JP5303461B2 - グルコース脱水素酵素 - Google Patents
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Description
Q192G、Q192AまたはQ192S;
L193X(Xは任意のアミノ酸残基である);
E277X(Xは任意のアミノ酸残基である);
A318X(Xは任意のアミノ酸残基である);
Y367A、Y367FまたはY367W;
G451C;および
N452X(Xは任意のアミノ酸残基である)
からなる群より選択される1またはそれ以上の変異をさらに含む。
本発明の改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素は、配列番号1で示される水溶性PQQGDHの99番目のアミノ酸残基Gまたは配列番号3で表されるPQQGDHの100番目のアミノ酸残基Gが、アミノ酸配列:TGZN(式中、ZはSX、SまたはNであり、Xは任意のアミノ酸残基である)で置き換えられていることを特徴とする。なお、本明細書においては、水溶性PQQGDHのアミノ酸配列中のアミノ酸の位置は、開始メチオニンを1として番号付けする。
Q192G、Q192AまたはQ192S;
L193X(Xは任意のアミノ酸残基である);
E277X(Xは任意のアミノ酸残基である);
A318X(Xは任意のアミノ酸残基である);
Y367A、Y367FまたはY367W;
G451C;および
N452X(Xは任意のアミノ酸残基である)
からなる群より選択される1またはそれ以上、好ましくは1〜10個、例えば、1,2,3,4、5または6個の変異をさらに含む。なお、ここで例えば「Q192G」との表記は、配列番号1の192番目のグルタミンまたはこれに対応する配列番号3の193番目のグルタミンがグリシンに置き換えられていることを表し、他の置換変異も同様にして表される。
G99(TGSXN)+Q192G+L193E;
G99(TGSXN)+Q192S+N452P;
G99(TGSXN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TGSXN)+Q192S+N452P;
G99(TGSNN)+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+N452P;
G99(TGSNN)+L193E+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+L193M+N452P;
G99(TGSNN)+A318Y+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G;
G99(TGSNN)+Q192S;
G99(TGSNN)+Q192A;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E;
G99(TGSNN)+Q192S+L193X;
G99(TGSNN)+Q192S+L193M;
G99(TGSNN)+Q192S+L193T;
G99(TGSNN)+Q192S+E277X;
G99(TGSNN)+Q192S+N452X;
G99(TGSNN)+Q192S+L193X+A318Y+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+A318X+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+A318X+N452P;
G99(TGSKN)+Q192S+N452P;
G99(TGSRN)+Q192S+N452P;
G99(TGSWN)+Q192S+N452P;
G99(TGSN)+Q192S+N452P;
G99(TGSN)+Q192G+L193E;
G99(TGSN)+Q192S+L193M;
G99(TGNN)+Q192S+N452P;
G99(TGNN)+Q192G+L193E;または
G99(TGNN)+Q192S+L193M
を含む改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素である。上記式中、Xは任意のアミノ酸であり、例えば、G99(TGSXN)とは、配列番号1で表されるPQQGDHにおいて99番目のGがTGSXNで置き換えられていることを示す。
G99(TGSXN)+Q192G+L193E;
G99(TGSXN)+Q192S+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+L193M+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+A318K+N452P;または
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+A318Q+N452P;
を含む改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素である。
Acinetobacter calcoaceticus 由来の天然の水溶性PQQGDHをコードする遺伝子の配列は配列番号2で、Acinetobacter baumannii由来の天然の水溶性PQQGDHをコードする遺伝子の配列は配列番号4で規定される。本発明の改変型PQQGDHをコードする遺伝子は、天然の水溶性PQQGDHをコードする遺伝子において、置換すべきアミノ酸残基をコードする塩基配列を、所望のアミノ酸残基をコードする塩基配列に置換することにより構築することができる。このような部位特異的塩基配列置換のための種々の方法は、当該技術分野においてよく知られており、例えば下記の実施例に記載されるように、適切に設計されたプライマーを用いるPCRを用いることができる。
本発明の改変型PQQGDHは、PQQを補酵素として、グルコースを酸化してグルコノラクトンを生成する反応を触媒する作用を有する。酵素活性の測定は、PQQGDHによるグルコースの酸化にともなって還元されるPQQの量を酸化還元色素の呈色反応により定量することができる。呈色試薬としては、例えば、PMS(フェナジンメトサルフェート)−DCIP(2,6−ジクロロフェノールインドフェノール)、フェリシアン化カリウム、フェロセンなどを用いることができる。
本発明の改変型PQQGDHのグルコースに対する選択性は、基質として、2−デオキシ−D−グルコース、マンノース、アロース、3−o−メチル−D−グルコース、ガラクトース、キシロース、ラクトースおよびマルトース等の各種の糖を用いて上述のように酵素活性を測定し、グルコースを基質としたときの活性に対する相対活性を調べることにより評価することができる。
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキットを特徴とする。本発明のグルコースアッセイキットは、本発明に従う改変型PQQGDHを少なくとも1回のアッセイに十分な量で含む。典型的には、キットは、本発明の改変型PQQGDHに加えて、アッセイに必要な緩衝液、メディエーター、キャリブレーションカーブ作製のためのグルコース標準溶液、ならびに使用の指針を含む。本発明に従う改変型PQQGDHは種々の形態で、例えば、凍結乾燥された試薬として、または適切な保存溶液中の溶液として提供することができる。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で提供されるが、アポ酵素の形態で提供し、使用時にホロ化することもできる。
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHをが装着されている酵素電極、ならびにこの酵素電極を用いるグルコースセンサーを特徴とする。電極としては、カーボン電極、金電極、白金電極などを用い、この電極上に本発明の酵素を固定化する。固定化方法としては、架橋試薬を用いる方法、高分子マトリックス中に封入する方法、透析膜で被覆する方法、光架橋性ポリマー、導電性ポリマー、酸化還元ポリマーなどがあり、あるいはフェロセンあるいはその誘導体に代表される電子メディエーターとともにポリマー中に固定あるいは電極上に吸着固定してもよく、またこれらを組み合わせて用いてもよい。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で電極上に固定化するが、アポ酵素の形態で固定化し、PQQを別の層としてまたは溶液中で提供することもできる。典型的には、グルタルアルデヒドを用いて本発明の改変型PQQGDHをカーボン電極上に固定化した後、アミン基を有する試薬で処理してグルタルアルデヒドをブロッキングする。
改変型PQQGDHをコードする遺伝子の構築
配列番号2に示されるAcinetobacter calcoaceticus由来水溶性PQQGDHの構造遺伝子をもとに、変異の導入を行った。簡単には、野生型水溶性PQQGDH全長用のフォワード側のプライマーと変異導入領域のリバース側のプライマーとを用いてPCRを行い、一方で、全長用のリバース側のプライマーと変異導入領域のフォワード側のプライマーとを用いてPCRを行い、これらのPCR産物を混合して、全長用のフォワードプライマーおよびリバースのプライマーを用いてPCRを行うことにより、変異が導入された全長PQQGDHをコードする遺伝子を作製した。次に、シークエンシングにより目的とする変異が正しく導入されていることを確認した。
フォワード:AACAGACCATGGATAAACATTTATTGGC(配列番号5)
リバース:ACAGCCAAGCTTTTACTTAGCCTTATAGG(配列番号6)
改変型PQQGDHの調製
野生型または上記のようにして調製した改変型PQQGDHをコードする遺伝子を、E.coli用の発現ベクターであるpTrc99A(ファルマシア社)のマルチクローニングサイトに挿入し、構築されたプラスミドをE.coliに形質転換した。これを450mlのL培地(アンピシリン50μg/ml、クロラムフェニコール30μg/ml含有)で37℃で一晩振とう培養し、1mM CaCl2、500μMPQQを含む7lのL培地に植菌した。培養開始後約3時間でイソプロピルチオガラクトシドを終濃度0.3mMになるように添加し、その後1.5時間培養した。培養液から遠心分離(5000×g、10分、4℃)で菌体を回収し、10mM MOPS(pH7.0)150μlに懸濁した。体積の1/2〜2/3量のガラスビーズ(バクテリア用0.105〜0.125mm)を加え、4℃で20分間ボルテックスした。各サンプルに10mM MOPS(pH7.0)1mlを加え、遠心分離(15000rpm、20分間、4℃)し、上清を回収した。これを粗精製酵素標品として以下の実施例において用いた。
酵素活性の測定
実施例2で得られた野生型および各改変型PQQGDHの粗精製酵素標品100μlに、10mM MOPS(pH7.0)+1mM PQQ+1mM CaCl2ホロ化液900μlを加え、静置(室温、暗所、30分以上)してホロ化を行った。10倍希釈したホロ化済み酵素試液150μlに、各濃度の基質(グルコースまたはマルトース)、PMS(フェナジンメトサルフェート)0.6mM、DCIP(2,6−ジクロロフェノールインドフェノール)0.3mM、いずれも終濃度)50μlを加え、計200ulで室温で反応させた。基質としては、グルコースおよびマルトースを、それぞれ終濃度0,1,2,4,10,20,40mMで用いた。DCIPの600nmの吸光度変化を分光光度計を用いて追跡し、その吸光度の減少速度を酵素の反応速度とした。このとき、1分間に1μmolのDCIPが還元される酵素活性を1ユニットとした。また、DCIPのpH7.0におけるモル吸光係数は16.3mM−1とした。蛋白質濃度は市販の蛋白質測定キット(BioRad)を用いて測定した。
酵素センサーの作製および評価
5ユニットの本発明の改変型PQQGDHにカーボンペースト20mgを加えて凍結乾燥させた。これをよく混合した後、既にカーボンペーストが約40mg充填されたカーボンペースト電極の表面だけに充填し、濾紙上で研磨した。この電極を1%のグルタルアルデヒドを含む10mM MOPS緩衝液(pH7.0)中で室温で30分間処理した後、20mMリジンを含む10mM MOPS緩衝液(pH7.0)中で室温で20分間処理してグルタルアルデヒドをブロッキングした。この電極を10mM MOPS緩衝液(pH7.0)中で室温で1時間以上平衡化させた。電極は4℃で保存した。
精製酵素標品を用いた酵素活性の測定
実施例2で得られた野生型および各改変型PQQGDHの粗精製酵素を、それぞれ10mMリン酸緩衝液pH7.0で平衡化した陽イオン交換クロマトグラフィー用充填カラムTSKgel CM−TOYOPEARL 650M(東ソー株式会社)に吸着させた。このカラムを10mMリン酸緩衝液pH7.0、750mlで洗浄した後、0−0.2M NaClを含む10mMリン酸緩衝液pH7.0を用い、酵素を溶出させた。流速は5ml/minで行った。GDH活性を有する画分を回収し、10mM MOPS−NaOH緩衝液(pH7.0)で一晩透析した。このようにして電気泳動的に均一な改変型PQQGDH蛋白質を得た。得られた精製酵素標品について、実施例4と同様にしてグルコースおよびマルトースに対する酵素活性を測定した。代表的な結果を以下の表に示す。
従来技術の改変型PQQGDHとの比較
実施例2で得られた野生型および各改変型PQQGDHの粗精製酵素、ならびに対照としてPQQGDHの99番目のアミノ酸残基Gには変異が導入されていないが、他の位置で1または2以上のアミノ酸置換を有する従来技術の改変型PQQGDHの酵素活性について、実施例4と同様にしてグルコースおよびマルトースに対する酵素活性を測定した。
Claims (9)
- 配列番号1で表されるピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素(PQQGDH)の99番目のアミノ酸残基G、または配列番号3で表されるPQQGDHの100番目のアミノ酸残基Gが、アミノ酸配列:TGZN(式中、ZはSX、SまたはNであり、Xは任意のアミノ酸残基である)で置き換えられており、かつ、配列番号1の1−98番目のアミノ酸残基および100−478番目のアミノ酸残基、または配列番号3の1−99番目のアミノ酸残基および101−480番目のアミノ酸残基の1〜10個が任意に他のアミノ酸残基で置き換えられていてもよい、改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素であって、以下のいずれかのアミノ酸の変異またはアミノ酸の変異の組み合わせ:G99(TGSAN);
G99(TGSCN);
G99(TGSDN);
G99(TGSEN);
G99(TGSGN);
G99(TGSHN);
G99(TGSIN);
G99(TGSKN);
G99(TGSMN);
G99(TGSNN);
G99(TGSPN);
G99(TGSQN);
G99(TGSRN);
G99(TGSSN);
G99(TGSTN);
G99(TGSVN);
G99(TGSWN);
G99(TGSFN);
G99(TGSLN);
G99(TGSYN);
G99(TGSGN)+Q192G+L193E;
G99(TGSMN)+Q192G+L193E;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E;
G99(TGSPN)+Q192G+L193E;
G99(TGSQN)+Q192G+L193E;
G99(TGSRN)+Q192G+L193E;
G99(TGSSN)+Q192G+L193E;
G99(TGSTN)+Q192G+L193E;
G99(TGSVN)+Q192G+L193E;
G99(TGSAN)+Q192G+L193E;
G99(TGSDN)+Q192G+L193E;
G99(TGSEN)+Q192G+L193E;
G99(TGSHN)+Q192G+L193E;
G99(TGSIN)+Q192G+L193E;
G99(TGSKN)+Q192G+L193E;
G99(TGSCN)+Q192G+L193E;
G99(TGSWN)+Q192G+L193E;
G99(TGSNN)+Q192S;
G99(TGSNN)+Q192S+E277A;
G99(TGSNN)+Q192S+E277D;
G99(TGSNN)+Q192S+E277I;
G99(TGSNN)+Q192S+E277T;
G99(TGSNN)+Q192S+E277Q;
G99(TGSNN)+Q192S+E277V;
G99(TGSNN)+Q192S+E277W;
G99(TGSNN)+Q192S+E277Y;
G99(TGSNN)+Q192S+E277C;
G99(TGSNN)+Q192S+E277F;
G99(TGSNN)+Q192S+E277G;
G99(TGSNN)+Q192S+E277H;
G99(TGSNN)+Q192S+E277K;
G99(TGSNN)+Q192S+E277M;
G99(TGSNN)+Q192S+E277N;
G99(TGSNN)+Q192S+E277S;
G99(TGSNN)+Q192S+E277R;
G99(TGSNN)+Q192S+E277P;
G99(TGSNN)+Q192S+N452A;
G99(TGSNN)+Q192S+N452C;
G99(TGSNN)+Q192S+N452D;
G99(TGSNN)+Q192S+N452F;
G99(TGSNN)+Q192S+N452G;
G99(TGSNN)+Q192S+N452H;
G99(TGSNN)+Q192S+N452I;
G99(TGSNN)+Q192S+N452K;
G99(TGSNN)+Q192S+N452L;
G99(TGSNN)+Q192S+N452M;
G99(TGSNN)+Q192S+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+N452R;
G99(TGSNN)+Q192S+N452S;
G99(TGSNN)+Q192S+N452T;
G99(TGSNN)+Q192S+N452V;
G99(TGSNN)+Q192S+N452Y;
G99(TGSNN)+Q192G;
G99(TGSNN)+Q192A;
G99(TGSNN)+Q192S+L193G;
G99(TGSNN)+Q192S+L193A;
G99(TGSNN)+Q192S+L193K;
G99(TGSNN)+Q192S+L193R;
G99(TGSNN)+Q192S+L193H;
G99(TGSNN)+Q192S+L193D;
G99(TGSNN)+Q192S+L193E;
G99(TGSNN)+Q192S+L193N;
G99(TGSNN)+Q192S+L193Q;
G99(TGSNN)+Q192S+L193S;
G99(TGSNN)+Q192S+L193T;
G99(TGSNN)+Q192S+L193Y;
G99(TGSNN)+Q192S+L193C;
G99(TGSNN)+Q192S+L193M;
G99(TGSNN)+Q192S+L193F;
G99(TGSNN)+Q192S+L193W;
G99(TGSNN)+Q192S+L193V;
G99(TGSNN)+Q192S+L193I;
G99(TGSNN)+Q192S+L193P;
G99(TGSNN)+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+N452P;
G99(TGSNN)+Y367A+N452P;
G99(TGSNN)+Y367F+N452P;
G99(TGSNN)+Y367W+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+Y367F+N452P;
G99(TGSNN)+Q192S+Y367W+N452P;
G99(TGSNN)+L193E+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TCSRN);
G99(TCSRN)+G451C;
G99(TGSNN)+Q192S+L193M+N452P;
G99(TGSNN)+Q192G+L193E+E277K;
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G99(TGSCN)+Q192S+N452P;
G99(TGSDN)+Q192S+N452P;
G99(TGSFN)+Q192S+N452P;
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G99(TGSWN)+Q192S+N452P;
G99(TGSYN)+Q192S+N452P;
G99(TGSEN)+Q192S+N452P;
G99(TGSHN)+Q192S+N452P;
G99(TGSQN)+Q192S+N452P;
G99(TGSRN)+Q192S+N452P;
G99(TGSAN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TGSHN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TGSIN)+Q192G+L193E+N452P;
G99(TGSLN)+Q192G+L193E+N452P;
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G99(TGNN)+Q192S+L193M+N452P;
を含むことを特徴とする、改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素。 - 請求項1に記載の改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素をコードする遺伝子。
- 請求項2に記載の改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素をコードする遺伝子を含有する組み換えベクター。
- 請求項3に記載の組み換えベクターで形質転換した形質転換体または形質導入体。
- 請求項4に記載の形質転換体を培養して、該培養物からピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素を採取することを特徴とする改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素の製造方法。
- 請求項1に記載の改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素を用いることを特徴とするグルコース分析方法。
- 請求項1に記載の改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素を含むことを特徴とするグルコースのアッセイキット。
- 請求項1に記載の改変型ピロロキノリンキノングルコース脱水素酵素が装着されている酵素電極。
- 作用極として請求項8に記載の酵素電極を用いることを特徴とするグルコースセンサー。
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