JP5926801B2 - プラスマローゲンの加水分解方法、プラスマローゲンの測定方法 - Google Patents
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Description
(i)カルシウムイオン非存在下、エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、18:1)に対する相対活性が、ジパルミトイルホスホコリンに対して、19±5%であり、
(ii)カルシウムイオン非存在下、エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する相対活性が、1−パルミトイル−2−オレオイル−ホスホコリンに対して、29±13%であり、
(iii)SDS−PAGE法による分子量が約25〜30kDaの範囲である、
という点で公知のホスホリパーゼA1及びホスホリパーゼA2とは明確に異なることを見出した。
本発明においては特に上記式中、Xがコリン又はエタノールアミンであるPlsが好ましい。本明細書中において、上記式中、Xがコリンの場合をコリン型プラスマローゲン(PlsChoと略す場合がある)といい、Xがエタノールアミンの場合をエタノールアミン型プラスマローゲン(PlsEtnと略す場合がある)という。本明細書中において単にPlsと記載した場合は、少なくともPlsChoとPlsEtnを含み、本発明においてはPlsEtnが好ましい。
本発明においては特に上記式中、Xがコリン又はエタノールアミンであるlyPlsが好ましい。本明細書中において、上記式中、Xがコリンの場合をコリン型リゾプラスマローゲン(lyPlsChoと略す場合がある)といい、Xがエタノールアミンの場合をエタノールアミン型リゾプラスマローゲン(lyPlsEtnと略す場合がある)という。本明細書中において単にlyPlsと記載した場合は、少なくともlyPlsChoとlyPlsEtnを含み、本発明においてはlyPlsEtnが好ましい。
80mM トリス−塩酸緩衝液pH8.0
50mM 塩化カルシウム
4mM ATP
4mM CoA
1.06U/mL Acyl−CoA Synthetase
2mM PlsEtn(C18、20:4)
<第二反応試薬混合液>
40mM PIPES−NaOH緩衝液pH7.5
0.06% 4−AA
0.04% フェノール
4.5U/mL peroxidase
30U/mL Acyl−CoA Oxidase
0.2% トリトンX−100
20mM ATP
0.1mM FAD
Acyl−CoA Synthetase(EC 6.2.1.3)及びAcyl−CoA Oxidase(EC 1.3.3.6)は旭化成ファーマ株式会社から入手することができる(品番はそれぞれT−16及びT17)。
0.5% SDS(ドデシル硫酸ナトリウム)を含む0.1M EDTA溶液pH8.0
<PL(A)溶解希釈用液>
0.05%BSAを含む10mMトリス−塩酸緩衝液pH8.0
<測定操作法>
(1)小試験管に第一反応試薬混合液0.50mLずつを正確に分注し、37℃で予備加温する。
以下の(数2)に従い活性を計算する。なお、1ユニット(U)とは、上記の条件下、PL(A)がPlsEtn(C18、20:4)を加水分解する作用をして脂肪酸を1分間に1μmol生成する酵素量とする。
<工程1>本明細書に記載の特性や性質を有するホスホリパーゼ(PL(A))を用いてPlsをlyPlsに加水分解する工程、
を含む。
<工程2−1>lysoplasmalogenase(EC 3.3.2.2; EC 3.3.2.5、alkenyl hydrolase、(Biochimica et Biophysica Acta、1437巻、1999年、142〜156頁、The journal of biological chemistry、286巻、24916〜24930頁、2011年)「lyPls ase」と略す場合がある)を用いる方法、
<工程2−2>薄層クロマトグラフィー(TLC)などを用いる方法、
<工程2−3>Lysophospholipase D(Autotaxin,The journal of biological chemistry、277巻、2002年、39436−39442頁)を用いる方法、
<工程2−4>HPLCを使用する方法(特開2007−33410号公報)、
<工程2−5>LC−MS(特開2011−136926号公報)を使用する方法、
などが挙げられる。
(II)公知のlyPls ase
(III)GPCP
(IV)Ethanolamine oxidase
(V)Lysophospholipase D
これらの組成物は必要に応じて、Peroxidase、Catalase(EC 1.11.1.6)、フェノール誘導体、アニリン誘導体、トルイジン誘導体などのトリンダー試薬の色原体、4−アミノアンチピリン(4−AA)若しくは3−メチル−2−ベンゾチアゾリノンヒドラゾンなどのカップラーを含有してもよい。
各ホスホリパーゼ(PL(A)、PLB、PLA2 II L、PLA2ナガセ、及びLIPOMOD 699L)の活性測定方法を図1に簡略して示した。Acyl−CoA Synthetase(EC 6.2.1.3)及びAcyl−CoA Oxidase(EC 1.3.3.6)は旭化成ファーマ株式会社から入手した(品番はそれぞれT−16及びT17)。
80mM トリス−塩酸緩衝液pH8.0
50mM(0mM(*)) 塩化カルシウム
4mM ATP
4mM CoA
1.06U/mL Acyl−CoA Synthetase
2mM ジパルミトイルホスホコリン(DPPC)
(*)他の実施例では0mMの場合もある。
40mM PIPES−NaOH緩衝液pH7.5
0.06% 4−AA
0.04% フェノール
4.5U/mL peroxidase
30U/mL Acyl−CoA Oxidase
0.2% トリトンX−100
20mM ATP
0.1mM FAD
<反応停止液>
0.5% SDS(ドデシル硫酸ナトリウム)を含む0.1M EDTA溶液pH8.0
<酵素溶解希釈用液>
0.05%BSAを含む10mMトリス−塩酸緩衝液pH8.0
<測定操作法>
(1)小試験管に第一反応試薬混合液0.50mLずつを正確に分注し、37℃で予備加温する。
以下の(式5)に従い活性を計算する。なお、1ユニット(U)とは、本実施例の条件下、各ホスホリパーゼが基質(実施例1においてはDPPC)を加水分解する作用をして脂肪酸を1分間に1μmol生成する反応速度とした。
図1で示したように、本実施例の活性測定方法は各ホスホリパーゼの作用により生成した脂肪酸を測定する方法である。したがって、本実施例の活性測定方法でPL(A)の活性が測定できたことは、PL(A)は他のPLA2と同様に、DPPCに作用して少なくとも脂肪酸を生成していることを示している。
[参考例1−1:Streptomyces albidoflavus NA297の染色体DNAの分離]
Streptomycesa albidoflavus NA297をYEME培地(0.3%酵母エキス、0.5%ペプトン、0.3%麦芽エキス、1%グルコース、34%シュークロース、5mM MgCl2、0.5%グリシン)50mLを用いて28℃で4日間培養し集菌した。次いで、この菌体を75mM NaCl、25mM EDTA、20mMトリス−塩酸緩衝液(pH7.5)及び1mg/mlリゾチームからなる溶液5mLに懸濁し、37℃で一晩処理した。これに10%(w/v) SDSを750μL、proteinase Kを5mg添加し55℃で2時間処理した。この溶液にクロロホルム7.5mLを加えて攪拌し、遠心分離により水相5mLを分取した。この水相に3mLのイソプロパノールを添加混合してDNA画分を回収し、10mM 卜リス−塩酸緩衝液(pH8.0)及び1mM EDTAからなる溶液500μLに溶解した。これにRNaseAを20μg/mLとなるように加え、37℃で1時間処理した後、0.8MのNaClを含む13%PEG溶液を500μL加え攪拌し、遠心分離により、水相を500μL分取した。これにフェノール/クロロホルム混合液500μLを加えて攪拌し、遠心分離により、水相を500μL分取した。この水相に3M 酢酸ナトリウム(pH5.2) 50μL及びエタノール1mLを添加混合しDNAを回収した。このDNAを70%(v/v)エタノールに10分間浸漬した後、10mM トリス−塩酸緩衝液(pH8.0)及び1mM EDTAからなる溶液200μLに溶解し、鋳型染色体DNAとした。
PCR用のオリゴとして、センスプライマー「primer S」(配列番号5)及びアンチセンスプライマーとして「primer AS」(配列番号6)を合成した。参考例1−1で得た鋳型染色体DNA 50ng、10×PCR Buffer 2.5μL、プライマー各1200nM、dNTPs各0.3mM、MgCl2、1.2mM、DMSO 4%、KOD DNA Polymerase 1.25ユニット、蒸留水を全量25μLとなるように添加した。PCR反応条件は次のとおりである。
ステップ2:98℃、15秒;
ステップ3:72℃、15秒;
ステップ4:74℃、60秒;
ステップ2からステップ4を30サイクル繰り返す;
ステップ5:74℃、4分。
参考例1−2で得た組換えプラスミドを用いて、「PRACTICAL STREPTOMY CES GENETICS(Kieserら、John Innes Foundation、2000年)」に記載の方法に従い、プロトプラスト化された放線菌Streptomyces lividans)1326を形質転換し、組換え放線菌を得た。
参考例1−3で得た組換え放線菌を、12μg/mLのチオストレプトンを含む100mL×4本のトリプチックソイ培地(ペクトン・ディッキンソン社製)で培養した。得られた培養液340mLから遠心分離(15000rpm、5分、4℃)にて上清を回収し、硫酸アンモニウム分画にて、沈殿を回収した。回収した沈殿を20mM 卜リス−塩酸緩衝液(pH8.0)に溶解し、20mM トリス−塩酸緩衝液(pH8.0)を外液として透析して酵素溶液を得た。得られたPL(A)の濃度は約2.5U/mLで、適宜10−kDa centrifugal filter device(ミリポア社製)などで濃縮して実施例1〜実施例11で本発明のPL(A)として使用した。
日本農芸化学会2011年度大会の講演番号:2C10a05(2011年3月23日9:44〜)、Streptomyces sp. NA684由来新規ホスホリパーゼBの大量発現とその特性解析(松本優作、杉森大助(福島大院・理工))によって公開された方法で調製して実施例で使用した。
NB培地「1%ペプトン(べクトン・ディンキンソン社製)、1%肉エキス(極東製薬工業(株)製)、0.5% 塩化ナトリウム(和光純薬工業(株)製)、pH7.2」300mLを調製し、500mL容三角フラスコに100mlずつ分注して、さらに1%大豆レシチンと0.1%ツィーン(Tween)80を添加した後、121℃で15分間蒸気殺菌を行った。予め平板培地に生育したストレプトマイセス・エスピー(Streptomyces sp.)NA684のコロニーを適当量とり、トリプチックソイ培地(べクトン・ディンキンソン社製)5mLを入れたφ18試験管(18×180mm)に接種し、28℃で良好な生育が得られるまで振とう培養した。この培養液を先の滅菌した培地100mLに1mlずつ接種し、28℃で108時間振とう培養した。遠心分離機を用いて、この培養液から上清を回収した。
上記(a)で回収した培養上清に、80%(w/v)飽和となるように硫酸アンモニウムを添加し、生じた沈殿を遠心分離(10,000rpm、30分、4℃)により回収した。この沈殿を可溶化し、20mMトリス−塩酸緩衝液(pH9.0)で透析し、粗酵素液を得た。
上記(b)で得られた粗酵素液を、20mM トリス−塩酸緩衝液(pH9.0)で予め平衡化した「DEAE−Toyopearl650Mカラム」(内径26mm、高さ55mm、東ソー社製)にアプライした。同緩衝液でカラムを洗浄した後、塩化ナトリウム(0Mから1Mまで)のリニアグラジェントにより、活性画分を溶出させた。
上記(c)で得られた活性画分を集め、Viva spin(ザルトリウス社製)を用い濃縮脱塩した。これに、20mMトリス−塩酸緩衝液(pH9.0)を加えた。これを、20mMトリス−塩酸緩衝液(pH9.0)で予め平衡化した「HiTrap Q」(5ml)カラム(GEヘルスケアバイオサイエンス社製)にアプライし、同緩衝液でカラムを洗浄した後、塩化ナトリウム(0Mから1Mまで)のリニアグラジェントにより、活性画分を溶出させた。
上記(d)で得られた活性画分を集め、Viva spinを用い濃縮脱塩した。これに、1M硫酸アンモニウムを含む20mMトリス−塩酸緩衝液(pH8.0)を加えた。1M硫酸アンモニウムを含む20mMトリス−塩酸緩衝液(pH8.0)で予め平衡化した「RESOURCE PHE」(1ml)カラム(GEヘルスケアバイオサイエンス社製)にアプライし、同緩衝液でカラムを洗浄した後、硫酸アンモニウム(1Mから0Mまで)のリニアグラジェントにより、活性画分を溶出させた。
上記(e)で得られた活性画分を集め、Viva spinを用い濃縮脱塩した。これに、20mMメス−水酸化ナトリウム緩衝液(pH6.0)を加えた。20mMメス−水酸化ナトリウム緩衝液(pH6.0)で予め平衡化した「Mono S」(1ml)カラム(GEヘルスケアバイオサイエンス社製)にアプライし、同緩衝液でカラムを洗浄した後、塩化ナトリウム(0Mから0.5Mまで)のリニアグラジェントにより、活性画分を溶出させた。
上記(e)で溶出した活性画分を集めてSDS−PAGE(12%(w/v)ポリアクリルアミドゲル)により解析した。
本実施例では、ホスファチジルコリンのsn−1位とsn−2位に対するPL(A)の反応速度(加水分解速度)を比較した。
100mM Tris−塩酸緩衝液(pH7.2)
0.50% ホスファチジルコリン(ナカライテスク、品番20342−52)
25mM EDTA
1% トリトンX−100
0.9mU/mL PL(A)
反応は37℃で行った。反応開始0、5、10、20、30分後に<反応液>を50μLずつ取り出して、この<反応液>にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を50μL加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリゾリン脂質の量をHPLCで測定した。
Systech社、Alltima Silica 3μm、100mm×4.6mm
溶離液A:CHCl3/MeOH/H2O(80/18/2)
溶離液B:CHCl3/MeOH/H2O(60/34/6)
グラジエント:0min、100%Aから15minで100%Bのリニアグラジエント
検出器:ELSD
流速:1 ml/min
カラム温度:25℃
<結果>
37℃、20分間の加水分解反応で、収率約16.5%でリゾリン脂質を得ることができた。その内訳は、2−アシル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン(2−Acyl−sn−glycero−3−phosphocholine)が約8割、1−アシル−sn−グリセ口−3−ホスホコリン(1−AcyL−sn−glycero−3−phosphocholine)が約2割であり、その比率は少なくとも反応開始後5分から30分の間は一定であった(図4)。
本実施例では、PlsEtn(C18、18:1)とDPPCに対するPL(A)の反応速度(加水分解速度)を比較し、比活性を測定した。
80mM トリス−塩酸緩衝液pH8.0
5又は0mM 塩化カルシウム
4mM ATP
4mM CoA
1.06U/mL Acyl−CoA Synthetase
2mM PlsEtn(C18、18:1)
まず実施例1の方法でPL(A)の活性を測定した。次に0mM塩化カルシウム(カルシウムイオン非存在)の<第一反応試薬混合液>を調製し、実施例1の方法でPL(A)の活性を測定した。次に<第一反応試薬混合液>の代わりに<第一反応試薬混合液2>を用いて、それ以外は実施例1の方法と同様にしてPL(A)の活性を測定した。最後に0mM塩化カルシウム(カルシウムイオン非存在)の<第一反応試薬混合液2>を用いて、それ以外は実施例1の方法と同様にしてPL(A)の活性を測定した。そして相対活性を(式3)で計算した。n=5で実施した。
本実施例では、PlsEtn(C18、20:4)とPOPCに対するPL(A)の反応速度(加水分解速度)を比較した。
120mM Tris−塩酸緩衝液(pH7.2)
2.5% PlsEtn(C18、20:4)
1mM EDTA
1% トリトンX−100
<反応液2>
120mM Tris−塩酸緩衝液(pH7.2)
2.5% POPC
1mM EDTA
1% トリトンX−100
50℃にした100μLの<反応液1>及び<反応液2>に、5mU/mLのPL(A)を5μL添加して反応を開始した。反応開始後5分後に、<反応液1>及び<反応液2>を煮沸して反応を停止した。<反応液1>及び<反応液2>に含まれる遊離脂肪酸の生成量を、遊離脂肪酸測定キットである「NEFA Cテストワコー」(和光純薬工業社製)で測定した。相対活性は(式4)で計算した。n=5で実施した。
PL(A)はPlsEtn(C18、20:4)に作用して脂肪酸を生成していることが明らかになった。また、本発明のPL(A)のPlsEtn(C18、20:4)に対する相対活性は、POPCに対して、29±13%(平均±SD)であった。
<SDS−PAGEサンプルバッファー>
125mM Tris−塩酸緩衝液(pH6.8)
4(W/V)% SDS
10(W/V)% シュークロース
0.01(W/V)% ブロモフェノールブルー
10(W/V)% 2−メルカプトエタノール
<泳動buffer>
3g/L Tris
14.4g/L Glycine
1g/L SDS
各ホスホリパーゼ(PL(A)、PLB、PLA2 II L、PLA2ナガセ、及びLIPOMOD 699L))溶液を280nmにおける吸光度が約1.0になるように蒸留水で希釈し、各ホスホリパーゼ水溶液とした。次に各ホスホリパーゼ水溶液20μLと<SDS−PAGEサンプルバッファー>を20μLとを混合して、99℃で20分間加熱して変性した。変性した各ホスホリパーゼを室温まで冷却して、10μLをSDS−PAGE法により分子量測定した。分子量マーカーはSDS−PAGEスタンダードBroad range(Bio RAD、品番161−0317)を使用した。ポリアクリルアミドゲルはe−PAGEL(アトー株式会社、品番E−T15S)を使用した。泳動bufferは上記の通りである。泳動は室温、定電流(20mA)にて約60分間行った。ポリペプチドの染色はEz Stain Aqua(アトー株式会社、品番AE−1340)を使用した。脱色は純水を使用した。
図5のレーン1と7はマーカーである。レーン2〜6は各ホスホリパーゼで、SDS− PAGE法による分子量は、
レーン2 PL(A) 約25〜30kDaの範囲
レーン3 PLB 約43〜45kDaの範囲
レーン4 PLA2 II L 約12〜14kDaの範囲
レーン5 PLA2ナガセ 約12〜14kDaの範囲
レーン6 LIPOMOD 699L 約12〜14kDaの範囲
となった。
本実施例では、各ホスホリパーゼ(PL(A)、PLB、PLA2 II L、PLA2ナガセ、LIPOMOD 699L)のブタ脳から抽出したPlsEtnに対する作用をカルシウムイオンの存在下比較した。
10mM トリス−塩酸緩衝液pH7.5
2mM ブタ脳から抽出したPlsEtn(又はlyPls(化7))
2mM CaCl2
10U/mL 各ホスホリパーゼ
<反応液>を37℃で反応し、反応開始10分後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と等量加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。盲検は各ホスホリパーゼを<反応液>に加えなかった。
薄層クロマトグラフィー(TLC、TLC silica gel 60、MERCK社)に3μLスポットし、展開溶媒(クロロホルム:メタノール:蒸留水=65:25:4)で約2〜3時間展開した。展開したTLCにニンヒドリンスプレー(和光純薬工業株式会社、品番145−08601)を適量噴霧して100℃で約15〜30秒間乾熱オーブンで熱してlyPlsEtnやPlsEtnを検出した。なお、他の実施例におけるTLCの条件も本実施例と同様である。
図6のレーン1〜7は次の通りである。
本実施例では、各ホスホリパーゼ(PL(A)、PLB、PLA2 II L、PLA2ナガセ、LIPOMOD 699L)のPlsEtn(化1)に対する作用を、カルシウムイオンの存在下、比較した。
10mM トリス−塩酸緩衝液pH7.5
2mM PlsEtn(化1)(又はlyPls(化7))
2mM CaCl2
10U/mL 各ホスホリパーゼ
<反応液>を37℃で反応し、反応開始10分後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と同じ量加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。
図7のレーン1〜7は次の通りである。
本実施例では、各ホスホリパーゼ(PL(A)、PLB、PLA2 II L、PLA2ナガセ、LIPOMOD 699L)のブタ脳から抽出したPlsEtnに対する作用をカルシウムイオンの非存在下比較した。
10mM トリス−塩酸緩衝液pH7.5
2mM ブタ脳から抽出したEtnPls(又はlyPls(化7))
10U/mL 各ホスホリパーゼ
<反応液>を37℃で反応し、反応開始10分後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と同じ量加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。盲検は各ホスホリパーゼを<反応液>に加えなかった。
図8のレーン1〜7は次の通りである。
本実施例では、各ホスホリパーゼ(PL(A)、PLB、PLA2 II L、PLA2ナガセ、LIPOMOD 699L)のPlsEtn(化4)に対する作用を、カルシウムイオンの存在下、比較した。
10mM トリス−塩酸緩衝液pH7.5
2mM PlsEtn(化4)(又はlyPls(化7))
10U/mL 各ホスホリパーゼ
<反応液>を37℃で反応し、反応開始10分後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と同じ量加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。盲検は各ホスホリパーゼを<反応液>に加えなかった。
図9のレーン1〜7は次の通りである。
実施例6−2及び実施例7−2において、PL(A)をPlsEtn(化4)に作用させたときの生成物(すなわち図7及び図9の矢印の物質)をLC/MSによって確認した。
装置 Waters,UPLC
カラム Waters、ACQUITY UPLC HSS C18 1.8μm
(2.1mmI.D.×50mm)
カラム温度 40℃
検出 220nm
移動相 A=水(0.1% HCOOH) B=イソプロピルアルコール
グラジェント 0分 A 80% B 20%
10分 A 0% B 100%
13分 A 0% B 100%
13.1分 A 80% B 20%
15分 A 80% B 20%
注入量 1μL
<MSの条件>
装置 Waters,Synapt G2
イオン化 ESI+
スキャンレンジ m/z 100〜1500
<結果>
MSではPlsEtn(化4)と考えられるイオンが1種類(m/z 730.55)、lyPlsEtn(化7)と考えられるイオンが1種類(m/z 466.31)検出され、標品のPlsEtn(化4)及びlyPlsEtn(化7)と一致した。したがって、PL(A)をPlsEtn(化4)に作用させたときの生成物はlyPlsEtn(化7)であることを確認した。
<反応液>
10mM トリス−塩酸緩衝液pH7.5
2mM PlsEtn(化4)(又はlyPls(化7))
0〜0.5U/mL PL(A)
0、0.005、0.0067、0.01、0.02、0.05、0.5U/mLのPL(A)を含む<反応液>を各1mL調製した。これらの<反応液>を37℃で10分間反応した後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と1mL加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。
図10のレーン1〜8は次の通りである。
<反応液>
50mM 各緩衝液
2mM PlsEtn(化4)(又はlyPls(化7))
0又は0.5U/mL PL(A)
各緩衝液として、クエン酸−NaOH緩衝液(pH4、5、6)、リン酸カリウム緩衝液pH7、トリス−塩酸緩衝液(pH8、9)、グリシン−NaOH緩衝液pH10を含む<反応液>を調製した。これらの<反応液>を室温で10分間反応した後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と1mL加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。
図11のレーン1〜18は次の通りである。
試料中のPls測定は図1の方法で測定した。
50mM BES−NaOH pH7.5
10U/mL Peroxidase
50U/mL Ethanolamine oxidase
5U/mL GPCP
1U/mL PL(A)
<反応液2>
50mM BES−NaOH pH7.5
4.2U/mL lyPls ase
12μM DA67
ここで、PeroxidaseはSIGMAより品番P8375として購入した。Ethanolamine oxidaseはBioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2008年、72巻、2732−2738頁の方法で製造した。GPCP(Glycerophosphorylcholine phosphatase)は旭化成ファーマ株式会社より品番T−33として入手した。lyPls aseはThe journal of biological chemistry、2011年、286巻、24916〜24930頁に記載の方法でラット由来のlyPls aseを大腸菌組換体として製造した。DA67は和光純薬工業株式会社より品番046−22341として購入した。
10%ドデシルマルトシド水溶液(同仁化学研究所、品番347−06163)にPlsEtn(化4)を0〜200μMになるように添加して調製した。
日立7080形自動分析機を使用して測定した。サンプル量は12μL、<反応液1>の量は180μL、<反応液2>の量は45μL、反応温度は37℃、1ポイントエンドアッセイとして660nm(副波長750nm)の吸光度差を測定した。
図12は10%ドデシルマルトシド水溶液にPlsEtn(化4)を0〜200μMになるように添加して調製した試料の検量線を示す。検量線は相関式Y=2.2724X−52.962で表され、R2=0.9991であった。試料中のPlsEtnが本実施例にて測定できたことが示された。なお、切片が−53となったのは、<反応液1>及び<反応液2>が着色・懸濁しているためである。
[実施例12−1:Streptomyces avermitilis JCM 5070の染色体DNAの分離]
Streptomycesa avermitilis JCM 5070を5mLのLB培地で用いて28℃で2日間培養し集菌した。次いで、この菌体をQIAprep Miniprep(QIAGEN社)のP1 buffer 250μLで懸濁し、250μLのP2 bufferを加えて5回転等攪拌して鋳型染色体DNAとした。
PCR用のオリゴとして、センスプライマー「primer S」(配列番号7)及びアンチセンスプライマーとして「primer AS」(配列番号8)を合成した。実施例12−1で得た鋳型染色体DNA 50ng、10×PCR Buffer 2.5μL、プライマー各1200nM、dNTPs各0.3mM、MgCl2、1.2mM、DMSO 4%、KOD DNA Polymerase 1.25ユニット、蒸留水を全量25μLとなるように添加した。PCR反応条件は次のとおりである。
ステップ2:98℃、15秒;
ステップ3:72℃、15秒;
ステップ4:74℃、60秒;
ステップ2からステップ4を30サイクル繰り返す;
ステップ5:74℃、4分。
実施例12−2で得た組換えプラスミドを大腸菌BL21(DE3)に形質転換し、組換え大腸菌を得た。
実施例13−3で得た組換え大腸菌を、50μg/mLのアンピシリン(pET21a(+)を形質転換した大腸菌の場合)又は30μg/mLのカナマイシン(pET24a(+)を形質転換した大腸菌の場合)を含む100mLのOvernight Express TB培地(Novagen社製)で、34℃、24時間培養した。得られた培養液を遠心分離して菌体を回収した。菌体は20mMトリス−塩酸緩衝液(pH7.5)で懸濁した後、超音波破砕し、遠心上清をそのまま実施例14で使用した(約0.1U/mL)。形質転換していない大腸菌を培養(抗生物質は加えない)・超音波破砕して得た遠心上清をネガティブコントロールとした。
本実施例では、Streptomycesa avermitilis JCM 5070由来PL(A)が、カルシウムイオンの非存在下、PlsEtn(化4)に作用することをTLCで確認した。
10mM トリス−塩酸緩衝液pH7.5
2mM PlsEtn(化4)(又はlyPls(化7))
培養可溶化遠心上清
<反応液>を25℃又は30℃で反応し、反応開始10分後にCHCl3:CH3OH(体積比2:1)の溶液を<反応液>と同じ量加えて混合し反応を停止した。有機相に抽出されたリン脂質をTLCのサンプルとした。
図13のレーン1〜8は次の通りである。
受託番号:NITE BP−1014
寄託機関の名称:独立行政法人製品評価技術基盤機構特許微生物寄託センター(NPMD)
寄託機関のあて名:日本国 〒292-0818 千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8
寄託の日付:2011年1月26日。
[Streptomyces sp. NA684(受託番号:NITE BP−1015)]
受託番号:NITE BP−1015
寄託機関の名称:独立行政法人製品評価技術基盤機構特許微生物寄託センター(NPMD)
寄託機関のあて名:日本国 〒292-0818 千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8
寄託の日付:2011年1月26日。
配列番号2:他のPL(A)のアミノ酸配列の全長
配列番号3:PL(A)遺伝子の塩基配列
配列番号4:他のPL(A)遺伝子の塩基配列
配列番号5:プライマーS
配列番号6:プライマーAS
配列番号7:他のプライマーS
配列番号8:他のプライマーAS
配列番号9:PL(A)のアミノ酸配列の一部
配列番号10:他のPL(A)のアミノ酸配列の一部
配列番号11:配列番号9に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列
配列番号12:配列番号9に記載のアミノ酸配列をコードする他の塩基配列
配列番号13:配列番号10に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列
配列番号14:配列番号10に記載のアミノ酸配列をコードする他の塩基配列
Claims (14)
- 少なくとも下記(a)から(c)までの特性を有し、さらに下記(h)から(j)までのいずれかの特性を有するホスホリパーゼを用いてプラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解することを特徴とするプラスマローゲンの加水分解方法。
(a)エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する比活性が0.66±0.2U/mgである。
(b)SDS−PAGE法による分子量が25〜30kDaの範囲である。
(c)Streptomyces属に属する放線菌由来である。
(h)配列番号1に記載のアミノ酸配列を有する。
(i)配列番号1に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。
(j)配列番号1に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、さらに配列番号9に記載のアミノ酸配列及び配列番号10に記載のアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。 - 前記ホスホリパーゼが、さらに下記(d)及び(e)の特性を有することを特徴とする請求項1に記載のプラスマローゲンの加水分解方法。
(d)カルシウムイオン非存在下、エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、18:1)に対する相対活性が、ジパルミトイルホスホコリンに対して、19±5%である。
(e)カルシウムイオン非存在下、エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する相対活性が、1−パルミトイル−2−オレオイル−ホスホコリンに対して、29±13%である。 - 前記ホスホリパーゼが、さらに下記(f)の特性を有することを特徴とする請求項1又は2に記載のプラスマローゲンの加水分解方法。
(f)Streptomyces albidoflavus由来である。 - 少なくとも下記(a)から(c)までの特性を有し、さらに下記(k)から(m)までのいずれかの特性を有するホスホリパーゼを用いてプラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解することを特徴とするプラスマローゲンの加水分解方法。
(a)エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する比活性が0.66±0.2U/mgである。
(b)SDS−PAGE法による分子量が25〜30kDaの範囲である。
(c)Streptomyces属に属する放線菌由来である。
(k)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する。
(l)配列番号2に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。
(m)配列番号2に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、さらに配列番号9に記載のアミノ酸配列及び配列番号10に記載のアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。 - 前記ホスホリパーゼが、さらに下記(g)の特性を有することを特徴とする請求項4に記載のプラスマローゲンの加水分解方法。
(g)Streptomyces avermitilis由来である。 - 前記プラスマローゲンがエタノールアミン型プラスマローゲンであり、前記リゾプラスマローゲンがエタノールアミン型リゾプラスマローゲンであることを特徴とする請求項1から5までのいずれか一項に記載のプラスマローゲンの加水分解方法。
- 前記プラスマローゲンが試料中のプラスマローゲンであることを特徴とする請求項1から6までのいずれか一項に記載のプラスマローゲンの加水分解方法。
- 少なくとも下記(a)から(c)までの特性を有し、さらに下記(h)から(j)までのいずれかの特性を有するホスホリパーゼを用いてプラスマローゲンを測定することを特徴とするプラスマローゲンの測定方法。
(a)エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する比活性が0.66±0.2U/mgである。
(b)SDS−PAGE法による分子量が25〜30kDaの範囲である。
(c)Streptomyces属に属する放線菌由来である。
(h)配列番号1に記載のアミノ酸配列を有する。
(i)配列番号1に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。
(j)配列番号1に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、さらに配列番号9に記載のアミノ酸配列及び配列番号10に記載のアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。 - 前記ホスホリパーゼが、さらに下記(d)及び(e)の特性を有することを特徴とする請求項8に記載のプラスマローゲンの測定方法。
(d)カルシウムイオン非存在下、エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、18:1)に対する相対活性が、ジパルミトイルホスホコリンに対して、19±5%である。
(e)カルシウムイオン非存在下、エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する相対活性が、1−パルミトイル−2−オレオイル−ホスホコリンに対して、29±13%である。 - 前記ホスホリパーゼが、さらに下記(f)の特性を有することを特徴とする請求項8又は9に記載のプラスマローゲンの測定方法。
(f)Streptomyces albidoflavus由来である。 - 少なくとも下記(a)から(c)までの特性を有し、さらに下記(k)から(m)までのいずれかの特性を有するホスホリパーゼを用いてプラスマローゲンを測定することを特徴とするプラスマローゲンの測定方法。
(a)エタノールアミン型プラスマローゲン(C18、20:4)に対する比活性が0.66±0.2U/mgである。
(b)SDS−PAGE法による分子量が25〜30kDaの範囲である。
(c)Streptomyces属に属する放線菌由来である。
(k)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する。
(l)配列番号2に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。
(m)配列番号2に記載のアミノ酸配列において1つ又は複数のアミノ酸が変異、欠損又は付加されたアミノ酸配列を有し、さらに配列番号9に記載のアミノ酸配列及び配列番号10に記載のアミノ酸配列を有し、プラスマローゲンをリゾプラスマローゲンに加水分解する作用を有する。 - 前記ホスホリパーゼが、さらに下記(g)の特性を有することを特徴とする請求項11に記載のプラスマローゲンの測定方法。
(g)Streptomyces avermitilis由来である。 - 前記プラスマローゲンがエタノールアミン型プラスマローゲンであり、前記リゾプラスマローゲンがエタノールアミン型リゾプラスマローゲンであることを特徴とする請求項8から12までのいずれか一項に記載のプラスマローゲンの測定方法。
- 前記プラスマローゲンが試料中のプラスマローゲンであることを特徴とする請求項8から13までのいずれか一項に記載のプラスマローゲンの測定方法。
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JPN6015053173; secreted hydrolase [Streptomyces albus J1074],GenBank AccessionNo.EFE80399 , 20100323 * |
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