JP6652781B2 - 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 - Google Patents
心血管系リスクイベントの予測およびその使用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6652781B2 JP6652781B2 JP2014533428A JP2014533428A JP6652781B2 JP 6652781 B2 JP6652781 B2 JP 6652781B2 JP 2014533428 A JP2014533428 A JP 2014533428A JP 2014533428 A JP2014533428 A JP 2014533428A JP 6652781 B2 JP6652781 B2 JP 6652781B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- individual
- risk
- biomarkers
- biomarker
- event
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 230000002526 effect on cardiovascular system Effects 0.000 title claims description 229
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims description 475
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 241
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 82
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 78
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 77
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 75
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 75
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 65
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 56
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 43
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 32
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 claims description 28
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 27
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 27
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 26
- 238000004590 computer program Methods 0.000 claims description 25
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 24
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims description 24
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 22
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 claims description 21
- 230000008859 change Effects 0.000 claims description 17
- 208000010125 myocardial infarction Diseases 0.000 claims description 17
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 14
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 14
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 claims description 13
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 11
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 11
- -1 antibodies Proteins 0.000 claims description 10
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 10
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims description 9
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 8
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 8
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 8
- 230000036541 health Effects 0.000 claims description 7
- 230000000250 revascularization Effects 0.000 claims description 7
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 claims description 6
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 claims description 6
- 238000002592 echocardiography Methods 0.000 claims description 6
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 claims description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 208000031481 Pathologic Constriction Diseases 0.000 claims description 5
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 claims description 5
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 claims description 5
- 210000004351 coronary vessel Anatomy 0.000 claims description 5
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 claims description 5
- 208000028867 ischemia Diseases 0.000 claims description 5
- 230000000391 smoking effect Effects 0.000 claims description 5
- 230000036262 stenosis Effects 0.000 claims description 5
- 208000037804 stenosis Diseases 0.000 claims description 5
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 239000011575 calcium Substances 0.000 claims description 4
- 238000010968 computed tomography angiography Methods 0.000 claims description 4
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000037213 diet Effects 0.000 claims description 4
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims description 4
- 238000002583 angiography Methods 0.000 claims description 3
- 230000036772 blood pressure Effects 0.000 claims description 3
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 claims description 3
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 3
- 238000009533 lab test Methods 0.000 claims description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 3
- 230000002107 myocardial effect Effects 0.000 claims description 3
- 235000021003 saturated fats Nutrition 0.000 claims description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 3
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 claims description 3
- 229940124549 vasodilator Drugs 0.000 claims description 3
- 239000003071 vasodilator agent Substances 0.000 claims description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 2
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 claims description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 2
- 102100022524 Alpha-1-antichymotrypsin Human genes 0.000 claims 5
- 108010091628 alpha 1-Antichymotrypsin Proteins 0.000 claims 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 197
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 181
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 128
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 57
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 38
- 230000007211 cardiovascular event Effects 0.000 description 37
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 34
- 206010007559 Cardiac failure congestive Diseases 0.000 description 33
- 206010019280 Heart failures Diseases 0.000 description 33
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 33
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 33
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 32
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 32
- 230000008569 process Effects 0.000 description 24
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 23
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 23
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 23
- 102000009075 Angiopoietin-2 Human genes 0.000 description 21
- 108010048036 Angiopoietin-2 Proteins 0.000 description 21
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 20
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 20
- 229940121710 HMGCoA reductase inhibitor Drugs 0.000 description 19
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 19
- 102000055008 Matrilin Proteins Human genes 0.000 description 18
- 108010072582 Matrilin Proteins Proteins 0.000 description 18
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 description 18
- 230000006870 function Effects 0.000 description 18
- 239000000463 material Substances 0.000 description 18
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 18
- 238000009739 binding Methods 0.000 description 17
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 17
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 17
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 17
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 16
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 16
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 102100038394 Platelet glycoprotein VI Human genes 0.000 description 15
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 15
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 15
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 15
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 15
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 15
- 101710194982 Platelet glycoprotein VI Proteins 0.000 description 14
- 238000000513 principal component analysis Methods 0.000 description 14
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 14
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 14
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 13
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 13
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 12
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 12
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 12
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 12
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 11
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 11
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 11
- 239000002872 contrast media Substances 0.000 description 10
- 230000034994 death Effects 0.000 description 10
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 10
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 description 10
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 10
- 239000000047 product Substances 0.000 description 10
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 10
- 102100032765 Chordin-like protein 1 Human genes 0.000 description 9
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 9
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 9
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101000941971 Homo sapiens Chordin-like protein 1 Proteins 0.000 description 9
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 9
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 9
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 9
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 9
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 9
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 9
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 9
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 8
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 8
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 8
- 230000002885 thrombogenetic effect Effects 0.000 description 8
- 238000012549 training Methods 0.000 description 8
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical group N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 7
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 7
- 210000001772 blood platelet Anatomy 0.000 description 7
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 7
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 7
- 238000002790 cross-validation Methods 0.000 description 7
- 238000011161 development Methods 0.000 description 7
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 7
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 7
- 238000007726 management method Methods 0.000 description 7
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 7
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 7
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 7
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 7
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 208000032109 Transient ischaemic attack Diseases 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 6
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 6
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 6
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 6
- 230000015654 memory Effects 0.000 description 6
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 6
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 6
- 201000010875 transient cerebral ischemia Diseases 0.000 description 6
- 238000003828 vacuum filtration Methods 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- 102100038591 Endothelial cell-selective adhesion molecule Human genes 0.000 description 5
- 101000882622 Homo sapiens Endothelial cell-selective adhesion molecule Proteins 0.000 description 5
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 5
- 230000008238 biochemical pathway Effects 0.000 description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 5
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 5
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 5
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 5
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 5
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 5
- 238000012502 risk assessment Methods 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 5
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 4
- 101000990912 Homo sapiens Matrilysin Proteins 0.000 description 4
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 4
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 4
- 102100030417 Matrilysin Human genes 0.000 description 4
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 4
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N Technetium-99 Chemical compound [99Tc] GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 4
- 238000013103 analytical ultracentrifugation Methods 0.000 description 4
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 4
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 4
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 4
- 238000003795 desorption Methods 0.000 description 4
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 4
- 239000002471 hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase inhibitor Substances 0.000 description 4
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 4
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 4
- 230000003907 kidney function Effects 0.000 description 4
- 238000002595 magnetic resonance imaging Methods 0.000 description 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- WQGWDDDVZFFDIG-UHFFFAOYSA-N pyrogallol Chemical compound OC1=CC=CC(O)=C1O WQGWDDDVZFFDIG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 4
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 229940056501 technetium 99m Drugs 0.000 description 4
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 3
- ZCYVEMRRCGMTRW-AHCXROLUSA-N Iodine-123 Chemical compound [123I] ZCYVEMRRCGMTRW-AHCXROLUSA-N 0.000 description 3
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 3
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 238000000668 atmospheric pressure chemical ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- 238000001854 atmospheric pressure photoionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 3
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 3
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 230000004087 circulation Effects 0.000 description 3
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 3
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 230000002380 cytological effect Effects 0.000 description 3
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 3
- 238000007418 data mining Methods 0.000 description 3
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 3
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 3
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 3
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 3
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 3
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 3
- 238000011223 gene expression profiling Methods 0.000 description 3
- 230000024924 glomerular filtration Effects 0.000 description 3
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 3
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000011503 in vivo imaging Methods 0.000 description 3
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 3
- 238000007885 magnetic separation Methods 0.000 description 3
- 239000006148 magnetic separator Substances 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 3
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 3
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000010118 platelet activation Effects 0.000 description 3
- 238000011176 pooling Methods 0.000 description 3
- 238000002600 positron emission tomography Methods 0.000 description 3
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 3
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 238000002603 single-photon emission computed tomography Methods 0.000 description 3
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 3
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 3
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 3
- 238000013179 statistical model Methods 0.000 description 3
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 3
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 3
- 230000001732 thrombotic effect Effects 0.000 description 3
- 238000007473 univariate analysis Methods 0.000 description 3
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DTLVBHCSSNJCMJ-JXQFQVJHSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[2-[2-[2-[5-[(3as,4s,6ar)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate Chemical compound C([C@H]1[C@H]2NC(=O)N[C@H]2CS1)CCCC(=O)NCCOCCOCCOCCOCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O DTLVBHCSSNJCMJ-JXQFQVJHSA-N 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000004476 Acute Coronary Syndrome Diseases 0.000 description 2
- WHVNXSBKJGAXKU-UHFFFAOYSA-N Alexa Fluor 532 Chemical compound [H+].[H+].CC1(C)C(C)NC(C(=C2OC3=C(C=4C(C(C(C)N=4)(C)C)=CC3=3)S([O-])(=O)=O)S([O-])(=O)=O)=C1C=C2C=3C(C=C1)=CC=C1C(=O)ON1C(=O)CCC1=O WHVNXSBKJGAXKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000008102 Ankyrins Human genes 0.000 description 2
- 108010049777 Ankyrins Proteins 0.000 description 2
- 108010031480 Artificial Receptors Proteins 0.000 description 2
- 101800000407 Brain natriuretic peptide 32 Proteins 0.000 description 2
- 101800002247 Brain natriuretic peptide 45 Proteins 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010034753 Complement Membrane Attack Complex Proteins 0.000 description 2
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004252 FT/ICR mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 108010023302 HDL Cholesterol Proteins 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- 101001091365 Homo sapiens Plasma kallikrein Proteins 0.000 description 2
- 101000605534 Homo sapiens Prostate-specific antigen Proteins 0.000 description 2
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 2
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 2
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical group C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000008214 LDL Cholesterol Methods 0.000 description 2
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 2
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 2
- 102100034869 Plasma kallikrein Human genes 0.000 description 2
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 description 2
- 238000001772 Wald test Methods 0.000 description 2
- 230000001133 acceleration Effects 0.000 description 2
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 2
- MGSKVZWGBWPBTF-UHFFFAOYSA-N aebsf Chemical compound NCCC1=CC=C(S(F)(=O)=O)C=C1 MGSKVZWGBWPBTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 2
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 2
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 2
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 2
- 230000002785 anti-thrombosis Effects 0.000 description 2
- 238000003491 array Methods 0.000 description 2
- 230000001174 ascending effect Effects 0.000 description 2
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 2
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 2
- 230000029918 bioluminescence Effects 0.000 description 2
- 238000005415 bioluminescence Methods 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 230000023555 blood coagulation Effects 0.000 description 2
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 2
- 108091006374 cAMP receptor proteins Proteins 0.000 description 2
- RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N caffeine Chemical compound CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1N=CN2C RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000004154 complement system Effects 0.000 description 2
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- CVSVTCORWBXHQV-UHFFFAOYSA-N creatine Chemical compound NC(=[NH2+])N(C)CC([O-])=O CVSVTCORWBXHQV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N creatinine Chemical compound CN1CC(=O)NC1=N DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 2
- 102000003675 cytokine receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010057085 cytokine receptors Proteins 0.000 description 2
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 2
- 238000013480 data collection Methods 0.000 description 2
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 2
- 238000002059 diagnostic imaging Methods 0.000 description 2
- 230000009274 differential gene expression Effects 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000011067 equilibration Methods 0.000 description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 2
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 2
- 230000012953 feeding on blood of other organism Effects 0.000 description 2
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 2
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 2
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 description 2
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 2
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 2
- 238000000370 laser capture micro-dissection Methods 0.000 description 2
- 238000001001 laser micro-dissection Methods 0.000 description 2
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 230000029226 lipidation Effects 0.000 description 2
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 2
- 238000011866 long-term treatment Methods 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 238000001840 matrix-assisted laser desorption--ionisation time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- 238000004848 nephelometry Methods 0.000 description 2
- 238000012634 optical imaging Methods 0.000 description 2
- CTSLXHKWHWQRSH-UHFFFAOYSA-N oxalyl chloride Chemical compound ClC(=O)C(Cl)=O CTSLXHKWHWQRSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003076 paracrine Effects 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 238000010384 proximity ligation assay Methods 0.000 description 2
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 description 2
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 description 2
- 238000007634 remodeling Methods 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 239000012898 sample dilution Substances 0.000 description 2
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 2
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 2
- 108010051423 streptavidin-agarose Proteins 0.000 description 2
- 230000035882 stress Effects 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 230000000153 supplemental effect Effects 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 230000000451 tissue damage Effects 0.000 description 2
- 231100000827 tissue damage Toxicity 0.000 description 2
- 238000000539 two dimensional gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 2
- 208000019553 vascular disease Diseases 0.000 description 2
- YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 5-[(3as,4s,6ar)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate Chemical compound C([C@H]1[C@H]2NC(=O)N[C@H]2CS1)CCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N 0.000 description 1
- CBXRMKZFYQISIV-UHFFFAOYSA-N 1-n,1-n,1-n',1-n',2-n,2-n,2-n',2-n'-octamethylethene-1,1,2,2-tetramine Chemical group CN(C)C(N(C)C)=C(N(C)C)N(C)C CBXRMKZFYQISIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PNDPGZBMCMUPRI-HVTJNCQCSA-N 10043-66-0 Chemical compound [131I][131I] PNDPGZBMCMUPRI-HVTJNCQCSA-N 0.000 description 1
- INEWUCPYEUEQTN-UHFFFAOYSA-N 3-(cyclohexylamino)-2-hydroxy-1-propanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CC(O)CNC1CCCCC1 INEWUCPYEUEQTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010048998 Acute phase reaction Diseases 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- PQSUYGKTWSAVDQ-ZVIOFETBSA-N Aldosterone Chemical compound C([C@@]1([C@@H](C(=O)CO)CC[C@H]1[C@@H]1CC2)C=O)[C@H](O)[C@@H]1[C@]1(C)C2=CC(=O)CC1 PQSUYGKTWSAVDQ-ZVIOFETBSA-N 0.000 description 1
- PQSUYGKTWSAVDQ-UHFFFAOYSA-N Aldosterone Natural products C1CC2C3CCC(C(=O)CO)C3(C=O)CC(O)C2C2(C)C1=CC(=O)CC2 PQSUYGKTWSAVDQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012103 Alexa Fluor 488 Substances 0.000 description 1
- 239000012114 Alexa Fluor 647 Substances 0.000 description 1
- 239000012116 Alexa Fluor 680 Substances 0.000 description 1
- 239000012117 Alexa Fluor 700 Substances 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-OUBTZVSYSA-N Ammonia-15N Chemical compound [15NH3] QGZKDVFQNNGYKY-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 206010002388 Angina unstable Diseases 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 102000005666 Apolipoprotein A-I Human genes 0.000 description 1
- 108010059886 Apolipoprotein A-I Proteins 0.000 description 1
- 101710095342 Apolipoprotein B Proteins 0.000 description 1
- 102100040202 Apolipoprotein B-100 Human genes 0.000 description 1
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 1
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- 208000037260 Atherosclerotic Plaque Diseases 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- ROFVEXUMMXZLPA-UHFFFAOYSA-N Bipyridyl Chemical compound N1=CC=CC=C1C1=CC=CC=N1 ROFVEXUMMXZLPA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102400000667 Brain natriuretic peptide 32 Human genes 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-OUBTZVSYSA-N Carbon-13 Chemical compound [13C] OKTJSMMVPCPJKN-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 206010008479 Chest Pain Diseases 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- 102100031051 Cysteine and glycine-rich protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 239000003154 D dimer Substances 0.000 description 1
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- BVTJGGGYKAMDBN-UHFFFAOYSA-N Dioxetane Chemical compound C1COO1 BVTJGGGYKAMDBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 1
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 1
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052688 Gadolinium Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010015133 Galactose oxidase Proteins 0.000 description 1
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 description 1
- 102100022624 Glucoamylase Human genes 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 108010015776 Glucose oxidase Proteins 0.000 description 1
- 239000004366 Glucose oxidase Substances 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010010234 HDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 244000043261 Hevea brasiliensis Species 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101001033020 Homo sapiens Platelet glycoprotein VI Proteins 0.000 description 1
- 238000004566 IR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- LPHGQDQBBGAPDZ-UHFFFAOYSA-N Isocaffeine Natural products CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1N(C)C=N2 LPHGQDQBBGAPDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N L-homocysteine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCS FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 108010023244 Lactoperoxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000045576 Lactoperoxidases Human genes 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000013460 Malate Dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108010026217 Malate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N Manganese Chemical compound [Mn] PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 102400001263 NT-proBNP Human genes 0.000 description 1
- QJGQUHMNIGDVPM-BJUDXGSMSA-N Nitrogen-13 Chemical compound [13N] QJGQUHMNIGDVPM-BJUDXGSMSA-N 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 208000037273 Pathologic Processes Diseases 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010043958 Peptoids Proteins 0.000 description 1
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 1
- 102000013566 Plasminogen Human genes 0.000 description 1
- 108010051456 Plasminogen Proteins 0.000 description 1
- 102000010752 Plasminogen Inactivators Human genes 0.000 description 1
- 108010077971 Plasminogen Inactivators Proteins 0.000 description 1
- 102000015795 Platelet Membrane Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010010336 Platelet Membrane Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 238000012356 Product development Methods 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 description 1
- 238000001069 Raman spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 102100028255 Renin Human genes 0.000 description 1
- 108090000783 Renin Proteins 0.000 description 1
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 1
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 1
- 206010042434 Sudden death Diseases 0.000 description 1
- 208000007814 Unstable Angina Diseases 0.000 description 1
- 108010092464 Urate Oxidase Proteins 0.000 description 1
- 108010046334 Urease Proteins 0.000 description 1
- BZHJMEDXRYGGRV-UHFFFAOYSA-N Vinyl chloride Chemical compound ClC=C BZHJMEDXRYGGRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 108010093894 Xanthine oxidase Proteins 0.000 description 1
- 102100033220 Xanthine oxidase Human genes 0.000 description 1
- 238000005299 abrasion Methods 0.000 description 1
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 description 1
- KRHYYFGTRYWZRS-BJUDXGSMSA-N ac1l2y5h Chemical compound [18FH] KRHYYFGTRYWZRS-BJUDXGSMSA-N 0.000 description 1
- 230000004658 acute-phase response Effects 0.000 description 1
- 238000011256 aggressive treatment Methods 0.000 description 1
- VFRROHXSMXFLSN-SLPGGIOYSA-N aldehydo-D-glucose 6-phosphate Chemical class OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O VFRROHXSMXFLSN-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002478 aldosterone Drugs 0.000 description 1
- 108010004469 allophycocyanin Proteins 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 210000004381 amniotic fluid Anatomy 0.000 description 1
- 238000002399 angioplasty Methods 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 229960004676 antithrombotic agent Drugs 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000000712 assembly Effects 0.000 description 1
- 238000000429 assembly Methods 0.000 description 1
- 238000004630 atomic force microscopy Methods 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 239000002876 beta blocker Substances 0.000 description 1
- 229940097320 beta blocking agent Drugs 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000000091 biomarker candidate Substances 0.000 description 1
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010241 blood sampling Methods 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 229920005549 butyl rubber Polymers 0.000 description 1
- 229960001948 caffeine Drugs 0.000 description 1
- VJEONQKOZGKCAK-UHFFFAOYSA-N caffeine Natural products CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1C=CN2C VJEONQKOZGKCAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-BJUDXGSMSA-N carbon-11 Chemical compound [11C] OKTJSMMVPCPJKN-BJUDXGSMSA-N 0.000 description 1
- 239000002327 cardiovascular agent Substances 0.000 description 1
- 229940125692 cardiovascular agent Drugs 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- VYXSBFYARXAAKO-WTKGSRSZSA-N chembl402140 Chemical compound Cl.C1=2C=C(C)C(NCC)=CC=2OC2=C\C(=N/CC)C(C)=CC2=C1C1=CC=CC=C1C(=O)OCC VYXSBFYARXAAKO-WTKGSRSZSA-N 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000003392 chemiluminescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 1
- PRQROPMIIGLWRP-BZSNNMDCSA-N chemotactic peptide Chemical class CSCC[C@H](NC=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PRQROPMIIGLWRP-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 235000020974 cholesterol intake Nutrition 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 210000003040 circulating cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000005794 circulatory dysfunction Effects 0.000 description 1
- 230000007012 clinical effect Effects 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000006835 compression Effects 0.000 description 1
- 238000007906 compression Methods 0.000 description 1
- 238000002591 computed tomography Methods 0.000 description 1
- 238000013170 computed tomography imaging Methods 0.000 description 1
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 1
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000009563 continuous hemofiltration Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 208000029078 coronary artery disease Diseases 0.000 description 1
- 239000006059 cover glass Substances 0.000 description 1
- 229960003624 creatine Drugs 0.000 description 1
- 239000006046 creatine Substances 0.000 description 1
- 229940109239 creatinine Drugs 0.000 description 1
- 210000002726 cyst fluid Anatomy 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 125000001295 dansyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=C2C([H])=C([H])C([H])=C(C2=C1[H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 238000003066 decision tree Methods 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 239000000104 diagnostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 239000012502 diagnostic product Substances 0.000 description 1
- 238000012631 diagnostic technique Methods 0.000 description 1
- 230000000378 dietary effect Effects 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L disodium;(2',7'-dibromo-3',6'-dioxido-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-4'-yl)mercury;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Na+].O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(Br)=C([O-])C([Hg])=C1OC1=C2C=C(Br)C([O-])=C1 BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000011863 diuretic therapy Methods 0.000 description 1
- 238000000835 electrochemical detection Methods 0.000 description 1
- 238000011209 electrochromatography Methods 0.000 description 1
- 239000003792 electrolyte Substances 0.000 description 1
- 230000005264 electron capture Effects 0.000 description 1
- 238000002101 electrospray ionisation tandem mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000000295 emission spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 239000006167 equilibration buffer Substances 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- ADRVRLIZHFZKFE-UHFFFAOYSA-N ethanediperoxoic acid Chemical compound OOC(=O)C(=O)OO ADRVRLIZHFZKFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol bis(2-aminoethyl)tetraacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCOCCOCCN(CC(O)=O)CC(O)=O DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 108010052295 fibrin fragment D Proteins 0.000 description 1
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002875 fluorescence polarization Methods 0.000 description 1
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 1
- UIWYJDYFSGRHKR-UHFFFAOYSA-N gadolinium atom Chemical compound [Gd] UIWYJDYFSGRHKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000007274 generation of a signal involved in cell-cell signaling Effects 0.000 description 1
- 238000011331 genomic analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 229940116332 glucose oxidase Drugs 0.000 description 1
- 235000019420 glucose oxidase Nutrition 0.000 description 1
- 208000019622 heart disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003054 hormonal effect Effects 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 150000004678 hydrides Chemical class 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- APFVFJFRJDLVQX-AHCXROLUSA-N indium-111 Chemical compound [111In] APFVFJFRJDLVQX-AHCXROLUSA-N 0.000 description 1
- 229940055742 indium-111 Drugs 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000028709 inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011147 inorganic material Substances 0.000 description 1
- 201000004332 intermediate coronary syndrome Diseases 0.000 description 1
- 238000005040 ion trap Methods 0.000 description 1
- 238000000534 ion trap mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002262 irrigation Effects 0.000 description 1
- 238000003973 irrigation Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000001948 isotopic labelling Methods 0.000 description 1
- 229940057428 lactoperoxidase Drugs 0.000 description 1
- 230000037356 lipid metabolism Effects 0.000 description 1
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- KNJDBYZZKAZQNG-UHFFFAOYSA-N lucigenin Chemical compound [O-][N+]([O-])=O.[O-][N+]([O-])=O.C12=CC=CC=C2[N+](C)=C(C=CC=C2)C2=C1C1=C(C=CC=C2)C2=[N+](C)C2=CC=CC=C12 KNJDBYZZKAZQNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004880 lymph fluid Anatomy 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 230000000527 lymphocytic effect Effects 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 1
- 230000007257 malfunction Effects 0.000 description 1
- 229910052748 manganese Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011572 manganese Substances 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 238000002483 medication Methods 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001531 micro-dissection Methods 0.000 description 1
- 108010029942 microperoxidase Proteins 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 1
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 238000007837 multiplex assay Methods 0.000 description 1
- 238000000491 multivariate analysis Methods 0.000 description 1
- 229920003052 natural elastomer Polymers 0.000 description 1
- 229920001194 natural rubber Polymers 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 210000002445 nipple Anatomy 0.000 description 1
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 1
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 1
- 238000003203 nucleic acid sequencing method Methods 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 239000000382 optic material Substances 0.000 description 1
- 239000011368 organic material Substances 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-BJUDXGSMSA-N oxygen-15 atom Chemical compound [15O] QVGXLLKOCUKJST-BJUDXGSMSA-N 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 238000009595 pap smear Methods 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000009054 pathological process Effects 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 239000000863 peptide conjugate Substances 0.000 description 1
- 230000010412 perfusion Effects 0.000 description 1
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 238000001050 pharmacotherapy Methods 0.000 description 1
- JTJMJGYZQZDUJJ-UHFFFAOYSA-N phencyclidine Chemical compound C1CCCCN1C1(C=2C=CC=CC=2)CCCCC1 JTJMJGYZQZDUJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RXNXLAHQOVLMIE-UHFFFAOYSA-N phenyl 10-methylacridin-10-ium-9-carboxylate Chemical compound C12=CC=CC=C2[N+](C)=C2C=CC=CC2=C1C(=O)OC1=CC=CC=C1 RXNXLAHQOVLMIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000000902 placebo Substances 0.000 description 1
- 229940068196 placebo Drugs 0.000 description 1
- 239000002797 plasminogen activator inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 239000000106 platelet aggregation inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000004910 pleural fluid Anatomy 0.000 description 1
- 229920003229 poly(methyl methacrylate) Polymers 0.000 description 1
- 229920002239 polyacrylonitrile Polymers 0.000 description 1
- 239000004417 polycarbonate Substances 0.000 description 1
- 229920000515 polycarbonate Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 239000004926 polymethyl methacrylate Substances 0.000 description 1
- 239000011116 polymethylpentene Substances 0.000 description 1
- 229920000306 polymethylpentene Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 229920001343 polytetrafluoroethylene Polymers 0.000 description 1
- 239000004810 polytetrafluoroethylene Substances 0.000 description 1
- 229920002689 polyvinyl acetate Polymers 0.000 description 1
- 239000011118 polyvinyl acetate Substances 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000007639 printing Methods 0.000 description 1
- 108010008064 pro-brain natriuretic peptide (1-76) Proteins 0.000 description 1
- 239000000092 prognostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 238000000575 proteomic method Methods 0.000 description 1
- 229940079877 pyrogallol Drugs 0.000 description 1
- 238000005173 quadrupole mass spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000010833 quantitative mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000000700 radioactive tracer Substances 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 238000007637 random forest analysis Methods 0.000 description 1
- 229910052761 rare earth metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002910 rare earth metals Chemical class 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 230000004043 responsiveness Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000002020 sage Nutrition 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 238000004574 scanning tunneling microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000013077 scoring method Methods 0.000 description 1
- 238000001004 secondary ion mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 1
- 150000003376 silicon Chemical class 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 230000005586 smoking cessation Effects 0.000 description 1
- 239000011343 solid material Substances 0.000 description 1
- 239000011537 solubilization buffer Substances 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 229920003048 styrene butadiene rubber Polymers 0.000 description 1
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 230000009469 supplementation Effects 0.000 description 1
- 230000003319 supportive effect Effects 0.000 description 1
- 238000010897 surface acoustic wave method Methods 0.000 description 1
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 210000001179 synovial fluid Anatomy 0.000 description 1
- 229920002994 synthetic fiber Polymers 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 230000035488 systolic blood pressure Effects 0.000 description 1
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- BFKJFAAPBSQJPD-UHFFFAOYSA-N tetrafluoroethene Chemical group FC(F)=C(F)F BFKJFAAPBSQJPD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N texas red Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC(S(Cl)(=O)=O)=CC=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001685 thyroid gland Anatomy 0.000 description 1
- 238000001269 time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000001776 time-resolved fluorescence quenching Methods 0.000 description 1
- 230000007838 tissue remodeling Effects 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 231100000167 toxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003440 toxic substance Substances 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 230000002485 urinary effect Effects 0.000 description 1
- 230000004218 vascular function Effects 0.000 description 1
- 230000006442 vascular tone Effects 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 239000011800 void material Substances 0.000 description 1
- 238000003260 vortexing Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-OUBTZVSYSA-N water-17o Chemical compound [17OH2] XLYOFNOQVPJJNP-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 230000004584 weight gain Effects 0.000 description 1
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 description 1
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 210000002268 wool Anatomy 0.000 description 1
- 230000003936 working memory Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6872—Intracellular protein regulatory factors and their receptors, e.g. including ion channels
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54306—Solid-phase reaction mechanisms
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H10/00—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
- G16H10/40—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
- G16H50/20—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for computer-aided diagnosis, e.g. based on medical expert systems
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
- G16H50/30—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for calculating health indices; for individual health risk assessment
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/475—Assays involving growth factors
- G01N2333/51—Bone morphogenetic factor; Osteogenins; Osteogenic factor; Bone-inducing factor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
- G01N2333/914—Hydrolases (3)
- G01N2333/948—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- G01N2333/95—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99)
- G01N2333/964—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue
- G01N2333/96425—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals
- G01N2333/96427—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general
- G01N2333/9643—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general with EC number
- G01N2333/96486—Metalloendopeptidases (3.4.24)
- G01N2333/96491—Metalloendopeptidases (3.4.24) with definite EC number
- G01N2333/96494—Matrix metalloproteases, e. g. 3.4.24.7
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/32—Cardiovascular disorders
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/50—Determining the risk of developing a disease
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/60—Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Measuring And Recording Apparatus For Diagnosis (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)
Description
[0001]本出願は、その全体が本明細書に組み入れられるところの2011年9月30日付けで出願された同時係属中の米国出願第61/541,828号に基づく優先権の利益を主張する。
[0002]本出願は、一般的には、個体における将来的な心血管系イベントリスクを評価するためのバイオマーカーの検出および方法に関し、より詳細には、5年間の心血管系(CV)イベントを発生させるリスクを予測するために個体を評価するのに用いられる1種またはそれより多くのバイオマーカー、方法、装置、試薬、システム、およびキットに関する。このようなイベントとしては、これらに限定されないが、心筋梗塞、卒中、うっ血性心不全または死亡が挙げられる。
[0084]ここで本発明の代表的な実施態様について詳細に説明する。本発明は列挙された実施態様により説明されるが、当然のことながら本発明がこれらの実施態様に限定されることは目的としない。それとは逆に、本発明は、特許請求の範囲で定義される本発明の範囲に包含される可能性がある全ての代替物、改変、および等価体を含むものとする。
[00123]様々な典型的な実施態様において、個体におけるCVイベントのリスクを評価するための方法が提供され、本方法は、多数の分析方法、例えば本明細書で説明される分析方法のいずれかによって、個体の循環系中、例えば血清または血漿中に存在する1種またはそれより多くのバイオマーカーに対応する1種またはそれより多くのバイオマーカー値を検出することによってなされる。これらのバイオマーカーは、例えば、高いCVイベントリスクを有する個体において、高いCVイベントリスクを有さない個体と比較して差次的に発現される。個体におけるバイオマーカーの差次的な発現の検出を用いて、例えば5年の時間枠以内のCVイベントリスクを予測することができる。
[00129]本明細書で説明されるバイオマーカーのバイオマーカー値は、様々な公知の分析方法のいずれかを用いて検出することができる。一実施態様において、バイオマーカー値は捕獲試薬を用いて検出される。「キャプチャー物質」または「捕獲試薬」は、本明細書で用いられる場合、バイオマーカーに特異的に結合することができる分子を意味する。様々な実施態様において、捕獲試薬は、溶液中でバイオマーカーと接触させてもよいし、あるいは捕獲試薬を固体支持体に固定した状態でバイオマーカーと接触させてもよい。その他の実施態様において、捕獲試薬は、固体支持体上で二次的な機構との反応性を有する機構を含む。これらの実施態様において、溶液中で捕獲試薬とバイオマーカーとを接触させて、捕獲試薬上の機構と固体支持体上の二次的な機構とを共にを用いてバイオマーカーを固体支持体に固定することもできる。捕獲試薬は、行われる解析のタイプに基づいて選択される。捕獲試薬としては、これらに限定されないが、SOMAmer、抗体、アドネクチン、アンキリン、その他の抗体模倣剤、およびその他のタンパク質の足場、自己抗体、キメラ、低分子物質、F(ab’)2フラグメント、単鎖抗体フラグメント、Fvフラグメント、単鎖Fvフラグメント、核酸、レクチン、リガンド結合受容体、アフィボディ、ナノボディ、インプリントポリマー、アビマー、ペプチドミメティクス、ホルモン受容体、サイトカイン受容体、および合成受容体、ならびにこれらの改変体およびフラグメントが挙げられる。
[00141]生体サンプルおよびその他のサンプル中の生理学的に重要な分子の検出および定量化を目的とした分析は、科学的な調査および健康管理分野において重要なツールである。このような分析のクラスの一つは、固体支持体に固定された1種またはそれより多くのアプタマーを有するマイクロアレイの使用に関するものである。アプタマーはそれぞれ、高度に特異的な様式で、かつ極めて高親和性で標的分子に結合することができる。例えば「Nucleic Acid Ligands」という表題の米国特許第5,475,096号を参照されたい。さらに、例えばそれぞれ「Nucleic Acid Ligand Diagnostic Biochip」という表題の米国特許第6,242,246号、米国特許第6,458,543号、および米国特許第6,503,715号も参照されたい。マイクロアレイがサンプルと接触すると、アプタマーはサンプル中に存在するそれぞれの標的分子に結合し、それにより、バイオマーカーに対応するバイオマーカー値を決定することができる。
[00160]イムノアッセイ法は、抗体のその対応する標的または分析物に対するの反応に基づいており、特異的分析の様式に応じてサンプル中の分析物を検出することができる。免疫反応性に基づく分析方法の特異度および感度を改善するために、モノクローナル抗体が用いられることが多いが、これはモノクローナル抗体は特異的なエピトープ認識を示すことによる。ポリクローナル抗体も様々なイムノアッセイでうまく用いられており、これは、ポリクローナル抗体は、モノクローナル抗体と比較して標的に対する親和性が高いことによる。イムノアッセイは、多様な生体サンプルマトリックスと共に使用するように設計されている。イムノアッセイの様式は、定性的、半定量的、および定量的な結果が得られるように設計されている。
[00166]生体サンプル中のmRNA測定は、生体サンプル中のそれに対応するタンパク質のレベルを検出するためのサロゲートとして利用することができる。従って、本明細書で説明されるバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルはいずれも、適切なRNAを検出することによって検出が可能である。
[00169]また説明されるバイオマーカーはいずれも(表1第7列を参照)、分子イメージング試験で用いることができる。例えば、造影剤を説明されるバイオマーカーのいずれかにカップリングしてもよく、これを利用して、その他の用途のなかでも特に、5年以内の心血管イベントリスクの予測を補助したり、治療的介入への応答をモニターしたり、臨床試験において集団を選択したりすることができる。
[00182]バイオマーカー値を検出するために、様々な立体構造のマススペクトロメーターを用いることができる。数々のタイプのマススペクトロメーターが利用可能であり、あるいは様々な立体構造を有するものを作製してもよい。一般的に、マススペクトロメーターは、以下の主な構成要素:サンプル注入口、イオン源、質量分析器、検出器、真空システム、および機器制御システム、ならびにデータシステムを有する。一般的に、サンプル注入口、イオン源、および質量分析器の違いにより、機器のタイプおよびその性能が決まる。例えば、注入口は、キャピラリー−カラム液体クロマトグラフィーの源であってもよいし、あるいは例えばマトリックス支援レーザー脱離で用いられるような直接プローブまたはステージであってもよい。一般的なイオン源は、例えば、ナノスプレーおよびマイクロスプレーなどなどのエレクトロスプレー、またはマトリックス支援レーザー脱離である。一般的な質量分析器としては、四重極質量フィルター、イオントラップ質量分析器、および飛行時間型質量分析器が挙げられる。さらなる質量分析法は当業界公知である(Burlingame等.Anal.Chem.70:647R〜716R (1998); KinterおよびSherman、ニューヨーク(2000)を参照)。
[00185]バイオマーカー値を決定するのに近接ライゲーションアッセイを用いることができる。簡単に言えば、試験サンプルを、対のそれぞれの要素をオリゴヌクレオチドで拡張した一対の親和性プローブ、例えば一対の抗体または一対のSOMAmerと接触させる。その一対の親和性プローブの標的は、1種のタンパク質に対する2種の別個の決定因子であってもよいし、あるいは2種の異なるタンパク質それぞれに対する1種の決定因子であってもよく、これらは、ホモまたはヘテロ多量体の複合体として存在していてもよい。プローブが標的の決定因子に結合すると、拡張されたオリゴヌクレオチドの遊離の端部が十分に近接し、共にハイブリダイズすることができる。拡張されたオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションは、拡張されたオリゴヌクレオチドがそれぞれ十分に近接して存在する場合にそれらを共に架橋するのに役立つ一般的なコネクターオリゴヌクレオチドによって促進される。プローブの拡張されたオリゴヌクレオチドがハイブリダイズしたら、拡張部分の端部が酵素によるDNAライゲーションによって共に連結される。
[00194]選択された特定のサンプルの特異体質の特徴に対するタンパク質の予測力の過剰適合を回避するために、クロス確認と次元縮小アプローチが採用された。クロス確認は、未選択サンプルの使用と併用してタンパク質によるリスクの関連を決定するためのサンプルセットの複合的な選択を含み、それによりその方法がリスクモデル作製に用いられなかったサンプルに適用できるかどうかをモニターすることができる(The Elements of Statistical Learning-Data Mining, Inference, and Prediction、T.Hastie等編、Springer Science+Business Media, LLC、第2版、2009)。本発明者等は、イベントリスクのモデリングにおいて高次元データセットに適用可能なTibshirani等の教師ありPCA法を応用した(Bair, E.およびTibshirani, R.(2004) Semi-supervised methods to predict patient survival from gene expression data.PLOS Biol.、2、511〜522)。教師ありPCA(SPCA)法は、データ中の観察されたイベントハザードと統計学的に関連するタンパク質セットの単変量選択、およびこれらのタンパク質全てからの情報と組み合わせる相関する成分の決定を含む。この相関する成分の決定は、次元数を低くする工程であって、この工程は、タンパク質に関する情報を組み合わせるだけでなく、1000種を超えるタンパク質の全タンパク質のメニューから数個の主成分に、独立した変数の数を減少させることによって過剰適合が起こる可能性も減らすものである(この作業において、本発明者等は第一の主成分のみを試験した)。Tibshirani等のSPCA法は、保留されたクロス確認試験セットにおいて本当に予測能のあるタンパク質の数を決定するために、タンパク質の選択にクロス確認を応用したものである。これらのタンパク質を用いて、イベントリスクに関連するタンパク質の変動の相関する成分を作製する。SPCAを用いて、本発明者等は、このクロス確認された次元縮小技術を用いて統計学的にイベントリスクと関連する155種のタンパク質のリストを見出した。この出願SPCAの応用において、本発明者等はさらに、ランダムSOMAmer配列に相当するタンパク質シグナル、加えてサンプル中に存在しない非ヒトタンパク質に相当するシグナルを試験した。SPCAでは、これら10〜20種の既知の非生物学的シグナルはどれも155種のタンパク質に選択されなかった(表1)。このようなクロス確認されたSPCAアプローチを用いた工程は、偽陽性タンパク質マーカーの関連に対してスクリーニングするのに重要である。Tibshirani等のアプローチは特に、クロス確認の予備的な確認とPCAに固有の次元縮小の使用による誤った発見を防ぐ。SPCAからの155種のタンパク質のリストを使用して、それに続く異なる技術を用いた解析をチェックし、SPCAからの155種のタンパク質のリストに含まれないタンパク質マーカーの誤った発見を検出した。
[00195]コックス比例ハザードモデル(Cox, David R (1972).「Regression Models and Life-Tables」.Journal of the Royal Statistical Society.シリーズB(方法論) 34 (2):187〜220.))は、医学統計で広く用いられている。コックス回帰分析は、特定の累積的な生存時間関数を適合させることを回避し、その代わりに、基準ハザード関数という相対リスク度のモデルを用いる(これは時間に応じて変化する)。基準ハザード関数は、全ての個体に共通する生存時間分布の形状を示すものであり、相対リスク度は、共変量値(例えば単一の個体またはグループ)のセットのハザードのレベルを複数の基準ハザードとして示すものである。コックスモデルでは、相対リスク度は、時間によらず一定である。
[00202]例えば本明細書において開示された方法の実行で使用するために、適切なキットを用いて表1第7列に記載のバイオマーカーのあらゆる組み合わせを検出することができる。さらにいずれのキットも、本明細書において説明されているような1種またはそれより多くの検出可能な標識、例えば蛍光成分などを含んでいてもよい。
[00208]バイオマーカーまたはバイオマーカーパネルが選択されたら、個体を診断する方法は、以下:1)生体サンプルを回収するかまたは別の方法で生体サンプルを得ること;2)分析方法を実行して、生体サンプルでパネル中のバイオマーカーまたはバイオマーカー(複数)を検出して測定すること;3)バイオマーカー値を回収するのに用いられる方法に必要なあらゆるデータの正規化または標準化を実行すること;4)マーカーのスコアを計算すること;5)マーカーのスコアを足し合わせてトータルの診断または予測スコアを得ること;および6)個体の診断または予測スコアを報告することを含んでいてもよい。このアプローチにおいて、診断または予測スコアは、全てのマーカーの計算の合計から決定される単一の数であってもよく、これを疾患の存在または非存在の指標である予め設定された閾値と比較する。あるいは診断または予測スコアは、それぞれバイオマーカー値を示す一連のバーであってもよく、応答パターンは、疾患、状態またはイベントの高い(または低い)リスクの存在または非存在の決定について予め設定されたパターンと比較してもよい。
[00234]この実施例は、表1に記載のバイオマーカーの同定のためにサンプルおよびコントロールを解析するのに用いられるマルチプレックスアプタマー分析を説明する。図1Aおよび1Bに、一般的なサンプル解析プロトコールを図示する。生存データの医学的な研究ではよくあることであるが、コックス比例ハザードモデルを用いて、病的状態の複数の共変量からリスクのスコアを作製した。この作業において、本発明者等はこの簡単でよく知られているアプローチ用いて、例えば、このフレキシブルで汎用のコックス比例ハザードの形式に従って個別サンプルに適用するのに適した、ハート・アンド・ソウル・スタディの集団データからモデルを作り出した。図1Bで示されるように、バイオマーカー値を、バイオマーカーの測定値と正常レベルとの対数比をとることにより連結させた。コックスモデルは、これらの対数比の加重和の指数関数を使用して、正常な集団に対するハザード比の推測を得た。
[00237]5%、0.316%、および0.01%の血清用の特注のストックアプタマー溶液を、1×SB17、0.05%トゥイーン−20で2倍濃度で調製した。これらの溶液を使用するまで−20℃で保存した。分析の日に、各アプタマーミックスを37℃10分で融解させ、沸騰する水浴中に10分置き、加熱工程と加熱工程との間に力強く混合しながら20分で25℃に冷却させた。加熱と冷却の後に、55μlの各2×アプタマーミックスを手動で96ウェルのハイバイド(Hybaid)プレートにピペット注入し、プレートホイルを密封した。最終的に、5%、0.316%または0.01%のアプタマーミックスを含む3つの96ウェルのホイルで密封したハイバイドプレートを得た。個々のアプタマー濃度は最終濃度の2倍かまたは1nMであった。
[00238]−80℃で保存された100%血清の凍結させたアリコートを25℃の水浴に10分置いた。融解させたサンプルを氷上に置き、穏やかにボルテックス(4に設定)で8秒混合し、再度に氷上に置いた。
[00241]サンプル/アプタマープレートをシリコンキャップのマットで密封し、37℃のインキュベーターに3.5時間置いた後、キャッチ(Catch)1工程に進めた。
[00242]マイワン(MyOne)(インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド)ストレプトアビジンC1ビーズの11mLのアリコートを等量の20mMのNaOH(洗浄ごとに5分インキュベート)で2回、等量の1×SB17、0.05%トゥイーン−20で3回洗浄し、11mLの1×SB17、0.05%トゥイーン−20に再懸濁した。12チャンネルのピペッターを用いて、手動でピペットにより50μLのこの溶液を96ウェルのハイバイドプレートの各ウェルに入れた。次にプレートをホイルで覆い、分析で使用するために4℃で保存した。
[00243]3つの0.45μmのミリポア(Millipore)HVプレート(デュラポア(Durapore)メンブレン、カタログ番号MAHVN4550)を100μLの1×SB17、0.05%トゥイーン−20で少なくとも10分平衡化した。次に平衡緩衝液をプレートに通してろ過し、各ウェルに133.3μLの7.5%ストレプトアビジン−アガロースビーズスラリー(1×SB17、0.05%トゥイーン−20中)を添加した。ストレプトアビジン−アガロースビーズを懸濁した状態に保ちつつそれらをフィルタープレートに移すために、ピペッティング作業間に、200μLの12チャンネルのピペッターで少なくとも6回ビーズ溶液を手動で混合した。3つのフィルタープレート全体にビーズを分配した後、真空を適用してビーズ上清を除去した。最後に、フィルタープレート中で200μLの1×SB17、0.05%トゥイーン−20でビーズを洗浄し、200μLの1×SB17、0.05%トゥイーン−20に再懸濁した。フィルタープレートの底を吸い取り、分析で使用するためにプレートを保存した。
[00244]サイトマットに、全てのチップ、プレート、槽中の全ての試薬(プレート添加の直前に新しく調製されるNHS−ビオチン試薬を除く)、3つの調製済みキャッチ1フィルタープレートおよび1つの調製済みマイワンプレートをローディングした。
[00245]3.5時間の平衡時間の後、インキュベーターからサンプル/アプタマープレートを取り出し、約1分遠心分離し、キャップのマットカバーを除去し、ベックマンのバイオメックFxPのデッキに置いた。ベックマンのバイオメックFxPプログラムを開始させた。キャッチ1におけるそれに続く全ての工程は、特に他の規定がない限りベックマンのバイオメックFxPロボットによって行われた。プログラム内で、キャッチ1フィルタープレートに真空を適用し、ビーズ上清を除去した。100マイクロリットルの5%、0.316%、および0.01%の平衡結合反応液それぞれをそれぞれのキャッチ1ろ過プレートに添加し、デッキ上のオービタルシェーカーを800rpmで10分で用いて各プレートを混合した。
[00247]無水DMSO中の100mMのNHS−PEO4−ビオチンのアリコート(−20℃で保存)を37℃で6分融解させ、続いてこれを、デッキ上の槽に手動で添加する直前にタグ付け用緩衝液(SB17、pH=7.25、0.05%トゥイーン−20)で1:100に希釈し、100μLのNHS−PEO4−ビオチンを各キャッチ1フィルタープレートの各ウェルにロボットで分配した。この溶液を、オービタルシェーカーで800rpmで5分振盪することによりキャッチ1ビーズと共にインキュベートした。
[00248]真空ろ過によりタグ付け反応液を除去し、キャッチ1プレートに1×SB17、0.05%トゥイーン−20中の150μLの20mMのグリシンを添加することによって反応を止めた。真空ろ過によりグリシン溶液を除去し、各プレートに別の1500μLの20mMのグリシン(1×SB17、0.05%トゥイーン−20中)を添加し、オービタルシェーカーで800rpmで1分インキュベートし、その後、真空ろ過により除去した。
[00253]キャッチ1の合わせた溶出物を含む1mLのディープウェルブロックを、キャッチ2用のベックマンのバイオメックFxPのデッキに置いた。
[00257]キャッチ2プレートをデッキ上のサーマルシェーカーに移し、各ウェルに75μLの1×SB17、0.05%トゥイーン−20を移した。プレートを37℃で1350rpmで1分混合し、ビーズを再懸濁して温めた。キャッチ2プレートの各ウェルに、37℃で75μLの60%グリセロールを移し、プレートを1350rpmおよび3℃でさらに1分混合し続けた。ロボットにより、プレートを37℃の磁気セパレーターに移し、そこでプレートを磁石上で2分インキュベートし、続いてロボットにより上清を取り除き捨てた。これらの洗浄をさらに2回繰り返した。
[00260]各ウェルに105μLの1MのNaCl、0.05%トゥイーン−20を含む100mMのCAPSOを添加することによってアプタマーをキャッチ2ビーズから溶出させた。この溶液と共に1300rpmで5分振盪しながらビーズをインキュベートした。
[00262]ベックマンのバイオメックFxPにより20μLの中和したキャッチ2溶出液を新しいハイバイドプレートに移し、各ウェルに、ハイブリダイゼーションコントロールの10×スパイクを含む10×アジレント・ブロック(Agilent Block)6μLを添加した。次に30μLの2×アジレント・ハイブリダイゼーション緩衝液を、中和したサンプルとブロッキング緩衝液とを含むプレートの各ウェルに手動でピペット注入し、この溶液の25μLを上下に15回ゆっくり手動でピペッティングすることによって混合し、広範にわたる気泡の形成を回避した。プレートを1000rpmで1分回転させた。
[00268]およそ400mLのアジレント洗浄緩衝液1を2つの別々のガラス染色皿それぞれに入れた。染色皿の一方を磁気撹拌プレート上に置き、スライドラックと撹拌子を緩衝液中に入れた。
[00276]製造元の説明書に従って、マイクロアレイスライドをアジレントのスキャナースライドホルダーに置き、アジレントのマイクロアレイスキャナーに入れた。
[00278]サンフランシスコ・ベイエリアに住む個体の集団におけるCVイベントリスクを予測するために、可能性のあるCVイベントのバイオマーカーの同定を行った。この研究について、参加者は、以下の登録基準のいずれか1つ、すなわち心筋梗塞の既往、血管造影で1本またはそれより多くの冠血管で50%を超える狭窄が確認された証拠、トレッドミルまたは心臓核試験による運動誘発性虚血、または冠血行再建の既往のいずれか1つを満たす必要があった。除外基準は、近年の心筋梗塞、約1ブロック歩けないこと、および引越しの予定を含む。空腹時の血液サンプルを回収し、血清のアリコートと血漿のアリコートを−70℃で保存した。実施例1で説明されているようなマルチプレックスSOMAmerの親和性分析を使用して、これらの987サンプルそれぞれの1034の分析物についてRFU値を測定し報告した。
[00282]コックス比例ハザードモデル(Cox, David R (1972).「Regression Models and Life-Tables」.Journal of the Royal Statistical Society.シリーズB(方法論) 34 (2):187〜220))は、医学統計で広く用いられている。コックス回帰分析は、特定の累積的な生存時間関数を適合させることを回避し、その代わりに、基準ハザード関数という相対リスク度のモデルを用いる(これは時間に応じて変化する)。基準ハザード関数は、全ての個体に共通する生存時間分布の形状を示すものであり、相対リスク度は、共変量値(例えば単一の個体またはグループ)のセットのハザードのレベルを複数の基準ハザードとして示すものである。コックスモデルでは、相対リスク度は、時間によらず一定である。
[00287]心血管イベントの大部分は2つのクラス、すなわち血栓形成およびCHFに分類される。血栓形成リスクとCHFリスクとを区別することは、例えば治療方針を決めること、抗血栓薬療法か利尿薬療法かを選択することにおいて医学的有用性を有する。血栓形成イベントのクラスとCHFイベントのクラスとで生物学の大部分が共通であるが、血栓形成イベントは特に、血液凝固の生物学を含む(これは、血栓形成という名称からも示される)。コックス比例ハザードモデル(実施例3)で同定された表3に記載の10種のタンパク質を用いることにより、凝固に関連するシグナルと組織のリモデリングに関連するシグナルを見つけ出すことができた。CHFイベントと血栓形成イベントとの間のあらゆる差次的なシグナルを決定するために、関連するカプラン・マイヤー曲線をCHFイベントと血栓形成イベントとで別々にプロットした。
[00291]既知の心血管疾患がある個体と、高LDLコレステロールを伴う状態などの特定の心血管に関する状態がない多くの個体との両方で構成される多くの個体をスタチン処理した。これらの強力な薬物は、多くのバイオマーカーにおいてリスクを有するものとリスクを有さないものとを区別するその能力を変更する。スタチンは、この集団でバイオマーカーが機能するかどうかを判断するのに役に立つ。
101 プロセッサー
102 インプット装置
103 アウトプット装置
104 記憶装置
105a コンピューターで読取り可能な記憶媒体リーダー
105b コンピューターで読取り可能な記憶媒体
106 通信システム
107 加速処理装置
109 メモリー
108 バス
193 その他のコード
Claims (21)
- 個体が増大した心血管系(CV)イベントリスクを有する可能性の判定を補助するための方法であって、該方法は:
該個体からの生体サンプルで、表1から選択されるN種のバイオマーカーのうち1種にそれぞれ相当するバイオマーカー値を検出することを含み、
前記バイオマーカー値は個体が増大したCVイベントのリスクを有する可能性について示し、ここでN=5〜155であり、前記N種のバイオマーカーが、PSA:α-1-アンチキモトリプシン複合体を含む、上記方法。 - 前記バイオマーカー値の検出が、インビトロでの分析を行うことを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記インビトロでの分析が、前記バイオマーカーのそれぞれに対応する少なくとも1種の捕獲試薬を含み、前記少なくとも1種の捕獲試薬を、アプタマー、抗体、および核酸プローブからなる群から選択することをさらに含む、請求項2に記載の方法。
- 前記生体サンプルが、全血、乾燥血液スポット、血漿、血清、および尿からなる群より選択される、請求項1に記載の方法。
- さらに、前記個体に相当する追加の生物医学的情報のうち少なくとも1つの項目を得ることを含み、ここで前記追加の生物医学的情報のうち少なくとも1つの項目は、独立して、
(a)心筋梗塞の既往、血管造影で1本またはそれより多くの冠血管で50%を超える狭窄が確認された証拠、トレッドミルまたは心臓核試験による運動誘発性虚血、または冠血行再建の既往からなる群より選択される、心血管系リスク因子の存在に相当する情報、
(b)前記個体の身体的な記述子に相当する情報、
(c)前記個体の体重変化に相当する情報、
(d)前記個体の民族性に相当する情報、
(e)前記個体の性別に相当する情報、
(f)前記個体の喫煙歴に相当する情報、
(g)前記個体のアルコール摂取歴に相当する情報、
(h)前記個体の職業歴に相当する情報、
(i)前記個体の心血管疾患またはその他の循環系状態の家族歴に相当する情報、
(j)前記個体または前記個体の家族におけるより高い心血管疾患リスクと相関する少なくとも1種の遺伝子マーカーの前記個体における存在または非存在に相当する情報、
(k)前記個体の臨床症状に相当する情報、
(l)その他の実験室試験に相当する情報、
(m)前記個体の遺伝子発現値に相当する情報、および
(n)飽和脂肪が多く、高塩濃度、高コレステロールの食事などの公知の心血管系リスク因子の前記個体における消費に相当する情報、
(o)心電図、心エコー検査、頚動脈内膜中膜厚の超音波診断、血流依存性血管拡張反応検査、脈波伝播速度、足関節上腕血圧比、ストレス心エコー検査、心筋血流イメージング、冠CTによる冠動脈カルシウム検査、高分解能CT血管撮影法、MRIイメージング、およびその他のイメージング様式からなる群より選択される技術により得られた個体のイメージング結果に相当する情報、および
(p)個体の薬物療法に関する情報
からなる群より選択され、
前記バイオマーカー値、および前記追加の生物医学的情報のうち少なくとも1つの項目が、CVイベントリスクについて示し得る、請求項1に記載の方法。 - 5年の期間内の将来的な心血管系(CV)イベントリスクを評価するためのバイオマーカーのパネルであって、前記パネルは、表1に記載のバイオマーカーからなる群より選択されるN種のバイオマーカーを含み、N=5〜155であり、前記N種のバイオマーカーが、PSA:α-1-アンチキモトリプシン複合体を含む、上記パネル。
- 集団における5年の期間の将来的な心血管系(CV)イベントリスクを評価するための方法であって、該方法は:
集団の個体からの生体サンプルで、表1から選択されるN種のバイオマーカーのうち1種にそれぞれ相当するバイオマーカー値を検出することを含み、
ここで前記バイオマーカー値は前記個体のCVイベントリスクに関して示し、N=5〜155であり、前記N種のバイオマーカーが、PSA:α-1-アンチキモトリプシン複合体を含む、上記方法。 - a)心血管疾患の既往歴を有するまたは有さない集団;および
b)突然変異、単一ヌクレオチド多型、および/または挿入/欠失を含む遺伝学的リスク因子を有するまたは有さない集団からなる群より選択される特徴に基づき集団を選択することをさらに含む、請求項7に記載の方法。 - CVイベントについて示された個体のリスクによって、個体を:
a)疾患管理プログラムの増加または減少に関する異なるカテゴリー;
b)生命保険の補償範囲に関する異なるリスクカテゴリー;
c)健康保険の補償範囲に関する異なるリスクカテゴリー;
d)パートナーシップ候補の異なるカテゴリー;
e)CV治療の臨床試験参加資格に関する異なるカテゴリー;
f)CV治療またはあらゆる治療の心血管安全性に関する異なるリスクカテゴリー
からなる群より選択されるカテゴリーに層別化することができる、請求項7に記載の方法。 - 前記バイオマーカー値を検出することが、インビトロでの分析を行うことを含む、請求
項7に記載の方法。 - 前記インビトロでの分析が、前記バイオマーカーのそれぞれに対応する少なくとも1種の捕獲試薬を含み、前記少なくとも1種の捕獲試薬を、アプタマー、抗体、および核酸プローブからなる群から選択することをさらに含む、請求項10に記載の方法。
- 前記生体サンプルが、全血、乾燥血液スポット、血漿、血清、および尿からなる群より選択される、請求項7に記載の方法。
- コンピューターにより実施される心血管系(CV)イベントのリスクを評価するための方法であって、該方法は:
コンピューターで個体のバイオマーカー情報を検索すること(ここでバイオマーカー情報は、表1から選択されるN種のバイオマーカーのうち1種にそれぞれ相当するバイオマーカー値を含む);
コンピューターを用いて前記バイオマーカー値のそれぞれの分類を行うこと;
複数の分類に基づいて前記個体のCVイベントリスクの評価の結果を示すこと
を含み、ここでN=5〜155であり、前記N種のバイオマーカーが、PSA:α-1-アンチキモトリプシン複合体を含む、上記方法。 - 前記個体のCVイベントリスクの評価の結果を示すことが、コンピューターディスプレイに結果を表示することを含む、請求項13に記載の方法。
- 心血管系(CV)イベントリスクを評価するためのコンピュータープログラム製品であって、該コンピュータープログラム製品は:
計算装置またはシステムのプロセッサーによって実行可能なプログラムコードを具体化するコンピューターで読取り可能な媒体
を含み、ここで該プログラムコードは:
個体からの生体サンプルに起因するデータを検索するコード(ここで該データは、表1から選択されるN種のバイオマーカーのうち1種にそれぞれ相当するバイオマーカー値を含み、前記バイオマーカーは、生体サンプル中で検出されたものである);および前記バイオマーカー値に応じて個体のCVイベントリスクの評価の結果を示す分類方法を実行するコードを含み、ここでN=5〜155であり、前記N種のバイオマーカーが、PSA:α-1-アンチキモトリプシン複合体を含む、上記製品。 - 前記分類方法が、連続的な測定スコアを使用するか、または2もしくはそれより多くのクラスへと割り当てる、請求項15に記載のコンピュータープログラム製品。
- N=6〜155である、請求項1、7または13に記載の方法。
- N=7〜155である、請求項1、7または13に記載の方法。
- N=8〜155である、請求項1、7または13に記載の方法。
- N=9〜155である、請求項1、7または13に記載の方法。
- N=10〜155である、請求項1、7または13に記載の方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2019193933A JP6917432B2 (ja) | 2011-09-30 | 2019-10-25 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161541828P | 2011-09-30 | 2011-09-30 | |
US61/541,828 | 2011-09-30 | ||
PCT/US2012/058060 WO2013049674A1 (en) | 2011-09-30 | 2012-09-28 | Cardiovascular risk event prediction and uses thereof |
Related Child Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018103211A Division JP6546318B2 (ja) | 2011-09-30 | 2018-05-30 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
JP2019193933A Division JP6917432B2 (ja) | 2011-09-30 | 2019-10-25 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2014528576A JP2014528576A (ja) | 2014-10-27 |
JP2014528576A5 JP2014528576A5 (ja) | 2015-11-12 |
JP6652781B2 true JP6652781B2 (ja) | 2020-02-26 |
Family
ID=47993164
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014533428A Active JP6652781B2 (ja) | 2011-09-30 | 2012-09-28 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
JP2018103211A Active JP6546318B2 (ja) | 2011-09-30 | 2018-05-30 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
JP2019193933A Active JP6917432B2 (ja) | 2011-09-30 | 2019-10-25 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018103211A Active JP6546318B2 (ja) | 2011-09-30 | 2018-05-30 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
JP2019193933A Active JP6917432B2 (ja) | 2011-09-30 | 2019-10-25 | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 |
Country Status (17)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US20130085079A1 (ja) |
EP (1) | EP2761289B1 (ja) |
JP (3) | JP6652781B2 (ja) |
KR (2) | KR102111624B1 (ja) |
CN (4) | CN107102151A (ja) |
AU (1) | AU2013202112B9 (ja) |
BR (2) | BR122019023720B1 (ja) |
CA (2) | CA2847903C (ja) |
ES (1) | ES2777002T3 (ja) |
HK (1) | HK1247666A1 (ja) |
IL (1) | IL231387A (ja) |
IN (1) | IN2014CN01970A (ja) |
MX (2) | MX2014003153A (ja) |
RU (1) | RU2651708C2 (ja) |
SG (3) | SG10201607331WA (ja) |
WO (1) | WO2013049674A1 (ja) |
ZA (1) | ZA201401778B (ja) |
Families Citing this family (39)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10359425B2 (en) | 2008-09-09 | 2019-07-23 | Somalogic, Inc. | Lung cancer biomarkers and uses thereof |
JP6055966B2 (ja) * | 2010-06-07 | 2017-01-11 | マイクロ‐シグネチャー リミテッド | 検出方法 |
CA2801110C (en) | 2010-07-09 | 2021-10-05 | Somalogic, Inc. | Lung cancer biomarkers and uses thereof |
AU2011289284B2 (en) | 2010-08-13 | 2015-04-09 | Somalogic Operating Co., Inc. | Pancreatic cancer biomarkers and uses thereof |
AU2012225273B2 (en) | 2011-03-10 | 2016-10-13 | Somalogic, Inc. | Aptamers for Clostridium difficile diagnostics |
ES2777002T3 (es) * | 2011-09-30 | 2020-08-03 | Somalogic Inc | Predicción de eventos de riesgo cardiovascular y usos de la misma |
JP6198047B2 (ja) * | 2013-08-02 | 2017-09-20 | 国立大学法人岐阜大学 | 冠動脈疾患の検査キット |
EP3049523B1 (en) | 2013-09-24 | 2019-08-07 | Somalogic, Inc. | Multiaptamer target detection |
CN110161252B (zh) * | 2014-03-21 | 2022-10-14 | 赛诺菲-安万特德国有限公司 | 用于评估心血管病症进展风险的新标志物 |
WO2015185672A2 (en) * | 2014-06-05 | 2015-12-10 | Sanofi | New markers for the assessment of an increased risk for mortality |
BR112017005730B1 (pt) | 2014-09-26 | 2023-12-12 | Somalogic Operating Co., Inc | Método para triagem de um indivíduo quanto ao risco de um evento cardiovascular ou para predizer a probabilidade que um indivíduo tenha tal evento |
CA3012985A1 (en) | 2015-01-27 | 2016-08-04 | Kardiatonos, Inc. | Biomarkers of vascular disease |
CN108291330A (zh) * | 2015-07-10 | 2018-07-17 | 西弗吉尼亚大学 | 卒中和卒中严重性的标志物 |
RU2602451C1 (ru) * | 2015-08-28 | 2016-11-20 | Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Способ диагностики генетической предрасположенности к развитию ишемического инсульта у больных с фибрилляцией предсердий |
EP3414575A1 (en) * | 2016-02-08 | 2018-12-19 | Somalogic, Inc. | Nonalcoholic fatty liver disease (nafld) and nonalcoholic steatohepatitis (nash) biomarkers and uses thereof |
WO2017156310A1 (en) * | 2016-03-09 | 2017-09-14 | Molecular Stethoscope, Inc. | Methods and systems for detecting tissue conditions |
CN108780101A (zh) * | 2016-04-06 | 2018-11-09 | 雀巢产品技术援助有限公司 | 用于预测体重减轻程度的生物标志物 |
WO2017179695A1 (ja) | 2016-04-15 | 2017-10-19 | オムロン株式会社 | 生体情報分析装置、システム、及び、プログラム |
CN105907857A (zh) * | 2016-04-29 | 2016-08-31 | 天津脉络生物科技有限公司 | 一种用于动脉血栓的分子标记物和试剂及其应用 |
WO2017214684A1 (en) * | 2016-06-17 | 2017-12-21 | Adelaide Research & Innovation Pty Ltd | Methods and products for identifying conditions associated with cardiac fibrotic remodelling |
ES2817087T3 (es) * | 2016-08-04 | 2021-04-06 | Hoffmann La Roche | ESM-1 (endocan) circulante en la evaluación de la fibrilación auricular |
US11079394B2 (en) * | 2017-07-25 | 2021-08-03 | Vanderbilt University | Detection of angiopoietin-2 and thrombospondin-2 in connection with diagnosing acute heart failure |
KR102368403B1 (ko) * | 2017-12-13 | 2022-02-25 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | 뇌졸중의 예측을 위한 순환하는 안지오포이에틴-2(Ang-2)와 인슐린-유사 성장 인자-결합 단백질 7(IGFBP7) |
RU2685859C1 (ru) * | 2018-07-04 | 2019-04-23 | Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") | Способ прогнозирования риска развития ишемического инсульта |
CN109192250B (zh) * | 2018-08-01 | 2021-12-07 | 华东理工大学 | 一种多相催化中克服表面物种快速迁移的加速模拟方法 |
WO2020037244A1 (en) * | 2018-08-17 | 2020-02-20 | Henry M. Jackson Foundation For The Advancement Of Military Medicine | Use of machine learning models for prediction of clinical outcomes |
EP3841381A1 (en) * | 2018-08-22 | 2021-06-30 | Roche Diagnostics GmbH | Circulating spon-1 (spondin-1) in the assessment of atrial fibrillation |
JP2022512949A (ja) * | 2018-10-31 | 2022-02-07 | セントロ ナショナル デ インベスティガシオネス カルディオバスキュラレス カルロス テルセーロ (エフェ.エセ.ペ.) | 無症候性アテローム性動脈硬化症のバイオマーカー |
KR102125053B1 (ko) * | 2018-12-14 | 2020-06-19 | 가톨릭대학교 산학협력단 | 심혈관계 질환의 검출용 조성물 및 이를 포함하는 키트 |
JP2022519897A (ja) | 2019-02-14 | 2022-03-25 | ミルヴィ・インコーポレイテッド | 対象の妊娠関連状態を決定するための方法及びシステム |
US11030743B2 (en) * | 2019-05-16 | 2021-06-08 | Tencent America LLC | System and method for coronary calcium deposits detection and labeling |
US10902955B1 (en) * | 2020-05-01 | 2021-01-26 | Georgetown University | Detecting COVID-19 using surrogates |
US20230393146A1 (en) * | 2020-10-20 | 2023-12-07 | Somalogic Operating Co., Inc. | Cardiovascular Event Risk Prediction |
RU2750716C1 (ru) * | 2020-11-23 | 2021-07-01 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ кардиологии" Минздрава России) | Способ прогнозирования сердечно-сосудистых осложнений у больных низкого или умеренного сердечно-сосудистого риска путем оценки их психологического статуса |
US20240060998A1 (en) * | 2021-02-01 | 2024-02-22 | Medtronic, Inc. | A method to identify lvad patients with elevated levels of blood activation using coupon tests |
RU2757752C1 (ru) * | 2021-04-26 | 2021-10-21 | Общество с ограниченной ответственностью "Медицинская Технологическая Компания" (ООО МТК) | Способ определения индивидуального профиля факторов суммарного сердечно-сосудистого риска у пациента трудоспособного возраста |
WO2023023748A1 (en) * | 2021-08-26 | 2023-03-02 | 3P Healthcare Pty Ltd | System and method for cardiovascular health assessment and risk management |
EP4230233A1 (en) * | 2022-02-22 | 2023-08-23 | mimiX Biotherapeutics Sàrl | Method for producing tissue constructs |
WO2023201054A1 (en) * | 2022-04-15 | 2023-10-19 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | Multi-modal machine learning to determine risk stratification |
Family Cites Families (32)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5660985A (en) * | 1990-06-11 | 1997-08-26 | Nexstar Pharmaceuticals, Inc. | High affinity nucleic acid ligands containing modified nucleotides |
US20030144476A1 (en) * | 2000-03-06 | 2003-07-31 | Pankaj Agarwal | Novel compounds |
US20030224501A1 (en) * | 2000-03-17 | 2003-12-04 | Young Paul E. | Bone morphogenic protein polynucleotides, polypeptides, and antibodies |
US6930085B2 (en) * | 2002-04-05 | 2005-08-16 | The Regents Of The University Of California | G-type peptides to ameliorate atherosclerosis |
ES2375181T3 (es) * | 2002-05-09 | 2012-02-27 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | 1l 1rl-1 como un marcador de enfermedades cardiovasculares. |
KR20060031809A (ko) * | 2003-06-09 | 2006-04-13 | 더 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 미시간 | 암 치료 및 진단용 조성물 및 방법 |
US20050181451A1 (en) * | 2004-02-12 | 2005-08-18 | Bates Harold M. | Detection of asymptomatic coronary artery disease using atherogenic proteins and acute phase reactants |
AU2005313938A1 (en) * | 2004-12-10 | 2006-06-15 | University Of Maryland, Baltimore | Serum amyloid a protein in inflammation and obesity |
CN2783324Y (zh) * | 2005-04-28 | 2006-05-24 | 穆海东 | 心血管疾病诊断和预测多指标蛋白芯片检测试剂盒 |
WO2006135886A2 (en) * | 2005-06-13 | 2006-12-21 | The Regents Of The University Of Michigan | Compositions and methods for treating and diagnosing cancer |
US20070099239A1 (en) * | 2005-06-24 | 2007-05-03 | Raymond Tabibiazar | Methods and compositions for diagnosis and monitoring of atherosclerotic cardiovascular disease |
ES2373989T3 (es) * | 2006-01-31 | 2012-02-10 | Mitsubishi Chemical Medience Corporation | Procedimiento para la determinación del estado de un síndrome de coagulación intravascular diseminada. |
EP2030025A2 (en) * | 2006-06-07 | 2009-03-04 | Tethys Bioscience, Inc. | Markers associated with arteriovascular events and methods of use thereof |
EP1887361A1 (en) * | 2006-08-07 | 2008-02-13 | Bio-Rad Pasteur | Method for the prediction of vascular events |
US7947447B2 (en) * | 2007-01-16 | 2011-05-24 | Somalogic, Inc. | Method for generating aptamers with improved off-rates |
RU2376372C2 (ru) * | 2007-04-03 | 2009-12-20 | Государственное учреждение Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук | Способ генетической диагностики подверженности к сердечно-сосудистым заболеваниям |
EP2019318A1 (en) * | 2007-07-27 | 2009-01-28 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Protein markers for cardiovascular events |
ES2402334T3 (es) * | 2007-08-02 | 2013-04-30 | Gilead Biologics, Inc | Procedimientos y composiciones para el tratamiento y el diagnóstico de la fibrosis |
GB0717637D0 (en) * | 2007-09-10 | 2007-10-17 | Univ Leiden | Future cardiac event biomarkers |
WO2009075566A1 (en) * | 2007-12-12 | 2009-06-18 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Biomarkers for cardiovascular disease |
JP2011510297A (ja) * | 2008-01-18 | 2011-03-31 | バトリックス・メディカル・インコーポレイテッド | 動脈瘤のための診断バイオマーカー |
US8030097B2 (en) * | 2008-04-30 | 2011-10-04 | Versitech Limited and R & C Biogenius Limited | Lipocalin-2 as a prognostic and diagnostic marker for heart and stroke risks |
JP2012500199A (ja) * | 2008-08-11 | 2012-01-05 | ザ ボード オブ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティー オブ テキサス システム | 血管統合性を促進するマイクロ−rnaおよびその使用 |
CN102203616A (zh) * | 2008-10-07 | 2011-09-28 | B.R.A.H.M.S有限公司 | 用于预测初次不利事件的生物标志物 |
WO2010144358A1 (en) * | 2009-06-08 | 2010-12-16 | Singulex, Inc. | Highly sensitive biomarker panels |
PT2264183T (pt) * | 2009-06-09 | 2017-03-14 | Gendiag Exe Sl | Marcadores de risco para doença cardiovascular |
CN102803951A (zh) * | 2009-06-15 | 2012-11-28 | 心脏Dx公司 | 冠状动脉疾病风险的测定 |
WO2011059721A1 (en) * | 2009-10-29 | 2011-05-19 | Tethys Bioscience, Inc. | Protein and lipid biomarkers providing consistent improvement to the prediction of type 2 diabetes |
CA2783536A1 (en) * | 2009-12-09 | 2011-06-16 | Aviir, Inc. | Biomarker assay for diagnosis and classification of cardiovascular disease |
CA2808233C (en) * | 2010-03-03 | 2017-07-11 | Somalogic, Inc. | Aptamers to 4-1bb and their use in treating diseases and disorders |
ES2777002T3 (es) * | 2011-09-30 | 2020-08-03 | Somalogic Inc | Predicción de eventos de riesgo cardiovascular y usos de la misma |
WO2013142114A1 (en) * | 2012-03-19 | 2013-09-26 | The Brigham And Women's Hosptial, Inc. | Growth differentiation factor (gdf) for treatment of diastolic heart failure |
-
2012
- 2012-09-28 ES ES12836076T patent/ES2777002T3/es active Active
- 2012-09-28 RU RU2014110508A patent/RU2651708C2/ru active
- 2012-09-28 CN CN201710329039.1A patent/CN107102151A/zh active Pending
- 2012-09-28 CN CN201280058717.0A patent/CN103959060B/zh active Active
- 2012-09-28 BR BR122019023720-4A patent/BR122019023720B1/pt active IP Right Grant
- 2012-09-28 EP EP12836076.5A patent/EP2761289B1/en active Active
- 2012-09-28 SG SG10201607331WA patent/SG10201607331WA/en unknown
- 2012-09-28 US US13/631,567 patent/US20130085079A1/en not_active Abandoned
- 2012-09-28 AU AU2013202112A patent/AU2013202112B9/en active Active
- 2012-09-28 CN CN202210145010.9A patent/CN114518458A/zh active Pending
- 2012-09-28 KR KR1020147011813A patent/KR102111624B1/ko active IP Right Grant
- 2012-09-28 SG SG10201906900QA patent/SG10201906900QA/en unknown
- 2012-09-28 WO PCT/US2012/058060 patent/WO2013049674A1/en active Application Filing
- 2012-09-28 CN CN201710064624.3A patent/CN107422126B/zh active Active
- 2012-09-28 IN IN1970CHN2014 patent/IN2014CN01970A/en unknown
- 2012-09-28 MX MX2014003153A patent/MX2014003153A/es active IP Right Grant
- 2012-09-28 JP JP2014533428A patent/JP6652781B2/ja active Active
- 2012-09-28 KR KR1020207013434A patent/KR102248900B1/ko active IP Right Grant
- 2012-09-28 BR BR112014007214-0A patent/BR112014007214B1/pt active IP Right Grant
- 2012-09-28 CA CA2847903A patent/CA2847903C/en active Active
- 2012-09-28 SG SG11201400904SA patent/SG11201400904SA/en unknown
- 2012-09-28 CA CA3074279A patent/CA3074279C/en active Active
-
2013
- 2013-12-31 US US14/145,026 patent/US20150168423A1/en not_active Abandoned
-
2014
- 2014-03-06 IL IL231387A patent/IL231387A/en active IP Right Grant
- 2014-03-11 ZA ZA2014/01778A patent/ZA201401778B/en unknown
- 2014-03-14 MX MX2020004617A patent/MX2020004617A/es unknown
-
2018
- 2018-05-29 HK HK18107011.0A patent/HK1247666A1/zh unknown
- 2018-05-30 JP JP2018103211A patent/JP6546318B2/ja active Active
-
2019
- 2019-10-25 JP JP2019193933A patent/JP6917432B2/ja active Active
-
2020
- 2020-01-23 US US16/751,102 patent/US20200166523A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6917432B2 (ja) | 心血管系リスクイベントの予測およびその使用 | |
JP7270696B2 (ja) | 心血管系のリスクイベントの予測及びその使用 | |
AU2015249162B2 (en) | Cardiovascular risk event prediction and uses thereof | |
AU2020343243A1 (en) | Cardiovascular risk event prediction and uses thereof | |
AU2021364805A1 (en) | Cardiovascular event risk prediction | |
WO2024064322A2 (en) | Methods of assessing tobacco use status | |
EP4356140A2 (en) | Renal insufficiency prediction and uses thereof | |
NZ622118B2 (en) | Cardiovascular risk event prediction and uses thereof |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20150918 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20150918 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160715 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20160720 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20161013 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170313 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20170612 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170809 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20170809 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20180131 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180530 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20180530 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20180619 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20180824 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190725 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190822 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190917 |
|
RD03 | Notification of appointment of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423 Effective date: 20190930 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20190930 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20191001 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20191025 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20200124 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6652781 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S533 | Written request for registration of change of name |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313533 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |