JP6726656B2 - クローディン６特異的免疫受容体およびｔ細胞エピトープ - Google Patents

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Description

本発明は、免疫療法のために有用なクローディン６特異的免疫受容体（Ｔ細胞受容体および人工Ｔ細胞受容体（キメラ抗原受容体；ＣＡＲ））ならびにＴ細胞エピトープの提供に関する。
免疫系の進化は、脊椎動物において２種類の防御：先天性免疫および養子免疫に基づく極めて有効なネットワークをもたらした。
病原体に関連した共通の分子パターンを認識する不変の受容体に依存する、進化的に古い先天性免疫系と異なり、養子免疫は、Ｂ細胞（Ｂリンパ球）およびＴ細胞（Ｔリンパ球）上の高度に特異的な抗原受容体ならびにクローン選択に基づく。
Ｂ細胞は抗体の分泌によって体液性免疫応答を惹起するが、Ｔ細胞は、認識された細胞の破壊をもたらす細胞性免疫応答を媒介する。
Ｔ細胞は、ヒトおよび動物における細胞媒介性免疫に中心的な役割を果たす。特定の抗原の認識および結合は、Ｔ細胞の表面に発現されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）によって媒介される。
Ｔ細胞のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子に結合して、標的細胞の表面に提示される免疫原性ペプチド（エピトープ）と相互作用することができる。ＴＣＲの特異的結合はＴ細胞の内部でシグナルカスケードを始動させ、増殖と成熟エフェクターＴ細胞への分化を導く。極めて多様な抗原を標的とすることができるように、Ｔ細胞受容体は大きな多様性を有する必要がある。
この多様性は、ＴＣＲの異なる構造領域をコードする遺伝子の異なる不連続セグメントの遺伝子再編成によって得られる。ＴＣＲは、１本のα鎖と１本のβ鎖または１本のγ鎖と１本のδ鎖から成る。ＴＣＲのα／β鎖は、抗原認識に関与するＮ末端の高度に多型の可変領域と不変の定常領域で構成される。遺伝子レベルでは、これらの鎖は数個の領域、すなわち可変（Ｖ）領域、多様性（Ｄ）領域（β鎖およびδ鎖のみ）、連結（Ｊ）領域および定常（Ｃ）領域に分けられる。ヒトβ鎖遺伝子は、６０個を超える可変セグメント（Ｖ）、２個の多様性セグメント（Ｄ）、１０個を超える連結セグメント（Ｊ）および２個の定常領域セグメント（Ｃ）を含む。ヒトα鎖遺伝子は、１個のＣセグメントに加えて、５０個を超えるＶセグメントおよび６０個を超えるＪセグメントを含むが、Ｄセグメントは含まない。マウスβ鎖遺伝子は、３０個を超える可変セグメント（Ｖ）、２個の多様性セグメント（Ｄ）、１０個を超える連結セグメント（Ｊ）および２個の定常領域セグメント（Ｃ）を含む。マウスα鎖遺伝子は、ほぼ１００個のＶセグメント、６０個のＪセグメントを含み、Ｄセグメントは含まないが、１個のＣセグメントを含む。Ｔ細胞の分化の間に、１個のＶ、１個のＤ（β鎖およびδ鎖のみ）、１個のＪおよび１個のＣ領域遺伝子を再編成することによって特異的Ｔ細胞受容体遺伝子が作り出される。ＴＣＲの多様性は、ランダムなヌクレオチドが組換え部位で導入されるおよび／または欠失される、不正確なＶ−（Ｄ）−Ｊ再編成によってさらに増幅される。ＴＣＲ遺伝子座の再編成はＴ細胞の成熟の間にゲノム内で起こるので、各々の成熟Ｔ細胞は１つの特異的α／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲだけを発現する。
ＭＨＣおよび抗原結合は、ＴＣＲの相補性決定領域１、２および３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、ＣＤＲ３）によって媒介される。抗原認識および結合のために最も重要なβ鎖のＣＤＲ３は、再編成されたＴＣＲ β鎖遺伝子のＶ−Ｄ−Ｊ接合部によってコードされる。
ＴＣＲは複雑なシグナル伝達機構の一部であり、前記機構は、ＴＣＲ α鎖およびβ鎖のヘテロ二量体複合体、補助受容体ＣＤ４またはＣＤ８ならびにＣＤ３シグナル伝達モジュールを包含する（図１）。ＣＤ３鎖は細胞の内部に活性化シグナルを伝達するが、ＴＣＲ α／βヘテロ二量体は単に抗原認識だけを担う。したがって、ＴＣＲ α／β鎖の移入は、Ｔ細胞を対象とする任意の抗原へと再指向させる可能性を提供する。
免疫療法
抗原特異的免疫療法は、感染性疾患または悪性疾患を抑制するために患者における特異的免疫応答を増強するまたは誘導することを目指す。ますます多くの病原体関連抗原および腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）が同定されることにより、免疫療法の適切な標的が幅広く収集されるに至った。これらの抗原に由来する免疫原性ペプチド（エピトープ）を提示する細胞は、能動免疫または受動免疫戦略のいずれかによって特異的に標的とすることができる。
能動免疫は、疾患細胞を特異的に認識し、死滅させることができる、患者における抗原特異的Ｔ細胞を誘導し、増殖させる傾向がある。これに対し、受動免疫は、インビトロで増殖させ、場合により遺伝子操作したＴ細胞の養子移入に基づく（養子Ｔ細胞療法）。
腫瘍ワクチンは、能動免疫によって内因性腫瘍特異的免疫応答を誘導することを目的とする。腫瘍ワクチン接種には、癌細胞全体、タンパク質、ペプチドまたはＲＮＡ、ＤＮＡもしくはウイルスベクターなどの免疫ベクターを含む種々の抗原様式を使用することができ、それらはインビボで直接適用できるかまたは患者への移入後にＤＣをパルスすることによってインビトロで適用できる。
治療が誘導する免疫応答を同定できる臨床試験の数は、免疫戦略の改善と抗原特異的免疫応答の検出方法の改善により、着実に増加しつつある（Ｃｏｎｎｅｒｏｔｔｅ，Ｔ．ｅｔ ａｌ．（２００８）．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．６８，３９３１−３９４０；Ｓｃｈｍｉｔｔ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｂｌｏｏｄ １１１，１３５７−１３６５；Ｓｐｅｉｓｅｒ，Ｄ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ １０５，３８４９−３８５４；Ａｄａｍｓ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８１，７７６−７８４）。
しかし、ほとんどの場合、検出された免疫応答は臨床転帰と体系的に関連付けることができない（Ｃｕｒｉｇｌｉａｎｏ，Ｇ．ｅｔ ａｌ．（２００６）Ａｎｎ．Ｏｎｃｏｌ．１７，７５０−７６２；Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｎａｔ．Ｍｅｄ．１０，９０９−９１５）。
腫瘍抗原に由来するペプチドエピトープの正確な定義は、それゆえ、ワクチン接種戦略の特異性と効率ならびに免疫モニタリングの方法を改善することに寄与し得る。
養子細胞移入（ＡＣＴ）
ＡＣＴに基づく免疫療法は、低い前駆体頻度から臨床的に適切な細胞数までエクスビボで増殖させた後に非免疫受容者または自己宿主に移入される、以前に感作されたＴ細胞での受動免疫の１つの形態であると広く定義することができる。ＡＣＴ実験に使用されてきた細胞型は、リンホカイン活性化キラー（ＬＡＫ）細胞（Ｍｕｌｅ，Ｊ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２５，１４８７−１４８９；Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（１９８５）Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３１３，１４８５−１４９２）、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）（Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（１９９４）Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．８６，１１５９−１１６６）、造血幹細胞移植（ＨＳＣＴ）後のドナーリンパ球ならびに腫瘍特異的Ｔ細胞株またはクローン（Ｄｕｄｌｅｙ，Ｍ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．２４，３６３−３７３；Ｙｅｅ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ ９９，１６１６８−１６１７３）である。
養子Ｔ細胞移入は、ＣＭＶなどのヒトウイルス感染に対して治療活性を有することが示された。健常個体ではＣＭＶ感染および内因性潜在ウイルスの再活性化は免疫系によって抑制されるが、移植受容者またはＡＩＤＳ患者などの免疫無防備状態の個体では有意の罹病率および死亡率をもたらす。
Ｒｉｄｄｅｌｌと共同研究者たちは、ＨＬＡが適合するＣＭＶ血清反応陽性移植ドナー由来のＣＤ８＋ ＣＭＶ特異的Ｔ細胞の移入後の免疫抑制患者において、養子Ｔ細胞療法によるウイルス免疫の再構成を明らかにした（Ｒｉｄｄｅｌｌ，Ｓ．Ｒ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５７，２３８−２４１）。
代替的アプローチとして、ポリクローナルドナー由来ＣＭＶまたはＥＢＶ特異的Ｔ細胞集団を移植受容者に移入し、移入されたＴ細胞の持続性の増大を生じさせた（Ｒｏｏｎｅｙ，Ｃ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ｂｌｏｏｄ ９２，１５４９−１５５５；Ｐｅｇｇｓ，Ｋ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｌａｎｃｅｔ ３６２，１３７５−１３７７）。
黒色腫の養子免疫療法に関して、Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇと共同研究者たちは、骨髄非破壊的リンパ球枯渇化学療法および高用量ＩＬ２と併用して、切り出した腫瘍から単離してインビトロで増殖させた自己腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の注入に基づくＡＣＴアプローチを確立した。最近公表された臨床試験は、処置された転移性黒色腫罹患患者の〜５０％の客観的奏効率をもたらした（Ｄｕｄｌｅｙ，Ｍ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｏｎｃｏｌ．２３：２３４６−２３５７）。
しかし、患者は、ＡＣＴ免疫療法に適格であるためにはいくつかの前提を満たさなければならない。患者は切除可能な腫瘍を有していなければならない。腫瘍は、細胞培養条件下で生存可能なＴＩＬを生成しなければならない。ＴＩＬは、腫瘍抗原に対して反応性でなければならず、インビトロで十分な数に増殖しなければならない。特に黒色腫以外の癌では、そのような腫瘍反応性ＴＩＬを得ることが困難である。さらに、正常なヒトＴリンパ球のインビトロ刺激とクローン増殖を繰り返すと、テロメラーゼ活性の漸進的な低下とテロメアの短縮を生じさせ、複製老化および移入されたＴ細胞の持続性の潜在能低下をもたらす（Ｓｈｅｎ，Ｘ．ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．３０：１２３−１２９）。
遺伝子操作したＴ細胞を使用するＡＣＴ
ＡＣＴの限界を克服する１つのアプローチは、短期間のエクスビボ培養の間に定められた特異性を有する腫瘍反応性免疫受容体を発現するように再プログラム化し、患者への再注入する自己Ｔ細胞の養子移入である（Ｋｅｒｓｈａｗ Ｍ．Ｈ．ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｃａｎｃｅｒ １３（８）：５２５−４１）。この戦略は、腫瘍反応性Ｔ細胞が患者に存在しない場合でも、ＡＣＴを様々な一般的悪性疾患に適用可能にする。Ｔ細胞の抗原特異性は全面的にＴＣＲ α鎖およびβ鎖のヘテロ二量体複合体に基づくので、クローン化されたＴＣＲ遺伝子のＴ細胞への移入は、対象とする任意の抗原へとそれらを再指向させる潜在的可能性を提供する。それゆえ、ＴＣＲ遺伝子療法は、処置選択肢として自己リンパ球による抗原特異的免疫療法を開発するための魅力的な戦略を提供する。ＴＣＲ遺伝子導入の主たる利点は、治療量の抗原特異的Ｔ細胞を数日以内に生成できることおよび患者の内因性ＴＣＲレパートリーには存在しない特異性を導入できることである。
いくつかのグループは、ＴＣＲ遺伝子導入が初代Ｔ細胞の抗原特異性を再指令する魅力的な戦略であることを明らかにした（Ｍｏｒｇａｎ，Ｒ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７１，３２８７−３２９５；Ｃｏｏｐｅｒ，Ｌ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７４，８２０７−８２１２；Ｆｕｊｉｏ，Ｋ．ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６５，５２８−５３２；Ｋｅｓｓｅｌｓ，Ｈ．Ｗ．ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２，９５７−９６１；Ｄｅｍｂｉｃ，Ｚ．ｅｔ ａｌ．（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２０，２３２−２３８）。
ヒトにおけるＴＣＲ遺伝子療法の実現可能性は、Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇと彼のグループによって悪性黒色腫の処置に関する臨床試験で最近明らかにされた。黒色腫／メラノサイト抗原特異的ＴＣＲをレトロウイルスで形質導入した自己リンパ球の養子移入は、処置された黒色腫患者の最大３０％において癌の退縮をもたらした（Ｍｏｒｇａｎ，Ｒ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ３１４，１２６−１２９；Ｊｏｈｎｓｏｎ，Ｌ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｂｌｏｏｄ １１４，５３５−５４６）。
キメラ抗原受容体
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）は、モノクローナル抗体の一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）を、Ｔ細胞活性化のための１つ以上のシグナル伝達ドメインから成る細胞内部分と組み合わせた、遺伝子操作された受容体である。ＣＡＲはＭＨＣ非拘束的に天然抗原を認識し、それゆえどのようなＨＬＡ型であってもすべての個体で使用することができ、ＣＤ４＋ならびにＣＤ８＋Ｔ細胞において機能性である。
種々の細胞表面腫瘍抗原のパネルを標的とする、多数のＣＡＲが過去１０年の間に報告されている。それらの生物学的機能は、第２世代ＣＡＲと称される三部分性受容体（ｓｃＦｖ、ＣＤ２８、ＣＤ３ζ）を生じさせる共刺激ドメインの組込みによって劇的に改善された。第３世代のＣＡＲは、改変されたＴ細胞の増殖能と持続性を増強するためのＯＸ４０および４−１ＢＢなどの共刺激分子の付加的なドメインを包含する（図２）。
抗原特異的免疫療法の標的構造物
多数の腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）の発見は、抗原特異的免疫療法という概念の根拠を提供した（Ｎｏｖｅｌｌｉｎｏ，Ｌ．ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．５４，１８７−２０７）。ＴＡＡは、その遺伝子不安定性に起因して腫瘍細胞上に発現される異常なタンパク質であり、正常細胞では全く発現しないかまたは発現が限られている。これらのＴＡＡは、免疫系による悪性細胞の特異的認識をもたらすことができる。
自己腫瘍特異的Ｔ細胞（ｖａｎ ｄｅｒ Ｂｒｕｇｇｅｎ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５４，１６４３−１６４７）もしくは循環抗体（Ｓａｈｉｎ，Ｕ．ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ ９２，１１８１０−１１８１３）を使用した腫瘍由来ｃＤＮＡ発現ライブラリのスクリーニング、逆免疫学アプローチ、生化学的方法（Ｈｕｎｔ，Ｄ．Ｆ．ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５６，１８１７−１８２０）、遺伝子発現解析またはインシリコクローニング戦略（Ｈｅｌｆｔｅｎｂｅｉｎ，Ｇ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｇｅｎｅ ４１４，７６−８４）によるＴＡＡの分子クローニングは、免疫療法戦略のための有意の数の標的候補物をもたらした。ＴＡＡは、分化抗原、過剰発現抗原、腫瘍特異的スプライス変異体、変異遺伝子産物、ウイルス抗原および癌精巣抗原（ＣＴＡ）を含む、いくつかのカテゴリーに分類される。癌精巣ファミリーは、それらの発現が精巣と多数の異なる腫瘍実体に限定されるので、ＴＡＡの非常に有望なカテゴリーである（Ｓｃａｎｌａｎ，Ｍ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．１８８，２２−３２）。現在までに５０個を超えるＣＴ遺伝子が記述されており（Ｓｃａｎｌａｎ，Ｍ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎ．４，１）、それらの一部は臨床試験で取り上げられている（Ａｄａｍｓ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８１，７７６−７８４；Ａｔａｎａｃｋｏｖｉｃ，Ｄ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７２，３２８９−３２９６；Ｃｈｅｎ，Ｑ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ １０１，９３６３−９３６８；Ｃｏｎｎｅｒｏｔｔｅ，Ｔ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．６８，３９３１−３９４０；Ｄａｖｉｓ，Ｉ．Ｄ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ １０１，１０６９７−１０７０２；Ｊａｇｅｒ，Ｅ．（２０００）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ ９７，１２１９８−１２２０３；Ｍａｒｃｈａｎｄ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ ８０，２１９−２３０；Ｓｃｈｕｌｅｒ−Ｔｈｕｒｎｅｒ，Ｂ．ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６５，３４９２−３４９６）。
免疫療法アプローチのための魅力的な標的構造物がますます増えつつあるにもかかわらず、所定のＨＬＡ拘束性を有する特異的Ｔ細胞クローンまたはＴ細胞株は、そのうちのごく一部に関してしか存在しない（Ｃｈａｕｘ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６３，２９２８−２９３６；Ｚｈａｎｇ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｔｉｓｓｕｅ Ａｎｔｉｇｅｎｓ ６０，３６５−３７１；Ｚｈａｏ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７４，４４１５−４４２３）。
クローディンは、上皮と内皮の密着結合内に位置する内在性膜タンパク質である。クローディンは、４つの膜貫通セグメントと２つの細胞外ループ、および細胞質内に位置するＮ末端とＣ末端を有すると予測される。クローディン（ＣＬＤＮ）ファミリーの膜貫通タンパク質は、上皮と内皮の密着結合の維持に重要な役割を果たし、また細胞骨格の維持および細胞シグナル伝達にも関与すると考えられる。
クローディン６（ＣＬＤＮ６）は、マウスおよびヒト幹細胞ならびに上皮細胞運命に関わる胚様体において発現される癌胎児性遺伝子である（Ｔｕｒｋｓｅｎ，Ｋ．ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｄｅｖ Ｄｙｎ ２２２，２９２−３００；Ａｎｄｅｒｓｏｎ ＷＪ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｄｅｖ Ｄｙｎ ２３７，５０４−１２；Ｔｕｒｋｓｅｎ Ｋ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，１２９，１７７５−８４；Ａｓｓｏｕ Ｓ． ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ ２５，９６１−７３）。腫瘍関連抗原として、ＣＬＤＮ６は、上皮分化および障壁形成に極めて重要である上皮形態形成の初期におけるその発現により、分化抗原として分類することができる。加えて、舌、皮膚、胃および乳房の上皮組織または新生児正常上皮組織において発現が認められた（Ａｂｕａｚｚａ Ｇ．ｅｔ ａｌ．（２００６）Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｎａｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２９１，１１３２−１１４１；Ｔｒｏｙ Ｔ．Ｃ．ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ３６，１６６−７４；Ｚｈａｏ Ｌ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｇｕｌ Ｉｎｔｅｇｒ Ｃｏｍｐ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２９４，１８５６−１８６２）。それに加えて、我々のデータも、ヒト胎盤、膀胱、子宮内膜、前立腺および末梢神経におけるＣＬＤＮ６の低発現または非常に低い発現、ならびに種々の癌におけるＣＬＤＮ６の頻繁な過剰発現を明らかにする。ＣＬＤＮ６は、腫瘍、例えば、小児脳腫瘍、胃腺癌および生殖細胞腫瘍ならびに卵巣癌などの内臓癌において過剰発現されることが実証されている（図４）。また、胃癌細胞におけるＣＬＤＮ６の過剰発現は侵襲性、移動および増殖の増大をもたらすことも明らかにされており、ＣＬＤＮ６が予後不良のマーカーであり、悪性表現型を維持するうえで潜在的役割を果たし得ることを示唆する。加えて、ＣＬＤＮ６は、乳癌細胞株では細胞増殖の阻害およびアポトーシスの誘導によって癌抑制因子として機能することが示されている。
Ｃｏｎｎｅｒｏｔｔｅ，Ｔ．ｅｔ ａｌ．（２００８）．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．６８，３９３１−３９４０ Ｓｃｈｍｉｔｔ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｂｌｏｏｄ １１１，１３５７−１３６５ Ｓｐｅｉｓｅｒ，Ｄ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ １０５，３８４９−３８５４ Ａｄａｍｓ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８１，７７６−７８４ Ｃｕｒｉｇｌｉａｎｏ，Ｇ．ｅｔ ａｌ．（２００６）Ａｎｎ．Ｏｎｃｏｌ．１７，７５０−７６２ Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｎａｔ．Ｍｅｄ．１０，９０９−９１５） Ｍｕｌｅ，Ｊ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２５，１４８７−１４８９ Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（１９８５）Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３１３，１４８５−１４９２ Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（１９９４）Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．８６，１１５９−１１６６） Ｄｕｄｌｅｙ，Ｍ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．２４，３６３−３７３ Ｙｅｅ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ ９９，１６１６８−１６１７３） Ｒｉｄｄｅｌｌ，Ｓ．Ｒ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５７，２３８−２４１） Ｒｏｏｎｅｙ，Ｃ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ｂｌｏｏｄ ９２，１５４９−１５５５ Ｐｅｇｇｓ，Ｋ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｌａｎｃｅｔ ３６２，１３７５−１３７７ Ｄｕｄｌｅｙ，Ｍ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｏｎｃｏｌ．２３：２３４６−２３５７ Ｓｈｅｎ，Ｘ．ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．３０：１２３−１２９ Ｋｅｒｓｈａｗ Ｍ．Ｈ．ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｃａｎｃｅｒ １３（８）：５２５−４１ Ｍｏｒｇａｎ，Ｒ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７１，３２８７−３２９５ Ｃｏｏｐｅｒ，Ｌ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７４，８２０７−８２１２ Ｆｕｊｉｏ，Ｋ．ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６５，５２８−５３２ Ｋｅｓｓｅｌｓ，Ｈ．Ｗ．ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２，９５７−９６１ Ｄｅｍｂｉｃ，Ｚ．ｅｔ ａｌ．（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２０，２３２−２３８ Ｍｏｒｇａｎ，Ｒ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ３１４，１２６−１２９ Ｊｏｈｎｓｏｎ，Ｌ．Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｂｌｏｏｄ １１４，５３５−５４６ Ｎｏｖｅｌｌｉｎｏ，Ｌ．ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．５４，１８７−２０７ ｖａｎ ｄｅｒ Ｂｒｕｇｇｅｎ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５４，１６４３−１６４７ Ｓａｈｉｎ，Ｕ．ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ ９２，１１８１０−１１８１３ Ｈｕｎｔ，Ｄ．Ｆ．ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５６，１８１７−１８２０ Ｈｅｌｆｔｅｎｂｅｉｎ，Ｇ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｇｅｎｅ ４１４，７６−８４ Ｓｃａｎｌａｎ，Ｍ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．１８８，２２−３２ Ｓｃａｎｌａｎ，Ｍ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎ．４，１ Ａｔａｎａｃｋｏｖｉｃ，Ｄ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７２，３２８９−３２９６ Ｃｈｅｎ，Ｑ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ １０１，９３６３−９３６８ Ｄａｖｉｓ，Ｉ．Ｄ．ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ １０１，１０６９７−１０７０２ Ｊａｇｅｒ，Ｅ．（２０００）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ ９７，１２１９８−１２２０３ Ｍａｒｃｈａｎｄ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ ８０，２１９−２３０ Ｓｃｈｕｌｅｒ−Ｔｈｕｒｎｅｒ，Ｂ．ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６５，３４９２−３４９６ Ｃｈａｕｘ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６３，２９２８−２９３６ Ｚｈａｎｇ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｔｉｓｓｕｅ Ａｎｔｉｇｅｎｓ ６０，３６５−３７１ Ｚｈａｏ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７４，４４１５−４４２３ Ｔｕｒｋｓｅｎ，Ｋ．ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｄｅｖ Ｄｙｎ ２２２，２９２−３００ Ａｎｄｅｒｓｏｎ ＷＪ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｄｅｖ Ｄｙｎ ２３７，５０４−１２ Ｔｕｒｋｓｅｎ Ｋ．ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，１２９，１７７５−８４ Ａｓｓｏｕ Ｓ． ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ ２５，９６１−７ Ａｂｕａｚｚａ Ｇ．ｅｔ ａｌ．（２００６）Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｎａｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２９１，１１３２−１１４１ Ｔｒｏｙ Ｔ．Ｃ．ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ３６，１６６−７４ Ｚｈａｏ Ｌ．ｅｔ ａｌ．（２００８）Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｇｕｌ Ｉｎｔｅｇｒ Ｃｏｍｐ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２９４，１８５６−１８６
腫瘍でのＣＬＤＮ６の頻繁な過剰発現は、この分子を、ワクチン療法および治療用抗体などのＣＬＤＮ６を対象とする治療法の開発のための極めて魅力的な標的にしている。しかし、これまでＨＬＡ−Ａ＊２拘束性ＣＬＤＮ６ Ｔ細胞エピトープおよびＣＬＤＮ６を標的とするＴ細胞受容体は記述されておらず、またＣＬＤＮ６を発現する癌細胞を、能動または受動免疫アプローチを用いたＴ細胞を含む免疫療法によってインビボで標的化できるかどうかは未知である。
本発明は、特に疾患細胞などの細胞の表面に存在する場合または疾患細胞もしくは抗原提示細胞などの細胞の表面に提示される場合の、腫瘍関連抗原ＣＬＤＮ６に特異的なＴ細胞受容体および人工Ｔ細胞受容体、ならびにこれらのＴ細胞受容体によって認識されるエピトープ、すなわちＣＬＤＮ６−Ｔ細胞エピトープを含むペプチドに関する。
そのようなＴ細胞受容体または人工Ｔ細胞受容体を発現するように遺伝子操作されたＴ細胞の養子移入により、ＣＬＤＮ６を発現する癌細胞が特異的に標的化され得、それにより癌細胞の選択的破壊をもたらし得る。さらに、本発明に従って提供されるＴ細胞エピトープは、ＣＬＤＮ６を発現する癌に対するワクチンを設計するのに有用である。
１つの態様では、本発明は、配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドに関する。１つの実施形態では、ペプチドは、１００以下、５０以下、２０以下または１０以下のアミノ酸長である。１つの実施形態では、ペプチドは、配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体から成るペプチドを産生するようにプロセシングされ得る。１つの実施形態では、ペプチドは、配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体から成る。
１つの実施形態では、ペプチドは、ＭＨＣクラスＩもしくはクラスＩＩ提示ペプチド、好ましくはＭＨＣクラスＩ提示ペプチドであるか、または細胞内に存在する場合は、ＭＨＣクラスＩもしくはクラスＩＩ提示ペプチド、好ましくはＭＨＣクラスＩ提示ペプチドであるそのプロセシング産物を生成するようにプロセシングされ得る。好ましくは、前記ＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ提示ペプチドは、所与のアミノ酸配列、すなわち配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体に実質的に対応する配列を有する。好ましくは、本発明によるペプチドは、クラスＩ ＭＨＣによるＣＬＤＮ６の提示を特徴とする細胞を含む疾患に対する細胞応答を刺激する能力を有する。
さらなる態様では、本発明は、本発明のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸および前記核酸を含む細胞に関する。前記核酸は組換え核酸であってよい。核酸は、プラスミドまたは発現ベクター中に存在してよく、プロモーターに機能的に連結されていてもよい。１つの実施形態では、核酸はＲＮＡである。好ましくは、前記細胞は前記ペプチドを発現する。前記細胞は組換え細胞であってよく、コードされるペプチドまたはそのプロセシング産物を分泌することができ、それを表面に発現することができ、好ましくは、前記ペプチドまたはそのプロセシング産物に結合して、好ましくは前記ペプチドまたはそのプロセシング産物を細胞表面に提示するＭＨＣ分子を付加的に発現し得る。１つの実施形態では、細胞はＭＨＣ分子を内因性に発現する。さらなる実施形態では、細胞は、ＭＨＣ分子および／またはペプチドを組換え的に発現する。細胞は、好ましくは非増殖性である。好ましい実施形態では、細胞は抗原提示細胞、特に樹状細胞、単球またはマクロファージである。
さらなる態様では、本発明は、本発明のペプチドまたはそのプロセシング産物を提示する細胞に関し、ここで前記プロセシング産物は、好ましくは所与のアミノ酸配列、すなわち配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を有するペプチドである。１つの実施形態では、前記細胞は、本発明のペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸を含む細胞である。好ましくは、前記細胞は、前記ペプチドを産生するように前記核酸を発現する。場合により前記細胞は、配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体から成るペプチドを産生するように前記ペプチドをプロセシングする。細胞は、ＭＨＣ分子によってペプチドまたはそのプロセシング産物をその表面に提示し得る。１つの実施形態では、細胞はＭＨＣ分子を内因性に発現する。さらなる実施形態では、細胞はＭＨＣ分子を組換え的に発現する。１つの実施形態では、細胞のＭＨＣ分子は、細胞へのペプチドの添加によってペプチドを負荷される（ペプチドでパルスされる）。細胞は、ペプチドを組換え的に発現することができ、および前記ペプチドまたはそのプロセシング産物をその細胞表面に提示し得る。細胞は、好ましくは非増殖性である。好ましい実施形態では、細胞は、樹状細胞、単球またはマクロファージなどの抗原提示細胞である。
さらなる態様では、本発明は、特に疾患細胞などの細胞の表面に提示された場合、本発明のペプチドと反応性である免疫反応性細胞に関する。免疫反応性細胞は、ペプチドを認識するようにインビトロで感作された細胞であり得る。免疫反応性細胞は、Ｔ細胞、好ましくは細胞傷害性Ｔ細胞であり得る。好ましくは、免疫反応性細胞は、特にＭＨＣ、例えば疾患細胞などの細胞の表面のＭＨＣに結合した場合、所与のアミノ酸配列、すなわち配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体に実質的に対応する配列に結合する。
さらなる態様では、本発明は、場合によりＭＨＣ分子との複合体中で、本発明のペプチドに結合する結合物質に関する。
さらなる態様では、本発明は、場合によりＭＨＣ分子との複合体中で、本発明のペプチドに結合し、および好ましくは前記ペプチドと反応性であるＴ細胞受容体、または前記Ｔ細胞受容体のポリペプチド鎖に関する。１つの実施形態では、前記Ｔ細胞受容体のポリペプチド鎖は、Ｔ細胞受容体α鎖またはＴ細胞受容体β鎖である。
さらなる態様では、本発明は、Ｔ細胞受容体α鎖または前記Ｔ細胞受容体α鎖を含むＴ細胞受容体に関し、ここで前記Ｔ細胞受容体α鎖は、
（ｉ）配列番号：６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択されるＴ細胞受容体α鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、ならびに
（ｉｉ）配列番号：６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択されるＴ細胞受容体α鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体α鎖
から成る群より選択される。
１つの実施形態では、前記配列番号は、配列番号：６、８、１０、１２、１４および１６から成る群より選択され、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：３のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、前記配列番号は、配列番号：１８、２０、２２、２４および２６から成る群より選択され、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：４のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、前記配列番号は配列番号：２８であり、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：５のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
さらなる態様では、本発明は、Ｔ細胞受容体β鎖または前記Ｔ細胞受容体β鎖を含むＴ細胞受容体に関し、ここで前記Ｔ細胞受容体β鎖は、
（ｉ）配列番号：７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７および２９から成る群より選択されるＴ細胞受容体β鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖、ならびに
（ｉｉ）配列番号：７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７および２９から成る群より選択されるＴ細胞受容体β鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体β鎖
から成る群より選択される。
１つの実施形態では、前記配列番号は、配列番号：７、９、１１、１３、１５および１７から成る群より選択され、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：３のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、前記配列番号は、配列番号：１９、２１、２３、２５および２７から成る群より選択され、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：４のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、前記配列番号は配列番号：２９であり、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：５のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
さらなる態様では、本発明は、
（Ｉ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、および
（ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖
［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
を含むＴ細胞受容体、ならびに
（ＩＩ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体α鎖、および
（ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体β鎖
［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
を含むＴ細胞受容体
から成る群より選択されるＴ細胞受容体に関する。
１つの実施形態では、前記ｘは、６、８、１０、１２、１４および１６から成る群より選択され、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：３のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、前記ｘは、１８、２０、２２、２４および２６から成る群より選択され、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：４のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、前記ｘは２８であり、前記Ｔ細胞受容体は、配列番号：５のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチドと反応性である。
１つの実施形態では、Ｔ細胞によって発現された場合および／またはＴ細胞上に存在する場合の前記Ｔ細胞受容体の、癌細胞などの細胞上に提示される上述したＣＬＤＮ６−ペプチドエピトープへの結合は、前記Ｔ細胞の増殖および／または活性化をもたらし、ここで前記活性化Ｔ細胞は、好ましくは細胞傷害性因子、例えばパーフォリンおよびグランザイムを放出し、癌細胞の細胞溶解および／またはアポトーシスを開始させる。
さらなる態様では、本発明は、クローディン６（ＣＬＤＮ６）に結合する人工Ｔ細胞受容体に関する。１つの実施形態では、結合は特異的結合である。
１つの実施形態では、前記ＣＬＤＮ６は癌細胞において発現される。１つの実施形態では、前記ＣＬＤＮ６は癌細胞の表面に発現される。１つの実施形態では、前記人工Ｔ細胞受容体は、ＣＬＤＮ６の細胞外ドメインまたは細胞外ドメイン内のエピトープに結合する。１つの実施形態では、前記人工Ｔ細胞受容体は、生細胞の表面に存在するＣＬＤＮ６の天然エピトープに結合する。１つの実施形態では、前記人工Ｔ細胞受容体は、ＣＬＤＮ６の第一細胞外ループに結合する。１つの実施形態では、Ｔ細胞によって発現された場合および／またはＴ細胞上に存在する場合の前記人工Ｔ細胞受容体の、癌細胞などの細胞上に存在するＣＬＤＮ６への結合は、前記Ｔ細胞の増殖および／または活性化をもたらし、ここで前記活性化Ｔ細胞は、好ましくは細胞傷害性因子、例えばパーフォリンおよびグランザイムを放出し、癌細胞の細胞溶解および／またはアポトーシスを開始させる。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体はＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを含む。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、前記人工Ｔ細胞受容体のエキソドメインに含まれる。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ６抗体の一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）を含む。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの重鎖の可変領域（ＶＨ）（ＶＨ（ＣＬＤＮ６））およびＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの軽鎖の可変領域（ＶＬ）（ＶＬ（ＣＬＤＮ６））を含む。１つの実施形態では、前記重鎖可変領域（ＶＨ）と対応する軽鎖可変領域（ＶＬ）は、ペプチドリンカーによって、好ましくはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）３を含むペプチドリンカーによって連結されている。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）を含有する。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：３３、３８もしくは３９によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）および配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：４０によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体は膜貫通ドメインを含む。１つの実施形態では、膜貫通ドメインは、膜を横切る疎水性αへリックスである。１つの実施形態では、膜貫通ドメインは、ＣＤ２８膜貫通ドメインまたはそのフラグメントを含む。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体はＴ細胞シグナル伝達ドメインを含む。１つの実施形態では、Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは細胞内に位置する。１つの実施形態では、Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、場合によりＣＤ２８と組み合わせて、ＣＤ３−ζ、好ましくはＣＤ３−ζのエンドドメインを含む。１つの実施形態では、Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、配列番号：４５に従う配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含む。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体は、新生タンパク質を小胞体内に向かわせるシグナルペプチドを含む。１つの実施形態では、シグナルペプチドはＣＬＤＮ６に対する結合ドメインに先行する。１つの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号：４２に従う配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含む。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体は、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを膜貫通ドメインに連結するスペーサー領域を含む。１つの実施形態では、スペーサー領域は、ＣＬＤＮ６認識を容易にするためにＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを異なる方向に配向することを可能にする。１つの実施形態では、スペーサー領域はＩｇＧ１からのヒンジ領域を含む。１つの実施形態では、スペーサー領域は、配列番号：４３に従う配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含む。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体は、構造：
ＮＨ２−シグナルペプチド−ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン−スペーサー領域−膜貫通ドメイン−Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン−ＣＯＯＨ
を含む。
１つの実施形態では、本発明の人工Ｔ細胞受容体は、配列番号：４６に従うアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む。
上記Ｔ細胞受容体および人工Ｔ細胞受容体は、好ましくは、特に疾患細胞などの細胞の表面に存在する場合または疾患細胞もしくは抗原提示細胞などの細胞の表面に提示される場合の、腫瘍関連抗原ＣＬＤＮ６に特異的である。
本発明のＴ細胞受容体および人工Ｔ細胞受容体は、Ｔ細胞などの細胞によって発現され得るおよび／または細胞の表面に存在し得る。
さらなる態様では、本発明は、本発明のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードするまたは本発明の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸に関する。１つの実施形態では、核酸は組換え核酸である。１つの実施形態では、核酸は、ベクターの形態またはＲＮＡの形態である。
さらなる態様では、本発明は、本発明のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体または本発明の人工Ｔ細胞受容体を含む細胞、および／または本発明のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードするまたは本発明の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含有する核酸を含む細胞に関する。１つの実施形態では、前記核酸は、ＲＮＡ、好ましくはインビトロ転写ＲＮＡである。細胞は、本発明のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体または本発明の人工Ｔ細胞受容体を発現する細胞であり得るか、および／または本発明のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体または本発明の人工Ｔ細胞受容体をその細胞表面に有し得る。１つの実施形態では、前記細胞は、養子細胞移入のために有用な細胞である。細胞は、エフェクター細胞または幹細胞、好ましくは免疫反応性細胞である。免疫反応性細胞は、Ｔ細胞、好ましくは細胞傷害性Ｔ細胞である。１つの実施形態では、免疫反応性細胞は腫瘍関連抗原ＣＬＤＮ６と反応性である。１つの実施形態では、前記ＣＬＤＮ６は、疾患細胞などの細胞の表面に存在する。１つの実施形態では、前記ＣＬＤＮ６は、疾患細胞または抗原提示細胞などの細胞の表面に提示され、免疫反応性細胞は本発明のペプチドと、特にペプチドがＭＨＣに関連して提示された場合、反応性であり、および好ましくは所与のアミノ酸配列、すなわち配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体に実質的に対応する配列に結合する。１つの実施形態では、前記細胞は、内因性ＴＣＲの表面発現を欠くかまたはＣＬＤＮ６に無関係な抗原に特異的である。
１つの実施形態では、本発明の細胞は、養子細胞移入に使用する前に抗原特異的増殖および再攻撃誘発に供され、ここで抗原特異的増殖および再攻撃誘発は、細胞を、好ましくはＣＬＤＮ６またはそのペプチドフラグメントを提示する自己抗原提示細胞に暴露することによって実施され得る。
さらなる態様では、本発明は、本発明のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードするまたは本発明の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸をＴ細胞に形質導入する工程を含む、免疫反応性細胞を作製する方法に関する。
さらに、本発明は一般に、癌細胞、特にＣＬＤＮ６を発現する癌細胞などの疾患細胞を標的とすることによる疾患の処置を包含する。この方法は、腫瘍関連抗原ＣＬＤＮ６をその表面に発現するおよび／または提示する細胞の選択的根絶を可能にし、それによりＣＬＤＮ６を発現しないおよび／または提示しない正常細胞への有害作用を最小限に抑える。したがって、治療ための好ましい疾患は、癌疾患などの、ＣＬＤＮ６が発現され、場合により提示される疾患、特に本明細書で述べるものである。
本発明のペプチド、本発明のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸または前記核酸を含む本発明の細胞を投与する場合、処置は、好ましくは能動免疫を含む。好ましくは、疾患細胞を認識して死滅させることができる、ＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞を患者において増殖させる。本発明の免疫反応性細胞、本発明のＴ細胞受容体、本発明の人工Ｔ細胞受容体、本発明のＴ細胞受容体をコードするもしくは本発明の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含む本発明の核酸、または本発明のＴ細胞受容体もしくは人工Ｔ細胞受容体を含むおよび／または本発明のＴ細胞受容体をコードするもしくは本発明の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含有する本発明の核酸を含む本発明の細胞を投与する場合、処置は、好ましくは受動免疫を含む。好ましくは、疾患細胞を認識して死滅させることができる、場合により遺伝子操作されたおよび／またはインビトロで増殖されたＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞を患者に養子移入する。
１つの態様では、本発明は、
（ｉ）本発明のペプチド、
（ｉｉ）本発明の核酸、
（ｉｉｉ）本発明の細胞、
（ｉｖ）本発明の免疫反応性細胞、
（ｖ）本発明の結合物質、
（ｖｉ）本発明のＴ細胞受容体、および
（ｖｉ）本発明の人工Ｔ細胞受容体
の１つ以上を含む医薬組成物に関する。
本発明の医薬組成物は、医薬的に許容される担体を含んでよく、場合により１つ以上のアジュバント、安定剤等を含み得る。医薬組成物は、治療ワクチンまたは予防ワクチンの形態であり得る。１つの実施形態では、医薬組成物は、本明細書で述べるような癌疾患を処置するまたは予防するのに使用される。
上述した医薬組成物の投与は、ＣＬＤＮ６（ＣＬＤＮ６をその表面に発現するおよび／またはＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する細胞を含む）に対するＣＤ４＋ヘルパーＴ細胞応答および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞応答を誘発する能力を有するＭＨＣクラスＩＩ提示エピトープを提供し得る。あるいはまたは加えて、上述した医薬組成物の投与は、ＣＬＤＮ６に対するＣＤ８＋Ｔ細胞応答を誘発する能力を有するＭＨＣクラスＩ提示エピトープを提供し得る。
さらなる態様では、本発明は、本発明の医薬組成物を患者に投与することを含む、癌疾患を処置するまたは予防する方法に関する。
さらなる態様では、本発明は、治療法において使用するため、特に癌を処置するまたは予防するのに使用するための本発明のペプチド、本発明の核酸、本発明の細胞、本発明の免疫反応性細胞、本発明の結合物質、本発明のＴ細胞受容体または本発明の人工Ｔ細胞受容体に関する。
別の態様は、本発明の医薬組成物を被験体に投与することを含む、被験体において免疫応答を誘導する方法に関する。
別の態様は、Ｔ細胞を、本発明のペプチド、本発明のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む本発明の核酸、前記核酸を含む本発明の細胞および／または本発明のペプチドもしくはそのプロセシング産物を提示する本発明の細胞の１つ以上と接触させることを含む、Ｔ細胞を刺激する、プライミングするおよび／または増殖させる方法に関する。１つの実施形態では、本発明のペプチドは、細胞、例えば抗原提示細胞の表面のＭＨＣ分子などのＭＨＣ分子に関連して提示される。
この態様では、本発明は、ＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞を調製する方法に関し得る。Ｔ細胞は、インビトロまたはインビボで刺激され得る、プライミングされ得るおよび／または増殖され得る。好ましくは、Ｔ細胞は、被験体から得た試料中に存在する。刺激された、プライミングされたおよび／または増殖されたＴ細胞は、被験体に投与することができ、被験体にとって自己、同種異系、同系であり得る。
被験体において免疫応答を誘導する方法またはＴ細胞を刺激する、プライミングするおよび／もしくは増殖させる方法の上記態様での本発明は、被験体において癌疾患を処置する方法に関し得る。
別の態様は、被験体において癌細胞を死滅させる方法であって、本発明のペプチド、本発明の核酸、本発明の細胞、本発明の免疫反応性細胞、本発明の結合物質、本発明のＴ細胞受容体または本発明の人工Ｔ細胞受容体の治療有効量を被験体に提供する工程を含む方法に関する。
本明細書で述べる組成物および作用物質は、好ましくは、ＣＬＤＮ６の発現および／またはクラスＩ ＭＨＣによるＣＬＤＮ６の提示を特徴とする疾患、例えば癌疾患に対する細胞応答、好ましくは細胞傷害性Ｔ細胞活性を誘導するまたは促進する能力を有する。
１つの態様では、本発明は、本明細書で述べる処置の方法における使用のための本明細書で述べる作用物質および組成物を提供する。
本明細書で述べる癌疾患の処置は、外科的切除術および／または放射線および／または伝統的化学療法と併用することができる。
別の態様では、本発明は、被験体における免疫応答を判定する方法であって、被験体から単離した生物学的試料中で本発明のペプチドまたは本発明のペプチドもしくはそのプロセシング産物を提示する本発明の細胞と反応性のＴ細胞を判定することを含む方法に関する。この方法は、
（ａ）被験体から単離したＴ細胞を含む試料を、
（ｉ）本発明のペプチド、
（ｉｉ）本発明のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む本発明の核酸、および
（ｉｉｉ）前記核酸を含む本発明の細胞または本発明のペプチドもしくはそのプロセシング産物を提示する本発明の細胞
の１つ以上と共にインキュベートする工程、ならびに
（ｂ）Ｔ細胞の特異的活性化を検出し、そこから前記被験体における免疫応答の存在または不在を判定する工程
を含み得る。
被験体における免疫応答を判定する方法の上記態様での本発明は、被験体において癌疾患を診断する方法に関し得る。
診断の方法の１つの実施形態では、生物学的試料は組織または器官に由来し、ここで組織または器官が疾患を有さない場合の細胞は、ＣＬＤＮ６を実質的に発現しない。
典型的には、生物学的試料中のＴ細胞のレベルを参照レベルと比較し、ここで前記参照レベルからの逸脱は、被験体における疾患の存在および／または病期を示す。参照レベルは、対照試料（例えば健常組織または健常被験体由来の）中で測定されるレベルまたは健常被験体からの平均レベルであり得る。前記参照レベルからの「逸脱」は、何らかの有意の変化、例えば少なくとも１０％、２０％または３０％、好ましくは少なくとも４０％または５０％、さらにはそれ以上の増大を表す。好ましくは、前記生物学的試料中のＴ細胞の存在または参照レベルと比較して増大している生物学的試料中のＴ細胞の量は、疾患の存在を示す。
Ｔ細胞は、例えば生検および切除術に由来する患者の末梢血、リンパ節、組織試料、または他の供給源から単離し得る。反応性アッセイは、初代Ｔ細胞または他の適切な誘導体に関して実施し得る。例えば、Ｔ細胞を融合してハイブリドーマを作製し得る。Ｔ細胞応答性を測定するためのアッセイは当分野で公知であり、これには増殖アッセイおよびサイトカイン放出アッセイが含まれる。
反応性Ｔ細胞を検出するためのアッセイおよび指標には、ＩＦＮγ ＥＬＩＳＰＯＴおよびＩＦＮγ細胞内サイトカイン染色の使用が含まれるが、これらに限定されない。Ｔ細胞クローンが特定のペプチドに応答するかどうかを判定するための他の様々な方法が当分野において公知である。典型的には、ペプチドを１〜３日間、Ｔ細胞の懸濁液に添加する。Ｔ細胞の応答は、増殖、例えば標識チミジンの取り込みによって、またはサイトカイン、例えばＩＬ−２の放出によって測定し得る。様々なアッセイが、放出されたサイトカインの存在を検出するために使用可能である。Ｔ細胞傷害性アッセイは、抗原に特異性を有する細胞傷害性Ｔ細胞を検出するのに使用できる。１つの実施形態では、細胞傷害性Ｔ細胞を、ＭＨＣクラスＩ分子と共に抗原を提示している標的細胞を死滅させるそれらの能力に関して試験する。抗原を提示している標的細胞を標識し、患者試料からのＴ細胞の懸濁液に添加し得る。細胞傷害性は、溶解した細胞からの標識の放出を定量することによって測定し得る。自発的放出および総放出に関する対照をアッセイに含めてもよい。
本発明の１つの実施形態では、本明細書で述べる癌は、ＣＬＤＮ６を発現するおよび／またはＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する癌細胞を含む。本発明の１つの実施形態では、疾患細胞は癌細胞である。１つの実施形態では、癌細胞などの疾患細胞は、ＣＬＤＮ６を発現するおよび／またはＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する細胞である。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６の発現は疾患細胞の表面上である。
本発明の１つの実施形態では、癌は、膀胱癌、卵巣癌、特に卵巣腺癌および卵巣奇形癌、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）および非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）を含む肺癌、特に肺扁平上皮癌および腺癌、胃癌、乳癌、肝癌、膵癌、皮膚癌、特に基底細胞癌および扁平上皮癌、悪性黒色腫、頭頸部癌、特に悪性多形腺腫、肉腫、特に滑膜肉腫および癌肉腫、胆管癌、膀胱の癌、特に移行上皮癌および乳頭状癌、腎癌、特に腎明細胞癌および乳頭状腎細胞癌を含む腎細胞癌、結腸癌、回腸の癌を含む小腸癌、特に小腸腺癌および回腸の腺癌、精巣胎生期癌、胎盤絨毛癌、子宮頸癌、精巣癌、特に精巣セミノーマ、精巣奇形腫および胎生期精巣癌、子宮癌、奇形癌または胎生期癌などの生殖細胞腫瘍、特に精巣の生殖細胞腫瘍、ならびにそれらの転移形態から成る群より選択される。
本発明の１つの実施形態では、癌細胞は、膀胱癌、卵巣癌、特に卵巣腺癌および卵巣奇形癌、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）および非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）を含む肺癌、特に肺扁平上皮癌および腺癌、胃癌、乳癌、肝癌、膵癌、皮膚癌、特に基底細胞癌および扁平上皮癌、悪性黒色腫、頭頸部癌、特に悪性多形腺腫、肉腫、特に滑膜肉腫および癌肉腫、胆管癌、膀胱の癌、特に移行上皮癌および乳頭状癌、腎癌、特に腎明細胞癌および乳頭状腎細胞癌を含む腎細胞癌、結腸癌、回腸の癌を含む小腸癌、特に小腸腺癌および回腸の腺癌、精巣胎生期癌、胎盤絨毛癌、子宮頸癌、精巣癌、特に精巣セミノーマ、精巣奇形腫および胎生期精巣癌、子宮癌、奇形癌または胎生期癌などの生殖細胞腫瘍、特に精巣の生殖細胞腫瘍、ならびにそれらの転移形態から成る群より選択される癌の癌細胞である。
本発明によれば、ＣＬＤＮ６は、好ましくは配列番号：１または２に従うアミノ酸配列を有する。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から明らかになる。
ＴＣＲ−ＣＤ３複合体の表示。細胞質内ＣＤ３免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を円筒として示す（出典"Ｔｈｅ Ｔ ｃｅｌｌ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｆａｃｔｓ ｂｏｏｋ"，ＭＰ Ｌｅｆｒａｎｃ，Ｇ Ｌｅｆｒａｎｃ，２００１）。 ＣＡＲの連続的世代の設計。異なる世代のＣＡＲ（１Ｇ、第１世代、２Ｇ、第２世代、３Ｇ、第３世代）の略図。第１世代は、細胞外ｓｃＦｖおよび細胞傷害を媒介する細胞質ＣＤ３ζ鎖／ＺＡＰ７０を含み、第２世代は、増殖を促進するＣＤ２８／ＰＩ３Ｋを付加的に含み、第３世代は、細胞生存を維持する４−１ＢＢまたはＯＸ４０／ＴＲＡＦをさらに含む（Ｃａｓｕｃｃｉ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．（２０１１）２：３７８−３８２）。 ＣＬＤＮ６に対するＴ細胞の再指向のための種々の受容体形式の略図。左側：ＣＬＤＮ６特異的ｓｃＦｖフラグメント、ＩｇＧ１由来のスペーサードメイン、ＣＤ２８共刺激およびＣＤ３ζシグナル伝達ドメインから成る第２世代ＣＡＲ（ＣＡＲ−２８ζ）；中央：マウスＴＣＲβ鎖の定常ドメインとｓｃＦｖの連結およびマウスＴＣＲα鎖の定常ドメインの共発現に基づく新規ＣＡＲ形式（ＣＡＲ／Ｃα）；右側：ＴＣＲ α／β鎖から成るマウスＴＣＲ（ｍｕ、マウスＴＣＲ）。 （図４）正常組織および種々の癌におけるクローディン６発現。ＣＬＤＮ６ ｍＲＮＡ発現を、種々の正常組織および４７の卵巣癌標本においてｑＲＴ−ＰＣＲによって分析した。 （図４続き）正常組織および種々の癌におけるクローディン６発現。ＣＬＤＮ６ ｍＲＮＡ発現を、種々の正常組織および４７の卵巣癌標本においてｑＲＴ−ＰＣＲによって分析した。 ＴＣＲの単離と検証のための技術プラットフォーム。このアプローチは、抗原特異的Ｔ細胞の単離（上段）からＴＣＲクローニング（中段）およびＴＣＲ検証（下段）までのすべての工程を統合する。ＨＬＡ−Ａ２／ＤＲ１トランスジェニックマウスを、腫瘍抗原コードするｍＲＮＡで免疫する。これらのマウスの脾細胞をＩＦＮγ−ＥＬＩＳＰＯＴによってそれぞれの抗原に対するエクスビボ反応性に関して分析し、抗原特異的マウスＣＤ８＋Ｔ細胞を、フローサイトメトリによってＣＤ１３７の活性化誘導性発現に基づくインビトロ再刺激後に単離する（上段）。単一細胞をマルチウェルプレートに採取し、包括的ＰＣＲ増幅工程による一本鎖ｃＤＮＡ合成と濃縮に供する。ＴＣＲ α／β可変領域を、定常領域カセットを含むインビトロ転写（ＩＶＴ）のためのベクターにクローニングする（中段）。ＴＣＲ α／β鎖ＲＮＡをヒトＣＤ８＋Ｔ細胞に移入し、適切な抗原を発現するＡＰＣおよびＨＬＡ分子と共培養して、操作されたＴ細胞の機能的再プログラム化に関して試験する（下段）。 ＩＦＮｙ−ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって分析した、ＣＬＤＮ６由来ペプチドに対する免疫ＨＬＡ−Ａ＊０２トランスジェニックマウスからの脾細胞のエクスビボ反応性。ＨＬＡ−Ａ＊０２ ＣＬＤＮ６特異的結合ペプチドを、特定のアルゴリズム（Ｒａｍｍｅｎｓｅｅ Ｈ．ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ５０，２１３−９）を適用して予測した。脾細胞を、ＣＬＤＮ６ペプチドプールまたは予測されたＨＬＡ−Ａ＊０２結合ＣＬＤＮ６由来ペプチドＡ２−１−６に対する反応性に関して分析した。陽性対照：ＰＭＡ処理した脾細胞；陰性対照：無関係なペプチドプール（ＨＩＶ−ｇａｇ）、無関係な９量体ペプチド（ＰＬＡＣ１−３１−３９）。 インビトロ再刺激後のＨＬＡ−Ａ＊０２トランスジェニックマウスからのＣＬＤＮ６特異的マウスＣＤ８＋Ｔ細胞のフローサイトメトリ選別。単一ＣＤ８＋／ＣＤ１３７＋Ｔ細胞をフローサイトメトリによって単離し、ＣＬＤＮ６オーバーラッピングペプチドプールでの脾細胞の再刺激後にＴＣＲクローニングのためにマルチウェルプレートに採取した。対照：無関係なペプチドプールで再刺激した脾細胞。 ＣＬＤＮ６免疫マウスのＣＤ８＋Ｔ細胞から単離したＴＣＲの特異性試験。ＨＬＡ−Ａ＊０２陽性健常ドナーのＣＤ８＋Ｔ細胞をＴＣＲ−α／β鎖ＲＮＡでトランスフェクトし、ＣＬＤＮ６ ＲＮＡでトランスフェクトしたまたはＣＬＤＮ６オーバーラッピング１５量体ペプチド（＝Ｃｌ６プール）もしくはＣＬＤＮ６ ＨＬＡ−Ａ＊０２結合ペプチド（Ｃｌ６−Ａ２−１、Ｃｌ６−Ａ２−２）でパルスしたＫ５６２−Ａ２細胞の認識に関してＩＦＮγ−ＥＬＩＳＰＯＴによって試験した。陰性対照：無関係なペプチドプール、無関係な９量体ペプチド；陽性対照：ＳＥＢ。 ヒト予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞上のＣＬＤＮ６特異的マウスＴＣＲの表面発現。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＯＫＴ３で予備活性化し、ＴＣＲ α／β ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体およびＴＣＲ β鎖のマウス定常ドメインを認識するＡＰＣ結合抗体で染色した。細胞を単一リンパ球でゲートした。 ＣＬＤＮ６特異的ＴＣＲによって媒介される腫瘍細胞溶解。予備活性化したＣＤ８＋Ｔ細胞をＴＣＲ α／β ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトし、２０時間後にＨＬＡ−Ａ＊０２を発現するＣＬＤＮ６陽性（ＰＡ１−Ｌｕｃ；ＮＩＨ−ＯｖＣａｒ３）またはＣＬＤＮ６陰性（ＳＫ−Ｍｅｌ−３７）腫瘍細胞株と共に３０：１のＥ：Ｔ（エフェクター細胞：標的細胞）比で共培養した。４時間の共培養後にルシフェラーゼに基づく細胞傷害アッセイによって特異的溶解を分析した。 （図１１）ＣＬＤＮ６を発現する標的細胞に応答してＣＬＤＮ６特異的ＴＣＲによって媒介される用量依存的増殖。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＴＣＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトし、ＣＦＳＥで標識して、滴定量のＣＬＤＮ６ ＲＮＡでトランスフェクトした自己単球と共培養した。共培養の４日後、細胞をＡＰＣ−Ｃｙ７標識抗ＣＤ８抗体で染色した。（図１１Ａ）特異的増殖を、ＣＦＳＥ増殖染料の希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。ドットプロットは、ＣＬＤＮ６−ＲＮＡ １μｇでトランスフェクトした単球との共培養後に生存ＣＤ８＋Ｔリンパ球を示す。 （図１１Ａ続き）特異的増殖を、ＣＦＳＥ増殖染料の希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。ドットプロットは、ＣＬＤＮ６−ＲＮＡ １μｇでトランスフェクトした単球との共培養後に生存ＣＤ８＋Ｔリンパ球を示す。 （図１１Ｂ）バーは、増殖中のＣＤ８＋Ｔ細胞のパーセンテージを示す。 （図１２）休止ヒトＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞上のＣＬＤＮ６特異的ＣＡＲ構築物の表面発現。ＰＢＭＣをＣＡＲ ＲＮＡ １０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体、ＦＩＴＣ結合抗ＣＤ４抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ−６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞を単一ＣＤ４＋またはＣＤ８＋Ｔ細胞でゲートした。 （図１２続き）休止ヒトＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞上のＣＬＤＮ６特異的ＣＡＲ構築物の表面発現。ＰＢＭＣをＣＡＲ ＲＮＡ １０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体、ＦＩＴＣ結合抗ＣＤ４抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ−６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞を単一ＣＤ４＋またはＣＤ８＋Ｔ細胞でゲートした。 種々のＣＬＤＮ６標的化受容体形式によって媒介される腫瘍細胞溶解。予備活性化したＣＤ８＋Ｔ細胞をＣＡＲまたはＴＣＲ ＲＮＡでトランスフェクトし、２０時間後にＣＬＤＮ６陽性またはＣＬＤＮ６陰性腫瘍細胞株ＰＡ１およびＭＤＡ−ＭＢ−２３１−Ｌｕｃと共に種々のＥ：Ｔ比で共培養した。４時間の共培養後にルシフェラーゼに基づく細胞傷害アッセイによって特異的溶解を分析した。 （図１４）ＣＬＤＮ６を発現する標的細胞に応答してＣＬＤＮ６特異的ＣＡＲによって媒介される抗原特異的増殖。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＴＣＲまたはＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトし、ＣＦＳＥで標識して、ＣＬＤＮ６または対照ＲＮＡでトランスフェクトした自己ｉＤＣと共に４日間共培養した。（図１４Ａ）ＴＣＲ／ＣＡＲ表面発現を、マウスＡＰＣ結合ＴＣＲβ特異的抗体またはＤｙｌｉｇｈｔ６５０結合イディオタイプ特異的抗体での染色後にフローサイトメトリによって分析した。特異的増殖をＣＦＳＥ増殖染料の希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。 （図１４Ｂ）ＴＣＲ／ＣＡＲ表面発現を、マウスＡＰＣ結合ＴＣＲβ特異的抗体またはＤｙｌｉｇｈｔ６５０結合イディオタイプ特異的抗体での染色後にフローサイトメトリによって分析した。特異的増殖をＣＦＳＥ増殖染料の希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。 （図１４Ｂ続き）ＴＣＲ／ＣＡＲ表面発現を、マウスＡＰＣ結合ＴＣＲβ特異的抗体またはＤｙｌｉｇｈｔ６５０結合イディオタイプ特異的抗体での染色後にフローサイトメトリによって分析した。特異的増殖をＣＦＳＥ増殖染料の希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。 （図１５）予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞上の、変異したシステイン４６を有するＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体の表面発現。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＯＫＴ３で予備活性化し、ＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞をシングレットおよびリンパ球でゲートした。 （図１５続き）予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞上の、変異したシステイン４６を有するＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体の表面発現。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＯＫＴ３で予備活性化し、ＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞をシングレットおよびリンパ球でゲートした。 （図１５続き）予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞上の、変異したシステイン４６を有するＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体の表面発現。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＯＫＴ３で予備活性化し、ＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞をシングレットおよびリンパ球でゲートした。 （図１５続き）予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞上の、変異したシステイン４６を有するＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体の表面発現。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＯＫＴ３で予備活性化し、ＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＰＥ結合抗ＣＤ８抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞をシングレットおよびリンパ球でゲートした。 ３名の異なるドナーの予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞上の、変異システイン４６を有するＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体の表面発現。ＣＤ８＋Ｔ細胞をＯＫＴ３で予備活性化し、ＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトした。電気穿孔の２０時間後、細胞をＤｙｌｉｇｈｔ６５０で標識したイディオタイプ特異的抗体で染色した。細胞を、ＣＡＲを発現するＣＤ８＋Ｔリンパ球でゲートした。３つの異なる実験の結果を示す。上：ＣＡＲ＋／ＣＤ８＋Ｔ細胞のパーセンテージを示す；下：ＣＡＲ陽性ＣＤ８＋Ｔ細胞の平均蛍光強度を示す。 （図１７）変異システイン４６を有するＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体によって媒介される特異的腫瘍細胞溶解。（図１７Ａ）標的細胞株上のＣＬＤＮ６表面発現を、Ａｌｅｘａ６４７結合ＣＬＤＮ６特異的抗体での染色後にフローサイトメトリによって分析した。 （図１７Ｂ）予備活性化したＣＤ８＋Ｔ細胞をＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトし、２０時間後にＣＬＤＮ６陽性（ＰＡ１）またはＣＬＤＮ６陰性（ＭＤＡ−ＭＢ−２３１−Ｌｕｃ−Ｔｏｍａｔｏ）腫瘍細胞株と共に種々のＥ：Ｔ比で共培養した。４時間の共培養後にルシフェラーゼに基づく細胞傷害アッセイによって特異的溶解を分析した。 （図１７Ｃ）Ｔ細胞上のＣＡＲ表面発現を、蛍光色素結合ＣＤ８特異的抗体およびイディオタイプ特異的抗体での染色後にフローサイトメトリによって分析した。 （図１８）変異システイン４６を有するＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物の種々の変異体によって媒介される標的細胞の用量依存的溶解。（図１８Ａ）予備活性化したＣＤ８＋Ｔ細胞をＣＡＲ ＲＮＡ ２０μｇでトランスフェクトし、２０時間後に滴定量のＣＬＤＮ６−ＲＮＡでトランスフェクトした自己ｉＤＣと共培養した（Ｅ：Ｔ＝３０：１）。 (図１８Ｂ)トランスフェクトしたｉＤＣ上のＣＬＤＮ６表面発現を、Ａｌｅｘａ６４７結合ＣＬＤＮ６特異的抗体での染色後にフローサイトメトリによって分析した。 安定なＣＡＲ発現のために使用したレトロウイルスＳＩＮ構築物の略図。プラスミドｐＥＳ１２．６−ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−Ｃ４６Ｓを、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を使用したＧＡＬＶエンベロープＳＩＮベクターの一時的作製のために使用した。 ＮＳＧマウスへの養子移入のために使用した形質導入ヒトＴ細胞上のＣＬＤＮ６−ＣＡＲおよび無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲの検出。細胞を、ＣＤ８およびＣＤ４に対する蛍光色素結合抗体（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）ならびにＣＬＤＮ６−ＣＡＲ（抗ＩＭＡＢ２０６，Ｇａｎｙｍｅｄ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ ＡＧ）および無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲのそれぞれのｓｃＦｖ部分に対するイディオタイプ特異的抗体でそれぞれ染色した。細胞を単一ＣＤ８＋またはＣＤ４＋リンパ球でゲートした。形質導入したＴ細胞をＯＶ９０−ＳＣ１２移植ＮＳＧマウスにおける養子細胞移入のために使用した。無関係な腫瘍抗原に対するＣＬＤＮ６−ＣＡＲおよびＣＡＲの形質導入率は、それぞれ、ＣＤ４＋の約３７％およびＣＤ８＋の２０％ならびにＣＤ４＋の３６％およびＣＤ８＋細胞の２４であった。グラフは対数目盛で示している。 ＮＳＧマウスへの養子移入のために使用した形質導入ヒトＴ細胞上のＣＬＤＮ６−ＣＡＲおよび無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲの検出。細胞を、ＣＤ８およびＣＤ４に対する蛍光色素結合抗体（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）ならびにＣＬＤＮ６−ＣＡＲ（抗ＩＭＡＢ２０６，Ｇａｎｙｍｅｄ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ ＡＧ）および無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲのそれぞれのｓｃＦｖ部分に対するイディオタイプ特異的抗体でそれぞれ染色した。細胞を単一ＣＤ８＋またはＣＤ４＋リンパ球でゲートした。形質導入したＴ細胞をＯＶ９０−ＳＣ１２移植ＮＳＧマウスにおける養子細胞移入のために使用した。無関係な腫瘍抗原に対するＣＬＤＮ６−ＣＡＲおよびＣＡＲの形質導入率は、それぞれ、ＣＤ４＋の約３７％およびＣＤ８＋の２０％ならびにＣＤ４＋の３６％およびＣＤ８＋細胞の２４であった。グラフは対数目盛で示している。 卵巣癌モデルにおけるＣＬＤＮ６−ＣＡＲ形質導入Ｔ細胞の抗腫瘍活性。１×１０７のヒトＯＶ９０−ＳＣ１２腫瘍細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ１１７３２）をＮＳＧマウス（１０匹のマウス／群）に皮下注射した。４日後、マウスを、１×１０７のＣＤ３／ＣＤ２８ビーズで刺激し、レトロウイルスで形質導入したヒトＴ細胞（ＣＤ４の約３７％およびＣＤ８の２０％がＣＬＤＮ６−ＣＡＲ陽性であった）の単回静脈内注射で処置した。（図２１Ａ）実験設定の計画。 対照群（Ｔ細胞なし、非形質導入Ｔ細胞および無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲで形質導入したＴ細胞）と比較したＣＬＤＮ６−ＣＡＲ処置マウスにおける腫瘍増殖の遅延。体積測定および末梢血の分析による腫瘍モニタリングを週１回実施した。結果を、すべての群に関してｎ＝１０マウスで平均腫瘍体積±ＳＥＭとして表す。腫瘍体積は、以下の式Ｖ＝１／２×（長さ×幅の二乗）を用いて計算した。ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ処置マウスに関するプロットは、ｔ＝３１日に関して対照処置群とは有意に異なる（＊ＡＮＯＶＡ、Ｐ＜０．０５）。 各群の個別マウスの腫瘍増殖曲線を示す。無関係な腫瘍抗原群の２匹のマウスは、高い腫瘍負荷により２４日目に犠死させなければならなかった（＋で示す）ことに留意されたい。 ｉＤＣを発現するＣＬＮＤ６との共培養後のＣＡＲ Ｔ細胞の増殖。ＣＤ８＋Ｔ細胞を、Ａ）ＣＬＤＮ６またはＢ）陰性対照として無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲをコードするＩＶＴ−ＲＮＡでトランスフェクトし、ＣＦＳＥ（カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル）で標識して、ＣＬＤＮ６でトランスフェクトした自己ｉＤＣと共に４日間共培養した。ＣＡＲ Ｔ細胞の増殖を、ＣＦＳＥの希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。細胞を単一生存ＣＤ８＋Ｔリンパ球でゲートした。 ｉＤＣを発現するＣＬＮＤ６との共培養後のＣＡＲ Ｔ細胞の増殖。ＣＤ８＋Ｔ細胞を、Ａ）ＣＬＤＮ６またはＢ）陰性対照として無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲをコードするＩＶＴ−ＲＮＡでトランスフェクトし、ＣＦＳＥ（カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル）で標識して、ＣＬＤＮ６でトランスフェクトした自己ｉＤＣと共に４日間共培養した。ＣＡＲ Ｔ細胞の増殖を、ＣＦＳＥの希釈に基づきフローサイトメトリによって分析した。細胞を単一生存ＣＤ８＋Ｔリンパ球でゲートした。
本発明を以下で詳細に説明するが、本発明は本明細書で述べる特定の方法、プロトコルおよび試薬に限定されず、これらは異なり得ることが理解されるべきである。また、本明細書で使用される用語は特定の実施形態を説明することだけを目的とし、本発明の範囲を限定することを意図せず、本発明の範囲は付属の特許請求の範囲によってのみ限定されることも理解されるべきである。特に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術および学術用語は、当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。
以下において、本発明の要素を説明する。これらの要素を具体的な実施形態と共に列挙するが、これらは付加的な実施形態を創製するために任意の方法および任意の数で組み合わせてもよいことが理解されるべきである。様々に説明される例および好ましい実施形態は、本発明を明白に記述される実施形態だけに限定すると解釈されるべきではない。この説明は、明白に記述される実施形態を任意の数の開示される要素および／または好ましい要素と組み合わせた実施形態を支持し、包含すると理解されるべきである。さらに、本出願において記述されるすべての要素の任意の並べ替えおよび組合せは、文脈上特に指示されない限り、本出願の説明によって開示されていると見なされるべきである。
好ましくは、本明細書で使用される用語は、"Ａ ｍｕｌｔｉｌｉｎｇｕａｌ ｇｌｏｓｓａｒｙ ｏｆ ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｃａｌ ｔｅｒｍｓ：（ＩＵＰＡＣ Ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎｓ）"，Ｈ．Ｇ．Ｗ．Ｌｅｕｅｎｂｅｒｇｅｒ，Ｂ．Ｎａｇｅｌ，ａｎｄ Ｈ．Ｋoｌｂｌ，Ｅｄｓ．，Ｈｅｌｖｅｔｉｃａ Ｃｈｉｍｉｃａ Ａｃｔａ，ＣＨ−４０１０ Ｂａｓｅｌ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ，（１９９５）に記載されているように定義される。
本発明の実施は、特に指示されない限り、当分野の文献（例えばＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｊ．Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ １９８９参照）中で説明される生化学、細胞生物学、免疫学および組換えＤＮＡ技術の従来の方法を用いる。
本明細書および以下の特許請求の範囲全体を通じて、文脈上特に要求されない限り、「含む」という語および「含むこと」などの変形は、記述される成員、整数もしくは工程または成員、整数もしくは工程の群の包含を意味するが、いかなる他の成員、整数もしくは工程または成員、整数もしくは工程の群の排除も意味しないと理解され、しかし一部の実施形態では、そのような他の成員、整数もしくは工程または成員、整数もしくは工程の群が排除され得る、すなわち主題が記述される成員、整数もしくは工程または成員、整数もしくは工程の群の包含に存する。本発明を説明することに関連して（特に特許請求の範囲に関連して）使用される「１つの」および「その」という用語および同様の言及は、本明細書で特に指示されない限りまたは文脈により明らかに否定されない限り、単数および複数の両方を包含すると解釈されるべきである。本明細書中の値の範囲の列挙は、単にその範囲内に含まれる各々別々の値を個別に言及することの簡略化された方法であることを意図している。本明細書で特に指示されない限り、各個別の値は、本明細書で個別に列挙されているかのごとくに本明細書に組み込まれる。
本明細書で述べるすべての方法は、本明細書で特に指示されない限りまたは文脈により明らかに否定されない限り、任意の適切な順序で実施することができる。本明細書で提供されるありとあらゆる例または例示的言語（例えば「など」）の使用は、単に本発明をよりよく説明することを意図しており、別段に特許請求される本発明の範囲に限定を課すものではない。本明細書中のいかなる言語も、本発明の実施に必須の特許請求されない要素を指示すると解釈されるべきではない。
本明細書の本文全体を通じていくつかの資料を引用する。本明細書で引用される資料（すべての特許、特許出願、学術出版物、製造者の仕様書、指示書等を含む）の各々は、上記または下記のいずれでも、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。本明細書のいかなる内容も、本発明が先行発明のためにそのような開示に先行する権利を有さないことの承認と解釈されるべきではない。
本発明に関連して「組換え」という用語は、「遺伝子工学を通して作製された」ことを意味する。好ましくは、本発明に関連して組換え細胞などの「組換え物」は、天然には存在しない。
本明細書で使用される「天然に存在する」という用語は、ある物体が自然界で見出すことができるという事実を指す。例えば、生物（ウイルスを含む）中に存在し、自然界の供給源から単離することができ、実験室において人間によって意図的に改変されていないペプチドまたは核酸は、天然に存在する。
「免疫応答」という用語は、抗原に対する統合された身体応答を指し、好ましくは細胞性免疫応答または細胞性ならびに体液性免疫応答を指す。免疫応答は、防御的／防止的／予防的および／または治療的であり得る。
「免疫応答を誘導する」とは、誘導前は特定の抗原に対する免疫応答が存在しなかったことを意味し得るが、また、誘導前に特定の抗原に対する一定レベルの免疫応答が存在し、誘導後に前記免疫応答が増強されることも意味し得る。したがって、「免疫応答を誘導する」には、「免疫応答を増強する」も包含される。好ましくは、被験体において免疫応答を誘導した後、前記被験体は癌疾患などの疾患の発症から防御されるかまたは免疫応答を誘導することによって疾患状態が改善される。例えば、ＣＬＤＮ６などの腫瘍関連抗原に対する免疫応答を、癌疾患を有する患者または癌疾患を発症する危険性がある被験体において誘導し得る。この場合免疫応答を誘導するとは、被験体の疾患状態が改善されること、被験体が転移を発症しないこと、または癌疾患を発症する危険性がある被験体が癌疾患を発症しないことを意味し得る。
「細胞性免疫応答」、「細胞性応答」、「抗原に対する細胞性応答」または同様の用語は、クラスＩまたはクラスＩＩ ＭＨＣによる抗原の提示を特徴とする細胞に対する細胞性応答を含むことが意図されている。細胞性応答は、「ヘルパー」または「キラー」のいずれかとして働くＴ細胞またはＴリンパ球と呼ばれる細胞に関する。ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋Ｔ細胞とも称される）は、免疫応答を調節することによって中心的な役割を果たし、キラー細胞（細胞傷害性Ｔ細胞、細胞溶解性Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞またはＣＴＬとも称される）は、癌細胞などの疾患細胞を死滅させ、さらなる疾患細胞の産生を防止する。
「抗原」という用語は、それに対する免疫応答が誘発されるべきであるおよび／または免疫応答の対象となるエピトープを含む作用物質に関する。好ましくは、本発明に関連して抗原は、場合によりプロセシング後に、好ましくは抗原に対してまたは抗原を発現するおよび／もしくは提示する細胞に対して特異的である免疫反応を誘導する分子である。「抗原」という用語は、特にタンパク質およびペプチドを包含する。抗原は、好ましくは天然に存在する抗原に対応するまたは由来する生成物である。そのような天然に存在する抗原は、腫瘍関連抗原を含み得るかまたは腫瘍関連抗原に由来し得る。
特に、抗原またはそのペプチドフラグメントは、Ｔ細胞受容体によって認識可能であるべきである。好ましくは、抗原またはペプチドは、Ｔ細胞受容体によって認識された場合、適切な共刺激シグナルの存在下で、抗原またはペプチドを認識するＴ細胞受容体を担持するＴ細胞のクローン性増殖を誘導することができる。本発明の実施形態に関連して、抗原は、好ましくは細胞によって、好ましくは抗原提示細胞および／または疾患細胞によって、ＭＨＣ分子に関連して提示され、それが、抗原（または抗原を提示する細胞）に対する免疫反応を生じさせ得る。
好ましい実施形態では、抗原は、腫瘍関連抗原、すなわち細胞質、細胞表面および細胞核に由来し得る癌細胞の成分であり、特に細胞内でまたは癌細胞上の表面抗原として、好ましくは大量に産生される抗原である。
本発明に関連して、「腫瘍関連抗原」または「腫瘍抗原」という用語は、正常条件下では限られた数の組織および／もしくは器官においてまたは特定の発生段階で特異的に発現されるタンパク質に関し、例えば腫瘍関連抗原は、正常条件下では胃組織、好ましくは胃粘膜において、生殖器官、例えば精巣において、栄養膜組織、例えば胎盤において、または生殖系列細胞において特異的に発現され得、および１つ以上の腫瘍または癌組織において発現されるまたは異常発現される。これに関連して、「限られた数」は、好ましくは３以下、より好ましくは２以下を意味する。本発明に関連して腫瘍関連抗原には、例えば分化抗原、好ましくは細胞型特異的分化抗原、すなわち正常条件下では特定の発生段階で特定の細胞型において特異的に発現されるタンパク質、癌／精巣抗原、すなわち正常条件下では精巣においておよび時として胎盤において特異的に発現されるタンパク質、ならびに生殖細胞特異抗原が含まれる。本発明に関連して、腫瘍関連抗原は、好ましくは癌細胞の細胞表面と会合しており、好ましくは正常組織では全く発現されないかまたは極めてまれにしか発現されない。好ましくは、腫瘍関連抗原または腫瘍関連抗原の異常発現は癌細胞を同定する。本発明に関連して、被験体、例えば癌疾患に罹患している患者において癌細胞によって発現される腫瘍関連抗原は、好ましくは前記被験体における自己タンパク質である。好ましい実施形態では、本発明に関連して腫瘍関連抗原は、正常条件下では、必須ではない組織もしくは器官、すなわち免疫系によって損傷された場合被験体の死をもたらさない組織もしくは器官において、または免疫系がアクセスできないもしくはほとんどアクセスできない身体の器官もしくは構造体において特異的に発現される。好ましくは、腫瘍関連抗原のアミノ酸配列は、正常組織で発現される腫瘍関連抗原と癌組織で発現される腫瘍関連抗原との間で同一である。好ましくは、腫瘍関連抗原は、それが発現されている癌細胞によって提示される。
本発明の様々な態様は腫瘍関連抗原ＣＬＤＮ６を含み、本発明は、前記腫瘍関連抗原を発現し、および好ましくは前記腫瘍関連抗原をクラスＩ ＭＨＣと共に提示する癌細胞に対する抗腫瘍ＣＴＬ反応の刺激または提供を含み得る。
クローディンは、密着結合の最も重要な成分であるタンパク質のファミリーであり、密着結合においてクローディンは上皮の細胞の間の細胞間隙中の分子の流れを制御する傍細胞バリアを確立する。クローディンは膜を４回横切る膜貫通タンパク質であり、Ｎ末端およびＣ末端の両方が細胞質内に位置する。ＥＣ１またはＥＣＬ１と称される第一細胞外ループは平均で５３アミノ酸から成り、ＥＣ２またはＥＣＬ２と称される第二細胞外ループは約２４アミノ酸から成る。ＣＬＤＮ６などのクローディンファミリーの細胞表面タンパク質は、様々な起源の腫瘍で発現され、それらの選択的発現（毒性に関連する正常組織では発現されない）および形質膜への局在のゆえに抗体媒介性癌免疫療法に関連する標的構造体として特に適する。
ＣＬＤＮ６は腫瘍組織において特異的に発現されると同定されており、ＣＬＤＮ６を発現する唯一の正常組織は胎盤である。
ＣＬＤＮ６は、例えば卵巣癌、肺癌、胃癌、乳癌、肝癌、膵癌、皮膚癌、黒色腫、頭頸部癌、肉腫、胆管癌、腎細胞癌および膀胱癌において発現されることが認められている。ＣＬＤＮ６は、卵巣癌、特に卵巣腺癌および卵巣奇形癌、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）および非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）を含む肺癌、特に肺扁平上皮癌および腺癌、胃癌、乳癌、肝癌、膵癌、皮膚癌、特に基底細胞癌および扁平上皮癌、悪性黒色腫、頭頸部癌、特に悪性多形腺腫、肉腫、特に滑膜肉腫および癌肉腫、胆管癌、膀胱の癌、特に移行上皮癌および乳頭状癌、腎癌、特に腎明細胞癌および乳頭状腎細胞癌を含む腎細胞癌、結腸癌、回腸の癌を含む小腸癌、特に小腸腺癌および回腸の腺癌、精巣胎生期癌、胎盤絨毛癌、子宮頸癌、精巣癌、特に精巣セミノーマ、精巣奇形腫および胎生期精巣癌、子宮癌、奇形癌または胎生期癌などの生殖細胞腫瘍、特に精巣の生殖細胞腫瘍、ならびにそれらの転移形態の予防および／または処置のための特に好ましい標的である。１つの実施形態では、ＣＬＤＮ６発現に関連する癌疾患は、卵巣癌、肺癌、転移性卵巣癌および転移性肺癌から成る群より選択される。好ましくは、卵巣癌は癌腫または腺癌である。好ましくは、肺癌は癌腫または腺癌であり、および好ましくは細気管支癌腫または細気管支腺癌などの細気管支癌である。
本明細書で使用される「ＣＬＤＮ」という用語はクローディンを意味し、ＣＬＤＮ６を包含する。好ましくは、クローディンはヒトクローディンである。「ＣＬＤＮ６」という用語はクローディン６に関し、そのあらゆる変異体を包含する。
「ＣＬＤＮ６」という用語は、好ましくはヒトＣＬＤＮ６、特に、配列表の配列番号：１もしくは配列番号：２のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含む、好ましくはそれから成るタンパク質に関する。ＣＬＤＮ６の第一細胞外ループは、好ましくは配列番号：１に示すアミノ酸配列または配列番号：２に示すアミノ酸配列のアミノ酸２８〜８０、より好ましくはアミノ酸２８〜７６を含む。ＣＬＤＮ６の第二細胞外ループは、好ましくは配列番号：１に示すアミノ酸配列または配列番号：２に示すアミノ酸配列のアミノ酸１３８〜１６０、好ましくはアミノ酸１４１〜１５９、より好ましくはアミノ酸１４５〜１５７を含む。前記第一および第二細胞外ループは、好ましくはＣＬＤＮ６の細胞外部分を形成する。
本発明による「変異体」という用語は、特に、突然変異体、スプライス変異体、立体配座変異体、アイソフォーム、対立遺伝子変異体、種変異体および種ホモログ、特に天然に存在するものを指す。対立遺伝子変異体は、遺伝子の正常な配列中の変化に関するが、その重要性はしばしば不明確である。完全な遺伝子配列決定は、しばしば所与の遺伝子について数多くの対立遺伝子変異体を同定する。種ホモログは、所与の核酸配列またはアミノ酸配列のものとは異なる種を起源とする核酸配列またはアミノ酸配列である。「変異体」という用語は、任意の翻訳後修飾変異体および立体配座変異体を包含する。
本発明の様々な態様によれば、その目的は、好ましくは、ＣＬＤＮ６を発現し、および好ましくはＣＬＤＮ６の提示を特徴とする癌細胞に対する免疫応答を誘導するまたは判定すること、ならびにＣＬＤＮ６を発現する細胞を含む癌疾患を診断、処置または予防することである。好ましくは、免疫応答は、ＣＬＤＮ６を発現し、および好ましくはＣＬＤＮ６をクラスＩ ＭＨＣと共に提示する癌細胞に対する抗ＣＬＤＮ６ ＣＴＬ反応の刺激を含む。
本発明によれば、「ＣＬＤＮ６陽性癌」という用語または同様の用語は、ＣＬＤＮ６を、好ましくは自らの表面にＣＬＤＮ６を発現する癌細胞を含む癌を意味する。あるいはまたは加えて、ＣＬＤＮ６を発現する前記癌細胞は、ＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する。ＭＨＣに関連してＣＬＤＮ６を提示する癌細胞は、Ｔ細胞受容体を担持する免疫反応性細胞によって標的とされ得、一方、表面にＣＬＤＮ６を発現する癌細胞は、人工Ｔ細胞受容体を担持する免疫反応性細胞によって標的とされ得る。
「細胞表面」は、当分野におけるその通常の意味に従って使用され、したがってタンパク質および他の分子による結合が可能である細胞の外側を含む。
ＣＬＤＮ６は、細胞の表面に位置する場合、前記細胞の表面に発現され、前記細胞に添加されたＣＬＤＮ６特異的抗体による結合が可能である。
本発明に関連して「細胞外部分」または「エキソドメイン」という用語は、細胞の細胞外空間に面しており、および好ましくは、例えば細胞の外側に位置する抗体などの抗原結合分子によって、前記細胞の外側からアクセス可能である、タンパク質などの分子の一部を指す。好ましくは、この用語は、１つ以上の細胞外ループもしくはドメインまたはそのフラグメントを指す。
「部分」という用語は画分を指す。アミノ酸配列またはタンパク質などの特定の構造体に関して、その「部分」という用語は、前記構造体の連続画分または不連続画分を表し得る。好ましくは、アミノ酸配列の部分は、前記アミノ酸配列のアミノ酸の少なくとも１％、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、好ましくは少なくとも５０％、より好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも７０％、さらにより好ましくは少なくとも８０％、最も好ましくは少なくとも９０％を含む。好ましくは、部分が不連続画分である場合、前記不連続画分は、構造体の２、３、４、５、６、７、８以上のパートで構成され、各々のパートは構造体の連続する要素である。例えば、アミノ酸配列の不連続画分は、前記アミノ酸配列の２、３、４、５、６、７、８以上、好ましくは４以下のパートで構成され、ここで各々のパートは、好ましくは、アミノ酸配列の少なくとも５個の連続するアミノ酸、少なくとも１０個の連続するアミノ酸、好ましくは少なくとも２０個の連続するアミノ酸、好ましくは少なくとも３０個の連続するアミノ酸を含む。
「パート」および「フラグメント」という用語は、本明細書では交換可能に使用され、連続する要素を指す。例えば、アミノ酸配列またはタンパク質などの構造体の１つのパートは、前記構造体の１つの連続する要素を指す。構造体の部分、パートまたはフラグメントは、好ましくは前記構造体の１つ以上の機能的特性を含む。例えば、エピトープ、ペプチドまたはタンパク質の部分、パートまたはフラグメントは、好ましくはそれが由来するエピトープ、ペプチドまたはタンパク質と免疫学的に等価である。本発明に関連して、アミノ酸配列などの構造体の「パート」は、好ましくは構造体全体またはアミノ酸配列の少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９２％、少なくとも９４％、少なくとも９６％、少なくとも９８％、少なくとも９９％を含み、好ましくはそれから成る。タンパク質配列のパートまたはフラグメントは、好ましくはタンパク質配列の少なくとも６個、特に少なくとも８個、少なくとも１２個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも３０個、少なくとも５０個または少なくとも１００個の連続するアミノ酸の配列を含む。上記で論じた部分、パートまたはフラグメントは、本明細書で使用される「変異体」の用語に包含される。
本発明によれば、ＣＬＤＮ６は、発現のレベルが胎盤細胞または胎盤組織での発現に比べてより低い場合、細胞において実質的に発現されない。好ましくは、発現のレベルは、胎盤細胞または胎盤組織での発現の１０％未満、好ましくは５％、３％、２％、１％、０．５％、０．１％もしくは０．０５％未満であるかまたはさらに一層低い。好ましくは、ＣＬＤＮ６は、発現のレベルが胎盤以外の非癌性組織での発現のレベルをせいぜい２倍だけ、好ましくは１．５倍だけ上回る場合、および好ましくは前記非癌性組織での発現のレベルを上回らない場合、細胞において実質的に発現されない。好ましくは、ＣＬＤＮ６は、発現のレベルが検出限界より低い場合および／または発現のレベルが、細胞に添加されたＣＬＤＮ６特異的抗体による結合を許容しないほど低い場合、細胞において実質的に発現されない。
本発明によれば、ＣＬＤＮ６は、発現のレベルが胎盤以外の非癌性組織での発現のレベルを好ましくは２倍以上、好ましくは１０倍、１００倍、１０００倍または１００００倍以上上回る場合、細胞において発現される。好ましくは、ＣＬＤＮ６は、発現のレベルが検出限界より高い場合および／または発現のレベルが、細胞に添加されたＣＬＤＮ６特異的抗体による結合を可能にするのに十分なだけ高い場合、細胞において発現される。好ましくは、細胞において発現されるＣＬＤＮ６は、前記細胞の表面に発現されるまたは暴露される。
「標的細胞」は、細胞性免疫応答などの免疫応答の標的である細胞を意味する。標的細胞には、抗原または抗原エピトープ、すなわち抗原に由来するペプチドフラグメントを提示する細胞が含まれ、および癌細胞などの任意の望ましくない細胞が含まれる。好ましい実施形態では、標的細胞は、好ましくは細胞表面に存在するおよび／またはクラスＩ ＭＨＣと共に提示されるＣＬＤＮ６を発現する細胞である。
「エピトープ」という用語は、抗原などの分子内の抗原決定基、すなわち、特にＭＨＣ分子に関連して提示される場合、免疫系によって認識される、例えばＴ細胞によって認識される分子中のパートまたは分子のフラグメントを指す。腫瘍関連抗原などのタンパク質のエピトープは、好ましくは前記タンパク質の連続部分または不連続部分を含み、好ましくは５〜１００、好ましくは５〜５０、より好ましくは８〜３０、最も好ましくは１０〜２５アミノ酸長であり、例えばエピトープは、好ましくは９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５アミノ酸長であり得る。本発明に関連してエピトープはＴ細胞エピトープであることが特に好ましい。
「エピトープ」、「抗原フラグメント」、「抗原ペプチド」または「免疫原性ペプチド」などの用語は、本明細書では交換可能に使用され、好ましくは、抗原に対するまたは抗原を発現するかもしくは含み、および好ましくは抗原を提示する細胞に対する免疫応答を惹起する能力を有する抗原の不完全な表現体に関する。好ましくは、これらの用語は抗原の免疫原性部分に関する。好ましくは、それは、特にＭＨＣ分子に関連して提示された場合、Ｔ細胞受容体によって認識される（すなわち特異的に結合される）抗原の部分である。特定の好ましい免疫原性部分は、細胞の表面などのＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ分子に結合し、したがってＭＨＣ結合ペプチドである。本明細書で使用される場合、ペプチドは、そのような結合が当分野で公知の任意のアッセイを用いて検出可能である場合、ＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ分子に「結合する」と言われる。
好ましくは、配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含む、本明細書で開示されるペプチドは、ＣＬＤＮ６またはＣＬＤＮ６の発現を特徴とし、および好ましくはＣＬＤＮ６の提示を特徴とする細胞に対する免疫応答、好ましくは細胞性応答を刺激する能力を有する。好ましくは、そのようなペプチドは、クラスＩ ＭＨＣによるＣＬＤＮ６の提示を特徴とする細胞に対する細胞性応答を刺激する能力を有し、好ましくはＣＬＤＮ６応答性ＣＴＬを刺激する能力を有する。好ましくは、本発明によるペプチドは、ＭＨＣクラスＩおよび／もしくはクラスＩＩ提示ペプチドであるか、またはＭＨＣクラスＩおよび／もしくはクラスＩＩ提示ペプチドを産生するようにプロセシングされ得る。好ましくは、ＭＨＣ分子に結合する配列は、配列番号：３、４および５から選択される。
抗原ペプチドが直接提示される、すなわちプロセシングされずに、特に切断されずに提示される場合、前記抗原ペプチドは、ＭＨＣ分子、特にクラスＩ ＭＨＣ分子に結合するのに適した長さを有し、好ましくは７〜２０アミノ酸長、より好ましくは７〜１２アミノ酸長、より好ましくは８〜１１アミノ酸長、特に９または１０アミノ酸長である。好ましくは、直接提示される抗原ペプチドの配列は、配列番号：３、４および５から選択される配列に実質的に対応し、好ましくは完全に同一である。
抗原ペプチドがプロセシング後に、特に切断後に提示される場合、プロセシングによって生成されるペプチドは、ＭＨＣ分子、特にクラスＩ ＭＨＣ分子に結合するのに適した長さを有し、好ましくは７〜２０アミノ酸長、より好ましくは７〜１２アミノ酸長、より好ましくは８〜１１アミノ酸長、特に９または１０アミノ酸長である。好ましくは、プロセシング後に提示されるペプチドの配列は、配列番号：３、４および５から選択される配列に実質的に対応し、好ましくは完全に同一である。したがって、１つの実施形態では本発明による抗原ペプチドは、配列番号：３、４および５から選択される配列を含み、抗原ペプチドのプロセシング後に配列番号：３、４および５から選択される配列を形成する。
ＭＨＣによって提示されるペプチドの配列に実質的に対応するアミノ酸配列を有するペプチドは、ＭＨＣによって提示された場合のペプチドのＴＣＲ認識に必須ではないまたはＭＨＣへのペプチド結合に必須ではない１つ以上の残基において異なっていてもよい。そのような実質的に対応するペプチドは、好ましくは抗原特異的ＣＴＬなどの抗原特異的細胞性応答を刺激する能力も有する。ＴＣＲ認識に影響を及ぼさないがＭＨＣへの結合の安定性を改善する残基において提示ペプチドとは異なるアミノ酸配列を有するペプチドは、抗原ペプチドの免疫原性を改善することができ、本明細書では「最適化ペプチド」と称され得る。これらの残基のいずれがＭＨＣまたはＴＣＲのどちらかへの結合に影響を及ぼす可能性がより高いと考えられるかについての既存の知識を利用して、実質的に対応するペプチドの設計への合理的なアプローチを使用し得る。生じる機能性のペプチドは、抗原ペプチドとして企図される。上記で論じた配列は、本明細書で使用される「変異体」の用語に包含される。
「抗原プロセシング」は、抗原の、その抗原のフラグメントであるプロセシング産物への分解（例えばタンパク質のペプチドへの分解）、および細胞、好ましくは抗原提示細胞による特異的Ｔ細胞への提示のための、ＭＨＣ分子とこれらのフラグメントの１つ以上との会合（例えば結合による）を指す。
抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、その表面に主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）に関連して抗原を展示する細胞である。Ｔ細胞は、そのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を利用してこの複合体を認識し得る。抗原提示細胞は抗原をプロセシングし、それをＴ細胞に提示する。
プロフェッショナル抗原提示細胞は、食作用または受容体媒介性エンドサイトーシスのいずれかによって抗原をインターナライズし、次にＭＨＣクラスＩＩ分子に結合した抗原のフラグメントをその膜上に展示するうえで非常に効率的である。Ｔ細胞は、抗原提示細胞の膜上の抗原−クラスＩＩ ＭＨＣ分子複合体を認識し、これと相互作用する。次に、さらなる共刺激シグナルが抗原提示細胞によって生成され、Ｔ細胞の活性化をもたらす。共刺激分子の発現はプロフェッショナル抗原提示細胞の決定的な特徴である。抗原提示細胞には、プロフェッショナル抗原提示細胞と非プロフェッショナル抗原提示細胞が含まれる。
プロフェッショナル抗原提示細胞の主な種類は、最も広範囲の抗原提示を有し、おそらく最も重要な抗原提示細胞である樹状細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および特定の活性化上皮細胞である。
非プロフェッショナル抗原提示細胞は、ナイーブＴ細胞との相互作用に必要なＭＨＣクラスＩＩタンパク質を構成的に発現しない；これらは、ＩＦＮγなどの特定のサイトカインによる非プロフェッショナル抗原提示細胞の刺激後にのみ発現される。
樹状細胞（ＤＣ）は、末梢組織中で捕獲された抗原を、ＭＨＣクラスＩＩおよびクラスＩの両方の抗原提示経路によってＴ細胞に提示する白血球集団である。樹状細胞が免疫応答の強力な誘導物質であり、これらの細胞の活性化が抗腫瘍免疫の誘導のための重要な段階であることは周知である。
樹状細胞および前駆細胞は、末梢血、骨髄、腫瘍浸潤細胞、腫瘍周囲組織浸潤細胞、リンパ節、脾臓、皮膚、臍帯血または任意の他の適切な組織もしくは体液から入手し得る。例えば樹状細胞は、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−４、ＩＬ−１３および／またはＴＮＦαなどのサイトカインの組合せを、末梢血から採取した単球の培養物に添加することによってエクスビボで分化させ得る。あるいは、末梢血、臍帯血または骨髄から採取したＣＤ３４陽性細胞を、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−３、ＴＮＦα、ＣＤ４０リガンド、ＬＰＳ、ｆｌｔ３リガンドならびに／または樹状細胞の分化、成熟および増殖を誘導する他の化合物の組合せを培地に添加することによって樹状細胞へと分化させ得る。
樹状細胞は、「未熟」細胞および「成熟」細胞として好都合に分類され、これは、２つの十分に特性付けられた表現型を区別する簡単な方法として使用できる。しかし、この命名法は分化のすべての可能な中間段階を除外すると解釈されるべきでない。
未熟樹状細胞は、抗原の取込みおよびプロセシングのための高い能力を有する抗原提示細胞として特性付けられ、前記能力はＦｃγ受容体およびマンノース受容体の高発現と相関する。成熟表現型は、典型的にはこれらのマーカーのより低い発現を特徴とするが、クラスＩおよびクラスＩＩ ＭＨＣ、接着分子（例えばＣＤ５４およびＣＤ１１）ならびに共刺激分子（例えばＣＤ４０、ＣＤ８０、ＣＤ８６および４−１ＢＢ）などのＴ細胞活性化を担う細胞表面分子の高発現によっても特性付けられる。
樹状細胞の成熟は、そのような抗原提示樹状細胞がＴ細胞のプライミングをもたらす樹状細胞活性化の状態と称されるが、未熟樹状細胞による提示は寛容を生じさせる。樹状細胞の成熟は、主として、先天的受容体によって検出される微生物特徴を有する生体分子（細菌ＤＮＡ、ウイルスＲＮＡ、内毒素等）、炎症誘発性サイトカイン（ＴＮＦ、ＩＬ−１、ＩＦＮ）、ＣＤ４０Ｌによる樹状細胞表面上のＣＤ４０の連結、およびストレス性細胞死を受けた細胞から放出される物質によって引き起こされる。樹状細胞は、骨髄細胞を、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）および腫瘍壊死因子αなどのサイトカインと共にインビトロで培養することによって誘導できる。
抗原提示細胞または標的細胞などの細胞は、細胞を暴露する、すなわちペプチドで細胞をパルスするか、またはペプチドをコードする核酸、好ましくはＲＮＡもしくは提示されるべきペプチド、例えば抗原をコードする核酸を含むタンパク質を細胞に形質導入することによってＭＨＣクラスＩ提示ペプチドを負荷することができる。
一部の実施形態では、本発明の医薬組成物は、抗原ペプチドを負荷された抗原提示細胞を含む。これに関して、プロトコルは、人工的に抗原ペプチドを提示するように操作された樹状細胞のインビトロ培養／分化に基づき得る。遺伝子操作された樹状細胞の作製は、抗原または抗原ペプチドをコードする核酸の樹状細胞への導入を含み得る。ｍＲＮＡでの樹状細胞のトランスフェクションは、強力な抗腫瘍免疫を刺激する有望な抗原負荷技術である。そのようなトランスフェクションはエクスビボで行うことができ、次にそのようなトランスフェクトされた細胞を含む医薬組成物を治療目的に使用し得る。あるいは、樹状細胞または他の抗原提示細胞を標的とする遺伝子送達ビヒクルを患者に投与し、インビボでトランスフェクションを生じさせ得る。樹状細胞のインビボおよびエクスビボトランスフェクションは、例えば、国際公開第ＷＯ９７／２４４４７号に記載されているような当分野で公知の任意の方法を用いて、またはＭａｈｖｉ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ ７５：４５６−４６０，１９９７によって記述されている遺伝子銃アプローチを用いて一般に実施し得る。樹状細胞の抗原負荷は、樹状細胞または前駆細胞を抗原、ＤＮＡ（裸もしくはプラスミドベクター内の）またはＲＮＡと共に、または抗原を発現する組換え細菌もしくはウイルス（例えばワクシニアウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルスもしくはレンチウイルスベクター）と共にインキュベートすることによって達成し得る。
「免疫原性」という用語は、免疫反応を誘導する抗原の相対的効率に関する。
本発明に関連して「免疫エフェクター機能」という用語は、例えば腫瘍細胞の死滅、または腫瘍の播種および転移の阻害を含む腫瘍増殖の阻害および／もしくは腫瘍発生の阻害をもたらす、免疫系の成分によって媒介される任意の機能を包含する。好ましくは、本発明に関連して免疫エフェクター機能は、Ｔ細胞媒介性エフェクター機能である。そのような機能には、ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋Ｔ細胞）の場合は、Ｔ細胞受容体によるＭＨＣクラスＩＩ分子に関連した抗原または抗原由来の抗原ペプチドの認識、サイトカインの放出ならびに／またはＣＤ８＋リンパ球（ＣＴＬ）および／もしくはＢ細胞の活性化が含まれ、ＣＴＬの場合は、Ｔ細胞受容体によるＭＨＣクラスＩ分子に関連した抗原または抗原由来の抗原ペプチドの認識、ＭＨＣクラスＩ分子に関連して提示される細胞、すなわちクラスＩ ＭＨＣによる抗原の提示を特徴とする細胞の、例えばアポトーシスまたはパーフォリン媒介性細胞溶解による排除、ＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−αなどのサイトカインの産生、ならびに抗原を発現する標的細胞の特異的細胞溶解性死滅が含まれる。
本発明に関連して「免疫反応性細胞」または「免疫エフェクター細胞」という用語は、免疫反応の間にエフェクター機能を及ぼす細胞に関する。「免疫反応性細胞」は、好ましくは細胞の表面に発現される抗原などの抗原、または抗原もしくは抗原由来の抗原ペプチドの提示を特徴とする細胞に結合し、免疫応答を媒介する能力を有する。例えばそのような細胞は、サイトカインおよび／またはケモカインを分泌し、微生物を死滅させ、抗体を分泌し、感染細胞または癌性細胞を認識し、および場合によりそのような細胞を排除する。例えば、免疫反応性細胞には、Ｔ細胞（細胞傷害性Ｔ細胞、ヘルパーＴ細胞、腫瘍浸潤性Ｔ細胞）、Ｂ細胞、ナチュラルキラー細胞、好中球、マクロファージおよび樹状細胞が含まれる。好ましくは、本発明に関連して、「免疫反応性細胞」はＴ細胞、好ましくはＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞である。
好ましくは、「免疫反応性細胞」は、抗原または抗原由来の抗原ペプチドを、特に抗原提示細胞または癌細胞などの疾患細胞の表面上などにＭＨＣ分子に関連して提示された場合、ある程度の特異性で認識する。好ましくは、前記認識は、抗原または前記抗原に由来する抗原ペプチドを認識する細胞が応答性または反応性になることを可能にする。細胞が、ＭＨＣクラスＩＩ分子に関連して抗原または抗原由来の抗原ペプチドを認識する受容体を担持するヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋Ｔ細胞）である場合、そのような応答性または反応性は、サイトカインの放出ならびに／またはＣＤ８＋リンパ球（ＣＴＬ）および／もしくはＢ細胞の活性化を含み得る。細胞がＣＴＬである場合、そのような応答性または反応性は、ＭＨＣクラスＩ分子に関連して提示される細胞、すなわちクラスＩ ＭＨＣによる抗原の提示を特徴とする細胞の、例えばアポトーシスまたはパーフォリン媒介性細胞溶解による排除を含み得る。本発明によれば、ＣＴＬ応答性には、持続的なカルシウム流動、細胞分裂、ＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−αなどのサイトカインの産生、ＣＤ４４およびＣＤ６９などの活性化マーカーの上方調節、ならびに抗原を発現する標的細胞の特異的細胞溶解性死滅が含まれ得る。ＣＴＬ応答性はまた、ＣＴＬ応答性を正確に示す人工レポーターを使用して決定してもよい。抗原または抗原由来の抗原ペプチドを認識し、応答性または反応性であるそのようなＣＴＬは、本明細書では「抗原応答性ＣＴＬ」とも称される。細胞がＢ細胞である場合、そのような応答性は免疫グロブリンの放出を含み得る。
本発明によれば、「免疫反応性細胞」という用語は、適切な刺激で免疫細胞（例えばＴ細胞、特にＴヘルパー細胞または細胞溶解性Ｔ細胞）に成熟することができる細胞も包含する。免疫反応性細胞には、ＣＤ３４＋造血幹細胞、未熟および成熟Ｔ細胞ならびに未熟および成熟Ｂ細胞が含まれる。抗原を認識する細胞溶解性またはＴヘルパー細胞の産生を所望する場合は、免疫反応性細胞を、細胞溶解性Ｔ細胞およびＴヘルパー細胞の産生、分化および／または選択を促す条件下で抗原または抗原ペプチドを提示する細胞と接触させる。抗原に暴露された場合、Ｔ細胞前駆体の細胞溶解性Ｔ細胞への分化は免疫系のクローン選択に類似する。
「リンパ系細胞」は、場合により適切な修飾後に、例えばＴ細胞受容体の移入後に、細胞性免疫応答などの免疫応答を生じさせる能力を有する細胞、またはそのような細胞の前駆細胞であり、リンパ球、好ましくはＴリンパ球、リンパ芽球および形質細胞を包含する。リンパ系細胞は、本明細書で述べる免疫反応性細胞であり得る。好ましいリンパ系細胞は、Ｔ細胞受容体の内因性発現を欠き、その細胞表面にそのようなＴ細胞受容体を発現するように修飾され得るＴ細胞である。
「Ｔ細胞」および「Ｔリンパ球」という用語は、本明細書では互換的に使用され、Ｔヘルパー細胞（ＣＤ４＋Ｔ細胞）および細胞溶解性Ｔ細胞を含む細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ、ＣＤ８＋Ｔ細胞）が含まれる。
Ｔ細胞は、リンパ球として公知の白血球の群に属し、細胞媒介性免疫に中心的な役割を果たす。これらは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）と呼ばれるその細胞表面上の特殊な受容体の存在によって、Ｂ細胞およびナチュラルキラー細胞などの他のリンパ球型から識別され得る。胸腺はＴ細胞の成熟に関与する主要な器官である。各々が異なる機能を有する、Ｔ細胞のいくつかの異なるサブセットが発見されている。
Ｔヘルパー細胞は、数ある機能の中でも特に、Ｂ細胞の形質細胞への成熟および細胞傷害性Ｔ細胞とマクロファージの活性化を含む免疫学的過程において他の白血球を助ける。これらの細胞は、その表面にＣＤ４タンパク質を発現するため、ＣＤ４＋Ｔ細胞としても知られる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）の表面に発現されるＭＨＣクラスＩＩ分子によってペプチド抗原と共に提示された場合、活性化する。ひとたび活性化すると、これらは速やかに分裂し、能動免疫応答を調節するまたは助ける、サイトカインと呼ばれる小さなタンパク質を分泌する。
細胞傷害性Ｔ細胞は、ウイルス感染細胞および腫瘍細胞を破壊し、移植片拒絶反応にも関与する。これらの細胞は、その表面にＣＤ８糖タンパク質を発現するので、ＣＤ８＋Ｔ細胞としても知られる。これらの細胞は、身体のほぼあらゆる細胞の表面上に存在する、ＭＨＣクラスＩと会合した抗原に結合することによってその標的を認識する。
Ｔ細胞の大部分は、いくつかのタンパク質の複合体として存在するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を有する。実際のＴ細胞受容体は、独立したＴ細胞受容体アルファおよびベータ（ＴＣＲαおよびＴＣＲβ）遺伝子から産生され、α−ＴＣＲ鎖およびβ−ＴＣＲ鎖と呼ばれる２つの別々のペプチド鎖から成る。γδＴ細胞（ガンマデルタＴ細胞）は、その表面に異なるＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を有するＴ細胞の小さなサブセットである。しかし、γδＴ細胞では、ＴＣＲは１本のγ鎖と１本のδ鎖で構成される。このＴ細胞の群はαβＴ細胞よりもずっと少ない（全Ｔ細胞の２％）。
Ｔ細胞受容体の構造は、抗体の腕の軽鎖と重鎖の組合せと定義される領域である、免疫グロブリンＦａｂフラグメントと非常に類似する。ＴＣＲの各々の鎖は免疫グロブリンスーパーファミリーの成員であり、１つのＮ末端免疫グロブリン（Ｉｇ）可変（Ｖ）ドメイン、１つのＩｇ定常（Ｃ）ドメイン、膜貫通／細胞膜貫通領域、およびＣ末端の短い細胞質尾部を有する。
本発明によれば、「Ｔ細胞受容体の可変領域」という用語は、ＴＣＲ鎖の可変ドメインに関する。
ＴＣＲ α鎖およびβ鎖の両方の可変領域は３つの超可変または相補性決定領域（ＣＤＲ）を有するが、β鎖の可変領域は、通常は抗原と接触せず、それゆえＣＤＲと見なされない超可変性の付加的な領域（ＨＶ４）を有する。ＣＤＲ３は、プロセシングされた抗原の認識を担う主たるＣＤＲであるが、α鎖のＣＤＲ１も抗原ペプチドのＮ末端部分と相互作用することが示されており、一方β鎖のＣＤＲ１はペプチドのＣ末端部分と相互作用する。ＣＤＲ２はＭＨＣを認識すると考えられる。β鎖のＣＤＲ４は抗原認識には関与しないと考えられるが、スーパー抗原と相互作用することが示されている。
本発明によれば、「ＣＤＲ配列の少なくとも１つ」という用語は、好ましくは少なくともＣＤＲ３配列を意味する。「Ｔ細胞受容体鎖のＣＤＲ配列」という用語は、好ましくはＴ細胞受容体のα鎖またはβ鎖のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３に関する。
ＴＣＲドメインの定常ドメインは、システイン残基がジスルフィド結合を形成する短い連結配列から成り、これが２本の鎖間のリンクを形成する。
すべてのＴ細胞は骨髄中の造血幹細胞から生じる。造血幹細胞に由来する造血前駆細胞は、胸腺に存在し、細胞分裂によって増殖して、未熟な胸腺細胞の大きな集団を生成する。最初期の胸腺細胞はＣＤ４またはＣＤ８のいずれも発現せず、それゆえ二重陰性（ＣＤ４−ＣＤ８−）細胞に分類される。これらは、その発生が進むと共に二重陽性胸腺細胞（ＣＤ４＋ＣＤ８＋）になり、最終的には単一陽性（ＣＤ４＋ＣＤ８−またはＣＤ４−ＣＤ８＋）胸腺細胞へと成熟して、その後胸腺から末梢組織に放出される。
Ｔ細胞の活性化における最初のシグナルは、Ｔ細胞受容体が別の細胞上の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）によって提示された短いペプチドに結合することによって与えられる。これは、そのペプチドに特異的なＴＣＲを有するＴ細胞だけが活性化されることを確実にする。パートナー細胞は、通常はプロフェッショナル抗原提示細胞（ＡＰＣ）であり、ナイーブ応答の場合は通常樹状細胞であるが、Ｂ細胞およびマクロファージは重要なＡＰＣであり得る。ＭＨＣクラスＩ分子によってＣＤ８＋Ｔ細胞に提示されるペプチドは８〜１０アミノ酸長である；ＭＨＣクラスＩＩ分子の結合溝の末端は開いているので、ＭＨＣクラスＩＩ分子によってＣＤ４＋Ｔ細胞に提示されるペプチドはより長い。
Ｔ細胞は、一般に標準的な手順を用いてインビトロまたはエクスビボで作製し得る。例えばＴ細胞は、市販の細胞分離システムを使用して、患者などの哺乳動物の骨髄、末梢血または骨髄もしくは末梢血の画分内に存在し得る（またはそこから単離され得る）。あるいは、Ｔ細胞は、関係のあるまたは無関係なヒト、非ヒト動物、細胞株または培養物に由来し得る。「Ｔ細胞を含む試料」は、例えば末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）であり得る。
Ｔ細胞は、抗原、ペプチド、核酸および／または抗原を発現する抗原提示細胞（ＡＰＣ）で刺激され得る。そのような刺激は、抗原、ペプチドおよび／または抗原もしくはペプチドを提示する細胞に特異的なＴ細胞が生成されるのに十分な条件下で十分な時間実施される。
ＣＤ４＋またはＣＤ８＋Ｔ細胞の特異的活性化は様々な方法で検出し得る。特異的Ｔ細胞活性化を検出する方法には、Ｔ細胞の増殖、サイトカイン（例えばリンホカイン）の産生または細胞溶解活性の発生を検出することが含まれる。ＣＤ４＋Ｔ細胞に関しては、特異的Ｔ細胞活性化を検出する好ましい方法は、Ｔ細胞の増殖の検出である。ＣＤ８＋Ｔ細胞に関しては、特異的Ｔ細胞活性化を検出する好ましい方法は、細胞溶解活性の発生の検出である。
ＣＤ８＋Ｔ細胞株を作製するために、抗原を産生する核酸でトランスフェクトした抗原提示細胞、好ましくは自己抗原提示細胞を刺激細胞として使用し得る。
Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）鎖をコードするＲＮＡなどの核酸を、Ｔ細胞または溶解能を有する他の細胞などのリンパ系細胞に導入し得る。適切な実施形態では、ＴＣＲ α鎖およびβ鎖を抗原特異的Ｔ細胞株からクローニングし、養子Ｔ細胞療法に使用する。これに関して、本発明は、本明細書で開示されるＣＬＤＮ６またはＣＬＤＮ６ペプチドに特異的なＴ細胞受容体を提供する。一般に、本発明のこの態様は、ＭＨＣに関連して提示されるＣＬＤＮ６ペプチドを認識するまたはＣＬＤＮ６ペプチドに結合するＴ細胞受容体に関する。Ｔ細胞受容体、例えば本発明に従って提供されるＴ細胞受容体のα鎖およびβ鎖をコードする核酸は、発現ベクターなどの別々の核酸分子上に含まれ得るか、あるいは単一の核酸分子上に含まれてもよい。したがって、「Ｔ細胞受容体をコードする核酸」という用語または同様の用語は、同じ核酸分子上または好ましくは異なる核酸分子上のＴ細胞受容体鎖をコードする核酸分子に関する。
「ペプチドと反応性の免疫反応性細胞」という用語は、特にペプチドが抗原提示細胞または癌細胞などの疾患細胞の表面などにＭＨＣ分子に関連して提示される場合に、そのペプチドを認識したとき、上述した免疫反応性細胞のエフェクター機能を発揮する免疫反応性細胞に関する。
「ペプチドと反応性のＴ細胞受容体」という用語は、免疫反応性細胞上に存在するとき、特にペプチドが抗原提示細胞または癌細胞などの疾患細胞の表面などにＭＨＣ分子に関連して提示される場合に、免疫反応性細胞が上述した免疫反応性細胞のエフェクター機能を発揮するようにそのペプチドを認識するＴ細胞受容体に関する。
「抗原反応性Ｔ細胞」という用語または同様の用語は、抗原提示細胞または癌細胞などの疾患細胞の表面などにＭＨＣ分子に関連して提示される場合に、その抗原を認識し、上述したＴ細胞のエフェクター機能を発揮するＴ細胞に関する。
「抗原特異的リンパ系細胞」という用語は、特に抗原特異的Ｔ細胞受容体を与えられたとき、抗原が抗原提示細胞または癌細胞などの疾患細胞の表面などにＭＨＣ分子に関連して提示される場合に、その抗原を認識し、好ましくは上述したＴ細胞のエフェクター機能を発揮するリンパ系細胞に関する。Ｔ細胞および他のリンパ系細胞は、その細胞が抗原を発現するおよび／または抗原ペプチドを提示する標的細胞を死滅させる場合、抗原に特異的であると見なされる。Ｔ細胞特異性は、様々な標準的技術のいずれかを用いて、例えばクロム放出アッセイまたは増殖アッセイにおいて評価し得る。あるいは、リンホカイン（例えばインターフェロンγ）の合成を測定することもできる。
「主要組織適合遺伝子複合体」という用語およびその略語「ＭＨＣ」は、ＭＨＣクラスＩおよびＭＨＣクラスＩＩ分子を包含し、すべての脊椎動物において生じる遺伝子の複合体に関する。ＭＨＣタンパク質またはＭＨＣ分子は、免疫反応におけるリンパ球と抗原提示細胞または疾患細胞との間のシグナル伝達のために重要であり、ここでＭＨＣタンパク質またはＭＨＣ分子は、ペプチドに結合し、Ｔ細胞受容体による認識のためにそれらを提示する。ＭＨＣによってコードされるタンパク質は、細胞の表面に発現され、自己抗原（前記細胞自体に由来するペプチドフラグメント）および非自己抗原（例えば侵入微生物のフラグメント）の両方をＴ細胞に展示する。
ＭＨＣ領域は３つのサブグループ、クラスＩ、クラスＩＩおよびクラスＩＩＩに分けられる。ＭＨＣクラスＩタンパク質はα鎖およびβ２ミクログロブリン（１５番染色体によってコードされるＭＨＣの一部ではない）を含む。それらは抗原フラグメントを細胞傷害性Ｔ細胞に提示する。大部分の免疫系細胞に関して、特に抗原提示細胞に関して、ＭＨＣクラスＩＩタンパク質はα鎖およびβ鎖を含み、それらは抗原フラグメントをＴヘルパー細胞に提示する。ＭＨＣクラスＩＩＩ領域は、他の免疫成分、例えば補体成分およびサイトカインをコードする一部の成分をコードする。
ヒトでは、細胞表面上の抗原提示タンパク質をコードするＭＨＣ領域内の遺伝子は、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）遺伝子と称される。しかし、ＭＨＣという略語はしばしばＨＬＡ遺伝子産物を指すのに使用される。ＨＬＡ遺伝子には、９個のいわゆる古典的ＭＨＣ遺伝子：ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、ＨＬＡ−Ｃ、ＨＬＡ−ＤＰＡ１、ＨＬＡ−ＤＰＢ１、ＨＬＡ−ＤＱＡ１、ＨＬＡ−ＤＱＢ１、ＨＬＡ−ＤＲＡおよびＨＬＡ−ＤＲＢ１が含まれる。
本発明のすべての態様の１つの好ましい実施形態では、ＭＨＣ分子はＨＬＡ分子である。
「抗原の提示を特徴とする細胞」、「抗原を提示する細胞」、「細胞によって提示される抗原」、「提示される抗原」または同様の表現は、癌細胞などの疾患細胞、またはＭＨＣ分子に関連して、特にＭＨＣクラスＩ分子に関連して、自らが発現する抗原もしくは前記抗原由来のフラグメントを、例えば抗原のプロセシングによって提示する抗原提示細胞などの細胞を意味する。同様に、「抗原の提示を特徴とする疾患」という用語は、特にクラスＩ ＭＨＣによる、抗原の提示を特徴とする細胞を含む疾患を表す。細胞による抗原の提示は、抗原をコードするＲＮＡなどの核酸をその細胞にトランスフェクトすることによって達成され得る。
「提示される抗原のフラグメント」または同様の表現は、フラグメントが、例えば抗原提示細胞に直接添加された場合、ＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ、好ましくはＭＨＣクラスＩによって提示され得ることを意味する。１つの実施形態では、フラグメントは、抗原を発現する細胞によって天然に提示されるフラグメントである。
一部の治療法は、クラスＩ ＭＨＣと共に抗原を提示する疾患細胞の溶解をもたらす、患者の免疫系の反応に基づく。これに関連して、例えば抗原ペプチドとＭＨＣ分子の複合体に特異的な自己細胞傷害性Ｔリンパ球を、疾患を有する患者に投与し得る。そのような細胞傷害性Ｔリンパ球のインビトロでの作製は公知である。Ｔ細胞を分化させる方法の一例は、国際公開第ＷＯ−Ａ−９６３３２６５号に見出すことができる。一般に、血球などの細胞を含む試料を患者から採取し、前記細胞を、複合体を提示し、および細胞傷害性Ｔリンパ球の増殖を引き起こすことができる細胞（例えば樹状細胞）と接触させる。標的細胞は、ＣＯＳ細胞などのトランスフェクト細胞であり得る。これらのトランスフェクト細胞は、所望の複合体をその表面に提示し、細胞傷害性Ｔリンパ球と接触させた場合、後者の増殖を刺激する。その後、クローン増殖させた自己細胞傷害性Ｔリンパ球を患者に投与する。
細胞傷害性Ｔリンパ球を選択する別の方法では、細胞傷害性Ｔリンパ球の特異的クローンを得るためにＭＨＣクラスＩ分子／ペプチド複合体の蛍光性四量体を使用する（Ａｌｔｍａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９６），Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７４：９４−９６；Ｄｕｎｂａｒ ｅｔ ａｌ．（１９９８），Ｃｕｒｒ．Ｂｉｏｌ．８：４１３−４１６，１９９８）。
さらに、所望の複合体を提示する細胞（例えば樹状細胞）を、高い親和性を有する特異的細胞傷害性Ｔリンパ球の増殖をもたらし得る、健常個体または別の種（例えばマウス）の細胞傷害性Ｔリンパ球と組み合わせてもよい。これらの増殖した特異的Ｔリンパ球の高親和性Ｔ細胞受容体をクローニングし、場合により種々の程度にヒト化して、その後このようにして得られたＴ細胞受容体を遺伝子導入によって、例えばレトロウイルスベクターを使用して、患者のＴ細胞に形質導入し得る。次にこれらの遺伝的に改変されたＴリンパ球を使用して養子移入を実施し得る（Ｓｔａｎｉｓｌａｗｓｋｉ ｅｔ ａｌ．（２００１），Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：９６２−７０；Ｋｅｓｓｅｌｓ ｅｔ ａｌ．（２００１），Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：９５７−６１）。
細胞傷害性Ｔリンパ球は、それ自体公知の方法でインビボでも作製し得る。１つの方法は、ＭＨＣクラスＩ／ペプチド複合体を発現する非増殖性細胞を使用する。ここで使用される細胞は、通常複合体を発現するもの、例えば照射された腫瘍細胞または複合体の提示に必要な一方もしくは両方の遺伝子（すなわち抗原ペプチドと提示するＭＨＣ分子）をトランスフェクトされた細胞である。別の好ましい形態は、例えばリポソーム導入または電気穿孔によって細胞に導入し得る組換えＲＮＡの形態での抗原の導入である。生じる細胞は、対象とする複合体を提示し、自己細胞傷害性Ｔリンパ球によって認識され、その後前記自己細胞傷害性Ｔリンパ球が増殖する。
同様の効果は、抗原または抗原ペプチドを、インビボで抗原提示細胞に組み込むことを可能にするためにアジュバントと組み合わせることによって達成され得る。抗原または抗原ペプチドは、タンパク質、ＤＮＡ（例えばベクター内で）またはＲＮＡであり得る。抗原は、プロセシングされてＭＨＣ分子のペプチドパートナーを産生し得るが、そのフラグメントはさらなるプロセシングを必要とせずに提示され得る。後者は、特にこれらがＭＨＣ分子に結合できる場合に当てはまる。完全な抗原がインビボで樹状細胞によってプロセシングされる投与形態が好ましく、というのは、これが、有効な免疫応答に必要なＴヘルパー細胞応答も生じさせ得るからである（Ｏｓｓｅｎｄｏｒｐ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｌｅｔｔ．（２０００），７４：７５−９；Ｏｓｓｅｎｄｏｒｐ ｅｔ ａｌ．（１９９８），Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８７：６９３−７０２）。一般に、有効量の腫瘍関連抗原を、例えば皮内注射によって患者に投与することが可能である。しかし、リンパ節への節内注射も実施し得る（Ｍａｌｏｙ ｅｔ ａｌ．（２００１），Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９８：３２９９−３０３）。
本発明によれば、「人工Ｔ細胞受容体」という用語は、「キメラＴ細胞受容体」および「キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）」という用語と同義である。
これらの用語は、Ｔ細胞などの免疫エフェクター細胞にモノクローナル抗体の特異性などの恣意的な特異性を付与する、遺伝子操作された受容体に関する。このようにして、養子細胞移入のために多数の癌特異的Ｔ細胞を作製することができる。したがって、人工Ｔ細胞受容体は、例えばＴ細胞自体のＴ細胞受容体の代わりにまたはそれに加えて、Ｔ細胞上に存在し得る。そのようなＴ細胞は、標的の認識のために抗原のプロセシングおよび提示を必ずしも必要とせず、むしろ、好ましくは標的細胞上に存在する任意の抗原を特異的に認識し得る。好ましくは、前記人工Ｔ細胞受容体は細胞の表面に発現される。本発明の目的上、人工Ｔ細胞受容体を含有するＴ細胞は、本明細書で使用される「Ｔ細胞」という用語に包含される。
１つの実施形態では、モノクローナル抗体に由来する一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）をＣＤ３−ζ膜貫通およびエンドドメインに融合する。そのような分子は、標的細胞上のその抗原標的のｓｃＦｖによる認識に応答したζシグナルの伝達および標的抗原を発現する標的細胞の死滅をもたらす。同じく使用し得る抗原認識ドメインには、中でも特にＴ細胞受容体（ＴＣＲ）αおよびβ一本鎖が含まれる。実際に、所与の標的に高親和性で結合するほとんどあらゆるものが抗原認識ドメインとして使用できる。
抗原認識に続いて、受容体がクラスタリングし、シグナルが細胞に伝達される。これに関して、「Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン」は、抗原が結合された後、活性化シグナルをＴ細胞に伝えるドメイン、好ましくはエンドドメインである。最も一般的に使用されるエンドドメイン成分はＣＤ３−ζである。
キメラ抗原受容体を発現するＣＡＲ操作されたＴ細胞での養子細胞移入療法は、ＣＡＲ改変Ｔ細胞を、実質的に任意の腫瘍抗原を標的とするように操作することができるので、有望な抗癌治療法である。例えば、患者のＴ細胞を、特異的に患者の腫瘍細胞上の抗原に向けられるＣＡＲを発現するように遺伝子操作し、その後患者に戻し注入し得る。
本発明によれば、人工Ｔ細胞受容体は、上述したＴ細胞受容体の機能を置き換えることができ、特に上述したＴ細胞などの細胞に対する細胞溶解活性などの反応性を付与し得る。しかし、上述したようにＴ細胞受容体が抗原ペプチド−ＭＨＣ複合体に結合するのに対し、人工Ｔ細胞受容体は抗原、特に細胞表面に発現された抗原に結合し得る。
Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３−ζ鎖は、ヒトではＣＤ２４７遺伝子によってコードされるタンパク質である。Ｔ細胞受容体α／βおよびγ／δヘテロ二量体ならびにＣＤ３−γ、ＣＤ３−δおよびＣＤ３−εと一緒になってＣＤ３−ζはＴ細胞受容体−ＣＤ３複合体を形成する。ζ鎖は、抗原認識をいくつかの細胞内シグナル伝達経路に結び付けるのに重要な役割を果たす。「ＣＤ３−ζ」という用語は、好ましくはヒトＣＤ３−ζ、および特に、配列表の配列番号：４５のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含む、好ましくはそれから成るタンパク質に関する。
ＣＤ２８（分化クラスター２８）は、Ｔ細胞活性化に必要な共刺激シグナルを与える、Ｔ細胞上に発現される分子の１つである。ＣＤ２８は、ＣＤ８０（Ｂ７．１）およびＣＤ８６（Ｂ７．２）の受容体である。Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）に加えてＣＤ２８を介した刺激は、様々なインターロイキン（特にＩＬ−６）の産生のためにＴ細胞に強力な共刺激シグナルを与えることができる。「ＣＤ２８」という用語は、好ましくはヒトＣＤ２８、および特に、配列表の配列番号：４４のアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含む、好ましくはそれから成るタンパク質に関する。
本発明によれば、ＣＡＲは一般に３つのドメインを含み得る。
最初のドメインは、ＣＬＤＮ６を認識して結合する結合ドメインである。
２番目のドメインは共刺激ドメインである。共刺激ドメインは、標的とする部分へのＣＡＲの結合後に細胞傷害性リンパ球の増殖および生存を増強する働きをする。共刺激ドメインの同一性は、ＣＡＲによる標的部分の結合後に細胞の増殖および生存を増強する能力を有するという点だけに限られる。適切な共刺激ドメインには、ＣＤ２８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）受容体ファミリーの成員であるＣＤ１３７（４−１ＢＢ）、受容体のＴＮＦＲスーパーファミリーの成員であるＣＤ１３４（ＯＸ４０）、および活性化Ｔ細胞上に発現されるＣＤ２８スーパーファミリーの共刺激分子であるＣＤ２７８（ＩＣＯＳ）が含まれる。当業者は、これらの列挙された抗刺激ドメインの配列変異体が、本発明に有害な影響を及ぼすことなく使用でき、前記変異体はそれらがモデルとするドメインと同じまたは類似の活性を有することを理解する。そのような変異体は、それらが由来するドメインのアミノ酸配列と少なくとも約８０％の配列同一性を有する。本発明の一部の実施形態では、ＣＡＲ構築物は２つの共刺激ドメインを含む。特定の組合せには、４つの列挙されたドメインのすべての可能な変形が含まれるが、具体的な例はＣＤ２８＋ＣＤ１３７（４−１ＢＢ）およびＣＤ２８＋ＣＤ１３４（ＯＸ４０）を含む。
３番目のドメインは、活性化シグナル伝達ドメイン（またはＴ細胞シグナル伝達ドメイン）である。活性化シグナル伝達ドメインは、ＣＡＲのＣＬＤＮ６への結合後に細胞傷害性リンパ球を活性化する働きをする。活性化シグナル伝達ドメインの同一性は、ＣＡＲによるＣＬＤＮ６の結合後に選択された細胞傷害性リンパ球の活性化を誘導する能力を有するという点だけに限られる。適切な活性化シグナル伝達ドメインには、Ｔ細胞ＣＤ３［ζ］鎖およびＦｃ受容体［γ］が含まれる。当業者は、これらの列挙された活性化シグナル伝達ドメインの配列変異体が、本発明に有害な影響を及ぼすことなく使用でき、前記変異体はそれらがモデルとするドメインと同じまたは類似の活性を有することを理解する。そのような変異体は、それらが由来するドメインのアミノ酸配列と少なくとも約８０％の配列同一性を有する。
本発明のＣＡＲは、３つのドメインを融合タンパク質の形態で一緒に含み得る。そのような融合タンパク質は一般に、Ｎ末端からＣ末端の方向に連結された、結合ドメイン、１つ以上の共刺激ドメインおよび活性化シグナル伝達ドメインを含む。しかし、本発明のＣＡＲはこの配置に限定されず、他の配置も許容され、これには結合ドメイン、活性化シグナル伝達ドメインおよび１つ以上の共刺激ドメインが含まれる。結合ドメインはＣＬＤＮ６に自由に結合することができなければならないので、融合タンパク質内の結合ドメインの位置は一般に、細胞の外側で領域の展示が達成される位置であることが理解される。同様に、共刺激ドメインおよび活性化シグナル伝達ドメインは、細胞傷害性リンパ球の活性と増殖を誘導する働きをするので、融合タンパク質は一般に、細胞の内部でこれら２つのドメインを展示する。ＣＡＲは、付加的な要素、例えば融合タンパク質の細胞表面への適切な輸送を確実にするシグナルペプチド、融合タンパク質が内在性膜タンパク質として維持されるのを確実にする膜貫通ドメイン、および結合ドメインに柔軟性を与え、ＣＬＤＮ６への強力な結合を可能にするヒンジドメイン（またはスペーサー領域）を含み得る。
本発明のＣＡＲシステムに関連して使用される細胞は、好ましくはＴ細胞、特に、好ましくは細胞傷害性Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞およびリンホカイン活性化キラー（ＬＡＫ）細胞から選択される細胞傷害性リンパ球である。活性化後、これらの細胞傷害性リンパ球の各々は標的細胞の破壊を引き起こす。例えば細胞傷害性Ｔ細胞は、以下の手段のいずれかまたは両方によって標的細胞の破壊を引き起こす。第一に、活性化後、Ｔ細胞はパーフォリン、グランザイムおよびグラニュライシンなどの細胞毒を放出する。パーフォリンおよびグラニュライシンは標的細胞に細孔を作り、グランザイムは細胞に入り込んで、細胞のアポトーシス（プログラム細胞死）を誘導する細胞質内のカスパーゼカスケードを始動させる。第二に、Ｔ細胞と標的腫瘍細胞との間でのＦａｓ−Ｆａｓリガンド相互作用によってアポトーシスが誘導され得る。細胞傷害性リンパ球は、好ましくは自己細胞であるが、異種細胞または同種異系細胞も使用できる。
本発明によれば、参照試料または参照生物などの「参照」は、試験試料または試験生物から本発明の方法において得られた結果を関連付け、比較するのに使用され得る。典型的には、参照生物は健常生物、特に癌疾患などの疾患に罹患していない生物である。「参照値」または「参照レベル」は、十分に大きな数の参照品を測定することによって参照品から経験的に決定され得る。好ましくは、参照値は、少なくとも２、好ましくは少なくとも３、好ましくは少なくとも５、好ましくは少なくとも８、好ましくは少なくとも１２、好ましくは少なくとも２０、好ましくは少なくとも３０、好ましくは少なくとも５０、または好ましくは少なくとも１００の参照品を測定することによって決定される。
本発明によれば、「結合物質」という用語は、標的への結合能力を有するあらゆる化合物を包含する。好ましくは、そのような結合物質は、標的に対する少なくとも１つの結合ドメインを含む。この用語には、抗体および抗体フラグメント、二重特異性または多重特異性分子、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）ならびにナノボディ、アフィボディ、アンチカリン、ＤＡＲＰｉｎ、モノボディ、アビマーおよびマイクロボディを含むがこれらに限定されない、標的への結合能力を有するすべての人工結合分子（足場）が含まれる。１つの実施形態では、前記結合は特異的結合である。
「免疫グロブリン」という用語は、免疫グロブリンスーパーファミリーのタンパク質、好ましくは抗体またはＢ細胞受容体（ＢＣＲ）などの抗原受容体に関する。免疫グロブリンは、特徴的な免疫グロブリン（Ｉｇ）フォールドを有する構造ドメイン、すなわち免疫グロブリンドメインを特徴とする。この用語は、膜結合免疫グロブリンならびに可溶性免疫グロブリンを包含する。膜結合免疫グロブリンは、一般にＢＣＲの一部である、表面免疫グロブリンまたは膜免疫グロブリンとも称される。可溶性免疫グロブリンは一般に抗体と称される。免疫グロブリンは、一般に数本の鎖、典型的にはジスルフィド結合によって連結された２本の同一の重鎖と２本の同一の軽鎖を含む。これらの鎖は、主として、ＶＬ（可変軽鎖）ドメイン、ＣＬ（定常軽鎖）ドメイン、ならびにＣＨ（定常重鎖）ドメインＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４などの免疫グロブリンドメインから成る。抗体の異なるクラス、すなわちＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧおよびＩｇＭを構成する５種類の哺乳動物免疫グロブリン重鎖、すなわちα、δ、ε、γおよびμが存在する。可溶性免疫グロブリンの重鎖と異なり、膜免疫グロブリンまたは表面免疫グロブリンの重鎖は、膜貫通ドメインおよび短い細胞質ドメインをそのカルボキシ末端に含む。哺乳動物では、２種類の軽鎖、すなわちλおよびκが存在する。免疫グロブリン鎖は可変領域と定常領域を含む。定常領域は、免疫グロブリンの異なるアイソタイプ内で基本的に保存されており、ここで可変部分は高度に多様性であり、抗原認識を担う。
「抗体」という用語は、ジスルフィド結合によって相互に連結された少なくとも２本の重（Ｈ）鎖と２本の軽（Ｌ）鎖を含む糖タンパク質を指す。「抗体」という用語は、モノクローナル抗体、組換え抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体およびキメラ抗体を包含する。各々の重鎖は、重鎖可変領域（本明細書ではＶＨと略す）および重鎖定常領域から成る。各々の軽鎖は、軽鎖可変領域（本明細書ではＶＬと略す）および軽鎖定常領域から成る。ＶＨおよびＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）と称されるより保存された領域が間に組み入れられた、相補性決定領域（ＣＤＲ）と称される超可変性の領域にさらに細分することができる。各々のＶＨとＶＬは、以下の順序でアミノ末端からカルボキシ末端へと配置された、３つのＣＤＲと４つのＦＲから成る：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞（例えばエフェクター細胞）および古典的補体系の第一成分（Ｃｌｑ）を含む、宿主組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介し得る。
本明細書で使用される「モノクローナル抗体」という用語は、単一分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体は単一結合特異性および親和性を示す。１つの実施形態では、モノクローナル抗体は、不死化細胞に融合された非ヒト動物、例えばマウスから得られるＢ細胞を含むハイブリドーマによって産生される。
「組換え抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、組換え手段によって作製された、発現された、創製されたまたは単離されたすべての抗体、例えば（ａ）免疫グロブリン遺伝子に関してトランスジェニックもしくはトランスクロモソーマルである動物（例えばマウス）またはそれから作製されたハイブリドーマから単離された抗体、（ｂ）抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えばトランスフェクトーマから単離された抗体、（ｃ）組換えコンビナトリアル抗体ライブラリから単離された抗体、および（ｄ）免疫グロブリン遺伝子配列の他のＤＮＡ配列へのスプライシングを含む任意の他の手段によって作製された、発現された、創製されたまたは単離された抗体を包含する。
「ヒト抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域および定常領域を有する抗体を包含することが意図されている。ヒト抗体は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基（例えばインビトロでランダムもしくは部位特異的突然変異誘発によってまたはインビボで体細胞突然変異によって導入された突然変異）を含み得る。
「ヒト化抗体」という用語は、非ヒト種からの免疫グロブリンに実質的に由来する抗原結合部位を有する分子を指し、ここで分子の残りの免疫グロブリン構造は、ヒト免疫グロブリンの構造および／または配列に基づく。抗原結合部位は、定常ドメインに融合した完全な可変ドメインを含み得るか、または可変ドメイン内の適切なフレームワーク領域に移植された相補性決定領域（ＣＤＲ）だけを含み得る。抗原結合部位は、野生型であり得るかまたは１つ以上のアミノ酸置換によって修飾されていてもよく、例えばヒト免疫グロブリンにより密接に類似するように修飾されていてもよい。ヒト化抗体の一部の形態はすべてのＣＤＲ配列を保存する（例えばマウス抗体からの６つのＣＤＲ全部を含むヒト化マウス抗体）。また別の形態は、もとの抗体に比べて改変された１つ以上のＣＤＲを有する。
「キメラ抗体」という用語は、重鎖および軽鎖のアミノ酸配列の各々の一部分が、特定の種に由来するまたは特定のクラスに属する抗体内の対応する配列に相同であり、一方鎖の残りのセグメントは別の抗体内の対応する配列に相同である抗体を指す。典型的には、軽鎖と重鎖の両方の可変領域が哺乳動物の１つの種に由来する抗体の可変領域を模倣し、一方定常部分は別の種に由来する抗体の配列に相同である。そのようなキメラ形態の１つの明らかな利点は、可変領域を非ヒト宿主生物からの容易に入手可能なＢ細胞またはハイブリドーマを使用して現在公知の供給源から好都合に誘導し、例えばヒト細胞調製物に由来する定常領域と組み合わせるこができることである。可変領域は調製の容易さという利点を有し、その特異性は供給源に影響されないが、ヒトである定常領域は、抗体を注射した場合、非ヒト供給源からの定常領域よりもヒト被験者から免疫応答を惹起する可能性が低い。しかし、その定義はこの特定の例に限定されない。
抗体は、マウス、ラット、ウサギ、モルモットおよびヒトを含むがこれらに限定されない、様々な種に由来し得る。
本明細書で述べる抗体は、ＩｇＡ１またはＩｇＡ２などのＩｇＡ、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＥ、ＩｇＭおよびＩｇＤ抗体を含む。様々な実施形態において、抗体は、ＩｇＧ１抗体、より特定するとＩｇＧ１、カッパまたはＩｇＧ１、ラムダアイソタイプ（すなわちＩｇＧ１、κ、λ）、ＩｇＧ２ａ抗体（例えばＩｇＧ２ａ、κ、λ）、ＩｇＧ２ｂ抗体（例えばＩｇＧ２ｂ、κ、λ）、ＩｇＧ３抗体（例えばＩｇＧ３、κ、λ）またはＩｇＧ４抗体（例えばＩｇＧ４、κ、λ）である。
本明細書で述べる抗体は、好ましくは単離されている。本明細書で使用される「単離された抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指すことが意図されている（例えば、ＣＬＤＮ６に特異的に結合する単離された抗体は、ＣＬＤＮ６以外の抗原に特異的に結合する抗体を実質的に含まない）。ヒトＣＬＤＮ６のエピトープ、アイソフォームまたは変異体に特異的に結合する単離された抗体は、しかし、他の関連抗原、例えば他の種からの関連抗原（例えばＣＬＤＮ６の種ホモログ）に対する交差反応性を有し得る。さらに、単離された抗体は、実質的に他の細胞物質および／または化学物質不含であり得る。本発明の１つの実施形態では、「単離された」モノクローナル抗体の組合せは、異なる特異性を有し、および十分に定義された組成物または混合物中で組み合わされている抗体に関する。
抗体の「抗原結合部分」（もしくは単に「結合部分」）または抗体の「抗原結合フラグメント」（もしくは単に「結合フラグメント」）という用語または同様の用語は、抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体の１つ以上のフラグメントを指す。抗体の抗原結合機能は完全長抗体のフラグメントによって実行され得ることが示されている。抗体の「抗原結合部分」という用語に包含される結合フラグメントの例には、（ｉ）ＶＬ、ＶＨ、ＣＬおよびＣＨドメインから成る一価フラグメントである、Ｆａｂフラグメント；（ｉｉ）ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された２つのＦａｂフラグメントを含む二価フラグメントである、Ｆ（ａｂ'）２フラグメント；（ｉｉｉ）ＶＨドメインとＣＨドメインから成るＦｄフラグメント；（ｉｖ）抗体の１本の腕のＶＬドメインとＶＨドメインから成るＦｖフラグメント；（ｖ）ＶＨドメインから成る、ｄＡｂフラグメント（Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ．，（１９８９）Ｎａｔｕｒｅ ３４１：５４４−５４６）；（ｖｉ）単離された相補性決定領域（ＣＤＲ）、ならびに（ｖｉｉ）場合により合成リンカーによって連結されていてもよい２つ以上の単離されたＣＤＲの組合せが含まれる。さらに、Ｆｖフラグメントの２つのドメイン、ＶＬとＶＨは別々の遺伝子によってコードされるが、それらは、ＶＬ領域とＶＨ領域が対合して一価分子を形成する単一タンパク質鎖（一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られる；例えばＢｉｒｄ ｅｔ ａｌ．（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４２：４２３−４２６；およびＨｕｓｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：５８７９−５８８３参照）としてそれらを作製することを可能にする合成リンカーによって、組換え法を用いて連結することができる。そのような一本鎖抗体も、抗体の「抗原結合フラグメント」という用語に包含されることが意図されている。さらなる例は、（ｉ）免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した結合ドメインポリペプチド、（ｉｉ）ヒンジ領域に融合した免疫グロブリン重鎖ＣＨ２定常領域、および（ｉｉｉ）ＣＨ２定常領域に融合した免疫グロブリン重鎖ＣＨ３定常領域を含む、結合ドメイン免疫グロブリン融合タンパク質である。結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域または軽鎖可変領域であり得る。結合ドメイン免疫グロブリン融合タンパク質は、さらに米国特許出願第２００３／０１１８５９２号および同第２００３／０１３３９３９号に開示されている。これらの抗体フラグメントは当業者に公知の従来技術を用いて得られ、フラグメントは、無傷抗体と同じ方法で有用性に関してスクリーニングされる。
本発明によれば、「ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン」という用語は、ＣＬＤＮ６抗体、すなわちＣＬＤＮ６に向けられ、および好ましくはＣＬＤＮ６に特異的である抗体の抗原結合部分を含み、好ましくはそれに関する。
「結合ドメイン」という用語は、本発明に関連して、所与の標的構造体／抗原／エピトープに結合する／所与の標的構造体／抗原／エピトープと相互作用する、例えば抗体の、構造を特徴付ける。したがって、本発明による結合ドメインは「抗原相互作用部位」を表す。
本発明の目的上、本明細書で述べるすべての抗体および抗体フラグメントなどの抗体の誘導体は、「抗体」という用語に包含される。
抗体は、従来のモノクローナル抗体法、例えばＫｏｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５（１９７５）の標準的な体細胞ハイブリダイゼーション技術を含む、様々な技術によって作製することができる。体細胞ハイブリダイゼーション手順が原則として好ましいが、モノクローナル抗体を作製するための他の技術、例えばＢリンパ球のウイルス形質転換もしくは発癌性形質転換または抗体遺伝子のライブラリを用いたファージディスプレイ技術も使用できる。
モノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを作製するための好ましい動物系は、マウスの系である。マウスにおけるハイブリドーマ作製は極めて広く確立された手順である。免疫プロトコルおよび融合のために免疫脾細胞を単離する技術は当分野で公知である。融合パートナー（例えばマウス骨髄腫細胞）および融合手順も公知である。
モノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを作製するための他の好ましい動物系は、ラットおよびウサギの系である（例えばＳｐｉｅｋｅｒ−Ｐｏｌｅｔ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９２：９３４８（１９９５）に記載されている；またＲｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ．Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐａｔｈｏｌ．１２４：２９５（２００５）も参照のこと）。
抗体を作製するため、記載されるように、抗原配列、すなわちそれに対して抗体が向けられるべき配列に由来する担体結合ペプチド、組換え発現された抗原もしくはそのフラグメントの濃縮調製物および／または、抗原を発現する細胞でマウスを免疫することができる。あるいは、抗原またはそのフラグメントをコードするＤＮＡでマウスを免疫することができる。抗原の精製または濃縮調製物を使用した免疫が抗体をもたらさない場合は、免疫応答を促進するために抗原を発現する細胞、例えば細胞株でマウスを免疫することもできる。
免疫プロトコルの間に、尾静脈または眼窩後採血によって得られる血漿および血清試料を用いて免疫応答を観測することができる。免疫グロブリンの十分な力価を有するマウスを融合のために使用できる。犠死および脾臓切除の３日前に抗原発現細胞でマウスを腹腔内または静脈内経路で追加免疫して、特異的抗体を分泌するハイブリドーマの割合を増大させることができる。
モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを作製するため、免疫マウスからの脾細胞およびリンパ節細胞を単離し、マウス骨髄腫細胞株などの適切な不死化細胞株に融合することができる。生じたハイブリドーマを、次に、抗原特異的抗体の産生に関してスクリーニングすることができる。その後個々のウェルを、ＥＬＩＳＡによって抗体を分泌するハイブリドーマに関してスクリーニングすることができる。抗原発現細胞を使用した免疫蛍光法およびＦＡＣＳ分析により、抗原に対して特異性を有する抗体を同定することができる。抗体分泌ハイブリドーマを再度プレーティングし、再びスクリーニングして、モノクローナル抗体に関してまだ陽性である場合は限界希釈によってサブクローニングすることができる。その後、安定なサブクローンをインビトロで培養し、特性付けのために組織培養培地中で抗体を作製することができる。
抗原に結合する抗体および他の結合物質の能力は、標準的な結合アッセイ（例えばＥＬＩＳＡ、ウェスタンブロット法、免疫蛍光法およびフローサイトメトリ分析）を用いて決定することができる。
抗体および抗体の誘導体は、抗体フラグメントなどの結合ドメインを提供するため、特にＶＬおよびＶＨ領域を提供するために有用である。
人工Ｔ細胞受容体内に存在し得る、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ６に結合する能力、すなわちＣＬＤＮ６中に存在するエピトープ、好ましくはＣＬＤＮ６の細胞外ドメイン内に位置するエピトープ、特に第一細胞外ループ、好ましくはＣＬＤＮ６のアミノ酸位置２８〜７６または第二細胞外ループ、好ましくはＣＬＤＮ６のアミノ酸位置１４１〜１５９に位置するエピトープに結合する能力を有する。特定の実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ９上には存在しないＣＬＤＮ６上のエピトープに結合する。好ましくは、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ４および／またはＣＬＤＮ３上には存在しないＣＬＤＮ６上のエピトープに結合する。最も好ましくは、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ６以外のＣＬＤＮタンパク質上には存在しない、ＣＬＤＮ６上のエピトープに結合する。
ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、好ましくはＣＬＤＮ６に結合するがＣＬＤＮ９には結合せず、ならびに好ましくはＣＬＤＮ４および／またはＣＬＤＮ３には結合しない。好ましくは、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインはＣＬＤＮ６に特異的である。好ましくは、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、細胞表面に発現されたＣＬＤＮ６に結合する。特定の好ましい実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、生細胞の表面に存在するＣＬＤＮ６の天然エピトープに結合する。
好ましい実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：３０、３２、３４および３６から成る群より選択されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む重鎖可変領域（ＶＨ）を含有する。
好ましい実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：３１、３３、３５、３７、３８および３９から成る群より選択されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）を含有する。
特定の好ましい実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、以下の可能性（ｉ）〜（ｘｉ）から選択される重鎖可変領域（ＶＨ）と軽鎖可変領域（ＶＬ）の組合せを含む：
（ｉ）ＶＨは配列番号：３０によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３１によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む、
（ｉｉ）ＶＨは配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３３によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む、
（ｉｉｉ）ＶＨは配列番号：３４によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３５によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む、
（ｉｖ）ＶＨは配列番号：３６によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３７によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む、
（ｖ）ＶＨは配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３１によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む、
（ｖｉ）ＶＨは配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３８によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む、
（ｖｉｉ）ＶＨは配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む。
特に好ましい実施形態では、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、重鎖可変領域（ＶＨ）と軽鎖可変領域（ＶＬ）の以下の組合せを含む：
ＶＨは配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、およびＶＬは配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む。
「フラグメント」という用語は、特に、重鎖可変領域（ＶＨ）および／または軽鎖可変領域（ＶＬ）の相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、好ましくは少なくともＣＤＲ３可変領域を指す。１つの実施形態では、前記相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上は、相補性決定領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３のセットから選択される。特に好ましい実施形態では、「フラグメント」という用語は、重鎖可変領域（ＶＨ）および／または軽鎖可変領域（ＶＬ）の相補性決定領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を指す。
１つの実施形態では、本明細書で述べる１つ以上のＣＤＲ、ＣＤＲのセットまたはＣＤＲのセットの組合せを含有する、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、前記ＣＤＲをそれらの介在フレームワーク領域と共に含む。好ましくは、その部分は、第１および第４フレームワーク領域のいずれかまたは両方の少なくとも約５０％を含み、前記５０％は、第１フレームワーク領域のＣ末端５０％および第４フレームワーク領域のＮ末端５０％である。組換えＤＮＡ技術によって行われる結合ドメインの構築は、本発明の可変領域を、免疫グロブリン重鎖、他の可変ドメイン（例えばダイアボディの作製において）またはタンパク質標識を包含するさらなるタンパク質配列に連結するリンカーの導入を含む、クローニングまたは他の操作工程を容易にするために導入されるリンカーによってコードされる可変領域のＮ末端側またはＣ末端側の残基の導入をもたらし得る。
１つの実施形態では、本明細書で述べる１つ以上のＣＤＲ、ＣＤＲのセットまたはＣＤＲのセットの組合せを含む結合ドメインは、ヒト抗体フレームワーク内に前記ＣＤＲを含む。
本発明による「結合」という用語は、好ましくは特異的結合に関する。
本発明によれば、Ｔ細胞受容体または抗体などの作用物質が、標準的なアッセイにおいて所定の標的に有意の親和性を有し、前記所定の標的に結合する場合、前記作用物質は前記所定の標的に結合することができる。「親和性」または「結合親和性」は、しばしば平衡解離定数（ＫＤ）によって測定される。好ましくは、「有意の親和性」という用語は、１０−５Ｍ以下、１０−６Ｍ以下、１０−７Ｍ以下、１０−８Ｍ以下、１０−９Ｍ以下、１０−１０Ｍ以下、１０−１１Ｍ以下、または１０−１２Ｍ以下の解離定数（ＫＤ）で所定の標的に結合することを指す。
作用物質が標準的なアッセイにおいて標的に有意の親和性を有さず、前記標的に有意に結合しない、特に検出可能に結合しない場合、前記作用物質は前記標的に（実質的に）結合することができない。好ましくは、作用物質が２、好ましくは１０、より好ましくは２０、特に５０または１００μｇ／ｍｌまたはより高い濃度で存在する場合、前記作用物質は前記標的に検出可能に結合しない。好ましくは、作用物質が、その作用物質が結合することができる所定の標的への結合に関するＫＤよりも少なくとも１０倍、１００倍、１０３倍、１０４倍、１０５倍または１０６倍高いＫＤである標的に結合する場合、前記作用物質はその標的に有意の親和性を有さない。例えば、作用物質が結合することができる標的へのその作用物質の結合に関するＫＤが１０−７Ｍである場合、前記作用物質が有意の親和性を有さない標的への結合に関するＫＤは少なくとも１０−６Ｍ、１０−５Ｍ、１０−４Ｍ、１０−３Ｍ、１０−２Ｍまたは１０−１Ｍである。
作用物質が、所定の標的に結合することができるが、他の標的には（実質的に）結合することができない、すなわち標準的なアッセイにおいて他の標的には有意の親和性を有さず、他の標的に有意に結合しない場合、前記作用物質は前記所定の標的に特異的である。本発明によれば、作用物質が、ＣＬＤＮ６に結合することができるが、他の標的には（実質的に）結合することができない場合、前記作用物質はＣＬＤＮ６に特異的である。好ましくは、そのような他の標的に対する親和性および結合が、ＣＬＤＮ６に無関係なタンパク質、例えばウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、カゼイン、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、または非クローディン膜貫通タンパク質、例えばＭＨＣ分子もしくはトランスフェリン受容体、または何らかの他の指定されるポリペプチドに対する親和性または結合を有意に上回らない場合、前記作用物質はＣＬＤＮ６に特異的である。好ましくは、作用物質が、その作用物質が特異的でない標的への結合に関するＫＤよりも少なくとも１０倍、１００倍、１０３倍、１０４倍、１０５倍または１０６倍低いＫＤで所定の標的に結合する場合、前記作用物質は前記所定の標的に特異的である。例えば、作用物質が特異的である標的へのその作用物質の結合に関するＫＤが１０−７Ｍである場合、前記作用物質が特異的でない標的への結合に関するＫＤは、少なくとも１０−６Ｍ、１０−５Ｍ、１０−４Ｍ、１０−３Ｍ、１０−２Ｍまたは１０−１Ｍである。
標的への作用物質の結合は、任意の適切な方法：例えばＢｅｒｚｏｆｓｋｙ ｅｔ ａｌ．，"Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ａｎｔｉｇｅｎ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ"Ｉｎ Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｐａｕｌ，Ｗ．Ｅ．，Ｅｄ．，Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ（１９８４）、Ｋｕｂｙ，Ｊａｎｉｓ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ（１９９２）参照、および本明細書で述べる方法を用いて実験的に測定することができる。親和性は、従来の技術を用いて、例えば平衡透析によって；製造者によって概説される一般的手順を用いて、ＢＩＡｃｏｒｅ ２０００装置を使用することによって；放射性標識した標的抗原を用いる放射性免疫検定法によって；または当業者に公知の別の方法によって、容易に決定し得る。親和性データは、例えばＳｃａｔｃｈａｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．ＳｃＬ，５１：６６０（１９４９）の方法によって分析し得る。特定の抗体−抗原相互作用の測定される親和性は、異なる条件下で、例えば異なる塩濃度、ｐＨの下で測定された場合、異なり得る。したがって、親和性および他の抗原結合パラメータ、例えばＫＤ、ＩＣ５０の測定は、好ましくは抗体および抗原の標準溶液ならびに標準緩衝液を用いて行われる。
本明細書で述べるペプチドおよびタンパク質作用物質は、作用物質をコードするＲＮＡなどの核酸の形態でおよび／または作用物質をコードするＲＮＡなどの核酸を含む宿主細胞の形態で、インビトロまたはインビボで提供され得ることが理解されるべきである。特に、非ウイルスベースのＤＮＡトランスフェクション、トランスポゾンベースのシステムおよびウイルスベースのシステムを含む様々な方法を、ＣＡＲ構築物をＴ細胞に導入するために使用し得る。非ウイルスベースのＤＮＡトランスフェクションは挿入突然変異誘発の危険性が低い。トランスポゾンベースのシステムは、組込み要素を含まないプラスミドよりも効率良く導入遺伝子を組み込むことができる。ウイルスベースのシステムは、γ−レトロウイルスおよびレンチウイルスベクターの使用を含む。γ−レトロウイルスは作製が比較的容易であり、Ｔ細胞を効率的および永続的に形質導入し、初代ヒトＴ細胞への組込みの見地から安全であることがあらかじめ証明されている。レンチウイルスベクターもＴ細胞を効率的および永続的に形質導入するが、製造により費用がかかる。それらはまた、潜在的にレトロウイルスベースのシステムよりも安全である。
本明細書で述べるペプチドおよびタンパク質作用物質は、作用物質をコードするＲＮＡなどの核酸を投与することによっておよび／または作用物質をコードするＲＮＡなどの核酸を含む宿主細胞を投与することによって患者に送達され得る。患者に投与する場合の核酸は、裸の形態でまたはリポソームもしくはウイルス粒子の形態などの適切な送達ビヒクル中に、または宿主細胞内に存在し得る。提供される核酸は、作用物質を長期間にわたって持続的に産生することができ、治療用タンパク質に関して少なくとも一部に認められる不安定性を軽減する。核酸が宿主細胞内に存在せずに患者に投与される場合、核酸は、好ましくは核酸によってコードされる作用物質の発現のために患者の細胞によって取り込まれる。核酸が宿主細胞内に存在しつつ患者に投与される場合、核酸は、好ましくは核酸によってコードされる作用物質を産生するように患者の体内で宿主細胞によって発現される。
「核酸」という用語は、本明細書で使用される場合、ＤＮＡおよびＲＮＡ、例えばゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ｍＲＮＡ、組換え生産された分子および化学合成された分子を包含することが意図されている。核酸は一本鎖または二本鎖であり得る。ＲＮＡは、インビトロ転写ＲＮＡ（ＩＶＴ ＲＮＡ）または合成ＲＮＡを含む。本発明によれば、核酸は、好ましくは単離された核酸である。
核酸はベクター中に含まれ得る。本明細書で使用される「ベクター」という用語は、プラスミドベクター、コスミドベクター、λファージなどのファージベクター、アデノウイルスもしくはバキュロウイルスベクターなどのウイルスベクター、または細菌人工染色体（ＢＡＣ）、酵母人工染色体（ＹＡＣ）もしくはＰ１人工染色体（ＰＡＣ）などの人工染色体ベクターを含む、当業者に公知の任意のベクターを包含する。前記ベクターは、発現ベクターならびにクローニングベクターを含む。発現ベクターは、プラスミドならびにウイルスベクターを含み、一般に所望のコード配列および特定の宿主生物（例えば細菌、酵母、植物、昆虫もしくは哺乳動物）またはインビトロ発現系における作動可能に連結されたコード配列の発現のために必要な適切なＤＮＡ配列を含む。クローニングベクターは、一般に特定の所望ＤＮＡフラグメントを操作し、増幅するために使用され、所望ＤＮＡフラグメントの発現に必要な機能的配列を欠如し得る。
本発明に関連して、「ＲＮＡ」という用語は、リボヌクレオチド残基を含み、および好ましくは完全にまたは実質的にリボヌクレオチド残基から成る分子に関する。「リボヌクレオチド」は、β，Ｄ−リボフラノシル基の２'位にヒドロキシル基を有するヌクレオチドに関する。この用語は、二本鎖ＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、単離されたＲＮＡ、例えば部分的に精製されたＲＮＡ、基本的に純粋なＲＮＡ、合成ＲＮＡ、組換え生産されたＲＮＡ、ならびに１個以上のヌクレオチドの付加、欠失、置換および／または変化によって天然に存在するＲＮＡとは異なる修飾ＲＮＡを包含する。そのような変化には、例えばＲＮＡの末端へのまたは内部での、例えばＲＮＡの１個以上のヌクレオチドにおける、非ヌクレオチド物質の付加が含まれ得る。ＲＮＡ分子中のヌクレオチドは、非標準ヌクレオチド、例えば天然には存在しないヌクレオチドまたは化学合成されたヌクレオチドもしくはデオキシヌクレオチドも含み得る。これらの変化したＲＮＡは、類似体または天然に存在するＲＮＡの類似体と称され得る。
本発明によれば、「ＲＮＡ」という用語は、「メッセンジャーＲＮＡ」を意味し、およびＤＮＡを鋳型として使用して生成され得、ペプチドまたはタンパク質をコードする「転写産物」に関する「ｍＲＮＡ」を包含し、好ましくは「ｍＲＮＡ」に関する。ｍＲＮＡは、典型的には５'非翻訳領域（５'−ＵＴＲ）、タンパク質またはペプチドコード領域および３'非翻訳領域（３'−ＵＴＲ）を含む。ｍＲＮＡは、細胞内およびインビトロで限られた半減期を有する。好ましくは、ｍＲＮＡはＤＮＡ鋳型を使用してインビトロ転写によって生成される。本発明の１つの実施形態では、ＲＮＡはインビトロ転写または化学合成によって得られる。インビトロ転写の方法は当業者に公知である。例えば、様々なインビトロ転写キットが市販されている。
本発明の１つの実施形態では、ＲＮＡは自己複製ＲＮＡ、例えば一本鎖自己複製ＲＮＡである。１つの実施形態では、自己複製ＲＮＡはプラスセンスの一本鎖ＲＮＡである。１つの実施形態では、自己複製ＲＮＡは、ウイルスＲＮＡまたはウイルスＲＮＡに由来するＲＮＡである。１つの実施形態では、自己複製ＲＮＡは、アルファウイルスゲノムＲＮＡであるかまたはアルファウイルスゲノムＲＮＡに由来する。１つの実施形態では、自己複製ＲＮＡはウイルス遺伝子発現ベクターである。１つの実施形態では、ウイルスはセムリキ森林ウイルスである。１つの実施形態では、自己複製ＲＮＡは１つ以上の導入遺伝子を含み、前記導入遺伝子の少なくとも１つは本明細書で述べる作用物質をコードする。１つの実施形態では、ＲＮＡがウイルスＲＮＡであるかまたはウイルスＲＮＡに由来する場合、導入遺伝子は、ウイルス配列、例えば構造タンパク質をコードするウイルス配列を部分的にまたは完全に置換し得る。１つの実施形態では、自己複製ＲＮＡはインビトロ転写ＲＮＡである。
本発明に従って使用されるＲＮＡの発現および／または安定性を高めるために、好ましくは発現されるペプチドまたはタンパク質の配列を変化させずに、ＲＮＡを修飾し得る。
本発明に従って使用されるＲＮＡに関連して「修飾」という用語は、前記ＲＮＡ中に天然では存在しないＲＮＡの任意の修飾を包含する。
本発明の１つの実施形態では、本発明に従って使用されるＲＮＡは非キャップ５'−三リン酸を有さない。そのような非キャップ５'−三リン酸の除去は、ＲＮＡをホスファターゼで処理することによって達成できる。
本発明によるＲＮＡは、その安定性を高めるおよび／または細胞傷害性を低下させるために、修飾された天然に存在するリボヌクレオチドまたは合成リボヌクレオチドを有し得る。例えば、１つの実施形態では、本発明に従って使用されるＲＮＡにおいて、シチジンを５−メチルシチジンで部分的にまたは完全に、好ましくは完全に置換する。あるいはまたは加えて、１つの実施形態では、本発明に従って使用されるＲＮＡにおいて、ウリジンをプソイドウリジンで部分的にまたは完全に、好ましくは完全に置換する。
１つの実施形態では、「修飾」という用語は、ＲＮＡに５'キャップまたは５'キャップ類似体を提供することに関する。「５'キャップ」という用語は、ｍＲＮＡ分子の５'末端に認められるキャップ構造を指し、一般に独特の５'−５'三リン酸結合によってｍＲＮＡに連結されたグアノシンヌクレオチドから成る。１つの実施形態では、このグアノシンは７位でメチル化されている。「従来の５'キャップ」という用語は、天然に存在するＲＮＡの５'キャップ、好ましくは７−メチルグアノシンキャップ（ｍ７Ｇ）を指す。本発明に関連して、「５'キャップ」という用語は、ＲＮＡキャップ構造に類似し、好ましくはインビボおよび／または細胞中で、ＲＮＡに結合した場合ＲＮＡを安定化する能力を有するように修飾されている５'キャップ類似体を包含する。
ＲＮＡに５'キャップまたは５'キャップ類似体を提供することは、前記５'キャップまたは５'キャップ類似体の存在下でのＤＮＡ鋳型のインビトロ転写によって達成でき、前記５'キャップを生成されたＲＮＡ鎖に同時転写によって組み込むか、または、例えばインビトロ転写によってＲＮＡを生成し、キャッピング酵素、例えばワクシニアウイルスのキャッピング酵素を用いて転写後に５'キャップをＲＮＡに結合し得る。
ＲＮＡはさらなる修飾を含み得る。例えば、本発明で使用されるＲＮＡのさらなる修飾は、天然に存在するポリ（Ａ）尾部の伸長もしくは末端切断または前記ＲＮＡのコード領域に関連しない非翻訳領域（ＵＴＲ）の導入などの５'ＵＴＲもしくは３'ＵＴＲの変化、例えばグロビン遺伝子、例えばα２グロビン、α１グロビン、βグロビン、好ましくはβグロビン、より好ましくはヒトβグロビンに由来する３'ＵＴＲの１コピー以上、好ましくは２コピーの挿入であり得る。
それゆえ、本発明に従って使用されるＲＮＡの安定性および／または発現を増大させるために、好ましくは１０〜５００個、より好ましくは３０〜３００個、さらにより好ましくは６５〜２００個、特に１００〜１５０個のアデノシン残基の長さを有する、ポリＡ配列と共に存在するようにＲＮＡを修飾し得る。特に好ましい実施形態では、ポリＡ配列は約１２０個のアデノシン残基の長さを有する。加えて、ＲＮＡ分子の３'非翻訳領域（ＵＴＲ）内への２つ以上の３'非翻訳領域の組込みは翻訳効率の上昇をもたらすことができる。１つの特定の実施形態では、３'ＵＴＲはヒトβグロビン遺伝子に由来する。
ＲＮＡの「安定性」という用語は、ＲＮＡの「半減期」に関する。「半減期」は、分子の活性、量または数の半分を除去するのに必要な期間に関する。本発明に関連して、ＲＮＡの半減期は前記ＲＮＡの安定性の指標である。ＲＮＡの半減期は、ＲＮＡの「発現の持続期間」に影響を及ぼし得る。長い半減期を有するＲＮＡは長期間にわたって発現されると予想できる。
本発明に関連して、「転写」という用語は、ＤＮＡ配列中の遺伝暗号がＲＮＡに転写される過程に関する。その後、ＲＮＡはタンパク質に翻訳され得る。本発明によれば、「転写」という用語は「インビトロ転写」を含み、ここで「インビトロ転写」という用語は、ＲＮＡ、特にｍＲＮＡが、好ましくは適切な細胞抽出物を使用して、無細胞系においてインビトロ合成される過程に関する。好ましくは、クローニングベクターを転写産物の生成に適用する。これらのクローニングベクターは一般に転写ベクターと称され、本発明によれば「ベクター」という用語に包含される。
本発明による「翻訳」という用語は、メッセンジャーＲＮＡの鎖がアミノ酸の配列のアセンブリを指令してペプチドまたはタンパク質を作製する、細胞のリボソームにおける過程に関する。
核酸は、本発明によれば、単独で存在し得るかまたは同種もしくは異種であり得る他の核酸と組み合わせて存在し得る。好ましい実施形態では、核酸は、前記核酸に対して同種または異種であり得る発現制御配列に機能的に連結されている。「同種」という用語は、核酸が天然でも機能的に連結されていることを意味し、「異種」という用語は、核酸が天然では機能的に連結されていないことを意味する。
核酸と発現制御配列は、前記核酸の発現または転写が前記発現制御配列の制御下または影響下にあるように互いに共有結合で連結されている場合、互いに「機能的に」連結されている。核酸が機能的タンパク質に翻訳される場合、コード配列に機能的に連結された発現制御配列により、前記発現制御配列の誘導が、コード配列のフレームシフトを引き起こすことなくまたはコード配列が所望のタンパク質もしくはペプチドに翻訳されるのを不可能にすることなく、前記核酸の転写を生じさせる。
「発現制御配列」または「発現制御要素」という用語は、本発明によれば、遺伝子の転写またはｍＲＮＡの翻訳を調節するプロモーター、リボソーム結合部位、エンハンサーおよび他の制御要素を含む。本発明の特定の実施形態では、発現制御配列を調節することができる。発現制御配列の正確な構造は、種または細胞型に応じて異なり得るが、一般に、それぞれ転写および翻訳の開始に関与する５'非転写配列ならびに５'および３'非翻訳配列、例えばＴＡＴＡボックス、キャッピング配列、ＣＡＡＴ配列等を含む。より具体的には、５'非転写発現制御配列は、機能的に連結された核酸の転写制御のためのプロモーター配列を含有するプロモーター領域を含む。発現制御配列は、エンハンサー配列または上流活性化配列も含み得る。
「発現」という用語は、本発明によればその最も一般的な意味で使用され、例えば転写および／または翻訳による、ＲＮＡおよび／またはペプチドもしくはタンパク質の生成を含む。ＲＮＡに関して、「発現」または「翻訳」という用語は、特にペプチドまたはタンパク質の生成に関する。この用語は核酸の部分的発現も含む。さらに、発現は一過性または安定であり得る。本発明によれば、発現という用語は「異所発現」または「異常発現」も包含する。
「異所発現」または「異常発現」は、本発明によれば、参照、例えば特定のタンパク質、例えば腫瘍抗原の異所または異常発現に関連する疾患を有していない被験体における状態と比較して、発現が変化している、好ましくは増大していることを意味する。発現の増大とは、少なくとも１０％、特に少なくとも２０％、少なくとも５０％または少なくとも１００％、またはそれ以上の増大を指す。１つの実施形態では、発現は疾患組織においてのみ認められ、健常組織での発現は抑制されている。
「特異的に発現される」という用語は、タンパク質が、基本的に特定の組織または器官においてのみ発現されることを意味する。例えば、胃粘膜において特異的に発現される腫瘍抗原は、前記タンパク質が主として胃粘膜において発現され、他の組織では発現されないまたは他の組織もしくは器官型では有意の程度に発現されないことを意味する。したがって、胃粘膜の細胞において排他的に発現され、精巣などの他の組織では有意に低い程度に発現されるタンパク質は、胃粘膜の細胞において特異的に発現される。一部の実施形態では、腫瘍抗原はまた、正常条件下では２つ以上の組織型または器官、例えば２または３の組織型または器官において、しかし好ましくは３以下の異なる組織または器官型において特異的に発現され得る。この場合、腫瘍抗原はこれらの器官において特異的に発現される。例えば、腫瘍抗原が、正常条件下では、好ましくは肺と胃においてほぼ同程度に発現される場合、前記腫瘍抗原は肺および胃において特異的に発現される。
本発明によれば、「をコードする核酸」という用語は、核酸が、適切な環境中に、好ましくは細胞内に存在する場合、それがコードするタンパク質またはペプチドを生成するように発現され得ることを意味する。
本発明の一部の態様は、宿主細胞が本明細書で述べる作用物質をコードするＲＮＡなどの核酸を用いてインビトロでトランスフェクトされ、好ましくは低い前駆体頻度から臨床的に適切な細胞数へのエクスビボ増殖後に、患者などの受容者に移入される養子移入に基づく。本発明による処置に使用される宿主細胞は、処置される受容者にとって自己、同種異系または同系であり得る。
「自己」という用語は、同じ被験体に由来する任意のものを表すために使用される。例えば、「自己移植」は、同じ被験体に由来する組織または器官の移植を指す。そのような手順は、さもなければ拒絶反応をもたらす免疫学的障壁を克服するので、好都合である。
「同種異系」という用語は、同じ種の異なる個体に由来する任意のものを表すために使用される。２以上の個体は、１つ以上の遺伝子座の遺伝子が同一でない場合、互いに同種異系であると言われる。
「同系」という用語は、同一の遺伝子型を有する個体または組織、すなわち同一の双生児もしくは同じ近交系の動物またはそれらの組織に由来する任意のものを表すために使用される。
「異種」という用語は、複数の異なる要素から成るものを表すために使用される。一例として、ある個体の骨髄の異なる個体への移入は異種移植を構成する。異種遺伝子は、被験体以外の供給源に由来する遺伝子である。
「トランスフェクション」という用語は、核酸、特にＲＮＡの細胞への導入に関する。本発明の目的上、「トランスフェクション」という用語は、細胞への核酸の導入またはそのような細胞による核酸の取込みも包含し、ここで細胞は被験体、例えば患者の体内に存在し得る。したがって、本発明によれば、本明細書で述べる核酸のトランスフェクションのための細胞は、インビトロまたはインビボで存在することができ、例えば細胞は患者の器官、組織および／または生物のパートを形成し得る。本発明によれば、トランスフェクションは一過性または安定であり得る。トランスフェクションの一部の適用に関しては、トランスフェクトされた遺伝物質が一過性にだけ発現されれば十分である。トランスフェクション工程で導入された核酸は、通常は核ゲノムに組み込まれないので、外来核酸は有糸分裂を介して希釈されるかまたは分解される。核酸のエピソーム増幅を許容する細胞は、希釈の割合を大きく低減させる。トランスフェクトされた核酸が実際に細胞およびその娘細胞のゲノム内に留まることを所望する場合は、安定なトランスフェクションが起こらなければならない。ＲＮＡを、そのコードされるタンパク質を一過性に発現するように細胞にトランスフェクトすることができる。
本発明によれば、核酸を細胞に導入する、すなわち移入するまたはトランスフェクトするために有用な任意の技術を使用し得る。好ましくは、ＲＮＡを標準的な技術によって細胞にトランスフェクトする。そのような技術には、電気穿孔、リポフェクションおよびマイクロインジェクションが含まれる。本発明の１つの特に好ましい実施形態では、ＲＮＡを電気穿孔によって細胞に導入する。
電気穿孔または電気透過化は、外部から印加される電場によって引き起こされる細胞膜の電気伝導度および透過性の有意の増大に関する。通常は、何らかの物質を細胞に導入する方法として分子生物学において用いられる。
本発明によれば、タンパク質またはペプチドをコードする核酸の導入は、前記タンパク質またはペプチドの発現をもたらすことが好ましい。
本発明による「ペプチド」という用語は、オリゴペプチドおよびポリペプチドを含み、ペプチド結合によって共有結合で連結された２個以上、好ましくは３個以上、好ましくは４個以上、好ましくは６個以上、好ましくは８個以上、好ましくは９個以上、好ましくは１０個以上、好ましくは１３個以上、好ましくは１６個以上、好ましくは２１個以上、および好ましくは８、１０、２０、３０、４０または５０個まで、特に１００個までのアミノ酸を含む物質を指す。「タンパク質」という用語は、大きなペプチド、好ましくは１００個を超えるアミノ酸残基を有するペプチドを指すが、一般に「ペプチド」という用語と「タンパク質」という用語は同義語であり、本明細書では交換可能に使用される。
本発明によれば、ペプチドは天然アミノ酸および非天然アミノ酸を含み得る。１つの実施形態では、ペプチドは単に天然アミノ酸だけを含む。
本発明によれば、「非天然アミノ酸」という用語は、２０個の天然アミノ酸種のものとは異なる構造を有するアミノ酸を指す。非天然アミノ酸は天然アミノ酸のものと類似の構造を有するので、非天然アミノ酸は、所与の天然アミノ酸の誘導体または類似体と分類され得る。
好ましくは、本発明に従って述べるタンパク質およびペプチドは単離されている。「単離されたタンパク質」または「単離されたペプチド」という用語は、タンパク質またはペプチドがその天然環境から分離されていることを意味する。単離されたタンパク質またはペプチドは、基本的に精製された状態であり得る。「基本的に精製された」という用語は、タンパク質またはペプチドが、それが自然界でまたはインビボで結合している他の物質を基本的に含まないことを意味する。
特定のアミノ酸配列、例えば配列表に示すものに関して本明細書で与えられる教示は、前記特定配列と機能的に等価である配列、例えば前記特定アミノ酸配列の特性と同一または類似の特性を示すアミノ酸配列を生じさせる前記特定配列の変異体にも関するように解釈されるべきである。１つの重要な特性は、ペプチドのＭＨＣ分子および／もしくはＴ細胞受容体への結合またはＴ細胞受容体のその標的への結合を保持すること、またはＴ細胞のエフェクター機能を維持することである。好ましくは、特定の配列に関して修飾された配列は、それがＴ細胞受容体内の前記特定配列を置換する場合、前記Ｔ細胞受容体の標的への結合および好ましくは前記Ｔ細胞受容体または本明細書で述べるＴ細胞受容体を担持するＴ細胞の機能を保持する。
例えば、配列表に示す配列は、１個以上、好ましくはすべての遊離システイン残基を除去するように、特にシステイン残基をシステイン以外のアミノ酸で、好ましくはセリン、アラニン、トレオニン、グリシン、チロシン、ロイシンまたはメチオニンで、最も好ましくはアラニンまたはセリンで置換することによって、修飾することができる。例えば、配列表の配列番号：３３に示す配列の４５位のシステインまたは前記配列を含む配列内の対応するシステインをこのようにして修飾し得る。
特にＣＤＲ配列、超可変および可変領域の配列は、標的に結合する能力を失うことなく修飾され得ることは当業者に認識される。例えばＣＤＲ領域は、本明細書で指定される抗体の領域と同一または高度に相同性である。「高度に相同性」により、１〜５個、好ましくは１〜４個、例えば１〜３個または１もしくは２個の置換がＣＤＲ内で行われ得ることが企図される。加えて、超可変および可変領域は、それらが本明細書で具体的に開示される領域と実質的な相同性を示すように修飾され得る。
ペプチド「変異体」は、所与のペプチドの免疫原性を保持し得る（例えばＴ細胞株またはクローンと反応する変異体の能力は所与のペプチドに比べて実質的に低下しない）。言い換えると、Ｔ細胞株またはクローンと反応する変異体の能力は、所与のペプチドに比べて増強され得るもしくは不変であり得るか、または所与のペプチドに比べて５０％未満、好ましくは２０％未満だけ低下していてもよい。
変異体は、ＭＨＣ分子に結合するその能力を評価することによって同定され得る。１つの好ましい実施形態では、変異体ペプチドは、ＭＨＣ分子に結合する変異体ペプチドの能力が所与のペプチドに比べて増大されるような修飾を有する。ＭＨＣ分子に結合する変異体ペプチドの能力は、所与のペプチドの能力に比べて少なくとも２倍、好ましくは少なくとも３倍、４倍または５倍増大され得る。したがって、特定の好ましい実施形態では、ペプチドは、免疫原性部分内の１〜３個のアミノ酸残基が、Ｔ細胞株またはクローンと反応する能力が非修飾ペプチドに関するものよりも統計的に大きいように置換されている変異体を含む。そのような置換は、好ましくはペプチドのＭＨＣ結合部位内に位置する。好ましい置換は、ＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ分子への結合を増大させる。特定の変異体は保存的置換を含む。
本発明による「変異体」という用語はまた、突然変異体、スプライス変異体、立体配座変異体、アイソフォーム、対立遺伝子変異体、種変異体および種ホモログ、特に天然に存在するものも包含する。対立遺伝子変異体は、遺伝子の正常な配列中の変化に関するが、その重要性はしばしば不明である。完全な遺伝子配列決定は、しばしば所与の遺伝子について数多くの対立遺伝子変異体を同定する。種ホモログは、所与の核酸配列またはアミノ酸配列のものとは異なる種を起源とする核酸配列またはアミノ酸配列である。「変異体」という用語は、任意の翻訳後修飾変異体および立体配座変異体を包含する。
本発明の目的上、アミノ酸配列の「変異体」は、アミノ酸挿入変異体、アミノ酸付加変異体、アミノ酸欠失変異体および／またはアミノ酸置換変異体を含む。タンパク質のＮ末端および／またはＣ末端に欠失を含むアミノ酸欠失変異体は、Ｎ末端および／またはＣ末端切断変異体とも呼ばれる。
アミノ酸挿入変異体は、特定のアミノ酸配列内に１個または２個以上のアミノ酸の挿入を含む。挿入を有するアミノ酸配列変異体の場合、１個以上のアミノ酸残基がアミノ酸配列内の特定の部位に挿入されているが、生じる産物の適切なスクリーニングを伴うランダムな挿入も可能である。
アミノ酸付加変異体は、１個以上のアミノ酸、例えば１、２、３、５、１０、２０、３０または５０個以上のアミノ酸のアミノ末端および／またはカルボキシ末端融合を含む。
アミノ酸欠失変異体は、配列からの１個以上のアミノ酸の除去、例えば１、２、３、５、１０、２０、３０または５０個以上のアミノ酸の除去を特徴とする。欠失はタンパク質の任意の位置であり得る。
アミノ酸置換変異体は、配列内の少なくとも１個の残基が除去され、別の残基がその位置に挿入されていることを特徴とする。相同なタンパク質もしくはペプチドの間で保存されていないアミノ酸配列内の位置に修飾が存在することおよび／またはアミノ酸が類似の特性を有する別のアミノ酸で置換されていることが好ましい。好ましくは、タンパク質変異体内のアミノ酸変化は、保存的アミノ酸変化、すなわち類似の荷電または非荷電アミノ酸の置換である。保存的アミノ酸変化は、その側鎖が関連するアミノ酸のファミリーの１つの置換を含む。天然に存在するアミノ酸は、一般に４つのファミリーに分けられる：酸性（アスパラギン酸、グルタミン酸）、塩基性（リシン、アルギニン、ヒスチジン）、非極性（アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、および非荷電極性（グリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、トレオニン、チロシン）アミノ酸。フェニルアラニン、トリプトファンおよびチロシンは、時として芳香族アミノ酸として一緒に分類される。
好ましくは、所与のアミノ酸配列と前記所与のアミノ酸配列の変異体であるアミノ酸配列との間の類似性、好ましくは同一性の程度は、少なくとも約６０％、６５％、７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％である。類似性または同一性の程度は、好ましくは参照アミノ酸配列の全長の少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％または約１００％であるアミノ酸領域に関して与えられる。例えば、参照アミノ酸配列が２００個のアミノ酸から成る場合、類似性または同一性の程度は、好ましくは少なくとも約２０、少なくとも約４０、少なくとも約６０、少なくとも約８０、少なくとも約１００、少なくとも約１２０、少なくとも約１４０、少なくとも約１６０、少なくとも約１８０または約２００個のアミノ酸、好ましくは連続するアミノ酸に関して与えられる。好ましい実施形態では、類似性または同一性の程度は、参照アミノ酸配列の全長に関して与えられる。配列類似性、好ましく配列同一性を決定するためのアラインメントは、当分野で公知のツールを用いて、好ましくは最良配列アラインメントを使用して、例えばＡｌｉｇｎを使用して、標準的な設定、好ましくはＥＭＢＯＳＳ：：ニードル、マトリックス：Ｂｌｏｓｕｍ６２、キャップオープン１０．０、ギャップ伸長０．５を用いて実施できる。
「配列類似性」は、同一であるかまたは保存的アミノ酸置換を表すアミノ酸のパーセントを示す。２つのアミノ酸配列の間の「配列同一性」は、これらの配列間で同一であるアミノ酸のパーセントを示す。
「同一性パーセント」という用語は、最良のアラインメント後に得られる、比較しようとする２つの配列の間で同一であるアミノ酸残基のパーセントを表すことが意図されており、このパーセントは純粋に統計的であって、２つの配列間の相違はランダムにおよびそれらの全長にわたって分布している。２つのアミノ酸配列の間の配列比較は、従来これらの配列を最適に整列した後で比較することによって実施され、前記比較は、配列類似性の局所領域を同定し、比較するためにセグメントごとにまたは「比較ウィンドウ」ごとに実施される。比較のための配列の最適アラインメントは、手作業による以外に、Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｗａｔｅｒｍａｎ，１９８１，Ａｄｓ Ａｐｐ．Ｍａｔｈ．２，４８２の局所相同性アルゴリズムによって、Ｎｅｄｄｌｅｍａｎ ａｎｄ Ｗｕｎｓｃｈ，１９７０，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８，４４３の局所相同性アルゴリズムによって、Ｐｅａｒｓｏｎ ａｎｄ Ｌｉｐｍａｎ，１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５，２４４４の類似性検索法によって、またはこれらのアルゴリズムを使用したコンピュータプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒｉｖｅ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．のＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴ Ｐ、ＢＬＡＳＴ ＮおよびＴＦＡＳＴＡ）によって作成され得る。
同一性パーセントは、比較する２つの配列の間で同一の位置の数を決定し、これら２つの配列間の同一性パーセントを得るためにこの数を比較する位置の数で除して、得られた結果に１００を乗じることによって計算される。
相同なアミノ酸配列は、本発明によればアミノ酸残基の少なくとも４０％、特に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、および好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％の同一性を示す。
本明細書で述べるアミノ酸配列変異体は、例えば組換えＤＮＡ操作により、当業者によって容易に調製され得る。置換、付加、挿入または欠失を有するタンパク質およびペプチドを調製するためのＤＮＡ配列の操作は、例えばＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．（１９８９）において詳細に説明されている。さらに、本明細書で述べるペプチドおよびアミノ酸変異体は、例えば固相合成および類似の方法などによる公知のペプチド合成技術を用いて容易に調製され得る。
本発明は、「ペプチド」および「タンパク質」という用語に含まれる、本明細書で述べるペプチドまたはタンパク質の誘導体を包含する。本発明によれば、タンパク質およびペプチドの「誘導体」は、タンパク質およびペプチドの修飾形態である。そのような修飾は、任意の化学的修飾を包含し、タンパク質またはペプチドに関連する任意の分子、例えば糖質、脂質および／またはタンパク質もしくはペプチドの単一または複数の置換、欠失および／または付加を含む。１つの実施形態では、タンパク質またはペプチドの「誘導体」は、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、パルミトイル化、ミリストイル化、イソプレニル化、脂質化、アルキル化、誘導体化、保護基の導入、タンパク質分解切断または抗体もしくは別の細胞リガンドへの結合から生じる修飾された類似体を包含する。「誘導体」という用語はまた、前記タンパク質およびペプチドのすべての機能的な化学的等価物に及ぶ。好ましくは、修飾されたペプチドは、高い安定性および／または高い免疫原性を有する。
ペプチドの模倣物も包含される。そのような模倣物は、１個以上のアミノ酸模倣物に連結されたアミノ酸を含み得るか（すなわちペプチド内の１個以上のアミノ酸がアミノ酸模倣物で置換されていてもよい）または完全に非ペプチド模倣物であり得る。アミノ酸模倣物は、例えばＴ細胞株またはクローンと反応する能力を実質的に低下させずにアミノ酸を置換することができる、立体配座的にアミノ酸に類似する化合物である。非ペプチド模倣物は、アミノ酸を含まず、および、例えばＴ細胞株またはクローンと反応する模倣物の能力が所与のペプチドの能力に比べて実質的に低下していない、ペプチドに類似した全体的立体配座を有する化合物である。
本発明によれば、アミノ酸配列、ペプチドまたはタンパク質の変異体、誘導体、修飾形態、フラグメント、パートまたは部分は、好ましくは、それぞれそれが由来するアミノ酸配列、ペプチドまたはタンパク質の機能的特性を有する、すなわち機能的に等価である。１つの実施形態では、アミノ酸配列、ペプチドまたはタンパク質の変異体、誘導体、修飾形態、フラグメント、パートまたは部分は、それぞれそれが由来するアミノ酸配列、ペプチドまたはタンパク質と免疫学的に等価である。１つの実施形態では、機能的特性は免疫学的特性である。
特定の特性は、ＭＨＣ分子と複合体を形成し、および適切な場合は、好ましくは細胞傷害性またはＴヘルパー細胞を刺激することによって、免疫応答を生じさせる能力である。
「免疫学的に等価」という用語は、免疫学的に等価の分子、例えば免疫学的に等価のアミノ酸配列が、例えば体液性および／もしくは細胞性免疫応答の誘導などの免疫学的作用の種類、誘導される免疫反応の強さおよび／もしくは持続期間、または誘導される免疫反応の特異性に関して、同じもしくは基本的に同じ免疫学的特性を示すおよび／または同じもしくは基本的に同じ免疫学的作用を及ぼすことを意味する。本発明に関連して、「免疫学的に等価」という用語は、好ましくは免疫のために使用されるペプチドまたはペプチド変異体の免疫学的作用または特性に関して用いられる。例えば、アミノ酸配列が被験体の免疫系に暴露されたとき参照アミノ酸配列と反応する特異性を有する免疫反応を誘導する場合、前記アミノ酸配列は参照アミノ酸配列と免疫学的に等価である。
「由来する」という用語は、本発明によれば、特定の実体、特に特定の配列が、それが誘導される対象物、特に生物または分子中に存在することを意味する。アミノ酸配列、特に特定の配列領域の場合、「由来する」は特に、該当するアミノ酸配列が、その配列がその中に存在するアミノ酸配列から誘導されることを意味する。
「細胞」または「宿主細胞」という用語は、好ましくは無傷の細胞、すなわち酵素、細胞小器官または遺伝物質などのその通常の細胞内成分が放出されていない無傷の膜を有する細胞に関する。無傷の細胞は、好ましくは生存可能細胞、すなわちその正常な代謝機能を実施することができる生細胞である。好ましくは、前記用語は、本発明によれば、外因性核酸でトランスフェクトすることができる任意の細胞に関する。好ましくは、細胞は、外因性核酸でトランスフェクトされ、受容者に移入された場合、受容者において核酸を発現することができる。「細胞」という用語は細菌細胞を包含する；他の有用な細胞は、酵母細胞、真菌細胞または哺乳動物細胞である。適切な細菌細胞には、グラム陰性細菌株、例えば大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）、プロテウス属（Ｐｒｏｔｅｕｓ）およびシュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）の菌株、ならびにグラム陽性細菌株、例えばバチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、ストレプトミセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）、連鎖球菌属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）およびラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）の菌株からの細胞が含まれる。適切な真菌細胞には、トリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）、アカパンカビ属（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ）およびアスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）の種からの細胞が含まれる。適切な酵母細胞には、サッカロミセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）（例えばサッカロミセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ））、シゾサッカロミセス属（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）（例えばシゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏ ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ））、ピキア属（Ｐｉｃｈｉａ）（例えばピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）およびピキア・メタノリカ（Ｐｉｃｈｉａ ｍｅｔｈａｎｏｌｉｃｄ））ならびにハンセニューラ属（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ）の種からの細胞が含まれる。適切な哺乳動物細胞には、例えばＣＨＯ細胞、ＢＨＫ細胞、ＨｅＬａ細胞、ＣＯＳ細胞、２９３ ＨＥＫ等が含まれる。しかし、両生類細胞、昆虫細胞、植物細胞、および異種タンパク質の発現のために当分野で使用される任意の他の細胞も使用できる。ヒト、マウス、ハムスター、ブタ、ヤギおよび霊長動物からの細胞などの哺乳動物細胞は、養子移入のために特に好ましい。細胞は多くの組織型に由来してよく、初代細胞および細胞株、例えば免疫系の細胞、特に樹状細胞およびＴ細胞などの抗原提示細胞、造血幹細胞および間葉系幹細胞などの幹細胞、ならびに他の細胞型が含まれる。抗原提示細胞は、主要組織適合遺伝子複合体に関連して抗原をその表面に展示する細胞である。Ｔ細胞は、そのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を使用してこの複合体を認識し得る。
核酸分子を含む細胞は、好ましくは前記核酸によってコードされるペプチドまたはタンパク質を発現する。
細胞は、組換え細胞であってよく、コードされたペプチドまたはタンパク質を分泌することができ、それを表面に発現することができ、好ましくは前記ペプチドまたはタンパク質またはそのプロセシング産物に結合するＭＨＣ分子を付加的に発現し得る。１つの実施形態では、細胞はＭＨＣ分子を内因性に発現する。さらなる実施形態では、細胞は、ＭＨＣ分子および／またはペプチドもしくはタンパク質もしくはそのプロセシング産物を組換え的に発現する。細胞は、好ましくは非増殖性である。好ましい実施形態では、細胞は抗原提示細胞、特に樹状細胞、単球またはマクロファージである。
「クローン増殖」という用語は、特定の実体が増加する過程を指す。本発明に関連して、この用語は、好ましくはリンパ球が抗原によって刺激され、増殖して、前記抗原を認識する特定のリンパ球が増幅される免疫学的応答に関連して使用される。好ましくは、クローン増殖はリンパ球の分化をもたらす。
抗原発現に関連する疾患は、生物学的試料中のペプチドと特異的に反応するＴ細胞の存在に基づいて検出し得る。特定の方法では、患者から単離されたＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞を含む生物学的試料を、本発明のペプチド、そのようなペプチドをコードする核酸ならびに／またはそのようなペプチドの少なくとも免疫原性部分を発現するおよび／もしくは提示する抗原提示細胞と共にインキュベートし、Ｔ細胞の特異的活性化の存在または不在を検出する。適切な生物学的試料には、単離されたＴ細胞が含まれるが、これに限定されない。例えば、Ｔ細胞は通常の技術によって（例えば末梢血リンパ球のＦｉｃｏｌｌ／Ｈｙｐａｑｕｅ密度勾配遠心分離によって）患者から単離し得る。ＣＤ４＋Ｔ細胞に関しては、活性化は、好ましくはＴ細胞の増殖を評価することによって検出される。ＣＤ８＋Ｔ細胞に関しては、活性化は、好ましくは細胞溶解活性を評価することによって検出される。疾患を有さない被験体におけるよりも少なくとも２倍大きい増殖のレベルおよび／または少なくとも２０％大きい細胞溶解活性のレベルは、被験体における抗原発現に関連する疾患の存在を示す。
本明細書で使用される「低減する」または「阻害する」は、好ましくは５％以上、１０％以上、２０％以上、より好ましくは５０％以上、最も好ましくは７５％以上の、レベルの全体的な低下を生じさせる能力を意味する。「阻害する」という用語または同様の語句は、完全なまたは基本的に完全な阻害、すなわちゼロへの低減または基本的にゼロへの低減を包含する。
「増大させる」または「増強する」などの用語は、好ましくは、およそ少なくとも１０％、好ましくは少なくとも２０％、好ましくは少なくとも３０％、より好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、さらにより好ましくは少なくとも８０％、最も好ましくは少なくとも１００％の増大または増強に関する。
本明細書で述べる作用物質、組成物および方法は、疾患、例えばＣＬＤＮ６を発現し、および好ましくはＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する疾患細胞の存在を特徴とする疾患を有する被験体を処置するために使用することができる。処置するおよび／または予防することができる疾患の例は、ＣＬＤＮ６を発現するすべての疾患を包含する。特に好ましい疾患は癌疾患である。
本明細書で述べる作用物質、組成物および方法はまた、本明細書で述べる疾患を予防するための免疫またはワクチン接種にも使用し得る。
「正常組織」または「正常状態」という用語は、健常組織または健常被験体における状態、すなわち非病的状態を指し、ここで「健常」は、好ましくは非癌性を意味する。
「疾患」という用語は、個体の身体を侵す異常な状態を指す。疾患はしばしば、特定の症状および徴候と関連する医学的状態と解釈される。疾患は、感染性疾患などの、もともと外部起源からの因子によって引き起こされ得るか、または自己免疫疾患などの、内部機能不全によって引き起こされ得る。ヒトでは、「疾患」はしばしば、罹患した個人に疼痛、機能不全、窮迫、社会問題または死亡を引き起こす、またはその個人と接触した人に同様の問題を引き起こすあらゆる状態を指すためにより広く使用される。このより広い意味で、疾患は時として、損傷、障害、疾病、症候群、感染、孤発性症状、逸脱行動ならびに構造および機能の非定型変化を包含するが、他の状況ではおよび他の目的上は、これらは区別できるカテゴリーと見なされ得る。多くの疾患を有することおよび多くの疾患と共に生活することはその人の人生の見方および人格を変化させ得るので、疾患は通常、肉体的のみならず感情的にも個人に影響を及ぼす。本発明によれば、「疾患」という用語は、癌、特に本明細書で述べる癌の形態を包含する。癌または癌の特定の形態への本明細書での言及は、その癌転移も包含する。好ましい実施形態では、本出願に従って処置される疾患は、ＣＬＤＮ６を発現し、および場合によりＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する細胞を含む。
「ＣＬＤＮ６を発現する細胞を含む疾患」または同様の表現は、本発明によれば、ＣＬＤＮ６が疾患組織または器官の細胞において発現されることを意味する。１つの実施形態では、疾患組織または器官の細胞におけるＣＬＤＮ６の発現は、健常組織または器官における状態と比較して増大している。増大とは、少なくとも１０％、特に少なくとも２０％、少なくとも５０％、少なくとも１００％、少なくとも２００％、少なくとも５００％、少なくとも１０００％、少なくとも１００００％またはさらにそれ以上の増大を指す。１つの実施形態では、発現は疾患組織においてのみ認められ、健常組織での発現は抑制されている。本発明によれば、ＣＬＤＮ６を発現する細胞を含む疾患は癌疾患を包含する。さらに、本発明によれば、癌疾患は、好ましくは癌細胞がＣＬＤＮ６を発現する疾患である。
「癌疾患」または「癌」という用語は、典型的には調節されない細胞増殖を特徴とする、個体における生理的状態を指すまたは表す。癌の例には、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫および白血病が含まれるが、これらに限定されない。より特定すると、そのような癌の例には、骨癌、血液癌、肺癌、肝癌、膵癌、皮膚癌、頭頸部癌、皮膚または眼内黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門部の癌、胃癌、結腸癌、乳癌、前立腺癌、子宮癌、性器および生殖器の癌、ホジキン病、食道癌、小腸癌、内分泌系の癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟組織の肉腫、膀胱癌、腎癌、腎細胞癌、腎盂の癌、中枢神経系（ＣＮＳ）の新生物、神経外胚葉癌、脊髄軸の腫瘍、神経膠腫、髄膜腫および下垂体腺腫が含まれる。本発明による「癌」という用語は癌転移も含む。好ましくは、「癌疾患」はＣＬＤＮ６を発現する細胞を特徴とし、癌細胞はＣＬＤＮ６を発現する。
疾患細胞は、好ましくはＣＬＤＮ６を発現する細胞であり、前記ＣＬＤＮ６は、好ましくは膜貫通タンパク質として前記細胞の表面に存在するおよび／またはＭＨＣ ＩなどのＭＨＣに関連して前記細胞によって提示される。ＣＬＤＮ６を発現する細胞は、好ましくは癌細胞、好ましくは本明細書で述べる癌の癌細胞である。
１つの実施形態では、癌疾患は、退形成、侵襲性および転移の性質を特徴とする悪性疾患である。悪性腫瘍は、悪性疾患がその成長において自己限定性でなく、隣接組織に浸潤することができ、および遠位組織に広がる（転移する）能力を有し得るという点で、非癌性の良性腫瘍と対比することができ、良性腫瘍はこれらの性質を有さない。
本発明によれば、「腫瘍」または「腫瘍性疾患」という用語は、細胞（新生細胞または腫瘍細胞と呼ばれる）の異常増殖によって形成される腫脹または病変を指す。「腫瘍細胞」とは、急速で制御されない細胞増殖によって成長し、新たな成長を開始させた刺激が停止した後も成長し続ける異常細胞を意味する。腫瘍は、構造機構および正常組織との機能的協調の部分的または完全な欠如を示し、通常、良性、前悪性または悪性のいずれかであり得る明確な組織塊を形成する。
本発明によれば、「癌腫」は、上皮細胞に由来する悪性腫瘍である。この群は、一般的な形態の乳癌、前立腺癌、肺癌および結腸癌を含む、最も一般的な癌である。
「腺癌」は、腺組織で発生する癌である。この組織は、上皮組織として知られるより大きな組織カテゴリーの一部でもある。上皮組織には、皮膚、腺ならびに体腔および身体の器官の内側を覆う様々な他の組織が含まれる。上皮は、発生学的には外胚葉、内胚葉および中胚葉に由来する。腺癌として分類されるには、細胞は、それらが分泌特性を有する限り、必ずしも腺の一部である必要はない。この形態の癌腫は、ヒトを含む一部の高等哺乳動物において発生し得る。十分に分化した腺癌は、それらが由来する腺組織に類似する傾向があるが、十分に分化していないものはその傾向がない場合もある。生検からの細胞を染色することにより、病理学者は腫瘍が腺癌であるかまたは何らかの他の型の癌であるかを決定する。腺癌は、体内の腺の遍在性のゆえに身体の多くの組織で生じ得る。各々の腺が同じ物質を分泌しているとは限らないが、細胞への外分泌機能が存在する限り、腺と見なされ、それゆえその悪性形態は腺癌と命名される。悪性腺癌は他の組織を浸潤し、転移するのに十分な時間があればしばしば転移する。卵巣腺癌は最も一般的な型の卵巣癌である。これには漿液性および粘液性腺癌、明細胞腺癌および類内膜腺癌が含まれる。
リンパ腫および白血病は、造血（血液形成）細胞に由来する悪性疾患である。
芽球腫または芽細胞腫は、未熟な組織または胚組織に類似する腫瘍（通常は悪性）である。これらの腫瘍の多くは小児において最も一般的である。
「転移」とは、そのもとの部位から身体の別の部分への癌細胞の拡大を意味する。転移の形成は非常に複雑な過程であり、原発性腫瘍からの悪性細胞の分離、細胞外マトリックスの侵襲、体腔および脈管に侵入するための内皮基底膜の貫通、ならびに次に、血液によって運ばれた後、標的器官の浸潤に依存する。最後に、標的部位における新たな腫瘍の成長は血管新生に依存する。腫瘍転移はしばしば原発性腫瘍の除去後でも起こり、これは、腫瘍細胞または腫瘍成分が残存し、転移能を発現し得るからである。１つの実施形態では、本発明による「転移」という用語は「遠隔転移」に関し、これは、原発性腫瘍および所属リンパ節系から遠く離れた転移に関する。１つの実施形態では、本発明による「転移」という用語はリンパ節転移に関する。
二次性または転移性腫瘍の細胞は、もとの腫瘍における細胞に類似する。これは、例えば卵巣癌が肝臓に転移した場合、二次性腫瘍は異常な肝細胞ではなく異常な卵巣細胞で構成されることを意味する。肝臓における腫瘍は、その場合、肝癌ではなく転移性卵巣癌と呼ばれる。
再発または回帰は、人が過去に罹患した状態に再び侵される場合に起こる。例えば、患者が腫瘍性疾患に罹患したことがあり、前記疾患の処置を受けて成功したが、前記疾患を再び発症した場合、前記の新たに発症した疾患は再発または回帰とみなされ得る。しかし、本発明によれば、腫瘍性疾患の再発または回帰は、もとの腫瘍性疾患の部位でも起こり得るが、必ずしもそうとは限らない。したがって、例えば、患者が卵巣腫瘍に罹患し、治療を受けて成功したことがある場合、再発または回帰は、卵巣腫瘍の発生であり得るかまたは卵巣とは異なる部位での腫瘍の発生であり得る。腫瘍の再発または回帰は、腫瘍がもとの腫瘍の部位とは異なる部位で起こる状況ならびにもとの腫瘍の部位で起こる状況も包含する。好ましくは、患者が処置を受けたことがあるもとの腫瘍は原発性腫瘍であり、もとの腫瘍の部位とは異なる部位における腫瘍は二次性または転移性腫瘍である。
「処置」または「治療的処置」という用語は、個体の健康状態を改善するおよび／または個体の寿命を延長させる（増大させる）あらゆる処置に関する。前記処置は、個体において疾患を除去し得る、個体において疾患の発症を停止させ得るもしくは遅らせ得る、個体において疾患の発症を阻害し得るもしくは遅らせ得る、個体において症状の頻度もしくは重症度を低下させ得る、ならびに／または現在疾患を有しているもしくは以前に有していたことがある個体において再発を減少させ得る。
「予防的処置」または「防止的処置」という用語は、個体において疾患の発生を予防することを意図したあらゆる処置に関する。「予防的処置」または「防止的処置」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。
「個体」および「被験体」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。これらの用語は、疾患または障害（例えば癌）に罹患し得るまたは罹患しやすいが、疾患または障害を有している可能性があるまたは有していない可能性があるヒト、非ヒト霊長動物または他の哺乳動物（例えばマウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ウマまたは霊長動物）を指す。多くの実施形態では、個体はヒトである。特に明記されない限り、「個体」および「被験体」という用語は特定の年齢を意味せず、したがって成体、高齢者、小児および新生児を包含する。本発明の好ましい実施形態では、「個体」または「被験体」は「患者」である。「患者」という用語は、本発明によれば処置のための被験体、特に疾患被験体を意味する。
「危険性がある」とは、一般集団と比較して、疾患、特に癌を発症する可能性が通常より高いと同定される被験体、すなわち患者を意味する。加えて、疾患、特に癌を有していたことがあるまたは現在有している被験体は、そのような被験体は引き続き疾患を発症する可能性があるので、疾患を発症する危険性が高い被験体である。現在癌を有しているまたは癌を有していたことがある被験体は、癌転移の危険性も高い。
「免疫療法」という用語は、特異的免疫反応を含む処置に関する。
本発明に関連して、「保護する」、「予防する」、「予防的」、「防止的」または「保護的」などの用語は、被験体における疾患の発症および／または伝播の予防または処置またはその両方、特に被験体が疾患を発症する可能性を最小限に抑えるまたは疾患の発症を遅らせることに関する。例えば、腫瘍の危険性がある人は、上述したように、腫瘍を予防するための治療法の候補者である。
免疫療法の予防的投与、例えば本発明の作用物質または組成物の予防的投与は、好ましくは受容者を疾患の発症から保護する。免疫療法の治療的投与、例えば本発明の作用物質または組成物の治療的投与は、疾患の進行／成長の阻害をもたらし得る。これは、好ましくは疾患の排除をもたらす、疾患の進行／成長の減速、特に疾患の進行の停止を含む。
免疫療法は、本明細書で提供される作用物質が好ましくはＣＬＤＮ６発現細胞を患者から除去するように機能する、様々な技術のいずれかを用いて実施し得る。そのような除去は、患者においてＣＬＤＮ６なまたはＣＬＤＮ６を発現するおよび／もしくはＭＨＣ分子に関連してＣＬＤＮ６を提示する細胞に特異的な免疫応答を増強するまたは誘導することの結果として起こり得る。
特定の実施形態では、免疫療法は能動免疫療法であり得、この場合の処置は、免疫応答調節物質（例えば本明細書で提供されるペプチドおよび核酸）の投与による、疾患細胞に対して反応する内因性宿主免疫系のインビボ刺激に基づく。
他の実施形態では、免疫療法は受動免疫療法であり得、この場合の処置は、直接または間接的に抗腫瘍作用を媒介することができ、必ずしも無傷の宿主免疫系に依存しない確立された腫瘍−免疫反応性を有する作用物質（例えばエフェクター細胞）の送達を含む。エフェクター細胞の例には、Ｔリンパ球（例えばＣＤ８＋細胞傷害性Ｔリンパ球およびＣＤ４＋Ｔヘルパーリンパ球）ならびに抗原提示細胞（例えば樹状細胞およびマクロファージ）が含まれる。本明細書で言及されるＣＬＤＮ６ペプチドに特異的なＴ細胞受容体およびＣＬＤＮ６に特異的な人工Ｔ細胞受容体を、養子免疫療法のためにエフェクター細胞に移入し得る。
上述したように、本明細書で提供される免疫反応性ペプチドは、免疫療法に十分な数の細胞を生成するために抗原特異的Ｔ細胞培養物を速やかに増殖させるのに使用し得る。特に、樹状細胞、マクロファージ、単球、線維芽細胞および／またはＢ細胞などの抗原提示細胞を、当分野で周知の標準的な技術を用いて免疫反応性ペプチドでパルスし得るかまたは１つ以上の核酸でトランスフェクトし得る。治療法で使用するための培養したエフェクター細胞は、成長して広く分布し、インビボで長期間生存することができなければならない。培養したエフェクター細胞を、インビボで成長させ、ＩＬ−２を添加した抗原での反復刺激によって多数で長期間生存するように誘導できることが試験で示されている（例えばＣｈｅｅｖｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９７），Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ １５７，１７７参照）。
あるいは、本明細書で言及されるペプチドを発現する核酸を、患者から採取した抗原提示細胞に導入し、同じ患者に戻し移植するためにエクスビボでクローン増殖させ得る。
トランスフェクトした細胞を当分野で公知の任意の手段を用いて、好ましくは静脈内、腔内、腹腔内または腫瘍内投与によって滅菌形態で、患者に再導入し得る。
本明細書で開示される方法は、ペプチドまたはペプチドを発現する抗原提示細胞に応答して活性化された自己Ｔ細胞の投与を含み得る。そのようなＴ細胞はＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋であり得、上述したように増殖させ得る。前記Ｔ細胞を、疾患の発症を阻害するのに有効な量で被験体に投与し得る。
「免疫」または「ワクチン接種」という用語は、治療的または予防的理由で免疫応答を誘導することを目的として被験体を処置する工程を表す。
「インビボ」という用語は、被験体における状況に関する。
本発明によれば、「試料」は、本発明に従って有用な任意の試料、特に生物学的試料、例えば体液を含む組織試料および／または細胞試料であり得、従来の方法で、例えばパンチ生検を含む組織生検によって、および血液、気管支吸引液、痰、尿、糞便または他の体液を採取することによって入手し得る。本発明によれば、「試料」という用語は、生物学的試料の分画または単離物、例えば核酸およびペプチド／タンパク質単離物などの処理された試料も包含する。
本明細書で述べる化合物および作用物質は、任意の適切な医薬組成物の形態で投与し得る。
本発明の医薬組成物は、好ましくは無菌であり、所望の反応または所望の作用を生じさせるために本明細書で述べる作用物質および場合により本明細書で論じるさらなる作用物質の有効量を含む。
医薬組成物は、通常は単位投与形態で提供され、それ自体公知の方法で調製され得る。医薬組成物は、例えば溶液または懸濁液の形態であり得る。
医薬組成物は、塩、緩衝物質、防腐剤、担体、希釈剤および／または賦形剤を含んでよく、それらすべてが、好ましくは医薬的に許容される。「医薬的に許容される」という用語は、医薬組成物の活性成分の作用と相互作用しない物質の無毒性を指す。
医薬的に許容されない塩は、医薬的に許容される塩を調製するために使用してよく、本発明に包含される。この種の医薬的に許容される塩は、非限定的に、以下の酸：塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、マレイン酸、酢酸、サリチル酸、クエン酸、ギ酸、マロン酸、コハク酸等から調製されるものを含む。医薬的に許容される塩はまた、アルカリ金属塩またはアルカリ土類金属塩、例えばナトリウム塩、カリウム塩またはカルシウム塩としても調製され得る。
医薬組成物における使用のための適切な緩衝物質には、塩中の酢酸、塩中のクエン酸、塩中のホウ酸および塩中のリン酸が含まれる。
医薬組成物における使用のための適切な防腐剤には、塩化ベンザルコニウム、クロロブタノール、パラベンおよびチメロサールが含まれる。
注射用製剤は、乳酸リンガー液などの医薬的に許容される賦形剤を含み得る。
「担体」という用語は、適用を容易にする、増強するまたは可能にするために活性成分と組み合わせる、天然または合成の有機または無機成分を指す。本発明によれば、「担体」という用語はまた、患者への投与に適した、１つ以上の適合性の固体または液体充填剤、希釈剤または被包物質も包含する。
非経口投与のための可能な担体物質は、例えば滅菌水、リンガー液、乳酸リンガー液、滅菌塩化ナトリウム溶液、ポリアルキレングリコール、水素化ナフタレンおよび、特に生体適合性ラクチドポリマー、ラクチド／グリコリドコポリマーまたはポリオキシエチレン／ポリオキシプロピレンコポリマーである。
本明細書で使用される場合の「賦形剤」という用語は、医薬組成物中に存在してよく、および活性成分ではないすべての物質、例えば担体、結合剤、潤滑剤、増粘剤、界面活性剤、防腐剤、乳化剤、緩衝剤、着香剤または着色剤を示すことが意図されている。
本明細書で述べる作用物質および組成物は、任意の従来の経路によって、例えば注射または注入を含む非経口投与によって投与し得る。投与は、好ましくは非経口的であり、例えば静脈内、動脈内、皮下、皮内または筋肉内経路である。
非経口投与に適する組成物は、通常、好ましくは受容者の血液と等張である、活性化合物の滅菌水性または非水性調製物を含む。適合性担体および溶媒の例は、リンガー液および等張塩化ナトリウム溶液である。加えて、通常は滅菌の、固定油が溶液または懸濁液媒質として使用される。
本明細書で述べる作用物質および組成物は有効量で投与される。「有効量」は、単独でまたはさらなる投与と共に所望の反応または所望の作用を達成する量を指す。特定の疾患または特定の状態の処置の場合、所望の反応は、好ましくは疾患の進行の阻止に関する。これは、疾患の進行を遅らせることおよび、特に疾患の進行を妨げるまたは逆転させることを含む。疾患または状態の処置における所望の反応はまた、前記疾患または前記状態の発症の遅延または発症の予防であり得る。
本明細書で述べる作用物質または組成物の有効量は、処置される状態、疾患の重症度、患者の年齢、生理的状態、大きさおよび体重を含む患者の個別パラメータ、処置の期間、併用療法の種類（存在する場合）、特定の投与経路ならびに同様の因子に依存する。したがって、本明細書で述べる作用物質の投与される用量は、そのような様々なパラメータに依存し得る。患者における反応が初期用量で不十分である場合は、より高用量（または異なる、より限局された投与経路によって達成される効果的により高い用量）を使用し得る。
本明細書で述べる作用物質および組成物は、本明細書で述べるような様々な障害を処置するまたは予防するために、例えばインビボで、患者に投与することができる。好ましい患者には、本明細書で述べる作用物質および組成物を投与することによって矯正または改善することができる障害を有するヒト患者が含まれる。これは、ＣＬＤＮ６の発現を特徴とする細胞を含む障害を包含する。
例えば、１つの実施形態では、本明細書で述べる作用物質は、癌疾患、例えばＣＬＤＮ６を発現する癌細胞の存在を特徴とする、本明細書で述べるような癌疾患を有する患者を処置するために使用できる。
本発明に従って述べる医薬組成物および処置の方法は、本明細書で述べる疾患を予防するための免疫またはワクチン接種にも使用し得る。
本発明の医薬組成物は、１つ以上のアジュバントなどの補足的な免疫増強物質と共に投与してよく、その有効性をさらに高める、好ましくは免疫刺激の相乗作用を達成する１つ以上の免疫増強物質を含み得る。「アジュバント」という用語は、免疫応答を延長させるまたは増強するまたは促進する化合物に関する。様々な種類のアジュバントに依存して、様々な機構がこれに関して可能である。例えば、ＤＣの成熟を可能にする化合物、例えばリポ多糖類またはＣＤ４０リガンドは、適切なアジュバントの最初のクラスを形成する。一般に、「危険シグナル」のタイプの免疫系に影響を及ぼす任意の作用物質（ＬＰＳ、ＧＰ９６、ｄｓＲＮＡ等）またはＧＭ−ＣＳＦなどのサイトカインは、制御された方法で免疫応答を強化するおよび／または免疫応答に影響を及ぼすことを可能にするアジュバントとして使用できる。ＣｐＧオリゴデオキシヌクレオチドも、場合によりこれに関連して使用できるが、上記で説明したように、特定の状況下で起こるその副作用を考慮すべきである。特に好ましいアジュバントは、サイトカイン、例えばモノカイン、リンホカイン、インターロイキンもしくはケモカイン、例えばＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＦＮα、ＩＦＮγ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＬＴ−α、または増殖因子、例えばｈＧＨである。さらなる公知のアジュバントは、水酸化アルミニウム、フロイントアジュバントまたはＭｏｎｔａｎｉｄｅ（登録商標）などの油であり、Ｍｏｎｔａｎｉｄｅ（登録商標）ＩＳＡ５１が最も好ましい。Ｐａｍ３Ｃｙｓなどのリポペプチドも、本発明の医薬組成物中のアジュバントとしての使用に適する。
医薬組成物は、局所的または全身的に、好ましくは全身的に投与することができる。
「全身投与」という用語は、作用物質が有意の量で個体の体内に広く分布するようになり、所望の作用を発現するような作用物質の投与を指す。例えば、作用物質は、血液中でその所望の作用を発現し得るおよび／または血管系を介してその所望の作用部位に達する。典型的な全身投与経路には、作用物質を血管系に直接導入することによる投与または経口、肺もしくは筋肉内投与が含まれ、この場合作用物質は吸着され、血管系に入って、血液を介して１つ以上の所望作用部位に運ばれる。
本発明によれば、全身投与は非経口投与によることが好ましい。「非経口投与」という用語は、作用物質が腸管を通過しない、作用物質の投与を指す。「非経口投与」という用語には、静脈内投与、皮下投与、皮内投与または動脈内投与が含まれるが、これらに限定されない。
投与はまた、例えば経口的、腹腔内または筋肉内経路でも実施し得る。
本明細書で提供される作用物質および組成物は、単独でまたは従来の治療レジメン、例えば手術、放射線、化学療法および／もしくは骨髄移植（自己、同系、同種異系もしくは無関係）と組み合わせて使用し得る。
本発明を以下の図面および実施例によって詳細に説明するが、これらは説明のためにのみ使用され、限定を意図されない。説明および実施例により、同様に本発明に包含されるさらなる実施形態が当業者により理解可能である。
以下、実施形態の例を付記する。
１． 配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチド。
２． １００以下、５０以下、２０以下または１０以下のアミノ酸長である、１．に記載のペプチド。
３． 配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体から成る、１．または２．に記載のペプチド。
４． １．から３．のいずれかに記載のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
５． 組換え核酸である、４．に記載の核酸。
６． ４．または５．に記載の核酸を含む細胞。
７． １．から３．のいずれかに記載のペプチドまたはそのプロセシング産物を提示する細胞。
８． １．から３．のいずれかに記載のペプチドと反応性である免疫反応性細胞。
９． 場合によりＭＨＣ分子との複合体中で、１．に記載のペプチドに結合する結合物質。
１０． 場合によりＭＨＣ分子との複合体中で、１．に記載のペプチドに結合し、および好ましくは前記ペプチドと反応性であるＴ細胞受容体、または前記Ｔ細胞受容体のポリペプチド鎖。
１１． Ｔ細胞受容体α鎖または前記Ｔ細胞受容体α鎖を含むＴ細胞受容体であって、ここで前記Ｔ細胞受容体α鎖が、
（ｉ）配列番号：６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択されるＴ細胞受容体α鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、ならびに
（ｉｉ）配列番号：６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択されるＴ細胞受容体α鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体α鎖
から成る群より選択される、Ｔ細胞受容体α鎖または前記Ｔ細胞受容体α鎖を含むＴ細胞受容体。
１２． Ｔ細胞受容体β鎖または前記Ｔ細胞受容体β鎖を含むＴ細胞受容体であって、ここで前記Ｔ細胞受容体β鎖が、
（ｉ）配列番号：７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７および２９から成る群より選択されるＴ細胞受容体β鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖、ならびに
（ｉｉ）配列番号：７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７および２９から成る群より選択されるＴ細胞受容体β鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体β鎖
から成る群より選択される、Ｔ細胞受容体β鎖または前記Ｔ細胞受容体β鎖を含むＴ細胞受容体。
１３． （Ｉ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、および
（ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖
［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
を含むＴ細胞受容体、ならびに
（ＩＩ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体α鎖、および
（ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体β鎖
［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
を含むＴ細胞受容体
から成る群より選択されるＴ細胞受容体。
１４． クローディン６（ＣＬＤＮ６）に結合する人工Ｔ細胞受容体。
１５． ＣＬＤＮ６の細胞外ドメインに結合する、１４．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
１６． 前記結合が特異的結合である、１４．または１５．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
１７． ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを含む、１４．から１６．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
１８． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、前記人工Ｔ細胞受容体のエキソドメインに含まれる、１７．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
１９． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、ＣＬＤＮ６抗体の一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）を含む、１７．または１８．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
２０． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、ＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの重鎖の可変領域（ＶＨ）（ＶＨ（ＣＬＤＮ６））およびＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの軽鎖の可変領域（ＶＬ）（ＶＬ（ＣＬＤＮ６））を含む、１７．から１９．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２１． 前記重鎖可変領域（ＶＨ）と対応する軽鎖可変領域（ＶＬ）がペプチドリンカーによって、好ましくはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）３を含むペプチドリンカーによって連結されている、２０．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
２２． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）を含有する、１７．から２１．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２３． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３３、３８もしくは３９によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する、１７．から２２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２４． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）および配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する、１７．から２３．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２５． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：４０によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む、１７．から２４．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２６． 膜貫通ドメインを含む、１４．から２５．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２７． Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む、１４．から２６．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２８． 前記Ｔ細胞シグナル伝達ドメインが、場合によりＣＤ２８と組み合わせて、ＣＤ３−ζ、好ましくはＣＤ３−ζのエンドドメインを含む、２７．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
２９． 新生タンパク質を小胞体内に向かわせるシグナルペプチドを含む、１４．から２８．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３０． 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを前記膜貫通ドメインに連結するスペーサー領域を含む、１４．から２９．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３１． 構造：
ＮＨ２−シグナルペプチド−ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン−スペーサー領域−膜貫通ドメイン−Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン−ＣＯＯＨ
を含む、１４．から３０．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３２． 配列番号：４６に従うアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む、１４．から３１．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３３． １０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードする、または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
３４． １０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体を含む、および／または前記Ｔ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードするまたは前記人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含有する核酸を含む、細胞。
３５． ３３．に記載の核酸でＴ細胞を形質導入する工程を含む、免疫反応性細胞を作製する方法。
３６． （ｉ）１．から３．のいずれかに記載のペプチド、
（ｉｉ）４．、５．および３３．のいずれかに記載の核酸、
（ｉｉｉ）６．、７．および３５．のいずれかに記載の細胞、
（ｉｖ）８．に記載の免疫反応性細胞、
（ｖ）９．に記載の結合物質、
（ｖｉ）１０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体、ならびに
（ｖｉ）１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体
の１つ以上を含む医薬組成物。
３７． 医薬的に許容される担体をさらに含む、３６．に記載の医薬組成物。
３８． ３６．または３７．に記載の医薬組成物を患者に投与することを含む、癌疾患を処置するまたは予防する方法。
３９． 治療法における使用、特に癌を処置するまたは予防するうえでの使用のための、１．から３．のいずれかに記載のペプチド、４．、５．および３３．のいずれかに記載の核酸、６．、７．および３５．のいずれかに記載の細胞、８．に記載の免疫反応性細胞、９．に記載の結合物質、１０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体、または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
４０． 被験体において免疫応答を誘導する方法であって、３６．に記載の医薬組成物を前記被験体に投与することを含む方法。
４１． Ｔ細胞を、１．から３．のいずれかに記載のペプチド、４．もしくは５．に記載の核酸および／または６．もしくは７．に記載の細胞の１つ以上と接触させることを含む、Ｔ細胞を刺激する、プライミングするおよび／または増殖させる方法。
４２． 被験体において癌細胞を死滅させる方法であって、１．から３．のいずれかに記載のペプチド、４．、５．および３３．のいずれかに記載の核酸、６．、７．および３５．のいずれかに記載の細胞、８．に記載の免疫反応性細胞、９．に記載の結合物質、１０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体、または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体の治療有効量を前記被験体に提供する工程を含む方法。
４３． 被験体における免疫応答を判定する方法であって、前記被験体から単離した生物学的試料中で１．から３．のいずれかに記載のペプチドと反応性のＴ細胞を測定することを含む方法。
本明細書で使用される技術および方法は、本発明において説明されるかまたはそれ自体公知のようにおよび、例えばＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ（１９８９）Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．に記載されているように実施される。キットおよび試薬の使用を含むすべての方法は、特に指示されない限り製造者の情報に従って実施される。
(実施例１)
実験材料および方法
細胞株および試薬
ヒト慢性骨髄性白血球細胞株Ｋ５６２（Ｌｏｚｚｉｏ，Ｃ．Ｂ．＆ Ｌｏｚｚｉｏ，Ｂ．Ｂ（１９７５），Ｂｌｏｏｄ ４５，３２１−３３４）を標準的な条件下で培養した。ＨＬＡ−Ａ＊０２０１で安定にトランスフェクトしたＫ５６２細胞（Ｂｒｉｔｔｅｎ，Ｃ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．（２００２），Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２５９，９５−１１０）（例えばＫ５６２−Ａ＊０２０１と称される）を検証アッセイに使用した。初代ヒト新生児包皮線維芽細胞株ＣＣＤ−１０７９Ｓｋ（ＡＴＣＣ Ｎｏ．ＣＲＬ−２０９７）を製造者の指示に従って培養した。
ヒトＣＬＤＮ６を発現する卵巣癌細胞株ＯＶ−９０−ＳＣ１２をＣＬＤＮ６−ＣＡＲのインビボ検証のために使用した。
ＰＡ−１−ＳＣ１２＿Ａ０２０１＿ｌｕｃ＿ｇｆｐ＿Ｆ７についての培地は、８６％ＲＰＭＩ １６４０＋ Ｇｌｕｔａｍａｘ（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号６１８７０）、１０％ＦＣＳ（Ｃｏ．Ｂｉｏｃｈｒｏｍｅ、カタログ番号Ｓ０６１５）、１％ピルビン酸ナトリウム（１００ｍＭ）（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号１１３６０）、１％ＭＥＭ非必須アミノ酸溶液（１００×）（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号１１１４０）、２％重炭酸ナトリウム７．５％溶液（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号２５０８０）から成る。
ＯＶ−９０−ＳＣ１２の培地は、４１．５％ＭＣＤＢ １０５（Ｃｏ．Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ、カタログ番号Ｍ６３９５−１Ｌ）、４１．５％１９９培地（Ｃｏ．Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ、カタログ番号Ｍ２１５４−５００ｍＬ）、１５％ＦＣＳ（Ｃｏ．Ｂｉｏｃｈｒｏｍｅ、カタログ番号Ｓ０６１５）、２％重炭酸ナトリウム７．５％溶液（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号２５０８０）から成る。
ＳＫ−ＭＥＬ−３７の培地は、９０％ＤＭＥＭ＋ Ｇｌｕｔａｍａｘ（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号３１９６６）、１０％ＦＣＳ（Ｃｏ．Ｂｉｏｃｈｒｏｍｅ、カタログ番号Ｓ０６１５）から成る。ＭＤＡ−ＭＢ−２３１＿ｌｕｃ＿ｔｏｍの培地は、８８％ＲＰＭＩ １６４０＋ Ｇｌｕｔａｍａｘ（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号６１８７０）、１０％ＦＣＳ（Ｃｏ．Ｂｉｏｃｈｒｏｍｅ、カタログ番号Ｓ０６１５）、１％ピルビン酸ナトリウム（１００ｍＭ）（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号１１３６０）、１％ＭＥＭ非必須アミノ酸溶液（１００×）（Ｃｏ．Ｇｉｂｃｏ、カタログ番号１１１４０）から成る。細胞株の供給および／または分配は２〜３日ごとに行った。
末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、単球および樹状細胞（ＤＣ）
ＰＢＭＣをＦｉｃｏｌｌ−Ｈｙｐａｑｕｅ（Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）密度勾配遠心分離によってバフィーコートから単離した。ＨＬＡアレロタイプをＰＣＲ標準法によって決定した。単球を抗ＣＤ１４マイクロビーズ（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｂｅｒｇｉｓｃｈ−Ｇｌａｄｂａｃｈ，Ｇｅｒｍａｎｙ）で濃縮した。未熟ＤＣ（ｉＤＣ）を、Ｋｒｅｉｔｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００７），Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．，ＣＩＩ，５６，１５７７−８７に記載されているようにサイトカイン添加培地中で単球を５日間分化させることによって得た。
ペプチドおよび刺激細胞のペプチドパルス
クローディン６またはＨＩＶ−ｇａｇの配列に対応する１１のアミノ酸オーバーラップを有するＮ末端およびＣ末端遊離１５量体ペプチドのプール（抗原ペプチドプールと称する）を標準的な固相化学（ＪＰＴ ＧｍｂＨ，Ｂｅｒｌｉｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）によって合成し、ＤＭＳＯに溶解して、最終濃度を０．５ｍｇ／ｍｌにした。９量体ペプチドをＰＢＳ １０％ＤＭＳＯに再溶解した。刺激細胞をパルスするため、細胞を、種々のペプチド濃度を用いて培地中で３７℃にて１時間インキュベートした。
ＲＮＡのインビトロ転写（ＩＶＴ）のためのベクター
すべての構築物は、以前に記述されているｐＳＴ１−ｓｅｃ−ｉｎｓｅｒｔ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）−Ｓａｐ１プラスミド（Ｈｏｌｔｋａｍｐ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００６），Ｂｌｏｏｄ １０８，４００９−４０１７）の変異体である。ヒトＴＣＲ鎖をコードするプラスミドを得るため、ＴＣＲ−αまたはＴＣＲ−β１およびＴＣＲ−β２定常領域をコードするｃＤＮＡをヒトＣＤ８＋Ｔ細胞から増幅し、この骨格にクローニングした。マウスＴＣＲ鎖をコードするプラスミドの作製のために、ＴＣＲ−α、ＴＣＲ−β１およびＴＣＲ−β２定常領域をコードするｃＤＮＡを商業的供給者から調達し、同様にクローニングした（それぞれＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号Ｍ１４５０６、Ｍ６４２３９およびＸ６７１２７）。特異的Ｖ（Ｄ）Ｊ ＰＣＲ産物をそのようなカセットに導入し、完全長ＴＣＲ鎖（ｐＳＴ１−ヒト／マウスＴＣＲαβ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）と称する）を生成した。
同様に、ドナーのＰＢＭＣからクローニングした個々のＨＬＡクラスＩおよびクラスＩＩ対立遺伝子ならびにヒトＤＣからのβ−２−ミクログロブリン（Ｂ２Ｍ）ｃＤＮＡをこの骨格に挿入した（ｐＳＴ１−ＨＬＡクラスＩ／ＩＩ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）およびｐＳＴ１−Ｂ２Ｍ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）と称する）。
分泌シグナル（ｓｅｃ）およびＭＨＣクラスＩ輸送シグナル（ＭＩＴＤ）に連結されたＣＭＶのｐｐ６５抗原をコードするプラスミド（ｐＳＴ１−ｓｅｃ−ｐｐ６５−ＭＩＴＤ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０））およびＮＹ−ＥＳＯ−Ｉ（ｐＳＴ１−ｓｅｃ−ＮＹ−ＥＳＯ−１−ＭＩＴＤ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０））は、以前に記述されている（Ｋｒｅｉｔｅｒ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００８），Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８０，３０９−３１８）。プラスミドｐＳＴ１−ｓｅｃ−ＰＬＡＣ１−ＭＩＴＤ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）をコードするＰＬＡＣ１は、商業的供給者から入手したｃＤＮＡ（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿０２１７９６）をＫｒｅｉｔｅｒ ｅｔ ａｌ．の骨格にクローニングすることによって作製した。プラスミドｐＳＴ１−αｇＵＴＲ−ＴＰＴＥ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）およびｐＳＴ１−αｇＵＴＲ−ＴＰＴＥ−ＭＩＴＤ−２βｇＵＴＲ−Ａ（１２０）をコードするＴＰＴＥは、商業的供給者から入手したｃＤＮＡ（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＦ００７１１８）を、付加的なαグロビン５'非翻訳領域を特徴とするＨｏｌｔｋａｍｐ ｅｔ ａｌ．のベクターの変異体にクローニングすることによって作製した。
プライマーは、Ｏｐｅｒｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｃｏｌｏｇｎｅ，Ｇｅｒｍａｎｙから購入した。
インビトロ転写（ＩＶＴ）ＲＮＡの作製および細胞への移入
ＩＶＴ ＲＮＡの作製を、以前に記述されているように（Ｈｏｌｔｋａｍｐ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２００６），Ｂｌｏｏｄ １０８，４００９−４０１７）実施し、予冷した４ｍｍギャップの滅菌電気穿孔キュベット（Ｂｉｏ−Ｒａｄ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ ＧｍｂＨ，Ｍｕｎｉｃｈ，Ｇｅｒｍａｎｙ）においてＸ−ＶＩＶＯ １５培地（Ｌｏｎｚａ，Ｂａｓｅｌ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）に懸濁した細胞に添加した。Ｇｅｎｅ−Ｐｕｌｓｅｒ−ＩＩ装置（Ｂｉｏ−Ｒａｄ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ ＧｍｂＨ，Ｍｕｎｉｃｈ，Ｇｅｒｍａｎｙ）で電気穿孔を実施した（Ｔ細胞：４５０Ｖ／２５０μＦ；ＩＶＳＢ Ｔ細胞：３５０Ｖ／２００μＦ；ＳｕｐＴ１（ＡＴＣＣ Ｎｏ．ＣＲＬ−１９４２）：３００Ｖ／２００μＦ；ヒトＤＣ：３００Ｖ／１５０μＦ；Ｋ５６２：２００Ｖ／３００μＦ）。
ＩＶＴ ＲＮＡでのＨＬＡ Ａ２．１／ＤＲ１マウスのリンパ節内免疫によるＴ細胞のインビボプライミング
Ａ２／ＤＲ１マウス（Ｐａｊｏｔ Ａ．ｅｔ ａｌ．（２００４），Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．３４，３０６０−６９）のＴ細胞を、抗原をコードするＩＶＴ ＲＮＡを使用した反復リンパ節内免疫により、対象とする抗原に対してインビボでプライミングした（Ｋｒｅｉｔｅｒ Ｓ．ｅｔ ａｌ．（２０１０），Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ７０，９０３１−４０）。リンパ節内免疫のために、マウスをキシラジン／ケタミンで麻酔した。鼠径部リンパ節を外科的に露出させ、リンガー液およびＲＮアーゼ不含水に希釈したＲＮＡ １０μＬ（２０μｇ）を、超微細針（３１Ｇ、ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を備えた使い捨て０．３ｍｌシリンジを使用して緩やかに注射し、創傷を閉鎖した。６回の免疫サイクル後、マウスを犠死させ、脾細胞を単離した。
脾細胞の採取
無菌条件下での切開後、脾臓を、ＰＢＳを含有するファルコンチューブに移した。鉗子で脾臓を機械的に分断し、セルストレーナー（４０μｍ）を用いて細胞懸濁液を得た。脾細胞をＰＢＳで洗浄し、遠心分離して、赤血球の溶解のために低張緩衝液に再懸濁した。室温で５分間インキュベートした後、培地またはＰＢＳ ２０〜３０ｍｌを添加して反応を停止させた。脾細胞を遠心分離し、ＰＢＳで２回洗浄した。
ＣＤ１３７染色後の抗原特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞の単細胞選別
抗原特異的再刺激のために、免疫Ａ２／ＤＲ１マウスからの２．５×１０６／ウェルの脾細胞を２４穴プレートに接種し、対象とする抗原または対照抗原をコードするオーバーラッピングペプチドのプールでパルスした。２４時間のインキュベーション後、細胞を採取し、ＦＩＴＣ結合抗ＣＤ３抗体、ＰＥ結合抗ＣＤ４抗体、ＰｅｒＣＰ−Ｃｙ５．５結合抗ＣＤ８抗体およびＤｙｌｉｇｈｔ−６４９結合抗ＣＤ１３７抗体で染色した。ＢＤ ＦＡＣＳ Ａｒｉａフローサイトメータ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）で選別を実施した。ＣＤ１３７、ＣＤ３およびＣＤ８に陽性の細胞を選別し、各ウェルにつき１細胞を、ヒトＣＣＤ−１０７９Ｓｋ細胞をフィーダー細胞として含む９６穴Ｖ底プレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ Ｂｉｏ−Ｏｎｅ）に採取し、４℃で遠心分離して、直ちに−８０℃で保存した。
ＲＮＡ抽出、ＳＭＡＲＴに基づくｃＤＮＡ合成および選別した細胞からの非特異的増幅
選別したＴ細胞からのＲＮＡを、ＲＮｅａｓｙ Ｍｉｃｒｏ Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ，Ｈｉｌｄｅｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて供給者の指示に従って抽出した。修正ＢＤ ＳＭＡＲＴプロトコルをｃＤＮＡ合成のために使用した：ＢＤ ＰｏｗｅｒＳｃｒｉｐｔ Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔａｓｅ（ＢＤ Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｍｏｕｎｔａｉｎ Ｖｉｅｗ，ＣＡ）を、一本鎖合成反応のプライミングのためのオリゴ（ｄＴ）−Ｔ−ｐｒｉｍｅｒ ｌｏｎｇならびに逆転写酵素の末端トランスフェラーゼ活性による伸長した鋳型の作製および鋳型スイッチを可能にするオリゴ（リボＧ）配列を導入するＴＳ−ｓｈｏｒｔ（Ｅｕｒｏｇｅｎｔｅｃ Ｓ．Ａ．Ｓｅｒａｉｎｇ，Ｂｅｌｇｉｕｍ）と組み合わせた（Ｍａｔｚ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２７，１５５８−１５６０）。製造者の指示に従って合成した一本鎖ｃＤＮＡを、ｄＮＴＰ ２００μＭの存在下に５Ｕ ＰｆｕＵｌｔｒａ Ｈｏｔｓｔａｒｔ Ｈｉｇｈ−Ｆｉｄｅｌｉｔｙ ＤＮＡ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｌａ Ｊｏｌｌａ，ＣＡ）およびＴＳ−ＰＣＲプライマー０．４８μＭでの２１サイクルの増幅に供した（サイクリング条件：９５℃ ２分、９４℃ ３０秒、６５℃ ３０秒、７２℃ １分、７２℃ ６分の最終伸長）。ＴＣＲ遺伝子の増幅の成功をヒトまたはマウスＴＣＲ−β定常領域特異的プライマーで制御し、強いバンドが検出された場合のみ、連続的なクローン型特異的ヒトまたはマウスＶα−ＰＣＲ／Ｖβ−ＰＣＲを実施した。
ＨＬＡクラスＩまたはＩＩ配列の増幅のための一本鎖ｃＤＮＡを、患者由来のＰＢＭＣから抽出したＲＮＡ １〜５μｇと共にＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔＩＩ Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔａｓｅ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）およびオリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成した。
ＴＣＲおよびＨＬＡ増幅のためのＰＣＲプライマーの設計
ヒトＴＣＲコンセンサスプライマーの設計のために、ＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ（ＩＭＧＴ）データベース（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｇｔ．ｏｒｇ）に列挙されている６７個のＴＣＲ−Ｖβ遺伝子および５４個のＴＣＲ−Ｖα遺伝子（オープンリーディングフレームおよび偽遺伝子）全部を、それらの対応するリーダー配列と共にＢｉｏＥｄｉｔ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｅｄｉｔｏｒ（例えばｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｂｉｏ−ｓｏｆｔ．ｎｅｔ）で整列した。最大３個の縮重塩基、４０〜６０％のＧＣ含量および３'末端にＧまたはＣを有する２４〜２７ｂｐ長の正プライマーを、できるだけ多くのリーダー配列にアニーリングするように設計し、数少ない制限酵素部位およびコザック配列を特徴とする１５ｂｐの５'伸長を備えさせた。逆プライマーは、定常領域遺伝子の第１エクソンにアニーリングし、プライマーＴＲＡＣｅｘ１＿ａｓはＣαのアミノ酸７〜１６に対応する配列に結合し、ＴＲＢＣｅｘ１＿ａｓはＣβ１およびＣβ２のアミノ酸（ａａ）８〜１６に対応する配列に結合するように設計した。どちらのオリゴヌクレオチドも５'リン酸を用いて合成した。プライマーを同じアニーリング温度で２〜５個の正オリゴのプールにまとめた。
この方法をマウスＴＣＲコンセンサスプライマーの設計のために再現し、１２９個の列挙されているＴＣＲ−Ｖα遺伝子および３５個の列挙されているＴＣＲ−Ｖβ遺伝子を整列した。逆プライマーｍＴＲＡＣｅｘ１＿ａｓおよびｍＴＲＢＣｅｘ１＿ａｓは、それぞれアミノ酸２４〜３１および８〜１５に対応する配列に相同である。
ＨＬＡコンセンサスプライマーを、Ａｎｔｈｏｎｙ Ｎｏｌａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅウエブサイト（ｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｃｏｍ）に列挙されているすべてのＨＬＡクラスＩおよびＩＩ配列をＢｉｏＥｄｉｔ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｅｄｉｔｏｒで整列することによって設計した。最大３個の、縮重しているが１つの遺伝子座のできるだけ多くのＨＬＡ配列にアニーリングするコード保存塩基を有する２３〜２７ｂｐ長の正プライマーに、５'リン酸およびコザック配列伸長を備えさせた。逆プライマーは、同様であるがゆらぎ塩基を導入せずに設計し、ＡｓｉＳＩ制限酵素部位をコードする１４ｂｐの５'伸長部を備えさせた。
ＰＣＲ増幅およびＶ（Ｄ）Ｊ配列のクローニング
単離されたＴ細胞からのあらかじめ増幅したｃＤＮＡ ３〜６μｌを、０．６μＭ Ｖα／Ｖβ特異的オリゴプール、０．６μＭ ＣαまたはＣβオリゴ、２００μＭ ｄＮＴＰおよび５Ｕ Ｐｆｕポリメラーゼの存在下で４０サイクルのＰＣＲに供した（サイクリング条件：９５℃ ２分、９４℃ ３０秒、アニーリング温度３０秒、７２℃ １分、７２℃ ６分の最終伸長時間）。Ｑｉａｇｅｎのキャピラリー電気泳動システムを使用してＰＣＲ産物を分析した。４００〜５００ｂｐのバンドを有する試料をアガロースゲルでサイズ分画し、バンドを切り出して、Ｇｅｌ Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ，Ｈｉｌｄｅｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用して精製した。ＴＲＢＣｅｘ１＿ａｓおよびｍＴＲＢＣｅｘ１＿ａｓプライマーがそれぞれ、ヒトおよびマウスにおけるＴＣＲ定常領域遺伝子β１およびβ２の両方にそれぞれマッチするので、Ｖ（Ｄ）Ｊドメインおよびβ定常領域の両方の配列を明らかにするために配列解析を実施した。ＤＮＡを消化し、完全なＴＣＲ−α／β鎖のために適切な骨格を含むＩＶＴベクターにクローニングした。
フローサイトメトリ分析
トランスフェクトＴＣＲ遺伝子の細胞表面発現を、適切な可変領域ファミリーまたはＴＣＲ β鎖の定常領域に対するＰＥ結合抗ＴＣＲ抗体（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ Ｉｎｃ．，Ｆｕｌｌｅｒｔｏｎ，ＵＳＡ）およびＦＩＴＣ／ＡＰＣ標識抗ＣＤ８／抗ＣＤ４抗体（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してフローサイトメトリによって分析した。トランスフェクトＣＡＲの細胞表面発現を、すべてのＣＬＤＮ６−ＣＡＲ構築物に含まれるｓｃＦｖフラグメントを認識するＤｙｌｉｇｈｔ−６５０結合イディオタイプ特異的抗体（Ｇａｎｙｍｅｄ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ）を使用して分析した。ＦＩＴＣ標識ＨＬＡクラスＩＩ特異的抗体（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ Ｉｎｃ．，Ｆｕｌｌｅｒｔｏｎ，ＵＳＡ）およびＰＥ標識ＨＬＡクラスＩ特異的抗体（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）での染色によってＨＬＡ抗原を検出した。標的細胞上のＣＬＤＮ６表面発現を、Ａｌｅｘａ−Ｆｌｕｏｒ６４７結合ＣＬＤＮ６特異的抗体（Ｇａｎｙｍｅｄ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ）での染色によって分析した。ＦＡＣＳ Ｄｉｖａソフトウェアを使用してＦＡＣＳ ＣＡＮＴＯ ＩＩフローサイトメータ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）でフローサイトメトリ分析を実施した。
ルシフェラーゼ細胞傷害アッセイ
細胞媒介性細胞傷害の評価のために、５１Ｃｒ放出の代替法および最適化として生物発光に基づくアッセイを確立した。標準的なクロム放出アッセイと異なり、このアッセイは、共インキュベーション後に生存可能なルシフェラーゼ発現標的細胞の数を計算することによってエフェクター細胞の溶解活性を測定する。標的細胞を、ホタルホティナス・ピラリス（Ｐｈｏｔｉｎｕｓ ｐｙｒａｌｉｓ）（ＥＣ １．１３．１２．７）からのホタルルシフェラーゼをコードするルシフェラーゼ遺伝子で安定にまたは一過性にトランスフェクトした。ルシフェラーゼはルシフェリンの酸化を触媒する酵素である。反応はＡＴＰ依存性であり、２段階で起こる：
ルシフェリン＋ＡＴＰ → ルシフェリルアデニレート＋ＰＰ ｉ
ルシフェリルアデニレート＋Ｏ ２ → オキシルシフェリン＋ＡＭＰ＋光
標的細胞を１０４細胞／ウェルの濃度で白色９６穴プレート（Ｎｕｎｃ，Ｗｉｅｓｂａｄｅｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）に塗布し、１００μｌの最終容量で様々な数のＴＣＲ−トランスフェクトＴ細胞と共培養した。３時間後、Ｄ−ルシフェリン（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を含有する反応混合物（ルシフェリン（１μｇ／μｌ）、ＨＥＰＥＳ緩衝液（５０ｍＭ、ｐＨ）、アデノシン５'−三リン酸（ＡＴＰアーゼ、０．４ｍＵ／μｌ、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＵＳＡ））５０μｌを細胞に添加した。反応混合物へのＡＴＰアーゼの添加により、死細胞から放出されたルシフェラーゼから生じる発光が減少した。
４時間の総インキュベーション時間後、生細胞によって放出された生物発光を、Ｔｅｃａｎ Ｉｎｆｉｎｉｔｅ ２００リーダー（Ｔｅｃａｎ，Ｃｒａｉｌｓｈｅｉｍ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて測定した。細胞死滅活性を、２％Ｔｒｉｔｏｎ−Ｘ １００の添加によって誘導される完全な細胞溶解後に得られた発光値に関しておよび標的細胞単独によって放出された発光と関連付けて計算した。データ出力は秒当たりカウント（ＣＰＳ）であり、パーセント細胞溶解は以下のように計算した：
（１−（ＣＰＳｅｘｐ−ＣＰＳｍｉｎ）／（ＣＰＳｍａｘ−ＣＰＳｍｉｎ）））×１００。
エフェクター細胞なしで標的細胞をインキュベートした後に最大発光（最大秒当たりカウント、ＣＰＳｍａｘ）を評価し、完全溶解のために界面活性剤Ｔｒｉｔｏｎ−Ｘ−１００で標的細胞を処理した後に最小発光（ＣＰＳｍｉｎ）を評価した。
ＥＬＩＳＰＯＴ（酵素結合免疫ＳＰＯＴアッセイ）
マイクロタイタープレート（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，Ｂｅｄｆｏｒｄ，ＭＡ，ＵＳＡ）を抗ＩＦＮγ抗体１−Ｄ１ｋ（Ｍａｂｔｅｃｈ，Ｓｔｏｃｋｈｏｌｍ，Ｓｗｅｄｅｎ）で室温にて一晩被覆し、２％ヒトアルブミン（ＣＳＬ Ｂｅｈｒｉｎｇ，Ｍａｒｂｕｒｇ，Ｇｅｒｍａｎｙ）でブロックした。電気穿孔の２４時間後、２〜５×１０４／ウェルの抗原提示刺激細胞を０．３〜３×１０５／ウェルのＴＣＲトランスフェクトＣＤ４＋またはＣＤ８＋エフェクター細胞と共に３組接種した。プレートを一晩インキュベートし（３７℃、５％ＣＯ２）、ＰＢＳ ０．０５％Ｔｗｅｅｎ ２０で洗浄して、抗ＩＦＮγビオチン化ｍＡＢ ７−Ｂ６−１（Ｍａｂｔｅｃｈ）と共に１μｇ／ｍｌの最終濃度で３７℃にて２時間インキュベートした。アビジン結合ホースラディッシュペルオキシダーゼＨ（Ｖｅｃｔａｓｔａｉｎ Ｅｌｉｔｅ Ｋｉｔ；Ｖｅｃｔｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｂｕｒｌｉｎｇａｍｅ，ＵＳＡ）をウェルに添加し、室温で１時間インキュベートして、３−アミノ−９−エチルカルバゾール（Ｓｉｇｍａ，Ｄｅｉｓｅｎｈｏｆｅｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）で発色させた。
ＣＦＳＥ（カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル）増殖アッセイ
ＣＤ８＋Ｔ細胞をＴＣＲまたはＣＡＲ ＲＮＡでトランスフェクトし、ＣＦＳＥ ２．５μＭで標識した。標識Ｔ細胞を洗浄し、ＲＮＡトランスフェクト自己単球またはｉＤＣと共培養した（Ｅ：Ｔ（エフェクター細胞：標的（腫瘍）細胞）＝１０：１）。共培養の４日後、細胞を採取し、細胞分裂後の娘細胞内のＣＦＳＥ蛍光の漸進的半減に基づきフローサイトメトリによって増殖を分析した。
安定なＣＡＲ発現のためのレトロウイルス構築物
ＣＬＤＮ６−ＣＡＲまたは陰性対照として使用した無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲの安定発現のために、レトロウイルスＳＩＮベクターＥＳ１２．６を使用した（図１９）。
ヒトＴ細胞の形質導入
マウス養子細胞移入（ＡＣＴ）実験のために、ヒトＴリンパ球を、２時間のプラスチック接着後に単球の除去によって健常ドナーのＰＢＭＣから濃縮した。Ｔリンパ球を、５％ヒトＡＢ血清（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、１００Ｕ／ｍｌ ＩＬ２（Ｐｒｏｌｅｕｋｉｎ Ｓ，Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、２０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ７（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）、１０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ１５（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）を添加したＸ−Ｖｉｖｏ１５（Ｌｏｎｚａ）培地で培養し、磁気抗ＣＤ３／抗ＣＤ２８ビーズ（Ｄｙｎａｂｅａｄｓ；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて１：３のＣＤ３細胞対ビーズ比で刺激して、刺激後３日目と４日目にレトロウイルス上清で形質導入した。５％ヒトＡＢ血清、３００Ｕ／ｍｌ ＩＬ２、２０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ７および１０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ１５を添加したＸ−Ｖｉｖｏ１５培地で細胞を増殖させた。３７℃、５％ＣＯ２、９５％相対湿度でのインキュベーション（図２０）。
抗腫瘍活性のインビボ検証のためのマウスモデル
１×１０７のＯＶ９０−ＳＣ１２ヒト卵巣腫瘍細胞を８〜１４週齢のＮＯＤ．Ｃｇ−Ｐｒｋｄｃｓｃｉｄ Ｉｌ２ｒｇｔｍ１Ｗｊｌ／ＳｚＪ（ＮＳＧ）マウス（Ｔｈｅ Ｊａｃｋｓｏｎ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｂａｒ Ｈａｒｂｏｒ，ＭＥ）に皮下注射することによって異種移植腫瘍を確立した。４日後、マウスを１×１０７のＣＡＲ形質導入Ｔ細胞（２０〜３７％ＣＡＲ陽性）の単回静脈内注射で処置した。カリパスを使用した体積測定によって腫瘍モニタリングを週１回実施した（図２１（ａ））。
（実施例２）
クローディン６に特異的な高親和性ＨＬＡ−Ａ＊０２拘束性マウスＴＣＲの単離
Ａ２／ＤＲ１マウスにおけるＣＬＤＮ６の免疫原性を、ＣＬＤＮ６をコードするＩＶＴ−ＲＮＡでの反復リンパ節内免疫によって検証し、これらのマウスの脾細胞をＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞の単離およびその後の対応するＴＣＲ遺伝子のクローニングのために使用した（図５）。免疫マウスの脾細胞を、ＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞の誘導の成功およびエクスビボでの予測されたＨＬＡ−Ａ＊０２結合ＣＬＤＮ６ペプチドに対するそれらの反応性に関してＩＦＮγ−ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって分析した（図６）。
有意の頻度のＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞をＲＮＡ免疫によって３匹すべてのマウスにおいて誘導することができたが、Ｔ細胞反応性は、最良のＨＬＡ−Ａ＊０２結合スコアを有する予測された２つのＣＬＤＮ６ペプチド（Ｃｌ６−Ａ２−１およびＣｌ６−Ａ２−２）に集中した。
ＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞の単離のために、免疫マウスの脾細胞をインビトロで再刺激し、ＣＤ１３７の活性化誘導性上方調節に基づきフローサイトメトリによって選別した（図７）。
ＣＬＤＮ６特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞を３匹すべての免疫Ａ２／ＤＲ１マウスから回収することができ、合計１１のＣＬＤＮ６特異的ＴＣＲを単一選別マウスＴ細胞からクローニングした。
ＴＣＲを免疫学的検証アッセイに供し、このアッセイは、６つのＣＬＤＮ６−ＴＣＲがＨＬＡ−Ａ＊０２０１拘束性エピトープＣＬＤＮ６−９１−９９（Ｃｌ６−Ａ２−１）を認識し、４つのＣＬＤＮ６−ＴＣＲがＣＬＤＮ６−１４−２２（Ｃｌ６−Ａ２−２）に特異的であることを明らかにしたが、どちらのエピトープも先にエクスビボＥＬＩＳＰＯＴ分析によって同定された（図８）。１つのＣＬＤＮ６−ＴＣＲ（ＴＣＲＣＤ８−ＣＬＤＮ６ Ｎｏ．７）はペプチドＣＬＤＮ６−７−１５（Ｃｌ６−Ａ２−３）を認識した。
（実施例３）
ＣＬＤＮ６ ９１−９９に特異的なマウスＴＣＲの比較試験
すべてＨＬＡ−Ａ＊０２拘束性エピトープＣＬＤＮ６−９１−９９を認識する合計６のマウスＴＣＲを同定した。このエピトープが天然にプロセシングされ、内因性にＣＬＤＮ６を発現する腫瘍細胞株によって提示されることを確認するため、および同定されたマウスＴＣＲの、そのような細胞の死滅を媒介する潜在能を評価するために、ルシフェラーゼに基づく細胞傷害アッセイを実施した。ヒト予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞をＴＣＲ ＲＮＡでトランスフェクトし、表面発現をフローサイトメトリによって分析した（図９）。マウスＴＣＲ−β鎖の定常ドメインに特異的な蛍光色素結合抗体での染色によって示されたように、ＲＮＡ移入後にすべてのマウスＴＣＲが高い割合のヒトＣＤ８＋Ｔ細胞上に発現された。ＴＣＲトランスフェクトＴ細胞を、ＣＬＤＮ６発現腫瘍細胞株ＰＡ１（奇形腫）およびＮＩＨ−Ｏｖｃａｒ３（卵巣癌）と共にルシフェラーゼに基づく細胞傷害アッセイに供した。ＣＬＮＤ６陰性乳癌細胞株ＭＤＡ−ＭＢ−２３１を陰性対照として使用した。すべてのＴＣＲが、ＰＡ１の３８〜９４％およびＮＩＨ−Ｏｖｃａｒ３の２９〜７６％に及ぶＣＬＤＮ６発現腫瘍細胞株の効率的な溶解を媒介し、一方非トランスフェクトＴ細胞では溶解は全く観察できなかった（図１０）。ｍＴＣＲＣＤ８−ＣＬＤＮ６ Ｎｏ．１、Ｎｏ．８またはＮｏ．１８を使用した場合、大部分の標的細胞が溶解した。
マウスＴＣＲが自己抗原発現標的細胞との共培養後にヒトＴ細胞の特異的増殖を媒介することができるかどうかを分析するため、ＣＦＳＥ増殖アッセイを実施した（図１１）。ＴＣＲトランスフェクトＣＤ８＋Ｔ細胞を、滴定量のＣＬＤＮ６ ＲＮＡでトランスフェクトした自己単球と共培養した。すべてのＴＣＲが、ＣＬＤＮ６−ＲＮＡトランスフェクトＣＤ１４＋細胞との４日間の共培養後に、ＣＦＳＥ増殖染料の希釈によって示された特異的増殖を媒介したが、特に低い量のＣＬＤＮ６ ＲＮＡを標的細胞にトランスフェクトした場合、やはりｍＴＣＲＣＤ８−ＣＬＤＮ６ Ｎｏ．１、Ｎｏ．８またはＮｏ．１８が最良の結果を示した。我々は、ｍＴＣＲＣＤ８−ＣＬＤＮ６ Ｎｏ．１８を、ＣＬＤＮ６を標的とするＣＡＲ形成と共にリード構造選択のためのゴールドスタンダードとして使用することを決定した。
（実施例４）
クローディン６特異的ＣＡＲの作製およびインビトロ検証
ＣＬＤＮ６を発現する標的細胞上のＣＬＤＮ６を特異的に標的とする２つの異なるＣＡＲ形式を評価した。その１つは、マウスＴＣＲβ鎖の定常ドメインとｓｃＦｖの結合およびＴＣＲα鎖の定常ドメインの共発現に基づく新規形式（ＣＡＲ／Ｃα）である（Ｖｏｓｓ ＲＨ ｅｔ ａｌ．，（２０１１）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ １９，ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ，Ｓ８６）（図３）。２番目の形式は、それぞれＣＤ３ζおよびＣＤ２８のシグナル伝達および共刺激部分を含む古典的第２世代ＣＡＲ（ＣＡＲ−２８ζ）である。ＣＤ２８エンドドメイン内のｌｃｋ結合部分の欠失は、ＣＡＲ係合後のＩＬ２分泌を排除し、制御性Ｔ細胞の誘導を妨げる（Ｋｏｆｌｅｒ Ｄ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．，（２０１１）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ １９（４），７６０−７６７）。ＣＡＲの細胞外部分内のＩｇＧ１ Ｆｃ「スペーサー」ドメインの修飾は、「オフターゲット」活性化および先天性免疫応答の意図せぬ開始を回避する（Ｈｏｍｂａｃｈ Ａ．ｅｔ ａｌ．，（２０１０）Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ １７，１２０６−１２１３）。
ＣＡＲはＨＬＡ非依存性のｓｃＦｖ媒介性抗原結合を提供するので、ＣＡＲはＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の両方において機能性である。それゆえ、我々は最初に、ＣＡＲ ＲＮＡのバルクＰＢＭＣへのトランスフェクション後にＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞上のＣＡＲ表面発現を分析した。
新規ＣＡＲ／Ｃαおよび古典的第２世代ＣＡＲ（ＣＡＲ−２８ζ）はどちらも、ＲＮＡ移入後のヒトＴ細胞の表面に発現される（図１２）。ＣＡＲ−２８ζは、ＣＡＲ／Ｃαよりも有意に良好にＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の表面に発現された。後者は、ＣＡＲとＣα鎖の共トランスフェクションによってまたはＣＡＲおよびＣα遺伝子の同時発現のための２Ａペプチドベースのバイシストロニックベクターとして移入した。フローサイトメトリ分析は、ＣＡＲとＣαの２Ａベースの結合が、２つの成分の共発現と比較して表面発現の減少をもたらすことを明らかにした。バイシストロニックベクターを臨床試験に使用するので、２つのＣＡＲ／Ｃα成分の結合をさらに改善しなければならない。
種々のＣＬＤＮ６標的化受容体形式によって媒介される特異的腫瘍細胞溶解を分析するため、ルシフェラーゼに基づく細胞傷害アッセイを実施した。ＣＡＲまたはＴＣＲでトランスフェクトした予備活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞を、ＣＬＤＮ６陽性または陰性腫瘍細胞株と共に種々のエフェクター対標的比で培養し、４時間の共培養後に特異的溶解を計算した（図１３）。すべてのＣＡＲおよびＴＣＲトランスフェクトＴ細胞は、非トランスフェクトＴ細胞と比較してＣＬＤＮ６発現腫瘍細胞株の有意の特異的溶解を示した。
患者におけるＣＡＲ操作したＴ細胞の増殖および持続のための必要条件は、血液悪性疾患におけるＣＤ１９特異的ＣＡＲの有望な臨床試験結果によって明らかにされたように、抗原の存在である。ＲＮＡ免疫による内因性Ｔ細胞の増殖と同様に、我々は、ＣＡＲ Ｔ細胞も、標的細胞のＲＮＡワクチン接種を使用して増殖させ、ＣＡＲ Ｔ細胞刺激のために天然ＣＬＮＤ６を提供することができるかどうかを分析したいと考えた。ＣＬＤＮ６または対照ＲＮＡトランスフェクト自己ｉＤｃと共にＣＡＲトランスフェクトＣＤ８＋Ｔ細胞を使用してインビトロ増殖アッセイを実施した（図１４）。ｍＴＣＲＣＤ８−ＣＬＤＮ６ Ｎｏ．１８は、ＣＬＤＮ６トランスフェクト標的細胞に応答して最良の増殖を媒介した（７３％）。ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζも有意の割合の増殖Ｔ細胞をもたらしたが（４４％）、ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ／Ｃαは、おそらくＣＤ２８媒介性共刺激の欠如に起因して、増殖を誘導することができなかった。増殖の誘導は抗腫瘍活性の成功のための必要条件であるので、我々は、ＣＡＲ−２８ζ形式をさらなるリード構造選択のために使用することを決定した。
（実施例５）
前臨床および臨床試験のためのＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζリード構造選択
抗原認識を担うＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ ｓｃＦｖフラグメントは不対システインを含む。そのような遊離システインは、特定の状況下でＣＡＲタンパク質のミスフォールディングまたはジスルフィド結合の形成による他のシステインとの望ましくない相互作用をもたらし得るので、このシステインを排除し、セリン、グリシンまたはアラニンに交換することを決定した。
次に、生じたＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζ構築物を表面発現（図１５、１６）および細胞傷害性（図１７）に関して比較分析した。グリシン変異体を除き、すべての変異構築物は野生型変異体と同等の表面発現および溶解を示した。
変異ＣＡＲ構築物の親和性を比較するため、滴定量のＣＬＤＮ６ ＲＮＡでトランスフェクトした自己ｉＤＣに応答したそれらの細胞傷害能を分析した。極めて少量のＣＬＤＮ６ ＲＮＡ（０．００１μｇ）でさえも、すべてのＣＡＲ構築物によって媒介される標的細胞の有意の溶解を生じさせた。ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ−２８ζのセリン変異体は表面発現および細胞傷害性に関してわずかにより良好な結果を示したので、この変異体を前臨床試験に使用することを決定した。
（実施例６）
ＣＬＤＮ６−ＣＡＲのインビボ抗腫瘍活性
ＣＬＤＮ６発現腫瘍細胞株に対する抗腫瘍活性をインビトロで決定した後、腫瘍担持マウスにおける抗腫瘍能を測定した。そのため、ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ形質導入ヒトＴ細胞の潜在能を、異種移植モデルにおいて無関係な腫瘍抗原に対する対照ＣＡＲで形質導入したＴ細胞および非形質導入Ｔ細胞と比較した。ヒト卵巣癌細胞株ＯＶ９０−ＳＣ１２の合計１×１０７細胞をＮＳＧマウスに皮下注射した。腫瘍移植の４日後にマウスを１×１０７のＣＡＲ形質導入Ｔ細胞の単回静脈内注射で処置した。カリパスを使用した体積測定によって腫瘍モニタリングを週１回実施した。ＣＬＤＮ６−ＣＡＲ形質導入Ｔ細胞でのマウスの処置は、無関係な腫瘍抗原−ＣＡＲ形質導入Ｔ細胞、非形質導入Ｔ細胞で処置した対照群またはＴ細胞を摂取しなかった群と比較して腫瘍増殖を有意に遅らせた（図２１（ｂ）および（ｃ））。
（実施例７）
ＣＬＤＮ６発現標的細胞に応答したＣＬＤＮ６−ＣＡＲ Ｔ細胞のインビトロ増殖
ＲＮＡ免疫による内因性Ｔ細胞の増殖と同様に、天然ＣＬＮＤ６を提供するための標的細胞のＲＮＡワクチン接種を用いたＣＡＲ Ｔ細胞の刺激および増殖をインビトロ増殖アッセイによって分析した。ＣＤ８＋Ｔ細胞を、ＣＬＤＮ６または陰性対照として無関係な腫瘍抗原に対するＣＡＲをコードするＩＶＴ−ＲＮＡでトランスフェクトし、ＣＦＳＥ（カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル）で標識して、ＣＬＤＮ６トランスフェクト自己ｉＤＣと共に４日間共培養した（図２２）。ＣＬＤＮ６トランスフェクトｉＤＣに応答してほぼすべてのＣＤ８＋Ｔ細胞のＣＬＤＮ６−ＣＡＲ媒介性増殖を観察することができ（９５％）、一方無関係な腫瘍抗原ＣＡＲトランスフェクトＴ細胞に関してはバックグラウンド増殖（１．５％）しか観察できず、増殖はＣＡＲ骨格に依存するのではなく、ＣＬＤＮ６特異的であることを示した。
ＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞エピトープ
Ａ２−１ （ａａ ９１−９９）
ＡＬＦＧＬＬＶＹＬ
Ａ２−２ （ａａ １４−２２）
ＴＬＬＧＷＶＮＧＬ
Ａ２−３ （７−１５）
ＱＩＬＧＶＶＬＴＬ
ＣＬＤＮ６特異的Ｔ細胞受容体
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１：
配列番号：６； ＞ Ｖα９Ｎ．３ Ｊ１３ Ｃ
ＭＬＬＡＬＬＳＶＬＧＩＨＦＬＬＲＤＡＱＡＱＳＶＴＱＰＤＡＲＶＴＶＳＥＧＡＳＬＱＬＲＣＫＹＳＹＦＧＴＰＹＬＦＷＹＶＱＹＰＲＱＧＬＱＬＬＬＫＹＹＰＧＤＰＶＶＱＧＶＮＧＦＥＡＥＦＳＫＳＮＳＳＦＨＬＲＫＡＳＶＨＷＳＤＷＡＶＹＦＣＡＶＳＭＳＳＧＴＹＱＲＦＧＴＧＴＫＬＱＶＶＰＮＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：７； ＞ Ｖβ２９ Ｄ１ Ｊ２．５ Ｃ２
ＭＲＶＲＬＩＳＡＶＶＬＣＦＬＧＴＧＬＶＤＭＫＶＴＱＭＰＲＹＬＩＫＲＭＧＥＮＶＬＬＥＣＧＱＤＭＳＨＥＴＭＹＷＹＲＱＤＰＧＬＧＬＱＬＩＹＩＳＹＤＶＤＳＮＳＥＧＤＩＰＫＧＹＲＶＳＲＫＫＲＥＨＦＳＬＩＬＤＳＡＫＴＮＱＴＳＶＹＦＣＡＳＳＳＱＮＱＤＴＱＹＦＧＰＧＴＲＬＬＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃２：
配列番号：８； ＞ Ｖα６Ｎ．６ Ｊ２３ Ｃ
ＭＤＳＦＰＧＦＶＡＶＩＬＬＩＬＧＲＴＨＧＤＳＶＴＱＴＥＧＱＶＴＶＳＥＳＫＳＬＩＩＮＣＴＹＳＡＴＳＩＧＹＰＮＬＦＷＹＶＲＹＰＧＥＧＬＱＬＬＬＫＶＩＴＡＧＱＫＧＳＳＲＧＦＥＡＴＹＮＫＥＡＴＳＦＨＬＱＫＡＳＶＱＥＳＤＳＡＶＹＹＣＡＬＮＮＱＧＫＬＩＦＧＱＧＴＫＬＳＩＫＰＮＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：９； ＞ Ｖβ１３．２ Ｄ１ Ｊ２．４ Ｃ２
ＭＧＳＲＬＦＦＶＬＳＳＬＬＣＳＫＨＭＥＡＡＶＴＱＳＰＲＮＫＶＡＶＴＧＧＫＶＴＬＳＣＮＱＴＮＮＨＮＮＭＹＷＹＲＱＤＴＧＨＧＬＲＬＩＨＹＳＹＧＡＧＳＴＥＫＧＤＩＰＤＧＹＫＡＳＲＰＳＱＥＮＦＳＬＩＬＥＬＡＴＰＳＱＴＳＶＹＦＣＡＳＧＧＤＳＱＮＴＬＹＦＧＡＧＴＲＬＳＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃３：
配列番号：１８； ＞ Ｖα１６Ｎ Ｊ６ Ｃ
ＭＬＩＬＳＬＬＧＡＡＦＧＳＩＣＦＡＡＴＳＭＡＱＫＶＴＱＴＱＴＳＩＳＶＶＥＫＴＴＶＴＭＤＣＶＹＥＴＲＤＳＳＹＦＬＦＷＹＫＱＴＡＳＧＥＩＶＦＬＩＲＱＤＳＹＫＫＥＮＡＴＶＧＨＹＳＬＮＦＱＫＰＫＳＳＩＧＬＩＩＴＡＴＱＩＥＤＳＡＶＹＦＣＡＭＲＤＳＳＧＧＮＹＫＰＴＦＧＫＧＴＳＬＶＶＨＰＹＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：１９； ＞ Ｖβ２ Ｄ２ Ｊ２．４ Ｃ２
ＭＧＳＩＦＬＳＣＬＡＶＣＬＬＶＡＧＰＶＤＰＫＩＩＱＫＰＫＹＬＶＡＶＴＧＳＥＫＩＬＩＣＥＱＹＬＧＨＮＡＭＹＷＹＲＱＳＡＫＫＰＬＥＦＭＦＳＹＳＹＱＫＬＭＤＮＱＴＡＳＳＲＦＱＰＱＳＳＫＫＮＨＬＤＬＱＩＴＡＬＫＰＤＤＳＡＴＹＦＣＡＳＳＱＥＤＷＧＳＱＮＴＬＹＦＧＡＧＴＲＬＳＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃７：
配列番号：２８； ＞ Ｖα６Ｎ．７ ｏｒ Ｖα６Ｄ．７＿４ Ｊ２６ Ｃ
ＭＤＳＦＰＧＦＭＴＶＭＬＬＩＦＴＲＡＨＧＤＳＶＴＱＴＥＧＱＶＡＬＳＥＥＤＦＬＴＩＨＣＮＹＳＡＳＧＹＰＡＬＦＷＹＶＱＹＰＧＥＧＰＱＦＬＦＲＡＳＲＤＫＥＫＧＳＳＲＧＦＥＡＴＹＤＫＧＴＴＳＦＨＬＲＫＡＳＶＱＥＳＤＳＡＶＹＹＣＡＬＧＮＮＹＡＱＧＬＴＦＧＬＧＴＲＶＳＶＦＰＹＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号２９； ＞ Ｖβ１３．３ Ｄ１ Ｊ１．４＿０２ Ｃ１
ＭＧＳＲＬＦＦＶＶＬＩＬＬＣＡＫＨＭＥＡＡＶＴＱＳＰＲＳＫＶＡＶＴＧＧＫＶＴＬＳＣＨＱＴＮＮＨＤＹＭＹＷＹＲＱＤＴＧＨＧＬＲＬＩＨＹＳＹＶＡＤＳＴＥＫＧＤＩＰＤＧＹＫＡＳＲＰＳＱＥＮＦＳＬＩＬＥＬＡＳＬＳＱＴＡＶＹＦＣＡＳＳＴＧＮＥＲＬＦＦＧＨＧＴＫＬＳＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＱＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＴＬＶＶＭＡＭＶＫＲＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃８：
配列番号：１０； ＞ Ｖα１６Ｎ Ｊ１３ Ｃ
ＭＬＩＬＳＬＬＧＡＡＦＧＳＩＣＦＡＴＳＭＡＱＫＶＴＱＴＱＴＳＩＳＶＶＥＫＴＴＶＴＭＤＣＶＹＥＴＲＤＳＳＹＦＬＦＷＹＫＱＴＡＳＧＥＩＶＦＬＩＲＱＤＳＹＫＫＥＮＡＴＶＧＨＹＳＬＮＦＱＫＰＫＳＳＩＧＬＩＩＴＡＴＱＩＥＤＳＡＶＹＦＣＡＭＲＥＡＡＮＳＧＴＹＱＲＦＧＴＧＴＫＬＱＶＶＰＮＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：１１； ＞ Ｖβ２ Ｄ１ Ｊ１．３ Ｃ１
ＭＧＳＩＦＬＳＣＬＡＶＣＬＬＶＡＧＰＶＤＰＫＩＩＱＫＰＫＹＬＶＡＶＴＧＳＥＫＩＬＩＣＥＱＹＬＧＨＮＡＭＹＷＹＲＱＳＡＫＫＰＬＥＦＭＦＳＹＳＹＱＫＬＭＤＮＱＴＡＳＳＲＦＱＰＱＳＳＫＫＮＨＬＤＬＱＩＴＡＬＫＰＤＤＳＡＴＹＦＣＡＳＳＱＱＮＳＧＮＴＬＹＦＧＥＧＳＲＬＩＶＶＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＱＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＴＬＶＶＭＡＭＶＫＲＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１０：
配列番号：２０； ＞ Ｖα１３Ｄ．４＿０３ Ｊ４２ Ｃ
ＭＫＲＬＶＣＳＬＬＧＬＬＣＴＱＶＣＷＶＫＧＱＱＶＱＱＳＰＡＳＬＶＬＱＥＧＥＮＡＥＬＱＣＮＦＳＳＴＡＴＲＬＱＷＦＹＱＲＰＧＧＳＬＶＳＬＬＹＮＰＳＧＴＫＨＴＧＲＬＴＳＴＴＶＴＫＥＲＲＳＳＬＨＩＳＳＳＱＴＴＤＳＧＴＹＦＣＡＭＳＳＮＳＧＧＳＮＡＫＬＴＦＧＫＧＴＫＬＳＶＫＳＮＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：２１； ＞ Ｖβ４＿０２ Ｄ２ Ｊ２．７ Ｃ２
ＭＧＣＲＬＬＳＣＶＡＦＣＬＬＧＩＧＰＬＥＴＡＶＦＱＴＰＮＹＲＶＴＲＶＧＮＥＶＳＦＮＣＥＱＴＬＤＨＮＴＭＹＷＹＫＱＤＳＫＫＬＬＫＩＭＦＳＹＮＮＫＱＬＩＶＮＥＴＶＰＲＲＦＳＰＱＳＳＤＫＡＨＬＮＬＲＩＫＳＶＥＬＥＤＳＡＶＹＬＣＡＳＳＤＷＧＤＳＹＥＱＹＦＧＰＧＴＲＬＴＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１２：
配列番号：１２； ＞ Ｖα３．３ Ｊ５０ Ｃ
ＭＫＴＶＴＧＰＬＦＬＣＦＷＬＱＬＮＣＶＳＲＧＥＱＶＥＱＲＰＰＨＬＳＶＲＥＧＤＳＡＶＩＴＣＴＹＴＤＰＮＳＹＹＦＦＷＹＫＱＥＰＧＡＳＬＱＬＬＭＫＶＦＳＳＴＥＩＮＥＧＱＧＦＴＶＬＬＮＫＫＤＫＲＬＳＬＮＬＴＡＡＨＰＧＤＳＡＡＹＦＣＡＶＥＳＳＳＦＳＫＬＶＦＧＱＧＴＳＬＳＶＶＰＮＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：１３； ＞ Ｖβ２６ Ｄ２ Ｊ２．５ Ｃ２
ＭＡＴＲＬＬＣＹＴＶＬＣＬＬＧＡＲＩＬＮＳＫＶＩＱＴＰＲＹＬＶＫＧＱＧＱＫＡＫＭＲＣＩＰＥＫＧＨＰＶＶＦＷＹＱＱＮＫＮＮＥＦＫＦＬＩＮＦＱＮＱＥＶＬＱＱＩＤＭＴＥＫＲＦＳＡＥＣＰＳＮＳＰＣＳＬＥＩＱＳＳＥＡＧＤＳＡＬＹＬＣＡＳＳＬＴＧＧＡＱＤＴＱＹＦＧＰＧＴＲＬＬＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１３：
配列番号：２２； ＞ Ｖα１６Ｎ Ｊ２２ Ｃ
ＭＬＩＬＳＬＬＧＡＡＦＧＳＩＣＦＡＡＴＳＭＡＱＫＶＴＱＴＱＴＳＩＳＶＶＥＫＴＴＶＴＭＤＣＶＹＥＴＲＤＳＳＹＦＬＦＷＹＫＱＴＡＳＧＥＩＶＦＬＩＲＱＤＳＹＫＫＥＮＡＴＶＧＨＹＳＬＮＦＱＫＰＫＳＳＩＧＬＩＩＴＡＴＱＩＥＤＳＡＶＹＦＣＡＭＲＶＡＳＳＧＳＷＱＬＩＦＧＳＧＴＱＬＴＶＭＰＤＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：２３； ＞ Ｖβ２ Ｄ１ Ｊ２．１ Ｃ２
ＭＧＳＩＦＬＳＣＬＡＶＣＬＬＶＡＧＰＶＤＰＫＩＩＱＫＰＫＹＬＶＡＶＴＧＳＥＫＩＬＩＣＥＱＹＬＧＨＮＡＭＹＷＹＲＱＳＡＫＫＰＬＥＦＭＦＳＹＳＹＱＫＬＭＤＮＱＴＡＳＳＲＦＱＰＱＳＳＫＫＮＨＬＤＬＱＩＴＡＬＫＰＤＤＳＡＴＹＦＣＡＳＳＱＧＤＮＮＹＡＥＱＦＦＧＰＧＴＲＬＴＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１４：
配列番号：１４； ＞ Ｖα４Ｎ．４ ｏｒ Ｖα４Ｄ．４＿０３ Ｊ６ Ｃ
ＭＱＲＮＬＶＡＶＬＧＩＬＷＶＱＩＣＷＶＲＧＤＱＶＥＱＳＰＳＡＬＳＬＨＥＧＴＧＳＡＬＲＣＮＦＴＴＴＭＲＡＶＱＷＦＲＫＮＳＲＧＳＬＩＮＬＦＹＬＡＳＧＴＫＥＮＧＲＬＫＳＡＦＤＳＫＥＲＹＳＴＬＨＩＲＤＡＱＬＥＤＳＧＴＹＦＣＡＡＥＧＧＧＮＹＫＰＴＦＧＫＧＴＳＬＶＶＨＰＹＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：１５； ＞ Ｖβ３１ Ｄ１ Ｊ１．１ Ｃ１
ＭＬＹＳＬＬＡＦＬＬＧＭＦＬＧＶＳＡＱＴＩＨＱＷＰＶＡＥＩＫＡＶＧＳＰＬＳＬＧＣＴＩＫＧＫＳＳＰＮＬＹＷＹＷＱＡＴＧＧＴＬＱＱＬＦＹＳＩＴＶＧＱＶＥＳＶＶＱＬＮＬＳＡＳＲＰＫＤＤＱＦＩＬＳＴＥＫＬＬＬＳＨＳＧＦＹＬＣＡＷＳＰＰＩＮＴＥＶＦＦＧＫＧＴＲＬＴＶＶＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＱＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＴＬＶＶＭＡＭＶＫＲＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１５：
配列番号：２４； ＞ Ｖα３．１ Ｊ３９ Ｃ
ＭＫＴＶＴＧＰＬＬＬＣＦＷＬＱＬＮＣＶＳＲＧＥＱＶＥＱＲＰＰＨＬＳＶＲＥＧＤＳＡＩＩＩＣＴＹＴＤＳＡＴＡＹＦＳＷＹＫＱＥＡＧＡＧＬＱＬＬＭＳＶＬＳＮＶＤＲＫＥＥＱＧＬＴＶＬＬＮＫＫＤＫＲＬＳＬＮＬＴＡＡＨＰＧＤＳＡＶＹＦＣＡＴＮＡＧＡＫＬＴＦＧＧＧＴＲＬＴＶＲＰＤＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：２５； ＞ Ｖβ４ Ｄ２ Ｊ２．７ Ｃ２
ＭＧＣＲＬＬＳＣＶＡＦＣＬＬＧＩＧＰＬＥＴＡＶＦＱＴＰＮＹＨＶＴＱＶＧＮＥＶＳＦＮＣＫＱＴＬＧＨＤＴＭＹＷＹＫＱＤＳＫＫＬＬＫＩＭＦＳＹＮＮＫＱＬＩＶＮＥＴＶＰＲＲＦＳＰＱＳＳＤＫＡＨＬＮＬＲＩＫＳＶＥＰＥＤＳＡＶＹＬＣＡＳＳＬＹＷＧＤＳＹＥＱＹＦＧＰＧＴＲＬＴＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１７：
配列番号：２６； ＞ Ｖα１４．３ ｏｒ Ｖα１４Ｄ．３／ＤＶ８＿０８ Ｊ２２ Ｃ
ＭＤＫＮＬＴＡＳＦＬＬＬＧＬＨＬＡＧＶＳＧＱＱＥＫＲＤＱＱＱＶＲＱＳＰＱＳＬＴＶＷＥＧＥＴＡＩＬＮＣＳＹＥＮＳＡＦＤＹＦＰＷＹＱＱＦＰＧＥＧＰＡＬＬＩＳＩＬＳＶＳＤＫＫＥＤＧＲＦＴＩＦＦＮＫＲＥＫＫＬＳＬＨＩＡＤＳＱＰＧＤＳＡＴＹＦＣＡＡＳＬＳＳＧＳＷＱＬＩＦＧＳＧＴＱＬＴＶＭＰＤＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：２７； ＞ Ｖβ３ Ｄ２ Ｊ２．７ Ｃ２
ＭＤＩＷＬＬＧＷＩＩＦＳＦＬＥＡＧＨＴＧＰＫＶＬＱＩＰＳＨＱＩＩＤＭＧＱＭＶＴＬＮＣＤＰＶＳＮＨＬＹＦＹＷＹＫＱＩＬＧＱＱＭＥＦＬＶＮＦＹＮＧＫＶＭＥＫＳＫＬＦＫＤＱＦＳＶＥＲＰＤＧＳＹＦＴＬＫＩＱＰＴＡＬＥＤＳＡＶＹＦＣＡＳＳＬＶＧＧＹＥＱＹＦＧＰＧＴＲＬＴＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ
ＴＣＲＣＤ８−ｍＣｌ６＃１８：
配列番号：１６； ＞ Ｖα６Ｄ．６＿０２ Ｊ４ Ｃ
ＭＤＳＳＰＧＦＶＡＶＩＬＬＩＬＧＲＴＨＧＤＳＶＴＱＴＥＧＰＶＴＶＳＥＳＥＳＬＩＩＮＣＴＹＳＡＴＳＩＡＹＰＮＬＦＷＹＶＲＹＰＧＥＧＬＱＬＬＬＫＶＩＴＡＧＱＫＧＳＳＲＧＦＥＡＴＹＮＫＥＴＴＳＦＨＬＱＫＡＳＶＱＥＳＤＳＡＶＹＹＣＡＬＧＥＴＧＳＦＮＫＬＴＦＧＡＧＴＲＬＡＶＣＰＹＩＱＮＰＥＰＡＶＹＱＬＫＤＰＲＳＱＤＳＴＬＣＬＦＴＤＦＤＳＱＩＮＶＰＫＴＭＥＳＧＴＦＩＴＤＫＴＶＬＤＭＫＡＭＤＳＫＳＮＧＡＩＡＷＳＮＱＴＳＦＴＣＱＤＩＦＫＥＴＮＡＴＹＰＳＳＤＶＰＣＤＡＴＬＴＥＫＳＦＥＴＤＭＮＬＮＦＱＮＬＳＶＭＧＬＲＩＬＬＬＫＶＡＧＦＮＬＬＭＴＬＲＬＷＳＳ
配列番号：１７； ＞ Ｖβ２６ Ｄ１ Ｊ２．７ Ｃ２
ＭＡＴＲＬＬＣＹＴＶＬＣＬＬＧＡＲＩＬＮＳＫＶＩＱＴＰＲＹＬＶＫＧＱＧＱＫＡＫＭＲＣＩＰＥＫＧＨＰＶＶＦＷＹＱＱＮＫＮＮＥＦＫＦＬＩＮＦＱＮＱＥＶＬＱＱＩＤＭＴＥＫＲＦＳＡＥＣＰＳＮＳＰＣＳＬＥＩＱＳＳＥＡＧＤＳＡＬＹＬＣＡＳＳＬＧＩＹＥＱＹＦＧＰＧＴＲＬＴＶＬＥＤＬＲＮＶＴＰＰＫＶＳＬＦＥＰＳＫＡＥＩＡＮＫＱＫＡＴＬＶＣＬＡＲＧＦＦＰＤＨＶＥＬＳＷＷＶＮＧＫＥＶＨＳＧＶＳＴＤＰＱＡＹＫＥＳＮＹＳＹＣＬＳＳＲＬＲＶＳＡＴＦＷＨＮＰＲＮＨＦＲＣＱＶＱＦＨＧＬＳＥＥＤＫＷＰＥＧＳＰＫＰＶＴＱＮＩＳＡＥＡＷＧＲＡＤＣＧＩＴＳＡＳＹＨＱＧＶＬＳＡＴＩＬＹＥＩＬＬＧＫＡＴＬＹＡＶＬＶＳＧＬＶＬＭＡＭＶＫＫＫＮＳ

Claims (28)

  1. 配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列を含むペプチドであって、当該ペプチドの長さが、１００以下、５０以下、２０以下または１０以下のアミノ酸長である、ペプチド。
  2. 配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列から成る、請求項１に記載のペプチド。
  3. 請求項１または２に記載のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
  4. 組換え核酸である、請求項３に記載の核酸。
  5. 請求項３または４に記載の核酸を含む細胞。
  6. 請求項１または２に記載のペプチドまたはそのプロセシング産物を提示する細胞。
  7. 請求項１または２に記載のペプチドと反応性である免疫反応性細胞。
  8. 請求項１または２に記載のペプチドに結合するＴ細胞受容体であって、
    当該Ｔ細胞受容体が、
    （Ｉ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖のＣＤＲ配列の３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、および
    （ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖のＣＤＲ配列の３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖
    ［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
    を含むＴ細胞受容体、ならびに
    （ＩＩ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖配列を含むＴ細胞受容体α鎖、および
    （ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖配列を含むＴ細胞受容体β鎖
    ［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
    を含むＴ細胞受容体
    から成る群より選択されるＴ細胞受容体。
  9. クローディン６（ＣＬＤＮ６）に結合し、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン、膜貫通ドメインおよびＴ細胞シグナル伝達ドメインを含む、人工Ｔ細胞受容体であって、
    前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、ＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの重鎖の可変領域（ＶＨ）（ＶＨ（ＣＬＤＮ６））およびＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの軽鎖の可変領域（ＶＬ）（ＶＬ（ＣＬＤＮ６））を含み、
    前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）を含有し、
    前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３３、３８もしくは３９によって表されるアミノ酸配列を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する、人工Ｔ細胞受容体。
  10. 前記重鎖可変領域（ＶＨ）と前記軽鎖可変領域（ＶＬ）がペプチドリンカーによって連結されている、請求項９に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  11. 前記ペプチドリンカーが、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）３を含む、請求項１０に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  12. 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）および配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する、請求項９から１１のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  13. 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：４０によって表されるアミノ酸配列を含む、請求項９から１２のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  14. 前記Ｔ細胞シグナル伝達ドメインが、ＣＤ３−ζを含む、請求項９から１３のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  15. 前記Ｔ細胞シグナル伝達ドメインが、ＣＤ３−ζのエンドドメインを含む、請求項１４に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  16. 前記Ｔ細胞シグナル伝達ドメインが、ＣＤ２８と組み合わせて前記シグナル伝達ドメインを含む、請求項１４または１５に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  17. 新生タンパク質を小胞体内に向かわせるシグナルペプチドを含む、請求項９から１６のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  18. 前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを前記膜貫通ドメインに連結するスペーサー領域を含む、請求項９から１７のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  19. 配列番号：４６に従うアミノ酸配列を含む、請求項９から１８のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体。
  20. 請求項８に記載のＴ細胞受容体をコードする、または請求項９から１９のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
  21. 請求項８に記載のＴ細胞受容体または請求項９から１９のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体を含む、および／または前記Ｔ細胞受容体をコードするまたは前記人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含有する核酸を含む、細胞。
  22. 請求項２０に記載の核酸でＴ細胞を形質導入する工程を含む、免疫反応性細胞を作製する方法。
  23. （ｉ）請求項１または２に記載のペプチド、
    （ｉｉ）請求項３、４および２０のいずれか一項に記載の核酸、
    （ｉｉｉ）請求項５、６および２１のいずれか一項に記載の細胞、
    （ｉｖ）請求項７に記載の免疫反応性細胞、
    （ｖ）請求項８に記載のＴ細胞受容体、ならびに
    （ｖｉ）請求項９から１９のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体
    の１つ以上を含む医薬組成物。
  24. 医薬的に許容される担体をさらに含む、請求項２３に記載の医薬組成物。
  25. 癌を処置するまたは予防する方法において使用するための医薬の調製のための、請求項２３または２４に記載の医薬組成物の使用。
  26. 癌を処置するまたは予防する方法において使用するための医薬の調製のための、請求項１または２に記載のペプチド、請求項３、４および２０のいずれか一項に記載の核酸、請求項５、６および２１のいずれか一項に記載の細胞、請求項７に記載の免疫反応性細胞、請求項８に記載のＴ細胞受容体、または請求項９から１９のいずれか一項に記載の人工Ｔ細胞受容体の使用。
  27. 被験体において免疫応答を誘導するための医薬の調製のための、請求項２３または２４に記載の医薬組成物の使用。
  28. 被験体における免疫応答を判定する方法であって、前記被験体から単離した生物学的試料中で請求項１または２に記載のペプチドと反応性のＴ細胞を測定することを含む方法。
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