JP6803918B2 - 導電性高分子を用いたゲル電気泳動法及び転写法の組合せ並びにその使用方法 - Google Patents
導電性高分子を用いたゲル電気泳動法及び転写法の組合せ並びにその使用方法 Download PDFInfo
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Description
弁護士整理番号16−01−7768PCT
[関連出願への相互参照]
本出願は、2015年11月10日に出願された米国仮特許出願第62/253,143号の利益を主張する、2016年2月5日に出願された米国特許出願第15/017,540号の一部継続出願である、2016年11月10日に出願された米国特許出願第15/348,803号の優先権及び利益を主張するものであり、それらの各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本発明は、一般に、巨大分子のゲル電気泳動法及び転写法に関し、より詳細には、透明導電性ポリマーを有する単一のプレキャストゲル及びメンブレン組合せユニットの使用に関する。
ウェスタンブロッティングは一般的な技術であるが、転写ステップから生じる多くの問題が依然として存在する。これらは、膜(メンブレン)上にゲルを配置するときの気泡の導入、及び、必要とされるタンパク質の量を減らすためにゲルがより薄くなってきたので、ブロッティング膜にセッティングするプレキャストからゲルをユーザーが動かすときに起きるゲルの破損、を含む。これらの組合せは、限られた量のタンパク質の分析が必要な場合、特に、利用可能なタンパク質がもうこれ以上ない場合或いは臨床検体である場合には、致命的となる可能性がある。更に、タンパク質の分離及び転写の組合せユニットの概念は、プレキャストゲルを収容するため、絶縁性のプラスチックの現行使用によって妨げられている。更に、研究者らは、電気泳動の間にタンパク質の分離を見ることをしばしば好み、ゲルを支持する構造プレート(gel supporting structural plates)としての不透明材料の使用を制限する。
本発明は、タンパク質のブロッティング膜への効率的な転写がその後に続く、ハンズフリーのタンパク質分離を実行するため、迅速で信頼性があり且つ容易な方法を提供する導電性ポリマーを使用する1つのプレキャストゲル及びメンブレン組合せユニットで、ゲル電気泳動及び転写を提供することによって、前述の欠点を有利に埋め合わせる。
本発明のこれら及び他の特徴及び利点は、本明細書、特許請求の範囲、及び図面を参照することにより、よりよく理解されるようになるであろう。
本発明は、本発明の実施例が示されている、添付の図面を参照して、以下においてより十分に記述されるであろう。しかしながら、本発明は、多くの異なる形態で具現化されてもよく、本明細書に記述の実施例に限定されると解釈されるべきではない。むしろ、これらの実施例は、本開示が完璧で完全であるように、そして、本発明の範囲を当業者に十分に伝えるように、提供される。
本発明におけるポリマーに関して、用語「導電性」は、絶縁性である、大抵のポリマーにおいて見られる導電性の欠如に相対的である。導電性ポリマーは、金属より導電性が低く、従って、半導電性であるが、用語「導電性ポリマー」は依然として一般的に使用され、典型的には半導電性とみなされる範囲内にあるすべてのポリマーをいう。ポリピロールは、典型的に、103〜7.5×105 S/mの間の導電率を有する。ポリチオフェンは、101〜103 S/mの間の導電率を有する。ポリフェニレン及びそのアナログであるポリ(パラフェニレン)は、104〜105 S/cmの間の導電率を有する。ポリ(p−フェニレンビニレン)は3〜5x105 S/mの間の導電率を有し、ポリアニリンは3x103〜2x104 S/mの間の導電率を有する。導電率は、(I2、AsF5、Na、Kでのドーピングのように)ポリマーをpドープ又はnドープするために、分子を添加することによって増加することができる。ポリチオフェン及びポリアセチレンのようなドープされていない導電性ポリマーは、一般に約10−8〜10−6 S/mの導電率を有する。材料の特性を記述するのに一般的に使用される、抵抗率は、導電率の数学的な逆数である。
透明な導電性ポリマーを論じるときに、本技術分野で理解されているような用語「透明」は、100%光学的に透明なポリマーを含むだけでなく、半透明であり、そして、ポリマーを通って幾らかの光の透過を可能にするポリマーをも含む。透明な導電性ポリマーの厚みが増加するにつれて、いくらかの減衰及びスペクトル吸収が起こるが、ポリマーは、依然として、透明なプレートを通してゲル内に染料前線(dye front)をユーザが視認するように視覚化するのに十分な規模で透過する光の相当量を可能にする。従って、用語「透明な導電性ポリマー」又は「透明な半導電性ポリマー」は、ユーザがプレートを通して染料前線を視認するように視覚化できる、プレートを通って十分な光が透過できるポリマーから作られるプレート及びそれらのポリマーを含む。
[ゲル電気泳動]
1.タンパク質サンプル(細胞溶解物、免疫沈降物、組換えタンパク質など)は、以下のように調製される:
a. 10μLの4×ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)サンプル緩衝液[例えば、250mM Tris−HCl;8%SDS;40%グリセロール;4%β−メルカプトエタノール;50mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA);0.8%w/vブロモフェノール・ブルー]を30μLのタンパク質サンプルに添加する。
b. サンプルを70℃で10分間インキュベートする。
2.約20μLのサンプルは、プレキャストゲル及びメンブレン組合せユニット10を含む2つの導電性/半導性プラスチック・プレート2、4の間に一緒にあるメンブレン12に隣接するゲル6(例えば、10%ポリアクリルアミド)の上に載せられる。
3.約10μLの予め染色されたタンパク質ラダー(pre−stained protein ladder)はゲルの上に載せられる。フロントプレートが透明であるので、予め染色されたタンパク質ラダーは、任意のウェル内に充填されることができる。
4.タンパク質は、分離フェーズ電極38、40を横切る一定の電圧で電気泳動的に分離される。分離に使用される電圧及び時間は、標的タンパク質のサイズ、標的タンパク質の所望の分離の度合、及びゲルの割合(例えば、10%ポリアクリルアミドゲルに対しては、150Vで60分間)に依存する。フロントプレートが透明であるので、ユーザは、予め染色されたタンパク質ラダー及びタンパク質サンプルからの染料前線の進行を視覚的に評価することによって、フロントプレートを通る分離の相対的な度合をモニターすることができる。
[分離されたサンプルをメンブレン上に転写する]
1.分離されたタンパク質は、転写電極50、52を横切って一定のアンペア数でメンブレン12上に電気泳動転写される。使用されるアンペア数及び時間は、転写される標的タンパク質のサイズに依存する(例えば、500mA、30分)。このアンペア数を達成するために必要な電圧は、抵抗がより高くなると、金属プレート電極を使用して標準転写装置と比べてより高いが、このようにして、最終電圧及びアンペア数は、使用されるポリマーの抵抗及び電源の電圧及びアンペア数の能力に依存するであろう。
[分離され、且つ、転写されたサンプルを調べる]
1.プレキャストゲル及びメンブレン組合せユニット10は、分離されたタンパク質を持つメンブレンを除去するために分解される。
2.メンブレンは、ブロッキング緩衝液(blocking buffer)[例えば、1%Tween 20(TBST)を含むトリス緩衝生理食塩水(Tris−buffered saline)中の5%脱脂粉乳]中で室温で1時間(又は、その代わりとして4℃で一晩)インキュベートされる。
3.メンブレン12は、室温で1時間(又は、代わりとして4℃で一晩)、ブロッキング緩衝液中において一次抗体の適切な希釈物(例えば、多くの市販の抗体に対しては、1:200−1:1000)と共にインキュベートされる。
4.メンブレン12は、TBSTで3回、それぞれ5分間洗浄される。
5.メンブレン12は、室温で1時間、ブロッキング緩衝液中において、コンジュゲート二次抗体(conjugated secondary antibody)の推奨された希釈物と共にインキュベートされる(例えば、1mg/mLのHRP−コンジュゲートに対しては、1:5000)。
6.そのメンブレンは、TBSTで3回、それぞれ5分間洗浄される。
7.シグナル展開のために、基板メーカーの推奨事項が使用される。
8.画像は、ケミルミネッセンスのために標準暗室現像技術使用して、又は、比色検出のための通常の画像走査法を用いて取得される。
透明なポリマーの多数の組成物は、ゲル・サポート・プレートとして使用されることができる。透明な導電性/半導電性ポリマープレートは、ポリ(ピロール)(poly(pyrrole))(PPY)、ポリアセチレン、ポリアニリン(polyanilines)(PANi)、ポリ(チオフェン)(poly(thiophene))(PT)、ポリ(3,4−エチレンジオキシチオフェン)(poly(3,4−ethylenedioxythiophene))(PEDOT)、ポリ(p−フェニレンスルフィド(poly(p−phenylene sulfide)(PPS)、ポリ(アセチレン)(poly(acetylene))(PAC)、及びポリ(p−フェニレンビニレン)(poly(p−phenylene vinylene))(PPV)、並びに、それらの混合物から作られ得る。例えば、最もよく特徴付けられている導電性/半導電性ポリマーの1つであるPPYは、アクリルポリマー(「導電性ポリ(メタクリル酸メチル)/ポリピロール複合材料の表面特性」、Journal of Materials Science 35 (2000) 1743−1749参照)、セルロース(「硝酸セルロースに基づくナノセルロースポリピロール複合材料」、International Journal of Polymer Science,Volume 2013,Article ID 175609参照)、ポリスチレン(「ナノサイズのポリピロールポリスチレン複合粒子の合成及び特徴」、Journal of Applied Polymer Science,Vol.91,1360−1367(2004)参照)、ポリウレタン(「遮蔽用ポリピロール複合材料」、Synthetic Metals 151(2005)211−217参照)、ポリジメチルシロキサン(「ポリピロール及びポリジメチルシロキサンの柔軟性のある及び導電性のある複合材料」、Journal of Applied Polymer Science,Vol.93,736−741(2004)参照)、ポリエチレングリコール(PEG)(「ポリピロール及びその複合材料の特性の研究」、World Journal of Chemistry 2(2:67−74,2007)参照)、及びポリ(アクリロニトリル−co−ビニルアセテート)(「導電性ポリ(アクリロニトリル−co−ビニルアセテート)複合材料の特徴:ピロール誘導体のマトリックス重合」、Fibers and Polymers 2011,Vol.12,No.2,151−158参照)を含む従来の/絶縁性ポリマーと共に複合材料に組み込まれてきた。重要なことに、PPy複合材料は、複合材料が従来の材料の機械的及び物理的特性及び導電性ポリマーの電気的な伝導性を保持するところ、これらの従来のコポリマーで作られてきた(「ポリ(メチルメタクリレート)基板上のポリピロールの化学的なその場での重合」、Thin Solid Film 515(2007)5324−5328参照)。これらの複合材料は、プレキャストゲル及びメンブレン組合せユニットの転写フェーズに対して要求される体積抵抗率の範囲内又はそれより下にされてきたが、このことは、従来のコポリマーとの複合体中のPPyの低い割合が、電気泳動の間の分離フェーズにおける使用に対して十分に高い抵抗率を持つことを示し、そのため、電場無効化の効果が起こらず、そして、プレート間に挟まれたゲルからタンパク質をブロッティング・メンブレンに転写する転写フェーズに対して十分に導電性であることを示している。
Claims (14)
- 電気泳動分離及びブロッティングのための装置であって、
透明な導電性ポリマーから作られる第1の電気的に半導電性プレートと、
導電性ポリマーから作られる第2の電気的に導電性プレートと、ここで、第2の電気的に導電性のプレートは、第1の電気的に半導電性プレートに実質的に平行であり、
電気泳動ゲルと、
ブロッティング膜と、
電気泳動ゲルよりも低い導電率を有する低導電性ゲルと、ここで、その低導電性ゲルは、電気泳動ゲル及びブロッティング膜の間にあり、それによって、低導電性ゲルが、電気泳動ゲルからの拡散消失、及び、巨大分子の分離フェーズの間のブロッティング膜への付着、から巨大分子の移動を防ぎ、
第2の半導電性プレート及びブロッティング膜の間のろ紙と、を含み、ここで、そのろ紙は、湿潤しているとき、イオンリザーバーとして作用し、そして、電気泳動ゲルから低導電性ゲルを通してブロッティング膜へ巨大分子を転写する際に支援するために第2の導電性プレート及びブロッティング膜の間の実質的な電気的接触を提供し、
電気泳動ゲルは、第1の電気的に半導電性プレート及びブロッティング膜の間にあり、
ブロッティング膜は、電気泳動ゲル及び第2の電気的に半導電性プレートの間にある、
ブロッティング膜は、ニトロセルロース膜、ポリビニリデンジフルオライド(PVDF)膜、又はナイロン膜の少なくとも1つである、装置。 - 請求項1の装置であって、第1の電気的に半導電性プレート内に又は上に配置される電気的に導電性ワイヤを更に含み、第1の電気的に半導電性プレートが、静電気消散性プラスチックを覆う外側の電気的に半導電性の透明な層を有することを特徴とする、装置。
- 請求項2の装置であって、外側の電気的に半導電性の透明な層は、1mmよりも薄く、そして、第1の電気的に半導電性プレートの内側の表面の上に配置され、その外側の電気的に半導電性の透明な層は、インジウム錫酸化物、フッ素ドープ錫、ドープ酸化亜鉛、及びアルミニウムドープ酸化亜鉛の少なくとも1つを含む、装置。
- 請求項1の装置であって、第1の電気的に半導電性プレートが、ポリアセチレン、ポリ(ピロール)(PPy)、ポリアニリン、ポリチオフェン、ポリ(3,4−エチレンジオキシチオフェン)、ポリ(p−フェニレン)スルフィド、ポリ(p−フェニレンビニレン)、及び、それらの誘導体からなるグループから選択される透明な導電性ポリマーの1又はそれ以上のタイプを含むポリマーから作られる、装置。
- 請求項4の装置であって、第1の電気的に半導電性プレートが、少なくとも1mmの厚みを有し、そして、透明な導電性ポリマー及び非導電性の透明なポリマーの複合材料を含む、装置。
- 請求項5の装置であって、その複合材料は、1%及び10%の間のPPy複合材料であり、それにより、タンパク質分離フェーズの間に絶縁性プレートとして作用するのに十分な体積抵抗率を有するように、そして、タンパク質転写フェーズの間にブロッティング膜へとタンパク質が移動できるだけ十分な導電率を有するように、そして、電気泳動ゲルをサポートするのに十分な剛性を有するように、そして、第1の電気的に半導電性プレートを通って染料前線をユーザが視覚化できるだけ十分な透明性を有するように、第1の電気的に半導電性プレートを提供する、装置。
- 請求項6の装置であって、PPy複合材料が、半導電性特性を有するPPyニッケル複合材料である、装置。
- 電気泳動分離及びブロッティング巨大分子のための装置であって、
透明なポリマーで作られる第1のプレートと、
その第1のプレートに隣接する電気的に半導電性の透明な層と、
その第1のプレートに実質的に平行な第2のプレートと、
電気泳動ゲルと、
ブロッティング膜と、
ここで、電気泳動ゲルは、電気的に半導電性の透明な層及びブロッティング膜の間にあり、及び
ブロッティング膜は、電気泳動ゲル及び第2のプレートの間にあり、
第1のプレート及び電気的に半導電性の透明な層と接触している第1の電気的に導電性のワイヤアレイを含み、
そのようにして、第1の電気的に導電性のワイヤアレイが電気的に半導電性の透明な層に沿って電荷を分配する、装置。 - 請求項8の装置であって、電気的に半導電性の透明な層は、第1のプレートの内側の表面上に配置される電気的に導電性フィルムであり、電気的に半導電性フィルムは、インジウム錫酸化物、フッ素ドープ錫、ドープ酸化亜鉛、アルミニウムドープ酸化亜鉛、及びそれらの誘導体からなるグループから選択される導電性の透明な金属の1又はそれ以上のタイプを含むフィルムから作られる、装置。
- 請求項8の装置であって、第1のプレートは、ポリアセチレン、ポリ(ピロール)(PPy)、ポリアニリン、ポリチオフェン、ポリ(3,4−エチレンジオキシチオフェン)、ポリ(p−フェニレンスルフィド)、ポリ(p−フェニレンビニレン)、及びそれらの誘導体からなる群から選択される透明な導電性ポリマーの1又はそれ以上のタイプを含むポリマーから作られる、装置。
- 請求項8の装置であって、電気的に半導電性の透明な層は、104 及び 105 ohm−cmの間の体積抵抗率を有し、及び、第1のプレートは、108 及び 1010 ohm−cmの間の体積抵抗率を有する、装置。
- 請求項8の装置であって、第2のプレートに隣接する第2の電気的に導電性のワイヤアレイを更に含み、これにより、第2の電気的に導電性のワイヤアレイが、第2のプレートに沿って電荷を分配する、装置。
- 電気泳動分離及びブロッティング巨大分子のためのシステムであって、
上方バッファ・チャンバ及び下方バッファ・チャンバ、フロントパネル、リアパネル、及び底を有する液体レセプタクル・タンクと、
上方バッファ・チャンバ内の第1の分離フェーズ電極と、
下方バッファ・チャンバ内の第2の分離フェーズ電極と、
第1のブロッティング・フェーズ電極と、
第2のブロッティング・フェーズ電極と、
(i)透明な導電性ポリマーから作られる第1の電気的に半導電性のプレート、 (ii)第1の電気的に導電性プレートに対して実質的に平行である、導電性ポリマーから作られる第2の電気的に半導電性のプレート、 (iii)電気泳動ゲル、及び (iv)ブロッティング膜、を有する、プレキャストゲル及びメンブレン組合せユニットと、及び
電源と、を含み、ここで、電源は、電気泳動ゲルに沿って巨大分子の電気泳動分離を実行するために、電圧を第1の分離フェーズ電極及び第2の分離フェーズ電極に印加するように構成され、そして、電源は、第1の及び第2の分離フェーズ電極から第1の及び第2のブロッティング・フェーズ電極へと、電圧を自動でスイッチするように構成され、それによって、その電圧をスイッチングすることで、ユーザがタンパク質の電気泳動分離及びタンパク質のブロッティング膜上への転写を実行できるようになる、
システム。 - 請求項13のシステムであって、
液体レセプタクル・タンクは更に、第1のブロッティング・フェーズ電極を収容する冷却チャンバと、及び
液体タンク・レセプタクルのリアパネルの上に配置されるガスケットと、を更に含み、それによって、ガスケットは、プレキャストゲル及びメンブレン組合せユニットが液体レセプタクル・タンク内に配置されるとき、上方チャンバから下方チャンバに液体が流れることを防止する、システム。
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