JP5689892B2 - 2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5エン酸、及びバシトラシン等のペプチドの生成におけるその使用方法 - Google Patents
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Description
幾つかの非リボソーム的に合成されたペプチドは、異常アミノ酸を含む。例えば、サイクロスポリンAは、2(S)−アミノ−3(R)−ヒドロキシ−4(R)−メチル−6(E)−オクテン酸を含み、これは、サイクロフィリンの細胞内受容体に結合するために重要であり、したがってその免疫抑制活性にとって重要である(非特許文献2)。
・新規のメチオニン類似体である2−アミノ−5−メチル−5−ヘキセン酸は、ストレプトミセスの発酵ブロスから単離された(非特許文献3)。
・4メチル−ノルロイシンは、組換えタンパク質に組み込むことができるイソロイシン誘導体である(非特許文献4)。
・アマニタ・ソリタリア(Amanita solitaria)の不飽和ノルロイシン。化学的及び薬理学的研究(非特許文献6)。
・特許文献1には、多次元コンビナトリアル化学ライブラリーに使用されるアミノ酸の種々のアリル誘導体が記載されている。
本発明者らは、2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸という名称を使用するが、それは、2−アミノ−3−メチル−5−ヘキセン酸と同じ化合物を包含する。
(2S,3S)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸、
(2R,3S)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸、
(2S,3R)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸、及び
(2R,3R)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸。
「バシトラシン」は、以下の構造(アミノ酸残基は上付きで付番されている)を含むペプチド化合物である。
Y及びZは、独立して、イソロイシン、バリン、又は5−メチレン−イソロイシンのアミノ酸残基であり、
Thzは、以下のチアゾリン環であり、
Leuは、ロイシンアミノ酸残基であり、
Gluは、グルタミンアミノ酸残基であり
Lysは、Y及びOrnとペプチド結合を形成するリジンアミノ酸残基であり、そのε−アミンは、ペプチド結合によりアスパラギンのα−カルボキシル基に結合されており、
Ornは、オルニチンアミノ酸残基であり、
Pheは、フェニルアラニンアミノ酸残基であり、
Hisは、ヒスチジンアミノ酸残基であり、
Aspは、アスパラギン酸アミノ酸残基であり、
Asnは、Aspとペプチド結合を形成するアスパラギンアミノ酸残基であり、そのα−カルボキシル基は、ペプチド結合によりリジンのε−アミンに結合されている。
−NH−CHR−COOH(C末端)
又は
NH2−CHR−CO−(N末端)
又は
−NH−CHR−CO−(内部)
式中、Rは、
グリシンの場合は、Hであり、
アラニンの場合は、CH3であり、
セリンの場合は、OHであり、
システインの場合は、CH2SHであり、
イソロイシンの場合は、CH(CH3)CH2CH3であり、
ロイシンの場合は、CH2CH(CH3)2であり、
バリンの場合は、CH(CH3)2、などである。
イソロイシンの場合は、CH(CH3)CH2CH3であり、
ロイシンの場合は、CH2CH(CH3)2であり、
バリンの場合は、CH(CH3)2である。
バシトラシンのアミノ酸残基の「位置」は、イソロイシン、バリン、又は5−メチレン−イソロイシンであってもよい1位のN末端(本出願では、バシトラシンを示す図の全てにおいて左端にある)から付番されている。したがって、Lysは位置番号6であり、Asnは位置番号12である。
5−メチレン−イソロイシンは、独立してR又はS配置であってもよい2つのキラル炭素原子を含む。
(実施例)
実施例1:
(2S,3R)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル、及び(2S,3S)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル
THF中の臭化ビニルマグネシウム(1.0M、83.64mL、83.64mmol)を、THF(100mL)中(2S,3S)及び(2S,3R)−4−ヨード−N−フタロイルバリンメチルエステル(26.96g、69.68mmol)、CuCl2(0.47g、3.5mmol)、乾燥LiCl(0.29g、7.0mmol)の予冷却(−10℃)混合物に添加する。反応混合物をこの温度で一晩撹拌する。反応混合物を、飽和塩化アンモニウム溶液(水溶液)(300mL)に添加する。相を分離させ、水相をジエチルエーテル(3×100mL)で抽出する。混合した有機相を、飽和ブライン(100mL)で洗浄し、乾燥し(MgS04)、溶媒を減圧下で除去する。10gの生成混合物を単離する。(2S,3S)及び(2S,3R)生成物を、カラムクロマトグラフイーにより分離する。
(2S,3R)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸
(2S,3R)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル(2.01g、7.00mmol)を、6N塩酸及び氷酢酸(62.5mL)の2:1混合液に溶解し、溶液を還流しながら4時間加熱する。溶液を室温に冷却し、減圧下で濃縮する。生成物を水で処理し、溶液をろ過する。ろ液を減圧下で濃縮し、残渣を水に溶解し、その後溶液を、アンバーライトIR120陽イオン交換樹脂(NH4 +型)のカラムにアプライする。カラムを水(2.5L)で洗浄し、その後アンモニア水溶液(2.5L)で溶出する。溶出液を、アンモニアが検出できなくなるまで沸騰させ、その後減圧下で濃縮して、表題の化合物を得た(0.5g、3.50mmol)。
(2S,3S)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸
(2S,3S)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル(2.01g、7.00mmol)を、6N塩酸及び氷酢酸(62.5mL)の2:1混合液に溶解し、溶液を還流しながら4時間加熱する。溶液を室温に冷却し、減圧下で濃縮する。生成物を水で処理し、溶液をろ過する。ろ液を減圧下で濃縮し、残渣を水に溶解し、その後溶液を、アンバーライトIR120陽イオン交換樹脂(NH4 +型)のカラムにアプライする。カラムを水(2.5L)で洗浄し、その後アンモニア水溶液(2.5L)で溶出する。溶出液を、アンモニアが検出できなくなるまで沸騰させ、その後減圧下で濃縮して、表題の化合物を得た(0.5g、3.50mmol)。
(2R,3R)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル、及び(2R,3S)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル THF中の臭化ビニルマグネシウム(1.0M、83.64mL、83.64mmol)を、THF(100mL)中(2S,3S)及び(2S,3R)−4−ヨード−N−フタロイルバリンメチルエステル(26.96g、69.68mmol)、CuCl2(0.47g、3.5mmol)、乾燥LiCl(0.29g、7.0mmol)の、予冷却(−10℃)混合物に添加する。反応混合物をこの温度で一晩撹拌する。反応混合物を、飽和塩化アンモニウム溶液(水溶液)(300mL)に添加する。相を分離させ、水相をジエチルエーテル(3×100mL)で抽出する。混合した有機相を、飽和ブライン(100mL)で洗浄し、乾燥し(MgS04)、溶媒を減圧下で除去する。10gの生成混合物を単離する。(2R,3S)及び(2R,3R)生成物を、カラムクロマトグラフイーにより分離する。
(2R,3R)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸
(2R,3R)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル(2.01g、7.00mmol)を、6N塩酸及び氷酢酸(62.5mL)の2:1混合液に溶解し、溶液を還流しながら4時間加熱する。溶液を室温に冷却し、減圧下で濃縮する。生成物を水で処理し、溶液をろ過する。ろ液を減圧下で濃縮し、残渣を水に溶解し、その後溶液を、アンバーライトIR120陽イオン交換樹脂(NH4 +型)のカラムにアプライする。カラムを水(2.5L)で洗浄し、その後アンモニア水溶液(2.5L)で溶出する。溶出液を、アンモニアが検出できなくなるまで沸騰させ、その後減圧下で濃縮して、表題の化合物を得た(0.5g、3.50mmol)。
(2R,3S)−2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸
(2R,3S)−2−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−イソインドール−2−イル)−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸メチルエステル(2.01g、7.00mmol)を、6N塩酸及び氷酢酸(62.5mL)の2:1混合液に溶解し、溶液を還流しながら4時間加熱する。溶液を室温に冷却し、減圧下で濃縮する。生成物を水で処理し、溶液をろ過する。ろ液を減圧下で濃縮し、残渣を水に溶解し、その後溶液を、アンバーライトIR120陽イオン交換樹脂(NH4 +型)のカラムにアプライする。カラムを水(2.5L)で洗浄し、その後アンモニア水溶液(2.5L)で溶出する。溶出液を、アンモニアが検出できなくなるまで沸騰させ、その後減圧下で濃縮して、表題の化合物を得た(0.5g、3.50mmol)。
以下、上記の実施形態から把握できる技術的思想を付記する。
(付記1)
化合物2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸。
(付記2)
(2S,3S)配置を有する、付記1に記載の化合物。
(付記3)
(2R,3S)配置を有する、付記1に記載の化合物。
(付記4)
(2S,3R)配置を有する、付記1に記載の化合物。
(付記5)
(2R,3R)配置を有する、付記1に記載の化合物。
(付記6)
アミノ基が保護されている、付記1に記載の化合物。
(付記7)
カルボキシル基が保護されている、付記1に記載の化合物。
(付記8)
ペプチドを生成するための、付記1に記載の化合物の使用方法。
(付記9)
前記ペプチドがバシトラシンである、付記8に記載の使用方法。
(付記10)
付記1に記載の化合物を含む組成物。
(付記11)
ビニルグリニャール試薬をハロゲン化アルキルとクロスカップリングさせることを含む、付記1に記載の化合物を生成する方法。
(付記12)
反応が、Li 2 CuCl 4 により触媒される、付記11に記載の方法。
(付記13)
前記ハロゲン化アルキルが、4位にハロゲン化物を有するバリンの誘導体である、付記11に記載の方法。
(付記14)
前記誘導体が、4−ヨード−N−フタロイルバリンメチルエステルである、付記13に記載の方法。
Claims (11)
- 化合物2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸またはその塩。
- (2S,3S)配置を有する、請求項1に記載の化合物。
- (2R,3S)配置を有する、請求項1に記載の化合物。
- (2S,3R)配置を有する、請求項1に記載の化合物。
- (2R,3R)配置を有する、請求項1に記載の化合物。
- ペプチドを生成するための、2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸の使用方法。
- 前記ペプチドがバシトラシンである、請求項6に記載の使用方法。
- 2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸を含む組成物。
- ビニルグリニャール試薬をハロゲン化アルキルとクロスカップリングさせることを含む、2−アミノ−3−メチル−ヘキサ−5−エン酸を生成する方法。
- 反応が、Li2CuCl4により触媒される、請求項9に記載の方法。
- 前記ハロゲン化アルキルが、4−ヨード−N−フタロイルバリンメチルエステルである、請求項10に記載の方法。
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