JP4233092B2 - 細胞移動アッセイ - Google Patents
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Description
本出願は、2001年6月7日に出願された、米国仮出願番号60/296,682に対する優先権を主張する。
(発明の分野)
本発明は、化学誘引物質レセプター(例えば、ケモカインレセプター)のアンタゴニストを同定するためのアッセイについて指向される。これまでのアッセイと比較した本アッセイの1つの利点は、偽陽性シグナルおよび偽陰性シグナルを生成する化合物から確かな化学誘引物質レセプターアンタゴニストを区別するその能力である。
化学誘引物質レセプターのアンタゴニストを同定するための高処理量スクリーニング(HTS)方法は、下流の事象における摂動(例えば、細胞移動)の検出にしばしば依存する。ケモカインレセプターの場合において、白血球細胞移動が、しばしばアッセイされる。しかし、細胞膜を破壊するか、または下流の事象をブロックする化合物は、これらの結果を模倣し、候補アンタゴニストとしてふるまう。次いで、相当な努力が、偽陽性シグナルを生じる化合物または分子から本物のアンタゴニストを区別するために必要とされる。本当のアンタゴニスト(これは、高処理量スクリーニングにて分析された候補アンタゴニストの大きなコレクションの非常に小さい画分のみを表す)を同定することは、厄介な仕事である。任意の時間または支出の節約を現実化することにより、より迅速かつ低支出で患者に新しい薬剤を運ぶことが可能となる。
第1の局面において、本発明は、化学誘引物質レセプターアンタゴニストを同定するための方法を提供する。化学誘引物質レセプターを有する細胞は、化学誘引物質レセプターに対する過剰の最適なリガンド濃度の存在下で、候補アンタゴニストと共にインキュベートされ、次いで、細胞移動がアッセイされる。細胞移動は、候補アンタゴニストがアンタゴニストであることを示す。
本発明の逆活性の移動(RAM)アッセイは、アンタゴニストを同定および区別する一方で、他のアッセイにおいて見出される混乱をおこす偽陽性シグナルおよび偽陰性シグナルの蔓延を有意に減少させる。故に、潜在的な薬学的化合物の確認に関する時間および労力は、多いに減少される。
(1)化学誘引物質レセプター(例えば、ケモカインレセプター)を含む細胞を候補アンタゴニストと共にインキュベートする工程;
(2)細胞を、化学誘引物質レセプターに対する阻害濃度のリガンドと接触させる工程;および
(3)細胞移動をアッセイする工程。
「細胞移動アッセイ」は、シグナルに応じて細胞移動の能力を試験する。
RAMアッセイにおいて、ケモカイン保持細胞を、候補アンタゴニストと共にインキュベートし、次いで標的ケモカインレセプターに対する阻害濃度のリガンドと接触させる。次いで、細胞の移動能力をアッセイする。RAMアッセイにおいて、候補アンタゴニストの存在下で細胞が移動する場合、ポジティブなシグナルが観察されている。「アンタゴニスト」は、細胞移動のような生物学的活性を、部分的もしくは完全にブロックするか、阻害するか、または部分的もしくは完全に中和する、任意の分子を包含する。同様に、「アゴニスト」とは、ケモカインのような分子の生物学的活性を模倣する、任意の分子を包含する。アゴニストまたはアンタゴニストとして作用し得る分子としては、有機性低分子、高分子、抗体または抗体フラグメント、ケモカインフラグメントまたはケモカイン改変体、ペプチドなどが挙げられる。「候補アンタゴニスト」は、アンタゴニスト活性について試験されている化合物であり:同様に、「候補アゴニスト」は、アゴニスト活性について試験されている化合物である。
ケモカインリガンドに対する細胞移動の用量応答を実施して、ケモカインリガンドの阻害濃度を規定し得る。用量応答曲線を決定するためのいずれかの標準的方法を使用し得る。このような方法の1つは、標的ケモカインレセプターを発現する細胞を回収する工程、漸増する量のケモカインの存在下で、細胞移動デバイスにその細胞を添加する工程、細胞移動を測定する工程、ケモカイン濃度に対する細胞移動をプロットする工程、次いで細胞移動を阻害するケモカイン濃度を、このグラフから計算する工程、を包含する。
RAMアッセイを、ケモカインレセプターアンタゴニストについてスクリーニングするために使用される任意の他のアッセイと組み合わせて実施し得る。RAM形式は最初のHTS工程として有用であるばかりでなく、またこれは他のアッセイにおいて同定される候補アンタゴニストについての確証アッセイまたは2次的アッセイを提供する。例えば、Ca2+流動を測定するHTS方法(FLIPRTMシステム(Molecular Devices Corp.,Sunnyvale,CA)に基づく方法、または細胞内の遊離Ca2+レベルの増加をアッセイする、他のレポーターベースの方法を含める)を、最初のアッセイとして使用し得る。RAMアッセイを使用してこのような候補物を確定し得るか、または逆もあり得る。第2アッセイとして、RAMは非特異的作用を表すそれらの候補アンタゴニストを識別する。RAMアッセイを他のHTS方法と共に使用する場合、非特異的ブロッカーから真の当たり(hit)を識別するための手段を提供する。
RAMアッセイにおける使用のための、標的ケモカインレセプター(または化学誘引物質レセプター)を発現する細胞を、種々の方法、例えば、被験体からの回収後、または培養物からの放出後の遠心分離によって収集し、次いで、細胞型および細胞サイズに依存した適切な密度で緩衝液中に再懸濁する。簡便な細胞濃度は、約1×106〜1×107細胞/mlの範囲に渡り;しばしば約2.5×106細胞/mlが適切である。
RAM形式においてアッセイされ得る細胞としては、細胞表面上に少なくとも1つのケモカインレセプターを発現する全ての細胞(例えば、ヒト単球)、または組換えケモカインレセプターを発現するように操作された他の細胞が挙げられ、そしてそれら細胞は、細胞移動を活性化させるのに適格である。既知のケモカインレセプターおよびいくつかのそのリガンドを、表Bに示す。ケモカインレセプターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:CXCクラス(例えば、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR5);CCクラス(例えば、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CCR10およびCCR11);CX3CRクラス(例えば、CX3CR1)、ならびにXCRクラス(例えば、XCR1)。
ケモカインレセプターのアンタゴニスト活性について、任意の分子および任意の化合物をスクリーニングし得る。ケモカインレセプター/リガンドの活性を阻害する化合物(例えば、細胞移動を活性化させる化合物、または細胞内Ca2+濃度を調節する化合物)が、候補アンタゴニストである。
移動性細胞を定量することを、非常に多様な利用可能な方法(例えば、DNA量をアッセイ(例えば、CyQuant Cell Proliferation Kit(Molecular Probes))し、次いで、生成されるシグナル(例えば、蛍光)をアッセイする方法)によって達成され得る。他の方法としては、顕微鏡を使用する細胞の計測、または適切な検出マーカー(例えば、色素(例えば、Calcein AM(NeuroProbe)もしくはMolecular Probe(Eugene、OR)より利用可能な多くの標識)を用いる細胞の標識、または放射性標識(例えば、135Iを用いる細胞表面のヨード化、35S−メチオニン/35S−システインを用いるタンパク質合成標識、もしくは3Hを用いる核酸標識)が挙げられる。
細胞移動アッセイの結果を混乱させず、そしてその結果が大抵はケモカイン−ケモカインレセプターの相互作用に関連され得るように、血清または他の増殖因子および化学走性因子が取り除かれ得るが、種々の溶液を調製するために使用され得る緩衝液としては、細胞培養培地が挙げられる。いくつかの場合において、タンパク質(例えば、ウシ血清アルブミンを含む、種々のアルブミン)は細胞を支持するために添加され得る。最適な培地の選択は、細胞型に依存する;細胞を培養するために使用されるこの培地は、通常、好ましい選択肢を表す。適切な培養培地の例としては、以下が挙げられる:Iscove’s Modified Dulbecco’s Medium(IMDM)、Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium(DMEM)、Minimal Essential Medium Eagle(MEM)、Basal Medium Eagle(BME)、Click’s Medium、L−15 Medium Leibovitz、McCoy’s 5A Medium、Glasgow Minimum Essential Medium(GMEM)、NCTC 109 Medium、William’s Medium E、RPMI−1640、およびMedium 199。特定の細胞型/細胞株または細胞機能のために特別に開発された培地(例えば、Madin−Darby Bovine Kidney Growth Medium、Madin−Darby Bovine Kidney Maintenance Medium、種々のハイブリドーマ培地、内皮細胞基本培地(Endothelial Basal Medium)、線維芽細胞基本培地(Fibroblast Basal Medium)、ケラチノサイト基本培地(Keratinocyte Basal Medium)およびメラノサイト基本培地(Melanocyte Basal Medium)もまた有用である。望ましい場合、タンパク質低減培地もしくは無タンパク質培地、および/または無血清培地、および/または化学的に規定される、動物成分のない培地(例えば、CHO、Gene Therapy MediumまたはQBSF Serum−free Medium(Sigma Chemical Co.;St.Louis、MO)、DMEM Nutrient Mixture F−12 Ham、MCDB(105、110、131、151、153、201および302)、NCTC 135、Ultra DOMA PFまたはHL−1(両方ともBiowhittaker;Walkersville、MDより提供される))が利用され得る。
RAMアッセイを実行するための成分を、適用のための指示書と一緒に、キット、容器、パックまたはディスペンサーにまとめ得る。1つのキットとして供給される場合、この組成の異なる成分を、個別の容器に包装し得、そして使用直前に混合され得る。これら成分をこのように個別に包装することは、活性成分の機能を損なうことなく長期保存を可能にし得る。例えば、キットは、細胞移動装置、ケモカインレセプター保有細胞、およびケモカインレセプター保有細胞に対する移動阻害濃度のケモカインを含む溶液中で含み得る。この溶液は、凍結乾燥されて提供され得る。
キットに含まれる試薬は、異なる成分の活性(life)が保存され、そして容器材料によって吸収も変化もされないように、任意の種類の容器中で供給され得る。例えば、密封ガラスアンプルは、中性の不活性な気体(例えば、窒素)の下で包装された、凍結乾燥されたケモカインまたは緩衝液を含み得る。アンプルは、任意の適切な材料(例えば、ガラス、有機ポリマー(例えば、ポリカーボネート、ポリスチレンなど)、セラミック、金属、または試薬を保持するために典型的に使用される任意の他の材料)から構成され得る。適切な容器の他の例は、アンプルと同じ物質から製造され得る単純なボトル、および箔(例えば、アルミニウムまたは合金)で裏打ちした内装から構成され得るエンベロープを含む。他の容器は、試験管、バイアル、フラスコ、ボトル、シリンジなどを含む。容器は、滅菌したアクセスポートを有する(例えば、皮下注射針により貫通され得るストッパーを有するボトル)。他の容器は、2つの区画を有し得、これらは、除去の際に成分(例えば、ある区画中の凍結乾燥されたリンホカイン、および他の区画中の緩衝液または水)を混合し得る、容易に除去可能なメンブレンによって隔てられる。除去可能なメンブレンは、ガラス、プラスチック、ラバーなどであり得る。
キットはまた、指示資料と共に供給され得る。指示書は、紙または他の物質に印刷され得、そして/または電子的に読み取り可能な媒体(例えば、フロッピー(登録商標)ディスク、CD−ROM、DVD−ROM、Zipディスク、ビデオテープ、オーディオテープなど)として供給され得る。詳細な指示書は、キットに物理的に添付されなくてもよく;その代わり、使用者はそのキットの製造業者または販売業者によって特定されるインターネットウェブサイトから指導され得るか、または電子メールとして提供され得る。
細胞表面のCXCR4を発現する活性化リンパ球についての用量応答曲線を得るために、従来の細胞移動アッセイを使用した(Baconら、1988;Penfoldら、1999)。細胞を遠心分離によって回収し、次いで細胞移動緩衝液(ハンクス緩衝化塩液(HBSS)/0.1% ウシ血清アルブミン(BSA))中に2.5×106細胞/mlで再懸濁した。CXCR4リガンドのストローマ細胞由来因子(SDF−1)を、細胞移動緩衝液中の系列希釈により濃度系列(0.1nM〜10mM)に調製した。低濃度では、SDFは、CXCR4を保持する活性化リンパ球の細胞移動を活性化する。
RAMアッセイにおいて、ケモカインレセプターのアンタゴニストを、阻害性のケモカイン濃度と共にインキュベートした細胞の移動を活性化する能力によって同定する。RAMアッセイを確証するために、ウイルスケモカインであるvMIP−IIを、CXCR4アンタゴニストとして使用した。vMIP−IIは、高い親和性でCXCR4に結合し、レセプターのシグナル伝達をブロックし、そして細胞移動を阻害し、CXCR4の通常のリガンドであるSDFと競合する(Kledalら、1997)。阻害濃度のSDFによって不動化されるCXCR4発現細胞を、vMIP−IIの存在下で活性化して増加した移動に伴って移動する場合、この結果はRAMアッセイの原理を確認する。参照のためそしてコントロールとして、従来の細胞移動アッセイを実施した。従来のアッセイ形式において、vMIP−IIによって細胞移動を阻害した。
(2) RAMアッセイ、1μM SDF。
RAMアッセイを、vMIP−IIの代りに以前に同定された低分子アンタゴニストおよび表2に記載されるさらなる細胞型を使用することを除き、実施例2に記載されるように実施した。
本実験は、非特異的ケモカインレセプターアンタゴニストと特異的ケモカインレセプターアンタゴニストとを識別するRAMアッセイの能力を、結論的に実証する。従来のアッセイおよびRAMアッセイを、以下の候補アンタゴニストを用いることを除き、実施例2に記載されるように実施した:
(1) コントロール(候補アンタゴニストなし)
(2) ポジティブコントロール(vMIP−II;既知のCXCR4アンタゴニスト)
(3) 既知の非特異的な細胞移動インヒビター:
化合物 #1
化合物 #2
化合物 #3。
Claims (13)
- ケモカインレセプターアンタゴニストを同定するための方法であって、該方法は:
ケモカインレセプターを含む細胞を候補アンタゴニストと共にインキュベートする工程;
該細胞を、該ケモカインレセプターに対する阻害濃度のリガンドと接触させる工程であって、該阻害濃度は、事前工程で決定された細胞移動を阻害するリガンド濃度である、工程;および
細胞移動をアッセイする工程であって、該候補アンタゴニストおよび該阻害濃度のリガンドが存在しているときの細胞移動の活性の増大によって、該候補アンタゴニストをアンタゴニストとして同定する工程を包含する、方法。 - 請求項1に記載の方法であって、前記候補アンタゴニストが、小ペプチド、ペプチド様分子、非ペプチジル有機化合物、無機化合物、核酸または抗体である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターが、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CCR10、CCR11、CX3CR1またはXCR1である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、CCRに対するリガンド、CXCRに対するリガンド、およびCX3CRに対するリガンドからなる群から選択される、方法。
- 請求項4に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、IL−8、GCP−2、Groα、Groβ、Groγ、ENA−78、PBP、MIG、IP−10、I−TAC、SDF−1、BLC、MIP−1α、MIP−1β、RANTES,HCC−1、HCC−2、HCC−3、HCC−4、MCP−1、MCP−2、MCP−3、MCP−4、エオタキシン−1、エオタキシン−2、TARC、MDC、MIP−3α、MIP−3β、6Ckine、I−309、TECK、リンホタクチン、フラクタルキン、TCA−4、Exodus−2、Exodus−3、またはCKβ−11である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターが、CCR5を含み、そして前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、MIP−1α、MIP−1β、またはRANTESを含む、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターが、CXCR4を含み、そして前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、SDF−1を含む、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターが、CCR9を含み、そして前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、TECKを含む、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記ケモカインレセプターが、CCR10を含み、そして前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、CTACKを含む、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記阻害濃度の前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、細胞移動を最大のリガンド活性化細胞移動の50%以上阻害する、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記阻害濃度の前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、細胞移動を最大のリガンド活性化細胞移動の95%以上阻害する、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記阻害濃度の前記ケモカインレセプターに対する前記リガンドが、細胞移動を最大のリガンド活性化細胞移動の100%阻害する、方法。
- ケモカインレセプターアンタゴニストを同定するための方法であって、該方法は:
従来のアッセイにおいてケモカインレセプターの候補アンタゴニストを同定する工程を包含し;
さらに第2の工程を包含し、該第2の工程は:
該ケモカインレセプターを含む細胞を該候補アンタゴニストと共にインキュベートする工程;
該細胞を、該ケモカインレセプターに対する阻害濃度のリガントと接触させる工程であって、該阻害濃度は、事前工程で決定された細胞移動を阻害するリガンド濃度である工程;および
細胞移動をアッセイする工程であって、該候補アンタゴニストおよび該阻害濃度のリガンドが存在しているときの細胞移動の活性の増大によって、該候補アンタゴニストをアンタゴニストとして同定する工程を包含する、方法。
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