JP5371743B2 - ヒトパピローマウイルスを処置するためのポリアミド類 - Google Patents

Description

優先権主張
本出願は、米国仮特許出願第60/797426号(2006年5月4日出願)、およびＰＣＴ出願第PCT/US 07/06133号(2007年3月9日出願)(それぞれは、言及することによって、その全体が本明細書に組み込まれる)の利益を主張している。

本発明の技術分野
本発明は、ヒトパピローマウイルス(ＨＰＶ)に感染した細胞を処置するための、ポリアミド組成物および治療に関する。

本発明の背景
ヒトパピローマウイルスは、小さい二重鎖ＤＮＡウイルスであり、皮膚、口および生殖器の粘膜などの種々の重層上皮にコロニーを形成し、パピローマ(疣贅)またはコンジロームとして知られる自己寛解型(self-limiting)良性腫瘍の形成を誘発する。これらの良性腫瘍の大部分は、宿主の免疫防御の作用により、ひとりでに消失する。しかしながら、ＨＰＶには、発癌の可能性を有し、特定のタイプの癌に関連するものがある。Lorincz et al., Obstetrics & Gynecology, 79:328-337 (1992); Beaudenon et al., Nature, 321:246-249 (1986); および Holloway et al., Gynecol. Onc., 41:123-128 (1991) を参照のこと。

ＨＰＶは、最も流行性の性行為感染ウイルスである。３５種以上のＨＰＶ遺伝子型が性行為感染することが知られており、比較的少数の遺伝子型が、大部分の肛門生殖器感染の原因である。これらの最も一般的なＨＰＶのタイプのうち、２種で発癌のリスクが高く(ＨＰＶ１６およびＨＰＶ１８)、２種で大部分の生殖器の疣贅を引き起こす(ＨＰＶ６およびＨＰＶ１１)。

米国では、毎年推定５,５００万人がＨＰＶに感染し、また推定２０００万人の米国人が現在感染している (Cates and et al., Lancet, 354, Suppl. SIV62, 1999)。男性および女性の生殖年齢人口の約７５％が性行為感染ＨＰＶに感染しているが、主な公衆衛生上のリスクは、女性に対して、子宮頸癌について存在する (Koutsky, Am. J. Med., 102(5A), 3-8, 1997)。従って、米国のみでも毎年数百万人が処置を必要とする。ＰＡＰ塗抹検査が世界中で最も多い公衆衛生スクリーニングプログラムであり、該検査が本質的にＨＰＶ感染の検査であることに留意することが重要である。ＰＡＰ塗抹検査ポジティブを管理するための現行の標準は、“経過観察”である。一般的に、子宮頸部異形成の進行期が観察されない限り処置しないことが推奨されている (CDC Sexually Transmitted Diseases Treatment Guidelines, 2002)。

ＨＰＶポジティブの患者において、有効なＨＰＶ抗ウイルス剤が大いに必要である。現在、ＨＰＶまたは疣贅に特異的な処置は存在しない。Aldara(商標)(イミキモド)は、生殖器外部の疣贅を処置するのに用いられる非特異的免疫調節剤であり、これは、市販されているもので最も成功している処置である。有効で特異的なＨＰＶ処置は、イミキモドより有意に改善された、またそれと有効に競合し得る可能性を有する。

ヒトの子宮頸癌の大多数(９５％)が、ＨＰＶ ＤＮＡを含有し、発現し、そして、２種のウイルス性腫瘍性タンパク質Ｅ６およびＥ７の発現が、細胞の癌化および癌化状態の維持に不可欠のようである。特に、４種のＨＰＶ(ＨＰＶ−１６、ＨＰＶ−１８、ＨＰＶ−３１およびＨＰＶ−４５)は、米国において、子宮頸癌の原因の７５〜９３％に関係している。ことによると、全世界の女性における癌による死亡全体の２０％が、ＨＰＶに関連した癌に由来すると推定されている。

一般的に言えば、ＨＰＶは、そのＤＮＡ配列の独自性に基づいたタイプにグループ化される。

ＨＰＶ類は、さらに、癌に関係する臨床学的病変、および該病変の癌への進行についての相対的な傾向に基づいて、リスクが高いものと低いものの何れかに分類され得る。低リスクのタイプ、例えばＨＰＶのＨＰＶ−１、ＨＰＶ−２、ＨＰＶ−３、ＨＰＶ−４、ＨＰＶ−５、ＨＰＶ−７、ＨＰＶ−８、およびＨＰＶ−９は、尋常性疣贅(common wart, verrucae plantaris), 足底疣贅(plantar warts, verrucae plantaris)、モザイク疣贅(mosaic wart)、扁平疣贅(flat wart, verrucae plane)、およびブッチャー疣贅(butcher wart)を引き起こす。さらに、ＨＰＶのＨＰＶ−６およびＨＰＶ−１１は、生殖器外部、肛門および子宮頸の疣贅を引き起こす。リスクの高いタイプ、例えばＨＰＶ−１６、ＨＰＶ−１８、ＨＰＶ−３１、ＨＰＶ−３３およびＨＰＶ４５は、特に、上皮内の癌腫、腫瘍および癌において一般的である。特に、２種のＨＰＶ、すなわちＨＰＶ−１６およびＨＰＶ−１８のゲノムは、子宮頸の浸潤性癌腫の約７０に関連することが分かっている。

ＨＰＶ感染における現行の処置は、非常に限定されている。対応は、通常、感染した組織の外科的除去、冷凍外科的除去、またはレーザー除去による、疣贅の物理的な破壊を含む。レーザー除去および手術などのこれらの現行の処置の幾つかは、高価であり、処置すべき領域を麻痺させるための麻酔の使用が必要である。冷凍外科的除去は、特別な装置の使用が必要である。さらに、大部分の患者が、処置中および処置後に中程度の疼痛を経験する。

局所のクリーム剤および溶液剤、例えば５−フルオロウラシル、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスおよびポドフィルムの製剤もまた使用されている (Reichman in Harrison's 7 Principles of Internal Medicine, 13th Ed. (Isselbacher et al., eds.); McGraw-Hill, Inc., NY (1993) pp. 801-803)。しかしながら、これらの処置後、通常、再発があり、これはウイルスが皮膚細胞中に潜伏しているという事実によるものである可能性が最も高い。従って、続いて反復した処置が必要であるが、これは健康な組織を損なうかもしれない。これらの処置は子宮頸感染の処置には利用できないか、または承認されていない。

インターフェロンは、従来、ＨＰＶのための最も有効な処置であったが、その効果は限定されている (Chang et al. (2002) Journal of Virology 76: 8864-74, ＨＰＶゲノムに感染した細胞にはほんの数回適用後にインターフェロン処置に耐性となるものが見出されている)。Cowsert (1994) Intervirol. 37:226-230; Bornstein et al. (1993) Obstetrics Gynecol. Sur. 4504:252-260; Browder et al. (1992) Ann. Pharmacother. 26:42-45 もまた参照のこと。

幾つかの本明細書に記載した疾患および状態を処置する治療に対する要請がある。

本発明の概要
本発明は、ポリアミド類、ポリアミド組成物、およびＨＰＶ感染細胞を処置する方法を提供する。幾つかの態様において、該ポリアミド抗ウイルス剤は、喉頭乳頭腫、子宮頸部異形成、子宮頸癌および再発性呼吸器乳頭腫(ＲＲＰ)の処置に非常に適切である。

幾つかの態様において、本発明は、式：
Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
[式中、
ｍ＋３は、少なくとも１１であり；
ｎ＝ｍ−ｏ；
ｏは、０、１または２であり；
Ｚは、Ｑ−Ｃ(Ｏ)−であり；
Ｑは、Ｈ、非置換脂肪族、ハロ−脂肪族、所望により１または２個のアミン基で置換されているＣ_１−４脂肪族、または、所望により脂肪族またはハロ−脂肪族で置換されているヘテロアリールであってもよく；
Ｘは、それぞれ、独立して、β−アラニン (式III)、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)、Ｃ_１−６脂肪族アミノ酸、天然α−アミノ酸、式X1、式X2、式X3、式X4、式X5、式X6、式X7、または式X8 (表１参照)であってもよく；
γ^ｑは、γ−アミノ酪酸 (式IV)、(Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸 (式VI)、(Ｓ)−２,４−ジアミノ酪酸、式γ1、式γ2、式γ3、式γ4、式IX：
{式中、Ｒ_１は、それぞれ、−Ｃ(Ｏ)−Ｒ_１Ａであってもよく；
Ｒ_１Ａは、それぞれ、Ｈ、非置換脂肪族またはハロ−脂肪族であってもよい}
であってもよく；
Ｙは、それぞれ、β−アラニン (式III)、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)、式X7、Ｃ_１−６脂肪族アミノ酸、または天然α−アミノ酸であってもよく；
Ａは、式A1、式A2、式A3、式A4、式A5、式A6、式A7、式A8、式A9、式A10、式A11、または
{式中、Ｒ_２は、それぞれ独立して、Ｃ_１−５脂肪族である。}であってもよい。]
の化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。

一つの態様において、Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ中の４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)ユニットの総数が０.１０(ｍ＋ｎ＋２)未満である。

別の態様において、Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ中の全てのβ−アラニン (式III)ユニットが、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)の少なくとも３個の連続ユニット、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)の少なくとも３個の連続ユニット、あるいは、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)と４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)の何れかの組み合わせの少なくとも３個の連続ユニットに隣接している。

別の態様において、該化合物は、式：
Ｚ−(Ｐ)_３−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｐ)−(β)−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
[式中、ｍ＋３は、少なくとも９であり；
他の置換基は、上記の通りである。]
を有するか、またはその薬学的に許容される塩である。

別の態様において、該化合物は、式：
Ｚ−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
[式中、ｍ＋３は、少なくとも７または少なくとも８であり；
他の置換基は上記の通りである。]
を有するか、またはその薬学的に許容される塩である。

上記の態様のうちの一つの態様において、Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ中の４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)ユニットの総数は、０.１０(ｍ＋ｎ＋２)未満である。

別の態様において、Ｑは、Ｈ、所望により１から３個のハロで置換されている(Ｃ_１−４)脂肪族、または、所望により置換されている単環式ヘテロアリールから選択される。Ｑはまた、所望により置換されているイミダゾール、Ｎ−メチルイミダゾール、ＣＦ_３−、Ｈ、所望により１または２個のアミン基で置換されているＣ_１−４脂肪族であってもよい。Ｑは、単環式または二環式ヘテロアリール、所望により脂肪族またはハロ−脂肪族で置換されている。

上記の態様のうちの別の態様において、Ｚは、式Z1〜17、
であってもよく、幾つかの態様において、Ｒ_２はＣ_１−３脂肪族である。

別の態様において、Ａは、式A1〜A11であってもよい。

別の態様において、本発明は、式：
−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−
[式中、ｍ＋３は、少なくとも１１であり；
他の置換基は上で定義した通りである。]
を含む化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。

別の態様において、本発明は、式：
−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−
[式中、ｍ＋３は、少なくとも７であり；
他の置換基は上で記載した通りである。]
を含む化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。

該態様を他の観点から見れば、γ^ｑは(Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸 (式VI)であり、別の態様において、γ^ｑはγ−アミノ酪酸 (式IV)である。

該態様のうちの別の態様において、ｍは８と１１の間の整数であり、ｎは６と１０の間の整数である。

該態様のうちのさらに別の態様において、Ｙはβ−アラニンである。

また、該態様のうちの別の態様において、ｍは２５以下である。

別の態様において、本化合物は、
であってもよい。

別の態様において、本発明は、治療有効量の上記の化合物および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を提供する。

該態様のうちの一つの態様において、本組成物は、さらに抗ウイルス剤を含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスまたはポドフィルムであってもよい。

また、別の態様において、本発明は、ＨＰＶ感染細胞を処置する方法であって、該細胞を上記の化合物と接触させることを含む方法を提供する。本発明の一つの態様において、本方法は、さらに、該細胞を抗ウイルス剤と接触させることを含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスまたはポドフィルムであってもよい。

さらに別の態様において、本発明は、患者または対象において、ＨＰＶ感染細胞を処置する方法であって、患者または対象に、本明細書で記載した化合物または医薬組成物を投与することを含む方法を提供する。本発明の一つの態様において、該方法は、さらに、該細胞を抗ウイルス剤と接触させることを含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスまたはポドフィルムであってもよい。別の態様において、ＨＰＶは、ＨＰＶ１１、ＨＰＶ１６、ＨＰＶ１８、ＨＰＶ１、またはＨＰＶ６であってもよい。

別の態様において、本発明は、ＨＰＶ１６感染細胞を処置する方法であって、患者に上記の化合物を投与することを含む方法を提供する。

さらに別の態様において、本発明は、ＨＰＶ１６感染細胞を処置する方法であって、患者に、式：
Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
[式中、ｍ＋３は、少なくとも１０であり；
他の置換基は、上で記載した通りである。]
の化合物またはその薬学的に許容される塩を投与することを含む方法を提供する。

別の態様において、本発明は、患者に、
から選択される化合物を投与することによって、ＨＰＶ１６感染細胞を処置する方法を提供する。

該態様を他の観点から見れば、該方法は、さらに、抗ウイルス剤を投与するこを含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスまたはポドフィルムであってもよい。

本発明のポリアミド類は、ＨＰＶ関連疾患の処置において、ＨＰＶに対してシドホビルまたはインターフェロンの力価よりも優れたin vitro力価を示す。これらの疾患は、生殖器または皮膚の疣贅、口内組織または子宮頸上皮を含む生殖器組織のＨＰＶ感染、肛門の癌、ＨＰＶによって引き起こされる腫瘍病変または過剰増殖病変、結膜乳頭腫、尖圭コンジローマおよび再発性呼吸器乳頭腫(ＲＲＰ)を含み得る。

図面の簡単な説明
図１は、ＨＰＶ１６複製数に対するシドホビル(cidafovir)およびＩＦＮγの効果を、２種のポリアミドと比較している。

図２Ａは、ポリアミドのＩＣ_５０値を決定するためのＱ−ＰＣＲの結果の代表的なグラフを示す。図２Ｂは、ポリアミドで処理した細胞中のＨＰＶ１６ ＤＮＡ複製数における投与量依存性減少、およびポリアミドの細胞生存率に対する効果を示す。

図３は、ＨＰＶ１６エピソームに対するポリアミド類の投与量依存性の効果を示したグラフを示す。

図４は、ポリアミドによるＨＰＶ ＤＮＡクリアランスのサザン・ブロットを示す。

図５は、ＨＰＶ１６複製数に対する濃度変化させたポリアミド 1037の力価と、ジスタマイシンＡおよびシドホビルの力価を比較し、またそれぞれの細胞生存率に対する対応する効果を比較する。

図６は、例示的ポリアミドの化学構造を示す。

図７は、ＨＰＶ１６エピソームへの、ケラチン生成細胞からポリアミドを離脱した効果を示す。

図８は、異なるポリアミド結合モチーフの図である。

本発明の詳細な説明
I. 定義
本明細書で用いるとき、特記しない限り、下記の定義を適用する。

本発明の目的において、化学元素は、the Elements, CAS version, Handbook of Chemistry and Physics, 75^th Edの周期表に従って識別される。さらに、有機化学の一般的原理は、“Organic Chemistry”, Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 1999、および“March's Advanced Organic Chemistry”, 5th Ed., Ed.: Smith, M.B. and March, J., John Wiley & Sons, New York: 2001 に記載されている。

本明細書で用いるとき、用語“脂肪族”は、用語アルキル、アルケニル、アルキニルを包含し、それぞれは、下に示した通り所望により置換されている。

本明細書で用いるとき、“アルキル”基は、１〜８個(例えば１〜６個または１〜４個)の炭素原子を含む飽和脂肪族炭化水素基を言う。アルキル基は、直鎖であっても分枝鎖であってもよい。アルキル基の例は、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ｎ−ペンチル、ｎ−ヘプチルまたは２−エチルヘキシルを含み、これらに限定されない。アルキル基は、１個以上の置換基、例えばハロ；シクロアリファチック(cycloaliphatic) [例えば、シクロアルキルまたはシクロアルケニル]；ヘテロシクロアリファチック [例えば、ヘテロシクロアルキルまたはヘテロシクロアルケニル]；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アシル [例えば、(脂肪族)カルボニル、(シクロアリファチック)カルボニル、または(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル]；ニトロ；シアノ；アミド [例えば、(シクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキル)カルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノ、ヘテロアラルキルカルボニルアミノ アルキルアミノカルボニル、シクロアルキルアミノカルボニル、ヘテロシクロアルキルアミノカルボニル、アリールアミノカルボニル、またはヘテロアリールアミノカルボニル]；アミノ [例えば、脂肪族アミノ、シクロアリファチックアミノ、またはヘテロシクロアリファチックアミノ]；スルホニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)_２−]；スルフィニル；スルファニル；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；オキソ；カルボキシ；カルバモイル；シクロアリファチックオキシ；ヘテロシクロアリファチックオキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ヘテロアリールアルコキシ；アルコキシカルボニル；アルキルカルボニルオキシ；またはヒドロキシで置換され得る(すなわち、所望により置換され得る)。置換アルキルの幾つかの例は、カルボキシアルキル (例えばＨＯＯＣ−アルキル、アルコキシカルボニルアルキル、およびアルキルカルボニルオキシアルキル)；シアノアルキル；ヒドロキシアルキル；アルコキシアルキル；アシルアルキル；アラルキル；(アルコキシアリール)アルキル；(スルホニルアミノ)アルキル (例えばアルキル−Ｓ(Ｏ)_２−アミノアルキル)；アミノアルキル；アミドアルキル；(シクロアリファチック)アルキル；またはハロアルキルを含み、これらに限定されない。

本明細書で用いるとき、ハロ−脂肪族基は、１〜３個のハロ原子で置換された脂肪族基を言い、ここで脂肪族およびハロは、本明細書で定義されている。置換は、化学的に可能な炭素原子の全てで起こり得る。

本明細書で用いるとき、“アルケニル”基は、２〜８個(例えば２〜６個または２〜４個)の炭素原子を含み、かつ少なくとも１個の二重結合を含む脂肪族炭素基を言う。アルキル基と同様に、アルケニル基は、直鎖であっても分子鎖であってもよい。アルケニル基の例は、アリル、イソプレニル、２−ブテニルおよび２−ヘキセニルを含み、これらに限定されない。アルケニル基は、所望により、１個以上の置換基、例えばハロ；シクロアリファチック [例えば、シクロアルキルまたはシクロアルケニル]；ヘテロシクロアリファチック [例えば、ヘテロシクロアルキルまたはヘテロシクロアルケニル]；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アシル [例えば、(脂肪族)カルボニル、(シクロアリファチック)カルボニル、または(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル]；ニトロ；シアノ；アミド [例えば、(シクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキル)カルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノ、ヘテロアラルキルカルボニルアミノ、アルキルアミノカルボニル、シクロアルキルアミノカルボニル、ヘテロシクロアルキルアミノカルボニル、アリールアミノカルボニル、またはヘテロアリールアミノカルボニル]；アミノ [例えば、脂肪族アミノ、シクロアリファチックアミノ、ヘテロシクロアリファチックアミノ、または脂肪族スルホニルアミノ]；スルホニル [例えば、アルキル−Ｓ(Ｏ)_２−、シクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)_２−、またはアリール−Ｓ(Ｏ)_２−]；スルフィニル；スルファニル；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；オキソ；カルボキシ；カルバモイル；シクロアリファチックオキシ；ヘテロシクロアリファチックオキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ヘテロアラルコキシ；アルコキシカルボニル；アルキルカルボニルオキシ；またはヒドロキシで置換され得る。置換されたアルケニルの幾つかの例は、シアノアルケニル、アルコキシアルケニル、アシルアルケニル、ヒドロキシアルケニル、アラルケニル、(アルコキシアリール)アルケニル、(スルホニルアミノ)アルケニル (例えば(アルキル−Ｓ(Ｏ)_２−アミノアルケニル)、アミノアルケニル、アミドアルケニル、(シクロアリファチック)アルケニル、またはハロアルケニルを含み、これらに限定されない。

本明細書で用いるとき、“アルキニル”基は、２〜８個(例えば２〜６個または２〜４個)の炭素原子を含み、かつ少なくとも１個の三重結合を有する脂肪族炭素基を言う。アルキニル基は、直鎖であっても分枝鎖であってもよい。アルキニル基の例は、プロパルギルおよびブチニルを含み、これらに限定されない。アルキニル基は、所望により、１個以上の置換基、例えばアロイル；ヘテロアロイル；アルコキシ；シクロアルキルオキシ；ヘテロシクロアルキルオキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ニトロ；カルボキシ；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；スルホ；メルカプト；スルファニル [例えば、脂肪族−Ｓ−またはシクロアリファチック−Ｓ−]；スルフィニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)−またはシクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)−]；スルホニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)_２−、脂肪族アミノ−Ｓ(Ｏ)_２−、またはシクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)_２−]；アミド [例えば、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、アルキルカルボニルアミノ、シクロアルキルアミノカルボニル、ヘテロシクロアルキルアミノカルボニル、シクロアルキルカルボニルアミノ、アリールアミノカルボニル、アリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキル)カルボニルアミノ、(シクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、ヘテロアラルキルカルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノまたはヘテロアリールアミノカルボニル]；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；アルコキシカルボニル；アルキルカルボニルオキシ；シクロアリファチック；ヘテロシクロアリファチック；アリール；ヘテロアリール；アシル [例えば、(シクロアリファチック)カルボニルまたは(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル]；アミノ [例えば、脂肪族アミノ]；スルホキシ；オキソ；カルバモイル；(シクロアリファチック)オキシ；(ヘテロシクロアリファチック)オキシ；または(ヘテロアリール)アルコキシで置換され得る。

本明細書で用いるとき、“アミド”は、“アミノカルボニル”および“カルボニルアミノ”の双方を包含する。単独でまたは他の基と連結して用いたとき、これらの用語はアミド基、例えば末端で用いたときは−Ｎ(Ｒ^Ｘ)−Ｃ(Ｏ)−Ｒ^Ｙまたは−Ｃ(Ｏ)−Ｎ(Ｒ^Ｘ)_２を言い、そして、内部で用いたときは−Ｃ(Ｏ)−Ｎ(Ｒ^Ｘ)−または−Ｎ(Ｒ^Ｘ)−Ｃ(Ｏ)−を言う。ここで、Ｒ^ＸおよびＲ^Ｙは下で定義されている。アミド基の例は、アルキルアミド (例えばアルキルカルボニルアミノまたはアルキルアミノカルボニル)、(ヘテロシクロアリファチック)アミド、(ヘテロアラルキル)アミド、(ヘテロアリール)アミド、(ヘテロシクロアルキル)アルキルアミド、アリールアミド、アラルキルアミド、(シクロアルキル)アルキルアミドまたはシクロアルキルアミドを含む。

本明細書で用いるとき、“アミノ”基は、−ＮＲ^ＸＲ^Ｙを言い、ここで、Ｒ^ＸおよびＲ^Ｙは、それぞれ独立して、水素、アルキル、シクロアリファチック、(シクロアリファチック)脂肪族、アリール、アラリファチック(araliphatic)、ヘテロシクロアリファチック、(ヘテロシクロアリファチック)脂肪族、ヘテロアリール、カルボキシ、スルファニル、スルフィニル、スルホニル、(脂肪族)カルボニル、(シクロアリファチック)カルボニル、((シクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、アリールカルボニル、(アラリファチック)カルボニル、(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル、((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、(ヘテロアリール)カルボニル、または(ヘテロアラリファチック)カルボニルであり、該基はそれぞれ本明細書で定義されており、所望により置換されている。アミノ基の例は、アルキルアミノ、ジアルキルアミノまたはアリールアミノを含む。用語“アミノ”が末端の基ではないとき(例えばアルキルカルボニルアミノ)、それは−ＮＲ^Ｘ−によって表される。Ｒ^Ｘは、上で定義した意味と同一の意味を有する。

本明細書で用いるとき、単独で、あるいは、“アラルキル”、“アラルコキシ”または“アリールオキシアルキル”などのより大きい部分の一部として用いる“アリール”基は、単環式(例えばフェニル)；二環式(例えばインデニル、ナフタレニル、テトラヒドロナフチル、テトラヒドロインデニル)；および三環式(例えばフルオレニル、テトラヒドロフルオレニル、またはテトラヒドロアントラセニル、アントラセニル)の環系を言い、ここで、単環式環系は芳香族性であり、あるいは、二環式または三環式環系の少なくとも１個の環は芳香族性である。該二環式および三環式基は、ベンゾ縮合した二〜三環式炭素環式環を含む。例えば、ベンゾ縮合基は、２個以上のＣ_４−８炭素環部分と縮合したフェニルを含む。アリールは、所望により、脂肪族 [例えば、アルキル、アルケニル、またはアルキニル]；シクロアリファチック；(シクロアリファチック)脂肪族；ヘテロシクロアリファチック；(ヘテロシクロアリファチック)脂肪族；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；(シクロアリファチック)オキシ；(ヘテロシクロアリファチック)オキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；(アラリファチック)オキシ；(ヘテロアラリファチック)オキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アミノ；オキソ (ベンゾ縮合二環式または三環式アリールの非芳香族性炭素環上で)；ニトロ；カルボキシ；アミド；アシル [例えば、脂肪族カルボニル、(シクロアリファチック)カルボニル、((シクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、(アラリファチック)カルボニル、(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル、((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、または(ヘテロアラリファチック)カルボニル]；スルホニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)_２−またはアミノ−Ｓ(Ｏ)_２−]；スルフィニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)−またはシクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)−]；スルファニル [例えば、脂肪族−Ｓ−]；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；メルカプト；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；またはカルバモイルを含む１個以上の置換基で置換されている。あるいは、アリールは非置換であってもよい。

置換アリールの非限定的な例は、ハロアリール [例えば、モノ−、ジ−(例えばｐ,ｍ−ジハロアリール)、および、(トリハロ)アリール]；(カルボキシ)アリール [例えば、(アルコキシカルボニル)アリール、((アラルキル)カルボニルオキシ)アリール、および(アルコキシカルボニル)アリール]；(アミド)アリール [例えば、(アミノカルボニル)アリール、(((アルキルアミノ)アルキル)アミノカルボニル)アリール、(アルキルカルボニル)アミノアリール、(アリールアミノカルボニル)アリール、および、(((ヘテロアリール)アミノ)カルボニル)アリール]；アミノアリール [例えば、((アルキルスルホニル)アミノ)アリールまたは((ジアルキル)アミノ)アリール]；(シアノアルキル)アリール；(アルコキシ)アリール；(スルファモイル)アリール [例えば、(アミノスルホニル)アリール]；(アルキルスルホニル)アリール；(シアノ)アリール；(ヒドロキシアルキル)アリール；((アルコキシ)アルキル)アリール；(ヒドロキシ)アリール、((カルボキシ)アルキル)アリール；(((ジアルキル)アミノ)アルキル)アリール；(ニトロアルキル)アリール；(((アルキルスルホニル)アミノ)アルキル)アリール；((ヘテロシクロアリファチック)カルボニル)アリール；((アルキルスルホニル)アルキル)アリール；(シアノアルキル)アリール；(ヒドロキシアルキル)アリール；(アルキルカルボニル)アリール；アルキルアリール；(トリハロアルキル)アリール；ｐ−アミノ−ｍ−アルコキシカルボニルアリール；ｐ−アミノ−ｍ−シアノアリール；ｐ−ハロ−ｍ−アミノアリール；または(ｍ−(ヘテロシクロアリファチック)−ｏ−(アルキル))アリールを含む。

本明細書で用いるとき、“アラリファチック”、例えば“アラルキル”基は、アリール基で置換されている脂肪族基(例えばＣ_１−４アルキル基)を言う。“脂肪族”、“アルキル”および“アリール”は、本明細書で定義されている。アラリファチック、例えばアラルキル基の例は、ベンジルである。

本明細書で用いるとき、“アラルキル”基は、アリール基で置換されているアルキル基(例えばＣ_１−４アルキル基)を言う。“アルキル”および“アリール”は両方とも上で定義されている。アラルキル基の例はベンジルである。アラルキルは、所望により、１個以上の置換基、例えば脂肪族 [例えば、アルキル、アルケニル、またはアルキニル (カルボキシアルキル、ヒドロキシアルキル、またはハロアルキル、例えばトリフルオロメチルを含む)]；シクロアリファチック [例えば、シクロアルキルまたはシクロアルケニル]；(シクロアルキル)アルキル；ヘテロシクロアルキル；(ヘテロシクロアルキル)アルキル；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；シクロアルキルオキシ；ヘテロシクロアルキルオキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ヘテロアラルキルオキシ；アロイル；ヘテロアロイル；ニトロ；カルボキシ；アルコキシカルボニル；アルキルカルボニルオキシ；アミド [例えば、アミノカルボニル、アルキルカルボニルアミノ、シクロアルキルカルボニルアミノ、(シクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキル)カルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノ、またはヘテロアラルキルカルボニルアミノ]；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；アシル；メルカプト；アルキルスルファニル；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；オキソ；またはカルバモイルで置換されている。

本明細書で用いるとき、“二環式環系”は、２個の環を形成した８〜１２員(例えば、９員、１０員または１１員)の構造を含み、該２個の環は、少なくとも１個の共有原子(例えば２個の共有原子)を有する。二環式環系は、ビシクロアリファチック(例えばビシクロアルキルまたはビシクロアルケニル)、ビシクロヘテロアリファチック、二環式アリール、および二環式ヘテロアリールを含む。

本明細書で用いるとき、“シクロアリファチック”基(脂環式基)は、“シクロアルキル”基および“シクロアルケニル”基を包含し、それぞれは、所望により下で示した通り置換されている。

本明細書で用いるとき、“シクロアルキル”基は、３〜１０個(例えば５〜１０個)の炭素原子を有する飽和炭素環式単環または二環式環(縮合したまたは架橋した)を言う。シクロアルキル基の例は、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、アダマンチル、ノルボルニル、キュビル、オクタヒドロ−インデニル、デカヒドロ−ナフチル、ビシクロ[３.２.１]オクチル、ビシクロ[２.２.２]オクチル、ビシクロ[３.３.１]ノニル、ビシクロ[３.３.２.]デシル、ビシクロ[２.２.２]オクチル、アダマンチル、アザシクロアルキル、または((アミノカルボニル)シクロアルキル)シクロアルキルを含む。“シクロアルケニル”基は、本明細書で用いるとき、３〜１０個(例えば４〜８個)の炭素原子を有し、かつ１個以上の二重結合を有する非芳香族性炭素環式環を言う。シクロアルケニル基の例は、シクロペンテニル、１,４−シクロヘキサ−ジ−エニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、ヘキサヒドロ−インデニル、オクタヒドロ−ナフチル、シクロヘキセニル、シクロペンテニル、ビシクロ[２.２.２]オクテニル、またはビシクロ[３.３.１]ノネニルを含む。シクロアルキル基またはシクロアルケニル基は、所望により、１個以上の置換基、例えば脂肪族 [例えば、アルキル、アルケニル、またはアルキニル]；シクロアリファチック；(シクロアリファチック)脂肪族；ヘテロシクロアリファチック；(ヘテロシクロアリファチック)脂肪族；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；(シクロアリファチック)オキシ；(ヘテロシクロアリファチック)オキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；(アラリファチック)オキシ；(ヘテロアラリファチック)オキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アミノ；アミド [例えば、(脂肪族)カルボニルアミノ、(シクロアリファチック)カルボニルアミノ、((シクロアリファチック)脂肪族)カルボニルアミノ、(アリール)カルボニルアミノ、(アラリファチック)カルボニルアミノ、(ヘテロシクロアリファチック)カルボニルアミノ、((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニルアミノ、(ヘテロアリール)カルボニルアミノ、または(ヘテロアラリファチック)カルボニルアミノ]；ニトロ；カルボキシ [例えば、ＨＯＯＣ−、アルコキシカルボニル、またはアルキルカルボニルオキシ]；アシル [例えば、(シクロアリファチック)カルボニル、((シクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、(アラリファチック)カルボニル、(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル、((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、または(ヘテロアラリファチック)カルボニル]；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；メルカプト；スルホニル [例えば、アルキル−Ｓ(Ｏ)_２−およびアリール−Ｓ(Ｏ)_２−]；スルフィニル [例えば、アルキル−Ｓ(Ｏ)−]；スルファニル [例えば、アルキル−Ｓ−]；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；オキソ；またはカルバモイルで置換され得る。

本明細書で用いるとき、“環状部分”は、シクロアリファチック、ヘテロシクロアリファチック、アリールまたはヘテロアリールを含み、それぞれは、上で定義している。

本明細書で用いるとき、用語“ヘテロシクロアリファチック”は、ヘテロシクロアルキル基およびヘテロシクロアルケニル基を包含し、それぞれは、下で示した通り所望により置換されている。

本明細書で用いるとき、“ヘテロシクロアルキル”基は、３〜１０員の単環式または二環式(縮合したまたは架橋した)(例えば、５員から１０員の単環式または二環式)飽和環構造であって、１個以上の環原子がヘテロ原子(例えば、Ｎ、Ｏ、Ｓ、またはその組み合わせ)であるものを言う。ヘテロシクロアルキル基の例は、ピペリジル、ピペラジル、テトラヒドロピラニル、テトラヒドロフリル、１,４−ジオキソラニル、１,４−ジチアニル、１,３−ジオキソラニル、オキサゾリジル、イソオキサゾリジル、モルホリニル、チオモルホリル、オクタヒドロベンゾフリル、オクタヒドロクロメニル、オクタヒドロチオクロメニル、オクタヒドロインドリル、オクタヒドロピリンジニル、デカヒドロキノリニル、オクタヒドロベンゾ[ｂ]チオフェニル、２−オキサ−ビシクロ[２.２.２]オクチル、１−アザ−ビシクロ[２.２.２]オクチル、３−アザ−ビシクロ[３.２.１]オクチル、および、２,６−ジオキサ−トリシクロ[３.３.１.０^３,７]ノニルを含む。単環式ヘテロシクロアルキル基は、フェニル部分と縮合し、ヘテロアリール、例えばテトラヒドロイソキノリンを形成してもよい。“ヘテロシクロアルケニル”基は、本明細書で用いるとき、１個以上の二重結合を有し、かつ１個以上の環原子がヘテロ原子(例えば、Ｎ、Ｏ、またはＳ)である、単環式または二環式(例えば５員から１０員の単環式または二環式)の非芳香環構造を言う。単環式および二環式ヘテロアリファチックは、標準的な化学命名法に従って番号付けされる。

ヘテロシクロアルキルまたはヘテロシクロアルケニル基は、所望により、１個以上の置換基、例えば脂肪族 [例えば、アルキル、アルケニル、またはアルキニル]；シクロアリファチック；(シクロアリファチック)脂肪族；ヘテロシクロアリファチック；(ヘテロシクロアリファチック)脂肪族；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；(シクロアリファチック)オキシ；(ヘテロシクロアリファチック)オキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；(アラリファチック)オキシ；(ヘテロアラリファチック)オキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アミノ；アミド [例えば、(脂肪族)カルボニルアミノ、(シクロアリファチック)カルボニルアミノ、((シクロアリファチック)脂肪族)カルボニルアミノ、(アリール)カルボニルアミノ、(アラリファチック)カルボニルアミノ、(ヘテロシクロアリファチック)カルボニルアミノ、((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニルアミノ、(ヘテロアリール)カルボニルアミノ、または(ヘテロアラリファチック)カルボニルアミノ]；ニトロ；カルボキシ [例えば、ＨＯＯＣ−、アルコキシカルボニル、またはアルキルカルボニルオキシ]；アシル [例えば、(シクロアリファチック)カルボニル、((シクロアリファチック) 脂肪族)カルボニル、(アラリファチック)カルボニル、(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル、((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニル、または(ヘテロアラリファチック)カルボニル]；ニトロ；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；メルカプト；スルホニル [例えば、アルキルスルホニルまたはアリールスルホニル]；スルフィニル [例えば、アルキルスルフィニル]；スルファニル [例えば、アルキルスルファニル]；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；オキソ；またはカルバモイルで置換され得る。

“ヘテロアリール”基は、本明細書で用いるとき、４から１５個の環原子を有し、かつ１個以上の環原子がヘテロ原子(例えば、Ｎ、Ｏ、Ｓ、またはその組み合わせ)であり、かつ単環式環系が芳香族性であって、二環式または三環式環系の少なくとも１個の環が芳香族性である、単環式、二環式、または三環式の環系を言う。ヘテロアリール基は、２から３個の環を有するベンゾ縮合環系を含む。例えば、ベンゾ縮合基は、ベンゾ縮合した１個または２個の４から８員のヘテロシクロアリファチック部分を含む(例えばインドリジル、インドリル、イソインドリル、３Ｈ−インドリル、インドリニル、ベンゾ[ｂ]フリル、ベンゾ[ｂ]チオフェニル、キノリニルまたはイソキノリニル)。ヘテロアリールの幾つかの例は、アゼチジニル、ピリジル、１Ｈ−インダゾリル、フリル、ピロリル、チエニル、チアゾリル、オキサゾリル、イミダゾリル、テトラゾリル、ベンゾフリル、イソキノリニル、ベンゾチアゾリル、キサンテン、チオキサンテン、フェノチアジン、ジヒドロインドール、ベンゾ[１,３]ジオキソール、ベンゾ[ｂ]フリル、ベンゾ[ｂ]チオフェニル、インダゾリル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾチアゾリル、プリル、シンノリル(cinnolyl)、キノリル、キナゾリル、シンノリル、フタラジル、キナゾリル、キノキサリル、イソキノリル、４Ｈ−キノリジル、ベンゾ−１,２,５−チアジアゾリル、または１,８−ナフチリジルである。

単環式ヘテロアリールは、フリル、チオフェニル、２Ｈ−ピロリル、ピロリル、オキサゾリル、チアゾリル、イミダゾリル、ピラゾリル、イソオキサゾリル、イソチアゾリル、１,３,４−チアジアゾリル、２Ｈ−ピラニル、４Ｈ−ピラニル、ピリジル、ピリダジル、ピリミジル、ピラゾリル、ピラジル、または１,３,５−トリアジルを含み、これらに限定されない。単環式ヘテロアリールは、標準的な化学命名法に従って番号付けされる。

二環式ヘテロアリールは、インドリジル、インドリル、イソインドリル、３Ｈ−インドリル、インドリニル、ベンゾ[ｂ]フリル、ベンゾ[ｂ]チオフェニル、キノリニル、イソキノリニル、インドリジル、イソインドリル、インドリル、ベンゾ[ｂ]フリル、ベンゾ[ｂ]チオフェニル、インダゾリル、ベンゾイミダジル、ベンゾチアゾリル、プリニル、４Ｈ−キノリジル、キノリル、イソキノリル、シンノリル、フタラジル、キナゾリル、キノキサリル、１,８−ナフチリジル、またはプテリジルを含み、これらに限定されない。二環式ヘテロアリールは、標準的な化学命名法に従って番号付けされる。

ヘテロアリールは、所望により、１個以上の置換基、例えば脂肪族 [例えば、アルキル、アルケニル、またはアルキニル]；シクロアリファチック；(シクロアリファチック)脂肪族；ヘテロシクロアリファチック；(ヘテロシクロアリファチック)脂肪族；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；(シクロアリファチック)オキシ；(ヘテロシクロアリファチック)オキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；(アラリファチック)オキシ；(ヘテロアラリファチック)オキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アミノ；オキソ (二環式または三環式ヘテロアリールの非芳香族性炭素環またはヘテロ環式環上で)；カルボキシ；アミド；アシル [例えば、脂肪族カルボニル；(シクロアリファチック)カルボニル；((シクロアリファチック)脂肪族)カルボニル；(アラリファチック)カルボニル；(ヘテロシクロアリファチック)カルボニル；((ヘテロシクロアリファチック)脂肪族)カルボニル;または(ヘテロアラリファチック)カルボニル]；スルホニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)_２−またはアミノ−Ｓ(Ｏ)_２−]；スルフィニル [例えば、脂肪族−Ｓ(Ｏ)−]；スルファニル [例えば、脂肪族−Ｓ−]；ニトロ；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；メルカプト；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；またはカルバモイルで置換されている。あるいは、ヘテロアリールは非置換であってもよい。

置換ヘテロアリールの非限定的な例は、(ハロ)ヘテロアリール [例えば、モノ−およびジ−(ハロ)ヘテロアリール]；(カルボキシ)ヘテロアリール [例えば、(アルコキシカルボニル)ヘテロアリール]；シアノヘテロアリール；アミノヘテロアリール [例えば、((アルキルスルホニル)アミノ)ヘテロアリールおよび((ジアルキル)アミノ)ヘテロアリール]；(アミド)ヘテロアリール [例えば、アミノカルボニルヘテロアリール、((アルキルカルボニル)アミノ)ヘテロアリール、((((アルキル)アミノ)アルキル)アミノカルボニル)ヘテロアリール、(((ヘテロアリール)アミノ)カルボニル)ヘテロアリール、((ヘテロシクロアリファチック)カルボニル)ヘテロアリール、および((アルキルカルボニル)アミノ)ヘテロアリール]；(シアノアルキル)ヘテロアリール；(アルコキシ)ヘテロアリール；(スルファモイル)ヘテロアリール [例えば、(アミノスルホニル)ヘテロアリール]；(スルホニル)ヘテロアリール [例えば、(アルキルスルホニル)ヘテロアリール]；(ヒドロキシアルキル)ヘテロアリール；(アルコキシアルキル)ヘテロアリール；(ヒドロキシ)ヘテロアリール；((カルボキシ)アルキル)ヘテロアリール；[((ジアルキル)アミノ)アルキル]ヘテロアリール；(ヘテロシクロアリファチック)ヘテロアリール；(シクロアリファチック)ヘテロアリール；(ニトロアルキル)ヘテロアリール；(((アルキルスルホニル)アミノ)アルキル)ヘテロアリール；((アルキルスルホニル)アルキル)ヘテロアリール；(シアノアルキル)ヘテロアリール；(アシル)ヘテロアリール [例えば、(アルキルカルボニル)ヘテロアリール]；(アルキル)ヘテロアリール、および(ハロアルキル)ヘテロアリール [例えば、トリハロアルキルヘテロアリール]を含む。

“ヘテロアラリファチック (例えばヘテロアラルキル基)は、本明細書で用いるとき、ヘテロアリール基で置換された脂肪族基(例えばＣ_１−４アルキル基)を言う。“脂肪族”、“アルキル”および“ヘテロアリール”は上で定義されている。

“ヘテロアラルキル”基は、本明細書で用いるとき、ヘテロアリール基で置換されたアルキル基(例えばＣ_１−４アルキル基)を言う。“アルキル”および“ヘテロアリール”は両方とも上で定義されている。ヘテロアラルキルは、所望により、１個以上の置換基、例えばアルキル (例えば、カルボキシアルキル、ヒドロキシアルキル、および、ハロアルキル、例えばトリフルオロメチル)；アルケニル；アルキニル；シクロアルキル；(シクロアルキル)アルキル；ヘテロシクロアルキル；(ヘテロシクロアルキル)アルキル；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；シクロアルキルオキシ；ヘテロシクロアルキルオキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ヘテロアラルキルオキシ；アロイル；ヘテロアロイル；ニトロ；カルボキシ；アルコキシカルボニル；アルキルカルボニルオキシ；アミノカルボニル；アルキルカルボニルアミノ；シクロアルキルカルボニルアミノ；(シクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ；アリールカルボニルアミノ；アラルキルカルボニルアミノ；(ヘテロシクロアルキル)カルボニルアミノ；(ヘテロシクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ；ヘテロアリールカルボニルアミノ；ヘテロアラルキルカルボニルアミノ；シアノ；ハロ；ヒドロキシ；アシル；メルカプト；アルキルスルファニル；スルホキシ；ウレア；チオウレア；スルファモイル；スルファミド；オキソ；またはカルバモイルで置換されている。

本明細書で用いるとき、“アシル”基は、ホルミル基またはＲ^Ｘ−Ｃ(Ｏ)− (例えば−アルキル−Ｃ(Ｏ)−, “アルキルカルボニル”とも記載)を言い、ここで、Ｒ^Ｘおよび“アルキル”は上で定義されている。アセチルおよびピバロイルは、アシル基の例である。

本明細書で用いるとき、“アロイル”または“ヘテロアロイル”は、アリール−Ｃ(Ｏ)−またはヘテロアリール−Ｃ(Ｏ)−を言う。アロイルまたはヘテロアロイルのアリール部分およびヘテロアリール部分は、上で定義した通り、所望により置換されている。

本明細書で用いるとき、“アルコキシ”基はアルキル−Ｏ−基を言い、ここで、“アルキル”は上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“カルバモイル”基は、構造：−Ｏ−ＣＯ−ＮＲ^ＸＲ^Ｙ、または、−ＮＲ^Ｘ−ＣＯ−Ｏ−Ｒ^Ｚ (ここで、Ｒ^ＸおよびＲ^Ｙは上で定義されており、Ｒ^Ｚは脂肪族、アリール、アラリファチック、ヘテロシクロアリファチック、ヘテロアリールまたはヘテロアラリファチックであってもよい。)を有する基を言う。

本明細書で用いるとき、“カルボキシ”基は、末端基として用いたときは−ＣＯＯＨ、−ＣＯＯＲ^Ｘ、−ＯＣ(Ｏ)Ｈ、−ＯＣ(Ｏ)Ｒ^Ｘ；または内部の基として用いたときは−ＯＣ(Ｏ)−、または、−Ｃ(Ｏ)Ｏ−を言う。

本明細書で用いるとき、“ハロ脂肪族”基は１〜３個のハロゲンで置換されている脂肪族基を言う。例えば、用語ハロアルキルは、基−ＣＦ_３を含む。

本明細書で用いるとき、“メルカプト”基は、−ＳＨを言う。

本明細書で用いるとき、“スルホ”基は、末端で用いたときは−ＳＯ_３Ｈ、または、−ＳＯ_３Ｒ^Ｘを言い、あるいは、内部で用いたときは−Ｓ(Ｏ)_３−を言う。

本明細書で用いるとき、“スルファミド”基は、末端で用いたときは構造：−ＮＲ^Ｘ−Ｓ(Ｏ)_２−ＮＲ^ＹＲ^Ｚを言い、そして、内部で用いたときは−ＮＲ^Ｘ−Ｓ(Ｏ)_２−ＮＲ^Ｙ−を言う。ここで、Ｒ^Ｘ、Ｒ^ＹおよびＲ^Ｚは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“スルファモイル”基は、末端で用いたときは構造：−Ｓ(Ｏ)_２−ＮＲ^ＸＲ^Ｙ、または、−ＮＲ^Ｘ−Ｓ(Ｏ)_２−Ｒ^Ｚを言い；あるいは、内部で用いたときは−Ｓ(Ｏ)_２−ＮＲ^Ｘ−、または、−ＮＲ^Ｘ−Ｓ(Ｏ)_２−を言う。ここで、Ｒ^Ｘ、Ｒ^ＹおよびＲ^Ｚは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“スルファニル”基は、末端で用いたときは−Ｓ−Ｒ^Ｘを言い、内部で用いたときは−Ｓ−を言う。ここで、Ｒ^Ｘは上で定義されている。スルファニルの例は、脂肪族−Ｓ−、シクロアリファチック−Ｓ−、アリール−Ｓ−などを含む。

本明細書で用いるとき、“スルフィニル”基は、末端で用いたときは−Ｓ(Ｏ)−Ｒ^Ｘを言い、内部で用いたときは−Ｓ(Ｏ)−を言う。ここで、Ｒ^Ｘは上で定義されている。スルフィニル基の例は、脂肪族−Ｓ(Ｏ)−、アリール−Ｓ(Ｏ)−、(シクロアリファチック(脂肪族))−Ｓ(Ｏ)−、シクロアルキル−Ｓ(Ｏ)−、ヘテロシクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)−、ヘテロアリール−Ｓ(Ｏ)−などを含む。

本明細書で用いるとき、“スルホニル”基は、末端で用いたときは−Ｓ(Ｏ)_２−Ｒ^Ｘを言い、内部で用いたときは−Ｓ(Ｏ)_２−を言う。ここで、Ｒ^Ｘは上で定義されている。スルホニル基の例は、脂肪族−Ｓ(Ｏ)_２−、アリール−Ｓ(Ｏ)_２−、(シクロアリファチック(脂肪族))−Ｓ(Ｏ)_２−、シクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)_２−、ヘテロシクロアリファチック−Ｓ(Ｏ)_２−、ヘテロアリール−Ｓ(Ｏ)_２−、(シクロアリファチック(アミド(脂肪族)))−Ｓ(Ｏ)_２−などを含む。

本明細書で用いるとき、“スルホキシ”基は、末端で用いたときは−Ｏ−ＳＯ−Ｒ^Ｘまたは−ＳＯ−Ｏ−Ｒ^Ｘ、内部で用いたときは−Ｏ−Ｓ(Ｏ)−または−Ｓ(Ｏ)−Ｏ−を言う。ここで、Ｒ^Ｘは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“ハロゲン”または“ハロ”基は、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素を言う。

本明細書で用いるとき、“アルコキシカルボニル”は、用語カルボキシに包含され、また、単独でまたは他の基と連結して用い、例えばアルキル−Ｏ−Ｃ(Ｏ)−基を言う。

本明細書で用いるとき、“アルコキシアルキル”は、アルキル基、例えばアルキル−Ｏ−アルキル−を言う。ここで、アルキルは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“カルボニル”は−Ｃ(Ｏ)−を言う。

本明細書で用いるとき、“オキソ”は＝Ｏを言う。

本明細書で用いるとき、“アミノアルキル”は構造：(Ｒ^Ｘ)_２Ｎ−アルキル−を言う。

本明細書で用いるとき、“シアノアルキル”は構造：(ＮＣ)−アルキル−を言う。

本明細書で用いるとき、“ウレア”基は、構造：−ＮＲ^Ｘ−ＣＯ−ＮＲ^ＹＲ^Ｚを言い、“チオウレア”基は、末端で用いたときは構造：−ＮＲ^Ｘ−ＣＳ−ＮＲ^ＹＲ^Ｚを言い、内部で用いたときは−ＮＲ^Ｘ−ＣＯ−ＮＲ^Ｙ−または−ＮＲ^Ｘ−ＣＳ−ＮＲ^Ｙ−を言う。ここで、Ｒ^Ｘ、Ｒ^ＹおよびＲ^Ｚは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“グアニジン”基は、構造：−Ｎ＝Ｃ(Ｎ(Ｒ^ＸＲ^Ｙ))Ｎ(Ｒ^ＸＲ^Ｙ)を言う。ここで、Ｒ^ＸおよびＲ^Ｙは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、用語“アミジノ”基は、構造：−Ｃ＝(ＮＲ^Ｘ)Ｎ(Ｒ^ＸＲ^Ｙ)を言う。ここで、Ｒ^ＸおよびＲ^Ｙは上で定義されている。

一般的に、用語“ビシナル”は、置換基が隣接する炭素原子に結合している２個以上の炭素原子を含む基上の置換基の配置を言う。

一般的に、用語“ジェミナル”は、置換基が同一の炭素原子に結合している２個以上の炭素原子を含む基上の置換基の配置を言う。

用語“末端に”および“内部で”は、置換基内の基の位置を言う。基が置換基の最後に存在し、化学構造の残りにさらに結合していないとき、その基は末端である。カルボキシアルキル、すなわちＲ^ＸＯ(Ｏ)Ｃ−アルキルが、末端に用いたカルボキシ基の一例である。基が置換基の中央に存在し、化学構造の残りに結合した置換基の末端に結合しているとき、その基は内部である。アルキルカルボキシ (例えば、アルキル−Ｃ(Ｏ)Ｏ−またはアルキル−ＯＣ(Ｏ)−)、および、アルキルカルボキシアリール (例えば、アルキル−Ｃ(Ｏ)Ｏ−アリール−またはアルキル−Ｏ(ＣＯ)−アリール−)は、内部で用いたカルボキシ基の例である。

本明細書で用いるとき、用語“アミジノ”基は構造：−Ｃ＝(ＮＲ^Ｘ)Ｎ(Ｒ^ＸＲ^Ｙ)を言う。ここで、Ｒ^ＸおよびＲ^Ｙは上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“環状基”は、シクロアリファチック、ヘテロシクロアリファチック、アリールまたはヘテロアリールを含む単環式、二環式および三環式環系を含み、それぞれは、上で定義されている。

本明細書で用いるとき、“架橋した二環式環系”は、環が架橋している二環式ヘテロシクロアリファチック環系、または二環式シクロアリファチック環系を言う。架橋した二環式環系の例は、アダマンタニル、ノルボルナニル、ビシクロ[３.２.１]オクチル、ビシクロ[２.２.２]オクチル、ビシクロ[３.３.１]ノニル、ビシクロ[３.２.３]ノニル、２−オキサ−ビシクロ[２.２.２]オクチル、１−アザ−ビシクロ[２.２.２]オクチル、３−アザ−ビシクロ[３.２.１]オクチル、および２,６−ジオキサ−トリシクロ[３.３.１.０３,７]ノニルを含み、これらに限定されない。架橋した二環式環系は、所望により、１個以上の置換基、例えばアルキル (カルボキシアルキル、ヒドロキシアルキル、およびハロアルキル(例えばトリフルオロメチル)を含む)、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、(シクロアルキル)アルキル、ヘテロシクロアルキル、(ヘテロシクロアルキル)アルキル、アリール、ヘテロアリール、アルコキシ、シクロアルキルオキシ、ヘテロシクロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、アラルキルオキシ、ヘテロアラルキルオキシ、アロイル、ヘテロアロイル、ニトロ、カルボキシ、アルコキシカルボニル、アルキルカルボニルオキシ、アミノカルボニル、アルキルカルボニルアミノ、シクロアルキルカルボニルアミノ、(シクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキル)カルボニルアミノ、(ヘテロシクロアルキルアルキル)カルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノ、ヘテロアラルキルカルボニルアミノ、シアノ、ハロ、ヒドロキシ、アシル、メルカプト、アルキルスルファニル、スルホキシ、ウレア、チオウレア、スルファモイル、スルファミド、オキソ、または、カルバモイルで置換され得る。

本明細書で用いるとき、“脂肪族鎖”は、分枝鎖または直鎖の脂肪族基(例えば、アルキル基、アルケニル基、またはアルキニル基)を言う。直鎖の脂肪族鎖は、構造：−[ＣＨ_２]_ｖ−を有し、ここで、ｖは１〜６である。分枝した脂肪族鎖は、１個以上の脂肪族基で置換されている直鎖の脂肪族鎖である。分枝した脂肪族鎖は、構造：−[ＣＨＱ]_ｖ−を有し、ここで、Ｑは水素または脂肪族基であるが、Ｑは少なくとも１個は脂肪族基であるべきである。用語脂肪族鎖は、アルキル鎖、アルケニル鎖、およびアルキニル鎖を含み、ここで、アルキル、アルケニルおよびアルキニルは上で定義されている。

フレーズ“所望により置換されている”は、“置換されているか、または非置換である”と交換して用いられ得る。本明細書で記載されるとき、本発明の化合物は、所望により、１個以上の置換基、例えば上で一般的に例示された基、または本発明の特定のクラス、サブクラスおよび種によって例示された基で置換され得る。本明細書で用いるとき、本明細書に含まれる可変基は、特定の基、例えばアルキルおよびアリールを包含する。特記しない限り、特定の基は、それぞれ、所望により、本明細書に記載した１個以上の置換基で置換され得る。特定の基の置換基はそれぞれ、さらに、所望により、ハロ、シアノ、オキソアルコキシ、ヒドロキシ、アミノ、ニトロ、アリール、ハロアルキルおよびアルキルのうちの１個から３個で置換されている。例えば、アルキル基は、アルキルスルファニルで置換され得る。そして、該アルキルスルファニルは、次いで、所望により、ハロ、シアノ、オキソアルコキシ、ヒドロキシ、アミノ、ニトロ、アリール、ハロアルキルおよびアルキルのうちの１個から３個で置換され得る。さらなる例として、(シクロアルキル)カルボニルアミノのシクロアルキル部分は、所望により、ハロ、シアノ、アルコキシ、ヒドロキシ、ニトロ、ハロアルキルおよびアルキルのうちの１個から３個で置換され得る。２個のアルコキシ基が同一または隣接する原子に結合しているとき、該２個のアルコキシ基は、それらが結合している原子と一体となって環を形成し得る。

一般的に、用語“置換されている”は、用語“所望により”が先行していてもいなくとも、示された構造中の水素基が特記された置換基で置き換えられていることを言う。特記された置換基は、「定義」において上で記載されているか、またその化合物および実施例の記載において、下で記載されている。特記しない限り、所望により置換されている基は、該基の置換基の位置でそれぞれ置換基を有し得る。示された構造の何れかにおいて、１個以上の位置が、特記された基から選択される１個以上の置換基で置換され得るときは、該置換基は、全ての位置で、同一であっても異なっていてもよい。環置換基、例えばヘテロシクロアルキルは、別の環、例えばシクロアルキルと結合してスピロ二環式環系、例えば、両方の環が１個の共通の原子を有する構造を形成してもよい。本発明によって構想される置換基の組み合わせは、安定な、または化学的に可能な化合物の形成をもたらす組み合わせであると当業者に認識されるであろう。

フレーズ“安定なまたは化学的に可能な”は、本明細書で用いるとき、その製造、検出、好ましくは回収、精製および本明細書で開示された１個以上の目的のための使用を可能とする条件下に置いたとき、実質的に変化しない化合物を言う。幾つかの態様において、安定なまたは化学的に可能な化合物は、４０℃未満の温度で、湿気または他の化学的に反応性の条件の非存在下で、少なくとも１週間維持したとき、実質的に変化しない化合物である。本発明の化合物は、プロトン化された(カチオン性)形態で機能してもよく、また中性の形態で膜を通過してもよい。

本明細書で用いるとき、有効量は、処置した患者に治療効果を与えるのに必要な量として定義され、典型的には患者の年齢、表面積、体重および状態に基づいて決定される。動物およびヒトにおける投与量の相互関係(mg/m²体表面積に基づく)は、Freireich et al., Cancer Chemother. Rep., 50: 219 (1966)によって記載されている。体表面積は、患者の身長および体重からおおよそ決定され得る。例えば、Scientific Tables, Geigy Pharmaceuticals, Ardsley, New York, 537 (1970)を参照のこと。本明細書で用いるとき、“患者”はヒトを含む哺乳動物を言う。

特記しない限り、本明細書で記載した構造はまた、該構造の全ての異性体の形態(例えばエナンチオマー、ジアステレオマーおよび幾何(または配座)異性体) ；例えば、それぞれの不斉中心についてのＲおよびＳ配置、(Ｚ)および(Ｅ)二重結合異性体、および(Ｚ)および(Ｅ)配座異性体を含むことを意味する。従って、本発明の化合物の単一の立体化学的異性体、ならびにエナンチオマー、ジアステレオマー、および幾何(または配座)異性体の混合物は、本発明の範囲内である。特記しない限り、全ての互変異性体の形態の本発明の化合物は、本発明の範囲内である。さらに、特記しない限り、本明細書で記載した構造はまた、１種以上の同位体が多い原子の存在でのみ異なる化合物を含むことを意味する。例えば、水素が重水素またはトリチウムによって置き換えられている以外、本発明の構造を有する化合物、あるいは、炭素が^１３Ｃまたは^１４Ｃが多い炭素によって置き換えられている以外、本発明の構造を有する化合物は、本発明の範囲内である。該化合物は、例えば、生物学的アッセイにおける分析ツールまたはプローブとして有用である。

II. 化学的背景
特定の窒素ヘテロ環のオリゴマーは、二重鎖ＤＮＡの特定の領域に結合するために用いられ得る。特に、Ｎ−メチルイミダゾール (I)、デス−アミノ−Ｎ−メチルイミダゾール (Im)、およびＮ−メチルピロール (P)は、特定の塩基に特異的な親和性を有する。この特異性は、これらの化合物が結合している順番に基づいて修飾され得る。G/CはIm/PまたはI/Pと相補的であり、C/GはP/ImまたはP/Iと相補的であり、A/TおよびT/AはP/Pと重複して相補的である点で特異的であることが示されている。

効果の点では、Ｎ−メチルイミダゾールおよびデス−アミノ−Ｎ−メチルイミダゾールが、グアニジンと結合する傾向があるが、Ｎ−メチルピロールはシトシン、アデニンおよびチミンと結合している。該ヘテロ環の２本の鎖を提供することによって、１分子または２分子として、二重鎖ＤＮＡとの２：１複合体を形成する；逆平行オリゴマーの２本の鎖を提供することによって、G/Cペアが近位にIm/PまたはI/Pを有し、C/GペアがP/ImまたはP/Iを有し、T/Aペアが近位にP/Pを有する。該ヘテロ環オリゴマーは、アミド(カルバミル)基によって結合しており、このときＮＨは、窒素、特にアデニンの窒素不対電子と水素結合し得る。

ポリアミド類は、例えばγ−アミノ酪酸 (γ)またはγ−アミノ−β−アミノ酪酸 (γＮＨ_２)などの化合物を組み込むことによってヘアピン化合物を形成するよう合成され、１本鎖ポリアミドがＤＮＡと複合体を形成することが可能となり得る。該構造は、ポリアミドの ＤＮＡ標的配列への結合親和性を著しく増大させることが見出されている。

ATまたはTA塩基対が標的配列であるとき、β−アラニン (β)を、Ｎ−メチルピロール基のペアと置き換えてもよい。β−アラニンの付加的なフレキシビリティーは、ポリアミド全体をＤＮＡ標的配列と「一致させて」存在させるのを助けることができる。

幾つかの態様において、ポリアミド分子は、グアノシンに特異的な親和性を有するデス−アミノ−Ｎ−メチルイミダゾールで開始する。別の態様において、ポリアミド分子は、３−(ジメチルアミノ)プロピルアミン (Da)、または３,３'−ジアミノ−Ｎ−メチルジプロピルアミン (Ta)の何れかで終了する。色素分子は、γ−アミノ−酪酸またはTaのアミノ基、あるいは、同じ分子中で両方が利用可能であるならばその両方に組み込まれ得る。

より最近では、新規の芳香族性アミノ酸である３−ヒドロキシ−Ｎ−メチルピロール(Hp)を含むことで、ポリアミドに組み込まれて反対側のPyとペアを組むとき、それはA-TとT-Aを区別する方法を提供することが見出された。White S., et al., Nature 391, 436-38 (1998)を参照のこと。予期しないことに、Hp/Pペア中のピロール上の１個の水素原子をヒドロキシ基と置き換えることで、大きさによって、ポリアミドの親和性と特異性が制御される。ポリアミド中にHpをPおよびImまたはIと共に用いて６個の芳香族性アミノ酸ペア(I/P、Im/P、P/Im、P/I、Hp/PおよびP/Hp)を形成することにより、Hpを分解しない環境中で、ＤＮＡの副溝中の４個のWatson-Crick塩基対全てを区別するコードが提供される。

天然由来のピロール含有ポリアミド類、例えばジスタマイシンおよびネトロプシンならびにそれらのピロール／イミダゾール含有合成アナログは、ＤＮＡの副溝と高い親和性を持って結合する。特異的なポリアミド−ＤＮＡ結合の直接的な証拠は、Dervanのグループによって、Ｘ線結晶解析、ＮＭＲ構造決定および定量的親和性切断法を用いて、広く報告されている (Baird and Dervan, 1998; Pilch et al., Biochemistry, 38, 2143-51, 1999; Pilch et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93, 8306-11 1996; Wang, Ellervik, and Dervan, Bioorg. Med. Chem., 9, 653-7, 2001; White, Baird, and Dervan, Biochemistry, 35, 12532-27, 1996; White, Baird, and Dervan, Chem. Biol., 4, 569-78, 1997, これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれている)。水素結合スキームにより、合成ポリアミド類は特異的なＤＮＡ配列を認識するよう設計され得る。

ポリアミド類によるＤＮＡ認識のルールは、以下の段落で要約される(White, Baird, and Dervan, Chem. Biol., 4, 569-78, 1997)。ピロール (典型的にはPyまたはPと略される)は、副溝中に水素結合アクセプターを有する３種のヌクレオチドまたはA、TおよびCに結合する (Kielkopf et al., Science, 282, 111-5, 1998; Kielkopf, et al., Nat. Struct. Biol., 5, 104-9, 1998; Melander, Herman, and Dervan, Chemistry, 6, 4487-97, 2000, これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれている)。これらのヌクレオチドは、水素結合アクセプターのみを副溝に提供する：AおよびCはそれぞれ１組の孤立電子対を有するが、TはＣ２に結合したカルボニル酸素由来の２組の孤立電子対を有する。ヘアピン・ピロールアミノ酸のアミドＮＨが、水素結合ドナーである。そして、該ピロール環は、Ｂ型ＤＮＡ中に位置するとき、アミドＮＨを正しい距離にする曲がったスペーサーとして作用し、A、CおよびTによって提供される水素結合アクセプターのパターンと一致するよう歪む。イミダゾール (下記の構造II)は典型的にIと略される。

さらなるポリアミド構成要素および結合ルールが見出され得る (Urbach et al.,J. Mol. Biol., 320, 55-71, 2002; Wang, Ellervik, and Dervan, Bioorg. Med. Chem., 9, 653-57, 2001, 両者は言及することによって本明細書に組み込まれる)。しかし、これらの試験は、β−アラニン (下記の構造III (β))がA、TおよびCに対して選択的な水素結合ドナーとして作用し得ることを示した。

さらなる認識については、ヘアピン・ターン(図５を参照のこと。)を形成するよう用いられたγ−アミノ酪酸 (下記の構造IV (γ)) 構成要素が、A/Tに結合するがG/C塩基対には結合しないことが見出された。同様に、大部分のポリアミド類に存在する正に荷電したアミノ尾部において、A/T塩基対がG/C塩基対より優先されることが示されている。これは、ジスタマイシン中のカチオン性グアニジン基を模倣している (Parks, Baird, and Dervan, 1996; Pilch et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93, 8306-11, 1996; Trauger et al., Chem. Biol., 3, 369-77, 1996; Urbach and Dervan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98, 4343-48, 2001; Urbach et al., J. Mol. Biol., 320, 55-71, 2002; Wang, Ellervik, and Dervan, Bioorg. Med. Chem., 9, 653-57, 2001, それぞれは言及することによって本明細書に組み込まれる)。標準的なヘアピン・ポリアミド類は、5'-WWG-3' (ここで、W=AまたはT)で開始する配列に最も高い親和性を示す。

他の構成要素は、デスアミノ−イミダゾール (式V (Im))、((Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸 (式VI, γNH₂))、３−(ジメチルアミノ)プロピルアミン (式VII, Dp)、および、３,３'−ジアミノ−Ｎ−メチルジプロピルアミン (式VIII, Ta)を含み、これらに限定されない。

ポリアミド−ＤＮＡ結合は、タンパク質−ＤＮＡ結合を妨げることが報告されており (Fechter and Dervan, J. Am. Chem. Soc., 125, 8476-85, 2003; Nguyen-Hackley et al., Biochemistry, 43, 6880-90, 2004; Schaal et al., Nucl. Acids Res., 31, 1282-91, 2003, これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる)、ポリアミド類は、たぶんＤＮＡ結合部位において転写因子と競合することにより、遺伝子発現を阻害することが報告されている (Dickinson et al., Biochemistry, 38, 10801-7, 1999; Supekova et al., Chem. Biol., 9, 821-7, 2002; Weisz, 1997, これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる)。真核生物の遺伝子発現が活性な転写複合体の形成に依存しており、当該複合体の構成要素は、可変であり、かつプロモーター／遺伝子依存性である。転写複合体の集合において、転写因子が、それに関連する一致した配列に結合していることが、最も重要である。多くの遺伝子が転写因子(ＴＦ)を共用するが、特異的なＴＦ結合部位と、標的遺伝子に独自の隣接するＤＮＡの組み合わせが、ヒトのゲノム内で比較的特異的な部位を提供し得る。従って、ＴＦ結合部位および幾つかの隣接するＤＮＡを認識するようポリアミド類を設計することによって、たとえＴＦが多くの遺伝子の制御領域中に結合部位を有していても、それが、独自の遺伝子のプロモーター領域を標的とすることが可能となる。

III. ＨＰＶ標的
本発明は、ＨＰＶ感染および他の疾患を処置するのに有用であるポリアミド類およびポリアミド・ポリマーのアナログを提供する。特定の理論に束縛されることなく、ポリアミド類の抗ＨＰＶ活性は、全てのＨＰＶサブタイプおよび他の二本鎖ＤＮＡウイルスに対してポリアミドを設計するための一般的なルールを予測し開発するための情報を提供する。該方法論は、ポリアミド構造が、エプスタイン・バーウイルス、ヘルペスウイルスおよびポックスウイルスを含む他の二重鎖ＤＮＡウイルスに対して広域な抗ウイルス活性を有することを予測するのに有用である。

本発明のポリアミド類の抗ＨＰＶウイルス作用の時間経過試験により、特定の活性な分子が、薬物処置後３０分ほどで、ヒトのケラチン生成細胞中のＨＰＶ ＤＮＡ濃度を＞９０％まで減少させることが見出された。

ＨＰＶ ＤＮＡは、それ自身をヒトの染色体に固定する。これの種々の理由は、ウイルス複製のためにヒトのＤＮＡ複製要素と非常に近接する必要があること、エピソームの核の維持が必要なこと、および細胞分割の間で娘細胞にウイルスのエピソームを適切に分離する必要があることを含む。さらに、該プロセスはほとんど理解されていないが、ウイルスのゲノムは、外部または非自己ＤＮＡを認識し排除する生来の免疫系を回避する必要がある。

理論に束縛されることなく、本発明のポリアミド類は、環状ＤＮＡゲノムを宿主の染色体から外した結果エピソームを迅速に喪失させて分解させ得るか、あるいは、ポリアミド類のウイルス性ＤＮＡまたは核ＤＮＡへの結合により宿主ＤＮＡ配列からウイルス性ＤＮＡ配列を特異的に除去し得る。ウイルス性ＤＮＡの喪失のための１つの可能性のあるメカニズムは、エピソームを細胞染色体から外すことにより、始めにＨＰＶ ＤＮＡを宿主の核から外し、次にＨＰＶ ＤＮＡをヌクレアーゼ酵素によって迅速に酵素分解することを含み得る。さらなる結論は、ＨＰＶ ＤＮＡを宿主染色体に固定する主な理由がウイルス性ＤＮＡをこの分解経路から保護することである。あるいは、ポリアミド類は、核中のエピソームＤＮＡの物理的性質を変化させ、その結果、宿主の防御機構によって外部ＤＮＡを認識し排除し得る。これらの予測は、ＤＮＡ副溝に結合する他の薬物に拡張することができ、また、エプスタイン・バーウイルスを含む同様のまたは関連するエピソーム維持戦略を用いる他の二重鎖ＤＮＡウイルスに拡張することができる。

ＨＰＶの場合において、ＤＮＡ塩基AおよびTの長い配列を介して染色体に固定されることが知られている。これらのAT配列は、天然物ジスタマイシンで見られるようにピロールによってAT塩基対が認識されるために、ピロール含有ポリアミド類の標的であり、ＤＮＡ結合に用いられるポリアミド構造の部分的前駆体と考えられ得る。ジスタマイシンはATリッチＤＮＡに結合するが、それは十分に小さい分子であり、非常に長いAT配列はジスタマイシンを引き寄せるのに必要ではない：５塩基長のみのAT領域で、ジスタマイシンによる認識に十分である。

いわゆる“脆弱ＤＮＡ”におけるＤＮＡのATリッチ領域は、ジスタマイシンの明らかな標的であり、ジスタマイシン処置に応答して細胞から除去される。さらに、例えば繊毛虫および他の微生物で見出されるＤＮＡ再配列およびプロセッシングのモデルシステムにおいて、ゲノム再配列の際に排除するために標的となるのがATリッチ領域であり、細胞が、ＤＮＡのプロセッシングおよび排除のための進化的保存メカニズムを保持し得ることが示唆され、また関連するATリッチ領域は、天然由来または合成ポリアミド類のピロールによる結合の標的であり得ることが示唆される。

本明細書で記載した本発明から、いわゆる選択性インデックス(ＳＩ：ＩＣ_５０とＴＤ_５０の比)、および選択性指数の最適範囲を決定するための通常の試験を考慮することによって、ＤＮＡウイルス、例えばＨＰＶサブタイプに対して有用な薬物を開発し得る。ジスタマイシンそれ自体は、抗ウイルス剤としての大部分のまたは全ての適用に、毒性が強すぎるが、ATリッチＤＮＡ領域を標的とする我々の設計したおよび目的に合わせた長鎖ポリアミド類は、非常に毒性が低く、かつ細胞培養物において非常に高いＳＩを有する。例えば、シドホビルは、２.５のＳＩを示すが、NV1028は７５０より大きいＳＩを示す。幾つかの態様において、ＳＩは５００以上である。別の態様において、２００以上であり、他ではＳＩは１００より大きい。幾つかの場合において、ＴＤ_５０を達成するのに必要な濃度が化合物の溶解度限界を超え得る。これらの場合では、正確なＳＩの計算ができない。

幾つかの態様において、ＨＰＶタイプ、特にＨＰＶ１、６、１１、１６および１８の抗ＨＰＶ活性を示すポリアミド配列は、宿主染色体からＨＰＶ ＤＮＡを置き換えるまたは排除する能力を示し、その結果、ＨＰＶ類に対する広い適用可能性を示す。これらは、ＨＰＶ１１(一部は、呼吸器乳頭腫として知られる しばしば重篤となる疾患、ならびに生殖器の疣贅の原因である)、ＨＰＶ１および６(それぞれ尋常性疣贅、ならびに生殖器外部、肛門および子宮頸の疣贅を引き起こす)、および、ＨＰＶ１６および１８(子宮頸癌の原因である)を含む。

ＨＰＶ１６、ＨＰＶ１８、ＨＰＶ１１、ＨＰＶ６ｂおよびＨＰＶ１ゲノムＤＮＡ配列は、それぞれ、genbank受付番号 NC_001526、NC_001357、M14119、NC_001355およびNC_001356で見出され得る。

IV. ポリアミド類
A. 一般構造
本発明の化合物は、Ｎ−メチルピロール−Ｎ−メチルイミダゾール・ヘアピン・ポリアミド誘導体として知られる化合物のファミリー中の活性な構造を含む (Zhang, W., T. Bando, and H. Sugiyama (2006) J. Am. Chem. Soc. 128:8766-76, 言及することによって本明細書に組み込まれている)。活性な構造は、下記の式：
Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
によって示される限定および定義で記載される。

Ｚ、Ｘ、γ^q、ＹおよびＡにおいて用いられた幾つかの構成要素の構造は、用語の解説として示した上記の式I〜VIII中で示される。また、下記の表１を参照のこと。ヘテロ環 Im-、-Py-および-Im-のＮ−メチル基は、Ｎ−エチルおよびＮ−トリフルオロメチル基などによって置き換えられてもよい。式中の用語を以下に定義する。

Ｚは、Ｎ−末端キャッピング基であり、トリフルオロアセトアミド、アセトアミド、ホルムアミド (Lacy,et al. (2002) J. Am. Chem. Soc. 124:2153-63, 言及することによって本明細書に組み込まれる)、プロピオンアミド、いわゆるデス−アミノ−イミダゾール (Im-と表す, 式V))などであり得る。Ｚはまた、式：Ｑ−Ｃ(Ｏ)− (ここで、ＱはＨ、非置換脂肪族、ハロ−脂肪族、所望により１または２個のアミン基で置換されているＣ_１−４脂肪族、および、所望により脂肪族またはハロ−脂肪族で置換されているヘテロアリールから選択される。)によって表され得る。該ヘテロアリールは、６,５または５,６−環系を有する縮合二環式ヘテロアリールであり得る。

Ｘは、主に、Ｎ−メチルピロールの４−アミノ−２−カルボン酸誘導体 (-P-(式I)、β−アラニン (β)、Ｎ−メチルイミダゾールの４−アミノ−２−カルボン酸誘導体 (-I-(式II))、および、β−アラニン以外のＣ_１−６脂肪族アミノ酸を含むこれらの基の代替物を含む、ポリアミド構成要素を含む。一つの態様において、該アミノ酸は、アミノ基および酸の基についてα−、ω−置換パターンを有する。これらの基についての他の代替物は、天然のα−アミノ酸(例えばグリシン)、および他のヘテロ環のアミノ酸誘導体(Nguyen, et al. (2001) Bioorg. Med. Chem. 9:7-17; Zhan and Dervan (2000) Bioorg. Med. Chem. 8:2467-2474, 両者は言及することによって本明細書に組み込まれる)、または縮合ヘテロ環 (Briehn, et al. (2003) Chemistry--A European Journal 9:2110-2122; Marques, et al. (2004) J. Am. Chem. Soc. 126:10339-10349; Phillion and Bashkin (2004), ＰＣＴ国際公開第WO 04/099131号; Renneberg and Dervan (2003) J. Am. Chem. Soc. 125:5707-5716, Tsai, et al. (2007) Nucl. Acids. Res. 35:307-16; Buchmueller, et al., Nucl. Acids. Res. (2005) 33:912-21; Buchmueller, et al. (2005) J. Am. Chem. Soc. 127:742-750; Nickols, et al. (2007) Nucl. Acids Res. 33:363-70; Zhang, et al., J. Am. Chem. Soc. (2006) 128:8766-76; Floreancig, et al., J. Am. Chem. Soc. (2000) 122:6342-50; これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる)を含み、これらは１個または２個のピロールおよび／またはイミダゾール基を模倣するよう設計されている。従って、Ｘは、β−アラニン (式III)、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)、Ｃ_１−６脂肪族アミノ酸、天然α−アミノ酸、式X1、式X2、式X3、式X4、式X5、式X6、式X7、および、式X8 (表１)を含む。

γ^ｑは、γ (式IV)と表すγ−アミノ酪酸構成要素、(Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸として知られるγ−アミノ酪酸のキラルアナログ (γ-NH₂と表す, 式VI)またはその(Ｓ)−異性体、および、トリフルオロ酢酸、酢酸、蟻酸、プロピオン酸などから誘導したγ-NH₂のアミド誘導体であり得る。従って、γ^ｑは、γ−アミノ酪酸 (式IV)、(Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸 (式VI)、(Ｓ)−２,４−ジアミノ酪酸、式γ1、式γ2、式γ3、式γ4 (表１)、および式IX：
{式中、Ｒ_１は、それぞれ、−Ｃ(Ｏ)−Ｒ_１Ａから独立して選択され；
Ｒ_１Ａはそれぞれ、Ｈ、非置換脂肪族、非置換Ｃ_１−Ｃ_４脂肪族アシル、ハロ−脂肪族、天然のカチオン性または天然の極性アミノ酸誘導アミノアシル、およびＣ_２−Ｃ_２０ポリエチレングリコールから独立して選択される。}
から選択される。

Ｙは、-P-(式I)、-I-(式II)、β−アラニン (式III)、他のＣ_１−６脂肪族アミノ酸などを含み、ここで、アミノおよび酸は、α−、ω−置換パターン、および、天然のアミノ酸(グリシンを含む)を組み込み得る。Ｙはまた、式X7 (表１)、Ｃ_１−６脂肪族アミノ酸、および天然α−アミノ酸を含む。

Ａはカチオン性である極性基を含み、３−ジメチルアミノ−プロピルアミン (Dp, 式VII)、ビス(アミノプロピルアミン)(Ta, 式VIII)、ならびに、関連する直鎖および環状の脂肪族アミン類、オリゴアミン類およびポリアミン類によって例示されるファミリーから得られる。Ａはまた、アミジン類、グアニジン類、第２級アンモニウム塩、スルホニウム塩、ホスホニウム塩、および、ＤＮＡ結合ポリアミド類および関連の天然生成物ジスタマイシンＡ、ネトロプシン中などで見出される他のカチオン性Ｃ末端基から選択され得る。

従って、Ａは、式A1、式A2、式A3、式A4、式A5、式A6、式A7、式A8、式A9、式A10、式A11 (表１)、および
{式中、Ｒ_２は、それぞれ、独立してＣ_１−５脂肪族である。}
を含み得る。

式：Ｚ−(Ｘ)_ｎ-γ^ｑ-(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａは、下記の条件を有する活性な分子を記載する。
式中、ｍ＋３は＞１０または１１である。
式中、ｎ＝ｍまたはｍ−１またはｍ−２である。
式中、イミダゾール誘導構成要素またはそのアナログは、構成要素２＋ｎ＋ｍの総数の約０〜１０％としてのみ組み込まれる；数“２”は、構成要素として存在するＺおよびγが占める。従って、２＋ｎ＋ｍ＝２２を有する活性な分子において、約０から２個のイミダゾール基が典型的に存在する(ここで、Ｚ基として使用されている可能性を含む。)。ｍは、２５ほど大きくてもよく、その結果、構成要素の総数が、５０、４０、３０、２０、１５または１０であってもよい。

式中、β−アラニンは、隣接するヘテロ環構成要素の最も長い基が約４であるよう存在し、β−アラニンは、-P-P-P-P-βおよびI-P-P-βによって例示される、２個、３個または４個の隣接するPおよび／またはI構成要素の後ろに存在する。一つの態様において、β−アラニンは、３個または４個の隣接するヘテロ環毎にその後ろに存在する。

式中、特定の縮合ヘテロ環または他のヘテロ環を控えめに用いて、ＤＮＡ結合ポリアミド類について上で記載した-P-、Im-または-I- 構成要素ZおよびX (主として-P-、Im-および-I-基を含む)を置き換え得る (Briehn, et al. (2003) Chemistry--A European Journal 9:2110-2122; .Buchmueller, et al. (2006) Abstracts of Papers, 231st ACS National Meeting, Atlanta, GA, United States, March 26-30, 2006:ORGN-678; Dervan, et al. ＰＣＴ国際公開第WO 04/078943号; Nguyen, et al. (2001) Bioorg. Med. Chem. 9:7-17; Phillion and Bashkin ＰＣＴ国際公開第WO 04/099131号; Renneberg and Dervan (2003) J. Am. Chem. Soc. 125:5707-5716; Turlington, et al. (2006) Heterocyclic Communications 12:89-92; Uthe, et al. (2005) Heterocyclic Communications 11:163-166; Zhan and Dervan (2000) Bioorg. Med. Chem. 8:2467-2474 (これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる))。このような場合において、脂肪族アミノ酸(α−、ω−アミノ酸、β−アラニンまたはγ^ｑなどを含む)は、構成要素-P-、-Im-またはI-の隣接した２〜４個(または３または４個)の置換えの後に存在する。

従って、一つの態様において、Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ中の４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)ユニットの総数は、０.１０(ｍ＋ｎ＋２)未満である。

別の態様において、Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ中の全てのβ−アラニン (式III)ユニットが、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)の少なくとも３個の連続ユニット、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)の少なくとも３個の連続ユニット、あるいは、４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルピロール (式I)および４−アミノ−２−カルボニル−Ｎ−メチルイミダゾール (式II)の何れかの組み合わせの少なくとも３個の連続ユニットに隣接している。

別の態様において、該化合物は、式：
Ｚ−(Ｐ)_３−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｐ)−(β)−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ,
[式中、ｍ＋３は、少なくとも９であり；
他の置換基は上で記載した通りである。]
を有するか、またはその薬学的に許容される塩である。

表１ ポリアミド構成要素

構成成分Ｚ、Ｘ、ＹおよびＡは、ヘテロ芳香族性縮合二環式構造(すなわち、その一方の環がヘテロ芳香族性であり、他方が芳香族性またはヘテロ芳香族性である構造)を含み得る。これらは、ＰＣＴ国際公開第WO 04/099131号および第WO 05/033282号(両者は言及することによって本明細書に組み込まれる)に記載されている。この構造は、二重鎖ＤＮＡの副溝中のグアニジンに結合するための水素結合アクセプターとして作用し得る。そして、該構造は、ヘテロ原子が水素結合ドナーとなるとき互変異性体を形成し得ない。二環式化合物は、連結部分、例えばアミドまたはアミド含有連結部分を含み得る。従って、一つの態様において、該化合物は、１個以上の連結部分で結合してｄｓＤＮＡのヌクレオチドと相補的にペアを形成する、少なくとも約２、４、６、８、１０以上の環状部分(例えば、本明細書で記載したヘテロ芳香族性部分および縮合二環式構造を含むヘテロ環)のシリーズを含み得る。

一つの態様において、縮合二環式構造は、他の縮合二環式構造またはヘテロ環部分(例えば、ピロールまたはイミダゾール環)に直接結合している。従って、ポリアミド中のそれぞれの縮合二環式構造の付加は、水素結合ドナー(例えばアミド・リンカーまたはアミド含有部分)の排除を可能とする。従って、ポリアミド類は、ＤＮＡの副溝における相互作用を変化させるまたは増加させることが可能である。縮合二環式構造の具体例は、以下の構造である：
ここで、Ｘ_１、Ｘ_３およびＸ_４は、独立して、さらに下で記載されており、ただし、Ｘ_４は水素結合アクセプターであるヘテロ原子であり、縮合二環式構造のそれぞれの環は、不飽和であり、５員または６員の環員を有し、また両方の環が５員の環員を有する場合を除く。上記構造の点線は、該環が、不飽和、芳香族性またはヘテロ芳香族性であることを示す。

該化合物中で水素結合アクセプターとして提供される縮合二環式構造は、一つの態様において、以下の通り特徴付けられ得る：
ここで、Ｘ_１およびＸ_２は、Ｏ、Ｓ、Ｎ、ＮＮＲ^２、ＣＲ^３、ＣＲ^４＝ＣＲ^４”、Ｎ＝ＮおよびＣＲ^４から独立して選択され；
ただし、(i) Ｘ_１およびＸ_２のそれぞれ一方が、ＣＲ^３またはＮから独立して選択されるとき、および(ii) Ｘ_１およびＸ_２のそれぞれ一方がＣＲ^４＝ＣＲ^４、ＣＲ^４＝Ｎ、Ｎ＝ＣＲ^４またはＮ＝Ｎから独立して選択されるとき、他方は、ＣＲ^４またはＮから独立して選択され；
Ｘ_３がＮ、Ｏ、Ｓ、ＣＲ^５、ＮＲ^５、ＣＲ^５＝ＣＲ^５'、ＣＲ^５＝Ｎ、Ｎ＝ＣＲ^５およびＮ＝Ｎから独立して選択され、
Ｘ^４が、Ｏ、Ｓ、ＮおよびＣＨから独立して選択され、
ただし、(i) Ｘ_３がそれぞれＣＲ^５またはＮから独立して選択されるとき、Ｘ_４がＯまたはＳから独立して選択され、(ii) Ｘ_３が、それぞれ、Ｏ、Ｓ、ＮＲ^５、ＣＲ^５＝ＣＲ^５、ＣＲ^５＝Ｎ、Ｎ＝ＣＲ^５またはＮ＝Ｎから独立して選択されるとき、Ｘ^４がＣＨまたはＮから独立して選択され；それぞれのＲ置換基(すなわち、Ｒ^２、Ｒ^３、Ｒ^４”、Ｒ^５、Ｒ^５')は、一般的に、Ｈ、または、化合物とｄｓＤＮＡとの結合を妨げないか、あるいは、結合を強化するよう作用する幾つかの他の置換基を表し、ただし、該構造は、グアニジンが結合するためのヘテロ原子が水素結合ドナーとなる互変異性体を形成しない (例えば、Ｘ^１またはＸ^２がＮＲ^２であるとき、Ｒ^２はＨ以外であり、Ｘ^３がＮＲ^５であるとき、Ｒ^５はＨ以外である)。

上記構造中の点線は、環が、不飽和(芳香族性、または、ヘテロ原子含有環の場合において、ヘテロ芳香族性)であることを示す。許容される置換基(例えばＲ)は、例えば、Ｈ、ヒドロキシ、Ｎ−アセチル、ベンジル、置換または非置換Ｃ_１−６アルキル、置換または非置換Ｃ_１−６アルキルアミン、置換または非置換Ｃ_１−６アルキルジアミン、置換または非置換Ｃ_１−６アルキルカルボキシレート、置換または非置換Ｃ_２−６アルケニル、置換または非置換Ｃ_２−６アルキニルなどから独立して選択される基を含み、炭素に結合しているとき、所望によりハロである。

縮合二環式構造の第１の環がヘテロ芳香族性であり、該構造が開始末端(すなわち“キャップ”)位置を占める例または態様において、例えばＸ_１がＮＲ^２(例えばＮ−ＣＨ_３)であるとき、Ｘ_２はＣ−Ｈであってもよい。従って、縮合二環式構造がキャップとして提供されるとき、Ｘ_３およびＸ_４の間に存在する炭素は、典型的に、該化合物の残りと第２の環の結合点である。このような例において、該構造は、例えば、以下の通り表され得る：
ここで、示されたＳＰ^２混成炭素から伸びた結合は、該構造と、該化合物の残りとを連結する。

一つの態様において、縮合二環式構造の第１の環は、以下の通りである：
ここで、Ｘ＝ＳまたはＮ−ＣＨ_３。

別の態様において、縮合二環式構造の第１の環は、以下の通りである：
ここで、Ｘ＝ＳまたはＮ−ＣＨ_３。

別の態様において、該化合物は、式：
Ｚ−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
[式中、ｍ＋３は少なくとも７であり、
他の置換基は上で記載した通りである。]
を有するか、またはその薬学的に許容される塩である。

別の態様において、本発明は、式：
−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−
[式中、ｍ＋３は少なくとも１１であり、
他の置換基は上で定義した通りである。]
を含む化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。

別の態様において、本発明は、式：
−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｐ)_２−β−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−
[式中、ｍ＋３は、少なくとも７であり、
他の置換基は上で記載した通りである。]
を含む化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。

該態様を他の観点から見れば、γ^ｑは(Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸 (式VI)であり、別の態様において、γ^ｑはγ−アミノ酪酸 (式IV)である。

該態様のうちの別の態様において、ｍは８と１１の間の整数であり、別の態様において、ｎは６と１０の間の整数である。

該態様のうちのさらに別の態様において、Ｙはβ−アラニンである。

また、該態様の別の態様において、ｍは２５以下である。

本発明のポリアミド類は、以下の化合物を含む：
[式中、Imは、Ｎ−メチル−イミダゾール (式V)であり、
Pは、メチルピロール (式I)であり、
Dpは、ジメチルアミノプロピルアミド (式VII)であり、
βは、β−アラニン (式III)であり、
Iは、Ｎ−メチルピロールのアミノ−２−カルボキシル誘導体 (式II)であり、
Taは、ビス(アミノプロピルアミン) (式VIII)である。]

本発明の代表的なポリアミドの化学構造を図６に示す。

本発明はまた、細胞取り込みおよび核局在化を改善し得るので、Ｃ末端位置にβ−アラニンがないアナログ、および、アセチル化ジアミノγターンを有するアナログを含む (Best, et al, (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100:12063-68; Crowley, et al. (2003) ＰＣＴ国際公開第WO 03/041128号; Crowley, et al. (2003) Bioorg. Med. Chem. Lett. 13:1565-70; Edelson, et al. (2004) Nucl. Acids Res. 32:2802-18; これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる)。

別の態様において、本ポリアミド類は、下記の１以上によって修飾され得る：(１) 本ポリアミドとカチオン性ジアミン尾部Dpを連結するβ−アラニンを除く；(２) トリアミン(Ta)カチオン性尾部を用いて活性なスペルミジン取り込み経路にアクセスする；および(３) ポリアミド類の等電点(ｐＩ)を低下させ、酸性小胞中での集積を減少させる。幾つかの態様において、本ポリアミド類は、修飾１、２および３の全てで変更される。

さらに別の態様において、本ポリアミド類は、Ｃ末端に、ＦＩＴＣ(フルオレセインイソチオシアネート)、ＢＩＯＤＩＰＹ、または細胞局在化を測定するのに用いられ得る他の化合物を含む。幾つかの態様において、ＦＩＴＣをＣ末端に含むポリアミド類が、細胞によって、より容易に取り込まれる。

また、別の態様において、ヘアピン構造の形成に加えて、図８に示した通り、本ポリアミド類は二量体を形成することができ、その幾つかが連結している。従って、Dervan に記載されたこれらの代替ポリアミドモチーフを用いて、活性なヘアピンのアナログを作成し得る。例えば、Dervan and Edelson (2003) Curr. Opin. Struct. Biol. 13:284-99 (言及することによって本明細書に組み込まれる)を参照のこと。

さらに別の態様において、本ポリアミド類は、ＨＰＶ１８、ＨＰＶ１６、ＨＰＶ１１、ＨＰＶ６、またはＨＰＶ１を標的とする。

さらなる態様において、本ポリアミド類は、エプスタイン・バーウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルスおよび他の二重鎖ＤＮＡウイルスを含むＤＮＡウイルスを標的とする。これらのウイルス内の可能性のある標的は、固定、維持または複製に必要な配列を含み得る。

B. 一般的な合成スキーム
本明細書で記載したポリアミド類は市販されているか、または既知の方法によって既知の出発物質から製造され得る。例えばWO 05/033282, Belitsky et al., (2002) Bioorg. Med. Chem., 10, 2767-74; Zhang, et al. (2006) J. Am. Chem. Soc. 128:8766-76; Turner, et al. (2001) Organic Letters, 3:1201-03 (これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれている)を参照のこと。

ポリアミド類は、手動固相合成および自動固相合成を用いて製造され得る。それぞれのカップリングは、ＨＰＬＣおよびＨＰＬＣ／質量分析(またはＭＷが１５００を越えるときはＭＡＬＤＩ質量分析)で行われる。

溶液相ポリアミド合成において、２種の主要なアミド結合形成経路が用いられ得る：(１) ハロ型反応；および(２) アミンを酸と、ＤＣＣ、ＥＤＣまたはＨＡＴＵなどのカップリング剤の存在下(必要なとき)で反応させること。我々のヘテロ環構成要素において、該ハロ型反応は、関連のトリクロロケトンが塩化トリクロロアセチルおよび該ヘテロ環から直接製造され得ることから、Xiao et al., (2000) Chin. J. Chem, 18:603-07 および Xiao et al., (2000) J. Org. Chem., 65:5506-13 (両者は言及することによって本明細書に組み込まれている)に記載された方法であり得る(スキームＩ)。
スキームＩ：ハロ型反応−出発物質の製造およびダイマー形成における使用

スキームＩの段階は、Ｈ_２およびＰｄ／Ｃでのニトロ基の還元によって行われる。得られた遊離アミノ基は、保護されてもよいし、あるいは、すぐにさらなる構成要素とカップリングされてもよい。ポリアミド全体を合成するための溶液法の使用をスキームIIに説明する。共通の構成要素はポリアミドで識別され、十分な溶液相合成を可能とする：P-Pダイマーは、大規模で合成され精製され、次いでスキームIIの通りにそのまま直接用いられるか、さらに加工され、標的配列の主要なセクションを形成し、次いで最終生成物を形成する。

スキームII

スキームIIは、トリマー由来の活性なポリアミドとモノマー構成要素の溶液相の集合に基づくスケールアップ戦略を示す。共通のP-Pユニットを加工し、分子全体を形成する。さらなるピロールを示す。さらにβ−アラニンを示し、分子中で２度Ｎ−β−アラニン-Py-Py-Pyフラグメントが見られる(角括弧によって示す)。３つの最終の独特のフラグメントも見られる。例えば、Xiao, et al., J. Org. Chem (2000) 65:5506-13 (言及することによって本明細書に組み込まれる)を参照のこと。

ピロール−イミダゾール ポリアミドを製造する別の方法は、米国特許公報第US 2004/0171799号(これは言及することによって本明細書に組み込まれる)に記載されている。

合成のさらに別の方法は、Ｂｏｃ−β−アラニン−WANG固相合成樹脂または同様の市販の樹脂から開始し、標的配列に必要な構成要素を付加することによって、ポリアミド・オリゴマーを製造することである(実施例８を参照のこと)。

ポリアミド化合物の構造は、それぞれのユニットを付加した後、および最終合成段階の後、ＭＡＬＤＩ質量スペクトルで特性決定される。測定は、Peptides International (Louisville KY)で行った。ポリアミド類は、分取ＨＰＬＣによって９８％以上の純度まで精製され得る(２度目の分取ＨＰＬＣが必要な場合がある)。分析ＨＰＬＣおよび質量スペクトル(ＭＡＬＤＩ)が最終生成物の存在および失敗した配列がないことを示した後、最終生成物のＨＰＬＣフラクションを合わせた。

V. 医薬組成物
A. 製剤
本発明の別の態様において、薬学的に許容される組成物は、これらの組成物が本明細書で記載した化合物の何れかを含み、また所望により薬学的に許容される担体、アジュバント、またはビークルを含んで提供される。特定の態様において、これらの組成物は、所望によりさらに１種以上のさらなる治療薬を含む。

ポリアミド類は、トリフルオロ酢酸(ＴＦＡ)塩の形態、ならびに塩酸塩、コハク酸塩、アスコルビン酸塩などの形態であり得る。これらはまた、例えばPEG-400、プロピレン グリコールなどの賦形剤と共に製剤化され得る。

安定性を増加させるように、ポリアミド薬物は、抗酸化剤、例えばアスコルビン酸、ＢＨＴおよびＢＨＡを含む水溶液中で、より安定な製剤を開発するために水溶液中に調製される (Mayers CL, et al (1993) Pharma Res, 10: 445-448、および Stuhar M, (1984) Farmaceuticky Obzor, 53; 499-504 (共に言及することによって本明細書に組み込まれる)を参照のこと)。

膣および子宮頸に送達するために、ポリアミド類は、溶液、エマルジョン、懸濁液、錠剤、ゲル、泡状物質、坐剤、フィルム、スポンジ、および膣リングで製剤化される。製剤は、ゲル(例えばヒドロキシエチルセルロースおよびポリアクリル酸、例えばCarbopols)、および、標的部位へのアプリケーターによって投与され得るポリビニルアルコールフィルムを含む。あるいは、より粘性の低い液体製剤(例えばPEG溶液)は、子宮頸の周囲にポリウレタンスポンジで送達され得る (Okada, (1991) in “Peptide and Protein Drug Delivery” V.H. Lee, ed., pp. 663-666, Marcel Dekker, NY; Garg, et al. (2001) Pharm. Tech. 25:14-24 (共に言及することによって本明細書に組み込まれる))。ポリアミド類の電荷によって、ポリアミド類は、Carbopolsを用いることによって制御送達ビークルで製剤化され得る。もしポリアミド類が＋１または＋２の電荷を有するならば、製剤のイオン強度を調節することによって、ポリアミドが該Carbopolに電気的に安定に結合し、それによって、放出速度が制御される。化学的および物理的に安定なＰＡ類を生じる全ての半固体投与形において、半固体投与形からの薬物拡散について、米国薬局方に記載された膜装置で放出速度を評価する (Dipiano, et al., ＰＣＴ国際公開第WO 04/064913号(言及することによって本明細書に組み込まれる)。carbopolをベースとするゲルで製剤化されたポリアミド類は、著しい降伏応力を示し、また、潜在的な生体接着性を有する (Kieweg, et al. (2004) J. Pharm Sci. 93, 2941-52 (言及することによって本明細書に組み込まれる))。

表２に、市販の膣用製剤に用いられる一定の範囲の賦形剤を、評価するために選択した
(Garg et al., 2001)。幾つかの一般的に用いられる賦形剤、例えばPEG(ポリエチレングリコール)、PVA(ポリビニルアルコール)およびTween界面活性剤もまた加えられ得る。抗酸化剤に加えて、さらに、相容剤(compatabilizer)または安定剤も用いられ得る。固体形態は、その物理的状態により、より長い貯蔵寿命を有する、より安定な製剤となり得る。ポリマー(例えばcarbopol)を用いた生体接着剤から製造され得るエマルジョンは有用であり得る。HPMC(ヒドロプロピルメチルセルロース)、PVA (ポリビニルアルコール)および脂質複合体もまた、溶解性の低い薬物で用いられ得る。脂質系は、不溶性ポリアミドを送達するための粘弾性ゲル中に懸濁され得る。

表２. ポリアミド類をラフト培養物およびウサギの子宮頸へ経皮送達するための第１製法

より保持される送達またはより有効な送達のために、薬物を長時間に亘って子宮頸部位で送達し得る利用可能な子宮頸バリアデバイス、例えばペッサリーを用い得る。さらにより連続的な送達のために、膣リングまたは徐放性の埋め込み可能なポリマーフィルムを用いてもよい。さらに、臨床試験における幾つかの新規の膣用送達系、例えば、薬物を子宮頸および膣壁の両方に送達し得る膣用スポンジ法およびＳＩＬＣＳペッサリー、１サイズシリコンデバイス(Cohen, (2004) The Microbiocide Quarterly, 2:15-19 (言及することによって本明細書に組み込まれる))を用いてもよい。延長された時間に亘る薬物の改善された連続送達のために、膣リングは、リングの構成要素からの薬物のゆっくりとした放出に利用可能である (Cohen, 2004; Hussain and Ahsan, (2005), J. Controlled Release 103:301-13 (言及することによって本明細書に組み込まれる))。また、制御された膣の薬物送達のために開発された多くの他のアプリケーターおよび製剤がある (Robinson (1999) Proc. Of the 26^th Intl. Symp. Controlled Release of Bioactive Materials, 26:2-3 (言及することによって本明細書に組み込まれる; Hussain and Ahsan, 2005)。

経皮送達用製剤は、生殖器の疣贅へのタンパク質医薬の送達のための脂質をベースとする製剤(Foldvari et al., (1999), Biotech. Appl. Biochem. 30:129-37; Leigh (2003) Drugs and the Pharm. Sci., 126:791-800; Lee et al., (2004) Biomaterials, 26:205-10 (これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる))、生体接着製剤(Bogataj and Mrhar (1998) Bioadhesive mucosal drug delivery systems, 49:445-57; Amaral et al. (1999) Contraception, 60:361-66; Barry, (1987) in “Drug Delivery systems”, Johnson and Lloyd-Jones, eds, Ch. 11, Ellis Horwood, Chichester; Vermani, et al. (2002) Drug Dev. Indust. Pharm. 28:1133-46 (これらは全て言及することによって本明細書に組み込まれる))、および新規のポリマー系を含む。新規のポリマーは、部分的に吸収可能な生体分解性抗ウイルス性膣内リング (Shalaby, (2005) 米国特許出願公開第2005/053639号(言及することによって本明細書に組み込まれる))、子宮頸に直接適用される２層生体接着性ポリマーフィルム (Sidhu et al., (1997) Br. J. Obstetrics and Gynaecology, 104:145-49 (言及することによって本明細書に組み込まれる)、新規の子宮頸の粘膜でゆっくりと放出されるポリマーディスク、および生体接着性が非常に上昇し、かつ薬物の保持性が非常に上昇する可能性があるという利点を有する熱ゲル化系 (Saltzman and Radomsky (1990) Polymer Preprints, 31:245-46; Edelman and Mark (1998) Nature Biotech, 16:136-37 (両者は言及することによって本明細書に組み込まれる))を含む。ポリアミド類はまた、細胞膜浸透ペプチドを用いて製剤化されてもよい (Gupta, et al. (2005) Adv. Drug Del Rev. 57:637-51; Wadia and Dowdy (2005) Adv. Drug Del. Rev., 57:579-96 (両者は言及することによって本明細書に組み込まれる))。

ポリアミド類はまた、腎クリアランスまでの時間を長くするよう設計された薬学的に許容されるポリマーと共に製剤化され得る。

ポリアミド類はまた、肺のエアゾール処置で送達されるよう製剤化され得る。

本発明の特定の化合物は、処置のために遊離形で存在してもよく、また、適切な場合は、その薬学的に許容される誘導体またはプロドラッグとして存在してもよいことが認められるであろう。本発明に従って、薬学的に許容される誘導体またはプロドラッグは、薬学的に許容される塩、エステル、該エステルの塩、あるいは、必要な患者への投与後に本明細書で記載した化合物またはその代謝物もしくは残留物を直接または間接的に提供し得る他の何れかの付加物または誘導体を含み、これらに限定されない。

本明細書で用いるとき、“薬学的に許容される塩”という用語は、通常の医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激性、アレルギー反応などを示さない、ヒトおよび下等動物の組織と接触して使用するのに適当な、かつ妥当な利益／リスク比を有する塩を言う。“薬学的に許容される塩”は、患者への投与後に、本発明の化合物または阻害活性な代謝物もしくは残留物を直接または間接的に提供し得る、何れかの非毒性の塩またはエステルの塩を意味する。

薬学的に許容される塩は当技術分野で周知である。例えば、S. M. Berge, et al.は、薬学的に許容される塩を、J. Pharmaceutical Sciences, 1977, 66, 1-19 (言及することによって本明細書に組み込まれる)に、詳細に記載している。本発明の化合物の薬学的に許容される塩は、適当な無機および有機の酸および塩基から誘導されるものを含む。薬学的に許容される非毒性の酸付加塩の例は、無機酸、例えば塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸および過塩素酸と形成されるアミノ基の塩であるか、または、有機酸、例えば酢酸(トリフルオロ酢酸を含む)、シュウ酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸またはマロン酸と形成されるアミノ基の塩であるか、または、例えばイオン交換などの当技術分野で用いられる他の方法を用いることによって形成される塩である。他の薬学的に許容される塩は、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、カンファー酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、蟻酸塩、フマル酸塩、グルコヘプタン酸塩、グリセロリン酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、２−ヒドロキシ−エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩(pectinate)、過硫酸塩、３−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、ｐ−トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などを含む。適当な塩基から誘導される塩は、アルカリ金属塩、アルカリ土類金属塩、アンモニウム塩およびＮ^＋(Ｃ_１−４アルキル)_４塩を含む。本発明はまた、本明細書で開示された本化合物の何れかの塩基性窒素含有基の四級化を意図する。水溶性または油溶性、または水または油に分散可能な製剤は、このような四級化によって得られ得る。代表的なアルカリ金属またはアルカリ土類金属の塩は、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどの塩を含む。さらに薬学的に許容される塩は、適切なときには、非毒性のアンモニウムカチオン、四級化アンモニウムカチオン、およびアミンカチオンと、カウンターイオン、例えばハロゲン化物イオン、水酸化物イオン、カルボン酸イオン、硫酸イオン、リン酸イオン、硝酸イオン、低級アルキルスルホン酸イオン、およびアリールスルホン酸イオンを用いて形成される塩を含む。

上記の通り、本発明の薬学的に許容される組成物は、さらに、薬学的に許容される担体、アジュバントまたはビークルを含み、本明細書で用いるとき、それらは、望ましい特定の投与形に適当な何れかのおよび全ての溶媒、希釈剤または他の液体ビークル、分散物または懸濁助剤、界面活性剤、等張剤、濃化剤、または乳化剤、保存料、固体結合剤、滑沢剤などを含む。Remington's Pharmaceutical Sciences, Sixteenth Edition, E. W. Martin (Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1980)は、薬学的に許容される組成物の製剤に用いられる種々の担体およびその既知の製造方法を開示している。慣用の担体は、例えば望ましくない何れかの生物学的効果を生じるか、または薬学的に許容される組成物の他の何れかの成分と心身に有害な方法で相互作用することによって、本発明の化合物と相容性でない場合を除いて、その使用は、本発明の範囲内であることが意図されている。薬学的に許容される担体として提供され得る幾つかの物質の例は、イオン交換剤、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、血清タンパク質、例えばヒト血清アルブミン、緩衝剤、例えばリン酸塩、グリシン、ソルビン酸、またはソルビン酸カリウム、植物性飽和脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩または電解質、例えば硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、ポリアクリレート、蝋、ポリエチレン−ポリオキシプロピレン−ブロックポリマー、羊毛脂、糖、例えば乳糖、ブドウ糖、およびショ糖；澱粉、例えばトウモロコシ澱粉およびじゃがいも澱粉；セルロースおよびその誘導体、例えばカルボキシメチルセルロース ナトリウム、エチルセルロース、および酢酸セルロース；粉末状トラガカントゴム；麦芽；ゼラチン；タルク；賦形剤、例えばカカオバターおよび坐剤用蝋；油脂、例えば落花生油、綿実油、紅花油、ごま油、オリーブ油、トウモロコシ油、および大豆油；グリコール、例えばプロピレングリコールまたはポリエチレングリコール；エステル類、例えばオレイン酸エチルおよびラウリン酸エチル；寒天；緩衝剤、例えば水酸化マグネシウムおよび水酸化アルミニウム；アルギン酸；パイロジェンを含まない水；等張性食塩水；リンゲル溶液；エチルアルコール、およびリン酸緩衝溶液、ならびに他の非毒性相容性滑沢剤、例えばラウリル硫酸ナトリウムおよびステアリン酸マグネシウム、ならびに着色料、放出剤、被覆剤、甘味料、風味剤および香料、保存料および抗酸化剤を含み、これらに限定されない。これらは、製剤する者の判断に従って組成物中に存在し得る。

本発明に従って、本化合物または薬学的に許容される組成物の“有効量”は、ＨＰＶ感染を処置するまたはその重症度を軽減するのに有効な量である。

B. 投与
本発明の方法に従って、医薬組成物は、慢性ＨＰＶ疾患を処置するまたはその重症度を軽減するのに有効な、何れかの量および何れかの経路の投与を用いて投与され得る。

正確な必要量は、対象の種、年齢、性別、体重、食事、医学的状態および全身の状態、感染の重症度、特定の薬物、その投与方法などに依存して、対象ごとに異なる。投与計画に影響を与える他の因子は、用いられる化合物の薬理学的考察、例えば活性、有効性、薬物動態、および毒性プロファイルを含み、また薬物送達系が用いられるかどうか、および本化合物が他の成分と共に投与されるかどうかを含む。投与量は、慣例的に、当技術分野に既知の標準的な方法を用いて決定され得る。実際に用いられる投与計画は、従って、処置される対象に基づいて広く変化し得る。また、その結果下記の投与計画の例から逸脱してもよい。本発明の化合物は、好ましくは、投与が容易で、かつ投与量が一定となる単位投与形で製剤される。“単位投与形”という表現は、本明細書で用いられるとき、処置される患者に適切な薬物の物理的に別個の単位を言う。しかしながら、本化合物の１日使用量の総量は、適切な医学的判断の範囲内で主治医によって決定されると理解されるであろう。何れかの特定の患者または生物において特定の有効投与量は、処置される疾患および疾患の重症度；用いられる特定の化合物の活性；用いられる特定の組成物；患者の年齢、体重、一般的な健康、性別および食事；用いられる特定の化合物の投与時間、投与形路および排出速度；処置の持続時間；用いられる特定の化合物と組み合わせて、またはそれと同時に用いられる薬物などの医学業界で既知の因子を含む種々の因子に依存する。“患者”という用語は、本明細書で用いられるとき、動物、例えば哺乳類またはヒトを意味する。

本化合物の投与は、１日１回投与、１日多回の間隔を空けた投与、１日置きに１回投与、数日毎に１回投与を必要とする投与計画で、または他の適切な投与計画で行われ得る。

例えば、製剤化されたポリアミド類は、１日１回、最終濃度５mg/mL(約２.５mM)で、約４mlのビークル中で、膣用アプリケーターを用いて、例えば後膣円蓋に投与され得る。もし睡眠前の夜に投与されるならば、移動しないために、膣管の最も高い部分に、すなわち子宮頸近くに、最も多くの薬物が保持されると予想される。一つの態様において、ポリアミド製剤は、１０日間投与される。

本発明の薬学的に許容される組成物は、ヒトおよび他の動物に、経口で、直腸に、非経腸で、大槽内に、膣内に、腹腔内に、局所に(粉末、軟膏または滴剤によって)、頬側に、口用または鼻用スプレーなどとして、処置される感染の重症度に依存して、投与され得る。特定の態様において、本発明の化合物は、経口または非経腸で、１日当たり約０.０１mg/kg体重から約５０mg/kg体重、好ましくは約１mg/kg体重から約２５mg/kg体重、１日１回以上投与して、望ましい治療効果が得られる。

経口投与のための液体投与形は、薬学的に許容されるエマルジョン、マイクロエマルジョン、溶液、懸濁液、シロップおよびエリキシルを含み、これらに限定されない。活性な化合物に加えて、液体投与形は、当技術分野で一般的に用いられる不活性な希釈剤、例えば水または他の溶媒、可溶化剤および乳化剤、例えばエチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、１,３−ブチレングリコール、ジメチルホルムアミド、油脂(特に綿実油、落花生油、トウモロコシ油、胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油およびごま油)、グリセロール、テトラヒドロフルフリルアルコール、ポリエチレングリコール類およびソルビタンの脂肪酸エステルおよびその混合物を含み得る。不活性な希釈剤の他にも、経口の組成物はまた、アジュバント、例えば湿化剤、乳化剤および懸濁剤、甘味料、風味剤および香料を含み得る。

注射可能な製剤は、例えば滅菌された注射可能な水性または油性懸濁液は、既知の方法に従って、適当な分散剤または湿化剤および懸濁剤を用いて製剤化され得る。滅菌された注射可能な製剤はまた、非毒性の非経腸で許容される希釈剤または溶媒中で、例えば１,３−ブタンジオールの溶液として、滅菌された注射可能な溶液、懸濁液またはエマルジョンであってもよい。用いられ得る許容されるビークルおよび溶媒は、水、リンゲル溶液(米国薬局方)、および等張性塩化ナトリウム溶液である。さらに、滅菌された固定油は、溶媒または懸濁媒体として慣用的に用いられる。この目的のために、合成モノまたはジグリセリドを含む全ての混合固定油が用いられ得る。さらに、脂肪酸、例えばオレイン酸は、注射剤の製造に用いられる。

注射可能な製剤は、例えば滅菌フィルター(bacterial-retaining filter)での濾過によって、滅菌された水または他の滅菌された注射可能な媒体に使用前に溶解または分散され得る滅菌された固体組成物の形態で滅菌処理された薬物を用いることによって滅菌され得る。

本発明の化合物の効果を延長するために、しばしば本化合物の皮下または筋肉内注射からの吸収を遅らせることが望ましい。このことは、水への溶解度が低い結晶性または無晶性物質の液体懸濁液の使用によって達成され得る。本化合物の吸収速度はその溶解速度に依存し、溶解速度はまた、結晶の大きさおよび結晶形に依存し得る。あるいは、非経腸で投与された化合物の形態の遅延吸収は、油性ビークル中に本化合物を溶解または懸濁することによって達成される。注入可能なデポー剤の形態は、生体分解ポリマー(例えばポリラクチド−ポリグリコリド)中に本化合物のマイクロカプセル・マトリックスを形成することによって製造される。化合物とポリマーの比および用いられる特定のポリマーの性質に依存して、化合物の放出速度は制御され得る。他の生体分解ポリマーの例は、ポリ(オルトエステル)およびポリ(無水物)を含む。デポー注入可能製剤はまた、本化合物を、リポソームまたは体内組織に相容性であるマイクロエマルジョン中にトラップすることによって製造される。

直腸または膣の投与のための組成物は、本発明の化合物を、環境温度で固体であるが体温で液体であって、その結果直腸または膣腔内で溶解し活性な化合物を放出する適当な非刺激性賦形剤または担体、例えばカカオバター、ポリエチレングリコールまたは坐剤用蝋と混合することによって製造され得る坐剤であり得る。

経口投与のための固体投与形は、カプセル、錠剤、丸薬(pill)、粉剤および顆粒剤を含む。このような投与形において、活性な化合物は、少なくとも１種の不活性な薬学的に許容される賦形剤または担体、例えばクエン酸ナトリウムまたはリン酸二カルシウム、および／または、(ａ)充填剤または増量剤、例えば澱粉、乳糖、ショ糖、ブドウ糖、マンニトールおよびケイ酸、(ｂ)結合剤、例えばカルボキシメチルセルロース、アルギネート類、ゼラチン、ポリビニルピロリジノン、ショ糖およびアラビアゴム、(ｃ)湿潤剤、例えばグリセロール、(ｄ)崩壊剤、例えば寒天、炭酸カルシウム、じゃがいも澱粉またはタピオカ澱粉、アルギン酸、特定のシリケート類、および炭酸ナトリウム、(ｅ)溶液遅延剤、例えばパラフィン、(ｆ)吸収促進剤、例えば四級アンモニウム化合物、(ｇ)湿化剤、例えばセチルアルコールおよびモノステアリン酸グリセロール、(ｈ)吸収剤、例えばカオリンおよびベントナイト・クレイ、および(ｉ)滑沢剤、例えばタルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール類、ラウリル硫酸ナトリウム、およびその混合物と混合される。カプセル、錠剤および丸薬の場合では、投与形はまた、緩衝剤を含んでもよい。

同様のタイプの固体組成物はまた、軟および硬ゼラチンカプセル中に充填剤として、例えば乳糖またはミルクシュガーおよび高分子量ポリエチレングリコールなどの賦形剤を用いて用いられ得る。錠剤、糖衣錠、カプセル、丸薬および顆粒剤の固体投与形は、コーティングおよびシェル、例えば腸溶性コーティングおよび他の製薬業界で周知のコーティングを有して製造され得る。それらは、所望により不透明化剤を含んでもよく、また、活性な成分のみを、好ましくは腸管の特定の部位で、所望により遅延した方法で、放出する組成物であり得る。用いられ得る埋め込み組成物(embedding composition)の例は、ポリマー物質および蝋を含む。同様のタイプの固体組成物はまた、軟および硬ゼラチンカプセル中に充填剤として、例えば乳糖またはミルクシュガーおよび高分子量ポリエチレングリコールなどの賦形剤を用いて用いられ得る。

活性な化合物はまた、上記の１種以上の賦形剤と共にマイクロカプセルに入れた形態であってもよい。錠剤、糖衣錠、カプセル、丸薬および顆粒剤の固体投与形は、コーティングおよびシェル、例えば腸溶性コーティング、放出制御コーティング、および他の製薬業界で周知のコーティングを有して製造され得る。このような固体投与形において、活性な化合物は、少なくとも１種以上の不活性な希釈剤、例えばショ糖、乳糖または澱粉と混合され得る。このような投与形はまた、一般的な慣行の通り、不活性な希釈剤以外のさらなる物質、例えば錠剤滑沢剤および錠剤化助剤、例えばステアリン酸マグネシウムおよび微晶性セルロースを含んでもよい。カプセル、錠剤および丸薬の場合、投与形はまた、緩衝剤を含んでもよい。それらは、所望により不透明化剤を含んでもよく、また、活性な成分のみを、好ましくは腸管の特定の部位で、所望により遅延した方法で、放出する組成物であり得る。用いられ得る埋め込み組成物の例は、ポリマー物質および蝋を含む。

本発明の化合物の局所または経皮投与のための投与形は、軟膏、ペースト、クリーム、ローション、ゲル、粉剤、溶液、スプレー、吸入剤またはパッチを含む。活性な成分は、滅菌された条件下で、薬学的に許容される担体および何れかの必要な保存料、および必要であれば緩衝剤と混合される。眼用製剤、点耳薬、および点眼薬はまた、本発明の範囲内である。さらに、本発明は、化合物の身体への制御送達を提供するという、さらなる利点を有する経皮パッチの使用を意図している。このような投与形は、適切な媒体に本化合物を溶解または分散することによって製造される。吸収増強剤はまた、本化合物が皮膚を通過する流れを増加させるために使用され得る。速度は、速度制御膜を提供することによって、あるいは、ポリマーマトリックスまたはゲル中に本化合物を分散することによって、制御され得る。

上で一般的に記載した通り、本発明の化合物は、慢性ＨＰＶ疾患を含むＨＰＶ疾患の処置として有用である。

１種以上の本発明の化合物を別個に、同時に、または連続して、感染した細胞に、感染した細胞を含む組織に、感染した臓器に、哺乳類および患者を含む感染した生物に投与され得る。

本発明の化合物および薬学的に許容される組成物は、併用治療に用いられ得ると認識されるであろう。すなわち、本化合物および薬学的に許容される組成物は、１種以上の他の望ましい治療薬または医学的手段と同時に、その前に、またはその後に、投与され得る。併用治療計画に用いるための特定の併用治療(治療または方法)は、望ましい治療および／または方法、ならびに達成されるべき望ましい治療効果の相容性を考慮する。用いられる治療は、同一の疾患における望ましい効果を達成し得る(例えば本発明の化合物が同一の疾患を処置するために用いられる他の薬物と同時に投与され得る)こと、あるいは、異なる効果を達成し得る(例えば副作用の制御)ことが認識されるであろう。本明細書で用いるとき、特定の疾患または状態を処置または予防するために通常投与される さらなる治療薬は、“処置される疾患または状態に適切である”ことが知られている。

本発明の組成物中に存在するさらなる治療薬の量は、活性な薬物のみとして治療薬を含む組成物において通常投与される量よりも多くない。好ましくは、本明細書に開示された組成物中のさらなる治療薬の量は、治療的に活性な薬物のみとして該薬物を含む組成物中に通常存在する量の５０％から１００％の範囲の量である。

本発明の化合物またはその薬学的に許容される組成物はまた、埋め込み可能な(implantable)医学デバイス、例えばプロステーシス、人工弁、血管用グラフト、ステントおよびカテーテルを被覆する組成物に混合され得る。従って、本発明は、別の態様において、埋め込み可能なデバイスを被覆するための組成物であって、本明細書のクラスおよびサブクラスの上で一般的に記載した本発明の化合物、および埋め込み可能なデバイスを被覆するのに適当な担体を含む組成物を含む。また、別の態様において、本発明は、本明細書のクラスおよびサブクラスの上で一般的に記載した本発明の化合物、および、埋め込み可能なデバイスを被覆するのに適当な担体を含む組成物で被覆された埋め込み可能なデバイスを含む。適当なコーティングおよび被覆された埋め込み可能なデバイスの一般的な製造は、米国特許第6,099,562号；第5,886,026号；および第5,304,121号に記載されている。コーティングは、典型的に、生体適合性ポリマー物質、例えばヒドロゲルポリマー、ポリメチルジシロキサン、ポリカプロラクトン、ポリエチレン グリコール、ポリ乳酸、エチレンビニル アセテート、およびその混合物である。該コーティングは、所望により、フルオロシリコン、ポリサッカライド、ポリエチレングリコール、リン脂質またはその組み合わせの適当なトップコートによって、さらに被覆され、組成物に制御放出特性を与え得る。

VI. 処置方法
本発明の別の態様は、ＨＰＶまたはパピローマウイルスに感染した細胞を処置すること、または、生物サンプルまたは患者中の他のパピローマウイルスを処置すること(例えばin vitroまたはin vivo)に関する。該方法は、患者(ヒトまたは他の動物)に、本明細書で記載したポリアミドを含み医薬組成物を投与すること、あるいは、該生物学的サンプルと、該医薬組成物を接触させることを含む。“生物学的サンプル”という用語は、本明細書で用いるとき、細胞培養物またはその抽出物；哺乳類またはその抽出物から得られる細胞診物質；および血液、唾液、尿、糞便、精液、涙または他の体液またはその抽出液を含み、これらの限定されない。“患者”という用語は、動物を含み、哺乳動物、ヒト、霊長類、イヌ、ネコ、ウマ、ブタ、ウシ、ヒツジなどを含む。

個々の細胞をＨＰＶに曝露し感染させた後、多数のＨＰＶエピソーム複製が感染した細胞内に確立され得る。ＨＰＶエピソームは、さらに、細胞分割時に複製され、ほぼ同数のＨＰＶエピソーム複製を新しい細胞中にそれぞれ形成する(例えば細胞分割後、２０〜１００の複製を含む細胞は、それぞれ約２０〜１００のエピソーム複製を含む２個の新しい細胞を形成する)。A/Tリッチ領域を標的とするよう設計されたポリアミド類は、ＨＰＶエピソームのクリアランスを促進し得る。従って、本発明の方法はまた、ＨＰＶを処置するための治療方法として有益に用いられ得る。

ＨＰＶまたは他のパピローマウイルスを処置するために用いられるポリアミド類は、本明細書に記載されたものを含み、これらに限定されない。

一つの態様において、本発明は、ＨＰＶ感染細胞を処置する方法であって、該細胞を本明細書に記載した化合物と接触させることを含む方法を提供する。本発明の一つの態様において、該方法は、さらに、該細胞を抗ウイルス剤と接触させることを含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスまたはポドフィルムであり得る。

別の態様において、本発明は、患者または対象において、ＨＰＶ感染細胞を処置する方法であって、患者または対象に、本明細書で記載した化合物または医薬組成物を投与することを含む方法を提供する。本発明の一つの態様において、本方法は、さらに、該細胞を抗ウイルス剤と接触させることを含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックスまたはポドフィルムであり得る。別の態様において、該ＨＰＶは、ＨＰＶ１１、ＨＰＶ１６、ＨＰＶ１８、ＨＰＶ１、ＨＰＶ６またはＨＰＶ３１であり得る。

別の態様において、本発明は、ＨＰＶ１６感染細胞を処置する方法であって、患者に、式
Ｚ−(Ｘ)_ｎ−γ^ｑ−(Ｘ)_ｍ−Ｙ−Ａ
[式中、ｍ＋３は少なくとも１０であり；
他の置換基は上記の通りである。]
の化合物またはその薬学的に許容される塩を投与することを含む方法を提供する。

さらに別の態様において、本発明は、患者に、
から選択される化合物を投与することによって、ＨＰＶ１６感染細胞を処置する方法を提供する。

該態様を他の観点から見れば、該方法は、さらに、抗ウイルス剤を投与することを含む。該抗ウイルス剤は、インターフェロン類、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックス、ポドフィルム、アシクロビルおよび他のヘルペス／サイトメガロウイルス薬、および抗ＨＩＶ剤であり得る。

幾つかの態様において、ＨＰＶ感染細胞を処置するために用いられるポリアミド類は、
の群から選択される構造を有する。

別の態様において、ＨＰＶ感染細胞を処置するために用いられるポリアミド類は、
[ここで、FITCは、フルオレセインのイソチオシアネートの形態を言う。]
の群から選択される構造を有する。

別の態様において、ＨＰＶ感染細胞を処置するために用いられるポリアミド類は、
から選択される。

また、別の態様において、ＨＰＶ感染細胞を処置するために用いられるポリアミド類は
から選択される。

また、別の態様において、ＨＰＶ感染細胞を処置するために用いられるポリアミド類は
から選択される。

さらにまた、別の態様において、該ポリアミド類は、他の抗ウイルス剤、例えば、インターフェロン類(例えばインターフェロン−γおよびインターフェロン−β)、イミキモド、シドホビル、ホルムアルデヒド、グルタラール、シメチジン、５−フルオロウラシル、トリクロロ酢酸、ブレオマイシン、ポドフィロックス、ポドフィルム、アシクロビルおよび他のヘルペス／サイトメガロウイルス処置薬、および抗ＨＩＶ薬(これらに限定されない)と組み合わせて用いられる。該ポリアミド類はまた、光線力学的療法、放射線療法および化学療法と組み合わせて用いられ得る。

本明細書に記載された本発明を完全に理解するために、以下の実施例を示す。これらの実施例は、説明の目的のみのためであり、本発明を何れの意味でも限定すると解釈するべきではないことが理解されるべきである。

実施例１： ポリアミド類および他の抗ＨＰＶ化合物
２０種以上のポリアミド類をA/T−リッチ領域を標的とするよう設計した。また、コントロール化合物および細胞取り込み試験のためにＢＯＦＬＸおよびＦＩＴＣ色素標識アナログを調製した。ヘアピン・ターンを、γ−アミノ酪酸および(Ｒ)−２,４−ジアミノ酪酸の両方から構成した (Baird and Dervan, 1998)。

5'-WWG-3'部位はＰＡ認識に重要であり、ここで、Ｗ＝AまたはTである。Ｅ１標的領域において、ＨＰＶ１６は幾つかのＷＷＧ認識モチーフ(太字および１〜５の番号が付けてある, 下記参照)を有する。ＨＰＶ１６の変異株は、下線の部位でGを有する。従って、４に続く長いATは変異体で保持されていない。

該化合物および質量分析データを表３に示す。

表３ ポリアミド類の質量スペクトルデータ

*: ＭＷを、ＬＣＭＳ−ＥＳＩまたは直接プローブＥＳＩによって決定した。アスタリスク*のない全ての化合物を、ＭＡＬＤＩ−ＭＳによって分析した。
(M+H₂+H)⁺: 質量分析条件は、時には、見かけ上、‘気相水素化’のポリアミドを生じ、Ｍ＋２のＭＷをもたらす。この現象は、以前に、James K. Bashkinによって、他のヘテロ芳香族性ポリアミド分子で観察された。バルク物質のＮＭＲ試験により、本化合物の溶解したサンプル中で、水素化された種が存在しないことが、以前に示されている。

ポリアミド 1011は、ＰＣＴ国際出願WO 04/099131に以前に記載されている；ポリアミド 1012、1014、1017および1021は、ＰＣＴ国際出願WO 98/37067に記載されている；ポリアミド 1005、1006、1007、1008および1020は、ＰＣＴ国際出願WO 05/033282 に記載されている。

該ポリアミドをＨＰＶ１６ ＤＮＡを保持する細胞において試験し、他の抗ウイルス処置と比較した。幾つかの抗ウイルス処置は、ＨＰＶ誘発病変を処置するのに利用可能である。シドホビルは、ＨＰＶ感染によって引き起こされる気道の珍しい疾患である再発性呼吸器乳頭腫(ＲＲＰ)に対して、幾らかの有効性を有する非環状ヌクレオシド ホスフェートである (Snoeck et al., 1998, J. Med. Virol. 54(3): 219-225)。シドホビルは、臨床的には、喉頭の病変部に直接注射することによって用いられる。シドホビルおよびインターフェロンは、この重篤な疾患の処置のための、２つの主要な選択肢である。シドホビルおよびインターフェロンγと、ＨＰＶ１６に対する抗ウイルス活性を有するポリアミドの抗ウイルス活性の比較により、試験されたポリアミドのＩＣ_５０が、シドホビルおよびインターフェロンγ(ＩＦＮγ)のＩＣ_５０より少なくとも１／１０００低いことが示された(図１)。

ＨＰＶ１６ ＤＮＡを保持する細胞を、シドホビル、インターフェロンγまたはポリアミドの存在下、７２時間培養した。次いで、ウイルス性ＤＮＡをリアルタイムＰＣＲを用いて定量し、ビークル(ＤＭＳＯ)処置コントロール培養と比較した。図１に示した通り、シドホビルは、総ＨＰＶ ＤＮＡ量の約４０％の喪失をもたらした(しかし非常に高濃度である)。(該ＩＣ_５０は、in vitroでのウイルス複製の５０％阻害に必要な化合物の濃度である)。これらの結果は、ＨＰＶエピソームＤＮＡに対するシドホビルの効果の以前の研究より有利である(Spanos et al., 2005, Ann Oto. Rhino. Laryngol. 114(11): 840-846)。

対照的に、ポリアミド類は、非常に低い濃度で、ウイルス性エピソームＤＮＡ量の著しい減少を引き起こす (図１および表４参照のこと)。実際、NV1028は、細胞を５μＭの濃度で曝露させたとき(２００ｎｇのＤＮＡがＰＣＲ反応のインプット量であった)、ＨＰＶエピソームを、ＱＰＣＲによって検出不能な濃度まで減少させた。NV1028は、ＨＰＶ１６に対して０.１μＭのＩＣ_５０を有する。これらの結果は、本発明の化合物が、細胞培養物中で、ＨＰＶによって引き起こされる病変の処置のために現在臨床的に用いられている薬物よりも非常に優れた効果を有することを示している。これらのアッセイにおいて、ポリアミド類は、細胞傷害性でもあるインターフェロンと比較して、力価の増加を示した。インターフェロンγにおける結果を図１に示した。また、同様の結果が、インターフェロンβでも得られた。

化合物は、始めに、W12E細胞において、Ｑ−ＰＣＲ(Taqman(商標))によって、３種の濃度範囲(０.１、１および１０μＭ)に亘って、ＨＰＶ１６エピソームＤＮＡ濃度に対する効果について試験した。W12E細胞は、M. Stanley (Cambridge University)によって始めに同定され、その後、P. Lambert (U. of Wisconsin)によって最適化され提供された子宮頸ケラチン生成細胞株である。これらの濃度で用量依存性阻害の証拠が示された化合物を、次に、１.０ｎＭから１０μＭの範囲に亘って最小６回の投与を用いて試験し、その結果、ＩＣ_５０値を得た。全ての場合(初期試験およびフォローアップＩＣ_５０試験)において、用量試験をトリプリケートで行った。それぞれの化合物について、対数用量−応答をプロットし、Microsoft Excel, Xlfit (version 2.0; ID Business Solutions, Guildford, UK)(非線形回帰を用いてカーブ・フィッティングが可能)によって、最もフィットした曲線を引いた。データを％阻害ｖｓ用量としてプロットし、ＩＣ_５０を、ＨＰＶ ＤＮＡにおいて、ビークル処置(０.１％ ＤＭＳＯ)コントロールと比較して、５０％減少に必要な薬物濃度として定義した。さらに、全ての試験をトリプリケートで複数回行った。次いで、データを合わせて、ＩＣ_５０値を計算し、偏差を決定し、データのモデルに対するフィットとその信頼性を明らかにした。最も強力なポリアミドの１つである1028についてのデータを図２に示す。活性な化合物についての全ての試験を、この方法で行った。

ポリアミド処置(ｎ＝４, 独立して試験)後のＨＰＶ１６ ＤＮＡ複製数の用量依存性減少を図２Ｂに示す。細胞生存率に対する付随効果(ＭＴＴアッセイ)を観察した。細胞を、ポリアミドの存在下、５日間培養した。％細胞生存率＝(OD590薬物／OD590コントロール)×１００；ｎ＝３。

表４は、例示的なポリアミドおよび不活性なポリアミドと、ＨＰＶ１６に対するＩＣ_５０の概要を表している。

表４ ポリアミド類のＨＰＶ １６に対するＩＣ_５０値
+++ は、０.１未満のＩＣ_５０を示し；
++ は、０.１と１.０の間のＩＣ_５０を示し；
+ は、の１.０以上のＩＣ_５０を示し；
NA は、該化合物が、活性がない、すなわち用量応答が得られなかったことを示す。

驚くべきことに、NV1020は、ＨＰＶ１６に対して有効であり、０.１と１.０μＭの間のＩＣ_５０を有した。

より短いポリアミド類およびより慣例的でない(less-traditional)ポリアミド構造 (Laemmli and Janssen, 2002a; Laemmli and Janssen, 2002b; Maeshima et al., EMBO J., 20, 3218-28, 2001)は、この試験で不活性であった。不活性な化合物のうち、3-Ta、すなわち ImPPPPγ(NH₂)PPPPPβTaは、２,４−ジアミノ−ヘアピン：γ(NH₂)を含む。化合物3-Taは、3-Taが８塩基対のみに結合するのに対して、2-Taおよび4-Taは１０塩基対に結合する以外、2-Taおよび4-Taと類似のＤＮＡ標的を認識する。

実施例２：ポリアミド毒性試験−ＴＣ _５０ は３００μＭで到達しない
毒性試験を、３種の別個のポリアミドについて行った。２種の異なるラット肝細胞腫アッセイを用いた。なおこれらはin vivo毒性を予測するための業界標準である。ＡＴＰについてのアッセイおよび膜完全性アッセイ(membrane integrity assay)を以下に詳細に記載する。従って、ラットの肝細胞腫(H4IIE)を、９６ウェル・プレートに植え付け、２０％ウシ血清を含む培地中で培養した。４８時間平衡化した後、細胞を、試験化合物によって、種々の濃度で、２４時間、３７℃で、５％ＣＯ_２中で処理した。ポリアミド化合物は、２種の別個のアッセイにおいて、毒性について試験した。ＴＣ_５０(細胞の半数を死亡させるのに必要な濃度)は、試験した広い濃度範囲に亘って、試験されたポリアミド類全てについて、到達しなかった(NV1028についてのＴＣ_５０は３００μＭより大きいと見積もった)。他方、コントロール化合物であるロテノンおよびカンプトテシン(データ示さず)は、膜完全性アッセイにおいて、０.４９μＭ (ロテノン)および５.０μＭ (カンプトテシン)のＴＣ_５０値を生じ、ＡＴＰアッセイにおいて、０.０５ (ロテノン)、および、０.９(カンプトテシン)のＴＣ_５０値を得た。さらに、シドホビルは、ＭＴＴアッセイ中で、７５０μＭのＴＣ_５０を得た。

アッセイの簡単な説明を以下に行う。
A. 細胞内ＡＴＰ濃度
細胞のアデノシン三リン酸(ＡＴＰ)濃度を、ＡＴＰ＋Ｄ−ルシフェリン＋ルシフェラーゼによって酸素触媒されたオキシルシフェリン＋ＡＭＰ＋ＰＰｉ＋ＣＯ_２＋光の間の反応に基づくアッセイを用いて決定した。放出光が存在するＡＴＰの量に比例する。非常に短い半減期を有する“flash”タイプのシグナルよりむしろ、このアッセイは、シグナル半減期を５時間まで伸張する特有の“grow”法を利用している。さらに、独特の細胞溶解試薬が内在性ＡＴＰアーゼを阻害し、その結果、ＡＤＰへの分解が妨げられることによって細胞のＡＴＰを安定化する。ＡＴＰは、全ての生存細胞中に存在し、細胞の死後速やかに減少する。さらに、このアッセイは、ＭＴＴアッセイと組み合わせて、細胞のミトコンドリア活性およびエネルギー状態のインジケーターを提供する。

２４時間曝露終了時に、培地を細胞から除去し、ＡＴＰ細胞溶解緩衝液をそれぞれのウェルに加えた。プレートをすぐに分析するか、必要になるまで−２０℃で保存する。分析する日にプレートを解凍し、サンプルと同じ液体マトリックス中のＡＴＰで較正曲線を引いた。ＡＴＰをＡＴＰ基質溶液を添加することによって定量し、次いで Packard Fusion Luminescence または同等のプレート・リーダーで、発光を測定した。

B. 膜完全性法／修飾ヨウ化プロピジウム法
修飾ヨウ化プロピジウム(ＰＩ)法を用いて、細胞増殖／生存率を評価する。この特異的な核酸結合色素は、核酸内にインターカレートしたときに蛍光を発する。１５nmのシフトがＰＩ発光を約２０倍増強し、一方で、励起光の最大値が３０〜４０nmシフトする。方法開発試験の間で、Triton-X-100がH4IIE細胞を透過処理するのに最も良い溶液であることが決定し、それによって、ＰＩが細胞内のＲＮＡおよびＤＮＡに近づくことを可能とした。発光を、Packard Fusion プレート・リーダーを用いて、励起光５４０nm、放出光６１０ｎｍで測定した。

C. ＭＴＴアッセイ
ＭＴＴ[臭化 ３−(４,５−ジメチルチアゾール−２−イル)−２,５−ジフェニルテトラゾリウム]アッセイ (Mosmannによって1983に初めて記載された)は、生存細胞由来のミトコンドリアのデヒドロゲナーゼ酵素が薄黄色のＭＴＴのテトラゾリウム環を切断し、細胞膜をほとんど透過しない暗青色のホルマザン結晶を形成し、その結果健康な細胞内でそれが蓄積する能力に基づいている。界面活性剤の添加による細胞の溶解は、この結晶の遊離をもたらし、該結晶は可溶化する。生存細胞数は、生じたホルマザン生成物の濃度に正比例する。この色は、単純な比色アッセイを用いて定量化され得る。結果は、マルチウェル走査型分光光度計(ＥＬＩＳＡリーダー)で測定され得る(Mosmann T., Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assays, J Immunol Methods, 65, 55-63, 1983)。

ＨＰＶウイルス性ＤＮＡは、培養されたW12E細胞において、以前に記載された通りに、Taqman プライマーとプローブを用いて、定量化されている(Peggy Garner-Hamrick and Fisher, C, HPV Episomal Copy Number Closely Correlates with Cell Size in Keratinocyte Monolayers, Virology 2002; 301: 334-341)。

実施例３：ポリアミド類の試験
ポリアミド類は、Dickerson および Dervanによって主として確立されたＤＮＡ結合ルールに従って再現可能性をもって示されている。本発明のポリアミド類は、ポリアミド類とそれにマッチしたＤＮＡ配列の間で高い結合定数を有する。これらの試験において、ＤＮＡ標的は、ビオチン−アビジン親和性によってBIAcoreチップに固定されて、ポリアミド類の結合の動力学および熱力学の両面が検討された。

細胞培養アッセイ
非常に定量的なリアルタイムＰＣＲアッセイ(Garner-Hamrick and Fisher, Virology, 301, 334-41, 2002)を用いて、細胞をポリアミド類で処理した後、ＨＰＶ１６エピソームＤＮＡ濃度を測定した。ＨＰＶ１６エピソームを維持するケラチン生成細胞を、ポリアミド類の濃度を増加させて処理した。図３に示した５種のポリアミド類は、絶対的なＨＰＶ１６ ＤＮＡ量に対して用量依存効果を示している。著しいことに、高用量の1031、1037、1028および1004は、幾つかの試験において、検出可能なウイルス性ＤＮＡをほぼ完全に除去した(図３)。

抗ＨＰＶ１６結果は、幾つかの理由により細胞毒性によって引き起こされるものではないようである。この理由の一つは、全ての試験において、細胞計数および細胞密度によって測定したところ、細胞は形態学的に正常であり、また正常に増殖し続けていることである。細胞生存率もまた、ＭＴＴアッセイで慣用的に評価した。図３において、試験で用いたアッセイは、ＨＰＶ１６ Ｌ１遺伝子のTaqman(商標) ＰＣＲ増幅を利用した(Garner-Hamrick and Fisher, Virology, 301, 334-41, 2002)。

幾つかの代替のアプローチを用いて、我々の化合物のウイルス性ＤＮＡに対する効果を確認した。これらのさらなる手順は、DNeasy (総ゲノムＤＮＡ) Qiagen スピン・カラム、DNAzol 総ゲノムＤＮＡ調製物、および Hirt (低分子量ＤＮＡ調製物；(Hirt, (1967), J Mol Biol. 26:365-9)を含む異なる手順による総ＤＮＡ、ＤＮＡの調製物での標準化を含む。全ての場合において、我々の結果は、我々の化合物によって、細胞中のエピソームＤＮＡ量が減少する点で完全に一致している。最後に、サザン・ブロット法で、Ｑ−ＰＣＲを用いて測定したウイルス性ＤＮＡの減少が、より伝統的であるが定量的でない手順と一致していることを確認した。図４は、ポリアミドに培地を曝露した、ＨＰＶ ＤＮＡを有するヒトのケラチン生成細胞細胞株由来のＨＰＶエピソームＤＮＡの用量依存性減少を示しているサザン・ブロットを示している。ＤＭＳＯは、ビークル・コントロールであり；ＨＰＶ ＤＮＡは、線状ＨＰＶ ＤＮＡを用いてDIG-dUTP (Roche)でランダムプライム標識を介してハイブリダイゼーション・プローブを形成したものを示す。ハイブリダイゼーション後、ブロットを抗DIG-APコンジュゲートと共にインキュベートし、ＨＰＶ ＤＮＡを、ＥＣＦ基質(Amersham)およびStorm phosphorimagerを用いて検出する。約１.３μＭのＩＣ_５０を有する NV1020 (１μＭ、１０μＭとマークされたレーンによって示されている)は、エピソームＤＮＡ量の予測される減少を示す。他のNV化合物は、同様に、サザン・ブロット法によって、ウイルス性ＤＮＡの予測される減少を示す。

ポリアミド類はまた、天然由来のポリアミド類、ネトロプシンおよびジスタマイシンよりも強力であり、また、ネトロプシンおよびジスタマイシンと異なり、細胞生存率への影響はほとんどないことが見出された(図５)。図５は、1037、ジスタマイシンＡおよびシドホビルの、ＨＰＶウイルス性ＤＮＡおよび細胞生存率への相対的な効果を比較している。ポリアミド 1037は、ウイルス性ＤＮＡ濃度の劇的な減少を示し、かつ細胞生存率への影響がほとんどないことを示している。シドホビルおよびジスタマイシンＡは、高濃度でのみ、ＨＰＶ ＤＮＡに対して有効であり、また細胞生存率に影響を及ぼす。

実施例４：ＨＰＶ１６エピソームに対するポリアミド離脱効果
この試験は、ポリアミドを細胞から離脱した後もＨＰＶ１６エピソームの減少が維持されるかどうかを測定するために行った。細胞を試験の１日目にプレートに置き、１０μＭのNV1028を加えた。細胞を３日間培養し、細胞を洗浄し、新しく1028を加えた。1028の存在下で、示した日数(ｘ軸)で、１５日間継代培養を行った。１７日目で薬物を洗浄して除き、細胞を薬物の非存在下で２週間継代培養を行って、ＨＰＶ１６エピソームＤＮＡのリバウンドをチェックした。コントロールW12E細胞に０.１％ ＤＭＳＯを与えた。図７により、ポリアミドを離脱したときに、ＨＰＶエピソームＤＮＡのリバウンドがいくらか起こるが、その回復は、ポリアミド離脱後少なくとも２週間では、コントロールの量に近づかないことが示されている。

実施例５：ポリアミド類の細胞取り込み制御および核局在化
上記の通り、本発明のポリアミド類は、ケラチン生成細胞の核にすぐに局在化する。しかし、種々の形質転換された細胞を含む他の細胞タイプにおいて、ポリアミド類は、しばしば、細胞の処置後に小胞コンパートメント内に局在化する。ポリアミド取り込みおよび細胞分布は、ポリアミド全体の変化および酸性度の影響、および多剤耐性阻害剤の取り込みに対する影響を研究することによって得られた (Crowley et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 13, 1565-70, 2003)。

この試験により、ＢＯＤＩＰＹ標識ポリアミド類が、哺乳動物の細胞の細胞質中で、酸性の小胞、主にリソソームに集積することが明らかとなった。このことは、穏やかな塩基である多くの薬物および化合物で観察される現象である。酸性の小胞のホメオスタシスを乱す薬物であるベラパミルは、小胞の集積をブロックし、ＢＯＤＩＰＹ標識ポリアミドの核の集積をもたらす。この結果、塩基性アミン基は、一般的に、合成ポリアミド鎖の末端で、哺乳動物の細胞中の細胞質小胞中で集積する原因である。この示唆に基づいて、我々は、アミン尾部のＢＯＤＩＰＹ部分をフルオレセイン部分と置き換えることによって、ポリアミドの電荷を修飾し、細胞質小胞に集積せずにむしろ細胞の核に局在化する新規の分子を得た。

核のＤＮＡがポリアミド標的であるため、ポリアミド類は、実際、本明細書に記載した２つの戦略の一方がポリアミド類の標的を核とするために用いられるとき、哺乳動物の細胞における遺伝子発現を制御するのに有用な化合物であり得る (Crowley et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 13, 1565-70, 2003)(Best et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100, 12063-68, 2003; Edelson et al., Nucl. Acids Res., 32: 2802-18, 2004を参照のこと)。

実施例６：ＨＰＶ１８に対するポリアミド類の識別
本発明のＤＮＡ結合ポリアミド類は、ＨＰＶ１６に対して指向性であり、ヒトのケラチン生成細胞中のウイルス性エピソームＤＮＡ濃度が強力にかつ劇的に減少する。ここで、ＨＰＶ１８に対する抗ウイルス剤を見出すためのアプローチを記載する。１つのアプローチにおいて、ＨＰＶが宿主染色体に固定されている箇所を、ＨＰＶを標的とするために用いる。

ポリアミド類は、文献の方法 (例えば Belitsky et al., Bioorg. Med. Chem., 10, 2767-74, 2002)および下記の実施例８に記載された方法によって、社内で合成された構成要素を用いて製造される。これらは、固相合成(例えばMerrifield合成)、および溶液合成法を含む。全ての最終生成物は、ＨＰＬＣによって、純度＞９８％まで精製され、次いでアリコートとし、凍結乾燥し、使用するまで冷凍保存される。ポリアミド類がその名目上のＤＮＡ標的に結合する能力は、BIAcore分析によって評価される。十分量が予備的毒性試験のために製造される。

ポリアミド類の、ＨＰＶ１８の A/T リッチ領域を標的とするための設計は、４つの既知の認識ルールに基づく。β−アラニン、γ−ターンおよびアミノ尾部は、全て、ヌクレオチドAまたはTを認識し、イミダゾールはGを認識する。ＨＰＶに対して有効なポリアミド類の３つの重要な側面は、次に示すものを含む：(１) ＨＰＶ１８の切断を起こすポリアミド配列；(２) 有効性と取り込みの釣り合いがとれたポリアミドの長さの発見；(３) β−アラニンがポリアミドに最もよく組み込まれるという発見。

表５ ＨＰＶ１８に対するポリアミド類

表５に示した全てのポリアミド類は、化合物１を除いて、かなり長い。それぞれのポリアミドの複数のバージョンは、ＤＮＡにこれらの長い分子をフィットするときに表れる僅かな不完全性によるポリアミド骨格の歪みを緩和するために、β−アラニン(β)を組み込んで製造される。Gと好ましくない相互作用をする場合を除く以外に、β−アラニンがどこにあるべきかについてルールはない。γ−ターンの何れかの側にβを加えたポリアミド組成物のバリエーションの代表例を表６に示す。

表６ β−アラニンで修飾した化合物をベースとするポリアミド配列

さらに、ポリアミド類の端を短くしたバージョンを製造し試験する。これは、取り込みを改善し、予測される長さと選択性についてのパラメーターを決定するのを助ける。表５中の２種の最も長いポリアミド類のうちの一方である、ポリアミド５に基づくポリアミド類の端を短くした例を表７に示す。

表７ 移入時により短い塩基対(bp)を認識する切断されたポリアミド類

本発明のポリアミド化合物はまた、ＨＰＶライフサイクルをプローブするためのツールとして有用である。

ＨＰＶエピソームを保持するものを含むヒトのケラチン生成細胞を、マイトマイシンＣ処置J2 3T3細胞上で、３部のダルベッコ修飾イーグル培地(ＤＭＥＭ)および１部のF12培地を含む培地中で、公表された方法(Rheinwald and Green, 1975)の我々の修飾で、培養する。培地(E Media)は、０.４μｇ/mLのヒドロコルチゾン、１０ng/mLのコレラ毒素、５μg/mLのインシュリン、２４μｇ/mLのアデニン、５μｇ/mLのトランスフェリン、５μg/mLの３,３',５−トリヨード−チロニン(Ｔ_３)、１０ng/mLの上皮増殖因子(ＥＧＦ)、１％のペニシリン−ストレプトマイシン、および５％のウシ胎児血清(ＦＢＳ)を加える。全ての細胞を、７０％コンフルエンスで、１：５の分割比で継代する。

ＨＰＶ１８に対するポリアミドを、１０ｍＭで、１００％ ＤＭＳＯに溶解し、Ｈ_２Ｏで１ｍＭまで希釈する。ポリアミド類をＥ培地中の細胞に、最終濃度０.１〜１０μＭで、最終ＤＭＳＯ濃度０.１％で加える。コントロールとして、細胞を、通常Ｅ培地および“ビークル”である０.１％ ＤＭＳＯを含むＥ培地と共に、インキュベートする。次いでＨＰＶ ＤＮＡ濃度を、以前に公表された手順(Garner-Hamrick and Fisher, Virology, 301, 334-41, 2002)に従って定量する。インキュベーション後、トリプシン処理によって、または、プロテイナーゼＫ消化緩衝液(ＰＫ緩衝液：１００ｍＭ ＮａＣｌ、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ(ｐＨ ８)、２５ｍＭ ＥＤＴＡ、０.５％ ＳＤＳ、０.１mg/mL プロテイナーゼＫ)で直接溶解することによって、細胞をプレートから回収する。トリプシン処理した細胞を血球計数器で計数し、遠心分離によってペレットにする。エピソームＨＰＶを、Hirt法(Hirt, 1967)によって単離し、細胞のペレットを、０.６％のＳＤＳ中、１０ｍＭのＥＤＴＡで溶解する。次にＮａＣｌを加え最終濃度１Ｍとする。４℃で終夜インキュベートした後、染色体ＤＮＡを含む沈殿物を遠心分離し(spin down)、エピソームＤＮＡをイソプロパノールの添加によって沈殿させた。ＰＫ緩衝液に直接溶解した細胞をマイクロチューブに移し、５０℃で２時間インキュベートする。次いでライセートをフェノール／クロロホルム／イソアミルアルコールで抽出し、phase lock gel (Eppendorf, Hamburg, Germany)で分離する。次いで総ＤＮＡを０.３ＭのＮａＯＡｃおよび２.５vol.のエタノールで沈殿させ、Ｔｒｉｓ−ＥＤＴＡ(ＴＥ)緩衝液に再度懸濁する。

次にウイルス性ＤＮＡ濃度を、我々の以前に公表した方法(Garner-Hamrick and Fisher, Virology, 301, 334-41, 2002)のバリエーションによって定量する。定量的ＰＣＲを、リアルタイムＰＣＲ法を用いて、ABI PRISM 7700 Sequence Detectorで行う。全てのプライマーおよびプローブを、Primer Express 1.0 (ABI)を用いて設計した。ＨＰＶ１８については、ＰＣＲプライマー−プローブのセットを、L1遺伝子内に設計した：
センス 5'-TTTGGTTCAGGCTGGATTGC (配列番号3)；
アンチセンス 5'-GCAGATGGAGCAGAACGTTTG (配列番号4)；
プローブ 5'-TCGCAAGCCCACCATAGGCCC (配列番号5)。
ＰＣＲのためのＨＰＶ３１のプライマー−プローブのセットをまた、L1遺伝子内に設計した：
センス 5'-CTGCTATTTTGGAAGATTGGAAT (配列番号6)；
アンチセンス 5'-GGCCTGTGAGGTGACAAACC (配列番号7)；
プローブ 5'-TTGGATTGACCACACCTCCCTCAGGTT (配列番号8)。

全てのプライマーおよびプローブを合成し、Applied Biosystems (Foster City, CA)によってＨＰＬＣで精製する。ＨＰＶプローブを、５'レポーター色素ＦＡＭ(６−カルボキシ−フルオレセイン)および３'クエンチャー色素ＴＡＭＲＡ(６−カルボキシテトラメチル−ローダミン)で標識する。１０^８から１０複製数／反応の範囲のクローン化ゲノムＨＰＶ３１またはＨＰＶ１８ ＤＮＡを用いて、次の式を用いて標準曲線を引く：(１.８２×１０^１５)(μｇ／μＬ ストックＤＮＡ)／(塩基対の長さ)(２)＝複製数／μＬ ストックＤＮＡ。ＰＣＲ反応は、最終濃度１×Universal Master Mix (PE Applied Biosystems)、２００ｎＭのそれぞれのプライマー、および２５０ｎＭのプローブ(PE Applied Biosystems)を、反応容積２５μＬ中に含む。Hirt単離ＤＮＡサンプルをそれぞれ、エピソームＨＰＶについてトリプリケートの反応で分析する。複製数／反応を標準曲線から決定し、複製数／細胞を次の式に従って決定する：(複製数／反応)(ＤＮＡ希釈)／(総細胞数)＝複製数／細胞。

実施例７：初期in vitro毒性試験
ＨＰＶ１８ ＤＮＡ濃度を著しく減少させるポリアミド類は、さらに、一連のフォローアップ試験で試験され得る。フォローアップ試験は、大規模でのポリアミド類の再合成を必要とする。

サザン・ブロット法は、リアルタイムＰＣＲ法を用いて測定されたＨＰＶ１８ ＤＮＡ濃度に対するポリアミド類の効果を確認するために用いられる。該試験は、以前に記載された通りに行う(Garner-Hamrick and Fisher, Virology, 301, 334-41, 2002)。簡単には、ポリアミド処理細胞およびコントロール細胞由来の総細胞ＤＮＡ５μｇを、BamHIで消化し、０.７％のアガロース・ゲル上に流す。Nytran (Schleicher & Scheull, Keene, NH)に移した後、ＤＮＡを、pUC19からBamHIで遊離し、DIG-UTP (Roche)の存在下でランダムプライムを行い、ゲル精製全長ＨＰＶ１８でプローブする。抗ＤＩＧ ＡＰ(アルカリホスファターゼ)と共にインキュベートした後、ＨＰＶ ＤＮＡを、ＥＣＦ基質と蛍光造影剤で検出する。該試験は、Taqman(商標)アッセイ結果を確認すべきであり、それらは活性の独立の直行アッセイを提供する。

次に、５０％および９０％有効濃度値(ＥＣ_５０およびＥＣ_９０)を、それぞれのポリアミドについて、１０ｎＭから５０μＭの用量範囲(１０ｎＭ、１００ｎＭ、５００ｎＭ、１μＭ、５μＭ、１０μＭおよび５０μＭ)に亘って、Taqmanデータを用いて測定する。我々の以前の研究により、この範囲が適当な用量応答曲線を提供することが示されている。細胞当たりのＨＰＶ ＤＮＡの最終濃度をそれぞれのポリアミド濃度について測定し、データを、ビークル処置コントロールに関する％阻害として表す。次いで、ＥＣ_５０を非線形回帰分析を用いて、Sigmaplot softwareで計算する。

ＨＰＶ１８に対して活性が見出された各ポリアミドの毒性を、正常なヒトのケラチン生成細胞において、ＭＴＴ細胞生存率アッセイを用いてモニターする(Denizot and Lang, 1986)。ポリアミド類は、始めに、増殖培地中の正常なケラチン生成細胞に、１０ｎＭ、１００ｎＭ、１μＭ、１０μＭ、１００μＭ、５００μＭ、１ｍＭおよび１０ｍＭの濃度で加えられる。サンプルのそれぞれのセットを、トリプリケートで、透明な９６ウェル・プレート中に提供する。テトラゾリウム色素(臭化 ３−[４,５−ジメチルチアゾール−２−イル]−２,５−ジフェニルテトラゾリウムまたはＭＴＴ, Sigma)を、ポリアミド類の添加から４８時間後、細胞培養物に加える。４時間後、細胞を１回ＰＢＳで濯ぎ、０.０４Ｎ ＨＣｌを含むイソプロパノール(isoproanol)を加えて細胞を溶解し、ＭＴＴホルマザンを可溶化する。プレートをプレート・リーダーで、試験波長５７０nm、参照波長６３０nmで測定する。ＨＰＶ ＤＮＡ濃度に対する効果の分析について、データをビークル処置コントロールの％阻害として表し、ＩＣ_５０を非線形回帰分析を用いて、Sigmaplot softwareで計算する。

次いで、それぞれの効果的なポリアミドについての選択性指数を、ＥＣ_５０とＩＣ_５０の比(ＳＩ＝ＥＣ_５０／ＩＣ_５０)として決定する。ＳＩの５が、許容される出発点と考えられる。

最後に、ポリアミド類の多回投与の効果をin vitroで試験した。これらの試験の目的は、ポリアミド類が免疫系の非存在下で、エピソームＤＮＡの細胞をどの程度除くかを測定することである。一般的に、損なわれていない免疫系が最適な抗ウイルス効果に重要であると認識されているが、これらの試験は、動物試験で、ウイルス性ＤＮＡを除くよう設計された化合物を優先して選択するのを助けるために重要である。典型的な臨床的な抗ウイルス治療計画は、１週間から２週間以上続くために、我々はＨＰＶ１８ポジティブなケラチン生成細胞に、、培地交換毎に新しいポリアミドを提供することによって、６日間、９日間、および１２日間投与し得る。ＨＰＶ１８ケラチン生成細胞を、必要に応じてこれらの試験にかける。投与量は、該濃度が上記で著しい毒性を示さない限り、＞ＥＣ_９０値の濃度であり得る。次いで処置された細胞を、Taqman分析で収集し、また、新しい培地に再度植える。この再度植えた細胞を、さらに７日間回復し、その後収集し、ウイルス性ＤＮＡ量をTaqmanによって分析する。次いで、回復した細胞のウイルス性ＤＮＡ量を、処置計画の最後の細胞のウイルス性ＤＮＡ量と比較する。

ＨＰＶについてのデータは、ウイルス性ＤＮＡ濃度の著しく大きい減少を示す。しかし、４８時間処理後にウイルス性ＤＮＡの回復または“リバウンド”が起こることは重要である。ポリアミド類を４８時間で培養物から除くと、数日後にＨＰＶ ＤＮＡ濃度のリバウンドが起こる。従って、全ての元のポリアミド投与は細胞中に６日存在するならば、細胞の倍増により少なくとも４の因子によって希釈された。大部分の抗ウイルス治療計画が少なくとも７から１４日続く(数ヶ月間続いてもよい)ことから、我々は、ここで記載されたより長い多回投与アプローチで、ＨＰＶが続くin vitro試験で回復する能力を減少させると予想しており、また、幾つかのポリアミド類は、ＨＰＶ ＤＮＡのクリアランスを起こし得ると予想している。

実施例８：ポリ−Ｎ−メチルイミダゾール−Ｎ−メチルピロール・ポリアミド類およびβ−アラニンがＣ末端ヘテロ環とＣ末端カチオン末端基の間に存在しないアナログの製造方法
合成方法の一つは、Ｂｏｃ−β−アラニン−ＷＡＮＧ固相合成樹脂で開始し、標的配列に必要な構成要素を添加して、ポリアミド・オリゴマーを製造することである。ポリアミド類のＣ末端で遊離カルボン酸を作ることは、ポリアミド分子から、さらに、溶液相カップリングによって種々の構造(Ｃ末端極性基(例えば脂肪族ジアミン類およびトリアミン類から誘導されるカチオン性基)に直接隣接したβ−アラニンがない分子を含む)を合成することを可能とする。Wang樹脂、特にＦｍｏｃ−β−アラニン−Ｗａｎｇ形態の樹脂が、この化学に有用である。これらの樹脂は、例えば、トリフルオロ酢酸切断可能な Novabiochem(登録商標)材料 [NovaSyn(登録商標) TG HMPとして知られる]、NovaPeg Wang、HMPA-PEGAおよびHMPA NovaGel(商標) 樹脂を含む。

ポリアミドをトリフルオロ酢酸で樹脂から切断する。ポリアミドをＷａｎｇまたはＷａｎｇ様樹脂からトリフルオロ酢酸によって切断した後、トリフルオロ酢酸を生成物から除去し、その後、Ｃ−末端カルボキシレートと新しいアミンをカップリングさせ、Ｃ−末端アミドを形成する。一般的に、凍結乾燥および／またはイオン交換を用いてトリフルオロ酢酸またはそのアニオンを除去し、その後、アミドカップリング反応を行って、ポリアミドを合成する。さらに、イオン交換でカチオン性ポリアミドの塩酸塩(または類似塩)を製造し、その後に、アミド結合形成するのが望ましい。

次いで、脂肪族β−アミノ酸がＣ−末端カチオン基に直接隣接する位置にないものを除いて、得られたＣ−末端での遊離カルボン酸を、ＤＮＡを認識するポリアミドのための標準的な構成要素からなる分子を含む溶液中で反応させる。

Ｃ−末端アミン類の適当な例は、下記の構造を含む：
ここで、
Ｘ＝ＣＨ、Ｎ；
ＰＧ＝必要なアミド結合形成条件に対して安定な保護基。
適当な保護基の例は、ＦＭＯＣ、ＢｏｃおよびＴＢＤＭＳを含む。

それぞれのユニットを加えた後、ポリアミド化合物をＭＡＬＤＩ質量スペクトルで確認した。測定は、Peptides International (Louisville KY)で行った。ポリアミド類は、分取ＨＰＬＣによって９８％以上の純度まで精製された (２回目の分取ＨＰＬＣにかける必要がある場合がある)。ＨＰＬＣフラクションを合わせて、最終生成物を得た。その後、分析的ＨＰＬＣおよび質量スペクトル(ＭＡＬＤＩ)により、最終生成物が存在することおよび失敗した配列が存在しないことが示された。

本明細書で引用された全ての引用文献は、言及することによってその全体が組み込まれている。

他の態様
本発明は、その詳細な説明と併せて記載されているが、前述の記載は説明することを意図したものであって本発明の範囲を限定するものではなく、本発明の範囲は請求項の範囲によって規定されると理解されるべきである。他の態様、利点および修飾は、請求項の範囲内である。

ＨＰＶ１６複製数に対するシドホビル(cidafovir)およびＩＦＮγの効果を、２種のポリアミドと比較している。 図２Ａは、ポリアミドのＩＣ_５０値を決定するためのＱ−ＰＣＲの結果の代表的なグラフを示す。図２Ｂは、ポリアミドで処理した細胞中のＨＰＶ１６ ＤＮＡ複製数における投与量依存性減少、およびポリアミドの細胞生存率に対する効果を示す。 ＨＰＶ１６エピソームに対するポリアミド類の投与量依存性の効果を示したグラフを示す。 ポリアミドによるＨＰＶ ＤＮＡクリアランスのサザン・ブロットを示す。 ＨＰＶ１６複製数に対する濃度変化させたポリアミド 1037の力価と、ジスタマイシンＡおよびシドホビルの力価を比較し、またそれぞれの細胞生存率に対する対応する効果を比較する。 例示的ポリアミドの化学構造を示す。 ＨＰＶ１６エピソームへの、ケラチン生成細胞からポリアミドを離脱した効果を示す。 異なるポリアミド結合モチーフの図である。

Claims (2)

1. ImPPβPIPβPPγ(NH₂)PPβPPPβPPPβTa；
   F₃CC(O)PPβPPβPIγ(NH₂)PβPPβPPPβPβTa；
   F₃CC(O)PPβPPβPγ(NH₂)PPPβPPPβPβTa；
   ImPPβPPPγ(NH₂)PPβPPPPβTa；
   ImPPPβPPβγPPβPPPβPβTa；
   ImPPPβPPβγ(NH₂)PPβPPPβPβTa；
   ImPPPβPPPγPPPβPPPββTa；
   ImPPβPPPγPPβPPPPβTa；
   ImPPPβPPβγ(NH₂)PPβPPPβPβDp；
   ImPPPβPPβPPPγ(NH₂)PPPβPPPβPPPβDp；および
   ImPPPβPPβPPPγPPPβPPPβPPPβDp
   ［式中、Imは、
   であり；
   Iは、
   であり；
   Pは、
   であり；
   βは、
   であり；
   γは、
   であり；
   γ(NH₂)は、
   であり；
   Taは、
   であり；
   Dpは、
   である。］からなる群から選択される化合物またはその薬学的に許容される塩。
2. ＨＰＶ感染細胞を処置するための医薬組成物であって、請求項１に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を含む、医薬組成物。