JP5268870B2 - 核酸の自動抽出システムおよびその方法 - Google Patents
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Description
(a)プロセス平板培地の空隙中に核酸を含有するサンプルを提供する工程と;
(b)試薬平板培地の空隙中に、該サンプルと混合するための試薬を提供するための再使用可能なピペットチップを反復して使用する工程と;
(c)使い捨てピペットチップを用いて該サンプルに該試薬を移す工程であって、サンプル−試薬混合物を得るために、該試薬平板培地の空隙と使い捨てピペットチップの双方に一対一で該サンプルの各々が割り当てられることを特徴とする工程と;
(d)該プロセス平板培地の空隙中の該サンプル−試薬混合物を培養し、それにより核酸を放出し、放出された核酸を含有する流体を得る工程と;
(e)抽出された核酸を含有する流体を得るために、該プロセス平板培地の空隙中の放出された核酸を含有する流体中に含まれる放出された核酸を単離する工程と;
(f)使い捨てピペットチップを用いて、抽出された核酸を含有する流体を該出力平板培地の空隙に移す工程であって、単離された核酸を含有する流体の各々が、該出力平板培地の空隙と使い捨てピペットチップの双方に一つずつ割り当てられることを特徴とする工程からなることを特徴とする方法を提供する。
(a)再使用可能なピペットチップ31を用いて専用の試薬平板培地21中に試薬を供給し;
(b)使い捨てピペットチップ34を用いてプロセス平板培地18中に設けられた核酸を含有するサンプルに試薬を移送し;
(c)試薬平板培地のウエルと使い捨てピペットチップ34の双方とサンプル(すなわち、プロセス平板培地ウエル41)の間に一対一での割り当てを維持しながら、同じ使い捨てピペットチップ34を用いて、プロセス平板培地18中での核酸放出と磁気単離操作とを実行し;および
(d)出力平板培地ウエル42と使い捨てピペットチップ34の双方とプロセス平板培地ウエル41の間に一対一での割り当てを維持しながら、同じまたは新鮮な使い捨てピペットチップ34を用いて、出力平板培地19の出力平板培地ウエル42に抽出された核酸を移送すると;
各サンプル用の単離サンプルプロセス経路より、物質の持ち越しおよびサンプルの2次汚染の拡大されたリスクも無く、1回の核酸抽出操作当たりの使い捨て品の比較的少ない消費を達成できる。さらに、培養工程および磁気単離工程の間および工程間において、プロセス平板培地18を静止することは、核酸の抽出を行うときにサンプルの汚染および/または吹きこぼれのリスクを削減するので有利である。
2 作業−平板培地
3 下部構造
4 ベース平板培地
5 リセス
6 廃棄ラック
7 処理ラック
8 チップラック
9 第1試薬ラック
10 第2試薬ラック
11 ボトルラック
12 開口
13 リブ
14 溝
15 保持部分
16 チップ廃棄平板培地
17 流体廃棄平板培地
18 プロセス平板培地
19 出力平板培地
20 チップ平板培地
21 試薬平板培地
22 加振器
23 ボトル
24 加熱装置
25 加熱ピン
26 キャリヤー
27 隣接表面
28 前面
29 試薬ピペッター
30 試薬ピペット
31 再使用可能なピペットチップ
32 サンプルピペッター
33 サンプルピペット
34 使い捨てピペットチップ
35 洗浄装置
36 洗浄空隙
37 流体容器
38 容器キャップ
39 ボトルキャップ
40 試薬平板培地ウエル
41 プロセス平板培地ウエル
42 出力平板培地ウエル
Claims (15)
- 核酸を含有するサンプルから核酸を自動抽出するシステム(1)であって、
該システムが、該核酸を処理するためのプロセス平板培地(18)と、該プロセス平板培地(18)の空隙中に含まれている該サンプルに混合されるべき試薬を提供する試薬平板培地(21)と、該抽出された核酸を出力するための出力平板培地(19)とを含む3つの平板培地(18、19、21)の少なくとも1セットを備え、該平板培地のそれぞれが複数の空隙を有し、
該システム中では:
該試薬は、該試薬を提供するために反復して使用される再使用可能なピペットチップ(31)が設けられている複数の試薬ピペット(30)を備える試薬ピペット装置(29)を用いて、該試薬平板培地(21)の空隙中に提供され;
該試薬は、サンプル−試薬混合物を得るために該試薬をピペットで採取する使い捨てピペットチップ(34)が設けられた複数のサンプルピペット(33)を備えるサンプルピペット装置(32)を用いて、該プロセス平板培地(18)中に収容された該サンプルに移され、
該プロセス平板培地(18)中に収容された該サンプル−試薬混合物は、核酸を放出するために培養装置(24,25)によって培養され;
該プロセス平板培地(18)中に収容された該放出された核酸は、抽出された核酸を含有する流体を得るために、単離装置により単離され、放出され;
該抽出された核酸を含有する流体は、使い捨てピペットチップ(34)により該出力平板培地(19)の空隙に移され;
該サンプルの各々は、該試薬平板培地(21)の空隙と、少なくとも1つの該使い捨てピペットチップ(34)と、該出力平板培地(19)の空隙とに、一対一で割り当てられ、該サンプルの各々が、該使い捨てピペットチップ(34)により該試薬平板培地(21)の各空隙から該プロセス平板培地(18)のそれぞれの空隙に移された該試薬と混合し、該プロセス平板培地(18)における同一の空隙において、該サンプル−試薬混合物の各々が培養され、該放出された核酸が単離されることを特徴とするシステム(1)。 - 該サンプルを含む空隙の数は、該試薬を含む空隙の数に等しく、該サンプルの各々が、該試薬平板培地(21)の空隙と、少なくとも1つの使い捨てピペットチップ(34)と、該出力平板培地(19)の空隙とに、一対一で割り当てられることを特徴とする請求項1記載のシステム(1)。
- 該試薬ピペット装置(29)の移動の第1範囲および該サンプルピペット装置(32)の移動の第2範囲が、試薬平板培地(21)を含む領域で重なり合っていることを特徴とする請求項1または2記載のシステム(1)。
- 該再使用可能なピペットチップ(31)の洗浄用に適用される洗浄装置(35)をさらに備えていることを特徴とする請求項1〜3のいずれか1項に記載のシステム(1)。
- 該平板培地(18,19,21)の支持用の少なくとも1つの保持器(6〜11)を備え、該保持器は、該平板培地を搭載したりまたは下ろしたりするために用いられる少なくとも操作不能の保持器の位置と、該核酸の抽出用に用いられる操作可能な保持器の位置との間に移動可能であることを特徴とする請求項1〜4のいずれか1項に記載のシステム(1)。
- 該核酸の抽出で生じる廃棄流体を受け取るための複数の空隙を有する少なくとも1つの流体廃棄平板培地(17)をさらに備えることを特徴とする請求項1〜5のいずれか1項に記載のシステム(1)。
- 該核酸の抽出で生じる使用されたピペットチップを受け取るための複数の空隙を有する少なくとも1つのチップ廃棄平板培地(16)をさらに備えていることを特徴とする請求項1〜6のいずれか1項に記載のシステム(1)。
- 該核酸の抽出で生じる使用された使い捨てピペットチップ(34)で満たされる複数の空隙を有する少なくとも1つのチップ平板培地(20)をさらに備えていることを特徴とする請求項1〜7のいずれか1項に記載のシステム(1)。
- 核酸を含有するサンプルから核酸を自動抽出する方法であって、次の工程:すなわち、
プロセス平板培地(18)の空隙中に該サンプルを提供する工程と;
試薬平板培地(21)の空隙中に該サンプルと反応するための試薬を提供するために、再使用可能なピペットチップ(31)を反復して使用する工程と;
使い捨てピペットチップ(34)を用いて該サンプルに該試薬を移す工程であって、サンプル−試薬混合物を得るために、該試薬平板培地の空隙と使い捨てピペットチップ(34)の双方に、該サンプルの各々が一対一で割り当てられることを特徴とする工程と;
該核酸を放出するために、該プロセス平板培地(18)中に収容された該サンプル−試薬混合物を培養する工程と;
抽出された核酸を含有する流体を得るために、該プロセス平板培地(18)中に収容された該放出された核酸を単離する工程と;
抽出された核酸を包含する該流体を、使い捨てピペットチップ(34)を用いて、出力平板培地(19)の空隙に移す工程とを備え、
抽出された核酸を包含する該流体の各々が、該出力平板培地(19)の空隙と使い捨てピペットチップ(34)の双方に一対一で割り当てられ、
該サンプルの各々が、該使い捨てピペットチップ(34)により該試薬平板培地(21)の各空隙から該プロセス平板培地(18)のそれぞれの空隙に移された該試薬と混合し、該プロセス平板培地(18)における同一の空隙において、該サンプル−試薬混合物の各々が培養され、該放出された核酸が単離されることを特徴とする方法。 - 該サンプルの各々1つに対して、1つの使い捨てピペットチップ(34)が、試薬を該サンプルまで移すために、およびそこから得られた抽出された核酸を含有する該流体を該出力平板培地(19)の空隙まで移すために使用されることを特徴とする請求項9記載の方法。
- 該サンプルの各々1つに対して、1つの使い捨てピペットチップ(34)が、試薬を該サンプルまで移すために使用され、および、他の使い捨てピペットチップ(34)が、そこから得られた抽出された核酸を含有する該流体を該出力平板培地(19)の空隙まで移すために使用されることを特徴とする請求項10記載の方法。
- 該再使用可能なピペットチップ(31)が、連続するピペット操作の合間に洗浄されることを特徴とする請求項9〜11のいずれか1項に記載の方法。
- 該核酸の抽出において生成する廃棄流体を流体廃棄平板培地(17)の空隙に移すために、該使い捨てピペットチップ(34)が使用されることを特徴とする請求項9〜12のいずれか1項に記載の方法。
- 該核酸の抽出において生成する使用された使い捨てピペットチップ(34)が、チップ廃棄平板培地(16)の空隙中に収納されることを特徴とする請求項9〜13のいずれか1項に記載の方法。
- 該核酸の放出および単離の間およびその合間において、該プロセス平板培地(18)が静止した状態を保つことを特徴とする請求項9〜14のいずれか1項に記載の方法。
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