JP5560351B1 - 理化学装置および画像処理方法 - Google Patents
理化学装置および画像処理方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5560351B1 JP5560351B1 JP2013004058A JP2013004058A JP5560351B1 JP 5560351 B1 JP5560351 B1 JP 5560351B1 JP 2013004058 A JP2013004058 A JP 2013004058A JP 2013004058 A JP2013004058 A JP 2013004058A JP 5560351 B1 JP5560351 B1 JP 5560351B1
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- image
- highlighting
- adopted
- objects
- image processing
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000003672 processing method Methods 0.000 title claims abstract description 24
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims abstract description 62
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 20
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims description 18
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 15
- 238000005054 agglomeration Methods 0.000 claims description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 claims description 2
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 claims 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 35
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 14
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 11
- 230000006870 function Effects 0.000 description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 6
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 5
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 229940000406 drug candidate Drugs 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000001678 irradiating effect Effects 0.000 description 1
- 239000004973 liquid crystal related substance Substances 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 238000012827 research and development Methods 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
- G06V20/698—Matching; Classification
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Image Processing (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Image Analysis (AREA)
Abstract
【解決手段】オン/オフ切替可能なボタンの操作により、採用とされたオブジェクトの強調表示の有無と、非採用とされたオブジェクトの強調表示の有無とを、個別独立に切り替える。これにより、採否に拘わらずオブジェクトを強調表示する状態、採用とされたオブジェクトのみを強調表示する状態、非採用とされたオブジェクトのみを強調表示する状態、および、採否に拘わらずオブジェクトを強調表示しない状態を、任意に切り替えることができる。ユーザは、これらの表示を切り替えながら、採否処理の結果が適正であるか否かを、容易に目視判断できる。
【選択図】図4
Description
図1は、画像取得装置1にセットされるウェルプレート9の一例を示す斜視図である。ウェルプレート9は、複数の窪部91を有する略板状の試料容器である。ウェルプレート9の材料には、例えば、光を透過する透明な樹脂が使用される。図1に示すように、複数の窪部91は、ウェルプレート9の上面に、規則的に配列されている。各窪部91内には、培養液92とともに、観察対象となる細胞93が保持される。また、各窪部91内の培養液92には、濃度や組成の異なる化合物が、それぞれ添加される。
<2−1.画像の切り出し〜ウインドウの表示>
図3は、画像取得装置1において、撮影画像データD1の取得後に実行される画像処理の流れを示したフローチャートである。図3の画像処理は、コンピュータ60が、入力デバイス50からの入力信号、オブジェクト抽出プログラムP1、採否処理プログラムP2、およびパラメータファイルF1を参照しながら、画像切り出し部62、オブジェクト抽出部63、採否処理部64、表示出力部65、および入力指示部66を動作させることにより、実行される。以下、図2と図3のフローチャートとを参照しつつ、当該画像処理の流れについて、説明する。
画像処理ウインドウ41が表示されると、画像取得装置1のユーザは、まず、入力デバイス50を操作して、画像処理ウインドウ41内のオブジェクト抽出ボタンB1を選択する。すると、オブジェクト抽出部63が、窪部画像データD2から複数のオブジェクト930を抽出する処理を行う(ステップS3)。
次に、画像取得装置1のユーザは、入力デバイス50を操作して、画像処理ウインドウ41内の採否処理ボタンB2を選択する。すると、採否処理部64が、窪部画像データD2に含まれる複数のオブジェクト930を、「採用」、「非採用」、または「採否対象外」の3つのカテゴリに分類する採否処理を行う(ステップS4)。本実施形態では、所定の条件に応じて、生存細胞と推定されるオブジェクト930aを「採用」とし、死亡細胞と推定されるオブジェクト930bを「非採用」とし、細胞以外の異物または気泡と推定されるオブジェクト930cを第3のカテゴリである「採否対象外」とする。
採否処理が完了すると、表示出力部65は、各オブジェクト930についての採否処理の結果を、画像処理ウインドウ41内の下段の画像表示領域A3に表示する(ステップS5)。画像表示領域A3では、窪部画像データD2内の一部または全部のオブジェクト930を、着色された輪郭により強調表示することができる。例えば、採否処理において「採用」とされたオブジェクト930aのみを、着色された輪郭により強調表示することができる。これにより、強調表示されたオブジェクト930と、強調表示されていないオブジェクト930とを、視覚的に区別することが可能となっている。
以上、本発明の一実施形態について説明したが、本発明は、上記の実施形態に限定されるものではない。
9 ウェルプレート
10 プレート保持部
20 投光部
30 撮像部
40 表示デバイス
41 画像処理ウインドウ
50 入力デバイス
60 コンピュータ
61 記憶部
62 画像切り出し部
63 オブジェクト抽出部
64 採否処理部
65 表示出力部
66 入力指示部
91 窪部
92 培養液
93 細胞
930 オブジェクト
A1〜A3 画像表示領域
A4 パラメータ設定部
B1 オブジェクト抽出ボタン
B2 採否処理ボタン
B3 全選択ボタン
B4 全解除ボタン
D1 撮影画像データ
D2 窪部画像データ
F1 パラメータファイル
P1 オブジェクト抽出プログラム
P2 採否処理プログラム
R1 第1許容範囲
R2 第2許容範囲
T1 第1トグルボタン
T2 第2トグルボタン
T3 第3トグルボタン
Claims (14)
- 細胞を撮影して得られた画像を処理する理化学装置であって、
前記画像から、複数のオブジェクトを抽出する抽出部と、
前記複数のオブジェクトを、所定の条件に応じて採用または非採用に分類する採否処理部と、
前記採否処理の結果を表示する表示部と、
を備え、
前記表示部は、
前記画像において採用とされたオブジェクトの強調表示の有無を切り替える第1切替部と、
前記画像において非採用とされたオブジェクトの強調表示の有無を切り替える第2切替部と、
を有し、
前記第1切替部および前記第2切替部は、互いに独立してオブジェクトの強調表示の有無を切り替える理化学装置。 - 請求項1に記載の理化学装置であって、
前記強調表示は、オブジェクトの輪郭に沿った閉曲線を、前記オブジェクトに重ねて表示する輪郭強調表示である理化学装置。 - 請求項1または請求項2に記載の理化学装置であって、
前記採否処理部は、前記複数のオブジェクトを、所定の条件に応じて、採用、非採用、または採否対象外に分類し、
前記表示部は、
前記画像において採否対象外とされたオブジェクトの強調表示の有無を切り替える第3切替部
をさらに有し、
前記第1切替部、前記第2切替部、および前記第3切替部が、互いに独立してオブジェクトの強調表示の有無を切り替える理化学装置。 - 請求項1から請求項3までのいずれかに記載の理化学装置であって、
前記表示部は、
前記画像において全てのオブジェクトを強調表示させる全選択部
をさらに有する理化学装置。 - 請求項1から請求項4までのいずれかに記載の理化学装置であって、
前記表示部は、
前記画像において全てのオブジェクトの強調表示を解除する全解除部
をさらに有する理化学装置。 - 請求項1から請求項5までのいずれかに記載の理化学装置であって、
前記画像は、複数の窪部を有する試料容器の各窪部の画像である理化学装置。 - 請求項1から請求項6までのいずれかに記載の理化学装置であって、
前記画像は、複数の細胞が立体的に集合した細胞集塊の画像である理化学装置。 - 細胞を撮影して得られた画像を処理する画像処理方法であって、
a)前記画像から、複数のオブジェクトを抽出する工程と、
b)前記複数のオブジェクトを、所定の条件に応じて採用または非採用に分類する工程と、
c)前記採否処理の結果を表示する工程と、
を備え、
前記工程c)では、オン/オフ切替可能なボタンの操作により、採用とされたオブジェクトの強調表示の有無と、非採用とされたオブジェクトの強調表示の有無とを、互いに独立して切り替える画像処理方法。 - 請求項8に記載の画像処理方法であって、
前記強調表示は、オブジェクトの輪郭に沿った閉曲線を、前記オブジェクトに重ねて表示する輪郭強調表示である画像処理方法。 - 請求項8または請求項9に記載の画像処理方法であって、
前記工程b)では、前記複数のオブジェクトを、所定の条件に応じて、採用、非採用、または採否対象外に分類し、
前記工程c)では、オン/オフ切替可能なボタンの操作により、採用とされたオブジェクトの強調表示の有無と、非採用とされたオブジェクトの強調表示の有無と、採否対象外とされたオブジェクトの強調表示の有無とを、互いに独立して切り替える画像処理方法。 - 請求項8から請求項10までのいずれかに記載の画像処理方法であって、
前記工程c)では、前記オン/オフ切替可能なボタンとは別の全選択ボタンを操作することにより、前記画像内の全てのオブジェクトを強調表示させる画像処理方法。 - 請求項8から請求項11までのいずれかに記載の画像処理方法であって、
前記工程c)では、前記オン/オフ切替可能なボタンとは別の全解除ボタンを操作することにより、前記画像内の全てのオブジェクトの強調表示を解除する画像処理方法。 - 請求項8から請求項12までのいずれかに記載の画像処理方法であって、
前記画像は、複数の窪部を有する試料容器の各窪部の画像である画像処理方法。 - 請求項8から請求項13までのいずれかに記載の画像処理方法であって、
前記画像は、複数の細胞が立体的に集合した細胞集塊の画像である画像処理方法。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013004058A JP5560351B1 (ja) | 2013-01-11 | 2013-01-11 | 理化学装置および画像処理方法 |
US14/150,338 US9292730B2 (en) | 2013-01-11 | 2014-01-08 | Apparatus for physics and chemistry and method of processing image |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013004058A JP5560351B1 (ja) | 2013-01-11 | 2013-01-11 | 理化学装置および画像処理方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP5560351B1 true JP5560351B1 (ja) | 2014-07-23 |
JP2014134524A JP2014134524A (ja) | 2014-07-24 |
Family
ID=51165170
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013004058A Active JP5560351B1 (ja) | 2013-01-11 | 2013-01-11 | 理化学装置および画像処理方法 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9292730B2 (ja) |
JP (1) | JP5560351B1 (ja) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5698208B2 (ja) * | 2012-11-30 | 2015-04-08 | 株式会社Screenホールディングス | 画像処理装置、画像処理方法、および画像処理プログラム |
JP2017009314A (ja) * | 2015-06-17 | 2017-01-12 | 株式会社Screenホールディングス | 教示データの作成支援方法、作成支援装置、プログラムおよびプログラム記録媒体 |
WO2018061131A1 (ja) * | 2016-09-28 | 2018-04-05 | オリンパス株式会社 | 細胞状態計測装置 |
EP3520004A2 (en) * | 2016-09-30 | 2019-08-07 | GE Healthcare Bio-Sciences Corp. | Computer device for detecting an optimal candidate compound and methods thereof |
Family Cites Families (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS5544914A (en) * | 1978-09-25 | 1980-03-29 | Omron Tateisi Electronics Co | Automatic blood corpuscle sorting apparatus |
JP3209673B2 (ja) | 1995-11-20 | 2001-09-17 | メディカテック株式会社 | 臨床検査における反応済検体の粒子凝集パターンの検査方法 |
US5790691A (en) * | 1996-03-12 | 1998-08-04 | The Regents Of The University Of Colorado | Method and apparatus for robust shape detection using a hit/miss transform |
JPH1183848A (ja) | 1997-09-09 | 1999-03-26 | Omron Corp | 検査装置 |
US6151426A (en) * | 1998-10-01 | 2000-11-21 | Hewlett-Packard Company | Click and select user interface for document scanning |
US6617111B2 (en) * | 2001-05-10 | 2003-09-09 | Invitrogen Corporation | Method for measuring unit activity of an enzyme |
JP3941668B2 (ja) * | 2002-11-11 | 2007-07-04 | 松下電器産業株式会社 | 細胞の観察方法 |
WO2004099773A1 (en) * | 2003-04-30 | 2004-11-18 | Pfizer Products Inc. | Automated in vitro cellular imaging assays for micronuclei and other target objects |
US7636465B2 (en) * | 2005-12-09 | 2009-12-22 | Cytyc Corporation | Cross-frame object reconstruction for image-based cytology applications |
US8244021B2 (en) * | 2006-12-20 | 2012-08-14 | Ventana Medical Systems, Inc. | Quantitative, multispectral image analysis of tissue specimens stained with quantum dots |
JP5438962B2 (ja) | 2008-12-25 | 2014-03-12 | シスメックス株式会社 | 細胞画像表示装置 |
US9002077B2 (en) * | 2009-08-10 | 2015-04-07 | Cambridge Research & Instrumentation, Inc. | Visualization of stained samples |
JP5550292B2 (ja) | 2009-09-17 | 2014-07-16 | シスメックス株式会社 | 細胞画像表示装置 |
JP5442542B2 (ja) * | 2010-06-25 | 2014-03-12 | 大日本スクリーン製造株式会社 | 病理診断支援装置、病理診断支援方法、病理診断支援のための制御プログラムおよび該制御プログラムを記録した記録媒体 |
JP5693101B2 (ja) * | 2010-08-30 | 2015-04-01 | キヤノン株式会社 | 画像処理装置及び画像処理方法 |
-
2013
- 2013-01-11 JP JP2013004058A patent/JP5560351B1/ja active Active
-
2014
- 2014-01-08 US US14/150,338 patent/US9292730B2/en active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20140198966A1 (en) | 2014-07-17 |
US9292730B2 (en) | 2016-03-22 |
JP2014134524A (ja) | 2014-07-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2021515240A (ja) | 定量的バイオマーカデータのオーバレイを有する病理学用拡張現実顕微鏡 | |
JP5560351B1 (ja) | 理化学装置および画像処理方法 | |
JP2019510963A (ja) | マルチビューの特徴付けのための方法及び装置 | |
KR20070104520A (ko) | 3-d 생체내 이미징을 위한 그래픽 사용자 인터페이스 | |
US8649580B2 (en) | Image processing method, image processing apparatus, and computer-readable recording medium storing image processing program | |
WO2010143420A1 (ja) | 細胞塊の状態判別手法、この手法を用いた画像処理プログラム及び画像処理装置、並びに細胞塊の製造方法 | |
WO2010146802A1 (ja) | 細胞塊の状態判別手法、この手法を用いた画像処理プログラム及び画像処理装置、並びに細胞塊の製造方法 | |
CN115511866B (zh) | 用于多维数据的图像分析的系统和方法 | |
CN109844606A (zh) | 试样观察装置及试样观察方法 | |
KR101969602B1 (ko) | 3d 데이터 해석 장치, 3d 데이터 해석 방법 및 기록 매체 | |
Martins et al. | R2OBBIE-3D, a fast robotic high-resolution system for quantitative phenotyping of surface geometry and colour-texture | |
Bueno et al. | An automated system for whole microscopic image acquisition and analysis | |
JP7006832B2 (ja) | 細胞解析装置 | |
JP5771635B2 (ja) | キャリブレーション方法 | |
CN110998330B (zh) | 用于分析荧光免疫斑点测定的方法和系统 | |
JP5698208B2 (ja) | 画像処理装置、画像処理方法、および画像処理プログラム | |
EP3521750B1 (en) | Captured image evaluation device, method, and program | |
CN111902761A (zh) | 试样观察装置和试样观察方法 | |
JP2020056832A (ja) | 顕微鏡システムの制御方法、顕微鏡システム、プログラム、記録媒体 | |
US20200074628A1 (en) | Image processing apparatus, imaging system, image processing method and computer readable recoding medium | |
JP5691452B2 (ja) | 3dデータ解析装置および3dデータ解析方法ならびに3dデータ解析プログラム | |
JP2012198139A (ja) | 画像処理プログラム、画像処理装置、計測解析装置及び画像処理方法 | |
Matula et al. | Acquiarium: free software for the acquisition and analysis of 3D images of cells in fluorescence microscopy | |
Halavatyi et al. | FRAP and other photoperturbation techniques | |
JP5972715B2 (ja) | 画像切り出し方法および画像取得装置 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20140426 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20140520 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140609 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5560351 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S533 | Written request for registration of change of name |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313533 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |