JP5231997B2 - WT117AA(−)アイソフォーム特異的siRNAおよびその利用 - Google Patents
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Description
Oji Y.ら、Int.J.Cancer 100:297(2002) Siehl J.M.ら、Ann.Hematol. 83:745(2000) Inoue K.ら、Blood 84:3071(1994) Inoue K.ら、Blood 89:1405(1997) Yamaguchi T.ら、Blood 87:2878(1996) Inoue K.ら、Blood 91:2969(1998) Oji Y.ら、Japanese Journal of Cancer Research 90:194(1999) Oji Y.ら、Int J Cancer;100:297−303(2002) Ueda T.ら、Cancer Science 94:271(2003) Oji Y.ら、Cancer Science 94:523(2003) Oji Y.ら、Cancer Science 94:606(2003) Oji Y.ら、Cancer Science 94:712(2003) Oji Y.ら、Neoplasma 51:17(2004) Oji Y.ら、Jpn.J.Clin.Oncol.34:74(2004) Hubinger G.ら、Exp Hematol 10: 1226−1235(2001) Li H.ら、Int J Hematol 77: 463−470(2003) Ito K.ら、Oncogene ;Mar 6:1(2006) Englert C.ら、Cancer Res 8: 1429−1434(1997) Loeb D.M.ら、Leukemia 17: 965−971(2003)。
本発明は、WT1 17AA(−)アイソフォーム特異的siRNAを提供するためのポリヌクレオチドに関する。
(1)医療用組成物
本発明は、WT1 17AA(−)アイソフォーム特異的siRNA(17AA(−)siRNA)を含有している医薬用組成物を提供する。本発明に係る医薬用組成物は、固形腫瘍を処置するために有効である。
本発明はまた、上述した17AA(−)siRNAを備えている、医療用キットを提供する。本明細書中において使用される場合、用語「キット」は、特定の材料を内包する容器(例えば、ボトル、プレート、チューブ、ディッシュなど)を備えた包装が意図される。好ましくは該材料を使用するための指示書を備える。本明細書中においてキットの局面において使用される場合、「備えている」は、キットを構成する個々の容器のいずれかの中に内包されている状態が意図される。また、本発明に係る医療用キットは、複数の異なる組成物を1つに梱包した包装であり得、ここで、組成物の形態は上述したような形態であり得、溶液形態の場合は容器中に内包されていてもよい。本発明に係る医療用キットは、物質Aおよび物質Bを同一の容器に混合して備えても別々の容器に備えてもよい。「指示書」は、紙またはその他の媒体に書かれていても印刷されていてもよく、あるいは磁気テープ、コンピューター読み取り可能ディスクまたはテープ、CD−ROMなどのような電子媒体に付されてもよい。本発明に係る医療用キットはまた、希釈剤、溶媒、洗浄液またはその他の試薬を内包した容器を備え得る。さらに、本発明に係る医療用キットは、治療法に適用するために必要な器具をあわせて備えてもよい。
本発明はさらに、治療法を提供する。本発明に係る方法は、上述した本発明に係る化合物を被験体に投与する工程を包含することを特徴としている。
[1.細胞培養]
ヒトの癌細胞株(卵巣癌細胞(TYK−nu.CP−r細胞(以下、TYK細胞と称する。))、胃癌細胞(MKN28細胞)、乳癌細胞(ZR−75細胞およびSKBr3細胞)、食道癌細胞(TE10細胞)、膵癌細胞(MiaPaCa2細胞)、結腸癌細胞(SW480細胞)および子宮頸癌細胞(HelaAG細胞))およびヒト線維肉腫細胞株(HT−1080細胞)を、実験に用いた。TE10細胞およびSW480細胞を、10%ウシ胎仔血清(FBS)を補充したRPMI−1640培地中で培養した。他の細胞株を、10%FBSを含むDulbecco’s modified Eagle’s medium(DMEM)中で培養した。
ヒトWT1の4つのアイソフォームのいずれかを含むpcDNA3.1(+)(Invitrogen,Carlsbad,CA,USA)を構築し、TYK細胞においてこれらのWT1アイソフォームの発現に用いた。pUC19ベクターにクローニングしたWT1アイソフォームの配列を、Pfx Taq polymerase(Invitrogen)を用いるPCRによって増幅し、pEGFPベクター(Clontech,PaloAlto,CA,USA)に挿入し、緑色蛍光タンパク質(GFP)タグ化WT1アイソフォームの一過性の発現に用いた。PCRで増幅した配列の全てにおいて、変異がないことを、BigDye Terminator V1.1 cycle sequencing kit(Applied Biosystems,Branchberg,NI,USA)を用いるdirect sequenceing法によって確認した。
哺乳動物発現ベクターおよびゲルソリンを標的化するsiRNAベクターを、PvuIで線状化し、Gene Pulsor II(Bio−Rad,CA,USA)を用いるエレクトロポレーションによって細胞に導入した。対応する選択用抗生物質を用いて、ベクターを安定して発現する細胞クローンを単離した。
5×104細胞/mLの細胞密度で、Fugene 6(Roche,Indianapolis,IN,USA)を製造業者の指示書に従って用いて、ベクターDNA(2μg)を細胞にトランスフェクトした。トランスフェクトした細胞を、示した時点で回収し、分析に用いた。
ISOGEN(Nippon Gene,Tokyo,Japan)を用いて総RNAを単離し、ジエチルピロカーボネート(DEPC)処理水中に溶解した。Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase(Promega,Madison,WI,USA)を使用して、総RNA(2μg)をcDNAに変換した。
細胞を、リン酸緩衝化生理食塩水(PBS)で2回洗浄し、SDSサンプル緩衝液(0.125M Tris−HCl(pH6.8)、100mM ジチオトレイトール、4% SDS、10%スクロースおよび0.004%ブロモフェノールブルー)で溶解した。細胞溶解物をSDS−PAGEに供し、Immobilon polyvinylidene difluoride membrane (Millipore, Bedford, MA, USA)に転写し、WT1(Dakocytomation,Carpinteria,CA,USA)、GAPDH、アクチン(Chemicon,Temecula,CA,USA)、F−アクチン(Abcam,Cambridge,UK)、α−チュブリン、コフィリン(Santa Cruz Biotechnology,Santa Cruz,CA,USA)、ゲルソリン(Sigma,St Louis,MO,USA)およびα−アクチニン1(clone AT6/172;Upstate Cell Signaling Solutions,New York,NY,USA)に特異的な抗体でイムノブロットした。
ほぼコンフルエントな細胞を回収し、6ウェルプレートの各ウェルに配置した24×24mmの滅菌カバーガラス上に5×104細胞/mLの細胞密度で10% FBSを含むDMEM1mL中に播いた。一晩培養した後、カバーガラス上の細胞を風乾し、パラホルムアルデヒド(0.5%(アクチンストレスファイバー染色用)または4%(他のタンパク質の染色用))で固定し、0.05% Tween20を含むPBSで2回洗浄し、1% Triton X−100を含むPBSで透過性にし(10分間)、ブロッキング緩衝液(2%BSA、0.2% Tween20、6.7%グリセリンおよび0.1% NaN3を含むPBS)中で30分間インキュベートし、そしてゲルソリン、α−アクチニン1またはコフィリンに対する一次抗体で1時間イムノブロットした。0.05% Tween20を含むPBSで洗浄した後、細胞を、対応する二次抗体で1時間インキュベートした。アクチンストレスファイバーおよび接着斑タンパク質ビンキュリンを、FAK100 staining kit(Chemicon)を製造業者の指示書に従って用いて染色した。これらのタンパク質の発現を、共焦点顕微鏡(LSM510 ver2.8;Carl Zeiss,Germany)を用いて解析した。
細胞接着アッセイを、Yu D.H. et al. J.Biol.Chem. 273:21 125−131(1998)に従って行った。0.5%FBSを含むDMEM中にて一晩血清を枯渇させた後、10μg/mLフィブロネクチン(Sigma)でコートした96ウェルプレートにて100μLの無血清DMEM中で1×104細胞/ウェルの細胞密度で、細胞(1×104細胞)を播き、5%CO2存在下、37℃で30分間インキュベートした。PBSで2回洗浄した後、接着した細胞をトリプシン処理して計数した。
Time lapseの顕微鏡を使用して、個々の細胞運動を解析した。要約すると、細胞を、30%コンフルエンシーで35mmディッシュに播き、48時間インキュベートした。次いで、細胞を5%O2、5%CO2、90%N2下にて37℃でインキュベートし、Meta cam software(Universal Imaging Software,Buckinghamshire,UK)を用いて、2分間隔で5時間記録した。特定の時点でのトレースした細胞の位置([X,Y])を、Commotion Pro 4.0 software(Pinnacle Systems,CA,USA)を用いて決定し、2分間毎に移動した距離を計算した。トレースした細胞の速度(μm/h)を、記録した5時間における総移動距離から決定した。
創傷治癒アッセイを、Stahle M, et al. J.Cell.Sci.;116:3835−46(2003)に従って行った。簡単には、細胞懸濁液(2×105細胞/2mL)を、6ウェルプレートにて10%FBSを含むDMEM2mL中に1×105細胞/mLの細胞密度で播き、コンフルエントまで増殖させた。コンフルエントな細胞単層を黄チップで傷付け細胞を剥がし、無血清DMEMで穏やかに2回洗浄し、10%FBSを含むDMEM中でインキュベートした。細胞の剥がれた部分を、創傷時および創傷12時間後に撮影した。細胞移動を、同一の写真上でのいくつかの視野における異なる3つの部位での傷の長さに対する突出した長さの割合(パーセント)の平均として決定した。
走化性侵入(chemotaxis invasion)アッセイを、Yoshioka K.et al. Proc Natl Acad Sci USA;100,7247−52(2003)に従って行った。0.1%BSAを含む無血清DMEM中での2時間のインキュベートの後、0.1%BSAを含む無血清DMEM200μL中の細胞(3×104細胞)を、Transwell upper chamber(PET membrane 8μm pore size;BD Falcon,NJ,USA)にアプライした。下部チャンバを、0.1%BSAを含む5%血清DMEMで満たした。18時間後、PET membraneの下側およびウェルの底面まで移動した細胞を、70%メタノールで固定し、計数した。
WT1を発現するヒト腫瘍細胞HT−1080(5×106個)を100μlのPBSで懸濁し、これを50μlのマトリゲル(BD)と混和した後に6週齢のメスのBalb/c nu/nuマウスの腹側の皮下に移植した。移植3日目よりWT1 17AA(−)アイソフォームを標的とするWT1−shRNA(50μg)またはコントロールのshRNAベクター(50μg)をlinear−polyethylenimine(L−PEI)を用いて、1週間に2回麻酔下にて腫瘍細胞移植部位に投与し、腫瘍細胞移植部位の腫瘤の長径および短径を2週間後に測定した。腫瘍容積を(長径)×(短径)×(短径)/2と定義した。
試験群の平均の間における差異の統計学的な有意差を、対応のないt検定(unpaired t−test)を用いて評価した。
図1は、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームの構成的な発現による、TYK卵巣ガン細胞における形態学的変化の誘導を示す図である。(a)は、4つのTYK細胞株(各々が異なる4つのWT1アイソフォームを導入している)におけるWT1タンパク質の発現を示すウエスタンブロット解析の結果を例示的に示す図である。(b)は、TYK細胞における各WT1アイソフォームの安定的な発現による細胞形態の変化を例示的に示す図である。スケールバーは10μmである。(c)は、3つの細胞クローンからの8個以上の個々の細胞の相対的な面積の平均を示す図である。面積をNIH Image Softwareを用いて算出した。
癌細胞のふるまいに対するWT1遺伝子の効果を試験するために、4つのWT1遺伝子のいずれか1つを、TYK卵巣癌細胞に安定的に発現させ、形質導入されたWT1アイソフォームを高レベルで発現するTYK細胞クローンを単離した(図1a)。WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームの安定な発現は、TYK細胞において、小サイズで線維芽細胞様の細胞形態によって特徴付けられる形態学的変化を誘導した(図1b、c)。対照的に、17AA(−)/KTS(−)アイソフォーム以外のWT1アイソフォームの安定な発現は、TYK細胞において何ら形態学的な変化を誘導しなかった。
WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを形質導入した細胞において観察された形態学的な変化が細胞の伸張能の変化に起因するか否かを試験するために、細胞−基質間接着に対するWT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームの構成的な発現の効果を、TYK細胞において解析した。細胞接着アッセイは、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞クローンにおいて(n=4)、Mockベクターを導入した細胞クローンと比較して(n=4)、基質に対する細胞接着が有意に低下することを示した(図3a)。さらに、細胞剥離アッセイは、Mockベクター導入細胞(n=5)と比較して、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞(n=5)の細胞−基質間接着の強度が有意に低下したことを示した(図3b)。細胞剥離アッセイにおいて、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォーム導入細胞の53.3%が、トリプシン処理の2分後にプラスチック基質から剥離したが、コントロールベクター導入細胞ではその9.8%のみが剥離した。よって、細胞−基質間接着の強度は、コントロールベクター導入細胞と比較してWT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォーム導入細胞において低下した。
細胞移動に対するWT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームの構成的な発現の効果を試験するために、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを誘導した細胞の、個々の移動、集団的な移動およびインビトロ侵入(invasion)を解析した。
WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームの構成的な発現は、TYK細胞において、形態学的な変化を誘導し、細胞−基質間接着を減弱させ、そして細胞運動を増強した。これらの結果が細胞骨格構造の変化を示唆するので、免疫細胞化学により解析を行った。予想したとおり、これらの細胞において、線維性アクチン(F−アクチン)ネットワークは減少し、接着斑は減少していた(図5a)。ウエスタンブロット分析は、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞において、Mockベクターを導入した細胞と比較してF−アクチンの発現レベルが減少したが、アクチンおよびα−チュブリンの総発現レベルは変化しないままであったことを示した(図5b)。そこで、RT−PCRにより、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞における11個のアクチン結合タンパク質(α−アクチニン1、コフィリン、ゲルソリン、FAK、プロフィリン、VASP、タリン、エズリン、モエシンおよびラディキシンを含む)のmRNA発現を調べた。図5cに示すように、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞において、α−アクチニン1およびコフィリンの発現は抑制されており、ゲルソリンの発現は増加していた。α−アクチニン1およびコフィリンの減少およびゲルソリンの増加を、ウエスタンブロット分析によってタンパク質レベルで確認した(図5d)。免疫細胞化学は、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞の細胞質において、α−アクチニン1タンパク質およびコフィリンタンパク質の発現が抑制されていることを示し、ゲルソリンタンパク質の発現が増加していることを示した(図5e)。残り8つのアクチン結合タンパク質mRNA発現については、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォームを導入した細胞とMockベクターを導入した細胞との間で変化していなかった(示さず)。
WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォ−ムを導入したTYK細胞において、α−アクチニン1およびコフィリンの発現低下が形態学的変化、接着斑の減少および細胞移動の増加に関与するか否かを調べるために、α−アクチニン1/pcDNA3.1/Zeo(+)発現ベクタ−およびコフィリン/pcDNA3.1/Zeo(+)発現ベクタ−を、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォ−ムを導入したTYK細胞に同時に導入し、そして、α−アクチニン1およびコフィリンの発現レベルがTYK親細胞に相当する細胞クロ−ン(TW/ACTN−CFL細胞を単離した(図6a)。TW/ACTN−CFL細胞の形質を、コントロ−ルpcDNA3.1/Zeo(+)ベクタ−を導入したWT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォ−ムを導入したTYK細胞クロ−ン(TW/Mock)と比較した。TW/ACTN−CFL細胞は、TYK親細胞のように十分に伸張した細胞形状へと形態学的な変化を示したが、TW/Mock細胞は示さなかった(図6b,c)。細胞剥離アッセイを行ったところ、トリプシン処理2分後のTW/ACTN−CFL細胞クロ−ン(n=3)における剥離細胞の数がTW/Mock細胞(n=3)と比較して減少し、TYK親細胞の数と同等であった(図6d)。さらに、創傷治癒アッセイを行ったところ、TW/ACTN−CFL細胞クロ−ン(n=3)の細胞運動性が、TW/Mock細胞クロ−ン(n=3)と比較して減少し、TYK親細胞の細胞運動性と同等であった(図6e)。対照的に、コフィリンまたはα−アクチニン1のいずれか一方の構成的な発現は、WT1 17AA(−)/KTS(−)アイソフォ−ムを導入したTYK細胞を親TYK細胞に匹敵する形質へ回復し得なかった(示さず)。このことは、TYK細胞の形態および挙動の調節にはα−アクチニン1およびコフィリンが協働して作用することを示す。
WT1 17AA(−)アイソフォームの発現を特異的に抑制するsiRNAベクターを構築した。具体的には、図9に示すように、17AA領域がspliced outすることにより形成される領域を標的配列とすべく、WT1 17AA(−)アイソフォームの配列5’−AGCCACCTTAAAGGGCCACAGCACAGGGTA−3’(配列番号26)を標的とした。センス鎖(5’−agccaccuuaaagggccgcgguauagggua(標的配列のセンス鎖に下線部で変異を加えた配列))−cttcctgtca(human pre−miR−23のloop配列)−uacccugugcuguggcccuuuaagguggcu(標的配列のアンチセンス鎖)からなるオリゴヌクレオチド(配列番号27)の両側に制限酵素部位を付加したオリゴDNA、および当該オリゴDNAに相補的なオリゴDNAを合成した(Japan Bio Service)。これらのオリゴDNAをアニーリングした後、piGENEtRNA Pur Vector(Clonetech)のtRNAValプロモータの下流に挿入し、loop配列を含むdsRNAを転写するWRI−17AA(−)siRNAベクターを構築した。
WT1 17AA(−)アイソフォームを標的とするWT1−shRNA(WRI)投与を行った群2匹およびコントロールshRNAベクター(mock)投与を行った群2匹における、接種したHT−1080細胞により形成された腫瘍のサイズを計測した結果を図11に示す。示すように、WT1 17AA(−)アイソフォームの発現を抑制することにより、腫瘍の増殖がインビボで抑制された。なお、図には各群の平均を示した。
Claims (11)
- 配列番号26に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基からなりかつ配列番号27に示される塩基配列を含む21〜49塩基長のポリヌクレオチドであって、WT1 17AA(+)アイソフォームの発現を阻害することなく、WT1 17AA(−)アイソフォームの発現を特異的に阻害し得るsiRNAを提供することができることを特徴とするポリヌクレオチド。
- 配列番号26に示される塩基配列からなることを特徴とするポリヌクレオチド。
- 固形腫瘍を処置するための医薬用組成物であって、
配列番号26に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基からなりかつ配列番号27に示される塩基配列を含む21〜49塩基長のポリヌクレオチドに相補的なDNAによりコードされる第1のRNAと、第1のRNAに対合し得る第2のRNAとからなる、WT1 17AA(+)アイソフォームの発現を阻害することなく、WT1 17AA(−)アイソフォームの発現を特異的に阻害し得る二本鎖RNA;
該二本鎖RNAをコードするDNA;または
該DNAが挿入されたベクター
のいずれか1つを含有していることを特徴とする医薬用組成物。 - 第2のRNAをコードするDNAが、配列番号26に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基からなりかつ配列番号27に示される塩基配列を含むポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズすることを特徴とする請求の範囲3に記載の医薬用組成物。
- 第2のRNAが配列番号29に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基を含んでいることを特徴とする請求の範囲3に記載の医薬用組成物。
- 第1のRNAが配列番号30に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基を含んでいることを特徴とする請求の範囲3に記載の医薬用組成物。
- 前記二本鎖RNAをコードするDNAが配列番号27に示される塩基配列を含んでいることを特徴とする請求の範囲3に記載の医薬用組成物。
- 前記二本鎖RNAが、配列番号29に示される塩基配列を含むRNAと配列番号30に示される塩基配列を含むRNAとが対合してなることを特徴とする請求の範囲3に記載の医薬用組成物。
- 固形腫瘍を処置するための医薬用キットであって、
配列番号26に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基からなりかつ配列番号27に示される塩基配列を含む21〜49塩基長のポリヌクレオチドに相補的なDNAによりコードされる第1のRNAと、第1のRNAに対合し得る第2のRNAとからなる、WT1 17AA(+)アイソフォームの発現を阻害することなく、WT1 17AA(−)アイソフォームの発現を特異的に阻害し得る二本鎖RNA;
該二本鎖RNAをコードするDNA;または
該DNAが挿入されたベクター
のいずれか1つを備えていることを特徴とする医薬用キット。 - 固形腫瘍を処置するための医薬を製造するための二本鎖RNAの使用であって、
該二本鎖RNAは、配列番号26に示される塩基配列の連続する少なくとも15塩基からなりかつ配列番号27に示される塩基配列を含む21〜49塩基長のポリヌクレオチドに相補的なDNAによりコードされる第1のRNAと、第1のRNAに対合し得る第2のRNAとからなる、WT1 17AA(+)アイソフォームの発現を阻害することなく、WT1 17AA(−)アイソフォームの発現を特異的に阻害し得るものであり、
該医薬は、固形腫瘍を形成する細胞に対して投与された際に該二本鎖RNAが発現可能となるものである
ことを特徴とする使用。 - 前記投与が、第1のRNAおよび第2のRNAを含むポリヌクレオチドを挿入したベクターの、目的の細胞への導入によることを特徴とする請求の範囲10に記載の使用。
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