JP4539342B2 - 解析装置、顕微鏡、および、解析プログラム - Google Patents
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Description
「BIO−PARISS イメージング分光器 カタログ」、Light Form 社
また、前記画像データに注目エリアを設定する設定手段を備え、前記決定手段は、前記注目エリアにおける前記1以上のスペクトルデータに基づいて、前記基準スペクトルデータを決定するものである。
また、前記判定手段は、前記画像データに判定エリアを設定して、該判定エリアにおける今回の画像データの前記スペクトルデータと前回の画像データの前記スペクトルデータとを比較し、前記経時変化が収束したか否かを判定するものである。
(第1実施形態)
ここでは、標本の共焦点観察を例に説明する。
本実施形態の顕微鏡10は、図1に示す通り、共焦点顕微鏡部(11〜20)と、スペクトルディテクタ部(21〜25)と、コントローラ部(26〜28)とで構成されている。
GFPの遺伝子を導入する前後において、複数のフレームの1ピクセルのスペクトルデータの変化を図示すると、例えば図2(a)〜(e)のようになる。GFPの遺伝子を導入する前は(図2(a))、生体細胞の自家蛍光のスペクトル成分が主体的である。そして、GFPの遺伝子の導入後は、GFPの発現に起因するスペクトル成分が現れ(図2(b))、時間の経過と共にGFPのスペクトル成分が次第に増加し(図2(c))、GFPの発現が成熟するとスペクトル形状は変化しなくなる(図2(d),(e))。
何れかの方法によりスペクトルデータの生成/取得処理の繰り返しを終了させるまでの間に、画像処理回路26は、スペクトルディテクタ部(21〜25)の光信号サンプリング回路25から、標本10Aの経時変化(GFPの発現過程)を表す多数のフレームについて、そのスペクトルデータ(図2(a)〜(e))を各ピクセルごとに取得したことになる。メモリ内では、各スペクトルデータがフレーム番号(観測時間)の情報とフレーム内での位置座標(ピクセル番号)の情報とに関連づけて記憶される。
この決定処理は、最終フレームの全スペクトルデータの中からGFPのスペクトル成分が顕著なスペクトルデータ(例えば図2(e))を1つ選択することにより行ってもよいし、GFPのスペクトル成分が顕著な複数のスペクトルデータ(ピクセル番号の異なるもの)を選択して平均化することにより行ってもよい。さらに、最終フレームとして2つのフレームを選択し、フレーム番号の異なる複数のスペクトルデータを平均化してもよい。
マッチング検索の前に、各データのスムージング処理や正規化処理などを行うことが好ましい。なお、スムージング処理は上記したスペクトルデータの生成/取得処理の際に行ってもよいし、ステップS1で基準スペクトルデータを決定する際に行ってもよい。この場合、ステップS3のマッチング検索の前には各データの正規化処理を行うことになる。
ステップS3のマッチング検索の結果、予め定めた閾値よりマッチング度の高い(つまり差分の小さい)ピクセルでは、そのスペクトルデータが基準スペクトルデータと略同一の形状を成すと考えられる。すなわち、マッチング度の高いピクセルは、GFPのスペクトル成分が顕著なスペクトルデータ(例えば図2(e))を有し、GFPの発現部位と考えられる。
上記した解析処理(図4)の間、コンピュータ29の表示装置には、図6(a)〜(d)に示す通り、GFPのスペクトル成分(GFPの発現部位35)の空間分布がフレームごとに表示され、更新されていく。そして、時間経過と共にGFPの発現部位35が拡大する様子(空間分布の変化)を観察することにより、標本10Aの経時変化が収束していく様子(GFPの発現が成熟していく様子)を評価することができる。
(第2実施形態)
ここでは、標本10Aの経時変化が収束した段階(例えばGFPの発現やFRETが成熟した段階)で、上記したスペクトルデータの生成/取得処理の繰り返しを効率よく自動終了させる処理(図8)について説明する。自動終了の処理(図8)は、顕微鏡10の制御回路27が行う。
また、判定エリア37の設定は、標本10Aの経時変化の途中(例えばGFPの発現やFRETが現れた段階)で行ってもよい。この場合、図8のステップS6の処理後に、判定エリア37が設定されたか否かの判断を行い、未設定の場合にはステップS7,S8の処理を省略してステップS6の処理を繰り返し、判定エリア37が設定された後、ステップS7,S8の処理を行うようにすることが好ましい。
(変形例)
なお、上記した実施形態では、標本10Aの経時変化が収束した段階(例えばGFPの発現やFRETが成熟した段階)でのスペクトルデータから基準スペクトルデータを決定する場合について説明したが、本発明はこれに限らない。標本10Aの経時変化の初期や途中の段階でのスペクトルデータから基準スペクトルデータを決定することもできる。つまり、画像処理回路26のメモリ内の1以上のスペクトルデータ(経時観測データ)に基づいて基準スペクトルデータを決定する場合に、本発明を適用できる。基準スペクトルデータの決め方に応じて、様々なスペクトル解析を行うことができる。
11 ステージ
12 レーザ光源
14,21 コリメートレンズ
15 ダイクロイックミラー
16 XYスキャナ
17 対物レンズ
18 結像レンズ
19 ピンホール板
22 グレーティング
23 集光レンズ
24 検出器
4A 光電子増倍管(PMT)
25 光信号サンプリング回路
26 画像処理回路
27 制御回路
28 XYスキャナ駆動回路
29 コンピュータ
31 細胞
32 核
33 発現領域
34 注目エリア
37 判定エリア
Claims (6)
- 経時変化する標本の画像データを構成する最小単位である各ピクセルのスペクトルデータを前記経時変化に伴って複数取得する取得手段と、
前記複数のスペクトルデータのうち、1以上の前記スペクトルデータを用いて、マッチング検索用の基準スペクトルデータを決定する決定手段と、
前記基準スペクトルデータを用いて、各々の前記スペクトルデータに対するマッチング検索を行う検索手段とを備えた
ことを特徴とする解析装置。 - 請求項1に記載の解析装置において、
前記決定手段は、前記経時変化が収束した段階における前記1以上のスペクトルデータに基づいて、前記基準スペクトルデータを決定する
ことを特徴とする解析装置。 - 請求項1に記載の解析装置において、
前記画像データに注目エリアを設定する設定手段を備え、
前記決定手段は、前記注目エリアにおける前記1以上のスペクトルデータに基づいて、前記基準スペクトルデータを決定する
ことを特徴とする解析装置。 - 請求項1から請求項3の何れか1項に記載の解析装置と、
前記スペクトルデータを生成して前記取得手段に出力する生成手段と、
前記生成手段が1つの前記画像データにおける全ての前記スペクトルデータの生成を終了したときに、今回の画像データの前記スペクトルデータと前回の画像データの前記スペクトルデータとを比較し、前記経時変化が収束したか否かを判定する判定手段と、
前記判定手段による判定の結果、前記経時変化が収束したときに、前記生成手段による前記スペクトルデータの生成を終了させる制御手段とを備えた
ことを特徴とする顕微鏡。 - 請求項4に記載の顕微鏡において、
前記判定手段は、前記画像データに判定エリアを設定して、該判定エリアにおける今回の画像データの前記スペクトルデータと前回の画像データの前記スペクトルデータとを比較し、前記経時変化が収束したか否かを判定する
ことを特徴とする顕微鏡。 - 経時変化する標本の画像データを構成する最小単位である各ピクセルのスペクトルデータを前記経時変化に伴って複数取得する取得手順と、
前記複数のスペクトルデータのうち、1以上の前記スペクトルデータを用いて、マッチング検索用の基準スペクトルデータを決定する決定手順と、
前記基準スペクトルデータを用いて、各々の前記スペクトルデータに対するマッチング検索を行う検索手順と
をコンピュータに実行させるための解析プログラム。
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