JP6609330B2 - レジストレーションの基準マーカー、システム、および方法 - Google Patents
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Description
本明細書において説明されるような基準マーカー、システム、および方法は、任意の断層撮影との組合せにおいて使用される任意の医用デバイスと共に利用され得る。断層撮影は、例えばMRI、CT、または超音波などであることが可能である。医用デバイスは、例えば針配置デバイスなどの患者取付け式デバイスであってもよい。
いくつかの実施形態では、ナビゲーションソフトウェア200、論理制御層206、および物理制御インターフェース208を備える3層のコンポーネントを有するソフトウェアシステムが用意される(図2)。これらのコンポーネントは、独立したソフトウェアプロセスとして実装され、例えばイーサネットおよびユニバーサルシリアルバス(USB)などを介して相互に通信する。しかし、他の実施形態では、さらに2つのこれらのコンポーネントが単一のソフトウェアプロセスに組み込まれる。
ナビゲーションソフトウェア200は、システム内の最上層コンポーネントであり、図2に例示される。ナビゲーションソフトウェア200は、例えば医師および/またはオペレータ用の主要ユーザインターフェースなどとして機能する。本明細書で説明されるように、このナビゲーションソフトウェア200は、オープンソースの医用画像演算処理ソフトウェアである3Dスライサ(Gering 2001、Andriy 2012)用のプラグインモジュールとして実装され、このまたは他のソフトウェアを介してコンソール212およびMRIハードウェア214を共に備えるMRIシステム204から画像を受信する。ナビゲーションソフトウェア200は、医師による以下のタスクの実施を支援する。
論理制御層(LCL)206は、システムの中間層に位置し、ナビゲーションソフトウェア200および低レベル物理制御層(PCL)208に接続する。この層202は、デバイスのハードウェアおよび運動学的構造をカプセル化し、デバイス非依存アプリケーションプログラムインターフェース(API)を上位層に提供することが可能である。したがって、LCL206は、以下のサブコンポーネントから構成される。
物理制御層(PCL)208の役割は、物理入出力(I/O)からは独立しているが運動学構造には依存するインターフェースを提供することである。いくつかの実施形態では、PCIは、デバイス制御サーバとの通信のためのUSBインターフェースと、エンコーダおよびフットスイッチから入力を読み取りモータドライバに個々のモータの目標速度を与えるためのデジタル入出力インターフェースとを備えたLinuxベース組み込み型コンピュータ上で動作する。コントローラが個々のアクチュエータのターゲット位置を受信すると、コントローラは、個々のモータの閉ループPID制御を実施して指定位置に2つのリングを位置決めする。任意には、このプロセス中にわたり、PCLは、リングの現位置および他のデバイス状態の送信をし続けることが可能である。
基準フレームは、複数の基準マーカーを含む。マーカーは、全てが球状マーカーであるなど、いずれも同一の形状およびサイズであってもよく、または基準フレームは、様々なサイズおよび/または形状を有する基準マーカーを含んでもよい。基準フレーム内における基準マーカーの配置は、リング形状であるか、または2つ以上のクラスタ状であるかのいずれかである。リング形状に配置される場合には、基準マーカーは、非対称的に構成される。クラスタ状に構成される場合には、クラスタはそれぞれ、異なる個数、サイズ、形状、構成、または材料特性の基準マーカーを有する。クラスタが、方向性を有する場合には、クラスタの方向性によりクラスタが6自由度(6DOF)内で固定され得るように、少なくとも1つのクラスタが存在しなければならない。クラスタが6DOF未満のみで固定され得る方向性を有するクラスタの場合には、少なくとも2つのクラスタが存在しなければならない。クラスタが方向性を有さない場合には、少なくとも3つのクラスタが存在しなければならない。いくつかの実施形態では、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、または10個のクラスタが存在する。医用デバイスが4つの隅部を有するいくつかの実施形態では、デバイスの隅部にほぼ位置決めされた4つのクラスタが存在する。
本明細書で説明される本発明の一実施形態は、球状基準マーカーの使用を含む。本実施形態のためのアルゴリズムは、特定の直径dMを有する各基準マーカーの球形状と、基準マーカーの円形構成(例えばリング形状)とに依存する。これは、図5aおよび図5bに例示される。球形状画像日付は、画像処理により容易に検出され得る。また、球状マーカーは、容易に製造され得る。例示の球状基準マーカーは、Gd−DTPA溶液で充填された3Dプリントされた球状液体容器である。
δi≠δj (0≦i<j≦NM)
ここで、δiは、円の中心の周囲におけるマークiとi+1との間の角度である。
δi=θi+1−θi (1<i<NM−1)
δN=2π−θN
我々の基準ベースレジストレーション方式は、各基準マーカーがトモグラフィ画像内で視認可能であり、本明細書で説明されるように容易に強調および検出され得る球形状を有することを要件とする。これらの球状マーカーは、少なくとも3つのクラスタを形成するように構成される。クラスタリングを単純化するために、同一クラスタ内の任意の所与の2つのマーカー間の距離がLC以下となり、一方で異なるクラスタ内のマーカー間の距離がLCmm超となるように、クラスタが定義される。第iのクラスタ内の第jのマーカーの位置をpijとした場合には、
1.C1にp1を割り当て、現点の指数をi=2とする。
2.piと各クラスタの第1の点との間の距離を計算する(第1の点が既に割り当てられている場合)。piとクラスタCjの第1の点との間の距離がLc未満である場合には、Cjにpiを割り当てる。いずれのクラスタもpiからLC内に位置する第1の点を有さない場合には、いずれの点もまだ割り当てられていないクラスタの中の1つにpiを割り当てる。
3.iを1だけ増加させる。i≦nの場合には、ステップ2を繰り返す。
これらのステップの終了までに、全ての点がクラスタC1、・・・、CNCへと割り当てられているものとする。
いくつかの実施形態では、医用デバイスで使用される基準フレームは、クラスタリングされた基準マーカーを備える。1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、またはそれ以上のクラスタが存在してもよい。各クラスタは、各クラスタが異なる個数の基準マーカー、異なるサイズの基準マーカー、異なる形状の基準マーカー、異なる構成でクラスタ内に配置された基準マーカー、または異なる材料特性を有する基準マーカーを有するため、各他のクラスタと識別可能である。
特徴強調
以下のステップにおける特徴抽出によるマーカー検出成功率を改善するために、球状マーカーの形状を用いて画像オブジェクトを強調することができる。特徴強調を実施する方法は多数存在する。画像オブジェクトの強調のための1つの共通するアプローチは、微分ベース演算であり、隣接し合うボクセルの一次空間導関数または二次空間導関数が、画像の特定の特徴を強調または除去するために計算される。
次に、いくつかの形状の基準マーカーを有する画像オブジェクトが、形状ベース特徴抽出を利用して検出される。
(x−a)2+(y−b)2+(z−c)2=r2 (7)
各オブジェクトまたはクラスタごとに、代表点が決定される。この代表点は、質量中心であり得る。代表点を規定する他の方法は、例えば各基準マーカーオブジェクトの最上点を選択する、焦点を計算する、頂点(例えば円錐の)を計算する、または同様の方法などである。かかる方法は、当技術において一般的に知られている。
基準マーカーレジストレーションプロセスのこの実施形態で論じられる最後のステップは、検出されたマーカーにマーカーのモデルをマッチングすることである。このステップは、4つのサブステップ、すなわち、1)検出されたマーカーに二次元平面をフィッティングし、2)検出されたマーカーが位置合わせされる円を推定し、3)推定された円にモデル円をマッチングし、4)モデルおよび検出されたマーカーをマッチングする回転を見つけることから構成される(図7)。第1のサブステップは、主成分分析(PCA)により達成される。PCAは、最大分散が第1の軸に沿って現れ、2番目に大きな分散が第2の軸に沿って現れ、最小分散が第3の軸に沿って現れる新たな座標系に点を変換する。したがって、点に対してフィッティングされる面は、新たな座標系により規定される。検出されたマーカーの座標は、X=(x1,x2,・・・,xN)とする。主成分分解は、3×3行列Wを利用して求められ得る。
m12=(p1+p2)/2
m23=(p2+p3)/2
により求めることが可能となり、ここでp1、p2、およびp3は、P1、P2、およびP3の二次元位置ベクトルである。P1P2およびP2P3の垂直二等分線に関する法線ベクトルは、
n12=R90°v12
n23=R90°v23
であり、ここで、
v12=p2−p1であり、v23=p3−p2であり、R90°は、x原点を中心とした90度の反時計回り回転である。
h12=m12+{(m23−m12)・n12}・n12
により計算される。
c=m23+a・n23
Tc+(p)=RC+・p+c
であり、ここで、R+=(w1 T、w2 T、w3 T)である。また、円は、反転(またはx軸またはy軸を中心とした180度の回転)の後にモデルにフィッティングされ得る。この場合に、変換は、
Tc-(p)=RC-・p+c=RC+・Rx,180°・p+c
であり、ここで、Rx,180°は、x軸を中心とした180度の反時計回り回転である。
Tθ(p)=RC・Rz(θ)・p+c
として記述することが可能であり、ここで、
RC=RC+またはRC=RC-=RC+・Rx,180°
である。
ql=Tθ1,l(p1)=RC・RZ(θ1,l)・p1+c
RZ(θ1,l)・p1=RC -1(ql−c)
ql '=RC -1(ql−c)との間の回転角度である。θ1,lを利用することにより、適合度Eを最小限に抑えるθは、
本明細書で説明されるような基準マーカー、システム、および方法の適用は、二重リング針ガイドデバイスを使用することで適用可能となる。米国特許出願公開第2014/0275979号に記載されるように、2自由度RCM運動は、二重リング機構により実現され、この機構は、固定角度で連結された2つのリング形状回転ステージからなる。これらのリング形状ステージは、超音波アクチュエータなどのモータにより手動的に回転または駆動され得る。2つのステージを個別に回転させることにより、遠隔中心の周囲において2方向に針ガイドを回転させることが可能となる。また、これらのステージは、PID制御のための内蔵エンコーダを有する。下方回転ステージおよび上方回転ステージの目標角度θ1およびθ2は、以下により計算され得る。
d=|pn−pt| (3)
上述の二重リングデバイスを使用した一例の臨床ワークフローを説明する。この実施形態では、二重リングデバイスの能動的2自由度機構が、所与の皮膚進入点の周囲において受動的針ガイドを傾斜させることにより、患者の3D術中画像上で識別される病巣への経路に針を位置合わせする。MRIガイダンスの下でターゲットの病巣にアブレーションプローブを導入するための臨床ワークフローが提示される。患者は、手技の最中にわたって手術台上に留まることが可能であり、画像が取得される場合にのみスキャナのガントリ内に移動され、他のステップはガントリ外部で実施され得る点に留意されたい。
1.第1の三次元(3D)画像(プランニング画像)が取得され、ナビゲーションソフトウェアに転送される。
2.進入点およびターゲット点が、ナビゲーションソフトウェア上で規定される。
3.針ガイドデバイスが、その遠隔運動中心(RCM)点が既定の進入点に対して与えられるように患者の身体上に取り付けられる。
4.第2の3D画像(較正画像)が取得され、ナビゲーションソフトウェアに転送される。
5.ナビゲーションソフトウェアが、デバイスに装着された基準マーカーを自動的に検出および位置特定する。
6.ナビゲーションソフトウェアは、コントローラが画像システムからデバイス座標系にターゲット座標を送信し得るように、デバイスコントローラにデバイスと画像座標系との間の空間関係を送信する。
7.ナビゲーションソフトウェアが、デバイスコントローラにターゲット点および進入点の座標を送信する。
8.デバイスコントローラが、アクチュエータを駆動して指定された軌道へと針ガイドを位置合わせさせる。
9.医師が、ガイドを使用してターゲットに向かってプローブを挿入する。このターゲットに向ける行為は、手動または自動のいずれかによる。
10.3D画像(確認画像)が、プローブ配置を確認するために取得される。
11.ステップ9および10が、複数のプローブが適切に配置されるまで繰り返され得る。
シミュレーション実験および撮像実験を利用することにより我々のレジストレーションアルゴリズムを試験した。目的は、種々のデバイス位置および配向、空間分解能、信号対雑音比(SNR)、および基準マーカーの構成を含む、様々な撮像条件下において提案するレジストレーション方法の精度、速度、およびロバストネスを評価することである。
αおよびγの平行移動パラメータ(−π,π)とβの平行移動パラメータ(−π/2,π/2)とに対して、3つの平行移動パラメータ(x,y,z)と(−150mm,150mm)の範囲を有するオイラー角(α,β,γ)とを生成することによって、ランダム剛体変換を生成した。この変換の行列表現は、
T=Rp+t
であり、ここでt=(x,y,z)であり、
また、人体模型のMR画像を使用してレジストレーションアルゴリズムを評価した。ガントリ内の既知の位置および配向にてデバイスおよび基準マーカーを配置することが可能なステージを生成した。各位置および配向にて三次元MR画像を取得し、デバイスの位置および配向を推定するために提案するアルゴリズムを使用してデバイス−画像間レジストレーションを実施し、次いでそれらの推定値をステージにより与えられる位置および配向と比較した。ボディマトリクスコイルおよびマルチスライスT2強調Half−Fourier Acquisition Single−shot Turboスピンエコー(HASTE)シーケンスを用いた3T MRIスキャナ(MAGNETOM Verio、Siemens Healthcare、Erlangen、Germany)において画像を取得した。
臨床手技中に想定され得るデバイスの変位を試験した。この移動は、腎臓のMR誘導冷凍アブレーション中に取得される3D画像を使用することによる皮膚表面および内部器官の移動に起因し得る。これらの画像を、プローブ配置プロセスの最中に定期的に取得し、したがってこれらの画像によりそれらの構造物の変位が示される。皮膚上の進入点にて配置されている場合にデバイスの想定され得る位置および配向がどのようなものであったかを推定するために使用されるようなデバイス配置シミュレータである。
デバイス−画像間レジストレーションの実証のために撮像調査と同一のスキャナを使用して全ての画像を取得した。本明細書で説明されるような一実施形態において、同一のボディマトリクスコイルおよびマルチスライス二次元MRIを使用してプローブ配置プロセスの最中にマルチスライスT2強調MR画像を取得した。
身体取付け式デバイスの具体的な1つの難点は、ロボットの位置および配向が、患者上に物理的に取り付けられるまで不明である点である。「臨床ワークフロー」の章で説明したように、デバイスは、プランニング画像を点検している間は患者の上に存在しない。この制約により、デバイスの誤配置が引き起こされる場合があり、ターゲットは、配置後にアクセス可能範囲外に位置することが判明する。デバイスが患者上にどのように配置されたかを医師が予想することが可能となるように、我々は、デバイスを患者上に物理的に取り付ける前にデバイスの想定され得る位置および配向を推定するために単純な方法を実施した。
本説明の参照において、具体的詳細が、開示される例の完全な理解を促すために示される。他の例では、周知の方法、手順、構成要素、および回路は、本開示を不要に冗長化しないために詳細には説明されていない。
Claims (18)
- 医用デバイスの画像データを取得するステップであって、前記医用デバイスは、前記医用デバイス上の基準フレームとして配置された複数の基準マーカーを備え、前記基準フレームは、
(a)基準マーカーの少なくとも2つのクラスタであって、各クラスタが、異なる個数、サイズ、形状、構成、または材料特性の基準マーカーを備える、基準マーカーの少なくとも2つのクラスタ、
(b)リング形状に配置された少なくとも3つの基準マーカーであって、配置が非対称である少なくとも3つの基準マーカー、または
(c)(a)および(b)の組合せ
を備える、ステップと、
前記画像データ内で基準マーカーオブジェクトを検出するステップであって、
前記基準マーカーオブジェクトを強調するために前記画像データに特徴強調を適用し、
前記基準マーカーオブジェクトを抽出するために特徴抽出を適用し、
基準マーカーの前記少なくとも2つのクラスタを備える前記医用デバイスの画像データに関して、前記基準マーカーオブジェクトのクラスタを規定するためにクラスタリングアルゴリズムを適用し、
前記抽出された各基準マーカーオブジェクトまたは基準マーカーオブジェクトの各クラスタに関して代表点を規定する
ことにより検出するステップと、
前記基準フレームのモデルに前記基準マーカーオブジェクトを位置合わせするステップであって、
(a)基準マーカーの前記少なくとも2つのクラスタを備える前記医用デバイスの画像データに関して、前記基準フレームの前記モデルと各クラスタの前記代表点のポイントツーポイントマッチングを行うこと、または
(b)前記リング形状に配置された前記少なくとも3つの基準マーカーの画像データに関して、前記基準マーカーオブジェクトの前記代表点が前記基準フレームの前記モデルにマッチングするまで前記リング形状を回転させること
を含む、ステップと
を含む、自動レジストレーションの方法。 - 前記特徴強調は、ヘシアン行列を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記基準マーカーオブジェクトに属する可能性のあるボクセルを強調するために前記ヘシアン行列の固有値を使用するステップをさらに含む、請求項2に記載の方法。
- 前記ヘシアン行列の前記固有値は、方向性を含み、前記基準マーカーオブジェクトに関する形状情報を規定する、請求項3に記載の方法。
- 前記特徴抽出は、ハフ変換アルゴリズムを含む、請求項1に記載の方法。
- 代表点を規定することは、各基準マーカーオブジェクトまたは基準マーカーオブジェクトのクラスタごとの質量中心を計算することを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記基準フレームの前記モデルと前記クラスタ代表点のポイントツーポイントマッチングを行った後に、各基準マーカーオブジェクトのポイントツーポイントマッチングを行うステップをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記複数の基準マーカーは、球状である、請求項1に記載の方法。
- 前記基準マーカーの少なくとも2つのクラスタは、クラスタごとに1〜6個の基準マーカーを備え、各クラスタは、異なる個数の基準マーカーを有する、請求項1に記載の方法。
- クラスタごとに2〜6個の基準マーカーを備える基準マーカーの2〜10個のクラスタを有し、各クラスタ内の基準マーカーの空間配置が明瞭である、請求項1に記載の方法。
- 3つまたは4つのクラスタを有する、請求項10に記載の方法。
- クラスタごとに1〜6個の基準マーカーを備える基準マーカーの少なくとも3つのクラスタを備え、各クラスタは、異なるサイズを有する少なくとも1つの基準マーカーを備える、請求項1に記載の方法。
- 前記複数の基準マーカーは、球体、長球体、偏球体、三軸楕円体、円筒体、および管の中の少なくとも3つを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記基準フレームは、リング形状に配置された少なくとも3つの基準マーカーを備え、前記基準マーカーの配置は、非対称である、請求項1に記載の方法。
- 前記医用デバイスは、
身体表面上に配置されるように構成されたベースと、
前記医用デバイスを介した前記身体表面への視覚的および物理的なアクセスを与えるための開口であって、リング形状に配置された前記基準マーカーが前記医用デバイスの前記開口を囲む、開口と
をさらに備える、請求項14に記載の方法。 - 前記基準フレームは、基準マーカーの少なくとも2つのクラスタを備え、各クラスタは、異なる個数、サイズ、形状、構成、または材料特性の基準マーカーを備える、請求項1に記載の方法。
- 基準フレームを備える医用デバイスであって、前記基準フレームは、
(a)基準マーカーの少なくとも2つのクラスタであって、各クラスタが、異なる個数、サイズ、形状、構成、または材料特性の基準マーカーを備える、基準マーカーの少なくとも2つのクラスタ、
(b)リング形状に配置された少なくとも3つの基準マーカーであって、配置が非対称である少なくとも3つの基準マーカー、または
(c)(a)および(b)の組合せ
を備える、医用デバイスと、
基準レジストレーションの方法を実施するためのコンピュータ実行可能プログラムを格納する非一時的コンピュータ可読記憶媒体であって、前記方法は、
前記医用デバイスの画像データを取得するステップと、
前記画像データ内で基準マーカーオブジェクトを検出するステップであって、
前記基準マーカーオブジェクトを強調するために前記画像データに特徴強調を適用し、
前記基準マーカーオブジェクトを抽出するために特徴抽出を適用し、
基準マーカーの前記少なくとも2つのクラスタを備える前記医用デバイスの画像データに関して、前記基準マーカーオブジェクトのクラスタを規定するためにクラスタリングアルゴリズムを適用し、
前記抽出された各基準マーカーオブジェクトまたは基準マーカーオブジェクトの各クラスタに関して代表点を規定する
ことにより検出するステップと、
前記基準フレームのモデルに前記基準マーカーオブジェクトを位置合わせするステップであって、
(a)基準マーカーの前記少なくとも2つのクラスタを備える前記医用デバイスの画像データに関して、前記基準フレームの前記モデルと各クラスタの前記代表点のポイントツーポイントマッチングを行うこと、または
(b)前記リング形状に配置された前記少なくとも3つの基準マーカーの画像データに関して、前記基準マーカーオブジェクトの前記代表点が前記基準フレームの前記モデルにマッチングするまで前記リング形状を回転させること
を含む、ステップと
を含む、非一時的コンピュータ可読記憶媒体と
を備える、システム。 - 前記医用デバイスは、身体表面上に配置されるように構成されたベースと、前記医用デバイスを介した前記身体表面への視覚的および物理的なアクセスを与えるための開口であって、リング形状に配置された前記基準マーカーが前記開口を囲む、開口とをさらに備える、請求項17に記載のシステム。
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