JP5708639B2 - 多孔質フィルターカラム及びそれを用いた試薬カートリッジ並びに核酸精製キット - Google Patents
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Description
しかし、Oリングと接触するフィルター部分は、フィルター面積が狭くなるためろ過効率が悪く、加圧しても流体の移動量が少ない。また、Oリングとカラムとで挟まれる角や隙間に溶液が不純物として残りやすいため、核酸抽出用途においては多孔質フィルターへの吸着効率・洗浄効率が共に悪く、試料の純度や収量が低下することが問題となっていた。
そのため、フィルターがカラム内へ固定され、なおかつろ過効率を高くすることで試料の純度や収量が高められ、さらに低コストであるようなフィルターカラムが求められていた。
即ち、請求項1に記載の発明は、底部に排出口を有する有底筒状カラムであって、前記底部上に多孔質フィルターが保持され、前記多孔質フィルター上に中空部材が載置された多孔質フィルターカラムにおいて、前記中空部材は前記カラムの内壁面および多孔質フィルターに接触しない中空部と、前記カラムの内壁面および多孔質フィルターと接触する脚部とからなることを特徴とする多孔質フィルターカラムである。
多孔質フィルターカラム1は、外容器10と多孔質フィルター18と中空部材20を図3のように組み合わせて構成されており、外容器10上部の開口部11より後述の試料溶液や洗浄溶液などの試液類が分注され、次いで加圧エア導入により試液類は多孔質フィルター18に吸着又は通過、ろ過されて排出口17より排出もしくは別容器へ回収される。
図4は外容器10の断面図であり、外容器10は少なくとも上端の開口部11と、円筒状の側面部12と、漏斗状の底面部13と、底面部13の中央に突出したノズル状の排出口17からなり、これらが一体となって成型されて外容器10が構成されている。さらに、開口部11周辺に鍔部16と、側面部12周辺に突起15を形成してもよい。外容器10の形状は上端の開口部11と下端の排出口17とがいずれも開口して貫通した筒状になっており、上端の開口部11から被検体が溶解された状態の溶解液や洗浄液、溶出液などが供給されるようになっている。これらの液体は、多孔質フィルター18及び支持部材19を通過して排出口17から排出されるようになっている。
多孔質フィルター18は、生体試料が化学的に吸着するような親水性基を表面に有する材料を用い、試料溶液が内部を通過して試料が効率よく吸着する為に表面積の大きい多孔質の膜状に形成したものが好ましい。また、洗浄液による洗浄時には核酸を吸着保持し、回収液による回収時には核酸の吸着力を弱めて離すように構成されている。本発明における多孔質材料は、ガラスウール等の繊維状の材料を重ね合わされたものを含む。
多孔質フィルター18は洗浄・ろ過等の際に加圧手段により加圧されるため、強度の低い多孔質フィルター18を用いる場合、多孔質フィルター18が撓んでしまい、外容器10と多孔質フィルター18との間に溶液が通過する隙間が生じ、この部分からの溶液漏れが起こるおそれがあるが、剛性の高い支持部材19を配置しておくことにより、多孔質フィルター18が撓むことを防ぎ、強度の低い多孔質フィルター18を用いた場合でも加圧することができる。そのため、支持部材19の剛性は多孔質フィルター18よりも高くなっており、多孔質フィルター18が外容器10で変形することが支持部材19によって抑制されている。
また、支持部材19は、少なくとも核酸に対する吸着性が低く、かつ被検体から核酸を抽出する反応を阻害しない材料によって形成されていることが好ましい。
中空部材20は、図6に示すように、中空部21と脚部22から構成される。図6は中空部材20の一例として、中空部21が円状で、脚部22を3本有するものを示した。図6(a)は中空部材の真下方向から見た図であり、図6(b)は中空部材を真横方向から見た図であり、図6(c)は中空部材を真上方向から見た図である。
また、脚部22は多孔質フィルター18側に向かって徐々に縮径するようなテーパー形状でもよい。この場合には脚部の底面積が小さくなるためろ過効率を向上させることができる。そのため、脚部22が載置される水平面と直交する面での脚部22の断面形状を、半円径、円形、半円形、台形などの形状とし、これらの形状のうち多孔質フィルター18と接する面積が最小になるような面を脚部22の底部とすることができる。
上述した多孔質フィルターカラム1を用い、全血からの核酸抽出を行った結果を以下に示す。
<1>多孔質フィルターカラム1の作製
外容器10に、支持部材19、多孔質フィルター18、中空部材20の順で底面部13へ装填して図3に示したものと同じ構成のカラムを作製した。外容器10は内径13mmのポリプロピレン成形品とした。中空部材20には図6に示した形状と同一のものをポリプロピレンで成形した。中空部21は外径11.9mm、内径10.7mm、厚み1mmの円状、脚部は3本あり、外形、13.1mm、内径10.9mm、厚み2mmの円弧形状で、中心角は10°とした。支持部材19にはポリプロピレンの粒を焼結させて作製した直径13mm、厚み1mmのフィルターを使用した。多孔質フィルター18には直径13mm、平均孔径1μm、厚み700μmのグラスファイバーフィルターを用いた。
溶解液(4Mのグアニジン塩酸塩、10v/v%のTritonX−100、50mMのTris−HCl、10mMのEDTAを含む)および洗浄液(3mMのTris−HCl、0.3mMのEDTA、30mMのNaCl、70v/v%のエタノールを含む)を調製した。
全血100μLと<2>で調製した溶解液500μLを55℃で2分間混合・攪拌し、<1>で作製した多孔質フィルターカラム1の上端開口部11より分注して多孔質フィルター18に接触させ、1分間インキュベートした。次に、ポンプによる加圧エアを導入し、全血溶解液を排出した。
以下、溶解液600μL、<2>で調製した洗浄液650μL、純水300μLに関しても同様に分注と排出操作を行った(洗浄液は2回繰り返し)。最後に55℃に加温した回収液(純水)350μLを分注して核酸を溶出した。上記の操作を3種類のカラムサンプルにつき2回ずつ繰り返した。
<3>で取得した各核酸溶液について、収量をPicoGreen定量法により、純度を吸光度法(A280/A260およびA230/A260)によりそれぞれ測定した。
上記中空部材20の替わりに、ポリプロピレンで成形した外径13.2mm、内径10mm、厚み1.5mmのOリングを搭載したこと以外は実施例1と同様にして、多孔質フィルターカラムを作製し、上記<2>溶解液および洗浄液の調製、<3>核酸抽出操作、<4>核酸収量・純度の測定を実施例1と同様に行なった。
上記中空部材20を搭載せず、支持部材19と多孔質フィルター18のみを装填したカラムを作製したこと以外は実施例1と同様にして、多孔質フィルターカラムを作製し、上記<2>溶解液および洗浄液の調製、<3>核酸抽出操作、<4>核酸収量・純度の測定を実施例1と同様に行なった。
10 外容器
11 開口部
12 側面部
13 底面部
14 担持部
15 突起
16 鍔部
17 排出口
18 多孔質フィルター
19 支持部材
20 中空部材
21 中空部
22 脚部
100 試薬カートリッジ
200 分注チップラック
201 分注チップ
Claims (9)
- 底部に排出口を有する有底筒状カラムであって、前記底部上に多孔質フィルターが保持され、前記多孔質フィルター上に中空部材が載置された多孔質フィルターカラムにおいて、
前記中空部材は前記カラムの内壁面および多孔質フィルターに接触しない中空部と、前記カラムの内壁面および多孔質フィルターと接触する脚部とからなることを特徴とする多孔質フィルターカラム。 - 前記脚部が、二本以上であることを特徴とする請求項1に記載の多孔質フィルターカラム。
- 前記脚部と前記カラムの内壁面との接触面が、円弧形状を有することを特徴とする請求項1又は2に記載の多孔質フィルターカラム。
- 前記円弧形状の曲率が、前記カラムの内壁面の曲率と同一であることを特徴とする請求項3に記載の多孔質フィルターカラム。
- 前記円弧形状の中心角が10°〜30°であることを特徴とする請求項4に記載の多孔質フィルターカラム。
- 前記中空部材の中空部が、円形であることを特徴とする請求項1乃至請求項5の何れか1項に記載の多孔質フィルターカラム。
- 前記多孔質フィルターが、核酸吸着能を有することを特徴とする請求項1乃至請求項6の何れか1項に記載の多孔質フィルターカラム。
- 被検体から核酸を分離精製するための液体が収容され、分注チップを用いて前記液体が分注される試薬カートリッジであって、
前記試薬カートリッジは、前記被検体を収容する被検体収容部と、前記液体を収容する液体収容部と、前記分離精製において発生する廃液を収容する廃液収容部と、前記被検体の前記核酸を精製する多孔質フィルターカラムと、を有し、
前記多孔質フィルターカラムが請求項1乃至7の何れか1項に記載の多孔質フィルターカラムであることを特徴とする試薬カートリッジ。 - 請求項8に記載の試薬カートリッジと、前記分注チップを複数収容するための分注チップ収容体と、を備えることを特徴とする核酸精製キット。
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