JP6480668B2 - 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 - Google Patents
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Description
しかも、細胞等の観察情報に付与するタグには、例えば細胞名など、装置が自動的に付与することが困難であって、ユーザを介した入力操作が必須の項目が多く存在する。
即ち、生細胞はインキュベータの内部で培養されているが、観察情報取得のためにインキュベータの外部に持ち出されると、気温・湿度等環境の変化がストレスとなってダメージを受ける。このため、生細胞をインキュベータの外部に持ち出す時間を極力短縮することが細胞の状態を正確に把握するために重要となる。
しかるに、従来、例えば、ユーザによる“前データ複写”ボタンの選択を介して、前回入力した過去の検体情報をコンピュータの画面上の検体情報入力・表示欄に表示し、その後のユーザによる検体情報入力・表示欄での入力、“保存”ボタンの選択を介して、検体情報を画像に関連付けてファイルに記憶する光学検査装置が、次の特許文献1に開示されている。
従って、装置が、画像に付与すべき全てのタグについて、生成及び画像への付与を自動的に行うようにすると、前回入力した情報とは異なる情報の入力を所望するタグについてのユーザの意図が反映されず、誤った情報が画像に付与されるリスクが高まる。
本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムは、1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための情報であって当該細胞の継代数を少なくとも含む細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報であって当該細胞に対する継代作業の有無を示す継代有無情報を含む情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグからなるタグセットを取得するタグ取得部と、各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存部と、を備える。
そして、前記タグ取得部は、第1の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第1の前記観察情報に対して付与すべき第1のタグセットの取得に際しては、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットの入力を受け付け、該受け付けたタグセットを第1のタグセットとして取得する。
また、前記タグ取得部は、第n(nは2以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第nの前記観察情報に対して付与すべき第nのタグセットの取得に際しては、第n−1の観察時点における第n−1の前記観察情報に付与された第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグ、第n−1の観察時点における第n−1の前記検索用タグ付き観察情報に含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞の活性度データ、第nの前記観察情報に含まれる当該細胞の活性度データと第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグの少なくともいずれかに基づき、第nの前記観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む候補タグセットを自動的に取得又は生成する。そして、前記タグ取得部は、自動的に取得又は生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付ける。そして、前記タグ取得部は、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットを第nのタグセットとして取得する。また、前記タグ取得部は、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第nのタグセットとして取得する。
細胞識別情報は、観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための識別情報であって、より詳しくは、細胞名、細胞種、培養を行う細胞であることを示す親株又はその親株から小分けした細胞であることを示す子株を識別するための細胞レベル情報、及び細胞の継代数のうちの少なくとも一つ以上を含む情報で、当該細胞の継代数を少なくとも含む情報である。
細胞名は、ユーザが実験・研究に用いる細胞に対して付ける任意の名称である。
細胞種は、分類される細胞固有の種類である。
タグセットとは、観察情報に付与すべき一つ以上のタグの組み合わせである。
このため、ユーザによるタグ取得のための入力作業の操作の手間を格段に減らすことができる。
観察情報に検索用タグとして付与すべきタグセットに含まれるタグ項目には、例えば、ユーザ識別情報におけるユーザ名など、内容が一定のタグ項目が存在する。また、例えば、細胞識別情報における細胞種や細胞名などのタグ項目は、所定期間、何回も繰り返して使用する可能性が高く、当該観察時点において前回の観察時点と同じである可能性が極めて高い。このため、これらのタグ項目について、観察情報に付与するための取得操作を行なう都度、ユーザが入力し、あるいは、特許文献1に記載の技術のような前回データの複写ボタンを押下しなければならないのでは、ユーザの操作が煩雑化する。
しかし、ユーザ名や細胞名は、ユーザ固有の情報又はユーザがカスタマイズして作成したユーザ固有の情報であり、装置が観察情報から自動的に取得することはできない。
しかるに、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにように、タグ取得部が、第n−1の観察時点の観察情報に付与された第n−1のタグセットを、第nの観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる候補タグセットとして自動的に取得するようにすれば、ユーザが入力したり、あるいは特許文献1に記載の技術のような前回複写ボタンを押下したりする手間が省ける。
なお、第n−1の検索用タグは、データベースファイルを構成する記録部に保存されている第n−1の検索用タグ付き観察情報から取得するようにしてもよい。あるいは、第n−1の検索用タグは、記録部に検索用タグ付き観察情報を保存する際に、データベースファイルを構成する記録部とは別の記憶領域に一時的に記憶させておき、その記憶領域から第n−1の検索用タグを取得するようにしてもよい。
前者は、上述のユーザ名や細胞名などのタグ項目に効果的である。後者は、継代数としてのタグ項目に有効である。
細胞の培養時には、細胞を維持管理するためのメンテナンス作業として、継代作業と、非継代作業とがあり、ユーザはこれらを随時行っている。
継代作業は、数日おきに増殖した細胞を別の容器に移す作業である。通常、実験・研究に用いる細胞は、生体から分離し、所定の培養容器内の培地に植え付けて培養し増殖させる。細胞が増殖して所定の細胞密度や細胞数に到達したとき、培養容器内の細胞の一部を他の培養容器内の培地に植え付け替える。これを継代という。
非継代作業は、継代作業時以外の作業であって、細胞状態の確認や、培養液を交換する作業である。
継代数は、継代作業を行うごとに増加していく。
このため、継代数や継代有無情報などのタグ項目については、前回(第n−1の観察時点)の観察情報に付与された第n−1のタグセットをそのまま、第nの観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる候補タグセットとして自動的に取得するようにしたのでは、観察時点によっては、正しい情報が得られず、ユーザによる入力し直しが必要となる場合が生ずる。
即ち、継代作業を行った観察日には、継代作業を行う前の細胞の観察情報に検索用タグを付与してデータベースファイルに保存する。このため、継代数は増加させず、継代作業の後の最初の非継代作業を行った観察日において、細胞の観察情報に検索用タグを付与してデータベースファイルに保存する際に、継代数を増加させることになる。
その結果、細胞に対して継代作業を行った観察日と、継代数を増加させてデータベースファイルに保存する観察日とのタイミングがずれる。
即ち、継代数は、前回の観察時点(第n−1)における継代有無情報が“継代作業”を示す情報である場合に、前回の観察時点(第n−1)における継代数に1を加えた値が、当該観察時点(第n)における継代数となる。
上述のように、タグセットに含まれるタグ項目には、例えば、継代数や継代有無情報など、所定の観察期間が経過するごとに変更する必要があるタグ項目が存在する。
ところで、当該観察時点の継代有無情報は、当該観察時点における観察情報に基づいて算出される活性度データ(細胞数又は細胞密度)の上方閾値に基づいて判別が可能である。
例えば、一般に、ユーザは、撮像した画像から得られた細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値に到達しない期間は、細胞に対し非継代作業を行う。
従って、当該観察時点の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値を下回る場合には、当該観察時点に細胞に対して行った作業が非継代作業である可能性が非常に高く、当該観察時点の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値以上である場合には、当該観察時点に細胞に対して行った作業が継代作業である可能性が非常に高い。
上述のように、当該観察時点の継代有無情報については、当該観察時点における観察情報に基づいて算出される活性度データ(細胞数又は細胞密度)の上方閾値に基づいて判別が可能である。
例えば、上述のように、一般に、ユーザは、撮像した画像から得られた細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値に到達したことが確認されたときに、細胞に対し継代作業を行う。ここで、継代作業を行った観察日の後で最新の観察日には、新しい培養容器内の細胞の画像を撮像することによって得られる活性度データは、所定の細胞密度、細胞数等の下方閾値を下回る。また、継代作業を行った観察日の後で最新の観察日の次の観察日には、培養容器内の細胞の画像を撮像することによって得られる活性度データは、所定の細胞密度、細胞数等の下方閾値以上となる。
従って、観察当日の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の下方閾値を下回る場合には、前回の観察時点に細胞に対して行った作業が継代作業である可能性が非常に高い。
そこで、当該観察時点(第n)における観察情報に基づいて算出される活性度データ(細胞数又は細胞密度)の下方閾値に基づいて前回(第n−1)の観察時点の継代有無情報を判別し、前回の観察時点に細胞に対して行った作業が継代作業と判別できた場合に、前回の観察時点における継代数に1を加えた値が観察当日の継代数となる。
その他、上記のようなタグ取得部が第nの観察情報に基づき自動的に取得又は生成する構成は、観察当日における候補タグセットに含まれるタグ項目として、観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を自動的に取得又は生成する用途に好適である。
また、タグ取得制御部は、第n(nは2以上の整数)の観察情報に対して付与すべき第nのタグセットの取得に際しては、候補タグセット自動取得・生成部を作動させて、第nの観察情報に付与すべき候補タグセットを自動的に取得又は生成させ、候補タグセット出力部を作動させて、候補タグセットを提示部に出力させるとともに、変更指示受付部を作動させて、候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け可能とし、変更指示受付部がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、入力タグセット受付部を作動させず、候補タグセット自動取得・生成部により自動的に取得又は生成された候補タグセットを第nのタグセットとして取得し、変更指示受付部がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、入力タグセット受付部を作動させて、入力タグセット受付部が受け付けた他のタグセットを第nのタグセットとして取得する。
このようにすれば、上述の本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムが具現化できる。
本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、タグ取得部は、第n(nは2以上の整数)以降の夫々の観察時点に対応して観察情報取得部を介して順次取得された夫々の観察情報に対して付与すべき夫々のタグセットの取得に際しては、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けるまで、ユーザによるタグセットの入力を受け付けずに、自動的に取得又は生成した候補タグセットを夫々の観察時点のタグセットとして取得し続け、保存部は、観察情報取得部により順次取得された夫々の観察情報に対して、タグ取得部により取得された夫々の観察時点のタグセットを検索用タグとして付与するように構成されている。
このようにすれば、複数の観察時点の異なる観察情報の夫々に付与すべき検索用タグを取得するために行なうユーザの操作を極力簡略化することができる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、タグ取得部は、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによるタグセットの入力を受け付け、受け付けたタグセットを所定の観察時点のタグセットとして取得し、保存部は、所定の観察時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された観察情報に対して、タグ取得部により取得された所定の観察時点のタグセットを検索用タグとして付与するように構成されている。
このようにすれば、システムが自動的に取得又は生成した候補タグセットの内容が正しくなく、ユーザがタグセットの変更を所望する場合に、随時、ユーザの意図を反映させることができ、全てのタグ付与を自動的に行う構成とした場合に懸念されるような、誤った内容の検索用タグ付き観察情報が記録部に保存される危険性を回避できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、タグ取得部は、第n(nは2以上の整数)以降の観察時点に対応して観察情報取得部を介して順次取得された夫々の観察情報に対して付与すべき夫々のタグセットの取得に際し、自動的に取得又は生成した候補タグセットを提示部に出力する候補タグセット出力部を備え、提示部により提示された候補タグセットを参照したユーザによる、該候補タグセットから他のタグセットへの変更についての指示を受け付けるように構成されている。
このようにすれば、自動的に取得又は生成された候補タグセットをユーザが提示部を介して肉眼で確認でき、必要に応じて候補タグセットを他のタグセットへと変更することが可能となる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、保存部は、各観察時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して順次取得された夫々の観察情報に対して、タグ取得部により取得された夫々のタグセットを検索用タグとして順次付与し、検索用タグを付与した夫々の検索用タグ付き観察情報を記録部に順次保存する。
このようにすれば、検索用タグとして付与すべきタグセットをリアルタイムに観察情報に付与して保存することができる。
このようにすれば、観察情報に検索用タグとしてのタグセットを付与して保存する時点を、観察情報を取得する時点と異ならせることができ、細胞の観察情報を取得する時点においては、取得した観察情報に検索用タグとしてタグセットを付与するための処理を省くことができる。これにより、細胞をインキュベータの外部に出しておく時間を短縮化でき、観察情報取得時に細胞に与えるダメージを極力抑えることができる。
また、ユーザは、複数の観察情報に付与すべき検索用タグとしてのタグセットを取得する際に、時間をかけて夫々のタグセットの入力誤りをチェックすることができるようになる。
さらに、ユーザは、検索用タグを付与した複数の検索用タグ付き観察情報を、記録部に保存させるための保存指示操作の手間が低減される。
このようにすれば、複数の観察時点における複数の観察情報に対して付与すべき検索用タグとしてのタグセットの候補となる複数の候補タグセットを、ユーザが同時に肉眼で確認することができ、複数の候補タグセットのうちの変更を所望する候補タグセットのタグ項目の入力を行うだけで済み、その他の候補タグセットのタグ項目についての入力操作が不要となる。そして、ユーザが、保存部を作動させるための保存ボタンを押すことにより、提示部に表示された複数の候補タグセットや、変更を所望する候補タグセットのタグ項目のみ入力を行ったタグセットを、複数の観察情報に付与すべき検索用タグとして一括して取得することができるようになる。
このため、ユーザによるタグの入力作業の操作の手間と保存のための操作の手間を格段に減らすことができる。
また、ユーザは、複数の観察情報に付与すべき検索用タグとしてのタグセットを取得する際に、時間をかけて夫々のタグセットの入力誤りをチェックすることができるようになる。
なお、毎回入力タグとしては、例えば、コメント情報が挙げられる。
細胞の状態は時間の経過とともに変化するものであるため、ユーザのコメントは、観察時点が異なるごとに内容が異なったものとなる場合が多い。
このため、例えば、前回の観察時点のコメントを自動的に候補タグとして取得して提示部に表示したとしても、ユーザによってコメントを打ち直す必要が生じる。
したがって、ユーザのコメントをタグとして観察情報に付与する場合には、そのコメントに関しては、前回観察時点のコメントを使用することができず、また、装置で自動的に取得することもできないため、ユーザが入力せざるを得ない。
しかるに、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムのように、タグ取得部11を、毎回入力タグの入力を受け付け、受け付けた毎回入力タグを第nのタグセットの一部として取得するようにすれば、ユーザによる毎回入力の必要性の高いタグのみをユーザによる毎回入力できるようにし、その他のタグについては候補タグセットを提示部に表示し必要に応じて変更入力ができるようにすることができ、ユーザによるタグの入力を必要最小限度に抑えることができる。
タグセット中のタグ項目には、上述のユーザ識別情報や細胞識別情報のように、現在の観察時点から先も所定期間、何回も繰り返して使用する可能性が高く、前回の観察時点と同じである可能性が極めて高いタグが存在する。
しかるに、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムのように、毎回入力タグと非毎回入力タグとにおいて、タグの入力処理制御を異ならせれば、上述のユーザによるタグの入力を必要最小限度に抑えることが具現化できる。
なお、細胞識別情報としては、例えば、細胞名、細胞種、継代数又は親株もしくは子株であることを識別するための細胞レベル情報が挙げられる。
例えば、上述のように、当該観察時点の継代有無情報については、装置が、当該観察時点における観察情報における活性度データ(細胞数又は細胞密度)の上方閾値に基づいて、当該観察時点での細胞に対して行う作業が“継代作業”、“非継代作業”のいずれであるかを判別することが可能である。
活性度データは、細胞の観察画像に対し所定の画像処理及び解析処理を施すことによって、検出される細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示すデータである。
従って、継代有無情報のように、システムが観察情報に基づいて、観察当日に自動的に取得できるタグ項目については、ユーザによる入力操作を極力省くことが望ましい。
このように細胞観察情報処理システムに提示部を備えれば、細胞観察情報処理システムとは別の提示部を用いることなく、ユーザが細胞観察情報処理システムに備えられた提示部に表示された候補タグセットから変更が必要である場合に他のタグへの変更入力するための操作をするだけで、検索用タグとして観察情報に付与すべきタグを、手間をかけずに短時間に取得することができるようになる。
図1は本発明の細胞観察情報処理システムの基本構成を概念的に示すブロック図である。図2は本発明の第1実施形態にかかる細胞観察情報処理システムの構成を示す説明図である。
第1実施形態の細胞観察情報処理システム10は、図1、図2に示すように、タグ取得部11と、保存部12を備えている。なお、図1及び図2中、1は細胞観察情報処理装置本体、13は記録部、18は提示部としてのモニタ、20は観察情報取得部、21はタグセット入力部、30はタグセット変更指示部である。なお、図2の例では、細胞観察情報処理システム10は、タグ取得部11と、保存部12とが、記録部13、提示部18、タグセット入力部21、タグセット変更指示部30、観察情報取得部20とともに、一つの装置本体1に備えられたスタンドアロン型の構成となっている。細胞観察情報処理装置本体1は、例えば、撮像装置とデータベースを備えたコンピュータを備えた顕微鏡装置で構成されている。
詳しくは、タグ取得部11は、例えば、細胞観察情報処理装置本体1に備わる、図示しないユーザID入力画面において、ユーザが選択入力したユーザIDや、タグセット入力部21を介して、後述する図3に示す提示部18のタグ入力・表示画面18cにおいて、ユーザが入力した細胞レベル情報(親株又は子株)、細胞名、継代数、継代有無情報等を検索用タグとして取得することができるように構成されている。
また、タグ取得部11は、この他にも、観察情報取得部20を介して取得された夫々の観察情報における細胞画像にログとして記録されている撮像日時など、装置が自動的に生成した測定日時を、観察情報を取得した日時を識別するための日時情報として取得することができるように構成されている。
さらに、タグ取得部11は、観察情報取得部20を介して取得された夫々の観察情報における細胞画像から画像タグを取得することができるように構成されている。
そして、タグ取得制御部11eは、変更指示受付部11cがユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、入力タグセット受付部11dを作動させず、候補タグセット自動取得・生成部11aにより自動的に取得又は生成された候補タグセットを第nのタグセットとして取得する。
また、タグ取得制御部11eは、変更指示受付部11cがユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、入力タグセット受付部11dを作動させて、入力タグセット受付部11dが、ユーザによるタグセット入力部21を介した提示部18のタグ入力・表示画面18cでの入力操作を通じて受け付けた当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む他のタグセットを第nのタグセットとして取得する。
なお、本実施形態では、便宜上、ユーザ識別情報としてユーザIDを用いることとするが、ユーザ識別情報は、ユーザIDに限定されるものではなく、例えば、ユーザの氏名やニックネーム等、ユーザを他のユーザと識別できる文字や記号等であればどのようなものでもよい。
なお、図示を省略したが、本実施形態の細胞観察情報処理システム10を備えた細胞観察情報処理装置本体1は、保存指示ボタン18d−2を押すための保存指示部も備えている。
また、ユーザによる観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報は、より詳しくは、作業の内容(継代有無情報:継代作業又は非継代作業)、希釈率、容器種類や容器サイズ、細胞を格納した容器番地のうちの少なくとも一つ以上を含む識別情報である。
希釈率とは、培養容器内で培養されている細胞を、継代や実験のために間引くときの間引き量である。
また、画像タグは、細胞画像を示すためのタグで、より詳しくは、例えば、提示部18に提示される図示しない画像選択入力画面において、小さなサイズで表示されうる画像や、画像と画像に対応した名称とが一体化した情報である。
また、活性度データの変化情報は、例えば、複数時点での観察情報に含まれる細胞の活性度データ(例えば、細胞密度、細胞数、生存率)の変化量(即ち、変化率)であり、例えば、グラフの傾き等で示すことができる情報である。
ユーザが培養している細胞の状態を管理する段階には、培養している細胞の観察情報を記録部13に保存する段階と、記録部13から所望の細胞の観察情報を検索・抽出して細胞の状態をチェックする段階とがある。観察情報に付与すべきタグセットのユーザによる取得操作、取得したタグセットを付与した観察情報の記録部13への保存は、培養している細胞の観察情報を記録部13に保存する段階において行われる。
次いで、タグ取得部11の入力タグセット受付部11dが、提示部18のタグ入力・表示画面18cにおいてタグセット入力部21を介した、第1の観察情報に付与すべき当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットの入力をユーザから受け付ける(ステップS3、S4)。
次いで、タグ取得部11は、入力タグセット受付部11dを介してユーザから受け付けたタグセットを第1の観察情報に付与すべきタグセットとして取得する(ステップS5)。
次いで、保存部12が、第1回目のタグセット付き観察情報を記録部13に保存する(ステップS7)。なお、本実施形態の細胞観察情報処理システム10においては、第1回目のタグセットを記録部13の他に別の記憶領域に一時的に保存するようにしてもよい。
そして、終了入力の入力がある場合は、処理を終了する(ステップS9)。
一方、終了入力の入力があるない場合は、次の観察時点(n=n+1)の観察情報の取得処理を行う(ステップS9、S10、S2)。
タグ取得部11の候補タグセット取得・生成部11aが、記録部13又は一時的に記録した記憶領域から第n−1の観察情報に付与された第n−1の検索用タグに基づき、当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む候補タグセットを自動的に取得又は生成する(ステップS11)。
次いで、タグ取得部11の候補タグセット出力部11bが、候補タグセット取得・生成部11aにより取得又は生成された候補タグセットを提示部18のタグ入力・表示画面18cに出力する(ステップS12)。
次いで、提示部18のタグ入力・表示画面18cが、タグ取得部11の候補タグセット出力部11bにより出力された候補タグセットを表示する(ステップS13)。
次いで、タグ取得部11の変更指示受付部11cが、タグセット変更指示部30を介した、提示部18のタグ入力・表示画面18cに表示された候補タグセットから他のタグセットへの変更指示をユーザから受け付ける(ステップS14)。
一方、ユーザからの他のタグセットへの変更指示がある場合は、タグ取得部11の入力タグセット受付部11dが、提示部18のタグ入力・表示画面18cにおいてタグセット入力部21を介した、第1の観察情報に付与すべき当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットの入力をユーザから受け付ける(ステップS4)。次いで、タグ取得部11が、入力タグセット受付部11dを介してユーザから受け付けたタグセットを第1の観察情報に付与すべきタグセットとして取得する(ステップS5)。以後、上述のステップS6以降と同様の処理を行う。
これらの処理を、観察情報取得部20が、ユーザからの観察情報取得処理の終了入力の指示を受け付けるまで繰り返す。
ユーザからの観察情報取得処理の終了入力の指示を受け付け、全ての時点の観察情報に対する検索用タグの付与及び検索用タグ付き観察情報の記録部13への保存が完了したとき、培養している細胞の観察情報を記録部に保存する段階での処理が終了する。
即ち、例えば、ユーザ名などのユーザ識別情報は、タグの内容が一定であり、また、例えば、細胞種や細胞名などのタグは、現在の観察時点から先も所定期間、何回も繰り返して使用する可能性が高く、観察時点が異なっても変動する可能性が少ない。
しかるに、図6の例のように、前回の観察時点のタグを候補タグセットとして取得して提示部18のタグ入力・表示画面18cに表示するようにすれば、ユーザはこれらのタグについて入力し、あるいは特許文献1に記載の技術のような前回複写ボタンを押下する手間が省ける。
前者は、上述のユーザ名や細胞名などのタグ項目に効果的である。後者は、継代数としてのタグ項目に有効である。
このため、図6の例のステップS11において、タグ取得部11の候補タグセット自動取得・生成部11aが、前回(第n−1の観察時点)の観察情報に付与された第n−1のタグセットに含まれる継代数をそのまま、第nの観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる候補タグセットのうちの継代数として自動的に取得するようにしたのでは、正しい情報が得られず、ユーザによる入力し直しが必要となる。
しかし、第1回目の観察時点における検索用タグに含まれる継代有無情報は、“継代作業”を示す情報である。即ち、第1回目の観察時点においては、細胞に対する継代作業が行われており、第2回目の観察時点における継代数は“2”が正しい値であるため、ユーザは、継代数を入力し直す必要が生じる。
例えば、候補タグセット自動取得・生成部11aは、前回の観察時点(第n−1)における継代有無情報が“継代作業”を示す情報である場合に、前回の観察時点(第n−1)における継代数に1を加えた値、前回の観察時点(第n−1)における継代有無情報が“非継代作業”を示す情報である場合に、前回の観察時点(第n−1)における継代数と同じ値を第nの継代数として自動的に取得又は生成する。
その結果、2回目の観察時点である観察当日における候補タグセットに含まれるタグ項目としての継代数の正しい値を自動的に取得することができ、提示部18のタグ入力・表示画面18cにおける継代数を入力・表示するタグ項目欄には、“2”が表示されることになるため、ユーザが継代数を入力し直す必要がなくなり、その分の手間が省ける。
その結果、3回目の観察時点である観察当日における候補タグセットに含まれるタグ項目としての継代数の正しい値を自動的に取得することができ、提示部18のタグ入力・表示画面18cにおける継代数を入力・表示するタグ項目欄には、“2”が表示されることになるため、ユーザが入力したり、あるいは特許文献1に記載の技術のような前回複写ボタンを押下したりする手間が省ける。
図7の例では、タグ取得部11の候補タグセット取得・生成部11aが、第n−1の観察時点における第n−1の検索用タグ付き観察情報に基づき、第nの観察情報に付与すべき候補タグセットを自動的に取得又は生成する(ステップS11’)。
その他の処理ステップは、図6の例と略同じである。
ところで、当該観察時点の継代有無情報は、当該観察時点における観察情報に基づいて算出される活性度データ(細胞数又は細胞密度)の上方閾値に基づいて判別が可能である。
例えば、一般に、ユーザは、撮像した画像から得られた細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値に到達しない期間は、細胞に対し非継代作業を行う。
従って、当該観察時点の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値を下回る場合には、当該観察時点に細胞に対して行った作業が非継代作業である可能性が非常に高く、当該観察時点の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値以上である場合には、当該観察時点に細胞に対して行った作業が継代作業である可能性が非常に高い。
図9の例では、タグ取得部11の候補タグセット取得・生成部11aが、第nの観察情報に基づき、第nの観察情報に付与すべき候補タグセットを自動的に取得又は生成する(ステップS11’)。
その他の処理ステップは、図6の例と略同じである。
上述のように、当該観察時点(第n)の継代有無情報は、当該観察時点(第n)における観察情報に基づいて算出される活性度データ(細胞数又は細胞密度)の上方閾値に基づいて判別が可能である。
例えば、上述のように、一般に、ユーザは、撮像した画像から得られた細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値に到達したことが確認されたときに、細胞に対し継代作業を行う。ここで、継代作業を行った観察日の後で最新の観察日には、新しい培養容器内の細胞の画像を撮像することによって得られる活性度データは、所定の細胞密度、細胞数等の下方閾値を下回る。また、継代作業を行った観察日の後で最新の観察日の次の観察日には、培養容器内の細胞の画像を撮像することによって得られる活性度データは、所定の細胞密度、細胞数等の下方閾値以上となる。
従って、観察当日の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の下方閾値を下回る場合には、前回の観察時点に細胞に対して行った作業が継代作業である可能性が非常に高い。
その他、図9の例の処理手順は、観察当日における候補タグセットに含まれるタグ項目として、観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を自動的に取得又は生成する用途に好適である。
このため、ユーザによるタグの入力作業の操作の手間を格段に減らすことができる。
その結果、細胞等の観察情報に付与するタグを取得するために要するユーザの操作の手間と時間を削減することができ、特に、細胞をインキュベータの外部に持ち出した状態で、細胞の観察結果に付与するタグを取得するための操作を行うような場合に、タグを取得するために要するユーザの操作の時間が短縮されることによって、細胞に与えるダメージを低減でき、正確な実験を担保できる。
図11は本発明の第2実施形態にかかる細胞観察情報処理システムを用いた、観察情報の取得から、観察情報に付与すべきタグセットの取得、取得したタグセットを付与した観察情報の記録部への保存までの処理手順の一例を示すフローチャートである。
詳しくは、候補タグセット自動取得・生成部11aは、第m(mは1以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して観察情報取得部20により取得された第mの観察情報に含まれる細胞の画像に基づき、第mの観察情報に付与すべき候補タグセットを自動的に生成するように構成されている。
そして、タグ取得制御部11eは、変更指示受付部11cがユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、入力タグセット受付部11dを作動させず、候補タグセット自動取得・生成部11aにより自動的に生成された候補タグセットを第mのタグセットとして取得する。
一方、タグ取得制御部11eは、変更指示受付部11cがユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、入力タグセット受付部11dを作動させて、入力タグセット受付部11dが受け付けた他のタグセットを第mのタグセットとして取得する。
その他の構成は、第1実施形態の細胞観察情報処理システム10と略同じである。
次いで、タグ取得部11の候補タグセット取得・生成部11aが、第mの観察情報に基づき、候補タグセットを自動的に生成する(ステップS23)。
上述のように、当該観察時点の継代有無情報については、当該観察時点における観察情報における活性度データ(細胞数又は細胞密度)の上限閾値に基づいて、当該時点での細胞に対して行う作業が“継代作業”、“非継代作業”のいずれであるかを判別できる。一般に、ユーザは、撮像した画像から得られた細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値に到達しない期間は、細胞に対し非継代作業を行う。
従って、観察当日の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値を下回る場合には、観察当日に細胞に対して行った作業が非継代作業である可能性が非常に高く、観察当日の細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値以上である場合には、観察当日に細胞に対して行った作業が継代作業である可能性が非常に高い。
そこで、候補タグセット取得・生成部11aは、観察当日に撮像した画像から得られた細胞の活性度データが所定の細胞密度、細胞数等の上方閾値に到達したときは、観察当日に細胞に対して行う作業が“継代作業”であることを示すタグを候補タグセットの一部として生成する。
次いで、提示部18のタグ入力・表示画面18cが、タグ取得部11の候補タグセット出力部11bにより出力された候補タグセットを表示する(ステップS25)。
次いで、タグ取得部11の変更指示受付部11cが、タグセット変更指示部30を介した、提示部18のタグ入力・表示画面18cに表示された候補タグセットから他のタグセットへの変更指示をユーザから受け付ける(ステップS26)。
一方、ユーザからの他のタグセットへの変更指示がある場合は、タグ取得部11の入力タグセット受付部11dが、提示部18のタグ入力・表示画面18cにおいてタグセット入力部21を介した、第1の観察情報に付与すべきタグセットの入力をユーザから受け付ける(ステップS29)。次いで、タグ取得部11が、入力タグセット受付部11dを介してユーザから受け付けたタグセットを第mの観察情報に付与すべきタグセットとして取得する(ステップS30)。
次いで、保存部13が、第mのタグセット付き観察情報を記録部13に保存する(ステップS32)。
そして、終了入力の入力がある場合は、処理を終了する(ステップS34)。
一方、終了入力の入力があるない場合は、次の観察時点(m=m+1)の観察情報の取得処理を行う(ステップS34、S35、S22)。
これらの処理を、観察情報取得部20が、ユーザからの観察情報取得処理の終了入力の指示を受け付けるまで繰り返す。
図12は本発明の第3実施形態にかかる細胞観察情報処理システムの構成を示す説明図である。図13は図12の細胞観察情報処理システムを用いた、観察情報の取得から、観察情報に付与すべきタグセットの取得、取得したタグセットを付与した観察情報の記録部への保存までの処理手順の一例を示すフローチャートである。図14は図12の細胞観察情報処理システムにおける提示部に表示されるタグセット入力・表示画面及び変更指示ボタンの一構成例を示す説明図である。
なお、第3実施形態の細胞観察情報処理システム10における候補タグセット一括自動取得・生成部11a’が取得又は生成する「第1〜第mの」観察情報とは、観察情報取得部20が複数の観察時点において取得した観察情報を意味し、「第1の」とは、例えば同一ユーザ名、同一細胞名を含む、過去の検索用タグ付き観察情報が記録部13に既に保存されている場合において、未だ記録部13に保存されていない観察情報のうちで最古の観察情報を取得した観察時点を相対的に示したものである。従って、「第1の」観察情報は、記録部13に保存する初期保存する観察情報に限られたものではない。
また、変更指示一括受付部11c’は、ユーザからの全ての候補タグセットに対する他のタグセットへの変更指示を一括して受け付ける。
また、入力タグセット一括受付部11d’は、全てのタグセットのうち変更指示一括受付部11c’を介して他のタグセットへの変更指示のあったタグセットの入力をユーザから一括して受け付ける。
そして、タグ一括取得制御部11e’は、変更指示一括受付部11c’がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、入力タグセット一括受付部11d’を作動させず、候補タグセット一括自動取得・生成部11a’により一括して自動的に生成された候補タグセットを第1〜第mの夫々のタグセットとして一括して取得する。
一方、タグ一括取得制御部11e’は、変更指示一括受付部11c’がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を一括して受けたときには、入力タグセット一括受付部11d’を作動させて、入力タグセット一括受付部11d’が一括して受け付けた他のタグセットを含む第1〜第mの夫々のタグセットを一括して取得する。
その他の構成は、第1実施形態の細胞観察情報処理システム10と略同じである。
次いで、候補タグセット一括出力部11b’が、候補タグセット一括自動取得・生成部11a’により一括して自動的に取得又は生成された全ての観察情報の夫々に付与すべき全ての候補タグセットを提示部18のタグ入力・表示画面18cに一括して出力する(ステップS46)。
図14の例では、提示部18は、タグ入力・表示画面18c1〜18c6に表示された全ての観察時点の候補タグセットの夫々に対し、他のタグセットへの変更を指示する変更指示ボタン18d−11〜18d−16を備えており、ユーザは、全ての観察時点の候補タグセットのうち、他のタグセットへの変更を所望する候補タグセットに対応する変更指示ボタン18d−1n(図14では便宜上、n:1〜6)を押すことができるようになっている。
そして、変更指示一括受付部11c’は、ユーザからの全ての候補タグセットに対する他のタグセットへの変更指示を一括して受け付ける(ステップS48)。
一方、タグ取得部11のタグ取得一括制御部11e’は、変更指示一括受付部11c’がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を一括して受けたときには、入力タグセット一括受付部11d’を作動させる。そして、入力タグセット一括受付部11d’が、変更指示を受けた当該観察時点の候補タグセットが表示されているタグ入力・表示画面18c−nにおいて他のタグセットへの入力を受け付ける(ステップS51)。他のタグセットへの入力を一括して受け付けた後、ユーザにより入力された他のタグセットを含む第1〜第mの夫々のタグセットを一括して取得する(ステップS52)。
次いで、保存部13が、第1〜第mの全てのタグセット付き観察情報を記録部13に一括して保存する(ステップS54)。
また、ユーザは、複数の観察情報に付与すべき検索用タグとしてのタグセットを取得する際に、時間をかけて夫々のタグセットの入力誤りをチェックすることができるようになる。
さらに、ユーザは、保存指示ボタン18d−2を1回押すと、検索用タグを付与した複数の検索用タグ付き観察情報を一括して記録部13に保存させることができることにより、保存指示操作の手間が低減される。
その他の作用効果は、第1又は第2実施形態の細胞観察情報処理システム10と略同じである。
図15は本発明の第4実施形態にかかる細胞観察情報処理システムの構成を示す説明図である。図16は図15の細胞観察情報処理システムにおけるタグセット表示・入力画面を備えた提示部の一構成例を示す説明図である。
非毎回入力タグ受付部11d1は、ユーザによる非毎回入力タグの入力を受け付けるように構成されている。非毎回入力タグは、後述する毎回入力タグと比較して、観察時点ごとの取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された夫々の観察情報に対し付与すべき検索用タグとして、タグ入力・表示画面18cにおいて、ユーザによる入力の必要性が低いタグである。非毎回入力タグとしては、例えば、観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報(例えば、ユーザID)を示すタグ、観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための細胞識別情報(例えば、細胞名、細胞種、継代数又は親株もしくは子株であることを識別するための細胞レベル情報)を示すタグ又は観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグが挙げられる。
非毎回入力タグ受付部11d1の構成は、第1〜第3実施形態の細胞観察情報処理システム10におけるタグ受付部11dの構成と略同じである。
また、候補タグセット出力部11bは、候補タグセット自動取得・生成部11aが自動的に取得又は生成した候補タグセットのうち、非毎回入力タグを提示部18の非毎回入力タグ入力・表示画面18c−1に出力し、毎回入力タグを提示部18の毎回入力タグ入力・表示画面18c−2に出力するように構成されている。
その他の構成は、第1〜第3実施形態の細胞観察情報処理システムと略同じである。
なお、図17は第1実施形態の細胞観察情報処理システム10を基にして、第4実施形態の細胞観察情報処理システム10を構成した場合の処理手順の一例を示す図、図18は図17の変形例として、第2実施形態の細胞観察情報処理システム10を基にして、第4実施形態の細胞観察情報処理システム10の処理手順を構成した一例を示す図である。
まず、第1回目の観察時点において取得された観察情報に付与する第1のタグセット取得のための操作手順について説明する。
観察情報取得部20による第1の観察情報の取得(ステップS1、S2)後、タグ取得部11の非毎回入力タグセット受付部11d1が、提示部18のタグ入力・表示画面18cの非毎回入力タグ入力・表示画面18c−1においてタグセット入力部21を介した、第1の観察情報に付与すべき非毎回入力タグの入力をユーザから受け付ける(ステップS3、S4’)。
次いで、タグ取得部11が、非毎回入力タグセット受付部11d1を介してユーザから受け付けた非毎回入力タグを第1の観察情報に付与すべきタグセットの一部として取得する(ステップS5’)。
次いで、タグ取得部11が、毎回入力タグセット受付部11d2を介してユーザから受け付けた毎回入力タグを第1の観察情報に付与すべきタグセットの一部として取得する(ステップS51)。
タグ取得部11の候補タグセット取得・生成部11aによる候補タグセットの取得(ステップS11)、候補タグセット出力部11bによる提示部18への候補タグセットの出力(ステップS12)、提示部18による候補タグセットの表示(ステップS13)、変更指示受付部11cによるユーザからの他のタグセットへの変更指示の受付(ステップS14)までの処理手順は、図6、図7、図9に示した第1実施形態の細胞観察情報処理システム10における処理手順と略同じである。
これらの処理を、観察情報取得部20が、ユーザからの観察情報取得処理の終了入力の指示を受け付けるまで繰り返す。
観察情報取得部20による第m(mは1以上の整数)の観察情報の取得(ステップS22)、タグ取得部11の候補タグセット取得・生成部11aによる候補タグセットの自動生成(ステップS23)、候補タグセット出力部11bによる提示部18への候補タグセットの出力(ステップS24)、提示部18による候補タグセットの表示(ステップS25)、変更指示受付部11cによるユーザからの他のタグセットへの変更指示の受付(ステップS25)までの処理手順は、図11に示した第2実施形態の細胞観察情報処理システム10における処理手順と略同じである。
一方、ユーザからの他のタグセットへの変更指示がある場合は、タグ取得部11の非毎回入力タグ受付部11d1が、提示部18の非毎回タグ入力・表示画面18c−1においてタグセット入力部21を介した、第mの観察情報に付与すべき非毎回入力タグの入力をユーザから受け付ける(ステップS29’)。次いで、タグ取得部11が、非毎回入力タグ受付部11d1を介してユーザから受け付けた非毎回入力タグを第nの観察情報に付与すべきタグセットの一部として取得する(ステップS30’)。
次いで、タグ取得部11が、毎回入力タグセット受付部11d2を介してユーザから受け付けた毎回入力タグを第mの観察情報に付与すべきタグセットの一部として取得する(ステップS61)。
これらの処理を、観察情報取得部20が、ユーザからの観察情報取得処理の終了入力の指示を受け付けるまで繰り返す。
また、細胞観察情報処理システム10は、図示しない検索条件取得部と観察データ抽出部を有している。検索条件取得部は、検索条件指定画面においてユーザが入力した情報に加えて、例えば、活性度データや日時情報等を組み合わせたものを検索条件として取得する。観察データ抽出部は、検索条件取得部により取得された検索条件を用いて記録部13を検索し、検索条件に合致する検索用タグが付与されている検索用タグ付き観察情報を含むデータを、記録部13から抽出する。観察データ抽出部が抽出した検索用タグ付き観察情報を含むデータは、検索条件取得部により取得された検索条件に応じた表示態様で図示しない表示画面に表示されるようになっている。
そして、これら検索条件指定画面におけるユーザによる検索条件の入力、検索条件取得部による検索条件の取得、観察データ抽出部による検索用タグ付き観察情報を含むデータの抽出、表示画面への表示を経て、記録部13から所望の細胞の観察情報を検索・抽出して細胞の状態をチェックする段階での処理を行うことができるようになっている。
本変形例の細胞観察情報処理システム10は、タグ取得部11が観察情報取得部20とともに観察処理装置1aに、保存部12が記録部13とともに記録処理装置1bに、提示部18、タグセット入力部21、タグセット変更指示部30がモニタ装置1cに、夫々備えられている。
観察処理装置1aは、例えば、撮像装置とコンピュータを備えた顕微鏡装置で構成されている。
記録処理装置1bは、例えば、データベースファイルを格納した記憶装置とコンピュータを内蔵して構成されている。
モニタ装置1cは、例えば、データベースソフトウェアを備えたコンピュータを内蔵した表示装置で構成されている。
観察処理装置1aと記録処理装置1b、モニタ装置1cと観察処理装置1aは、互いにネットワーク接続されている。
タグ取得部11、保存部12、記録部13、提示部18、タグセット入力部21、タグセット変更指示部30、観察情報取得部20の構成は、図2に示した第1実施形態における構成と略同じである。
本変形例の細胞観察情報処理システム10は、複数の観察処理装置1a−1、1a−n(nは2以上の整数。図20では便宜上、n=2)によって観察情報が取得され、夫々の観察処理装置1a−1、1a−nにより取得された観察データを一括して管理する構成となっている。
詳しくは、図20の細胞観察情報処理システム10では、複数の観察処理装置1a−1、1a−nの夫々が、観察情報取得部20と、タグ取得部11を備えている。
その他の構成は、図19の細胞観察情報処理システム17と略同じである。
また、複数の観察処理装置1a−1、1a−nにより取得された観察データを集中して管理する構成としたので、各々の観察処理装置を小型軽量化し、夫々のユーザごとに専用の観察処理装置を携帯可能に構成することで、各ユーザは、細胞の観察情報を任意の場所で取得することができ、利便性がより一層向上する。
その他の構成及び作用効果は、図19の変形例と略同じである。
本変形例の細胞観察情報処理システム10は、図2の細胞観察情報処理システムに、さらに提示部18を備えて構成されている。
提示部18は、候補タグセット自動取得・生成部11aにより自動的に取得又は生成され、候補タグセット出力部11bにより出力された候補タグセットを、例えば、図3に示したモニタ等の表示画面におけるタグセット表示・入力画面18cに表示する。
その他の構成及び作用効果は、図2に示した第1実施形態における構成及び作用効果と略同じである。
なお、ここでは、図2の細胞観察情報処理システムに適用した例を説明したが、本発明の細胞観察情報処理システム10に提示部18を備える構成は、他の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいても適用可能である。
なお、本変形例では、他のユーザインタフェースとして、音声インタフェースや視線インタフェース等を挙げたが、これらに限られるものではなく、例えば、脳波インタフェースによってユーザからの指示を取得するように構成することも可能である。
1a、1a−1、1a−2 観察処理装置
1b 記録処理装置
1c モニタ装置
10 細胞観察情報処理システム
11 タグ取得部
11a 候補タグセット自動取得・生成部
11a’ 候補タグセット一括自動取得・生成部
11b 候補タグセット出力部
11b’ 候補タグセット一括出力部
11c 変更指示受付部
11c’ 変更指示一括受付部
11d 入力タグセット受付部
11d’ 入力タグセット一括受付部
11d1 非毎回入力タグ受付部
11d2 毎回入力タグ受付部
11e タグ取得制御部
11e’ タグ一括取得制御部
12 保存部
13 記録部
18 提示部(モニタ)
18a 細胞画像表示画面
18b 活性度データ表示画面
18c タグ入力・表示画面
18d 指示ボタン
18d−1 変更指示ボタン
18d−2 保存指示ボタン
20 観察情報取得部
21 タグセット入力部
30 タグセット変更指示部
Claims (37)
- 1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための情報であって当該細胞の継代数を少なくとも含む細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報であって当該細胞に対する継代作業の有無を示す継代有無情報を含む情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグからなるタグセットを取得するタグ取得部と、
各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存部と、
を備えた細胞観察情報処理システムであって、
前記タグ取得部は、
第1の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第1の前記観察情報に対して付与すべき第1のタグセットの取得に際しては、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットの入力を受け付け、該受け付けたタグセットを第1のタグセットとして取得し、
第n(nは2以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第nの前記観察情報に対して付与すべき第nのタグセットの取得に際しては、第n−1の観察時点における第n−1の前記観察情報に付与された第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグ、第n−1の観察時点における第n−1の前記検索用タグ付き観察情報に含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞の活性度データを示すタグ、第nの前記観察情報に含まれる当該細胞の活性度データと第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグの少なくともいずれかに基づき、第nの前記観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む候補タグセットを自動的に取得又は生成し、該自動的に取得又は生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットを第nのタグセットとして取得し、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第nのタグセットとして取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、第n−1(nは2以上の整数)の前記検索用タグ、第n−1の前記検索用タグ付き観察情報、第nの前記観察情報の少なくともいずれかに基づき、第nの前記観察情報に付与すべき前記候補タグセットを自動的に取得又は生成する候補タグセット自動取得・生成部と、
前記候補タグセット自動取得・生成部により自動的に取得又は生成された前記候補タグセットを提示部に出力する候補タグセット出力部と、
前記提示部に表示されている前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付ける変更指示受付部と、
ユーザによるタグセットの入力を受け付ける入力タグセット受付部と、
前記候補タグセット自動取得・生成部、前記候補タグセット出力部、前記変更指示受付部、前記入力タグセット受付部の作動を制御するタグ取得制御部
を有し、
前記タグ取得制御部は、
第1の前記観察情報に対して付与すべき第1のタグセットの取得に際しては、前記入力タグセット受付部を作動させて、該入力タグセット受付部が受け付けたタグセットを第1のタグセットとして取得し、
第n(nは2以上の整数)の前記観察情報に対して付与すべき第nのタグセットの取得に際しては、前記候補タグセット自動取得・生成部を作動させて、第nの前記観察情報に付与すべき前記候補タグセットを自動的に取得又は生成させ、
前記候補タグセット出力部を作動させて、前記候補タグセットを前記提示部に出力させるとともに、前記変更指示受付部を作動させて、前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け可能とし、
前記変更指示受付部がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、前記入力タグセット受付部を作動させず、前記候補タグセット自動取得・生成部により自動的に取得又は生成された前記候補タグセットを第nのタグセットとして取得し、
前記変更指示受付部がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、前記入力タグセット受付部を作動させて、該入力タグセット受付部が受け付けた他のタグセットを第nのタグセットとして取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、第n(nは2以上の整数)以降の夫々の観察時点に対応して前記観察情報取得部を介して順次取得された夫々の前記観察情報に対して付与すべき夫々のタグセットの取得に際しては、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けるまで、ユーザによるタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットを夫々の観察時点のタグセットとして取得し続け、
前記保存部は、前記観察情報取得部により順次取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された夫々の観察時点のタグセットを検索用タグとして付与することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項3に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによるタグセットの入力を受け付け、該受け付けたタグセットを所定の観察時点のタグセットとして取得し、
前記保存部は、前記所定の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された所定の観察時点のタグセットを検索用タグとして付与することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、第n(nは2以上の整数)以降の観察時点に対応して前記観察情報取得部を介して順次取得された夫々の前記観察情報に対して付与すべき夫々のタグセットの取得に際し、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットを提示部に出力する候補タグセット出力部を備え、前記提示部により提示された前記候補タグセットを参照したユーザによる、該候補タグセットから他のタグセットへの変更についての指示を受け付けることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記保存部は、各観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して順次取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された夫々のタグセットを検索用タグとして順次付与し、該検索用タグを付与した夫々の検索用タグ付き観察情報を前記記録部に順次保存することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記保存部は、第n(nは2以上の整数)以降の複数の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された複数の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された夫々のタグセットを検索用タグとして一括して付与し、該検索用タグを付与した複数の検索用タグ付き観察情報を前記記録部に一括して保存することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項7に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、前記保存部が前記第n(nは2以上の整数)以降の複数の観察時点における複数の前記観察情報に対して夫々のタグセットを検索用タグとして一括して付与する前に、夫々の前記観察情報に付与すべき夫々のタグセットの候補となる複数の候補タグセットを提示部に一括して出力する、候補タグセット一括出力部を備え、前記提示部により一括提示された複数の前記候補タグセットを参照したユーザによる、所定の前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についての指示を受け付けることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグセットは、さらに、観察時点ごとの取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対し付与すべき検索用タグとして、ユーザによる入力の必要性が高い毎回入力タグを含み、
前記タグ取得部は、前記第nの観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された前記第nの前記観察情報に対して付与すべき前記第nのタグセットの取得に際して、ユーザによる前記毎回入力タグの入力を受け付け、該受け付けた前記毎回入力タグを前記第nのタグセットの一部として取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項9に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記毎回入力タグは、コメント情報を示すタグであることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項9に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグセットは、さらに、前記毎回入力タグと比較して、前記観察時点ごとの取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対し付与すべき検索用タグとして、ユーザによる入力の必要性が低い非毎回入力タグを含み、
前記タグ取得部は、前記第nの観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された前記第nの前記観察情報に対して付与すべき前記第nのタグセットの取得に際して、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる前記非毎回入力タグの入力を受け付けずに、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットに含まれる前記非毎回入力タグを前記第nのタグセットの一部として取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項11に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記非毎回入力タグは、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための情報であって当該細胞の継代数を少なくとも含む細胞識別情報を示すタグ又は前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグを含むことを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項12に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記細胞識別情報は、細胞名、細胞種、継代数又は親株もしくは子株であることを識別するための細胞レベル情報であることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、前記第n−1の観察時点の観察情報に付与された前記第n−1のタグセットを、前記候補タグセットとして自動的に取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも一つ以上のタグからなるタグセットを取得するタグ取得部と、
各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された前記タグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存部と、
を備えた細胞観察情報処理システムであって、
前記タグ取得部は、
第m(mは1以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部により取得された第mの観察情報に含まれる前記細胞の画像に基づき、第mの前記観察情報に付与すべき第mのタグセットの候補となる候補タグセットを自動的に生成し、該自動的に生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に生成した前記候補タグセットを第mのタグセットとして取得し、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第mのタグセットとして取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、第m(mは1以上の整数)の前記観察情報に含まれる前記細胞の画像に基づき、第mの前記観察情報に付与すべき第mのタグセットの候補となる候補タグセットを自動的に生成する候補タグセット自動取得・生成部と、
前記候補タグセット自動取得・生成部により自動的に生成された前記候補タグセットを提示部に出力する候補タグセット出力部と、
前記提示部に表示されている前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付ける変更指示受付部と、
ユーザによるタグセットの入力を受け付ける入力タグセット受付部と、
前記候補タグセット自動取得・生成部、前記候補タグセット出力部、前記変更指示受付部、前記入力タグセット受付部の作動を制御するタグ取得制御部
を有し、
前記タグ取得制御部は、
前記候補タグセット自動取得・生成部を作動させて、第mの前記観察情報に付与すべき前記候補タグセットを自動的に生成させ、
前記候補タグセット出力部を作動させて、前記候補タグセットを前記提示部に出力させるとともに、前記変更指示受付部を作動させて、前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け可能とし、
前記変更指示受付部がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、前記入力タグセット受付部を作動させず、前記候補タグセット自動取得・生成部により自動的に生成された前記候補タグセットを第mのタグセットとして取得し、
前記変更指示受付部がユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、前記入力タグセット受付部を作動させて、該入力タグセット受付部が受け付けた他のタグセットを第mのタグセットとして取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、夫々の観察時点に対応して前記観察情報取得部を介して順次取得された夫々の前記観察情報に対して付与すべき夫々のタグセットの取得に際しては、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けるまで、ユーザによるタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に生成した前記候補タグセットを夫々の観察時点のタグセットとして取得し続け、
前記保存部は、前記観察情報取得部により順次取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された夫々の観察時点のタグセットを検索用タグとして付与することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによるタグセットの入力を受け付け、該受け付けたタグセットを所定の観察時点のタグセットとして取得し、
前記保存部は、前記所定の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された所定の観察時点のタグセットを検索用タグとして付与することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、夫々の観察時点に対応して前記観察情報取得部を介して順次取得された夫々の前記観察情報に対して付与すべき夫々のタグセットの取得に際し、前記自動的に生成した前記候補タグセットを提示部に出力する候補タグセット出力部を備え、前記提示部により提示された前記候補タグセットを参照したユーザによる、該候補タグセットから他のタグセットへの変更についての指示を受け付けることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記保存部は、各観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して順次取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された夫々のタグセットを検索用タグとして順次付与し、該検索用タグを付与した夫々の検索用タグ付き観察情報を前記記録部に順次保存することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記保存部は、複数の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部により取得された複数の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された夫々のタグセットを検索用タグとして一括して付与し、前記検索用タグを付与した複数の検索用タグ付き観察情報を前記記録部に一括して保存することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項21に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部は、前記保存部が前記複数の観察時点における複数の前記観察情報に対して夫々のタグセットを検索用タグとして一括して付与する前に、夫々の前記観察情報に付与すべき夫々のタグセットの候補となる複数の候補タグセットを前記提示部に一括して出力する、候補タグセット一括出力部を備え、前記提示部により一括提示された複数の前記候補タグセットを参照したユーザによる、所定の前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についての指示を受け付けることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグセットは、さらに、観察時点ごとの取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対し付与すべき検索用タグとして、ユーザによる入力の必要性が高い毎回入力タグを含み、
前記タグ取得部は、前記第mの観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された前記第mの前記観察情報に対して付与すべき前記第mのタグセットの取得に際して、ユーザによる前記毎回入力タグの入力を受け付け、該受け付けた前記毎回入力タグを前記第nのタグセットの一部として取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項23に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記毎回入力タグは、コメント情報を示すタグであることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項23に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグセットは、さらに、前記毎回入力タグと比較して、前記観察時点ごとの取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対し付与すべき検索用タグとして、ユーザによる入力の必要性が低い非毎回入力タグを含み、
前記タグ取得部は、前記第mの観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された前記第mの前記観察情報に対して付与すべき前記第mのタグセットの取得に際して、ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる前記非毎回入力タグの入力を受け付けずに、前記自動的に生成した前記候補タグセットに含まれる前記非毎回入力タグを前記第mのタグセットの一部として取得することを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項25に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記非毎回入力タグは、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための細胞識別情報を示すタグ又は前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグを含むことを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項26に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記細胞識別情報は、細胞名、細胞種、継代数又は親株もしくは子株であることを識別するための細胞レベル情報であることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための情報であって当該細胞の継代数を少なくとも含む細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報であって当該細胞に対する継代作業の有無を示す継代有無情報を含む情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグからなるタグセットを取得するタグ取得段階と、
各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存段階と、
を備えた細胞情報観察処理方法であって、
前記タグ取得段階においては、
第1の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第1の前記観察情報に対して付与すべき第1のタグセットの取得に際しては、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットの入力を受け付け、該受け付けたタグセットを第1のタグセットとして取得し、
第n(nは2以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第nの前記観察情報に対して付与すべき第nのタグセットの取得に際しては、第n−1の観察時点における第n−1の前記観察情報に付与された第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグ、第n−1の観察時点における第n−1の前記検索用タグ付き観察情報に含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞の活性度データ、第nの前記観察情報に含まれる当該細胞の活性度データと第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグの少なくともいずれかに基づき、第nの前記観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む候補タグセットを自動的に取得又は生成し、該自動的に取得又は生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットを第nのタグセットとして取得し、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第nのタグセットとして取得することを特徴とする細胞情報観察処理方法。 - 1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも一つ以上のタグからなるタグセットを取得するタグ取得段階と、
各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された前記タグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存段階と、
を備えた細胞情報観察処理方法であって、
前記タグ取得段階においては、
第m(mは1以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部により取得された第mの観察情報に含まれる前記細胞の画像に基づき、第mの前記観察情報に付与すべき第mのタグセットの候補となる候補タグセットを自動的に生成し、該自動的に生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に生成した前記候補タグセットを第mのタグセットとして取得し、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第mのタグセットとして取得することを特徴とする細胞情報観察処理方法。 - コンピュータを、
1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための情報であって当該細胞の継代数を少なくとも含む細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報であって当該細胞に対する継代作業の有無を示す継代有無情報を含む情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグからなるタグセットを取得するタグ取得手段、
各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存手段、
として機能させるための細胞観察情報処理プログラムであって、
前記タグ取得手段は、
第1の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第1の前記観察情報に対して付与すべき第1のタグセットの取得に際しては、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含むタグセットの入力を受け付け、該受け付けたタグセットを第1のタグセットとして取得し、
第n(nは2以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された第nの前記観察情報に対して付与すべき第nのタグセットの取得に際しては、第n−1の観察時点における第n−1の前記検索用タグ付き観察情報に付与された第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグ、第n−1の観察時点における第n−1の前記検索用タグ付き観察情報に含まれる当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞の活性度データ、第nの前記観察情報に含まれる当該細胞の活性度データと第n−1の前記検索用タグに含まれる当該細胞の継代数を示すタグの少なくともいずれかに基づき、第nの前記観察情報に付与すべき第nのタグセットの候補となる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む候補タグセットを自動的に取得又は生成し、該自動的に取得又は生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に取得又は生成した前記候補タグセットを第nのタグセットとして取得し、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる当該細胞の継代数を示すタグ又は当該細胞の継代数を示すタグと当該細胞に対する継代有無情報を示すタグを含む他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第nのタグセットとして取得することを特徴とする細胞観察情報処理プログラム。 - コンピュータを、
1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像、細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データ、観察名を含む細胞の観察結果を示す観察情報に付与すべき検索用タグであって、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を検索することで所望の観察情報を得るための検索用タグとして、前記観察情報における観察対象となっている細胞の観察を行うユーザを識別するためのユーザ識別情報を示すタグ、前記観察情報における観察対象となっている細胞を識別するための細胞識別情報を示すタグ、前記観察情報を取得した日時を識別するための日時情報を示すタグ、前記ユーザによる前記観察情報における観察対象となっている細胞のメンテナンスのための作業に関する情報を示すタグ、前記観察情報を取得するために用いた装置を識別するための装置識別情報を示すタグ、複数時点での前記観察情報に含まれる細胞の活性度データの変化量である活性度データの変化情報を示すタグ及び前記観察情報に含まれる細胞画像を示すための画像タグのうちの少なくとも一つ以上のタグからなるタグセットを取得するタグ取得手段、
各時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部を介して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された前記タグセットを検索用タグとして付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存手段、
として機能させるための細胞情報観察処理プログラムであって、
前記タグ取得手段は、
第m(mは1以上の整数)の観察時点での取得指示に対応して前記観察情報取得部により取得された第mの観察情報に含まれる前記細胞の画像に基づき、第mの前記観察情報に付与すべき第mのタグセットの候補となる候補タグセットを自動的に生成し、該自動的に生成した前記候補タグセットから他のタグセットへの変更についてのユーザによる指示を受け付け、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けないときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付けずに、前記自動的に生成した前記候補タグセットを第mのタグセットとして取得し、
ユーザによる他のタグセットへの変更をすべきである旨の指示を受けたときには、ユーザによる他のタグセットの入力を受け付け、該受け付けた他のタグセットを第mのタグセットとして取得することを特徴とする細胞情報観察処理プログラム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記記録部は、1以上の前記検索用タグ付き観察情報のレコードを有し、
夫々の前記レコードは、各観察時点での細胞画像の撮像に対応して作成され、
1時点での細胞画像の撮像に対応する1つの観察情報と、前記観察情報を検索するための前記検索用タグとが互いに関連付けられていることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記記録部は、1以上の前記検索用タグ付き観察情報のレコードを有し、
夫々の前記レコードは、各観察時点での細胞画像の撮像に対応して作成され、
1時点での細胞画像の撮像に対応する1つの観察情報と、前記観察情報を検索するための前記検索用タグとが互いに関連付けられていることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
複数の装置を備え、
前記複数の装置が、前記タグ取得部および前記保存部を、分散して設けていることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
複数の装置を備え、
前記複数の装置が、前記タグ取得部および前記保存部を、分散して設けていることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項1に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部により取得された前記第nのタグセットを提示部に出力するタグセット出力部と、
前記タグセット出力部により出力された前記第nのタグセットをユーザに提示する提示部と、
をさらに備えることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 請求項15に記載の細胞観察情報処理システムにおいて、
前記タグ取得部により取得された前記第mのタグセットを提示部に出力するタグセット出力部と、
前記タグセット出力部により出力された前記第mのタグセットをユーザに提示する提示部と、
をさらに備えることを特徴とする細胞観察情報処理システム。
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