JP5804341B2 - エストロゲン関連疾患の判定方法 - Google Patents
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Landscapes
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Description
本発明におけるヒトGPR30遺伝子としては、例えばGenbankのアクセッション番号AF027956、GI:2739106を例示することができ、GPR30遺伝子のORFとしては、配列番号1に示される塩基配列や、配列番号2に示されるアミノ酸配列を例示することができる。
本明細書における「エストロゲン関連疾患」としては、エストロゲンとの関連が知られている疾患であれば特に限定はされないが、例えば女性特有の組織、子宮や卵巣、乳房における筋腫やがん等を挙げることができ、好ましくは子宮筋腫、子宮腺筋症、子宮内膜増殖症、子宮内膜がん、子宮体がん、胞状奇胎、絨毛がん、卵巣腫瘍、卵巣嚢腫、卵巣がん、線維腺腫、乳腺症、乳がんを挙げることができ、さらに好ましくは子宮筋腫や乳がんを挙げることができる。
本発明におけるエストロゲン関連疾患の判定方法は、GPR30遺伝子のORFにおける少なくとも1種のSNPを検出することにより、エストロゲン関連疾患の発症の可能性、エストロゲン関連疾患の発症の有無、あるいは発症しているエストロゲン関連疾患のタイプを判定する方法である。
(1)GPR30遺伝子DNA領域であって、配列番号1に記載の塩基配列の14番目の塩基がシトシンではなくチミンである一塩基多型;
(2)GPR30遺伝子DNA領域であって、配列番号1に記載の塩基配列の47番目の塩基がシトシンではなくチミンである一塩基多型;
を挙げることができ、本明細書においてはそれぞれ(1)14C>T、(2)47C>Tと表記する場合がある。
(1)配列番号2に示されるアミノ酸配列からなるGPR30における、5番目のセリンがフェニリアラニンである変異;
(2)配列番号2に示されるアミノ酸配列からなるGPR30における、18番目のプロリンがロイシンである変異;
に相当し、本明細書においてはそれぞれ(1)S5F、(2)P16Lと表記する場合がある。
SNP検出の対象としてはゲノムDNAが好ましいが、cDNAやmRNAを使用することもできる。また、上記対象を採取する試料としては、一般的に核酸採取に用いられる任意の生物学的試料であればよく、例えば血液、骨髄液、精液、腹腔液、尿等の体液や、組織細胞、体毛等を挙げることができる。ゲノムDNA等は、これらの試料より常法に従い抽出、精製し、調製することができる。また、遺伝子多型を検出するためのテンプレートは、採取したゲノムDNA等でも、PCR法や他の公知の増幅方法、例えばNASBA法、LCR法、SDA法、LAMP法等で増幅された増幅産物でもよい。
SNPの検出は、高分解能融解曲線解析(HRM法)によると、大量のサンプルを高速で解析できる点で好ましい。HRM法は、温度上昇に伴う二本鎖DNAから一本鎖DNAへの解離(融解)が、その長さ、GC含量、あるいは相補性などにより変化がするという特性に基づき、二本鎖PCR産物の融解曲線を分析することにより、その特性を調べる手法である。HRM法による遺伝子解析は、PCR反応により標的配列が増幅されること、増幅産物が色素等により検出可能な形態であること、色素を検出しつつ温度を上昇させることで二本鎖DNAから一本鎖DNAへの解離を測定、融解曲線データを取得し、ソフトウェアによりその形を認識、分析するシステムであれば特に制限されず、例えば、DNA色素存在下で、かかる色素を検出するに適した励起、蛍光波長を放射もしくは検出することができる適切な検出機器を備えたサーマルサイクラーでPCRによる増幅反応、温度上昇を順次行い、DNA色素を検出して融解曲線を解析する例を挙げることができる。さらに具体的には、例えば、蛍光色素SYTO9(Invitrogen社製)とTaq polymerase Expand High Fidelity PLUS(Roche社製)を含むPCR反応液を調製し、Rotor-Gene(登録商標)Q(QIAGEN社製)を用いてPCR反応及び融解曲線を取得し解析する方法を挙げることができる。また、LightCycler 480 High Resolution Meltingマスターミックス(Roche社製)によりPCR反応液を調製し、LightCycler(登録商標)480(Roche社製)によりPCR反応及び融解曲線を取得する方法も挙げることができる。
上述のプライマーは、これを含むエストロゲン関連疾患診断用キットとして有利に使用することができる。また、GPR30遺伝子DNA及びGPR30遺伝子のORF内にSNPをもつDNAや、これらDNAを含むプラスミドは、かかる診断キットにおいてコントロールとして利用することができる。本発明の診断キットは、ほかに遺伝子多型の分析法に使用される制限酵素、ポリメラーゼ、ヌクレオシド三リン酸、核酸標識分子、緩衝液等を含んでいてもよい。
本発明の細胞株としては、ヒトGPR30遺伝子のORFに存在する少なくとも1種のSNPを含むGPR30を発現し、野生型GPR30を発現する細胞株に比べて細胞死の程度が低い細胞株であれば特に制限されず、上記SNPとしては前記14C>Tや47C>Tを具体的に例示することができる。これらSNPを含むヒトGPR30遺伝子のORF領域を含むDNAを動物細胞用発現ベクターに挿入して変異型GPR30組換えベクターを作製し、かかる組換えベクターを宿主細胞株に導入することにより、変異型GPR30を発現する、好ましくは、SNPを含むヒトGPR30遺伝子がゲノムDNAに組み込まれて変異型GPR30を安定的に発現する、本発明の細胞株を調製することができる。宿主細胞の種類は特に制限されず、例えば哺乳動物細胞株、好ましくはヒト由来細胞株、さらに好ましくはヒト子宮頸がん由来細胞HeLaを挙げることができる。なお、野生型GPR30を発現する細胞株はコントロールとして用いることができる。
本発明のエストロゲン関連疾患の治療薬のスクリーニング方法は、上記の変異型GPR30発現細胞株に被検物質を接触させ、1)細胞の増殖の程度を分析し、細胞の増殖を抑制する物質を選択する工程;又は2)細胞死の程度を分析し、細胞死を促進する物質を選択する工程を備えている。スクリーニング方法として、具体的には、被検物質存在下、もしくは被検物質及びGPR30リガンド/アゴニスト存在下で変異型GPR30発現細胞株の細胞増殖又は細胞死を測定して細胞増殖が減少/細胞死が増加する物質、好ましくは野生型GPR30発現細胞株と同程度に、細胞増殖が減少/細胞死が増加する物質を選択する方法を例示することができる。上記GPR30のリガンドの例としてはエストロゲン、GPR30のアゴニストの例としてはG−1が挙げられる。被検物質としては、任意の物質を使用することができ、例えば、個々の低分子合成化合物でもよいし、天然物抽出物中に存在する化合物でもよく、あるいは化合物ライブラリー、ファージディスプレーライブラリー、コンビナトリアルライブラリーでもよい。化合物ライブラリーの構築は当業者に公知であり、また市販の化合物ライブラリーを使用することもできる。
細胞増殖の測定方法としては、観測開始時点及び1点以上の任意の時間経過後に細胞数や細胞構成因子の量を測定する方法により細胞増殖を解析する方法を挙げることができる。例えば、顕微鏡下で直接に培養ディッシュ上の細胞を数える方法や、一度培養ディッシュから剥がしてから血球計算盤やフローサイトメトリーなどを用いて細胞数を測定する方法が挙げられる。測定に用いる細胞は、蛍光タンパク質の過剰発現や蛍光標識された抗体や分子により蛍光標識されていてもよく、また、以下に挙げる各種染色方法などにより染色したものを用いることができる。例えば、細胞質、核などの細胞構成因子や、細胞に発現させたタンパク質を、トリパンブルーやクリスタルバイオレット、DAPI、Hoechst、ヨウ化プロピジウム(PI)、BrdUや[3H]チミジン取り込み法、免疫蛍光染色や各種染色試薬により染色する例が挙げられる。また、例えば細胞をBrdU存在下で培養してDNAにBrdUを取り込ませ、蛍光標識した抗BrdU抗体などによりアッセイ中に取り込まれた核酸量を測定する方法や、還元発色試薬により生細胞中の脱水素酵素活性を測定するMTT法やWST法により、間接的に細胞数を計測する方法も挙げられる。
細胞死の測定方法としては、細胞死を起こしつつある細胞を検出できる方法、好ましくはアポトーシスの特徴を検出する方法であれば特に限定されず、例えば、細胞を固定してSYTOX(登録商標)Green(Invitrogen社製)で染色し、顕微鏡観察によりアポトーシスの特徴である核の断片化を起こしている細胞数を測定したり、蛍光標識アネキシンVによりアポトーシスを起こしつつある細胞の表面に露出するフォスファチジルセリンを検出し、染色された細胞をフローサイトメトリーで測定する方法を挙げることができる。
本発明のトランスジェニック非ヒト動物としては、ヒト又は非ヒト動物のGPR30遺伝子のORFに存在する少なくとも1種のSNP、好ましくは14C>Tや47C>Tを含むGPR30を発現する非ヒト動物であれば特に制限されず、全身又は部分的に、一時的又は継続的に変異型のGPR30タンパク質を発現していてもよい。例えば、変異型GPR30発現配列を組み込んだウィルスベクターを非ヒト動物の子宮組織に注射する方法や、初期発生胚に接触させて感染させる方法や、前核期受精卵やES細胞にかかるベクターをマイクロインジェクションにより導入する方法で作製されたトランスジェニック非ヒト動物を挙げることができ、好ましくは、トランスジェニック非ヒト動物におけるGPR30の発現が、テトラサイクリンによる誘導やCre/LoxPシステムにより、時期、あるいは組織特異的に制御される例を挙げることができる。また、非ヒト動物の種類としては、例えば、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、イヌ、ネコ、サル、モルモット、ハムスター、ラット、マウス等を挙げることができるが、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、マウス又はラットが好ましく、なかでもモルモット、ハムスター、マウス、ラット等の齧歯目がより好ましく、とりわけマウスが好ましい。
本発明におけるGPR30発現トランスジェニック非ヒト動物を用いたエストロゲン関連疾患の治療薬のスクリーニング方法は、上述の変異GPR30発現トランスジェニック非ヒト動物、好ましくは変異GPR30発現マウスに被検物質を投与し、子宮筋腫の大きさを測定し、子宮筋腫を縮小させる物質を選択する工程を備えている。スクリーニング方法として、具体的には、GPR30発現トランスジェニック非ヒト動物に、塗布、注射、経口投与等の手段により候補物質、あるいは候補物質及びGPR30リガンド/アゴニストを投与し、子宮筋腫のサイズを評価し、候補物質の非存在下の条件と比較して子宮筋腫のサイズが縮小する物質、好ましくは同種の野生型動物と同程度に、子宮筋腫が縮小する物質をエストロゲン関連疾患の治療薬として選択する方法を例示することができる。上記GPR30のリガンドの例としてはエストロゲン、GPR30のアゴニストの例としてはG−1が挙げられる。被検物質としては、任意の物質を使用することができ、例えば、個々の低分子合成化合物でもよいし、天然物抽出物中に存在する化合物でもよく、あるいは化合物ライブラリー、ファージディスプレーライブラリー、コンビナトリアルライブラリーでもよい。化合物ライブラリーの構築は当業者に公知であり、また市販の化合物ライブラリーを使用することもできる。子宮筋腫のサイズを評価する方法としては、子宮を解剖して組織染色や免疫染色により筋腫又は正常組織を染色し、子宮筋腫のサイズを測定する方法を挙げることができる。また、GPR30発現配列及びIRES(Internal ribosome entry site)−GFP配列を含むウィルスベクターを非ヒト動物の子宮組織に注射して子宮筋腫を引き起こし、候補物質の投与前及び投与後に、in vivo蛍光イメージング装置を用いてトランスジェニック非ヒト動物生体内のGFP蛍光を測定することにより子宮筋腫を可視化し、子宮筋腫のサイズを測定する方法も好適に例示することができる。
臨床サンプルにおけるGPR30の未知変異を検出するために、高速に大量サンプルの測定が可能なHRM法によるSNPの条件を確立した。GPR30の1128塩基のORFを、表1で示される211〜505塩基の各領域に分け、これらの領域を増幅するためのプライマー(配列番号3〜24)を作製した。表2で示される9個の既知のSNPを導入した変異型GPR30DNA配列をもつプラスミドを作製し、これらをポジティブコントロールのテンプレートとして用いて、塩濃度、4種類のTaq polymerase及び4種類の蛍光色素の組み合わせについて至適条件を検討した。表1に示すように、Mg2+ 1.5〜2.5mM存在下でTaq polymerase Expand High Fidelity PLUS(Roche社製)及び蛍光色素SYTO9(Invitrogen社製)を用いた組み合わせの条件が最も高感度であった。
正常検体100例及びヒト子宮筋腫71例、乳がん25例の検体から、ゲノムDNAを抽出し、HRM法によりGPR30のORFに存在する変異を検出した。さらにHRM法の結果を評価するため、DNAシークエンサーを用いて全サンプルにおけるGPR30のORFの配列を調べ、SNPを確認した。その結果、子宮筋腫サンプルでは表3に示す7個のSNPが同定され、そのうち14番目のシトシンがチミンに変異した14C>T(S5F)を子宮筋腫に特異的なGPR30における新規SNPとして見いだした。さらにこのSNPの遺伝子型に、子宮筋腫サンプルとコントロールサンプルとの間で統計学的に有意な差があることを見出した。この変異は乳がんサンプルでは検出されず、筋腫の約12%で検出された。
(GPR30発現ベクター)
ヒトの正常腎臓から作製したcDNAクローンを鋳型にして、開始コドンと停止コドンをそれぞれ含むプライマーのセットでGPR30遺伝子のDNA配列を増幅し、制限酵素EcoRV処理にて平滑末端にしたpBluscript SK(-)にクローニングした。その後、このクローニングされたベクターを鋳型にして、N末端側にBamHIサイトとHindIIIサイトをそれぞれ含むプライマーでGPR30DNA配列を増幅し、pFLAG(Sigma社製)にサブクローニングした。それぞれがN末端側にNotIサイトを含むプライマーを用いて、両端にNotIサイトをもつFLAG−GPR30DNA配列を増幅し、pIRES-GFP(Clontech社製)のマルチクローニングサイトにサブクローニングして、FLAG−GPR30とGFPが同時に発現するベクターを構築し、GFPの発現を確認してから実験を行った。本ベクターはGPR30配列下流にIRES及びGFP配列をもつため、pIRES-GFPのCMVプロモーターによって転写されたGPR30配列及びGFP配列をコードするmRNAから、FLAG−GPR30タンパク質とGFPタンパク質がそれぞれ発現する。GFP蛍光を検出することで、トランスフェクションされたFLAG−GPR30発現細胞を選別したり、細胞のGFP蛍光を蛍光顕微鏡下で観察することにより、トランスフェクション効率を確認することができる。
野生型及び2種の変異型GPR30(14C>T、47C>T)とエストロゲン関連疾患の病態との関連性を調べるため、組織培養E−プレート上のヒト子宮頸がん由来細胞HeLa細胞に野生型又は変異型GPR30発現ベクターをトランスフェクションし、エストロゲン100nM存在下の細胞の増殖を、xCELLigence(Roche社製)を用いて測定した(図1)。グラフ縦軸はCell impedance(細胞増殖の指標)を、横軸は経過時間を表す。以下図2〜5、図7〜12も同様である。本実験で用いたヒト子宮頸がん由来HeLa細胞は癌細胞由来であるため、対照(control)では細胞が増加するが、野生型GPR30の過剰発現では、細胞の増殖が見られなかった。しかし14C>T又は47C>Tの変異型GPR30の過剰発現では、野生型GPR30による細胞増殖抑制効果の減少が見られた。
子宮頸がん細胞(HeLa細胞)以外の細胞におけるGPR30及び変異型GPR30過剰発現による細胞増殖への影響を調べるために、以下6種類の細胞に野生型GPR30、14C>T又は47C>T変異型GPR30をトランスフェクションし、図1と同様の手法にて細胞の増殖を調べた。
1)ヒト子宮頸がん由来HeLa細胞(図7)
2)ヒト乳ガン由来MCF−7細胞(図8)
3)マウス上皮由来3T3細胞(図9)
4)ヒト腎臓由来HEK293T細胞(図10)
5)チャイニーズハムスター卵巣由来CHO細胞(図11)
6)ラット心臓由来H9c2細胞(図12)
GPR30遺伝子のORFに変異を含まない子宮筋腫の臨床サンプル及びGPR30遺伝子に14C>T変異を含む子宮筋腫の臨床サンプルの組織、各約5mgよりMagNA Pure LC mRNA Isolation kit2 (Roche社製;cat no.03172627001)を用いてmRNAを抽出し、表5に示す反応液を調製した。ランダムプライマーはTOYOBO社製(cat no.FSK-301)を使用した。この反応液をGeneAmp PCR system 2700(Applied bio systems社製)を用いて65℃で5分間ヒートショックし、その後氷上に1分間置いて冷却した。
GPR30遺伝子のプロモーター領域配列の下流にGFP遺伝子を有するDNAを遺伝子導入し、GPR30遺伝子プロモーター依存的にGFPタンパク質が発現するトランスジェニックマウスを作製した。ゲノムライブラリーのGPR30遺伝子の染色体領域が挿入されているBacpacクローンから、制限酵素SalIおよびEcoRVで切り出した7.1kbのGPR30遺伝子を含む配列を、pBluescriptにクローニングした。次に、N末端側にSpeIサイト、EcoRVサイトをそれぞれ含むプライマーのセットで、GPR30遺伝子のプロモーター領域5.8kb(転写開始点までの領域であり、本明細書において、GLA(GPR30 Long Arm)と表すこともある。)とpBluscriptが連結したDNA配列をPCR反応で増幅した。N末端側にSpeIサイト、EcoRVサイトをそれぞれ含むプライマーのセットで、pEGFP-N1からEGFP(Enhanced Green Fluorescent Protein)-SV40 polyA配列を増幅し、増幅されたSpeI-EGFP-SV40 polyA-EcoRVを、上述のGPR30のプロモーター領域とpBluscriptが連結したDNA配列にin fusionクローニングで組み込み、ターゲティングベクターpBluescript-GLA-EGFP-SV40 polyAを作製した。ターゲティングベクターを制限酵素SalIおよびEcoRVで切り出し、全長約6.8KbのリニアなDNAを精製し、このDNAをC57/BL6マウスの受精卵にマイクロインジェクションした。遺伝子を導入した受精卵をマウスの仮親に戻し、生まれたマウスのジェノタイピングを、ゲノムDNAにおけるGLA−GFP遺伝子をEGFPプローブを用いたサザンハイブリダイゼーション法で検出することにより行い、GLA−GFPを有するトランスジェニックマウスを選別した。図15に、No.3及びNo.11マウスを掛け合わせて生まれたマウスのジェノタイピングの結果を一例として示した。
Claims (5)
- ヒトGPR30遺伝子のORFに存在する一塩基多型を検出することを含むことを特徴とする子宮筋腫の判定を補助する方法であって、一塩基多型が、配列番号1に示される塩基配列の14番目の塩基がシトシンではなくチミンである一塩基多型である方法。
- ヒトGPR30遺伝子のORFに存在し、配列番号1に示される塩基配列の14番目の塩基がシトシンではなくチミンである一塩基多型を含むGPR30を発現し、野生型GPR30を発現する細胞株に比べて細胞死の程度が低いことを特徴とする細胞株。
- 請求項2記載の細胞株に被検物質を接触させ、1)細胞の増殖の程度を分析し、細胞の増殖を抑制する物質を選択する工程;又は2)細胞死の程度を分析し、細胞死を促進する物質を選択する工程;を含む子宮筋腫の治療薬のスクリーニング方法。
- ヒト又は非ヒト動物のGPR30遺伝子のORFに存在し、配列番号1に示される塩基配列の14番目の塩基がシトシンではなくチミンである一塩基多型、又は非ヒト動物のGPR30ホモログ遺伝子に保存された、配列番号1に示される塩基配列の14番目の塩基に相当するシトシンがチミンである一塩基多型を含むGPR30を発現することを特徴とするトランスジェニック非ヒト動物。
- 請求項4記載の変異GPR30発現トランスジェニック非ヒト動物に被検物質を投与し、子宮筋腫の大きさを測定し、子宮筋腫を縮小させる物質を選択する工程を含む子宮筋腫の治療薬のスクリーニング方法。
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