JP5875230B2 - 遺伝子の増幅方法、特定遺伝子の検出方法 - Google Patents
遺伝子の増幅方法、特定遺伝子の検出方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5875230B2 JP5875230B2 JP2011019698A JP2011019698A JP5875230B2 JP 5875230 B2 JP5875230 B2 JP 5875230B2 JP 2011019698 A JP2011019698 A JP 2011019698A JP 2011019698 A JP2011019698 A JP 2011019698A JP 5875230 B2 JP5875230 B2 JP 5875230B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- reaction solution
- water
- test sample
- carrier
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 0 CC(C(c1c2cccc1)O)=C(*)C2O Chemical compound CC(C(c1c2cccc1)O)=C(*)C2O 0.000 description 2
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
以下の手順で、検査対象(被検者A、B、C、D)からそれぞれ採取した唾液(口腔内細胞を含む)について、アルコール脱水素酵素ADH1Bの遺伝子およびアルデヒド脱水素酵素ALDH2の遺伝子の遺伝子多型の検出をリアルタイムPCR装置ABI7300(Applied Biosystems社製)を用いてTaqMan(登録商標)法により行なった。
・TaqMan(登録商標) Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name: alcohol dehydrogenase 1B(class I), beta polypeptide、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID: C_2688467_20。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_2688467_20:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
・TaqMan(登録商標)Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:aldehyde dehydrogenase 2 family(mitochondrial)、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID:C_11703892_10。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_11703892_10:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
熱変性:50℃、2分→95℃、10分、
95℃、15秒→60℃、1分を40サイクル。
39人の被検者を検査対象とし、以下の試薬を含む反応液を用いたこと以外は実施例1と同様にして、ビタミンKエポキシド還元酵素VKORC1の遺伝子の遺伝子型を判定した。
・TaqMan(登録商標) Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1; polyserase 3、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID: C_30403261_20。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_30403261_20:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
7人の被検者を検査対象とし、以下の試薬を含む反応液を用いたこと以外は実施例1と同様にして、薬物代謝酵素CYP2C9の遺伝子の遺伝子型を判定した。
・TaqMan(登録商標)Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 9、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID:C_27104892_10。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_27104892_10:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
7人の被検者を検査対象とし、以下の試薬を含む反応液を用いたこと以外は実施例1と同様にして、β2アドレナリンレセプター(ADRB2)の遺伝子の遺伝子型を判定した。
・TaqMan(登録商標)Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:adrenergic, beta−2−, receptor, surface、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID:C_2084765_20。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_2084765_20:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
7人の被検者を検査対象とし、以下の試薬を含む反応液を用いたこと以外は実施例1と同様にして、β3アドレナリンレセプター(ADRB3)の遺伝子の遺伝子型を判定した。
・TaqMan(登録商標)Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:adrenergic, beta−3−, receptor, surface、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID:C_2215549_20。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_2215549_20:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
3人の被検者を検査対象とし、以下の試薬を含む反応液を用いたこと以外は実施例1と同様にして、脱共役たんぱく質1(UCP1)の遺伝子の遺伝子型を判定した。
・TaqMan(登録商標)Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:Uncoupling Protein 1、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID:C_8866368_20。
・Realtime PCR Master Mix:5μl、
・Taqman Assay Mix C_8866368_20:0.5μl、
・KOD FX Buffer:1μl、
・DW(distilled water):3.5μl。
3人の被検者を検査対象とし、以下の試薬を含む反応液を用いたこと以外は実施例1と同様にして、ACTN3遺伝子の遺伝子型を判定した。
・TaqMan(登録商標)Drug Metabolism Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)、
・Gene Name:Cathepsin F, Actinin Alpha 3、
・TaqMan(登録商標) SNP Genotyping Assay Mix ID:C_590093_1。
・Realtime PCR Master Mix:10μl、
・Taqman Assay Mix C_590093_1:0.5μl、
・KOD FX Buffer:2μl、
・DW(distilled water):7.5μl。
Claims (4)
- 血液、または、口腔内細胞を含む唾液である被検試料に含まれる特定遺伝子を検出する方法であって、
被検試料を担持した水解性担体を、バッファー、DNAポリメラーゼおよびプライマーを含む反応液に接触させ、水解性担体を反応液中で分解させることで、水解性担体に干渉されることなく水解性担体の分解後の反応液にCCD方式による光学的手段を用いて、反応液中に特定遺伝子が含まれるか否かを検出することを特徴とする、方法。 - 水解性担体が水解性紙である、請求項1に記載の方法。
- アルコール脱水素酵素ADH1Bおよびアルデヒド脱水素酵素ALDH2の遺伝子の遺伝子多型の検出に用いられる、請求項1または2に記載の方法。
- 被検試料を担持した水解性担体を接触後の前記反応液中で、PCR法、LAMP法、SDA法、RT−SDA法、RT−PCR法、RT−LAMP法、NASBA法、TMA法、RCA法、ICAN法、UCAN法、LCR法、LDR法、SMAP法、SMAP2法から選ばれる反応を行うことを特徴とする請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2011019698A JP5875230B2 (ja) | 2011-02-01 | 2011-02-01 | 遺伝子の増幅方法、特定遺伝子の検出方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2011019698A JP5875230B2 (ja) | 2011-02-01 | 2011-02-01 | 遺伝子の増幅方法、特定遺伝子の検出方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2012157295A JP2012157295A (ja) | 2012-08-23 |
JP5875230B2 true JP5875230B2 (ja) | 2016-03-02 |
Family
ID=46838382
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2011019698A Expired - Fee Related JP5875230B2 (ja) | 2011-02-01 | 2011-02-01 | 遺伝子の増幅方法、特定遺伝子の検出方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP5875230B2 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3885450A1 (en) | 2020-03-23 | 2021-09-29 | Ricoh Company, Ltd. | Carrier and testing method |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2018181850A1 (ja) * | 2017-03-31 | 2018-10-04 | 健司 木下 | 水溶紙を含むサンプル調製用材料およびそれを用いるサンプル調製方法 |
JP6761093B1 (ja) * | 2019-09-12 | 2020-09-23 | 積水メディカル株式会社 | リアルタイムpcrによる核酸検出方法 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1430462A4 (en) * | 2001-09-25 | 2006-12-20 | Dnaform Kk | PRINTED MATERIALS INCLUDING AN OLIGOMERE AND / OR POLYMER-COATED MEDIA, METHOD FOR THE PREPARATION THEREOF, AND METHOD OF DISPENSING AND / OR STORAGE |
JP2004283165A (ja) * | 2003-03-04 | 2004-10-14 | Shimadzu Corp | Hlaタイピング法 |
JP2006166711A (ja) * | 2004-12-13 | 2006-06-29 | Okayama Univ | 糞便由来遺伝子の簡便増幅方法 |
JP2007124993A (ja) * | 2005-10-07 | 2007-05-24 | Japan Science & Technology Agency | 生体物質の保管及び/又は配送及び/又は流通方法、並びに生体物質を保管及び/又は配送及び/又は流通するための支持体 |
JP2008099622A (ja) * | 2006-10-20 | 2008-05-01 | Japan Health Science Foundation | 体液中の遺伝子増幅方法 |
-
2011
- 2011-02-01 JP JP2011019698A patent/JP5875230B2/ja not_active Expired - Fee Related
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3885450A1 (en) | 2020-03-23 | 2021-09-29 | Ricoh Company, Ltd. | Carrier and testing method |
US11795446B2 (en) | 2020-03-23 | 2023-10-24 | Ricoh Company, Ltd. | Carrier and testing method |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2012157295A (ja) | 2012-08-23 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Gao et al. | RT-qPCR based quantitative analysis of gene expression in single bacterial cells | |
JP2009505651A (ja) | 微生物および抗生物質耐性マーカーの検出の方法およびそのための核酸オリゴヌクレオチド | |
WO2012067901A1 (en) | Methods and kits for multiplex amplification of short tandem repeat loci | |
JP2011019505A (ja) | 特定遺伝子を検出する方法 | |
Van den Broeck et al. | Optimal sample storage and extraction procotols for reliable multilocus genotyping of the human parasite Schistosoma mansoni | |
JP7336091B2 (ja) | 簡便な遺伝子検査法およびコピー数計測法ならびにその支援技術 | |
Rajalakshmi | DIFFERENT TYPES OF PCR TECHNIQUES AND ITS APPLICATIONS. | |
KR20160106040A (ko) | cMET 핵산의 멀티모달 분석을 위한 조성물 및 방법 | |
JP5875230B2 (ja) | 遺伝子の増幅方法、特定遺伝子の検出方法 | |
CN113508182A (zh) | 用于检测人乳头状瘤病毒(hpv)的测定 | |
Uchiyama et al. | Understanding quantitative polymerase chain reaction bioanalysis issues before validation planning: Japan Bioanalysis Forum discussion group | |
WO2020149301A1 (ja) | Pvaスポンジを用いるリキッドバイオプシーの調製方法 | |
WO2017079461A2 (en) | Systems and methods of diagnosing and characterizing infections | |
Kreutz et al. | Pyrosequencing: powerful and quantitative sequencing technology | |
Powell et al. | Digital PCR in the clinical microbiology laboratory: another tool on the molecular horizon | |
JP2023547498A (ja) | マルチプレックス核酸検出のためのジェネリックカートリッジおよび方法 | |
AU2019375773B2 (en) | Rapid PCR methodology | |
EP2345741A1 (en) | METHOD FOR MEASURING SURVIVIN mRNA | |
EP2351851B1 (en) | Method for measuring cytokeratin-19 mrna | |
WO2010149861A1 (en) | Method for quantitative pcr amplification of deoxyribonucleic acids from a sample containing pcr inhibitors | |
JP2010200670A (ja) | 遺伝子型判定方法 | |
JP2006523455A (ja) | ポリメラーゼ反応および放出されたピロリン酸の酵素的検出による標的核酸の検出 | |
Yeatts | Quantitative polymerase chain reaction using the comparative C q method | |
WO2022085530A1 (ja) | 外来性核酸を検出する方法に供する試料の調製のための前処理方法 | |
RU2699180C1 (ru) | Набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации рнк возбудителей сапа burkholderia mallei и мелиоидоза burkholderia pseudomallei на основе транскрипционной амплификации (nasba) в режиме "реального времени" |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20131029 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20131029 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20150120 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20150320 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 Effective date: 20150320 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20150320 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20150901 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20151124 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20151201 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20160105 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20160119 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5875230 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |