JP4420821B2 - 組織学的アセスメント - Google Patents
組織学的アセスメント Download PDFInfo
- Publication number
- JP4420821B2 JP4420821B2 JP2004528645A JP2004528645A JP4420821B2 JP 4420821 B2 JP4420821 B2 JP 4420821B2 JP 2004528645 A JP2004528645 A JP 2004528645A JP 2004528645 A JP2004528645 A JP 2004528645A JP 4420821 B2 JP4420821 B2 JP 4420821B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- saturation
- hue
- pixel
- pixels
- image data
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S128/00—Surgery
- Y10S128/92—Computer assisted medical diagnostics
- Y10S128/922—Computer assisted medical diagnostics including image analysis
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Image Processing (AREA)
- Image Analysis (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Spectrometry And Color Measurement (AREA)
Description
本発明の目的は、ER状態、PR状態、「C−erb−2」、及び血菅分布のうちの少なくとも1つの客観的測定のための技術を提供することである。
本発明は、それがコンピュータ実施可能であり、従って、マニュアル検査処理の主観性を回避する方法で実行されるという利点を提供する。
段階c)は、画像データを色度空間に変換し、画像ピクセル及び基準色から色相及び飽和度を導出することによって実施することができる。色相は、
正規化された平均飽和度には、それぞれ、(i)≦25%、(ii)>25%及び≦50%、(iii)>50%及び≦75%、又は(iv)>75%及び≦100%であるか否かに従って得点0、1、2、又は3を与えることができる。
正規化された平均飽和度と優先的に染色された細胞に対応するピクセルの割合とに対する得点は、互いに加算してER又はPRの測定値をもたらすことができる。
この態様では、ウィンドウ関数の少なくともいくつかは、6、12、24、及び48ピクセルという非ゼロ値をそれぞれ有し、それ以外の場所ではゼロ値を有することができる。細胞境界に関連するピクセルは、細胞境界幅の推定値を与える長さを有するウィンドウ関数との最大相関から識別される。
段階d)では、細胞境界回りの明度の範囲の明度関連の尺度は、各々がそれぞれのマグニチュードの範囲に関連する異なるマグニチュードのグループに正規化境界マグニチュードを分割し、各マグニチュードのグループに対して正規化境界マグニチュードのそれぞれのマグニチュード合計を与え、より大きなマグニチュードの合計からより小さなマグニチュードの合計を差し引く段階を含む計算を用いて計算することができる。
画像データに関して判断された尺度に最も近い明度関連尺度を有する比較画像は、比較画像及び画像データの明度関連尺度間のユークリッド距離から判断することができる。
RMM及びCMM値の最初の3つの対は、それぞれ、0.802と1.24、0.903と0.903、及び1.24と0.802とすることができる。
閾値化された赤色画像は、形態的閉鎖操作を受ける場合がある。
本発明のコンピュータプログラム及び装置の態様は、それぞれの方法の態様の特徴に対応する好ましい特徴を有することができる。
ここで、本発明をより十分に理解することができるように、添付図面を参照して単に例示的にその実施形態を以下に説明する。
乳房の潜在的な癌腫の病理組織学的スライドという形態の組織サンプル評価の手順10を図1に示す。この図は、患者診断、予後、及び治療計画を評価するための基盤として病理学者によって使用される特化された種類の測定結果を生成する処理を示す。
a)基体(化学染色剤)としてジアミノベンジジン(DAB)を用いる「C−erb−2」の免疫組織化学的染色−集合的に「Cerb−DAB」。これは、「C−erb−2」遺伝子増幅状態を評価するためのものである。
b)エストロゲン受容体の発現(発現又は放出量)を評価するための基体としてのDABを伴うエストロゲン受容体(ER)(集合的に「ER−DAB」)。プロゲステロン受容体(PR)状態は、ERにおけるものと同じ染色が得られる化学処理を用いて調査する。
c)血菅分布を評価するための基体としてフクシン(F)を用いるCD31に対する免疫組織化学的染色(血管形成)。
本発明では、適切な形態による組織学的スライドから得られたデータが必要である。本実施例においては、画像データは、「Jenoptiks Progres 3012」デジタルカメラ付きの「Zeiss Axioskop」顕微鏡を使用して病理学者によって得られたものである。各スライドから得られたデータは、40の線形拡大(すなわち、40X)で得られた一組のデジタル画像であり、各画像は、タイルの電子的均等物である。このカメラを使用した40Xの倍率では、画像内の各ピクセルは、拡大していないスライドにおける一辺約220nmの正方形(実際には、縦218nm×横225nm)に相当する。従って、ピクセルは、±5%よりも良い誤差で正方形であり、これは、後述する画像処理技術で仮定されるものである。
14での血菅分布測定に対して3つのタイルが必要であり、16でのエストロゲン受容体及びプロゲステロン受容体の測定、及び18での「C−erb−2」の測定の各々に対してタイル1つが必要である。これらの測定結果は、20での診断報告の入力となる。
クラスター及びマハラノビスの距離を用いてデジタルカラー画像にK平均クラスター化アルゴリズム30が適用される。クラスターは、関連の距離と類似の値を有するデータの自然なグループ分けであり、マハラノビスの距離は、クラスター中心に対するデータ項目の緊密の程度の指示を与える測定値である。細胞核をピクセルグループとして位置付けるための何らかの手段を有することが必要であるが、4つのクラスター又はマハラノビスの距離を使用することは必須のものではない。これらは、これまで、それぞれの細胞核に対応する近接ピクセルのグループを識別する際に良好に機能することが判明している。K平均アルゴリズムについては、J.A.Hartigan及びM.A.Wong著の論文「K平均クラスター化アルゴリズム」、アルゴリズムAS136、応用統計学会誌、1979年によって説明されている。マハラノビスの距離については、F.Heijden著「画像ベース測定システム−オブジェクト認識及びパラメータ推定」、ジョン・ワイリー・アンド・サンズ、1994年、及びR.Schalkoff「パターン認識−統計的、構造的、神経的手法」、ジョン・ワイリー・アンド・サンズ・インコーポレーテッド、1992年で説明されている。この処理は、初期化段階a)、その後の段階b)での共分散行列の計算を含む。これは、段階c)での確率計算に至り、この計算により、クラスター中心からのピクセルの距離が実質的に得られる。この手順は、以下の通りである。
i)式(1)から、各クラスターのピクセル内の異なる色の強度間の変化の程度を示す画像バンドの共分散行列の種類σk ijの要素を計算する。
c)ピクセル番号を示す指数iで、各ピクセル:
また、式(2)は、他の全てのクラスターにおける同じピクセルベクトル:
どのピクセルがクラスターkに属するかの記録をアレイXkとして記憶し、そのクラスターに割り当てられた各ピクセルベクトルでそれを更新し、そのクラスター内のピクセルの数Nkを更新する。
ここでは、第1のクラスター(k=1)は、細胞核に対応し、対応するピクセルベクトルは、出力及び更に別の処理に対して関連あるものとして並べられたものである。
実際には、明度は、化学染色の程度及びスライドに亘るサンプル厚みの変動、並びに画像を生成するのに使用されるカメラレンズによるぼかしの可能性のために変わりやすい。その結果、本実施例においては、後述するように色相(又は色)及び飽和度の測定値の計算に重点を置いている。
r=R/(R+G+B)、g=G/(R+G+B)、及び、b=B/(R+G+B) (5)
色度空間58内の点Pから線JK及びLDまでの垂線は、それぞれ、E及びGで後者と出会う。P及びGから平面JOKまでの垂線は、それぞれ、F及びHで後者と出会う。
式(5)を使用すると、三角形色度空間58内の点Pは、次に、図4に示すx座標及びy座標によって定義され、以下の式によって与えることができる。
(d)図6において、極座標系(r,θ)は、ここでは(R+G+B=1)平面つまり色度空間85上で定義される。座標系原点は、三角形58の重心Gである。θ=0に対する基準方向は、図5の基準色Sに向う半径ベクトルの方向QSとして定義される。HSV色空間において座標(x,y)を有するとして定義された三角形上のPのような任意の点に対して、色相Hは、自身に対する半径ベクトル(例えば、QP)と基準色に対する半径ベクトルQSとの間の角度φとして定義される。これは、34でφに対する以下の式から計算される。
ER及びPRの画像は、視覚的に識別することができず、異なる染色を使用して生成されることによって区別される。従って、PRの得点は、上述のERの得点と同じ方法で染色スライドから得られる。乳癌種におけるプロゲステロン受容体(PR)陽性の重要性は、ERの均等物ほどは十分に理解されていない。また、一般的に、ER陽性の癌はPR陽性になる。しかし、ER陽性ではなくてPR陽性の癌腫の方が予後が悪いものとなる場合がある。
残念ながら、以下のように、測定をより複雑なものにするアーチファクトがある。
退縮(収縮)によるアーチファクト:真の細胞膜染色よりもぼけて画定される。
熱によるアーチファクト:電気焼灼器を用いた場合、かなり画定不良の染色が発生する。
粉砕によるアーチファクト:組織が不注意で機械的に変形し、染色の画定不良を大きくする。
熱及び粉砕によるアーチファクトは、通常は、組織サンプルの境界部に限定され、望ましくは、タイルの撮影を行う臨床医によってある程度スライドから除外されるであろう。しかし、画定不良の染色が細胞膜に付着しないように防ぐことはそれでも重要なことである。
細胞膜染色の完全性、
細胞膜染色の強度及び厚み、及び
細胞膜染色の比率。
本発明では2つの主な段階があり、これらは、画像の品質が劣る場合は、任意的に前処理によって先行させることができる。主な段階は、以下のものである。
腫瘍に関連する面積及び位置の制限を満たす細胞核を見つける段階、及び
先の段階で見つかった細胞核の細胞膜を特徴付ける得点を判断する段階。
段階71から段階78で画像のセグメント化、すなわち、デジタル画像における背景からの事物の自動分離が行われる。タイルの元のデジタル画像は、赤、緑、及び青色の画像平面を有する。段階71では、緑色及び青色の画像平面からシアン画像平面を導出され、段階72では、ソーベルフィルタ処理されたシアン画像平面が導出される。この時点で、画像平面は5つである。これらのうち、赤色及び青色の画像平面は、従来の色の染色に関して必須のものであり、他の画像平面は、赤色画像平面に対する望ましいが必須のものではない濾過作業に使用される。74及び76では、5つの画像平面の統計学的尺度が計算され、その後、78では、不要なピクセル及び空間的ノイズを除去するために既に濾過されたセグメント化画像が最適化されて生成される。セグメント化画像では、細胞核が識別される。段階78は、ピクセル回りの領域からの情報を用いる適応閾値化技術であり、それは、鎖線80内により詳細に示されており、矢印82は反復を示している。これは、同じく使用することができる上述のK平均クラスター化アルゴリズムの代案である。
各細胞に対して、88では、細胞境界明度値、細胞膜幅、及び強度の最も高い染色部の図心からの距離を判断するために、一連の様々な幅の相互相関ウィンドウが細胞の図心から4つの半径に沿って通される。細胞境界明度値は、細胞膜幅で割ることによって正規化される。その後、核面積と各細胞の正規化された境界明度値の合計とが得られる。その後、細胞膜染色強度、特異性、及び完全性を特徴付ける統計学的な尺度が推論される。これらの尺度は、4つの基準画像から得られた均等物と比較される。その後、測定された画像は、ユークリッド距離基準を用いて、最も近い基準値の得点である得点を割り当てることによって等級が付けられる。他の距離基準を使用することもできる。代替的に、適度に大きいサンプルの得点を基準値として使用してもよい。
(a)画像を適切な数のタイルに分割して(個々の変動性は少ない)別々に処理する段階。これは、一般的にオプションと考えるべきであるが、個々の画像に亘って適切な均一性がある場合は必要ではない。又は
(b)好ましくは、十分な画像が同じカメラ対物レンズから利用可能である場合、境界に亘って分割されたより多くの部分細胞で副画像を処理するのではなく、その不足分を計算して補正する段階。
p={Ci-1,j-1+2Ci-1,j+Ci-1,j+1}−{Ci+1,j-1+2Ci+1,j+Ci+1,j+1} (12)
q={Ci-1,j-1+2Ci,j-1+Ci+1,j-1}−{Ci-1,j+1+2Ci,j+1+Ci+1,j+1} (13)
i=j=2で始まり、p及びqは、行の最後に到達するまでjを1だけ上げて各このようなアレイについて式(2)及び(3)を評価することによって連続的な3×3ピクセルアレイについて計算される。その後、jを1だけ上げて、画像全体が変換されるまで第2の行などについてこの手順を繰り返す。この変換画像は、以下では「シアンのソーベル」画像又は画像平面と呼ばれる。
赤色画像平面については、統計学的パラメータは、そのピクセル値の平均μR及び標準偏差σRである。式(15)及び(14)では、xkは、赤色画像平面における一般的なピクセル値を表す。更に、最大値、最小値、範囲(最大値−最小値)を得るために、赤色画像平面のピクセルを互いに比較する。同様に、各平面についてそれぞれの最大値、最小値、及び範囲を得るために、緑色及び青色の画像ピクセルの各々におけるピクセルを互いに比較する。最後に、シアン画像については、ピクセルの平均及び標準偏差を式(14)及び(15)を使用して計算するが、ここでは、xkは、シアン画像平面における一般的なピクセル値を表す。
(a)以下のように、赤色画像平面(青色に対してほぼ相補的)について閾値化画像を生成する。適応閾値よりも小さい全ての赤色ピクセル値については、閾値化赤色画像内の対応するピクセル位置を1に設定する。それ以外の場合は、それを0に設定する。以下のように、全てピクセル位置についてそれぞれの適応閾値を個別に計算する。段階78のa)では、赤色画像閾値は、各ピクセル近傍の囲い茶色染色の存在に依存し、すなわち、それは、シアン平均μc及び赤色平均μRの関数である。考慮中のピクセルから外方に半径方向に検索することによって囲み茶色がないか検査を行う。この手順は、シアン画像平面において赤色画像平面と同じピクセル位置を選択し、そこから4つの方向、つまり東西南北の方向に70ピクセル(又は、70までの最大の利用可能な数)の距離がないか検索することである。ここで、東西南北は以下の意味を有する。すなわち、北は同じ列のピクセルから上方、南は同じ列のピクセルから下方、東は同じ行のピクセルから右、及び西は同じ行のピクセルから左にという意味を有する。精度を向上させるために、より多くの方向(例えば、対角的な北−東、北−西、南−東、及び南−西)を使用することができるが、本例では4つが適切であることが判明している。これらの方向又は半径のいずれにおいても、シアンピクセルが閾値(茶色ピクセルを示す)よりも小さいか、又は、シアンピクセルがそうしなくても70ピクセルの半径に到達することになるかのいずれかである。ここで、半径に対する70ピクセル値又はピクセル数Np1は、上述のように、40倍の倍率及び未拡大スライド上の220nmの距離に対応するピクセル側面長さに相当する。nm単位による別のピクセル側面長さLp2を与える別の倍率の場合、新しいピクセル数Np2又は半径は、Np1(220/Lp2)ピクセルであるべきである。その後、以下の方法で赤色閾値を適応的に変更するために「茶色」半径の数RB(少なくとも1つの茶色ピクセルと交差する半径)を使用する。新しい赤色画像平面閾値RTN=RMM1μR−σR(4−RB)が計算され、ただし、RMM1μRは、RMM1とμRの積であり、σRは、赤色画像平面の標準偏差である。限界値をRTNに置くと、255という最大可能値が得られる。考慮中の赤色画像平面ピクセルがそれに対して計算された赤色画像平面閾値よりも小さい場合、閾値化赤色画像内の同じ位置にある対応するピクセルを1に設定し、それ以外の場合はゼロに設定する。
(c)シアンのソーベルの画像平面を使用し、段階74からのシアン平均μc及び標準偏差σcを用いて、(μc+1.5σc)よりも大きい全てシアンピクセル値に対して閾値化赤色画像内の対応するピクセルをゼロに設定し、それ以外はピクセルを変更しない。これは、余分な茶色エッジピクセルを除去する効果を有する。
(i)赤色値>赤色最小値+0.98×(赤色範囲)、かつ
(ii)緑色ピクセル>緑色最小値+0.98×(緑色範囲)、かつ
(iii)青色ピクセル>青色最小値+0.98×(青色範囲)
段階(c)及び段階(d)は、必要に応じて、その後の手順の変更を行って鎖線80内に形成された回帰ループの外側に移動させることができるであろう。
段階(a)から(f)は、全ての開始点又は三角形頂点(RMM1,CMM1)、(RMM2,CMM2)、及び(RMM3,CMM3)の全てについて実施される。これによって、各場合の2値画像内に残る領域の数に対して3つの値が得られる。
下降シンプレックス法で画像領域数が少なくとも16個であると判断された場合、84において処理は88に切り替わり、そこで、これらの領域の境界を特徴付けるための検索を実施する。検索では、78(f)での接続成分ラベル付けにおいて得られるような各領域の面積及び図心ピクセル位置が使用され、各領域は、細胞核の中心である図心を有する細胞であると仮定される。この仮定は、ほとんどの細胞について正当化されるが、図心を保持しない不格好な細胞がある可能性がある。例えば、くぼんだ境界領域を有するものを排除することによって不格好な細胞を無視することが可能であるが、本例では実施されない。
その後、各最大値又は領域境界マグニチュードは、これを導出するために使用された関連するウィンドウサイズ(領域境界幅)で割り算される。これは、この明細書の目的に対して正規化境界マグニチュードと呼ばれるものを形成する。これは、明度と鮮明度の両方の尺度である。これは、細胞膜に付着していない不明瞭な染色に対する区別を可能にする。
octile=画像領域又は細胞核の総数の1/8 (16)
境界=正規化境界マグニチュード (17)
Σ=・・・の合計(部分集合又は最良octile内の全ての境界に亘って) (18)
項目1=最大正規化境界マグニチュード (19)
項目3=3番目に大きい正規化境界マグニチュード (20)
grand_mean=6×[(Σ最大の境界)+(Σ2番目に大きい境界)+(Σ3番目に大きい境界)+(Σ最小の境界)]/4octile (21)
mean_range=[(Σ項目1)−(Σ項目3)]/octile (22)
relative_range=10×mean_range/grand_mean (23)
「C−erb−2」指標=mini{(Mi−総平均)2+(RRi−相対範囲)2} (24)
ただし、miniは、式(24)の右辺の中括弧{ }内の式が最小であるi(i=0,1,2,又は3)の値である。ベクトルMについては、データセットからM0=12.32、M1=23.16、M2=42.34、及びM3=87.35という要素が判断された。ベクトルRRに対して同様に判断された要素は、RR0=2.501、RR1=1.85、RR2=1.111、及びRR3=0.5394であった。指数iの値は、「C−erb−2」測定処理に対する指標として戻される。
Let M=(R,G,B)の最大値 (25)
Let m=(R,G,B)の最小値 (26)
次に、newr=(M−R)/(M−m) (27)
newg=(M−G)/(M−m)、及び (28)
newb=(M−B)/(M−m) (29)
これによって、ピクセルの各色は、そのマグニチュードとそのピクセルの3つの色のマグニチュードの最大値のマグニチュードとの間の差分に変換され、この差分を(R、G、B)の最大値と最小値の差分で割る。
Mがゼロに等しい場合、S=0 (30)
Mがゼロに等しくない場合、S=(M−m)/M (31)
色相(H)の計算は、以下の通りである。すなわち、式(25)から、Mは、R、G、及びBのうちの少なくとも1つに等しくなければならない。
Mがゼロに等しい場合、H=180 (32)
MがRに等しい場合、H=60(newb−newg) (33)
MがGに等しい場合、H=60(2+newr−newb) (34)
MがBに等しい場合、H=60(4+newrg−newr) (35)
Hが360又はそれ以上である場合、H=H−360 (36)
Hが0よりも小さい場合、H=H+360 (37)
値Vは、この例では使用しないが、仮に使用する場合は(R、G、B)の最大値に設定されるであろう。
次の段階104は、接続成分のラベル付け(先に定義済み)をセグメント化された2値画像に適用することである。これによって、1に等しい近接ピクセルの領域を有する2値画像が得られ、領域は、更に別の処理に向けて独特にラベル付けされ、それらの面積が判断される。次に、血菅分布に貢献しない不十分なピクセルを有する小さな接続された成分(10ピクセルよりも小さい画像領域)を除去するために、ラベル付けされた2値画像を空間的に濾過し、これは、低減した2値画像をもたらす。
下表10に示すように、血菅分布は、それが少なくとも31%に等しいか否かによって高い又は低いと判断される。
本明細書で説明した3つの発明の全ての例で説明した処理段階は、全てが必須のものではなく、代替案を与えることができる。例えば、結果的に増大する処理上の負担が許容可能である場合は、その後の処理のための面積を選択する際の不適切に小さな面積を無視する段階は、省略することが可能である。以上の例は、実行可能な開示を提供し、本発明を制限しないことを意図するものである。
14 血菅分布の測定
16 エストロゲン及びプロゲステロン受容体の測定
18 「Cerb B2」の測定
Claims (14)
- コンピュータ制御を用いて実行するエストロゲン又はプロゲステロン受容体(ER又はPR)状態を測定する方法であって、
a)病理組織学的標本の画像データを取得する段階と、
b)前記画像データにおいてそれぞれの細胞核に対応する近接ピクセルのグループを識別する段階と、
c)色相座標及び飽和度座標を有する色空間において、画像データに対する色相及び飽和度を導出する段階と、
d)色相及び飽和度に基づいて前記画像データを閾値化し、周囲の標本組織に対して優先的に染色された細胞に対応するピクセルを識別する段階であって、ピクセルは、予め決められた色相閾値よりも小さい色相係数であり、前記ピクセルの飽和度が予め決められた範囲内にあるか否かに応じて異なる値になる飽和度閾値よりも大きい飽和度である場合に、優先的に染色された細胞に対応するように識別される、前記識別する段階と、
e)優先的に染色された細胞に対応するように識別されたピクセルの正規化された平均飽和度、及び、画像データ内にあるピクセルの総数に対する、前記識別されたピクセルの数の割合の組み合わせからER又はPR状態を判断する段階と、
を更に含むことを特徴とするコンピュータにより実行される方法。 - 前記色相及び飽和度を導出する段階は、前記画像データ内にあるピクセルのピクセル値を色度空間に変換し、前記色度空間内にあるピクセルの色データの座標及び前記色度空間内にある基準色の座標から色相及び飽和度を導出することによって実行されることを特徴とする請求項1に記載のコンピュータにより実行される方法。
- 色相は、0から90度の範囲にあるようになっており、色相閾値が、80度であることを特徴とする請求項1又は2に記載のコンピュータにより実行される方法。
- 飽和度閾値0.1から1.9の範囲の飽和度に対して0.9、及びこの範囲外の飽和度に対して0であることを特徴とする請求項1又は2に記載のコンピュータにより実行される方法。
- ER又はPR状態を判断する段階は、正規化された平均飽和度の第一得点と優先的に染色された細胞に対応するピクセルの割合の第二得点とを取得し、該第一得点及び第二得点を互いに加算することによって実行されることを特徴とする請求項1に記載のコンピュータにより実行される方法。
- コンピュータ装置を制御するためのプログラムコードを組み込むER又はPR状態を測定する際に使用するためのコンピュータプログラムであって、
a)画像データにおいてそれぞれの細胞核に対応する近接ピクセルのグループを識別する段階と、
b)色相座標及び飽和度座標を有する色空間において画像データに対する色相及び飽和度を導出する段階と、
c)色相及び飽和度に基づいて前記画像データを閾値化し、周囲の標本組織に対して優先的に染色された細胞に対応するピクセルを識別する段階であって、前記ピクセルは、予め決められた色相閾値よりも小さい色相係数であり、ピクセルの飽和度が予め決められた範囲内にあるか否かに応じて異なる値になる飽和度閾値よりも大きい飽和度である場合に、優先的に染色された細胞に対応するように識別される、前記識別する段階と、
d)優先的に染色された細胞に対応するように識別されたピクセルの正規化された平均飽和度、及び、画像データ内にあるピクセルの総数に対する、前記優先的に染色された細胞に対応するように識別されたピクセルの数の割合の組み合わせからER又はPR状態を判断する段階と、
を実施するように構成されたことを特徴とするコンピュータプログラム。 - 前記コンピュータ装置を制御するためのプログラムコードは、
前記画像データ内にあるピクセルのピクセル値を色度空間に変換し、前記色度空間内にあるピクセルの色データの座標及び前記色度空間内にある基準色の座標から色相及び飽和度を導出する段階、
を実施するように構成されたことを特徴とする請求項7に記載のコンピュータプログラム。 - 前記コンピュータ装置を制御するためのプログラムコードは、
正規化された平均飽和度の第一得点と優先的に染色された細胞に対応するピクセルの割合の第二得点とを取得し、該第一得点及び第二得点を互いに加算することによって、ER又はPR状態を判断するように、
構成されたことを特徴とする請求項7に記載のコンピュータプログラム。 - 画像データを準備するために病理組織学的標本を撮影するためのコンピュータ制御により実行される手段と、該画像データを処理するためのコンピュータ装置とを含むER又はPR状態を測定するための装置であって、
コンピュータ装置が、
a)該画像データにおいてそれぞれの細胞核に対応する近接ピクセルのグループを識別する段階と、
b)色相座標及び飽和度座標を有する色空間において画像データに対する色相及び飽和度を導出する段階と、
c)色相及び飽和度に基づいて前記画像データを閾値化し、周囲の標本組織に対して優先的に染色された細胞に対応するピクセルを識別する段階であって、前記ピクセルは、予め決められた色相閾値よりも小さい色相係数であり、ピクセルの飽和度が予め決められた範囲内にあるか否かに応じて異なる値になる飽和度閾値よりも大きい飽和度である場合に、優先的に染色された細胞に対応するように識別される、前記識別する段階と、
d)優先的に染色された細胞に対応するように識別されたピクセルの正規化された平均飽和度、及び、画像データ内にあるピクセルの総数に対する、前記優先的に染色された細胞に対応するように識別されたピクセルの数の割合の組み合わせからER又はPR状態を判断する段階と、
を実行するようにプログラムされたことを特徴とする装置。 - 前記コンピュータ装置は、前記画像データ内にあるピクセルのピクセル値を色度空間に変換し、前記色度空間内にあるピクセルの色データの座標及び前記色度空間内にある基準色の座標から色相及び飽和度を導出することによって、前記色相及び飽和度を導出する段階を実行するようにプログラムされたことを特徴とする請求項11に記載の装置。
- 前記コンピュータ装置は、
正規化された平均飽和度の第一得点と優先的に染色された細胞に対応するピクセルの割合の第二得点とを取得し、該第一得点及び第二得点を互いに加算することによって、ER又はPR状態を判断するように、
構成されたことを特徴とする請求項11に記載の装置。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB0218909A GB0218909D0 (en) | 2002-08-15 | 2002-08-15 | Histological assessment |
GB0219271A GB0219271D0 (en) | 2002-08-15 | 2002-08-19 | Histological assessment |
GB0222035A GB0222035D0 (en) | 2002-08-15 | 2002-09-23 | Histological assessment |
GB0222218A GB0222218D0 (en) | 2002-08-15 | 2002-09-25 | Histological assessment |
PCT/GB2003/003465 WO2004017052A2 (en) | 2002-08-15 | 2003-08-08 | Histological assessment |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009241484A Division JP4981112B2 (ja) | 2002-08-15 | 2009-10-20 | 組織学的アセスメント |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2005535892A JP2005535892A (ja) | 2005-11-24 |
JP4420821B2 true JP4420821B2 (ja) | 2010-02-24 |
Family
ID=28678966
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2004528645A Expired - Fee Related JP4420821B2 (ja) | 2002-08-15 | 2003-08-08 | 組織学的アセスメント |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20030165263A1 (ja) |
EP (1) | EP1529207A2 (ja) |
JP (1) | JP4420821B2 (ja) |
AU (1) | AU2003255763A1 (ja) |
WO (1) | WO2004017052A2 (ja) |
Families Citing this family (115)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2002230842A1 (en) | 2000-10-30 | 2002-05-15 | The General Hospital Corporation | Optical methods and systems for tissue analysis |
US9295391B1 (en) | 2000-11-10 | 2016-03-29 | The General Hospital Corporation | Spectrally encoded miniature endoscopic imaging probe |
GB2408797B (en) | 2001-05-01 | 2006-09-20 | Gen Hospital Corp | Method and apparatus for determination of atherosclerotic plaque type by measurement of tissue optical properties |
US7355716B2 (en) | 2002-01-24 | 2008-04-08 | The General Hospital Corporation | Apparatus and method for ranging and noise reduction of low coherence interferometry LCI and optical coherence tomography OCT signals by parallel detection of spectral bands |
US20030165263A1 (en) * | 2002-02-19 | 2003-09-04 | Hamer Michael J. | Histological assessment |
GB0229734D0 (en) * | 2002-12-23 | 2003-01-29 | Qinetiq Ltd | Grading oestrogen and progesterone receptors expression |
WO2004066824A2 (en) | 2003-01-24 | 2004-08-12 | The General Hospital Corporation | System and method for identifying tissue using low-coherence interferometry |
US7643153B2 (en) | 2003-01-24 | 2010-01-05 | The General Hospital Corporation | Apparatus and method for ranging and noise reduction of low coherence interferometry LCI and optical coherence tomography OCT signals by parallel detection of spectral bands |
US7337398B1 (en) | 2003-02-28 | 2008-02-26 | Adobe Systems Incorporated | Reconstitute tag-delimited tables in a graphics editing application |
CA2519937C (en) | 2003-03-31 | 2012-11-20 | Guillermo J. Tearney | Speckle reduction in optical coherence tomography by path length encoded angular compounding |
JP2007526620A (ja) | 2003-06-06 | 2007-09-13 | ザ・ジェネラル・ホスピタル・コーポレイション | 波長同調発信源装置及びその方法 |
US20050136549A1 (en) * | 2003-10-30 | 2005-06-23 | Bioimagene, Inc. | Method and system for automatically determining diagnostic saliency of digital images |
US8068988B2 (en) | 2003-09-08 | 2011-11-29 | Ventana Medical Systems, Inc. | Method for automated processing of digital images of tissue micro-arrays (TMA) |
WO2005027015A2 (en) * | 2003-09-10 | 2005-03-24 | Bioimagene, Inc. | Method and system for quantitatively analyzing biological samples |
EP2270448B1 (en) | 2003-10-27 | 2020-03-18 | The General Hospital Corporation | Method and apparatus for performing optical imaging using frequency-domain interferometry |
US7343046B2 (en) * | 2004-02-12 | 2008-03-11 | Xerox Corporation | Systems and methods for organizing image data into regions |
KR101239250B1 (ko) | 2004-05-29 | 2013-03-05 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 광간섭 단층촬영 화상 진단에서 반사층을 이용한 색 분산보상을 위한 프로세스, 시스템 및 소프트웨어 배열 |
AU2005270037B2 (en) | 2004-07-02 | 2012-02-09 | The General Hospital Corporation | Endoscopic imaging probe comprising dual clad fibre |
US8081316B2 (en) | 2004-08-06 | 2011-12-20 | The General Hospital Corporation | Process, system and software arrangement for determining at least one location in a sample using an optical coherence tomography |
JP5324095B2 (ja) | 2004-08-24 | 2013-10-23 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 血管セグメントを画像化する方法および装置 |
WO2006024014A2 (en) | 2004-08-24 | 2006-03-02 | The General Hospital Corporation | Process, system and software arrangement for measuring a mechanical strain and elastic properties of a sample |
US7365859B2 (en) | 2004-09-10 | 2008-04-29 | The General Hospital Corporation | System and method for optical coherence imaging |
KR101257100B1 (ko) | 2004-09-29 | 2013-04-22 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 광 간섭 영상화 시스템 및 방법 |
WO2006058049A1 (en) | 2004-11-24 | 2006-06-01 | The General Hospital Corporation | Common-path interferometer for endoscopic oct |
EP1816949A1 (en) | 2004-11-29 | 2007-08-15 | The General Hospital Corporation | Arrangements, devices, endoscopes, catheters and methods for performing optical imaging by simultaneously illuminating and detecting multiple points on a sample |
EP1875436B1 (en) * | 2005-04-28 | 2009-12-09 | The General Hospital Corporation | Evaluation of image features of an anatomical structure in optical coherence tomography images |
WO2006130802A2 (en) | 2005-06-01 | 2006-12-07 | The General Hospital Corporation | Apparatus, method and system for performing phase-resolved optical frequency domain imaging |
WO2007019574A2 (en) | 2005-08-09 | 2007-02-15 | The General Hospital Corporation | Apparatus, methods and storage medium for performing polarization-based quadrature demodulation in optical coherence tomography |
GB2430026A (en) | 2005-09-09 | 2007-03-14 | Qinetiq Ltd | Automated selection of image regions |
PL1937137T3 (pl) | 2005-09-29 | 2022-11-21 | General Hospital Corporation | Sposób oraz aparatura dla obrazowania optycznego za pośrednictwem kodowania spektralnego |
US7889348B2 (en) | 2005-10-14 | 2011-02-15 | The General Hospital Corporation | Arrangements and methods for facilitating photoluminescence imaging |
GB2433985A (en) * | 2006-01-09 | 2007-07-11 | Cytokinetics Inc | Characterization of features within the boundary regions of biological cells |
JP5680826B2 (ja) | 2006-01-10 | 2015-03-04 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 1以上のスペクトルを符号化する内視鏡技術によるデータ生成システム |
US9087368B2 (en) | 2006-01-19 | 2015-07-21 | The General Hospital Corporation | Methods and systems for optical imaging or epithelial luminal organs by beam scanning thereof |
WO2007084903A2 (en) | 2006-01-19 | 2007-07-26 | The General Hospital Corporation | Apparatus for obtaining information for a structure using spectrally-encoded endoscopy techniques and method for producing one or more optical arrangements |
JP5524487B2 (ja) | 2006-02-01 | 2014-06-18 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | コンフォーマルレーザ治療手順を用いてサンプルの少なくとも一部分に電磁放射を放射する方法及びシステム。 |
EP2659852A3 (en) | 2006-02-01 | 2014-01-15 | The General Hospital Corporation | Apparatus for applying a plurality of electro-magnetic radiations to a sample |
WO2007092911A2 (en) | 2006-02-08 | 2007-08-16 | The General Hospital Corporation | Methods, arrangements and systems for obtaining information associated with an anatomical sample using optical microscopy |
JP2009527770A (ja) | 2006-02-24 | 2009-07-30 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 角度分解型のフーリエドメイン光干渉断層撮影法を遂行する方法及びシステム |
EP2015669A2 (en) | 2006-05-10 | 2009-01-21 | The General Hospital Corporation | Processes, arrangements and systems for providing frequency domain imaging of a sample |
WO2008024948A2 (en) | 2006-08-25 | 2008-02-28 | The General Hospital Corporation | Apparatus and methods for enhancing optical coherence tomography imaging using volumetric filtering techniques |
US8838213B2 (en) * | 2006-10-19 | 2014-09-16 | The General Hospital Corporation | Apparatus and method for obtaining and providing imaging information associated with at least one portion of a sample, and effecting such portion(s) |
US9697582B2 (en) | 2006-11-16 | 2017-07-04 | Visiopharm A/S | Methods for obtaining and analyzing images |
ITVA20060079A1 (it) * | 2006-12-19 | 2008-06-20 | St Microelectronics Srl | Metodo di classificazione cromatica di pixel e metodo di miglioramento adattativo di un'immagine a colori |
JP2010517080A (ja) | 2007-01-19 | 2010-05-20 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 分散広帯域光の高速波長スキャンのための回転ディスク反射 |
EP2132840A2 (en) | 2007-03-23 | 2009-12-16 | The General Hospital Corporation | Methods, arrangements and apparatus for utlizing a wavelength-swept laser using angular scanning and dispersion procedures |
US10534129B2 (en) | 2007-03-30 | 2020-01-14 | The General Hospital Corporation | System and method providing intracoronary laser speckle imaging for the detection of vulnerable plaque |
WO2008131082A1 (en) | 2007-04-17 | 2008-10-30 | The General Hospital Corporation | Apparatus and methods for measuring vibrations using spectrally-encoded endoscopy techniques |
US8335360B2 (en) | 2007-05-14 | 2012-12-18 | Historx, Inc. | Compartment segregation by pixel characterization using image data clustering |
EP2173254A2 (en) | 2007-07-31 | 2010-04-14 | The General Hospital Corporation | Systems and methods for providing beam scan patterns for high speed doppler optical frequency domain imaging |
US8611619B2 (en) * | 2007-08-22 | 2013-12-17 | Phadia Ab | Read-out method and apparatus |
WO2009059034A1 (en) | 2007-10-30 | 2009-05-07 | The General Hospital Corporation | System and method for cladding mode detection |
JP5365011B2 (ja) | 2008-01-29 | 2013-12-11 | 日本電気株式会社 | 病理診断支援装置、病理診断支援方法、およびプログラム |
US7898656B2 (en) | 2008-04-30 | 2011-03-01 | The General Hospital Corporation | Apparatus and method for cross axis parallel spectroscopy |
WO2009137701A2 (en) | 2008-05-07 | 2009-11-12 | The General Hospital Corporation | System, method and computer-accessible medium for tracking vessel motion during three-dimensional coronary artery microscopy |
US8861910B2 (en) | 2008-06-20 | 2014-10-14 | The General Hospital Corporation | Fused fiber optic coupler arrangement and method for use thereof |
EP2309923B1 (en) | 2008-07-14 | 2020-11-25 | The General Hospital Corporation | Apparatus and methods for color endoscopy |
EP2327040B1 (en) * | 2008-08-15 | 2013-12-18 | Visiopharm A/s | A method and a system for determining a target in a biological sample by image analysis |
JP5401062B2 (ja) * | 2008-09-05 | 2014-01-29 | ベックマン コールター, インコーポレイテッド | 画像パターンの判定方法、システム、装置、プログラムおよび前記プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体 |
JP5551702B2 (ja) | 2008-09-16 | 2014-07-16 | ヒストロックス,インコーポレイテッド. | バイオマーカー発現の再現性のある定量 |
CN102197305B (zh) * | 2008-10-23 | 2014-02-19 | 皇家飞利浦电子股份有限公司 | 生物样本的颜色管理 |
US20100124372A1 (en) * | 2008-11-12 | 2010-05-20 | Lockheed Martin Corporation | Methods and systems for identifying/accessing color related information |
EP2359121A4 (en) | 2008-12-10 | 2013-08-14 | Gen Hospital Corp | SYSTEMS, APPARATUS AND METHODS FOR EXTENSION OF THE OPTICAL COHERENCE TOMOGRAPHY IMAGING DEPTH RANGE, THROUGH OPTICAL SUB-SAMPLING |
EP2389093A4 (en) | 2009-01-20 | 2013-07-31 | Gen Hospital Corp | APPARATUS, SYSTEM AND METHOD FOR ENDOSCOPIC BIOPSY |
WO2010085775A2 (en) | 2009-01-26 | 2010-07-29 | The General Hospital Corporation | System, method and computer-accessible medium for providing wide-field superresolution microscopy |
US9178330B2 (en) | 2009-02-04 | 2015-11-03 | The General Hospital Corporation | Apparatus and method for utilization of a high-speed optical wavelength tuning source |
CN102469943A (zh) | 2009-07-14 | 2012-05-23 | 通用医疗公司 | 用于测量脉管内流动和压力的设备、系统和方法 |
JP5819864B2 (ja) | 2010-03-05 | 2015-11-24 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 特定の分解能にて少なくとも1つの解剖構造の微細画像を提供するシステム、方法およびコンピュータがアクセス可能な媒体 |
US9069130B2 (en) | 2010-05-03 | 2015-06-30 | The General Hospital Corporation | Apparatus, method and system for generating optical radiation from biological gain media |
EP2575597B1 (en) | 2010-05-25 | 2022-05-04 | The General Hospital Corporation | Apparatus for providing optical imaging of structures and compositions |
EP2575598A2 (en) | 2010-05-25 | 2013-04-10 | The General Hospital Corporation | Apparatus, systems, methods and computer-accessible medium for spectral analysis of optical coherence tomography images |
JP6066901B2 (ja) | 2010-06-03 | 2017-01-25 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 1つまたは複数の管腔器官内または管腔器官にある構造を撮像するための装置およびデバイスのための方法 |
US9025850B2 (en) | 2010-06-25 | 2015-05-05 | Cireca Theranostics, Llc | Method for analyzing biological specimens by spectral imaging |
WO2012058381A2 (en) | 2010-10-27 | 2012-05-03 | The General Hospital Corporation | Apparatus, systems and methods for measuring blood pressure within at least one vessel |
US8861851B2 (en) * | 2011-05-13 | 2014-10-14 | Dolby Laboratories Licensing Corporation | Color highlight reconstruction |
WO2013013049A1 (en) | 2011-07-19 | 2013-01-24 | The General Hospital Corporation | Systems, methods, apparatus and computer-accessible-medium for providing polarization-mode dispersion compensation in optical coherence tomography |
US10241028B2 (en) | 2011-08-25 | 2019-03-26 | The General Hospital Corporation | Methods, systems, arrangements and computer-accessible medium for providing micro-optical coherence tomography procedures |
EP2769491A4 (en) | 2011-10-18 | 2015-07-22 | Gen Hospital Corp | DEVICE AND METHOD FOR PRODUCING AND / OR PROVIDING RECIRCULATING OPTICAL DELAY (DE) |
JP5910637B2 (ja) | 2012-02-09 | 2016-04-27 | 日本電気株式会社 | 生体画像解析システム、生体画像解析方法および生体画像解析プログラム |
EP2833776A4 (en) | 2012-03-30 | 2015-12-09 | Gen Hospital Corp | IMAGING SYSTEM, METHOD AND DISTAL FIXATION FOR MULTIDIRECTIONAL FIELD ENDOSCOPY |
US11490797B2 (en) | 2012-05-21 | 2022-11-08 | The General Hospital Corporation | Apparatus, device and method for capsule microscopy |
WO2013179581A1 (ja) | 2012-05-30 | 2013-12-05 | パナソニック株式会社 | 画像計測装置、画像計測方法及び画像計測システム |
US9020221B2 (en) | 2012-07-13 | 2015-04-28 | Sony Corporation | Method and apparatus for automatic cancer diagnosis scoring of tissue samples |
EP2888616A4 (en) | 2012-08-22 | 2016-04-27 | Gen Hospital Corp | SYSTEM, METHOD AND COMPUTER-ACCESSIBLE MEDIA FOR MANUFACTURING MINIATURE ENDOSCOPES USING SOFT LITHOGRAPHY |
US9881371B2 (en) | 2012-10-24 | 2018-01-30 | Sony Corporation | System for visualization of a cancer diagnosis |
JP5413501B1 (ja) | 2012-12-07 | 2014-02-12 | 富士ゼロックス株式会社 | 画像処理装置、画像処理システム及びプログラム |
EP2948758B1 (en) | 2013-01-28 | 2024-03-13 | The General Hospital Corporation | Apparatus for providing diffuse spectroscopy co-registered with optical frequency domain imaging |
WO2014120791A1 (en) | 2013-01-29 | 2014-08-07 | The General Hospital Corporation | Apparatus, systems and methods for providing information regarding the aortic valve |
US11179028B2 (en) | 2013-02-01 | 2021-11-23 | The General Hospital Corporation | Objective lens arrangement for confocal endomicroscopy |
JP6378311B2 (ja) | 2013-03-15 | 2018-08-22 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 物体を特徴付ける方法とシステム |
EP2997354A4 (en) | 2013-05-13 | 2017-01-18 | The General Hospital Corporation | Detecting self-interefering fluorescence phase and amplitude |
WO2015010133A1 (en) | 2013-07-19 | 2015-01-22 | The General Hospital Corporation | Determining eye motion by imaging retina. with feedback |
EP3692887B1 (en) | 2013-07-19 | 2024-03-06 | The General Hospital Corporation | Imaging apparatus which utilizes multidirectional field of view endoscopy |
EP3910282B1 (en) | 2013-07-26 | 2024-01-17 | The General Hospital Corporation | Method of providing a laser radiation with a laser arrangement utilizing optical dispersion for applications in fourier-domain optical coherence tomography |
US9585627B2 (en) * | 2013-08-14 | 2017-03-07 | Siemens Healthcare Gmbh | Histological differentiation grade prediction of hepatocellular carcinoma in computed tomography images |
WO2015105870A1 (en) | 2014-01-08 | 2015-07-16 | The General Hospital Corporation | Method and apparatus for microscopic imaging |
US10736494B2 (en) | 2014-01-31 | 2020-08-11 | The General Hospital Corporation | System and method for facilitating manual and/or automatic volumetric imaging with real-time tension or force feedback using a tethered imaging device |
CA2935473C (en) * | 2014-02-21 | 2022-10-11 | Ventana Medical Systems, Inc. | Medical image analysis for identifying biomarker-positive tumor cells |
US10228556B2 (en) | 2014-04-04 | 2019-03-12 | The General Hospital Corporation | Apparatus and method for controlling propagation and/or transmission of electromagnetic radiation in flexible waveguide(s) |
US9569464B1 (en) * | 2014-05-28 | 2017-02-14 | Pivotal Software, Inc. | Element identification in database |
US10912462B2 (en) | 2014-07-25 | 2021-02-09 | The General Hospital Corporation | Apparatus, devices and methods for in vivo imaging and diagnosis |
US9725766B1 (en) | 2014-07-29 | 2017-08-08 | Flagship Biosciences, Inc. | Methods for measuring and reporting vascularity in a tissue sample |
AU2015345199A1 (en) * | 2014-11-10 | 2017-04-27 | Ventana Medical Systems, Inc. | Classifying nuclei in histology images |
JP6346576B2 (ja) * | 2015-02-27 | 2018-06-20 | Hoya株式会社 | 画像処理装置 |
WO2016201186A1 (en) * | 2015-06-11 | 2016-12-15 | University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Systems and methods for finding regions of interest in hematoxylin and eosin (h&e) stained tissue images and quantifying intratumor cellular spatial heterogeneity in multiplexed/hyperplexed fluorescence tissue images |
US10460439B1 (en) | 2015-08-12 | 2019-10-29 | Cireca Theranostics, Llc | Methods and systems for identifying cellular subtypes in an image of a biological specimen |
JP6725646B2 (ja) * | 2015-09-02 | 2020-07-22 | ベンタナ メディカル システムズ, インコーポレイテッド | 解析的に別個の検体染色のパターンの混合を有する細胞サンプルの自動化解析 |
CN106885802A (zh) * | 2015-12-16 | 2017-06-23 | 范石军 | 一种养殖过程中污水排放的抗生素残留的实时监控系统 |
WO2017106272A1 (en) * | 2015-12-18 | 2017-06-22 | Abbott Laboratories | Methods and systems for assessing histological stains |
CN106896100A (zh) * | 2015-12-18 | 2017-06-27 | 范石军 | 一种畜产品中抗生素残留的快速判定系统 |
US10229495B2 (en) * | 2016-11-22 | 2019-03-12 | Agilent Technologies, Inc. | Method for unsupervised stain separation in pathological whole slide images |
WO2019009893A1 (en) * | 2017-07-05 | 2019-01-10 | Flagship Biosciences Inc. | METHODS OF MEASURING AND REPORTING VASCULARITY IN A TISSUE SAMPLE |
SE544735C2 (en) * | 2018-11-09 | 2022-11-01 | Mm18 Medical Ab | Method for identification of different categories of biopsy sample images |
CN111079637B (zh) * | 2019-12-12 | 2023-09-08 | 武汉轻工大学 | 田间图像中分割油菜花的方法、装置、设备及存储介质 |
CN117575977B (zh) * | 2024-01-17 | 2024-04-02 | 锦恒科技(大连)有限公司 | 一种用于卵巢组织分析的卵泡区域增强方法 |
Family Cites Families (28)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4724543A (en) * | 1985-09-10 | 1988-02-09 | Beckman Research Institute, City Of Hope | Method and apparatus for automatic digital image analysis |
US5485527A (en) * | 1985-11-04 | 1996-01-16 | Becton Dickinson And Company | Apparatus and method for analyses of biological specimens |
US5134662A (en) * | 1985-11-04 | 1992-07-28 | Cell Analysis Systems, Inc. | Dual color camera microscope and methodology for cell staining and analysis |
JPS6379632A (ja) * | 1986-09-25 | 1988-04-09 | 株式会社東芝 | 電子内視鏡装置 |
US5202931A (en) * | 1987-10-06 | 1993-04-13 | Cell Analysis Systems, Inc. | Methods and apparatus for the quantitation of nuclear protein |
US5235522A (en) * | 1990-10-10 | 1993-08-10 | Cell Analysis Systems, Inc. | Method and apparatus for automated analysis of biological specimens |
US5548661A (en) * | 1991-07-12 | 1996-08-20 | Price; Jeffrey H. | Operator independent image cytometer |
US5332968A (en) * | 1992-04-21 | 1994-07-26 | University Of South Florida | Magnetic resonance imaging color composites |
DE69434131T2 (de) * | 1993-05-05 | 2005-11-03 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Vorrichtung zur Segmentierung von aus Texturen bestehenden Bildern |
JP3267739B2 (ja) | 1993-05-11 | 2002-03-25 | フクダ電子株式会社 | 超音波カラードプラ診断装置 |
JPH07299053A (ja) * | 1994-04-29 | 1995-11-14 | Arch Dev Corp | コンピュータ診断支援方法 |
WO1996009598A1 (en) * | 1994-09-20 | 1996-03-28 | Neopath, Inc. | Cytological slide scoring apparatus |
US5787208A (en) * | 1995-06-07 | 1998-07-28 | Neopath, Inc. | Image enhancement method and apparatus |
US6215892B1 (en) * | 1995-11-30 | 2001-04-10 | Chromavision Medical Systems, Inc. | Method and apparatus for automated image analysis of biological specimens |
US6330349B1 (en) * | 1995-11-30 | 2001-12-11 | Chromavision Medical Systems, Inc. | Automated method for image analysis of residual protein |
US6151405A (en) * | 1996-11-27 | 2000-11-21 | Chromavision Medical Systems, Inc. | System and method for cellular specimen grading |
CA2318789C (en) | 1998-02-25 | 2011-05-10 | The United States Of America As Represented By The Secretary Department Of Health And Human Services | Cellular arrays for rapid molecular profiling |
AU762085B2 (en) * | 1999-04-13 | 2003-06-19 | Chromavision Medical Systems, Inc. | Histological reconstruction and automated image analysis |
EP1185307A2 (en) | 1999-06-17 | 2002-03-13 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods of imaging and targeting tumor vasculature |
EP1203343A4 (en) * | 1999-07-13 | 2006-08-23 | Chromavision Med Sys Inc | AUTOMATIC DETECTION OF OBJECTS IN A BIOLOGICAL SAMPLE |
WO2001011547A1 (en) * | 1999-08-04 | 2001-02-15 | Chromavision Medical Systems, Inc. | Method and apparatus for applying color thresholds in light microscopy |
CA2394358A1 (en) | 1999-12-13 | 2001-06-14 | The Government Of The United States Of America, As Represented By The Se Cretary, Department Of Health & Human Services, The National Institutes | High-throughput tissue microarray technology and applications |
WO2001051924A2 (en) * | 2000-01-12 | 2001-07-19 | Ventana Medical Systems, Inc. | Method for determining the response to cancer therapy |
IL136884A0 (en) | 2000-06-19 | 2001-06-14 | Yissum Res Dev Co | A system for cancer detection and typing and for grading of malignancy |
IL138123A0 (en) | 2000-08-28 | 2001-10-31 | Accuramed 1999 Ltd | Medical decision support system and method |
US8078262B2 (en) | 2001-04-16 | 2011-12-13 | The Johns Hopkins University | Method for imaging and spectroscopy of tumors and determination of the efficacy of anti-tumor drug therapies |
US20030165263A1 (en) * | 2002-02-19 | 2003-09-04 | Hamer Michael J. | Histological assessment |
US7272252B2 (en) * | 2002-06-12 | 2007-09-18 | Clarient, Inc. | Automated system for combining bright field and fluorescent microscopy |
-
2002
- 2002-10-21 US US10/274,358 patent/US20030165263A1/en not_active Abandoned
-
2003
- 2003-08-08 EP EP03787870A patent/EP1529207A2/en not_active Withdrawn
- 2003-08-08 US US10/524,492 patent/US7079675B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2003-08-08 AU AU2003255763A patent/AU2003255763A1/en not_active Abandoned
- 2003-08-08 JP JP2004528645A patent/JP4420821B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2003-08-08 WO PCT/GB2003/003465 patent/WO2004017052A2/en active Application Filing
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2003255763A1 (en) | 2004-03-03 |
US20050276457A1 (en) | 2005-12-15 |
US20030165263A1 (en) | 2003-09-04 |
EP1529207A2 (en) | 2005-05-11 |
JP2005535892A (ja) | 2005-11-24 |
WO2004017052A3 (en) | 2004-06-03 |
WO2004017052A2 (en) | 2004-02-26 |
US7079675B2 (en) | 2006-07-18 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4420821B2 (ja) | 組織学的アセスメント | |
JP5156631B2 (ja) | 画像領域の自動選定 | |
US7979212B2 (en) | Method and system for morphology based mitosis identification and classification of digital images | |
Palomera-Perez et al. | Parallel multiscale feature extraction and region growing: application in retinal blood vessel detection | |
EP1563457B1 (en) | Image analysis | |
JP4864857B2 (ja) | 有糸分裂活性の測定 | |
US9177378B2 (en) | Updating landmarks to improve coregistration as regions of interest are corrected | |
US20090003691A1 (en) | Segmentation of tissue images using color and texture | |
EP2765557B1 (en) | Coregistering images of needle biopsies using multiple weighted landmarks | |
CN106780522B (zh) | 一种基于深度学习的骨髓液细胞分割方法 | |
EP1422661B1 (en) | Method and device for the analysis of array images | |
WO2003105675A2 (en) | Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample | |
US8019156B2 (en) | Method and device for segmenting a digital representation of cells | |
JP6882329B2 (ja) | Ihc画像解析のための空間インデックス作成 | |
WO2005076197A2 (en) | Method and system for morphology based mitosis identification and classification of digital images | |
JP7214756B2 (ja) | ステイン集合体における信号の定量 | |
WO2006087526A1 (en) | Apparatus and method for processing of specimen images for use in computer analysis thereof | |
EP1579366A1 (en) | Histological assessment of nuclear pleomorphism | |
CN117853722A (zh) | 一种融合超像素信息的钢材金相组织分割方法 | |
CN110428437B (zh) | 基于边缘敏感的slic和二次密度聚类的ggo分割方法 | |
JP4981112B2 (ja) | 組織学的アセスメント | |
EP3611694A1 (en) | System for analysis of microscopic data using graphs | |
EP2776979B1 (en) | Post processing for improved generation of intrinsic images | |
CN114638774A (zh) | 图像数据处理方法及装置、非易失性存储介质 | |
JP2019215766A (ja) | 画像処理装置、細胞認識装置、細胞認識方法および細胞認識プログラム |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20060713 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20090420 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20090618 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20090625 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20091020 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20091116 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20091201 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121211 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131211 Year of fee payment: 4 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |