JP4338529B2 - ホーミングプロセス - Google Patents

ホーミングプロセス Download PDF

Info

Publication number
JP4338529B2
JP4338529B2 JP2003584676A JP2003584676A JP4338529B2 JP 4338529 B2 JP4338529 B2 JP 4338529B2 JP 2003584676 A JP2003584676 A JP 2003584676A JP 2003584676 A JP2003584676 A JP 2003584676A JP 4338529 B2 JP4338529 B2 JP 4338529B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
mark
disk
microfluidic
microfluidic device
controller
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Lifetime
Application number
JP2003584676A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2005522691A (ja
Inventor
シェーベルイ,ヤン
ビベルグ,ロニー
ワールベルグ,ゲーラン
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Gyros Patent AB
Original Assignee
Gyros Patent AB
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from SE0201072A external-priority patent/SE0201072D0/xx
Application filed by Gyros Patent AB filed Critical Gyros Patent AB
Publication of JP2005522691A publication Critical patent/JP2005522691A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP4338529B2 publication Critical patent/JP4338529B2/ja
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Lifetime legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/00029Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor provided with flat sample substrates, e.g. slides
    • G01N35/00069Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor provided with flat sample substrates, e.g. slides whereby the sample substrate is of the bio-disk type, i.e. having the format of an optical disk
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L9/00Supporting devices; Holding devices
    • B01L9/56Means for indicating position of a recipient or sample in an array
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2200/00Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
    • B01L2200/02Adapting objects or devices to another
    • B01L2200/025Align devices or objects to ensure defined positions relative to each other
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5027Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/02Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor using a plurality of sample containers moved by a conveyor system past one or more treatment or analysis stations
    • G01N35/04Details of the conveyor system
    • G01N2035/0474Details of actuating means for conveyors or pipettes
    • G01N2035/0491Position sensing, encoding; closed-loop control
    • G01N2035/0493Locating samples; identifying different tube sizes

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Clinical Laboratory Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
  • Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)

Description

技術分野
この発明はマイクロ流体システムにおけるホーミングプロセスに関する。
より特定的には、この発明は、マイクロ流体システムで用いられる特別のマイクロ流体装置タイプのホーム位置のマークによってホーム位置を決定するためのホーミングプロセスに関する。この発明はまた、マイクロ流体システムとコンピュータプログラム製品とコンピュータ使用可能な媒体上のコンピュータプログラム製品とに関する。
発明の背景
「マイクロ流体」という用語は、超小型寸法で、たとえば少なくとも1つの断面寸法が約0.1μm〜約500μmの範囲である封入されたチャンバおよび/またはチャネルのうちの1つまたはそれらのネットワークを有するシステムまたは装置を意味する。装置、システム、ディスクなどの文脈における「マイクロ流体」という用語は、μlの範囲における流体体積がシステム内で搬送されるということを意味する。これは、システムの或る部分、たとえばマイクロ流体装置/ディスク内に流体搬送があり得るかまたはあり得ないことを意味する。μlの範囲は、nlの範囲ならびにピコリットルの範囲を含む。マイクロ流体基板はしばしば、フォトリソグラフィ、ウェットケミカルエッチング、射出成形、エンボス加工、および半導体業界で用いられるものと類似する他の技術を用いて作製される。結果として得られる装置を用いて、種々の高度な化学的および生物学的な分析技術を実行することができる。
マイクロ流体分析システムは従来の化学的または物理学的な実験技術に勝るいくつかの利点を有する。たとえば、マイクロ流体システムは、典型的にはナノリットルおよびさらにはピコリットルのオーダでサンプルを利用して小さなサンプル寸法を分析するために特に適切に適合される。基板を規定するチャネルは比較的低いコストで製造され得、チャネルは、混合、供給、弁調節、反応、検出、電気泳動などを含む多数の分析動作を実行するよう配置することができる。マイクロ流体システムの分析能力は概して、ネットワークチャネル、反応チャンバなどの数および複雑さを増すことによって高められる。
近年、サンプルと支持分析構造との間における流れ制御および物理的相互作用の全般的分野において実質的な進歩がなされている。
流れ制御管理は、(たとえば動電学的流れまたは電気泳動分離を誘発および/または制御するために)基板への電圧、電流または電力のパターン化された印加を含むさまざまな機構を利用し得る。代替的には、流体の流れは、差圧、音響エネルギなどの適用によって機械的に誘発されてもよい。基板の周りに分散した選択された場所に選択的な加熱、冷却、露光もしくは他の放射または他の入力を供給して、所望の化学的および/または生物学的な相互作用を促進し得る。同様に、光または他の放出物、電気/電気化学信号およびpHの測定値を基板から取得して、分析結果を提供し得る。これらの分野の各々における研究が進んできているので、チャネルの寸法が徐々に小さくなり、チャネルネットワークの複雑さが増して、マイクロ流体システムの全体的な能力が著しく高められる。
マイクロ流体技術/装置はごく少量の液体を制御および移送することができ、これにより生物学的検定を小規模で統合および達成することが可能となる。
マイクロ流体工学とは、掌に収まるほど小さい「チップ」上で複数の「実験」を実現することができる程度にまで生物学的分離および検定技術を小型化することである。ごく小量の溶媒、サンプルおよび試薬がチップ上の狭いチャネルを通って導かれ、そこで、電気泳動、蛍光検出、免疫学的検定またはほとんどすべての古典的な実験室的方法のような技術によって混合および分析される。
現在、多くの点において異なるいくつかの製品が利用可能である。実験用チップはプラスチック、ガラス、石英またはさらにはシリコンから作られてもよい。流体は、遠心力、機械圧力もしくは真空ポンプによって、慣性によって、またはいくつかの電気的方法のうち1つによって駆動され得る。流体の流れは、機械弁、表面張力、電圧勾配または電磁力によってチップを周って迂回させることができる。
流体を駆動するのに遠心力を用いる技術においては、スピン可能なディスクが使用される。いくつかのディスクは従来のCDと同じ物理的フォーマットのものであった。サンプルはディスクの中心近くに配置され、ディスクが回転するともたらされる遠心力が、プラスチックに切込まれたチャネルを通じてこれらのサンプルを押出すことにより、高度な動電学的または機械的なポンプ構造を設計する必要性を回避する。
後の記載で明らかになるように、この発明は、しばしば「ラブ・オン・チップ(lab on
a chip)」と称される、通常プラスチック製の回転可能なディスクに形成されたマイクロチャネルに基づくマイクロ分析システムに特に適用可能である(但し、これに限定されない)。このようなディスクを用いて小量の流体に対し分析および分離を実行することができる。コスト削減のために、ディスクは単に1種類の試薬または流体での使用に限定されるべきではなく、さまざまな流体で作動可能であるべきことが望ましい。
さらに、サンプルの調製中には、このディスクによりユーザがディスクに変更を加えることなく所望のいかなる組合せの流体またはサンプルをも正確な量で供給することが可能となることがしばしば望ましい。回転可能なディスクに設けられた流体用のマイクロ分析装置は、たとえばWO−0146465に記載される。液体移送ステーションはロボットを有し、このロボットは、少なくとも1つのサンプルまたは他のいずれかの予め定められた液体の部分標本をサンプルおよび試薬ステーションから、たとえばスピン可能なディスクの形であるマイクロ流体装置に一度に移送する。このステーションは液体サンプルおよび他の液体の移送のための手段を有し、たとえば、シリンジポンプまたはいくつかの中実のピンに接続されるいくつかの注入針がサンプルの移送のために用いられてもよい。上記針およびピンは、両方向の先端間に異なる距離を有する異なる数の列および行で構成され得る。別の代替例はWO 9701085に記載されるマイクロディスペンサである。
針またはピンは各チャネルの入口に正確に誘導されなければならない。マイクロ流体ディスクはさまざまな方法で設計されてもよく、各マイクロ流体ディスクは製造プロセスのために個々に異なっている。ホーム位置のマークは、好ましくは検出領域の外にある外周ゾーンまたはどこか他の位置に配置され、高い精度で検出可能である。ディスク表面の各々の特定の箇所の位置座標は、ホーム位置のマークに対する角度位置として、および円周もしくは対称軸に対するかまたはディスク上の他の任意の固定位置に対する半径方向位置として与えられる。
ホーム位置のマークを発見しこれを決定するためのプロセスまたは方法は、「ディスクの回帰」および「ホーミング」プロセスを必要とする。公知のホーミングプロセスは、ホーム位置のマークの端部を発見するためのディスクの走査を含む。ディスクホルダ上に配
置される回転ディスク上のホーム位置のマークは、ホームマークが通過しているときにホーム位置のマークの検出器によって検出される。ディスク上にある検出可能な端部だけがホームマークの端部であると仮定される。しかしながら、多くの場合、検出された端部は「偽のホームマーク」の端部である。欠陥または汚染は、ホーム位置のマークが配置される検出領域の外側の外周ゾーンに存在する。上記欠陥および汚染はホーム位置のマークとして解釈される可能性もある。公知のホーミングプロセスはマークがホームマークであるか否かのチェックを含まず、いずれの端部もホームマークと認められるだろう。上記偽のマークにより問題が生じ、マイクロ流体ディスク全体を損なうおそれがある。というのも、ホーム位置のマークを配置し、針を適切に駆動および配置する可能性がないからである。
発明の簡単な説明
この発明の目的は、偽の「ホーム位置のマーク」に関する上記問題を解決することである。
この発明の別の目的は、特別のマイクロ流体装置タイプ上におけるホーム位置のマークによってホーム位置の正確さを増すことである。
この発明の別の目的は偽のマークから真のホーム位置のマークを識別することである。
さらに、この発明の目的はホーム位置の正確な位置を決定することである。
これらの目的は、請求項1〜21に従って主張されたこの発明によって達成される。
この発明の1つの利点は、通常ならホーミングプロセスを妨害するであろう多くの偽のマークがディスク上に存在するにもかかわらず、システムがより迅速かつより適切に作動することである。
別の利点は、破棄されなければならないマイクロ流体ディスクの数が少ないので歩留りが向上することである。
発明の詳細な説明
この発明はマイクロ流体システムに関する。
さまざまなマイクロ流体システムが公知である。1つの種類のシステムはコントローラユニットおよびマイクロ流体機器を含む。このようなシステムはスタンドアロンシステムと呼ばれる。各システムはそれ自体のデータを有し、完全に独立して作動する。システムとの相互作用は関連するパーソナルコンピュータ(PC)で行なわれてもよい。
別のシステムは、一群の機器に共通の永続的な記憶場所、たとえばデータベースを加えたものとみなされ得る。多くの機器が同じ組のデータ(メソッドデータ、マイクロ流体装置データなど)に対して作動し得る。システムとの相互作用はすべて、機器に接続されたコンピュータすなわちコントローラで実行される必要がある。この第2のシステムはしばしば、分散型データベースソリューションと称される。
第3のソリューションすなわち分散型ソリューションにおいては、システムは機器の群、共通の記憶の永続的な記憶場所(データベース)およびいくつかのクライアントとして
みなされる。このソリューションにより、上述の分散型データベースソリューションにおけるのと同じ機能が達せられる。加えて、機器に接続されていないコンピュータからシステムと相互作用する可能性があるだろう。付加的に提供された機能の例は以下の通りである。
− 機器の遠隔監視。
− 機器に特定されない機能の実行(メソッド開発、処理されたデータの評価など)。
この第3のソリューションを用いると、遠隔的に、すなわち機器に接続されていないコンピュータから処理を制御(開始、休止、中止)することが可能である。
オペレータ/ユーザは、マイクロ流体機器の動作をコントローラから制御および監視することができる。マイクロ流体機器はいくつかの異なるステーションを含み、各ステーションは1つまたはいくつかの規定された動作を実行することができる。タイプの異なるマイクロ流体機器は、種類または数の異なるステーションで構成される。したがって、いくつかの動作は、あるタイプのマイクロ流体機器には与えられないかまたはその機器上では適用できないだろう。
動作はコントローラから開始される。
図1は、コントローラとも示される制御ユニット110と機器120とを含むマイクロ流体システム100を概略的に示すブロック図であり、当該機器120は、サンプルおよび試薬ステーション130と、洗浄ステーション140と、液体移送ステーション150と、マイクロ流体装置内で液体の搬送を実現するための少なくとも1つのステーション160、たとえばスピナステーションと、検出器ステーション170とを含む。
コントローラ110は、機器の外側にある1つ以上のコンピュータおよび/または機器の内側にある1つ以上の中央処理装置であり得る。当該コントローラは、導体またはデータバス180を介して機器120とその様々なステーションとに接続され、動作命令が電気信号もしくは光信号として、または好適な予め定められたプロトコルに含められて、ステーション間に分散したハードウェア回路に伝送される。
コントローラは様々な制御手段を含んでもよく、たとえば、オペレータのインターフェイスおよびソフトウェアを備える電子的でプログラム可能な制御手段が、これ以上は開示しないが、特に以下のa)〜f)のために検出器構成に割当てられ得る。
a) 利用される検出原理が照射を必要とする場合に照射するための、および/または放射線を収集するための1組以上の開始位置/停止位置(角度および/または半径方向)を認識する。
b) ディスク表面における検出領域またはその他の場所にある個々の小領域を識別する。
c) ディスクの同時的な回転と検出器のヘッドの漸増する半径方向の変位とを制御する。
d) 検出領域/検出マイクロキャビティからの放射データを収集する。
e) 収集されたデータの処理および提示、ならびに/または、
f) 特定の角度位置が検出器のヘッドの対物レンズの前方にある時間を回転速度から決定する。
この構成のさまざまな部分がコントローラ110と通信し得る。当該コントローラは、好ましい変形例では、ディスク表面の別個の予め選択された部分から放射線を逐次収集するよう検出器のヘッドに命令する。典型的には、コントローラは、意図された検出領域に先立つ或る位置、主に角度位置および/または半径方向位置で放射線の収集を開始し、同じ検出領域の後の位置で当該収集を終了するようにプログラムされる。好ましくは、開始位置および終了位置は本質的に同じ半径方向距離にある。これは、主に放射線が収集される小領域が検出領域内に配置されることを意味する。さらに、好ましい変形例では、検出領域に近い小領域も含まれる。蛍光性を測定する場合に放射線が物質の照射を必要とする場合、制御手段はまた、照射についての開始位置および停止位置に対する設定を規定する。これら後者の設定は、典型的には放射線を収集する場合と本質的に同じである。
放射線の収集に対する開始信号および停止信号は、好ましくは、ディスクにおける、収集をそれぞれ開始および終了させる角度位置に直接リンクされる。これはまた、システムに内在し得るかまたは予め設定され得る遅延を十分に考慮に入れることを含み、すなわち開始信号および停止信号は、焦点領域が開始位置および停止位置の前方にそれぞれ位置決めされる前に起動される必要があるかもしれない。マイクロ流体システム内の角度調整システムがエンコーダを含む場合、開始位置および停止位置に対応するエンコーダ信号を用いて、放射線を収集すべき期間を規定する。代替例においては、放射線を収集するための開始および停止は、予め設定された回転速度にリンクされる、すなわち、コントローラは開始および停止位置が対物レンズの前方にあるべき時間を予め設定された回転速度から算出する。
コントローラは予め定められたディスク回転数の後、たとえば1回、2回またはそれ以上の回転の後、好ましくは1回の回転の後に、検出器のヘッド(焦点領域)の半径方向位置を変更するようプログラムされてもよい。
さらに、この発明のシステムは、サンプル、試薬または他の液体を貯蔵するための手段を含むサンプルおよび試薬ステーション130を有する。上記サンプル、試薬または他の液体はある種の容器、たとえばマイクロプレートもしくはマルチウェルプレート、試験管立てまたは試験管などに貯蔵される。上記プレートは小さな容器またはウェルのマトリックスとして設計される。上記プレートはその寸法がウェルの数に応じて異なる可能性がある。容器は容器ホルダ、たとえば、円形の回転プレートであるいわゆる回転ラックに緩く固定されてもよい。
液体移送ステーション150はロボット150aを含み、このロボット150aは、少なくとも1つのサンプルまたは他のいずれかの予め定められた液体部分標本をサンプルおよび試薬ステーション130から、たとえばスピン可能なディスクの形であるマイクロ流体装置へ一度に移送する。当該ステーションは、液体サンプルおよび他の液体を移送するための手段を有し、たとえばシリンジポンプに接続されるいくつかの注入針またはいくつかの中実のピンを用いてサンプルを移送し得る。上記針およびピンは、両方向の先端間に異なる距離を有する異なる数の行および列で構成され得る。別の代替例には、WO 9701085に記載されるマイクロディスペンサがある。
上記針およびピンは、サンプルおよび試薬の移送の間に洗浄溶液で洗浄されてもまたは洗浄されなくてもよい。洗浄は洗浄ステーション140に配置される手段によって行なわれる。
マイクロ流体装置に供給される液体は、液体搬送を実現するためのステーション160に関連付けられる手段によって当該装置内で搬送される。このステーションは、スピンによってもたらされる液体搬送を可能にするようにマイクロ流体装置が適合される場合にはスピナステーションであり得る。マイクロ流体装置内で実行されるプロセスの結果は、検出器ステーション170内に位置する検出するための手段(検出器)によって決定される。
検出器ステーション170の構成は、複数の検出からの放射線を測定するよう適合され、その各々はマイクロ流体において検出マイクロキャビティに関連付けられる。この構成は以下を含む。
(a) 焦点領域を備えた検出器のヘッドおよびディスクホルダ。これらは、ディスクがディスクホルダ内に配置される場合、検出器のヘッドすなわち焦点領域がディスクの表面を横切ることを可能にする手段にリンクされる。
(b) 特定の時間に焦点領域によって覆われる部分領域の角度位置を認識するための角度調整システム。
(c) 特定の時間に焦点領域によって覆われる部分領域の半径方向位置を認識するための任意の半径方向調整システム。
(d) コントローラ、たとえばソフトウェアを備えたコンピュータ。これは以下を制御する。
(i) 焦点領域がディスクの環状ゾーンにおける検出領域を横切ることを引起こす機器。
(ii) 上記環状ゾーンにおける検出領域のうち少なくとも1つの中にある焦点領域と本質的に同じ寸法の個々の小領域から、予め選択された態様で、放射線を逐次収集する検出器のヘッド。
図1に示すように、上記ステーションの各々はコントローラ110に接続され、いくつかのオペレーションによってコントローラ110から制御および監視される。ソフトウェア演算は、ある機能を達成するよう実行されるハードウェア命令の論理グループとして規定され、たとえば以下のとおりである。
− 液体搬送の実現、たとえば、装置が液体の流れを誘導するためにスピン可能なディスクの形である場合には装置のスピン。
− 特定の共通の分配チャネルまたは特定の微細構造へのサンプル移送。
− 特定の共通の分配チャネルまたは特定の微細構造への試薬移送。
− マイクロ流体装置の位置決め。
− 微細構造における或る位置での特定の時間にわたる液体の保温。
− 検出、すなわち、マイクロ流体装置において実行される方法の結果の検出。
オペレーションはいくつかのステップで構成され得る。ステップは分割することのでき
ない命令、たとえばスピン動作におけるランプ(ramp)である。いくつかのこれらの動作を所望の順序でまとめ合わせることによりセットを構成し得る。このようなセットは方法として規定され、機器内で導かれるすべての部分を制御する。それはマイクロ流体装置のタイプを指定し、行動、動作のセットを規定する。それは、機器の外側でのステップ、たとえばこの方法が細胞培養に関連する場合には一定温度での保温、を実行するために停止を指定し得る。
この発明は、上述のとおり、マイクロ流体システムで用いられる特別のマイクロ流体装置タイプ上におけるホーム位置のマークによってホーム位置を決定するための方法に関する。
図2はマイクロ流体システムにおけるスピナステーションとともに配置されたホーム位置のマークの検出器を示す。典型的な変形例においては、ディスクホルダ205を担持する回転可能な軸204を備えたモータ203(たとえばスピナ)はフレーム構造213上で支持される。モータ203は、たとえば、0〜15,000rpmの間隔の範囲内で、たとえば60rpm以上に変えることのできる回転速度を制御する。ディスク201の回転は段階的であり得る。ディスクホルダ205は好ましくは上にディスクが配置され得るプレートである。ディスクホルダはまたディスクをその周辺部で保持する装置であり得る。(ディスクが歪んでいる場合)ディスクのぐらつきを軽減するために、ディスクに面するプレートの側部214が、均一に分散され覆われていない浅い溝またはチャネル開口部のシステムを含み得、これら浅い溝またはチャネル開口部はディスクをプレートへ吸引することのできる真空システムに接続される。たとえば、引用によりこの明細書中に援用されるWO−03025549を参照されたい。
システムはまた、ディスクの予め定められた角度位置がいつシステムの針またはシステムの検出器の対物レンズの前方にあるかを決定するための位置装置209を含む必要がある。さまざまな位置装置、たとえばエンコーダ、絶対的な位置エンコーダなどが市場において公知である。単純であるが精度の劣る代替例として含まれる計算手段は、予め設定された回転速度および予め定められた位置とホーム位置のマークとの間にある角距離から(すなわち、予め設定された回転速度および角度位置座標から)必要とされる時間を計算する。この種類の計算手段はコントローラに関連付けられてもよい。
絶対的なエンコーダは、ディスクが回転している間にホーム位置のマークからの角距離を漸進的に与える位置装置である。
位置装置209は典型的には、モータ203、軸204およびディスクホルダ205に関連付けられ、コントローラの位置制御手段に接続される。位置装置をディスク201に直接関連付けることにより最も正確な決定が達成されるだろう。位置装置は典型的には、軸の各回転を分解能段階と示される多数の段階、たとえば>5000、たとえば>10000または>20000または>30000などへと分割する。位置装置は、ホーム位置のマークの検出器の前方にあるディスクの部分に対する角度位置座標を、(1回転当たり360°であるとすれば)±1°、たとえば±0.1°以内または±0.01°以内の正確さおよび分解能で与えることができるはずである。必要とされる厳密な正確さは、ディスクの寸法、検出領域の半径方向位置、所要の感度、検出領域の寸法などに依存するだろう。
コントローラ212の位置制御手段220は、位置装置209の種類に応じて、接続部215を介し位置信号Pを用いて様々なデータを受信または伝送するだろう。位置装置が各分解能段階に対するパルスを生成するエンコーダである場合、位置制御手段は、開始位置またはホーム位置に対するディスクの現在の位置を表わしているパルスの合計値を示す
ためのパルスカウンタと、検出器とを含む。位置装置が絶対的なエンコーダである場合、位置制御手段は、開始位置またはホーム位置からの角距離の絶対的な算定基準を受信または伝送するだろう。いずれの場合も、コントローラの位置制御手段は位置装置を制御することができる。位置制御手段は所望の位置を設定し、所望の値を位置装置に転送し、この位置装置が当該位置を受信し、モータ203、軸204およびディスクホルダ205を制御してディスクを所望の位置に設定する。
各マイクロ流体ディスク201上においては、好ましくは、ホーム位置のマーク(図3における310)が検出領域の外側の外周ゾーンかまたは他の位置に配置される。ホーム位置のマークは、好ましくは高い精度で検出可能でありかつコントローラおよびマイクロ流体システムに対して識別可能である少なくとも1つの特有の特性を有する必要がある。このような特有の特性は、Lmarkと示されるマークの角度距離であり得る。ディスク表面の各々の特定の箇所の位置座標は、ホーム位置のマークに対する角度位置として、および円周もしくは対称軸に対するかまたはディスク上の他の任意の固定位置に対する半径方向の位置として与えられる。
ホーム位置マーク検出器208は典型的にはディスクの外側に、たとえばフレーム構造213上に固定位置を有する。ホーム位置マーク検出器208は、ホーム位置のマーク(図3における305)が通過しているときに検出することができる。
図2に示される実施例においては、ホーム位置マーク検出器208は電磁ビーム源222および変換器構成224を含む。ディスクの外周は2つの光ファイバ、すなわちソースファイバ228と検出器ファイバ230との間にある隙間226に配置される。当該ファイバのうちソースファイバ228と示されるものは、ディスクの、電磁ビーム源と同じ側に位置すべきである。上記ソースファイバは当該ソースからの電磁ビームを通し、ホームマークがある、ディスクが通過する円周の箇所を照らす。ディスクのもう一方側上では、ビーム貫通領域はファイバの貫通領域よりも大きい。しかしながら、検出器ファイバの受信端部は散乱したビームの明確な部分しか受信しないだろう。検出器ファイバ230は、受信された電磁ビームの強度を示す/測定する変換器構成224にビームを導く。変換器構成224は電磁変換器および比較手段を含み得る。電磁変換器は、入ってくるビームの強度に関する情報を含む電気強度信号を生成する。当該強度信号はDC信号であってもよく、その出力電圧レベルは入ってくるビームの強度に依存している。比較手段は変換器から電気強度信号を受信する。当該比較手段は、強度情報たとえば出力電圧をしきい値と比較するだろう。当該比較手段は、出力電圧がしきい値を超える場合には、たとえば「1」または5ボルトの「高レベルの」出力信号を与えるよう設計され得、強度信号がしきい値よりも低い場合には、たとえば「0」または0ボルトの「低レベルの」出力信号を与えるよう設計され得る。しきい値のレベルは検出器の感度を設定するために調整可能であってもよい。ホーム位置マーク検出器は出力信号すなわち検出器信号Dをコントローラに供給する。比較手段の出力信号は導体217を通じてコントローラに直接接続され得るかまたはインターフェイス入出力回路を介してコントローラに接続され得る。コントローラは、高レベルと低レベルとの間の変化と、それらが時間内にいつ発生するかとを示すことができる。
ディスクの光伝送およびそれらのホーム位置のマークは製造されたディスクのバッチによって異なり得る。したがって、代替的にはディスクの光伝送が同じように走査され、測定され/示され、そして記録され得る。光伝送はディスクの1周全体を通じて走査されてもよく、しきい値は制御プログラムソフトウェアにおける命令によって変換器および/またはコントローラによって適応的に設定されてもよい。ホーム位置のマークは、(固定値の代わりに)適応的に設定されたしきい値を用いることによって記録された伝送値を分析することにより配置される。
比較手段は、代替的には、変換器構成ではなくコントローラに含まれてもよい。
検出器の感度に応じて、ビームの強度に十分な影響をもたらすものをすべて示すことができる。ホーム位置のマークに対するディスクの外周ゾーンを走査する場合、予め設定された感度に応じて、ホーム位置のマークおよびこのゾーンにおける欠陥によって生じる他のマークがともに示されるだろう。このような欠陥は、ディスク上に付いた汚れまたはディスクの製造の問題に関連した欠陥である可能性がある。ホーム位置のマークがマイクロ流体ディスクを製造するプロセス中に作られる。さまざまなタイプのホームマークが使用可能である。注入成形されるマイクロ流体ディスクについては、ディスク基盤の上に蓋が被せられる前にホーム位置のマークをチャネルパターンとして同時に形成することは好都合である。ホームマークは、回転方向に対し相対的に垂直な方向にある平行なダクトおよびリブを含む格子パターンとして形成されてもよい。ビームはホーム位置のマークの領域内に当たると散乱し、その領域を通過した後に残されるビームの強度が低くなるだろう。しかしながら、各ホームマークの品質は製造中の優勢な条件に依存する。
したがって、境界の鮮明さおよびビームの減少特性はディスクによって異なる可能性がある。
この発明およびホーム位置のマークの設計は上述の実施例には限定されない。したがって、ホーム位置のマークの代替的な設計はすべてこの発明の範囲内であるだろう。たとえば、光伝送または極めて低い光伝送値がいずれも、ホーム位置のマークの場所を除いてはディスク1周分にわたって検出されないかもしれない。
ホーム位置のマークを作製するステップは、マイクロ流体ディスク製造プロセス中にいつでも実行することができる。たとえば、ディスクは光減衰材料から製造され、ホーム位置のマークはいかなる種類の貫通孔でもある。このような孔はディスクの成形中に作製され得る。
マーク、すなわちホームマークまたは偽のマーク、がビームを通っているとき、変換器によって受信されるビームの強度が減じられるだろう。マークおよびその境界が別個である場合、ビームの強度は、マークの第1の先端がビームに接する際に高レベルからより低い、すなわち低レベルへと即時に変化する。受信されたビームの強度は、マークの第2の終端がビームを通りビームの強度が低レベルから高レベルに変わるまで低いだろう。マークの境界が不鮮明である場合、高から低への強度の変化の時間が延長されるだろう。というのも、入ってくるビームの強度が弱まるにつれて当該強度が低減するからである。検出された端部の位置は、感度および予め設定された検出器構成しきい値に依存するだろう。
ホーム位置検出器208は、各マークのあらゆる先端および/または終端を検出し得、これらに対して反応し得る。検出器は、マークの端部が検出されるたびに高から低への検出器信号のレベル変化を引起こす。検出器信号を受信するコントローラはこのレベル変化を示し、コントローラのパルスカウンタ手段からのパルス合計値を表のカラムにおける位置の値/データとして、コントローラに接続されるメモリに記憶する。1周目の間の各パルス合計はディスク上の固有の位置に対応する。したがって、パルス合計は開始位置からの規定された方向にある位置に対応する。すなわち、開始位置np=0からの規定された方向にある角距離である。或る角距離は、或る数のパルス、すなわちパルス合計値npで乗算される弧単位の角度に相当する。
図3は、マイクロ流体ディスク300の概略図である。回転可能なディスクは、たとえばWO−0146465において前述されている。マイクロ流体装置は、たとえばプラス
チック、ガラス、シリコンポリマーなどの様々な材料から作られてもよい。検出器領域は、検出器が用いる検出原理に対して透明/半透明でなくてはならない。当該ディスクはディスクホルダのための中央の窪み305を有する。サンプルはディスクの中央近くに配置され得、ディスクの回転に伴ってもたらされる遠心力がプラスチックに切込まれたチャネル310を通じてこれらサンプルを押出して、高度な動電学的または機械的なポンプ構造を設計する必要性を回避し得る。
この発明のさまざまな局面において用いられるマイクロ流体装置は、液体の部分標本が搬送および/または処理される複数のマイクロチャネル構造を含む。当該装置は、典型的には、1つ以上の面に向けられたマイクロチャネル構造を備えたディスク型をしている。当該構造は、その内部が主として別個の入口および/もしくは出口開口部ならびに/または通気孔を介して周囲の大気と接触するという意味で覆われている。各マイクロチャネル構造は1つ以上の検出マイクロキャビティを含み、おそらくは1つ以上の反応マイクロキャビティも含み、さらに、互いにこれらの部分を接続する微小導管を含む。反応マイクロキャビティは検出マイクロキャビティと一致してもよい。マイクロチャネル構造における処理の結果は、検出マイクロキャビティに直接的または間接的に関連付けられる検出領域からの放射線として測定される。これは、放射線がマイクロ流体装置内でたとえば光ファイバを介して検出マイクロキャビティから当該マイクロキャビティに直接関連付けられない部分/表面領域へと導かれ得ることを含む。
マイクロ流体装置はまた、別々のマイクロチャネル構造を接続する共通のチャネル、たとえば、液体の導入のための共通の分散チャネルおよび不用な貯蔵器を含む共通の不用なチャネルを含み得る。共通のチャネルは吸込口、吐出口、通気孔などのさまざまな部分を含むが、それらが接続している各マイクロチャネル構造の部分とみなされる。共通のマイクロチャネルはまた、別々の面にあるマイクロチャネル構造の群を流動的に接続し得る。「マイクロチャネル」、「微小導管」などの用語は、チャネル構造が、≦103μm、好ましくは≦102μmの断面寸法を有する1つ以上のキャビティおよび/またはチャネル/導管を含むことを企図する。その下限は、典型的には、マイクロチャネルを通過することになる部分標本の最大の試薬および成分の寸法よりもはるかに大きい。マイクロキャビティ/マイクロチャンバの体積は、典型的には≦1000nl、たとえば≦500nlまたは≦100nlまたは≦50nlまたは≦25nlであり、特に検出マイクロキャビティに適用される。液体のための吸込口に直接接続されるチャンバ/キャビティ、たとえばサンプルおよび/または洗浄液体を加えることを意図したマイクロチャンバ/マイクロキャビティは、はるかにより大きい可能性がある。マイクロフォーマットとは、装置内で搬送される1つ、2つ、3つまたはそれ以上の液体部分標本がμlの範囲、すなわち≦1000μl、たとえば≦100μlまたは≦50μlの体積を有することを意味し、これはnlの範囲(ナノフォーマット)、たとえば≦1000nlまたは≦500nlまたは≦100nlまたは≦50nlを含むがこれらには限定されない。マイクロ流体システムのコントローラは、数μmの精度で、上述の針、ピンまたは検出器のヘッドを制御しかつ上記小さなキャビティへと誘導することができなくてはならない。コントローラは、正しいホーム位置を用いる各ディスクタイプの様々な吸込口、吐出口、通気口、検出位置などに対する正確な位置データを有する必要がある。上記位置データは記憶可能であり、コントローラがそれを記憶装置から検索することが可能であり、代替的には、コントローラが位置データを計算するようプログラムされてもよい。したがって、正しいホーム位置のマークを発見し、ディスク上の正確なホーム位置を決定することが極めて重要である。
この発明は、正しいホーム位置のマークを発見し、ディスクホルダ上にある現在のディスク上の正確なホーム位置を決定するための方法を提供する。現在のプロセスはしばしば「ホーミングプロセス」と示される。図4〜図6はこの発明の方法の実施例を示すフローチャートである。
この発明の方法のこの実施例においては、検出器は、マークのすべての終端を検出し、そしてこれらに対して反応するだろう。この発明の方法の別の実施例では、検出器は各マークの先端を検出するよう設定される。この発明の実施例においては、検出器はマークの終端が検出されるたびに高から低への検出器信号のレベル変化を引起こす。検出器信号を受信するコントローラはレベル変化を示し、コントローラの位置制御手段に記憶される位置データを表のカラムにおける位置の値/データとして、コントローラに接続されるメモリに記憶する。1周目の間の各パルス合計はディスク上の固有の位置に対応する。したがって、位置データは開始位置からの規定された方向にある位置に対応する。すなわち、開始位置np=0からの規定された方向への角距離である。或る角距離は、或る数のパルス、すなわちパルス合計値npで乗算される分解能段階の角度に相当する。
ホーム位置を発見する「ホーミング」プロセスの第1の段階400が開始すると、コントローラは、ステップ405において、ホーミングプロセスが現在のマイクロ流体ディスクに対して実行されていたという事実によりホーム位置が既に知られているかどうかテストする。ホーム位置および現在のディスクのホーム位置のマークが決定されている場合、このテストは肯定的すなわちイエスであり、次にこの方法はステップ600を続け、プロセスは、ホーム位置を決定する段階3を続ける(図6を参照)。「ホーミングプロセス」が現在のディスクに対して実行されていない場合、テストは否定的すなわちノーであり、ホーミングプロセスは第1の段階、すなわちディスクの走査を開始する。ステップ410においては、リセット信号が、コントローラによってパルスカウンタに対して生成され、このパルスカウンタが上記信号をそのリセット入力上で受信し、パルス合計npが「0」に設定される。停止位置Nは、好ましくは第2の回転または2周目上のどこかに配置される停止位置に対応する最大パルス合計nstopに設定され、ディスクが第1の方向にスピンし始める。走査の1回転または1周分はディスクの1回の回転よりも長く続く。したがって、停止値は、1周分に正確に対応するパルスの数よりも大きくなるよう選択される。ディスクの回転中に、新しいパルスが、各分解能段階と分解能段階が表わす角度セクタ移動の単位とに対し前述のエンコーダによって生成される。当該パルスは、ディスクが第1の方向に回転する場合、ステップ412aのように位置制御手段におけるパルスカウンタのパルス合計値に加えられるが、ディスクが第2の方向に回転する場合、ステップ412bのようにパルス合計値から差し引かれる。
ステップ414において、終端が検出されている場合、コントローラはホーム位置検出器からの検出器信号のレベル変化を示し、ステップ416において、コントローラはマーク表のカラムにおける開始位置に対して相対的なディスク上の位置に対応するパルスの数を記憶する。第1のカラムは上段から下方向にごとに埋められる。位置の値で埋められたの数は、ビームが走査手順中に走査する弧形に沿ったマークの数に対応する。第1のカラムにおける最後の位置の値は、走査段階の後半の間に反対方向への第1の位置の値を提供するマークに属する。したがって、第2のカラムは、下段から上方向にごとに埋められるだろう。というのも、このカラムにおける位置の値は反対方向の回転中に受取られるからである。第1のカラムにおける最終は表全体の一番下にあり、2周目の第1の位置の値は最終に入力されるだろう。したがって、同じマークの端部の位置が正しくリンクされるだろう。
走査手順は新しい終端に対するアークユニットセクタをすべて繰返し探索するだろう(アークユニットセクタは分解能段階の角距離に対応する)。ステップ418において、合計Npは、停止位置に対応する停止値Nと比較される。したがって、ディスクは、ステップ418における停止基準が満たされイエスとなるまで上記開始位置をさらに超えて予め定められた走査距離、たとえば1周の10%回転し、そしてディスクの回転が停止する。
走査プロセスの次のモーメントは、1周目の走査の間に示された各マークの他の端部を発見するために、反対方向にディスクを走査することとなる。
しかしながら、第1の走査回転中に1つの端部しか検出されなかった場合、この端部はおそらくホームマークの境界に属するだろう。というのも、ホーム位置のマークが配置される円周ゾーンには欠陥がないからである。ステップ419において、1つの端部しか検出されないか否かテストされる。このテストが肯定的すなわちイエスである場合、当該方法はステップ600を続けて、プロセスがホーム位置を決定する段階3を続ける(図6を参照)。そうではなく、テストが否定的すなわちノーである場合、当該方法は、ディスクが反対方向へのディスク回転を開始する前に既に両方向に回転しているかどうかのテストを続ける。このようなテストはステップ420において実行される。特別のメモリアドレスにおけるフラグは、両方向ともが走査されたことを示す。ステップ420における上記テストは1周の走査が終了したときに発生し、フラグがない場合には、一方向しか終了しておらず2周目を走査する必要があることを示す。
フラグはステップ422において設定され、停止値Nはステップ424において0に設定され、他の方向への第2の走査は、ステップ426においてコントローラがモータを起動してディスクを他の方向に回転させると開始する。停止基準は0に設定される。というのも、ディスクが反対方向に回転し、位置制御手段のパルスカウンタが最大値から0にカウントダウンするからである。したがって、パルスカウンタがカウントダウンし、走査される各アークユニットセクタについては、ステップ412bにおいてパルス合計が1単位ごとに減じられる。終端がアークユニットセクタで検出されると直ちに、コントローラによって検出器信号のレベル変化が検出され、パルスカウンタのパルス合計が読出されてステップ416において表に記憶される。走査プロセスは、ステップ418においてカウンタパルス合計が停止基準を満たすまで、すなわちイエスになるまで続く。パルス合計npが0になると直ちに中央処理装置は回転および走査を停止する。ビームがディスク上の最初の開始箇所に正確に着く。当該ディスクは両方向に回転しており、2周目の走査が始まったときにフラグが設定されると、当該フラグは、両方向ともに走査されたことを示し、ステップ420における基準が満たされる(イエス)。どのマークが真のホーム位置のマークであるかを識別するためにプロセスの第2の段階が図5のステップ500において始まり得る。
図5に、第2の段階と示される、ホームマークを識別するプロセス500のアルゴリズムが示される。第2の段階はステップ510から始まり、処理ユニットが2つの初期の位置の値を、同じにある各カラムから1つずつ読出す。次のステップすなわちステップ512において、コントローラは位置の値の間にある角距離Lを計算する。当該距離は、ステップ514において最小距離値lminと比較されるだろう。Lがlminを超えない場合、条件L>lminは偽である(ノー)。そのマークはホーム位置のマークではなく、このような偽のマークはステップ518において拒否される。そうではなく、ステップ514における条件が真すなわちイエスである場合、角距離Lが最小距離lminよりも長い場合に発生する。そのマークが正しいホーム位置のマークである可能性がある。ステップ516において、算出された角距離Lは最大距離値Lmaxと比較される。条件が偽すなわちノーである場合、L>lmaxであるので、マークは偽のマークであるはずであり、このような各々のマークはプロセスのステップ518において拒否される。マークがテストステップ514および516のうち1つにおいて偽であると発見されるたびに、そのマークの位置の値が表において削除され、位置の値の新しい対が表から読出される。ステップ522の基準は、位置の値の対がすべて調査されるまで繰返しプロセスを実行し続ける。したがって、プロセスがステップ510を続け、プロセッサが位置の値の新しい対を読出す。ステップ514および516における両方の条件が真である場合、このマークは可能性のあるホーム位置のマークであり、ステップ520でなされるように位置の値が保存および記憶される。すべての位置の値が調査された場合、ステップ522の条件は真すなわちイエスであり、繰返しプロセスが停止される。ステップ514および516の条件が十分にきびしい場合には1対の位置の値しか残されないだろう。ステップ524において、2対以上の位置の値が残されるかまたは位置の値が1対も残されないかがテストされる。2対以上の位置の値が残されるかまたは位置の値が1対も残されない場合、すなわちイエスである場合、コントローラはステップ526においてエラーコードを生成および表示するだろう。これはすなわち、現在のディスクが受け入れ不可能であり、ホーミングプロセスを続けるのが無駄であることを意味する。ディスクは破棄されなければならない。ステップ524でのテストが肯定的である場合、ホーミングプロセスはステップ600を続け得る(図6を参照)。
単一の対の位置の値しか残されない場合、その角距離Lはステップ514および516の「ウィンドウ」基準を満たす。これらの位置の値は、そのマイクロ流体ディスクの局所座標系に対するホーム位置または起点を計算するのに用いられる。ホーム位置はホームマークの2つの位置の値の上またはそれらの間であればどこにでも規定され得る。この発明の例および実施例として、ホーム位置は、ホームマーク位置の値の間で中間に位置するよう規定され得る。
この発明の好ましい実施例の第3の段階が図6に関連してより詳細に記載されるだろう。このプロセスの段階によりホーム場所の正確な位置が決定される。
方法600の第1のステップは、ホーム位置を発見するための方法がこの発明のマイクロ流体ディスクのために既に用いられているか否かと、正確なホーム位置が既に存在するか否かとをステップ610においてチェックすることである。これは、この発明の方法が実行されるたびにフラグが或る記憶アドレスに設定される場合に行なわれ得る。代替的なテストは、位置の値が存在するかどうかチェックすることである。フラグが存在するかまたはホーム位置の値が存在する場合(ホーム位置パラメータは0より大きな値を有する)、ステップ610における条件が満たされ、すなわちイエスであり、方法はディスクがホーム位置に位置決めされるステップ630に進む。
当該条件が満たされない場合、すなわちノーである場合、当該方法は、ステップ612においてマーク表から第1の位置の値を検索する。コントローラは、検索された位置を囲む領域を当該方法の第1の段階中におけるよりも遅く走査するだけで、ステップ614においてこの第1の端部に対する正確な位置の値を決定するだろう。当該方法の感度を高める新しいしきい値はコントローラによって設定され得、検出器において用いられ得るが、これはオプションであってもよい。新しい位置の値は、ステップ616において、マーク表における古い位置の値と、たとえ異なっていなくても置換わる。
ディスクがホーム位置のマーク以外のマークを持たない場合、段階1の走査は一操作方向にしか実行されないだろう。したがって、ホーム位置のマークの1つの端部しか検出されず、マーク表は1つの位置の値しか含まないだろう。ステップ618においては、マーク表が1つの位置の値しか含まないか否かテストされる。
ステップ618における条件が満たされない場合、すなわちノーである場合、コントローラは、ステップ620において、マーク表から第2の位置の値を検索する。コントローラは、ステップ624において、検索された位置を囲む領域をこの方法の第1の段階中における走査よりも遅く走査するだけでこの第2の端部に対する正確な位置の値を決定するだろう。この方法の感度を高める新しいしきい値はコントローラによって設定され得、検出器において用いられ得るが、これはオプションであってもよい。新しい位置の値は、ステップ626においてマーク表に記憶され、このマーク表における古い位置の値とたとえ
異なっていなくても置換わる。
ステップ618の条件が満たされる場合、すなわちイエスである場合、当該方法はステップ622を実行し、第2の位置の値は、マーク表から第1の位置の値を検索しそして標準的なホーム位置のホームマークの角距離Lhomeをマーク表からのこの第1の位置の値に追加することにより算出される。コントローラは、ステップ624において、算出された位置を囲む領域を走査するだけでこの第2の端部に対する正確な位置の値を決定する際に第2の位置の値に対するこの算出された値を用いるだろう。新しい位置の値は、ステップ626において、マーク表における第2の位置として記憶されるだろう。
ホームマーク位置の2つの端部はここでは既知である。ステップ628において、これらの位置の値は、そのマイクロ流体ディスクの局所座標系に対するホーム位置または起点を算出するのに用いられる。ホーム位置は、ディスクの外周ゾーン上であればどこにでも規定され得るが、好ましくは、ホーム位置は、ホームマークの2つの位置の値の上またはそれらの間に配置される。この発明の例および実施例として、ホーム位置はステップ628においてホームマーク位置の値の間で中間に位置するよう規定され得る。たとえば、ホーム位置Nhomeは以下の式を用いることによって算出され得る。
Figure 0004338529
最後に、ホーム位置が既知である場合、ディスクは、ステップ630において、ホーム位置検出器のビームがホーム位置に当るように回転させられる。
上述のように、エンコーダ、絶対的な位置エンコーダなどの様々な位置装置を用いてもよい。したがって、この発明の方法のいくつかのステップには変更を加えなくてはならない。
この発明の方法の別の実施例が以下に示される。この実施例は、絶対的なエンコーダを位置装置として用いるシステムに対し適応される。このタイプの装置は、ディスクが回転している間にホーム位置のマークからの角距離を漸進的に与える。したがって、第1の実施例のいくつかのステップには変更を加えなくてはならない。ステップ412aおよび412bは削除されてもよい。第1の実施例のステップ416において、パルス合計は記憶されないだろう。変更を加えられた方法においては、ホーム位置のマークからの角距離が記憶されるだろう。新しい停止基準はステップ418に対して規定されなくてはならない。たとえば位置制御手段に含まれる計算手段を用いることにより(図2における220)、任意の開始位置から停止位置までの予め定められた走査距離が、予め設定された回転速度および開始位置と停止位置との間の角距離から(すなわち予め設定された回転速度および角度位置座標から)必要とされる時間として計算され得る。ディスクは、走査開始からの実行時間を測定する時間パラメータtが算出された停止時間Tstopと等しい場合、予め定められた走査距離を走査される。第1の実施例の他のステップは、この第2の実施例において変更を加えられないままである可能性がある。
この発明は、請求項1から9のいずれかのステップを実行するためのソフトウェアコード手段を含む、マイクロ流体システムにおけるコントローラ内の処理ユニットの内部記憶
装置に直接ロード可能なコンピュータプログラム製品として実現され得る。
さらに、この発明は、請求項1から9のいずれかのステップの実行をコンピュータ手段における処理ユニットに制御させるための読取可能なプログラムを含む、コンピュータ使用可能な媒体上に格納されるコンピュータプログラム製品に関する。
当該コンピュータ使用可能な媒体は、記録媒体、コンピュータメモリ、読出専用メモリまたは電気搬送波信号である。
この発明は上述の好ましい実施例に限定されない。さまざまな代替例、変形例および同等例を用いてもよい。したがって、上述の実施例は、この発明の範囲を限定するものとして理解されるべきではなく、当該範囲は添付の特許請求の範囲によって規定されるものである。
マイクロ流体システムを概略的に示すブロック図である。 マイクロ流体システムにおけるホーム位置マーク検出器の構成を示す図である。 ディスクの形であるマイクロ流体装置の概略図である。 この発明の方法の実施例を示すフローチャートである。 この発明の方法の実施例を示すフローチャートである。 この発明の方法の実施例を示すフローチャートである。

Claims (14)

  1. マイクロ流体装置としてのディスクと、記憶手段を有する少なくとも1つのプログラム可能なコントローラと、前記コントローラと通信することができ、前記ディスクの位置を表わす信号を出力する位置装置と、前記コントローラに接続されるとともに、マークを検出するマーク検出器とを含むマイクロ流体システムにおいて、前記ディスク上におけるマークによってホーム位置を決定するための方法であって、
    前記ディスクの任意の開始位置から、回転する前記ディスク上においてマークの端部を走査および検出するステップと、
    前記走査回転中に前記検出器によって検出されているマークの端部に対応する位置の値を前記記憶手段に記憶するステップと、
    マークの一方の端部から他方の端部までの角距離Lがl min を超えないマークならびにl max を超えるマークを拒否し、角距離Lがl min を超え、かつl max を超えないマークを正しいマークとして識別するステップと、
    正しいマークとして識別されたマークの一方の端部および他方の端部の位置によって前記ホーム位置を決定するステップとを含む、方法。
  2. 前記方法は以下のステップを含み、前記以下のステップは
    記マイクロ流体装置が前記任意の開始位置から前記ディスクの一回転よりも長い距離だけ第1の方向に回転したときに前記マイクロ流体装置の第1の方向への走査を停止するステップと、
    2つ以上のマークの端部が第1の方向への走査中に発見される場合、第2の反対方向に回転する前記装置を走査するステップとを含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記方法はまた、マークの位置を用いることにより前記ホーム位置を計算するステップを含み、前記ホーム位置は前記マークの一方の端部および他方の端部の位置上またはこれらの間であればどこにでも規定され得る、請求項1に記載の方法。
  4. コンピュータプログラムコードに対し少なくとも1つの中央処理装置および記憶手段と、マイクロ流体装置と、前記マイクロ流体装置が回転すると前記マイクロ流体装置の予め規定された分解能に対応するエンコーダパルスを生成するエンコーダと、前記マイクロ流
    体装置上のマークを検出する検出器とを含むマイクロ流体システムにおいて前記マイクロ流体装置のホーム位置を確認するための方法であって、各々の特定の数のエンコーダパルスすなわちパルス合計(np)は開始位置(np=0)に対する第1の方向への特定の角度位置を表わし、前記方法は、
    第1の方向に回転する前記マイクロ流体装置を走査するステップと、
    前記マイクロ流体装置が前記第1の方向に回転している間に生成されたエンコーダパルスをパルスカウンタにおいてエンコーダパルス合計に追加するステップと、
    前記マイクロ流体装置が前記第1の方向に回転している間にマークの端部が検出されたか否かを判断するステップと、
    前記マイクロ流体装置が前記第1の方向に回転している間にマークの端部が検出される各パルス合計npをマーク表に記憶するステップと、
    前記パルス合計npの値が値Nに等しいかまたはこれを超える場合、前記マイクロ流体装置の第1の方向の走査を停止するステップと、
    前記第1の方向とは逆の第2の方向に前記マイクロ流体装置を回転させかつ走査するステップと、
    前記マイクロ流体装置が前記第2の方向に回転している間に生成されたエンコーダパルスに応じて、パルスカウンタにおいてエンコーダパルス合計を小さくするステップと、
    前記マイクロ流体装置が前記第2の方向に回転している間にマークの端部が検出されたか否かを判断するステップと、
    前記マイクロ流体装置が前記第2の方向に回転している間にマークの端部が検出される各パルス合計npを前記マーク表に記憶するステップと、
    前記エンコーダパルス合計の値が0に等しい場合、前記マイクロ流体装置の第2の方向の走査を停止するステップと、
    前記マーク表に記憶されるマークの各々の一方の端部から他方の端部までの角距離Lを計算するステップと、
    角距離Lがl min を超え、かつl max を超えないマークを正しいマークとして識別するステップと、
    正しいマークとして識別されたマークの一方の端部および他方の端部の位置によって前記ホーム位置を決定するステップとを含む、方法。
  5. マイクロ流体システムのコンピュータ内の処理ユニットの内部記憶装置に直接ロード可能な、ソフトウェアコードを含むコンピュータプログラムであって、前記コンピュータプログラムは請求項1からのいずれかのステップを実行するためのソフトウェアコードを含む、コンピュータプログラム。
  6. コンピュータ使用可能な媒体上に格納されるコンピュータプログラムであって、マイクロ流体システムのコンピュータにおける処理ユニットに請求項1からのいずれかのステップの実行を制御させるための読取可能なコンピュータプログラム。
  7. 前記コンピュータ使用可能な媒体は記録媒体である、請求項に記載のコンピュータプログラム。
  8. 前記コンピュータ使用可能な媒体はコンピュータメモリである、請求項に記載のコンピュータプログラム。
  9. 前記コンピュータ使用可能な媒体は読出専用メモリである、請求項に記載のコンピュータプログラム。
  10. 記憶手段を有するプログラム可能なコントローラによって制御される少なくとも1つのマイクロ流体機器としてのディスクと、前記コントローラと通信することができ、前記デ
    ィスクの位置を特定する信号を出力する位置装置と、前記コントローラに接続されるとともに、前記ディスク上のマークを検出するマーク検出器とを含むマイクロ流体システムであって、前記コントローラは、
    前記ディスクの任意の開始位置から、回転する前記ディスク上においてマークの端部を走査および検出し、
    前記走査回転中に前記検出器によって検出されているマークの端部に対応する位置の値を前記記憶手段に記憶し、
    マークの一方の端部から他方の端部までの角距離Lがl min を超えないマークならびにl max を超えるマークを拒否し、角距離Lがl min を超え、かつl max を超えないマークを正しいマークとして識別し、
    正しいマークとして識別されたマークの一方の端部および他方の端部の位置によってホーム位置を決定する、マイクロ流体システム。
  11. 前記マーク検出器は、電磁ビーム源および受信した電磁ビームの強度に応じた信号を生成する変換器構成を含む、請求項10に記載のシステム。
  12. 前記コントローラは、位置装置(209)の種類に応じ、前記コントローラと前記位置装置とを接続する接続部(215)を介し位置信号Pを用いてさまざまなデータを受信または伝送することができる位置制御手段を含む、請求項10に記載のシステム。
  13. 前記位置装置(209)の種類は各分解能段階に対するパルスを生成するエンコーダであり、前記位置制御手段は、開始位置または前記ホーム位置に対するディスクの現在の位置を表わしているパルス合計値を示すためのパルスカウンタと、前記検出器とを含む、請求項12に記載のシステム。
  14. 前記位置装置(209)の種類は絶対的なエンコーダであり、前記位置制御手段は開始位置または前記ホーム位置からの角距離の絶対的な算定基準を受信または伝送する、請求項12に記載のシステム。
JP2003584676A 2002-04-08 2003-04-07 ホーミングプロセス Expired - Lifetime JP4338529B2 (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US37023402P 2002-04-08 2002-04-08
SE0201072A SE0201072D0 (sv) 2002-04-08 2002-04-08 Homing process
PCT/SE2003/000557 WO2003087779A1 (en) 2002-04-08 2003-04-07 Homing process

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2005522691A JP2005522691A (ja) 2005-07-28
JP4338529B2 true JP4338529B2 (ja) 2009-10-07

Family

ID=29253783

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2003584676A Expired - Lifetime JP4338529B2 (ja) 2002-04-08 2003-04-07 ホーミングプロセス

Country Status (5)

Country Link
US (1) US6992278B2 (ja)
EP (1) EP1493012B1 (ja)
JP (1) JP4338529B2 (ja)
AU (1) AU2003222544A1 (ja)
WO (1) WO2003087779A1 (ja)

Families Citing this family (41)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB9808836D0 (en) * 1998-04-27 1998-06-24 Amersham Pharm Biotech Uk Ltd Microfabricated apparatus for cell based assays
GB9809943D0 (en) * 1998-05-08 1998-07-08 Amersham Pharm Biotech Ab Microfluidic device
US7261859B2 (en) * 1998-12-30 2007-08-28 Gyros Ab Microanalysis device
SE9901100D0 (sv) 1999-03-24 1999-03-24 Amersham Pharm Biotech Ab Surface and tis manufacture and uses
SE9904802D0 (sv) * 1999-12-23 1999-12-23 Amersham Pharm Biotech Ab Microfluidic surfaces
SE0000300D0 (sv) 2000-01-30 2000-01-30 Amersham Pharm Biotech Ab Microfluidic assembly, covering method for the manufacture of the assembly and the use of the assembly
SE0001790D0 (sv) * 2000-05-12 2000-05-12 Aamic Ab Hydrophobic barrier
SE0004296D0 (sv) * 2000-11-23 2000-11-23 Gyros Ab Device and method for the controlled heating in micro channel systems
US6653625B2 (en) * 2001-03-19 2003-11-25 Gyros Ab Microfluidic system (MS)
US7429354B2 (en) 2001-03-19 2008-09-30 Gyros Patent Ab Structural units that define fluidic functions
CA2441206A1 (en) 2001-03-19 2002-09-26 Gyros Ab Characterization of reaction variables
US6919058B2 (en) * 2001-08-28 2005-07-19 Gyros Ab Retaining microfluidic microcavity and other microfluidic structures
US20050214442A1 (en) * 2001-11-27 2005-09-29 Anders Larsson Surface and its manufacture and uses
US7238255B2 (en) * 2001-12-31 2007-07-03 Gyros Patent Ab Microfluidic device and its manufacture
US7221783B2 (en) * 2001-12-31 2007-05-22 Gyros Patent Ab Method and arrangement for reducing noise
EP1490292A1 (en) * 2002-03-31 2004-12-29 Gyros AB Efficient mmicrofluidic devices
US6955738B2 (en) 2002-04-09 2005-10-18 Gyros Ab Microfluidic devices with new inner surfaces
US20050277195A1 (en) * 2002-04-30 2005-12-15 Gyros Ab Integrated microfluidic device (ea)
JP4423189B2 (ja) * 2002-05-31 2010-03-03 ユィロス・パテント・アクチボラグ 表面プラズモン共鳴に基づく検出装置
US20050042770A1 (en) * 2003-05-23 2005-02-24 Gyros Ab Fluidic functions based on non-wettable surfaces
US7776272B2 (en) * 2003-10-03 2010-08-17 Gyros Patent Ab Liquid router
US20090010819A1 (en) * 2004-01-17 2009-01-08 Gyros Patent Ab Versatile flow path
US8592219B2 (en) 2005-01-17 2013-11-26 Gyros Patent Ab Protecting agent
CN1985174B (zh) * 2004-07-12 2010-12-22 爱科来株式会社 分析用具
JP2008534914A (ja) * 2005-01-17 2008-08-28 ユィロス・パテント・アクチボラグ 多目的流路
US7709249B2 (en) * 2005-04-01 2010-05-04 3M Innovative Properties Company Multiplex fluorescence detection device having fiber bundle coupling multiple optical modules to a common detector
US7507575B2 (en) * 2005-04-01 2009-03-24 3M Innovative Properties Company Multiplex fluorescence detection device having removable optical modules
EP1888237B1 (en) * 2005-05-31 2016-01-20 Gyros Patent Ab Method for determining the identity of a microfluidic disc and microfluidic disc
US7527763B2 (en) 2005-07-05 2009-05-05 3M Innovative Properties Company Valve control system for a rotating multiplex fluorescence detection device
US20070009382A1 (en) * 2005-07-05 2007-01-11 William Bedingham Heating element for a rotating multiplex fluorescence detection device
JP4661445B2 (ja) * 2005-08-12 2011-03-30 セイコーエプソン株式会社 エンコーダ
KR101278154B1 (ko) 2007-04-16 2013-06-27 삼성전자주식회사 원심력 기반의 미세유동 장치, 이를 구비한 미세유동시스템 및, 상기 미세유동 장치의 홈 위치 결정 방법
WO2008153985A1 (en) * 2007-06-11 2008-12-18 Numia Medical Technology, Llc Syringe infusion pump
JP5174627B2 (ja) * 2008-01-21 2013-04-03 パナソニック株式会社 分析装置
CA2722484A1 (en) * 2008-04-24 2009-10-29 Peter D. Ludowise Analysis of nucleic acid amplification curves using wavelet transformation
KR20110010922A (ko) * 2009-07-27 2011-02-08 삼성전자주식회사 미세유동 장치, 이를 포함하는 미세유동 시스템 및 미세유동 장치의 기준각 검출 방법
WO2015113700A1 (en) * 2014-01-30 2015-08-06 Fresenius Kabi Deutschland Gmbh Centrifuge and separation chamber for a centrifuge
CN104034909B (zh) * 2014-05-22 2016-05-25 唐山首钢京唐西山焦化有限责任公司 一种取样系统及方法
EP3086126B1 (de) * 2015-04-23 2020-12-16 Siemens Healthcare Diagnostics Products GmbH Verfahren zur bestimmung der lage von messpositionen in einem messsystem
CN104950862B (zh) * 2015-07-28 2018-02-13 苏州大学 一种基于真假值的智能家居控制方法
CN114602325B (zh) * 2022-02-18 2023-05-09 中国科学院水生生物研究所 轮盘式环境dna滤饼更换装置的采样方法、控制方法及系统

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3044372A1 (de) * 1980-11-25 1982-07-08 Boehringer Mannheim Gmbh, 6800 Mannheim Rotoreinheit mit einsatzelementen fuer einen zentrifugalanalysator
DE3126367A1 (de) 1981-07-03 1983-01-13 Siemens AG, 1000 Berlin und 8000 München Bidirektionaler lichtwellenleiter-verzweiger und verfahren zu seiner herstellung
US5639428A (en) * 1994-07-19 1997-06-17 Becton Dickinson And Company Method and apparatus for fully automated nucleic acid amplification, nucleic acid assay and immunoassay
GB9418981D0 (en) * 1994-09-21 1994-11-09 Univ Glasgow Apparatus and method for carrying out analysis of samples
SE9502251D0 (sv) 1995-06-21 1995-06-21 Pharmacia Ab Flow-through sampling cell and use thereof
US6001231A (en) * 1997-07-15 1999-12-14 Caliper Technologies Corp. Methods and systems for monitoring and controlling fluid flow rates in microfluidic systems
EP1004009B1 (en) * 1997-08-15 2001-10-31 Bishop Innovation Limited Torque transducer
US5932874A (en) * 1997-10-10 1999-08-03 Analogic Corporation Measurement and control system for controlling system functions as a function of rotational parameters of a rotating device
JP3627531B2 (ja) * 1998-09-30 2005-03-09 セイコーエプソン株式会社 情報処理装置
SE0001779D0 (sv) 2000-05-12 2000-05-12 Gyros Ab Microanalysis device
JP2004529312A (ja) 1999-06-18 2004-09-24 ガメラ バイオサイエンス コーポレイション 小型化均一アッセイ用のデバイスおよび方法
US6706519B1 (en) * 1999-06-22 2004-03-16 Tecan Trading Ag Devices and methods for the performance of miniaturized in vitro amplification assays
US6556923B2 (en) 2000-01-26 2003-04-29 Caliper Technologies Corp. Software for high throughput microfluidic systems
US20020103809A1 (en) * 2000-02-02 2002-08-01 Searchlogic.Com Corporation Combinatorial query generating system and method

Also Published As

Publication number Publication date
EP1493012B1 (en) 2012-01-18
WO2003087779A1 (en) 2003-10-23
EP1493012A1 (en) 2005-01-05
US6992278B2 (en) 2006-01-31
AU2003222544A1 (en) 2003-10-27
JP2005522691A (ja) 2005-07-28
US20030231312A1 (en) 2003-12-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP4338529B2 (ja) ホーミングプロセス
CN110161003B (zh) 光学检测装置及实时荧光定量核酸扩增检测系统
JP5129124B2 (ja) スピナーホームシーケンス
US20080138247A1 (en) Liquid Detection and Confidence Determination
JP2005513418A (ja) マイクロフルイディックデバイス用のディテクタ構成
KR20010020145A (ko) 분석 시스템
JPH02257065A (ja) 分析較正用データを備えた分析装置および分析較正用データの供給方法
EP3472658B1 (en) Image based analysis of samples
EP3472655B1 (en) Sample holder for image based analysis of samples
US20220280938A1 (en) Measurement of an anlyte with a cartridge
JP4665673B2 (ja) 光学分析装置
JP5021486B2 (ja) 液体検出および信頼度判定
JP2011080769A (ja) 円盤型分析チップおよびそれを用いた測定システム
JP2015121413A (ja) 分析基板
JP4969923B2 (ja) サンプルの測定方法
JP4423039B2 (ja) マイクロ流体デバイスにおける雑音を低減させるための方法および装置
JP2007527514A (ja) 信頼度判定

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20060124

A711 Notification of change in applicant

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711

Effective date: 20060602

A977 Report on retrieval

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007

Effective date: 20080626

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20081111

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20090205

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20090616

A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20090630

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 4338529

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120710

Year of fee payment: 3

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130710

Year of fee payment: 4

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

EXPY Cancellation because of completion of term