JP6385956B2 - 生体試料の液滴から標的物質を分離するための装置および方法 - Google Patents

生体試料の液滴から標的物質を分離するための装置および方法 Download PDF

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Description

政府援助に対する参照:本発明は、ARMY/MRMCによって授与されたW81XWH−9−1−0192の下、米国政府支援によってなされた。米国政府は、本発明において一定の権利を有する。
本発明は、生体試料の調製に関し、具体的には、生体試料から標的分画を抽出するための装置および方法に関する。
複合生体試料からDNA、RNA、およびタンパク質を分離するための方法は、分子生物学における最も重要なステップの一部である。しかし、これらの方法は、しばしば、生体試料処理の作業流れの中で見過ごされる。下流側での分析技術の処理能力が向上するにつれて、試料調製方法は、全体処理能力における阻害因子となってきている。試料調製に最も使用される方法の多くは、非常に時間がかかり、基質結合、複数の洗浄ステップ、希釈、または試料の損失や検定時間における劇的な増大の結果となり得る他のプロセスを含む多くのステップを含み得る。
官能性常磁性粒子(PMP)を使用して対象の検体を分離する能力は、さまざまなプラットフォームにわたって分離方法の有用性を拡張させてきた。PMPの利点の1つは、作動および検体分離に必要とされるのは磁石のみであるため、粒子が、数多くのシステム構成内で使用できる柔軟性を有することである。対象の検体を所与の試料から分離する方法は、さらに、2つの基本的な方法に分割され得る。第1に、PMPを用いるための現在の主な方法では、PMPは、流体が基質上に流されてバックグラウンドの試料およびあらゆる汚染物質を除去する間、固定して保たれる。この広く使用される方法の限界は、元の投与試料の損失を含み、それによって1つの試料につき1回の効果的な分離しか可能にせず、また、希釈による試料の調製技術の非効率性を含み、それによって汚染物質を効果的に除去するために複数の洗浄を必要とし、作業の流れの長期化をまねく。第2に、近年の研究は、排除による方法を用いて対象の元の試料からPMPを除去する能力を実証した。これらの方法は、一般に、重力または表面張力の支配を微少規模で活用して元の試料を配置し、装置の表面に沿ってPMPを物理的に投与試料から引きずり出し、何らかの不混和相(たとえば空気または油)を通して第2の水相に入れる。これらの方法は、高い特異性および選択性で検体を分離する上で極めて効果的である。さらに、これらの方法は、分離がまたたく間に実行され得るため、それらの簡潔明快な作業流れに有益である。効果的であるけれども、これらの方法の問題は、これらの技術の製作および使用の両方をより大きく複雑化する可能性がある不混和流体(油)を必要とすること、および試料の摩擦による損失を結果として生じさせる、表面に沿って粒子を「引きずり出す」機能にある。
したがって、本発明の主な目的および特徴は、生体試料から標的分画を抽出するための装置および方法を提供することである。
本発明の別の目的および特徴は、製作および実施が簡単である、生体試料から標的分画を抽出するための装置および方法を提供することである。
本発明のさらに別の目的および特徴は、従来の装置/方法の標的分画の摩擦による損失を低減する、生体試料から標的分画を抽出するための装置および方法を提供することである。
本発明によれば、生体試料の液滴から標的物質を分離するための装置が提供される。標的物質は固相基質に結合されて、標的結合された固相基質を形成する。本装置は、複数の領域を有する上側表面を備えた下側プレートを含む。生体試料の液滴は、複数の領域の第1の部分上に受け入れ可能である。上側プレートは、下側プレートの上側表面に向けられ、その第1の部分上に受け入れられた生体試料の液滴に接触する間隔をあけて配置された下側表面を有する。上側プレートに隣接する力は、標的結合された固相基質を上側プレートの下側表面に向かって引き付ける。上側プレートおよび下側プレートの少なくとも1つは、生体試料の液滴内の標的結合された固相基質が力によって上側プレートの下側表面に引き寄せされる第1の位置から、標的結合された固相基質が力によって上側プレートの下側表面に隣接して引き寄せられ生体試料の液滴から分離される第2の位置平面に沿って移動可能である。
下側プレートの領域は親水性であり、下側プレートのこの領域の外側の上側表面の部分は、疎水性である。上側プレートの下側表面もまた、疎水性である。上側プレートは、第1の位置と第2の位置の間で軸方向に移動可能であり、または第1の位置と第2の位置の間で回転式に移動可能である。下側プレートの上側表面および上側プレートの下側表面は、所定の距離だけ離間される。
本発明の別の態様によれば、生体試料の液滴から標的物質を分離するための方法が提供される。標的物質は固相基質に結合されて、標的結合された固相基質を形成する。本方法は、生体試料の液滴を下側プレートの上側表面の第1の領域に提供するステップと、上側プレートを下側プレートに対してその第の領域に提供された生体試料の液滴に接触する間隔をあけて配置するステップとを含む。上側プレートは、下側プレートの上側表面に向けられた下側表面を有する。標的結合された固相基質は、力によって上側プレートの下側表面に向かって引き寄せられる。標的結合された固相基質は、力によって上側プレートの下側表面に隣接して保持される。上側プレートおよび下側プレートの少なくとも1つは、生体試料の液滴内の標的結合された固相基質が力によって上側プレートの下側表面に隣接して保持される第1の位置から、標的結合された固相基質が力によって上側プレートの下側表面に隣接して保持され生体試料の液滴から分離される第2の位置まで平面に沿って移移動される。本態様においては、第1の領域から離間した、下側プレートの上側表面の第2の領域に流体を提供するステップを含んでもよい。生体試料の液滴から分離された標的結合された固相基質は、下側プレートの上側表面の第2の領域で流体と混合される。
下側プレートの上側表面は、親水性である複数の領域を含むことができる。この領域の外側の下側表面の上側表面は、疎水性である。下側プレートの上側表面の第1の領域は親水性である。第1の領域は下側プレートの上側表面の複数の領域の1つである。第2の領域は下側プレートの上側表面の複数の領域の1つである。下側プレートの上側表面は複数の領域の外側の部分を有する。上側プレートの下側表面は、疎水性である。上側プレートは、長手方向軸に沿って第1の位置と第2の位置の間を移動し、または第1の位置と第2の位置の間で回転可能である。下側プレートの上側表面および上側表面の下側表面を所定の距離だけ離間させることが、企図される。
本発明のさらに別の態様によれば、生体試料の液滴から標的物質を分離するための方法が提供される。標的物質は固相基質に結合されて、標的結合された固相基質を形成する。本方法は、生体試料の液滴を第1のプレートの表面の第1の領域に提供するステップを含む。流体が、第1のプレートの表面の第2の領域上に載せられる。第2の領域は、流体が第1のプレートの表面に沿って生体試料の液滴から隔てられるよう、第1の領域から離間されている。第2のプレートは、第1のプレートに対してその第の領域上に載せられた生体試料の液滴に接触する間隔をあけて配置される。第2のプレートは、第1のプレートの表面に向かって向けられた疎水性表面を有する。標的結合された固相基質は、力によって第2のプレートの表面に向かって引き寄せられる。標的結合された固相基質は、力によって第2のプレートの表面に隣接して保持される。第1のプレートおよび第2のプレートの少なくとも1つは、生体試料の液滴内の標的結合された固相基質が力によって第2のプレートの表面に隣接して保持される第1の位置から、標的結合された固相基質が力によって第2のプレートの表面に隣接して保持され生体試料の液滴から分離される第2の位置まで平面に沿って移動される。
第1および第2の領域の外側の第1のプレートの表面の一部分は、疎水性である。第2のプレートは、長手方向軸に沿って第1の位置と第2の位置の間を移動し、または第1の位置と第2の位置の間で回転可能である。第2のプレートの表面は、第1のプレートの表面から所定の距離だけ離間される。力が磁気性のものであり、標的結合された固相基質は、第1のプレートおよび第2のプレートの少なくとも1つが第2の位置にある状態で、流体内に受け入れられることが意図される。本方法はまた、標的結合された固相基質を力から分離するステップを含むこともできる。
本明細書の添付の図は、本発明の好ましい構造を例示するものであり、上記の利点および特徴、ならびに例示された実施形態の以下の説明から容易に理解される他のものが、明確に例示される。
初期構成にある本発明による装置の断面図である。 第2の構成にある本発明による装置の断面図である。 第3の構成にある本発明の装置の断面図である。 第4の構成にある本発明の装置の等角図である。 第5の構成にある本発明の装置の断面図である。 第6の構成にある本発明の装置の断面図である。 第7の構成にある本発明の装置の断面図である。 第3の構成にある本発明の装置の上部平面図である。 作動中の本発明の装置の一部分を示す拡大された断面図である。 初期構成にある、本発明による装置の代替の実施形態の等角図である。 第2の構成にある図4の装置の等角図である。 第3の構成にある第4の装置の等角図である。 図5の線7−7に沿って切り取られた装置の断面図である。 初期構成にある、本発明による装置のさらに別の実施形態の断面図である。 第2の構成にある、本発明による装置の断面図である。 第3の構成にある、本発明による装置の断面図である。
図1〜3には、本発明による、培養細胞、組織試料および他の生体物質を含む複合生体試料から、DNA、RNA、およびタンパク質などの標的分画を抽出し精製するための装置および方法が、参照番号10によって示されている。装置10は、上側表面16および下側表面18を有する下側の第1のプレート14を含む。下記に説明されない限り、下側プレート14の上側表面16は、疎水性である。第1のプレート14の上側表面16は、縁22によって画定された第1の領域20を含み、それにより、第1の領域20は、略円形の構成を有する。しかし、他の構成が、本発明の範囲内にあるように企図される。第1の領域20は、選択された流体をこの上に空間的に保持することが意図され、これは下記に説明される。例として、第1の領域20は親水性であることが企図される。あるいは、第1の領域20は、1)さまざまな外形構成を利用することができ、2)第1のプレート14の上側表面16内にウエルの形態をとることができ、または3)第1の領域20の周囲に延びる、選択された流体をこの上に空間的に保持するための壁を含むことができることが理解され得る。
第1のプレート14の上側表面16は、さらに、それぞれ縁28および30によって画定された、第2の領域24および第3の領域26を含むことができ、それにより、第2の領域24および第3の領域26は、それぞれ、略円形の構成を有する。しかし、他の構成が、本発明の範囲内に入るように企図される。第2の領域24および第3の領域26それぞれは、選択された流体をこれらの上に空間的に保持することが意図され、これは、下記に説明される。例として、第2の領域24および第3の領域26それぞれは、親水性であることが企図される。あるいは、第2の領域24および第3の領域26それぞれが、1)さまざまな外形構成を利用することができ、2)第1のプレート14の上側表面16内にウエルの形態をとることができ、または3)第2の領域24および第3の領域26の周囲に延びる、選択された流体をこれらの上に空間的に保持するための壁を含むことができることが理解され得る。さらに、第1の領域20、第2の領域24、および第3の領域26それぞれの外側の第1のプレート14の上側表面16の部分は、疎水性領域32を画定する。
装置10はさらに、上側表面42および下側表面44それぞれを有する上側の第2のプレート40を含む。下記に説明されない限り、第2のプレート40の下側表面44は、疎水性である。磁石46が、第2のプレート40の上側表面42によって支持される。磁石46は、磁石が第2のプレート40の上側表面42に隣接する第1の位置と、第2のプレート40の上側表面42から軸方向に離間された第2の位置との間で軸方向に移動可能であることが企図され、その理由は下記に説明される。
装置10を利用して、生体試料36からDNA、RNA、タンパク質、全細胞、および/またはそのようなものの標的分画を抽出することが意図される。知られているように、生体試料36は、溶解物、体液、法医学試料、および/または生体汚染などの望ましくない物質38を含み得る。分画の抽出のための生体試料36を調製するために、適切な試薬が、生体試料36に加えられ、分画が試薬内の固相基質と結合して分画結合された固相基質38を形成するように混合される。固相基質が、対応する力に引き付けられることが企図される。たとえば、固相基質は、対応する磁場に引き付けられる常磁性体でよい。重力、光学力、超音波作動力またはそのようなものなどの他の非磁気的機構が、本発明の範囲内にあるように企図される。
試薬と混合された後、生体試料36の液滴33が、第1の領域20上に、マイクロピペットまたはそのようなものなどの任意の従来の手法で載せられる。あるいは、生体試料36が第1の領域20内に流れることを可能にするために第1の領域20と連通する出口を有するチャネルを第1のプレート14内に設けることが、企図される。加えて、第1の試薬(たとえば、洗浄液、二次抗体など)の液滴35が、第2の領域24上に載せられ、第2の試薬の液滴37が、第3の領域26上に載せられる。液滴33、35、および37の体積はほぼ等しくなることが企図される。第1の領域20、第2の領域24、および第3の領域26それぞれの親水性質は、これらの上に液滴33、35、および37をとどめるように作用することが理解され得る。加えて、第1のプレート14の上側表面16の疎水性領域32は、さらに、液滴33、35および37を、第1の領域20、第2の領域24、および第3の領域26それぞれの上に保持するように作用する。
液滴33、35および37を第1の領域20、第2の領域24、および第3の領域26それぞれの上に載せた後、この下側表面44が、液滴33、35、および37に近接近するまたはこれと接触するように、また、磁石46が、第1のプレート14の上側表面16の第1の領域20と軸方向に位置合わせされるように、第2のプレート40が配置される(図1A)。第2のプレート40の下側表面44は、第1のプレート14の上側表面16から所定の距離を離して維持され、それにより、液滴33、35および37は、この略円筒状の形状を維持し、潰されない。
上述したように、第2のプレート40が配置された状態で、磁石46は、第2のプレート40の上側表面42に隣接して配置され、分画結合された固相基質38を磁気的に引き付け、それにより、分画結合された固相基質38は、第2のプレート40の下側表面44に向かって引き寄せられる(図1B)。液滴33内のあらゆる望ましくない(結合されていない)材料が、第1のプレート14の上側表面16に向かって自由に降下する。その後、第1のプレート14を固定状態にしたまま、第2のプレート40は、軸方向に向けて第1の方向に移動される(図1C)。第2のプレート40の下側表面44の疎水性質は、第2のプレート40が液滴33、35、および37に接着することを防止し、それによって、液滴33、35および37が、第2のプレート40が軸方向に移動されるときにこれらの完全性を維持することを確実にする。第2のプレート40が移動されるとき、磁石46は、分画結合された固相基質38を第2のプレート40の下側表面44に引き付けて保持し、それによって、分画結合された固相基質38が、液滴33の外側周囲に到達したときに液滴33の表面張力を破ることを可能にする。第2のプレート40は、引き続き第1の方向に移動され、それにより、磁石46は、第1のプレート14の上側表面16の第2の領域24と軸方向に位置合わせされる(図1D)。分画結合された固相基質38は、磁石46を第2のプレート40の上側表面42から離して軸方向に移動させるだけで、第2の領域24上の液滴35内に沈殿されてよく(図1E)、それによって分画結合された固相基質38を磁石46の磁気力から自由にする。分画結合された固相基質38のすべてが、液滴35内に保持されることを確実にするために、第1のプレート14、すなわち磁石46は、磁石46を第2のプレート40の上側表面42から離すように軸方向に移動させる前に、液滴35を過ぎるようにスライド移動される。より詳細には、第1のプレート14および第2のプレート40の相対移動は、液滴35内にクエット流れを引き起こし、それにより、液滴35はそれ自体内で混ざる(図3)。加えて、液滴35の後端39の表面張力が、分画結合された固相基質38を第2のプレート40の疎水性の下側表面44から引き離す。
分画結合された固相基質38を液滴37内に移動させるために、磁石46が、第1のプレート14の上側表面16の第2の領域24と軸方向に位置合わせして、第2のプレート40の上側表面42に隣接して再配置される。上述したように、磁石46が再配置された状態で、磁石46は、分画結合された固相基質38を磁気的に引き付け、それにより、分画結合された固相基質38は、第2のプレート40の下側表面44に向かって引き寄せられる(図1D)。第1のプレート14を固定状態にしたまま、第2のプレート40は、軸方向に向けて第1の方向に移動される。第2のプレート40が移動されるとき、磁石46は、分画結合された固相基質38を第2のプレート40の下側表面44に引き付けて保持し、それによって、分画結合された固相基質38が、液滴35の外側周囲に到達したときに液滴35の表面張力を破ることを可能にする。第2のプレート40は、引き続き第1の方向に移動され、それにより、磁石46は、第1のプレート14の上側表面16の第3の領域26と軸方向に位置合わせされる(図1F)。磁石46が第1のプレート14の上側表面16の第3の領域26と軸方向に位置合わせされた状態で、磁石46は、第2のプレート40の上側表面42から離れて軸方向に移動され(図1G)、それによって分画結合された固相基質38を第3の領域26上の液滴37内で自由にする。説明されたように、分画結合された固相基質38は、次いで、受動的に液滴37内に混合させられる。分画結合された固相基質38のビードすべてが、液滴37内に保持されることを確実にするために、第1のプレート14、すなわち磁石46は、磁石46を第2のプレート40の上側表面42から離すように軸方向に移動させる前に、液滴37を過ぎるようにスライド移動される。より詳細には、第1のプレート14および第2のプレート40の相対移動は、液滴37内にクエット流れを引き起こし、それにより、液滴37はそれ自体内で混ざる。加えて、液滴37の後端の表面張力が、分画結合された固相基質38を第2のプレート40の疎水性の下側表面44から引き離す。
装置10の上記の説明は、本発明の例にすぎないことが理解され得る。装置10に対するさまざまな改変が、本発明の範囲から逸脱することなく可能である。例として、第1のプレート14が、第2のプレート40に対して軸方向に移動可能であることが企図され、第1のプレートのそのような移動(または第1のプレート14および第2のプレート40それぞれの移動の組み合わせ)の結果、液滴33、35、および37は、磁石46と位置合わせされ、その理由は上述されている。さらに、ユーザが、分画結合された固相基質38の追加の洗浄などの、追加の(またはより少ない)処理ステップを分画結合された固相基質38上にもたらすことを可能にするために、第1のプレート14の上側表面16上に追加の(またはより少ない)親水性領域を提供することが企図される。さらに、第1のプレート14の上側表面16は、親水性領域の配列を含むことができ、磁石の対応する配列が、第2のプレート40上に支持され得る。その結果、本発明の方法論による複数の抽出作動が、単一の装置10を利用することで同時に行われ得る。そのような配置では、親水性領域の各々の「セット」を配列内の他のセットから効果的に分離するために親水性領域の各々の「セット」の周りに壁またはフェンスを提供することが企図され、それによってセット間の潜在的な二次汚染を防止する。代替の実施形態では、磁石46を第2のプレート40に永久的に固着させることが企図される。したがって、磁石46を第2のプレート40の上側表面42から離して軸方向に移動させて分画結合された固相基質38を対応する液滴内に解放する代わりに、第2のプレートは、液滴との接触から取り外されるだけでよい。第2のプレート40が液滴から係合解除された状態で、分画結合された固相基質38は、所望の液滴内に受動的に混合させられる。第2のプレート40の下側表面44は疎水性であるため、液滴は、これに接着せず、したがって液滴がこれらの完全性を維持することを可能にすることが留意される。
図4〜7には、本発明による装置の代替的実施形態が、参照番号60によって示されている。装置60は、上側表面74および下側表面76を有する下側の第1のプレート72を含む。第1のプレート72は、中心と、直径と、外側縁78によって画定された略円形の構成とを有する。支持体79が、第2のプレート104をこの上で回転式に支持するために第1のプレート72の中心から離れて軸方向に延びる。下記に説明されない限り、第1のプレート72の上側表面74は疎水性である。第1のプレート72の上側表面74は、縁82によって画定された第1の領域80を含み、それにより、第1の領域80は、略円形の構成を有する。第1の領域80の中心は、第1のプレート72の中心88から所定の径方向距離にある。第1の領域80は、選択された流体をこの上に空間的に保持することが意図され、これは下記に説明される。例として、第1の領域80が親水性であることが企図される。あるいは、第1の領域80は、1)さまざまな外形構成を利用することができ、2)第1のプレート72の上側表面74内にウエルの形態をとることができ、または3)第1の領域80の周囲に延びる、選択された流体をこの上に空間的に保持するための壁を含むことができることが理解され得る。
第1のプレート72の上側表面74は、さらに、それぞれ縁94および96によって画定された、第2の領域90および第3の領域92を含むことができ、それにより、第2の領域90および第3の領域92それぞれは、略円形の構成を有する。第2の領域90および第3の領域92それぞれの中心は、第1のプレート72の中心88から、所定の径方向距離だけ離間される。第2の領域90および第3の領域92それぞれは、選択された流体をこれらの上に空間的に保持することが意図され、これは下記に説明される。例として、第2の領域90および第3の領域92それぞれは親水性であることが企図される。あるいは、第2の領域90および第3の領域92それぞれは、1)さまざまな外形構成を利用することができ、2)第1のプレート72の上側表面74内にウエルの形態をとることができ、または3)第2の領域90および第3の領域92の周囲に延びる、選択された流体をこれらの上に空間的に保持するための壁を含むことができることが理解され得る。第1の領域80、第2の領域90、および第3の領域92それぞれの外側の第1のプレート72の上側表面74の部分は、疎水性領域102を画定する。
第2のプレート104は、中心と、第1のプレート72の直径とほぼ等しい直径と、上側表面106および下側表面108とを有する。上側の第2のプレート104は、第1のプレート72に対して離間されて支持体79によって回転可能に支持され、それにより、第2のプレート104の中心は、第1のプレート72の中心と軸方向に位置合わせされる。第2のプレート104の下側表面108は、疎水性である。磁石110が、第2のプレートの中心から所定の径方向距離だけ径方向に離間された場所に、第2のプレート104の上側表面106によって支持される。磁石110は、磁石110が第2のプレート104の上側表面106に隣接する第1の位置と、第2のプレート104の上側表面106から軸方向に離間された第2の位置との間で軸方向に移動可能であり、その理由は下記に説明される。
生体試料36から標的分画を抽出するために、生体試料36の液滴112が、第1の領域80上に、マイクロピペット113またはそのようなものなどの任意の従来の手法で載せられる(図4)。あるいは、生体試料36が第1の領域80内に流されることを可能にするために第1の領域80と連通する出力部を有するチャネルを第1のプレート72内に設けることが企図される。加えて、第1の試薬(たとえば、洗浄液、二次抗体など)の液滴114が、第2の領域90上に載せられ、第2の試薬の液滴116が、第3の領域92上に載せられる。液滴112、114および116の体積はほぼ等しくなることが企図される。この下側表面108が、液滴112、114、および116に近接近するまたはこれと接触するように、また、磁石110が、第1のプレート72の上側表面74の第1の領域80と軸方向に位置合わせされるように、第2のプレート104が配置される。第2のプレート104の下側表面108は、支持体79によって第1のプレート72の上側表面74から所定の距離を離して維持され、それにより、液滴112、114および116は、これらの略円筒状の形状を維持し、潰されない。
上述したように第2のプレート104が配置された状態で、磁石110は、分画結合された固相基質38を磁気的に引き付け、それにより、分画結合された固相基質38は、第2のプレート104の下側表面108に向かって引き寄せられる。第1のプレート72を固定状態にしたまま、第2のプレート104は、軸方向に第1の方向に回転される(図5および7)。第2のプレート104が移動されるとき、磁石110は、分画結合された固相基質38を第2のプレート104の下側表面108に引き付けて保持し、それによって、分画結合された固相基質38が、液滴112の外側周囲に到達したときに液滴112の表面張力を破ることを可能にする。第2のプレート104は、引き続き第1の方向に移動され、それにより、磁石110は、第1のプレート72の上側表面74の第2の領域90と軸方向に位置合わせされる。分画結合された固相基質38は、磁石110を第2のプレート104の上側表面74から離すように軸方向に移動させるだけで、第2の領域90上の液滴114内に沈殿され得る。分画結合された固相基質38のすべてが、液滴114内に保持されることを確実にするために、第2のプレート104、すなわち磁石110は、磁石110を第2のプレート104の上側表面106から離すように軸方向に移動させる前に、液滴114を過ぎるようにスライド移動される。より詳細には、第1のプレート72および第2のプレート104の相対移動は、液滴114内にクエット流れを引き起こし、それにより、液滴114はそれ自体内で混ざる。加えて、液滴114の後端の表面張力は、分画結合された固相基質38を第2のプレート104の疎水性の下側表面108から引き離す。
分画結合された固相基質38を液滴116内に移動させるために、磁石110は、第1のプレート72の上側表面74の第2の領域90と軸方向に位置合わせして、第2のプレート104の上側表面106に隣接して再配置される。上述したように、磁石110が再配置された状態で、磁石110は、分画結合された固相基質38を磁気的に引き付け、それにより、分画結合された固相基質38は、第2のプレート104の下側表面108に向かって引き寄せられる。第1のプレート72を固定状態にしたまま、第2のプレート104は、第1の方向に回転される。第2のプレート104が移動されるとき、磁石110は、分画結合された固相基質38を第2のプレート104の下側表面108に引き付けて保持し、それによって、分画結合された固相基質38が、液滴114の外側周囲に到達したときに液滴114の表面張力を破ることを可能にする。第2のプレート104は、引き続き第1の方向に移動され、それにより、磁石110は、第1のプレート72の上側表面74の第3の領域92と軸方向に位置合わせされる。磁石110が第1のプレート104の上側方面106の第3の領域92と軸方向に位置合わせされた状態で、磁石110は、第2のプレート104の上側表面106から離れて軸方向に移動され、それによって分画結合された固相基質38を第3の領域92上の液滴116内に沈殿する。上述したように、分画結合された固相基質38は、次いで、受動的に液滴116内に混合させられる。液滴116は、マイクロピペット139などによって(図6)、さらなる処理のために取り外され得る。
装置60の上記の説明は、本発明の例にすぎないことが理解され得る。装置60に対するさまざまな改変が、本発明の範囲から逸脱することなく可能である。例として、第1のプレート72が、第2のプレート104に対して移動可能であることが企図され、第1のプレート72のそのような移動(または第1のプレート72および第2のプレート104それぞれの移動の組み合わせ)の結果、液滴112、114、および116は、磁石46と位置合わせされ、その理由は上述されている。さらに、ユーザが、分画結合された固相基質38の追加の洗浄などの、追加の(またはより少ない)処理ステップを分画結合された固相基質38上にもたらすことを可能にするために、第1のプレート72の上側表面74上に追加の(またはより少ない)親水性領域を設けることが企図される。さらに、第1のプレート72の上側表面74は、この上に円周上に離間された親水性領域の配列と、第2のプレート104上に支持される磁石の対応する配列とを含むことができる。その結果、本発明の方法論による複数の抽出作動は、単一の装置60を利用することで同時に行われ得る。そのような配置では、親水性領域の各々の「セット」を配列内の他のセットから効果的に分離するために親水性領域の各々の「セット」の周りに壁またはフェンスを設けることが企図され、それによってセット間の潜在的な二次汚染を防止する。代替の実施形態では、磁石110を第2のプレート104に永久的に固着させることが企図される。したがって、磁石110を第2のプレート104の上側表面106から離すように軸方向に移動させて分画結合された固相基質38を対応する液滴内に解放する代わりに、第2のプレート104は、液滴との接触から取り外されるだけである。第2のプレート104が液滴から係合解除された状態で、分画結合された固相基質38は、所望の液滴内に受動的に混合させられる。第2のプレート104の下側表面108は疎水性であるため、液滴は、これに接着せず、したがって液滴がこれらの完全性を維持することを可能にすることが留意される。
図8〜10には、本発明による装置のさらに別の実施形態が、参照番号120によって示されている。装置120は、上側表面126および下側表面128を有する下側の第1のプレート124を含む。下記に説明されない限り、下側プレート124の上側表面126は疎水性である。第1のプレート124の上側表面126は、縁132によって画定された第1の領域130を含み、それにより、第1の領域130は、略円形の構成を有する。しかし、他の構成が、本発明の範囲内にあるように企図される。第1の領域130は、選択された流体をこの上に空間的に保持することが意図され、これは下記に説明される。例として、第1の領域130は親水性であることが企図される。あるいは、第1の領域130は、1)さまざまな外形構成を利用することができ、2)第1のプレート124の上側表面126内にウエルの形態をとることができ、または3)第1の領域130の周囲に延びる、選択された流体をこの上に空間的に保持するための壁を含むことができることが理解され得る。
第1のプレート124の上側表面126は、さらに、対応する縁138によって画定された第2の領域134を含むことができ、それにより、第2の領域134は、略円形の構成を有する。しかし、他の構成が、本発明の範囲内に入るように企図される。第2の領域134は、選択された流体をこの上に空間的に保持することが意図され、これは、下記に説明される。例として、第2の領域134は、親水性であることが企図される。あるいは、第2の領域134は、1)さまざまな外形構成を利用することができ、2)第1のプレート124の上側表面126内にウエルの形態をとることができ、3)第2の領域134の周囲に延びる、選択された流体をこの上に空間的に保持するための壁を含むことができることが理解され得る。上述された理由のため、本発明の範囲から逸脱することなく、追加の親水領域が、第1のプレート124の上側表面126上に提供され得る。第1の領域130および第2の領域134それぞれの外側の第1のプレート124の上側表面126の部分は、疎水性領域136を画定する。
装置120は、さらに、上側プレートまたはスライド140を含み、上側プレートまたはスライド140は、第1のプレート124の上側表面126に対してほぼ垂直な長手方向軸に沿って延び、上側表面142と、略凸状の下側表面144と、これらの間の外面146とによって画定される。スライド140の外面146は、略円形の縁148においてスライド140の下側表面144と交わる。縁148は、本発明の範囲から逸脱することなく他の構成を有することができることが理解され得る。スライド140は、さらに、この下側表面144の全体および重複縁148を覆う疎水性テープ150を含む。テープ150は、スライド140の下側表面144を疎水性にするが、その理由は下記に説明される。スライド140は、さらに、スライド140の長手方向軸に沿って、上側表面142から下側表面144に向かって延びる磁石受け入れ通路152を含む。通路152は、スライド140の下側表面144に近接近する端部表面154において終端する。通路152は、磁石156をこの中に摺動式に受け入れるように適合される。磁石156は、磁石156が端部表面154に隣接する第1の位置と、端部表面154から軸方向に離間された第2の位置との間で軸方向に移動可能であることが意図され、その理由は、下記に説明される。磁石156は、通路152と共に第1の位置と第2の位置の間を、機械的手段、真空、磁気力またはそのようなものなどによって任意の従来のやり方で移動され得る。
生体試料36から標的分画を抽出するために、生体試料36の液滴160が、第1の領域130上に、マイクロピペットまたはそのようなものなどの任意の従来の手法で載せられる。加えて、所望の試薬の液滴162が、第2の領域134上に載せられる。液滴160および162の体積はほぼ等しくなることが企図される。スライド140は、この下側表面144上のテープ150が、液滴160および162に近接近するまたはこれと接触するように、また、第1の位置にある磁石156が、第1のプレート124の上側表面126の第1の領域130と軸方向に位置合わせされるように配置される。スライド140の下側表面144、すなわちテープ150は、第1のプレート124の上側表面126から所定の距離を離して維持され、それにより、液滴160および162は、これらの略円筒状の形状を維持し、潰されない(図8)。
上述したようにスライド140が配置された状態で、磁石156は、分画結合された固相基質38を磁気的に引き付け、それにより、分画結合された固相基質38は、スライド140の下側表面144に向かって引き寄せられる。第1のプレート124を固定状態にしたまま、スライド140は、軸方向に第1の方向に移動される(図9)。スライド140が移動されるとき、磁石156は、分画結合された固相基質38をテープ150、すなわちスライドの下側表面144に引き付けて保持し、それによって、分画結合された固相基質38が、液滴160の外側周囲に到達したときに液滴160の表面張力を破ることを可能にする。スライド140は、引き続き第1の方向に移動され、それにより、磁石156は、第1のプレート124の上側表面126の第2の領域134と軸方向に位置合わせされる(図10)。分画結合された固相基質38は、磁石156を端部表面154から離してスライド140の上側表面142に向かって移動させるだけで、第2の領域134上の液滴162内に沈殿され得る。分画結合された固相基質38のすべてが、液滴162内に保持されることを確実にするために、スライド140、すなわち磁石156は、磁石156を端部表面154から離して軸方向に移動させる前に、液滴162を過ぎるように軸方向にスライド移動され得る。より詳細には、第1のプレート124およびスライドの相対移動は、液滴162内にクエット流れを引き起こし、それにより、液滴162はそれ自体内で混ざる。加えて、液滴162の後端の表面張力が、分画結合された固相基質38をスライド140の下側表面144上の疎水性テープ150から引き離す。
さらに、第2の領域134の下方の、第1のプレート124の下側表面128に隣接する場所に、磁石156と反対の極性を有して配向された第2の磁石166を設けることが企図される。したがって、上述した、分画結合された固相基質38の液滴162の解放時、分画結合された固相基質38は、第2の磁石166との強力な親和性を有する。これは、さらに、分画結合された固相基質38に極性を切り替えさせる。第2の磁石166の磁気力が、分画結合された固相基質38を第1のプレート124の上側表面126に向かって引き付けるように作用するとき、磁石156は、反対極性の反発力として作用し、それによって分画結合された固相基質38をスライド140の下側表面144から離れるように押し進める。
装置120の上記の説明は、本発明の例にすぎないことが理解され得る。装置120に対するさまざまな改変が、本発明の範囲から逸脱することなく可能である。例として、第1のプレート124が、スライド140に対して軸方向に移動可能であることが企図され、第1のプレート124(または第1のプレート124およびスライド140の移動の組み合わせ)のそのような移動の結果、液滴160および162は、磁石156と位置合わせされ、その理由は上述されている。さらに、ユーザが、分画結合された固相基質38の追加の洗浄などの、追加の(またはより少ない)処理ステップを分画結合された固相基質38上にもたらすことを可能にするために、第1のプレート124の上側表面126上に追加の(またはより少ない)親水性領域を提供することが企図される。さらに、第1のプレート124の上側表面126は、この上に円周上に離間された親水性領域の配列と、スライド140の対応する配列とを含むことができる。その結果、本発明の方法論による複数の抽出作動が、単一の装置120を利用することで同時に行われ得る。そのような配置では、親水性領域の各々の「セット」を配列内の他のセットから効果的に分離するために親水性領域の各々の「セット」の周りに壁またはフェンスを設けることが企図され、それによってセット間の潜在的な二次汚染を防止する。
本発明を実施するさまざまな形態が、特に、本発明とみなされる主題を支持し、明確に特許請求する特許請求の範囲内に入ることが企図される。

Claims (23)

  1. 生体試料の液滴から標的物質を分離するための装置であって、前記標的物質が、固相基質に結合されて標的結合された固相基質を形成し、前記装置が、
    複数の領域を有する上側表面を有し、前記生体試料の液滴が前記領域の第1の部分上に受け入れられる下側プレートと、
    該下側プレートの前記上側表面に向けられ、前記第1の部分上に受け入れられた前記生体試料の液滴に接触する間隔をあけて配置された下側表面を有する上側プレートと、
    前記標的結合された固相基質を前記上側プレートの前記下側表面に向かって引き付ける、該上側プレートに隣接する力と、
    を備え、
    前記上側プレートおよび前記下側プレートの少なくとも1つが、前記生体試料の液滴内の前記標的結合された固相基質が前記力によって前記上側プレートの前記下側表面に引き寄せられる第1の位置から、前記標的結合された固相基質が前記力によって前記上側プレートの前記下側表面に隣接して引き寄せられ前記生体試料の液滴から分離される第2の位置平面に沿って移動可能である、生体試料の液滴から標的物質を分離するための装置。
  2. 前記下側プレートの前記領域が親水性である、請求項1に記載の装置。
  3. 前記下側プレートの前記領域の外側の前記上側表面の部分が疎水性である、請求項1または請求項2に記載の装置。
  4. 前記上側プレートの前記下側表面が疎水性である、請求項1から請求項3のいずれかに記載の装置。
  5. 前記上側プレートが、前記第1の位置と第2の位置との間で軸方向に移動可能である、請求項1から請求項4のいずれかに記載の装置。
  6. 前記上側プレートが、前記第1の位置と第2の位置の間で回転可能である、請求項1から請求項4のいずれかに記載の装置。
  7. 前記下側プレートの前記上側表面および前記上側プレートの前記下側表面が、所定の距離だけ離間される、請求項1から請求項6のいずれかに記載の装置。
  8. 生体試料の液滴から標的物質を分離するための方法であって、前記標的物質が、固相基質に結合されて標的結合された固相基質を形成し、前記方法が、
    前記生体試料の液滴を下側プレートの上側表面の第1の領域に提供するステップと、
    前記下側プレートの前記上側表面に向けられた下側表面を有する上側プレートを前記下側プレートに対して前記第の領域に提供された前記生体試料の液滴に接触する間隔をあけて配置するステップと、
    前記標的結合された固相基質を前記上側プレートの前記下側表面に向かって力によって引き寄せるステップと、
    前記標的結合された固相基質を前記力によって前記上側プレートの前記下側表面に隣接して保持するステップと、
    前記下側プレートおよび前記上側プレートの少なくとも1つを、前記生体試料の液滴内の前記標的結合された固相基質が前記力によって前記上側プレートの前記下側表面に隣接して保持される第1の位置から、前記標的結合された固相基質が前記力によって前記上側プレートの前記下側表面に隣接して保持され前記生体試料の液滴から分離される第2の位置まで平面に沿って移動させるステップと、を含む、生体試料の液滴から標的物質を分離するための方法。
  9. 前記第1の領域から離間した、前記下側プレートの前記上側表面の第2の領域に流体を提供するステップを含み、
    前記生体試料の液滴から分離された前記標的結合された固相基質が、前記下側プレートの前記上側表面の前記第2の領域で前記流体と混合される請求項8に記載の方法。
  10. 前記下側プレートの前記上側表面の前記第1の領域が親水性である、請求項8または請求項9に記載の方法。
  11. 前記下側プレートの前記上側表面が親水性の複数の領域を含み、前記第1の領域が前記下側プレートの前記上側表面の前記複数の領域の1つであり、前記第2の領域が前記下側プレートの前記上側表面の前記複数の領域の1つである、請求項に記載の方法。
  12. 前記下側プレートの前記上側表面が前記複数の領域の外側の部分を有し、前記下側プレートの前記上側表面における前記複数の領域の外側の部分が疎水性である、請求項11に記載の方法。
  13. 前記上側プレートの前記下側表面が疎水性である、請求項8から請求項12のいずれかに記載の方法。
  14. 前記上側プレートが、長手方向軸に沿って前記第1の位置と第2の位置との間を移動する、請求項8から請求項13のいずれかに記載の方法。
  15. 前記上側プレートが、前記第1の位置と第2の位置の間で回転可能である、請求項8から請求項13のいずれかに記載の方法。
  16. 前記下側プレートの前記上側表面および前記上側プレートの下側表面を所定の距離だけ離間させる追加のステップを含む、請求項8から請求項15のいずれかに記載の方法。
  17. 生体試料の液滴から標的物質を分離するための方法であって、前記標的物質が、固相基質に結合されて標的結合された固相基質を形成し、前記方法が、
    前記生体試料の液滴を第1のプレートの表面の第1の領域に提供するステップと、
    流体を、該流体が前記第1のプレートの前記表面に沿って前記生体試料の液滴から隔てられるよう前記第1の領域から離間されている前記第1のプレートの前記表面の第2の領域上に載せるステップと、
    前記第1のプレートの前記表面に向けられた疎水性表面を有する第2のプレートを、前記第1のプレートに対して前記第の領域上に載せられた前記生体試料の液滴に接触する間隔をあけて配置するステップと、
    前記標的結合された固相基質を前記第2のプレートの前記表面に向かって力によって引き寄せるステップと、
    前記標的結合された前記固相基質を前記力によって前記第2のプレートの前記表面に隣接して保持するステップと、
    前記第1のプレートおよび前記第2のプレートの少なくとも1つを、前記生体試料の液滴内の前記標的結合された固相基質が前記力によって前記第2のプレートの前記表面に隣接して保持される第1の位置から、前記標的結合された固相基質が前記力によって前記第2のプレートの前記表面に隣接して保持され前記生体試料の液滴から分離される第2の位置まで平面に沿って移動させるステップと、を含む、生体試料の液滴から標的物質を分離するための方法。
  18. 前記第1の領域および第2の領域の外側の前記第1のプレートの前記表面の部分が疎水性である、請求項17に記載の方法。
  19. 前記第2のプレートが、長手方向軸に沿って前記第1の位置と第2の位置との間を移動する、請求項17または請求項18に記載の方法。
  20. 前記第2のプレートが、前記第1の位置と第2の位置との間で回転可能である、請求項17または請求項18に記載の方法。
  21. 前記第2のプレートの前記表面を前記第1のプレートの前記表面から所定の距離だけ離間させる追加のステップを含む、請求項17から請求項20のいずれかに記載の方法。
  22. 前記力が磁気である、請求項17から請求項21のいずれかに記載の方法。
  23. 前記標的結合された固相基質を前記力から分離する追加のステップを含む、請求項17から請求項22のいずれかに記載の方法。
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