JP5745273B2 - 化学療法のためのマーカーとしてのtle3 - Google Patents
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Description
本特許出願は、付属書類Aとして提示される表およびデータを含む構成要素を指す。詳しくは、付属書類Aは、本発明の方法においてTLE3マーカーとともにパネルにおいて使用できる種々のマーカーを列挙する表である。この表は、抗体ID、親遺伝子名、Entrez Gene ID、親遺伝子の既知仮名、抗体の調製において使用され得るペプチドおよび染色のための例示的抗体力価を含む。当業者ならば、親遺伝子名、Entrez Gene IDおよび/または親遺伝子の既知仮名を使用して、付属書類Aに列挙されている親遺伝子1つ1つのヌクレオチド(および対応するアミノ酸)配列を、公共データベース(例えば、GenBank、Swiss−Protまたは任意のこれらの次世代の派生物)から容易に得ることができる。付属書類Aに列挙されている親遺伝子1つ1つのヌクレオチド配列および対応するアミノ酸配列は、これらの公共データベースから参照により本明細書に組み込まれる。S5またはS6ではじまるIDを有する抗体は、示される商業的供給源から得てもよい。
結合する−相互作用パートナーがマーカーと「結合する」場合、直接非共有結合性相互作用によって連結される。
上記のように、本発明者らは、癌サンプル中のTLE3(スプリット3のトランスデューシン様エンハンサー、Entrez Gene ID7090)の発現と、化学療法に対する癌の応答の間の相関を同定した。実施例に記載のとおり、この相関は、TLE3抗体と、既知の転帰を有する、治療された患者および治療されていない患者の両方を含む2つの乳癌コホートから得たサンプルを使用して実証された。本発明者らはまた、この予測モデルが、治療された卵巣癌患者のコホートから得たサンプルに適用した場合にも一致することを示した。本発明者らはまた、特定の種類の化学療法、例えば、細胞周期特異的化学療法薬、例えば、メトトレキサートおよびタキサンの投与を含む治療に対する応答を予測するためのTLE3の有用性を実証した。これらの化学療法薬は、種々の癌の種類の全域で既知有用性を有するので、これらの結果は、本発明の方法はまた、種々の癌の種類の全域で、それらの有効性を予測することにおいて有用であろうと示唆する。
一態様では、本発明は、TLE3を、患者の癌が、化学療法に対して応答する見込みを予測するためのマーカーとして使用する方法を提供する。概して、これらの方法は、癌患者由来の癌サンプルを提供すること、癌サンプル中でTLE3が発現されるか否かを測定すること、および測定するステップの結果に基づいて、患者の癌が化学療法に対して応答する見込みを予測することを含む。一実施形態では、予測するステップは、癌サンプル中のTLE3発現の存在に基づいて、患者の癌が化学療法に対して応答する可能性が高いと予測することを含む。一実施形態では、予測するステップは、癌サンプル中にTLE3発現がないことに基づいて、患者の癌が化学療法に対して応答する可能性が低いと予測することを含む。
上記のように、TLE3の発現は、任意の既知法を使用して調べることができる。一実施形態では、TLE3発現は、相互作用パートナー(例えば、抗体)を使用してTLE3ポリペプチドマーカーを検出することによって調べてもよい。別の実施形態では、TLE3発現は、プライマーを用いてTLE3ポリヌクレオチドマーカーを検出することによって調べてもよい。
TLE3ポリペプチドマーカーは、TLE3ポリペプチドマーカー(TLE3タンパク質またはその抗原性断片であり得る)を結合する任意の相互作用パートナーを使用して検出してもよい。したがって、本発明に従って、親和性および特異性の適当な組み合わせでマーカーを結合する限り、相互作用パートナーとして、TLE3マーカーを検出可能に結合する任意の成分を利用してよい。
多くの場合で、抗体などの相互作用パートナーを使用するポリペプチドマーカーの検出は、特定のサンプル中でTLE3が発現されるか否かを測定する最も好都合な手段に相当し得るが、本発明の方法はまた、ポリヌクレオチドマーカーの検出のためのプライマーの使用も包含する。特定のポリヌクレオチドマーカーの存在を検出するためのさまざまな方法が、当技術分野で公知であり、本発明の方法において使用してもよい。通常、これらの方法は、1種以上のプライマーと、ポリヌクレオチドマーカー間のハイブリダイゼーションに頼るものである。
本発明に従って、TLE3の予測力は、癌を、既知治療法に対するその応答性の可能性に関して分類するためだけでなく、癌の治療において有用であり得る、可能性ある新規治療法または治療薬を同定するためにも有用である。
上記のように、本発明は、新規治療法およびこれらを同定する方法を提供する。特定の実施形態では、相互作用パートナーまたはプライマーは、有用な治療薬であり得る。あるいは、またはさらに、本発明に従って定義されるか、調製される相互作用パートナーは、治療薬の標的として働くマーカー(例えば、TLE3)と結合する。また、本発明の相互作用パートナーを使用して、癌細胞に治療薬を送達してもよい。例えば、本発明に従って提供される相互作用パートナーを、1種以上の治療薬とカップリングしてもよい。
実施例1:抗体を作製すること
この実施例は、これらの実施例において使用されたTLE3抗体を作製するために使用した方法を記載する。同様の方法を使用して、注目する任意のマーカーと(例えば、付属書類Aに列挙されるその他のマーカーであるか、その他のマーカーに由来するタンパク質と)結合する抗体を作製してもよい。いくつかの場合には、抗体は、商業的供給源(例えば、Chemicon、Dako、Oncogene Research Products、NeoMarkersなど)またはその他の公共の利用可能な供給源(例えば、Imperial Cancer Research Technologyなど)から得てもよい。
・アニソール(カタログ番号A4405、Sigma、St. Louis、MO)
・2,2’−アジノ−ジ−(3−エチル−ベンゾチアゾリン−スルホン酸)(ABTS)(カタログ番号A6499、Molecular Probes、Eugene、OR)
・活性化型マレイミドキーホールリンペットヘモシアニン(カタログ番号77106、Pierce、Rockford、IL)
・キーホールリンペットヘモシアニン(カタログ番号77600、Pierce、Rockford、IL)
・リン酸(H3PO4)(カタログ番号P6560、Sigma)
・氷酢酸(カタログ番号BP1185−500、Fisher)
・EDC(EDAC)(カタログ番号341006、Calbiochem)
・25%グルタルアルデヒド(カタログ番号G−5882、Sigma)
・グリシン(カタログ番号G−8898、Sigma)
・ビオチン(カタログ番号B2643、Sigma)
・ホウ酸(カタログ番号B0252、Sigma)
・セファロース4B(カタログ番号17−0120−01、LKB/Pharmacia、Uppsala、Sweden)
・ウシ血清アルブミン(LP)(カタログ番号100 350、Boehringer Mannheim、Indianapolis、IN)
・臭化シアン(カタログ番号C6388、Sigma)
・透析チューブスペクトル/細孔膜MWCO:6−8,000(カタログ番号132665、Spectrum Industries、Laguna Hills、CA)
・ジメチルホルムアミド(DMF)(カタログ番号22705−6、Aldrich、Milwaukee、WI)
・DIC(カタログ番号BP 592−500、Fisher)
・エタンジチオール(カタログ番号39,802−0、Aldrich)
・エーテル(カタログ番号TX 1275−3、EM Sciences)
・エチレンジアミン四酢酸(EDTA)(カタログ番号BP 120−1、Fisher、Springfield、NJ)
・1−エチル−3−(3’ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド、HCL(EDC)(カタログ番号341−006、Calbiochem、San Diego、CA)
・フロイントのアジュバント、完全(カタログ番号M−0638−50B、Lee Laboratories、Grayson、GA)
・フロイントのアジュバント、不完全(カタログ番号M−0639−50B、Lee Laboratories)
・フリット付きクロマトグラフィーカラム(カラム部分番号12131011、フリット部分番号12131029、Varian Sample Preparation Products、Harbor City、CA)
・ウシ皮膚由来のゼラチン(カタログ番号G9382、Sigma)
・ヤギ抗ウサギIgG、ビオチン化(カタログ番号A 0418、Sigma)
・HOBt(カタログ番号01−62−0008、Calbiochem)
・西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)(カタログ番号814 393、Boehringer Mannheim)
・HRP−ストレプトアビジン(カタログ番号S 5512、Sigma)
・塩酸(カタログ番号71445−500、Fisher)
・過酸化水素30% w/w(カタログ番号H1009、Sigma)
・メタノール(カタログ番号A412−20、Fisher)
・マイクロタイタープレート、96ウェル(カタログ番号2595、Corning−Costar、Pleasanton、CA)
・Calbiochem製のN−α−Fmoc保護されたアミノ酸。’97〜’98カタログ1〜45ページ。
・ペプチド(Research Geneticsによって合成された。詳細は以下に示される)
・ピペリジン(カタログ番号80640、Fluka、Sigmaから入手可能)
・炭酸水素ナトリウム(カタログ番号BP328−1、Fisher)
・ホウ酸ナトリウム(カタログ番号B9876、Sigma)
・炭酸ナトリウム(カタログ番号BP357−1、Fisher)
・塩化ナトリウム(カタログ番号BP 358−10、Fisher)
・水酸化ナトリウム(カタログ番号SS 255−1、Fisher)
・ストレプトアビジン(カタログ番号1 520、Boehringer Mannheim)
・チオアニソール(カタログ番号T−2765、Sigma)
・トリフルオロ酢酸(カタログ番号TX 1275−3、EM Sciences)
・Tween−20(カタログ番号BP 337−500、Fisher)
・ウェットボックス(Rectangular Servin’Saver(商標)部分番号3862、Rubbermaid、Wooster、OH)
・蒸留水に溶解したEDTAを含むBBS−ホウ酸緩衝生理食塩水(HClまたはNaOHを用いてpH8.2〜8.4)、25mMホウ酸ナトリウム(Borax)、100mMホウ酸、75mM NaClおよび5mM EDTA。
・蒸留水に溶解し、所望のpHに調整したグリシン(pH2.0およびpH3.0)、0.1Mグリシンおよび0.154M NaCl。
・MRXプレートリーダー(Dynatech、Chantilly、VA)
・Hamilton Eclipse(Hamilton Instruments、Reno、NV)
・Beckman TJ−6遠心機(モデル番号TJ−6、Beckman Instruments、Fullerton、CA)
・チャートレコーダー(Recorder1部分番号18−1001−40、Pharmacia LKB Biotechnology)
・UVモニター(Uvicord SII部分番号18−1004−50、Pharmacia LKB Biotechnology)
・Amicon撹拌細胞濃縮器(Stirred Cell Concentrator)(モデル8400、Amicon、Beverly、MA)
・30kD MWカットオフフィルター(カタログ番号YM−30 メンブランカタログ番号13742、Amicon)
・マルチチャネル自動化ピペッター(カタログ番号4880、Corning Costar、Cambridge、MA)
・pHメータCorning 240(Corning Science Products、Corning Glassworks、Corning、NY)
・ACT396ペプチドシンセサイザー(Advanced ChemTech、Louisville、KY)
・真空乾燥機(Labconco、Kansas City、MO製のボックスおよびAlcatel、Laurel、MD製のポンプ)。
ペプチド選択
それに対して抗体が作製されるペプチドまたは複数のペプチドを、Hopp/Woods法(HoppおよびWoods、Mol.Immunol.20:483、1983ならびにHoppおよびWoods、Proc.Nat.Acad.Sci.U.S.A. 78:3824、1981に記載される)を使用するプログラムを使用して注目するタンパク質配列内から選択した。このプログラムは、低い溶媒到達性によって予測される、いくつかの推定抗原エピトープを含有する15〜20個のアミノ酸のペプチド配列を同定するスキャンニングウィンドウを使用する。これは、単一の短い(約6アミノ酸)の推定的抗原エピトープを同定するHopp/Woods法のほとんどの実行とは対照的である。場合により、予測された溶媒到達性を、ループ構造のPHD予測によってさらに評価する(RostおよびSander、Proteins 20:216、1994に記載される)。好ましいペプチド配列は、さらなる既知ヒトタンパク質と最小の類似性しか示さない。類似性は、ワードサイズ2を使用してBLASTPアラインメントを実施することによって決定した(Altschulら、J.Mol.Biol.215:403、1990に記載される)。1000未満のEXPECT値を与えられたすべてのアラインメントを調べ、正確な近接するギャップのないアラインメント中、60%を超えるまたは5残基以上の類似性を有するアラインメントは、それらのペプチドが退けられるようにした。細胞膜の外側の露出されたタンパク質の領域を標的とすることが望ましい場合には、文献から、または隠れMarkovモデルを使用する予測膜貫通ドメインによって定義される、注目するタンパク質の細胞外領域を決定した(Kroghら、J.Mol.Biol.305:567、2001)。ペプチド配列が細胞外ドメイン中にあった場合には、ペプチドは、N結合型グリコシル化部位を含んでいた場合には退けられた。付属書類Aに示されるように、TLE3抗体の調製のためには、アミノ酸配列KNHHELDHRERESSAN(配列番号383)を有する単一ペプチドを使用した。付属書類Aは、その他のマーカーに対する抗体の調製において使用してもよい1〜3のペプチド配列を提供する。
所望のペプチドの配列を、ペプチドシンセサイザーに提供した。C末端残基を決定し、適当なWang樹脂を反応容器と付着させた。ペプチドまたは複数のペプチドを、合成サイクルを使用する時点で1個のアミノ酸を加えることによってC末端からN末端に合成した。どのアミノ酸が加えられるかは、ペプチドシンセサイザーによって制御され、ペプチドシンセサイザーは、データベースに入力されたペプチドの配列を頼りにする。合成ステップは、以下の通りに実施した:
ステップ1−樹脂膨潤:2mlのDMFを加え、30分間インキュベートし、DMFを排出した。
2a−脱保護:反応溶液に1mlの脱保護溶液を加え、20分間インキュベートした。
2c−カップリング:反応槽に750mlのアミノ酸溶液(ペプチドシンセサイザー中に列挙される配列が決定されると変更される)および250mlのDIC溶液を加えた。反応槽を30分間インキュベートし、1回洗浄した。カップリングステップを1回繰り返した。
ステップ3−最終脱保護:最後にもう一度、ステップ2aおよび2bを実施した。
ペプチド(6mg)を、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)とコンジュゲートした。選択されたペプチドが、少なくとも1個のシステインを含む場合には、総容量4mlについて、3アリコート(2mg)をPBS(2ml)に溶解し、PBS2ml中のグルタルアルデヒド、EDCまたはマレイミド活性化KLH(2mg)によってKLHとカップリングしてもよい。ペプチドが、システインを欠く場合には(TLE3ペプチドにおけるように)、2アリコート(3mg)を、グルタルアルデヒドおよびEDC法によってカップリングしてもよい
マレイミドカップリングは、2mgのペプチドを、PBS(4ml)中に溶解した2mgのマレイミド活性化KLHと混合し、4時間インキュベートすることによって達成できる。
2匹のニュージランドホワイトウサギに、総容量1ml中、等容量の完全フロイントアジュバントおよび生理食塩水中、250μg(合計)のKLHがコンジュゲートしているペプチドを注射した。次いで、最初の免役化の2、6、8および12週間後に、総容量1mlについて、等容量の不完全フロイントアジュバントおよび生理食塩水中の、KLHがコンジュゲートしているペプチド100μgを、3〜4箇所の皮下背側部位に注射した。免役化スケジュールは以下の通りとした:
0日目 免役前出血、一次免役
15日目 最初の追加免役
27日目 最初の出血
44日目 2回目の追加免役
57日目 2回目の出血および3回目の追加免役
69日目 3回目の出血
84日目 4回目の追加免役
98日目 4回目の出血
ウサギ血清の採取
ウサギを、耳介動脈から出血させた(30〜50ml)。血液を室温で15分間凝血させ、IEC DPR−6000遠心機を5000gで使用して血清を血餅から分離した。細胞を含まない血清を、穏やかにデカントして、清潔な試験管に入れ、アフィニティー精製のために−20℃で保存した。
洗浄溶液を除くすべての溶液は、Hamilton Eclipse、液体処理ディスペンサーによって加えた。固相上のペプチドを用いるELISAアッセイを使用して、ウサギにおいて抗体力価を求めた。柔軟な高結合ELISAプレートを、BBSで希釈されたペプチド(100ml、1mg/ウェル)を用いて受動的にコーティングし、ウェットボックス中、4℃で一晩インキュベートした(湿らせた綿ボールを含む気密容器)。プレートを空にし、次いで、半自動化プレートウォッシャーを使用して、満たすことおよび空にすることの反復によって、0.1% Tween−20を含有するBBS(BBS−TW)で3回洗浄した。各ウェルを、1%BSAおよび0.1%ゼラチンを含有するBBS−TW(BBS−TW−BG)で完全に満たすことおよび室温で2時間インキュベートすることによってプレートをブロッキングした。このプレートを空にし、ウェルに免疫前および免疫後両方の血清を加えた。最初のウェルは、血清をBBS中1:50で含んでいた。次いで、1:204,800の最後の(12回目の)希釈の間、1:1の割合で、プレート中で血清を12回以上連続的に力価測定した。プレートを4℃で一晩インキュベートした。このプレートを空にし、記載されるように3回洗浄した。
10mlの臭化シアン活性化セファロース4Bに5mgのペプチドを、ヒドラジン−セファロース4Bに5mgのペプチドをコンジュゲートすることによって親和性カラムを調製した。手短には、ペプチド(5mg)にDMF100μlを加え、混合物を、内容物が完全に湿潤するまでボルテックス処理した。次いで、水を加え(900ml)、内容物を、ペプチドが溶解するまでボルテックス処理した。溶解したペプチドの半分(500μl)を、pH8.4のホウ酸緩衝生理食塩水(BBS)0.1ml中、10mlの臭化シアン活性化セファロース4Bおよびクエン酸バッファーpH6.0中の過剰のEDCを使用してpH4.5に調整した0.1M炭酸バッファー中、10mlのヒドラジン−セファロース4Bを含有する別個の試験管に加えた。コンジュゲーション反応は、室温で一晩進行させた。コンジュゲートされたセファロースをプールし、フリット付きカラムにロードし、10mlのBBSで洗浄し、10mlの1Mグリシンでブロッキングし、HClを用いてpH2.5に調整した0.1Mグリシン10mlで洗浄し、BBS中で再中和した。280nmの光学濃度がベースラインに達するのに十分な容量でカラムを洗浄した。
ペプチド親和性カラムを、UVモニターおよびチャートレコーダーに取り付けた。力価測定したウサギ抗血清を、解凍し、プールした。血清を、1容量のBBSで希釈し、1分あたり10mlでカラムを通して流した。非ペプチド免疫グロブリンおよびその他のタンパク質を、過剰のBBSを用いて、280nmの光学密度がベースラインに達するまで、カラムから洗浄除去した。カラムを外し、親和性精製されたカラムを、pH7.0〜1.0の段階的なpH勾配を使用して溶出した。溶出を280nmでモニターし、抗体を含有する画分(pH3.0〜1.0)を、過剰の0.5M BBSに直接的に回収した。回収試験管中の過剰のバッファー(0.5M BBS)は、pH勾配の酸性画分中に回収された抗体を中和するよう働いた。
この実施例には、実施例に使用された組織アレイを調製するために使用された方法が記載されている。この実施例はまた、どのように抗体染色を実施したかを記載している。
2種の異なる乳癌コホートから得た腫瘍サンプル−Huntsville Hospital(HH)およびRoswell Park Cancer Institute(RP)を、実施例1のTLE3抗体を用いて染色した。両コホート中のすべての患者について、治療および再発データを入手した。図2は、TLE3抗体を用いる染色に基づいて分類した後のHHコホート中のすべての患者を使用して作成したカプラン−マイヤー再発曲線を示す。TLE3陽性およびTLE3陰性患者から得た再発データを使用して、上の曲線および下の曲線をそれぞれ作成した。図に示されるように、TLE3マーカーとの抗体結合は、この乳癌コホートの全域で予後の改善と相関する(HR=0.573、p=0.004)。図3は、RPコホート中のすべての患者を使用して、同様の様式で作成したカプラン−マイヤー再発曲線を示す。HHコホートと同様に、TLE3マーカーとの抗体結合は、予後の改善と相関するとわかった(HR=0.239、p=0.011)。
HHおよびRPコホート中の種々の患者が、種々の種類の化学療法を受けたので、本発明者らは、TLE3発現が、特定の種類の化学療法に対する応答と相関するかどうかを調べることができた。
TLE3の予測力が、その他の臨床因子(例えば、年齢、腫瘍の大きさ、結節の状態、壊死など)と無関係であることを確認するために、本発明者らは、RP乳房コホートから得た結果を使用して二変数統計分析を実施した。結果は、以下の表1に要約されている。表に示されるように、TLE3を使用する予測は、すべての二変数分析において有意性を残しており、このことは、そのその他の臨床因子の非依存を実証する。
本発明のその他の実施形態は、明細書の考察または本明細書に開示される本発明の実施から当業者には明らかであろう。明細書および実施例は、単に例示と考えられ、本発明の真の範囲は、以下の特許請求の範囲によって示されると意図される。
Claims (29)
- 患者の乳癌、肺癌、または、卵巣癌が、メトトレキサート、メトトレキサート誘導体、タキサン、または、タキサン誘導体を用いる処置を包含する化学療法に対して応答する見込みを予測するための判断基準を得る方法であって、該方法は、インビトロでの以下のステップ:
該癌患者由来の癌サンプルを提供するステップと、
該癌サンプル中でTLE3が発現されるか否かを測定するステップと、
該測定するステップの結果に基づいて、該患者の癌が化学療法に対して応答する見込みを予測するための判断基準を得るステップと
を含み、
ここで、該予測するための判断基準を得るステップにおいて、該癌サンプル中のTLE3発現の存在が、該患者の癌が、化学療法に対して応答する可能性が高いと予測するための判断基準を与え、該癌サンプル中にTLE3発現がないことが、該患者の癌が、化学療法に対して応答する可能性が低いと予測するための判断基準を与える、方法。 - 前記測定するステップが、
陰性対照サンプルを提供するステップと、
該陰性対照サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
前記癌サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
該癌サンプル中のTLE3発現のレベルを、該陰性対照サンプル中のTLE3発現のレベルと比較するステップと
を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記測定するステップが、
陽性対照サンプルを提供するステップと、
該陽性対照サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
前記癌サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
該癌サンプル中のTLE3発現のレベルを、該陽性対照サンプル中のTLE3発現のレベルと比較するステップと
を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記測定するステップが、前記癌サンプルを、TLE3ポリペプチドと結合する相互作用パートナーと接触させるステップを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記相互作用パートナーが抗体である、請求項4に記載の方法。
- 前記測定するステップが、前記癌サンプルを、TLE3ポリヌクレオチドとハイブリダイズする1種以上のプライマーと接触させるステップを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記患者の癌が化学療法に対して応答する予測された見込みが、該癌患者に化学療法を投与するべきか否かの指標である、請求項1に記載の方法。
- 前記癌サンプル中のTLE3発現の存在が、前記癌患者に化学療法を投与すべきであることを示す、請求項7に記載の方法。
- 前記癌サンプル中にTLE3発現がないことが、前記癌患者に化学療法を投与すべきではないことを示す、請求項7に記載の方法。
- 前記タキサンがパクリタキセルである、請求項7に記載の方法。
- 前記タキサンがドセタキセルである、請求項7に記載の方法。
- 前記化学療法が、ネオアジュバント設定の投与である、請求項1に記載の方法。
- 前記化学療法が、アジュバント設定の投与である、請求項1に記載の方法。
- 前記癌患者が、ステージII+の癌を有する、請求項1に記載の方法。
- 前記癌患者が、ステージIIb+の癌を有する、請求項1に記載の方法。
- 前記癌患者が、ステージIII+の癌を有する、請求項1に記載の方法。
- 乳癌、肺癌、または、卵巣癌の患者のために、メトトレキサート、メトトレキサート誘導体、タキサン、または、タキサン誘導体を用いる処置を包含する化学療法を選択すべきか否かの判断基準を得る方法であって、該方法は、インビトロでの以下のステップ:
該癌患者由来の癌サンプルを提供するステップと、
該癌サンプル中でTLE3が発現されるか否かを測定するステップと、
該測定するステップの結果に基づいて、該癌患者のための化学療法を選択かすべきか否かの判断基準を得るステップと
を含み、ここで、該選択するステップにおいて、該癌サンプル中のTLE3発現の存在が化学療法を選択すべきとの判断基準を与える、方法。 - 前記測定するステップが、
陰性対照サンプルを提供するステップと、
該陰性対照サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
前記癌サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
該癌サンプル中のTLE3発現のレベルを、該陰性対照サンプル中のTLE3発現のレベルと比較するステップと
を含む、請求項17に記載の方法。 - 前記測定するステップが、
陽性対照サンプルを提供するステップと、
該陽性対照サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
前記癌サンプル中のTLE3発現のレベルを検出するステップと、
該癌サンプル中のTLE3発現のレベルを、該陽性対照サンプル中のTLE3発現のレベルと比較するステップと
を含む、請求項17に記載の方法。 - 前記測定するステップが、前記癌サンプルを、TLE3ポリペプチドと結合する相互作用パートナーと接触させるステップを含む、請求項17に記載の方法。
- 前記相互作用パートナーが抗体である、請求項20に記載の方法。
- 前記測定するステップが、前記癌サンプルを、TLE3ポリヌクレオチドとハイブリダイズする1種以上のプライマーと接触させるステップを含む、請求項17に記載の方法。
- 前記タキサンがパクリタキセルである、請求項17に記載の方法。
- 前記タキサンがドセタキセルである、請求項17に記載の方法。
- 前記化学療法が、ネオアジュバント設定での投与である、請求項17に記載の方法。
- 前記化学療法が、アジュバント設定の投与である、請求項17に記載の方法。
- 前記癌患者が、ステージII+の癌を有する、請求項17に記載の方法。
- 前記癌患者が、ステージIIb+の癌を有する、請求項17に記載の方法。
- 前記癌患者が、ステージIII+の癌を有する、請求項17に記載の方法。
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