TWI810456B - Tlr7調節化合物及hiv疫苗之組合 - Google Patents
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Abstract
本發明描述與TLR7調節化合物及HIV疫苗之組合相關的方法、組合物及套組。該組合可用於治療或預防人類之HIV感染之方法中。
Description
先天免疫系統為身體提供對抗入侵病原體之第一線防線。在先天免疫反應中,侵入病原體係藉由生殖系編碼之受體識別,其活化引發導致細胞介素表現之誘導的信號級聯。先天免疫系統受體具有廣泛特異性,從而識別在不同病原體中高度保守之分子結構。此等受體之一個家族由於其與首先鑑別且以果蠅命名之受體的同源性而稱為鐸樣受體(TLR)。TLR存在於諸如巨噬細胞、樹突狀細胞及上皮細胞之細胞中。
在哺乳動物中存在至少十種不同TLR。已鑑別配體及對應信號傳導級聯用於此等受體中之一些。舉例而言,TLR2係藉由細菌(例如大腸桿菌(E. coli))之脂蛋白活化,TLR3係藉由雙股RNA活化,TLR4係藉由革蘭氏陰性細菌(Gram-negative bacteria) (例如,沙門氏菌(Salmonella)及大腸桿菌O157:H7)之脂多醣(亦即LPS或內毒素)活化,TLR5係藉由能動菌(例如李氏菌(Listeria))之鞭毛蛋白活化,TLR7識別咪喹莫特且對咪喹莫特作出反應,且TLR9係藉由病原體DNA之未甲基化CpG序列活化。刺激此等受體中之每一者引起轉錄因子NF-κB及涉及調節細胞介素基因之表現之其他信號傳導分子之活化,該等其他信號傳導分子包括編碼腫瘤壞死因子-α (TNF-α)、介白素-1 (IL-1)及某些趨化因子之信號傳導分子。TLR7促效劑為免疫刺激劑且可誘導活體內產生內源性干擾素-α。
存在多種與TLR有關之疾病、病症及病狀,使得使用TLR促效劑之療法被認為係有前景的,該等疾病、病症及病狀包括(但不限於)黑素瘤、非小細胞肺癌、肝細胞癌、基底細胞癌、腎細胞癌、骨髓瘤、過敏性鼻炎、哮喘、COPD、潰瘍性結腸炎、肝纖維化及病毒感染。
TLR7調節化合物包括美國專利第8,367,670號、第8,629,142號及第8,809,527號之TLR7促效劑化合物,其經由IFN-α最小有效濃度(MEC)展現。TLR7促效劑GS-9620之活性已論述於以下文章中:Lanford等人的Gastroenterology 2013
,144(7)
, 1508-17及Roethle, P.等人的J. Med. Chem. 2013 , 56(18)
, 7324-7333中,該等文章論述美國專利第8,367,670號、第8,629,142號及第8,809,527號之化合物之TLR7促效劑活性,該等化合物包括實例4、49、89、99及105之化合物。
全世界超過3600萬人感染HIV病毒。已研發大量藥物及組合療法用於治療人類之HIV感染。儘管組合抗反轉錄病毒療法(cART)及高活性抗反轉錄病毒療法(HAART)能夠減少HIV病毒活化,通常低於每毫升血漿50個HIV RNA複本,但沒有一種療法會消除HIV感染細胞,該等HIV感染細胞不會主動地複製HIV,通常被稱為患者之HIV潛伏儲集庫。一直在尋求用於治療HIV之「剔除殺滅」方法的策略,其中潛伏儲集庫之細胞將用以「剔除」HIV感染信號以誘導靜態複製型活性HIV前病毒之轉錄,形成短暫病毒血症病況且使得經活化之細胞易受來自抗反轉錄病毒療法之「殺滅」影響。「剔除」程式已對各種藥劑進行測試,該等藥劑包括組蛋白脫乙醯基酶抑制劑、雙硫侖(disulfiram)、PD-1抗體及HIV疫苗,如以下中所述:Barton, K. M.等人,Clin. Pharmacol. Ther. 2013
,93(1)
, 46-56;Marsden, M. D.等人,Cell 2014
,158(5)
, 971-972;Battistini, A.等人,Viruses 2014
,6(4)
, 1715-1758;及Cillo, A. R.等人,Proc. Natl. Acad. Sci. 2014
,111(19)
, 7078-7083。
增加之對高活性組合抗反轉錄病毒療法(cART)之使用使得與人類免疫缺乏病毒(HIV)感染相關之發病率及死亡率顯著降低。然而,儘管具有新穎類別之抗反轉錄病毒藥物,但當前可獲得的cART方案不能夠自身體根除HIV。因此,在維持不可偵測之病毒負荷之參與者中cART中止之後係病毒血症之反彈。此反映了標準cART不能消除由潛伏感染細胞形成之病毒儲集庫,其中綜合前病毒自感染早期保持靜態且穩定,且反映了免疫反應在治療中斷後不能有效地控制病毒反彈。
即使cART控制病毒負荷(因此預防AIDS之發展及病毒傳播),但其仍具有若干問題:
(a)非治癒性:cART係終身治療。若人員停止治療,則病毒負荷通常在2至4週內反彈至初始量,使得此人員再次感染。
(b)依從性問題:30至50%患者不能夠控制病毒負荷,係因為未嚴格遵循治療方案。其與心理壓力有很大關係——攜帶HIV生活而無治癒希望會影響患者之生活品質且即使沒有心理壓力,仍會因患者之治療常式而在不同程度為患者帶來不便(亦稱為「丸劑疲勞」)。
(c)抗性:HIV可對cART產生抗性。
(d)副作用:因為cART之長期毒性,患者可能患有心血管疾病、血脂異常、高血壓、糖尿病、骨質疏鬆或腎病。
(e)高成本:治療具有cART之患者的成本為每年約$20,000,而患者一生之醫療系統之總成本經計算超過$400,000。
(f)社會恥辱感:HIV帶來之恥辱感使人不情願進行測試或揭示其HIV狀態;亦限制其獲得可用HIV治療。
仍需要能夠輔助潛伏HIV感染細胞之活化以增強抗反轉錄病毒療法及免疫反應之活性的新穎藥劑及療法。
在一個實施例中,本發明提供一種治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下的有需要之人類之HIV感染的方法,該方法包含向該人類投與治療有效量之式(I)化合物:,
或其醫藥學上可接受之鹽,
及第一病毒,其包含編碼免疫原性多肽之核酸,該免疫原性多肽包含:
(i) 與SEQ ID NO: 1具有至少90%序列一致性之序列;
(ii) 與SEQ ID NO: 2具有至少90%序列一致性之序列;
(iii) 與SEQ ID NO: 3具有至少90%序列一致性之序列;
(iv) 與SEQ ID NO: 4具有至少90%序列一致性之序列;
(v) 與SEQ ID NO: 5具有至少90%序列一致性之序列;
(vi) 與SEQ ID NO: 6具有至少90%序列一致性之序列;
(vii) 與SEQ ID NO: 7具有至少90%序列一致性之序列;
(viii) 與SEQ ID NO: 8具有至少90%序列一致性之序列;
(ix) 與SEQ ID NO: 9具有至少90%序列一致性之序列;
(x) 與SEQ ID NO: 10具有至少90%序列一致性之序列;
(xi) 與SEQ ID NO: 11具有至少90%序列一致性之序列;
(xii) 與SEQ ID NO: 12具有至少90%序列一致性之序列;
(xiii) 與SEQ ID NO: 13具有至少90%序列一致性之序列;
(xiv) 與SEQ ID NO: 14具有至少90%序列一致性之序列;
(xv) 與SEQ ID NO: 15具有至少90%序列一致性之序列;及
(xvi) 與SEQ ID NO: 16具有至少90%序列一致性之序列;
其中(i)至(xvi)中之至少兩者係藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,其中該連接子使得在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列,且其中(i)至(xvi)中之每一者之序列長度為11至85個胺基酸。
進一步提供一種方法,其包含向人類投與如本文所描述之TLR7調節化合物及HIV疫苗。
相關申請之交叉參考
本申請案主張2019年5月22日申請之美國臨時申請案第62/851,363號之優先權,其出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。I. 綜述
本發明提供用於治療或預防人類之HIV感染之方法、組合物及套組,其包含TLR7調節化合物與HIV疫苗之組合。II. 定義
「本發明化合物」包括本文所揭示之化合物,例如本發明化合物包括式(I)化合物及其醫藥學上可接受之鹽。
「Tris」或參(羥甲基)胺基甲烷或在醫學應用中被稱為緩血酸胺或THAM係具有式(HOCH2
)3
CNH2
之化合物。
「調節(Modulation/modulating)」及「調節劑」係指用以促效(活化或強化)或拮抗(抑制或減少)生物目標之功能之藥劑之作用。促效劑或強化子包括增加TLR7受體活性之調節劑。在本文所描述之利用或含有TLR7調節劑或TLR7調節化合物之每一方法、組合、套組、用途、組合物及方案內,存在其中TLR7調節劑或TLR7調節化合物係TLR7促效劑的單獨實施例。TLR7促效作用可藉由美國專利第8,367,670號中以及Bioorg. Med. Chem. Lett. 16, 4559 (2006)中之PBMC分析方案測定,該專利之內容係以引用之方式併入本文中。
如本文中所使用,關於物質之「醫藥學上可接受」意謂物質在可靠醫學判斷之範疇內、適用於與人類及低等動物之組織接觸而無不當毒性、刺激、過敏反應及其類似情況,與合理利益/風險比率相匹配,且在物質用於醫藥組合物中時有效用於預期用途。
如本文所使用之「醫藥學上可接受之鹽」意謂本發明化合物之鹽,其在可靠醫學判斷之範疇內、適用於與人類及低等動物之組織接觸而無不當毒性、刺激、過敏反應及其類似情況,與合理利益/風險比率相匹配,通常為水溶性或油溶性或水可分散性或油可分散性,且有效用於其預定用途。該術語包括(但不限於)醫藥學上可接受之酸加成鹽及醫藥學上可接受之鹼加成鹽。合適之鹽之清單例如係在Berge, S. M. 等人,J. Pharm. Sci.
,1977
,66
, 1-19中找到。
在蛋白質之情形下,功能等效物或功能等效物之片段可具有一或多個保守胺基酸取代。術語「保守性胺基酸取代」係指用具有類似於原始胺基酸殘基之特性的另一胺基酸殘基取代胺基酸。保守胺基酸之群如下:
群 | 胺基酸之名稱 |
脂族 | Gly, Ala, Val, Leu, Ile |
含羥基或含硫氫基/含硒 | Ser, Cys, Thr, Met |
環狀 | Pro |
芳族 | Phe, Tyr, Trp |
鹼性 | His, Lys, Arg |
酸性及其醯胺 | Asp, Glu, Asn, Gln |
保守取代可引入預定肽或其片段之任何位置。然而,亦可需要引入非保守取代,尤其(但不限於)在任何一或多個位置中之非保守取代。導致形成肽之功能上等效片段之非保守取代將例如實質上在極性、電荷及/或位阻方面不同,同時維持衍生物或變異片段之功能性。
「序列一致性百分比」係藉由在比較窗上比較兩個最佳比對序列來測定,其中聚核苷酸或多肽序列在比較窗中之部分相較於參考序列(不具有添加或缺失)可具有添加或缺失(亦即空隙)以用於對兩個序列進行最佳比對。在一些情況下,百分比可藉由以下計算:確定一致核酸鹼基或胺基酸殘基出現在兩個序列中之位置的數目,得到匹配位置數目;將匹配位置數目除以比較窗中之位置總數及將結果乘以100,得到序列一致性百分比。
在兩個或更多個核酸或多肽序列之上下文中,「一致」或「一致性」百分比係指,在比較窗內或指定區域內進行最大對應關係比較及比對時相同的或具有指定百分比之胺基酸殘基或相同核苷酸的兩個或更多個序列或子序列(例如,在指定區域(例如整個多肽序列或多肽之個別域)內具有60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%一致性),如使用以下序列比較演算法或藉由手動比對及目視檢查來量測。此類序列隨後稱為「實質上一致」。此定義亦指測試序列之互補序列。
「編碼」特定RNA之DNA序列為可轉錄成RNA之DNA核酸序列。DNA聚核苷酸可編碼轉譯成蛋白質中之RNA (mRNA),或DNA聚核苷酸可編碼未轉譯成蛋白質中之RNA (例如tRNA、rRNA或導向RNA;在本文中亦稱為「非編碼」RNA或「ncRNA」)。「蛋白質編碼序列」或編碼特定蛋白質或多肽之序列係當置於適當調節序列的控制下時經轉錄成mRNA (在DNA之情況下)及經轉譯為活體外或活體內多肽(在mRNA之情況下)的核酸序列。
「載體」、「表現載體」或「構築體」為用於將異源核酸引入具有調節元件之細胞中以提供異源核酸在細胞中之表現的核酸。載體包括(但不限於)質體、微環(minicircles)、酵母以及病毒基因組。在一些實施例中,載體為質體、微環、酵母或基因組。在一些實施例中,載體為病毒載體。
如本文所用之「治療(treatment/treat/treating)」係指用於獲得有益或所需結果之方法。出於本發明之目的,有利或所需結果包括(但不限於)症狀緩解及/或症狀程度減輕及/或預防與疾病或病狀相關之症狀的惡化。在一個實施例中,「治療(treatment/treating)」包括以下中之一或多者:a)抑制疾病或病狀(例如,減少由疾病或病狀引起之一或多種症狀,及/或減輕疾病或病狀之程度);b)減緩或遏制與疾病或病狀相關之一或多種症狀的發展(例如,使疾病或病狀穩定、延遲疾病或病狀之惡化或進展);及c)緩解疾病或病狀,例如使臨床症狀消退、改善疾病病況、延遲疾病進展、提高生活品質及/或延長存活期。
如本文所使用之「治療有效量」或「有效量」係指在投與給患者以治療疾病時有效引發所要生物學或醫學反應的量(包括藥劑(例如式(I)化合物或HIV疫苗)之量)足以實現該疾病之此類治療。有效量將取決於待治療之患者之藥劑、疾病及其嚴重程度及年齡、體重等而變化。有效量可包括一系列量。如此項技術中所理解,有效量可呈一或多次劑量,亦即,單次劑量或多次劑量可為達成所要治療指標所需。在投與一或多種治療劑之情形下可考慮有效量,且若單一藥劑與一或多種其他藥劑結合,則可考慮以有效量給與單一藥劑,可達成或達成所期望或有益之結果。任何共同投與之藥劑之適合劑量可視情況因藥劑之組合作用(例如,加成或協同效應)而降低。
如本文所用之「延緩」疾病或病狀之發展意謂推遲、阻礙、減緩、遏止、穩定及/或延遲疾病或病狀之發展。此延遲可具有不同時間長度,視所治療之疾病及/或個體之病史而定。如熟習此項技術者顯而易見,足夠或顯著延遲可實際上涵蓋預防,從而使個體不出現疾病或病狀。
如本文所用之「預防(prevent/prevention/preventing)」係指防止疾病或病症發作以使得疾病之臨床症狀不發展的療法。因此,「預防」係關於在患者中可偵測到疾病跡象之前向患者投與療法(例如,投與治療物質) (例如,在患者中不存在可偵測感染物(例如,病毒)下向患者投與治療物質)。患者可為處於罹患疾病或病症風險下之個體,諸如具有一或多種已知與疾病或病症發展或發作相關之風險因素的個體。因此,在某些實施例中,術語「預防HIV感染」係指將抗HIV治療物質投與至不具有可偵測HIV感染之患者。應理解,抗HIV預防性治療之患者可為處於感染HIV病毒之風險下的個體。亦應理解,預防不需要100%成功率。在一些情況下,預防可理解為降低感染風險,而非完全消除感染發生。
如本文所使用之「處於風險下之人類」係指處於罹患待治療之病狀之風險下的人員。在進行本文中所描述之治療方法之前,「處於風險下」之人員可能患有或可能未患有可偵測之疾病或病狀,且可能顯示或可能未顯示可偵測之疾病。「處於風險下」表示人員具有一或多種風險因素,其為與疾病或病狀之發展相關且在此項技術中已知的可量測參數。具有此等風險因素中之一或多者的人員比不具有此等風險因素的人員具有更高的發展疾病或病狀之機率。
「病毒感染」描述一種患病病況,其中病毒侵入健康細胞,使用細胞之再生機制以倍增或複製且最終裂解細胞,從而導致細胞死亡,釋放病毒粒子且藉由新產生之後代病毒感染其他細胞。由某些病毒(例如HIV)引起之潛伏性感染亦為病毒感染之可能結果。
如本文所用之「ART」係指抗反轉錄病毒療法。一般而言,該術語係指用於治療人類病毒感染(包括HIV感染)之抗反轉錄病毒藥物療法之組合。組合及方案可包括多種(通常三種或更多種)藥物,諸如核苷反轉錄酶抑制劑(NRTI)、非核苷反轉錄酶抑制劑(NNRTI)、蛋白酶抑制劑(PI)、融合抑制劑、CCR5促效劑及/或整合酶抑制劑。
「病毒負荷」及「HIV病毒負荷」係指HIV感染之人類之血液中可偵測到之HIV的量。其可藉由估計所涉及體液中之病毒量來計算。舉例而言,其可以每毫升血液或血漿之HIV RNA複本形式給出。「不可偵測」之HIV病毒負荷包含其中HIV RNA複本並未照例藉由標準病毒負荷測試來偵測,例如每毫升血液或血漿少於50個複本HIV RNA的情況。
「病毒血症」係指病毒或病毒粒子在感染病毒之人類中之循環中的可量測存在。短暫病毒血症係指病毒或病毒粒子在感染病毒之人類之循環中之可量測存在的短暫、暫時或臨時增加。短暫HIV病毒血症之一個實例包括其中感染HIV之人類之血液或血漿中已在少於50個HIV-1 RNA複本/mL的濃度下維持一段時間的HIV-1 RNA量短暫地、暫時地或臨時地上升至大於50個複本/mL (諸如50至2,000個複本/mL)的濃度的時期。
術語「慢性設定點」、「慢性HIV感染之設定點」、「病毒負荷設定點」及「慢性HIV感染之病毒設定點」係指在感染HIV之人類之血液中確立的穩態HIV病毒負荷。慢性設定點可指在引入抗反轉錄病毒療法或治療(包括投與本文所述之ART、TLR7調節化合物及/或HIV疫苗)之後或在中止抗反轉錄病毒療法或治療之後的感染後之穩態HIV病毒負荷之值。可在單個感染HIV之人類中測定慢性設定點或將其測定為感染HIV之人類之組中之中值慢性設定點。當比較兩個慢性設定點時,第一慢性設定點可為第二慢性設定點之百分比,或第二慢性設定點可為第一慢性設定點之倍數。舉例而言,100個複本HIV-1 RNA/mL之第一慢性設定點係1000個複本HIV-1 RNA/mL之第二慢性設定點之10%,且可替代地被描述為比第一慢性設定點高10倍之第二慢性設定點。
「病毒反彈」係指如下觀測結果:在用ART治療之後在病毒學上抑制之感染HIV之人類中的不可偵測之HIV病毒負荷常常在ART中止之後回復至可偵測之治療前HIV病毒負荷。病毒反彈可在ART中止之後數天或數週(例如4週)內發生。「病毒反彈之延遲」係指在中止ART之後(例如第4週)的病毒反彈之預期觀測結果與中止另一療法(例如,根據本文描述之方法投與ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗)之後(例如第12週)的實際觀測病毒反彈之間的時段。在以上假設實例中,病毒反彈之延遲為治療ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗之後8週。可在單一感染HIV之人類中測定病毒反彈之延遲或將其測定為感染HIV之人類之組中之病毒反彈的中值延遲。III. 化合物
本文描述可用於本發明之方法、組合物及/或套組中之TLR7調節化合物。在一些實施例中,TLR7調節化合物為式(I)化合物:,
或其醫藥學上可接受之鹽。
本文描述之TLR7調節化合物之醫藥學上可接受之鹽包括(但不限於):保留游離鹼之生物有效性及特性且並非在生物學上或其他方面不合需要的鹽,其由無機酸(包括但不限於鹽酸、氫溴酸、硫酸、胺磺酸、硝酸、磷酸及其類似物)及有機酸(包括但不限於乙酸、三氟乙酸、己二酸、抗壞血酸、天冬胺酸、苯磺酸、苯甲酸、丁酸、樟腦酸、樟腦磺酸、肉桂酸、檸檬酸、二葡萄糖酸、乙磺酸、麩胺酸、乙醇酸、甘油磷酸、半硫酸、己酸、甲酸、反丁烯二酸、2-羥基乙磺酸(羥乙基磺酸)、乳酸、羥基順丁烯二酸、蘋果酸、丙二酸、杏仁酸、均三甲苯磺酸、甲磺酸、萘磺酸、菸鹼酸、2-萘磺酸、草酸、雙羥萘酸、果膠酯酸、苯乙酸、3-苯基丙酸、特戊酸、丙酸、丙酮酸、柳酸、硬脂酸、丁二酸、對胺基苯磺酸、酒石酸、對甲苯磺酸、十一酸及其類似物)形成。
亦包括本發明化合物之固體形式。式(I)之TLR7調節化合物之結晶形式描述於美國專利第9,738,646號及第10,202,384號中,其各自以全文引用之方式併入本文中。式(I)化合物之例示性結晶形式可藉由在5.8、11.4、11.6、17.7、20.1、20.9、22.3、23.9、26.0及26.8度2θ (±0.2度2θ)處具有峰值的X射線粉末繞射(XRPD)圖表徵,其中XRPD係使用CuKα1
輻射及具有約133℃、170℃及273℃下之吸熱之差示掃描熱量測定(DSC)曲線圖製得。式(I)化合物之另一例示性結晶形式可藉由在4.6、9.2、15.8、17.8、18.3、19.2、19.9、22.4、25.5及29.1度2θ (±0.2度2θ)處具有峰值的XRPD圖表徵,其中XRPD係使用CuKα1
輻射及在約98℃及約253℃下之DSC吸熱製得。IV. 疫苗
本文描述特異性靶向HIV病毒之Gag、Pol、Vif及Nef蛋白質上之區域的HIV疫苗。此類HIV疫苗可誘導對一或多種HIV蛋白質之免疫反應,且可保護不具有HIV感染之人類避免感染病毒或可對感染HIV或後來感染HIV之人員具有治療作用。疫苗一般包含遞送機制,例如病毒載體;及包裝,諸如免疫原性組合物或編碼免疫原性組合物之核酸,其經設計以產生所要免疫反應。在一些實施例中,免疫原性組合物包含免疫原性多肽,該免疫原性多肽為能夠在活體內引入時誘導後天性免疫反應(亦即體液或細胞介導之免疫反應)的抗原。
能夠將所需包裝引入身體中以促進適應性反應之任何病毒載體可用於本發明所描述之方法、組合物及/或套組中。在一些實施例中,病毒載體包含活載體疫苗、滅活疫苗或經修飾之套膜疫苗。在一些實施例中,病毒載體包含腺病毒科(Adenoviridae)、痘病毒科(Poxviridae)、疱疹病毒科(Herpesviridae)、腺相關病毒、細胞巨大病毒(cytomegalovirus)、卡連環痘(carynpox)、風疹脊髓灰白質炎病毒(rubella poliovirus)、委內瑞拉馬腦炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus)、慢病毒(lentivirus)或仙台(Sendai)病毒載體。在一些實施例中,病毒載體包含腺病毒科或痘病毒科病毒載體。在一些實施例中,病毒載體包含痘病毒載體,例如經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)載體。例示性MVA載體描述於Barouch, D. H.等人的Cell 2013
,155(3)
, 531-539中(其以全文引用的方式併入本文中)。在一些實施例中,病毒載體包含腺病毒病毒載體,諸如黑猩猩腺病毒(chimpanzee adenovirus),例如複製缺陷型黑猩猩腺病毒。例示性黑猩猩腺病毒載體已描述於例如美國專利第9,714,435號中(其以全文引用之方式併入本文中)。
國際公開案WO 2013/110818及美國專利第9,988,425號(其中之每一者以全文引用之方式併入本文中)描述HIV疫苗接種之免疫原。HIV-1病毒之Gag、Pol、VIf及Nef蛋白質中之十六個區域相對保守且藉由具有<5000個HIV-1 RNA複本/mL之降低的病毒負荷的HIV患者靶向。Hancock, G.等人的PLOS Pathogens 2015
,11(2)
, e1004658; Mothe, B.等人的J. Translational Med. 2015
,13
, 60。HIV蛋白質之此等區域形成用於HIV之治療性疫苗接種的免疫原之基礎。下表概述藉由免疫原靶向之HIV-1區域:
HIV編號係正如Korber, B. T.等人(1998)的HIV相對於HXB2CG之編號位置(Numbering positions in HIV relative to HXB2CG)中所描述。在Korber, C. K.、Foley, B.、Hahn, B.、McCutchan, F.、Mellors, J.及Sodroski, J (編).Human Retroviruses and AIDS 1998
中。理論生物學及生物物理學組(Theoretical Biology and Biophysics Group), 洛斯阿拉莫斯國家實驗室(Los Alamos National Laboratory), Los Alamos, NM, 第 III-102-111頁。
HIV-1 蛋白質 | 位置 (HXB2) | SEQ ID NO |
p17 | 17-94 | 1 |
p24 | 30-43 | 2 |
p24 | 61-71 | 3 |
p24 | 91-150 | 4 |
p24 | 164-177 | 5 |
p24 | 217-231 | 6 |
p2p7p1p6 | 63-89 | 7 |
蛋白酶 | 45-99 | 8 |
反轉錄酶 | 34-50 | 9 |
反轉錄酶 | 210-264 | 10 |
反轉錄酶 | 309-342 | 11 |
整合酶 | 210-243 | 12 |
整合酶 | 266-282 | 13 |
Vif | 25-50 | 14 |
Vif | 166-184 | 15 |
Nef | 56-68 | 16 |
在一些實施例中,HIV疫苗包含含免疫原性多肽之病毒或編碼免疫原性多肽之核酸,其中該免疫原性多肽包含:
(i) 與SEQ ID NO: 1具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(ii) 與SEQ ID NO: 2具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(iii) 與SEQ ID NO: 3具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(iv) 與SEQ ID NO: 4具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(v) 與SEQ ID NO: 5具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(vi) 與SEQ ID NO: 6具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(vii) 與SEQ ID NO: 7具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(viii) 與SEQ ID NO: 8具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(ix) 與SEQ ID NO: 9具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(x) 與SEQ ID NO: 10具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xi) 與SEQ ID NO: 11具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xii) 與SEQ ID NO: 12具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xiii) 與SEQ ID NO: 13具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xiv) 與SEQ ID NO: 14具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xv) 與SEQ ID NO: 15具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;及
(xvi) 與SEQ ID NO: 16具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
其中(i)至(xvi)中之至少兩者係藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,其中該連接子使得在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列,且其中(i)至(xvi)中之每一者之序列長度為11至85個,例如11至82個、11至80個或11至78個胺基酸。在一些實施例中,免疫原性多肽包含具有在SEQ ID NO: 1-16中之任一者中具有不超過1、2或3個取代之胺基酸序列的序列。在一些實施例中,免疫原性多肽包含具有根據SEQ ID NO: 1-16之胺基酸序列的序列。
在一些實施例中,免疫原性多肽包含與SEQ ID NO: 17具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之胺基酸序列。在一些實施例中,免疫原性多肽包含根據SEQ ID NO: 17之胺基酸序列。
免疫原性多肽可由任何適合之核酸序列編碼。在一些實施例中,編碼免疫原性多肽之核酸包含與SEQ ID NO: 18具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之核酸序列。在一些實施例中,編碼免疫原性多肽之核酸包含根據SEQ ID NO: 18之核酸序列。
在一些實施例中,HIV疫苗包含經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),其包含編碼具有根據SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。在一些實施例中,HIV疫苗包含複製缺陷型黑猩猩腺病毒,其包含編碼具有根據SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。V. 組合物
在一些實施例中,本發明提供一種醫藥組合物,其包含式(I)之TLR7調節化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。
在一些實施例中,醫藥組合物包含如本文所描述之HIV疫苗及醫藥學上可接受之賦形劑。
在一些實施例中,如下文更充分闡述,醫藥組合物包含一或多種額外治療劑。
包含本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合物可用一或多種醫藥學上可接受之賦形劑製備,該等賦形劑可根據一般實踐加以選擇。錠劑可含有包括滑動劑、填充劑、黏合劑及其類似物之賦形劑。在某些實施例中,以固體劑型(包括固體口服劑型)的形式提供包含TLR7調節化合物之組合物。
本文中所描述之適用於經口投與之組合物可以離散單元(單位劑型)形式存在,包括(但不限於)膠囊、藥囊或錠劑,其各自含有預定量之活性成分。在一個實施例中,醫藥組合物為錠劑。
本文所揭示之醫藥組合物包含一或多種本文所揭示之治療劑,例如本發明化合物或HIV疫苗,以及醫藥學上可接受之賦形劑及視情況選用之其他治療劑。含有活性成分之醫藥組合物可呈適用於預期投與方法之任何形式。醫藥學上可接受之賦形劑可為任何佐劑、載劑、賦形劑、滑動劑、甜味劑、稀釋劑、防腐劑、染料/著色劑、增香劑、界面活性劑、濕潤劑、分散劑、懸浮劑、穩定劑、等張劑、溶劑或乳化劑,其已經美國食品與藥物管理局批准為可接受用於人類。
可根據製造醫藥組合物之技術中已知的任何方法製備意欲用於口服使用的組合物,且該等組合物可含有一或多種賦形劑,包括甜味劑、調味劑、著色劑及防腐劑以便提供可口製劑。含有與醫藥學上可接受之無毒賦形劑摻合的活性成分之錠劑為可接受的,該等賦形劑適用於製造錠劑。此等賦形劑可為例如惰性稀釋劑,諸如碳酸鈣或碳酸鈉、乳糖、單水合乳糖、交聯羧甲纖維素鈉、聚維酮、磷酸鈣或磷酸鈉;粒化劑及崩解劑,諸如玉米澱粉或褐藻酸;黏合劑,諸如纖維素、微晶纖維素、澱粉、明膠或阿拉伯膠;及潤滑劑,諸如硬脂酸鎂、硬脂酸或滑石。錠劑可未經包覆或可藉由已知技術(包括微囊封裝)包覆以延遲在胃腸道中之崩解及吸附,且因此提供較長時段的持續作用。舉例而言,可單獨或伴以蠟使用諸如單硬脂酸甘油酯或二硬脂酸甘油酯之時間延遲材料。
可與非活性成分組合以產生劑型之活性成分之量可視預期治療患者及特定投與模式而變化。舉例而言,在一些實施例中,用於向人類經口投與之式(I)化合物之劑型可含有與適當且適宜量之醫藥學上可接受之賦形劑一起調配的約1至10 mg之活性物質,例如約2、3、4、5、6、7或約8 mg。在某些實施例中,醫藥學上可接受之賦形劑在總組合物之約5至約95% (重量:重量)之範圍內變化。
在某些實施例中,在一種變化形式中包含本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽的組合物不含有影響活性成分代謝之速率的藥劑。因此,應理解,在一個態樣中,包含本發明化合物之組合物不包含將影響(例如減緩、阻礙或扼止)本發明化合物或與本發明之化合物分開、依序或同時投與的任何其他活性成分之代謝的藥劑。亦應理解,在一個態樣中,本文中詳細描述之任何方法、套組、製品及其類似物不包含將影響(例如減緩、阻礙或扼止)本發明化合物或與本發明化合物分開、依序或同時投與的任何其他活性成分之代謝的藥劑。
水性組合物(諸如用於製備HIV疫苗調配物之水性組合物)可以無菌形式製備,且當意欲藉由除經口投與以外之方式遞送時,通常可為等張的。所有組合物可視情況含有諸如Rowe等人, Handbook of Pharmaceutical Excipients, 第6版, American Pharmacists Association, 2009中所闡述之賦形劑的賦形劑。賦形劑可包括抗壞血酸及其他抗氧化劑、螯合劑(諸如EDTA)、碳水化合物(諸如糊精)、羥烷基纖維素、羥烷基甲基纖維素、硬脂酸及其類似物。
HIV疫苗調配物內之病毒之量可藉由此項技術中已知之任何手段量測。該量可藉由在一定量之水性組合物內對病毒粒子(vp)之數目進行體積量測(例如,藉由流式細胞測量術)來測定。或者,該量可藉由組合物內之病毒之活性測定,例如藉由噬菌斑分析測定。基於噬菌斑之分析可用於測定在感染劑量方面之病毒濃度。病毒噬菌斑分析測定病毒樣品中噬菌斑形成單位(pfu)之數目,其可用作病毒數量之量度。參見例如Kaufmann, S.H.; Kabelitz, D. (2002).Methods in Microbiology Vol.32: Immunology of Infection
. Academic Press. ISBN 0-12-521532-0。
組合物包括適用於各種投與途徑,包括經口及經肌內投與之組合物。組合物可以單位劑型呈現,且可藉由製藥技術中眾所周知之方法中之任一種來製備。此類方法包括使活性成分(例如本發明化合物或其醫藥鹽)與一或多種醫藥學上可接受之賦形劑結合的步驟。組合物可藉由使活性成分與液體賦形劑或細粉狀固體賦形劑或兩者均勻且緊密地結合,且隨後視需要使產物成形來製備。技術及調配物通常可見於Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第21版, Lippincott Williams and Wilkins, Philadelphia, Pa., 2006中。
在一些實施例中,組合物包含約2至約6 mg,諸如約2、3、4、5或約6 mg,例如2 mg或4 mg式(I)化合物、乳糖、微晶纖維素、交聯羧甲纖維素鈉、硬脂酸鎂、聚乙二醇、聚乙烯醇、滑石及二氧化鈦。
在一些實施例中,該組合物包含於約0.5 mL調配緩衝液中約1×1010
至約1×1011
,例如約1×1010
、2×1010
、3×1010
、4×1010
、5×1010
、6×1010
、7×1010
、8×1010
、9×1010
或約1×1011
個病毒粒子(vp)的複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。在一些實施例中,調配緩衝液包含約10 mM L-組胺酸。在一些實施例中,調配緩衝液包含約35 mM NaCl。在一些實施例中,調配緩衝液包含約7.5% (w/v)蔗糖。在一些實施例中,調配緩衝液包含約1 mM MgCl2
。在一些實施例中,調配緩衝液包含約0.1 mM EDTA二鈉。在一些實施例中,調配緩衝液包含約0.1% (w/v)聚山梨醇酯-80。在一些實施例中,調配緩衝液包含約0.5% (v/v)乙醇。在一些實施例中,調配緩衝液具有約6.6之pH。在一些實施例中,該組合物包含於0.5 mL調配緩衝液中5 × 1010
個病毒粒子(vp)之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,其中調配緩衝液包含10 mM L-組胺酸、35 mM NaCl、7.5% (w/v)蔗糖、1 mM MgCl2
、0.1 mM EDTA二鈉、0.1% (w/v)聚乙二醇-80、0.5% (w/v)聚乙醇且pH為6.6。
在一些實施例中,該組合物包含經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)之約0.5 mL Tris緩衝液中之約0.5×108
至約5×108
個,例如約1×108
個、2×108
個、3×108
個、4×108
個或約5×108
個噬菌斑形成單位(pfu),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。在一些實施例中,該組合物包含經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)之0.5 mL Tris緩衝液中之約2×108
個噬菌斑形成單位(pfu),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。VI. 方法
如熟習此項技術者將瞭解,當治療諸如HIV之病毒感染時,此類治療可以多種方式表徵且藉由多個評估指標量測。本發明之範疇意欲涵蓋所有此類表徵。
在一些實施例中,一種治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下的有需要之人類之HIV感染的方法包含向人類投與本發明之TLR7調節化合物(例如式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽)及如本文所描述之HIV疫苗。在一些實施例中,該方法可有效誘導針對HIV之一或多個分支之免疫反應。在一些實施例中,該方法可用於誘導針對人類之病毒感染之多個抗原決定基的免疫反應。針對病毒感染誘導免疫反應可使用熟習此項技術者已知用於判定免疫反應是否已發生之任何技術評估。偵測本發明之免疫反應之適合方法尤其包括偵測患者之血清中之病毒負荷或抗原之減少、偵測干擾素(IFN)-γ-分泌抗原特異性T細胞及偵測一或多種肝酶(諸如丙胺酸轉移酶(ALT)及天冬胺酸轉移酶(AST))之含量之升高。在一個實施例中,偵測IFN-γ-分泌抗原特異性T細胞係使用ELISPOT檢定或FACS分析實現。另一實施例包括降低與HIV感染相關之病毒負荷,包括如藉由PCR測試所量測之降低。
TLR7調節化合物能夠自潛伏HIV儲集庫誘導短暫病毒血症。參見例如美國專利公開案20160008374 (以全文引用之方式併入本文中)。潛伏HIV儲集庫及潛伏HIV感染係指靜息CD4+ T淋巴細胞或其他細胞感染HIV但未主動地產生HIV之病狀。非活性HIV感染細胞通常稱為潛伏感染細胞。抗反轉錄病毒療法(ART)可將血液中HIV之含量減少至不可偵測水準,同時HIV之潛伏儲集庫繼續存活。當再活化潛伏感染細胞時,細胞開始產生HIV (HIV複製)。
治療或預防HIV感染之方法可靶向及移除活性HIV病毒以及活化潛伏HIV病毒以便靶向及移除來自潛伏儲集庫之HIV病毒,該方法包含本發明之TLR7調節化合物與如本文所描述之HIV疫苗之「剔除殺滅」組合。測定潛伏儲集庫中HIV之含量之方法為此項技術中已知的,且包括例如直接量測CD4+ T細胞中HIV DNA之含量及間接量測在抗HIV療法中止之後病毒反彈之時間。與針對標準HIV療法所觀測到之病毒反彈相比,藉由本文所述之治療或預防方法改善對HIV病毒血症之控制可反映在病毒反彈之延遲中。
在一些實施例中,包含向人類投與本發明之TLR7調節化合物及如本文所述之HIV疫苗的治療或預防人類HIV感染之方法進一步包含在抗HIV病毒治療(包括ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗)中止之後維持低病毒負荷(例如小於約200、100、50或約20個HIV-1 RNA複本/mL血液或血漿),持續一段時間,例如約一週至約9個月。在一些實施例中,與僅投與TLR7調節化合物或HIV疫苗相比,投與TLR7調節化合物及HIV疫苗之後的時間段更長。在一些實施例中,該時間段為一週、兩週、三週、一個月、2個月、3個月、4個月、5個月、6個月、7個月、8個月、9個月或更久。
在一些實施例中,一種治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下的有需要之人類之HIV感染的方法包含向人類投與式(I)之TLR7調節化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗。在一些實施例中,TLR7調節化合物為式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,HIV疫苗包含含有編碼免疫原性多肽之核酸的病毒,該免疫原性多肽包含具有根據SEQ ID NO: 1-16之胺基酸序列的序列,例如具有SEQ ID NO: 17之序列的免疫原性多肽。
在一些實施例中,患有HIV感染之有需要之人類為在病毒學上經抑制之人類,亦即維持於或低於指定人類或抗病毒治療或方案之所要病毒血症程度之病毒感染之人類。HIV感染之人類中HIV病毒學抑制之實例可為維持人類中之可量測HIV病毒負荷小於200個HIV-1 RNA複本/mL血液或血漿。病毒學抑制之其他實例將為維持人類中之病毒負荷小於100個複本/mL、小於50個複本/mL、小於40個複本/mL、小於30個複本/mL及小於20個複本/mL。
在一些實施例中,治療或預防HIV感染之方法包含達成人類中之病毒學抑制。在一些實施例中,治療或預防HIV感染之方法包含維持人類中之病毒學抑制。
在一些實施例中,病毒學抑制可經由其他抗HIV療法(諸如抗反轉錄病毒療法(ART))達成。在一些實施例中,抗反轉錄病毒療法包含HIV反轉錄酶抑制劑(例如核苷或非核苷反轉錄酶抑制劑)、HIV整合酶抑制劑、HIV非催化位點(或異位)整合酶抑制劑、HIV進入(融合)抑制劑、HIV成熟抑制劑或其組合。例示性抗反轉錄病毒劑包括HIV整合酶催化位點抑制劑,如雷特格韋(raltegravir) (ISENTRESS®; Merck)、比替格韋(bictegravir) (Gilead)、埃替格韋(elvitegravir) (Gilead)、索特格韋(soltegravir) (GSK, ViiV)、卡伯格韋(cabotegravir) (GSK 1265744, GSK744, GSK, ViiV)及都魯格韋(dolutegravir);HIV核苷反轉錄酶抑制劑,如阿巴卡韋(abacavir) (ZIAGEN®, GSK)、地達諾新(didanosine) (VIDEX®, BMS)、反丁烯二酸替諾福韋二吡呋酯(tenofovir disoproxil fumarate) (VIREAD®, Gilead)、替諾福韋艾拉酚胺(tenofovir alafenamide) (TAF)、安卓西他賓(emtricitabine) (EMTRIVA®, Gilead)、拉美夫定(lamivudine) (EPIVIR®, GSK/Shire)、司他夫定(stavudine) (ZERIT®, BMS)、齊多夫定(zidovudine) (RETROVIR®, GSK)、阿巴卡韋(abacavir)、艾夫他濱(elvucitabine) (Achillion)、替諾福韋前藥(tenofovir exalidex) (CMX-157, Chimerix)及非替那韋(festinavir) (Oncolys);HIV非核苷反轉錄酶抑制劑,如奈韋拉平(nevirapine) (VIRAMUNE®, BI)、依法韋侖(efavirenz) (SUSTIVA®, BMS)、依曲韋林(etravirine) (INTELENCE®, J&J)、利匹韋林(rilpivirine) (TMC278, R278474, J&J)、福斯韋林(fosdevirine) (GSK, ViiV)、多拉韋林(doravirine) (MK-1439, Merck)及樂司韋林(lersivirine) (Pfizer /ViiV);HIV蛋白酶抑制劑,如阿紮那韋(atazanavir) (REYATAZ®, BMS)、達盧那韋(darunavir) (PREZISTA®, J&J)、茚地那韋(indinavir) (CRIXIVAN®, Merck)、咯匹那韋(lopinavir) (KALETRA®, Abbvie)、奈非那韋(nelfinavir) (VIRACEPT®, Pfizer)、沙奎那韋(saquinavir) (INVIRASE®, Hoffmann-LaRoche)、替拉那韋(tipranavir) (APTIVUS®, BI)、利托那韋(ritonavir) (NORVIR®, Abbvie)及夫沙那韋(fosamprenavir) (LEXIVA®, GSK/Vertex);HIV進入抑制劑,如馬拉維若(maraviroc) (SELZENTRY®, Pfizer)、恩夫韋地(enfuvirtide) (FUZEON®, Trimeris)及福斯薩維(fostemsavir) (BMS-663068, BMS);及HIV成熟抑制劑,如貝韋立馬(bevirimat) (Myriad Genetics)。
在一些實施例中,抗反轉錄病毒療法包含一或多種選自由以下組成之群的藥劑:雷特格韋、埃替格韋、索特格韋、卡伯格韋、都魯格韋、阿巴卡韋、地達諾新、反丁烯二酸替諾福韋二吡呋酯、替諾福韋艾拉酚胺、安卓西他賓、拉美夫定、司他夫定、齊多夫定、阿巴卡韋、艾夫他濱、替諾福韋前藥、非替那韋、奈韋拉平、依法韋侖、依曲韋林、利匹韋林、福斯韋林、多拉韋林、樂司韋林、阿紮那韋、達盧那韋、茚地那韋、咯匹那韋、奈非那韋、沙奎那韋、替拉那韋、利托那韋、夫沙那韋、馬拉維若、恩夫韋地、福斯薩維、貝韋立馬、考比西他(cobicistat)及比替格韋(bictegravir);或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,抗反轉錄病毒療法包含一或多種選自由以下組成之群的藥劑:雷特格韋、索特格韋、卡伯格韋、都魯格韋、阿巴卡韋、地達諾新、反丁烯二酸替諾福韋二吡呋酯、替諾福韋艾拉酚胺、安卓西他賓、拉美夫定、司他夫定、齊多夫定、阿巴卡韋、艾夫他濱、替諾福韋前藥、非替那韋、利匹韋林、福斯韋林、多拉韋林、樂司韋林、馬拉維若、恩夫韋地、福斯薩維、貝韋立馬及比替格韋;或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,抗反轉錄病毒療法包含三種或更多種藥劑,例如兩種核苷反轉錄酶抑制劑及非核苷反轉錄酶抑制劑或整合酶抑制劑。
在一些實施例中,治療或預防HIV感染之方法包含在投與ART之後投與式(I)之TLR7調節化合物及HIV疫苗。在一些實施例中,治療或預防HIV感染之方法包含將本發明之TLR7調節化合物及HIV疫苗與ART同時投與。在一些實施例中,ART之治療劑在投與TLR7調節化合物及HIV疫苗之前及期間係相同的。在一些實施例中,ART之治療劑在投與TLR7調節化合物及HIV疫苗之前及期間係不同的。
已在非人類靈長類動物中研發出HIV疫苗接種方案,其包含兩種不同病毒,例如腺病毒激活免疫接種載體及經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)加打載體。參加例如Barouch, D. H. 等人的Cell 2013
,155(3)
, 531-539。與使用單一病毒載體之HIV疫苗相比,此異源初打-加打免疫苗接種方法可提供更有效的HIV疫苗。因此,在一些實施例中,HIV疫苗包含第一病毒及第二病毒。在一些實施例中,第一病毒包含腺病毒科或痘病毒科病毒載體,例如腺病毒病毒載體,例如黑猩猩腺病毒,諸如複製缺陷型黑猩猩腺病毒。在一些實施例中,第二病毒包含痘病毒科病毒載體,例如經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)。
在一些實施例中,一種治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與治療有效量之式(I)化合物:,
或其醫藥學上可接受之鹽,
及第一病毒,其包含免疫原性多肽或編碼免疫原性多肽之核酸,其中該免疫原性多肽包含:
(i) 與SEQ ID NO: 1具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(ii) 與SEQ ID NO: 2具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(iii) 與SEQ ID NO: 3具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(iv) 與SEQ ID NO: 4具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(v) 與SEQ ID NO: 5具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(vi) 與SEQ ID NO: 6具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(vii) 與SEQ ID NO: 7具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(viii) 與SEQ ID NO: 8具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(ix) 與SEQ ID NO: 9具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(x) 與SEQ ID NO: 10具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xi) 與SEQ ID NO: 11具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xii) 與SEQ ID NO: 12具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xiii) 與SEQ ID NO: 13具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xiv) 與SEQ ID NO: 14具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xv) 與SEQ ID NO: 15具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;及
(xvi) 與SEQ ID NO: 16具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
其中(i)至(xvi)中之至少兩者係藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,其中該連接子使得在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列,且其中(i)至(xvi)中之每一者之序列長度為11至85個,例如11至82個、11至80個或11至78個胺基酸。在一些實施例中,免疫原性多肽包含具有在SEQ ID NO: 1-16中之任一者中具有不超過1、2或3個取代之胺基酸序列的序列。在一些實施例中,免疫原性多肽包含具有根據SEQ ID NO: 1-16之胺基酸序列的序列。
在一些實施例中,該方法包含免疫原性多肽,該免疫原性多肽包含與SEQ ID NO: 17具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之胺基酸序列。在一些實施例中,免疫原性多肽包含根據SEQ ID NO: 17之胺基酸序列。
在一些實施例中,該方法包含編碼免疫原性多肽之核酸,該免疫原性多肽包含與SEQ ID NO: 18具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性的核酸序列。在一些實施例中,編碼免疫原性多肽之核酸包含根據SEQ ID NO: 18之核酸序列。
在一些實施例中,一種治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與治療有效量之式(I)化合物:,
或其醫藥學上可接受之鹽,
及第一病毒,其包含編碼免疫原性多肽之核酸,該免疫原性多肽包含:
(i) 與SEQ ID NO: 1具有至少90%序列一致性之序列;
(ii) 與SEQ ID NO: 2具有至少90%序列一致性之序列;
(iii) 與SEQ ID NO: 3具有至少90%序列一致性之序列;
(iv) 與SEQ ID NO: 4具有至少90%序列一致性之序列;
(v) 與SEQ ID NO: 5具有至少90%序列一致性之序列;
(vi) 與SEQ ID NO: 6具有至少90%序列一致性之序列;
(vii) 與SEQ ID NO: 7具有至少90%序列一致性之序列;
(viii) 與SEQ ID NO: 8具有至少90%序列一致性之序列;
(ix) 與SEQ ID NO: 9具有至少90%序列一致性之序列;
(x) 與SEQ ID NO: 10具有至少90%序列一致性之序列;
(xi) 與SEQ ID NO: 11具有至少90%序列一致性之序列;
(xii) 與SEQ ID NO: 12具有至少90%序列一致性之序列;
(xiii) 與SEQ ID NO: 13具有至少90%序列一致性之序列;
(xiv) 與SEQ ID NO: 14具有至少90%序列一致性之序列;
(xv) 與SEQ ID NO: 15具有至少90%序列一致性之序列;及
(xvi) 與SEQ ID NO: 16具有至少90%序列一致性之序列;
其中(i)至(xvi)中之至少兩者係藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,其中該連接子使得在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列,及
其中(i)至(xvi)中之每一者之序列長度為11至85個胺基酸。
在該方法之一些實施例中,免疫原性多肽包含:
(i) 與SEQ ID NO: 1具有至少95%序列一致性之序列;
(ii) 與SEQ ID NO: 2具有至少95%序列一致性之序列;
(iii) 與SEQ ID NO: 3具有至少95%序列一致性之序列;
(iv) 與SEQ ID NO: 4具有至少95%序列一致性之序列;
(v) 與SEQ ID NO: 5具有至少95%序列一致性之序列;
(vi) 與SEQ ID NO: 6具有至少95%序列一致性之序列;
(vii) 與SEQ ID NO: 7具有至少95%序列一致性之序列;
(viii) 與SEQ ID NO: 8具有至少95%序列一致性之序列;
(ix) 與SEQ ID NO: 9具有至少95%序列一致性之序列;
(x) 與SEQ ID NO: 10具有至少95%序列一致性之序列;
(xi) 與SEQ ID NO: 11具有至少95%序列一致性之序列;
(xii) 與SEQ ID NO: 12具有至少95%序列一致性之序列;
(xiii) 與SEQ ID NO: 13具有至少95%序列一致性之序列;
(xiv) 與SEQ ID NO: 14具有至少95%序列一致性之序列;
(xv) 與SEQ ID NO: 15具有至少95%序列一致性之序列;及
(xvi) 與SEQ ID NO: 16具有至少95%序列一致性之序列。
在該方法之一些實施例中,免疫原性多肽包含SEQ ID NO: 1-16之序列,其中SEQ ID NO: 1-16中之至少兩者藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,且其中連接子引起在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列。
在該方法之一些實施例中,免疫原性多肽具有根據SEQ ID NO: 17之胺基酸序列。
在該方法之一些實施例中,該核酸具有根據SEQ ID NO: 18之核酸序列。
在該方法之一些實施例中,第一病毒包含腺病毒科或痘病毒科病毒載體。在一些實施例中,第一病毒包含腺病毒病毒載體。在一些實施例中,第一病毒包含黑猩猩腺病毒病毒載體。在一些實施例中,第一病毒包含複製缺陷型黑猩猩腺病毒病毒載體。在一些實施例中,投與約5×1010
個病毒粒子之第一病毒粒子。在一些實施例中,第一病毒係每12週投與一次。在一些實施例中,第一病毒係投與兩次。
在一些實施例中,該方法進一步包含投與包含編碼免疫原性多肽之核酸的第二病毒。在一些實施例中,第二病毒包含經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)載體。在一些實施例中,投與約2×108
個噬菌斑形成單位之第二病毒。在一些實施例中,第二病毒係每12週投與一次。在一些實施例中,第二病毒係投與兩次。
在該方法之一些實施例中,第一病毒及第二病毒係經肌內投與。
在該方法之一些實施例中,在第0週及第12週投與第一病毒,且在第24週及第36週投與第二病毒。
在該方法之一些實施例中,投與約6 mg至約8 mg式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,在第三次投與病毒之後每兩週投與式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,在第26週、第28週、第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與式(I)化合物。
在該方法之一些實施例中,人類係在病毒學上經抑制的。在一些實施例中,在病毒學上經抑制人類之病毒負荷小於約200、100、50或約20個HIV-1 RNA複本/mL血漿或血液。在一些實施例中,病毒學抑制由投與抗反轉錄病毒療法產生。在一些實施例中,抗反轉錄病毒療法包含一或多種選自由以下組成之群的藥劑:雷特格韋、埃替格韋、索特格韋、卡伯格韋、都魯格韋、阿巴卡韋、地達諾新、反丁烯二酸替諾福韋二吡呋酯、替諾福韋艾拉酚胺、安卓西他賓、拉美夫定、司他夫定、齊多夫定、阿巴卡韋、艾夫他濱、替諾福韋前藥、非替那韋、奈韋拉平、依法韋侖、依曲韋林、利匹韋林、福斯韋林、多拉韋林、樂司韋林、阿紮那韋、達盧那韋、茚地那韋、咯匹那韋、奈非那韋、沙奎那韋、替拉那韋、利托那韋、夫沙那韋、馬拉維若、恩夫韋地、福斯薩維、貝韋立馬、考比西他及比替格韋;或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週及第28週投與4 mg式(I)化合物,且在第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週、第28週及第30週投與4 mg式(I)化合物,且在第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週、第28週、第30週及第32週投與4 mg式(I)化合物,且在第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,且在第26週、第28週、第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,治療或預防患有HIV感染或處於罹患HIV感染之風險下之有需要之人類的HIV感染之方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週及第28週投與6 mg式(I)化合物,且在第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與8 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,治療患有HIV感染之有需要之人類之HIV感染的方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週及第28週投與6 mg式(I)化合物,且在第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與8 mg式(I)化合物。
預期一種方法,其包含向人類投與本文所述之式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗以產生針對人類中HIV之細胞及體液反應。在一些實施例中,疫苗產生有效的細胞毒性T細胞反應。細胞毒性T細胞或細胞毒性T淋巴細胞(CTL)分析可用於在用針對同源及異源HIV病毒株之病毒序列進行次基因組免疫接種之後監測細胞免疫反應。參見Burke, S.等人,J. Inf. Dis. 1994; 170:1110-1119及Tigges, M.等人,J. Immunol, 1996; 156:3901-3910。用於偵測T細胞反應之習知分析包括例如增殖分析、淋巴激素分泌分析、直接細胞毒性分析及有限稀釋分析。舉例而言,可分析已與肽一起培育之抗原呈現細胞在反應細胞群體中誘導CTL反應之能力。抗原呈現細胞可為細胞,諸如周邊血液單核細胞(PBMC)或樹突狀細胞(DC)。或者,用經內部加工之肽裝載I類MHC分子的能力不足且已經適當人類MHC I類基因轉染的突變非人類哺乳動物細胞株可用於測試所關注肽誘導活體外原初CTL反應之能力。PBMC可用作CTL前驅體之反應細胞源。將適當抗原呈現細胞與肽一起培育,其後在最佳化培養條件下將裝載蛋白質之抗原呈現細胞與反應細胞群體一起培育。可藉由分析培養物中殺死放射性標記之目標細胞的CTL的存在來測定陽性CTL活化,該等放射性標記之目標細胞為特異性肽脈衝目標及表現源自肽序列之抗原之經內源性加工形式的目標細胞兩者。舉例而言,可用51
Cr對目標細胞進行放射性標記且可由自目標細胞釋放之放射能計算細胞毒性活性。另一種適合的方法允許藉由用螢光素標記之HLA四聚體複合物染色來直接定量抗原特異性T細胞。參見Altman J,等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993; 90:10330-10334 及Altman J, 等人,Science 1996; 274:94-96。其他相關的最近技術發展包括用於細胞內淋巴激素及干擾素釋放分析之染色或ELISPOT分析。在一些實施例中,一種在有需要之人類中產生有效CTL的方法包含向該人類投與治療有效量之本發明化合物及編碼免疫原性多肽之病毒,該免疫原性多肽包含根據SEQ ID NO: 1-16之序列,其中CTL經導向至HIV病毒之一或多個下列區域: p17 17-94、p24 30-43、p24 61-71、p24 91-150、p24 164-177、p24 217-231、p2p7p1p6 63-89、蛋白酶45-99、反轉錄酶34-50、反轉錄酶210-264、反轉錄酶309-342、整合酶210-243、整合酶266-282、Vif 25-50、Vif 166-184及Nef 56-68,其中胺基酸係根據HIV-1 HXB2編號。
亦提供一種增強HIV疫苗之功效的方法,該方法包含向有需要之人類投與醫藥學上有效量之如本文所描述之式(I)之TLR7調節化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗。
預期經治療之感染HIV之人類優於比較者(經標準護理治療之感染HIV之人類)的臨床改善。臨床改善可包括較低峰值病毒負荷、較低慢性設定點或增加之病毒反彈延遲中之一或多者。
在一些實施例中,如本文所描述之方法對治療HIV感染有效,例如,如藉由相比標準療法(例如僅ART)較低之峰值病毒負荷所測定。如此項技術中通常所理解,在同一時間段內量測第一感染HIV之人類中之第一峰值病毒負荷與第二感染HIV之人類中之第二峰值病毒負荷的比較值。在一些實施例中,在所有抗病毒療法中止之後進行量測。在一些實施例中,在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後,第一感染HIV之人類中之病毒負荷經維持在不可偵測之水準。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷低於第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二峰值病毒負荷。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高,例如高約1.2倍至約10000倍、約2倍至約10000倍、約5倍至約10000倍、約10倍至約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高約1.2倍、約1.5倍、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍、約100倍、約200倍、約500倍、約1000倍、約2000倍、約5000倍或約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高約1000倍。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷低於第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二峰值病毒負荷。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高,例如高約1.2倍至約10000倍、約2倍至約10000倍、約5倍至約10000倍、約10倍至約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高約1.2倍、約1.5倍、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍、約100倍、約200倍、約500倍、約1000倍、約2000倍、約5000倍或約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高約20倍。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷低於第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二峰值病毒負荷。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高,例如高約1.2倍至約10000倍、約2倍至約10000倍、約5倍至約10000倍、約10倍至約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高約1.2倍、約1.5倍、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍、約100倍、約200倍、約500倍、約1000倍、約2000倍、約5000倍或約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二峰值病毒負荷比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一峰值病毒負荷高約100倍。
在一些實施例中,如本文所描述之方法對治療HIV感染有效,例如,如藉由相比標準療法(例如ART)較低之慢性設定點所測定。如此項技術中通常所理解,在同一時間點量測第一感染HIV之人類中之第一慢性設定點與第二感染HIV之人類中之第二慢性設定點的比較值。在一些實施例中,在所有抗病毒療法中止之後進行量測。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點低於第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二慢性設定點。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高,例如高約1.2倍至約10000倍、約2倍至約10000倍、約5倍至約10000倍、約10倍至約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高約1.2倍、約1.5倍、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍、約100倍、約200倍、約500倍、約1000倍、約2000倍、約5000倍或約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高約10倍。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點低於第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二慢性設定點。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高,例如高約1.2倍至約10000倍、約2倍至約10000倍、約5倍至約10000倍、約10倍至約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高約1.2倍、約1.5倍、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍、約100倍、約200倍、約500倍、約1000倍、約2000倍、約5000倍或約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高約2倍。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點低於第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二慢性設定點。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高,例如高約1.2倍至約10000倍、約2倍至約10000倍、約5倍至約10000倍、約10倍至約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高約1.2倍、約1.5倍、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍、約100倍、約200倍、約500倍、約1000倍、約2000倍、約5000倍或約10000倍。在一些實施例中,第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的第二慢性設定點比第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的第一慢性設定點高約10倍。
在所有抗病毒療法中止之後,與標準療法相比,本發明之方法可增加病毒反彈之延遲。在一些實施例中,在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後,感染HIV之人類中之病毒負荷不反彈。在無反彈之情況下,先前感染HIV之人類在抗病毒療法中止之後至少1個月、2個月、3個月、4個月、5個月、6個月、7個月、8個月、9個月、10個月、11個月、1年、1.5年、2年、3年、5年或至少10年或更長時間仍維持抗病毒療法中止後的不可偵測之病毒負荷。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的病毒反彈之第二延遲長。在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的病毒反彈之第二延遲長約1天至約10年,例如約1週至約1年、約2週至約1年、約3週至約1年、約1個月至約1年、約2個月至約1年、約3個月至約1年、約3個月至約2年等。在一些實施例中,與第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的病毒反彈之第二延遲相比,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲超過1天、3天、1週、2週、3週、1個月、2個月、3個月、4個月、5個月、6個月、7個月、8個月、9個月、10個月、11個月、1年、1.5年、2年、3年、5年、10年或更長時間。在一些實施例中,與第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的病毒反彈之第二延遲相比,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲為約1週、約2週、約3週、約1個月、約2個月、約3個月、約4個月、約5個月、約6個月、約7個月、約8個月、約9個月、約10個月、約11個月、約1年、約1.5年、約2年、約3年或更長時間。在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在僅用ART治療之後的病毒反彈之第二延遲長約3個月。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的病毒反彈之第二延遲長。在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的病毒反彈之第二延遲長約1天至約10年,例如約1週至約1年、約2週至約1年、約3週至約1年、約1個月至約1年、約2個月至約1年、約3個月至約1年、約3個月至約2年等。在一些實施例中,與第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的病毒反彈之第二延遲相比,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲超過1天、3天、1週、2週、3週、1個月、2個月、3個月、4個月、5個月、6個月、7個月、8個月、9個月、10個月、11個月、1年、1.5年、2年、3年或更長時間。在一些實施例中,與第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的病毒反彈之第二延遲相比,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲為約1週、約2週、約3週、約1個月、約2個月、約3個月、約4個月、約5個月、約6個月、約7個月、約8個月、約9個月、約10個月、約11個月、約1年、約1.5年、約2年、約3年或更長時間。在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在用ART及TLR7調節化合物治療之後的病毒反彈之第二延遲長約3個月。
在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第二延遲長。在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第二延遲長約1天至約10年,例如約1週至約1年、約2週至約1年、約3週至約1年、約1個月至約1年、約2個月至約1年、約3個月至約1年、約3個月至約2年等。在一些實施例中,與第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第二延遲相比,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲超過1天、3天、1週、2週、3週、1個月、2個月、3個月、4個月、5個月、6個月、7個月、8個月、9個月、10個月、11個月、1年、1.5年、2年、3年或更長時間。在一些實施例中,與第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第二延遲相比,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲為約1週、約2週、約3週、約1個月、約2個月、約3個月、約4個月、約5個月、約6個月、約7個月、約8個月、約9個月、約10個月、約11個月、約1年、約1.5年、約2年、約3年或更長時間。在一些實施例中,第一感染HIV之人類在用ART、TLR7調節化合物及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第一延遲比第二感染HIV之人類在用ART及HIV疫苗治療之後的病毒反彈之第二延遲長約1個月。VII. 投與
向人類投與本發明之TLR7調節化合物(例如式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽)與如本文所描述之HIV疫苗的組合以增加實現所需生物效應及最小化副作用之可能性。在一些實施例中, TLR7調節化合物及HIV疫苗係同時投與。在一些實施例中,TLR7調節化合物及HIV疫苗係依序投與,例如在不同天數或不同週投與。
如本文所描述之HIV疫苗可藉由此項技術中已知之任何手段投與,包括(但不限於)經靜脈內、經肌內、經鞘內、經腹膜內、經鼻內或經口投與。在一些實施例中,HIV疫苗係經肌內投與。在一些實施例中,每8週、每10週、每12週、每14週或每16週投與HIV疫苗一次。在一些實施例中,每12週投與HIV疫苗一次。在一些實施例中,HIV疫苗包含第一病毒及第二病毒。在一些實施例中,第一病毒係投與一或多次,隨後第二病毒係投與一或多次。在一些實施例中,第一病毒係投與兩次,且第二病毒係投與兩次。在一些實施例中,第一病毒係在第0週及第12週投與,且第二病毒係在第24週及第36週投與。
本發明之TLR7調節化合物可藉由此項技術中已知之任何手段投與,包括(但不限於)經靜脈內、經肌內、經鞘內、經腹膜內或經口投與。在一些實施例中,TLR7調節化合物係經口投與。
在一些實施例中,式(I)之TLR7調節化合物或其醫藥學上可接受之鹽係每週、每兩週或每三週投與一次。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係每兩週投與一次,例如每12至16天、每13至15或天每14天投與一次。在一些實施例中,在第三次投與病毒之後每兩週投與式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以連續方式投與,例如每兩週一次,經八週,總計5次投與,亦即在第26週、第28週、第30週、第32週及第34週投與,其中第0週為第一病毒之初次投與。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係間歇投與。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係在第26週、第28週、第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與,其中第0週為第一病毒之初次投與。
在一些實施例中,式(I)化合物係以單一錠劑之形式投與。在一些實施例中,式(I)化合物係以兩種或更多種,例如3、4或5種錠劑之形式投與。當以兩種或更多種錠劑之形式投與時,式(I)化合物可以相同劑量存在,例如三錠2 mg (亦即,3×2 mg)的式(I)化合物,總共投與6 mg,或兩錠4 mg式(I)化合物,總共投與8 mg,或以不同劑量存在,例如一錠4 mg的式(I)化合物及一錠2 mg的式(I)化合物,總共投與6 m。
在一些實施例中,投與約4 mg至約12 mg,諸如約6至約8 mg,例如約4、5、6、7、8、9、10、11或約12 mg式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係投與10次。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以10劑投與,其中第1至2劑為一個4 mg錠劑且第3至10劑為3×2 mg錠劑。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以10劑投與,其中第1至3劑為一個4 mg錠劑且第4至10劑為3×2 mg錠劑。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以10劑投與,其中第1至4劑為一個4 mg錠劑且第5至10劑為3×2 mg錠劑。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以10劑投與,其中第1至10劑為3×2 mg錠劑。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以10劑投與,其中第1至2劑為3×2 mg錠劑且第3至10劑為2×4 mg錠劑。在一些實施例中,式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽係以10劑投與,其中第1至3劑為5×2 mg錠劑且第4至10劑為3×4 mg錠劑。
在一些實施例中,式(I)之TLR7調節化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗係與ART同時投與。在一些實施例中,ART之治療劑在投與式(I)化合物及HIV疫苗之前及期間係相同的。在一些實施例中,ART之治療劑在投與式(I)化合物及HIV疫苗之前及期間係不同的。
在一些實施例中,一種方法包含向人類投與治療有效量之式(I)化合物:,
或其醫藥學上可接受之鹽,
及第一病毒,其包含免疫原性多肽或編碼免疫原性多肽之核酸,其中該免疫原性多肽包含:
(i) 與SEQ ID NO: 1具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(ii) 與SEQ ID NO: 2具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(iii) 與SEQ ID NO: 3具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(iv) 與SEQ ID NO: 4具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(v) 與SEQ ID NO: 5具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(vi) 與SEQ ID NO: 6具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(vii) 與SEQ ID NO: 7具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(viii) 與SEQ ID NO: 8具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(ix) 與SEQ ID NO: 9具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(x) 與SEQ ID NO: 10具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xi) 與SEQ ID NO: 11具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xii) 與SEQ ID NO: 12具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xiii) 與SEQ ID NO: 13具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xiv) 與SEQ ID NO: 14具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
(xv) 與SEQ ID NO: 15具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;及
(xvi) 與SEQ ID NO: 16具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之序列;
其中(i)至(xvi)中之至少兩者係藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,其中該連接子使得在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列,且其中(i)至(xvi)中之每一者之序列長度為11至85個,例如11至82個、11至80個或11至78個胺基酸。在一些實施例中,免疫原性多肽包含具有在SEQ ID NO: 1-16中之任一者中具有不超過1、2或3個取代之胺基酸序列的序列。在一些實施例中,免疫原性多肽包含具有根據SEQ ID NO: 1-16之胺基酸序列的序列。
在一些實施例中,投與包含與SEQ ID NO: 17具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之胺基酸序列的免疫原性多肽。在一些實施例中,免疫原性多肽包含根據SEQ ID NO: 17之胺基酸序列。
在一些實施例中,投與包含與SEQ ID NO: 18具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性之核酸序列的編碼免疫原性多肽之核酸。在一些實施例中,編碼免疫原性多肽之核酸包含根據SEQ ID NO: 18之核酸序列。
在一些實施例中,一種方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週及第28週投與4 mg式(I)化合物,且在第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,一種方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週、第28週及第30週投與4 mg式(I)化合物,且在第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,一種方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週、第28週、第30週及第32週投與4 mg式(I)化合物,且在第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,一種方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,且在第26週、第28週、第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與6 mg式(I)化合物。
在一些實施例中,一種方法包含向人類投與式(I)化合物:,
第一病毒,其包含5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,及
第二病毒,其包含2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸;
其中在第0週及第12週投與第一病毒,在第24週及第36週投與第二病毒,在第26週及第28週投與6 mg式(I)化合物,且在第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與8 mg式(I)化合物。VIII. 套組
本發明提供一種套組,其包含如本文所描述之式(I)之TLR7調節化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗。該套組可進一步包含例如用於治療病毒感染之使用說明書。使用說明書一般為書面說明書,但含有說明書之電子儲存媒體(例如磁碟或光碟)亦為可接受的。
本發明亦提供一種醫藥套組,其包含一或多個容器,該一或多個容器包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗。與此類容器視情況相關聯的可為呈由管理藥品製造、使用或銷售之政府機構所規定之形式之通告,該通告反映機構對製造、使用或銷售以用於人類投與的認可。各組分可封裝於獨立容器中,或在交叉反應性及存放期允許的情況下,可將一些組分合併於一個容器中。套組可呈單位劑型、散裝包裝(例如多劑量包裝)或次單位劑量。套組亦可包括多個單位劑量之化合物及HIV疫苗以及使用說明書,且以足以供藥房(例如,醫院藥房及混配藥房)儲存及使用之數量封裝。
亦提供呈用於本文所描述之方法之適合包裝的製品,其包含單位劑量之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽及HIV疫苗。適合包裝為此項技術中已知,且包括例如小瓶、容器、安瓿、瓶子、罐、軟包裝及其類似物。製品可進一步經滅菌及/或密封。IX. 實例
實例1.式(I)之TLR7調節化合物及HIV疫苗之HIV治療方案
在此實例中描述評估HIV疫苗及式(I)化合物之定序方案在早期診斷及早期治療之HIV-1感染中之安全性及耐受性的IIa階段、隨機、雙盲、雙模擬、安慰劑對照研究。研究篩選感染HIV-1之參與者,其在估計之HIV-1感染日期之180天(6個月)內起始ART且已實現病毒學抑制至少1年。將提供知情同意書且符合研究進入標準之參與者隨機分為4個平行治療組中之1個。在3個週期中進行研究:第1期持續48週,在此期間參與者接受投與方案且繼續ART方案;第2期持續至多24週,在此期間參與者停止ART方案(亦即分析治療中斷期);且第3期持續至多12週,在此期間在參與者重新開始ART之後監測參與者。
參與該研究之參與者的下列標準包括如下患者:
(1) 18至60歲,確認感染HIV-1;
(2)正接受ART,亦即三種或更多中抗反轉錄病毒藥物,其在估計之HIV-1感染日期之6個月內起始。早期治療起始需要由以下標準(a)-(h)中之至少1個記錄:
(a)在ART起始日期之前<160天內對HIV-1/2陰性及陽性血漿HIV-1 RNA之第三代或第四代分析,
(b)在ART起始日期之前<158天內對HIV1/2陰性及陽性血漿HIV-1 p24Ag及陽性血漿HIV-1 RNA之第三代分析,
(c)在ART起始日期之前<158天內對HIV1/2陰性及陽性HIV-1 及HIV-2抗體分化免疫檢定及陽性HIV-1 RNA之第四代分析,
(d)在ART起始日期之前<157天內對HIV-1/2陰性及陽性西方墨點(WB)測試(未偵測到條帶)及陽性HIV-1 RNA之第三代或第四代分析,
(e)在ART起始日期之前<151天內對HIV-1/2陰性及不確定WB測試(<2個套膜條帶)及陽性HIV-1 RNA之第三代或第四代分析,
(f)對HIV-1/2陰性以及不確定HIV-1及HIV-2抗體分化免疫檢定及陽性HIV-1 RNA之第三代或第四代分析,
(g) HIV血清轉化(在第一次陽性HIV測試之前<160天的陰性HIV測試)且ART在自HIV-1診斷以來<90天內起始,及
(h)在ART起始日期之前<151天的相容性病史(在HIV診斷之前<5個月,明確報導有傳播風險及/或記錄有急性反轉錄病毒症候群)之情形下,在ART起始日期之前<90天內對無p31條帶之HIV-1/2陽性及陽性WB測試之第三代或第四代分析;
(3)在篩選前已進行病毒學抑制,定義為pVL<50個複本/mL,持續至少1年;允許有孤立偏差(<200個複本/mL,非連續,表示總測設定點<10%或出現率每年小於或等於兩次);
(4)篩選前6個月具有≥450個細胞/mm3
之穩定CD4計數;及
(5)自HIV診斷以來具有≥200個細胞/mm3
之最低CD4計數;只有在ART起始之後遵循適當的免疫恢復時將允許在急性HIV-1感染時分離之更低計數(參見納入標準#4)。
將篩選參與者以登記參與研究。在提供知情同意書之後,參與者係使用交互式響應技術(IRT)隨機以5:1:1:2比率分配,以接受HIV疫苗及式(I)化合物,僅接受HIV疫苗,僅接受式(I)化合物或安慰劑。隨機化係藉由前哨及非前哨參與者分為不同等級。由前9個參與者組成之前哨組隨機分組為5:1:1:2且給藥。在登記剩餘81個參與者(非前哨組)之前,不知情的獨立安全監測委員會(SMC)檢查在最後一位哨兵參與者已接受其第一次注射之後的第1週收集之前哨組資料。SMC檢查用於研究之剩餘部分的所有參與者之安全性資料。出於與安全無關之原因,在第一次研究用藥品(IMP)給藥後1週內替換停止研究之前哨參與者,而在此後停止研究之前哨參與者及在第一次IMP給藥後停止研究之非前哨參與者未被替換。IMP投與時程將藉由IRT管理。
由於式(I)化合物主要係由具有來自活體外CYP2C8及CYP2D6之較小貢獻之細胞色素P450 (CYP) 3A4酶(CYP3A)代謝,且由於式(I)化合物為活體外P-醣蛋白及乳癌耐藥蛋白之基質,所以化合物血漿暴露可在與CYP3A、P-醣蛋白或乳癌耐藥蛋白抑制劑或誘導劑共同投與時增加或減少。在治療(第1期)期間,在此研究中不使用已知用以抑制或誘導CYP3A、P-醣蛋白或乳癌耐藥蛋白之任何ART藥劑。對於可正進行包括此等藥物療法中之一者之方案的彼等參與者,在篩選與基線訪視之間准許方案自禁止之藥物療法中之一者切換至所允許之藥物療法。在該研究期間自ART方案排除以下藥劑:HIV蛋白酶抑制劑(包括低劑量利托那韋)、含考比西他之方案、埃替格韋、依法韋侖、依曲韋林及奈韋拉平。
參與者在第一劑HIV疫苗之前28天內具有篩選訪視。在第1期(第0週至第48週)中,參與者在第0週(基線)隨機分配進行治療且在同一天接受第一劑HIV疫苗或匹配的疫苗安慰劑投與。在研究期間需要將其ART自禁止藥物療法切換至所允許之藥物療法的參與者在篩選與基線之間亦做如此切換且對於此等參與者,篩選時段延長直至第一次給藥之前45天。
參與者在第1期內繼續進行ART。對比用於額外監測及評定之非前哨群,前哨群中之參與者具有額外的第1期訪視。參與者在第1期內接受包含第一病毒及第二病毒之HIV疫苗:至多兩劑第一病毒包含於0.5 mL調配緩衝液中5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,兩劑第二病毒包含於0.5 mL Tris沖液中2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸,且接受十劑式(I)化合物或匹配安慰劑。所有參與者的HIV-1病毒負荷均在整個第1期中被監測。在第1期結束時,參與者在進入第2期以開始ATI之前滿足分析性治療中斷(ATI)合格標準。若未滿足ATI合格標準,則推遲進入第2期,或參與者停止研究且經歷第1期提前終止程序。過早停用疫苗之第1期中之參與者撤出研究且完成第1期提前終止評定,而過早停止化合物投與之參與者選擇繼續研究且進入第2期。
第一病毒包含美國專利第9,714,435號(其以全文引用之方式併入本文中)中描述之基於黑猩猩腺病毒分離株ChAdY25的複製缺陷型重組黑猩猩腺病毒(ChAd)載體,其中該載體編碼根據SEQ ID NO: 17之免疫原性多肽。藉由將免疫原性多肽序列次選殖至通用ChAdOx1細菌人工染色體(BAC)系統(Oxford University, Oxford, United Kingdom)中而得到該載體。由此次選殖產生之質體(pC255;40,483 kbp)經線性化且轉染至商業HEK293 T-REx®細胞(Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA USA)中以產生第一病毒,該第一病毒經調配為用於肌內注射之懸浮液。注射用緩衝液含有10 mM L-組胺酸、35 mM NaCl、7.5% (w/v)蔗糖、1 mM MgCl2
、0.1 mM EDTA二鈉、0.1% (w/v)聚山梨醇酯-80及0.5% (v/v)乙醇。用HCl將pH調節至6.6。將小瓶儲存在-80℃。
第1期之投與時程如下:在第0週及第12週,投與第一病毒,該第一病毒包含於0.5 mL調配緩衝液中5×1010
個病毒粒子之複製缺陷型黑猩猩腺病毒,該複製缺陷型黑猩猩腺病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。在第24週及第36週,投與第二病毒,該第二病毒包含於0.5 mL Tris緩衝液(10 mM Tris HCl,pH 7.7,140 mM NaCl)中2×108
個噬菌斑形成單位之經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA),該經修飾之安卡拉痘瘡病毒包含編碼具有SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之免疫原性多肽的核酸。在第26週及第28週,投與6 mg式(I)化合物。在第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週,投與8 mg式(I)化合物,其限制條件為在投與6 mg化合物時不會發生化合物相關3/4級不良事件。
在第2期(第48週至第72週)中,指示參與者在第48週訪視之後停止ART。在每週訪視時監測參與者之HIV-1血漿病毒血症反彈。若符合特定標準,則參與者之ART在第2期內重新開始。在第72週訪視時,對在第2期結束時病毒負荷<50個複本/mL且在第2期內未重新開始ART之參與者進行額外評定。在第2期內符合重新開始ART之標準之參與者重新開始ART且參與者進入第3期。若參與者在第2期內過早地停止研究,則參與者之ART方案應重新開始且參與者應經歷第2期提前終止程序。
24週的第2期由每週訪視組成。參與者在第48週停止使用ART。所有參與者在其已符合如此進行之標準後或在最晚第72週訪視線時重新開始ART。在第2期結束之前重新開始其ART之所有參與者在其ART藥物療法重新開始時繼續第3期。在第2期內(無論在第2期內抑或在第2期結束時(亦即在第72週期間))重新開始ART之所有參與者的病毒負荷在重新開始ART之後受到監測。
在第2期內,研究者進行症狀之仔細臨床監測。參與者提供用於測定HIV-1 pVL (亦即血漿病毒負荷)、CD4及CD8計數且用於ART藥物動力學之常規血液樣本。在第72週訪視時對在完成12週ATI (亦即第60週)之後具有病毒負荷<50個複本/mL且未重新開始ART的參與者進行額外評定;具體而言,收集血液樣本用於免疫學及病毒學分析。
在第3期(第72週至第84週)中,在第2期內(無論在第2期抑或在完成第2期之後(亦即在第72週訪視時))重新開始ART的所有參與者的病毒負荷在重新開始ART (第76週及第84週)之後4週及12週受到監測。參與者在第84週進行研究結束訪視。第84週訪視亦充當過早在第3期內停止研究之參與者的提前終止訪視。
藉由隨時間推移之HIV-1 pVL變化以及病毒儲集庫中之周邊及腸相關淋巴組織(GALT)變化評定功效評估指標。在整個研究中監測參與者之病毒血症。
收集用於評定HIV-1 pVL之血液樣本係用於測定對病毒及病毒反彈之病毒學控制,例如病毒負荷<50個複本/mL或<2000個複本/mL。持續病毒學控制在ATI (第2期,自第48週直至第72週)期間通常<50個複本/mL。
基於以下實驗室測試評定免疫原性及藥力學評估指標:(1)用於測定對HIV-1蛋白質之HIV疫苗靶向區域之全程T細胞反應及疫苗誘導之總HIV-1特異性反應之廣度及幅度的干擾素-γ ELISPOT分析;(2)以下各者在給藥式(I)化合物之前至化合物給藥後24小時的變化:(a)血清/血漿細胞介素、(b)全血中之基因表現(包括干擾素刺激基因)、(c)末梢血液中之免疫細胞表現型/活化;(3)基於糞便樣本收集之微生物群;及(4)基線GALT免疫細胞表現型/活化、基因表現(包括干擾素刺激基因)、HIV-1特異性T細胞反應及HIV-1儲集庫之變化。
在第0週及第26週以及在提前終止該方案之時(若適用),收集糞便樣本用於微生物群分析。
實例2. HIV患者之給藥
向確認感染HIV-1且接受ART之40歲人類男性患者投與HIV疫苗及根據實例1之式(I)化合物,由此治療HIV-1感染。X. 序列
除本發明中其他地方所揭示之序列以外,提供以下序列,正如其在本發明之其於說明之目的而提供的各種例示性實施例中提及或使用。
SEQ ID NO | 序列 | 描述 |
1 | EKIRLRPGGKKKYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELKSLYNTVATLYCVHQKIEV | HIV-1 p17 17-94 |
2 | KAFSPEVIPMFSAL | HIV-1 p24 30-43 |
3 | GHQAAMQMLKE | HIV-1 p24 61-71 |
4 | IAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTNNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSI | HIV-1 p24 91-150 |
5 | YVDRFYKTLRAEQA | HIV-1 p24 164-177 |
6 | ACQGVGGPGHKARVL | HIV-1 p24 217-231 |
7 | CTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSR | HIV-1 p2p7p1p6 63-89 |
8 | KMIGGIGGFIKVRQYDQILIEICGHKAIGTVLVGPTPVNIIGRNLLTQIGCTLNF | HIV-1 蛋白酶45-99 |
9 | LVEICTEMEKEGKISKI | HIV-1反轉錄酶34-50 |
10 | LRWGFTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWTVQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKL | HIV-1反轉錄酶210-264 |
11 | ILKEPVHGVYYDPSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIY | HIV-1反轉錄酶309-342 |
12 | TKELQKQITKIQNFRVYYRDSRDPLWKGPAKLLW | HIV-1整合酶210-243 |
13 | KIIRDYGKQMAGDDCVA | HIV-1整合酶266-282 |
14 | VKHHMYISKKAKGWFYRHHYESTHPR | HIV-1 Vif 25-50 |
15 | VTKLTEDRWNKPQKTKGHR | HIV-1 Vif 166-184 |
16 | AWLEAQEEEEVGF | HIV-1 Nef 56-68 |
17 | EKIRLRPGGKKKYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELKSLYNTVATLYCVHQKIEVAAAKAFSPEVIPMFSALAAAGHQAAMQMLKEAAAIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTNNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSIAAAYVDRFYKTLRAEQAAACQGVGGPGHKARVLAAACTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRAAAKMIGGIGGFIKVRQYDQILIEICGHKAIGTVLVGPTPVNIIGRNLLTQIGCTLNFAAALVEICTEMEKEGKISKIAAALRWGFTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWTVQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLAAAILKEPVHGVYYDPSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYAAATKELQKQITKIQNFRVYYRDSRDPLWKGPAKLLWAAAKIIRDYGKQMAGDDCVAAAVKHHMYISKKAKGWFYRHHYESTHPRAAAVTKLTEDRWNKPQKTKGHRAAAWLEAQEEEEVGF | 免疫原性多肽 |
18 | GAGAAGATCCGCCTGCGCCCCGGCGGCAAGAAAAAGTACAAGCTGAAGCACATCGTGTGGGCCTCCCGCGAGCTGGAGCGCTTCGCCGTGAACCCCGGCCTGCTGGAGACCTCCGAGGGCTGCCGCCAGATCCTGGGCCAGCTGCAGCCCTCCCTGCAGACCGGCTCCGAGGAGCTGAAGTCCCTGTACAACACCGTGGCCACCCTGTACTGCGTGCACCAGAAGATCGAGGTGGCCGCCGCCAAGGCCTTCTCCCCCGAGGTGATCCCCATGTTCTCCGCCCTGGCCGCCGCCGGCCACCAGGCCGCCATGCAGATGCTGAAGGAGGCCGCCGCCATCGCCCCCGGCCAGATGCGCGAGCCCCGCGGCTCCGACATCGCCGGCACCACCTCCACCCTGCAGGAGCAGATCGGCTGGATGACCAACAACCCCCCCATCCCCGTGGGCGAGATCTACAAGCGCTGGATCATCCTGGGCCTGAACAAGATCGTGCGCATGTACTCCCCCACCTCCATCGCCGCCGCCTACGTGGACCGCTTCTACAAGACCCTGCGCGCCGAGCAGGCCGCCGCCTGCCAGGGCGTGGGCGGCCCCGGCCACAAGGCCCGCGTGCTGGCCGCCGCCTGCACCGAGCGCCAGGCCAACTTCCTGGGCAAGATCTGGCCCTCCCACAAGGGCCGCCCCGGCAACTTCCTGCAGTCCCGCGCCGCCGCCAAGATGATCGGCGGCATCGGCGGCTTCATCAAGGTGCGCCAGTACGACCAGATCCTGATCGAGATCTGCGGCCACAAGGCCATCGGCACCGTGCTGGTGGGCCCCACCCCCGTGAACATCATCGGCCGCAACCTGCTGACCCAGATCGGCTGCACCCTGAACTTCGCCGCCCTGGTGGAGATCTGCACCGAGATGGAGAAGGAGGGCAAGATCTCCAAGATCGCCGCCGCCCTGCGCTGGGGCTTCACCACCCCCGACAAGAAGCACCAGAAGGAGCCCCCCTTCCTGTGGATGGGCTACGAGCTGCACCCCGACAAGTGGACCGTGCAGCCCATCGTGCTGCCCGAGAAGGACTCCTGGACCGTGAACGACATCCAGAAGCTGGTGGGCAAGCTGGCCGCCGCCATCCTGAAGGAGCCCGTGCACGGCGTGTACTACGACCCCTCCAAGGACCTGATCGCCGAGATCCAGAAGCAGGGCCAGGGCCAGTGGACCTACCAGATCTACGCCGCCGCCACCAAGGAGCTGCAGAAGCAGATCACCAAGATCCAGAACTTCCGCGTGTACTACCGCGACTCCCGCGACCCCCTGTGGAAGGGCCCCGCCAAGCTGCTGTGGGCCGCCGCCAAGATCATCCGCGACTACGGCAAGCAGATGGCCGGCGACGACTGCGTGGCCGCCGCCGTGAAGCACCACATGTACATCTCCAAGAAGGCCAAGGGCTGGTTCTACCGCCACCACTACGAGTCCACCCACCCCCGCGCCGCCGCCGTGACCAAGCTGACCGAGGACCGCTGGAACAAGCCCCAGAAGACCAAGGGCCACCGCGCCGCCGCCTGGCTGGAGGCCCAGGAGGAGGAAGAGGTGGGCTTCTGATAG | 編碼免疫原性多肽之核酸 |
儘管出於清楚理解之目的已藉助於說明及實例相當詳細地描述了前述發明,但熟習此項技術者應瞭解,可在隨附申請專利範圍之範疇內實踐某些改變及修改。此外,本文中所提供之各參考文獻係以全文引用之方式併入本文中,其併入程度如同各參考文獻單獨以引用的方式併入之程度相同。當本申請案與本文所提供之參考文獻之間存在衝突時,應以本申請案為準。
Claims (25)
- 一種式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽用於製備醫藥品之用途,其中該醫藥品係用於在患有HIV感染之人類中治療HIV感染,
- 如請求項1之用途,其中該免疫原性多肽包含:(i)與SEQ ID NO:1具有至少95%序列一致性之序列;(ii)與SEQ ID NO:2具有至少95%序列一致性之序列;(iii)與SEQ ID NO:3具有至少95%序列一致性之序列;(iv)與SEQ ID NO:4具有至少95%序列一致性之序列;(v)與SEQ ID NO:5具有至少95%序列一致性之序列;(vi)與SEQ ID NO:6具有至少95%序列一致性之序列;(vii)與SEQ ID NO:7具有至少95%序列一致性之序列;(viii)與SEQ ID NO:8具有至少95%序列一致性之序列;(ix)與SEQ ID NO:9具有至少95%序列一致性之序列;(x)與SEQ ID NO:10具有至少95%序列一致性之序列;(xi)與SEQ ID NO:11具有至少95%序列一致性之序列;(xii)與SEQ ID NO:12具有至少95%序列一致性之序列;(xiii)與SEQ ID NO:13具有至少95%序列一致性之序列;(xiv)與SEQ ID NO:14具有至少95%序列一致性之序列; (xv)與SEQ ID NO:15具有至少95%序列一致性之序列;及(xvi)與SEQ ID NO:16具有至少95%序列一致性之序列。
- 如請求項1之用途,其中該免疫原性多肽包含SEQ ID NO:1-16之序列,其中SEQ ID NO:1-16中之至少兩者係藉由單一、雙重或三重丙胺酸胺基酸連接子接合,且其中該連接子使得在鄰接序列之間的接合區中形成AAA序列。
- 如請求項1之用途,其中該免疫原性多肽具有根據SEQ ID NO:17之胺基酸序列。
- 如請求項1之用途,其中該核酸具有根據SEQ ID NO:18之核酸序列。
- 如請求項1之用途,其中該第一病毒包含腺病毒科或痘病毒科病毒載體。
- 如請求項1之用途,其中該第一病毒包含腺病毒病毒載體。
- 如請求項7之用途,其中該第一病毒為黑猩猩腺病毒。
- 如請求項7之用途,其中該第一病毒為複製缺陷型黑猩猩腺病毒。
- 如請求項7之用途,其中該第一病毒係以約5×1010個病毒粒子之量投與。
- 如請求項1之用途,其中該第一病毒係每12週投與一次。
- 如請求項11之用途,其中該第一病毒係投與兩次。
- 如請求項1之用途,其中該醫藥品係進一步與第二病毒合併使用,該第二病毒包含編碼該免疫原性多肽之核酸。
- 如請求項13之用途,其中該第二病毒包含經修飾之安卡拉痘瘡病毒(MVA)載體。
- 如請求項14之用途,其中該第二病毒係以約2×108個噬菌斑形成單位投與。
- 如請求項13之用途,其中該第二病毒係每12週投與一次。
- 如請求項16之用途,其中該第二病毒係投與兩次。
- 如請求項13之用途,其中該第一病毒及該第二病毒係經肌內投與。
- 如請求項13之用途,其中該第一病毒係在第0週及第12週投與,且該 第二病毒係在第24週及第36週投與。
- 如請求項19之用途,其中該醫藥品係用於在第三次投與病毒之後每兩週投與。
- 如請求項19之用途,其中該醫藥品係用於在第26週、第28週、第30週、第32週、第34週、第38週、第40週、第42週、第44週及第46週投與。
- 如請求項1至21中任一項之用途,其中該人類係在病毒學上經抑制的。
- 如請求項22之用途,其中在病毒學上經抑制之該人類之病毒負荷小於約200、100、50或約20個HIV-1 RNA複本/mL血漿或血液。
- 如請求項22之用途,其中該病毒學抑制由投與抗反轉錄病毒療法產生。
- 如請求項24之用途,其中該抗反轉錄病毒療法包含一或多種選自由以下組成之群的藥劑:雷特格韋(raltegravir)、埃替格韋(elvitegravir)、索特格韋(soltegravir)、卡伯格韋(cabotegravir)、都魯格韋(dolutegravir)、阿巴卡韋(abacavir)、地達諾新(didanosine)、反丁烯二酸替諾福韋二吡呋酯(tenofovir disoproxil fumarate)、替諾福韋艾拉酚胺 (tenofovir alafenamide)、安卓西他賓(emtricitabine)、拉美夫定(lamivudine)、司他夫定(stavudine)、齊多夫定(zidovudine)、阿巴卡韋(abacavir)、艾夫他濱(elvucitabine)、替諾福韋前藥(tenofovir exalidex)、非替那韋(festinavir)、奈韋拉平(nevirapine)、依法韋侖(efavirenz)、依曲韋林(etravirine)、利匹韋林(rilpivirine)、福斯韋林(fosdevirine)、多拉韋林(doravirine)、樂司韋林(lersivirine)、阿紮那韋(atazanavir)、達盧那韋(darunavir)、茚地那韋(indinavir)、咯匹那韋(lopinavir)、奈非那韋(nelfinavir)、沙奎那韋(saquinavir)、替拉那韋(tipranavir)、利托那韋(ritonavir)、夫沙那韋(fosamprenavir)、馬拉維若(maraviroc)、恩夫韋地(enfuvirtide)、福斯薩維(fostemsavir)、貝韋立馬(bevirimat)、考比西他(cobicistat)及比替格韋(bictegravir);或其醫藥學上可接受之鹽。
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