JP6738111B1 - 翻訳促進剤、鋳型核酸、翻訳鋳型の生産方法、および、タンパク質の生産方法 - Google Patents
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Abstract
Description
目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域の3’末端に隣接して連結される3’非翻訳領域としての核酸からなり、
前記3’非翻訳領域が、
前記コード領域の3’末端に隣接する、10〜40個の核酸配列からなる第1領域と、
前記第1領域に連結する2〜40個のAが連続するポリA配列からなる第2領域と、
から構成され、
前記第1領域が、ヘアピン構造を有する、
翻訳促進剤。
(2)無細胞タンパク質合成系に用いる鋳型核酸であって、
プロモーター領域と、
前記プロモーター領域によって作動可能に連結される目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域と、
上記(1)に記載の翻訳促進剤からなる、前記コード領域の3’非翻訳領域と、
を含む、鋳型核酸。
(3)前記コード領域は、前記目的タンパク質として、任意のタンパク質のC末端にプロテインタグを含む融合タンパク質をコードする領域である、上記(2)に記載の鋳型核酸。
(4)前記コード領域は、前記目的タンパク質として、任意のタンパク質のN末端にプロテインタグを含む融合タンパク質をコードする領域である、上記(2)または(3)に記載の鋳型核酸。
(5)前記鋳型核酸は、転写鋳型DNAである、上記(2)〜(4)のいずれか一つに記載の鋳型核酸。
(6)前記鋳型核酸は、翻訳鋳型mRNAである、上記(2)〜(4)のいずれか一つに記載の鋳型核酸。
(7)無細胞タンパク質合成系のための翻訳鋳型の生産方法であって、
細胞の不存在下であってかつ転写鋳型DNAをmRNAに転写するための要素の存在下で上記(2)〜(5)のいずれか一つに記載の鋳型核酸を用いて翻訳鋳型mRNAを合成する工程、
を備える、方法。
(8)タンパク質の生産方法であって、
細胞の不存在下であってかつ翻訳鋳型mRNAをタンパク質に翻訳するための要素の存在下で上記(6)に記載の鋳型核酸を用いてタンパク質を合成する工程、
を備える、生産方法。
図1を参照して、翻訳促進剤の実施形態について説明する。図1は、翻訳促進剤の概略を説明する概略図である。翻訳促進剤1は、無細胞タンパク質合成系で使用する鋳型核酸において、目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域2の3’末端に隣接して連結されている。そして、翻訳促進剤1は、自身はタンパク質として合成されない、3’非翻訳領域としての核酸からなる。実施形態に係る翻訳促進剤1は、コード領域2の3’末端に隣接する第1領域1aと、第1領域1aに連結する第2領域1bと、から構成されている。
図1を参照して、鋳型核酸の実施形態について説明する。図1は、鋳型核酸の概略を説明する概略図である。鋳型核酸10は、プロモーター領域3と、目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域2と、翻訳促進剤1と、を含む。翻訳促進剤1は、既に説明済みであることから、プロモーター領域3とコード領域2について、以下に説明をする。
無細胞タンパク質合成系のための転写鋳型DNAの生産方法は、目的タンパク質のコード領域を含むDNAに対して核酸増幅反応を実施して、転写鋳型DNAを合成する工程、を備えることができる。転写鋳型DNAは、例えば、適宜設計したプライマーセットを用いて、目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域を含むDNAに対して、PCRの核酸増幅反応により得ることができる。
細胞タンパク質合成系のための翻訳鋳型の生産方法は、細胞の不存在下であってかつ転写鋳型DNAをmRNAに転写するための要素の存在下で転写鋳型DNAを用いて翻訳鋳型mRNAを合成する工程、を備えることができる。より具体的には、転写鋳型DNAを含むPCR反応液又はベクターに由来する転写鋳型DNAに対して、転写鋳型DNAが備えるプロモーター領域に適合するRNAポリメラーゼ及びRNA合成用の基質(4種類のリボヌクレオシド3リン酸)等を転写反応に必要な成分を含む組成の下で、例えば、約20℃〜60℃、好ましくは、約30℃〜42℃で適当な時間インキュベートすることにより翻訳鋳型mRNAを得ることができる。なお、上記の例は、転写鋳型DNAから翻訳鋳型mRNAを合成する手順を示している。代替的に、mRNAの長さにもよるが、核酸合成により直接mRNAを合成してもよい。
タンパク質の生産方法は、細胞の不存在下であってかつ翻訳鋳型mRNAからタンパク質に翻訳するための要素の存在下で、翻訳鋳型mRNAを用いてタンパク質を合成する工程、を備えることができる。タンパク質の生産方法は、また、細胞の不存在下であってかつ転写鋳型DNAをmRNAに転写するための要素の存在下で転写鋳型DNAを用いて翻訳鋳型mRNAを合成する工程も備えることができる。さらに、タンパク質の生産方法は、目的タンパク質のコード領域を含むDNAに対して核酸増幅反応を実施して、前記転写鋳型DNAを合成する工程を備えることもできる。本出願で開示するタンパク質の生産方法は、翻訳促進剤を含む翻訳鋳型mRNA、転写鋳型DNAを用いるために、タンパク質合成を効率的に行うことができる。
実施例における無細胞タンパク質合成手順について説明する。
(1)転写用鋳型DNAの構造
図2を参照して、実施例および比較例で用いた転写用鋳型DNAの概略について説明する。転写鋳型DNAは、図2に示すように、
・5’非翻訳領域(5’UTR):T7プロモーター3、エンハンサー
・コード領域2:CSF3(Granulocyte colony−stimulating factor protein)、Linker_C、FLAG tag、
・3’非翻訳領域(3’UTR)、
から構成されている。後述する実施例および比較例では、3’UTR部分のみを、様々な配列に代えて実験を行った。3’UTR部分を除く配列は、以下のとおり。
図3を参照して、PCRにより転写鋳型DNAの作製手順について説明する。転写鋳型DNAは、図3に示すようにPrimerを設計し、転写鋳型DNAを2段階PCRにより作製した。PCRの反応溶液組成とプログラムを以下に示す。なお、表5に示すプログラムは、SEQ.ID.30、31に示すプライマーを用いた際の専用プログラムである。
・PCR酵素:東洋紡株式会社 KOD−Plus−Neo
・Primer,人工遺伝子:ユーロフィンジェノミクス株式会社 受託合成サービス
・Thermal Cycler:eppendorf社製 Mastecycler X50s
次に、作製した転写鋳型DNAを用いて、翻訳鋳型mRNAを作製した。転写反応は、NUProtein社製PSS4050の以下の反応液を用い、先に作製した第2回のPCR反応溶液(転写鋳型DNA含有)2.5μlを用いて、37℃で3時間行った。
次に、以下の組成の翻訳反応液を用いて、16℃のインキュベーターにいれて10時間反応させた。なお、以下の組成のうち、翻訳鋳型mRNAを除いた組成液を調製し、その後、この組成液を室温に戻した後に、翻訳鋳型mRNAを添加して、泡を立てないようにポンピングして、反応させた。Wheat germ extract、および、amino acid mixは、NUProtein社製PSS4050用いた。
・ゲル:4−15% Tris−Glycine gel(バイオラッドラボラトリーズ社製)
・メンブレン:0.2μm PVDFメンブレン(バイオラッドラボラトリーズ社製)
・一次抗体:FLAG抗体(mouse;和光純薬工業株式会社製)
・二次抗体:goat anti mouse HRP 抗体(Southern Biotech社製)
・ウェスタンブロット発光試薬:SuperSignal West Pico(Thermo社製)
(1)翻訳完了後のタンパク質溶液上清を1μL、4x sample buffer 2.5μL、2M DTT 1μL、超純水5.5μLを混合して10μLに調整した。
(2)ブロックヒーターで、70℃、10分加熱した。
(3)加熱したサンプルの、SDS−PAGEを行った。
(4)SDS−PAGE完了後のゲルとメンブレンを、Toubin bufferで15分平衡化した。
(5)セミドライ転写装置で、ゲルのタンパク質をメンブレンへ電気転写した。
(6)メンブレンを、超純水で2分洗浄した。
(7)PBS+2%スキムミルク+0.05%Tween20で30分、メンブレンのブロッキングを行った。
(8)適量の(7)のスキムミルク溶液に、1次抗体(1:2000)、2次抗体(1:1000)となるように抗体を加えた。
(9)この抗体溶液とメンブレンをパックして室温で1時間反応させた。
(10)反応終了後、パックからメンブレンを取り出し、(7)のバッファーで5分×3回の洗浄を行った。
(11)メンブレンを超純水で2分洗浄した。
(12)メンブレンに発光試薬をまんべんなく塗布し、3分放置した。
(13)ケミルミイメージングシステム Fusion Solo 7S.(VILBER社製)を用い、露光時間1秒で、メンブレンの発光量を3Dイメージ画像とした。
(ヘアピン構造+ポリA配列の評価)
(1)転写用鋳型DNAの構造
実施例1〜2および比較例1〜3の3’UTRとして、以下の配列を有する転写用鋳型DNAを用いた。具体的な配列は、表8に示す。
・NAME1−1(比較例1):ポリA配列(長さ10)+核酸配列(長さ47、ヘアピン構造有り)
・NAME1−2(比較例2):第1領域(長さ20、ヘアピン構造無し)+ポリA配列(長さ10)
・NAME1−3(比較例3):第1領域(長さ20、ヘアピン構造無し)+ポリA配列(長さ10)
・NAME1−4(実施例1):第1領域(長さ20、ヘアピン構造有り)+ポリA配列(長さ10)
・NAME1−5(実施例2):第1領域(長さ20、ヘアピン構造有り)+ポリA配列(長さ10)
上記[無細胞タンパク質合成の手順]にしたがって、実施例1〜2および比較例1〜3の転写用鋳型DNAを用いてタンパク質を合成した。使用したプライマーを以下に示す。なお、“2nd Reverse primer CR2”は、実施例1〜2および比較例1〜3に応じて異なるプライマーを使用したが、その他のプライマーは同じものを使用した。
(第1領域の長さの検討)
次に、第1領域の長さとタンパク質発現量の関係を調べた。
(1)転写用鋳型DNAの構造
実施例3〜5および比較例4の3’UTRとして、以下の配列を有する転写用鋳型DNAを用いた。具体的な配列は、表10に示す。
・NAME2−1(比較例4):第1領域(長さ0)+ポリA配列(長さ10)
・NAME2−2(実施例3):第1領域(長さ10)+ポリA配列(長さ10)
・NAME2−3(実施例4):第1領域(長さ30)+ポリA配列(長さ10)
・NAME2−4(実施例5):第1領域(長さ40)+ポリA配列(長さ10)
上記[無細胞タンパク質合成の手順]にしたがって、実施例3〜5および比較例4の転写用鋳型DNAを用いてタンパク質を合成した。使用したプライマーを以下に示す。なお、SEQ.ID.が同じ番号のものは、同じ配列を意味する。
(ポリA配列の長さの検討)
次に、ポリA配列の長さとタンパク質発現量の関係を調べた。
(1)転写用鋳型DNAの構造
実施例6〜9および比較例5の3’UTRとして、以下の配列を有する転写用鋳型DNAを用いた。具体的な配列は、表12に示す。
・NAME3−1(比較例5):第1領域(長さ20)+ポリA配列(長さ0)
・NAME3−2(実施例6):第1領域(長さ20)+ポリA配列(長さ10)
・NAME3−3(実施例7):第1領域(長さ20)+ポリA配列(長さ20)
・NAME3−4(実施例8):第1領域(長さ20)+ポリA配列(長さ40)
・NAME3−5(実施例9):第1領域(長さ20)+ポリA配列(長さ2)
上記[無細胞タンパク質合成の手順]にしたがって、実施例6〜9および比較例5の転写用鋳型DNAを用いてタンパク質を合成した。使用したプライマーを以下に示す。なお、SEQ.ID.が同じ番号のものは、同じ配列を意味する。
Claims (8)
- 無細胞タンパク質合成系における翻訳促進剤であって、
目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域の3’末端に隣接して連結される3’非翻訳領域としての核酸からなり、
前記3’非翻訳領域が、
前記コード領域の3’末端に隣接する、10〜40個の核酸配列からなる第1領域と、
前記第1領域に連結する2〜40個のAが連続するポリA配列からなる第2領域と、
から構成され、
前記第1領域が、ヘアピン構造を有する、
翻訳促進剤。 - 無細胞タンパク質合成系に用いる鋳型核酸であって、
プロモーター領域と、
前記プロモーター領域によって作動可能に連結される目的タンパク質のアミノ酸配列をコードするコード領域と、
請求項1に記載の翻訳促進剤からなる、前記コード領域の3’非翻訳領域と、
を含む、鋳型核酸。 - 前記コード領域は、前記目的タンパク質として、任意のタンパク質のC末端にプロテインタグを含む融合タンパク質をコードする領域である、請求項2に記載の鋳型核酸。
- 前記コード領域は、前記目的タンパク質として、任意のタンパク質のN末端にプロテインタグを含む融合タンパク質をコードする領域である、請求項2または3に記載の鋳型核酸。
- 前記鋳型核酸は、転写鋳型DNAである、請求項2〜4のいずれか一項に記載の鋳型核酸。
- 前記鋳型核酸は、翻訳鋳型mRNAである、請求項2〜4のいずれか一項に記載の鋳型核酸。
- 無細胞タンパク質合成系のための翻訳鋳型の生産方法であって、
細胞の不存在下であってかつ転写鋳型DNAをmRNAに転写するための要素の存在下で請求項2〜5のいずれか一項に記載の鋳型核酸を用いて翻訳鋳型mRNAを合成する工程、
を備える、方法。 - タンパク質の生産方法であって、
細胞の不存在下であってかつ翻訳鋳型mRNAをタンパク質に翻訳するための要素の存在下で請求項6に記載の鋳型核酸を用いてタンパク質を合成する工程、
を備える、生産方法。
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