JP5773569B2 - 受容体リガンド模倣体を検出する方法 - Google Patents
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Description
作動性または拮抗性の受容体リガンドを介した生物機能の調節は、通常、過度に活発の高い生化学経路を遮断または緩和するか、またはある疾患に関するか該疾患の原因となっていると考えられる経路を活性化または復帰させることを目的としている。
多くの疾患では、特に腫瘍の治療では、著しい進歩が遂げられてきたが、単一薬剤治療としての1つの薬剤によってはいまだ限られた利益しか与えられないことが多い。疾患の原因である分子経路が個々の患者間で、あるいは同じ患者内の細胞サブクローン間で冗長であり、可変であることを考えると、それは驚くことではない。それゆえ、一つの標的に焦点を当てた治療が大部分の患者で永続性に疾患を制御したり治療したりする可能性は低い(非特許文献2)。薬剤の組み合わせの使用は、患者により良い治療と利益を供給するため、特に癌治療において十分に確立された治療原理を提供している。少数の例外を除いて、癌のための有用な薬物治療は、既知の活性を有し、毒性のスペクトルが最小限しか重複していない複数の薬物の組み合わせを、それらの最適用量で、正常な細胞の回復に匹敵するスケジュールにより、使用する。これらの化学療法薬の組み合わせのうち前臨床的に評価されているのはほんの少数しかなく、これらの組み合わせのうち相乗的なもの、すなわち組み合わせるとそれらの個々の活性の相加作用よりも大きな効果を与えるものは少数しかない。現在の併用治療の多くは、ヒト患者を用いて試行錯誤アプローチを用いて、まず臨床研究で試みられている。
らに、ATCC等の組織によって提供されるか、国立癌研究所によって使用されるような永続的癌細胞株は、それらの由来元である元の腫瘍と比較すると生物学的特性や化学感受性パターンでかなりの変更が示されている。2つの研究が、国立癌研究所の60個の細胞株のパネルにおけるインビトロ試験と、インビボ異種移植片と、細胞毒性薬剤の臨床上の有効性との間の相関が限られていることを示している(非特許文献3および非特許文献4)。
アポトーシスと呼ばれるプログラム細胞死は、組織恒常性の維持を媒介し、皮膚および胃腸管からの細胞の除去を調節すると共に環境上のトリガに応じて骨を改造する。アポトーシスは、また全身ウイルス感染を阻止し、自己免疫を防ぐべく自己応答T細胞およびB細胞を除去し、腫瘍形成特性を獲得する可能性がある細胞を除去することにより、疾患を予防する。アポトーシスの異常調節は、多くの疾患プロセスで役割を果たしている。アポトーシスの不適当な活性化は、パーキンソン病やアルツハイマー病等の神経変性障害に関連したり、または梗塞の後の心組織の再潅流後に観察される心筋障害に関連したりしている。さらに、外来性エピトープが細胞表面で検知されると、免疫系のナチュラルキラー(NK)細胞か細胞傷害性Tリンパ球(CTL)によりアポトーシスが選択的に引き起こされ得る。アポトーシスへの耐性すなわち細胞がアポトーシスを受ける閾値がより高いことは、p53腫瘍抑圧遺伝子等の多くの遺伝子での突然変異に関連している。
内因性(すなわちミトコンドリアの)および外因性アポトーシス(すなわち受容体媒介性)の経路は、アポトーシスが生じ得る2つの機構である。
ゼが開裂および活性化される。いくつかの細胞では、かかる開始物質のカスパーゼは最後の実行物質分子であるカスパーゼ−3、カスパーゼ−6およびカスパーゼ−7を開裂および活性化するのに十分であるが、いくつかの細胞では、細胞死受容体シグナルを増幅するためにミトコンドリアに基づくアポトーシスシステムの活性化も必要とする。カスパーゼ−8とカスパーゼ−10は、細胞質のアポトーシス促進因子Bcl−2相互作用ドメイン(BID)を開裂および活性化し、該BIDがミトコンドリアに移動してアポトーシス開始因子シトクロムcの放出を引き起こす(非特許文献6)。多数の異なる細胞死受容体ファミリーの受容体およびその天然リガンドが知られている(表1):
HGS−ETRl(マパツムマブ;Human Genome Sciences社)は、TRAIL−Rl
を標的とする完全なヒト作動性モノクローナル抗体であるが、進行性悪性腫瘍患者でのフェーズII評価中である。HGS−TR2J等のTRAIL−R2に対する完全なヒトモ
ノクローナル抗体(HGS−ETR2;Human Genome Sciences社)も臨床段階に入って
おり、現在フェーズIの臨床開発中である。HGS−ETR2とHGS−TR2Jは両者
の臨床での使用を保証するわずかに異なる生理化学的および動態学的プロファイルを有している(非特許文献11および非特許文献12)。
MDRは癌の有効な治療に対する主な障害である。薬剤耐性の癌は、本質的に治療できない(内因的耐性)か、治療の間に種々の抗癌剤に対する耐性を現すよう進展したか(後天的抵抗性)のいずれかである。MDRという用語は、一つの細胞障害性薬物に暴露された腫瘍細胞の、広範囲の構造的および機能的に無関係な薬剤に対する抵抗を現す能力を説明するために使用される。この現象には多数の機構が寄与することが知られており、その例には薬剤流出ポンプの過剰発現、DNA修復機構の活性の増大、薬剤標的酵素の変更、および薬剤の解毒と除去に関与する酵素の過剰発現が含まれる。ほとんどの化学療法アプローチはアポトーシスを介してそれらの結果を結局誘発するため、アポトーシスの制御レベルの変更は薬物耐性が生じ得るさらに別の機構を提供する。この概説は、調節不全にされたアポトーシス経路の操作により耐性腫瘍を化学感受性にするために使用された戦略のいくつかに焦点を当てている。
本発明による小分子受容体リガンド模倣体の発見方法を確認し、その有用性を実証するために、本願発明者らは当該技術分野で十分に確立されている小分子をさらに選択した。この分子のことを本明細書では「AP−121」と称する(別の表記はエデルフォシン、ET−18−OCH3、1−O−オクタデシル−2−O−メチル−グリセロ−3−ホスホコリン、rac−1−O−オクタデシル−2−O−メチル−グリセロ−3−ホスホコリン、または場合によってはアルキルリゾリン脂質またはALPと称されることもある)。AP−121はエーテル脂質、より正確には以下の化学式を有するアルキルリゾリン脂質である:
詳細には、インビトロやいくつかの動物データは、一連の腫瘍での非常に後半な「非特異的な」活性を示唆しているが、これは公表されたヒトの試験では明らかには証明できなかった。さらに、得られた生物学的データのいくつかは、使用した細胞株が異なったり、実験条件が異なったり、あるいは関連する科学者の技能が異なったりする等、検定システムが異なっていたため、矛盾してもいる。
害されるが、低濃度や高濃度では活性化されることが判っている(非特許文献20)。他は、PKCがHL−60APおよびK562細胞の細胞毒性作用に関与しないと説明している(非特許文献21)。AP−121は、その濃度が合計脂質の30mol%まで増大されるにつれて前進的にPKCαの活性を阻害するが、30mol%を超えると効果が活性化のそれとなる。AP−121はPKCεに対して三相性の効果を有する。つまり低濃度ではPKCεを活性化し、わずかに高い濃度ではそれを阻害し、より高い濃度では再びそれを活性化する(非特許文献22)。
体とは無関係に、ミトコンドリアのシトクロムcの放出にかかるアポトーシス促進特性が起因するとしている(非特許文献38)。AP−121はエンドシトーシスによって腫瘍細胞の脂質ラフトへ内在化される(非特許文献39および非特許文献40)。一旦、細胞内に入ると、AP−121はFas関連細胞死ドメインタンパク質であるプロカスパーゼ−8、プロカスパーゼ−10およびc−Jun N末端キナーゼおよびBidと、アポトーシスの開始にとって重要な分子の動員を引き起こす(非特許文献41)。したがって、細胞死受容体(FAS−R)とミトコンドリアのアポトーシス経路は空間的に関連しており、ミトコンドリアの膜電位差の乱れ、反応性酸素種の生成、カスパーゼ−3の活性化、ポリ(ADPリボース)ポリメラーゼの開裂、およびDNA分断化を生じる(非特許文献42)低μmol範囲である細胞株でのAP−121の報告されている生物活性と比較すると、本願発明者らが知っている限りの現在までに記載された最も有力な効果は、HMECl内皮細胞に対する60nmolの抗血管形成活性である(非特許文献43)。
「小分子」とは、本明細書に使用する場合、特にペプチド、タンパク質、核酸分子、炭水化物、脂質、および低分子量の化合物を含む。
つの金属原子を含む分子、好ましくは有機分子のことを指す。そのような分子の例には、イミダゾール、インドール、イソオキサゾール、オキサゾール、ピリジン、ピリミジンおよびチアゾールが特に含まれる。
。説明の目的で、配列AlおよびA2は以下の形式をとり得る。
Rogers-Tanimoto、 Russel-Rao、 Simpson、 Tanimoto またはYule 係数を使用することも可能である。
本発明は、治療に有用な処理、診断方法、CH−11FAS受容体リガンドとしてのAP−121を、単独でまたは他の治療上有用な化合物と組み合わせて含む組成物、およびかかる治療上の有用性を確立するための方法をも指す。好ましくは、本発明の組成物は経口的に適用可能な医薬の剤形をしており、特に好ましくは錠剤、丸剤、カプセル剤、および顆粒剤等の固形の剤形である。さらに、かつCH−11とは異なって、AP−121は、生物学的利用能が高く耐性が良好なので、Ch−11や同様な抗体と比較すると患者に治療上の利点を与える。
実施例および実験手順
実施例1:選択ステップ
本方法の実際の有用性を決定するために、本願発明者らは、一例として、活性化小分子リガンドが求められるFAS受容体と、適切な受容体リガンドとしての作動性抗体CH−11と、推定CH−11模倣体としてのAP−121とを選択した。組み合わせ測定のための追加化合物を備えたパネルとして、既知の薬剤であるカンプトテシン、テモゾラミド、アドリアマイシン、およびタルセバを選択した。
星状細胞腫におけるアポトーシスと生存は、腫瘍Fas(APO−1/CD95)発現と関連する(Frankel et al., Neurooncol. 2002, 59: 27-34)。
ップレギュレーションにより、脳内悪性神経膠腫を有するラットでアポトーシスが増大し、生存期間が延びた(B. Frankel et al., Neurosurgery 2001, 49: 168-75)。
ログ番号05−201)から得た活性化ヒト項Fas抗体クローンであるCH−11は、マウス免疫アフィニティ精製したIgMであるが、この抗体はFas(43kD)を認識し、Faswo発現するヒト細胞に対して細胞溶解活性を有する。ヒトFasLをコードするcDNAでトランスフェクトしたマウスWR19LおよびL929細胞をかかる抗体と反応させてアポトーシスを及ぼした。抗体はTNFを認識せず、マウスFasLとは交
差反応しない。24時間後、86%のヒトJurkat細胞が死に至った。
実施例2:細胞株および試薬
U−118MG(神経膠芽腫
/星状細胞腫、p53変異型、PTEN変異型)、T98G(多形性神経膠芽腫
、p53変異型、PTEN変異型)、A172(神経膠芽腫
、p53野生型、PTEN変異型)およびU87MG(神経膠芽腫
/星状細胞腫、p53野生型、PTEN変異型)をアメリカ培養細胞株保存機関
(ATCC)から購入した。
インキュベートした。AP−121は滅菌蒸留水の5mMストック溶として調製した。テモゾロミド(TMZ)(Harorui Pharma-Chem社、ニュージャージー州エディソン所在)
は100mMの滅菌濾過DMSOとして調製した。アドリアマイシン(ADR)(Sigma
社)は10mMの0.1N NaOH溶液として調製した。タルセバ(Proteinkinase社
、ドイツ)は5mMの滅菌DMSOとして調製した。すべての化合物ストックは−20℃で保存した。
実施例3:WST−1増殖アッセイ
2000個の細胞96ウェルの平坦な有底プレートの各ウェルに播き、5%CO2、3
7℃で一晩インキュベートした。3つの対照ウェルに7.5μMのWST−1試薬(Roche Applied Sciences社、ドイツ)を加え、SpectraMax250プレートリーダで650nmお
よび450nmでの吸光度をそれぞれ測定することにより、播いた細胞の増殖を測定した。OD650−DO450の値が0.5を超える場合、プレートの残りをAP−121、他の薬剤、または溶媒対照との96時間のインキュベートの為に使用した。
在)により決定した。併用指数(CI)の平均を計算することによりデータを評価した。ここで、CI<0.3の場合は強い相乗作用があるとし、0.3<CI<0.7の場合は相乗効果があるとし、0.7<CI<0.9の場合は中程度の相乗性があるとし、0.9<CI<1の場合は相加効果があるとし、CI>iの場合は拮抗作用があるとする。
4時間および96時間)で6回繰り返し、上記実験の各々を有効な結果が得られるまで3回繰り返した。
実験概要:以下では、実験全体の一部の選択データのみを記載する。
実施例4:AP−121の併用指数(CI)
このデータから、AP−121および対応する化合物混合物に対する各ED50データ
を用いて以下のデータ配列A2およびA1を導き出すことができる。
B1およびB2から、1つの細胞当たりの各化合物または化合物混合物に対する類似性の値を単純に平均することにより、類似性配列Sを計算することができる。
は生物活性の考えられる重複が最も低いことに相当する。
、および未分化星状細胞腫と共に、3つすべての細胞株で強い相乗効果が観察された。
実施例7:
実施例4および5で概説した手順を用いると、シスプラチン(DDP)/AP−121およびゲミシタビン(GMZ)/AP−121に対して非小細胞性肺癌で強い相乗効果が観察された。DDPとGMZはいずれもSigma-aldrich社(アメリカ、ミズーリ州セント
ルイス所在)から購入した。以下の細胞株を使用した:A549(FAS陰性)、NCI−H460(FAS陽性)、およびHCC827(FAS陽性)、いずれもATTC(アメリカ、メリーランド州ロックヴィル所在)から得た。
前立腺癌の細胞株がFAS受容体を発現していること、かかる細胞株のいくつかはFASに対して感受性でないことが知られている(OW Rokhlin et al., Can cer Res. 1997, 57: 1758-68)。LNCaPは放射線に対する感受性が低減された前立腺癌細胞株であるが
、拮抗薬FAS抗体CH−11は放射線誘発性アポトーシスに対して細胞を感作する(K.
Kimura and E.P. Gelmann, Cell Death and Differentiation 2002, 9: 972-980;以下の実施例も参照のこと)。それゆえ、本願発明者等は、LNCaP細胞をマウス前立腺に注入し、腫瘍を増殖させた後、種々の用量の0−30mg/kg腹腔内注射と同時に放射線照射を適用することにより、動物実験を行った。
実施例9:前立腺癌の治療における1−O−オクタデシル−2−O−メチル−グリセロ−3−ホスホコリンの効果
前立腺癌は、男性生殖系の腺である前立腺で発達するタイプの癌である。前立腺癌はほとんどの場合、健康診断により、またはPSA(前立腺特異的抗原)試験等のスクリーニング血液検査により発見される。PSA試験は前立腺特異的抗原、すなわちカリクレインと類似のセリンプロテアーゼの血液レベルを測定する。その通常の機能は、射精後のゼラチン様精液を液化することであり、これにより精子は子宮頸管の中をより容易に進むことが可能となる。約4ng/mlを超えるPSAレベルは、前立腺癌が発展しているリスク
を示すと一般に考えられている。しかしながら、PSAは完全な試験ではなく、尿中の細胞関連PCA−3 mRNAの検出などの追加分析により確認されるべきである。
1−O−オクタデシル−2−O−メチル−グリセロ−3−ホスホコリン単独のおよびRT、AD、またはRT+ADと組み合わせた場合の、前立腺細胞のプログラム細胞死(アポトーシス)の程度と生存率とに対する効果をそれぞれ調べた。
スコンシン州マジソン所在)を用いて製造業者の取扱説明書に従って測定した。生きている癌細胞の割合を文献(Freshney, R.I. (1994) Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique. 3rd Ed. Wiley-Liss. StateStateNew York. USA)に記載の通りトリパ
ンブルー染色排除法により概算した。
ロ−3−ホスホコリン(最終濃度、「CHEM」)と(イオン化)放射線(5グレイ単位、「RT」)をLNCaP細胞に同時に適用し、後続のインキュベーション時間を24時間まで延長した。アポトーシスを上述のようにApo-ONE(商標)Homogenous Caspase-3/7Assayを使用して測定し、相対蛍光単位(RFLU)で表した。アポトーシス細胞の割合は、確立された標準プロトコルにより、アネキシンV−PE陽性染色細胞および7−AAD(7−アミノアクチノマイシンD)陰性染色細胞(いずれもBD Biosciences、アメリカ合衆国カリフォルニア州サンホセ所在、から購入)のフローサイトメトリー分析により決定した。結果は以下の表に概説する。データは3つの独立した実験からの平均±SEMを表す。
次に、1−O−オクタデシル−2−O−メチル−グリセロ−3−ホスホコリン投与(「CHEM」)とアンドロゲン枯渇治療(「AD」)の相互作用について調べた。LNCaP細胞から、当該技術分野で周知の確立された手順に従い血清の炭吸着により3日間アンドロゲンを枯渇させた。CHEMをそれぞれ5μMおよび10μMの最終濃度で添加した。さらに、CHEM投与前2日間の合成アンドロゲンR1881(「R1881」)の添加が効果の逆転を生じさせるか否かについても試験した。
は、属(genus)からの主題を除外する条件または否定的限定付きで、除外される題材が
本明細書に詳細に記載しているか否かにかかわらず、本発明の包括的(generic)説明を
含む。
Claims (9)
- ある小分子が細胞の受容体のタンパク質またはペプチドリガンドの機能的置換物であるか否かを決定するための方法であって、前記小分子が、前記受容体の調節に治療効果をもたらす場合には同小分子が疾患の治療において有用である機能的置換物であると決定する方法において、前記方法は、
前記受容体のタンパク質またはペプチドリガンド及び前記小分子の両方の生物学的効果であって、少なくとも3つの異なる種類の細胞であって永久細胞株および初代細胞の少なくとも一方から選択される細胞のパネルに対する前記生物学的効果を測定し、測定により得られた対応するデータの第1及び第2の配列を得る工程と、
前記第1及び第2の配列の類似性を数学的アルゴリズムにより計算する工程と、を含み、
前記生物学的効果は、阻害濃度、有効量、または併用指数を含み、かつ
前記配列の類似性が所定の閾値よりも高い場合に、前記小分子が前記タンパク質またはペプチドリガンドの機能的置換物であると決定される、方法。 - 前記小分子と前記タンパク質またはペプチド受容体リガンドとの前記細胞に対する生物学的効果は個別におよび組み合わせて測定される請求項1に記載の方法。
- 前記小分子と前記タンパク質またはペプチド受容体リガンドとの生物学的効果は、タンパク質、ペプチド、または小分子から選択された少なくとも1つの追加化合物の存在下で測定される請求項1または2に記載の方法。
- 前記小分子と前記タンパク質またはペプチド受容体リガンドとの生物学的効果の類似性、及び前記小分子と前記タンパク質またはペプチド受容体リガンドとの組み合わせと、前記追加化合物または複数の追加化合物を有するパネルと、の生物学的効果の類似性が計算され、
前記測定された化合物の生物学的効果の類似性は、個別に、2つの化合物を組み合わせて、および3つ以上の化合物を組み合わせての少なくともいずれかで測定された少なくとも3つの細胞系と少なくとも3つの化合物の生物学的データのマトリクスからなり、前記小分子と前記タンパク質またはペプチド受容体リガンドとの間の類似性は確立された数学的方法により該データのマトリクスから計算される請求項3に記載の方法。 - 前記小分子を前記追加化合物の一つと組み合わせると相乗的生物学的効果が生じるか否かを決定するための請求項3に記載の方法。
- 前記小分子はAP−121であるか、
前記受容体のリガンドは作動薬FASの抗体またはFAS結合タンパク質から選択されたタンパク質またはペプチドであり、対象受容体はFAS受容体であるか、
の少なくとも一方である
請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。 - 小分子はFAS受容体の活性化因子として識別される請求項1に記載の方法。
- 前記小分子はAP−121であり、前記追加化合物または複数の化合物からなるアレイは1または複数の抗腫瘍剤から選択され、該抗腫瘍剤は、16−アザエポチロンB、アルデスロイキン、アミホスチン、アラノース、ベバシズマブ、ブレオシン、ブレオマイシン、BMS−184476、ボルテゾミブ、カルシトリオール、カンプトテシン、カネルチニブ、カンフォスファミド、カペシタビン、カルボプラチン、カルムスチン、セフィキシム、セフトリアキソン、セレコキシブ、セルモロイキン、セツキシマブ、シクロスポリン、シスプラチン、クロドロン酸、シクロホスファミド、シタラビン、ダサチニブ、デオキソルビシン、デスオキシエポシロンB、ジエチルスチルベストロール、ジフロモテカン、ドセタキセル、ドキソルビシン、エダトレキサート、エファプロキシラル、EKB−569、エピルビシン、エプラツズマブ、エルロチニブ、エトポシド、エキサテカン、フルダラビン、フルオロウラシル、フォリン酸、ガラルビシン、ゲフィニチブ、ゲムシタビン、ゲムツズマブ、ジマテカン、グルフォスファミド、グラニセトロン、ホモハリントニン、ヒアルロン酸、イバンドロン酸、イブリツモマブ、イホスファミド、イマチニブ、イホスファミド、インターフェロンα、インターフェロンα−2a、インターフェロンα−2b、イリノテカン、イソフラボン、イソトレチノイン、イクサベピロン、ケトコナゾール、ラパチニブ、レフルノミド、レノグラスチム、ロイコボリン、レキシドロナム、リネゾリド、ロメトレキソール、ルートテカン、MEN10755、メルファラン、メトトレキサート、マイトマイシン、ネリドロネート、ノイラジアブ(Neuradiab)、ニメスリド、ニトログリセリン、06−ベンジルグアニン、オメプラゾール、オルタタキセル、オキサリプラチン、パクリタクセル、パツピロン(Patupilone)、ペグフィルグラスチム、ペリチニブ、ペメトレキセド、ペンタスタチン、ペリホシン、プロビトレキセド、ポリプレイン酸、キヌプリスチン、ラロキシフェン、ラルチトレキセド、ラモセトロン、レチノイン酸、リセドロン酸、リツキシマブ、ロフェコキシブ、ルビテカン、S−9788、サバルビシン、サルグラモスチム、サトラプラチン、SN−38、ソラフェニブ、スベラニロヒドロキサミン酸、スーテント、タモキシフェン、タキソテール、タザロテン、テガフール、テモゾラミド、テスミリフェン、テトロドトキシン、サリドマイド、ティピファニブ、トポテカン、トラベクテジン、トラスツズマブ、トラスズツマブ、トレオスルファン、トレチノイン、バタラニブ、ビンクリスチン、ビノレルビン、ZD−6474、ゾレドロン酸、またはゾスキダルから選択されるか、または
前記小分子はAP−121であり、前記追加化合物は1または複数の抗ウイルス薬から選択され、該抗ウイルス薬は、3TC、アバカビル、アデホフィルビボキシル、アシクロビル、アンプレナビル、アマンタジン、アモキソビル、AZT、クレビジン、デラビルジン、d4T、エムトリシタラビン、エンテカビル、ファムシクロビル、ガンシクロビル、インジナビル、ラミブジン、ネルフィナビル、ネビラピン、オセルタミビル、リマンタジン、リトナビル、サキナビル、セプトリン、テルビブジン、テノホビル、バラシクロビル、バルトルシタビン、バロピシタビン、またはザナミビルから選択される請求項3に記載の方法。 - AP−121を前記追加化合物の1つと組み合わせて測定し、前記細胞のパネルに対して前記組み合わせにより相乗的生物学的効果に影響が及ぼされるか否かを決定する請求項8に記載の方法。
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