JP5945365B2 - Nmrスペクトルから物質を同定するための方法 - Google Patents
Nmrスペクトルから物質を同定するための方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5945365B2 JP5945365B2 JP2015503878A JP2015503878A JP5945365B2 JP 5945365 B2 JP5945365 B2 JP 5945365B2 JP 2015503878 A JP2015503878 A JP 2015503878A JP 2015503878 A JP2015503878 A JP 2015503878A JP 5945365 B2 JP5945365 B2 JP 5945365B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nmr
- values
- spectrum
- value
- distance
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 title claims description 122
- 239000000126 substance Substances 0.000 title claims description 99
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 70
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 claims description 91
- 230000010354 integration Effects 0.000 claims description 73
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 claims description 52
- 239000013558 reference substance Substances 0.000 claims description 17
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 87
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 36
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 34
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 17
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 17
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 15
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 15
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 12
- 239000000463 material Substances 0.000 description 9
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 9
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 239000012925 reference material Substances 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 4
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 239000011365 complex material Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 239000013076 target substance Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01R—MEASURING ELECTRIC VARIABLES; MEASURING MAGNETIC VARIABLES
- G01R33/00—Arrangements or instruments for measuring magnetic variables
- G01R33/20—Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance
- G01R33/44—Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance using nuclear magnetic resonance [NMR]
- G01R33/46—NMR spectroscopy
- G01R33/4625—Processing of acquired signals, e.g. elimination of phase errors, baseline fitting, chemometric analysis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N24/00—Investigating or analyzing materials by the use of nuclear magnetic resonance, electron paramagnetic resonance or other spin effects
- G01N24/08—Investigating or analyzing materials by the use of nuclear magnetic resonance, electron paramagnetic resonance or other spin effects by using nuclear magnetic resonance
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01R—MEASURING ELECTRIC VARIABLES; MEASURING MAGNETIC VARIABLES
- G01R33/00—Arrangements or instruments for measuring magnetic variables
- G01R33/20—Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance
- G01R33/44—Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance using nuclear magnetic resonance [NMR]
- G01R33/46—NMR spectroscopy
Landscapes
- Physics & Mathematics (AREA)
- High Energy & Nuclear Physics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Condensed Matter Physics & Semiconductors (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Signal Processing (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Description
Claims (9)
- 試料中の物質の同定のための方法であって、
a)少なくとも1つのNMR活性原子核を有する少なくとも1つの物質を含有する試料のNMRスペクトルを得る工程と、
b)前記NMRスペクトルを別個のスペクトル値に変換する工程であって、各スペクトル値が、前記NMRスペクトルの個々のラインまたは前記NMRスペクトルの個々のスペクトル部分の高さおよび/もしくは面積を規定する積分値と、前記NMRスペクトルにおける検討されるラインまたは検討されるスペクトル部分の位置を規定する位置値とを有する工程と、
c)多数の積分比値を、いずれの場合も前記NMRスペクトルの2つの積分値から求める工程であって、各積分比値が、基礎をなすスペクトル値の高さおよび/もしくは面積の比を規定する工程と、
d)多数の距離値を、いずれの場合も前記NMRスペクトルの2つの位置値から求める工程であって、各距離値が、前記基礎をなすスペクトル値間のスペクトル距離を規定する工程と、
e)前記NMRスペクトルの前記積分比値と、少なくとも1つの基準物質のNMR基準スペクトルの対応する積分比値とを比較する工程と、
f)第1の適切なサブセットを前記NMRスペクトルの前記積分比値から選択する工程であって、前記第1のサブセットが、それぞれの場合において設定可能である第1の許容限界内の前記NMR基準スペクトルの積分比値に対応する積分比値を含む工程と、
g)前記NMRスペクトルの前記距離値と、前記NMR基準スペクトルの対応する距離値とを比較する工程と、
h)第2の適切なサブセットを前記NMRスペクトルの前記距離値から選択する工程であって、前記第2のサブセットが、それぞれの場合において設定可能である第2の許容限界内の前記NMR基準スペクトルの距離値に対応する距離値を含む工程と、
i)第1のサブセットと第2のサブセットを比較し、同じスペクトル値から形成した、両方のサブセットからのそれら積分比値および距離値を第3の適切なサブセットとして選択する工程と、
j)前記第3のサブセットの前記各値の質判定基準を用いて、前記試料中に含まれる前記物質が、前記基準物質として同定されるか否かを決定する工程であって、前記判定基準が、これらの各値と、前記NMR基準スペクトルの前記積分比値および/または前記距離値とを比較することにより決定される工程と
を含む方法。 - 請求項1に記載の方法において、前記NMR基準スペクトルが、1つだけの基準物質のNMRスペクトルであることを特徴とする方法。
- 請求項1または2に記載の方法において、前記質判定基準が、前記NMR基準スペクトルの前記積分比値と前記NMRスペクトルの前記積分比値とのずれ、および/または前記NMR基準スペクトルの前記距離値と前記NMRスペクトルの前記距離値とのずれの尺度を含むことを特徴とする方法。
- 請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法において、前記質判定基準が、前記NMR基準スペクトルの積分比値または距離値の数と比較した、前記第3のサブセットの値の数の尺度を含むことを特徴とする方法。
- 請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法において、前記工程e)〜j)が、前記試料中に含まれる前記物質が基準物質として同定されるまで、または、NMR基準スペクトルがもうそれ以上存在しなくなるまで他の基準物質のさらなるNMR基準スペクトルを用いて繰り返されることを特徴とする方法。
- 請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法において、前記距離値が、前記位置値の直接の差として、前記位置値の標準化された差としてまたは前記位置値の商として計算されることを特徴とする方法。
- 請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法において、前記試料中に含まれる前記物質が、量的に同定されることを特徴とする方法。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法において、前記方法が、デカップリングしたNMRスペクトルを用いて行われ、前記物質が明白に同定されていない場合には、同じ試料のデカップリングしないNMRスペクトルを用いることにより再度行われることを特徴とする方法。
- コンピュータで実行されたとき、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法を行うようコーディングされたプログラムを含むソフトウェアを有するソフトウェア製品。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201261620700P | 2012-04-05 | 2012-04-05 | |
DE102012205686.6 | 2012-04-05 | ||
US61/620,700 | 2012-04-05 | ||
DE201210205686 DE102012205686B3 (de) | 2012-04-05 | 2012-04-05 | Verfahren zur Substanzidentifizierung und zugehöriges Computerprogrammprodukt |
PCT/EP2013/057104 WO2013150098A1 (en) | 2012-04-05 | 2013-04-04 | Method for substance identification from nmr spectrum |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2015512520A JP2015512520A (ja) | 2015-04-27 |
JP2015512520A5 JP2015512520A5 (ja) | 2016-05-19 |
JP5945365B2 true JP5945365B2 (ja) | 2016-07-05 |
Family
ID=48783982
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015503878A Active JP5945365B2 (ja) | 2012-04-05 | 2013-04-04 | Nmrスペクトルから物質を同定するための方法 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9285444B2 (ja) |
EP (1) | EP2834659B1 (ja) |
JP (1) | JP5945365B2 (ja) |
AU (1) | AU2013244967B2 (ja) |
CA (1) | CA2865476C (ja) |
DE (1) | DE102012205686B3 (ja) |
ES (1) | ES2644285T3 (ja) |
HU (1) | HUE035504T2 (ja) |
PL (1) | PL2834659T3 (ja) |
SG (1) | SG11201405232TA (ja) |
WO (1) | WO2013150098A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10353033B2 (en) | 2016-05-02 | 2019-07-16 | Lg Chem, Ltd. | Method for quantitative analysis |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101686005B1 (ko) * | 2015-02-02 | 2016-12-13 | 삼성전자주식회사 | 자기 공명 영상 장치 및 상기 자기 공명 영상 장치를 이용한 자기 공명 분광법 |
WO2016183647A1 (en) * | 2015-05-18 | 2016-11-24 | Universidade Estadual Paulista Júlio De Mesquita Filho - Unesp | Method of analysis' pattern recognition and computer program |
JP6574661B2 (ja) * | 2015-09-29 | 2019-09-11 | 積水化学工業株式会社 | コバルト錯体含有試料の評価方法、及び電解液の製造方法 |
EP3258285B1 (en) | 2016-06-14 | 2020-10-21 | Bruker BioSpin GmbH | Method for predicting chemical shift values of nmr spin systems in a sample of a fluid class, in particular in a sample of a biofluid |
CN113138206B (zh) * | 2021-03-04 | 2022-04-19 | 宁波大学 | 一种鉴别氨基酸的方法 |
EP4377676A1 (en) * | 2021-07-28 | 2024-06-05 | John Wiley & Sons, Inc. | Adaptive search mass spectrometer spectral analysis |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0679060B2 (ja) * | 1989-01-20 | 1994-10-05 | 鐘紡株式会社 | 混合物の組成分析におけるデータ処理方法 |
EP1705578A1 (en) * | 2005-03-24 | 2006-09-27 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Method for processing a set of spectra, particularly NMR spectra |
US8143890B2 (en) * | 2008-05-27 | 2012-03-27 | Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Spectral resolution enhancement of magnetic resonance spectroscopic imaging |
EP2161587A1 (en) * | 2008-09-03 | 2010-03-10 | Bruker BioSpin AG | Method and system for automated analysis of NMR spectra |
DE102010038014B4 (de) * | 2010-10-06 | 2021-10-07 | Numares Ag | Verwendung spezifischer Substanzen als Marker zur Bestimmung des Risikos einer Nierenabstoßung |
-
2012
- 2012-04-05 DE DE201210205686 patent/DE102012205686B3/de active Active
-
2013
- 2013-04-04 JP JP2015503878A patent/JP5945365B2/ja active Active
- 2013-04-04 ES ES13719430.4T patent/ES2644285T3/es active Active
- 2013-04-04 CA CA2865476A patent/CA2865476C/en active Active
- 2013-04-04 WO PCT/EP2013/057104 patent/WO2013150098A1/en active Application Filing
- 2013-04-04 SG SG11201405232TA patent/SG11201405232TA/en unknown
- 2013-04-04 HU HUE13719430A patent/HUE035504T2/en unknown
- 2013-04-04 US US14/390,044 patent/US9285444B2/en active Active
- 2013-04-04 PL PL13719430T patent/PL2834659T3/pl unknown
- 2013-04-04 EP EP13719430.4A patent/EP2834659B1/en active Active
- 2013-04-04 AU AU2013244967A patent/AU2013244967B2/en active Active
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10353033B2 (en) | 2016-05-02 | 2019-07-16 | Lg Chem, Ltd. | Method for quantitative analysis |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
PL2834659T3 (pl) | 2018-01-31 |
HUE035504T2 (en) | 2018-05-02 |
AU2013244967B2 (en) | 2016-06-30 |
US20150042328A1 (en) | 2015-02-12 |
JP2015512520A (ja) | 2015-04-27 |
AU2013244967A1 (en) | 2014-09-11 |
CA2865476C (en) | 2019-02-19 |
ES2644285T3 (es) | 2017-11-28 |
DE102012205686B3 (de) | 2013-08-01 |
WO2013150098A1 (en) | 2013-10-10 |
EP2834659A1 (en) | 2015-02-11 |
CA2865476A1 (en) | 2013-10-10 |
EP2834659B1 (en) | 2017-08-23 |
SG11201405232TA (en) | 2014-09-26 |
US9285444B2 (en) | 2016-03-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5945365B2 (ja) | Nmrスペクトルから物質を同定するための方法 | |
Aguilan et al. | Guide for protein fold change and p-value calculation for non-experts in proteomics | |
Birks et al. | Does pollen-assemblage richness reflect floristic richness? A review of recent developments and future challenges | |
Colangelo et al. | Review of software tools for design and analysis of large scale MRM proteomic datasets | |
JP6089345B2 (ja) | 時および/または空間系列ファイルの多成分回帰/多成分分析 | |
JP6088177B2 (ja) | 解析装置、解析方法、プログラム | |
US20160216244A1 (en) | Method and electronic nose for comparing odors | |
JP2017224283A (ja) | ビッグデータ解析方法及び該解析方法を利用した質量分析システム | |
JP6715451B2 (ja) | マススペクトル解析システム,方法およびプログラム | |
JP2006267111A (ja) | スペクトル、特にnmrスペクトルのセットをプロセッシングする方法 | |
JP2006528339A (ja) | クロマトグラフィー/質量分析における生体分子パターンのアノテーション法及びシステム | |
CN107505346A (zh) | 预测流体类别样本中特别是生物流体样本中nmr自旋系统的化学位移值的方法 | |
US9400868B2 (en) | Method computer program and system to analyze mass spectra | |
Smirnov et al. | Mass difference maps and their application for the recalibration of mass spectrometric data in nontargeted metabolomics | |
Brinson et al. | Principal component analysis for automated classification of 2D spectra and interferograms of protein therapeutics: influence of noise, reconstruction details, and data preparation | |
JP2024526079A (ja) | 質量スペクトル中の分子種を同定するための方法及び装置 | |
Hoffmann et al. | BiPACE 2D—graph-based multiple alignment for comprehensive 2D gas chromatography-mass spectrometry | |
Schleif et al. | Genetic algorithm for shift-uncertainty correction in 1-D NMR-based metabolite identifications and quantifications | |
Baumgartner et al. | A novel network-based approach for discovering dynamic metabolic biomarkers in cardiovascular disease | |
JP2023511456A (ja) | 複雑な生体サンプルまたは環境サンプル中の化合物を同定するための方法およびシステム | |
JP6280910B2 (ja) | 分光システムの性能を測定するための方法 | |
Lucio | Datamining metabolomics: the convergence point of non-target approach and statistical investigation | |
Fertin et al. | Mass Spectra Interpretation and the Interest of SpecFit for Identifying Uncommon Modifications | |
Horvatovich et al. | Bioinformatics and Statistics: LC‐MS (/MS) Data Preprocessing for Biomarker Discovery | |
JPH07119721B2 (ja) | 混合物の組成成分の定性定量方法及びその方法に用いる標準データ作成方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160318 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20160318 |
|
A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20160318 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20160425 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20160510 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20160527 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5945365 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |