
CDR(複数可):本明細書で使用される場合、「CDR」または「相補性決定領域」という用語は、重鎖免疫グロブリンポリペプチドおよび軽鎖免疫グロブリンポリペプチドの両方の可変領域内に見出される非隣接の抗原結合部位を意味することを意図している。CDRは、Kabat et al.,(1977)J.Biol.Chem.252:6609-6616、Kabat,et al.,U.S.Dept.of Health and Human Services,“Sequences of proteins of immunological interest”(1991)(本明細書ではKabat 1991とも呼ばれる)、Chothia et al.(1987)J.Mol.Biol.196:901-917、およびMacCallum,et al.(1996)J.Mol.Biol.262:732-745によって記載されており、定義には、互いに比較したときのアミノ酸残基の重複またはサブセットが含まれる。それにもかかわらず、抗体または移植された抗体またはそれらのバリアントのCDRを指すためのいずれかの定義の適用は、本明細書で定義および使用される用語の範囲内にあることを意図している。本明細書におけるCDR位置の番号付けは、Kabatの番号付け規則に従って提供される。
循環腫瘍細胞:本明細書で使用される場合、「循環腫瘍細胞(CTC)」という用語は、対象の腫瘍体積から末梢循環へと脱落した腫瘍細胞を指す。
同等:本明細書で使用される場合、「同等」という用語は、評価可能な定性的または定量的パラメータの2つの測定における差異の程度を記載するのに使用される。例えば、評価可能なパラメータの第1の測定および評価可能なパラメータの第2の測定が、許容範囲(すなわち、当業者が、その状況における、2つの結果間の効果の統計的に有意な差をもたらさないと認識する範囲)を超えて逸脱しない場合に、2つの測定は、「同等」であると見なされ得る。場合によっては、1つの測定が、35%未満だけ、30%未満だけ、25%未満だけ、20%未満だけ、15%未満だけ、10%未満だけ、7%未満だけ、5%未満だけ、4%未満だけ、3%未満だけ、2%未満だけ、または1%未満だけ別の測定から逸脱する場合に、測定は、「同等」であると見なすことができる。特定の実施形態において、1つの測定は、それが15%未満だけ、10%未満だけ、または5%未満だけ参照標準から逸脱する場合に、参照標準と同等である。「同等の」という用語はまた、幸福感、食欲、エネルギー、無気力などのような定量化できない臨床的に評価可能なパラメータの改善などの定性的および定量的パラメータに関して使用され得る。
に由来する:本明細書で使用される場合、アミノ酸配列またはポリヌクレオチド配列(例えば、IL-10ポリペプチド「に由来する」アミノ酸配列)の文脈において使用される「に由来する」という用語は、ポリペプチドまたは核酸が、参照ポリペプチドまたは核酸(例えば、天然に存在するIL-10ポリペプチドまたはIL-10をコードする核酸)の配列に基づく配列を有することを示すことが意図され、タンパク質または核酸が作製される源または方法に関して限定的であることは意図されない。例えば、天然に存在するポリペプチドの配列に関して保存的アミノ酸置換を有する固相化学合成によって合成されたポリペプチドは、天然に存在するポリペプチドアミノ酸配列に由来すると見なされる。例として、「に由来する」という用語は、参照アミノ酸またはDNA配列のホモログまたはバリアントを含む。
ドライバー変異:本明細書で使用される場合、「ドライバー変異」という用語は、腫瘍の成長および生存に寄与し、それにより選択的利点を付与する腫瘍性細胞内の変異を指す。
濃縮された:本明細書で使用される場合、「濃縮された」という用語は、目的の分子が、(a)出発試料中の分子の濃度よりも高い濃度(例えば、少なくとも3倍高い、少なくとも4倍高い、少なくとも8倍高い、少なくとも64倍高い、もしくはそれ以上)で存在するように、試料が、(例えば、「人間の手」によって)非自然的に操作されることを指す。出発試料は、例えば、分子が天然に存在する試料(例えば、天然に存在する材料の試料)、または投与後に存在する試料、または分子が合成的に調製された環境の試料(例えば、組換え細菌細胞培養、化学合成、細胞培養上清などから得られる試料)であり得る。分子の試料は、環境またはその合成環境に関して分子の純度が向上している可能性があるが、実質的に純粋ではない可能性がある。
IL-10剤:本明細書で使用される場合、「IL-10剤」という用語は、分子が、(a)IL-10受容体に結合し、その結合が、IL-10として1つ以上のシグナル伝達経路の調節をもたらすことができ、(b)IL-10に特徴的な生物学的応答を誘発することができる、2つのIL-10ポリペプチドを含むIL-10活性を有する、二量体分子を指す。IL-10剤という用語は、アミノ酸の置換、欠失、または修飾(IL-10類似体およびIL-10バリアント)ならびに修飾されたIL-10剤(例えば、ペグ化IL-10)を含む、IL-10分子を含む。
IL-10類似体:本明細書で使用される場合、「IL-10類似体」という用語は、IL-10と同じ作用機構を通して作動し(すなわち、IL-10受容体、およびIL-10に類似した様式でIL-10と同じシグナル伝達経路を調節する薬剤に結合し、その活性を調節し)、IL-10と同等の(またはそれを超える)生物学的応答を誘発することができる、IL-10剤を指す。
ポリペプチド類似体:本明細書で使用される場合、「ポリペプチド類似体」という用語は、それらが由来する親ポリペプチドと同じ作用機構を作動し(すなわち、親ポリペプチドの受容体、および親ポリペプチドに類似した様式で親ポリペプチドと同じシグナル伝達経路を調節する薬剤に特異的に結合し、その活性を調節し)、親ポリペプチドと同等の(またはそれを超える)生物学的応答を誘発することができる、ポリペプチド薬剤を指す。本発明の実施において有用なポリペプチド類似体の例には、IL-10ポリペプチド類似体、IL-12ポリペプチド類似体、IL-7ポリペプチド類似体、IL-15ポリペプチド類似体、IL-2ポリペプチド類似体、およびIL-18ポリペプチド類似体が含まれるが、これらに限定されない。
変化をもたらすのに十分な量で:「変化をもたらすのに十分な量で」という語句は、特定の薬剤の投与前に測定された指標のレベル(例えば、ベースラインレベル)とその投与後のレベルとの間に検出可能な差異が存在することを意味するために本明細書で使用される。指標には、任意の客観的パラメータ(例えば、体温、IL-10の血清中濃度)または主観的パラメータ(例えば、対象の幸福感)が含まれる。「変化をもたらすのに十分な」量は、治療上有効な量であり得るが、「変化をもたらすのに十分な」そのような量は、治療上有効な量よりも多くても少なくてもよい。
と併用して:本明細書で使用される場合、「と併用して」という用語は、対象への第1の薬剤および第2の薬剤の投与を指す。本発明の目的のために、第1の薬剤および第2の薬剤の治療効果が重複するように、第1の薬剤の投与から生じる生物学的効果が、第2の薬剤の投与の時点で対象において持続している場合に、1つの薬剤(例えば、IL-10剤)は、第2の薬剤(例えば、CAR-T細胞)と併用して投与されるものと見なされる。例えば、市販のCAR-T細胞療法(例えば、Kymriah商標のチサゲンレクロイセル)は、典型的には、頻度が低く(または1回のみ)、投与される一方で、hIL-10またはペグ化hIL-10などの本開示によって企図される分子と併用される薬剤は、一般的には、1日1回皮下投与される。しかしながら、第1の薬剤の投与が、長期間にわたって治療効果を提供し、第2の薬剤の投与が、第1の薬剤の治療効果が依然として進行中である間に、その治療効果を提供することで、第1の薬剤が、第2の薬剤の投与の時点から有意に離れた(例えば、数日間または数週間)時点で投与されているにも関わらず、第2の薬剤は、第1の薬剤と併用して投与されるものと見なされる。「と併用して」という用語はまた、第1の薬剤および第2の薬剤が同時にまたは同時期に投与される状況も指す。本開示の文脈において、第1および第2の薬剤が互いに30分以内に投与される場合、第1の薬剤は、第2の薬剤と同時に投与されるものと見なされる。本開示の文脈において、第1および第2の薬剤が、互いに約24時間以内、好ましくは互いに約12時間以内、好ましくは互いに約6時間以内、好ましくは互いに約2時間以内、または好ましくは互いに約30分以内に投与される場合、第1の薬剤は、第2の薬剤と「同時期に」投与されるものと見なされる。「と併用して」という用語はまた、第1の薬剤および第2の薬剤が単一の医薬的に許容される製剤で共製剤化され、第1および第2の薬剤を含む共製剤が対象に投与される状況にも適用されるものと理解されるものとする。
治療を必要とする:本明細書で使用される「治療を必要とする」という用語は、対象が治療を必要とするまたは治療から益を得るであろうという医師または他の介護者によって下される判断を指す。この判断は、医師または介護者の専門知識の領域にある多様な因子に基づいて下される。
予防を必要とする:本明細書で使用される「予防を必要とする」という用語は、対象が予防的ケアを必要とする、または予防的ケアから益を得るであろうという医師または他の介護者によって下される判断を指す。この判断は、医師または介護者の専門知識の領域にある多様な因子に基づいて下される。
阻害剤:阻害剤は、例えば、遺伝子、タンパク質、リガンド、受容体、または細胞を減少させる、遮断する、防止する、活性化を遅らせる、不活性化する、脱感作する、または下方調節する分子である。阻害剤はまた、構成的活性を低減、遮断、または不活性化する分子としても定義され得る。
腫瘍内異質性:本明細書で使用される場合、「腫瘍内異質性(ITH)」という用語は、対象における腫瘍内、または同じ患者における個々の腫瘍病変間の細胞の遺伝的変動および表現型の変動を指す。
単離された:ポリペプチドの文脈において、「単離された」という用語は、天然に存在する場合、天然に存在することができる環境とは異なる環境に存在する、目的とするポリペプチドを指す。「単離された」は、目的とするポリペプチドが実質的に富化された、および/または目的とするポリペプチドが部分的にまたは実質的に精製された試料中にあるポリペプチドを含むことを意味する。ポリペプチドが天然に存在しない場合、「単離された」は、ポリペプチドが、合成手段または組換え手段のいずれかによって作製された環境から分離されたことを示す。
Kabat番号付け:本明細書で使用される、「Kabat番号付け」という用語は、当該技術分野で認識されており、免疫グロブリンの重鎖および軽鎖領域における他のアミノ酸残基よりも可変的である(例えば、超可変である)アミノ酸残基を番号付けするシステムを指す(Kabat,et al.,Ann.NY Acad.Sci.190:382-93(1971)、Kabat,et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242(1991))。本開示の目的のために、抗体の可変領域におけるCDRの配置は、Kabat番号付け、または単に「Kabat」に従う。
リガンド:本明細書で使用される場合、リガンドという用語は、それが結合する生体分子の活性に変化をもたらすように、生体分子に結合し、それと複合体を形成する分子を指す。一実施形態において、「リガンド」という用語は、受容体のアゴニストまたはアンタゴニストとして作用し得る、分子またはその複合体を指す。「リガンド」は、天然および合成のリガンド、例えば、サイトカイン、サイトカインバリアント、類似体、変異タンパク質、および抗体に由来する結合組成物を包含する。「リガンド」はまた、小分子、サイトカインのペプチド模倣体、および抗体のペプチド模倣物を包含する。リガンドという用語はまた、アゴニストでもアンタゴニストでもないが、受容体がその生物学的活性(例えば、シグナル伝達、触媒作用、または接着)を保持する(またはその活性の増強を示す)ことを可能にしつつ、受容体に結合することができる分子を包含する。さらに、この用語は、例えば、化学法または組換え法によって、膜結合リガンドの可溶性バージョンに変換される膜結合リガンドを含む。リガンドまたは受容体は、完全に細胞内にあってもよく、すなわち、それは、サイトゾル、核、またはいくつかの他の細胞内コンパートメントに存在することができる。リガンドおよび受容体の複合体は、「リガンド-受容体複合体」と称される。
転移:本明細書で使用される場合、「転移」という用語は、原発腫瘍から周辺組織および対象の遠隔臓器への癌細胞の蔓延を記載する。
修飾ポリペプチド剤:「修飾ポリペプチド剤」という用語は、ペグ化グリコシル化(N結合およびO結合);ポリシアリル化;血清アルブミン(例えば、ヒト血清アルブミン(HSA)、カニクイザル血清アルブミン、またはウシ血清アルブミン(BSA))を含むアルブミン融合分子;例えば、共役脂肪酸鎖を通したアルブミン結合(アシル化);ならびにFc融合タンパク質などの1つ以上の修飾によって修飾されたポリペプチドである。修飾IL-10剤は、1つ以上の特性、例えば、免疫原性の調節;水溶性、生体利用能、血清半減期および/もしくは治療半減期を増大させる方法;ならびに/または生物学的活性の調節を増強するために調製することができる。ある特定の修飾はまた、免疫原性を増強するために、例えば、検出アッセイで使用するための抗体(例えば、ジフテリアまたはテタンタス毒素およびそれらの断片およびトキソイド、エピトープタグなどの免疫原性担体分子)を生じさせるため、および/または精製(例えば、ポリヒスチジル配列などの遷移金属イオンキレートペプチド配列)を促進するために有用であり得る。本発明の実施に有用な修飾ポリペプチド剤の例には、修飾ポリペプチドIL-10剤、修飾ポリペプチドIL-12剤、修飾ポリペプチドIL-7剤、修飾ポリペプチドIL-15剤、修飾ポリペプチドIL-2剤、および修飾ポリペプチドIL-18剤が含まれるが、これらに限定されない。
調節する:本明細書で使用される場合、「調節する」および「調節」などの用語は、薬剤が生物系を含む系または生化学的経路において、正もしくは負、または直接的もしくは間接的に応答をもたらす能力を指す。調節剤という用語は、アゴニストおよびアンタゴニストの両方を含む。
腫瘍性疾患:本明細書で使用される場合、「腫瘍性疾患」という用語は、細胞の過剰増殖または制御されない(もしくは制御不全の)細胞複製から生じる、対象における障害または病態を指す。腫瘍性疾患という用語は、対象における腫瘍の存在から生じる障害を指す。腫瘍は、(1)良性、(2)前悪性(または「前癌性」)、または(3)悪性(または「癌性」)として分類することができる。「腫瘍性疾患」という用語は、腫瘍性疾患に直接的または間接的に関連する病態を指す、腫瘍性関連疾患、障害、および病態を含み、例えば、血管新生および前癌性病態(異形成など)を含む。
N末端:ポリペプチドの構造との関連において本明細書で使用される場合、「N末端」(または「アミノ末端」)および「C末端」(または「カルボキシ末端」)は、それぞれ、ポリペプチドのアミノ極端およびカルボキシル極端を指し、「N末端」および「C末端」という用語は、それぞれ、N末端およびC末端に対するポリペプチドのアミノ酸配列の相対位置を指し、それぞれ、N末端およびC末端で残基を含み得る。「最N末端の」または「最C末端の」は、第1および第2のアミノ酸残基が共有結合して、近接するアミノ酸配列を提供する、第2のアミノ酸残基に対する第1のアミノ酸残基の位置を指す。
核酸:「核酸」、「核酸分子」、「ポリヌクレオチド」などの用語は、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態、デオキシリボヌクレオチドもしくはリボヌクレオチドのいずれか、またはそれらの類似体を指すために本明細書では互換的に使用される。ポリヌクレオチドの非限定的な例には、線状および環状の核酸、メッセンジャーRNA(mRNA)、相補的DNA(cDNA)、組換えポリヌクレオチド、ベクター、プローブ、およびプライマーなどが含まれる。
癌遺伝子中毒:本明細書で使用される場合、「癌遺伝子中毒」という用語は、癌細胞の生存が、変異した癌遺伝子の継続的な活性に依存する現象を指す。
パッセンジャー変異:本明細書で使用される場合、「パッセンジャー変異(複数可)」という用語は、変異速度の増加の結果として腫瘍の発生中に生じるが、腫瘍の成長には寄与しない変異(複数可)を指す。
PD-1:本明細書で使用される場合、「PD-1」(または「PD1」)という用語は、以下のアミノ酸配列を有する288アミノ酸のポリペプチドを指す:
MQIPQAPWPV VWAVLQLGWR PGWFLDSPDR PWNPPTFSPA LLVVTEGDNA TFTCSFSNTS ESFVLNWYRM SPSNQTDKLA AFPEDRSQPG QDCRFRVTQL PNGRDFHMSV VRARRNDSGT YLCGAISLAP KAQIKESLRA ELRVTERRAE VPTAHPSPSP RPAGQFQTLV VGVVGGLLGS LVLLVWVLAV ICSRAARGTI GARRTGQPLK EDPSAVPVFS VDYGELDFQW REKTPEPPVP CVPEQTEYAT IVFPSGMGTS SPARRGSADG PRSAQPLRPE DGHCSWPL(配列番号58)
PD-1のアミノ酸残基の番号付けは、配列番号58に示される完全長ポリペプチドを指す。配列番号58のアミノ酸1~20は、翻訳処理中に除去され、配列番号58のアミノ酸21~288を含む「成熟PD1」分子をもたらす、シグナル配列を定義する。配列番号58のアミノ酸171~191は、膜貫通ドメインを定義し、残基192~288は、細胞質ドメインを定義する。PD-1という用語には、215位でアラニンがバリンに置換された天然に存在するバリアントを含む天然に存在するバリアントが含まれる。アミノ酸21~170は、以下のアミノ酸配列を有するPD-1の150アミノ酸の細胞外ドメインを定義する。
PGWFLDSPDR PWNPPTFSPA LLVVTEGDNA TFTCSFSNTS ESFVLNWYRM SPSNQTDKLA AFPEDRSQPG QDCRFRVTQL PNGRDFHMSV VRARRNDSGT YLCGAISLAP KAQIKESLRA ELRVTERRAE VPTAHPSPSP RPAGQFQTLV(配列番号59)
細胞外ドメインは、残基49、58、74、および116に4つのグリコシル化部位を有し、残基54と123の間にジスルフィド結合が存在する。
PD1受容体(複数可):本明細書で使用される場合、PD1受容体という用語は、B7-H1/PD-L1(以下「PD-L1」)およびB7-DC/PD-L2以下「PD-L2」)からなる群のいずれかを指す。
PEG-IL10:ポリエチレングリコール分子との共有結合修飾によって修飾された修飾IL-10剤を指す。「PEG-IL-10剤」という用語は、IL-10ポリペプチドの少なくとも1つのアミノ酸残基に共有結合(共役)した少なくとも1つのポリエチレングリコール(PEG)分子を含む修飾IL-10剤を指す。「モノペグ化IL-10剤」および「モノ-PEG-IL-10剤」という用語は、一般にリンカーを介して、IL-10二量体の1つのIL-10ポリペプチド上の単一のアミノ酸残基に共有結合したポリエチレングリコール分子を有するIL-10剤を指す。本明細書で使用される場合、「ジペグ化IL-10」および「ジ-PEG-IL-10」という用語は、少なくとも1つのポリエチレングリコール分子が、一般にリンカーを介して、IL-10二量体のIL-10ポリペプチド上の単一の残基に結合していることを示す。
ポリペプチド:本明細書で互換的に使用される「ポリペプチド」、「ペプチド」、および「タンパク質」という用語は、任意の長さのアミノ酸のポリマー形態を指し、遺伝子的にコードされたおよび遺伝子的にコードされていないアミノ酸、化学的または生化学的に修飾または誘導体化されたアミノ酸、ならびに修飾されたポリペプチド骨格を有するポリペプチドを含み得る。ポリペプチドという用語は、異種アミノ酸配列を有する融合タンパク質(例えば、キメラ抗原受容体)、異種および同種のリーダー配列を有する融合タンパク質、N末端のメチオニン残基を有するかまたは有しない融合タンパク質、免疫学的に標識されたタンパク質を有する融合タンパク質、免疫学的に活性なタンパク質の融合タンパク質(例えば、抗原性ジフテリアもしくは破傷風毒素断片)などを含むが、これらに限定されない、多数の機能的ドメインからなる隣接するポリマーアミノ酸配列を含む。
予防する:「予防する」、「予防すること」、および「予防」などの用語は、対象が(例えば、臨床症状の不在によって決定される)疾患、障害、もしくは病態などを発症する、または一般に特定の疾患、障害、もしくは病態を有する遺伝的、経験的、もしくは環境因子により影響を受けやすい対象の文脈において、それらの発症を遅延させるリスクを一時的もしくは永続的に予防、抑制、阻害、または低減するために、疾患、障害、病態、またはそれらの症状の発症前に、対象に対して開始される作用の過程を指す。場合によっては、「予防する」、「予防すること」、「予防」という用語はまた、疾患、障害、または病態の進行を遅らせること、またはより有害なもしくはあまり望ましくない状態への進行を遅らせることを指すために使用される。予防接種は、予防の一例である。
組換え:本明細書で使用される場合、「組換え」という用語は、組換えDNA技術を使用して生成されたポリペプチドおよび核酸を指す。分子に関して、例えば、「組換えヒトIL-10」または「rhIL-10」は、分子が形質転換された宿主細胞に発現する(および任意に分泌する)ように、分子(またはそのサブユニット)をコードする核酸配列で形質転換された宿主細胞などによって組換えDNA技術によって生成された分子を示すために使用される。組換えDNA技術のための技術およびプロトコルは、本発明が関係する当業者によく知られている。
応答:例えば、細胞、組織、臓器、または生物体の「応答」という用語は、生化学的または生理学的挙動、例えば、生物学的コンパートメント内の濃度、密度、接着、もしくは移動、遺伝子発現率、または分化の状態における変化を包含し、その変化が、活性化、刺激、もしくは処理、または遺伝子プログラミングなどの内部機構と相関する。ある特定の文脈において、「活性化」、「刺激」などの用語は、内部機構および外部または環境因子によって調節される細胞活性化を指し、「阻害」、「下方調節」などの用語は、逆の効果を指す。
小分子(複数可):「小分子」という用語は、約10kDa未満、約2kDa未満、または約1kDa未満の分子量を有する、化学化合物を指す。小分子には、無機分子、有機分子、無機構成成分を含有する有機分子、放射性原子を含有する分子、および合成分子が含まれるが、これらに限定されない。治療的には、最も大きな分子と比較して、小分子は、細胞透過性の向上、腸からの吸収の改善、免疫原性の低下、および特に高温での安定性の向上をもたらすことが観察されている。「小分子」という用語は、製薬分野の当業者によく理解されている用語である。
特異的に結合する:「特異的に結合する」という用語は、1つの分子が別の分子に結合する選択性または親和性の程度を指すために本明細書で使用される。結合対(例えば、リガンド/受容体、抗体/抗原、抗体/リガンド、抗体/受容体結合対)の文脈において、結合対の第1の分子が、試料中に存在する他の構成成分に有意な量で結合しない場合に、結合対の第1の分子は、結合対の第2の分子に特異的に結合すると言われる。第2の分子に対する第1の分子の親和性が、試料中に存在する他の構成成分に対する第1の分子の親和性よりも、少なくとも2倍高い、少なくとも10倍高い、少なくとも20倍高い、または少なくとも100倍高い場合に、結合対の第1の分子は、結合対の第2の分子に特異的に結合すると言われる。特定の実施形態において、結合対の第1の分子が抗体である場合、結合対の第2の分子に対する抗体の親和性が、例えば、スキャッチャード分析(Munsen,et al.1980Analyt.Biochem.107:220-239)によって決定されるように、約10リットル/モルよりも高いか、あるいは約1010リットル/モルよりも高いか、約1011リットル/モルよりも高いか、約1012リットル/モルよりも高い場合に、抗体は、結合対の第2の分子(例えば、タンパク質、抗原、リガンド、または受容体)に特異的に結合する。特異的結合は、競合ELISA、BIACORE(登録商標)アッセイ、および/またはKINEXA(登録商標)アッセイを含むが、これらに限定されない、当該技術分野で既知の技術を使用して評価することができる。
対象:「患者」または「対象」という用語は、ヒトまたは非ヒト動物を指すために互換的に使用される。哺乳動物対象の例には、スーパーファミリーCercopithecoideaおよびHominoideaのメンバー、特にヒトを含むヒト科のメンバーが含まれるが、これらに限定されない。「対象」という用語はまた、イヌ科(Canis familiarisを含む)、ネコ科(ネコ科およびネコ属の種、具体的には、特にイエネコ(Felis catus)を含む)、ウマ科(特に、飼いならされたウマなどのウマ属の種を含む)、ならびにウシ科(ウシ(Bos taurus)などのウシ族の種を含む)のメンバーも含まれる。
に罹患している:本明細書で使用される場合、「に罹患している」という用語は、決定が、X線、CTスキャン、従来の研究室診断検査(例えば、血球数など)、ゲノムデータ、タンパク質発現データ、病状の免疫組織化学検査を含むが、これらに限定されない、疾患、障害、または病態の特定のために、当該分野で一般に受け入れられる入手可能な情報に基づいた対象に関して、ならびに対象が必要とするか、または治療から益を得るであろう、医師によって行われる、疾患に関して使用される。
実質的に純粋な:本明細書で使用される場合、「実質的に純粋な」という用語は、ある構成成分(例えば、ポリペプチド)が、組成物の総含有量の約50%超および典型的には総ポリペプチド含有量の約60%超を占めることを示す。より典型的には、「実質的に純粋な」は、全組成物の少なくとも75%、少なくとも85%、少なくとも90%、またはそれ以上が、目的の構成成分である、組成物を指す。いくつかの場合には、ポリペプチドは、組成物の全含有量の約90%超、または約95%超を構成することになる。
治療上有効な量:本明細書で使用される、「治療上有効な量」という語句は、単独であれ医薬組成物または治療レジメンの一部としてであれ、単回用量であれ一連の用量の一部としてであれ、対象に投与されたときに疾患、障害、または病態の任意の症状、側面、もしくは特徴に対して任意の検出可能なプラスの効果を有することが可能な量での、薬剤の対象への投与を指す。治療上有効量は、関連性のある生理学的効果を測定することによって確認することができ、それは、投薬レジメンおよび対象の病態の診断的分析などに関連して調整することができる。例として、投与後に生成される炎症性サイトカインの量の測定は、治療上有効な量が使用されたかどうかを示すことができる。薬剤の治療上有効な量の決定に寄与するものには、年齢、体重、性別、全身健康、ECOGスコア、観察可能な生理学的パラメータなどの容易に識別可能な兆候が含まれるが、これらに限定されない。あるいは、または加えて、臨床設定で一般的に評価される他のパラメータをモニタリングして、体温、心拍数、血液化学の正常化、血圧の正常化、コレステロール値の正常化、または疾患、障害、もしくは病態の任意の症状、側面、もしくは特徴、バイオマーカー(炎症性サイトカイン、IFN-γ、グランザイムなど)、血清腫瘍マーカーの減少、固体腫瘍における反応評価基準(RECIST)の改善、免疫関連応答基準(irRC)の改善、生存期間の延長、無増悪生存率の延長期間、無増悪期間の延長、治療失敗までの期間の増加、無事象生存期間の延長期間、次の治療までの期間の延長、客観的奏効率の改善、奏効期間の改善、薬剤の投与に応答した対象の病態の改善を評価するために、現場の臨床医によって信頼される腫瘍負荷の減少、完全応答、部分応答、安定疾患などの治療上有効な量の薬剤が対象に投与されたかどうかを決定することができる。本明細書で使用される場合、標的病変に関する「完全応答(CR)」、「部分応答(PR)」、「安定疾患(SD)」、および「進行性疾患(PD)」という用語、ならびに非標的病変に関する「完全応答(CR)」、「不完全反応/安定疾患(SD)」、および進行性疾患(PD)という用語は、RECIST基準で定義されているとおりであると理解される。本明細書で使用される場合、「免疫関連完全応答(irCR)」、「免疫関連部分応答(irPR)」、「免疫関連進行性疾患(irPD)」、および「免疫関連安定疾患(irSD)」という用語は、免疫関連応答基準(irRC)に従って定義されるとおりである。本明細書で使用される場合、「免疫関連応答基準(irRC)」という用語は、Wolchok,et al.(2009)Guidelines for the Evaluation of Immune Therapy Activity in Solid Tumors:Immune-Related Response Criteria,Clinical Cancer Research15(23):7412-7420に記載の免疫療法に対する応答の評価のためのシステムを指す。治療上有効な量は、投薬レジメンおよび/または対象の病態の評価、ならびに前述の因子の変動に関連して、対象の治療の過程にわたって調整することができる。一実施形態において、治療上有効な量は、単独で、または別の薬剤と併用して使用した場合に、哺乳動物対象への投与の過程で、不可逆的で深刻な有害事象をもたらさない薬剤の量である。
治療:「治療する」、「治療すること」、「治療」などの用語は、疾患、障害、もしくは病態、またはそれらの症状が診断された、観察された、および同様のことの後に開始される、対象が罹患した疾患、障害、もしくは病態の根本的な原因のうちの少なくとも1つ、または対象が罹患した疾患、障害、もしくは病態に関連する症状のうちの少なくとも1つを、一時的であれ永続的であれ、排除する、低減する、抑制する、軽減する、または寛解させるような行為の過程(IL-10、CAR-T細胞、またはそれらを含む医薬組成物を投与することなど)を指す。治療は、行為の過程が、対象における疾患の阻害をもたらす(例えば、疾患、障害、または病態の発症を阻止するか、またはそれに関連する1つ以上の症状を改善する)場合に、疾患に罹患している対象に関して取られる行動の過程を含む。
バリアント:本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、天然に存在するバリアントおよび天然に存在しないバリアントを包含する。天然に存在する変異体には、相同体(それぞれアミノ酸またはヌクレオチド配列が種ごとに異なるポリペプチドおよび核酸)、ならびに対立遺伝子変異体(それぞれアミノ酸またはヌクレオチド配列がある種において個体ごとに異なるポリペプチドおよび核酸)が含まれる。天然に存在しないバリアントには、それぞれ、アミノ酸またはヌクレオチド配列の変化を含むポリペプチドおよび核酸が含まれ、配列の変化は、人工的に導入され(例えば、変異タンパク質)、例えば、変化は、人間の介入(「人の手」)によって研究室で生成される。したがって、本明細書において「変異タンパク質」は、通常、単一または多数のアミノ酸置換を有し、部位特異的またはランダム突然変異誘発を受けたクローン化遺伝子、または完全に合成されたコード配列にしばしば由来する変異組換えタンパク質を広く指す。例示的なIL-10変異タンパク質は、2015年2月2日公開のEatonらの米国特許出願公開第S2015/0038678A1号、2003年10月2日公開のHansenらの米国特許出願公開第US203/0186386A1号、および2016年3月10日公開のVan Vlasselaerらの米国特許出願公開第US2016/0068583A1号に記載されている。本発明の実施に有用なポリペプチド類似体の例には、IL-10ポリペプチドバリアント、IL-12ポリペプチドバリアント、IL-7ポリペプチドバリアント、IL-15ポリペプチドバリアント、IL-2ポリペプチドバリアント、およびIL-18ポリペプチドバリアントが含まれるが、これらに限定されない。
C.IL-10ポリペプチド:
IL-10ポリペプチドという用語は、広く解釈されるべきであり、それには、例えば、相同体、バリアント(変異タンパク質を含む)、およびそれらの断片を含む、ヒトおよび非ヒトIL-10関連ポリペプチド、ならびに例えば、リーダー配列(例えば、シグナルペプチド)を有するIL-10ポリペプチド、ならびに前述のものの修飾バージョンが含まれる。さらなる特定の実施形態において、IL-10、IL-10ポリペプチド(複数可)、およびIL-10剤(複数可)は、アゴニストである。
「IL10ポリペプチド」という用語は、保存的アミノ酸置換を含むIL-10ポリペプチドを含む。「保存的アミノ酸置換」という用語は、タンパク質中のアミノ酸(複数可)を、その側鎖と類似の酸性度、塩基性度、電荷、極性、またはサイズの側鎖を有するアミノ酸で置き換えることによって、タンパク質の活性を保存する置換を指す。保存的アミノ酸置換は、一般に、次の群(a)L、I、M、V、F;(b)R、K;(c)F、Y、H、W、R;(d)G、A、T、S;(e)Q、N;および/または(f)D、E内のアミノ酸残基の置換を伴う。置換、挿入、または欠失のガイダンスは、異なるバリアントタンパク質または異なる種からのタンパク質のアミノ酸配列のアラインメントに基づくことができる。したがって、任意の天然に存在するIL-10ポリペプチドに加えて、本開示は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の置換、挿入、または欠失を有するIL-10ポリペプチドを企図する。いくつかの実施形態において、IL-10ポリペプチドは、20、10、または5個以下のアミノ酸置換、挿入、または欠失を有し、置換は、通常、保存的アミノ酸置換である。
場合によっては、IL-10ポリペプチドは、ペプチド結合以外の1つ以上の結合を含み、例えば、少なくとも2つの隣接するアミノ酸は、望ましくないタンパク質分解もしくは他の分解手段を低減または排除するように、および/または血清安定性を増加させるように、および/または構造的柔軟性を制限もしくは増加させるように、アミド結合以外の結合を介して接合され、IL-10のバックボーン内の1つ以上のアミド結合は、置換されてもよい。IL-10ポリペプチド中の1つ以上のアミド結合(-CO-NH-)は、-CH2NH-、-CH2S-、-CH2CH2-、-CH=CH-(シスおよびトランス)、-COCH2-、-CH(OH)CH-、または-CHSO-などのアミド結合の同配体である結合で置き換えることができる。IL-10中の1つ以上のアミド結合はまた、例えば、還元同配体偽ペプチド結合によって置き換えることもできる。Couder et al.(1993)Int.J.Peptide Protein Res.41:181-184を参照されたい。そのような置換およびそれらに影響を及ぼす方法は、当業者に既知である。
「IL10ポリペプチド」という用語は、a)アラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、ノルロイシン、(S)-2-アミノ酪酸、(S)-シクロヘキシルアラニンまたは分岐、環状、および直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニル置換を含むC-C10炭素の脂肪族側鎖によって置換されている他の単純なα-アミノ酸を含む、アルキル置換疎水性アミノ酸の置換、b)フェニルアラニン、トリプトファン、チロシン、スルホチロシン、ビフェニルアラニン、1-ナフチルアラニン、2-ナフチルアラニン、2-ベンゾチエニルアラニン、3-ベンゾチエニルアラニン、ヒスチジン(上記に列挙した芳香族アミノ酸のアミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アザ、ハロゲン化(フルオロ、クロロ、ブロモ、もしくはヨード)、または(C-C由来の)アルコキシ置換形態を含み、これらの例示となる例は、2-、3-、または4-アミノフェニルアラニン、2-、3-、または4-クロロフェニルアラニン、2-、3-、または4-メチルフェニルアラニン、2-、3-、または4-メトキシフェニルアラニン、5-アミノ-、5-クロロ-、5-メチル-、または5-メトキシトリプトファン、2’-、3’-、または4’-アミノアラニン、2’-、3’-、または4’-クロロアラニン、2、3、または4-ビフェニルアラニン、2’-、3’-、または4’-メチルアラニン、2-、3-、または4-ビフェニルアラニン、および2-または3-ピリジルアラニンである)を含む、芳香族置換疎水性アミノ酸の置換、c)アルギニン、リジン、ヒスチジン、オルニチン、2,3-ジアミノプロピオン酸、ホモアルギニン(置換がヘテロ原子(α-窒素または遠位の窒素(複数可)など)上にあるかα-炭素(例えば、プロ-R位におけるもの)上にあるかに関わらず、前のアミノ酸の(C-C10分岐状、直鎖状、または環状由来の)アルキル、アルケニル、またはアリール置換誘導体を含む)を含む、塩基性側鎖を含有するアミノ酸の置換、が含まれるが、これらに限定されない、1つ以上のアミノ酸置換を含むIL-10ポリペプチドを含む。例示となる例として機能する化合物には、N-イプシロン-イソプロピル-リジン、3-(4-テトラヒドロピリジル)-グリシン、3-(4-テトラヒドロピリジル)-アラニン、N,N-ガンマ、ガンマ’-ジエチル-ホモアルギニンが挙げられる。α-メチル-アルギニン、α-メチル-2,3-ジアミノプロピオン酸、α-メチル-ヒスチジン、α-メチル-オルニチンなどの化合物もまた挙げられ、アルキル基は、α-炭素のプロ-R位を占める。アルキル、芳香族、ヘテロ芳香族(ヘテロ芳香族基が、1つ以上の窒素、酸素、または硫黄原子を単独または組み合わせで有する場合)、カルボン酸、または多くの周知の活性化誘導体のいずれか(塩化物、活性エステル、活性アゾリド、および関連誘導体など)から形成されるアミド、ならびにリジン、オルニチン、または2,3-ジアミノプロピオン酸、d)アスパラギン酸、グルタミン酸、ホモグルタミン酸、2,4-ジアミノプリオピオン酸、オルニチン、またはリジンのチロシン、アルキル、アリール、アリールアルキル、およびヘテロアリールスルホンアミド、ならびにテトラゾール置換アルキルアミノ酸を含む、酸性アミノ酸の置換、e)アスパラギン、グルタミン、およびアスパラギンまたはグルタミンのアルキルまたは芳香族置換誘導体を含む、側鎖アミド残基の置換、ならびにf)セリン、スレオニン、ホモセリン、2,3-ジアミノプロピオン酸、およびセリンまたはスレオニンのアルキルまたは芳香族置換誘導体を含む、ヒドロキシル含有アミノ酸の置換もまた挙げられる。
「IL10ポリペプチド」という用語は、1つ以上の天然に存在する非遺伝的にコードされたL-アミノ酸、合成L-アミノ酸、またはアミノ酸のD-鏡像異性体を含むIL-10ポリペプチドを含む。例えば、IL-10は、D-アミノ酸のみを含んでもよい。例えば、IL-10ポリペプチドは、以下の残基、ヒドロキシプロリン、β-アラニン、o-アミノ安息香酸、m-アミノ安息香酸、p-アミノ安息香酸、m-アミノメチル安息香酸、2,3-ジアミノプロピオン酸、α-アミノイソ酪酸、N-メチルグリシン(サルコシン)、オルニチン、シトルリン、t-ブチルアラニン、t-ブチルグリシン、N-メチルイソロイシン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、ノルロイシン、ナフチルアラニン、ピリジルアラニン3-ベンゾチエニルアラニン、4-クロロフェニルアラニン、2-フルオロフェニルアラニン、3-フルオロフェニルアラニン、4-フルオロフェニルアラニン、ペニシラミン、1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-3-カルボン酸、β-2-チエニルアラニン、メチオニンスルホキシド、ホモアルギニン、N-アセチルリジン、2,4-ジアミノ酪酸、rho-アミノフェニルアラニン、N-メチルバリン、ホモシステイン、ホモセリン、ε-アミノヘキサン酸、ω-アミノヘキサン酸、ω-アミノヘプタン酸、ω-アミノオクタン酸、ω-アミノデカン酸、ω-アミノテトラデカン酸、シクロヘキシルアラニン、α,γ-ジアミノ酪酸、α,β-ジアミノプロピオン酸、δ-アミノ吉草酸、および2,3-ジアミノ酪酸の1つ以上を含んでもよい。
「IL10ポリペプチド」という用語は、IL-10ポリペプチドがジスルフィド結合を介して別のポリペプチドに結合するのを促進するため、またはIL-10ポリペプチドの環化を提供するための、1つ以上の追加のシステイン残基またはシステイン類似体を含むIL-10ポリペプチドを含む。システインまたはシステイン類似体を導入する方法は、当該技術分野で既知であり、例えば、米国特許第8,067,532号を参照されたい。
「IL10ポリペプチド」という用語は、環化ポリペプチドを含む。環化結合は、架橋の導入を可能にする官能基を有するアミノ酸の任意の組み合わせを用いて(またはアミノ酸および-(CH2)-CO-または-(CH2)-C-CO-を用いて)生成することができる。いくつかの例は、ジスルフィド、ジスルフィド模倣物(-(CH2)-カルバ架橋など)、チオアセタール、チオエーテル架橋(シスタチオニンまたはランチオニン)、ならびにエステルおよびエーテルを含有する架橋である。これらの例では、nは、任意の整数であり得るが、しばしば10未満である。
「IL10ポリペプチド」という用語は、例えば、N-アルキル(またはアリール)置換(ψ[CONR])、またはラクタムおよび他の環状構造を構築するための骨格架橋を含む、追加の修飾を含む。他の誘導体には、C末端ヒドロキシメチル誘導体、o修飾誘導体(例えば、C末端ヒドロキシメチルベンジルエーテル)、アルキルアミドおよびヒドラジドなどの置換アミドを含むN末端修飾誘導体が含まれる。
「IL10ポリペプチド」という用語は、レトロインベルソ類似体を含む(例えば、Sela and Zisman(1997)FASEBJ.11:449を参照されたい)。レトロインベルソペプチド類似体は、アミノ酸配列の方向が逆転(レトロ)しており、例えば、L-アミノ酸ではなくD-アミノ酸を使用するなどして、その中の1つ以上のアミノ酸のキラリティー(D-またはL-)が逆位(インベルソ)である、線状ポリペプチドの異性体である。[例えば、Jameson et al.(1994)Nature368:744およびBrady et al.(1994)Nature368:692を参照されたい]。
「IL10ポリペプチド」という用語は、「タンパク質形質導入ドメイン」(PTD)を含むような修飾を含む。「タンパク質形質導入ドメイン」という用語は、脂質二重層、ミセル、細胞膜、オルガネラ膜、または小胞膜の横断を促進する、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、炭水化物、または有機もしくは無機分子を指す。別の分子に結合したPTDは、分子による膜の横断(例えば、細胞外空間から細胞内空間への移動、またはサイトゾルからオルガネラ内への移動)を促進する。いくつかの実施形態において、PTDは、IL-10ポリペプチドのアミノ末端に共有結合される一方で、他の実施形態において、PTDは、IL-10ポリペプチドのカルボキシル末端に共有結合される。例示的なタンパク質形質導入ドメインには、最小ウンデカペプチドタンパク質形質導入ドメイン(YGRKKRRQRRRを含むHIV-1 TATの残基47~57に対応、配列番号1)、細胞内への進入を指向するのに十分ないくつかのアルギニン残基を含むポリアルギニン配列(例えば、3、4、5、6、7、8、9、10、または10~50個のアルギニン)、VP22ドメイン(Zender et al.(2002)Cancer Gene Ther.9(6):489-96)、Drosophila Antennapediaタンパク質形質導入ドメイン(Noguchi et al.(2003)Diabetes52(7):1732-1737)、切断型ヒトカルシトニンペプチド(Trehin et al.(2004)Pharm.Research21:1248-1256)、ポリリジン(Wender et al.(2000)Proc.Natl.Acad.Sci.USA97:13003-13008)、RRQRRTSKLMKR(配列番号2)、トランスポータンGWTLNSAGYLLGKINLKALAALAKKIL(配列番号3)、KALAWEAKLAKALAKALAKHLAKALAKALKCEA(配列番号4)、およびRQIKIWFQNRRMKWKK(配列番号5)が含まれるが、これらに限定されない。例示的なPTDには、YGRKKRRQRRR(配列番号6)、RKKRRQRRR(配列番号7)、3個のアルギニン残基~50個のアルギニン残基のアルギニンホモポリマーが含まれるが、これらに限定されず、例示的なPTDドメインのアミノ酸配列には、以下、YGRKKRRQRRR(配列番号8)、RKKRRQRR(配列番号9)、YARAAARQARA(配列番号10)、THRLPRRRRRR(配列番号11)、およびGGRRARRRRRR(配列番号12)のうちのいずれかが含まれるが、これらに限定されない。
IL-10ポリペプチドのC末端にあるアミノ酸のカルボキシル基CORは、遊離形態(R3=OH)、または生理学的に許容されるアルカリもしくはアルカリ土類塩の形態(例えば、ナトリウム、カリウム、もしくはカルシウム塩)で存在することができる。カルボキシル基はまた、第一級、第二級、または第三級アルコール(例えば、メタノールなど)、分岐状または非分岐状C1-C6-アルキルアルコール(例えば、エチルアルコールまたはtert-ブタノール)でエステル化されてもよい。カルボキシル基はまた、第一級または第二級アミン(アンモニアなど)、分岐状または非分岐状C1-C6アルキルアミンまたはC1-C6ジアルキルアミン(例えば、メチルアミンまたはジメチルアミン)でアミド化されてもよい。
IL-10ポリペプチドのN末端にあるアミノ酸NR1R2のアミノ基は、遊離形態(R1=HおよびR2=H)、または生理学的に許容される塩の形態(例えば、塩化物もしくは酢酸塩)で存在することができる。アミノ基はまた、R1=HおよびR2=アセチル、トリフルオロアセチル、またはアダマンチルなどの酸でアセチル化されてもよい。アミノ基は、上記に提供されるもの(例えば、Fmoc、ベンジルオキシ-カルボニル(Z)、Boc、およびAlloc)などの、ペプチド化学で従来使用されるアミノ保護基によって保護された形態で存在することができる。アミノ基は、N-アルキル化されてもよく、Rおよび/またはR=C-CアルキルまたはC-CアルケニルまたはC-Cアラルキルである。アルキル残基は、直鎖状、分岐状、または環状(例えば、それぞれ、エチル、イソプロピル、およびシクロヘキシル)であり得る。
「IL10ポリペプチド」という用語は、IL-10ポリペプチドの活性断片を含む。「活性IL-10ポリペプチド断片」という用語は、天然に存在するIL-10種に由来する近接するアミノ酸残基を含有する天然に存在するIL-10種の断片(例えば、部分配列)であり、別のIL-10ポリペプチドとともに二量体化することができる(そのような二量体は、IL-10活性を有する)、IL-10ポリペプチドを指す。ペプチドまたはポリペプチド部分配列の近接するアミノ酸残基の長さは、部分配列が由来する特定の天然に存在するアミノ酸配列に応じて変動する。一般に、ペプチドおよびポリペプチドは、約20アミノ酸長~約40アミノ酸長、約40アミノ酸長~約60アミノ酸長、約60アミノ酸長~約80アミノ酸長、約80アミノ酸長~約100アミノ酸長、約100アミノ酸長~約120アミノ酸長、約120アミノ酸長~約140アミノ酸長、約140アミノ酸長~約150アミノ酸長、約150アミノ酸長~約155アミノ酸長、約155アミノ酸長~最大で完全長ペプチドまたはポリペプチドであり得る。「IL-10ポリペプチドの活性断片」という用語は、成熟した(すなわち、シグナルペプチド配列を含まない)IL-10ポリペプチドのN末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、または23アミノ酸の欠失を含むIL-10ポリペプチドを含む。「IL-10ポリペプチドの活性断片」という用語は、成熟した(すなわち、シグナルペプチド配列を含まない)IL-10ポリペプチドのC末端からの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、または13アミノ酸の欠失を含むIL-10ポリペプチドを含む。
加えて、IL-10ポリペプチドは、定義された長さの近接するアミノ酸(例えば、「比較ウインドウ」)にわたって、参照配列と比較して、定義された配列同一性を有し得る。比較のための配列アラインメント方法は、当該技術分野で周知である。比較のための配列の最適なアラインメントは、例えば、Smith & Waterman,(1981)Adv.Appl.Math.2:482の局地的相同性アルゴリズム、Needleman&Wunsch(1970)J.Mol.Biol.48:443の相同性アラインメントアルゴリズム、Pearson & Lipman(1988)Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA85:2444の類似性検索法、コンピュータによるこれらのアルゴリズムの実行(Wisconsin Genetics Software Package,Madison,Wis.のGAP、BESTFIT、FASTA、およびTFASTA)、または手動アラインメントおよび目視検査(例えば、Current Protocols in Molecular Biology(Ausubel et al.,eds.1995 supplement)を参照されたい)によって行うことができる。例えば、抗原断片、リーダー配列、タンパク質折り畳み、機能ドメイン、グリコシル化部位、および配列整列を決定するためのソフトウェアパッケージおよびデータベースが、利用可能である(例えば、GCG Wisconsin Package(Accelrys,Inc.,San Diego,CA)、およびDeCypher(商標)(TimeLogic Corp.,Crystal Bay,NV)を参照されたい)。
一例として、好適なIL-10ポリペプチドは、約20アミノ酸長~約40アミノ酸長、約40アミノ酸長~約60アミノ酸長、約60アミノ酸長~約80アミノ酸長、約80アミノ酸長~約100アミノ酸長、約100アミノ酸長~約120アミノ酸長、約120アミノ酸長~約140アミノ酸長、約140アミノ酸長~約150アミノ酸長、約150アミノ酸長~約155アミノ酸長、約155アミノ酸長~最大で完全長ペプチドまたはポリペプチドの近接する区間と、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
以下でさらに考察されるように、IL-10ポリペプチドは、天然源(例えば、それが天然に存在する環境以外の環境)から単離することができ、組換えにより(例えば、細菌、酵母、Pichia、および昆虫細胞などの遺伝子組換え宿主細胞内で)作製することもでき、遺伝子組換え宿主細胞は、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で修飾される。IL-10ポリペプチドはまた、合成により(例えば、無細胞化学合成によって)生成することもできる。
本開示は、オルソログを含む様々な哺乳動物源および非哺乳動物源から得られるIL-10ポリペプチド、ならびにそれらの修飾形態で構成される、IL-10剤を企図する。ヒトポリペプチドおよびそれらをコードする核酸分子に加えて、本開示は、マウス、ラット(受託NP_036986.2、GI148747382)、ウシ(受託NP_776513.1、GI41386772)、ヒツジ(受託NP_001009327.1、GI57164347)、イヌ(受託ABY86619.1、GI166244598)、およびウサギ(受託AAC23839.1、GI3242896)を含む他の種に由来する、IL-10ポリペプチドおよび対応する核酸分子を企図する。非哺乳動物源に由来するIL-10剤の例には、ヘルペスウイルス科ベータヘルペスウイルス亜科、ヒトサイトメガロウイルスを含むサイトメガロウイルス属(Genbank受託番号AAR31656およびACR49217)、ミドリザルサイトメガロウイルス(Genbank受託番号AEV80459)、アカゲザルサイトメガロウイルス(Genbank受託番号AAF59907)、ヒヒサイトメガロウイルス(Genbank受託番号AAF63436)、ヨザルサイトメガロウイルス(Genbank受託番号AEV80800)、およびリスザルサイトメガロウイルス(Genbank受託番号AEV80955);ガンマヘルペスウイルス科リンホクリプトウイルス属エプスタイン・バーウイルス(Genbank受託番号CAD53385)、ボノボヘルペスウイルス(Genbank受託番号XP_003804206.1)、アカゲザルリンホクリプトウイルス(Genbank受託番号AAK95412)、ヒヒリンホクリプトウイルス(Genbank受託番号AAF23949);ヒツジヘルペスウイルス2(Genbank受託番号AAX58040)を含むマカウイルス属;ウマヘルペスウイルス2(Genbank受託番号AAC13857)を含むペルカウイルス属;コイヘルペスウイルス3(Genbank受託番号ABG429610)、ウナギヘルペスウイルス1(Genbank受託番号AFK25321)を含むアロヘルペスウイルス科コイヘルペスウイルス属;羊鵞口瘡ウイルス(Genbank受託番号AAR98352)、ウシ丘疹性口内炎ウイルス(Genbank受託番号AAR98483)、偽牛痘ウイルス(Genbank受託番号ADC53770)を含むポックスウイルス科コードポックスウイルス(chodopoxvirinae)亜科;ランピースキン病ウイルス(Genbank受託番号AAK84966)、羊痘ウイルス(Genbank受託番号NP_659579)、山羊痘ウイルス(Genbank受託番号YP_00129319)を含むカプリポックスウイルス属;ならびにカナリアポックスウイルス(Genbank受託番号NP_955041)を含むトリポックスウイルスに由来するウイルスIL-10が含まれる。
一実施形態において、IL-10ポリペプチドは、ヒトIL-10ポリペプチドである。本明細書で使用される場合、「ヒトIL-10」または「hIL10」という用語は、2つのヒトiIL-10ポリペプチドで構成されるIL10剤を指す。一実施形態において、ヒトIL-10ポリペプチドは、(アミノ末端からカルボキシ末端へ)以下のアミノ酸配列を有する160アミノ酸ポリペプチドである。
SPGQGTQSEN SCTHFPGNLP NMLRDLRDAF SRVKTFFQMK DQLDNLLLKE SLLEDFKGYL GCQALSEMIQ FYLEEVMPQA ENQDPDIKAH VNSLGENLKT LRLRLRRCHR FLPCENKSKA VEQVKNAFNK LQEKGIYKAM SEFDIFINYI EAYMTMKIRN(配列番号13)
一実施形態において、ヒトIL-10ポリペプチドは、(アミノ末端からカルボキシ末端へ)以下のアミノ酸配列を有する161アミノ酸ポリペプチドである。
MSPGQGTQSE NSCTHFPGNL PNMLRDLRDA FSRVKTFFQM KDQLDNLLLK ESLLEDFKGY LGCQALSEMI QFYLEEVMPQ AENQDPDIKA HVNSLGENLK TLRLRLRRCH RFLPCENKSK AVEQVKNAFN KLQEKGIYKA MSEFDIFINY IEAYMTMKIR N(配列番号14)
一実施形態において、ヒトIL-10ポリペプチドは、(アミノ末端からカルボキシ末端へ)以下のアミノ酸配列を有する161アミノ酸ポリペプチドである。
N-ホルミル-MSPGQGTQSE NSCTHFPGNL PNMLRDLRDA FSRVKTFFQM KDQLDNLLLK ESLLEDFKGY LGCQALSEMI QFYLEEVMPQ AENQDPDIKA HVNSLGENLK TLRLRLRRCH RFLPCENKSK AVEQVKNAFN KLQEKGIYKA MSEFDIFINY IEAYMTMKIR N(配列番号15)
本開示のポリペプチドおよび核酸分子に関連するいかなる「ヒト」への言及も、ポリペプチドもしくは核酸が得られる様式または源に関して限定的であることは意図されず、むしろ配列(それは、天然に存在するヒトポリペプチドまたは核酸分子の配列に対応し得るため)に言及するに過ぎないことに留意されたい。
D.IL-10活性:
「IL-10活性」という用語は、IL-10剤が、典型的には、IL-10受容体に結合することによってそれらの効果を発揮することを指す。II型サイトカイン受容体であるIL-10受容体は、それぞれR1およびR2とも称される、アルファおよびベータサブユニットからなる。受容体の活性化には、アルファおよびベータの両方への結合が必要とされる。二量体IL-10の一方のIL-10単量体は、アルファに結合し、IL-10の他方のIL-10単量体は、ベータに結合する。IL-10活性は、当該技術分野で周知のアッセイによって評価することができる。例えば、IL-10剤のIL-10活性は、TNF-α阻害アッセイ、MC9増殖アッセイ、CD8 T細胞IFNγ分泌アッセイを使用して、または以下に提供される腫瘍モデルおよび腫瘍分析において決定することができる。しかしながら、以下のアッセイは、IL-10活性を決定するためのアッセイの代表的なものであり、排他的なものではないことが当業者に理解される。当業者は、IL-10活性を測定するための任意の当該技術分野で認識されているアッセイまたは方法論を単独または組み合わせで使用して、本明細書に記載のIL-10剤の活性を評価することができることを理解する。
IL-10剤のIL-10活性は、実質的に以下のTNFα阻害アッセイに従って評価することができる。簡潔には、U937細胞(Sigma-Aldrich(番号85011440)、St.Louis,MOから入手可能な肺由来のリンパ芽球ヒト細胞株)のPMA刺激が、細胞にTNFαを分泌させ、その後これらのTNFα分泌細胞を、IL-10活性を有する試験剤で処理することにより、用量依存的な様式でTNFα分泌の低下がもたらされる。例示的なTNFα阻害アッセイは、以下のプロトコルを使用して実行することができる。10%のFBS/FCSおよび抗生物質を含有するRMPI中でU937細胞を培養した後、96ウェルの平底プレート(任意のプラズマ処理された組織培養プレート(例えば、Nunc、Thermo Scientific,USA)を使用することができる)に、1つの条件当たり三連で、1×105個、90%の生存U937細胞を播種する。細胞を播種して、以下の条件(すべて少なくとも三連、「培地単独」については、2分の1が10nMのPMAとのインキュベーション後の生存に使用されるため、ウェルの数は倍になる)を提供する:5ng/mlのLPS単独;5ng/mLのLPS+0.1ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+1ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+10ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+100ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+1000ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+0.1ng/mLのPEG-rhIL-10;5ng/mLのLPS+1ng/mLのPEG-rhIL-10;5ng/mLのLPS+10ng/mLのPEG-rhIL-10;5ng/mLのLPS+100ng/mLのPEG-rhIL-10;および5ng/mLのLPS+1000ng/mLのPEG-rhIL-10。各ウェルを200μL中10nMのPMAに24時間曝露し、37℃、5%のCOのインキュベーター内で培養した後、細胞の約90%が接着性であるはずである。3つの余分なウェルを再懸濁し、細胞を計数して、生存率を評価する(90%超が生存可能である必要がある)。新鮮な非PMA含有培地で穏やかに、しかし完全に3回洗浄し、細胞がウェル内に残ることを確実にする。1ウェル当たり100μLの適切な濃度のIL-10剤を含有する培地を添加し(体積が100%だけ希釈されるため、2倍になる)、37℃、5%のCOのインキュベーター内で30分間インキュベートする。1ウェル当たり100μLの10ng/mLのストックLPSを添加して、各ウェル内で5ng/mlのLPSの最終濃度を達成し、37℃、5%のCOのインキュベーター内で18~24時間インキュベートする。上清を除去し、製造業者の取扱説明書に従ってTNFαELISAを実行する。各条件付けされた上清を、ELISA内、二連で実行する。
IL-10剤のIL-10活性は、実質的に以下のMC/9細胞増殖アッセイに従って評価することができる。簡潔には、MC/9細胞に対するIL-10活性を有する化合物の投与は、用量依存的な様式で細胞増殖の増加を引き起こす。MC/9は、Cell Signaling Technology、Danvers,MAから入手可能な肥満細胞の特徴を有するマウス細胞株である。Thompson-Snipes,L.ら((1991)J.Exp.Med.173:507-10)は、MC/9細胞にIL3+IL10およびIL3+IL4+IL10を補った標準的なアッセイプロトコルについて記載している。当業者であれば、細胞にIL-10のみを補うように、Thompson-Snipes,L.らに記載の標準的なアッセイプロトコルを変更することができる。
IL-10剤のIL-10活性は、実質的に以下のCD8 T細胞IFNγ分泌アッセイに従って評価することができる。簡潔には、活性化初代ヒトCD8 T細胞は、IL-10活性を有する化合物で処理し、その後抗CD3抗体で処理したときに、IFNγを分泌する。以下のプロトコルは、例示的なCD8 T細胞IFNγ分泌アッセイを提供する。ヒト初代末梢血単核細胞(PBMC)は、任意の標準的なプロトコルに従って単離することができる(例えば、Fuss et al.(2009)Current Protocols in Immunology,Unit7.1,John Wiley,Inc.,NYを参照されたい)。2.5mLのPBMC(1000万個の細胞/mLの細胞密度)は、任意の標準的な組織培養処理された6ウェルプレート(BD、Franklin Lakes,NJ)内、RPMI(Life Technologies、Carlsbad,CA)、10mMのHEPES(Life Technologies、Carlsbad,CA)、10%のウシ胎児血清(Hyclone Thermo Fisher Scientific、Waltham,MA)、およびペニシリン/ストレプトマイシンカクテル(Life Technologies、Carlsbad,CA)を含有する完全RPMIとともに、ウェルごとに培養することができる。その後、IL-10剤を、100ng/mLの最終濃度でウェルに添加し、阻害性受容体/チェックポイント受容体の機能を遮断する、10μg/mLの最終濃度の抗体もまた、IL-10剤と併用して添加してもよい。細胞を、5%のCOを有する37℃の加湿インキュベーター内で6~7日間培養することができる。インキュベーション後、Miltenyi BiotecのMACS細胞分離技術を、製造業者の取扱説明書(Miltenyi Biotec、Auburn,CA)に実質的に従って使用して、CD8 T細胞を単離する。その後、単離したCD8 T細胞を、任意の標準的な組織培養プレート内、1μg/mLの抗CD3抗体(Affymetrix eBioscience、San Diego,CA)を含有する完全RPMIとともに、4時間培養することができる。4時間のインキュベーション後、培地を収集し、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、市販のELISAキット(例えば、Affymetrix、eBioscience、San Diego,CA)を使用して、IFNγについてアッセイする。
腫瘍モデルはまた、様々な腫瘍に対するIL-10剤の活性の評価にも使用することができる。本明細書以下に記載の腫瘍モデルおよび腫瘍分析は、利用可能な腫瘍モデルおよび腫瘍分析の代表的なものである。同系マウス腫瘍細胞を、1回の腫瘍接種当たり10、10、または10個の細胞で、皮下または皮内注射する。Ep2乳癌、CT26結腸癌、PDV6皮膚の扁平上皮癌、および4T1乳癌モデルを使用することができる(例えば、Langowski et al.(2006)Nature442:461-465を参照されたい)。免疫適格性Balb/CまたはB細胞欠損Balb/Cマウスを使用することができる。マウスIL-10種に基づくIL-10剤を、免疫適格性マウスに投与することができ、ヒトIL-10または他の非マウス種処理に基づくIL-10剤を、典型的には、B細胞欠損マウスに提供する。腫瘍成長は、典型的には、電子ノギスを使用して、1週間に2回監視する。腫瘍体積は、式(幅×長さ/2)を使用して計算することができ、式中、長さは、より長い方の寸法である。IL-10試験剤の投与前に、腫瘍を、90~250mmのサイズに到達させる。IL-10剤または緩衝液対照を、腫瘍移植から離れた部位に投与する。IL-10試験剤の投与後の腫瘍成長を、典型的には、上記の電子ノギスを使用して、1週間に2回監視し、IL-10試験剤の投与に応答した腫瘍体積に対する効果を、経時的に評価する。腫瘍組織およびリンパ器官を、様々なエンドポイントで採取して、いくつかの炎症マーカーのmRNA発現を測定し、いくつかの炎症細胞マーカーの免疫組織化学を実行する。組織を、液体窒素中で急速冷凍し、-80℃で保管する。
E.IL-10ポリペプチドの入手
IL-10ポリペプチドは、天然源(例えば、それが天然に存在する環境以外の環境)から単離することができ、組換えにより(例えば、細菌、酵母、Pichia、および昆虫細胞などの遺伝子組換え宿主細胞内で)作製することもでき、遺伝子組換え宿主細胞は、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で修飾されている。IL-10ポリペプチドはまた、合成により(例えば、無細胞または固相化学合成によって)生成することもできる。
IL-10ポリペプチドが、化学的に合成される場合、合成は、液相または固相を介して進行することができる。固相ペプチド合成(SPPS)は、非天然アミノ酸および/またはペプチド/タンパク質の骨格修飾の組み込みを可能にする。本開示のポリペプチドの合成には、9-フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)およびt-ブチルオキシカルボニル(Boc)などのSPPSの様々な形態が利用可能である。化学合成の詳細は、当該技術分野で既知である(例えば、Ganesan A.(2006)Mini Rev.Med.Chem.6:3-10、およびCamarero J.A.et al.,(2005)Protein Pept Lett.12:723-8)。
固相ペプチド合成は、本明細書以下に記載のように実行することができる。アルファ機能(Nα)および反応性側鎖は、酸に不安定な基または塩基に不安定な基で保護されている。保護基は、アミド結合の連結のための条件下では安定しているが、形成されたペプチド鎖を傷害することなく容易に切断することができる。α-アミノ機能に好適な保護基には、以下、Boc、ベンジルオキシカルボニル(Z)、O-クロルベンジルオキシカルボニル、ビフェニルイソプロピルオキシカルボニル、tert-アミルオキシカルボニル(Amoc)、α,α-ジメチル-3,5-ジメトキシ-ベンジルオキシカルボニル、o-ニトロスルフェニル、2-シアノ-t-ブトキシ-カルボニル、Fmoc、および1-(4,4-ジメチル-2,6-ジオキソシクロヘキサ-1-イリデン)エチル(Dde)などが含まれるが、これらに限定されない。
好適な側鎖保護基には、アセチル、アリル(All)、アリルオキシカルボニル(Alloc)、ベンジル(Bzl)、ベンジルオキシカルボニル(Z)、t-ブチルオキシカルボニル(Boc)、ベンジルオキシメチル(Bom)、o-ブロモベンジルオキシカルボニル、t-ブチル(tBu)、t-ブチルジメチルシリル、2-クロロベンジル、2-クロロベンジルオキシカルボニル、2,6-ジクロロベンジル、シクロヘキシル、シクロペンチル、1-(4,4-ジメチル-2,6-ジオキソシクロヘキサ-1-イリデン)エチル(Dde)、イソプロピル、4-メトキシ-2,3-6-トリメチルベンジルスルホニル(Mtr)、2,3,5,7,8-ペンタメチルクロマン-6-スルホニル(Pmc)、ピバリル、テトラヒドロピラン-2-イル、トシル(Tos)、2,4,6-トリメトキシベンジル、トリメチルシリル、およびトリチル(Trt)が含まれるが、これらに限定されない。
固相合成では、C末端アミノ酸は、好適な支持材料にカップリングする。好適な支持材料は、合成プロセスの段階的な縮合および切断反応のための試薬および反応条件に対して不活性であり、かつ使用される反応培地中に溶解しないものである。市販の支持材料の例には、反応性基および/またはポリエチレングリコールで修飾されたスチレン/ジビニルベンゼン共重合体、クロロメチル化スチレン/ジビニルベンゼン共重合体、ならびにヒドロキシメチル化またはアミノメチル化スチレン/ジビニルベンゼン共重合体などが含まれる。ペプチド酸の調製が所望される場合、ポリスチレン(1%)-ジビニルベンゼン、または4-ベンジルオキシベンジル-アルコール(Wangアンカー)または2-クロロトリチルクロリドで誘導体化されたTentaGel(登録商標)を使用することができる。ペプチドアミドの場合、ポリスチレン(1%)-ジビニルベンゼン、または5-(4’-アミノメチル)-3’,5’-ジメトキシフェノキシ)吉草酸(PALアンカー)またはp-(2,4)-ジメトキシフェニル-アミノメチル)-フェノキシ基(Rinkアミドアンカー)で誘導体化されたTentaGel(登録商標)を使用することができる。
重合体支持体への結合は、エタノール、アセトニトリル、N,N-ジメチルホルムアミド(DMF)、ジクロロメタン、テトラヒドロフラン、N-メチルピロリドン、または類似の溶媒中の活性化試薬を添加することによって、室温または高温(例えば、40℃~60℃)および例えば、2~72時間の反応時間で、C末端Fmoc保護アミノ酸を支持材料と反応させることによって達成することができる。
Nα保護アミノ酸(例えば、Fmocアミノ酸)の、PAL、Wang、またはRinkアンカーへのカップリングは、例えば、N、N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、N,N’-ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)または他のカルボジイミド、2-(1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TBTU)または他のウロニウム塩、O-アシル-ウレア、ベンゾトリアゾール-1-イル-トリス-ピロリジノ-ホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(PyBOP)または他のホスホニウム塩、N-ヒドロキシスクシンイミド、他のN-ヒドロキシイミドまたはオキシムなどのカップリング試薬の助けを借りて、1-ヒドロキシベンゾトリアゾールまたは1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾールの存在下または不在下で、例えば、HOBtを添加したTBTUの助けを借りて、例えば、ジイソプロピルエチルアミン(DIEA)、トリエチルアミン、またはN-メチルモルホリンなどの塩基を添加するかまたは添加せずに、例えば、ジイソプロピルエチルアミンで2~72時間の反応時間で(例えば、1.5~3倍過剰のアミノ酸およびカップリング試薬中で3時間、例えば、2倍過剰および約10℃~50℃の温度で、例えば、ジメチルホルムアミド、N-メチルピロリドン、またはジクロロメタンなどの溶媒(例えば、ジメチルホルムアミド)中25℃で)実行することができる。
カップリング試薬の代わりに、活性エステル(例えば、ペンタフルオロフェニルまたはp-ニトロフェニルなど)、Nα-Fmoc-アミノ酸の対称無水物、その酸塩化物または酸フッ化物を、上述の条件下で使用することもまた可能である。
Nα保護アミノ酸(例えば、Fmocアミノ酸)は、10~120分間、例えば、20分間の反応時間を有して、DIEAを添加したジクロロメタン中の2-クロロトリチル樹脂にカップリングすることができるが、この溶媒およびこの塩基の使用には限定されない。
保護アミノ酸の連続的なカップリングは、ペプチド合成における従来の方法に従って、典型的には、自動化ペプチド合成機内で実行することができる。例えば、ジメチルホルムアミド中のピペリジン(10%~50%)で5~20分間、例えば、DMF中50%のピペリジンで、2×2分間、DMF中20%のピペリジンで、1×15分間処理することによって、固相にカップリングしたアミノ酸のNα-Fmoc保護基を切断した後、3~10倍過剰、例えば、10倍過剰の次の保護アミノ酸を、ジクロロメタン、DMF、またはその2つの混合物などの不活性、非水性極性溶媒中、および約10℃~50℃の温度、例えば、25℃で、前のアミノ酸にカップリングする。第1のNα-Fmocアミノ酸を、PAL、Wang、またはRinkアンカーにカップリングするための前述の試薬が、カップリング試薬として好適である。保護アミノ酸の活性エステル、またはその塩化物もしくはフッ化物もしくは対称無水物もまた、代替物として使用することができる。
固相合成の終了時に、側鎖保護基を同時に切断しながら、ペプチドを支持材料から切断する。切断は、5~20%V/Vのスカベンジャー(ジメチルスルフィド、エチルメチルスルフィド、チオアニソール、チオクレゾール、m-クレゾール、アニソールエタンジチオール、フェノール、または水、例えば、15%v/vのジメチルスルフィド/エタンジチオール/m-クレゾール1:1:1)を添加したトリフルオロ酢酸または他の強酸性培地を用いて、0.5~3時間以内、例えば、2時間、実行することができる。2-クロロトリチルアンカーを氷酢酸/トリフルオロエタノール/ジクロロメタン2:2:6で切断することによって、側鎖が完全に保護されたペプチドが得られる。保護ペプチドを、シリカゲルでのクロマトグラフィーで精製してもよい。ペプチドが、Wangアンカーを介して固相に結合している場合、およびC末端がアルキルアミド化したペプチドを得ることが意図される場合は、切断は、アルキルアミンまたはフルオロアルキルアミンを用いたアミノ分解によって実行することができる。アミノ分解は、約-10℃~50℃(例えば、約25℃)の温度で、および約12~24時間(例えば、約18時間)の反応時間で実行される。加えて、ペプチドは、例えば、メタノールでの再エステル化によって支持体から切断することができる。
得られた酸性溶液を、3~20倍量の冷エーテルまたはn-ヘキサン、例えば、10倍過剰のジエチルエーテルと混合して、ペプチドを沈殿させることで、エーテル中に残るスカベンジャーおよび切断された保護基を分離することができる。氷酢酸からペプチドを数回再沈殿させることによって、さらなる精製を実行することができる。得られた沈殿物は、水もしくはtert-ブタノール、または2つの溶媒の混合物中、例えば、1:1でtert-ブタノール/水の混合物中に取り込み、凍結乾燥することができる。
得られたペプチドは、アセテート形態の弱塩基性樹脂でのイオン交換;非誘導体化ポリスチレン/ジビニルベンゼン共重合体(例えば、Amberlite(登録商標)XAD)での疎水性吸着クロマトグラフィー;シリカゲルでの吸着クロマトグラフィー;例えば、カルボキシメチルセルロースでのイオン交換クロマトグラフィー;例えば、Sephadex(登録商標)G-25での分配クロマトグラフィー;向流分配クロマトグラフィー;または高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)、例えば、オクチルもしくはオクタデシルシリルシリカ(ODS)相での逆相HPLCを含む、様々なクロマトグラフィー法で精製することができる。
ヒトおよびマウスIL-10の調製について記載する方法は、例えば、組換え技術および他の合成技術を含む、IL-10活性を有するタンパク質の産生のための方法を教示する、米国特許第5,231,012号に見出すことができる。IL-10は、ウイルス起源のものであってもよく、エプスタイン・バーウイルス(BCRF1タンパク質)からのウイルスIL-10のクローニングおよび発現は、Moore et al.,(1990)Science248:1230に開示されている。IL-10は、本明細書に記載のものなどの、当該技術分野で既知の標準的な技術を使用して、いくつかの方法で得ることができる。組換えヒトIL-10はまた、例えば、PeproTech,Inc.、Rocky Hill,N.Jからも市販されている。
それらの天然に存在するおよび天然に存在しないアイソフォーム、対立遺伝子変異体、およびスプライス変異体を含む、IL-10剤をコードする核酸分子が、本開示によって企図される。本開示はまた、天然に存在するDNA配列とは1つ以上の塩基が変動するが、遺伝暗号の縮重のためにIL-10ポリペプチドに対応するアミノ酸配列に依然として翻訳される、核酸配列も包含する。
ポリペプチドが、組換え技術を使用して産生される場合、ポリペプチドはそれぞれ、任意の好適な構築物および任意の好適な宿主細胞(原核細胞もしくは真核細胞(細菌(例えば、E.coli)など)であり得る)または酵母宿主細胞を使用して、細胞内タンパク質として、または分泌タンパク質として産生されてもよい。宿主細胞として使用することができる真核細胞の他の例には、昆虫細胞、哺乳動物細胞、および/または植物細胞が含まれる。哺乳動物宿主細胞が使用される場合、それらには、ヒト細胞(例えば、HeLa、293、H9、およびJurkat細胞)、マウス細胞(例えば、NIH3T3、L細胞、およびC127細胞)、霊長類細胞(例えば、Cos1、Cos7、およびCV1)、ならびにハムスター細胞(例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞)が含まれ得る。
当該技術分野で既知の標準的な手順に従って、ポリペプチドの発現に好適な様々な宿主-ベクター系を用いることができる。例えば、Sambrook et al.,(1989)Current Protocols in Molecular Biology Cold Spring Harbor Press,New York、およびAusubel et al.(1995)Current Protocols in Molecular Biology,Eds.Wiley and Sonsを参照されたい。遺伝子材料を宿主細胞に導入するための方法には、例えば、形質転換、エレクトロポレーション、共役、およびリン酸カルシウム法などが含まれる。導入のための方法は、導入されるポリペプチドをコードする核酸の安定した発現を提供するように選択することができる。ポリペプチドをコードする核酸は、遺伝性エピソーム要素(例えば、プラスミド)として提供されてもよく、またはゲノム的に組み込まれてもよい。目的のポリペプチドの産生に使用するための様々な適切なベクターが、市販されている。
ベクターは、宿主細胞内で染色体外維持を提供することができるか、または宿主細胞ゲノムへの組み込みを提供することができる。発現ベクターは、転写および翻訳制御配列を提供し、コード領域が転写開始領域ならびに転写および翻訳終結領域の転写制御下で作動可能に結合している、誘導性発現または構成的発現を提供することができる。一般に、転写および翻訳制御配列には、プロモーター配列、リボソーム結合部位、転写開始および停止配列、翻訳開始および停止配列、ならびにエンハンサーまたはアクチベーター配列が含まれ得るが、これらに限定されない。プロモーターは、構成的であっても誘導性であってもよく、強力な構成的プロモーター(例えば、T7)であってもよい。
発現構築物は一般に、目的のタンパク質をコードする核酸配列の挿入を提供するための、プロモーター配列の近くに位置する好都合な制限部位を有する。ベクターを含有する細胞の選択を促進するために、発現宿主内で作動する選択可能なマーカーが存在してもよい。さらに、発現構築物は、追加の要素を含んでもよい。例えば、発現ベクターは、1つまたは2つの複製システムを有してもよく、それにより生物内で(例えば、発現のために哺乳動物細胞または昆虫細胞内で、ならびにクローンニングおよび増幅のために原核生物宿主内で)それを維持することが可能になる。加えて、発現構築物は、形質転換された宿主細胞の選択を可能にするための選択可能なマーカー遺伝子を含有してもよい。選択可能な遺伝子は、当該技術分野で周知であり、使用される宿主細胞とともに変動する。
タンパク質の単離および精製は、当該技術分野で既知の方法に従って達成することができる。例えば、タンパク質は、構成的におよび/もしくは誘導時にタンパク質を発現するように遺伝子改変された細胞の溶解物から、または一般に試料を抗タンパク質抗体と接触させることと、洗浄して非特異的に結合した材料を除去することと、特異的に結合したタンパク質を溶出することとを伴う免疫親和性精製によって合成反応混合物から、単離することができる。単離されたタンパク質は、透析およびタンパク質精製で通常用いられる他の方法によってさらに精製することができる。一実施形態において、タンパク質は、金属キレートクロマトグラフィー法を使用して単離することができる。タンパク質は、単離を促進するための修飾を含有してもよい。
ポリペプチドは、実質的に純粋な形態または単離された形態(例えば、他のポリペプチドを含まない)で調製することができる。ポリペプチドは、存在し得る他の構成成分(例えば、他のポリペプチドまたは他の宿主細胞構成成分)と比較して、ポリペプチドが濃縮されている組成物中に存在してもよい。例えば、精製されたポリペプチドは、ポリペプチドが他の発現タンパク質を実質的に含まない(例えば、約90%未満、約60%未満、約50%未満、約40未満%、約30%未満、約20%未満、約10%未満、約5%未満、または約1%未満)組成物中に存在するように提供されてもよい。
IL-10ポリペプチドは、当該技術分野で既知の異なるIL-10関連核酸を操作して、IL-10ポリペプチドをコードすることができる構築物を提供する、組換え技術を使用して生成することができる。特定のアミノ酸配列が提供される場合、当業者は、その背景および例えば、分子生物学における経験を考慮して、そのようなアミノ酸配列をコードする様々な異なる核酸分子を認識することが理解される。
F.ペグ化IL-10:
一実施形態において、修飾IL-10剤は、PEG-IL10剤である。IL-10剤のペグ化は、薬物動態学的パラメータ(例、血清半減期)を含む特定の特性の改善、活性の増強、物理的および熱的安定性の改善、酵素分解への感受性に対する保護、溶解性の増加、より長いインビボ循環半減期およびクリアランスの低下、免疫原性および抗原性の低減、ならびに毒性の低減をもたらす。薬物動態学的パラメータに対するペグ化の有益な効果に加えて、ペグ化自体が、活性を増強することができる。例えば、PEG-IL-10は、非ペグ化IL-10よりも特定の癌に対して有効であることが示されている(例えば、EP206636A2を参照されたい)。
ある特定の実施形態において、本開示で使用されるPEG-IL-10剤は、1~9個のPEG分子が、IL-10二量体の1つのIL-10ポリペプチドのN末端で、アミノ酸残基のα-アミノ基にリンカーを介して共有結合している、モノ-PEG-IL-10剤である。1つのIL-10ポリペプチドのモノペグ化は一般に、サブユニットのシャッフリングのために、非ペグ化、モノペグ化、およびジペグ化IL-10ポリペプチドの不均一な混合物をもたらす。本開示の特定の実施形態は、本明細書に記載の方法によって生成されるモノジペグ化IL-10剤とジペグ化IL-10剤との混合物の投与を含む。特定の実施形態において、モノペグ化IL-10とジペグ化IL-10との混合物は、2014年4月8日に発行されたBlaisdellらの米国特許第8,691,205B2号(その全教示は参照により本明細書に組み込まれる)、およびBlaisdell、欧州特許第2379115B1号(2017年10月25日付与)の教示に実質的に従って調製された、約1:1の比率のモノペグ化およびジペグ化rhIL-10である。
PEG-IL-10剤の生物学的活性は、米国特許第7,052,686号に記載のように、細菌抗原(リポ多糖(LPS))に曝露され、かつPEG-IL-10で治療される対象の血清中の炎症性サイトカイン(例えば、TNF-αまたはIFN-γ)のレベルによって評価することができる。
IL-10へのPEG結合の方法または部位は、重要ではないが、特定の実施形態において、ペグ化は、IL-10剤の活性を改変しないか、または最小限にしか改変しない。ある特定の実施形態において、半減期の増加は、生物学的活性のいかなる低下よりも大きい。
IL-10ポリペプチド配列への共役に好適なPEGは一般に、室温で水溶性であり、一般式R(O-CH-CHO-R(式中、Rは、水素または保護基(アルキルもしくはアルカノール基など)であり、nは、1~1000の整数である)を有する。Rが保護基である場合、それは一般に、1~8個の炭素を有する。ポリペプチド配列に共役したPEGは、線状または分岐状であり得る。
分岐状PEG誘導体、「スターPEG」およびマルチアームPEGは、本開示によって企図される。
本開示で使用されるPEGの分子量は、いかなる特定の範囲にも制限されない。PEG-IL-10剤のPEG構成成分は、約5kDa超、約10kDa超、約15kDa超、約20kDa超、約30kDa超、約40kDa超、または約50kDa超の分子質量を有することができる。いくつかの実施形態において、分子質量は、約5kDa~約10kDa、約5kDa~約15kDa、約5kDa~約20kDa、約10kDa~約15kDa、約10kDa~約20kDa、約10kDa~約25kDa、または約10kDa~約30kDaである。
本開示はまた、PEGが異なるn値を有し、それにより様々な異なるPEGが特定の比率で存在する、共役体の組成物も企図する。例えば、いくつかの組成物は、n=1、2、3、および4である、共役体の混合物を含む。いくつかの組成物では、n=1が18~25%である共役体のパーセンテージ、n=2が50~66%である共役体のパーセンテージ、n=3が12~16%である共役体のパーセンテージ、およびn=4が最大で5%である共役体のパーセンテージ。そのような組成物は、当該技術分野で既知の反応条件および精製方法によって生成することができる。クロマトグラフィーを使用して、共役体画分を分解することができ、その後例えば、所望の数のPEGが結合し、未修飾タンパク質配列および他の数のPEGが結合した共役体を含まないように精製した共役体を含有する画分を特定する。
ポリペプチド配列への共役に好適なPEGは一般に、室温で水溶性であり、一般式R(O-CH-CHO-R(式中、Rは、水素または保護基(アルキルもしくはアルカノール基など)であり、nは、1~1000の整数である)を有する。Rが保護基である場合、それは一般に、1~8個の炭素を有する。
2つの広く使用されている第1世代の活性化モノメトキシPEG(mPEG)は、スクシンイミジルカーボネートPEG(SC-PEG、例えば、Zalipsky,et al.(1992)Biotehnol.Appl.Biochem 15:100-114、およびMiron and Wilcheck(1993)Bio-conjug.Chem.4:568-569を参照されたい)ならびにベンゾトリアゾールカーボネートPEG(BTC-PEG、例えば、Dolenceらの米国特許第5,650,234号を参照されたい)であり、これらは、リジン残基と優先的に反応して、カルバメート結合を形成するが、ヒスチジン残基およびチロシン残基と反応することも知られている。特定の分子(例えば、IFNα)上のヒスチジン残基への結合は、加水分解に不安定なイミダゾールカルバメート結合であることが示されている(例えば、Lee and McNemarの米国特許第5,985,263号を参照されたい)。第2世代のペグ化技術は、これらの不安定な結合、および残基の反応性における選択性の欠如を回避するように設計されている。PEG-アルデヒドリンカーの使用は、還元的アミノ化を通してポリペプチドのN末端上の単一部位を標的とする。
ポリペプチド配列に共役したPEGは、線状または分岐状であり得る。分岐状PEG誘導体、「スターPEG」およびマルチアームPEGは、本開示によって企図される。本発明の実施において有用な特定の実施形態のPEGには、10kDaの線状PEG-アルデヒド(例えば、Sunbright(登録商標)ME-100AL、NOF America Corporation、One North Broadway,White Plains,NY10601USA)、10kDaの線状PEG-NHSエステル(例えば、Sunbright(登録商標)ME-100CS、Sunbright(登録商標)ME-100AS、Sunbright(登録商標)ME-100GS、Sunbright(登録商標)ME-100HS、NOF)、20kDaの線状PEG-アルデヒド(例えば、Sunbright(登録商標)ME-200AL、NOF)、20kDaの線状PEG-NHSエステル(例えば、Sunbright(登録商標)ME-200CS、Sunbright(登録商標)ME-200AS、Sunbright(登録商標)ME-200GS、Sunbright(登録商標)ME-200HS、NOF)、20kDaの2アーム分岐状PEG-アルデヒド、2つの10kDA線状PEG分子を含む20kDAのPEG-アルデヒド(例えば、Sunbright(登録商標)GL2-200AL3、NOF)、20kDaの2アーム分岐状PEG-NHSエステル、2つの10kDAの線状PEG分子を含む20kDAのPEG-NHSエステル(Sunbright(登録商標)GL2-200TS、Sunbright(登録商標)GL200GS2、NOF)、40kDaの2アーム分岐状PEG-アルデヒド、2つの20kDAの線状PEG分子を含む40kDAのPEG-アルデヒド(例えば、Sunbright(登録商標)GL2-400AL3)、40kDaの2アーム分岐状PEG-NHSエステル、2つの20kDAの線状PEG分子を含む40kDAのPEG-NHSエステル(例えば、Sunbright(登録商標)GL2-400AL3、Sunbright(登録商標)GL2-400GS2、NOF)、線状30kDaのPEG-アルデヒド(例えば、Sunbright(登録商標)ME-300AL)、および線状30kDaのPEG-NHSエステルが含まれる。
ペグ化は、ポリペプチドのN末端のα-アミノ基、リジン残基の側鎖上のイプシロンアミノ基、およびヒスチジン残基の側鎖上のイミダゾール基で最も頻繁に生じる。ほとんどの組換えポリペプチドは、単一のアルファ基ならびにいくつかのイプシロンアミノ基およびイミダゾール基を有するため、リンカー化学に応じて、多数の位置異性体を生成することができる。当該技術分野で既知の一般的なペグ化戦略が、本明細書に適用され得る。
PEGは、ポリペプチド配列の1つ以上の遊離アミノ基またはカルボキシル基とポリエチレングリコールとの間の結合を媒介する末端反応性基(「スペーサー」)を介して、本開示のIL-10ポリペプチドに結合することができる。遊離アミノ基に結合することができるスペーサーを有するPEGは、ポリエチレングリコールのコハク酸エステルをN-ヒドロキシスクシニルイミドで活性化することによって調製することができる、N-ヒドロキシスクシニルイミドポリエチレングリコールを含む。遊離アミノ基に結合することができる別の活性化ポリエチレングリコールは、2,4-ビス(O-メトキシポリエチレングリコール)-6-クロロ-s-トリアジンであり、これは、ポリエチレングリコールモノメチルエーテルをシアヌル酸クロリドと反応させることによって調製することができる。遊離カルボキシル基に結合している活性化ポリエチレングリコールは、ポリオキシエチレンジアミンを含む。
本開示のIL-10ポリペプチド配列の1つ以上の、スペーサーを有するPEGへの共役は、様々な従来の方法によって実行することができる。例えば、共役反応は、4:1~30:1の試薬対タンパク質のモル比を利用して、5~10のpHで溶液中、4℃~室温の温度で、30分~20時間実行することができる。反応条件は、主に所望の程度の置換を生成するように反応を指向するように選択することができる。一般に、低温、低pH(例えば、pH=5)、および短い反応時間は、結合するPEGの数を低下させる傾向がある一方で、高温、中性~高pH(例えば、pH≧7)、およびより長い反応時間は、結合するPEGの数を増加させる傾向がある。当該技術分野で既知の様々な手段を使用して、反応を停止させることができる。いくつかの実施形態において、反応は、反応混合物を酸性化し、例えば、-20℃で凍結することによって停止される。様々な分子のペグ化は、例えば、米国特許第5,252,714号、同第5,643,575号、同第5,919,455号、同第5,932,462号、および同第5,985,263号で考察されている。PEG-IL-10は、例えば、米国特許第7,052,686号に記載されている。本明細書での使用が企図される特定の反応条件は、実験の節に明記されている。
ペグ化は、ポリペプチドのN末端のアルファ-アミノ基、リジン残基の側鎖上のイプシロンアミノ基、およびヒスチジン残基の側鎖上のイミダゾール基で最も頻繁に生じる。ほとんどの組換えポリペプチドは、単一のアルファ基ならびにいくつかのイプシロンアミノ基およびイミダゾール基を有するため、リンカー化学に応じて、多数の位置異性体を生成することができる。当該技術分野で既知の一般的なペグ化戦略が、本明細書に適用され得る。
本開示のポリペプチド配列の1つ以上の、スペーサーを有するPEGへの共役は、様々な従来の方法によって実行することができる。例えば、共役反応は、4:1~30:1の試薬対タンパク質のモル比を利用して、5~10のpHで溶液中、4℃~室温の温度で、30分~20時間実行することができる。反応条件は、主に所望の程度の置換を生成するように反応を指向するように選択することができる。一般に、低温、低pH(例えば、pH=5)、および短い反応時間は、結合するPEGの数を低下させる傾向がある一方で、高温、中性~高pH(例えば、pH≧7)、およびより長い反応時間は、結合するPEGの数を増加させる傾向がある。当該技術分野で既知の様々な手段を使用して、反応を停止させることができる。いくつかの実施形態において、反応は、反応混合物を酸性化し、例えば、-20℃で凍結することによって停止される。様々な分子のペグ化は、例えば、米国特許第5,252,714号、同第5,643,575号、同第5,919,455号、同第5,932,462号、および同第5,985,263号で考察されている。PEG-IL-10は、例えば、米国特許第7,052,686号に記載されている。
本開示は、当業者に既知の任意の手段によるペグ化IL-10の合成を企図するが、以下は、モノ-PEG-IL-10を生成するためのいくつかの代替的な合成スキームを提供し、モノ-PEG-IL-10とジ-PEG-IL-10との混合物は、例示を意図したものに過ぎない。モノ-PEG-IL-10、およびモノ-PEG-IL-10とジ-PEG-IL-10との混合物の両方は、多くの同等の特性を有するが、選択的にペグ化したモノ-PEG-IL-10とジ-PEG-IL-10との混合物は、最終ペグ化生成物の収率を改善させる(例えば、米国特許第7,052,686号および米国特許公開第2011/0250163号を参照されたい)。本開示の実施に好適なPEG(および他の薬物送達技術)の生成および使用における自身の技術を活用することに加えて、当業者はまた、PEG関連技術(および他の薬物送達技術)の多くの商業的供給業者にも精通している。例として、NOF America Corp(Irvine,CA)は、単官能性線状PEG、二官能性PEG、マルチアームPES、分岐状PEG、ヘテロ官能性PEG、フォーク型PEG、および放出可能PEGを供給しており、Parchem(New Rochelle,NY)は、PEG生成物および他の特殊原材料の世界的卸売業者である。
例示的なPEG-IL-10合成スキーム番号1。IL-10を、10mMのリン酸ナトリウム(pH7.0)、100mMのNaClに対して透析する。透析したIL-10を、透析緩衝液を使用して、約0.5~12mg/mLの濃度まで3.2倍に希釈する。リンカー、SC-PEG-12K(Delmar Scientific Laboratories、Maywood,Ill.)の添加前に、1体積の100mMの四ホウ酸ナトリウム(pH9.1)を9体積の希釈IL-10に添加して、IL-10溶液のpHを8.6まで上昇させる。SC-PEG-12Kリンカーを、透析緩衝液中に溶解させ、適切な体積のリンカー溶液(1モルのIL-10あたり1.8~3.6モルのリンカー)を希釈IL-10溶液に添加して、ペグ化反応を開始する。反応の速度を制御するために5℃で反応を実行し、反応溶液を穏やかに撹拌する。サイズ排除HPLC(SE-HPLC)によって決定されるモノ-PEG-IL-10の収率が、40%に近づいたとき、1Mのグリシン溶液を30mMの最終濃度まで添加することによって、反応を停止させる。HCl溶液を使用して、反応溶液のpHを7.0に緩徐に調整し、反応物を0.2ミクロンで濾過し、-80℃で保管する。
例示的なPEG-IL-10合成スキーム番号2。メトキシ-PEG-アルデヒド(PALD-PEG)をリンカーとして使用して、モノ-PEG-IL-10を調製する(Inhale Therapeutic Systems Inc.(Huntsville,AL)、NOF America Corp(Irvine,CA)からも入手可能)。PALD-PEGは、5KDa、12KDa、または20KDaの分子量を有し得る。反応緩衝液のpHが6.3~7.5であることを除いて、IL-10を、上述のように透析および希釈する。活性化PALD-PEGリンカーを、1:1のモル比で反応緩衝液に添加する。水性シアノ水素化ホウ素を、0.5~0.75mMの最終濃度になるまで反応混合物に添加する。室温(18~25℃)で15~20時間、穏やかに撹拌しながら、反応を実行する。1Mのグリシンで反応を停止させる。SE-HPLCによって収率を分析する。モノ-PEG-IL-10を、未反応のIL-10、PEGリンカー、およびジ-PEG-IL-10から、ゲル濾過クロマトグラフィーによって分離し、RP-HPLCおよびバイオアッセイ(例えば、IL-10応答性細胞または細胞株の刺激)によって特性評価する。
例示的なPEG-IL-10合成スキーム番号3。IL-10(例えば、げっ歯類または霊長類)を、50mMのリン酸ナトリウム、100mMの塩化ナトリウム(pH範囲5~7.4)に対して透析する。1:1~1:7のモル比の5K PEG-プロピルアルデヒドを、0.75~30mMのシアノ水素化ホウ素ナトリウムの存在下、1~12mg/mLの濃度のIL-10と反応させる。あるいは、反応は、類似の様式で、ピコリンボランで活性化してもよい。反応物を、5~30℃で3~24時間インキュベートする。ペグ化反応物のpHを6.3に調整し、7.5mg/mLのhIL-10をPEGと反応させて、IL-10対PEGリンカーの比を1:3.5にする。シアノ水素化ホウ素の最終濃度は、約25mMであり、反応は、15℃で12~15時間実行される。モノ-PEG IL-10およびジ-PEG IL-10は、最大の反応生成物であり、反応停止時の各々の濃度は、約45~50%である。反応は、グリシンもしくはリジンなどのアミノ酸、またはあるいはトリス緩衝液を使用して、停止させることができる。ゲル濾過、陰イオンおよび陽イオン交換クロマトグラフィー、ならびにサイズ排除HPLC(SE-HPLC)などの多数の精製方法を用いて、所望のペグ化IL-10分子を単離することができる。
いくつかの実施形態において、PEG-IL-10剤は、AM-0010である。AM0010という用語は、約1:1のモノペグ化rhIL-10ポリペプチドとジペグ化rhIL-10ポリペプチドとの混合物を含み、リンカーを介してIL-10ポリペプチドのN末端に結合した5kDaのポリエチレングリコール(PEG)を用いる、組換えヒトインターロイキン10(rHuIL-10)を指す。AM0010は、2つの非共有結合で関連付けられたrHuIL-10ポリペプチド単量体で構成される非グリコシル化ホモ二量体タンパク質であり、各単量体は、直接的発現の組換え細菌産生から生じる天然ヒトIL-10ポリペプチドには存在しないN末端メチオニンを含む、161個のアミノ酸で構成され、各単量体は、2つの分子内ジスルフィド結合を含み、第1のジスルフィド結合は、161個のアミノ酸のrHuIL-10ポリペプチドの13位および109位のシステインの間であり、第2のジスルフィド結合は、63位および115位のシステインの間である(天然に存在するhIL-10ポリペプチドの、12位および108位のシステインならびに62位および114位のシステインに対応する)。AM0010は、多数の臨床試験で評価されており、20マイクログラム/kgの1日1回の皮下用量で単剤として良好な耐容性を示しており、腎細胞癌(RCC、25%のORR)、ブドウ膜黒色腫における客観的応答、ならびに皮膚T細胞リンパ腫における最大で2.5年間の耐久性のある応答を有するCR、ならびにCRCおよびPDACにおける持続的な安定疾患が観察された。
G.グリコシル化IL-10:
本発明の一実施形態において、修飾IL-10剤は、グリコシル化IL-10である。本開示の目的のために、「グリコシル化」は、グリカンを、タンパク質、脂質、または他の有機分子に結合させる酵素プロセスを広く指すことが意図される。本開示と併せた「グリコシル化」という用語の使用は一般に、(基礎をなすグリコシル化部位の除去、または化学的および/もしくは酵素的手段によるグリコシル化の欠失のいずれかによる)1つ以上の炭水化物部分の追加または欠失、ならびに/あるいは天然配列内に存する可能性も存在しない可能性もある1つ以上のグリコシル化部位の追加を意味することが意図される。加えて、この語句は、存在する様々な炭水化物部分の性質および割合の変化を伴う、天然タンパク質のグリコシル化の定性的変化を含む。グリコシル化は、IL-10などのポリペプチドの物理的特性(溶解性など)に劇的な影響を与える可能性があり、タンパク質の安定性、分泌、および細胞内局在化にも重要である可能性がある。グリコシル化ポリペプチドはまた、増強した安定性を呈することもでき、半減期などの1つ以上の薬物動態学的特性を改善することもできる。加えて、溶解性の改善により、例えば、非グリコシル化ポリペプチドを含む製剤よりも薬剤投与に好適な製剤の生成が可能になる。
グリコシル化部位の付加は、IL-10ポリペプチドのアミノ酸配列を改変することにより達成することができる。IL-10ポリペプチドへの改変は、例えば、1つ以上のセリンもしくはスレオニン残基(O結合型グリコシル化部位の場合)またはアスパラギン残基(N結合型グリコシル化部位の場合)の付加、またはそれによる置換によって行うことができる。N結合型およびO結合型オリゴ糖の構造、ならびに各種類に見出される糖残基は、異なる場合がある。両方に一般的に見出される糖の1つの種類は、N-アセチルノイラミン酸(本明細書以下、シアル酸と称される)である。シアル酸は、通常、N結合型オリゴ糖およびO結合型オリゴ糖の両方の末端残基であり、その負電荷により、糖タンパク質に酸性特性を付与することができる。本開示の特定の実施形態は、N-グリコシル化変異体の生成および使用を含む。グリコシル化部位を組み込むための修飾アミノ酸配列を含むIL-10ポリペプチドの例は、例えば、2016年3月10日公開のVan Vlasselaerらの米国特許出願公開第US2016/0068583A1号に提供されている。本開示のIL-10ポリペプチド配列は、核酸レベルの変化を通して、特に、所望のアミノ酸に翻訳されるコドンを生成して、グリコシル化部位の導入を促進するように、ポリペプチドをコードする核酸を事前選択した塩基で変異させることによって、任意で改変されてもよい。
H.ポリシアル化IL-10
本発明の一実施形態において、修飾IL-10剤は、ポリシアル化IL-10である。「ポリシアリル化」という用語は、ポリペプチドの安定性およびインビボ薬物動態を改善するための、ポリペプチドと天然に存在する生分解性α-(2→8)結合ポリシアル酸(「PSA」)との共役を指す。PSAは、高度に親水性である、生分解性で非毒性の天然重合体であり、これにより血中の見かけの分子量が高くなり、その血清半減期が増加する。加えて、様々なペプチドおよびタンパク質治療剤のポリシアリル化は、タンパク質分解の著しい低減、インビボ活性における活性の保持、ならびに免疫原性および抗原性の低減をもたらしている(例えば、G.Gregoriadis et al.,Int.J.Pharmaceutics300(1-2):125-30を参照されたい)。部位特異的ポリシアリル化のための様々な技術が、利用可能である(例えば、T.Lindhout,et al.(2011)PNAS 108(18)7397-7402を参照されたい。
I.IL-10融合タンパク質
本発明の一実施形態において、修飾IL-10剤は、本明細書では「IL-10アルブミン融合体」と称されるアルブミンに共役される。IL-10アルブミン融合体の文脈で使用される場合、「アルブミン」という用語は、ヒト血清アルブミン(HSA)、カニクイザルアルブミン、およびウシ血清アルブミン(BSA)などのアルブミンを含む。本開示に従うと、アルブミンは、カルボキシル末端、アミノ末端、カルボキシル末端およびアミノ末端の両方、ならびに内部において、IL-10ポリペプチド(例えば、本明細書に記載のポリペプチド)に共役させることができる(例えば、USP5,876,969およびUPS7,056,701を参照されたい)。本開示によって企図されるHSA-IL-10ポリペプチド共役体では、アルブミン分泌プレ配列、ならびにそれらの変異体、それらの断片および変異体、およびHSA変異体などの様々な形態のアルブミンを使用することができる。そのような形態は一般に、1つ以上の所望のアルブミン活性を有する。追加の実施形態において、本開示は、アルブミン、アルブミン断片、およびアルブミンバリアントなどに直接的または間接的に融合したIL-10ポリペプチドを含む融合タンパク質を含み、融合タンパク質は、非融合薬物分子よりも高い血漿安定性を有し、かつ/または融合タンパク質は、非融合薬物分子の治療活性を保持する。いくつかの実施形態において、間接的な融合は、リンカー、例えば、ペプチドリンカーまたはその修飾バージョンによって行われる。
あるいは、IL-10アルブミン融合は、アルブミン結合ドメイン(ABD)ポリペプチド配列およびIL-10ポリペプチドを含む融合タンパク質である、IL-10ポリペプチドを含む。上記に言及したように、アルブミン結合ドメイン(ABD)ポリペプチド配列およびIL-10ポリペプチドを含む融合タンパク質は、例えば、HSAまたはその断片をコードする核酸が1つ以上のIL-10ポリペプチド配列をコードする核酸に接合されるような遺伝子操作によって行われ得る。
IL-10剤への共役のための追加の好適な構成成分および分子には、例えば、チログロブリン;破傷風トキソイド;ジフテリアトキソイド;ポリ(D-リジン:D-グルタミン酸)などのポリアミノ酸;ロタウイルスのVP6ポリペプチド;インフルエンザウイルスヘマグルチニン、インフルエンザウイルス核タンパク質;キーホールリンペットヘモシアニン(KLH);ならびにB型肝炎ウイルスのコアタンパク質および表面抗原;または前述のものの任意の組み合わせが含まれる。
本開示は、別のポリペプチド(例えば、主題のポリペプチドに対して異種のアミノ酸配列を有するポリペプチド)などのポリペプチド配列、または担体分子の、N末端および/またはC末端における1つ以上の追加の構成成分または分子の共役を企図する。したがって、例示的なポリペプチド配列は、別の構成成分または分子との共役体として提供され得る。
IL-10ポリペプチドはまた、タンパク質;セファロース、アガロース、セルロース、またはセルロースビーズなどの多糖;ポリグルタミン酸などの重合体アミノ酸、またはポリリジン;アミノ酸共重合体;不活性化ウイルス粒子;ジフテリア、破傷風、コレラ、またはロイコトキシン分子由来のトキソイドなどの不活性化細菌毒素;不活化細菌;および樹状細胞などの、大きく、緩徐に代謝される巨大分子に共役させることもできる。そのような共役形態は、所望される場合、本開示のポリペプチドに対する抗体の産生に使用してもよい。
共役のための追加の候補構成成分および分子には、単離または精製に好適なものが含まれる。特定の非限定的な例には、ビオチン(ビオチン-アビジン特異的結合対)などの結合分子、抗体、受容体、リガンド、レクチン、または例えば、プラスチックもしくはポリスチレンビーズ、プレートもしくはビーズ、磁気ビーズ、試験片、および膜を含む固体支持体を含む分子が含まれる。
ある特定の実施形態において、本開示のIL-10ポリペプチド配列のアミノ末端またはカルボキシル末端を免疫グロブリンFc領域(例えば、ヒトFc)と融合させて、融合共役体(または融合分子)を形成することができる。Fc融合共役体は、バイオ医薬品の全身半減期を増加させることが示されており、それによりバイオ医薬品生成物は、より少ない頻度の投与を必要とし得る。Fcは、血管を覆う内皮細胞内の新生児Fc受容体(FcRn)に結合し、結合時に、Fc融合分子は、分解から保護され、循環に再放出され、分子の循環をより長く保つ。このFc結合は、内因性IgGがその長い血漿半減期を保持する機構であると考えられている。より最近のFc融合技術は、バイオ医薬品の単一コピーを抗体のFc領域に結合させて、従来のFc融合共役体と比較して、バイオ医薬品の薬物動態学的および薬力学的特性を最適化する。
本開示は、1つ以上の特性を改善するためのIL-10剤の他の修飾の使用を企図する。例には、ヘシル化(その様々な態様は、例えば、米国特許出願第2007/0134197号および同第2006/0258607号に記載されている)、ならびに融合タグとしてSUMOを含むIL-10ポリペプチド融合分子(LifeSensors,Inc.;Malvern,PA)が含まれる。
本開示はまた、IL-10ポリペプチドが、IL-10ポリペプチドおよび1つ以上のPEG模倣物の融合タンパク質である、IL-10剤も企図する。いくつかの追加の有利な特性を付与しながら、PEGの属性(例えば、増強した血清半減期)を保持する、ポリペプチドPEG模倣物が開発されている。例として、PEGと類似した拡張構造を形成することができる単純なポリペプチド鎖(例えば、Ala、Glu、Gly、Pro、Ser、およびThrを含む)を、目的のペプチドまたはタンパク質薬物に既に融合された状態で、組換えにより生成することができる(例えば、AmunixのXTEN技術、Mountain View,CA)。そのようなポリペプチド配列の融合タンパク質を含むIL-10剤は、この融合タンパク質をコードする核酸配列の発現による組換え手段によって生成することができ、これは、製造プロセス中の追加の共役ステップの必要性を取り除く。さらに、確立された分子生物学技術は、ポリペプチド鎖の側鎖組成の制御を可能にし、これにより免疫原性および製造特性の最適化が可能となる。
リンカーおよびそれらの使用については、上述されている。本開示のポリペプチド配列の修飾に使用される前述の構成成分および分子のいずれも、任意で、リンカーを介してIL-10剤またはIL-10ポリペプチドに共役させることができる。好適なリンカーには、修飾ポリペプチド配列と結合した構成成分および分子との間のいくらかの移動を許容するのに一般に十分な長さである「可撓性リンカー」が含まれる。リンカー分子は一般に、約6~50原子長である。リンカー分子はまた、例えば、アリールアセチレン、2~10個の単量体単位を含有するエチレングリコールオリゴマー、ジアミン、二酸、アミノ酸、またはそれらの組み合わせであってもよい。好適なリンカーは、容易に選択することができ、1アミノ酸長(例えば、Gly)、2、3、4、5、6、7、8、9、10、10~20、20~30、30~50アミノ酸長、または50以上のアミノ酸長などの任意の好適な長さのものであり得る。
可撓性リンカーの例には、グリシン重合体(G)、グリシン-セリン重合体(例えば、(GS)、GSGGS(配列番号16)、およびGGGS(配列番号17)(式中、nは、少なくとも1の整数である))、グリシン-アラニン重合体、アラニン-セリン重合体、ならびに他の可撓性リンカーが含まれる。グリシン重合体およびグリシン-セリン重合体は、比較的構造不定であるため、構成成分間の中性テザーとして機能することができる。
可撓性リンカーのさらなる例には、グリシン重合体(G)、グリシン-アラニン重合体、アラニン-セリン重合体、グリシン-セリン重合体(例えば、(G、(GSGGS)(配列番号18)、(G(配列番号19)、(G(配列番号220)、(GSGGS(配列番号21)、(GSGSG)(配列番号22)、および(GGGS(配列番号23)、ならびにそれらの組み合わせ(式中、m、n、およびoは、各々独立して、少なくとも1~20の整数、例えば、1~18、2~16、3~14、4~12、5~10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10から選択される)、ならびに他の可撓性リンカーが含まれる。グリシン重合体およびグリシン-セリン重合体は、比較的構造不定であるため、構成成分間の中性テザーとして機能することができる。可撓性リンカーの例には、GGSG(配列番号24)、GGSGG(配列番号25)、GSGSG(配列番号26)、GSGGG(配列番号27)、GGGSG(配列番号28)、およびGSSSG(配列番号29)が含まれるが、これらに限定されない。
追加の可撓性リンカーには、グリシン重合体(G)またはグリシン-セリン重合体(例えば、(GS)、(GSGGS)(配列番号16)、(GGGS)(配列番号17)、および(GGGGS)(配列番号30)(式中、n=1~50、例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、10~20、20~30、30~50である)が含まれる。例示的な可撓性リンカーには、GGGS(配列番号31)、GGGGS(配列番号32)、GGSG(配列番号33)、GGSGG(配列番号34)、GSGSG(配列番号35)、GSGGG(配列番号36)、GGGSG(配列番号37)、およびGSSSG(配列番号38)が含まれるが、これらに限定されない。これらのリンカー配列の多量体(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、10~20、20~30、または30~50)をともに結合させて、異種アミノ酸配列の、本明細書に開示されるポリペプチドへの共役に使用され得る、可撓性リンカーを提供してもよい。本明細書に記載のように、異種アミノ酸配列は、アルブミンおよびFc配列などのシグナル配列および/または融合パートナーであり得る。
J.キメラ抗原受容体:
本発明の実施に有用なCARは、当該技術分野で周知の原理に従って調製される。例えば、2010年6月22日に発行されたEshhaarらの米国特許第7,741,465B1号、Sadelain,et al(2013)Cancer Discovery 3(4):388-398(キメラ抗原受容体(CAR)設計の基本原理)、Jensen and Riddell(2015)Current Opinions in Immunology 33:9-15(腫瘍を効果的かつ安全に標的とするキメラ抗原受容体の設計)、Gross,et al.(1989)PNAS(USA)86(24):10024-10028(抗体型特異性を有する機能的受容体としての免疫グロブリン-T細胞受容体キメラ分子の発現)、Curran,et al.(2012)J Gene Med 14(6):405-15を参照されたい。本発明の文脈におけるCARおよびその機能的ドメインの構築に関する考慮を以下で考察する。
CAR-T細胞療法製品は、米国食品医薬品局によって米国での商業的使用が承認されており、本開示の教示に従う使用に適している。本明細書に記載の方法および組成物と組み合わせて使用することができる市販のCAR-T細胞製品の例には、アキシカブタジェンシロルーセル(axicabtagene ciloleucel)(Gilead Pharmaceuticalsから市販されているYescarta(登録商標)として販売されている)およびチサゲンレクロイセル(tisagenlecleucel)(Novartisから市販されているKymriah(登録商標)として販売されている)が含まれる。
(a)シグナル配列;
本発明のCARは、ARDの表面表示を容易にするためのシグナルペプチドを含む(以下を参照)。本発明の実施において、任意の真核生物シグナルペプチド配列が、使用され得る。シグナルペプチドは、表面発現タンパク質の天然のシグナルペプチドに由来し得る。本発明の一実施形態において、CARのシグナルペプチドは、ヒト血清アルブミンシグナルペプチド、プロラクチンアルブミンシグナルペプチド、ヒトIL2シグナルペプチド、ヒトトリプシノーゲン-2、ヒトCD-5、ヒト免疫グロブリンカッパ軽鎖、ヒトアズロシジン、ガウシアルシフェラーゼ、およびそれらの機能的誘導体からなる群から選択されるシグナルペプチドである。シグナルペプチドを使用して分泌効率を高めるための特定のアミノ酸置換は、Stern,et al.(2007)Trends in Cell and Molecular Biology 2:1-17およびKober,et al.(2013)Biotechnol Bioeng.1110(4):1164-73に記載されている。あるいは、シグナルペプチドは、確立された原理に従って調製された合成配列であり得る。例えば、Nielsen,et al.(1997)Protein Engineering 10(1):1-6(原核生物および真核生物のシグナルペプチドの同定およびそれらの切断部位の予測)、Bendtsen,et al(2004)J.Mol.Biol 340(4):783-795(シグナルペプチドSignalP 3.0の改善された予測)、Petersen,et al(2011)Nature Methods 8:785-796(Signal P4.0;シグナルペプチドを膜貫通領域と区別する)を参照されたい。
(b)細胞外抗原認識ドメイン
本発明のCARは、標的細胞の表面上に発現する抗原に特異的に結合する細胞外抗原認識ドメイン(「ARD」)をさらに含む。ARDは、標的細胞の表面上に発現する抗原に特異的に結合する任意の一本鎖ポリペプチドであり得る。標的細胞の表面上に発現する抗原の選択は、ARDの設計および選択を決定する。ある特定の実施形態において、標的細胞集団は、腫瘍抗原を含み得る。Vigneron,N.ら((2013年7月15日)Cancer Immunity 13:15)は、400を超える腫瘍抗原ペプチドを含むT細胞定義のヒト腫瘍抗原のデータベースについて説明する。CARのARDによって標的とされ得る腫瘍抗原の例には、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド(MICA/BならびにULBP-1、-2、-3、および-4を含む)、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A(PDGFRαとも呼ばれる)、ならびにWnt1抗原を含まれるが、これらに限定されない、群から選択される1つ以上の抗原が含まれる。
一実施形態において、ARDは、一本鎖Fv(ScFv)である。ScFvは、ペプチドリンカーによって共有結合された抗体の免疫グロブリン重鎖および軽鎖の可変領域で構成されるポリペプチドである(Bird,et al.(1988)Science 242:423-426、Huston,et al.(1988)PNAS(USA)85:5879-5883、S-z Hu,et al.(1996)Cancer Research,56,3055-3061、Ladnerの1990年8月7日に発行された米国特許第4946778号)。抗標的抗原ScFvの調製は、抗標的抗原ScFvが由来する標的抗原に対するモノクローナル抗体を生成することによって進行する。モノクローナル抗体の生成およびハイブリドーマの単離は、当業者によく知られている技術である。例えば、Monoclonal Antibodies:A Laboratory Manual,Second Edition,Chapter 7(E.Greenfield,Ed.2014 Cold Spring Harbor Press)を参照されたい。免疫応答は、ミョウバン、アルミニウム塩、またはフロイント、SP-21などの当該技術分野でよく知られているアジュバントの同時投与によって増強され得る。生成された抗体は、ファージディスプレイおよび指向性進化などの当該技術分野でよく知られている技術を通して特定の所望の特徴を有する抗体を選択するように最適化され得る。例えば、Barbas,et al.(1991)PNAS(USA)88:7978-82、Ladnerらの1993年6月29日に発行された米国特許第5,223,409号、Stemmer,W.(1994)Nature 370:389-91、Garrardの1998年10月13日に発行された米国特許第5,821,047号、Camps,et al.(2003)PNAS(USA)100(17):9727-32、Dulbeccoの1986年6月3日に発行された米国特許第4,593,002号、McCaffertyの2004年10月19日に発行された米国特許第6,806,079号、McCaffertyの2009年12月22日に発行された米国特許第7,635,666号、McCaffertyの2010年2月16日に発行された米国特許第7,662,557号、McCaffertyの2010年5月25日に発行された米国特許第7,723,271号、および/またはMcCaffertyの米国特許第7,732,377号を参照されたい。モノクローナル抗体配列に基づくScFvの生成は、当該技術分野でよく知られている。例えば、The Protein Protocols Handbook,John M.Walker,Ed.(2002)Humana Press Section 150“Bacterial Expression,Purification and Characterization of Single-Chain Antibodies”Kipriyanov,Sを参照されたい。いくつかの実施形態において、ARDは、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソセリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvに由来する。
別の実施形態において、ARDは、ラクダまたはラマを標的細胞由来の抗原で免疫化することによって得られる単一ドメイン抗体である。例えば、Muyldermans,S.(2001)Reviews in Molecular Biotechnology 74:277-302を参照されたい。
あるいは、ARDは、ペプチドライブラリーの生成および所望の標的細胞抗原結合特性を有する化合物の単離を介して完全に合成的に生成され得る。そのような技術は、科学文献でよく知られている。例えば、Wiglerらの1999年11月12日に発行された米国特許第6303313B1号、Knappikらの2004年2月24日に発行された米国特許第6,696,248B1号、Binz,et al.(2005)Nature Biotechnology 23:1257-1268、Bradbury,et al.(2011)Nature Biotechnology 29:245-254を参照されたい。
標的細胞発現抗原に対して親和性を有するARDに加えて、ARDはまた、追加の分子に対して親和性を有し得る。例えば、本発明のARDは、二重特異性であり得る、すなわち、第1の標的細胞発現抗原および第2の標的細胞発現抗原への特異的結合を提供することができる。二価の一本鎖ポリペプチドの例は、当該技術分野で知られている。例えば、Thirion,et al.(1996)European J.of Cancer Prevention 5(6):507-511、DeKruif and Logenberg(1996)J.Biol.Chem 271(13)7630-7634、およびKayらの2015年11月5日に公開された米国特許出願公開第2015/0315566号を参照されたい。
代替の実施形態において、CARまたはCARのARDは、免疫療法に応答して誘導されたクローンのTCRに由来し得る。新規腫瘍特異的TCR配列を同定し、これらの配列を含むCAR T細胞の産生にそのような配列を組み込むための方法は、2017年7月20日にWO2017/123557A1として公開されたMummらのPCT/US2017/012882に記載されており、その全教示は、参照により本明細書に組み込まれる。簡単に言えば、IL-10剤療法は、IL-10剤を患者に投与した後、疾患抗原特異的CD8+T細胞を患者の末梢に誘導する結果となる。患者が一定期間IL-10剤療法を受けた後、リンパ球を含む組織試料、例えば、末梢血リンパ球(PBL)を含む末梢血試料が、白血球アフェレーシスなどの従来の手順によって患者から収集され得る。組織試料を収集した後、試料中の核酸を配列決定によって分析して、TCR配列(例えば、可変アルファ(Vα)TCRポリペプチドをコードするおよび/または可変ベータ(Vβ)TCRポリペプチドをコードする核酸)を得る。配列決定の読みを分析して、CD8+T細胞上に発現する、すなわち試料中の抗原特異的T細胞の細胞表面上に機能的に存在するTCRに対してVα TCRポリペプチドをコードする核酸および/またはVβ TCRポリペプチドをコードする核酸の存在量の推定値を得ることができる。試料中のCD8+T細胞上に発現するTCRに対してVα TCRポリペプチドをコードする核酸および/またはVβ TCRポリペプチドをコードする核酸の存在量を、IL-10剤療法中のより早い時点で参照試料中のVα TCRポリペプチドをコードする核酸および/またはVβ TCRポリペプチドをコードする核酸VαTCRポリペプチドおよび/または核酸をコードする核酸の存在量と比較することによって、Vβ TCRポリペプチドをコードすることにより、(α鎖およびβ鎖TCR対配列によって定義される)抗原特異的TCRを発現する特定のT細胞集団が、IL-10剤療法に応答して、クローン的に広がった、クローン的に収縮、または新たに生成されていることを同定することが可能である。CD8+T細胞、例えば単離されたCD8+T細胞の表面上に発現するTCRのアルファ鎖とベータ鎖の対をコードする核酸を配列決定した後、各鎖のCDR領域を含むアルファ鎖およびベータ鎖のアミノ酸配列が、決定され得る。これらのTCR対アミノ酸配列を使用して、完全長α鎖およびβ鎖TCR対アミノ配列をコードする核酸構築物、またはα鎖およびβ鎖TCR対アミノ配列の可変領域を含むキメラ抗原受容体を形質導入することによって、組換え疾患抗原特異的CAR-T細胞を生成し得る。次いで、そのような疾患抗原特異的CAR-T細胞は、そのCAR-T細胞が対象の腫瘍細胞に対する活性のために特に選択され得るため、新規TCR配列が単離された患者を含む、疾患の治療を必要とする好適な患者に投与され得る。新生抗原誘導T細胞を単離するための方法は、Cohen,et al.(2015)Journal of Clinical Investigation 125(10):3981-3991に記載されている。そのような患者由来の配列は、免疫療法、特にIL-10療法に応答して誘導されるこれらの新規T細胞クローンが、対象に存在する腫瘍細胞の集団に対して選択された親和性を有するTCRを含み、したがって、「一般的な」腫瘍抗原と比較して、特異性および標的効率の向上を提供することが期待され得る場合に、本発明の実施において特に有用である。
c)膜貫通ドメイン:
本発明の実施に有用なCARは、抗標的抗原ARD(または含まれる場合はスペーサー)をCARの細胞内ドメインに連結する膜貫通ドメインをさらに提供する。膜貫通ドメインは、真核生物の細胞膜で熱力学的に安定している任意の配列からなる。本発明の実施に有用なCARの構築に有用な膜貫通ドメインは、アルファヘリックス二次構造を有する形成に有利な約20個のアミノ酸からなる。膜貫通ドメインは、天然に存在する膜貫通タンパク質の膜貫通ドメインに由来し得る。あるいは、膜貫通ドメインは、合成であり得る。合成膜貫通ドメインの設計においては、アルファヘリックス構造に有利なアミノ酸が、好ましい。アルファヘリックスの形成に有利なアミノ酸は、当該技術分野でよく知られている。例えば、Pace,et al.(1998)Biophysical Journal 75:422-427を参照されたい。
(d)細胞内シグナル伝達ドメイン
CARの細胞内ドメインは、1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ζ鎖)を含む。一実施形態において、細胞内シグナルドメインは、T細胞受容体(TCR)の細胞質配列と、抗原受容体の関与および機能的誘導体およびそのサブ断片に続いてシグナル伝達を開始する共受容体と、を含む。さらに、または代替的に、CARの細胞質ドメインは、1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含み得る。細胞内シグナル伝達ドメインの例には、CD27、CD28の細胞質ドメイン、CD137の細胞質ドメイン(4-1BBおよびTNFRSF9とも称される)、CD278の細胞質ドメイン(ICOSとも称される)、PI3キナーゼp110α、β、またはδ触媒サブユニット)、CD3ζ鎖、CD134の細胞質ドメイン(OX40およびTNFRSF4とも称される)が含まれるが、これらに限定されない。FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖など)、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3ポリペプチド(δ、Δ、およびε)、sykファミリーチロシンキナーゼ(Syk、ZAP 70など)、srcファミリーのチロシンキナーゼ(Lck、Fyn、Lynなど)、ならびにCD2、CD5、およびCD28などのT細胞形質導入に関与する他の分子。本発明の一実施形態において、CARの細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζ鎖である。本発明の別の実施形態において、CARの細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζ鎖およびCD28の細胞質ドメインを含む。本発明の別の実施形態において、CARの細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζ鎖、CD28の細胞質ドメインS、およびOX40を含む三量体構造である。一実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインおよびCD28のシグナル伝達ドメインを含む。別の実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζのシグナル伝達ドメインおよびCD137のシグナル伝達ドメインを含む。別の実施形態において、細胞質ドメインは、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインならびにCD28およびCD137のシグナル伝達ドメインを含む。細胞内ドメインはまた、1つのシグナル伝達ドメインに加えて、1つ以上の「共刺激ドメイン」(CSD)も提供し得る。共刺激ドメインとは、メモリ細胞の増殖、生存、または発達を促進するCARの部分を指す。本開示のいくつかの実施形態において、CSDは、TNFRスーパーファミリーのメンバーの1つ以上、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、CD40、またはそれらの組み合わせを含む。当業者は、本開示の教示と併せて使用され得る他の共刺激ドメインを認識している。
CAR-T細胞療法は比較的急速に進行しており(一般に、米国特許出願公開第2015/0038684号を参照)、その多くは細胞内シグナル伝達ドメインの性質に焦点を合わせている。いわゆる「第1世代のCAR」は、T細胞受容体(TCR)複合体のCD3ζ活性化鎖への抗原認識ドメインの融合を対象とした。これらの第1世代のCARは、インビトロでT細胞エフェクター機能を誘導したが、インビボでの有効性は、その不十分な抗腫瘍効力によって大きく制限された。CAR技術の発展によって、「第2世代のCAR」がもたらされ、これは1つのCSDと並んでCD3ζ活性化鎖を含み、この例には、CD28または様々なTNF受容体ファミリー分子、例えば4-1BB(41BB、CD137)およびOX40(CD134)由来の細胞内ドメインが含まれる。CD3ζ活性化鎖に加えて2つの共刺激シグナルを含む「第3世代のCAR」が開発され、CSDは最も一般的にはCD28および4-1BBに由来する。第2世代および第3世代のCARは、抗腫瘍効力を劇的に向上させた。第2世代および第3世代のCARの効力の増大は、CAR-T細胞に対する抗原標的が非標的細胞上に発現する可能性があることと相まって、重度の毒性の危険性も増大させた。(例えば、Carpenito et al.(2009)Proc Natl Acad Sci USA 106(9):3360-65、Grupp et al.(2013)N Engl J Med 368(16):1509-18)を参照されたい)、その結果、このような第2世代および第3世代のCAR-Tの使用は、第1世代のCAR-Tに通常関連する用量よりも低い用量で評価する必要がある。
本発明のいくつかの実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、以下の配列においてアミノからカルボキシに配置された以下のドメインのポリペプチドを含む:
-CD3ζ
-CD28-41BB-CD3ζ,
-CD28-CD3ζ
-CD28-OX40-CD3ζ
-CD28-41BB-CD3ζ
-OX40-CD3ζ
-OX40-CD28-CD3ζ
-41BB-CD3ζ
-ICOS-CD3ζ
-ICOS-41BB-CD3ζ
-41BB-ICOS-CD3ζ
-41BB-OX40-CD3ζ、および
-41BB-CD28-CD3ζ。
(e)リンカー
本発明の実施に有用なCARは、任意に、CARのドメイン、特にARDとCARの膜貫通ドメインとの間の結合を連結する1つ以上のポリペプチドスペーサーを含み得る。CAR構造の必須要素ではないが、スペーサードメインを含めることは、ARDによる抗原認識を容易にするために一般的に望ましいと考えられている。Moritz and Groner(1995)Gene Therapy 2(8)539-546。本明細書に記載のCAR-T細胞技術と併せて使用される場合、「リンカー」、「リンカードメイン」、および「リンカー領域」という用語は、本開示のCARのドメイン/領域のうちのいずれかを一緒に連結する、約1~100アミノ酸長のオリゴ領域またはポリペプチド領域を指す。リンカーは、隣接するタンパク質ドメインが互いに自由に移動できるように、グリシンおよびセリンのような可撓性残基から構成され得る。ある特定の実施形態は、2つの隣接するドメインが互いに立体的に干渉しないことを確実にすることが望ましい場合に、より長い長さのリンカーの使用を含む。いくつかの実施形態において、リンカーは切断不可能であるが、他の実施形態において、リンカーは切断可能である(例えば、2Aリンカー(例えば、T2A))、2A様リンカーまたはそれらの機能的同等物、および前述の組み合わせである。スペーサー機能を達成するために必要なアミノ酸の特定の配列はないが、スペーサーの典型的な特性は、ARDの動きの自由を可能にして標的抗原認識を容易にする柔軟性である。同様に、CAR機能を維持しながらスペーサーの長さにかなりの寛大さが存在することが見出されている。Jensen and Riddell(2014)Immunol.Review 257(1)127-144。本発明の実施に有用なCARの構築においてスペーサーとして有用な配列には、IgG1のヒンジ領域、免疫グロブリン1CH2-CH3領域、IgG4ヒンジ-CH2-CH3、IgG4ヒンジ-CH3、およびIgG4ヒンジが含まれるが、これらに限定されない。ヒンジおよび膜貫通ドメインは、CD8-アルファのヒンジおよび膜貫通ドメインなどと同じ分子に由来し得る。Imai,et al.(2004)Leukemia 18(4):676-684。リンカーが、ピコルナウイルス2A様リンカー、ブタテッショウウイルス(P2A)のCHYSEL配列、ゾゼアアシグナ(thosea asigna)ウイルス(T2A)、またはそれらの組み合わせ、バリアント、および機能的均等物を含む、本開示の実施形態が企図される。さらに別の実施形態において、リンカー配列は、2Aグリシンと2Bプロリンとの間の切断をもたらすAsp-Val/Ile-Glu-X-Asn-Pro-Gly(2A)-プロ(2B)モチーフを含む。
本発明のいくつかの実施形態において、CARは、以下のようにアミノからカルボキシ末端に配置された、介在またはスペーサー配列を提供し得る以下の機能的ドメインを含むポリペプチドである:
抗CD20-CD3ζ
抗CD20-CD28-41BB-CD3ζ、
抗CD20-CD28-CD3ζ
抗CD20-CD28-OX40-CD3ζ
抗CD20-CD28-41BB-CD3ζ
抗CD20-OX40-CD3ζ
抗CD20-OX40-CD28-CD3ζ
抗CD20-41BB-CD3ζ
抗CD20-ICOS-CD3ζ
抗CD20-ICOS-41BB-CD3ζ
抗CD20-41BB-ICOS-CD3ζ
抗CD20-41BB-OX40-CD3ζ
抗CD20-41BB-CD28-CD3ζ
抗HER2-CD3ζ
抗HER2-CD28-41BB-CD3ζ
抗HER2-CD28-CD3ζ
抗HER2-CD28-OX40-CD3ζ
抗HER2-CD28-41BB-CD3ζ
抗HER2-OX40-CD3ζ
抗HER2-OX40-CD28-CD3ζ
抗HER2-41BB-CD3ζ
抗HER2-ICOS-CD3ζ
抗HER2-ICOS-41BB-CD3ζ
抗HER2-41BB-ICOS-CD3ζ
抗HER2-41BB-OX40-CD3ζ
抗HER2-41BB-CD28-CD3ζ
抗CEA-CD3ζ
抗CEA-CD28-41BB-CD3ζ
抗CEA-CD28-CD3ζ
抗CEA-CD28-OX40-CD3ζ
抗CEA-CD28-41BB-CD3ζ
抗CEA-OX40-CD3ζ
抗CEA-OX40-CD28-CD3ζ
抗CEA-41BB-CD3ζ
抗CEA-ICOS-CD3ζ
抗CEA-ICOS-41BB-CD3ζ
抗CEA-41BB-ICOS-CD3ζ
抗CEA-41BB-OX40-CD3ζ
抗CEA-41BB-CD28-CD3ζ
抗VEGF-CD3ζ
抗VEGF-CD28-41BB-CD3ζ
抗VEGF-CD28-CD3ζ
抗VEGF-CD28-OX40-CD3ζ
抗VEGF-CD28-41BB-CD3ζ
抗VEGF-OX40-CD3ζ
抗VEGF-OX40-CD28-CD3ζ
抗VEGF-41BB-CD3ζ
抗VEGF-ICOS-CD3ζ
抗VEGF-ICOS-41BB-CD3ζ
抗VEGF-41BB-ICOS-CD3ζ
抗VEGF-41BB-OX40-CD3ζ
抗VEGF-41BB-CD28-CD3ζ
抗CD19-CD3ζ
抗CD19-CD28-41BB-CD3ζ
抗CD19-CD28-CD3ζ
抗CD19-CD28-OX40-CD3ζ
抗CD19-CD28-41BB-CD3ζ
抗CD19-OX40-CD3ζ
抗CD19-OX40-CD28-CD3ζ
抗CD19-41BB-CD3ζ
抗CD19-ICOS-CD3ζ
抗CD19-ICOS-41BB-CD3ζ
抗CD19-41BB-ICOS-CD3ζ
抗CD19-41BB-OX40-CD3ζ
抗CD19-41BB-CD28-CD3ζ
抗EGFR-CD3ζ
抗EGFR-CD28-41BB-CD3ζ
抗EGFR-CD28-CD3ζ
抗EGFR-CD28-OX40-CD3ζ
抗EGFR-CD28-41BB-CD3ζ
抗EGFR-OX40-CD3ζ
抗EGFR-OX40-CD28-CD3ζ
抗EGFR-41BB-CD3ζ
抗EGFR-ICOS-CD3ζ
抗EGFR-ICOS-41BB-CD3ζ
抗EGFR-41BB-ICOS-CD3ζ
抗EGFR-41BB-OX40-CD3ζ、および
抗EGFR-41BB-CD28-CD3ζ。
K.CAR発現ベクター
本発明の実施に有用なCAR T細胞の調製は、単離されたT細胞を、上記のCARポリタンパク質をコードする核酸配列を含む発現ベクターで形質転換することによって達成される。
T細胞におけるCARの発現のための発現ベクターは、ウイルスベクターまたは非ウイルスベクターであり得る。「非ウイルスベクター」という用語は、正常なゲノムとは異なり、標的細胞におけるコード配列の発現に影響を与えることができる非選択的条件下での細胞生存に必須ではない、自律的に複製する染色体外環状DNA分子を指す。プラスミドは、非ウイルスベクターの例である。標的細胞のトランスフェクションを容易にするために、標的細胞は、非ウイルスベクターの取り込みを容易にする条件下で、非ウイルスベクターに直接曝露され得る。哺乳動物細胞による外来核酸の取り込みを促進する条件の例は、当該技術分野でよく知られており、化学的手段(Lipofectamine(登録商標)、Thermo-Fisher Scientificなど)、高塩、磁場(エレクトロポレーション)が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態において、非ウイルスベクターは、非ウイルス送達システムで提供され得る。非ウイルス送達システムは、典型的には、核酸がカチオン性脂質(DOTAP、DOTMA)、界面活性剤、生物学的物質(ゼラチン、キトサン)、金属(金、磁性鉄)、および合成ポリマー(PLG、PEI、PAMAM)などの薬剤と複合体を形成する核酸カーゴによる標的細胞の形質導入を促進するための複合体である。非ウイルス送達システムの多数の実施形態は、脂質ベクターシステム(Lee et al.(1997)Crit Rev Ther Drug Carrier Syst.14:173-206)、ポリマー被覆リポソーム(Marinらの1993年5月25日に発行された米国特許第5,213,804号、Woodleらの1991年5月7日に発行された米国特許第5,013,556号)、カチオン性リポソーム(Epandらの1994年2月1日に発行された米国特許第5,283,185号、Jessee,J.A.の1996年11月26日に発行された米国特許第5,578,475号、Roseらの1994年1月18日に発行された米国特許第5,279,833号、Gebeyehuらの1994年8月2日に発行された米国特許第5,334,761号)を含む当該技術分野でよく知られている。非ウイルスベクターを用いるT細胞におけるCAR配列の発現効率は、いわゆるSleeping Beauty(SB)トランスポゾンシステムなどのトランスポゾン/トランスポザーゼシステム(例えば、Geurts,et al.(2003)Mol Ther 8(1):108-117を参照されたい)を使用することで大幅に向上させることができ、piggyBacシステム(例えば、Manuri,et al.(2010)Human Gene Therapy 21(4):427-437を参照されたい)を使用して、ヒトT細胞への抗標的抗原CARをコードする核酸配列を含む非ウイルス性ベクター(例えばプラスミド)を安定して導入することができる。
別の実施形態において、発現ベクターは、ウイルスベクターであり得る。本明細書で使用される場合、ウイルスベクターという用語は、その従来の意味で、タンパク質合成またはエネルギー産生機構を有さない義務的な細胞内寄生虫のうちのいずれかを指すために使用され、外因性の導入遺伝子を哺乳類細胞に送達するために一般に使用される、エンベロープまたは非エンベロープ動物ウイルスのうちのいずれかを指す。ウイルスベクターは、複製可能(例えば、実質的に野生型)、条件付き複製(ある特定の条件下で複製するように組換え操作される)、または複製欠損(ウイルスの欠失した機能を補完することができる細胞株の不在下で実質的に複製できない)であり得る。ウイルスベクターは、それを「選択的に複製する」ようにする、すなわち、それは、ある特定の細胞型または表現型細胞状態、例えば、癌性において優先的に複製するためのある特定の修飾を有することができる。本発明の実施に有用なウイルスベクターシステムには、例えば、天然に存在するまたは組換えウイルスベクターシステムが含まれる。本発明の実施に有用なウイルスの例には、組換え改変されたエンベロープまたは非エンベロープDNAおよびRNAウイルスが含まれる。例えば、ウイルスベクターは、ヒトまたはウシアデノウイルス、ワクシニアウイルス、レンチウイルス、ヘルペスウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、シンドビスウイルス、およびレトロウイルス(ルース肉腫ウイルスを含むがこれらに限定されない)、およびB型肝炎ウイルスのゲノムに由来し得る。典型的には、目的の遺伝子がそのようなベクターに挿入されて、典型的には付随するウイルスゲノム配列を伴う遺伝子構築物のパッケージングを可能にし、続いて感受性宿主細胞の感染をもたらし、目的の遺伝子(例えば、標的抗原)の発現をもたらす。加えて、抗標的抗原CARをコードする発現ベクターもまた、mRNAベクターであり得る。ウイルスベクターシステムをトランスフェクションに使用する場合、レトロウイルスまたはレンチウイルス発現ベクターは、これらのシステムを使用したT細胞への遺伝子導入の有効性が高まり、臨床応用のためのかなりの量のT細胞の培養時間が短縮されるため、T細胞をトランスフェクトすることが好ましい。特に、ガンマレトロウイルスは、臨床グレードのT細胞の遺伝子改変に特に好ましく、治療効果があることが示されている。Pule,et al.(2008)Nature Medicine 14(11):1264-1270。同様に、自己不活化レンチウイルスベクターはまた、静止状態のT細胞に組み込まれることが実証されているため、有用である。June,et al.(2009)Nat Rev Immunol 9(10):704-716。CAR配列(および任意の追加の導入遺伝子)の発現に有用な特定のレトロウイルスベクターは、Naldini,et al.(1996)In Vivo Gene Delivery and Stable Transduction of Nondividing Cells by a Lentiviral Vector,Science 272:263-267、Naldini,et al.(1996)Efficient transfer,integration,and sustained long-term expression of the transgene in adult rat brains injected with a lentiviral vector,Proc.Natl.Acad.Sci.USA Vol.93,pp.11382-11388、Dull,et al.(1998)A Third-Generation Lentivirus Vector with a Conditional Packaging System,J.Virology 72(11):8463-8471、Milone,et al.(2009)Chimeric Receptors Containing CD137 Signal Transduction Domains Mediate Enhanced Survival of T Cells and Increased Antileukemic Efficacy In Vivo,Molecular Therapy 17(8):1453-1464、Kingsmanらの2000年8月1日に発行された米国特許第6,096,538号、およびKingsmanらの2005年8月2日に発行された米国特許第6,924,123号に記載されるものであり、参照により本明細書に組み込まれる。本発明の一実施形態において、CAR発現ベクターは、Oxford Biomedicaからのライセンスの下で入手可能なLentivector(登録商標)レンチウイルスベクターである。
L.CARベクターによってコードおよび発現された任意の導入遺伝子
CARの発現ベクターは、標的抗原に加えて、1つ以上のポリペプチドをコードし得る。本発明の実施のように多数のポリペプチドを発現する場合、各ポリペプチドは、発現制御配列(モノシストロン性)に作動可能に連結され得るか、または多数のポリペプチドは、多数の核酸配列が単一の発現制御配列に作動可能に連結され、任意に、介在配列(例えばIRES要素)を提供する場合に、ポリシストロン性構築物によってコードされ得る。
一実施形態において、標的抗原をコードする発現ベクターは、任意に、1つ以上の免疫学的調節剤をさらにコードし得る。本発明の実施に有用な免疫学的調節剤の例には、サイトカインが含まれるが、これに限定されない。そのようなサイトカインの例は、IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-12、IL-18、TNF-アルファ、インターフェロンアルファ、インターフェロンアルファ-2b、インターフェロン-ベータ、インターフェロン-ガンマ、GM-CSF、MIP1-アルファ、MIP1-ベータ、MIP3-アルファ、TGF-ベータ、および免疫応答を調節することができる他の適切なサイトカインを含むが、これらに限定されないインターロイキンである。発現されたサイトカインは、細胞内発現に向けられ得るか、または細胞外提示もしくは分泌のためのシグナル配列で発現され得る。
IL-12:一実施形態において、ベクターは、一実施形態において、CAR-T細胞療法の文脈において増強された抗腫瘍効果を提供すると報告されているIL-12四量体を生成するために必要なIL-12A(p35)およびIL-12B(p40)コード配列を提供することによって、ポリペプチドIL-12剤をコードする核酸配列をさらに含む(例えば、Pegram et al(2012)Blood 119(18):4133-4141、2017年9月5日にオンラインで公表されるYeku,et al(2017)Scientific Reports Vol.7,商品番号:10541)。
IL15剤:別の実施形態において、ベクターは、ポリペプチドIL-15剤をコードする核酸配列をさらに含む。ポリペプチドIL-15剤という用語には、ヒトIL-15分子のバリアント、類似体が含まれる。別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有するプレ-プロ-ヒトIL-15ポリペプチド(hIL15)をコードする核酸配列をさらに含む。
MRISKPHLRS ISIQCYLCLL LNSHFLTEAG IHVFILGCFS AGLPKTEANW VNVISDLKKI EDLIQSMHID ATLYTESDVH PSCKVTAMKC FLLELQVISL ESGDASIHDT VENLIILANN SLSSNGNVTE SGCKECEELE EKNIKEFLQS FVHIVQMFIN TS(配列番号39)
別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有するプレ-ヒトIL-15ポリペプチド(hIL15)をコードする核酸配列をさらに含む。
MRISKPHLRS ISIQCYLCLL LNSHFLTEAN WVNVISDLKK IEDLIQSMHI DATLYTESDV HPSCKVTAMK CFLLELQVIS LESGDASIHD TVENLIILAN NSLSSNGNVT ESGCKECEEL EEKNIKEFLQ SFVHIVQMFI NTS(配列番号40)
別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有するプロ-ヒトIL-15ポリペプチド(hIL15)をコードする核酸配列をさらに含む。
GIHVFILGCF SAGLPKTEAN WVNVISDLKK IEDLIQSMHI DATLYTESDV HPSCKVTAMK CFLLELQVIS LESGDASIHD TVENLIILAN NSLSSNGNVT ESGCKECEEL EEKNIKEFLQ SFVHIVQMFI NTS(配列番号41)
リーダー配列なしで直接発現される場合、任意に、N末端メチオニル残基を提供する。別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有する成熟ヒトIL-15ポリペプチド(hIL15)をコードする核酸配列をさらに含む。
NWVNVISDLK KIEDLIQSMH IDATLYTESD VHPSCKVTAM KCFLLELQVI SLESGDASIH DTVENLIILA NNSLSSNGNV TESGCKECEE LEEKNIKEFL QSFVHIVQMF INTS(配列番号42)
リーダー配列なしで直接発現される場合、任意に、N末端メチオニル残基を提供する。本発明の好ましい実施において、IL-15剤は、システイン残基83~133と90~136との間のジスルフィド結合を保持し、かつ/または127位にN結合型グリコシル化GlcNAcである。
前述のポリペプチドIL-15剤をコードする核酸配列を得ることは、当業者によく知られている。例えば、Grabstein,et al.(1994)Cloning of a T cell growth factor that interacts with the beta chain of the interleukin-2 receptor,Science 264:965-968、Krause,et al.(1996)Genomic sequence and chromosomal location of the human interleukin-15 gene(IL15),Cytokine 8:667-674、および/またはTagaya,et al(1997)Generation of secretable and nonsecretable interleukin 15 isoforms through alternate usage of signal peptides,PNAS(USA)94:14444-14449を参照されたい。
IL-2剤:別の実施形態において、ベクターは、ポリペプチドIL-2剤をコードする核酸配列をさらに含む。ポリペプチドIL-2剤という用語には、ヒトIL-2分子のバリアント、類似体が含まれる。別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有するプレ-ヒトIL-2ポリペプチド(hIL2)をコードする核酸配列をさらに含む。
MYRMQLLSCI ALSLALVTNS APTSSSTKKT QLQLEHLLLD LQMILNGINN YKNPKLTRML TFKFYMPKKA TELKHLQCLE EELKPLEEVL NLAQSKNFHL RPRDLISNIN VIVLELKGSE TTFMCEYADE TATIVEFLNR WITFCQSIIS TLT(配列番号43)
別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有する成熟hIL-2ポリペプチドをコードする核酸配列をさらに含む。
APTSSSTKKT QLQLEHLLLD LQMILNGINN YKNPKLTRML TFKFYMPKKA TELKHLQCLE EELKPLEEVL NLAQSKNFHL RPRDLISNIN VIVLELKGSE TTFMCEYADE TATIVEFLNR WITFCQSIIS TLT(配列番号44)
リーダー配列なしで直接発現される場合、任意に、N末端メチオニル残基を提供する。本発明の好ましい実施において、IL-2剤は、システイン残基78~125の間のジスルフィド結合を保持し、かつ/または23位でグリコシル化される。
前述のIL-2剤をコードする核酸配列を得ることは、当業者によく知られている。例えば、Taniguchi,et al.(1983)Nature 302:315-310、Devos,et al(1983)Nucleic Acids Research 11:4307-4323、またはFujita,et al(1983)PNAS(USA)80:7347-7441を参照されたい。
IL-7剤:別の実施形態において、ベクターは、ポリペプチドIL-7剤をコードする核酸配列をさらに含む。ポリペプチドIL-7剤という用語には、ヒトIL-7分子のバリアント、類似体が含まれる。一実施形態において、ベクターは、以下の配列を有するプレ-ヒトIL-7ポリペプチド(hIL7)をコードする核酸配列をさらに含む。
MFHVSFRYIF GLPPLILVLL PVASSDCDIE GKDGKQYESV LMVSIDQLLD SMKEIGSNCL NNEFNFFKRH ICDANKEGMF LFRAARKLRQ FLKMNSTGDF DLHLLKVSEG TTILLNCTGQ VKGRKPAALG EAQPTKSLEE NKSLKEQKKL NDLCFLKRLL QEIKTCWNKI LMGTKEH(配列番号45)
別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有する成熟hIL-7ポリペプチドをコードする核酸配列をさらに含む。
DCDIEGKDGK QYESVLMVSI DQLLDSMKEI GSNCLNNEFN FFKRHICDAN KEGMFLFRAA RKLRQFLKMN STGDFDLHLL KVSEGTTILL NCTGQVKGRK PAALGEAQPT KSLEENKSLK EQKKLNDLCF LKRLLQEIKT CWNKILMGTK
EH(配列番号46)
リーダー配列なしで直接発現される場合、任意に、N末端メチオニル残基を提供する。本発明の好ましい実施において、IL-7剤は、システイン残基27~166、59~154、および72~117の間のジスルフィド結合を保持し、かつ/または95、116、および/もしくは141位のうちの1つ以上でグリコシル化される。前述のポリペプチドIL-7剤をコードする核酸配列を得ることは、当業者によく知られている。
IL-18剤:別の実施形態において、ベクターは、ポリペプチドIL-18剤をコードする核酸配列をさらに含む。ポリペプチドIL-18剤という用語には、ヒトIL-18分子のバリアント、類似体が含まれる。一実施形態において、ポリペプチドIL-18剤は、以下のアミノ酸配列を有するシグナル配列を有するhIL-18のアイソフォーム1の前駆体である。
MAAEPVEDNC INFVAMKFID NTLYFIAEDD ENLESDYFGK LESKLSVIRN LNDQVLFIDQ GNRPLFEDMT DSDCRDNAPR TIFIISMYKD SQPRGMAVTI SVKCEKISTL SCENKIISFK EMNPPDNIKD TKSDIIFFQR SVPGHDNKMQ FESSSYEGYF LACEKERDLF KLILKKEDEL GDRSIMFTVQ NED(配列番号47)
別の実施形態において、ベクターは、以下の配列を有する成熟hIL-18アイソフォーム1ポリペプチドをコードする核酸配列をさらに含む。
YFGKLESKLS VIRNLNDQVL FIDQGNRPLF EDMTDSDCRD NAPRTIFIIS MYKDSQPRGM AVTISVKCEK ISTLSCENKI ISFKEMNPPD NIKDTKSDII FFQRSVPGHD NKMQFESSSY EGYFLACEKE RDLFKLILKK EDELGDRSIM FTVQNED(配列番号48)
一実施形態において、ポリペプチドIL-18剤は、以下のアミノ酸配列を有するシグナル配列を有するhIL-18のアイソフォーム2(カノニカル配列のデルタ27~30)の前駆体である。
MAAEPVEDNC INFVAMKFID NTLYFIENLE SDYFGKLESK LSVIRNLNDQ VLFIDQGNRP LFEDMTDSDC RDNAPRTIFI ISMYKDSQPR GMAVTISVKC EKISTLSCEN KIISFKEMNP PDNIKDTKSD IIFFQRSVPG HDNKMQFESS SYEGYFLACE KERDLFKLIL KKEDELGDRS IMFTVQNED(配列番号49)
前述のポリペプチドIL-18剤をコードする核酸配列を得ることは、当業者によく知られている。
一実施形態において、標的抗原の発現カセットに加えて、発現ベクターは、IL-10ポリペプチド、特に分泌リーダー配列を含むIL-10ペプチドをコードする核酸配列を含む発現カセットをさらに含む。多数の発現カセットを使用する代わりに、CARおよびIL-10ポリペプチドをコードする核酸配列は、ポリシストロン性構築物によってコードされ得、発現カセットは、内部リボソーム侵入部位(IRES)要素、EF1aコアプロモーター、または標的細胞での共発現を促進するための口蹄疫ウイルスタンパク質2A(FMVD2A)の核酸配列を含むが、これらに限定されない、ポリシストロン構築物の下流コード配列の発現を促進するために、配列を使用する核酸配列CARおよびIL-10ポリペプチドを含む。
発現ベクターは、任意に、「レスキュー」遺伝子をコードする核酸配列を含む追加の発現カセットを提供し得る。「レスキュー遺伝子」は、その発現が細胞を外的因子による死滅に対して感受性を示すか、または細胞が死滅するように細胞に毒性状態を引き起こす、核酸配列である。レスキュー遺伝子を提供することにより、形質導入された細胞の選択的な細胞死滅を可能にする。したがって、レスキュー遺伝子は、構築物が哺乳動物対象の細胞に組み込まれる場合にさらなる安全予防策を提供して、形質導入された細胞の望ましくない拡大または複製可能なベクター系の影響を防ぐ。一実施形態において、レスキュー遺伝子は、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子である(例えば、1997年5月20日に発行されたWooらの米国特許第5,631,236号、および1997年2月11日に発行されたFreemanらの米国特許第5,601,818号を参照のこと)であり、TK遺伝子産物を発現する細胞は、ガンシクロビルの投与による選択的死滅の影響を受けやすい。あるいは、レスキュー遺伝子は、既知の細胞表面抗原(例えば、CD20またはEGFR)をコードし得、そのような細胞を標的とする分子(例えば、CD20発現細胞の選択的除去にはリツキシマブ(Rituxan(登録商標)またはEGFR発現細胞の選択的除去にはセツキシマブ(Erbitux商標))の投与によってCAR-T細胞の選択的死滅を可能にする。
一実施形態において、発現ベクターは、任意に、ITIMに対する結合分子をコードする核酸配列を含むさらなる発現カセットを提供し得る。一実施形態において、発現ベクターは、任意に、その活性を阻害する免疫系の阻害性受容体の細胞質ドメイン上の免疫受容体チロシンベース阻害モチーフ(ITIM)に結合する分子をコードする核酸配列を含むさらなる発現カセットを提供し得る。ITIMは、典型的には、配列S/I/V/LxYxxI/V/Lのアミノ酸の保存配列である。ITIMを保有する阻害性受容体がそれらのリガンドと相互作用する場合、それらのITIMモチーフは、ホスホチロシンホスファターゼSHP-1および/もしくはSHP-2またはSHIPと呼ばれるSHIPイノシトールホスファターゼなどの他の酵素を動員する能力を促進するSrcキナーゼファミリー酵素によってリン酸化される。これらのホスファターゼは、細胞シグナル伝達に関与する分子の活性を下方調節する。そのようなITIMモチーフに結合する分子の例は、当該技術分野で知られており、例えば、SHP-1、SHP-2、およびSHIPのうちの1つ以上を含むがこれらに限定されない、ホスホチロシンホスファターゼまたはイノシトールホスファターゼによって媒介される免疫機能の下方調節を阻害するために、CAR発現ベクターからの細胞内発現が可能な結合分子(例えばScFv)の設計に使用することができる。
代替の実施形態において、発現ベクターは、任意に、特にヘテロ多量体受容体(例えば、IL-12)の場合、受容体および/または受容体サブユニットをコードする核酸配列を含むさらなる発現カセットを提供し得る。特定の実施形態において、ベクターによってコードされる受容体は、IL2受容体、IL7受容体、IL10受容体、IL12受容体、IL17受容体、IL18受容体、およびその機能的類似体からなる群から選択される受容体のうちの1つ以上である。いくつかの実施形態において、ベクターは、CAR T細胞の表面上でのベクターの提示を促進するために、分泌リーダー配列を有する前述の受容体のうちの1つ以上をコードする核酸配列をさらに含む。
M.CAR-T細胞源細胞の入手:
キメラ抗原受容体T細胞(CAR-T細胞)は、上記の教示に実質的に従って、CARをコードする発現ベクターでの形質導入によって組換え改変されたT細胞である。抗標的抗原CARをコードする発現ベクターでT細胞を形質転換するための前提条件は、複数のT細胞を得ることである。本明細書で企図されるCAR-T細胞の調製に有用なT細胞には、ナイーブT細胞、中央メモリT細胞、エフェクターメモリT細胞、またはそれらの組み合わせが含まれる。
一実施形態において、CAR-T細胞は、当該技術分野で利用可能な様々なT細胞株のうちのいずれかによって、対象自身の(自己)T細胞から調製される(例えば、Snook and Waldman(2013)Discovery Medicine 15(81):120-25)。形質転換のためのT細胞は、典型的には、治療される哺乳動物対象から得られる。T細胞は、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、脾臓組織、および腫瘍を含む、哺乳動物対象の多くの供給源から得られ得る。一実施形態において、T細胞は、白血球アフェレーシスなどのアフェレーシス手順によって得られる。白血球アフェレーシスは、当業者によく知られているプロセスであり、製造業者によって提供される取扱説明書に実質的に従って、Haemonetics(登録商標)Cell Saver(登録商標)5+(Haemonetics Corporation,400 Wood Road,Braintree MA 02184から市販されている)、またはCOBE(登録商標)2991細胞プロセッサ(TerumoBCT,Inc.10811 West Collins Avenue,Lakewood CO 80215から市販されている)を含むが、これらに限定されない、市販の機器を用いて達成され得る。代替の実施形態において、CAR-T細胞は、同種異系であり得る(例えば、Gouble,et al.,(2014)In vivo proof of concept of activity and safety of UCART19,an allogeneic“off-the-shelf”adoptive T-cell immunotherapy against CD19+B-cell leukemias;Blood 124:4689を参照のこと)。
一実施形態において、T細胞は、末梢血から単離され、特定のT細胞(CD3、CD28、CD4、CD8、CD45RA、およびCD45ROT細胞など)は、抗CD3/抗CD28共役ビーズとのインキュベーションである、当該技術分野でよく知られている選択技術によって単離され得る。単離されたT細胞の集団から、特定のマーカーが濃縮されたT細胞のサブセットが、得られ得る。典型的には、T細胞のサブセットは、CD3+、CD4+、CD8+、CD25+、またはCD62L+T細胞を含むが、これらに限定されない、T細胞上の1つ以上の細胞表面マーカーの発現に基づいて単離される。1つ以上の特定のマーカーが濃縮されたT細胞のサブセットの調製は、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、CliniMACS(登録商標)PlusおよびProdigy(Miltenyi Biotec Inc.,2303 Lindbergh Street,Auburn,CA 95602から市販されている)を含むが、これらに限定されない、市販の機器を使用する当該技術分野でよく知られている技術によって達成され得る。一実施形態において、CD3+CAR-T細胞が濃縮された集団が、さらなるプロセシングのために使用される。しかしながら、ナイーブT細胞、中央メモリ、またはメモリ幹細胞などのT細胞の他のサブセットも使用され得る。
上記の手順に実質的に従って調製された処理済みT細胞は、さらなる処理に使用され得るか、または凍結保存され得る。
N.CAR発現ベクターによるT細胞の形質転換:
CAR発現ベクターによるT細胞の形質導入は、ウイルスベクターを用いた宿主T細胞との共インキュベーション、エレクトロポレーション、および/または化学的に増強された送達を含むが、これらに限定されない、当該技術分野でよく知られている技術を使用して達成され得る。例えば、Naldini,et al.(1996)In Vivo Gene Delivery and Stable Transduction of Nondividing Cells by a Lentiviral Vector,Science 272:263-267、Naldini,et al.(1996)Efficient transfer,integration,and sustained long-term expression of the transgene in adult rat brains injected with a lentiviral vector,Proc.Natl.Acad.Sci.USA Vol.93,pp.11382-11388、Dull,et al.(1998)A Third-Generation Lentivirus Vector with a Conditional Packaging System,J.Virology 72(11):8463-8471、Milone,et al.(2009)Chimeric Receptors Containing CD137 Signal Transduction Domains Mediate Enhanced Survival of T Cells and Increased Antileukemic Efficacy In Vivo,Molecular Therapy 17(8):1453-1464、Morgan and Boyerinas (2106)Genetic Modification of T Cells Biomedicines 4:9を参照されたい。
O.CAR-T細胞の拡大
形質転換後、T細胞は、例えば、米国特許第6,352,694号、同第6,534,055号、同第6,905,680号、同第6,692,964号、同第5,858,358号、同第6,887,466号、同第6,905,681号、同第7,144,575号、同第7,067,318号、同第7,172,869号、同第7,232,566号、同第7,175,843号、同第5,883,223号、同第6,905,874号、同第6,797,514号、同第6,867,041号、および米国特許出願公開第2006/0121005号に記載されているような方法を一般的に使用して活性化および拡大することができる。一般に、本発明のT細胞は、表面と接触して細胞を培養することにより増殖し、CD3 TCR複合体関連シグナルを刺激する薬剤(例えば、抗CD3抗体)およびT細胞の表面上に共刺激分子を刺激する薬剤(例えば抗CD28抗体)を提供する表面で接触する細胞を培養することによって拡大される。T細胞培養に適した条件は、Lin,et al.(2009)Cytotherapy 11(7):912-922(表現型および多機能抗原に特異的なCD4およびCD8T細胞応答をモニタリングするための堅牢なヒトT細胞培養法の最適化および検証)、Smith,et al.(2015)Clinical & Translational Immunology 4:e31 published online 16 January 2015(「新規の異種フリーCTS免疫細胞血清置換を使用した養子免疫療法のためのヒトT細胞のエクスビボでの拡大」)の当該技術分野でよく知られている。標的細胞は、成長を支援するために必要な条件下、例えば、適切な温度(例えば、37℃)および雰囲気(例えば、空気プラス5%CO)の下で維持される。エクスビボでのT細胞活性化は、細胞ベースのT細胞活性化、抗体ベースの活性化、または様々なビーズベースの活性化試薬を使用する活性化を含む、当該技術分野で確立した手順によって達成され得る。細胞ベースのT細胞活性化は、樹状細胞などの抗原提示細胞または照射されたK562細胞などの人工抗原提示細胞へのT細胞の曝露によって達成され得る。可溶性抗CD3モノクローナル抗体によるT細胞表面CD3分子の抗体ベースの活性化もまた、IL-2の存在下でのT細胞活性化を支援するか、あるいは、臨床使用のためのCAR-T細胞の調製のために当該技術分野で受け入れられるビーズベースのT細胞活性化を得る。T細胞のビーズベースの活性化は、Invitrogen(登録商標)CTS Dynabeads(登録商標)CD3/28(Life Technologies,Inc.Carlsbad CAから市販されている)またはMiltenyi MACS(登録商標)GMP ExpAct TregビーズまたはMiltenyi MACS GMP TransAct(登録商標)CD3/28ビーズ(Miltenyi Biotec,Inc.から市販されている)を含むが、これらに限定されない、多種多様な市販のT細胞活性化試薬を使用して達成され得る。GE WAVEバイオリアクターシステム、G-Rexバイオリアクター、Miltenyi CliniMACS Prodigyシステム、および再帰的AAPC刺激を含む、CAR-T細胞の実験室または商業規模の拡張に使用可能である。
P.培地:
本発明は、IL-10剤を補充したCAR-T細胞の培養のための培地をさらに提供する。一実施形態において、本発明の培地は、IL-10剤が少なくとも0.1ng/ml、少なくとも0.2ng/ml、少なくとも0.5ng/ml、少なくとも1ng/ml、少なくとも2ng/ml、少なくとも3ng/ml、少なくとも4ng/ml、少なくとも5ng/ml、少なくとも10ng/ml、少なくとも50ng/ml、少なくとも100ng/ml、少なくとも200ng/ml、少なくとも400ng/ml、少なくとも500ng/ml、少なくとも1000ng/ml、少なくとも1500ng/mlの濃度を達成するためにIL-10剤が補充される完全な培地である。
培地中のIL-10のレベルは、IL-10がT細胞に対して毒性があるレベルよりも低いレベルで、任意に、毒性IL-10剤濃度の50%未満、任意に、毒性IL-10剤濃度の30%未満、任意に、毒性IL-10剤濃度の20%未満、または任意に、毒性IL-10剤濃度の10%未満で維持するべきである。
T細胞の培養および増殖に有用な培地は、当該技術分野でよく知られている。T細胞の完全な培地の培養の技術の一般的な実践において。T細胞などの白血球の培養に使用される典型的な完全培地は、Moore,G.E.,et al.(1967)J.A.M.A.,199:519に記載されるRPMI培地、およびMoore,G.E.and Woods,L.K.,”Culture media for human cells RPMI 1603,RPMI 1634,RPMI 1640 and GEM 1717.”Tissue Culture Association Manual,v.3,503-508(1976)に記載されるそのバリアントである。RPMI培地の例示的な製剤は、ThermoFisher Scientific(Carlsbad,CA)からカタログ番号11875として入手可能なRPMI 1640培地であり、水溶液中に以下の製剤を有する。
Figure 0007097465000002
Q.治療的および予防的使用
本開示は、CAR-T細胞療法の治療効果を増強するために、本明細書に記載のIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)の使用を企図する。より具体的には、IL-10剤は、対象における標的細胞集団へのT細胞媒介性免疫応答の調節を目的とした方法であって、キメラ抗原受容体を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を対象に導入することであって、当該キメラ抗原受容体が、CAR-T細胞療法の治療効果を増強するために、IL-10剤と併用して標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的化領域を含む、導入することを含む、方法に使用される。
R.治療に適している新生物:
本発明の組成物および方法は、良性および悪性腫瘍を含む腫瘍、ならびに腫瘍性疾患の治療に有用である。本発明の組成物および方法を使用する治療に適した良性腫瘍の例には、腺腫、線維腫、血管腫、および脂肪腫が含まれるが、これらに限定されない。本発明の組成物および方法を使用する治療に適した前悪性腫瘍の例には、過形成、非定型性、化生、および異形成が含まれるが、これらに限定されない。本発明の組成物および方法を使用する治療に適した悪性腫瘍の例には、癌腫(皮膚、または内臓を覆う組織などの上皮組織から生じる癌)、白血病、リンパ腫、および(典型的には、骨、脂肪、筋肉、血管、または結合組織に由来する)肉腫が含まれるが、これらに限定されない。腫瘍という用語には、ウイルス誘導腫瘍(疣贅など)およびEBV誘導疾患(すなわち、伝染性単核症)、瘢痕形成、過剰増殖性血管疾患(内膜平滑筋細胞過形成、再狭窄、および血管閉塞などを含む)もまた含まれる。
「腫瘍性疾患」という用語は、乳癌;肉腫(骨肉腫および血管肉腫ならびに線維肉腫を含むがこれらに限定されない)、白血病、リンパ腫、泌尿生殖器癌(卵巣癌、尿道癌、膀胱癌、および前立腺癌を含むがこれらに限定されない);消化器癌(結腸食道癌および胃癌を含むがこれらに限定されない);肺癌;骨髄腫;膵臓癌;肝臓癌;腎臓癌;内分泌癌;皮膚癌;ならびに神経膠腫および神経芽腫、星状細胞腫、骨髄異形成障害を含む、悪性または良性の脳腫瘍または中枢および末梢神経(CNS)系腫瘍;子宮頸上皮内癌;腸ポリープ症;口腔白板症;組織球増殖症、過剰増殖性瘢痕(ケロイド瘢痕を含む)、血管腫;過剰増殖性動脈狭窄、乾癬、炎症性関節炎;角質増殖症および丘疹鱗屑性発疹(関節炎を含む)を含むが、これらに限定されない、固形腫瘍および非固形腫瘍によって特徴付けられる癌を含む。いくつかの実施形態において、CARのARDは、例えば、アルツハイマー病の治療のための抗Aβ CAR-T細胞、例えば、関節炎の治療のための抗TNF CAR-T細胞、例えば、プラーク乾癬の治療のための抗IL17RA CAR-T細胞、例えば、前立腺癌および良性前立腺過形成の治療のための抗PSMA CAR-T細胞、例えば、皮膚炎の治療のための抗IL4RA CAR-T細胞、例えば、高コレステロール血症の治療のための抗PCSK9 CAR-T細胞、例えば、加齢性黄斑変性症の治療のための抗VEGFR1 CAR-T細胞、例えば、加齢性黄斑変性症の治療のための抗VEGFR2 CAR-T細胞、例えば、リウマチ関節炎の治療のための抗IL-6R CAR-T細胞、例えば、乾癬、関節炎、およびクローン病の治療のための抗IL-23 CAR-T細胞、ならびに例えば、HIV感染の治療のための抗CD4 CAR-T細胞を含む、CAR-T細胞組成物を含むがこれらに限定されない、非癌性炎症および過剰増殖状態に関連する細胞表面マーカーと相互作用するように、それらの使用の関連方法が設計される。
「腫瘍性疾患」という用語は、骨髄性腫瘍およびリンパ系腫瘍を含む。各カテゴリは、形態学、病理生物学、治療、および/または予後を定義する特徴を有する、異なる種類の造血癌を含有する。最適な治療を可能にするには、予後または化学療法に対する応答に影響を与える可能性がある追加の因子の特定とともに、正しい分類が不可欠である。骨髄性腫瘍には、骨髄増殖性腫瘍、好酸球増加症を伴う骨髄性およびリンパ系障害、骨髄増殖性/骨髄異形成性腫瘍、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病および関連する前駆腫瘍、ならびに分化系統不明瞭な急性白血病が含まれるが、これらに限定されない。リンパ系腫瘍には、前駆リンパ系腫瘍、成熟B細胞腫瘍、成熟T細胞腫瘍、ホジキンリンパ腫、および免疫不全関連リンパ増殖性障害が含まれるが、これらに限定されない。造血系の他の癌には、組織球性腫瘍および樹状細胞腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。
S.抗腫瘍効果および臨床反応の評価:
癌の治療における臨床有効性の決定は一般に、病変の低減、特に転移性病変の低減、転移の低減、腫瘍体積の低減、およびECOGスコアの改善などの、1つ以上の当該技術分野で認識されているパラメータの達成に関連付けられる。治療に対する応答の決定は、そのような療法に対する対象の応答の存在および程度、ならびにそのような療法によって引き起こされる有害作用の存在および程度を含む、IL-10または免疫経路調節剤のいかなる態様でも有用な、再現性のある情報を提供することができるバイオマーカーの測定を通して、評価することができる。限定ではなく、例として、バイオマーカーには、IFNγの増強、ならびにグランザイムA、グランザイムB、およびパーフォリンの上方制御、CD8+T細胞の数および機能の増加、IFNγの増強、CD8+T細胞上でのICOS発現の増加IL-10発現TReg細胞の増強を含む。エフェクター分子IP-10(誘導性タンパク質10)およびMIG(IFNγによって誘導されるモノカイン)の発現は、LPSまたはIFNγのいずれかによって、特定のIL-10発現腫瘍内で増加することが知られており、これらのエフェクター分子はまた、本明細書に記載のコンビナトリアル療法によって増強され得る潜在的な血清バイオマーカーとして活用することもできる。治療に対する応答は、従来の臨床有効性の指標の向上によって特性評価することができ、完全応答(CR)、部分応答(PR)、安定疾患(SD)、および標的病変に関しては、RECISTによって定義される、完全応答(CR)、不完全応答/安定疾患(SD)、ならびに免疫関連応答基準(irRC)によって定義される、免疫関連完全応答(irCR)、免疫関連部分応答(irPR)、および免疫関連安定疾患(irSD)などを用いることができ、当業者は、哺乳動物(例えばヒト)対象における腫瘍性疾患の治療における有効性を証明するものと見なす。
さらなる実施形態は、併用における最適な量の薬剤(複数可)を決定するための方法またはモデルを含む。最適な量は、例えば、対象または対象集団において最適な効果を達成する量、または1つ以上の薬剤に関連する悪影響を最小化もしくは排除しながら、治療効果を達成する量であり得る。いくつかの実施形態において、IL-10とCAR-T細胞自体との組み合わせの要素は、対象(例えば、ヒト)または対象集団における、本明細書に記載の疾患、障害、または病態(例えば、癌性病態)の治療または予防に有効であることが既知であるか、または決定されており、1つの薬剤の量が、他の薬剤(複数可)の量を一定に保ちながら、滴定される。この様式で薬剤(複数可)の量を操作することによって、臨床医は、例えば、特定の疾患、障害、もしくは病態の治療、または副作用の排除もしくはその状況下で許容されるような副作用の低減に最も有効な薬剤の比率を決定することができる。
特定の実施形態において、治療上有効な量のIL-10剤(例えば、皮下)および治療上有効な複数のCAR-T細胞(例えば、静脈内)が、対象に非経口的に投与される。他の実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞が、静脈内注入によって対象に導入される。他の実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞が、腫瘍内注射によって対象に導入される。他の実施形態において、キメラ抗原受容体およびIL-10剤を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞が、局所領域注入によって対象に導入される。さらに別の実施形態において、活性化誘導細胞死を防止または制限するのに十分な治療上有効な量のIL-10剤が、IL-10剤を発現するように遺伝子改変された細胞によって対象に導入され、それによって発現構築物はCARを発現する細胞とは異なる細胞中に存在する。
CAR-T細胞がIL-10剤も発現するこれらの実施形態において、その直接的および局所的効果のために、治療上有効な量を達成するために必要なIL-10剤の量は、IL-10剤の全身投与による治療効果を達成するために必要とされるものよりも有意に低くてもよい。本明細書に記載されるように、IL-10の発現のレベルは、原位置でのIL-10の発現レベルの調節を容易にする調節可能なプロモーターの制御下にあり得る。
T.投与/投薬:
一般に、治療剤の投薬パラメータは、投薬量が、対象に不可逆的に毒性であり得る量(すなわち、最大耐量、「MTD」)未満であり、かつ対象に測定可能な効果をもたらすのに必要な量未満ではないことを指示する。そのような量は、例えば、投与経路および他の因子を考慮して、ADMEに関連する薬物動態学的および薬力学的パラメータによって決定される。
有効用量(ED)は、それを服用する対象の一部において治療応答または所望の効果をもたらす薬剤の用量または量である。ある薬剤の「有効用量中央値」またはED50は、それが投与される集団の50%において治療応答または所望の効果をもたらす薬剤の用量または量である。ED50は一般的に、薬剤の効果の妥当な期待値の尺度として使用されるが、臨床医が必ずしもすべての関連する因子を考慮して適切と見なし得る用量であるわけではない。したがって、いくつかの状況では、有効量は、ED50計算値を超える可能性があり、他の状況では、有効量は、ED50計算値未満である可能性があり、さらに他の状況では、有効量は、ED50計算値と同じである可能性がある。
本開示の治療剤(例えば、IL-10剤およびCAR-T細胞)は、例えば、投与の目標(例えば、所望の消散の程度);製剤が投与される対象の年齢、体重、性別、健康状態、および体調;ならびに投与経路に依存する量で、対象に投与することができる。治療上有効な量および投薬レジメンは、例えば、安全性および用量漸増試験、インビボ研究(例えば、動物モデル)、ならびに当業者に既知の他の方法から決定することができる。
1.IL-10剤の投与/投薬:
一実施形態において、IL-10剤および他の薬剤(複数可)による治療は、一定期間にわたって維持される。別の実施形態において、少なくとも1つの他の薬剤(複数可)による治療は、低減または中止され(例えば、対象は安定している場合)、その間、本開示のIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)は、一定の投薬レジメンで維持される。さらなる実施形態において、他の薬剤(複数可)による治療は、低減または中止され(例えば、対象が安定している場合)、一方、本開示のIL-10剤による治療は、低減される(例えば、より低い用量、より低い頻度の投薬、またはより短い治療レジメン)。さらに別の実施形態において、他の薬剤(複数可)による治療は、低減または中止され(例えば、対象が安定している場合)、本開示のIL-10剤による治療は、増大される(例えば、より高い用量、より高い頻度の投薬、またはより長い治療レジメン)。さらに別の実施形態において、他の薬剤(複数可)による治療は、維持され、本開示のIL-10剤による治療は、低減または中止される(例えば、より低い用量、より低い頻度の投薬、またはより短い治療レジメン)。さらに別の実施形態において、他の薬剤(複数可)による治療および本開示のIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)による治療は、低減または中止される(例えば、より低い用量、より低い頻度の投薬
本明細書に記載の方法におけるIL-10の血漿レベルは、(1)ある特定のレベルを超えるか、またはあるレベルの範囲内の、平均IL-10血清中トラフ濃度、(2)ある期間にわたって、ある特定のレベルを超える平均IL-10剤血清中トラフ濃度、(3)ある特定のレベルを超えるかもしくはそれ未満であるか、またはあるレベルの範囲内の、定常状態のIL-10血清濃度レベル、あるいは(4)ある特定のレベルを超えるかもしくはそれ未満であるか、またはあるレベルの範囲内の、濃度プロファイルのCmaxを含む、いくつかの様式で特性評価することができる。本明細書に明記されるように、平均IL-10血清中トラフ濃度は、ある特定の適応症における有効性にとって特に重要であることが見出されている。
いくつかの実施形態において、IL-10血清中トラフ濃度は、一定期間にわたって、約0.1ng/mL超、約0.2ng/mL超、約0.3ng/mL超、約0.4ng/mL超、約0.5ng/mL超、約0.6ng/mL超、約0.7ng/mL超、約0.8ng/mL超、約0.9ng/mL超、約1.0ng/mL超、約1.5ng/mL超、約2.0ng/mL超、約2.5ng/mL超、約3.0ng/mL超、約3.5ng/mL超、約4.0ng/mL超、約4.5ng/mL超、約5.0ng/mL超、約5.5ng/mL超、約6.0ng/mL超、約6.5ng/mL超、約7.0ng/mL超、約7.5ng/mL超、約8.0ng/mL超、約8.5ng/mL超、約9.0ng/mL超、約9.5ng/mL、または約10.0ng/mL超のレベルで維持される。
本開示の特定の実施形態において、平均IL-10剤血清中トラフ濃度は、0.1ng/mL~10.0ng/mLの範囲内である。さらに他の実施形態において、平均IL-10剤血清中トラフ濃度は、1.0ng/mL~1ng/mLの範囲内である。例として、一実施形態において、平均IL-10剤血清濃度は、0.5ng/mL~5ng/mLの範囲内であり得る。さらなる例として、本開示の特定の実施形態は、約0.5ng/mL~約10.5ng/mL、約1.0ng/mL~約10.0ng/mL、約1.0ng/mL~約9.0ng/mL、約1.0ng/mL~約8.0ng/mL、約1.0ng/mL~約7.0ng/mL、約1.5ng/mL~約10.0ng/mL、約1.5ng/mL~約9.0ng/mL、約1.5ng/mL~約8.0ng/mL、約1.5ng/mL~約7.0ng/mL、約2.0ng/mL~約10.0ng/mL、約2.0ng/mL~約9.0ng/mL、約2.0ng/mL~約8.0ng/mL、および約2.0ng/mL~約7.0ng/mLの範囲内の平均IL-10血清中トラフ濃度を含む。
特定の実施形態において、1~2ng/mLの平均IL-10血清中トラフ濃度は、治療期間にわたって維持される。本開示はまた、平均IL-10血清中ピーク濃度が、治療期間にわたって約10.0ng/mL以下である実施形態も企図する。
本開示は、一定期間にわたって、上記に明記されるIL-10血清中トラフ濃度のうちのいずれかの維持をもたらす、任意の用量および投薬レジメンの投与を企図する。限定ではなく、例として、対象がヒトである場合、非ペグ化hIL-10は、0.5μg/kg/日超、1.0μg/kg/日超、2.5μg/kg/日超、5μg/kg/日超、7.5μg/kg超、10.0μg/kg超、12.5μg/kg超、15μg/kg/日超、17.5μg/kg/日超、20μg/kg/日超、22.5μg/kg/日超、25μg/kg/日超、30μg/kg/日超、または35μg/kg/日超の用量で投与することができる。加えて、限定ではなく、例として、対象がヒトである場合、比較的小さいPEGを含むペグ化hIL-10(例えば、5kDaのモノ-ジ-PEG-hIL-10)は、0.5μg/kg/日超、0.75μg/kg/日超、1.0μg/kg/日超、1.25μg/kg/日超、1.5μg/kg/日超、1.75μg/kg/日超、2.0μg/kg/日超、2.25μg/kg/日超、2.5μg/kg/日超、2.75μg/kg/日超、3.0μg/kg/日超、3.25μg/kg/日超、3.5μg/kg/日超、3.75μg/kg/日超、4.0μg/kg/日超、4.25μg/kg/日超、4.5μg/kg/日超、4.75μg/kg/日超、または5.0μg/kg/日超の用量で投与することができる。
さらなる実施形態において、IL-10剤の血清中トラフレベルが維持される前述の期間は、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも48時間、少なくとも72時間、少なくとも1週間、少なくとも2週間、少なくとも3週間、少なくとも1カ月間、少なくとも6週間、少なくとも2カ月間、少なくとも3カ月間、少なくとも6カ月間、少なくとも9カ月間、または12カ月間超である。
本開示の特定の実施形態において、平均IL-10血清中トラフ濃度は、この期間の少なくとも85%、この期間の少なくとも90%、少なくとも96%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%維持される。
特定のIL-10血清濃度などを達成するために必要なIL-10血清濃度、用量、および治療プロトコルに関する前述の考察は、IL-10剤(例えば、PEG-IL-10)による単剤療法に関係しているが、当業者(例えば、薬理学者)は、IL-10剤(例えば、PEG-IL-10)が1つ以上の追加の治療法と併用して投与される場合、最適な投薬レジメン(複数可)を決定することができる。
2.CAR-T細胞剤の投与/投薬
前に考察されたように、CAR-T剤は、CAR-T融合タンパク質をコードする組換えベクターの宿主として患者自身のT細胞を使用して調製される。結果として、投与される細胞の集団は、対象に必然的に可変である。さらに、CAR-T細胞剤が変動するため、そのような薬剤への応答は、変動し得、したがって、治療に関連する毒性の継続的なモニタリングおよび管理が含まれる。
マウスの動物モデルに基づいて、治療過程ごとに動物あたり500万個の細胞の投与は、有意な抗腫瘍反応を示す。ヒトに対して計量される場合、この用量は、約0.5×1010個の生存CAR-T細胞の用量とほぼ等しい。
本発明の実施におけるCAR-T細胞の投与の典型的な範囲は、CAR-T細胞療法の過程ごとに対象体重1kgあたり約1×10~5×10の生存可能なCAR-Tの範囲である。したがって、体重に対して調節され、ヒト対象における生存T細胞の投与のための典型的な範囲は、治療過程において、個約1×10~約1×1013個の生存CAR-T細胞、あるいは約5×10~約5×1012個、あるいは約1×10~約1×1012個、あるいは約5×10~約1×1012個、あるいは約1×10~約1×1012個、あるいは約5×10~約1×1012個、あるいは約1×10~約1×1012個の範囲に及ぶ。一実施形態において、CAR-T細胞の用量は、治療過程ごとに2.5~5×10個の生存CAR-T細胞の範囲内である。健康な成人のT細胞の平均数は、約1×1012個の細胞であると推定され、用量範囲は、T細胞の総体重の約1%未満である。いくつかの実施形態において、CAR-T細胞療法は、50kg以上の患者には、体重1kg当たり0.2~5.0×10個のCAR陽性生存T細胞を単回投与し、≦50kg未満の患者には、0.1~2.5×10個のCAR陽性生存T細胞を単回投与されるKymriahである。
CAR-T細胞剤による治療過程は、一定期間にわたって、単回投与または多数回投与であり得る。いくつかの実施形態において、CAR-T細胞は、単回投与で投与される。いくつかの実施形態において、CAR-T細胞は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、21、28、30、60、90、または120日の期間にわたって、投与される2つ以上の分割用量で投与される。そのような分割投与プロトコルで投与される細胞の量は、各投与で同じであり得るか、または異なるレベルを提供し得る。例えば、複数日間の3回投与分割投与プロトコルで提供される治療過程は、1日目に10%、2日目に30%、および3日目に60%、あるいは1日目に10%、2日目に40%、3日目に50%、あるいは1日目に25%、2日目に25%、3日目に50%、あるいは1日目に50%、14日目に50%、あるいは1日目に50%、7日目に50%、あるいは1日目に50%、30日目に50%、あるいは1日目に25%、14日目に25%、30日目に50%、あるいは1日目に50%、14日目に25%、30日目に25%、あるいは1日目に60%、14日目に30%、30日目に10%、またはあるいは1日目に50%、30日目に25%、60日目に25%の投与を提供し得る。
前に考察されたように、CAR-T剤は、CAR-T融合タンパク質をコードする組換えベクターの宿主として患者自身のT細胞を使用して調製され得る。結果として、投与される細胞の集団は、対象に必然的に非常に可変である。結果として、CAR-T細胞療法の投与に関連する投薬量も可変であり、しばしば毒性の管理の機能である。薬理学的免疫抑制またはB細胞枯渇の過程で管理される過剰な免疫応答(サイトカイン放出症候群を含む)における同種または自己T細胞注入に関連する毒性の一形態。全身性コルチコルステロイド(例えば、メチルプレドニゾロン)を含むそのような免疫抑制療法の例。B細胞枯渇の治療法には、血清免疫グロブリンレベルの正常レベルを回復するための確立された臨床投与ガイドラインによる静脈内免疫グロブリン(IVIG)が含まれる。
いくつかの実施形態において、本発明のCAR-T細胞療法の投与前に、対象は、任意に、リンパ球枯渇レジメンに供され得る。そのようなリンパ球枯渇レジメンの一例は、対象への、フルダラビン(30mg/mの静脈内[IV]を4日間毎日)およびシクロホスファミド(500mg/mのIVを2日間毎日、フルダラビンの第1の投与から開始して)の投与からなる。このようなリンパ球枯渇は、CAR-T細胞療法における反応の改善と関連している。
本明細書に記載されるように、IL-10剤(および任意に、追加の免疫調節剤および治療剤)と併用したCAR-T細胞の投与は、CAR-T細胞の細胞毒性および免疫調節特性を増強する。結果として、所与の疾患、障害、または病態の治療に従来使用されているCAR-T細胞のレベルは、IL-10剤と併用して、CAR-T細胞療法で潜在的に特定される副作用の低減を達成する場合に低減され得る。したがって、本発明は、IL-10剤と併用したCAR-T細胞剤の投与によって、CAR-T細胞療法に関連する副作用を低減する方法を企図する。本発明の組成物および方法を使用することによって緩和され得る副作用の例には、サイトカイン放出症候群、標的外反応性、免疫抑制、および炎症が含まれるが、これらに限定されない。
U.さらなる化学療法剤との組み合わせ:
本明細書に記載されるCAR-T細胞およびIL-10剤の併用療法と併せて、本開示は、CAR-T細胞およびIL-10剤の併用療法への1つ以上の活性剤(「補助剤」)の追加を企図する。そのようなさらなる併用は、「補助的併用」、「補助的併用療法」と称され、CAR-T細胞とIL-10剤との併用療法に添加される薬剤は、「補助剤」と称され得る。
本明細書で使用される場合、「補助的併用」は、例えば、別々の投与のために別々に製剤化された別々に投与または導入することができるこれらの併用(例えば、キット中で提供され得るものなど)、および一緒に投与または導入することができる治療薬を含むことを意味する。ある特定の実施形態において、CAR-T細胞およびIL-10剤の併用療法および補助剤(複数可)は、例えば、1つの薬剤が、1つ以上の他の薬剤の前に投与される場合には、連続して投与または適用される。他の実施形態において、CAR-T細胞/IL-10剤の併用療法および補助剤(複数可)は、例えば、2つ以上の薬剤が同時にまたはほぼ同時に投与され、これらの2つ以上の薬剤は、2つ以上の別々の製剤中に存在してもよく、あるいは単一の製剤(すなわち、同時製剤)に組み合されてもよい場合には、同時に投与される。薬剤が連続的に投与されるのか同時に投与されるのかにかかわらず、これらは、本開示の目的では組み合わせて投与されると見なされる。
一実施形態において、補助剤は、化学療法剤である。「化学療法剤」という用語は、チオテパおよびシクロホスファミドなどのアルキル化剤;ブスルファン、インプロスルファン、およびピポスルファンなどのスルホン酸アルキル;ベンゾドパ、カルボコン、メトレドパ、およびウレドパなどのアジリジン;アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド、およびトリメチルオロメラミンを含む、エチレンイミンおよびメチルアメラミン;キオランブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシドヒドロクロリド、メルファラン、ノベムビシン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタードなどのナイトロジェンマスタード;カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、ラニムスチンなどのニトロスウレア(nitrosurea);アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オートラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カリケアマイシン、カラビシン、カミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、エソルビシン(esorubicin)、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、ケラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシンなどの抗生物質;メトトレキサートおよび5-フルオロウラシル(5-FU)などの代謝拮抗剤;デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート、葉酸などの葉酸類似体;フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニンなどのプリン類似体;アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン、5-FUなどのピリミジン類似体;カルステロン、プロピオン酸ドロモスタロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトンなどのアンドロゲン;アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタンなどの抗副腎剤;フロリン酸などの葉酸補充剤;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトレキセート(edatraxate);デフォファミン;デメコルシン;ジアジコン;エルフォルミチン(elformithine);酢酸エリプチニウム;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシウレア;レンチナン;ロニダミン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモール;ニトラクリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ポドフィリン酸;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;ラゾキサン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジコン;2,2’,2’’-トリクロロトリエチルアミン;ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン;アラビノシド(Ara-C);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド、例えば、パクリタキセル、nab-パクリタキセル、およびドセタキセル;クロラムブシル;ゲムシタビン;6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;白金および白金配位錯体(シスプラチン、オキサプラチン、およびカルボプラチンなど);ビンブラスチン;エトポシド(VP-16);イホスファミド;マイトマイシンC;ミトキサントロン;ビンクリスチン;ビノレルビン;ナベルビン;ノバントロン;テニポシド;ダウノマイシン;アミノプテリン;ゼローダ;イバンドロネート;CPT11;トポイソメラーゼ阻害剤;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイン酸;エスペラミシン;カペシタビン;ならびに上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体を含むが、これらに限定されない。「化学療法剤」という用語はまた、例えば、タモキシフェン、ラロキシフェン、アロマターゼ阻害性4(5)-イミダゾール、4-ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、オナプリストン、およびトレミフェンなどの抗エストロゲン;ならびにフルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリド、およびゴセレリンなどの抗アンドロゲン剤;ならびに上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体などの、腫瘍に対するホルモン作用を制御または阻害するように作用する抗ホルモン剤も含む。いくつかの実施形態において、補助剤は、サイトカインまたはサイトカインアンタゴニスト(IL-12など)、INFα、または抗上皮成長因子受容体、放射線療法、イリノテカン;テトラヒドロ葉酸代謝拮抗剤(ペメトレキセドなど);腫瘍抗原に対する抗体、モノクローナル抗体と毒素との複合体、T細胞アジュバント、骨髄移植、または抗原提示細胞(例えば、樹状細胞療法)、抗腫瘍ワクチン、複製可能ウイルス、およびシグナル伝達阻害剤(例えば、Gleevec(登録商標)もしくはHerceptin(登録商標))または腫瘍成長の相加的または相乗的抑制を達成するための免疫調節剤、非ステロイド性抗炎症薬(NSAID)、シクロオキシゲナーゼ-2(COX-2)阻害剤、ステロイド、TNFアンタゴニスト(例えば、Remicade(登録商標)およびEnbrel(登録商標))、インターフェロン-β1a(Avonex(登録商標))、およびインターフェロン-β1b(Betaseron(登録商標))、ならびにTAC、FOLFOX、TPC、FEC、ADE、FOLFOX-6、EPOCH、CHOP、CMF、CVP、BEP、OFF、FLOX、CVD、TC、FOLFIRI、PCV、FOLFOXIRI、ICE-V、XELOX、および当業者によって認められているその他のものが含まれるが、これらに限定されない、腫瘍性疾患の治療に有用なものとして当該技術分野で特定される、1つ以上の化学的または生物学的薬剤であってもよい。
一実施形態において、補助剤は、1つ以上の非薬理学的モダリティ(例えば、局所放射線療法または全身放射線療法)である。例として、本開示は、放射線相が、1つ以上のさらなる療法(例えば、CAR-T細胞療法およびIL-10剤の投与)または本明細書に記載される薬剤による治療の前または後に続く治療レジメンを企図する。いくつかの実施形態において、本開示は、骨髄移植、末梢血幹細胞移植、または他のタイプの移植治療と併用したCAR-T細胞療法およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)の使用をさらに企図する。
本発明の一実施形態において、CAR-T細胞の投与前に、対象は、既存のT細胞を除去するために「化学プライミング」を受ける。典型的な診療では、化学プライミングは、シクロホスファミドとフルダカルビンの併用投与などのシクロホスファミド化学療法レジメン、プラチナベースの化学療法レジメン、タキサン、テモゾロミドを含むが、これらに限定されない、T細胞の減少または切除をもたらす1つ以上の治療モダリティの投与によって達成される。
V.チェックポイント調節剤との組み合わせ:
別の実施形態において、「補助剤」は、対象における腫瘍性疾患、ならびに腫瘍性疾患に関連する疾患、障害、または病態の治療および/または予防のための免疫チェックポイント調節剤である。「免疫チェックポイント経路」という用語は、抗原提示細胞(APC)上に発現する第1の分子(例えば、PD1などのタンパク質)が、免疫応答の刺激(例えば、T細胞活性の上方制御)または阻害(例えば、T細胞活性の下方制御)のいずれかを通して免疫応答を調節する免疫細胞(例えば、T細胞)上に発現する第2の分子(例えば、PDL1などのタンパク質)に結合することによって引き起こされる、生物学的応答を指す。免疫応答を調節する結合対の形成に関与する分子は一般に、「免疫チェックポイント」と称される。そのような免疫チェックポイント経路によって調節される生物学的応答は、細胞活性化、サイトカイン産生、細胞遊走、細胞毒性因子分泌、および抗体産生などの下流免疫エフェクター経路をもたらす細胞内シグナル伝達経路によって媒介される。免疫チェックポイント経路は一般に、第1の細胞表面発現分子が免疫チェックポイント経路に関連する第2の細胞表面分子に結合すること(例えば、PD1がPDL1に、CTLA4がCD28に結合することなど)によって引き起こされる。免疫チェックポイント経路の活性化は、免疫応答の刺激または阻害をもたらすことができる。
その活性化が免疫応答の阻害または下方制御をもたらす免疫チェックポイントは、本明細書では「負の免疫チェックポイント経路」と称される。負の免疫チェックポイントの活性化から生じる免疫応答の阻害は、宿主免疫系が腫瘍関連抗原などの外来抗原を認識する能力を低下させる。負の免疫チェックポイント経路という用語には、PD1がPDL1に、PD1がPDL2に、およびCTLA4がCDCD80/86に結合することによって調節される生物学的経路が含まれるが、これらに限定されない。そのような負の免疫チェックポイントアンタゴニストの例には、PD1(CD279とも称される)、TIM3(T細胞膜タンパク質3、HAVcr2としても知られる)、BTLA(BおよびTリンパ球減衰因子、CD272としても知られる)、VISTA(B7-H5)受容体、LAG3(リンパ球活性化遺伝子3、CD233としても知られる)、ならびにCTLA4(細胞毒性Tリンパ球関連抗原4、CD152としても知られる)を含むがこれらに限定されない、T細胞阻害性受容体に結合するアンタゴニスト(例えば、アンタゴニスト抗体)が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態において、その活性化が免疫応答の刺激をもたらす免疫チェックポイント経路は、本明細書では「正の免疫チェックポイント経路」と称される。正の免疫チェックポイント経路という用語には、ICOSLがICOS(CD278)に、B7-H6がNKp30に、CD155がCD96に、OX40LがOX40に、CD70がCD27に、CD40がCD40Lに、およびGITRLがGITRに結合することによって調節される生物学的経路が含まれるが、これらに限定されない。正の免疫チェックポイントを刺激する分子(免疫応答を刺激する結合対の構成成分に対する、そのような天然または合成リガンド)は、免疫応答の上方制御に有用である。そのような正の免疫チェックポイントアゴニストの例には、例えば、ICOS(JTX-2011、Jounce Therapeuticsなど)、OX40(MEDI6383、Medimmuneなど)、CD27(バルリルマブ、Celldex Therapeuticsなど)、CD40(ダセツズマブ、CP-870、893、Roche、Chi Lob7/4など)、HVEM、CD28、CD137 4-1BB、CD226、およびGITR(MEDI1873、Medimmune、INCAGN1876、Agenusなど)のT細胞活性化受容体に結合するアゴニスト抗体が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「免疫チェックポイント経路調節剤」という用語は、免疫適格性哺乳動物を含む生物系における免疫チェックポイント経路の活性を阻害または刺激する分子を指す。免疫チェックポイント経路調節剤は、免疫チェックポイントタンパク質(癌細胞および/もしくは免疫Tエフェクター細胞などの抗原提示細胞(APC)の表面上に発現する免疫チェックポイントタンパク質など)に結合することによってその効果を発揮することができるか、または免疫チェックポイント経路の上流および/もしくは下流の反応に対してその効果を発揮することができる。例えば、免疫チェックポイント経路調節剤は、PD-1およびCTLA-4シグナル伝達に関与するチロシンホスファターゼであるSHP2の活性を調節することができる。「免疫チェックポイント経路調節剤」という用語は、阻害性免疫チェックポイント(本明細書では「免疫チェックポイント経路阻害剤」または「免疫チェックポイント経路アンタゴニスト」と称される)の機能を少なくとも部分的に下方制御することができる免疫チェックポイント経路調節剤(複数可)、および刺激性免疫チェックポイント(本明細書では「免疫チェックポイント経路エフェクター」または「免疫チェックポイント経路アゴニスト」と称される)の機能を少なくとも部分的に上方制御することができる免疫チェックポイント経路調節剤(複数可)の両方を包含する。
免疫チェックポイント経路によって媒介される免疫応答は、T細胞媒介性免疫応答に限定されない。例えば、NK細胞のKIR受容体は、NK細胞によって媒介される腫瘍細胞に対する免疫応答を調節する。腫瘍細胞は、HLA-Cと呼ばれる分子を発現し、この分子が、NK細胞のKIR受容体を阻害し、減少または抗腫瘍免疫応答をもたらす。HLA-CのKIR受容体への結合をアンタゴナイズする薬剤(抗KIR3マブ(例えば、リリルマブ、BMS)など)の投与は、HLA-CがNK細胞阻害性受容体(KIR)に結合する能力を阻害し、それによりNK細胞が癌細胞を検出および攻撃する能力を回復させる。したがって、HLA-CがKIR受容体に結合することによって媒介される免疫応答は、その阻害が非T細胞媒介性免疫応答の活性化をもたらす、負の免疫チェックポイント経路の一例である。
一実施形態において、免疫チェックポイント経路調節剤は、負の免疫チェックポイント経路阻害剤/アンタゴニストである。別の実施形態において、IL-10剤と併用して用いられる免疫チェックポイント経路調節剤は、正の免疫チェックポイント経路アゴニストである。別の実施形態において、CAR-T細胞および/またはIL-10剤と併用して用いられる免疫チェックポイント経路調節剤は、免疫チェックポイント経路アンタゴニストである。
前に考察されたように、「負の免疫チェックポイント経路阻害剤」は、負の免疫チェックポイント経路の活性化を妨害し、免疫応答の上方制御または増強をもたらす、免疫チェックポイント経路調節剤を指す。例示的な負の免疫チェックポイント経路阻害剤には、プログラム死1(PD1)経路阻害剤、プログラム死リガンド1(PDL1)経路阻害剤、TIM3経路阻害剤、および抗細胞毒性Tリンパ球抗原4(CTLA4)経路阻害剤が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態において、免疫チェックポイント経路調節剤は、PD1のPDL1および/またはPDL2への結合を阻害する負の免疫チェックポイント経路のアンタゴニスト(「PD1経路阻害剤」)である。PD1経路阻害剤は、T細胞の消耗の逆転、サイトカイン産生の回復、抗原依存性T細胞の拡大などの、様々な好ましい免疫応答の刺激をもたらす。PD1経路阻害剤は、黒色腫、肺癌、腎臓癌、ホジキンリンパ腫、頭頸部癌、膀胱癌、および尿路上皮癌を含む様々な癌の治療についてUSFDAから承認を受けており、様々な癌に有効であるものとして認識されている。
PD1経路阻害剤という用語は、PD1のPDL1および/またはPDL2への結合を妨害するモノクローナル抗体を含む。抗体PD1経路阻害剤は、当該技術分野で周知である。PD1のPDL1および/またはPDL2への結合を妨害するモノクローナル抗体である市販のPD1経路阻害剤の例には、ニボルマブ(Opdivo(登録商標)、BMS-936558、MDX1106、BristolMyers Squibb、Princeton NJから市販されている)、ペンブロリズマブ(Keytruda(登録商標)MK-3475、ラムブロリズマブ、Merck and Company,Kenilworth NJから市販されている)、およびアテゾリズマブ(Tecentriq(登録商標)、Genentech/Roche,South San Francisco CA)が含まれる。デュルバルマブ(MEDI4736、Medimmune/AstraZeneca)、ピディリズマブ(CT-011、CureTech)、PDR001(Novartis)、BMS-936559(MDX1105、BristolMyers Squibb)、ならびにアベルマブ(MSB0010718C、Merck Serono/Pfizer)およびSHR-1210(Incyte)を含むがこれらに限定されない、さらなるPD1経路阻害剤抗体が、臨床開発段階にある。さらなる抗体PD1経路阻害剤は、2012年7月10日に発行された米国特許第8,217,149号(Genentech,Inc)、2012年5月1日に発行された米国特許第8,168,757号(Merck Sharp and Dohme Corp.)、2011年8月30日に発行された米国特許第8,008,449号(Medarex)、2011年5月17日に発行された米国特許第7,943,743号(Medarex,Inc)に記載されている。
本発明の一実施形態において、PD1免疫チェックポイント経路調節剤は、以下の表3に提供されるCDR配列を含む抗体である。
Figure 0007097465000003
本発明の一実施形態において、PD1免疫チェックポイント経路阻害剤は、以下の表4に提供される可変ドメイン配列(配列番号56および配列番号57)を含む抗体である。
Figure 0007097465000004
本発明の一実施形態において、PD1アンタゴニスト抗体は、AM0001であり、これは、ラムダ2軽鎖、および228位にセリンからプロリンへの置換(S228P)を有することで、「ヒンジ安定化」重鎖を提供するIgG4を有する、モノクローナル抗体であり、上記の表3に明記される配列番号50~55に対応するアミノ酸配列を有するVLおよびVH CDRを特徴とし、軽鎖可変領域は、配列番号56の配列を特徴とし、重鎖可変領域は、配列番号57のアミノ酸配列を特徴とする。AM0001抗体は、25℃で、約10pM以下のヒトおよびカニクイザルPD-1に対する結合親和性(K)を有することを特徴とする。バイオレイヤー干渉法(BLI)によって測定されるAM0001の結合親和性を、以下の表5に示す。
Figure 0007097465000005
AM0001の重鎖および軽鎖の完全長アミノ酸配列を、以下に提供する。
AM0001成熟重鎖タンパク質配列(ヒトIgG4 S228Pフレームワーク):
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCPASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLGWVSDISGGGGTTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRGEDTAVYYCAKSGTVVTDFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号60)
AM0001成熟軽鎖タンパク質配列(ヒトラムダ-2フレームワーク):
SYVLTQPPSVSVAPGQTARVTCGGNSIGSYSVHWYQQKPGQAPVLVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTAALTISRVEAGDEADYYCQVWDTSSYWVFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS(配列番号61)
PD-1経路阻害剤抗体は、組換え手段によって産生することができる。本発明は、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号5、配列番号56、配列番号57、配列番号60、および配列番号61のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。一実施形態において、本開示は、PD1アンタゴニスト抗体がAM0001である場合の核酸配列を提供し、AM0001の重鎖および軽鎖をコードする核酸配列(配列番号60および配列番号61)は、それぞれ、配列番号62および配列番号63として以下に明記されるとおりである。
AM0001成熟重鎖DNA配列(ヒトIgG4 S228Pフレームワーク):
GAGGTCCAGCTCCTGGAATCCGGGGGCGGTCTGGTCCAGCCGGGCGGCTCGCTCCGCCTGTCCTGCCCGGCGAGCGGCTTCACCTTCTCCTCCTACGCCATGTCCTGGGTGAGGCAGGCCCCCGGCAAGGGCCTCGGCTGGGTCAGCGACATCTCCGGCGGCGGCGGCACCACGTACTACGCGGACTCGGTGAAGGGCCGGTTCACGATCTCCCGGGACAACTCCAAGAACACCCTGTACCTGCAGATGAACTCACTGCGGGGCGAGGACACGGCGGTGTATTACTGCGCCAAGTCCGGAACGGTTGTGACTGATTTCGACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACCGTGTCCAGCGCCTCCACCAAGGGCCCCAGCGTGTTCCCCCTGGCGCCGTGCTCGCGGAGCACCAGCGAGTCCACCGCCGCGCTCGGTTGCCTCGTCAAGGACTACTTCCCCGAGCCGGTCACAGTGTCATGGAACTCCGGCGCGCTGACGAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCCGTGCTCCAGTCCAGCGGCCTGTACAGCCTCAGTAGCGTCGTGACGGTGCCCTCGTCGTCGCTGGGCACGAAGACCTACACCTGCAACGTGGACCACAAGCCGTCCAACACCAAGGTCGATAAGCGAGTGGAGAGCAAGTACGGCCCCCCGTGCCCCCCCTGCCCGGCCCCGGAGTTCCTGGGTGGCCCCTCCGTGTTCCTCTTCCCCCCGAAGCCCAAAGACACCCTCATGATCAGCCGGACGCCGGAGGTCACGTGCGTCGTCGTGGACGTGAGCCAGGAAGACCCGGAGGTCCAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTCGAGGTGCATAACGCCAAGACCAAGCCTCGCGAGGAACAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTCAACGGGAAGGAATACAAGTGCAAGGTCTCGAACAAGGGCCTGCCGTCGTCCATCGAGAAGACCATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCGCGGGAGCCCCAGGTCTACACCCTCCCCCCCTCCCAGGAAGAGATGACGAAGAACCAGGTGAGCCTGACGTGCCTCGTGAAGGGGTTCTACCCCTCCGACATCGCAGTCGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCGGAGAACAACTACAAGACGACCCCCCCGGTGCTGGACAGCGACGGGTCCTTCTTCCTCTACTCGCGTCTCACAGTCGACAAGTCGCGCTGGCAGGAGGGCAACGTCTTCTCGTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCGCTGTCCCTGTCCCTGGGCAAG(配列番号62)
AM0001成熟軽鎖タンパク質配列(ヒトラムダ-2フレームワーク):
AGCTACGTGCTGACCCAGCCGCCCTCGGTGTCGGTCGCCCCGGGCCAGACGGCACGTGTGACCTGCGGCGGTAACAGCATCGGCTCCTACTCGGTCCACTGGTATCAGCAGAAGCCGGGGCAGGCCCCGGTCCTGGTGGTCTACGACGACAGCGACCGCCCGTCCGGCATCCCCGAACGCTTCAGCGGCTCAAACAGCGGGAACACCGCGGCCCTGACGATCTCGCGCGTCGAGGCGGGGGACGAAGCCGATTACTACTGCCAGGTCTGGGACACCTCGAGTTACTGGGTGTTCGGCGGGGGCACGAAGCTGACCGTCCTCGGCCAGCCGAAGGCCGCCCCCTCAGTAACCCTGTTCCCCCCGTCCTCGGAGGAGTTGCAGGCGAACAAGGCGACGCTGGTGTGCTTGATCTCGGACTTCTACCCCGGAGCGGTGACGGTCGCCTGGAAGGCCGACTCCTCCCCGGTCAAGGCGGGCGTGGAGACGACCACCCCCTCCAAGCAGAGCAACAACAAGTACGCCGCCTCGAGCTACCTCTCGCTGACACCCGAGCAGTGGAAGTCCCACCGGTCCTACTCGTGCCAGGTAACCCACGAGGGCTCCACCGTCGAGAAGACCGTGGCCCCCACCGAGTGCAGC(配列番号63)
PD1経路阻害剤という用語は、アンタゴニスト抗体に限定されない。PD-L2 IgG2a融合タンパク質であるAMP-224を含む非抗体生物学的PD1経路阻害剤もまた、臨床開発中であり、PDL2融合タンパク質であるAMP-514は、AmplimmuneおよびGlaxo SmithKlineによって臨床開発中である。アプタマー化合物はまた、PD1経路阻害剤として有用であるものとして、文献にも記載されている(Wang,et al.Selection of PD1/PD-L1 X-Aptamers,Biochimie(印刷中)、2017年9月11日時点で、https://doi.org/10.1016/j.biochi.2017.09.006.のインターネットアドレスにてオンラインで入手可能)。
PD1経路阻害剤という用語は、2016年8月23日に発行されたSasikumarらの米国特許第9,422,339号、および2014年12月9日に発行されたSasilkumarらの米国特許第8,907,053号に記載されたものなどの、ペプチジルPD1経路阻害剤を含む。CA-170(AUPM-170、Aurigene/Curis)は、免疫チェックポイントPDL1およびVISTAを標的とする、経口で生体利用可能な小分子であると報告されている。Pottayil Sasikumar,et al.Oral immune checkpoint antagonists targeting PD-L1/VISTA or PD-L1/Tim3for cancer therapy.[要約].In:Proceedings of the107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research;2016Apr16-20;New Orleans,LA.Philadelphia(PA):AACR;Cancer Res2016;76(14Suppl):Abstract No.4861.CA-327(AUPM-327、Aurigene/Curis)は、免疫チェックポイント、プログラム死リガンド1(PDL1)、ならびにT細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン含有タンパク質3(TIM3)を阻害する、経口で利用可能な小分子であると報告されている。
PD1経路阻害剤という用語は、小分子PD1経路阻害剤を含む。本発明の実施に有用な小分子PD1経路阻害剤の例は、Sasikumarらの、免疫調節剤としての1,2,4-オキサジアゾールおよびチアジアゾール化合物(2016年3月7日に出願されたPCT/IB2016/051266、WO2016142833A1として2016年9月15日に公開)、ならびにSasikumarらの、免疫調節剤としての3-置換-1,2,4-オキサジアゾールおよびチアジアゾール化合物(2016年3月9日に出願されたPCT出願第PCT/IB2016/051343号、WO2016142886A2として公開)、以下の構造を有するBMS-1166およびBMS-1001(Skalniak,et al(2017)Oncotarget 8(42):72167-72181)を含む当該技術分野に記載されている。
Figure 0007097465000006
および
Figure 0007097465000007
Chupak LS amd Zheng X.Compounds useful as immunomodulators.Bristol-Myers Squibb Co.2015 WO2015/034820 A1、EP3041822B1(2017年8月9日に認可)、WO2015034820 A1、およびChupak,et al.Compounds useful as immunomodulators.Bristol-Myers Squibb Co.2015 WO2015/160641 A2.WO2015/160641 A2、Chupak,et al.Compounds useful as immunomodulators.Bristol-Myers Squibb Co.Sharpe,et al.Modulators of immunoinhibitory receptor pd-1,and methods of use thereof、WO2011082400 A2(2011年7月7日に公開)、米国特許第7,488,802号(Wyeth)(2009年2月10日に発行)。
本開示のCAR-T細胞および/またはIL-10剤の組成物およびそれらの方法は、黒色腫、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、頭頸部癌、腎細胞癌、膀胱癌、卵巣癌、子宮体癌、子宮頸癌、子宮肉腫、胃癌、食道癌、DNAミスマッチ修復欠損結腸癌、DNAミスマッチ修復欠損子宮内膜癌、肝細胞癌、乳癌、メルケル細胞癌、甲状腺癌、ホジキンリンパ腫、濾胞性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、菌状息肉症、末梢T細胞リンパ腫を含むが、これらに限定されない、疾患の治療のためのFDAの承認または臨床試験における臨床有効性の実証を通して、PD1経路阻害剤がヒトにおける臨床効果を実証している腫瘍性病態の治療に特に適している。
おそらく、最も多くの臨床経験を有する最もよく研究された免疫療法は、抗PD1モノクローナル抗体のペンブロリズマブ(Keytruda(登録商標))およびニボルマブを用いて得られている。これらの生成物は、有意な有効性を実証しており、現在、多種多様な癌に対して多数の承認を取得している。これらの薬剤の臨床経験は、成功の可能性が最も高いことを示す一連のパラメータを実証している。抗PD1療法は、高レベルのPDL1の発現が存在する腫瘍内で最高レベルの有効性を実証しており(GaronらのNEJM 2014)、ここで腫瘍は、腫瘍変異負荷を有し(RizviらのScience 2015、CarboneらのNEJM 2017)、腫瘍内の高レベルのCD8+T細胞(TumehらのNature 2014)、IFNγに関連する免疫活性化シグネチャ(PratらのCancer Res.2017、AyersらのJCI 2017)、および転移性疾患、特に肝臓転移の欠如(TumehらのCancer Imm.Res.2017、PillaiらのASCO 2017)が存在する。これらの因子は、PD1療法の有効性を、比較的小さな範囲の腫瘍に制限する。多種多様な腫瘍は、稀なネオ抗原特異的CD8+T細胞による低ネオ抗原負荷を有し、高ネオ抗原負荷を有する腫瘍は、最終的にICIから逃れている。他の状況では、腫瘍微小環境内に、T細胞が消耗し、アポトーシスした、免疫砂漠が存在し、T細胞発現の欠如は、腫瘍内の低レベルのグランザイムおよびIFNγ発現をもたらす。IL-10単剤療法は、これらのパラメータの多くに対処する。IL-10は、腫瘍内CD8+T細胞の活性を増加させ、グランザイムであるFasLおよびIFNγのレベルを増加させることが観察されている。Mumm,et al.,(2011)Cancer Cell、Emmerich et al.,(2012)Cancer Research、Oft,et al.(2014)Cancer Immunology Research。これらの障害物(これまでのスライドに提示される)への対処におけるIL-10の確立された有用性のために、我々は、抗PD1Mab療法と併用したIL-10剤を評価した。
一実施形態において、免疫チェックポイント経路調節剤は、CTLA4のCD28への結合を阻害する負の免疫チェックポイント経路のアンタゴニスト(「CTLA4経路阻害剤」)である。免疫チェックポイント受容体CTLA4は、PD1、BTLA、リンパ球減衰因子、TIM3、およびT細胞活性化のVドメイン免疫グロブリン抑制因子もまた含む、受容体の免疫グロブリンスーパーファミリーに属する。CD80(B7.1としても知られる)およびCD86(B7.2としても知られる)は、CTLA4受容体リガンドとして特定されている。臨床的に標的とされる第1の免疫チェックポイント受容体であるCTLA4は、もっぱらT細胞上にのみ発現され、T細胞上で、それは、主にT細胞活性化の初期段階の振幅を制御する。それは、T細胞共刺激受容体CD28の活性を相殺することが示されている。
抗原認識時、CD28シグナル伝達は、T細胞受容体シグナル伝達を強く増幅して、T細胞を活性化する。[例えば、Riley et al.,(2002)Proc.Natl Acad.Sci.USA99:11790-95を参照されたい]。CTLA4は、T細胞活性化後に転写的に誘導される。CTLA4は、活性化CD8+エフェクターT細胞によって発現されるが、その主な生理学的役割は、CD4+T細胞の2つの主要なサブセットに対する異なる効果、つまりi)ヘルパーT細胞活性の下方調節、およびii)制御性T細胞の免疫抑制活性の増強を通して顕在化すると考えられている。具体的には、CTLA4遮断は、ヘルパーT細胞に依存した免疫応答の増強をもたらす一方で、制御性T細胞のCTLA4関与は、それらの抑制機能を増加させる。[例えば、Fontenot et al.,(2003)Nat.Immunol.Proc.4:330-36を参照されたい]。CTLA4経路阻害剤の例は、当該技術分野で周知である(例えば、2004年1月27日に発行された米国特許第6,682,736号(Abgenix)、2007年5月29日に発行された米国特許第6,984,720号(Medarex,Inc.)、2009年10月20日に発行された米国特許第7,605,238号(Medarex,Inc.)を参照されたい。
現在、CTLA4経路阻害剤抗体治療アプローチに、欠点がないわけではない。例として、ヒト化抗CTLA4アンタゴニスト抗体を用いた転移性黒色腫の治療は、ある特定の自己免疫毒性(例えば、腸の炎症および皮膚炎)を引き起こすことが報告されており、許容される治療ウィンドウの決定が促進されている(Wu et al.,(2012)Int.J.Biol.Sci.8:1420-30)。CTLA4経路阻害剤(例えば、イピリムマブなどの抗体)とIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)との併用の増強された治療有効性は、治療有効性を維持しながら投薬量を低減する潜在性を提供する。
一実施形態において、免疫チェックポイント経路調節剤は、BTLAのHVEMへの結合を阻害する負の免疫チェックポイント経路のアンタゴニスト(「BTLA経路阻害剤」)である。BTLAは、CTLA-4およびPD-1に構造的および機能的に関連する共阻害分子である。BTLAは、ウイルス特異的なヒトCD8+T細胞上に発現されるが、それは、それらがナイーブ表現型からエフェクター表現型へと分化した後、漸進的に下方制御される(Paulos et al.,(Jan.2010)J.Clin.Invest.120(1):76-80)。ある特定の腫瘍細胞型(例えば、黒色腫)および腫瘍関連内皮細胞上に発現する、ヘルペスウイルス侵入媒介因子(HVEM、TNFRSF14としても知られる)は、BTLAリガンドとして特定されている。BTLAとHVEMとの間の相互作用は、複雑であるため、BTLAの治療阻害戦略は、他の免疫チェックポイント経路阻害受容体およびリガンドの場合よりも単純ではない。[Pardoll,(April 2012)Nature Rev.Cancer 12:252-64]。抗BTLA抗体およびアンタゴニストHVEM-Igを使用してBTLA/HVEM経路を標的とする、いくつかのアプローチが評価されており、そのようなアプローチは、移植、感染、腫瘍、および自己免疫疾患を含む、いくつかの疾患、障害、および病態において見込みがある有用性を示唆している(Wu et al.,(2012)Int.J.Biol.Sci.8:1420-30)。
一実施形態において、免疫チェックポイント経路調節剤は、TIM3がTIM3活性化リガンドに結合する能力を阻害する負の免疫チェックポイント経路のアンタゴニスト(「TIM3経路阻害剤」)である。TIM3は、Tヘルパー1(TH1)細胞応答を阻害し、抗TIM3抗体は、抗腫瘍免疫を増強することが示されている。TIM3経路の調節に関与する分子であるガレクチン9は、乳癌を含む様々な種類の癌において上方制御される。TIM3は、腫瘍特異的CD8+T細胞上にPD1とともに同時発現されることが報告されている。癌精巣抗原NY-ESO-1によって刺激されると、両方の分子の二重阻害により、ヒトT細胞のインビトロでの増殖およびサイトカイン産生が大幅に増強される。さらに、動物モデルでは、PD1およびTIM3の協調的な遮断が、個々の分子の遮断によるわずかな影響のみが観察される状況で、抗腫瘍免疫応答を増強することが報告された。[例えば、Pardoll,(April 2012)Nature Rev.Cancer 12:252-64、Zhu et al.,(2005)Nature Immunol.6:1245-52、Ngiow et al.,(2011)Cancer Res.71:3540-51)を参照されたい]。TIM3経路阻害剤の例は、当該技術分野で既知であり、代表的で非限定的な例は、2016年9月15日に公開された米国特許公開第PCT/US2016/021005号、2016年9月8日に公開されたLifkeらの米国特許公開第US2016/0257749A1号(F.Hoffman-LaRoche)、2017年4月27日に発行されたKarunskyの米国特許第9,631,026号、2014年9月23日に発行された(isued)Karunsky、Sabatos-Peytonらの米国特許第8,841,418号、米国特許第9,605,070号、および2013年10月8日に発行されたTakayanagiらの米国特許第8552156号に記載されている。
LAG3は、制御性T(TReg)細胞の機能を増強する役割、および独立してCD8+エフェクターT細胞機能を阻害する役割を果たすことが示されている。LAG3のリガンドであるMHCクラスII分子は、いくつかの上皮癌で(しばしばIFNγに応答して)上方制御され、腫瘍浸潤マクロファージおよび樹状細胞上でも発現される。LAG3-MHCクラスIIの相互作用の役割は、決定的には解明されていないが、この相互作用は、TReg細胞機能の増強におけるLAG3の役割の重要な構成要素である可能性がある。
LAG3は、TReg細胞およびアネルギーT細胞の両方で協調的に上方制御されるいくつかの免疫チェックポイント受容体のうちの1つである。LAG3およびPD1の同時遮断は、1つの受容体のみの遮断と比較して、アネルギー状態の逆転の増強を引き起こすことができる。実際、LAG3およびPD1の遮断は、慢性感染の設定では、腫瘍特異的CD8+T細胞とウイルス特異的CD8+T細胞との間のアネルギーを相乗的に逆転させることが示されている。IMP321(ImmuFact)は、黒色腫、乳癌、および腎細胞癌において評価されている。[一般に、Woo et al.,(2012)Cancer Res 72:917-27、Goldberg et al.,(2011)Curr.Top.Microbiol.Immunol.344:269-78、Pardoll,(April 2012)Nature Rev.Cancer 12:252-64、Grosso et al.,(2007)J.Clin.Invest.117:3383-392を参照されたい]。
A2aRは、CD4+T細胞をTreg細胞へと発達するように刺激することによって、T細胞応答を阻害する。A2aRは、腫瘍免疫において特に重要であるが、これは、細胞の代謝回転による腫瘍内の細胞死の速度が高く、瀕死の細胞がA2aRのリガンドであるアデノシンを放出するためである。加えて、A2aRの欠失は、感染に対する炎症応答の増強、および場合によっては病理学的な炎症応答に関連付けられている。A2aRの阻害は、アデノシン結合を阻害する抗体によって、またはアデノシン類似体によってもたらすことができる。そのような薬剤は、癌およびパーキンソン病などの障害において有用である可能性がある。[一般に、Zarek et al.,(2008)Blood 111:251-59、Waickman et al.,(25 Nov 2011)Cancer Immunol.Immunother.(doi:10.1007/s00262-011-1155-7)を参照されたい]。
IDO(インドールアミン2,3-ジオキシゲナーゼ)は、通常、腫瘍細胞内および活性化免疫細胞内で発現される、免疫制御酵素である。IDOは、トリプトファンの酸化を通した免疫応答を下方制御する。これは、T細胞活性化の阻害およびT細胞アポトーシスの誘導をもたらし、これにより、腫瘍特異的細胞毒性Tリンパ球が機能的に不活性化されるか、または対象の癌細胞を攻撃することができない環境が作り出される。インドキシモド(NewLink Genetics)は、転移性乳癌において評価されているIDO阻害剤である。
ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の産生、精製、および断片化は、記載されおり(例えば、Harlow and Lane(1999)Using Antibodies,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY)、リガンド/受容体相互作用を特性評価するための標準的な技術が利用可能であり(例えば、Coligan et al.(2001)Current Protocols in Immunology,Vol.4,John Wiley,Inc.,NYを参照されたい)、蛍光標識細胞分取(FACS)を含むフローサイトメトリーのための方法が利用可能であり(例えば、Shapiro(2003)Practical Flow Cytometry,John Wiley and Sons,Hoboken,NJを参照されたい)、例えば、診断試薬として使用するための、核酸プライマーおよびプローブ、ポリペプチド、ならびに抗体を含む、核酸の修飾に好適な蛍光試薬が利用可能である(Molecular Probes(2003)Catalogue,Molecular Probes,Inc.,Eugene,OR.、Sigma-Aldrich(2003)Catalogue,St.Louis,MO)。
以前に記載したように、本発明は、2つ、3つ、またはそれ以上の免疫チェックポイント経路を調節する免疫チェックポイント経路調節剤を含む、少なくとも1つの免疫チェックポイント経路を調節する薬剤(複数可)と併用して、CAR-T細胞および/またはIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)を投与することによる、哺乳動物対象における腫瘍性疾患(例えば、癌)の治療方法を提供する。
一実施形態において、多数の免疫チェックポイント経路は、多数の免疫チェックポイント経路の調節剤として作用することができる多機能分子の投与によって調節することができる。そのような多重免疫チェックポイント経路調節剤の例には、二重特異性抗体または多特異性抗体が含まれるが、これらに限定されない。調節剤または多数の免疫チェックポイント経路として作用することができる多特異性抗体の例は、当該技術分野で既知である。例えば、米国特許公開第2013/0156774号は、PD1およびTIM3を同時発現する細胞を標的とするための二重特異性薬剤および多重特異性薬剤(例えば、抗体)、ならびにそれらの使用方法を記載している。さらに、BTLAおよびPD1の二重遮断は、抗腫瘍免疫を増強することが示されている(Pardoll,(April 2012)Nature Rev.Cancer12:252-64)。本開示は、PD1およびLAG3の両方に結合する二重特異性抗体を含むがこれに限定されない、多数の免疫チェックポイント経路を標的とする免疫チェックポイント経路調節剤と併用した、IL-10剤の使用を企図する。したがって、抗腫瘍免疫は、多数のレベルで増強することができ、様々な機構的考察を考慮して、コンビナトリアル戦略を生成することができる。
他の実施形態は、多数のチェックポイント経路調節剤と併用したIL-10剤の投与を企図し、さらなる実施形態は、3つ以上の免疫チェックポイント経路調節剤と併用したIL-10剤の投与を企図する。CAR-T細胞および/またはIL-10剤と多数の免疫チェックポイント経路調節剤とのそのような組み合わせは、免疫チェックポイント経路が、異なる作用機構を有することができ、これが、多数の異なる治療角度から基礎疾患、障害、または病態を攻撃する機会を提供するという点で、有利であり得る。IL-10剤の投与と併用することができる免疫チェックポイント経路調節剤の代表的な併用(以下に特定されるように、それらのいくつかは臨床試験中である)には、以下が含まれるが、これらに限定されない。
(a)PD1/PDL1経路阻害剤(ニボルマブ、ペンブロリズマブ、PDR001、MEDI4736、アテゾリズマブ、およびデュルバルマブを含むがこれらに限定されない)と、LAG3アンタゴニスト抗体(例えば、BMS-986016、臨床試験識別子NCT01968109)、CTLA4アンタゴニスト抗体(例えば、イピルムマブ)、B7-H3アンタゴニスト抗体(例えば、エノブリツズマブ、臨床試験識別子NCT01968109)、KIRアンタゴニスト抗体(例えば、リリルマブ、臨床試験識別子NCT01714739)との併用、
(b)PD1/PDL1経路阻害剤(ニボルマブ、ペンブロリズマブ、PDR001、MEDI4736、アテゾリズマブ、およびデュルバルマブを含むがこれらに限定されない)と、4-1BBに対するアゴニスト抗体(レルマブ、臨床試験識別子NCT02253992)、ICOSに対するアゴニスト抗体(例えば、JTX-2011、例えば、臨床試験識別子NCT02904226)、CD27に対するアゴニスト抗体(例えば、バルリルマブ、例えば、臨床試験識別子NCT02335918)、GITRに対するアゴニスト抗体(例えば、GWN323、例えば、臨床試験識別子NCT02740270)、およびOX40に対するアゴニスト抗体(例えば、MEDI6383(例えば、臨床試験識別子NCT02221960))などの正の免疫チェックポイントアゴニスト抗体との併用、
(c)CTLA4経路阻害剤(イピルムアブを含むがこれに限定されない)と、LAG3アンタゴニスト抗体(例えば、BMS-986016)、TIM3アンタゴニスト抗体との併用。
IL-10剤の追加によって補うことができるPD1/PDL1経路阻害剤を用いた他の代表的な併用療法には、PD1/PDL1経路阻害剤と、BRAF/MEK阻害剤、スニチニブ(NCT02484404)などのキナーゼ阻害剤、オラパリブなどのPARP阻害剤(NCT02484404)、オシメルチニブなどのEGFR阻害剤(Ahn,et al.(2016)J Thorac Oncol 11:S115)、エパカドスタットなどのIDO阻害剤、およびタリモジーン・ラハーパレプベック(T-VEC)などの腫瘍溶解性ウイルスとの併用が含まれる。IL-10剤の追加によって補うことができるCTL4経路阻害剤を用いた他の代表的な併用療法には、CTL4経路阻害剤と、IL2、GMCSF、およびIFN-αとの併用が含まれる。
免疫チェックポイント経路阻害剤に対する治療応答は、しばしば、チロシンキナーゼ阻害剤などの従来の化学療法に対する応答よりもはるかに後に顕在化することに留意すべきである。場合によっては、免疫応答チェックポイント経路阻害剤を用いた治療開始後、治療応答の客観的な兆候が観察されるまでに、6カ月以上かかる可能性がある。加えて、抗CTLA4抗体療法に関与する場合によっては、転移性病変は、実際に、コンピュータ断層撮影(CT)または磁気共鳴画像法(MRI)スキャンでサイズが増加してから、その後に退縮する[例えば、Pardoll,(April 2012)Nature Rev.Cancer12:252-64を参照されたい]。したがって、本開示のCAR-T細胞および/またはIL-10剤と併用した免疫チェックポイント経路阻害剤(複数可)を用いた治療についての決定は、しばしば従来の化学療法よりも長い進行までの時間にわたって行わなくてはならない。所望の応答は、その状況下で好ましいと思われる任意の結果であり得る。いくつかの実施形態において、所望の応答は、疾患、障害、または病態の進行の予防である一方で、他の実施形態において、所望の応答は、疾患、障害、または病態の1つ以上の特徴の退縮または安定化(例えば、腫瘍サイズの低減)である。さらに他の実施形態において、所望の応答は、併用の1つ以上の薬剤に関連する1つ以上の有害作用の低減または排除である。
3.補助剤としてのケモカインおよびサイトカイン剤:
CARベクターでの共発現の代わりに、IL-2、IL-7、IL-12、IL-15、およびIL18などのサイトカイン、ならびにそれらの類似体およびバリアントを、CAR-T細胞療法とともに補助剤として投与することができる。追加の補助剤の例には、IL-7剤、修飾ポリペプチドIL-10剤、修飾ポリペプチドIL-12剤、修飾ポリペプチドIL-7剤、修飾ポリペプチドIL-15剤、ペグ化IL-2剤、および修飾ポリペプチドIL-18剤、具体的には、ペグ化IL-7剤、ペグ化IL-12剤、ペグ化IL-7剤、ペグ化IL-15剤(特にMcCauleyらのPCT出願番号PCT/US2016/067042に開示されているもの、2017年6月29日に公開された国際公開WO2017/112528)、ペグ化IL-2剤(NKTR-214,Nektar Therapeutics,Inc.を含むがこれらに限定されない)、ペグ化IL-18剤、IL-7バリアント、IL-10バリアント、IL-12バリアント、IL-7バリアント、IL-15バリアント、IL-2バリアント、IL-18バリアント、IL-7類似体、IL-10類似体、IL-12類似体、IL-7類似体、IL-15類似体、IL-2類似体、およびIL-18類似体を含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、ペグ化IL-15分子は、以下の構造を有する:
Figure 0007097465000008

式中、w、x、およびzがPEG分子であり、x、w、およびzの各々のMWが同じであり、x、w、およびzのうちの少なくとも1つのMWが異なり、xおよびzの各々のMWが同じであり、xおよびzの各々のMWが異なる。本開示は、PEGのMWが、7.5kDa~80kDaである、15kDa~45kDaである、15kDa~60kDaである、15kDa~80kDaである、20kDa~30kDaである、20kDa~40kDaである、20kDa~60kDaである、20kDa~80kDaである、30kDa~40kDaである、30kDa~50kDaである、30kDa~60kDaである、30kDa~80kDaである、40kDa~60kDaである、または40kDa~80kDaである、実施形態を企図する。特定の実施形態において、xおよびzの各々のMWは20kDaであり、wのMWは10kDaである。
Figure 0007097465000009

式中、xおよびzはPEG分子であり、xおよびzはPEGの構成成分を表し、IL-15は、PEG分子でもあり得るリンカーwを介してPEGに共有結合している。ある特定の実施形態において、PEG xまたはz PEGのMWは、約20kDa、約30kDa、約40kDa、約50kDa、約60kDa、約70kDa、もしくは約80kDaであるか、またはそれを超える。xおよびzの各々のMWが、10kDa、20kDa、30kDa、または40kDaである、特定の実施形態が企図される。
V.活性化誘導細胞死
特異的標的抗原に対する遺伝子改変T細胞(car T細胞など)の注入は、長期の疾患管理、細胞毒性化学療法のものまたは標的療法と同様の作用の急速な開始、ならびにT細胞レパートリーの免疫寛容およびMHC制限の両方の回避を含めた、いくつかの潜在的な利点を有する。しかしながら、CAR-T細胞療法によるある特定の癌(例えば、非B細胞悪性腫瘍)の治療は、標的抗原を発現する正常組織を標的とする抗原特異的毒性の誘導と生命を脅かすサイトカイン放出症候群をもたらすこともあるCAR-T細胞治療の極端な効力の両方によって部分的に制限されてきた(Magee(Nov.2014)Discov Med 18(100):265-71)。特に、著しい抗原負荷を伴う高親和性T細胞受容体相互作用は、活性化誘導細胞死につながり得ることが観察されている(Song et al.(2012)Blood 119(3):696-706、Hombach et al(2013)Mol Ther 21(12):2268-77)。
Fasリガンド(例えば、FasL、CD95リガンド)とFas受容体(例えば、Fas、CD95)との相互作用から生じるプログラム細胞死である活性化誘導細胞死(AICD)は、末梢性免疫寛容を維持するのに役立つ。AICDエフェクター細胞はFasLを発現し、Fas受容体を発現する細胞でアポトーシスが誘導される。活性化誘導細胞死は、そのT細胞受容体の反復性刺激に起因する活性化Tリンパ球の負の調節因子である。このプロセスを変更することは、自己免疫疾患につながり得る(Zhang J,et al.(2004)Cell Mol Immunol.1(3):186-92)。
機構的に、Fas受容体へのFasリガンドの結合は、Fas受容体の三量体化を誘発し、次いで、その細胞質内ドメインがアダプタータンパク質FADD(デスドメインを有するFas結合タンパク質)のデスドメインと結合することができる。プロカスパーゼ8はFADDのデスエフェクタードメインに結合し、タンパク質分解的にカスパーゼ8を自己活性化し、Fas、FADD、およびプロカスパーゼ8は、デス誘導シグナル伝達複合体を一緒に形成する。活性化されたカスパーゼ8は、サイトゾルに放出され、そこでアポトーシスを引き起こすカスパーゼカスケードを活性化する(Nagata S.(1997)Cell.88(3):355-65s。
基本的に、car T細胞の活性化誘導細胞死は、CAR T細胞療法の効果の長期的な維持を妨げる問題である。
活性化誘導増殖とエフェクター細胞死とのバランスは、T細胞の恒常性増殖において重要な点である。休止状態のT細胞はアポトーシスになりやすいが、サイトカイン(例えば、IL-2、IL-4、IL-7、およびIL-12)の存在下でのTCR/CD3を介するT細胞の刺激は、クローン性増殖をもたらす。興味深いことに、T細胞の恒常性におけるこれらの分子の役割は、矛盾していることもある。例として、IL-2はCD4+T細胞の増殖および生存に必要であるが、活性化誘導細胞死の必要条件でもある。さらに、IL-18が、活性化CD8+T細胞の増殖および生存を促進することが示された。IL-18は、刺激への曝露後に特定の機能を有するCD8+T細胞集団のサイズを調節することによって、免疫/炎症反応に影響し得る。活性化T細胞の増殖および活性化誘導細胞死の調節は、免疫/炎症反応と密接に関連している(Li,W.,et al.(July 2007)J Leukocyte Bio 82(1):142-51)。
本発明の一実施形態において、本発明は、CAR-T細胞をIL-10剤と接触させ、CAR-T細胞療法を受けている対象に、CAR-T細胞療法の投与前、投与中、または投与後に、IL-10剤(ペグ化IL-10剤を含む)を投与することによって、CAR-T細胞アポトーシスを阻害するための方法および組成物を提供し、この投与は、CAR-T細胞剤の投与と同時に、またはCAR-T細胞療法に関連する治療ウィンドウ内である。さらに、本発明の一実施形態において、本発明は、CAR-T細胞を改変してポリペプチドIL-10剤を発現させることによって、CAR-T細胞アポトーシスを阻害するための方法および組成物を提供し、この改変は、CAR-T細胞におけるIL-10ポリペプチドの発現させることができる配列を含むベクターを導入することによって達成される。一実施形態において、本発明は、CAR-T細胞をIL-10剤と接触させることによって、エクスビボでCAR-T細胞のアポトーシスを阻害する方法を提供する。一実施形態において、本発明は、IL-10剤を含む溶液中にCAR-T細胞を懸濁することによって、エクスビボでCAR-T細胞の寿命を延ばすための組成物および方法を提供する。
W.CAR-T細胞療法に対するIL-10の効果
IL-10剤(例えば、PEG-IL-10)の特徴は、本明細書の他の箇所に記載されている。抗炎症および免疫抑制分子として、IL-10は、抗原提示、CD4+T細胞機能、CD8+T細胞病原体特異的機能(Biswas et al.(2007)J Immunol 179(7):4520-28)、ウイルスエピトープ特異的CD8+T細胞IFNγ応答(Liu et al.(2003)J Immunol 171(9):4765-72)、および抗LCMV(リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス)CD8+T細胞応答(Brooks et al.(2008)PNAS USA 105(51):20428-433)を阻害する。
IL-10は、活性化誘導細胞死の増強との関連で考察されてきたが(Georgescu et al.(1997)J Clin Invest 100(10):2622-33)、本明細書に提示されたインビトロおよびインビボデータは、IL-10剤(例えば、PEG-IL-10)が、CAR-T細胞療法と併用して、活性化誘導細胞死を予防または制限し、一方で、CD8+T細胞の機能および生存を増強することができることを示す。
例として、実験セクションの実施例1に提示する発見は、PEG-IL-10の投与がCD8+T細胞免疫活性化を媒介したことを示唆している。実施例1に記載されるように、腫瘍学の患者において、PEG-rHuIL-10による治療の前後に、PD-1およびLAG3を発現するCD8+T細胞の数を比較した(実施例1を参照のこと)。PD-1およびLAG3の両方は、CD8+T細胞の活性化および細胞毒性機能のマーカーである。PD-1を発現する末梢CD8+T細胞の数は約2倍まで増加し、LAG3を発現する末梢CD8+T細胞の数は約4倍まで増加した。全体として見れば、これらのデータは、PEG-IL-10の投与がCD8+T細胞の免疫活性化を媒介したことを示す。
PEG-IL-10の投与は、活性化メモリCD8+T細胞の機能を増強することも観察された(実施例2を参照のこと)。メモリT細胞(抗原経験T細胞とも称される)は、以前の感染、癌への曝露、または以前のワクチン接種の間に、その同族抗原に以前に遭遇および応答したTリンパ球のサブセット(例えば、ヘルパーT細胞(CD4+)および細胞毒性T細胞(CD8+))である。対照的に、ナイーブT細胞は末梢内でその同族抗原に遭遇しておらず、これは、一般に、活性化マーカーのCD25、CD44、またはCD69がないこと、およびメモリCD45ROアイソフォームがないことを特徴とする。一般にCD45RO+であるメモリT細胞は、ナイーブT細胞よりも速く強力な免疫応答を再現および開始することができる。
考察されたように、CAR-T細胞は、しばしば、メモリCD8+T細胞に由来し、メモリCD8+T細胞に対するPEG-IL-10の効果は、インビトロで評価された。実施例2に提示するデータは、活性化メモリCD8+T細胞の機能を増強するためのPEG-IL-10の効果と矛盾がない。
CAR-T細胞と併用したIL-10剤の投与の効果を評価するために、インビトロ研究を行って、以下の実施例により完全に記載されるように、標的腫瘍細胞に曝露されたCAR-T細胞中の細胞毒性、IFNγ放出、およびCAR-TにおけるグランザイムB誘導に対するIL-10剤の影響を評価した。前述のように、これらの実験で使用されたIL-10剤は、約50/50のモノペグ化組換えヒトIL-10とジペグ化組換えヒトIL-10との混合物であるAM0010であった。これらの実験で使用されたCAR-T細胞は、抗CD-19 CD28-CD3zキメラ抗原受容体(CAR)をコードする組換えレンチウイルスベクターで形質導入されたCD8+T細胞であった。標的細胞は、CD19+HeLaヒト子宮頸癌細胞であった。約10,000個のCD19/HeLa標的細胞を、Eプレートマイクロタイタープレート(ACEA Biosciencesから市販されている)の各ウェルに添加した。細胞を、約24時間の間増殖させて、コンフルエンスに到達した。抗CD-19 CD28-CD3z CAR-T細胞は、血液バンクから得られたヒトPBMCを使用して調製し、抗CD-19 CD28-CD3zキメラ抗原受容体をコードする核酸構築物を発現する組換えレンチウイルスベクターでトランスフェクトした。抗CD-19 CD28-CD3z CAR-T細胞を、以下の量:(a)100,000個のCAR-T細胞(10:1のE:T比)、(b)50,000個のCAR-T細胞(5:1のE:T比)、(c)20,000個のCAR-T細胞(2:1のE:T比)、および(e)10,000個のCAR-T細胞(1:1のE:T比)で、抗CD19 CAR-Tエフェクター細胞対CD19/HeLa標的細胞の様々なエフェクター:標的(E:T)比で、各ウェルに(3重に)添加した。IL-10剤であるAM0010を、各E:T比に関して、HeLa細胞と抗CD19CAR-T細胞への曝露過程中、AM-0010を含まない対照ウェルを用いて、1000ng/ml、100ng/ml、10ng/ml、1ng/mlの4つの濃度で各ウェルに添加した。IL-10剤AM0010の非存在下での細胞毒性、IFNγ誘導、およびグランザイムB放出に対するCAR-T細胞の効果も評価された。対照として、IL-10剤AM0010の存在下および非存在下での非形質導入T細胞の細胞毒性、IFNγ誘導、およびグランザイムB放出に対する効果も、2:1および10:1の2つのE:T比で評価した。
IL-10の存在下での標的CD19-HeLa細胞の曝露は、IL-10で前治療せずに様々な濃度のAM-0010の存在下での抗CD19 CD28-CD3z CAR-T細胞のE:T比の変化に応答して標的CD19-HeLa細胞のグランザイムB誘導応答から判断した場合に、IL-10の用量依存的な様式でグランザイムBの分泌を増加させた。グランザイムBは、CAR-T細胞を添加してから8時間後および24時間後に、製造業者によって提供された取扱説明書に実質的に従って、市販のサンドイッチELISAアッセイキットカタログ番号DY2906-05(R&D Systems,614 McKinley Place NE,Minneapolis,MN 55413から市販している)を使用して測定した。
免疫活性化の特徴であり、抗腫瘍免疫応答と相関するIFNγは、CAR-T細胞を添加してから8時間および24時間後に、製造業者によって提供された取扱説明書に実質的に従って、従来のサンドイッチELISAアッセイキットカタログ番号KHC4012(市販のThermoFisher Scientific 168 Third Avenue Waltham,MA USA 02451)を使用して測定した。実施例でより完全に記載されているように、IL-10で前治療せずに様々な濃度のAM-0010の存在下での抗CD19 CD28-CD3z CAR-T細胞のE:T比の変化に応答して標的CD19-HeLa細胞のインターフェロン-ガンマ誘導応答のインビトロ分析から得られるデータは、IL-10の用量依存的な様式でT細胞活性化の特徴であるインターフェロン-ガンマ発現の分泌の増加をもたらすIL-10の存在下での標的CD19-HeLa細胞の曝露を示す。
細胞毒性は、ACEA xCelligence(登録商標)リアルタイム細胞分析(RTCA)システム(ACEA Biosciences,Inc.,San Diego CA)を使用して、CAR-T細胞の投与後約25時間の期間にわたって、約5分ごとに評価された。このシステムでは、付着した標的細胞がマルチウェル電子マイクロタイタープレート(「Eプレート」)のウェルに播種され、金の微小電極のアレイが提供される。細胞が表面全体で増殖するにつれて、電極アレイ全体の電気インピーダンスが増加する。細胞が死んでプレートから浮き上がると、電気インピーダンスが低下する。したがって、アレイを横断する電子流のインピーダンスを測定することによって、細胞の生存率をリアルタイムで測定することができる。付着細胞によって引き起こされる電子流のインピーダンスは、細胞指数(CI)として報告され、単位のないパラメータは、細胞指数(CI)=(時点nでのインピーダンス-細胞がない場合のインピーダンス)/公称インピーダンス値として計算される。付着細胞がプレートの表面全体に増殖すると、電気インピーダンスの増加を反映してCIが上昇する。CIがプラトーになると、細胞はプレート上でコンフルエントになると推定される。付着した標的細胞が死滅すると、それらは、電子マイクロタイターウェル表面から持ち上がり、電気インピーダンスの低下(伝導率の増加)をもたらし、各プレートに対して測定することができ、経時的に細胞毒性の連続的評価を可能にする。実験中、電気抵抗データは5分ごとに収集され、xCELLigence(登録商標)システムを備えているソフトウェアを使用してデータが分析された。同じソフトウェアを使用して、3つの各ウェルからのデータを組み合わせて平均化した。
この研究から得られた結果は、CAR-T細胞へのIL-10剤の添加が、IL-10剤の用量依存的な様式でCAR-T細胞毒性の特異的増強を媒介したことを実証する。特に、データの比較は、IL-10剤の存在下での標的細胞の細胞毒性の有意な増強を実証する。特に、標的腫瘍性細胞に対するCAR-T細胞の細胞毒性効果の増強は、非常に低濃度のIL-10(0.1ng/ml)でも観察される。結果として、約0.1ng/ml未満、あるいは約0.08ng/ml未満、あるいは約0.06ng/ml未満、あるいは約0.05ng/ml未満、あるいは約0.03ng/ml未満、あるいは約0.01ng/ml未満の血清中トラフ濃度を達成するためのIL-10剤の投与が、CAR-T細胞療法の治療効果を増強する(またはその毒性を低減する)のに有用であろう。前に考察されたように、いくつかのCAR-T細胞療法は、ヒト対象の治療における重大な有害事象と関連している。このデータはまた、CAR-T細胞療法(特に「ブラックボックス」警告を含む重篤な副作用を有するCAR-T細胞療法)とIL-10剤の組み合わせがCAR-T細胞療法の低用量の投与(より低い数の細胞の投与、より低いE:T比での投与)を促進し、それにより、有害事象、特にCAR-T細胞療法に関連する有害事象の減少を達成しつつ、より高いCAR-T細胞用量が観察された治療的有用性に匹敵する治療的有用性を対象に提供することを実証する。特に、標的腫瘍性細胞に対するCAR-T細胞の細胞毒性効果の増強は、非常に低濃度のIL-10(0.1ng/ml)でも観察される。結果として、約0.1ng/ml未満、あるいは約0.08ng/ml未満、あるいは約0.06ng/ml未満、あるいは約0.05ng/ml未満、あるいは約0.03ng/ml未満、あるいは約0.01ng/ml未満のIL-10剤の血清中トラフ濃度を達成するためのIL-10剤の投与が、CAR-T細胞療法の治療効果を増強する(および/またはその毒性を低減する)のに有用であろう。
前述の実験から得られた細胞毒性データは、抗CD-19CAR-T細胞と併用し、様々な量の抗CD-19CAR-T細胞で示すように、様々な濃度(0ng/ml、1ng/ml、10ng/ml、100ng/ml、および1000ng/ml)でIL-10剤(AM0010)を添加することによって、10,000個のCD19/HeLa細胞の培養に対する細胞毒性効果の増強を示すヒストグラムとして再プロットされた。AM0010の添加は、AM-0010のすべての試験濃度で、CD19/HeLa細胞に対する抗CD-19 CAR-Tのすべての比率で、CD19/HeLa細胞に対する抗CD-19 CAR-T細胞の細胞毒性効果を増強した。
対象に移植する前に、エクスビボでのIL-10剤によるCAR T細胞の前処理の効果を評価するために、さらなる研究が行われた。CD19-HeLa標的腫瘍細胞に対するCAR-T細胞の細胞毒性を、CAR-T細胞の投与からの8および24時間後に、様々な濃度のAM-0010の存在下で、抗CD19 CD28-CD3z CAR-T細胞の様々なE:T比に応答して、上記のように評価し、CAR-T細胞は、実施例により完全に記載されるように、標的細胞への曝露の前にIL-10とプレインキュベートされた。IL-10の存在下での標的CD19-HeLa細胞の曝露は、8時間の時点でIL-10の用量依存的な様式でCAR-T細胞の細胞毒性の増加をもたらした。さらに、IL-10の存在下での標的CD19-HeLa細胞の曝露は、IL-10の用量依存的な様式でCAR-T細胞の細胞毒性の増加をもたらした。IL-10の存在下での標的CD19-HeLa細胞の曝露は、IL-10の用量依存的な様式でT細胞の活性化および抗腫瘍効果の特徴であるIFNγ発現の増加をもたらした。
前述のインビトロ研究に加えて、マウスにおける腫瘍性疾患のインビボ腫瘍モデルにおけるIL-10剤(AM-0010)と抗腫瘍CAR-T細胞療法との組み合わせの効果を評価するために、追加のインビボ研究が実施された。簡単に説明すると、5匹の雌NOD.Cg-Prkdcscid IL2rgtm1Wjl/SzJ(NOD/scid IL2RGnull)マウスのコホートに、全身生物発光が腫瘍成長を評価することを可能にするルシフェラーゼ遺伝子を提供するベクターによる形質導入によるRaji細胞株(ATCC CCL-86)を操作することによって構築されたCD19+Rajiヒトバーキットリンパ腫細胞株である0.5×10個のRaji-luc細胞を腹腔内接種した。
実施例、特に実施例17でより完全に記載されているように、マウス癌モデルにおけるCAR-T細胞活性のインビボ分析の結果から。対照(治療なし)は急速な死亡をもたらし、研究の21日目までにすべてのマウスが死亡し、動物における疾患の急速な進行を示した。AM0010単独、AM-0010なしまたはAM-0010ありの非形質導入(すなわち、非CAR)T細胞の効果は、ある程度の抗腫瘍効果をもたらしたが、それでも研究の35日目までに動物の多数の死亡を伴う著しく高い死亡率を示した。全身生物発光イメージングデータは、腫瘍(暗い領域)が動物全体に急速に広がり、コホート内のすべての動物に罹患率および死亡率をもたらし、研究の35日目までに多数の動物が死亡することを示す。
500万個のCAR-T細胞の投与は、5匹すべての動物が研究の35日目まで生存したという治療的有用性を示した。しかしながら、500万個のCAR-T細胞の投与と併用した0.5mg/kgのAM-0010へのマウスの曝露の結果は、CAR-T細胞療法単独でIL-10剤の存在下で投与された場合のCAR-T細胞療法の有意な改善を実証し、この組み合わせは大多数の動物で有意な腫瘍の減少を実証した。マウスに0.5mg/kgのAM-0010を投与せずに、より少ない(250万)量のCAR-T細胞を用いた同様の実験を行った。250万個のCAR-T細胞へのマウスの曝露は、5匹すべての動物が研究の35日目まで生存したという治療的有用性を示した。しかしながら、これらのデータとIL-10剤の投与と併用した治療的有用性との対照は、CAR-T細胞療法単独でIL-10剤の存在下で投与された場合のCAR-T細胞療法の有意な改善を実証し、この組み合わせは大多数の動物で有意な腫瘍の減少を実証した。
これらの結果は、全身生物発光データによって確認されている。500万個のCAR-T細胞の投与と関連する生物発光データを生成し、5匹すべての動物が研究の35日目まで生存したという治療的有用性を示した。500万個のCAR-T細胞を用いた0.5mg/kgのAM-0010による治療から得られた全身生体発光データを生成し、CAR-T細胞療法単独でIL-10剤の存在下で投与された場合のCAR-T細胞療法の有意な治療的改善をもたらし、この組み合わせは、35日目に5匹の動物のうちの3匹の動物で有意な腫瘍の減少および腫瘍の明らかな欠如を実証する。
250万個のCAR-T細胞による治療から得られた全身生体発光データは、5匹すべての動物が研究の35日目まで生存したという治療的有用性を示した。0.5mg/kgのAM-0010および250万個のCAR-T細胞の併用治療レジメンに関連する全身生物発光データは、CAR-T細胞療法単独よりも併用治療の重要な利点を実証する。
前述のインビボデータは、CAR-T細胞療法をIL-10剤の投与と併用することによって提供される増強した抗腫瘍効果の当該技術分野で認識されている腫瘍モデルを実証する。
X.医薬組成物
CAR-T細胞および/またはIL-10剤が対象に投与される場合、本開示は、そのような薬剤の対象への投与に適した任意の形態の組成物の使用を企図する。一般に、そのような組成物は、CAR-T細胞および/またはIL-10剤と、1つ以上の薬学的に許容されるまたは生理学的に許容される希釈剤、担体または賦形剤と、任意に、捕足的な治療剤と、を含む「医薬組成物」である。医薬組成物は、本開示の方法で使用することができ、それにより例えば、医薬組成物を、エキソビボまたはインビボで対象に投与して、本明細書に記載の治療および予防の方法および使用を実施することができる。
本開示の医薬組成物は、意図される投与方法または経路と互換性であるように製剤化され得、例となる投与経路は本明細書に示される。さらに、本医薬組成物は、本開示によって企図される疾患、障害、および病態を治療または予防するために、本明細書に記載される他の治療的に活性な薬剤または化合物と組み合わせて使用することができる。
本医薬組成物は、典型的には、治療上有効な量の本開示によって企図されるIL-10剤と、1つ以上の医薬的および生理学的に許容される製剤と、を含む。好適な薬学的に許容されるかまたは生理学的に許容される希釈剤、担体、または賦形剤には、酸化防止剤(例えば、アスコルビン酸および重硫酸ナトリウム)、保存剤(例えば、ベンジルアルコール、メチルパラベン、エチルまたはn-プロピル、p-ヒドロキシベンゾエート)、乳化剤、懸濁剤、分散剤、溶媒、充填剤、増量剤、洗剤、緩衝液、ビヒクル、希釈剤、ならびに/またはアジュバントが含まれるが、これらに限定されない。例えば、好適なビヒクルは、おそらく非経口投与用の医薬組成物中で一般的な他の材料を補充した、生理食塩水またはクエン酸緩衝食塩水であり得る。中性緩衝食塩水または血清アルブミンと混合した食塩水は、さらなる例示的なビヒクルである。
当業者は、本明細書で企図される医薬組成物および剤形で使用することができる様々な緩衝液を容易に認識するであろう。典型的な緩衝液には、薬学的に許容される弱酸、弱塩基、またはそれらの混合物が含まれるが、これらに限定されない。一例として、緩衝液構成成分は、リン酸、酒石酸、乳酸、コハク酸、クエン酸、酢酸、アスコルビン酸、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびそれらの塩などの水溶性材料であり得る。許容される緩衝剤には、例えば、トリス緩衝液、N-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-N’-(2-エタンスルホン酸)(HEPES)、2-(N-モルホリノ)エタンスルホン酸(MES)、2-(N-モルホリノ)エタンスルホン酸ナトリウム塩(MES)、3-(N-モルホリノ)プロパンスルホン酸(MOPS)、およびN-トリス[ヒドロキシメチル]メチル-3-アミノプロパンスルホン酸(TAPS)が含まれる。
医薬組成物を製剤化した後、それは、溶液、懸濁液、ゲル、乳濁液、固体、または脱水粉末もしくは凍結乾燥粉末として、無菌バイアル内で保管することができる。そのような製剤は、使用準備済みの形態、使用前に再構成が必要な凍結乾燥形態、使用前に希釈が必要な液体形態、または他の許容される形態のいずれかで保管することができる。いくつかの実施形態において、医薬組成物は、使い捨て容器(例えば、使い捨てバイアル、アンプル、シリンジ、または自動注射器(例えば、EpiPen(登録商標)に類似したもの))内に提供される一方で、他の実施形態において、多用途容器(例えば、多用途バイアル)が提供される。留置剤(例えば、留置可能ポンプ)およびカテーテル系、緩徐注射ポンプおよびデバイスを含む、IL-10を送達するための任意の薬物送達装置を使用することができ、これらはすべて、当業者に周知である。一般に皮下または筋肉内投与されるデポ注射もまた、本明細書に開示されるポリペプチドを定義された期間にわたって放出するために利用することができる。デポ注射は、通常、固体ベースまたは油ベースのいずれかであり、一般に本明細書に明記される製剤構成成分の少なくとも1つを含む。当業者は、可能な製剤およびデポ注射の使用に精通している。
医薬組成物は、無菌の注射可能な水性または油性の懸濁液の形態であってもよい。この懸濁液は、本明細書で言及される好適な分散剤または湿潤剤および懸濁剤を使用して、既知の技術に従って製剤化することができる。無菌の注射可能な調製物はまた、例えば、1,3-ブタンジオール中の溶液としての、非毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の、無菌の注射可能な溶液または懸濁液であってもよい。用いることができる許容される希釈剤、溶媒、および分散培地には、水、リンガー溶液、等張塩化ナトリウム溶液、Cremophor EL(商標)(BASF、Parsippany,NJ)またはリン酸緩衝食塩水(PBS)、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール)、ならびにそれらの好適な混合物が含まれる。加えて、無菌の固定油は、溶媒または懸濁培地として従来用いられている。この目的のために、合成モノグリセリドまたはジグリセリドを含む、任意の無刺激の固定油を用いることができる。さらに、オレイン酸などの脂肪酸は、注射剤の調製において用途を見出している。特定の注射可能な製剤の吸収延長は、吸収を遅延させる薬剤(例えば、モノステアリン酸アルミニウムまたはゼラチン)を含めることによって達成することができる。
活性剤を含有する医薬組成物は、例えば、錠剤、カプセル、トローチ、ロゼンジ、水性もしくは油性懸濁液、分散性粉末もしくは顆粒、乳濁液、硬質もしくは軟質カプセル、またはシロップ、溶液、マイクロビーズ、もしくはエリキシル剤としての、経口使用に好適な形態であり得る。特定の実施形態において、本明細書に記載のIL-10剤と同時投与される薬剤の活性成分は、経口使用に好適な形態である。経口使用が意図される医薬組成物は、医薬組成物の製造について当該技術分野で既知の任意の方法に従って調製することができ、そのような組成物は、例えば、甘味剤、香味剤、着色剤、および保存剤などの1つ以上の薬剤を含有することで、医薬的に上品で口当たりのよい調製物を提供することができる。錠剤およびカプセルなどは、錠剤の製造に好適な非毒性の薬学的に許容される賦形剤と混合された、活性成分を含有する。これらの賦形剤は、例えば、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、ラクトース、リン酸カルシウム、またはリン酸ナトリウムなどの希釈剤;造粒剤および崩壊剤、例えば、コーンスターチまたはアルギン酸;結合剤、例えば、デンプン、ゼラチン、またはアラビアゴム;ならびに潤滑剤、例えば、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、またはタルクであってもよい。
水性懸濁液は、その製造に好適な賦形剤と混合された活性材料を含有する。そのような賦形剤は、懸濁剤、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、ポリビニル-ピロリドン、トラガントゴムおよびアラビアゴム;分散剤または湿潤剤、例えば、天然に存在するホスファチド(例えば、レシチン)、またはアルキレンオキシドと脂肪酸との縮合生成物(例えば、ステアリン酸ポリオキシ-エチレン)、またはエチレンオキシドと長鎖脂肪族アルコールとの縮合生成物(例えば、ヘプタデカエチレンオキシセタノールの場合)、またはエチレンオキシドと脂肪酸およびヘキシトールに由来する部分エステルとの縮合生成物(例えば、モノオレイン酸ポリオキシエチレンソルビトール)、またはエチレンオキシドと脂肪酸およびヘキシトール無水物に由来する部分エステルとの縮合生成物(例えば、モノオレイン酸ポリエチレンソルビタン)であり得る。水性懸濁液はまた、1つ以上の保存剤を含有してもよい。
油性懸濁液は、活性成分を、植物油、例えば、ピーナッツ油、オリーブ油、ゴマ油、もしくはヤシ油中に、または流動パラフィンなどの鉱物油中に懸濁させることによって製剤化され得る。油性懸濁液は、増粘剤、例えば、ミツロウ、固形パラフィン、またはセチルアルコールを含有してもよい。上記に明記されるものなどの甘味剤、および香味剤を添加して、口当たりのよい経口調製物を提供することができる。
水の添加による水性懸濁液の調製に好適な分散性粉末および顆粒は、分散もしくは湿潤剤、懸濁剤、および1つ以上の防腐剤との混合物中の活性成分を提供する。好適な分散剤または湿潤剤および懸濁剤は、本明細書に例証されている。
本開示の医薬組成物はまた、水中油型乳濁液の形態であってもよい。油性相は、植物油(例えば、オリーブ油もしくはラッカセイ油)、または鉱物油(例えば、流動パラフィン)、あるいはこれらの混合物であり得る。好適な乳化剤は、天然に存在するゴム、例えば、アラビアゴムまたはトラガントガム;天然に存在するホスファチド、例えば、ダイズ、レシチン、および脂肪酸に由来するエステルまたは部分エステル;ヘキシトール無水物、例えば、モノオレイン酸ソルビタン;ならびに部分エステルとエチレンオキシドとの縮合生成物、例えば、モノオレイン酸ポリオキシエチレンソルビタンであり得る。
製剤はまた、インプラント、リポソーム、ヒドロゲル、プロドラッグ、およびマイクロカプセル送達系を含む、制御放出製剤等の、組成物を急速な分解または身体からの排泄から保護するための担体を含み得る。例えば、モノステアリン酸グリセリルまたはステアリン酸グリセリルなどの時間遅延材料を、単独またはワックスと併用して使用することができる。
本開示は、直腸投与のための座薬の形態にあるIL-10ポリペプチドの投与を企図する。坐薬は、常温では固体であるが直腸温度では液体であるため、薬物と、直腸内で溶けて薬物を放出する好適な非刺激性賦形剤とを混合することによって調製することができる。そのような材料には、カカオバターおよびポリエチレングリコールが含まれるが、これらに限定されない。
CAR-T細胞およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)、ならびに本開示によって企図される他の薬剤は、現在既知であるか、または将来開発される任意の他の好適な医薬組成物の形態(例えば、経鼻または吸入使用のためのスプレー)であり得る。
製剤中のポリペプチド(例えば、IL-10)またはその断片の濃度は、広く異なり得(例えば、約0.1重量%未満から、通常、約2重量%で、または少なくとも約2重量%で、最大20重量%~50重量%以上)、通常は、例えば、選択される特定の投与様式に従って、主に、液量、粘度、および対象に基づく因子に基づいて選択されることになる。
本開示のIL-10剤およびCAR-T細胞(ならびにIL-10/CAR-T細胞療法と併用して投与するための補助剤)は、対象への投与に適した組成物の形態であり得る。一般に、かかる組成物は、IL-10および/またはCAR-T細胞と、1つ以上の薬学的に許容されるまたは生理学的に許容される希釈剤、担体、または賦形剤とを含む「医薬組成物」である。ある特定の実施形態において、IL-10剤およびCAR-T細胞は各々、治療的に許容される量で存在する。CAR-T細胞がIL-10剤とエクスビボでプレインキュベートされる本発明のそれらの実施形態において、CAR-T細胞は、投与前のCAR-T細胞からIL-10剤を除去する必要なしにプレインキュベーションIL-10剤と併用して投与され得る。医薬組成物は、本開示の方法で使用することができ、それにより例えば、医薬組成物を、エキソビボまたはインビボで対象に投与して、本明細書に記載の治療および予防の方法および使用を実施することができる。
一実施形態において、本発明は、IL-10剤およびCAR-T細胞を含む医薬的に許容される製剤を提供する。一実施形態において、IL-10剤およびCAR-T細胞を含む医薬的に許容される製剤を含む薬理学的に許容される製剤は、凍結される。一実施形態において、医薬的に許容される製剤は、ある量のCAR-T細胞を解凍し、解凍されたCAR-T細胞を、IL-10剤を含む医薬的に許容される製剤と接触させることによって調製される。一実施形態において、IL-10剤およびCAR-T細胞を含む医薬的に許容される製剤を含む許容される製剤は、対象への投与前24時間以内、任意に対象への投与前12時間以内、任意に対象への投与前8時間以内、任意に対象への投与前6時間以内、任意に対象への投与前4時間以内、任意に対象への投与前2時間以内、任意に対象への投与前1時間以内、または任意に対象への投与前30分以内に調製される。本発明の一実施形態において、本発明は、CAR-T細胞およびIL-10剤を含む医薬製剤の投与によって、疾患、障害、または病態の治療方法を提供する。本発明の一実施形態において、CAR-T細胞およびIL-10剤を含む医薬製剤の投与によって、疾患、障害、または病態の治療方法を提供し、IL-10剤およびCAR-T細胞を含む医薬的に許容される製剤は、対象への投与前24時間以内、任意に対象への投与前12時間以内、任意に対象への投与前8時間以内、任意に対象への投与前6時間以内、任意に対象への投与前4時間以内、任意に対象への投与前2時間以内、任意に対象への投与前1時間以内、または任意に対象への投与前30分以内に調製される。一実施形態において、治療される疾患の障害、または病態は、腫瘍性、炎症性、または過剰増殖性の疾患、障害、または病態からなる群から選択される。
Y.投与経路
本開示は、任意の好適な様式における、CAR-T細胞およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)、ならびにそれらの組成物の投与を企図する。好適な投与経路には、非経口(例えば、筋肉内、静脈内、皮下(例えば、注射またはインプラント)、腹腔内、嚢内、関節内、腹腔内、脳内(実質内および脳室内)、経口、鼻腔内、膣内、舌下、眼内、直腸内、局所(例えば、経皮)、舌下、および吸入が含まれる。一般に皮下または筋肉内投与されるデポ注射もまた、本明細書に開示されるIL-10剤を定義された期間にわたって放出するために利用することができる。
本開示のいくつかの特定の実施形態において、CAR-T細胞およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)は非経口的に投与され、さらに特定の実施形態において、非経口投与は皮下投与される。いくつかの実施形態において、CAR-T細胞は、静脈内に提供され、IL-10剤は、皮下に投与される。
CAR-T細胞療法に関しては、対象に、キメラ抗原受容体を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を導入するための代替手段が、本明細書に記載されており、キメラ抗原受容体は、標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含み、標的細胞集団へのキメラ抗原受容体標的化領域の結合は、活性化誘導性細胞死を誘発することができる。
Z.キット
本開示はまた、CAR-T細胞およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)、ならびにそれらの医薬組成物を含むキットも企図する。キットは一般に、後述のように、様々な構成要素を収容する物理的構造の形態であり、例えば、上述の方法を実施する際に利用することができる。キットは、本明細書に開示されるCAR-T細胞およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)(例えば、滅菌容器で提供される)を含み得、これらは、対象への投与に適した医薬組成物の形態であり得る。CAR-T細胞およびIL-10剤(例えば、PEG-IL-10)IL-10剤は、即時使用可能な形態、または例えば投与前に、解凍、再構築、もしくは希釈が必要な形態で提供され得る。CAR-T細胞および/またはIL-10剤が、ユーザーによる再構成が必要な形態である場合、キットはまた、IL-10剤とともに、またはそれらとは別個にパッケージ化された、緩衝液、薬学的に許容される賦形剤なども含むことができる。キットには、IL-10剤および/または使用する特定のCAR-T細胞療法の成分の両方を含めることもでき、キットには、複数のエージェントを個別に含めることもできるか、またはキット内ですでに組み合わせることができる。本開示のキットは、その中に収容される構成要素を適切に維持するために必要な条件(例えば、冷蔵または冷凍)のために設計することができる。
キットは、その中の構成要素を特定する情報ならびにそれらの使用に関する指示(例えば、投薬パラメータ、活性成分(複数可)の臨床薬理学(作用機構(複数可)を含む)、薬物動態学および薬力学、有害作用、禁忌症など)を含む、ラベルまたはパッケージ挿入物を含有してもよい。キットの各構成要素は、個々の容器内に封入されてもよく、様々な容器のすべては、単一のパッケージ内にあってもよい。ラベルまたは文書は、ロット番号および有効期限などの製造業者の情報を含むことができる。ラベルまたは添付文書は、例えば、構成要素を収容する物理的構造内に組み込まれる、物理的構造体内に別個に含有される、またはキットの構成要素(例えば、アンプル、シリンジ、またはバイアル)に貼付され得る。
ラベルまたは文書は、ディスク(例えば、ハードディスク、カード、メモリディスク)、光ディスク(CD-もしくはDVD-ROM/RAM、DVD、MP3、磁気テープなど)、または電気メモリ媒体(RAMおよびROMなど)、またはこれらのハイブリッド(磁気/光メモリ媒体、FLASH媒体、もしくはメモリ型カードなど)などのコンピュータ可読媒体をさらに含む、またはそれらに組み込むことができる。いくつかの実施形態において、実際の説明書は、キット内に存在しないが、例えば、政府の規制(例えばHIPAA)に準拠するためのパスワード(またはIL-10もしくはCAR-T細胞の容器におけるバーコードもしくはQRコードなどのスキャン可能なコード)を提供することによって安全なアクセスを含む、インターネットサイトを介して遠隔源から説明書を得るための手段が提供される。
以下の実施例は、当業者に本発明をどのように作製および使用するかの完全なる開示および説明を提供するように提示され、発明者らが自身の発明とみなすものの範囲を限定するようには意図されておらず、以下の実験が、実行されたものであり、また実行され得る実験のすべてであると表すようにも意図されていない。現在形で書かれている例となる説明は必ずしも実行されておらず、むしろそれらの説明は、本明細書に記載のデータなどを生成するために実行され得ることを理解されたい。使用される数値(例えば、量、温度など)に対する正確さを確保する努力がなされているが、いくつかの実験によるエラーおよび偏差が計上されるはずである。
別段示されない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度は摂氏(℃)であり、圧力は大気圧または大気圧付近でのものである。標準的な省略形が使用され、これには以下が含まれる:sまたはsec=秒(複数可);min=分(複数可);hまたはhr=時間(複数可);aa=アミノ酸(複数可);bp=塩基対(複数可);kb=キロベース(複数可);nt=ヌクレオチド(複数可);ng=ナノグラム;μg=マイクログラム;mg=ミリグラム;g=グラム;kg=キログラム;dlまたはdL=デシリットル;μlまたはμL=マイクロリットル;mlまたはmL=ミリリットル;lまたはL=リットル;nM=ナノモル;μM=マイクロモル;mM=ミリモル;M=モル;kDa=キロダルトン;i.m.=筋肉内(に)、i.p.=腹腔内(に);SCまたはSQ=皮下(に);HPLC=高速液体クロマトグラフィー;BW=体重;U=単位;ns=統計的に有意ではない;PMA=Phorbol12-ミリステート13-アセテート;PBS=リン酸緩衝生理食塩水;DMEM=ダルベッコ改変イーグル培地;PBMC=一次末梢血単核細胞;FBS=ウシ胎児血清;FCS=ウシ胎児血清;HEPES=4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸;LPS=リポ多糖;RPMI=ロズウェルパーク記念研究所培地;APC=抗原提示細胞;FACS=蛍光活性化セルソーティング。
以下の一般的な材料および方法は、指示されている場合に使用されたか、または以下の実施例で使用され得る。
分子生物学的手順。分子生物学における標準的な方法は、科学文献に記載されている(例えば、Sambrook and Russell(2001)Molecular Cloning,3rd ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.、ならびに細菌細胞内でのクローニングおよびDNA変異誘発(Vol.1)、哺乳動物細胞および酵母におけるクローニング(Vol.2)、複合多糖およびタンパク質発現(Vol.3)、ならびに生物情報学(Vol.4)について記載する、Ausubel,et al.(2001)Current Protocols in Molecular Biology,Vols.1-4,John Wiley and Sons,Inc.New York,N.Y.を参照されたい)。
抗体関連プロセス。ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の産生、精製、および断片化は、記載されおり(例えば、Harlow and Lane(1999)Using Antibodies,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY)、リガンド/受容体相互作用を特性評価するための標準的な技術が利用可能であり(例えば、Coligan et al.(2001)Current Protocols in Immunology,Vol.4,John Wiley,Inc.,NYを参照されたい)、蛍光標識細胞分取(FACS)を含むフローサイトメトリーのための方法が利用可能であり(例えば、Shapiro(2003)Practical Flow Cytometry,John Wiley and Sons,Hoboken,NJを参照されたい)、例えば、診断試薬として使用するための、核酸プライマーおよびプローブ、ポリペプチド、ならびに抗体を含む、核酸の修飾に好適な蛍光試薬が利用可能である(Molecular Probes(2003)Catalogue,Molecular Probes,Inc.,Eugene,OR.、Sigma-Aldrich(2003)Catalogue,St.Louis,MO.)。抗体のさらなる考察は、本明細書の他の箇所に現れる。
ソフトウェア。例えば、抗原断片、リーダー配列、タンパク質折り畳み、機能ドメイン、グリコシル化部位、および配列整列を決定するためのソフトウェアパッケージおよびデータベースが、利用可能である(例えば、GCG Wisconsin Package(Accelrys,Inc.,San Diego,CA)、およびDeCypher(商標)(TimeLogic Corp.,Crystal Bay,NV)を参照されたい)。
ペグ化。本明細書に記載のペグ化IL-10は、当業者に知られている任意の手段によって合成することができる。モノ-PEG-IL-10およびモノ-/ジ-PEG-IL-10の混合物を生成するための例示的な合成スキームが記載されている(例えば、米国特許第7,052,686号、米国特許公開第2011/0250163号、WO2010/077853を参照されたい)。本開示の特定の実施形態は、選択的にペグ化されたモノ-およびジ-PEG-IL-10の混合物を含む。本開示の実施に好適なPEG(および他の薬物送達技術)の生成および使用における自身の技術を活用することに加えて、当業者は、PEG関連技術の多くの商業的供給業者(例えば、NOF America Corp(Irvine,CA)およびParchem(New Rochelle,NY))に精通している。
動物。当業者に知られている様々なマウスおよび他の動物系統を、本開示の教示と併せて使用することができる。例えば、免疫適格性Balb/CまたはB細胞欠損Balb/Cマウスは、The Jackson Lab.,Bar Harbor,MEから得ることができ、標準的な手順に従って使用し得る(例えば、Martin et al(2001)Infect.Immun.,69(11):7067-73およびCompton et al.(2004)Comp.Med.54(6):681-89を参照されたい)。
IL-10濃度。血清IL-10濃度レベルおよび曝露レベルは、当該技術分野で使用される標準的な方法によって決定することができる。例えば、実験対象が、マウスである場合、血清曝露レベルアッセイは、単純な毛細管の中に切り取ったマウスの尾から全血(約50μL/マウス)を収集し、血清と血液細胞とを遠心分離によって分離させ、標準的なELISAキットおよび技法によってIL-10曝露レベルを決定することによって行うことができる。
FACS分析。FACS分析のための多数のプロトコル、材料、および試薬が市販されており、本明細書の教示と併せて使用することができる(例えば、Becton-Dickinson,Franklin Lakes,NJ、Cell Signaling Technologies,Danford,MA、Abcam,Cambridge,MA、Affymetrix,Santa Clara,CA)。直接フローサイトメトリー(すなわち、共役一次抗体を使用する)および間接フローサイトメトリー(すなわち、一次抗体および共役二次抗体を使用する)の両方を使用することができる。例示的な直接フロープロトコルは、以下のとおりである:収集した細胞を洗浄し、氷冷したPBS、10%FCS、1%アジ化ナトリウム中の細胞懸濁液で1~5×10個の細胞/mLの濃度に調整する。ポリスチレンの丸底12×75mmのファルコンチューブ中で、細胞を染色することができる。細胞の喪失がほとんどない状態であるが、細胞を再懸濁するのが困難でない程度で、細胞を十分に遠心分離して、それで上清液を除去することができる。一次標識抗体を添加し(0.1~10μg/mL)、必要に応じて3%BSA/PBSで希釈物を作製することができる。4℃で少なくとも30分間インキュベートした後、細胞を400gで5分間遠心分離して3回洗浄し、0.5~1mLの氷冷したPBS、10%FCS、1%アジ化ナトリウム中に再懸濁することができる。細胞は、分析するまで(好ましくは同じ日以内に)、暗所の氷上で維持することができる。細胞を数日間保つために標準的な方法論を使用して細胞を固定することもでき、異なる抗原の固定は、抗原特異的な最適化を必要とする場合がある。
PBMCおよびCD8+T細胞遺伝子発現アッセイ。以下のプロトコルは、遺伝子発現を調べるための例示的なアッセイを提供する。ヒトPBMCは、任意の標準的なプロトコルに従って単離することができる(例えば、Fuss et al.(2009)Current Protocols in Immunology,Unit7.1,John Wiley,Inc.,NYを参照されたい)。RPMI(Life Technologies;Carlsbad,CA)、10mMのHEPES(Life Technologies;Carlsbad,CA)、10%のFCS(Hyclone Thermo Fisher Scientific;Waltham,MA)、およびペニシリン/ストレプトマイシンカクテル(Life Technologies;Carlsbad,CA)を含有する完全RPMIを用いて、任意の標準的な組織培養処理6ウェルプレート(BD、Franklin Lakes,NJ)において、1ウェル当たり2.5mLのPBMC(800万個の細胞/mLの細胞密度)を、培養することができる。ヒトペグ化IL-10を、100ng/mLの最終濃度でウェルに添加し、7日間インキュベートすることができる。Miltenyi BiotecのMACS細胞分離技術を使用して、製造業者のプロトコル(Miltenyi Biotec;Auburn,CA)に従って、CD8+T細胞をPBMCから分離することができる。RNAを抽出することができ、cDNAを、製造業者の説明書(Qiagen N.V.;Netherlands)に従って、それぞれ、QiagenのRNeasyキットおよびRT First Strandキットを使用して単離したCD8+T細胞およびCD8+T細胞を枯渇させたPBMCから合成することができる。QiagenのRT SYBR Green qPCR Mastermixおよびプライマー(IDO1、GUSB、およびGAPDH)を使用して、製造業者のプロトコルに従って、cDNAテンプレートに対して定量的PCRを実施することができる。IDO1 Ct値は、ハウスキーピング遺伝子、GUSBおよびGAPDHの平均Ct値に正規化することができる。
PBMCおよびCD8+T細胞サイトカイン分泌アッセイ。活性化一次ヒトCD8+T細胞は、PEG-IL-10、次いで抗CD3抗体で処理した場合に、IFN-γを分泌する。以下のプロトコルは、サイトカイン分泌を調べるための例示的なアッセイを提供する。
TNFα阻害アッセイ。U937細胞(Sigma-Aldrich(番号85011440)、St.Louis,MOから入手可能な肺由来のリンパ芽球ヒト細胞株)のPMA刺激が、細胞にTNFαを分泌させ、その後、これらのTNFα分泌細胞のヒトIL-10活性による処理は、用量依存的な様式で、TNFα分泌の低下をもたらす。例示的なTNFα阻害アッセイは、以下のプロトコルを使用して実行することができる。
10%のFBS/FCSおよび抗生物質を含有するRMPI中でU937細胞を培養した後、96ウェルの平底プレート(任意のプラズマ処理された組織培養プレート(例えば、Nunc、Thermo Scientific,USA)を使用することができる)に、1つの条件当たり三連で、1×105個、90%の生存U937細胞を播種する。細胞を播種して、以下の条件(すべて少なくとも三連、「培地単独」については、2分の1が10nMのPMAとのインキュベーション後の生存に使用されるため、ウェルの数は倍になる)を提供する:5ng/mlのLPS単独;5ng/mLのLPS+0.1ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+1ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+10ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+100ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+1000ng/mLのrhIL-10;5ng/mLのLPS+0.1ng/mLのPEG-rhIL-10;5ng/mLのLPS+1ng/mLのPEG-rhIL-10;5ng/mLのLPS+10ng/mLのPEG-rhIL-10;5ng/mLのLPS+100ng/mLのPEG-rhIL-10;および5ng/mLのLPS+1000ng/mLのPEG-rhIL-10。各ウェルを200μL中10nMのPMAに24時間曝露し、37℃、5%のCOのインキュベーター内で培養した後、細胞の約90%が接着性しているべきである。3つの余分なウェルを再懸濁させることができ、細胞を計数して、生存率を評価する(90%超が生存可能であるべきである)。新鮮な非PMA含有培地で穏やかに、しかし完全に3回洗浄し、細胞がウェル内に残ることを確実にする。1ウェル当たり100μLの、適切な濃度(体積が100%に希釈されるため、2倍)のrhIL-10またはPEG-rhIL-10を含有する培地を添加し、37℃、5%のCOのインキュベーター内で30分間インキュベートする。1ウェル当たり100μLの10ng/mLのストックLPSを添加して、各ウェル内で5ng/mlのLPSの最終濃度を達成し、37℃、5%のCOのインキュベーター内で18~24時間インキュベートする。上清を除去し、製造業者の取扱説明書に従ってTNFαELISAを実行する。各条件付けされた上清を、ELISA内、二連で実行する。
MC/9細胞増殖アッセイ。MC/9細胞(Cell Signaling Technology;Danvers,MAから入手可能な肥満細胞の特徴を備えたマウス細胞株)へのIL-10投与は、用量依存的な様式で細胞増殖の増大を引き起こす。Thompson-Snipes,L.et al.(1991)J.Exp.Med.173:507-10)は、MC/9細胞がIL3+IL-10およびIL-3+IL-4+IL-10で補う標準的なアッセイプロトコルについて記載している。供給業者(例えば、R&D Systems,USA;およびCell Signaling Technology,Danvers,MA)は、rhIL-10のロットリリースアッセイとしてこのアッセイを使用する。当業者であれば、細胞にIL-10のみを補うように、Thompson-Snipes,L.らに記載の標準的なアッセイプロトコルを変更することができる。
活性化誘導細胞死アッセイ。以下のプロトコルは、例示的な活性化誘導細胞死アッセイを提供する。
ヒトPBMCは、任意の標準的なプロトコルに従って単離することができる(例えば、Fuss et al.(2009)Current Protocols in Immunology,Unit7.1,John Wiley,Inc.,NYを参照されたい)。CD8+T細胞(CD45RO+)は、Miltenyi Biotecの抗CD45RO MACSビーズおよびMACS細胞分離技術を製造業者のプロトコル(Miltenyi Biotec Inc;Auburn,CA)に従って使用して単離することができる。細胞を活性化するために、抗CD3および抗CD28抗体(Affymetrix eBioscience,San Diego,CA)でプレコーティングされた標準的な24ウェルプレート(BD;Franklin Lakes,NJ)中で、AIM V培地(Life Technologies;Carlsbad,CA)で、1mLの単離細胞(3×10細胞/mLの密度)を3日間培養することができる。プレコーティングプロセスは、10μg/mLの抗CD3および2μg/mLの抗CD28抗体を含有する、300μLの炭酸緩衝液(0.1M NaHCO3(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO)、0.5M NaCl(Sigma-Aldrich)、pH8.3)を各ウェルに添加し、37°Cで2時間インキュベートし、AIMV培地で各ウェルを洗浄することによって行うことができる。3日間の活性化期間に続いて、細胞を収集し、計数し、収集することができ、標準的な24ウェルプレートに1mLのAIM V培地(2×10細胞/mLの密度)に再播種し、100ng/mlのPEG-hIL-10で3日間処理することができる。PEG-hIL-10による活性化および処理のプロセスを繰り返すことができ、その後、製造業者のプロトコル(Life Technologies)に従って、トリパンブルー排除によって生細胞を計数することができる。
腫瘍モデルおよび腫瘍分析。当該技術分野で認められている任意の腫瘍モデル、アッセイなどを使用して、本明細書に記載のIL-10剤が様々な腫瘍に与える影響を評価することができる。本明細書以下に記載の腫瘍モデルおよび腫瘍分析は、利用可能な腫瘍モデルおよび腫瘍分析の代表的なものである。同系マウス腫瘍細胞を、1回の腫瘍接種当たり10、10、または10個の細胞で、皮下または皮内注射する。Ep2乳癌、CT26結腸癌、PDV6皮膚の扁平上皮癌、および4T1乳癌モデルを使用することができる(例えば、Langowski et al.(2006)Nature 442:461-465を参照されたい)。免疫適格性Balb/CまたはB細胞欠損Balb/Cマウスを使用することができる。PEG 10-mIL-10を免疫適格性マウスに投与し得、一方でPEG-hIL-10治療は、B細胞欠乏性マウスにおいて行い得る。腫瘍を、治療開始前に、100~250mmのサイズに到達させる。IL-10、PEG-mIL-10、PEG-hIL-10、または緩衝液対照を、腫瘍移植部から離れた部位に皮下投与する。腫瘍成長は、典型的には、電子ノギスを使用して、1週間に2回監視する。腫瘍組織およびリンパ器官を、様々なエンドポイントで採取して、いくつかの炎症マーカーのmRNA発現を測定し、いくつかの炎症細胞マーカーの免疫組織化学を実行する。組織を、液体窒素中で急速冷凍し、-80℃で保管する。一次腫瘍成長は、電子キャリパーを使用して、典型的には週に2回監視する。腫瘍体積は、式(幅×長さ/2)を使用して計算することができ、式中、長さは、より長い方の寸法である。腫瘍を、治療開始前に、90~250mmのサイズに到達させる。
実施例1.PEG-IL-10は、CD8+T細胞免疫活性化を媒介する
PEG-rHuIL-10による治療の29日前と後の癌患者において、PD-1およびLAG3を発現するCD8+T細胞の数の変化を、測定した。持続性の部分応答を伴って療法に応答した2人の患者は、血中のPD1+CD8 T細胞が増加した。1人目の患者(腎細胞癌)は、20μg/kgのPEG-rHuIL-10 SCを毎日投与され、22週間後に総腫瘍量が71%減少した。2人目の患者(黒色腫)は、40μg/kgのPEG-rHuIL-10 SCを毎日投与され、22週間後に総腫瘍量が57%減少した。
末梢血単球細胞(PBMC)は、治療前および治療期間中に各患者の末梢から分離され、FACS分析に供された。PD-1を発現する末梢CD8+T細胞の数は、29日以内に約2倍まで増加し、治療期間中も増加し続け、LAG3を発現する末梢CD8+T細胞の数は、29日以内に約4倍まで増加した。PD-1およびLAG3の両方は、CD8+T細胞の活性化および細胞毒性機能のマーカーである。これらの所見は、PEG-rHuIL-10の投与がCD8+T細胞免疫活性化を媒介したことを示唆している。
実施例2.PEG-IL-10は、活性化メモリCD8+T細胞の機能を増強する
メモリT細胞(抗原経験T細胞とも称される)は、以前の感染、癌への曝露、または以前のワクチン接種の間に、その同族抗原に以前に遭遇および応答したTリンパ球のサブセット(例えば、ヘルパーT細胞(CD4+)および細胞毒性T細胞(CD8+))である。対照的に、ナイーブT細胞は末梢内でその同族抗原に遭遇しておらず、これは、一般に、活性化マーカーのCD25、CD44、またはCD69がないこと、およびメモリCD45ROアイソフォームがないことを特徴とする。一般にCD45RO+であるメモリT細胞は、ナイーブT細胞よりも速く強力な免疫応答を再現および開始することができる。
CAR-T細胞が、メモリCD8+T細胞に由来することを考えれば、メモリCD8+T細胞に対するPEG-IL-10の効果は、標準的な方法論を使用してインビトロで評価され、この実施例は、本明細書に記載されている。PEG-IL-10は、ナイーブCD8+T細胞ではなく、メモリCD8+T細胞(CD45RO+)でのIFNγ産生を優先的に増強する。これらのデータは、活性化メモリCD8+T細胞の機能を増強するためのPEG-IL-10の効果と矛盾がない。
実施例3.PEG-IL-10処理は、活性化メモリCD8+T細胞を増加する
本明細書に記載されるように、CAR-T細胞療法は、メモリCD8+T細胞に由来する。効果的であるためには、注入されたメモリCD8+T細胞は、細胞毒性を示すだけでなく、持続しなければならない(Curran KJ,Brentjens RJ.(20 Apr 2015)J Clin Oncol pii:JCO.2014.60.3449、Berger et al.,(Jan 2008)J Clin Invest 118(1):294-305)。しかしながら、T細胞の反復活性化は、活性化誘導細胞死を引き起こし、細胞数を減少させ、したがって全体的な治療効果を減少させる。
本明細書に記載の手順を使用して、2人のドナーからのヒトCD45RO+メモリCD8+T細胞の活性化誘導細胞死を、PEG-IL-10での処理の有無にかかわらず決定した。2ラウンドのTCRおよび共刺激誘導活性化後のPEG-IL-10によるヒトCD45RO+メモリCD8+T細胞の処理は、より多くの生細胞をもたらした。これらのデータは、PEG-IL-10が活性化誘導細胞死を制限することができ、その結果、より多くの活性化メモリT細胞が持続することを示す。これらの観察は、CAR-T細胞療法と併用したPEG-IL-10の使用が、さらなる臨床的利益を提供することを示唆している。
実施例4.IL2分泌アッセイ:
分泌されたIL-2のレベルは、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、ヒトIL-2 ELISAキット(カタログ番号EH2IL2、ThermoFisher Scientific 168 Third Avenue Waltham,MA USA 02451として市販されている)を使用することによって決定された。
実施例5.IFN-ガンマ分泌アッセイ
分泌されたインターフェロンガンマのレベルは、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、ヒトIFN-g ELISAキット(カタログ番号KHC4012、ThermoFisher Scientific 168 Third Avenue Waltham,MA USA 02451)を使用することによって決定された。
実施例6.グランザイムBアッセイ
グランザイムBのレベルは、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、DuoSet Human Granzyme B ELISAキット(カタログ番号DY2906-05、R&D Systems 614 McKinley Place NE,Minneapolis,MN 55413,USA)を使用することによって決定された。
実施例7.FACS-細胞染色
細胞を洗浄し、FACS緩衝液(リン酸緩衝生理食塩水(PBS)および0.1%アジ化ナトリウムおよび0.4%BSA)に懸濁した。細胞を、1×10個のアリコートに分割した。
Fc受容体は、正常ヤギIgG(Life Technologies)でブロックした。100μlの1:1000で希釈した正常ヤギlgGを、各チューブに添加し、氷上で10分間インキュベートした。1.0mlのFACS緩衝液を、各チューブに添加し、よく混合し、300gで5分間遠心分離した。ビオチン標識されたポリクローナルヤギ抗マウス-F(ab)2抗体(Life Technologies)を添加して、CD19 scFvを検出した。ビオチン標識された正常ポリクローナルヤギIgG抗体(Life Technologies)を添加して、アイソタイプ対照として機能を果たした。(1:200の希釈、100μlの反応体積)。
細胞を、4℃で25分間インキュベートし、FACS緩衝液で1回洗浄した。細胞を、FACS緩衝液に再懸濁し、100μlの1:1000で希釈した正常マウスlgGを、各チューブに添加することによって、正常マウスIgG(Invitrogen)でブロックし、氷上で10分間インキュベートした。細胞を、FACS緩衝液で洗浄し、100μlのFAC緩衝液に再懸濁する。次いで、細胞を、フィコエリトリン(PE)標識されたストレプトアビジン(BD Pharmingen,San Diego,CA)およびアロフィコシアニン(APC)標識されたCD3(eBiocience,San Diego,CA)で染色した。1.0μlのPEおよびAPCを、それぞれ、チューブ2および3に添加した。
フローサイトメトリーの取得は、BD FacsCalibur(BD Biosciences)を使用して実行し、分析は、FlowJo(Treestar,Inc.Ashland,OR)を用いて実行した。
実施例8.末梢血単核細胞(PBMC)の単離
全血を、10mLのヘパリンバキュテナー(Becton Dickinson)で、個々のドナーまたは混合ドナーから(必要とされる血液の量に応じて)収集した。約10mlの全抗凝固血液を、滅菌リン酸緩衝生理食塩水(PBS pH7/4、Ca2+/Mg2+なし)緩衝液と混合して、50mlのコニカル遠心チューブで20mlの最終体積を達成した。15mLのFicoll-PaquePLUS(登録商標)(GE Healthcare、カタログ番号17-1440-03)を、滅菌50mLのコニカル遠心チューブに入れ、20mLの体積の血液/PBSを、Ficoll(登録商標)の表面に重層し、400xgで30~40分間室温で遠心分離した。血漿/フィコール界面に末梢血単核細胞(PBMC)を含む細胞の層を、注意深く除去した。PBMCを、40mlの総体積のPBSで2回洗浄し、200xgで10分間室温で遠心分離し、細胞を血球計で計数した。
洗浄したPBMCをすぐに使用した場合、細胞をCAR-T培地で1回洗浄した。CAR-T培地は、5%AB血清および1.25ug/mLのアンホテリシンB、100U/mLのペニシリン、および100ug/mLのストレプトマイシンを補ったAIMV-AlbuMAX(登録商標)培地(ThermoFisher Scientificからカタログ番号31035025として市販されている)である。
洗浄したPBMCをすぐに使用しなかった場合、細胞を再懸濁し、洗浄し、断熱バイアルに移し、液体窒素で保存する前に-80℃で24時間冷蔵した。
実施例9.PBMCの活性化:
PBMCは、上記の実施例_の教示に実質的に従って調製した。新しく単離したPBMCを使用した場合、単離された細胞(1×PBS(pH7.4)で洗浄、Ca2+/Mg2+なし)は、1×10個の細胞/mLの濃度で、CAR-T培地中で1回洗浄した。細胞を、300IU/mLのhuIL2(Invitrogen)を用いて、CAR-T培地中で1×10個の細胞/mLの最終濃度に再懸濁した。凍結PBMCを使用した場合、細胞を解凍し、10%FBS、100u/mLのペニシリン、および100ug/mLのストレプトマイシンの存在下で、9mLの予熱(37℃)cDMEM培地(Life Technologies)中で1×10個の細胞/mLの濃度に再懸濁した。細胞を、300×gで5分間遠心分離することによってペレット化し、CAR-T培地中で1回洗浄し、300IU/mLのhuIL-2を用いて、CAR-T培地中で1×10個の細胞/mLの最終濃度に再懸濁した。
抗ヒトCD28およびCD3抗体共役磁気ビーズ(Invitrogen)を、磁気ラックを使用して1mLの滅菌PBS(pH7.4)で3回洗浄し、ビーズを溶液から単離し、300IU/mLのhuIL-2で補ったCAR-T培地中で4×10個のビーズ/mLの最終濃度に再懸濁した。
PBMC細胞ならびにCD28およびCD3抗体共役磁気ビーズを、1:1のビーズ対細胞比で混合した。
アリコートを、12ウェル低結合または非処理細胞培養プレートの単一のウェルに移し、COの存在下で、ウイルス形質導入前に24時間インキュベートした。
実施例10.レンチウイルスCAR発現ベクター構築物:
CD8ヒンジ、4-1-BB共刺激ドメイン、およびCD3ゼータ活性化ドメインに連結された、抗CD19一本鎖抗体の細胞外配列をコードする核酸配列を含むCAR発現カセット(Nicholson,et al.(1997)Construction and characterization of a functional CD19 specific single chain Fv fragment for immunotherapy of B lineage leukaemia and lymphoma,Molecular Immunology 34:1157-1165に記載されているFMC63のScFv配列を、調製した。CAR発現カセットを、レンチウイルスプラスミドLenti CMV-MCS-EF1a-puro(Alstem,Richmond,Calif.)にクローニングして、プラスミドST1165を調製した。これらのプラスミドをHEK293細胞にトランスフェクトして、組換えレンチウイルスを生成し、これを使用して、一次ヒトT細胞を形質導入して、全血から単離した。
実施例11.レンチウイルスCAR Plus IL-10発現ベクター構築物:
CARおよびhIL-10の両方を発現するCAR-T細胞を調製するために、キメラ抗原受容体(CAR)レンチウイルスプラスミドPMC 303を、核酸配列が、IL-10コード配列の発現を促進するために、介在EF1aコアプロモーター配列を有するCARコード配列のCARの下流に挿入された上記の実施例10の教示に実質的に従って調製した。
実施例12.レンチウイルス粒子の生成
レンチウイルス粒子の産生には、3つの成分:1)レンチウイルスベクター、2)必要なすべてのウイルス構造タンパク質を含むパッケージングベクター、3)水疱性口内炎ウイルス(VSV)糖タンパク質(G)を発現するエンベロープベクター、が一般に必要である。レンチウイルスパッケージングは、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、SuperLenti(商標)レンチウイルスパッケージングシステム(Alstem LLC,2600 Hilltop Drive,Building B,STE C328,Richmond,CA 94806から市販されている)を使用して達成された。
実施例13.T細胞の形質導入および増殖
本明細書の実施例8および9に従って調製された活性化PBMCは、37℃、5%COで24時間インキュベートした。活性化PBMCは、本明細書の実施例12に従って調製された高力価レンチウイルス粒子で、5の感染多重度(MOI)で形質導入した。細胞は、1×10個の細胞/mLの細胞濃度を維持するために、時独添加されている培地を用いた所望のCAR-T細胞の数に応じて、12~14日間、ヒトIL-2の300IU/mLの存在下で増殖した。抗CD19CARの発現は、抗CD19 scFvを検出するために抗マウスFab抗体断片を使用して、フローサイトメトリーによって検出した。
実施例14.xCELLigence RTCAを使用した細胞毒性の評価
インビトロで、コンフルエンスおよび細胞毒性は、製造業者から提供された取扱説明書に実質的に従って、RTCA iCELLigence(登録商標)システムおよびソフトウェア(Acea Biosciences,Inc.,6779 Mesa Ridge Road,#100,San Diego CA 92121から市販されている)を使用したxCELLigence(登録商標)リアルタイム細胞分析(RTCA)手順を使用して細胞インピーダンスアッセイによって評価した。xCELLigenceシステムは、マルチウェルプレートである「Eプレート」を使用し、各ウェルの底部は、電極アレイを含浸した表面を提供する。細胞が表面全体で増殖するにつれて、電極アレイ全体の電気インピーダンスが増加する。細胞が死んでプレートから浮き上がると、電気インピーダンスが低下する。したがって、アレイを横断する電子流のインピーダンスを測定することによって、細胞の生存率をリアルタイムで頻繁に測定することができる。付着細胞によって引き起こされる電子流のインピーダンスは、細胞指数(CI)として報告され、単位のないパラメータは、
Figure 0007097465000010

付着細胞がプレートの表面全体に増殖すると、電気インピーダンスの増加を反映してCIが上昇する。CIがプラトーになると、細胞はプレート上でコンフルエントになると推定される。
データは、CAR-T細胞へのIL-10剤の添加が、IL-10剤の用量依存的な様式でCAR-T細胞毒性の特異的増強を媒介したことを実証する。特に、データは、IL-10剤の存在下での標的細胞の細胞毒性の有意な増強を実証する。特に、標的腫瘍性細胞に対するCAR-T細胞の細胞毒性効果の増強は、非常に低濃度のIL-10(0.1ng/ml)でも観察されている。このデータは、約0.1ng/ml未満、あるいは約0.08ng/ml未満、あるいは約0.06ng/ml未満、あるいは約0.05ng/ml未満、あるいは約0.03ng/ml未満、あるいは約0.01ng/ml未満の血清中トラフ濃度を達成するためのIL-10剤の投与が、ヒト対象におけるCAR-T細胞療法の治療効果を増強する(またはその毒性を低減する)のに有用であろう。
実施例15.細胞毒性CAR-T細胞に対するIL-10による前処理の効果
CAR-T細胞の細胞毒性に対するIL-10の前処理の効果を評価するために、抗CD19 CAR-T細胞を洗浄し、濃度:(a)1000ng/ml、(b)100ng/ml、(c)10ng/ml、(e)1ng/ml、(f)AM0010なし、で様々な濃度のIL-10剤であるAM0010を含む培地中で(IL-2の不在下で)、37℃、5%COで24時間インキュベートした。
CAR-T細胞のインキュベーション期間と並行して、ウェルごとにCD19(「CD19/HeLa細胞」)を3重に安定的にトランスフェクトしたHeLa細胞(ATCC CCL-2)を、ウェルあたり約10,000個の細胞を用いてxCELLigence Eプレート(ACEA Bioscience,San Diego CA)に付着させた。細胞がコンフルエンスに到達したことを反映してCI値がプラトーになるまで(約18~20時間)、細胞を付着させた。
次いで、上記のように調製した抗CD19 CAR-T細胞を、濃度:(a)100,000個のCAR-T細胞(10:1のE:T比)、(b)50,000個のCAR-T細胞(5:1のE:T比)、(c)20,000個のCAR-T細胞(2:1のE:T比)、および(e)10,000個のCAR-T細胞(1:1のE:T比)で、抗CD19 CAR-T細胞対CD19/HeLa細胞の様々なエフェクター:標的(E:T)比(E:T比)で、CD19/HeLa細胞プレートに(3重に)添加した。
IL-10剤であるAM0010を、各E:T比に関して、HeLa細胞と抗CD19 CAR-T細胞への曝露過程中、IL-10剤の前インキュベーションレベル(すなわち、1000ng/ml、100ng/ml、10ng/ml、1ng/ml、および0ng/ml)を維持するために、各ウェルに添加した。HeLa細胞に対する抗CD19 CAR-T細胞の細胞毒性は、CAR-T細胞がプレートから剥離するHela細胞を死滅させるときの電気抵抗の減少によって評価される。実験過程中、電気抵抗データは2分ごとに収集され、iCELLigence(登録商標)システムを備えるソフトウェアを使用してデータが分析された。同じソフトウェアを使用して、3つの各ウェルからのデータを組み合わせて平均化した。
観察された抗CD19 CAR-T細胞の添加時点から約1時間のインピーダンスの増加は、xCELLigenceシステムによって測定されるように、抗CD19 CAR-T細胞がプレートに付着して、インピーダンスを増加させた結果によるものであった。しかしながら、抗CD19 CAR-T細胞の添加後約1時間の時点から、CIの着実な減少が観察され、抗CD19 CAR-T細胞によるCD19/HeLa細胞の効果的な死滅、および評価したIL-10剤のすべてのレベルで有意に増強された細胞毒性効果を示した。このデータは、IL-10の添加が腫瘍細胞に対するCAR-T細胞の細胞毒性を増強することを実証する。
前述の実験から得られたデータは、抗CD-19 CAR-T細胞と併用し、様々な量の抗CD-19 CAR-T細胞で示すように、様々な濃度(0ng/ml、1ng/ml、10ng/ml、100ng/ml、および1000ng/ml)でIL-10剤(AM0010)を添加することによって、10,000個のCD19/HeLa細胞の培養に対する細胞毒性効果の増強を示すヒストグラムとして再プロットされた。AM0010の添加は、AM-0010のすべての試験濃度で、CD19/HeLa細胞に対する抗CD-19 CAR-Tのすべての比率で、CD19/HeLa細胞に対する抗CD-19 CAR-T細胞の細胞毒性効果を増強した。
実施例16.IL-10剤による治療はCAR-T細胞活性化を増強する:
加えて、IL-10剤への曝露に応答したT細胞活性化の特徴は、IFN-ガンマの発現の増強である。治療へのIL-10の添加は、IL-10用量依存的な様式でCAR-T細胞におけるIFN-ガンマ産生の有意な上方調節をもたらした。
実施例17.インビボ評価:
マウスの腫瘍性疾患のインビボ腫瘍モデルにおいて、IL-10剤(AM-0010)と抗腫瘍CAR-T細胞療法との組み合わせの効果を評価するために、研究が実施された。
簡単に説明すると、Jackson Labからの5匹の雌NOD.Cg-Prkdcscid IL2rgtm1Wjl/SzJ(NOD/scid IL2RGnull)マウスのコホートに、ルシフェラーゼ遺伝子を提供するベクターによる形質導入によるRaji細胞株(CCL-86としてATCCから得られる)を操作することによって構築されたCD19+Rajiヒトバーキットリンパ腫細胞株である0.5×10個のRaji-luc細胞を腹腔内接種した。ルシフェラーゼ遺伝子の発現により、生物発光イメージングが、当該技術分野でよく知られている技術(Chen and Thorne,Practical Methods for Molecular In Vivo Optical Imaging;(2012)Current Protocols in Cytometry 59(1):12.24.1-12.24.11)に従って全身生物発光によって腫瘍成長を評価することができるようになる。
CAR-T細胞は、上記の実施例XXXの教示に実質的に従って調製した。要約研究設計治療群および投与された試験薬剤を、以下の表6に提供する。
Figure 0007097465000011
研究0日目に、50万個のRaji-luc腫瘍細胞を、各マウスに100マイクロリットルの体積で静脈内注射によって投与した。治療開始前の同じ日に、マウスを画像化した。
研究0日目に、AM-0010による治療を開始した。AM0010を、研究1~8日目に毎日腹腔内投与し、9日目以降に皮下投与に切り替えた。
研究2日目および9日目に、CAR-T細胞またはT細胞(模擬)を受容する動物において、CAR-TまたはT細胞は、100マイクロリットルの体積で表6に従って投与した。
研究0日目、7日目、14日目、21日目、28日目、および35日目に、製造業者の取扱説明書に実質的に従って、IVIS(登録商標)(登録商標)Spectrumインビボイメージングシステム(Perkin Elmer,940 Winter St.Waltham MA 02451から市販している)を使用して、マウスをイメージングした。
示されるように、癌は両方の群で急速に進行し、各群のすべての動物が実験の21日目までに死亡した。
さらなる腫瘍成長が本質的に阻止されたため、T細胞およびCAR-T細胞のみの効果があった。治療群2の5匹の動物のうちの2匹が、21日目までに死亡し、治療群3の3匹目の動物が、35日目までに死亡した。
群4および5の場合、IL-10剤AM0010の存在下での500万個のCAR-T細胞の投与の効果は、CAR-T剤と併用してIL-10剤で治療した群における腫瘍減少の顕著な改善を実証する。各治療群のすべての動物は、研究の35日目には生存していた。
群6および7の場合、データは、上で考察されたように提供されたデータと比較して、この低用量のCAR-T細胞でCAR-T剤と併用してIL-10剤で治療した群における腫瘍減少の顕著な改善を実証する。各治療群のすべての動物は、研究の35日目には生存していた。
前述のデータは、CAR-T細胞療法をIL-10剤の投与と併用することによって提供される増強した抗腫瘍効果の当該技術分野で認識されている腫瘍モデルを実証する。
本発明者らに既知である、本発明を実行するための最良の機序を含む、本発明の特定の実施形態が、本明細書に記載されている。前述の記載の閲読時に、開示された実施形態の変形が、当業者に明らかになる可能性があり、当業者は、そのような変形を必要に応じて用いることができることが期待される。したがって、本発明が、本明細書に具体的に記載される方法以外の方法で実施されること、ならびに本発明が、適用可能な法によって許容されるように、本明細書に添付の特許請求の範囲に列挙される主題のすべての修正および同等物を含むことが意図される。さらに、そのすべての可能な変形における上述の要素のいかなる組み合わせも、別段本明細書で指示されない限り、または別段文脈が明らかに矛盾しない限り、本発明によって包含される。
本明細書で引用されるすべての出版物、特許出願、受託番号、および他の参考文献は、あたかも個々の各出版物または特許出願が、参照により組み込まれることが具体的かつ個々に示されているかのように、参照により本明細書に組み込まれる。

本発明の様々な実施形態を以下に示す。
1.腫瘍性疾患に罹患している哺乳動物対象を治療する方法であって、
a.患者由来のT細胞の試料を得ることと、
b.前記試料中のT細胞の一部をベクターで形質導入することであって、前記ベクターが、キメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、前記核酸配列が、1つ以上の制御要素と作動可能に会合して、T細胞内のキメラ抗原受容体(CAR)をコードする前記核酸配列の転写および翻訳をもたらして、前記CARを発現するT細胞の集団を生成する、形質導入することと、
c.前記CARを発現する前記T細胞(CAR-T細胞)を単離することと、
d.IL-10剤の存在下で前記CAR-T細胞をエクスビボで培養することと、
e.前記哺乳動物対象に、ステップ(d)から前記CAR-T細胞を投与することと、を含む、方法。
2.f.前記対象に、治療上有効な量のIL-10剤を含む医薬製剤を投与するステップをさらに含む、上記1に記載の方法。
3.ステップ(d)の前記IL-10剤およびステップ(f)の前記医薬製剤の前記IL-10剤が、同じIL-10剤である、上記2に記載の方法。
4.ステップ(d)の前記IL-10剤およびステップ(f)の前記医薬製剤の前記IL-10剤が、異なるIL-10剤である、上記2に記載の方法。
5.ステップ(d)の第1のIL-10剤が、rhIL-10であり、ステップ(f)のIL-10剤の前記医薬製剤が、ペグ化IL-10剤を含む、上記4に記載の方法。
6.IL-10剤を含む前記医薬製剤が、モノペグ化IL-10剤を含む、上記5に記載の方法。
7.IL-10剤を含む前記医薬製剤が、モノペグ化IL-10剤とジペグ化IL-10剤との混合物を含む、上記5に記載の方法。
8.前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.01ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記2に記載の方法。
9.前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.05ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記2に記載の方法。
10.前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.1ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記2に記載の方法。
11.前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.5ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記2に記載の方法。
12.前記IL-10剤が、hIL-10に由来するIL-10バリアントである、上記1~11のいずれかに記載の方法。
13.前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、上記1に記載の方法。
14.前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、上記1に記載の方法。
15.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドである、上記1に記載の方法。
16.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、上記1に記載の方法。
17.前記方法が、前記対象への1つ以上の補助剤の投与をさらに含む、上記1~16のいずれかに記載の方法。
18.前記1つ以上の補助剤が、化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤、IL-2剤、IL-7剤、IL-12剤、IL-15剤、およびIL-18剤からなる群から選択される、上記17に記載の方法。
19.前記1つ以上の補助剤が、1つ以上の化学療法剤である、上記17に記載の方法。
20.前記1つ以上の補助剤が、PD1調節剤、PDL1調節剤、CTLA4調節剤、LAG-3調節剤、TIM-3調節剤、ICOS調節剤、OX40調節剤、cd-27調節剤、CD-137調節剤、HVEM調節剤、CD28調節剤、CD226調節剤、GITR調節剤、BTLA調節剤、A2A調節剤、IDO調節剤、およびVISTA調節剤からなる群から選択される1つ以上の免疫チェックポイント調節剤である、上記17に記載の方法。
21.前記免疫チェックポイント調節剤が、抗体である、上記20に記載の方法。
22.対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、
a)前記対象に、キメラ抗原受容体(CAR)を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を導入することであって、前記キメラ抗原受容体が、前記標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、ことと、
b)前記対象に、治療上有効な量のIL-10剤を投与することであって、前記IL-10剤の前記投与が、少なくとも0.01ng/mlの血清中トラフレベルをもたらす、ことと、を含む、方法。
23.前記IL-10剤が、モノペグ化IL-10剤である、上記22に記載の方法。
24.前記IL-10剤が、モノペグ化IL-10剤とジペグ化IL-10剤との混合物である、上記22に記載の方法。
25.前記IL-10剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.03ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記22に記載の方法。
26.前記IL-10剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.06ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記22に記載の方法。
27.前記IL-10剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.1ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記22に記載の方法。
28.前記IL-10剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.5ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記22に記載の方法。
29.前記IL-10剤が、hIL-10に由来するIL-10バリアントである、上記22~28のいずれかに記載の方法。
30.前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、上記22に記載の方法。
31.前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、上記22に記載の方法。
32.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドである、上記22に記載の方法。
33.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、上記22に記載の方法。
34.前記方法が、前記対象への1つ以上の補助剤の投与をさらに含む、上記22~33のいずれかに記載の方法。
35.前記1つ以上の補助剤が、化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤、IL-2剤、IL-7剤、IL-12剤、IL-15剤、およびIL-18剤からなる群から選択される、上記34に記載の方法。
36.前記1つ以上の補助剤が、1つ以上の化学療法剤である、上記34に記載の方法。
37.前記1つ以上の補助剤が、PD1調節剤、PDL1調節剤、CTLA4調節剤、LAG-3調節剤、TIM-3調節剤、ICOS調節剤、OX40調節剤、cd-27調節剤、CD-137調節剤、HVEM調節剤、CD28調節剤、CD226調節剤、GITR調節剤、BTLA調節剤、A2A調節剤、IDO調節剤、およびVISTA調節剤からなる群から選択される1つ以上の免疫チェックポイント調節剤である、上記34に記載の方法。
38.前記免疫チェックポイント調節剤が、抗体である、上記37に記載の方法。
39.対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、前記対象に、
a)キメラ抗原受容体(CAR)であって、前記キメラ抗原受容体が、前記標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、キメラ抗原受容体と、
b)IL-10剤と、を発現するように遺伝子改変された治療上有効な複数の細胞を導入し、
それにより、前記T細胞媒介性免疫応答を調節することを含む、方法。
40.遺伝子改変された細胞による前記IL-10剤の前記発現が、少なくとも0.01ng/mlの前記標的細胞微小環境における局所的IL-10剤濃度を提供する、上記39に記載の方法。
41.前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、上記39に記載の方法。
42.前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、上記39に記載の方法。
43.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドである、上記39に記載の方法。
44.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、上記39に記載の方法。
45.前記方法が、前記対象への1つ以上の補助剤の前記投与をさらに含む、上記39~44のいずれかに記載の方法。
46.前記1つ以上の補助剤が、化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤、IL-2剤、IL-7剤、IL-12剤、IL-15剤、およびIL-18剤からなる群から選択される、上記45に記載の方法。
47.前記1つ以上の補助剤が、1つ以上の化学療法剤である、上記45に記載の方法。
48.前記1つ以上の補助剤が、PD1調節剤、PDL1調節剤、CTLA4調節剤、LAG-3調節剤、TIM-3調節剤、ICOS調節剤、OX40調節剤、cd-27調節剤、CD-137調節剤、HVEM調節剤、CD28調節剤、CD226調節剤、GITR調節剤、BTLA調節剤、A2A調節剤、IDO調節剤、およびVISTA調節剤からなる群から選択される1つ以上の免疫チェックポイント調節剤である、上記45に記載の方法。
49.前記免疫チェックポイント調節剤が、抗体である、上記48に記載の方法。
50.前記IL-10剤が、hIL-10に由来するIL-10バリアントである、上記39~49のいずれかに記載の方法。
51.対象における標的細胞集団に対するT細胞媒介性免疫応答を調節する方法であって、前記対象に、
a)キメラ抗原受容体(CAR)を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第1の複数の細胞であって、前記キメラ抗原受容体が、前記標的細胞集団に結合することができる少なくとも1つの抗原特異的標的領域を含む、治療上有効な第1の複数の細胞と、
b)IL-10剤を発現するように遺伝子改変された治療上有効な第2の複数の細胞と、を導入することを含む、方法。
52.前記第2の複数の細胞による前記IL-10剤の前記発現が、少なくとも1時間の期間にわたって、少なくとも0.01ng/mlの前記標的細胞微小環境における局所的IL-10剤濃度を提供する、上記39に記載の方法。
53.前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、上記51に記載の方法。
54.前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、上記51に記載の方法。
55.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドである、上記51に記載の方法。
56.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、上記51に記載の方法。
57.前記方法が、前記対象への1つ以上の補助剤の前記投与をさらに含む、上記51~56のいずれかに記載の方法。
58.前記1つ以上の補助剤が、化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤、IL-2剤、IL-7剤、IL-12剤、IL-15剤、およびIL-18剤からなる群から選択される、上記57に記載の方法。
59.前記1つ以上の補助剤が、1つ以上の化学療法剤である、上記57に記載の方法。
60.前記1つ以上の補助剤が、PD1調節剤、PDL1調節剤、CTLA4調節剤、LAG-3調節剤、TIM-3調節剤、ICOS調節剤、OX40調節剤、cd-27調節剤、CD-137調節剤、HVEM調節剤、CD28調節剤、CD226調節剤、GITR調節剤、BTLA調節剤、A2A調節剤、IDO調節剤、およびVISTA調節剤からなる群から選択される1つ以上の免疫チェックポイント調節剤である、上記57に記載の方法。
61.前記免疫チェックポイント調節剤が、抗体である、上記60に記載の方法。
62.前記IL-10剤が、hIL-10に由来するIL-10バリアントである、上記51~61のいずれかに記載の方法。
63.T細胞を有効量のIL-10剤と接触させることによってCAR-T細胞中のアポトーシスを阻害する、方法。
64.前記方法が、エクスビボで実施され、IL-10剤の量が、約0.005ng/mlを超える前記IL-10剤の濃度を有する緩衝液中に提供される、上記63に記載の方法。
65.前記方法が、対象においてインビボで実施され、前記対象に投与されるIL-10剤の量が、少なくとも24時間の期間にわたって、前記対象における少なくとも0.01ng/mlの前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、上記63に記載の方法。
66.前記対象における前記IL-10剤の前記血清中トラフ濃度が、少なくとも24時間の期間にわたって、少なくとも0.1ng/mlである、上記65に記載の方法。
67.IL-10剤、CAR、およびサイトカインをコードする核酸配列を含む、組換えベクターであって、前記核酸配列が、発現制御配列に作動可能に連結されている、組換えベクター。
68.前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、上記67に記載の組換えベクター。
69.前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、上記67に記載の組換えベクター。
70.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、上記67に記載の組換えベクター。
71.前記の細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質伝達ドメインに由来する1つ以上の共刺激ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドをさらに含む、上記67に記載の組換えベクター。
72.前記サイトカインが、IL-7、IL-12、IL-15、およびIL18、ならびにそれらのバリアントからなる群から選択される、上記67に記載の組換えベクター。
73.前記ベクターが、ウイルスベクターである、上記67~71のいずれかに記載のベクター。
74.前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、上記73に記載のベクター。
75.上記67~74のいずれかに記載のベクターでトランスフェクトされた、組換え改変されたT細胞。
76.CAR-T細胞およびIL-10剤を含む、医薬製剤。
77.前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、上記76に記載の医薬製剤。
78.前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、または抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、上記76に記載の医薬製剤。
79.前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、上記76に記載の医薬製剤。
80.前記の細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、およびCD40の細胞質伝達ドメインに由来する1つ以上の共刺激ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドをさらに含む、上記76に記載の医薬製剤。
81.前記IL-10剤が、ヒトIL-10剤である、上記76~80のいずれかに記載の医薬製剤。
82.前記IL-10剤が、ペグ化されている、上記81に記載の医薬製剤。
83.前記IL-10剤が、ヒトIL-10剤である、上記81に記載の医薬製剤。
84.前記IL-10剤が、モノペグ化IL-10とジペグ化IL-10との混合物である、上記81に記載の医薬製剤。
85.前記IL-10剤が、AM-0010である、上記81に記載の医薬製剤。

Claims (21)

  1. 腫瘍性疾患に罹患している哺乳動物対象を治療する方法における使用のための、CAR-T細胞を含む組成物であって、前記CAR-T細胞が抗腫瘍効果を有し、前記方法が、
    a.患者由来のT細胞の試料を得ることと、
    b.前記試料中のT細胞をベクターで形質導入することであって、前記ベクターが、キメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、前記核酸配列が、1つ以上の制御要素と作動可能に会合して、T細胞内のキメラ抗原受容体(CAR)をコードする前記核酸配列の転写および翻訳をもたらして、前記CARを発現するT細胞の集団を生成する、形質導入することと、
    c.前記CARを発現する前記T細胞(CAR-T細胞)を単離することと、
    d.IL-10剤の存在下で前記CAR-T細胞をエクスビボで培養することと、
    e.前記哺乳動物対象に、ステップ(d)から前記CAR-T細胞を投与することと、を含む、組成物。
  2. 前記方法が、f.前記対象に、治療上有効な量のIL-10剤を含む医薬製剤を投与するステップをさらに含む、請求項1に記載の組成物。
  3. ステップ(d)の前記IL-10剤およびステップ(f)の前記医薬製剤の前記IL-10剤が、同じIL-10剤である、請求項2に記載の組成物。
  4. ステップ(d)の前記IL-10剤およびステップ(f)の前記医薬製剤の前記IL-10剤が異る、請求項2に記載の組成物。
  5. ステップ(d)の第1のIL-10剤が、rhIL-10であり、ステップ(f)のIL-10剤の前記医薬製剤が、ペグ化IL-10剤を含む、請求項4に記載の組成物。
  6. IL-10剤を含む前記医薬製剤が、モノペグ化IL-10剤を含む、請求項5に記載の組成物。
  7. IL-10剤を含む前記医薬製剤が、モノペグ化IL-10剤とジペグ化IL-10剤との混合物を含む、請求項5に記載の組成物。
  8. 前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.01ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、請求項2に記載の組成物。
  9. 前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.05ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、請求項2に記載の組成物。
  10. 前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.1ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、請求項2に記載の組成物。
  11. 前記IL-10剤を含む医薬製剤の前記投与が、少なくとも72時間の期間にわたって、少なくとも0.5ng/mlの前記対象における前記IL-10剤の血清中トラフ濃度を維持するのに十分である、請求項2に記載の組成物。
  12. 前記IL-10剤が、hIL-10に由来するIL-10バリアントである、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
  13. 前記CARの抗原認識ドメインが、HER2、MUC1、テロメラーゼ、PSA、CEA、VEGF、VEGF-R2、T1、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソセリン、CD33/IL3Ra、c-Met、PSMA、糖脂質F77、FAP、EGFRvIII、GD-2、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、5T4、WT1、KG2Dリガンド、葉酸受容体(FRa)、血小板由来増殖因子受容体A、またはWnt1抗原に特異的に結合するポリペプチドである、請求項1に記載の組成物。
  14. 前記CARの抗原認識ドメインが、抗CD19 scFv、抗PSA scFv、抗CD19 scFv、抗HER2 scFv、抗CEA scFv、抗EGFR scFv、抗MUC1 scFv、抗HER2-neu scFv、抗VEGF-R2 scFv、抗T1 scFv、抗CD22 scFv、抗ROR1 scFv、抗メソテリンscFv、抗CD33/IL3Ra scFv、抗c-Met scFv、抗PSMA scFv、抗糖脂質F77 scFv、抗FAP scFv、抗EGFRvIII scFv、抗GD-2 scFv、抗NY-ESO-1 scFv、抗MAGE scFv、抗A3 scFv、抗5T4 scFv、抗WT1 scFv、および抗Wnt1 scFvからなる群から選択される、請求項1に記載の組成物。
  15. 前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137 CD278、CD134、FcεR1γおよびβ鎖、MB1(Igα)鎖、B29(Igβ)鎖、ヒトCD3ゼータ鎖、CD3、sykファミリーチロシンキナーゼ、srcファミリーチロシンキナーゼ、CD2、CD5、またはCD28の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含むポリペプチドである、請求項1に記載の組成物。
  16. 前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、Dap10、CD27、CD2、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、Lck、TNFR-I、TNFR-II、Fas、CD30、またはCD40の細胞質ドメインに由来するアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の組成物。
  17. 前記方法が、前記対象への1つ以上の補助剤の投与をさらに含む、請求項1~16のいずれか一項に記載の組成物。
  18. 前記1つ以上の補助剤が、化学療法剤、免疫チェックポイント調節剤、IL-2剤、IL-7剤、IL-12剤、IL-15剤、およびIL-18剤からなる群から選択される、請求項17に記載の組成物。
  19. 前記1つ以上の補助剤が、1つ以上の化学療法剤である、請求項17に記載の組成物。
  20. 前記1つ以上の補助剤が、PD1調節剤、PDL1調節剤、CTLA4調節剤、LAG-3調節剤、TIM-3調節剤、ICOS調節剤、OX40調節剤、cd-27調節剤、CD-137調節剤、HVEM調節剤、CD28調節剤、CD226調節剤、GITR調節剤、BTLA調節剤、A2A調節剤、IDO調節剤、およびVISTA調節剤からなる群から選択される1つ以上の免疫チェックポイント調節剤である、請求項17に記載の組成物。
  21. 前記免疫チェックポイント調節剤が、抗体である、請求項20に記載の組成物。
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