JP6798085B2 - 糖化合物、糖化合物の製造方法、ENGase活性検出用組成物、及びENGase活性阻害剤のスクリーニング方法 - Google Patents
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Landscapes
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Description
本発明は、ENGase活性の検出に利用することができる新規な化合物やENGase活性阻害剤の開発に役立つスクリーニング方法を提供することを目的とする。
<1> 下記式(I)で表される糖化合物。
(式(I)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はヒドロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表す。)
<2> 前記蛍光基と前記消光基の組合せが、下記(i)〜(iv)の何れかである、請求項1に記載の糖化合物。
(i)下記式(d−1)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−1)中、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を表す。)
(ii)下記式(d−2)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−2)中、Rは水素原子又はヒドロキシル基の保護基を表す。)
(iii)下記式(d−3)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−3)中、Rは水素原子又はヒドロキシル基の保護基を、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を表す。)
(iv)下記式(d−4)で表される蛍光基と下記式(a−2)で表される消光基の組合せ
(式(d−4)及び(a−2)中、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を表す。)
<3> <1>又は<2>に記載の糖化合物を含むエンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)活性検出用組成物。
<4> 糖転移活性を有する酵素の存在下、下記式(II)で表される化合物と下記式(III)で表される化合物を反応させて下記式(I−1)で表される化合物を生成する糖転移反応工程を含む、糖化合物の製造方法。
(式(II)、(III)、及び(I−1)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はヒド
ロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表す。)
<5> 被検化合物をエンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)に接触させる接触工程、及び前記被検化合物を接触させたエンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)に下記式(I)で表される糖化合物を接触させて、前記糖化合物の分解活性を確認する活性確認工程を含む、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)活性阻害剤のスクリーニング方法。
(式(I)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はヒドロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表す。)
本発明の一態様である糖化合物(以下、「本発明の糖化合物」と略す場合がある。)は、下記式(I)で表される化合物である。
(式(I)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はヒドロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表す。)
本発明者らは、下記式で表される反応のように、ENGaseが式(I)中の五糖構造に対して、特定の位置を選択的に切断する特異性があることを見出しており、切断によって分離される位置に蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基(ドナー)と消光基(アクセプター)を配置した糖化合物を合成して、これがFRETプローブとして実際に利用できることを確認したのである。例えば、下記式で表される反応中の糖化合物は、式(I)のZ1の位置に蛍光基としてN−メチルアントラニル基を、式(I)のZ2の位置に消光基として2,4−ジニトロフェニル基を有しており、ENGaseによって糖鎖が切断されると、蛍光基と消光基の距離が離れて蛍光基の蛍光発光の強度変化等が生じるため、ENGase活性が検出できることになるのである。
なお、「蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基」と「蛍光基に対応する消光基」とは、蛍光基と消光基が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる任意の組合せであることを意味する。
式(I)中のRは、それぞれ独立して「水素原子」又は「ヒドロキシル基の保護基」を表しているが、ヒドロキシル基の保護基としては、メチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基等のエーテル系保護基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基等のアシル系保護基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、tert−ブチルジフェニルシリル基等のシリルエーテル系保護基等が挙げられる。
炭化水素基としては、メチル基(−CH3、−Me)、エチル基(−C2H5、−Et)、n−プロピル基(−nC3H7、−nPr)、i−プロピル基(−iC3H7、−iPr)、n−ブチル基(−nC4H9、−nBu)、t−ブチル基(−tC4H9、−t
Bu)、n−ペンチル基(−nC5H11)、n−ヘキシル基(−nC6H13,−nHex)、シクロヘキシル基(−cC6H11,−Cy)、フェニル基(−C6H5,−Ph)等が挙げられる。
アミノ基の保護基としては、t−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc)等のアルコキシカルボニル系保護基;アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa)等のアシル系保護基;p−トルエンスルホニル基(Ts)、2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)等のアルキル(アリール)スルホニル基等が挙げられる。
「第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)」、「アミド基(−NR’CO−)」、「オキシ基(−O−)」、「カルボニル基(−CO−)」、「オキシカルボニル基(−OCO−)」とは、下記式で表される構造のように後述するZ1やZ2がこれらの基を介して糖の六員環に結合していることを意味する。
「2価の炭化水素基」とは、2つの結合位置を有する炭化水素基を意味し、直鎖状の飽和炭化水素基に限られず、炭素−炭素不飽和結合、分岐構造、環状構造のそれぞれを有していてもよいことを意味する。また、「第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい」とは、下記式で表される構造のように、炭化水素基の炭素骨格の内部及び/又は末端にこれらの基を含んでもよいことを意味する。
(i)下記式(d−1)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−1)中、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を表す。)
(ii)下記式(d−2)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−2)中、Rは水素原子又はヒドロキシル基の保護基を表す。)
(iii)下記式(d−3)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−3)中、Rは水素原子又はヒドロキシル基の保護基を、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を表す。)
(iv)下記式(d−4)で表される蛍光基と下記式(a−2)で表される消光基の組合せ
(式(d−4)及び(a−2)中、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を表す。)
なお、式(d−1)〜(d−4)及び式(a−1)及び(a−2)中のRとR’としては、前述のものと同様のものが挙げられる。
本発明の糖化合物の製造方法は、特に限定されず、公知の有機合成反応、化学酵素法等を組み合せて製造してもよいが、糖転移活性を有する酵素の存在下、下記式(II)で表される化合物と下記式(III)で表される化合物を反応させて下記式(I−1)で表される化合物を生成する糖転移反応工程(以下、「糖転移反応工程」と略す場合がある。)を含む方法によって製造することが好ましい。なお、糖転移反応工程を含む糖化合物の製造方法も本発明の一態様である。
(式(II)、(III)、及び(I−1)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はヒドロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表す。)
上記式で表される反応経路は、ラクトサミン誘導体のガラクトース残基のC−3位とC−6位にマンノース残基を、C−4位にアジド基を経由してアミノ基を導入し、アミノ基に蛍光基としてN−メチルアントラニル基を導入して、還元末端基部分をオキサゾリン化することで式(II)で表される化合物を調製している。
前述のようにENGaseには、式(I)中の五糖構造に対して、特定の位置を選択的
に切断する特異性があり、ENGaseによって糖鎖が切断されると、蛍光発光の強度変化等が生じるため、ENGase活性が検出できることになる。本発明の糖化合物の用途は、特に限定されないが、このようにENGase活性の検出に利用することが挙げられる。なお、本発明の糖化合物を含むENGase活性検出用組成物(以下、「本発明の組成物」と略す場合がある。)も本発明の一態様である。
736-744, 2013に記載のものが挙げられ、具体的にはEndo−M、Endo−A、Endo−D、Endo−CC、ヒトENGase、マウスENGase、酵母ENGase、担子菌類ENGase等が挙げられる。
前述のようにNgly1欠損症においては、ENGaseが病態発現に関与しているものと考えられており、ENGase活性を阻害することでNgly1欠損症の病態を改善できるものと考えられている。本発明の糖化合物は、ENGase活性を簡易的に検出することができるため、被検化合物に接触させたENGaseを本発明の糖化合物と接触させて、本発明の糖化合物の分解活性を確認することで、ENGase活性阻害剤を効率的にスクリーニングすることができるのである。なお、被検化合物をENGaseに接触させる接触工程(以下、「接触工程」と略場合がある。)、及び被検化合物を接触させたENGaseに式(I)で表される糖化合物を接触させて、糖化合物の分解活性を確認する活性確認工程(以下、「活性確認工程」と略す場合がある。)を含むENGase活性阻害剤のスクリーニング方法(以下、「本発明のスクリーニング方法」と略す場合がある。)も本発明の一態様である。
(Benzyl 4,6-O-benzylidene-2-O-tert-butyldimethylsilyl-3-O-pivaroyl-α-
D-mannopyranosyl-(1-3)-[4,6-O-benzylidene-2-O-tert-butyldimethylsilyl
-3-O-pivaroyl-α-D-mannopyranosyl-(1-6)]-β-D-galactopyranosyl
-(1-4)-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside (3)の合成)
モレキュラーシーブズ4A(7.8g)とN−ヨードスクシンイミド(NIS,936mg,4.16mmol)存在下、化合物1(940mg,1.26mmol)と化合物2(1.55g,2.77mmol)のジクロロメタン溶液(16mL)を加えた。−78℃にてトリフルオロメタンスルホン酸(122μL,1.39mmol)を加え2日間撹拌した。トリエチルアミン(290μL)を加え、反応を停止した後、反応混合物を酢酸エチルで希釈、不溶物をセライトで濾過し、有機層をチオ硫酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水、1M塩酸溶液、飽和食塩水、飽和重曹水、飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥後、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル=96/4〜60/40)にて精製し、化合物3(1.00g,48%)を得た。Rf=0.29(ヘキサン/酢酸エチル=3/1)。
D-mannopyranosyl-(1-3)-[4,6-O-benzylidene-2-O-tert-butyldimethylsilyl
-3-O-pivaroyl-α-D-mannopyranosyl-(1-6)]-2-O-acetyl-4-azide-4-deoxy-β-D-
mannopyranosyl-(1-4)-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-
D-glucopyranoside (4)の合成)
化合物3(456mg,0.278mmol)をジクロロメタン(6mL)に溶かし、0℃にてピリジン(672μL,8.34mmol)、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(468μL,2.78mmol)を加えた。室温で2.5時間攪拌後、反応液を酢酸エチルにて希釈、有機層を飽和重曹水、飽和食塩水で洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムにて乾燥後、減圧濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(トルエン/酢酸エチル=100/0〜83/17)にて精製し、2,4−ジトリフルオロメタンスルホニル化合物(417mg,79%)を得た。得られた化合物をトルエンにて共沸、真空乾燥した後に、トルエン(9mL)に溶かし、0℃にてテトラブチルアンモニウムアジド(78mg,0.263mmol)を加え、室温にて1.5時間撹拌した。反応液を酢酸エチルにて希釈、有機層を飽和食塩水、飽和重曹水、飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムにて乾燥後、減圧濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(トルエン/酢酸エチル=100/0〜83/17)にて精製し、4−位がアジド化された化合物(384mg,97%)を得た。得られた化合物をトルエン共沸、真空乾燥した後にトルエン(9mL)に溶かし、酢酸セシウム(410mg,2.13mmol)、18−クラウン−6(562mg,2.13mmol)を加え、一晩超音波処理をおこなった。反応液を酢酸エチルで希釈後、有機層を順次、飽和食塩水、飽和重曹水、飽和食塩水で洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムにて乾燥、減圧濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(トルエン/酢酸エチル=97/3〜82/18)にて精製し、化合物4(290mg,61% in 3 steps)を得た。Rf=0.35(トルエン/酢酸エチル=5/1)。
-4-amino-4-deoxy-β-D-mannopyranosyl-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-D-glucopyranose (5)の合成)
化合物4(82.5mg,48.4μmol)をTHF(1.4mL)に溶解させ、0℃にて1M TBAF/THF溶液(144μL,0.145mmol)を加え、室温にて一晩反応させた。反応液を減圧濃縮後、残渣にn−ブタノール(2mL)、エチレンジ
アミン(200μL)を加え、アルゴンガス雰囲気下、90℃にて一晩攪拌した。反応液を減圧濃縮後、残渣をピリジン(2mL)に溶かし、氷浴中、無水酢酸(500μL)を加え、アルゴン雰囲気下、40℃にて一晩攪拌した。メタノール(1mL)を加え反応を停止し、反応液を減圧濃縮した。残渣を酢酸エチルにて希釈し、有機層を飽和重曹水、食塩水にて順次洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムにて乾燥し、減圧濃縮した。残渣をテトラヒドロフラン(1mL)に溶かし、氷浴中1M ナトリウムメトキシド/メタノール(500μL)を加え、アルゴンガス雰囲気下、40℃で一晩攪拌した。反応液をアンバーリスト(オルガノ株式会社製,登録商標)にて中和後、アンバーリストを濾別し、ろ液を減圧濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール=100/0〜93/7)にて精製し、脱保護中間体(44mg,77%)を得た。得られた中間体(58mg,49.2μmol)をテトラヒドロフラン(5mL)に溶かし、水(5mL)を加えた。反応容器をアルゴンガスにて置換し、水酸化パラジウム(50mg)を加え、再び反応容器をアルゴンガスで置換した。ついで反応容器を水素ガスで置換後、40℃にて一晩攪拌した。セライト濾過にて水酸化パラジウムを除去した後、反応液を凍結乾燥した。残渣をISOLUT 18C(バイオタージ社製,登録商標,水100%)にて精製後、凍結乾燥し、化合物5(32mg,93%)を得た。Rf=0.17(アセトニトリル/水=2/1)。
-4-deoxy-4-N-methylanthraniloylamido-β-D-mannopyranosyl-(1-4)-
2-acetamido 2-deoxy-β-D-glucopyranose (6)の合成)
化合物5(4.0mg,5.7μmol)をジメチルスルホキシド(370μL)に溶解し、ジメチルアミノピリジン(1.4mg,11μmol)、N−メチルアントラニル酸(1.0mg,8.4μmol)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N’,N’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロりん酸塩(HATU,4.13mg,10μmol)を加え、室温にて5時間反応させた。反応液を水にて希釈、水層をジエチルエーテルにて洗浄後、水層を凍結乾燥した。得られた残渣をISOLUTE
C18(水〜メタノール)にて精製した。その後、HPLC(Imtakt Unison US−C18,5μm,20×250mm,水/アセトニトリル=97/3,0.1%TFA溶液)により精製し、化合物6(3.5mg,74%)を得た。Rf=0.5(アセトニトリル/水=3/1)。
-(1-6)]-4-deoxy-4-N-methylanthraniloylamido-β-D-mannopyranosyl-(1-4)
-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano]-[2,1-d]-oxazoline (7)の合成)
化合物6(1mg,1.2μmol)と炭酸カリウム(6.2mg,44.6μmol)を重水(60μL)に溶かし、0℃にて2−クロロ−1,3−ジメチル−1H−ベンズイミダゾール−3−イウム塩化物(CDMBI,3.9mg,17.8μmol)を加え、2時間反応させた。反応液(5μL)を分注し、重水にて希釈後NMRを測定し、反応の終了を確認した。反応混合物から不溶性の塩を遠心ろ過により除去し、化合物7溶液(20mM,55μL)を得た。
4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside (10)の合成)
モレキュラーシーブズ4A(0.9g)とN−ヨードスクシンイミド(64mg,285μmol)存在下、化合物8(53mg,177μmol)と化合物9(119mg,190μmol)のジクロロメタン溶液(5mL)を加えた。−78℃にてトリフルオロメタンスルホン酸(17μL,190μmol)を加え、−20℃にて1時間撹拌した。反応混合物にトリエチルアミン(50μL)を加え、反応を停止した後,酢酸エチルで希釈、不溶物をセライトで濾過した。得られたろ液をチオ硫酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水、1M塩酸溶液、飽和食塩水、飽和重曹水、飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥後、減圧濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル=75/25)にて精製し、化合物10(93mg,63%)を得た。Rf=0.45(ヘキサン/酢酸エチル=2/1)。
化合物10(66.0mg,79.6μmol)にn−ブタノール(1mL)、エチレ
ンジアミン(100μL)を加え、アルゴンガス雰囲気下、80℃にて一晩攪拌した。反応液を減圧濃縮後、残渣をピリジン(1mL)に溶かし、氷浴中、無水酢酸(500μL)を加え、アルゴン雰囲気下40℃にて一晩攪拌した。メタノール(1mL)を加え反応を停止し、反応液を減圧濃縮した。残渣を酢酸エチルにて希釈し、有機層を飽和重曹水、食塩水にて洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムにて乾燥し、減圧濃縮した。残渣をテトラヒドロフラン(1mL)に溶かし、氷浴中1Mナトリウムメトキシド/メタノール(500μL)を加え、アルゴンガス雰囲気下、40℃で一晩攪拌した。反応液をアンバーリストにて中和後、アンバーリストを濾別し、溶液を減圧濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール=100/0〜90/10)にて精製し、脱保護中間体(40mg,72% in 3 steps)を得た。得られた中間体(40mg,57.2μmol)をテトラヒドロフラン(2mL)に溶かし、水(2mL)を加えた。反応容器をアルゴンガスにて置換後、水酸化パラジウム(20mg)を加えた。反応容器を水素ガスで置換後、室温にて一晩攪拌した。反応液に再度、水酸化パラジウム(20mg)、水(2mL)を加え、一晩撹拌した。セライト濾過にて水酸化パラジウムを除去後、得られたろ液を凍結乾燥した。残渣をISOLUT 18C(水100%)にて精製後、凍結乾燥し、化合物11(11.8mg,74%)を得た。Rf=0.18(2−プロパノール/水=2/1)。
化合物11(8.7mg,31.4μmol)を飽和重曹水(200μL)に溶解し、2,4−ジニトロフェニルフルオリド(8.9mg,47.1μmol)のメタノール溶液(100μL)を加えた。1時間反応させた後、2,4−ジニトロフェニルフルオリド(8.9mg,47.1μmol)のメタノール溶液(100μL)を再度加えた。1時間反応させた後、反応混合物を水で希釈し、ジエチルエーテルにて洗浄した。水層を凍結乾燥し、得られた残渣をISOLUTE C18(水〜メタノール)にて精製し、化合物12(3.19mg,23%)を得た。Rf=0.62(アセトニトリル/水=5/1)。
α-D-mannopyranosyl-(1-3)-[α-D-mannopyranosyl-(1-6)]
-4-deoxy- 4-N-methylanthraniloylamido-β-D-mannopyranosyl
-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside (MANT−Man3GN2−DNP)の合成)
20mMの糖供与体溶液7を50μL、40mMの糖受容体溶液12を50μL、水92μL、1Mリン酸バッファー(pH7)を50μL、Endo−M−N175Q(4mU,東京化成工業株式会社)を8μLを加えた(終濃度200mMリン酸バッファー(pH7)、全量250μLに調製)。37℃で2時間インキュベーションした後、アセトニトリルを100μL加え、反応を停止した。反応混合液を凍結乾燥し、得られた残渣をISOLUTE C18にて精製(水〜60%メタノール溶液)、生成物を含む画分を凍結乾燥した。得られた残渣をHPLC(Imtakt Unison US−C18,5μm,20×250mm,水/アセトニトリル=73/27,0.1%TFA溶液)にて精製し、MANT−Man3GN2−DNP(0.2mg,16%)を得た。得られたMANT−Man3GN2−DNPの1HNMRの測定結果(NMRチャート)を図1に、ESIMSの測定結果(スペクトル)を図2に示す。
1H NMR (600 MHz, D2O) δ 9.12 (d, 1H, J = 2.4 Hz, Ar-H), 8.30 (m, 1H, Ar-H), 7.53 (m, 2H, Ar-H), 7.11 (d, 1H, J = 9.6 Hz, Ar-H), 7.04 (d, 1H, J = 7.9 Hz, Ar-H),
6.97 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 4.95 (s, 1H, H-1), 4.85 (s, 1H, H-1), 4.60 (d, 1H, J = 7.6 Hz, H-1), 4.51 (d, 1H, J = 8.2 Hz, H-1), 4.43-4.39 (m, 1H), 4.31 (d, 1H, J
= 2.7 Hz), 4.03 (m, 1H), 3.96-3.48 (m, 33H), 2.88 (s, 3H, -NHCH3), 2.07 (s, 3H,
-COCH3), 1.99 (m, 2H, -CH2CH2CH2-), 1.91 (s, 3H, -COCH3). ESI-MS: m/z: calcd for : C51H75N7NaO30: 1288.4455; found 1288.4434 [M+Na]+.
(方法1:HPLCを用いた加水分解反応の活性検出)
MANT−Man3GN2−DNPプローブ溶液(5mM)を2μLと、DMSOを2μL、リン酸ナトリウムバッファー(250mM,pH6)を4μLの混合溶液に酵素液を2μL(Endo−M,0.1mU,東京化成工業株式会社)加え、10μLの反応混合液(終濃度1mM MANT−Man3GN2−DNP,20%DMSO,100mMリン酸バッファー)を37℃で2時間インキュベートした。反応は、15、30、60、120分ごとに反応液を2μLずつ分注し、8μLのアセトニトリルに加え、反応を停止した。反応混合液を30μLの水で希釈し、HPLC(TOSOH TSK−gel ODS−100V,5μm,4.6mm×15cm,水/アセトニトリル=97/3〜60/40,0.1%TFA溶液,流速1mL/min,15分間、島津超高速液体クロマトグラフ Nexera)にて分析した。反応混合液のHPLCクロマトグラムの結果を図3に示す。
MANT−Man3GN2−DNPプローブ溶液(25μM)を20μLとDMSOを20μL、リン酸ナトリウムバッファー(250mM,pH6)を40μLの混合溶液に酵素液を20μL(Endo−M,0.01、0.02、0.05、0.1mU,東京化成工業)加え、100μLの反応混合液(終濃度5μM MANT−Man3GN2−DNP,20% DMSO 100mM リン酸バッファー)を37℃で2時間インキュベートした。反応は、マイクロプレートリーダー(TECAN Infinite(登録商標
) M200 PRO)を使用し、励起波長340nm、蛍光波長440nmにて追跡した。マイクロプレートリーダーにより反応混合液の蛍光強度変化を追跡した結果を図4に示す。酵素反応の進行に伴い、蛍光強度が上昇していることから,基質の切断を確認することができる。
Claims (4)
- 下記式(I)で表される糖化合物。
(式(I)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表し、前記
蛍光基と前記消光基の組合せが、下記(i)〜(iv)の何れかである。)
(i)下記式(d−1)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−1)中、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。)
(ii)下記式(d−2)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−2)中、Rは水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を表す。)
(iii)下記式(d−3)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−3)中、Rは独立して水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(T
fa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。)
(iv)下記式(d−4)で表される蛍光基と下記式(a−2)で表される消光基の組合せ
(式(d−4)及び(a−2)中、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。) - 請求項1に記載の糖化合物を含むエンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)活性検出用組成物。
- 糖転移活性を有する酵素の存在下、下記式(II)で表される化合物と下記式(III)で表される化合物を反応させて下記式(I−1)で表される化合物を生成する糖転移反応工程を含む、糖化合物の製造方法。
子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表し、前記蛍光基と前記消光基の組合せが、下記(i)〜(iv)の何れかである。)
(i)下記式(d−1)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合
せ
(式(d−1)中、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。)
(ii)下記式(d−2)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−2)中、Rは水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を表す。)
(iii)下記式(d−3)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−3)中、Rは独立して水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。)
(iv)下記式(d−4)で表される蛍光基と下記式(a−2)で表される消光基の組合せ
(式(d−4)及び(a−2)中、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。) - 被検化合物をエンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)に接触させる接触工程、及び前記被検化合物を接触させたエンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)に下記式(I)で表される糖化合物を接触させて、前記糖化合物の分解活性を確認する活性確認工程を含む、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)活性阻害剤のスクリーニング方法。
(式(I)中、Rはそれぞれ独立して水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を、R”はそれぞれ独立して単結合、第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、アミド基(−NR’CO−)、オキシ基(−O−)、カルボニル基(−CO−)、オキシカルボニル基(−OCO−)、又は第二級若しくは第三級アミノ基(−NR’−)、オキシ基(−O−)、及びカルボニル基(−CO−)からなる群より選択される少なくとも1種の基を含んでいてもよい炭素原子数1〜6の2価の炭化水素基を、Z1及びZ2は何れか一方が蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)が生じる蛍光基を、もう一方が前記蛍光基に対応する消光基を表し、前記蛍光基と前記消光基の組合せが、下記(i)〜(iv)の何れかである。)
(i)下記式(d−1)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合
せ
(式(d−1)中、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。)
(ii)下記式(d−2)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−2)中、Rは水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を表す。)
(iii)下記式(d−3)で表される蛍光基と下記式(a−1)で表される消光基の組合せ
(式(d−3)中、Rは独立して水素原子又はメチル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、tert−ブチル基;アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基;トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、tert−ブチルジメチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、およびtert−ブチルジフェニルシリル基から選択されるヒドロキシル基の保護基を、R’は水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す。)
(iv)下記式(d−4)で表される蛍光基と下記式(a−2)で表される消光基の組合せ
(式(d−4)及び(a−2)中、R’はそれぞれ独立して水素原子、炭素原子数1〜6の炭化水素基、又はt−ブトキシカルボニル基(Boc)、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)、2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル基(Troc)、アリルオキシカルボニル基(Alloc);アセチル基、トリフルオロアセチル基(Tfa);p−トルエンスルホニル基(Ts)および2−ニトロベンゼンスルホニル基(Ns)から選択されるアミノ基の保護基を表す
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JP2016118055A JP6798085B2 (ja) | 2016-06-14 | 2016-06-14 | 糖化合物、糖化合物の製造方法、ENGase活性検出用組成物、及びENGase活性阻害剤のスクリーニング方法 |
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