JP6152944B2 - 束縛免疫原性組成物およびその用途 - Google Patents

Description

本発明は、免疫原性タンパク様束縛複合体と、それらを含んでなる組成物およびキットとに関する。いくつかの実施形態では、本発明は、免疫応答を誘導する対照への束縛抗原の送達に関する。

対象明細書の参考文献の文献目録の詳細はまた、明細書の終わりにも列挙される。

あらゆる先行公開（またはそれに由来する情報）、または公知のあらゆる物質に関する本明細書中の参照は、先行公開（またはそれにに由来する情報）または既知の物質が、本明細書がそれに関わる努力傾注分野の一般常識の一部を構成することの認知、または承認またはいかなる形態の提案でもなく、またはそのように解釈すべきではない。

免疫機構の理解における大きな進展にも関わらず、ＨＩＶやマラリア原虫などの主要病原体に対するワクチンは、分かりにくいままである。近年、より大きな有効性、安全性、および生成の容易さのために、代案の抗原送達系が活発に調査されている。これらの取り組みの中で最も成功しているのは、ウイルス性構造タンパク質（ＨＢＶ、パピローマウイルス）の自己組織化に依存する、ウイルス様粒子（ＶＬＰ）である。しかし多数の病原体はこのようなアセンブリーを生成せず、ＶＬＰスキャフォールドに組み込み得る抗原のサイズには限界がある。抗原の粒子としての投与には、いくつかの利点があると考えられる。抗原提示細胞は微粒子抗原を優先的に取り込んで、それらを細胞区画に輸送して、抗体産生および細胞応答を容易にする（Ｒｉｃｅ−Ｆｉｃｈｔ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，１３：１０６−１１２，２０１０によるレビューを参照されたい）。

様々な性質とサイズの抗原を提示して、頑強な体液性および細胞性応答を誘導できる、用途の広いプラットフォーム技術に対する必要性がある。

特に断りのない限り、本明細書中の各実施形態は、変更すべきところは変更して、他の全ての実施形態に適用される。

冠詞「ａ」および「ａｎ」は、冠詞の１つまたは２つ以上（すなわち少なくとも１つ）の文法的目的に言及するために、本明細書で使用される。一例として、「ａ ｃｅｌｌ（細胞）」は、１つの細胞または２つ以上の細胞を意味する。「ａｎ ａｎｔｉｇｅｎ（抗原）」は、１種の抗原または２種以上の抗原を意味する。

本明細書の全体を通じて、文脈上他の意味に解すべき場合を除き、「ｃｏｍｐｒｉｓｅ（含んでなる）」「ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ（含んでなる）」および「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ（含んでなる）」と言う語は、述べられたステップまたは要素、またはステップまたは要素群の包含を暗示すると理解されるが、いかなるその他のステップまたは要素、またはステップまたは要素群も排除しない。したがって「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ（含んでなる）」などの用語の使用は、列挙される要素が必要または必須であるが、その他の要素は任意であり、存在してもしなくてもよいことを示す。「ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ（からなる）」は、語句「からなる」に続くものをどれも含み、そしてそれに限定されることが意図される。したがって、「からなる」という語句は、列挙された要素が必要または必須であって、他のいかなる要素も存在できないことを示す。「ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ（から本質的になる）」は、語句の後に列挙されるあらゆる要素を含み、列挙される要素について開示中で明記される働きまたは作用を妨げず、またはそれに寄与する、その他の要素に限定されることを意味する。したがって、「から本質的になる」という語句は、列挙された要素が必要または必須であるが、その他の要素は任意であり、それらが列挙される要素の働きまたは作用に影響を及ぼすかどうか次第で、存在してもしなくてもよいことを示す。

本発明は、ヒトまたは非ヒト哺乳類対象を冒す病原体、疾患または病状と関連付けられている抗原を提示して、免疫応答を誘導するための多面体と称される昆虫ウイルス結晶の要素の使用に広く関する。結晶は生物から迅速にクリアされ、または毒性であり、または抗原提示細胞が処理できず、または体液性または細胞性応答のどちらかのみを引き起こし得ると推測されたので、多面体（本明細書ではＭｉｃｒｏＣｕｂｅとも称される）形の抗原ポリへドリン複合体が免疫応答を引き起こす能力は驚くべきである。

いくつかの実施形態では、多面体ポリへドリンおよび抗原を含んでなるポリペプチドは、抗原の構造を少なくとも部分的に束縛し、および／または抗原を分解から保護する、安定複合体を形成する。したがって、いくつかの実施形態では、本発明は関心のある抗原を免疫系に提示するためのビヒクルを提供する。自然界では、ウイルス多面体は、生存および感染機序として機能する、結晶格子内に包埋（封入）された複数のウイルス粒子を含有する。カプセル化ウイルス粒子は、長年にわたって土壌中で感染性のままであり得て、昆虫が結晶を摂取すると生活環が継続し、結晶はアルカリ性の中腸内で分解して感染ウイルス粒子が放出される。当該技術分野で公知のように、ポリへドリン標的化ペプチド（ｔａｇ）を使用して融合タンパク質を引き寄せて、それらをポリへドリンを含んでなる結晶構造に含め得る。

「複合体」という用語は、修飾ＣＰＶポリへドリンならびに「修飾多面体」を形成する「抗原ポリへドリンサブユニット」を指す。いくつかの好ましい実施形態では、「複合体」という用語は、ヒトまたは非ヒト哺乳類対象を冒す病原体または疾患または病状の抗原を含んでなる、修飾多面体（「ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ」、「多面体結晶」、「修飾多面体結晶」、「多面体」、「ポリへドリン」または「マイクロ分子構造」などの用語が同義的に使用される）を指す。

いくつかの実施形態では、本発明は、先に開発されたプロトコルを用いて、ポリペプチドを昆虫多面体中で融合タンパク質として発現させる。この技術は、当該技術分野で公知であり、例えばその内容全体を本明細書に援用するＩｋｅｄａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７５：９８８−９９５，２００１；Ｉｋｅｄａ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ，６：５４−６６，２００６；Ｍｏｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８２（２３）：１７２８９−１７２９６，２００７；Ｉｊｉｒｉ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓ３０：４２９７−４３０８，２００９でレビューされる。生成法は変動してもよいので、本発明は特定の生成法に限定されない。

本発明は、ヒトまたは非ヒト動物対象中でそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンまたはポリへドリン様タンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、免疫原性またはワクチン組成物を提供する。

「ポリへドリン」および「ポリへドリン様」は、あらゆる細胞質多角体病ウイルス（ｃｙｐｏ）（ＣＰＶ）からのあらゆる天然形態のポリへドリン、ならびに本明細書で定義されるような、それらの生物学的活性部分、およびこれらの変種、アナログ、相同体または誘導体を網羅する。異なるポリへドリンポリペプチドおよびペプチドの配列が、当該技術分野で入手できる（ＮＣＢＩ Ｅｎｔｒｅｚ Ｓｅａｒｃｈ参照）。ポリへドリンは、技術分野から選択されて、本明細書に記載される方法で慣例的に試験されてもよい。ＣＰＶによって生成されるポリへドリン分子は、バキュロウイルスによって生成されるものと異なる。それらは構造が異なり、ウイルスは無関係である。それらの分子構造間の差異は、Ｃｏｕｌｉｂａｌｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．１０６（５２）：２２２０５−２２２１０，２００９に記載され、バキュロウイルス多面体は、抗原への完全なアクセスを妨げることもある外被を有し、ＣＰＶは細胞質内で、バキュロウイルスは核内で自己複製するので、それらの細胞局在性は異なっている。

いくつかの実施形態では、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、単離された、均質な、完全または部分的精製形態である。単離および／または精製は、塩分別、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過、サイズ排除クロマトグラフィー、サイズ分画、そして親和性および免疫親和性クロマトグラフィーをはじめとする、当該技術分野で公知の方法により実施され得る。ＦＡＣＳ分離もまた、用い得る。

「単離」または「精製」という用語は、常態ではその天然状態に付随する構成要素を実質的にまたは本質的に含まない、材料を意味する。例えば、「単離複合体」は、本明細書の用法では、その生成で使用される、細胞、無細胞、または分子混合物から単離された複合体を指す。いくつかの実施形態では、精製複合体は、純度が少なくとも９５〜９９％である。

言及されたように、好ましい一実施形態では、ポリへドリンは細胞質多角体病（ｃｙｐｏ）ウイルス（ＣＰＶ）に由来する。別の実施形態では、ポリへドリンはバキュロウイルスに由来しない。

例示的な実施形態では、実質的に微粒子多面体形での複合体の対象への送達が、それに対する免疫応答を誘導する。本発明に従って、多面体は抗原の分解を低下させる。いくつかの実施形態では、それはまた免疫応答を活性化し、したがって潜在的に抗原特異免疫応答を高める。

説明に役立つ実例では、それに対する免疫応答が求められる抗原は、腫瘍などの病状と関連付けられている抗原、すなわち腫瘍抗原である。したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、例えば動物モデルにおいて効果的な免疫応答を生じさせることから、ワクチン接種目的のための抗原の候補として当該技術分野で記載される１つまたは複数の抗原を用いて、マイクロ分子多面体を形成するポリへドリンとの複合体として抗原を再パッケージし、抗原は構造的および物理的に束縛される。いかなる特定の理論または作用様式によっても制限されることなく、微粒子多面体形の抗原送達は、改善された細胞および／または免疫応答、好ましくはその双方を誘導することが提案される。代案としては、またはこれに加えて、複数投与に対する必要性を低下させ、および／またはより高い力価／強度の細胞または抗体応答を生じさせるために、マイクロ分子構造からの抗原の緩慢なまたは持続性の放出が提案される。

一実施形態では本発明は、ヒトまたは非ヒト動物対象中でそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、細胞質多角体病ウイルス（ＣＰＶ）に由来するポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、安定した免疫原性またはワクチン組成物を提供し、実質的に微粒子多面体形での複合体の対象への送達が、それに対する免疫応答を誘導する。

「安定」への言及は、多面体中の複合体抗原の構成要素が、生理学的または環境条件下で実質的に分解抵抗性であり、または複合体またはそれを含んでなる多面体の不在下の抗原などの対照と比較して、分解低下を呈示することを含む。

いくつかの実施形態では、多面体中の抗原は熱安定性である。例えば、実施例に記載されるように、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ抗原は約４℃〜約２１℃で、また約３７℃においてさえ安定している。別の実施形態では、多面体中の抗原は分解低下を呈示する。

いくつかの実施形態では、「分解低下」への言及は、ポリへドリンとの複合体中または多面体中にない同じ抗原が、５０％、６０％、７０％を超える抗原分解を呈示する条件下における保存期間において、５０％未満、４０％未満、３０％未満、２０％未満、１０％未満、１％未満の抗原の分解を呈する組成物を指す。いくつかの実施形態では、多面体中の抗原は、トリプシン分解などの酵素的耐性である。

例示的な非限定的実施形態では、ポリへドリンはカイコガ（Ｂｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ）ＣＰＶに由来する。いくつかの実施形態では、酵素はトリプシンである。

「に由来する」とは天然形態および天然形態の機能的変種を意味し、したがって直接または間接的に、生物に由来する配列を含む。例えば、ポリへドリンなどのウイルス性ポリペプチドは、それが、（ｉ）ウイルスのポリヌクレオチドの読み取り枠によってコードされ（ウイルス性ポリヌクレオチド）、または（ｉｉ）本明細書に記載されるそのウイルスのポリペプチドに対して配列および／または構造機能的類似性を示す場合に、ウイルスの特定のポリペプチド（ウイルス性ポリペプチド）に「由来する」。機能的変種については本明細書に記載され、ポリへドリンポリペプチドの断片であってもよい誘導体を含む。

いくつかの実施形態では、抗原は、ＣＰＶのポリへドリンのＮ末端Ｈ１α螺旋またはＶＰ３ポリへドリン認識シグナルに由来する、またはその機能的変種である、標的化ペプチドなどのポリへドリン標的化ペプチドに融合している。いくつかの実施形態では、標的化ペプチドは、カイコガ（Ｂｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ）ＣＰＶのポリへドリンのＮ末端Ｈ１α螺旋またはＶＰ３ポリへドリン認識シグナルに由来し、またはその機能的変種である。

不確かさを回避するために、いくつかの実施形態では、抗原−ポリへドリン標的化融合タンパク質はキメラポリペプチドであり、それは組み合わせが自然界で発生せず、タンパク質が１種の生物からの抗原からなり、ポリへドリン標的化ペプチドが、異なる種などの第２の生物に由来することを意味する。

例示的な実施形態では、本発明のキメラ抗原−ポリへドリン標的化タンパク質が生成され、その中では同じ発現産物の一部として発現されることで、または合成によって、異なる種に由来する少なくとも２つのポリペプチドまたはペプチドが、共有結合によって結合される。どちらの場合も、得られるポリペプチドは、融合タンパク質と称されてもよい。抗原の多面体への共有結合架橋による直接付着、またはコーティングも検討される。

「ポリペプチド」、「タンパク質」、「ペプチド」、および「糖タンパク質」という用語は同義的に使用され、いかなる特定の長さにも限定されないアミノ酸のポリマーを意味する。本用語は、ミリスチン化、グリコシル化、リン酸化、および付加および／またはシグナル配列欠失などの改変を排除しない。

サイポウイルスのポリへドリンＨ１α螺旋（ｔａｇ）などのポリペプチドの「部分」または「一部分」または「領域」または「ドメイン」は、少なくとも約１０個のアミノ酸または約２０〜３０個のアミノ酸、１５〜１００個のアミノ酸または約５〜８０個のアミノ酸または約１５〜１２０個のアミノ酸の最小限のサイズを有すると定義される。

本明細書の用法では、「免疫応答」は、組成物に対して抗体を形成して免疫を生じることをはじめとする、発明の組成物の存在に対する全身の反応を指す。免疫は、免疫応答の先天性および適応性アームの双方の活性化の結果として生じてもよい。したがって、本明細書に記載される、ヒトまたは非ヒト動物の病原体抗原、またはヒトの病状（がんなど）または疾患と関連付けられている抗原に対する免疫応答は、対象における、関心のある抗原に対する体液性および／または細胞性免疫応答の発生もまた含む。先天性免疫応答の刺激によって、このようなあらゆる応答を改善または活性化を含めて改変し得る。「体液性免疫応答」は、形質細胞により産生される抗体によって媒介される。「細胞性免疫応答」は、Ｔリンパ球および／またはその他の白血球細胞によって媒介される。抗原に対する「免疫学的応答」または「免疫応答」としては、対象中における、抗原に対する体液性（Ｂ細胞）および／または細胞性（Ｔ細胞）免疫応答の発生が挙げられる。対象複合体の多面体構成要素は、本明細書で定義されるところの抗原ではないが、本明細書で判定されているように、それは、サイトカイン分泌および／またはインフラマソームの活性化をはじめとする免疫応答を引き起こし、求められている抗原特異的免疫応答を潜在的に高める。形質細胞およびＢ細胞による抗体産生やサプレッサーＴ細胞および／またはγδＴ細胞の活性化をはじめとする、細胞媒介性または体液性の免疫学的応答を刺激する特定の抗原の能力は、リンパ球増殖性（リンパ球活性化）アッセイ、ＣＴＬ細胞毒性細胞アッセイなどのいくつかのアッセイにより、または感作対象中において抗原に対して特異的なＴリンパ球をアッセイすることにより、求めてもよい。このようなアッセイは、当該技術分野で周知である。細胞媒介性免疫応答を測定する方法としては、Ｔ細胞集団による細胞内サイトカインまたはサイトカイン分泌の測定、またはエピトープ特異的Ｔ細胞の測定が挙げられる。免疫応答はまた、感染性を中和し、伝播または負荷を軽減し、および／または抗体補完、または抗体依存性細胞傷害（ＡＤＣＣ）を媒介する役割を果たして、免疫化宿主に保護を提供してもよい。免疫応答は、当該技術分野で公知のように、標準免疫測定法と中和アッセイを使用して測定し得る。

「免疫原性組成物」は抗原性分子を含んでなる組成物であり、組成物の対象への投与は、対象中において、関心のある抗原性分子に対する体液性および／または細胞性免疫応答の発生をもたらす。本発明に従って、ポリへドリンタンパク質またはペプチドはまた、免疫原性でもあり、それに対する免疫応答が求められる抗原に対する免疫応答を高めるのに適した、免疫応答を刺激する。

免疫応答を評価するアッセイは実施例に記載され、抗体応答および遅延型過敏反応を測定するためのアッセイなどの生体内アッセイを含んでなってもよい。一実施形態では、抗体応答を測定するアッセイは、主にＢ細胞機能ならびにＢ細胞／Ｔ細胞相互作用を測定してもよい。抗体応答アッセイでは、抗原投与に続いて血液中の抗体力価を比較してもよい。本明細書の用法では、「抗体力価」は、各対象において、免疫前サンプルを超える値をもたらす、免疫後血清の最大希釈と定義し得る。

これらのレベルは、例えば、ＩｇＧ、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＭ、ＩｇＡまたはＩｇＤなどの抗体型に従って、定量化し得る。また免疫系の発生は、抗原刺激なしで、血液中の抗体およびリンパ球レベルを判定することにより評価してもよい。

生体外アッセイは、細胞が分割する、または他の細胞が分割するのを助ける、またはリンフォカインやその他の因子を放出する、活性化マーカーを発現する、そして標的細胞を溶解する能力を判定するステップを含んでなってもよい。マウスおよびヒトリンパ球は、生体外アッセイで比較し得る。一実施形態では、末梢血細胞、脾細胞、またはリンパ節細胞などの類似起源からのリンパ球が比較される。しかし非限定的例として、ヒト末梢血細胞とマウス脾細胞などの異なる起源からのリンパ球を比較することも可能である。生体外アッセイでは、細胞は精製されてもよく（例えばＢ細胞、Ｔ細胞、およびマクロファージ）、またはその天然状態のままでもよい（例えば脾細胞またはリンパ節細胞）。精製は、所望の結果を与えるあらゆる方法で行ってもよい。細胞は、生体外で、マイトジェンまたは特異的抗原を使用して、それらの増殖能力について試験できる。特異的抗原存在下で分割する細胞の能力は、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイを使用して判定し得る。培養細胞からの上清を試験して、細胞が特定のリンフォカインを分泌する能力を定量化し得る。細胞を培養物から取り出して、活性化抗原を発現するそれらの能力について試験し得る。これは適切なあらゆる方法によって行い得て、非限定的例として、活性化抗原に結合する抗体またはリガンドと、活性化抗原をコードするＲＮＡに結合するプローブとを使用する方法が挙げられる。

いくつかの実施形態では、表現型細胞アッセイを実施して、特定の細胞型の発生頻度を判定し得る。末梢血血球数算定を実施して、血中のリンパ球またはマクロファージ数を判定してもよい。ＣＤ４細胞数およびＣＤ４／ＣＤ８比率を判定する非限定的例のように、抗体を使用して末梢血リンパ球をスクリーニングして、特定抗原を発現する細胞のパーセントを判定し得る。

したがって本発明は、本明細書に記載される複合体を含んでなる組成物を提供し、複合体に対する免疫応答は、細胞性および体液性応答を含む。

いくつかの実施形態では、複合体のポリへドリンまたはポリへドリンペプチド部分に対する免疫応答は、細胞性または体液性応答を含んでなる。

いくつかの実施形態では、複合体のポリへドリンまたはポリへドリンペプチド部分に対する免疫応答は、インフラマソーム活性化を含んでなる。

いくつかのさらなる実施形態では、組成物は、薬学的または生理学的に許容可能なキャリアおよび／または希釈剤を含んでなる。

「ワクチン」という用語は、本明細書の用法では、対象において免疫学的応答を誘導する免疫学的活性構成要素と、可能であるが必須でない前記活性構成要素の免疫学的活性を高める１つまたは複数の追加的な構成要素（例えばアジュバント）とを含んでなる医薬組成物を指す。ワクチンは、医薬組成物に典型的なさらなる構成要素をさらに含んでなってもよい。本発明に従って、ワクチンの免疫学的活性構成要素は、ヒトまたは非ヒト動物対象中でそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる。「ワクチン」および「ワクチン組成物」という用語は、本発明で同義的に使用される。本明細書で定義されるように、ポリへドリン部分は免疫応答もまた誘導する。

本発明で検討される「対象」としては、好都合には、霊長類、魚類や甲殻類や鳥類をはじめとする、家畜動物、臨床検査動物、コンパニオンアニマル、または飼育下の野生動物をはじめとする、あらゆる商業的または人道主義的関心のある動物が挙げられる。いくつかの実施形態では、対象は哺乳類動物である。特定の実施形態では、対象はヒト対象である。いくつかの実施形態では、「対象」は、ヒト、または研究室または技術分野で受け入れられている、実験用または荷役用動物をはじめとする動物である。「患者」としては、治療または予防法を必要とするヒト対象が挙げられる。

別の実施形態では、本発明は、それに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ＣＰＶ多面体とを含んでなる免疫原性組成物を提供し、組成物の送達は抗原に対する免疫応答を誘導し、ＣＰＶ多面体は抗原に対する免疫応答を高める。

いくつかの実施形態では、本発明は、抗原に対する免疫応答を刺激するために抗原と併せて使用されるＣＰＶ多面体を含んでなる、免疫原性組成物を提供する。いくつかの実施形態では、ＣＰＶ多面体はカイコガ（Ｂｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ）に由来する。

別の実施形態では、本発明は、抗原と関連付けられている、感染症、疾患または病状を治療または予防するためのワクチンの製造で使用される、ヒトまたは非ヒト動物対象においてそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、本明細書に記載される免疫原性組成物を提供する。

別の実施形態では、抗原と関連付けられている、感染症、疾患または病状を治療または予防するための薬剤の製造における、ヒトまたは非ヒト動物対象においてそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、本明細書に記載される免疫原性組成物の使用が提供される。

別の広義の実施形態では、免疫応答を引き起こす条件下において、ヒトまたは非ヒト動物対象においてそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、本明細書に記載される免疫原性組成物の有効量を対象または患者に投与するステップを含んでなる、対象または患者において免疫応答を引き起こす方法が提供される。

さらに、本発明は、ヒトまたは非ヒト動物対象においてそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、本明細書に記載される免疫原性組成物を対象に投与するステップを含んでなる、抗原と関連付けられている、感染症または疾患または病状に対して、対象を免疫化する方法を含む。

さらに、本発明は、感染症またはがん／疾患または病状を治療または予防するのに十分な時間と条件で、ヒトまたは非ヒト動物対象においてそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、本明細書に記載される免疫原性組成物を対象に投与するステップを含んでなる、病原体による感染症または疾患（がん）またはその他の病状を治療または予防する方法を提供する。

一実施形態では、本発明は、（ａ）それに対する免疫応答が求められる病状と関連付けられている病原体抗原またはその他の抗原と；（ｂ）ポリへドリンとを含んでなる複合体の有効量を対象に投与するステップを含んでなる、対象において免疫応答を誘導する方法を提供し、投与は抗原が免疫応答を誘導するのに十分な時間と条件で行われる。

別の実施形態では、本発明は、（ａ）ポリへドリン標的化ペプチドと、それに対する免疫応答が求められる病状と関連付けられている病原体抗原またはその他の抗原とを含んでなるキメラ融合ポリペプチド；および（ｂ）ポリへドリンを含んでなる複合体の有効量を対象に投与するステップを含んでなる、対象において免疫応答を誘導する方法を提供し、投与は抗原が免疫応答を誘導するのに十分な時間と条件で行われる。

類似実施形態では、本発明は、ウイルス感染症を治療または予防するのに十分な時間および条件で、本発明に従ったウイルス抗原を含んでなる複合体および／または同複合体を含んでなる融合タンパク質を投与するステップを含んでなる、対象においてウイルス感染症を治療または予防する方法を提供する。

類似実施形態では、本発明は、病原体または腫瘍／がん感染症／病状を治療または予防するのに十分な時間および条件で、本発明に従った病原体抗原または腫瘍／がん抗原を含んでなる複合体および／または同複合体を含んでなる融合タンパク質を投与するステップを含んでなる、対象において感染症を治療または予防する方法を提供する。

その他の類似実施形態では、本発明は、ウイルス感染症または病原体または腫瘍／がん感染症／病状の治療および／または予防で使用するための対象複合体と融合タンパク質とを提供する。さらなる類似実施形態では、ウイルス性病原体またはその他の病原性の感染症または腫瘍を治療および／または予防するための薬剤の製造で使用される、複合体および／または融合タンパク質が提案される。

いくつかの実施形態では、本発明は、対象融合ポリペプチドをコードする単離核酸分子を含んでなる、免疫原性または推定上のワクチン組成物をはじめとする、医薬組成物を提供する。

いくつかの実施形態では、免疫原性または推定上のワクチン組成物をはじめとする医薬組成物は、薬学的に許容できるキャリアおよび／または希釈剤と配合される。

別の実施形態では、本発明は、本明細書に記載される対象複合体または融合ポリペプチドを含んでなる、医薬組成物を提供する。

推定上のワクチン組成物は、例えば、一般に受け入れられている動物または細胞モデルにおいて、効果的な免疫応答を誘導する見込みがあるものである。

他の実施形態では、本発明は、ヒトまたは非ヒト動物対象または患者においてそれに対する免疫応答が求められる、病原体抗原またはその他の抗原と特異的に結合する、単離されたまたは精製された抗体または免疫細胞を生成する方法を提供する。方法は、ヒトまたは非ヒト動物対象においてそれに対する免疫応答が求められる、病原体抗原またはその他の抗原と、ポリへドリンタンパク質とを含んでなる複合体を含んでなる、本明細書に記載される免疫原性組成物の有効量を対象に投与するステップと、抗体または免疫細胞を単離または精製するステップを含んでなる。

いくつかの実施形態では、複合体または同複合体を含んでなる多面体は、単離された均質な完全または部分的精製形態である。

好ましい実施形態では、ポリへドリンはＣＰＶに由来する。

さらなる実施形態では、実質的に多面体形での複合体の対象への送達は、複合体に対する免疫応答を誘導する。

いくつかの実施形態では、抗原はポリへドリン標的化ペプチドに融合する。

いくつかの実施形態では、複合体に対する免疫応答は、複合体のポリへドリン部分に対する免疫応答を含み、細胞性または体液性免疫応答を含んでなり、および／またはインフラマソーム活性化を含んでなる。活性化は、ＩＬ−１β分泌についてアッセイするなどの様々なアッセイによって検出してもよい。

いくつかの実施形態では、ポリへドリンは昆虫細胞核を標的とせず、多面体外被を形成しない。

いくつかの実施形態では、免疫応答は、体液性および細胞性免疫応答である。

上の方法は、非ヒト対象における抗体および／または免疫細胞の生成を網羅する。この実施形態では、抗体は、例えば、治療的または予防的抗体の製造で使用するのに適する。別の実施形態では、このような抗体は、診断、スクリーニング、および研究に有用である。さらに別の実施形態では、方法は、病原体または病状の影響を受けやすい、または治療または予防を必要とする対象における、抗原に対する体液性および／または免疫応答の誘導を包含する。予防的または治療的投与の場合、ヒトをはじめとする哺乳類対象が特に検討される。

別の実施形態では、本発明は、（ａ）ウイルス性ポリへドリン標的化ペプチドと、（ｂ）それに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の分子とを含んでなる、融合ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、対象への投与に適して、対象において免疫応答を誘導する組成物中に提供される。例示的な組成物は、当該技術分野で公知の動物またはヒト用途に適するアジュバントを含んでなる。その他の例示的な組成物は、鼻、口、腸などの粘膜に送達するために調合される。

例示的な実施形態では、三量体ポリへドリンポリペプチドがＮ末端螺旋のスキャフォールドの周囲に配置される。多面体は、マイクロ分子複合体である。三量体は、分子間ジスルフィド結合によって４つの三量体が架橋された、四面体クラスターに配置される（Ｃｏｕｌｉｂａｌｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，４４６：９７−１０１，２００７；Ｃｏｕｌｉｂａｌｙ ｅｔ ａｌ．，２００９（前出））。特定の実施形態では、対象多面体はバキュロウイルスまたはサイポウイルスのウイルス性またはウイルス性様粒子を含まない。

別の実施形態では、本発明は、（ａ）ポリへドリン標的化ペプチドと、それに対する免疫応答が求められる病状と関連付けられている病原体抗原またはその他の抗原とを含んでなる融合ポリペプチド；および（ｂ）ポリへドリンを含んでなる、複合体を提供する。いくつかの実施形態では、複合体は免疫原性でありおよび／または対象中で徐放を提供する。別の実施形態では、複合体は、ポリへドリンとの複合体の形態でない、またはポリへドリン標的化ペプチドとの融合タンパク質の形態でない、抗原によって生じる免疫応答と比較して、改善された免疫応答を引き起こすのに適する。

いくつかの実施形態では、複合体は、抗原性部分とポリへドリン標的化部分とを含んでなる、複数の融合ポリペプチドを含んでなる、組換えまたは修飾多面体の形態である。いくつかの実施形態では、抗原部分は、単一の病原性生物または病状に由来する、１つまたは複数のエピトープを含んでなる。別の実施形態では、抗原部分は、２種以上の病原性生物または病状からの１つまたは複数のエピトープを含んでなる。いくつかの実施形態では、組換えまたは修飾多面体は、用いられる昆虫ポリへドリン分子次第で、０．１μｍ〜５０μｍ、特に０．１μｍ〜１０μｍのサイズ範囲である。粒度は、免疫付与のための投与様式に合わせて調節されてもよい。

例示的な実施形態において、病原体はＨＩＶである。さらなる例示的な実施形態では、抗原はＨＩＶ Ｇａｇポリペプチドまたはその抗原性ペプチドである。当該技術分野で公知のように、Ｇａｇは、ミリスチン化タンパク質（ｐ５５）を含んでなる前駆体として生成され、それは典型的にプロテアーゼによって様々な程度に処理されて、マトリックスタンパク質（ＭＡ−ｐ１７）、コア抗原カプシドタンパク質（ＣＡ−ｐ２４）、核カプシドタンパク質（ＮＣ−ｐ７）、ｐ６、ｐ２、およびｐ１を形成する。ＨＩＶ Ｇａｇ ｐ３９は、ｐ２４、ｐ９およびｐ６を含んでなる。

別の実施形態では、本発明は、（ａ）ポリへドリン標的化ペプチドと、それに対する免疫応答が求められる病状と関連付けられている病原体抗原またはその他の抗原とを含んでなる融合ポリペプチド；および（ｂ）ポリへドリンを含んでなる、複合体を生成する方法を提供し、方法は、ポリへドリン標的化ペプチドとの融合ポリペプチドとして、抗原をコードする核酸分子を発現するステップと、昆虫またはその他の適切な宿主細胞中で、ポリへドリンまたはポリへドリン様ポリペプチドをコードする核酸分子を発現させるステップと、融合タンパク質が、抗原およびポリへドリンを含んでなる複合体を形成するのに十分な時間と条件で、ポリへドリンと融合ポリペプチドを接触させるステップを含んでなる。いくつかの実施形態では、２つのタンパク質は、昆虫またはその他の同等の宿主細胞内で同時生成される。複合体は、典型的に、融合タンパク質の複数のコピーを含んでなる。特定の実施形態では、方法は、その他の細胞または培養材料から、複合体を単離しまたは精製するステップをさらに含んでなる。

別の実施形態では、宿主細胞中で、またはポリへドリン抗原複合体の形成および折り畳み、および多面体または多面体様粒子の生成ができる無細胞条件下で、融合ポリペプチドを直接合成してポリへドリンと組み合わせてもよい。

いくつかの実施形態では、方法は、上の方法に従って調製された抗原、または同抗原を含んでなる組成物の半減期または貯蔵寿命（安定性）を増大させる。いくつかの実施形態では、方法は、酵素分解または特定の生理学的または環境条件下の分解に対する、抗原調製品の抵抗性を増大させる。

いくつかの実施形態では、単離または精製複合体または融合タンパク質および／または抗体を含んでなる、免疫診断または免疫スクリーニングキットなどのキットが検討される。

いくつかの実施形態では、（ａ）ポリへドリン標的化ペプチドと、それに対して抗体が求められる病状と関連付けられている病原体抗原またはその他の抗原とを含んでなる融合ポリペプチド；および（ｂ）ポリへドリンを含んでなる複合体の有効量を非ヒト対象に投与するステップを含んでなる方法に従って、抗体が生成され、投与は、抗原が抗体応答を誘導するのに十分な時間と条件で行われる。別の実施形態では、融合ポリペプチドが投与される。

いくつかの実施形態では、抗体は、当該技術分野で公知のキメラ、脱免疫化、ヒト化またはヒト抗体の製造において使用される。

別の実施形態では、本発明は、本明細書に記載されるポリへドリンまたは融合ポリペプチドを含んでなる複合体の形態の対象抗原に結合するものについて、推定上の相互作用（結合）物質をスクリーニングする方法を検討する。いくつかの実施形態では、方法は、本発明の精製複合体または融合タンパク質に、推定上の相互作用物質を接触させるステップと、対照と比較して結合を判定するステップを含んでなる。いくつかの実施形態では、それから抗原が誘導された、病原体またはがん性細胞のレベルまたは活性を低下させる能力について、結合因子がさらに試験される。

さらなる実施形態は、本明細書に記載される融合ポリペプチドをコードする核酸分子、対象複合体または融合ポリペプチドを含んでなる宿主細胞、および精製組換えまたは修飾多面体を含んでなる組成物を対象とする。組成物は、生体内で複合体の不安定化（ｐＨ調節剤など）または安定化（架橋など）を促進する作用物質を含んでもよい。

対象ポリへドリン−抗原複合体、またはポリへドリン標的化ペプチド−抗原融合ポリペプチド、またはそれによって定まる特異的に抗原を認識する抗体を含んでなる、医薬組成物が提供される。

上の概要は、本発明の全実施形態の網羅的列挙ではなく、そのように見なされるべきではない。

いくつかの図は、色彩表現または実体を含む。カラー版の図は、請求あり次第、特許権所有者から、または適切な特許庁から入手できる。特許庁から得られる場合、手数料がかかることもある。

Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの固定化を示すデータの写真表現である。 Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅが、トリプシン存在下で高度に安定していることを示すデータの写真表現である。 Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅが、生理学的に妥当な条件下で高度に安定していることを示すデータの写真表現である。 ＨＩＶ Ｇａｇの完全長ＨＩＶ Ｇａｇ、ｐ３９、およびｐ２４ペプチドに対する、ＩＬ−２応答を示すデータのグラフ表示である。 ＨＩＶ Ｇａｇの完全長ＨＩＶ Ｇａｇ、ｐ３９、およびｐ２４ペプチドに対する、ＩＦＮ−γ応答を示すデータのグラフ表示である。 ＨＩＶ Ｇａｇの完全長ＨＩＶ Ｇａｇ、ｐ３９、およびｐ２４ペプチドに対する、ＩＦＮ−γ応答を示すデータのグラフ表示である。 ＨＩＶ Ｇａｇの完全長ＨＩＶ Ｇａｇ、ｐ３９、およびｐ２４ペプチドに対する、ＩＦＮ−γ応答を示すデータのグラフ表示である。 ＨＩＶ Ｇａｇの完全長ＨＩＶ Ｇａｇ、ｐ３９、およびｐ２４ペプチドに対する、ＩＦＮ−γ応答を示すデータのグラフ表示である。 抗体応答を示すデータのグラフ表示である。 抗体応答を示すデータのグラフ表示である。 終点滴定を示すデータのグラフ表示である。 終点滴定を示すデータのグラフ表示である。 ペプチドＨＩＶ−Ｇａｇの略図である。 抗原−多面体（ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ）の効率的な生成を示すデータの写真表現である。図９Ａは、１００μｇのＭｉｃｒｏＣｕｂｅのＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析である。結晶は精製して均質にされ、質量分析法によって、３本の可視バンドは全てポリへドリンタンパク質であることが確認された。図９Ｂは、成功裏の組み込みを示す、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）産生組換えＧａｇおよびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのウエスタンブロット分析である。図９Ｃおよび図９Ｄは、抗原の組み込みは、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの結晶性マトリックスを妨害しないことを示す。 ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ中への２つの抗原の同時組み込みを示す画像である。図１０Ａおよび図１０Ｂは、ＨＩＶ−１ ＧａｇおよびＥＧＦＰの双方を含有する、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの明視野および蛍光顕微鏡の写真表現である。図１０Ｃは、ＦＡＣＳによる二重組み込みの定量化のグラフ表示である。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの４２％は、ＨＩＶ−１ ＧａｇおよびＥＧＦＰの双方を含有する。 マウス免疫原性実験におけるＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに対する、頑強な体液性および細胞性応答のグラフ表示である。図１１Ａは、０、７、および１０週目における、５μｇの可溶性ＧａｇまたはＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅで免疫化されたマウス（ｎ−８）からの血清のＥＬＩＳＡである。被覆抗原は、可溶性Ｇａｇである。 マウス免疫原性実験におけるＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに対する、頑強な体液性および細胞性応答のグラフ表示である。図１１Ｂは、１μｇの溶性ＧａｇまたはＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅで免疫化されたマウス（ｎ−８）からの脾細胞のＩＬ−２およびＩＦＮ−γ ＥＬＩＳＰＯＴ応答である。差し込み図で言及されるように、５×１０^５脾細胞は、ｐ５５、ｐ３９、ｐ２４、プールされたペプチドＩおよびＩＩ、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ、およびＧａｇ−ＭｉｃｒｏＣｕｂｅで刺激された。培養液のみを陰性対照、Ｃｏｎ Ａを陽性対照として使用した（図示せず）。点線を超える値（５０ＳＦＣ／１０^６細胞）は、バックグラウンドよりも顕著に高い。 ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ中のＧａｇが、熱変性およびタンパク質分解から保護されることを示すデータの写真表示である。図１２Ａでは、可溶性ＧａｇおよびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅを２１℃で０〜１１週間インキュベートした。ウエスタンブロット分析で、３〜１１週目にかけて可溶性Ｇａｇの分解が明らかになったのに対し、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの顕著な分解は観察されない。図１２Ｂは、ヒト血清中において３７℃で２週間インキュベートしたＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのウエスタンブロットである。図１２Ｃおよび図１２Ｄは、１０μｇ／ｍＬのトリプシンと共にインキュベートした、可溶性ＧａｇおよびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのウエスタンブロット分析である。 Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの免疫原性が、２１℃において、およびトリプシンとのインキュベーション後に、維持されたことを図示する。図１３Ａは、注入前に、様々な温度で１週間インキュベートされた、およびトリプシンあり（ＴＴ）またはなし（ＮｏＴＴ）で３７℃で１時間インキュベートされた、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのウエスタンブロット分析である。ＴＴサンプルは、トリプシン消化によるＧａｇ損失量の過大評価が原因で、わずかにより多くのＧａｇを含有する。 Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの免疫原性が、２１℃において、およびトリプシンとのインキュベーション後に、維持されたことを図示する。図１３Ｂは、対応するＩＦＮ−γおよびＩＬ−２ ＥＬＩＳＰＯＴである。点線を超える値（５０ＳＦＣ／１０^６細胞）は、バックグラウンドよりも顕著に高い。 Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅによるヒトＴ細胞の再刺激を示すデータのグラフ表示である。ＰＢＭＣは、ＨＩＶ陽性ドナー（被験者ＡおよびＢ）およびＨＩＶ陰性ドナー（被験者Ｃ）から単離され、ペプチド、タンパク質（ｐ５５）またはＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｇａｇ−ＣＰＶまたはＣＰＶ）、ＰＨＡと抗ＣＤ３をはじめとする対照で再刺激した。ＩＦＮ−γＴ細胞応答をＥＬＩＳｐｏｔ分析によって測定し、１×１０^６細胞あたりの応答としてプロットした。 ＭｉｃｒｏＣｕｂｅがヒトＰＢＭＣ中で、カスパーゼ−１依存性に、食作用を要して、ＩＬ−１βの放出を誘導することを示すデータのグラフ表示である。図１５Ａでは、ヒトＰＢＭＣ１０^６／ｍｌを３時間にわたりＬＰＳ（１００ｐｇ／ｍｌ）で初回刺激し、または未処理のままにして、引き続いてＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｂｍ−ＣＰＶ）で刺激した。６時間後、ＥＬＩＳＡによって上清をＩＬ−１β生成について評価した。図１５Ｂでは、初回刺激されたＰＢＭＣをＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｂｍ−ＣＰＶ）、ミョウバン、シリカ結晶、またはニゲリシンで刺激した。刺激の６時間後、ＥＬＩＳＡによって上清をＩＬ−１βについて分析した。全てのデータは、４人の独立したドナーからのものである。 ＭｉｃｒｏＣｕｂｅがヒトＰＢＭＣ中で、カスパーゼ−１依存性に、食作用を要して、ＩＬ−１βの放出を誘導することを示すデータのグラフ表示である。図１５Ｃでは、初回刺激されたＰＢＭＣを増大していく用量で、食作用阻害剤ラトランクリンＡで処理し、引き続いてＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｂｍ−ＣＰＶ）、ニゲリシンまたはミョウバンで刺激した。刺激の６時間後に、ＥＬＩＳＡによってＩＬ−１β放出を測定した。図１５Ｄでは、カスパーゼ−１阻害剤ｚ−ＹＶＡＤ（１０μＭ）の存在下または不在下で、ヒトＬＰＳ初回刺激ＰＢＭＣをＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｂｍ−ＣＰＶ）で刺激した。６時間後、ＥＬＩＳＡによって上清をＩＬ−１βについて評価した。全てのデータは、４人の独立したドナーからのものである。 成熟ＩＬ−１βのＭｉｃｒｏＣｕｂｅ媒介放出が、ＮＡＬＰ３インフラマソームによって媒介されることを示す、データのグラフ表示である。図１６Ａでは、野生型マウスの不死化骨髄由来マクロファージをＬＰＳ（１００ｎｇ／ｍｌ）で３時間初回刺激して、引き続いて低下していく量のＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｂｍ−ＣＰＶ）またはニゲリシンで刺激した。刺激の６時間後、ＥＬＩＳＡによって上清をＩＬ−１βについて分析した（上清）。図１６Ｂでは、不死化ＷＴ、ＡＳＣ−欠乏またはＮＡＬＰ３−欠乏ＢＭＭをＬＰＳで３時間初回刺激し、引き続いて低下していく濃度のＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｂｍ−ＣＰＶ）でさらに６時間刺激した。次にＥＬＩＳＡによって上清を成熟ＩＬ１β分泌について評価した。全て、三連で実施されたｎ＝３を表す。

特定のスクリーニング手順、特定の配合物、および様々な医療技法は変動してもよいので、本発明はこれらに限定されない。

特に断りのない限り、本明細書で使用される全ての技術的および科学的用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものに類似し、またはそれと同等のあらゆる材料と方法を使用して、本発明を実施し得てまたは試験し得る。実務家は、特に、Ｒｅａｍ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ：Ａｎ Ｉｎｔｅｎｓｉｖｅ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｃｏｕｒｓｅ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９９８；Ｎｅｗｔｏｎ ａｎｄ Ｇｒａｈａｍ ｅｄｓ．，ＰＣＲ，Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｔｏ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ Ｓｅｒｉｅｓ，２ｎｄ ｅｄ．，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｖｅｒｌａｇ，１９９７；Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８９；Ｃｏｌｉｇａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．１９９５−１９９７の特に第１、５、および６章；およびＡｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１９３（１）：９９−１０７，１９９９；Ｃｏｌｏｗｉｃｋ ａｎｄ Ｋａｐｌａｎ，ｅｄｓ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．；Ｗｅｉｒ ａｎｄ Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ，ｅｄｓ．，Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌｓ．Ｉ−ＩＶ，Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ，１９８６；Ｊｏｋｌｉｋ ｅｄ．，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，３ｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９８８；Ｆｉｅｌｄｓ ａｎｄ Ｋｎｉｐｅ，ｅｄｓ，Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，２ｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１；Ｆｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，３ｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，Ｐａ，１９９６；Ｍｏｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．７４（１）：９９−１０２，１９９３；Ｉｋｅｄａ ｅｔ ａｌ．，２００６（前出）；米国特許出願公開第２００６／０１５５１１４号明細書；国際公開第２００８／１１０５６７２号パンフレットを参照されたい。

本明細書中でのウイルスまたはウイルス抗原への言及は、制限なしに、あらゆるウイルス科のウイルスまたはそれからの抗原を含む。ウイルス科の非限定的例としては、アデノウイルス科（Ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、アフリカ豚コレラ様ウイルス、アレナウイルス科（Ａｒｅｎａｖｉｒｉｄａｅ）、アルテリウイルス属（Ａｒｔｅｒｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス科（Ａｓｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ）、バキュロウイルス科（Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｉｄａｅ）、ビルナウイルス科（Ｂｉｒｎａｖｉｒｉｄａｅ）、ブニヤウイルス科（Ｂｕｎｙａｖｉｒｉｄａｅ）、カリシウイルス科（Ｃａｌｉｃｉｖｉｒｉｄａｅ）、サーコウイルス科（Ｃｉｒｃｏｖｉｒｉｄａｅ）、コロナウイルス科（Ｃｏｒｏｎａｖｉｒｉｄａｅ）、デルタウイルス（Ｄｅｌｔａｖｉｒｕｓ）、フィロウイルス科（Ｆｉｌｏｖｉｒｉｄａｅ）、フラビウイルス科（Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ）、ヘパドナウイルス科（Ｈｅｐａｄｎａｖｉｒｉｄａｅ）、ヘペウイルス科（Ｈｅｐｅｖｉｒｉｄａｅ）、ヘルペスウイルス科（Ｈｅｒｐｅｓｖｉｒｉｄａｅ）、オルソミクソウイルス科（Ｏｒｔｈｏｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅ）、パラミクソウイルス科（Ｐａｒａｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅ）、ピコルナウイルス科（Ｐｉｃｏｒｎａｖｉｒｉｄａｅ）、ポックスウイルス科（Ｐｏｘｖｉｒｉｄａｅ）、レオウイルス科（Ｒｅｏｖｉｒｉｄａｅ）、レトロウイルス科（Ｒｅｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ）、およびラブドウイルス科（Ｒｈａｂｄｏｖｉｒｉｄａｅ）が挙げられる。特に、パラミクソウイルス科（Ｐａｒａｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅ）、レトロウイルス科（Ｒｅｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ）、およびフィロウイルス科（Ｆｉｌｏｖｉｒｉｄａｅ）からのウイルスである。

いくつかの実施形態では、ウイルスとしては、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、クラミジア、アデノウイルス科、マストアデノウイルス、トリアデノウイルス、ヘルペスウイルス科、単純ヘルペスウイルス１、単純ヘルペスウイルス２、単純ヘルペスウイルス５、単純ヘルペスウイルス６、レビウイルス科、レビウイルス、腸内細菌ファージＭＳ２、アロレビウイルス、ポックスウイルス科、脊椎動物ポックスウイルス亜科、パラポックスウイルス、アビポックスウイルス、カプリポックスウイルス、レポリポックスウイルス、スイポックスウイルス、伝染性軟属腫ウイルス、昆虫ポックスウイルス亜科、パポバウイルス科、ポリオーマウイルス、パピローマウイルス、パラミクソウイルス科、パラミクソウイルス、パラインフルエンザウイルス１、モルビリウイルス、麻疹ウイルス、ルブラウイルス、おたふく風邪ウイルス、ニューモノウイルス亜科、肺炎ウイルス、メタニューモウイルス、トリニューモウイルス、ヒトメタニューモウイルス、ピコルナウイルス科、腸内ウイルス、ライノウイルス、ヘパトウイルス、ヒトＡ型肝炎ウイルス、カルジオウイルス、口蹄疫ウイルス、レオウイルス科、オルトレオウイルス、オルビウイルス、ロタウイルス、サイポウイルス、フィジウイルス、フィトレオウイルス、オリザウイルス、レトロウイルス科、哺乳類Ｂ型レトロウイルス、哺乳類Ｃ型レトロウイルス、トリＣ型レトロウイルス、Ｄ型レトロウイルス群、ＢＬＶ−ＨＴＬＶレトロウイルス、レンチウイルス、ヒト免疫不全ウイルス１、ヒト免疫不全ウイルス２、スプマウイルス、フラビウイルス科、Ｃ型肝炎ウイルス、ヘパドナウイルス科、Ｂ型肝炎ウイルス、トガウイルス科、アルファウイルス、シンドビスウイルス、ルビウイルス、風疹ウイルス、ラブドウイルス科、ベシクロウイルス、リッサウイルス、エフェメロウイルス、レタス壊死性黄変病ウイルス、ヌクレオラブドウイルス、アレナウイルス科、アレナウイルス、リンパ球脈絡髄膜炎ウイルス、Ｉｐｐｙ（イッピイ）ウイルス、ラッサウイルス、コロナウイルス科、コロナウイルス、およびトロウイルスから選択されるウイルスが挙げられる。

例示的な病原性ウイルスとしては、ＨＩＶ、ＨＳＶ、クラミジア、ＳＡＲＳ、ＲＳＶ、デングウイルス、およびインフルエンザが挙げられる。別の例示的な病原体は、プラスモジウム（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ）種などのアピコンプレックス門の寄生生物である。本発明の様々な態様に従って、抗原または病原体または病状をポリへドリン標的化ポリペプチドと組み合わせてもよい。

特定の実施形態では、抗原は、少なくともある種の対象において、効果的な免疫応答を発生させ、または生成を促進することが提案される、ポリペプチドまたはペプチドである。いかなる特定の理論または作用様式によっても制限されることなく、検討中の複合体は、抗原の三次元構造を安定化およびまたは保護して、抗体に、効果的な免疫応答生成のための、実施形態によっては中和抗体生成、免疫応答および抗体スクリーニングをするための改善されたビヒクルを提供することが提案される。診断またはスクリーニングのための抗体の調製において、効果的な免疫応答は、一般に、ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ、ＲＡＰＩＤなどの抗体を用いた標準プロトコルにおいて有用な試薬であるための十分な親和性がある抗体を生成するものである。いくつかの実施形態では、抗原は、当該技術分野で、防御または中和免疫応答生成のために、有用でありまたは潜在的に有用であると見なされる。一連の例示的な公知の標的抗原が、本明細書に記載される。別の実施形態では、本発明は、例えば、感染対象からの抗体を中和することで、認識された新しい有用な抗原および立体構造エピトープを特性評価できるようにする。

本明細書に記載されまたは参照される方法を使用して、病原体またはがんのあらゆるウイルス抗原または非ウイルス抗原を改変してもよい。

「抗原」または「免疫原」または「抗原性」または「免疫原性」は、免疫系を刺激して、体液性および／または細胞性抗原特異反応を生じる（直鎖、立体構造のいずれかまたは双方の）１つまたは複数のエピトープを含有する分子を指す。一般に、Ｂ細胞エピトープは少なくとも約５個のアミノ酸を含むが、３〜４個のアミノ酸程度に小さくてもよい。細胞溶解性Ｔ細胞（ＣＴＬ）エピトープなどのＴ細胞エピトープは、少なくとも約７〜９個のアミノ酸を含み、およびヘルパーＴ細胞エピトープは、少なくとも約１２〜２０個のアミノ酸を含む。常態では、エピトープは、９、１０、１２または１５個のアミノ酸など、約７〜１５個のアミノ酸を含む。「抗原」という用語は、サブユニット抗原（すなわち抗原が自然界で関連する生物全体から切り離された分離した抗原）、ならびに死滅、弱毒化または不活性化細菌、ウイルス、真菌、寄生生物またはその他の微生物の双方を意味する。抗イディオタイプ抗体などの抗体、またはその断片、および抗原または抗原性決定因子を模倣し得る合成ペプチドミモトープもまた、本明細書の用法で抗原の定義下に捕らえられる。「抗原」は、１つまたは複数の種、亜種、型、分岐群、変種、分離株などおよび／または１つまたは複数の病原体および／または１つまたは複数のがん抗原の１つまたは複数のエピトープを含んでなってもよい。いくつかの実施形態では、「抗原」への言及は、腫瘍抗原を除く、ヒトにおいて発現される核酸分子によってコードされるヒトまたは哺乳類抗原を含まない。いくつかの実施形態では「抗原」は、ヒトにおいて発現される常在性核酸分子によってコードされる抗原を含まない。

例示的な抗原としては、インフルエンザウイルス赤血球凝集素、ヒト呼吸器合胞体ウイルスＧ糖タンパク質、コアタンパク質、デングウイルスのマトリックスタンパク質またはその他のタンパク質、はしかウイルス赤血球凝集素、単純ヘルペスウイルス２型糖タンパク質ｇＢ、ポリオウイルスＩ ＶＰ１、ＨＩＶ−ＩまたはＨＩＶ−ＩＩの外被またはカプシド糖タンパク質、Ｂ型肝炎表面抗原、ジフテリア毒素、連鎖球菌２４Ｍエピトープ、淋菌ピリン、仮性狂犬病ウイルスｇ５０（ｇｐＤ）、仮性狂犬病ウイルスＩＩ（ｇｐＢ）、仮性狂犬病ウイルスｇＩＩＩ（ｇｐＣ）、仮性狂犬病ウイルス糖タンパク質Ｈ、仮性狂犬病ウイルス糖タンパク質Ｅ、伝染性胃腸炎糖タンパク質１９５、伝染性胃腸炎マトリックスタンパク質、ブタロタウイルス糖タンパク質３８、ブタパルボウイルスカプシドタンパク質、セルプリナ・ヒオディセンテリア（Ｓｅｒｐｕｌｉｎａ ｈｙｏｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ）防御抗原、ウシウイルス性下痢糖タンパク質５５、ニューカッスル病ウイルス赤血球凝集素−ノイラミニダーゼ、豚インフルエンザ赤血球凝集素、豚インフルエンザノイラミニダーゼ、口蹄疫ウイルス、豚コレラウイルス、豚インフルエンザウイルス、アフリカ豚コレラウイルス、マイコプラズマ・ヒオニューモニエ（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ ｈｙｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、ウシ伝染性鼻気管炎ウイルス、ウシ伝染性鼻気管炎ウイルス糖タンパク質Ｅ、糖タンパク質Ｇ、伝染性喉頭気管炎ウイルス、伝染性喉頭気管炎ウイルス糖タンパク質Ｇまたは糖タンパク質Ｉ、ラクロスウイルスの糖タンパク質、新生子ウシの下痢ウイルス、ベネズエラウマ脳脊髄炎ウイルス、プンタトロウイルス、マウス白血病ウイルス、マウス乳腺腫瘍ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルスコアタンパク質およびＢ型肝炎ウイルス表面抗原またはその断片または誘導体、ウマインフルエンザウイルスＡ／Ａｌａｓｋａ ９１型ノイラミニダーゼとウマインフルエンザウイルスＡ／Ｍｉａｍｉ ６３型ノイラミニダーゼとウマインフルエンザウイルスＡ／Ｋｅｎｔｕｃｋｙ ８１型ノイラミニダーゼウマヘルペスウイルス１型糖タンパク質Ｂとウマヘルペスウイルス１型糖タンパク質Ｄをはじめとするウマインフルエンザウイルスまたはウマヘルペスウイルスの抗原、ウシ呼吸器合胞体ウイルスまたはウシパラインフルエンザウイルスの抗原、ウシ呼吸器合胞体ウイルス付着タンパク質（ＢＲＳＶ Ｇ）、ウシ呼吸器合胞体ウイルス融合タンパク質（ＢＲＳＶ Ｆ）、ウシ呼吸器合胞体ウイルスヌクレオカプシドタンパク質（ＢＲＳＶＮ）、ウシパラインフルエンザウイルス３型融合タンパク質、ウシパラインフルエンザウイルス３型赤血球凝集素ノイラミニダーゼ、ウシウイルス性下痢ウイルス糖タンパク質４８および糖タンパク質５３．から選択されるものが挙げられる。

例示的ながん抗原としては、ＫＳ１／４汎がん抗原；卵巣がん抗原（ＣＡ１２５）；前立腺酸性ホスファターゼ；前立腺特異的抗原；メラノーマ関連抗原ｐ９７；メラノーマ抗原ｇｐ７５；高分子量メラノーマ抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）；前立腺特異的膜抗原；がん胎児性抗原（ＣＥＡ）；多形性上皮性ムチン抗原、ヒト乳脂肪球抗原；ＣＥＡ、ＴＡＧ−７２、ＬＥＡなどの結腸直腸腫瘍関連抗原；バーキットリンパ腫抗原−３８．１３、ＣＤ１９；ヒトＢリンパ腫抗原−ＣＤ２０、ＣＤ３３；ガングリオシドＧＤ２、ガングリオシドＧＤ３、ガングリオシドＧＭ２、ガングリオシドＧＭ３などのメラノーマ特異的抗原；腫瘍特異的移植型細胞表面抗原（ＴＳＴＡ）；Ｔ抗原ＤＮＡ腫瘍ウイルスなどのウイルス誘導性腫瘍抗原；ＲＮＡ腫瘍ウイルスのエンベロープ抗原；がん胎児性抗原−α−フェトプロテイン；大腸のＣＥＡ；膀胱腫瘍がん胎児性抗原；分化抗原；ヒト肺がん抗原Ｌ６、Ｌ２０；線維肉腫の抗原；ヒト白血病Ｔ細胞抗原−Ｇｐ３７；ネオ糖タンパク質；スフィンゴ脂質；乳がん抗原；ＥＧＦＲ（表皮成長因子受容体）；ＨＥＲ２抗原；多形性上皮性ムチン；悪性ヒトリンパ球抗原−ＡＰＯ−１；胎児赤血球に見られるＩ抗原、一次内胚葉、成人赤血球に見られるＩ抗原、着床前胚、胃腺がんに見られるＩ（Ｍａ）、乳房上皮に見られるＭ１８とＭ３９、骨髄性細胞に見られるＳＳＥＡ−１、結腸直腸がんに見られるＶＥＰ８とＶＥＰ９とＭｙｌとＶＩＭ−Ｄ５とＤｕ５６−２２、ＴＲＡ−１−８５（血液型Ｈ）、結腸腺がんに見られるＣ１４、肺腺がんに見られるＦ３、胃がんに見られるＨ６、Ｙハプテン、胎生期がん細胞に見られるＬｅＹ、ＴＬ５（血液型Ａ）、Ａ４３１細胞に見られるＧＦ受容体、膵臓がんに見られるＥｌｓｅｒｉｅｓ（血液型Ｂ）、胎生期がん細胞に見られるＦＣ１０．２、胃腺がん抗原、腺がんに見られるＣＯ−５１４（血液型Ｌｅａ）、腺がんに見られるＮＳ−１０、ＣＯ−４３（血液型Ｌｅｂ）、Ａ４３１細胞のＥＧＦ受容体に見られるＧ４９、結腸腺がんに見られるＭＨ２（血液型ＡＬｅｂ／Ｌｅｙ）、大腸がんに見られる１９．９、胃がんムチン、骨髄性細胞に見られるＴｓＡ７、メラノーマに見られるＲ２４、胎生期がん細胞に見られる４．２、ＧＤ３、Ｄ１．１、ＯＦＡ−１、ＧＭ２、ＯＦＡ−２、ＧＤ２、およびＭ１：２２：２５：８、そして４〜８細胞期の胚に見られるＳＳＥＡ−３とＳＳＥＡ−４をはじめとする分化抗原が挙げられる。

非ウイルス性病原体および抗原としては、病原性または非病原性真菌、アピコンプレクサ、または単細胞寄生生物、線形動物、吸虫、条虫、および植物病原体または寄生性細菌をはじめとする寄生生物からのものがさらに挙げられる。

例示的な一実施形態では、病原体の１つの重要な群は、コクシジオイデス・イミチス（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ ｉｍｍｉｔｉｓ）、ヒストプラスマ・カプスラーツム（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ ｃａｐｓｕｌａｔｕｍ）、ブラストミセス・デルマティティディス（Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ ｄｅｒｍａｔｉｔｉｄｉｓ）、およびパラコクシジオイデス・ブラジリエンシス（Ｐａｒａｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）などのヒトの原発性全身性病原真菌である。免疫不全宿主に依存する傾向がある重要な日和見病原性真菌としては、クリプトコッカス・ネオフォルマンス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ）、ニューモシスチス・イロベチ（Ｐｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ ｊｉｒｏｖｅｃｉ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）種、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）種、ペニシリウム・マルネッフェイ（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ ｍａｒｎｅｆｆｅｉ）、および接合菌（Ｚｙｇｏｍｙｃｅｔｅｓ）、バイゲル毛芽胞菌（Ｔｒｉｃｈｏｓｐｏｒｏｎ ｂｅｉｇｅｌｉｉ）、およびフザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）種が挙げられる。一連の病原性真菌は、特にＡＩＤＳ患者、化学療法誘導性好中球減少がある患者、または造血性幹細胞移植を受ける患者をはじめとする、免疫不全対象と関連付けられている。

いくつかの実施形態では、病原体は、細菌、真菌、ウイルス、藻類、（外部または内部寄生生物をはじめとする）寄生生物、プリオン、卵菌綱、粘菌、線形動物、マイコプラズマなどをはじめとする微生物である。非限定的例として、微生物は、以下の目、属または種の１つまたは複数から選択される。アシネトバクター（Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ）、アクチノバチルス（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、放線菌（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｓ）、アクチノミセス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ）、アエロモナス（Ａｅｒｏｍｏｎａｓ）、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）、ボレリア（Ｂｏｒｒｅｌｉａ）、ブルセラ（Ｂｒｕｃｅｌｌａ）、ブルコルデリア（Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ）、カンピロバクター（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、シトロバクター（Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、エンテロバクター（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ）、腸球菌（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、エリシペロスリクス（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｈｒｉｘ）、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、フランシセラ（Ｆｒａｎｃｉｓｅｌｌａ）、ヘモフィルス（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ヘリコバクター（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ）、クレブシエラ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ）、レジオネラ（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ）、レプトスピラ（Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａ）、リステリア（Ｌｉｓｔｅｒｉａ）、ミクロコッカス（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ）、モラクセラ（Ｍｏｒａｘｅｌｌａ）、モルガネラ（Ｍｏｒｇａｎｅｌｌａ）、マイコバクテリウム（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）（結核）、ノカルジア（Ｎｏｃａｒｄｉａ）、ナイセリア（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ）、パスツレラ（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ）、プレジオモナス（Ｐｌｅｓｉｏｍｏｎａｓ）、プロピオニバクテリウム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、プロテウス（Ｐｒｏｔｅｕｓ）、プロビデンシア（Ｐｒｏｖｉｄｅｎｃｉａ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、ロドコッカス（Ｒｈｏｄｏｃｏｃｃｕｓ）、サルモネラ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）、セラチア（Ｓｅｒｒａｔｉａ）、赤痢菌（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）、ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ステノトロホモナス（Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ）、連鎖球菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、トレポネーマ（Ｔｒｅｐｏｎｅｍａ）、ビブリオ（Ｖｉｂｒｉｏ）（コレラ）およびエルシニア（Ｙｅｒｓｉｎｉａ）（腺ペスト）、アデノウイルス科（Ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、アフリカ豚コレラ様ウイルス、アレナウイルス科（ウイルス性出血熱、ラッサ熱など）、アストロウイルス科（Ａｓｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ）（アストロウイルス）、ブニヤウイルス属（Ｂｕｎｙａｖｉｒｉｄａｅ）（ラクロス）、カリシウイルス科（Ｃａｌｉｃｉｖｉｒｉｄ）（ノロウイルス）、コロナウイルス科（Ｃｏｒｏｎａｖｉｒｉｄａｅ）（コロナウイルス）、フィロウイルス科（Ｆｉｌｏｖｉｒｉｄａｅ）（エボラウイルス、マールブルグウイルスなど）、パルボウイルス科（Ｐａｒｖｏｖｉｒｉｄａｅ）（Ｂ１９ウイルス）、フラビウイルス科（Ｃ型肝炎ウイルス、デングウイルスなど）、ヘパドナウイルス科（Ｂ型肝炎ウイルス、デルタウイルスなど）、ヘルペスウイルス科（Ｈｅｒｐｅｓｖｉｒｉｄａｅ）（単純ヘルペスウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス）、オルソミクソウイルス科（Ｏｒｔｈｏｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅ）（インフルエンザウイルス）、パポバウイルス科（Ｐａｐｏｖａｖｉｒｉｄａｅ）（乳頭腫ウイルス）、パラミクソウイルス科（ヒトパラインフルエンザウイルス、おたふく風邪ウイルス、はしかウイルス、ヒト呼吸器合胞体ウイルスなど）、ピコルナウイルス科（感冒ウイルス）、ポックスウイルス科（Ｐｏｘｖｉｒｉｄａｅ）（天然痘ウイルス、オルフウイルス、サル痘ウイルス）レオウイルス科（Ｒｅｏｖｉｒｉｄａｅ）（ロタウイルス）、レトロウイルス科（ヒト免疫不全ウイルス）、パルボウイルス科（Ｐａｖｏｖｉｒｕｓｅｓ）（パルボウィルス）、パピローマウイルス科（Ｐａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｉｄａｅ）（パピローマウイルス）アルファウイルスおよびラブドウイルス科（Ｒｈａｂｄｏｖｉｒｉｄａｅ）（狂犬病ウイルス）、トリパノソーマ（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａ）、リーシュマニア（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ）、ジアルジア（Ｇｉａｒｄｉａ）、トリコモナス（Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ）、エントアメーバ（Ｅｎｔａｍｏｅｂａ）、ネグレリア（Ｎａｅｇｌｅｒｉａ）、アカントアメーバ（Ａｃａｎｔｈａｍｏｅｂａ）、プラスモジウム（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ）、トキソプラスマ（Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ）、クリプトスポリジウム（Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）、イソスポラ（Ｉｓｏｓｐｏｒａ）、バランチジウム（Ｂａｌａｎｔｉｄｉｕｍ）、シストソーマ（Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ）、エキノストーマ（Ｅｃｈｉｎｏｓｔｏｍａ）、ファシオロプシス（Ｆａｓｃｉｏｌｏｐｓｉｓ）、クロノルキス（Ｃｌｏｎｏｒｃｈｉｓ）、ファスキオラ（Ｆａｓｃｉｏｌａ）、オピストルキス（Ｏｐｉｓｔｈｏｒｃｈｉｓ）およびパラゴニムス（Ｐａｒａｇｏｎｉｍｕｓ）、擬葉目（Ｐｓｅｕｄｏｐｈｙｌｌｉｄｅａ）（例えば、ジフィロボスリウム（Ｄｉｐｈｙｌｌｏｂｏｔｈｒｉｕｍ））、および円葉目（Ｃｙｃｌｏｐｈｙｌｌｉｄｅａ）（例えば、テニア（Ｔａｅｎｉａ））。病原性の線形動物としては、以下の目からの種が挙げられる。桿線虫目（Ｒｈａｂｄｉｔｉｄａ）（例えば、糞線虫類（Ｓｔｒｏｎｇｙｌｏｉｄｅｓ））、円虫目（Ｓｔｒｏｎｇｙｌｉｄａ）（例えば、アンシロストーマ属（Ａｎｃｙｌｏｓｔｏｍａ））、回虫類（Ａｓｃａｒｉｄａ）（例えば、アスカリス属（Ａｓｃａｒｉｓ）、トキソカラ属（Ｔｏｘｏｃａｒａ））、旋尾線虫目（Ｓｐｉｒｕｒｉｄａ） （例えば、ドラクンクルス属（Ｄｒａｃｕｎｃｕｌｕｓ）、ブルギア属（Ｂｒｕｇｉａ）、オンコセルカ属（Ｏｎｃｈｏｃｅｒｃａ）、ウケレリア属（Ｗｕｃｈｅｒｅｒｉａ））、および双器綱Ａｄｅｎｏｐｈｏｒｅａ （例えば、鞭虫属（Ｔｒｉｃｈｕｒｉｓ）および旋毛虫属（Ｔｒｉｃｈｉｎｅｌｌａ））、プロトセカ属（Ｐｒｏｔｏｔｈｅｃａ）およびフィエステリア属（Ｐｆｉｅｓｔｅｒｉａ）、アブシディア属（Ａｂｓｉｄｉａ）、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、ブラストミセス属（Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ）、カンジダ属（Ｃａｎｄｉｄａ）（酵母）、クラドフィアロフォラ属（Ｃｌａｄｏｐｈｉａｌｏｐｈｅｒａ）、コクシジオイデス（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ）、クリプトコッカス属（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、クニンガメラ属（Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍｅｌｌａ）、フザリウム属（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、ヒストプラスマ属（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ）、マズレラ属（Ｍａｄｕｒｅｌｌａ）、マラセジア属（Ｍａｌａｓｓｅｚｉａ）、小胞子菌属（Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｕｍ）、ケカビ属（Ｍｕｃｏｒ）、ペシロミセス属（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ）、パラコクシジオイデス属（Ｐａｒａｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ）、ペニシリウム属（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、ニューモシスチス属（Ｐｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ）、シュードアレシェリア属（Ｐｓｅｕｄａｌｌｅｓｃｈｅｒｉａ）、クモノスカビ属（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ）、ロドトルラ属（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）属、セドスポリウム属（Ｓｃｅｄｏｓｐｏｒｉｕｍ）、スポロトリクス属（Ｓｐｏｒｏｔｈｒｉｘ）、トリコフィトン属（Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ）、およびトリコスポロン属（Ｔｒｉｃｈｏｓｐｏｒｏｎ）。不確かさを回避するために病原体は、新興または再興病原体または、これまで特定の対象の病原体として同定されたことがない生物を含むこともできる。

本明細書における「結合」への言及は、共有結合および非共有結合を含む。例証実施形態では、結合は、融合タンパク質の直鎖構成要素の間などの共有結合である。別の共有結合は、ジスルフィド塩基である。「融合」は、共有結合を指す。

「合成」配列は、本明細書の用法では、通常、発現を最適化するために、その発現が、例えばコドン置換、阻害配列の欠失、置換および／または不活性化によって、本明細書に記載されるように最適化されているポリヌクレオチドを含む。「野生型」または「未変性」または「天然」配列は、本明細書の用法では、本質的に天然に見られるそのままのポリペプチドをコードする配列を指す。

組換えポリペプチドおよび抗原は、好都合には、例えばＳａｍｂｒｏｏｋ， ｅｔ ａｌ．，１９８９（前出）の特に１６および１７節；Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，１９９４（前出）の特に第１０および１６章；およびＣｏｌｉｇａｎ ｅｔ ａｌ．，ＣｕｒｒｅｎｔＰｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ，ＪｏｈｎＷｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．１９９５−１９９７の特に第１、５、および６章に記載されるようにして、標準プロトコルを使用して調製し得る。ポリへドリン標的化ペプチドおよびポリへドリンをコードする発現ベクターを含んでなる、ＡｃＣＰ−Ｈなどの融合タンパク質については、Ｉｋｅｄａ ｅｔ ａｌ．，２００６（前出）；米国特許出願公開第２００６／０１５５１１４号明細書；Ｍｏｒｉ ｅｔ ａｌ．，１９９３（前出）；国際公開第２００８／１１０５６７２号パンフレットに記載される。ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、例えば、Ａｔｈｅｒｔｏｎ ａｎｄ Ｓｈｅｐｈａｒｄの第９章（前出）およびＲｏｂｅｒｇｅ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２６９（５２２１）：２０２−２０４，１９９５に記載されるように、例えば溶液合成または固相合成を使用した化学合成によって合成されてもよい。

医薬組成物は、好都合には従来の医薬品調剤技術に従って調製される。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄ．，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，Ｕ．Ｓ．Ａ．，１９９０を参照されたい。組成物は、活性薬剤または活性薬剤の薬学的に許容可能な塩を含有してもよい。これらの組成物は、活性物質の１つに加えて、薬学的に許容可能な賦形剤、キャリア、緩衝液、安定剤または当該技術分野で周知のその他の材料を含んでなってもよい。このような材料は無毒であるべきで、活性成分の有効性に干渉してならない。キャリアは、例えば静脈内、経口または非経口などの投与のために所望される調製品の形態に応じて、多種多様な形態を取ってもよい。

「薬学的に許容できるキャリア」および／または希釈剤は、不都合でない、すなわち単独でまたは活性薬剤と一緒になって実質的な有害反応を引き起こす可能性が低い材料からなる、薬学的ビヒクルである。キャリアとしては、全ての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌性および抗真菌作用物質、浸透圧を調節し、吸収またはクリアランス速度を増大または低下させる作用物質、ｐＨを維持するための緩衝液、キレート剤、膜または障壁横断作用物質が挙げられる。薬学的に許容可能な塩は、不都合でない塩である。作用物質、または作用物質を含んでなる組成物は、酸付加塩または金属錯体などの薬学的に許容可能な無毒の塩の形態で投与されてもよい。

経口投与のためには、化合物は、カプセル、丸薬、錠剤、ロゼンジ、粉末、懸濁液またはエマルションなどの固体または液体調製品に配合し得る。組成物の経口剤形への調製では、例えば、経口液体調製品（例えば、懸濁液、エリキシル剤、および溶液など）の場合は、水、グリコール、油、アルコール、着香剤、保存料、着色剤、懸濁剤；または経口固体調製品（例えば、粉末、カプセル、および錠剤など）の場合は、デンプン類、糖類、希釈剤、顆粒化作用物質、潤滑剤、バインダー、崩壊剤などのキャリアなどのあらゆる通常の製薬媒体を用いてもよい。それらの投与の容易さのために、錠剤およびカプセルは、最も有利な経口投与単位形態に相当し、その場合、言うまでもなく固体薬学的キャリアが用いられる。錠剤は、トラガカント、コーンスターチまたはゼラチンなどのバインダー；アルギン酸などの崩壊剤；およびステアリン酸マグネシウムなどの潤滑剤を含有してもよい。所望ならば、錠剤は、標準的な技術によって糖衣掛けし、または腸溶コーティングを施してもよい。活性薬剤は、それが胃腸管を安定して通過するようにカプセル化し得る。例えば国際公開第９６／１１６９８号パンフレットを参照されたい。

非経口投与のためには、組成物をキャリアに溶解して、溶液または懸濁液として投与してもよい。作用物質をクモ膜下腔内に投与する場合は、それらを脳脊髄液に溶解してもよい。経粘膜または経皮（パッチをはじめとする）送達では、対象複合体を送達するために、当該技術分野で公知の適切な浸透剤が使用される。吸入では、送達は、乾燥粉末煙霧剤、液体送達系、空気ジェットネブライザー、噴霧剤システムなどのあらゆる都合良いシステムを使用する。例えば、製剤は煙霧剤またはミストの形態で投与し得る。作用物質はまた、持続送達または徐放形式で送達されてもよい。例えば、持続送達できる生分解性微小球またはカプセルまたはその他の高分子配列を製剤に含め得る。処方を修正して、薬物動態および生体内分布を変更し得る。薬物動態学的の一般考察については、例えばＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓを参照されたい。いくつかの実施形態では、製剤は、リポソームまたはミセルなどの脂質単層または二重層に組み込まれてもよい。当該技術分野で公知の標的化治療法を使用して、制限を意図しない例として、抗原提示細胞などの特定の種類の細胞または組織に、より特異的に作用物質を送達してもよい。

投与される活性薬剤の実際の量および投与の速度と経時変化は、疾患または病状の性質と重篤性に左右される。例えば投与量やタイミング決定などの治療の処方は、一般開業医または専門家の任務の範囲内であり、典型的に、個々の患者の病状、送達部位、投与方法、およびその他の医師に既知の要素が考慮される。技術およびプロトコルの例は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（前出）にある。

調製されてもよい持効性製剤は、免疫応答を誘導するのに特に便利である。持効性製剤の例としては、拮抗薬を含有する固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスが挙げられ、そのマトリックスは、例えばフィルムまたはマイクロカプセルなどの造形品の形態である。持効性マトリックスの例としては、ポリエステル、ハイドロゲル（例えば、ポリ（２−ヒドロキシエチル−メタクリルアミド）、またはポリ（ビニルアルコール）、ポリラクチド、Ｌ−グルタミン酸とエチル−Ｌ−グルタメートの共重合体、非分解性エチレン−酢酸ビニル、分解性乳酸−グリコール酸共重合体、およびポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。エチレン−酢酸ビニルおよび乳酸−グリコール酸などのポリマーが分子を１００日間にわたって放出できる一方、特定のハイドロゲルはタンパク質を短時間で放出する。小型（約２００〜８００Å）単層タイプのリポソームを使用してもよく、その中では脂質含量が約３０％コレステロールを超え、選択される比率は最適治療法のために調節される。

スルフヒドリル残基を修飾し、酸性溶液から凍結乾燥し、水分含量を制御し、適切な添加剤を使用し、独自のポリマーマトリックス組成物を開発することで、タンパク質の安定化を達成してもよい。例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）基などのその他の要素の付着をはじめとする、当該技術分野で公知の技術を使用して、タンパク質の生体内半減期を延長してもよい。

当該技術分野で開示されるプライムブースト免疫付与ストラテジーが、明らかに検討される。例えば国際公開第２００３／０４７６１７号パンフレットを参照されたい。したがって組成物は、ワクチン、初回刺激または追加免疫作用物質の形態であってもよい。

タンパク質複合体を直接投与する代わりに、例えばウイルスベクター内または細胞ベースの送達系内で、それらを宿主細胞または導入細胞内で生成し得る。ベクターは、免疫系の要素を標的にし得る。所望標的部位で患者の身体に埋め込むために細胞ベースの送達系がデザインされ、対象融合ポリペプチド、複合体、および多面体のためのコード配列が含有される。代案としては、作用物質は、治療される細胞内で生成されまたは治療される細胞を標的とする活性化剤によって、活性形態に転換される前駆体形態で投与し得る。

免疫応答を誘発する上での対象組成物の様々な用途についてさらに述べると、組成物は、一般に、有効量で、免疫応答を引き起こすのに十分な時間と条件で投与される。本発明の組成物は、単回投与で投与されてもよい。代案としては、組成物は反復投与または適用を伴ってもよい。

「治療的有効量」および「予防的有効量」をはじめとする「有効量」という用語は、本明細書の用法では、本明細書で定義される複合体、または本明細書に記載される細胞または抗体を含んでなる組成物が、所望の治療的または生理学的効果を提供するのに十分な量であり、十分な体液性または細胞性免疫を誘導するなどの生物学的効果を達成するのに十分な量を意味する。所望の生物学的効果としては、症状の軽減または解消、寛解、病原体力価低下、脈管または脳の損傷軽減、鼻汁、発熱の低下が挙げられるが、これに限定されるものではない。例えば副作用などの望ましくない効果が、所望の治療効果と共に、時に発現することもある。したがって医師は、適切な「有効量」を判定する上で、潜在的利点と潜在的リスクの均衡を図る。必要な作用物質の正確な量は、対象の種、年齢、および全身状態、投与様式などに応じて、対象毎に変動する。したがって正確な「有効量」の規定が可能でないこともある。しかしあらゆる個々の症例の適切な「有効量」は、通例の実験法を使用して当業者によって判定されてもよい。当業者は、以前の作用物質の投与、対象のサイズ、対象の症状の重篤性、病原体負荷、および選択された特定の組成物または投与経路などの要素に基づいて、必要な量を決定し得る。

「治療」または「予防法」または「治療法」という用語は、その最も広義の文脈で同義的に使用され、少なくともいくらかの対象における、治療される１つまたは複数の病状の症状における、または特定の病状を発症するリスクにおける、あらゆる測定可能なまたは統計的に有意な改善を含む。予防法は、病状の重篤性または発症、または病状の徴候の低下と見なされてもよい。治療はまた、既存の病状の重篤性を低下させてもよい。ワクチン組成物の投与は、一般に予防的な目的のためである。

いくつかの実施形態では、ワクチンまたは本発明の組成物は、その存在が、少なくとも１株の病原体またはウイルスに対する一次または二次体液性または細胞性応答の少なくとも１つを増強し、または増強を示す、検出可能な変化を受容患者の生理機能にもたらすならば、生理学的に有効である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物が投与されて病原体の感染を防ぐ。「防御」は絶対的でなくてもよく、すなわち対照患者集団またはセットと比較して、統計的に有意な改善があるならば、感染症は完全に予防または根絶されなくてもよい。防御は、ウイルス性またはその他の病原体感染症状の発症、または本明細書に記載されるがんまたはその他の病状の発症の重篤性または迅速性の低下に限定されてもよい。

一実施形態では、本発明のワクチン組成物が、感染症発症前に（予期される感染症を予防または軽減するように）または感染症発症後に、対象に提供され、それによってウイルス感染症から防御する。いくつかの実施形態では、本発明のワクチン組成物が、感染症発症の前後に対象に提供されて、対象間のウイルス伝播を減少させる。

本発明の組成物を唯一の活性医薬品として投与し、または１つまたは複数の作用物質と組み合わせて使用し、病原体感染性またはこのような感染症と関連付けられている症状を治療または予防し得ることもさらに理解されるであろう。

医薬組成物は、具体的事例に左右される量で投与すると、治療活性を呈示することが検討される。変動は例えば、ヒトまたは動物および作用物質の選択に左右される。広範な用量が、適用可能なこともある。対象を考察して、例えば毎日または隔日または毎週または毎月体重１キログラムあたり、約０．１μｇ〜１μｇ（すなわち０．１μｇ、０．２μｇ、０．３μｇ、０．４μｇ、０．５μｇ、０．６μｇ、０．７μｇ、０．８μｇ、および０．９μｇをはじめとする）０．５μｇ〜５０μｇ、１μｇ〜１０μｇ、２μｇ〜２００μｇ、０．１ｍｇ〜１．０ｍｇ（すなわち０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、０．５ｍｇ、０．６ｍｇ、０．７ｍｇ、０．８ｍｇ、および０．９ｍｇをはじめとする）、約１５ｍｇ〜３５ｍｇ、約１ｍｇ〜３０ｍｇまたは５〜５０ｍｇ、または１０ｍｇ〜１００ｍｇの作用物質を投与してもよい。予防的な組成物をはじめとする治療薬は約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇの投与量で投与してもよいが、この量を超えるまたはそれ未満の投与量が、上に列挙した範囲内で検討される。投薬計画を調節して、最適治療反応を提供してもよい。例えば、いくつかの分割用量を日毎、週毎、月毎、またはその他の適切な時間間隔で投与してもよく、または状況の要件によって示唆されるように、用量を比例的に低減してもよい。組成物を徐放性製剤中で投与することもまた可能である。医薬品は、好都合には錠剤、カプセル、粉末などの単位用量形態で提供される。

組成物、複合体、抗体、および細胞は、経口、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、皮内、くも膜下腔内または坐薬手段または（例えば徐放分子を使用した）埋め込みなどによって、都合良い様式で投与してもよい。投与は、全身性または局所性であってもよい。全身性への言及は、静脈内、腹腔内、皮下注射、輸液、ならびに経口、直腸、膣、および鼻孔を介した、または吸入による投与を含む。その他の検討される投与手段は、パッチ、細胞転移、埋め込み、舌下、眼内、局所または経皮による。

いくつかの実施形態では、経口または経鼻投与が検討される。毛細血管はおよそ５μｍの直径を有して、直径が約１μｍよりも小さい複合体の投与を可能にする。５μｍを超える多面体は、皮下または筋肉内に、または当該技術分野で公知のその他の都合良い手段によって投与されてもよい。多面体は、慣例的にサイズに基づいて分けられる。

機能的変種および誘導体は、「生物学的に活性な一部」または「生物学的に活性な部分」または「機能的一部または部分」を含み、それは完全長標的化ポリペプチドの部分を意味し、少なくとも抗原がポリへドリンを標的とする構造的および機能的能力を保ちさえすれば、その部分は完全長分子の活性を保つ。本明細書の用法では、「生物学的に活性な一部」という用語は、活性を保つ、例えば２０、２１、２２、２３、２４、２５、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１２０、１５０、３００、３５０個の隣接するアミノ酸（そしてその間の各整数）などの少なくとも約２０〜２００個のアミノ酸を含む、欠失変異体およびペプチドを含む。このタイプの部分は、標準組換え核酸技術の適用を通じて得てもよく、または従来法または最先端技術の液相または固相合成技術を使用して合成してもよい。例えば、と題された第９章に記載される、溶液合成または固相合成を参照してもよい。「誘導体」は、例えば当該技術分野で理解されているように、その他の化学的部分との接合または錯化による、または翻訳後修飾技術による、修飾によって基礎配列から誘導されるポリペプチドを意味する。「誘導体」という用語はまた、機能的に同等の分子を提供する、付加、または欠失をはじめとする、標的化ポリペプチドに加えられた改変もその範囲内に含む。

ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの「部分」または「一部」は、少なくとも約２０個のヌクレオチドまたはアミノ酸の最小限のサイズを有すると定義され、少なくとも約１００個のヌクレオチドまたはアミノ酸の最小限のサイズを有してもよい。この定義は、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４または３５個のヌクレオチドまたはアミノ酸をはじめとする、１０〜３５個のヌクレオチドまたはアミノ酸の範囲内の全てのサイズ、ならびに３００、５００、６００個のヌクレオチドまたはアミノ酸をはじめとする、１００個を超えるヌクレオチドまたはアミノ酸、またはこれらの値内のあらゆる数のヌクレオチドまたはアミノ酸を有する分子を含む。

本明細書における標的化ポリペプチドまたはペプチドまたはポリへドリンポリペプチドの「機能的変種」への言及は、本明細書に記載されるポリへドリンとの複合体を形成する、本明細書で同定される配列の機能的および構造的能力を保つのに十分な程度の配列類似性または１つまたは複数の生物学的活性部分または活性部の脱落を有する、天然または非天然機能的変種、生物学的活性部分または活性部、前駆体、誘導体、アナログおよび組換えまたは合成形態を含む。機能的変種は、詳細な説明でさらに説明される。

「配列同一性」という用語は、本明細書の用法では、比較ウインドウ全体にわたって、ヌクレオチド単位で、またはアミノ酸単位で、配列が同一である程度を指す。したがって「配列同一性百分率」は、比較ウインドウ全体にわたって最適に整列させた２つの配列を比較して、同一核酸塩基（例えば、Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｇ、Ｉ）または同一アミノ酸残基（例えば、Ａｌａ、Ｐｒｏ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｇｌｙ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｈｉｓ、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｃｙｓ、およびＭｅｔ）が、双方の配列内に存在する位置の数を求めて一致位置数とし、一致位置数を比較ウインドウ内の総位置数（すなわちウインドウサイズ）で除して、結果に１００を乗じて配列同一性百分率を得ることで計算される。本発明の目的で、「配列同一性」は、適切な方法で計算された「一致百分率」である計算を意味すると理解される。例えば、配列同一性分析は、ソフトウェアに付属する参照マニュアルで使用される標準初期設定を使用して、ＤＮＡＳＩＳコンピュータプログラム（Ｗｉｎｄｏｗｓ（登録商標）版Ｖｅｒｓｉｏｎ ２．５；Ｈｉｔａｃｈｉ Ｓｏｆｔｗａｒｅ ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｃｏ．，Ｌｔｄ．，Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ，ＵＳＡより入手可能）を使用して実施してもよい。

２つ以上のポリヌクレオチドまたはポリペプチド間の配列の関係性を記述するために使用される用語には、「参照配列」、「比較ウインドウ」、「配列同一性」、「配列同一性の百分率」、および「実質同一性」が含まれる。「参照配列」は、長さが少なくとも１２、頻繁に１５〜１８であり、少なくとも２５のモノマー単位であることが多い、ヌクレオチドおよびアミノ酸残基である。２つのポリヌクレオチドは、それぞれ（１）２つのポリヌクレオチド間で同様の配列（すなわち相補的ポリヌクレオチド配列の一部）、および（２）２つのポリヌクレオチド間で相違する配列を含んでなってもよいため、２つ（以上）のポリヌクレオチド間の配列比較は、典型的に、配列類似性の局在性領域を同定し比較する「比較ウインドウ」全体にわたって、２つのポリヌクレオチド配列を比較することで実施される。「比較ウインドウ」は、少なくとも６個、一般的には約５０〜約１００個、より一般的には約１００〜約１５０個の隣接位置の概念的セグメントを指し、その中では配列が、２つの配列を最適に整列させた後に、同数の隣接位置の参照配列と比較される。比較ウインドウは、２つの配列の最適アラインメントのための（付加または欠失を含まない）と参照配列比較して、約２０％以下の付加または欠失（すなわちギャップ）を含んでなってもよい。比較ウインドウを配列比較するための最適な配列アラインメントは、アルゴリズムのコンピュータ化された実装によって行ってもよく（Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒｉｖｅ Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ，ＵＳＡからのＷｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ Ｒｅｌｅａｓｅ ７．０中のＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、およびＴＦＡＳＴＡ）、または検査と、選択された様々な方法のいずれかによって作成される最良整列化（すなわち比較ウインドウ全体にわたる最高の百分率相同性がもたらされる）とによって行ってもよい。例えばＡｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２５：３３８９−３４０２，１９９７によって開示される、プログラムのＢＬＡＳＴファミリーを参照してもよい。配列分析の詳細な考察は、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ ＳｏｎｓＩｎｃ，第１５章，１９９４−１９９８の第１９．３部にある。

「組換え」という用語は、本明細書核酸分子について記述するのに使用されてもよく、その起源または操作が（１）それが自然界で付随するポリヌクレオチドの全部または一部に付随しておらず；および／または（２）それが自然界で結合している以外のポリヌクレオチドに結合しているという理由から、ゲノム起源、ｃＤＮＡ起源、半合成起源、または合成起源であるポリヌクレオチドを意味する。タンパク質またはポリペプチドに関して使用される「組換え」という用語は、組換えポリヌクレオチドの発現によって生成されるポリペプチドを意味する。

「組換え宿主細胞」、「宿主細胞」、「細胞」、「細胞系」、「細胞培養」、およびその他のこのような用語は、単細胞実体として培養された原核微生物または真核細胞系統を指し、同義的に使用されて、組換えベクターまたはその他のトランスファーＤＮＡの受容体として使用され得る、または使用されている細胞を指し、形質移入された最初の細胞の子孫を含む。

「ハイブリダイゼーション」または「ハイブリダイズ」は、ＤＮＡ−ＤＮＡハイブリッドまたはＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッドを生じる、相補的ヌクレオチド配列の対合形成を意味するために本明細書で使用される。ハイブリダイゼーションは、当業者に知られている変動する状況下で生じ得る。「と特異的にハイブリダイズする」などの語句は、当該技術分野で公知のストリンジェントな条件下において、分子が特定のヌクレオチド配列のみと結合、二重化、またはハイブリダイズすることを指す。

「抗体」および「抗体群」という用語は、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体、そして完全長抗体（例えば無処理Ｆｃ領域を有する）と、例えばＦｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、およびＦ（ａｂ’） _２断片をはじめとする抗原結合性断片とをはじめとするが、これに限定されるものではない、モノクローナル抗体に由来する全ての様々な形態；および一本鎖抗体などの組換え手法を使用して生成された抗体由来ポリペプチドを含む。「抗体」および「抗体群」という用語はまた、本明細書の用法では、例えば遺伝子導入動物中で、またはファージディスプレイを通じて、生成されたヒト抗体、ならびに対象抗体、ｓ抗体、霊長類化抗体または脱免疫化抗体も指す。それは、例えば軟骨海産動物またはラクダ科動物に由来する単一ドメイン抗体、またはこのような抗体に基づくライブラリーに由来するものなど、治療的に許容可能であってもよいその他の形態の抗体、およびその抗原結合性断片もまた含む。抗体の断片または修飾形態の選択には、断片または修飾形態がそれらの半減期に及ぼすあらゆる影響もまた関与してもよい。

「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均質な抗体の集団から得られた抗体を指すために本明細書で使用される。すなわち集団を構成する個々の抗体は、わずかに存在することもある自然発生的突然変異を除いては、同一である。「モノクローナル」という用語は、本明細書の用法では、抗体の特徴が実質的に均質な抗体集団から得られたことを示し、抗体が特定の方法によって生成されたことを示すためには使用されない。例えば本発明に従ったモノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５−４９９，１９７５によって記載されるハイブリドーマ法によって生成されてもよく、または（米国特許第４，８１６，５６７号明細書に記載されるような）組換えＤＮＡ法によって生成されてもよい。モノクローナル抗体はまた、Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３５２：６２４−６２８，１９９１またはＭａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１−５９７，１９９１に記載される技術を使用して、ファージ抗体ライブラリーから単離されてもよい。

宿主細胞系統中でのクローニングおよび発現のために利用できるベクターは当該技術分野で周知であり、哺乳類細胞系中でのクローニングおよび発現のためのベクター、細菌細胞系中でのクローニングおよび発現のためのベクター、ファージ中でのクローニングおよび発現のためのベクター、および昆虫細胞系中でのクローニングおよび発現のためのベクターが挙げられるが、これに限定されるものではない。抗体は、標準タンパク質精製法を使用して回収し得る。

適切な場合は、抗原またはポリへドリン分子の化学アナログを慣例的に用いてもよい。本明細書で検討されるアナログとしては、側鎖の修飾；ペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質合成中の非天然アミノ酸および／またはそれらの誘導体の組み込み；およびタンパク様分子またはそれらのアナログに立体構造的束縛を課す、架橋剤およびその他の方法の使用が挙げられるが、これに限定されるものではない。

本発明は、非ヒト動物を免疫化し、または本明細書に記載される融合または複合体タンパク質または多面体で、またはそれらをコードする核酸で、ヒト免疫グロブリン遺伝子のライブラリーの発現産物をスクリーニングして、対象抗原、または同抗体を含んでなる病原体または組織全部または一部に特異的に結合する抗体を単離するステップを含んでなる、抗体を生成する方法を提供する。

別の実施形態では、本発明は、対象タンパク質または複合体を使用して、本明細書に記載される方法によって生成される抗体、またはその対象ヒトまたはヒト化形態を提供する。抗体は、ポリクローナルでなくモノクローナルであることが好ましく、好ましくは対象ヒト化脱免疫化抗体であり、またはヒト抗体である。

機能的変種への言及は、少なくとも１つのアミノ酸残基の付加、欠失および／または置換によって、天然形態または本明細書に提示する形態と区別されるものを含む。したがって変種は、天然タンパク質のＮ末端および／またはＣ末端における、１つまたは複数のアミノ酸の欠失（いわゆるトランケーション）または付加；天然タンパク質の１つまたは複数の部位における、１つまたは複数のアミノ酸の欠失または付加；または天然タンパク質の１つまたは複数の部位における１つまたは複数のアミノ酸の置換によって天然タンパク質から誘導されるタンパク質を含む。本発明に包含される変種タンパク質は生物学的に活性であり、すなわちそれらは、親タンパク質の所望の生物学的活性（例えば免疫原性、またはポリへドリンと複合体を形成しまたは関心のある抗原を少なくとも部分的にカプセル化する能力）を保持し続ける。変種は、例えば遺伝的多形性または人間による操作から得られてもよい。ウイルス性ポリペプチドの生物学的に活性な変種は、デフォルトパラメータを使用した本明細書の他の箇所に記載される配列アラインメントプログラムによる測定で、本明細書に記載される公開されたタンパク質のアミノ酸配列と、典型的に少なくとも４０％、５０％、６０％、７０％、一般に少なくとも７５％、８０％、８５％、好ましくは約９０％〜９５％以上、およびより好ましくは約９８％以上の配列類似性または同一性を有する。いくつかの実施形態では、同定された百分率は、完全長ポリペプチドに、またはそれに変種が由来する親分子に言及する。対象ポリペプチドの生物学的に活性な変種は、一般に１００、５０または２０個程度のアミノ酸残基、または適切にはわずか１〜１５個のアミノ酸残基、６〜１０個などわずか１〜１０個、わずか５個、わずか４、３、２個、またはたった１個でさえあるアミノ酸残基が、対象ポリペプチドと異なっていてもよい。

変種ポリペプチドは、アミノ酸置換、欠失、トランケーション、および挿入をはじめとする様々なやり方で改変されてもよい。このような操作方法は、一般に当該技術分野で公知である。例えば対象ポリペプチドのアミノ酸配列変種をＤＮＡ中の変異によって調製し得る。変異誘発およびヌクレオチド配列変更方法は、当該技術分野で周知である。例えば、Ｋｕｎｋｅｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８２：４８８−４９２，１９８５；Ｋｕｎｋｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌ．，１５４：３６７−３８２，１９８７；Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，８７３，１９２；Ｗａｔｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｇｅｎｅ，Ｆｏｕｒｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｂｅｎｊａｍｉｎ／Ｃｕｍｍｉｎｇｓ，ＭｅｎｌｏＰａｒｋ，Ｃａｌｉｆ．，１９８７）およびその中で引用される参考文献を参照されたい。関心のあるタンパク質の生物学的活性に影響を及ぼさない適切なアミノ酸置換に関するガイダンスは、Ｄａｙｈｏｆｆ ｅｔ ａｌ．，Ａｔｌａｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，Ｎａｔｌ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｆｏｕｎｄ．，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｄ．Ｃ．，１９７８のモデルに見られる。点突然変異またはトランケーションによって作製されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産物をスクリーニングする方法、および選択された特性を有する遺伝子産物についてｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングする方法は、当該技術分野で公知である。このような方法は、対象ポリペプチドのコンビナトリアル変異誘発によって作成された遺伝子ライブラリーの迅速なスクリーニングのために適合できる。スクリーニングアッセイと組み合わせて、ライブラリー中の機能的変異体の発生頻度を高める技術である再帰アンサンブル変異誘発（ＲＥＭ）を使用して、対象ポリペプチド変種を同定し得る（Ａｒｋｉｎ ａｎｄ Ｙｏｕｒｖａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：７８１１−７８１５，１９９２；Ｄｅｌｇｒａｖｅ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，６：３２７−３３１，１９９３）。下でより詳細に考察するように、１つのアミノ酸を別の同様な特性を有するもので置換するような保存的置換が望ましい。

変種対象ポリペプチドは、参照アミノ酸配列と比較して、それらの配列の様々な位置に保存的アミノ酸置換を含有してもよい。「保存的アミノ酸置換」は、その中でアミノ酸残基が、同様の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されているものである。同様の側鎖を有するアミノ酸残基ファミリーは、当該技術分野で定義されており、それは一般に以下のように下位分類される。

酸性：残基は生理学的ｐＨにおけるＨイオンの損失に起因する負電荷を有し、ペプチドが生理学的ｐＨの水性媒体中にある場合、残基はそれがその中に含有されるペプチド立体構造中で表面位置を求めるように、水溶液に引きつけられる。酸性側鎖を有するアミノ酸としては、グルタミン酸およびアスパラギン酸が挙げられる。

塩基性：残基は、生理学的ｐＨまたはその１または２ｐＨ単位内におけるＨイオンとの結びつきに起因する正電荷を有し（例えばヒスチジン）、ペプチドが生理学的ｐＨの水性媒体中にある場合、残基はそれがその中に含有されるペプチド立体構造中で表面位置を求めるように、水溶液に引きつけられる。塩基性側鎖を有するアミノ酸としては、アルギニン、リジン、およびヒスチジンが挙げられる。

荷電：残基は生理学的ｐＨにおいて荷電し、したがって、酸性または塩基性側鎖を有するアミノ酸を含む（すなわちグルタミン酸、アスパラギン酸、アルギニン、リジン、およびヒスチジン）。

疎水性：残基は生理学的ｐＨにおいて荷電せず、ペプチドが水性媒体中にある場合、残基はそれがその中に含有されるペプチド立体構造中で内部位置を求めるように、水溶液を忌避する。疎水性側鎖を有するアミノ酸としては、チロシン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、およびトリプトファンが挙げられる。

中性／極性：残基は生理学的ｐＨにおいて荷電せず、ペプチドが水性媒体中にある場合、残基はそれがその中に含有されるペプチド立体構造中で内部位置を求めるのに十分であるようには、水溶液を忌避しない。中性／極性側鎖を有するアミノ酸としては、アスパラギン、グルタミン、システイン、ヒスチジン、セリン、およびスレオニンが挙げられる。

この記述はまた、たとえ極性基を欠いていても、疎水性もたらすには側鎖が十分に大型でないため、特定のアミノ酸を「小型」と特徴付ける。プロリンを除いて、「小型」アミノ酸は、少なくとも１つの極性基が側鎖上にある場合は４つ以下の炭素、そうでない場合は３つ以下の炭素を含む。小型側鎖を有するアミノ酸としては、グリシン、セリン、アラニン、およびスレオニンが挙げられる。遺伝子がコードする二次アミノ酸プロリンは、ペプチド鎖二次立体構造に対するその公知の影響のために、特別な例である。プロリンの構造は、全てのその他の天然アミノ酸と異なり、その側鎖はα−アミノ基の窒素ならびにα−炭素に結合する。しかしいくつかのアミノ酸類似性マトリックス（例えばＤａｙｈｏｆｆ ｅｔ ａｌ．１９７８，（前出），Ａ ｍｏｄｅｌ ｏｆ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｃｈａｎｇｅ ｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎｓ．Ｍａｔｒｉｃｅｓ ｆｏｒ ｄｅｔｅｒｍｉｎｉｎｇ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ Ｉｎ Ｍ．Ｏ．Ｄａｙｈｏｆｆ，（ｅｄ．），Ａｔｌａｓ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，Ｖｏｌ．５，ｐｐ．３４５−３５８，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ，ＷａｓｈｉｎｇｔｏｎＤＣによって；およびＧｏｎｎｅｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５６（５０６２）：１４４３−１４４５，１９９２によって開示されるＰＡＭ１２０マトリックスおよびＰＡＭ２５０マトリックス）は、プロリンをグリシン、セリン、アラニン、およびスレオニンと同じグループ内に含む。したがって本発明の目的で、プロリンは「小型」アミノ酸に分類される。

極性または非極性の分類のために必要な引力または反発の程度は任意であり、したがって本発明によって具体的に検討されるアミノ酸は、そのどちらか一方に分類されている。具体的に指名されないアミノ酸のほとんどは、既知の挙動に基づいて分類され得る。

アミノ酸残基は、環式または非環式、および芳香族または非芳香族、残基の側鎖置換基に関する自明の分類、および小型または大型にさらに下位分類され得る。残基は、追加的な極性置換基が存在するという条件で、それがカルボキシル炭素を含めて合計４つ以下の炭素原子を含有し、存在しない条件では３つ以下の炭素原子を含有する場合、小型と見なされる。もちろん小型残基は、常に非芳香族である。それらの構造特性次第で、アミノ酸残基は２つ以上のクラスに含まれてもよい。天然タンパク質アミノ酸について、このスキームに従った下位分類を表１に提示する。

保存的アミノ酸置換は、側鎖に基づく分類もまた含む。例えば脂肪族側鎖を有するアミノ酸群は、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシンであり；脂肪族ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸群は、セリンおよびスレオニンであり；アミド含有側鎖を有するアミノ酸群は、アスパラギンおよびグルタミンであり；芳香族側鎖を有するアミノ酸群は、フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファンであり；塩基性側鎖を有するアミノ酸群は、リジン、アルギニン、およびヒスチジンであり；イオウ含有側鎖を有するアミノ酸群は、システインおよびメチオニンである。例えば、ロイシンのイソロイシンまたはバリンによる、アスパルテームのグルタメートによる、スレオニンのセリンによる置換、またはアミノ酸の構造的関連アミノ酸による同様の置換が、得られる変種ポリペプチドの特性に、大きな影響を及ぼさないと予想することは理にかなっている。アミノ酸変化が機能的対象ポリペプチドをもたらすかどうかは、その活性をアッセイすることにより容易に求め得る。保存的置換は、表２（下）の例示的な置換の見出しの下に示される。より望ましい置換は、好ましい置換の見出しの下に示される。本発明の範囲内に入るアミノ酸置換は、一般に以下の維持に対する、それらの影響が顕著に異ならない置換を選択することで達成される。（ａ）置換領域におけるペプチド主鎖の構造、（ｂ）標的部位における分子の電荷または疎水性、または（ｃ）側鎖の大半。置換を導入した後、変種を生物学的活性についてスクリーニングする。

代案としては、側鎖の同一性に基づいて、保存的置換を行うための類似アミノ酸を３つのカテゴリーにグループ分けし得る。Ｚｕｂａｙ，Ｇ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，ｔｈｉｒｄ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｗｍ．Ｃ．Ｂｒｏｗｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ（１９９３）に記載されるように、第１のグループは全て荷電側鎖を有するグルタミン酸、アスパラギン酸、アルギニン、リジン、ヒスチジンを含み；第２のグループはグリシン、セリン、スレオニン、システイン、チロシン、グルタミン、アスパラギンを含み；第３のグループはロイシン、イソロイシン、バリン、アラニン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファン、メチオニンを含む。

したがって、対象ポリペプチド中の予測された非必須アミノ酸残基は、典型的に、同じ側鎖ファミリーからの別のアミノ酸残基で置換されている。代案としては、変異は、飽和変異誘発などによって、対象ポリヌクレオチドコード配列の全部または一部に沿って無作為に導入し得て、得られた変異体を親ポリペプチドの活性についてスクリーニングして、活性を保つ変異体を同定し得る。コード配列の変異誘発に続いて、コードされたペプチドを組換え的に発現し得て、ペプチドの活性を求め得る。

したがって本発明は、本明細書で提供される対象ポリペプチドの変種、またはそれらの生物学的に活性な断片もまた検討し、その中で変種は、１つまたは複数のアミノ酸残基の付加、欠失、または置換により、提供配列と区別される。一般に変種は、参照対象ポリペプチド配列と、少なくとも約３０、４０、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９％の類似性を示す。望ましくは変種は、対象親ポリペプチド配列と、少なくとも３０、４０、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９％の配列同一性を有する。さらに１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００個以上のアミノ酸の付加、欠失、または置換により、開示配列と異なるが、対象親ポリペプチドの生物学的活性を保つ配列が検討される。変種対象ポリペプチドは、本明細書で定義されるストリンジェントな条件、特に高ストリンジェンシー条件下で、開示ポリヌクレオチド配列、またはその非コード鎖にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドもまた含む。

いくつかの実施形態では、変種ポリペプチドは、少なくとも１個であるが、５０、４０、３０、２０、１５、１０、８、６、５、４、３または２個未満のアミノ酸残基が、先行技術または野生型配列と異なる。別の実施態様では、変種ポリペプチドは、少なくとも１％であるが、２０％、１５％、１０％または５％未満の残基が、列挙された配列と異なる（この比較がアラインメントを要する場合、配列は最大類似性のために整列されるべきである。欠失または挿入、またはミスマッチから「ループ」アウトした配列は、相違と見なされる）。相違は、適切には、非必須残基または保存的置換における相違または変化である。

「非必須」アミノ酸残基は、その機能の１つまたは複数を無効化したりまたは実質的に改変することなく、実施形態ポリペプチドの野生型配列から変更され得る残基である。適切には、変更はこれらの機能を実質的に改変せず、例えば活性は、野生型の少なくとも２０％、４０％、６０％、７０％または８０％である。「必須」アミノ酸残基は、変更されると、親活性の２０％未満が存在するなど、親分子の活性の無効化をもたらす残基である。

以下の非限定的例によって、本発明をさらに説明する。

実施例１
材料と方法
Ｇａｇ多面体の生成
１）ＳＦ９細胞を１５０〜３００ｍｌのＳＦ−９００ＳＦＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で、１×１０^６細胞／ｍｌの濃度に分割する。
２）Ｐ３ウイルス株ＣＰＶを１：５００で、Ｇａｇクローン１５Ｐ３（Ｈ１−ＷＴ−Ｇａｇ−Ｈｉｓ）を１：１２５でＳＦ９細胞に添加する。
３）細胞を振盪機内で２７℃で４８時間培養する。

多面体の精製
１）ＳＦ９細胞懸濁液を５０ｍｌのＦａｌｃｏｎチューブに入れる。
２）２０００ｒｐｍで５分間遠心分離する。
３）上清を除去する。
４）１ｍｌの無菌ＰＢＳ（ｐＨ７．４）を再懸濁細胞に添加して、エッペンドルフ管に移す。
５）懸濁液を氷上において１０ｍＡｍｐで３０秒間超音波処理する。
６）４０００ｒｐｍで１分間遠心分離する。
７）上清を除去して１ｍｌのＰＢＳに再懸濁する。
８）ステップ５〜７をさらに２回繰り返す。
９）結晶を最終容積３００μｌのＰＢＳに再懸濁する。
１０）光学顕微鏡を使用して多面体の純度を調べる。

スクロース勾配を使用した精製
１）以下のようにして、無菌ｍＱＨ_２０中で以下の濃度のスクロースを作製する：

２）Ｂｅｃｋｍａｎ ｕｌｔｒａ ｃｌｅａｒ １４×８９ｍｍ遠心管を使用して、２ｍｌの６５％スクロース、それに続いて２ｍｌの６０％スクロース、２ｍｌの５５％スクロース、２ｍｌの５０％スクロース、そして２ｍｌの４５％スクロースを注意深く重ねる。
３）ｍＱＨ_２０中で多面体の全容積を１．５ｍｌにして、これを勾配の上部に添加する。
４）ＴＨ−６４１回転子を使用して、バランス管を超遠心機に入れて、２４０００ｒｐｍで３時間４℃で遠心分離する。
５）管を取り出し、次に１ｍｌピペットによってスクロース上層を注意深く除去する。
６）およそ１．５ｍｌ中の多面体層（ｉｎ６０％スクロース）を取り出して、エッペンドルフ管に入れる。

スクロースからの多面体の取り出し
１）Ｓｌｉｄｅ−Ａ−Ｌｙｚｅｒ透析カセット（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を使用して、カセットをＰＢＳ中で１分間吸水させる。
２）製造会社の使用説明書に従って、１８Ｇの針を使用して、カセットに３ｍｌの多面体／スクロースを注意深く挿入する。
３）シリンジを引き戻して、メンブランから全ての空気を除去する。
４）５００ｍｌの無菌ＰＢＳ中で、一晩透析する。
５）１８Ｇ針内の少量の空気でメンブランを満たし、次にカセットからサンプルを回収する。
６）体積が増えたサンプルを約１０本のエッペンドルフ管に入れる。
７）エッペンドルフ管を１００００ｒｐｍで５分間遠心分離する。
８）ＰＢＳを除去して、ペレットを残留ＰＢＳ中で再懸濁する。全容積は、２つのスクロース勾配から約４００μｌである。

Ｇａｇウエスタンブロット
−ＳＤＳ−Ｐａｇｅゲルを常法通り１５％ゲル上で実施する。
−次に転写バッファー（３．０３ｇトリス塩基、１４．４ｇグリシン、および２０％エタノール）を使用して、タンパク質をニトロセルロースメンブランに移す。
−ＴＢＳ−Ｔｗｅｅｎ中の５％脱脂粉乳（ｂｌｏｔｔｏ）中でメンブランを一晩ブロックする。
−ｐ２４ Ｇａｇに対して特異的なｍＡｂ １８３を５％ｂｌｏｔｔｏ−ＴＢＳ−Ｔ中でＲＴで１時間、１：１０００に希釈する。
−メンブランをＴＢＳ−Ｔで３×５分間で洗浄する。
−抗マウスＩｇ−ＨＲＰコンジュゲート抗体（Ｃｈｅｍｉｃｏｎ）を添加して、５％のｂｌｏｔｔｏ−ＴＢＳ−ＴでＲＴで１時間、１：１０，０００に希釈する。
−メンブランをＴＢＳ−Ｔで３×５分間で洗浄する。
−ＥＣＬ−Ｐｌｕｓ試薬（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）およびＸ線フィルム曝露を使用した化学発光検出。

マウスＥＬＩＳＰＯＴプロトコル

手順：ＩＦＮ−γ抗体ペアを使用した実施例、全ての抗体ペアで同じ抗体濃度が使用される。

ＩＦＮ−γ検出のためのＥＬＩＳｐｏｔアッセイ
プレートの調製
１．９６ウェル（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，ｍｕｌｔｉｓｃｒｅｅｎ−ＩＰ ０．４５μｍ ＰＶＤＦ ＥＬＩＳＰＯＴプレート）のそれぞれを５μｇ／ｍＬの抗マウスＩＦＮ−γｍＡｂＡＮ１８を含有する無菌ＰＢＳによって、ウェルあたり１００μｌでコーティングする。
２．４℃で一晩インキュベートする。
３．プレートを弾いてｍＡｂ溶液を除去する。
４．プレートを無菌ＰＢＳで５回洗浄する。
５．プレートを無菌紙タオル（加圧滅菌可能）で吸い取る。
６．ウェルあたり２００μｌの無菌ＲＰＭＩ＋１０％ＦＣＳでプレートをブロックする。
７．室温で１時間インキュベートする（必要ならばより長時間でもよい）。

脾細胞、ペプチド抗原、およびペプチドプールの添加
８．プレートを弾いてブロック緩衝液を除去し、プレートを無菌ＰＢＳで１回洗浄するが、ブロックが残留したりまたは泡立つ場合は、２回の洗浄を要することもある。
９．プレートを無菌紙タオル（加圧滅菌可能）で吸い取る。
１０．あらかじめ作製した、ＲＰＭＩ＋１０％ＦＣＳ中の抗原（２μｇ／ｍＬ、８μｇ／ｍＬのＣＯＮＡを除く、最終ウェル濃縮１μｇ／ｍＬ）を使用する。
１１．ウェルあたり５０μｌの抗原、およびウェルあたり５０μｌの脾細胞細胞懸濁液を入れる。
１２．３７℃で１８〜２０時間インキュベートする。

プレート発色
１３．プレートを弾いて細胞を除去する。
１４．無菌ＰＢＳで５回洗浄する。
１５．無菌ＰＢＳで希釈したビオチン化ｍＡｂ（１μｇ／ｍＬ、ＲＡ−６Ａ２）をウェルあたり１００μｌ添加する。室温で２時間インキュベートする。
１６．ＰＢＳで５回洗浄する。
１７．無菌ＰＢＳ中で１μｇ／ｍＬに希釈したストレプトアビジン−アルカリホスファターゼをウェルあたり１００μｌ添加する。室温で１時間インキュベートする。
１８．無菌ＰＢＳで５回洗浄する。
１９．ＢＣＩＰ／ＮＢＴ液体基質（使用直前シリンジ濾過）をウェルあたり１００μｌ添加する。スポットの発生で決めて、２０〜３０分間にわたり室温でインキュベートする。
２０．プレートを弾いて無菌ＤＤＨ_２Ｏで１回洗浄して発色を停止し、水道水を流しながらプレートを洗浄する。
２１．プレートを紙タオルで吸い取り、一晩放置して乾燥させる。

注意
−各洗浄ステップに続いて、そして細胞添加前に、プレートを紙タオル（加圧滅菌可能）で吸い取って、試薬を希釈するあらゆる可能性を低下させることが一番良い。
−全てのステップは、クリーンベンチ内で実行する。
−全ての洗浄は、マルチチャンネルで実施する。

実施例２
Ｎ末端Ｈ１配列のあるバキュロウイルスＨＩＶ−１ Ｇａｇ
組換えバキュロウイルストランスファーベクターを構築して、Ｂｍ−ＣＰＶポリへドリンのＨ１螺旋のヌクレオチド配列とインフレームの様々な形態のＨＩＶ−１ Ｇａｇをでコードした（Ｉｊｉｒｉ ｅｔ ａｌ．，２００９（前出））。

実施例３
ＨＩＶ−１Ｇａｇ抗原を含んでなる多面体の生成
ポリへドリンを産生し、立方多面体をさらに産生するＢｍ−ＣＰＶ（ＡｃＣＰ−Ｈ）の組換え形態をこの研究で使用した（Ｍｏｒｉ ｅｔ ａｌ．，１９９３（前出））。

Ｈ１タンパク質はポリへドリン認識シグナルとして機能し、Ｇａｇ−Ｈ１タンパク質はポリへドリンと一緒に多面体Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに組み込まれる。

実施例４
多面体中へのＧａｇの固定化
ＨＩＶ−１ポリへドリンを産生するＡｃＣＰ−Ｈ、およびＨ１螺旋ポリペプチド配列との融合タンパク質としてＧａｇ抗原を発現する組換えバキュロウイルスで、（任意にＥＧＦＰなどの検出可能なマーカーと一緒に）同時感染させたスポドプテラ・フルギペルダ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ）細胞系から、多面体（Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ）を回収して精製し、超音波処理、連続洗浄ステップ、そしてスクロース勾配精製した。

ウエスタンブロット分析は、Ｇａｇが多面体に成功裏に組み込まれたことを示した。完全長Ｇａｇ（ｐ５５）、Ｇａｇｌａｃｋｉｎｇｐ６、およびｐ３９に対応する、３つのバンドが検出できた。二量体形成が阻害されているＧａｇの突然変異型を野生型Ｇａｇと比較して同様のレベルで、多面体結晶に組み込んだ。ＥＬＩＳＡおよびウエスタンブロット法の双方を使用して、ポリへドリンタンパク質（図１）あたり推定量１０．９μｇのＧａｇタンパク質を組み込んだ。

実施例５
安定ＭｉｃｒｏＣｕｂｅが生成される
Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、トリプシン存在下（図２）、および生理学的に妥当な条件下（図３）で、高度に安定である。

ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに組み込まれたＧａｇタンパク質は、トリプシン分解に対して可溶性Ｇａｇよりも安定しており、生体内に注射した際に、安定した複合体および抗原の持続放出を提供することが示唆される。

実施例６
ＨＩＶ Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの免疫原性のアセスメント
マウス免疫原性
目的
投与量決定試験において、可溶性ＨＩＶｇａｇタンパク質と比較して、生体内でＨＩＶ−１ Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの免疫原性を調査する。

研究デザイン
１群あたり６匹のＢＡＬＢ／ｃマウスを１００μｌのＰＢＳ中の免疫原で０、４、および８週目に皮下免疫化する。
Ａ群；高用量ＨＩＶ ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（およそ４５０μｇ、５μｇのＨＩＶｇａｇ含有）
Ｂ群；中用量ＨＩＶ ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（およそ９０μｇ、１．０μｇのＨＩＶｇａｇ含有）
Ｃ群；低用量ＨＩＶ ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（およそ１８μｇ、０．２μｇのＨＩＶｇａｇ含有）
Ｄ群；高用量ＨＩＶ ｇａｇ可溶性タンパク質５μｇ
Ｅ群；中用量ＨＩＶ ｇａｇ可溶性タンパク質１．０μｇ
Ｆ群；低用量ＨＩＶ ｇａｇ可溶性タンパク質０．２μｇ

０（採血前）、４、および８週目に、動物から静脈血を採取する。動物を１０週目に殺処分して、免疫原に対するＴ細胞応答のアセスメントのために脾臓を摘出し、抗体アセスメント用血清のために終末心臓放血を実施する。

方法
ＩＦＮ−γおよびＩＬ−２ ＥＬＩＳＰＯＴアッセイ中で、Ｔ細胞応答を評価する。簡単に述べると、マウスＩＦＮ−γまたはマウスＩＬ−２のどちらかに対するモノクローナル抗体で被覆されたウェルに、５×１０^５の脾臓細胞を入れた。これらの細胞を以下の抗原で刺激した；陰性対照としての培地単独、陽性対照としてのＣｏｎ Ａ、ＨＩＶ Ｇａｇ可溶性タンパク質（１０、１．０、０．１μｇ／ｍｌ）、ＨＩＶ Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（１００、１０、１．０μｇの総タンパク質量）、対照タンパク質（多面体結晶単独）、ＨＩＶ Ｇａｇ重複ペプチドプールＩおよびＩＩ（図８参照）（ＮＩＨ提供；各ペプチドの最終濃度１μｇ／ｍｌ）。

一晩の培養後、細胞を取り出してＥＬＩＳＰＯＴを発色させた。ＡＩＤ ＥＬＩＳＰＯＴ造影システムを使用して、スポット形成細胞／１０^６供試脾細胞を計算した。

抗原として組換えＨＩＶ Ｇａｇ可溶性タンパク質を使用したＥＬＩＳＡを使用して、ＨＩＶ ｇａｇへの抗体応答を評価した（Ｋｅｏｓｈｋｅｒｉａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ．Ｖｉｒｏｌ．７１（４）：４８３−４９１，２００３；Ｄａｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｖａｃｃｉｎｅ，２３（２）：１８８−１９７，２００４；Ｔｈｏｍｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｖａｃｃｉｎｅ，２３（３８）：４６４７−４６５７，２００５；Ｋｅｌｌｅｈｅｒ ｅｔ ａｌ．，ＡＩＤＳ，２０（２）：２９４−２９７，２００６）。

可溶性ＧａｇおよびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ免疫化マウスの双方で、Ｇａｇに対する強力な抗体応答が検出された。５．０μｇ群では１：２５６００の最大抗体力価が、より低い用量ではより弱い応答が観察された（図６および７を参照されたい）。ＨＩＶ Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ免疫化マウスは、ＣＰＶポリへドリンタンパク質に対する強力な抗体応答もまた実証した。

ＩＦＮ−γおよびＩＬ−２ ＥＬＩＳＰＯＴアッセイを使用して、Ｔ細胞応答を評価した。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、Ｇａｇ ５５に対する非常に強力なＩＦＮ−γおよびＩＬ−２応答を引き起こした（＞５００ＳＦＣ／１０^６個の細胞）。より小さな断片Ｇａｇ ｐ３９またはｐ２４に対しては、わずかに低下した応答が観察された。ピークＩＦＮ−γ応答は１．０μｇ群で見られ、５．０μｇでは応答がわずかに低下した。重要なことには、１．０μｇのｇａｇ（平均１５０ＳＦＣ／１０^６個の細胞）よりも、１．０μｇのＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（平均２１０ＳＦＣ／１０^６個の細胞）でより高いＩＦＮ−γ応答が見られた。ＣＰＶポリへドリンタンパク質に対する強力なＩＦＮ−γ応答もまた見られたが、これはＩＬ−２アッセイでは観察されなかった。ＨＩＶ−１ Ｇａｇタンパク質のＮおよびＣ末端領域に対応する重複ペプチドの２つのプールに対する応答のアッセイは、ＩＦＮ−γおよびＩＬ−２の応答の大部分が、タンパク質の後半を対象とすることを示した。

Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの注射後に観察される、Ｇａｇタンパク質およびＧａｇペプチドに対する頑強なＩＦＮ−γおよびＩＬ−２応答は、このワクチンが、アジュバントの必要なしに、ＣＤ４およびＣＤ８応答の双方を引き起こすことを暗示する。

実施例７
考察
本発明は、一般的昆虫ウイルスによって産生される、超安定性の結晶またはＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（多面体）をベースとした、感染症に対するワクチンのプラットフォームを提供する。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、それらを既存のワクチンストラテジーから際立たせる２つの特徴を提示する：擬似結晶性配列としての抗原の新規提示、およびユニークな徐放送達機序。いくつかの実施形態では、これらの性質は免疫原性および安定性を提供する。いくつかの実施形態では、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、ＨＩＶまたはマラリアなどの積極的な細胞性免疫応答を要する各疾患に関して使用される。別の実施形態では、単回注射免疫を提供し、ワクチン供給における低温流通体系に対する必要性を低下させることで、発展途上世界のためのワクチン接種のためのＭｉｃｒｏＣｕｂｅが提案される。

本発明の一態様は、多数の昆虫ウイルス粒子を環境の侵襲から保護するウイルス性多面体、すなわちポリへドリンタンパク質のウイルス含有結晶の天然機能を用いることである。多面体の著しい物理化学的安定性は、土壌中で多年にわたり環境温度で、ウイルスの感染性が保存され得ることを意味する。最近、サイポウイルス多面体の大変待ち望まれていた構造によって、これらの結晶を改変して、結晶の全体にそして表面に、ウイルス粒子の代わりに、ヒト病原体に由来するタンパク質を効率的に組み込む、先例のない機会が提供された。本明細書では、これらの結晶は、それらの形とサイズの（０．５〜１０μｍ）のために「ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ」と称される。

サブユニットワクチンは、いくつかの主要な病原体（例えばＨＩＶ）を防ぐのに必要である、強力な細胞性免疫応答を引き起こすことができない。弱毒化ウイルスは安全性に劣り、多数の疾患（例えばマラリア）のために改変することは不可能でないにしても困難である。対照的に、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、改善された抗原提示とそれらの微粒子特性のために、一連の抗原に対する体液性および細胞性応答の双方を誘導することが提案される。これに加えて、抗原の高度に多価の提示、および徐放送達機序は、単回注射免疫であってさえも、いかなる利用できるサブユニットワクチンよりも免疫応答がはるかにより強力で、より持続性であることを意味する。

今まで、抗原の対称的提示の利点は、遺伝的ワクチンプラットフォームの可能性を欠く特定例でのみ探索されてきた。例えば、ウイルス様粒子ベースのワクチンは、現在のパピローマウイルスワクチン（例えば「Ｇａｒｄａｓｉｌ」）およびＢ型肝炎ワクチン（例えば「Ｅｎｇｅｒｉｘ−Ｂ」）において非常に成功しているが、特に大型または複数の抗原が必要な場合、一般に適用可能でない。対照的に、いくつかの実施形態では、ウイルス粒子全体程の大きな積荷に耐えて、一度に複数の異なる抗原にさえ耐性であるＭｉｃｒｏＣｕｂｅが提案される。

本明細書で示されるように、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、マウスに注射した際に、特異的抗体生成と頑強な細胞応答の双方をはじめとする、強力な免疫応答を誘導する。これは、結晶が生物から迅速に除去され、または抗原提示細胞によって処理されることができず、または体液性または細胞性応答のどちらかのみを誘導できるという、基礎的な情報からは予期できなかった。

実施例８
例示的な抗原ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（多面体）の遺伝子操作
ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは改変されＨＩＶ−１ Ｇａｇタンパク質に効率的に組み込まれ得る
特定用途向けプラスミドｐＤＥＳＴ−Ｈ１に、Ｂｍ−ＣＰＶＨ１−ｔａｇとのＮ末端融合として、Ｇａｇタンパク質の６つのコンストラクトをクローンした。これらのコンストラクトは、ＨＩＶ−１ＮＬ４．３の完全長ｐ５５Ｇａｇタンパク質、ＧａｇΔｐ６、およびＧａｇ−ＷＭ（Ｗ_３１６Ｍ_３１７／ＡＡ；Ｇａｇ二量体化低下変異体）であった。これらの各コンストラクトのＣ末端Ｈｉｓ_６−ｔａｇ融合物もまた、改変された。組換えバキュロウイルスは、改変ｐＤＥＳＴ−Ｈ１ベクターおよび直線化バキュロウイルスゲノム（ＢａｃｕｌｏＧｏｌｄ，Ｎｏｖａｇｅｎ）のセルフェクチン媒介同時形質移入によって得られた。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、得られた高力価バキュロウイルス株と、Ｂｍ−ＣＰＶのポリへドリンタンパク質をコードするバキュロウイルスによる、Ｓｆ９細胞の同時感染によって生成された。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、Ｉｊｉｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓ ３０：４２９７−４３０８，２００９に記載されるようにして、感染細胞から超音波処理および分画遠心法によって精製される。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのウエスタンブロット分析は、全てのコンストラクト中へのＧａｇタンパク質の同様レベルの組み込みを実証した。引き続く実験は全て、完全長−Ｈｉｓ_６コンストラクト（図９Ａ〜Ｂ）を使用して実施した。

経時変化は、Ｇａｇが、感染後早くも２４時間でＭｉｃｒｏＣｕｂｅに組み込まれることを明らかにした。組み込みレベルは、感染の４８時間後に増大し、７２時間後に劇的に低下した（データ示さず）。ワクチン接種の目的で、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅを４５〜６５％（ｗ／ｗ）のスクロースステップ勾配で、さらに精製した。調製品次第で、結晶に対応する１本または２本の明白なバンドが観察された。得られた結晶は精製して均質にされ、質量分析法による確認で、極めて過負荷のゲル上でさえも、ＧａｇおよびＢｍ−ＣＰＶポリへドリンタンパク質のみが検出された（図９Ａ）。５５ｋＤａ前後の上方バンドは、ペプチドマスフィンガープリンティング分光測定によって、おそらくはＳＤＳ耐性三量体を形成する、ＨＩＶ−１ＧａｇとＢｍ−ＣＰＶポリへドリンの混合物であることが確認された。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ内の積荷タンパク質のレベルを増大させるために、２つのバキュロウイルス株の比率を一定の総感染効率で変動させた。４倍過剰のＧａｇバキュロウイルス株が、最大組み込みレベルをもたらした。比率は、半定量的ウエスタンブロットと市販のｐ２４ ＥＬＩＳＡ（ＮＣＩ−Ｆｒｅｄｅｒｉｃｋ）によって推定された。最適条件では、ポリへドリンタンパク質対Ｇａｇの比率は９０：１（ｗ／ｗ）または１７０：１（モル：モル）であった。電子顕微鏡法（図９Ｃ〜Ｄ）は、以前の分析（Ｃｏｕｌｉｂａｌｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，４４６：９７−１０１，２００７）から予期されたように、積荷分子組みの込みによって、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの結晶組織中にいかなる甚だしい欠陥も導入されなかったことを実証した。実際、シンクロトロンＸ線の高解像度回析は、これらの結晶から２．４Åまで観察され、結晶性マトリックスの完全性が実証された（データ示さず）。

ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、２つの抗原を同時に組み込み得る
二重標識ＭｉｃｒｏＣｕｂｅを生成する、Ｈ１−ＥＧＦＰとの同時発現。蛍光性の結晶が得られ（図１０Ａ〜Ｂ）、我々は新しいＦＡＣＳ分析を開発し、それを実施して双方の積荷の組み込みの程度を定量化した。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの４２％が二重標識された一方で（図１０Ｃ）、１３％は有意なＥＧＦＰ蛍光を呈示しながらアクセスできるＧａｇを有さなかった。Ｇａｇの大部分は高密度の結晶性マトリックス内に包埋しており、無処理ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ上における抗Ｇａｇ抗体とのインキュベーションによって検出できないので、これらの結晶はなおも二重発現していた可能性がある。合計で３８％の結晶が、積荷を有さなかった。結論として、１）二重ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、一般的Ｈ１−ｔａｇを使用した場合でさえも容易に生成し得て、２）ＦＡＣＳは、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅを特性解析し分類するための強力なツールとして出現した。

実施例９
マウスモデルにおける抗原ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの免疫原性研究
抗原ＭｉｃｒｏＣｕｂｅはマウスにおいて安全であり高度に免疫原性である
高度に精製された結晶は、無菌であり（ＮＡＴＯ公認無菌試験；Ｓｉｌｌｉｋｅｒ Ａｕｓｔｒａｌｉａ）有意なＬＰＳ汚染がない（注射あたり＜０．０２ＥＵ；Ｌｉｍｕｌｕｓ Ａｍｅｂｏｃｙｔｅ Ｌｙｓａｔｅ ａｓｓａｙ；Ｃａｍｂｒｅｘ）ことが示された。抗原ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの免疫原性を調査するために、８匹のＢＡＬＢ／ｃマウス群を高用量（５μｇのＧａｇに相当する）、中用量（１μｇ）または低用量（０．２μｇ）のＰＢＳ中の免疫原で０、４、および７週目に皮下免疫した。３つの対照群には、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）から精製された同一用量の組換えＧａｇを投与した。０（採血前）、４、および８週目に、動物から静脈血を採取した。動物を１０週目に殺処分して、免疫原に対するＴ細胞応答のアセスメントのために脾臓を摘出した。

組換えＧａｇに対するＥＬＩＳＡによる評価で、可溶性ＧａｇおよびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅでは、強力なＧａｇ特異的用量漸増体液性応答が観察された。２．６×１０^４ （可溶性Ｇａｇ）およびｄ１．３×１０^４ （Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ）の最大抗体力価は、５．０μｇ群で測定された（図１１Ａ）。Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ免疫化マウスはまた、結晶性マトリックスを形成するポリへドリンタンパク質に対する強力な抗体応答も実証した。

Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅはまた、Ｇａｇ ｐ５５に対するＩＦＮ−γおよびＩＬ−２ ＥＬＩＳＰＯＴ応答による測定で、非常に強力なＴ細胞応答（＞２００ＳＦＣ／１０^６細胞）、そしてＧａｇのｐ３９またはｐ２４ドメインに対するわずかにより弱い応答も引き起こした。ピークＩＦＮ−γ応答は１．０μｇ群で見られ、５．０μｇではわずかにより低い応答であった。１．０μｇの可溶性Ｇａｇ（平均１６０ＳＦＣ／１０^６個の細胞）よりも、１．０μｇのＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（平均２０５ＳＦＣ／１０^６個の細胞）で、より高いＩＦＮ−γ応答が見られた（図１１Ｂ）。ＣＰＶポリへドリンタンパク質に対する応答はまた、特にＩＦＮ−γアッセイでも非常に強力であった。Ｇａｇタンパク質のＮおよびＣ末端領域に対応する、重複ペプチドの２つのプールの応答のアッセイは、ＩＦＮ−γおよびＩＬ−２の応答の大部分が、タンパク質の後半を対象とすることを示した。

最初の仮説に反して、可溶性Ｇａｇに対するＴ細胞応答もまた強力であり、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのものと実際に匹敵した。この仮説は、非アジュバント化組換えタンパク質が有意な細胞応答を誘導しないことを想定した。しかしここで見られた頑強な細胞性および体液性応答は、注射条件で凝集体およびＶＬＰを形成することが知られている、この組換えＧａｇ調製品の微粒子特性によって説明され得る。これに加えて、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）でなく昆虫細胞中で生成された可溶性Ｇａｇ中では、わずかにより高いＬＰＳレベル（ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの＜０．０２ＥＵ／注射に対して０．０４）が一貫して観察された。汚染ＬＰＳもまた穏和なアジュバントとして機能した可能性もあり、それによって組換えＧａｇにより誘発される応答が高まる。

結論として、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅによる免疫化後に観察された頑強なＧａｇ特異的ＩＦＮ−γおよびＩＬ−２応答、および高力価抗体応答は、このワクチンが、アジュバントを必要とせずに、強力な細胞性および体液性免疫を引き起こすことを実証する。この概念実証は、確立されたワクチンストラテジーと比べて、これらの応答の規模を調査するしっかりした基礎を提供する。

実施例１０
ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの際立った特徴：頑強性および自己アジュバント化特性
ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、抗原をタンパク質分解および熱変性から保護する。
多面体の天然頑強性と、ウイルスサイクルにおけるそれらの保護機能のために、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ内の積荷は分解から保護されるという仮説が立られた。この見解を試験するために、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅを様々な温度でインキュベートしてウエスタンブロットにより分析し、Ｇａｇタンパク質のレベルと完全性をモニターした。−２０℃での凍結と凍結乾燥を最初に調査した。微量の損失が観察され、これらの保存条件は後続の実験では回避された。これは、プラスチック管への付着力増大の結果であると考えられ、それは凍結乾燥後に特に明白であり、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの白色フィルムが管の側面に明らかに沈着した（データ示さず）。

対照的に、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、４℃〜２１℃で、そして３７℃であってさえも高度に安定していることが分かった。可溶性Ｇａｇとの比較を図１２Ａに提示する。可溶性Ｇａｇの分解は３週目に明白であり、１１週目に実質的に完了する。全く対照的に、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ内のＧａｇは、少なくとも１１週間にわたり完全に保護される（図１２Ａ）。

この実験セットの最高温度である３７℃では、中間の状態が観察された。Ｇａｇは最初に完全に保護されるように見えたが、４日目から分解し始め、最終的に１４日目には検出不能になった（データ示さず）。さらなる実験を実施して、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ内のＧａｇ分解の原因の同定を試みて、その防止を試みた。

最初に、タンパク質分解に対するＧａｇの感受性を調査した。予期されたように、可溶性Ｇａｇは、トリプシン分解に対して極めて感受性であることが分かり、３７℃におけるトリプシン（１０μｇ／ｍＬ）との１０μｇの可溶性Ｇａｇのインキュベーションは、１０分未満でＧａｇの完全損失をもたらした（図１２Ｃ）。しかしＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅを同じ実験条件でインキュベートして、ウエスタンブロットにより分析した場合は、より小さなＧａｇ断片のみが分解の影響を受けやすいようであり、完全長Ｇａｇに対応するバンド強度は、３７℃で２４時間のインキュベーションの後でさえも一定のままであった（図１２Ｄ）。したがってＧａｇタンパク質の一部はＭｉｃｒｏＣｕｂｅの表面に存在して、トリプシンによって迅速に分解される一方、結晶性マトリックス内に包埋されるＧａｇは隔絶されて、タンパク質分解から完璧に保護されるようである。この実験はまた、タンパク質分解が、３７℃で観察されたＭｉｃｒｏＣｕｂｅからのＧａｇ損失の理由でないことも暗示する。実際、広域スペクトルプロテアーゼ阻害剤（Ｒｏｃｈｅ Ｃｏｍｐｌｅｔｅ錠剤）が添加された場合でさえも、３７℃で同様のＧａｇの損失が観察された。アジ化ナトリウムによってさらなる安定化は達成されなかったが、血清添加は安定性の改善をもたらした。ヒト血清中では、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、その他の添加剤の不在下において、３７℃で少なくとも１４日間安定していることが分かった（図１２Ｂ）。

結論として、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ内に包埋されている場合、Ｇａｇタンパク質はタンパク質分解から保護され、実験の持続期間（１１週間）にわたり４℃〜２１℃で安定している。Ｇａｇはまた、血清が添加されれば、３７℃でインキュベートした際に安定しており、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの全体的安定性は、発展途上世界の事情に合わせたワクチンのために非常に有望に見える。安定化添加剤、異なる結晶配合物、および現地条件に近いインキュベーション条件を使用して、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ保護能力の精微特性解析を調査する。

抗原ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、２１℃での長期保存およびトリプシン処理の後に、それらの免疫原性を保つ
あらかじめ４℃、２１℃または３７℃で１週間インキュベートされ、またはトリプシンで１時間処理されたＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅによって、３回の皮下免疫化（０、４、および６週目；１μｇ当量のＧａｇ）を受けたＢＡＬＢ／ｃマウスで免疫原性研究を実施した（図１３Ａ）。強力な抗体応答が全群で、わずかにより高い力価が４℃群で観察された（データ示さず）。４℃および２１℃群の双方で比較できるＴ細胞応答が生じた一方で（図１３Ｂ）、３７℃群は同様のＩＬ−２応答を示したが、全ての抗原に対してＩＦＮ−μ応答が低下した。対照群（ｎｏＴＴ）と比較して、トリプシン処理された（ＴＴ）ＭｉｃｒｏＣｕｂｅで免疫化された群は、ＩＬ−２ ＥＬＩＳＰＯＴ応答に見ることができるＧａｇ特異的Ｔ細胞応答のわずかな低下のみを示した。したがってＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅのトリプシン処理は、表面抗原タンパク質が、体液性および細胞性応答に必須でないことを実証した。これは、古典的ウイルス様粒子に見られる表面提示と比較して、基本的に異なる、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの三次元結晶性マトリックス内へのＧａｇのパッケージングを強調する。さらに、投与されたＭｉｃｒｏＣｕｂｅに対して物理的に内部にある抗原が免疫系に提示されることは、表面抗原はもちろん存在してもよいが、必要でないことを示す。強力な体液性および細胞性応答が、４℃および２１℃免疫化群の双方で観察され、それはＭｉｃｒｏＣｕｂｅが、周囲条件で１週間後に、頑強な免疫応答を生じるそれらの能力を保つことを示す。

実施例１１
ヒトＴ細胞に対する抗原提示
ＩＦＮ−γおよびＩＬ−２ ＥＬＩＳＰＯＴアッセイを使用して、ＨＩＶ陽性対象からの自然誘導されたＨＩＶ特異的Ｔ細胞が、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ内で発現されるＧａｇを認識する能力を生体外で評価した。我々はＨＩＶ陽性対象からの末梢血単核細胞を使用して、対照およびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ、組換えＧａｇタンパク質および重複ペプチドの認識についてそれらを試験した。ＧａｇＴ細胞応答を有した６人の内４人の対象において、Ｇａｇタンパク質またはペプチドに対する陽性応答による判定により、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに対する強力な陽性応答が観察された（データ示さず）。２人のＨＩＶ陽性ドナー（Ａ、Ｂ）、および１人のＨＩＶ陰性ドナー（Ｃ）の結果を図１４に提示する。ＨＩＶ Ｇａｇペプチド、可溶性Ｇａｇタンパク質（ｐ５５）またはＭｉｃｒｏＣｕｂｅ（Ｇａｇ−ＣＰＶまたはＣＰＶ）によって、細胞を生体外で再刺激した。ペプチドプールおよびＧａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに対する強力なＩＦＮ−γ応答は、ＨＩＶ陽性サンプルにおいてのみ検出された（図１４）。これは、Ｇａｇ ＭｉｃｒｏＣｕｂｅが取り込まれ、抗原提示細胞によって処理されて、ＨＩＶ陽性ドナーから単離されたＴ細胞に、ＨＩＶエピトープが正しく提示され得ることを実証する。

実施例１２
ＭｉｃｒｏＣｕｂｅはヒトＰＢＭＣ中で成熟ＩＬ−１βの放出を誘導する
ＮＡＬＰ３インフラマソームは、滑液中に危険信号として出現する結晶物質を認識する。シリカおよびミョウバン結晶は、ＮＡＬＰ３インフラマソームの活性化を介して、それらの炎症性および免疫原性の特性を発揮することが最近実証されている（Ｈｏｒｎｕｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９（８）：８４７−８５６，２００８）。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、ＩＬ１βを誘導するインフラマソームの結晶性活性化を介して、そのアジュバント特性の少なくとも一部を発揮するという仮説が立てられた。

数人のドナーからのヒトＰＢＭＣを精製ＭｉｃｒｏＣｕｂｅと共にインキュベートした。Ｐｒｏ−ＩＬ−１βは構成的に発現されず、例えばＴＬＲ刺激に応えた転写誘導を必要とする。ＭｉｃｒｏＣｕｂｅは、それ自体はヒトＰＢＭＣ中でＩＬ−１βの切断および放出を誘導しなかったが、ＬＰＳで初回刺激されたＰＢＭＣは、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅの添加に対して用量依存的様式で強力に応答した（図１５Ａ）。ヒトＰＢＭＣのＭｉｃｒｏＣｕｂｅ媒介活性化は、ミョウバン、シリカ結晶、またはニゲリシンなど、ＮＡＬＰ３インフラマソームのその他の既知の活性化因子程度に強力であった（図１５Ｂ）。特異的ペプチド阻害剤ｚ−ＹＶＡＤによるカスパーゼ−１の阻害は、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ処理に応えたＩＬ−１β応答をほぼ完全に無効にした（図１５Ｃ）。これらのデータは、ヒト免疫細胞中で、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅがＩＬ−１βをカスパーゼ−１依存的様式で活性化することを示唆する。

ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ−誘導性ＩＬ−β分泌に関与する上流機構を解読するために、結晶性インフラマソーム活性化因子の取り込みが、細胞活性化に影響を及ぼすか否かを試験した。フィラメントアセンブリー作用を損なう食作用阻害剤ラトランクリンＡでヒトＰＢＭＣを前処理し、引き続いてＭｉｃｒｏＣｕｂｅで、ならびに非結晶性ＮＡＬＰ３活性化因子ニゲリシンで刺激した。ラトランクリンＡは、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに続くＩＬ−１β放出を強力に阻害した一方、ニゲリシンへの応答は影響を受けなかった（図１５Ｄ）。

実施例１３
ＭｉｃｒｏＣｕｂｅはＮＡＬＰ３インフラマソームを活性化する
ＭｉｃｒｏＣｕｂｅがＮＡＬＰ３インフラマソームを活性化し得るかどうかを調査するために、ＮＡＬＰ３またはＡＳＣを欠いているマウスからの不死化マウスマクロファージ中で実験を実施した（Ｈｏｒｎｕｎｇ ｅｔ ａｌ.、前出）。野生型マウスからのマクロファージは、低下していく量のＭｉｃｒｏＣｕｂｅ曝露による処理に続いて、大量のＩＬ−１βを産生した（図１６Ａ）。対照的に、ＮＡＬＰ３または下流アダプター分子ＡＳＣを欠くマクロファージは、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅに応えて比較できる切断ＩＬ−１βを放出できず（図１６Ｂ）、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅ曝露時のＩＬ−１βプロセッシングに対するＮＡＬＰ３およびＡＳＣの要求が示唆される。まとめると、これらの結果は、シリカ結晶がＮＡＬＰ３／ＡＳＣ複合体を活性化して、カスパーゼ−１の活性化と、引き続く成熟分泌型ＩＬ−１βへのプロＩＬ−１βの切断をもたらすことを明らかに示唆する。

全体的に、これらの結果は、ＭｉｃｒｏＣｕｂｅが、成熟ＩＬ１βを産生するＡＳＣ／ＮＡＬＰ３インフラマソームを食作用依存的様式で活性化することを明らかに実証する。インフラマソーム活性化は、生体内で、強力な炎症促進性効果を有することもあり、それが、マウス実験で観察されたＭｉｃｒｏＣｕｂｅ刺激の自己アジュバント効果の少なくとも一部を説明し得る。

本発明の範囲を逸脱することなく多数の修正ができることは、当業者には明らかである。

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Claims (14)

1. 薬学的または生理学的に許容可能なキャリアおよび／または希釈剤中に複合体を含んでなる、安定した免疫原性またはワクチン組成物であって、当該組成物は、薬学的組成物であって、対象中で免疫応答を誘導する量で前記複合体を含む薬学的組成物であり、かつ、
   前記複合体は、
   ヒトまたは非ヒト動物対象中でそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またその他の抗原と、
   細胞質多角体病ウイルス（ＣＰＶ）に由来するポリへドリンタンパク質と
   を含んでなり、かつ、
   前記抗原が、ＣＰＶポリへドリンタンパク質由来のポリへドリン標的化ペプチドに融合されており、かつ、
   実質的に微粒子多面体形での前記複合体の前記対象への送達が、それに対する免疫応答を誘導する、
   組成物。
2. 前記標的化ペプチドが、ＣＰＶポリへドリンタンパク質のＮ末端Ｈ１α螺旋に由来するか、またはその機能的変種である、請求項１に記載の組成物。
3. 前記複合体に対する前記免疫応答が、細胞性または体液性応答を含む、請求項１または２に記載の組成物。
4. 前記複合体の前記ポリへドリンタンパク質またはポリへドリンペプチド部分への前記免疫応答が、細胞性または体液性応答を含んでなる、請求項１〜３のいずれか一項に記載の組成物。
5. 前記複合体の前記ポリへドリンタンパク質またはポリへドリンペプチド部分への前記免疫応答が、インフラマソーム活性化を含んでなる、請求項１〜４のいずれか一項に記載の組成物。
6. 前記多面体中の前記抗原が熱安定性である、請求項１〜５のいずれか一項に記載の組成物。
7. 前記多面体中の前記抗原が分解低下を呈示する、請求項１〜６のいずれか一項に記載の組成物。
8. 前記抗原がＨＩＶ Ｇａｇポリペプチドまたはその抗原性ペプチドである、請求項１〜７のいずれか一項に記載の組成物。
9. 前記抗原と関連付けられている、感染症、疾患または病状を治療または予防するためのワクチンの製造で使用される、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物。
10. 前記抗原と関連付けられている、感染症、疾患または病状を治療または予防するためのワクチンの製造における、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物の使用。
11. 非ヒト対象または非ヒト患者において免疫応答を引き起こす方法であって、免疫応答を引き起こす条件下において、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物の有効量を前記非ヒト対象または前記非ヒト患者に投与するステップを含んでなる、方法。
12. 抗原と関連付けられている、感染症または疾患または病状に対して、非ヒト対象を免疫化する方法であって、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物を前記非ヒト対象に投与するステップを含んでなる、方法。
13. 病原体による感染症、またはがんまたはその他の病状を治療または予防する方法であって、前記感染症またはがんまたは疾患または病状を治療または予防するのに十分な時間と条件で、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物を非ヒト対象に投与するステップを含んでなる、方法。
14. 非ヒト動物対象または非ヒト患者においてそれに対する免疫応答が求められる病原体抗原またはその他の抗原と特異的に結合する、単離されたまたは精製された抗体または免疫細胞を生成する方法であって、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物の有効量を前記対象または前記患者に投与するステップと、前記抗体または免疫細胞を単離または精製するステップを含んでなる、方法。

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