JP3808498B2 - フラボノールシンターゼ酵素をコードする遺伝子配列およびその用途 - Google Patents
フラボノールシンターゼ酵素をコードする遺伝子配列およびその用途 Download PDFInfo
- Publication number
- JP3808498B2 JP3808498B2 JP50483394A JP50483394A JP3808498B2 JP 3808498 B2 JP3808498 B2 JP 3808498B2 JP 50483394 A JP50483394 A JP 50483394A JP 50483394 A JP50483394 A JP 50483394A JP 3808498 B2 JP3808498 B2 JP 3808498B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleic acid
- seq
- fls
- plant
- sequence
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 108010076511 Flavonol synthase Proteins 0.000 title claims abstract description 17
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims description 54
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 44
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 97
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 84
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 61
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 61
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 42
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 42
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 31
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 27
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 17
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 claims description 16
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 16
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 16
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 16
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 claims description 13
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 13
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 12
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 11
- 235000007516 Chrysanthemum Nutrition 0.000 claims description 8
- 240000006497 Dianthus caryophyllus Species 0.000 claims description 8
- 235000009355 Dianthus caryophyllus Nutrition 0.000 claims description 7
- 241000208125 Nicotiana Species 0.000 claims description 5
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 3
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims 7
- 241000207748 Petunia Species 0.000 claims 5
- 241000723353 Chrysanthemum Species 0.000 claims 2
- 241001233957 eudicotyledons Species 0.000 claims 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 claims 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 abstract description 47
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 abstract description 47
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 21
- 229930003935 flavonoid Natural products 0.000 abstract description 7
- 150000002215 flavonoids Chemical class 0.000 abstract description 7
- 235000017173 flavonoids Nutrition 0.000 abstract description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 abstract description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 abstract description 3
- 101710115666 Flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase Proteins 0.000 description 89
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 74
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 45
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 39
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 33
- 240000007377 Petunia x hybrida Species 0.000 description 32
- HVQAJTFOCKOKIN-UHFFFAOYSA-N flavonol Natural products O1C2=CC=CC=C2C(=O)C(O)=C1C1=CC=CC=C1 HVQAJTFOCKOKIN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 28
- 235000011957 flavonols Nutrition 0.000 description 28
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 26
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 21
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 18
- 150000002216 flavonol derivatives Chemical class 0.000 description 17
- KJXSIXMJHKAJOD-LSDHHAIUSA-N (+)-dihydromyricetin Chemical compound C1([C@@H]2[C@H](C(C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)=O)O)=CC(O)=C(O)C(O)=C1 KJXSIXMJHKAJOD-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 16
- REFJWTPEDVJJIY-UHFFFAOYSA-N Quercetin Chemical compound C=1C(O)=CC(O)=C(C(C=2O)=O)C=1OC=2C1=CC=C(O)C(O)=C1 REFJWTPEDVJJIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 14
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 13
- 235000010208 anthocyanin Nutrition 0.000 description 13
- 229930002877 anthocyanin Natural products 0.000 description 13
- 239000004410 anthocyanin Substances 0.000 description 13
- 150000004636 anthocyanins Chemical class 0.000 description 13
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 13
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 12
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 11
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 11
- CXQWRCVTCMQVQX-LSDHHAIUSA-N (+)-taxifolin Chemical compound C1([C@@H]2[C@H](C(C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)=O)O)=CC=C(O)C(O)=C1 CXQWRCVTCMQVQX-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 10
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 244000189548 Chrysanthemum x morifolium Species 0.000 description 10
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 10
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- XCGZWJIXHMSSQC-UHFFFAOYSA-N dihydroquercetin Natural products OC1=CC2OC(=C(O)C(=O)C2C(O)=C1)c1ccc(O)c(O)c1 XCGZWJIXHMSSQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- MWDZOUNAPSSOEL-UHFFFAOYSA-N kaempferol Natural products OC1=C(C(=O)c2cc(O)cc(O)c2O1)c3ccc(O)cc3 MWDZOUNAPSSOEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 10
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 10
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 150000007946 flavonol Chemical class 0.000 description 9
- 108010028143 Dioxygenases Proteins 0.000 description 8
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 8
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 8
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 8
- KQILIWXGGKGKNX-UHFFFAOYSA-N dihydromyricetin Natural products OC1C(=C(Oc2cc(O)cc(O)c12)c3cc(O)c(O)c(O)c3)O KQILIWXGGKGKNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 8
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 8
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 8
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- ZVOLCUVKHLEPEV-UHFFFAOYSA-N Quercetagetin Natural products C1=C(O)C(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=C(O)C(O)=C(O)C=C2O1 ZVOLCUVKHLEPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- HWTZYBCRDDUBJY-UHFFFAOYSA-N Rhynchosin Natural products C1=C(O)C(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=CC(O)=C(O)C=C2O1 HWTZYBCRDDUBJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 7
- 101150096282 fls gene Proteins 0.000 description 7
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 7
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 7
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 7
- 235000005875 quercetin Nutrition 0.000 description 7
- 229960001285 quercetin Drugs 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- 102000016680 Dioxygenases Human genes 0.000 description 6
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 6
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 6
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 6
- IYRMWMYZSQPJKC-UHFFFAOYSA-N kaempferol Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=C(O)C=C(O)C=C2O1 IYRMWMYZSQPJKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 6
- YEDFEBOUHSBQBT-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydroflavon-3-ol Chemical class O1C2=CC=CC=C2C(=O)C(O)C1C1=CC=CC=C1 YEDFEBOUHSBQBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 5
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 5
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 5
- 101100298295 Drosophila melanogaster flfl gene Proteins 0.000 description 5
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 5
- 241000218922 Magnoliophyta Species 0.000 description 5
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 5
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 5
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 5
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 5
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 5
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101100462537 Caenorhabditis elegans pac-1 gene Proteins 0.000 description 4
- 241001573881 Corolla Species 0.000 description 4
- 241001284366 Koumansetta rainfordi Species 0.000 description 4
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 4
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 4
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 4
- -1 flavonol glycosides Chemical class 0.000 description 4
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 4
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 4
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 4
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 4
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- VGONTNSXDCQUGY-RRKCRQDMSA-N 2'-deoxyinosine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(N=CNC2=O)=C2N=C1 VGONTNSXDCQUGY-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 3
- YQNRVGJCPCNMKT-LFVJCYFKSA-N 2-[(e)-[[2-(4-benzylpiperazin-1-ium-1-yl)acetyl]hydrazinylidene]methyl]-6-prop-2-enylphenolate Chemical compound [O-]C1=C(CC=C)C=CC=C1\C=N\NC(=O)C[NH+]1CCN(CC=2C=CC=CC=2)CC1 YQNRVGJCPCNMKT-LFVJCYFKSA-N 0.000 description 3
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 3
- UBSCDKPKWHYZNX-UHFFFAOYSA-N Demethoxycapillarisin Natural products C1=CC(O)=CC=C1OC1=CC(=O)C2=C(O)C=C(O)C=C2O1 UBSCDKPKWHYZNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010018087 Flavanone 3-dioxygenase Proteins 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101100117764 Mus musculus Dusp2 gene Proteins 0.000 description 3
- IKMDFBPHZNJCSN-UHFFFAOYSA-N Myricetin Chemical compound C=1C(O)=CC(O)=C(C(C=2O)=O)C=1OC=2C1=CC(O)=C(O)C(O)=C1 IKMDFBPHZNJCSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 3
- 235000004789 Rosa xanthina Nutrition 0.000 description 3
- 241000109329 Rosa xanthina Species 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 3
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 3
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 3
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 3
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 3
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 3
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 description 3
- VGONTNSXDCQUGY-UHFFFAOYSA-N desoxyinosine Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 VGONTNSXDCQUGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 3
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 3
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 3
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 3
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 3
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 3
- 235000008777 kaempferol Nutrition 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- UXOUKMQIEVGVLY-UHFFFAOYSA-N morin Natural products OC1=CC(O)=CC(C2=C(C(=O)C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)O)=C1 UXOUKMQIEVGVLY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PCOBUQBNVYZTBU-UHFFFAOYSA-N myricetin Natural products OC1=C(O)C(O)=CC(C=2OC3=CC(O)=C(O)C(O)=C3C(=O)C=2)=C1 PCOBUQBNVYZTBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000007743 myricetin Nutrition 0.000 description 3
- 229940116852 myricetin Drugs 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 3
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 3
- PADQINQHPQKXNL-LSDHHAIUSA-N (+)-dihydrokaempferol Chemical compound C1([C@@H]2[C@H](C(C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)=O)O)=CC=C(O)C=C1 PADQINQHPQKXNL-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 2
- FTVWIRXFELQLPI-ZDUSSCGKSA-N (S)-naringenin Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1[C@H]1OC2=CC(O)=CC(O)=C2C(=O)C1 FTVWIRXFELQLPI-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 2
- KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 2-oxoglutaric acid Chemical compound OC(=O)CCC(=O)C(O)=O KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 235000009604 Chrysanthemum X morifolium Nutrition 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 2
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 2
- 241000219322 Dianthus Species 0.000 description 2
- 241000511009 Eustoma exaltatum subsp. russellianum Species 0.000 description 2
- 108010062650 Flavonoid 3',5'-hydroxylase Proteins 0.000 description 2
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 2
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 2
- 241000735332 Gerbera Species 0.000 description 2
- 108010088437 Hyoscyamine (6S)-dioxygenase Proteins 0.000 description 2
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- 241000234435 Lilium Species 0.000 description 2
- 244000061322 Nicotiana alata Species 0.000 description 2
- 241000208136 Nicotiana sylvestris Species 0.000 description 2
- 240000009164 Petroselinum crispum Species 0.000 description 2
- 239000012506 Sephacryl® Substances 0.000 description 2
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000005811 Viola adunca Nutrition 0.000 description 2
- 240000009038 Viola odorata Species 0.000 description 2
- 235000013487 Viola odorata Nutrition 0.000 description 2
- 235000002254 Viola papilionacea Nutrition 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 2
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 150000001915 cyanidin derivatives Chemical class 0.000 description 2
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- RAYJUFCFJUVJBB-UHFFFAOYSA-N dihydrokaempferol Natural products OC1Oc2c(O)cc(O)cc2C(=O)C1c3ccc(O)cc3 RAYJUFCFJUVJBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 2
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000035558 fertility Effects 0.000 description 2
- 229930003944 flavone Natural products 0.000 description 2
- 235000011949 flavones Nutrition 0.000 description 2
- 230000008124 floral development Effects 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 2
- 229930182470 glycoside Natural products 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 2
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- KZMACGJDUUWFCH-UHFFFAOYSA-O malvidin Chemical compound COC1=C(O)C(OC)=CC(C=2C(=CC=3C(O)=CC(O)=CC=3[O+]=2)O)=C1 KZMACGJDUUWFCH-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- WGEYAGZBLYNDFV-UHFFFAOYSA-N naringenin Natural products C1(=O)C2=C(O)C=C(O)C=C2OC(C1)C1=CC=C(CC1)O WGEYAGZBLYNDFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000007625 naringenin Nutrition 0.000 description 2
- 229940117954 naringenin Drugs 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 235000011197 perejil Nutrition 0.000 description 2
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 239000012536 storage buffer Substances 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K tripotassium phosphate Chemical compound [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCCN1CCOCC1 DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UZFMOKQJFYMBGY-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-TEMPO Chemical compound CC1(C)CC(O)CC(C)(C)N1[O] UZFMOKQJFYMBGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100030310 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Human genes 0.000 description 1
- 101710163881 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Proteins 0.000 description 1
- NGYHUCPPLJOZIX-XLPZGREQSA-N 5-methyl-dCTP Chemical compound O=C1N=C(N)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NGYHUCPPLJOZIX-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 1
- 241000207875 Antirrhinum Species 0.000 description 1
- 101100226484 Arabidopsis thaliana CYP75B1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 235000008537 Brassica juncea var. integrifolia Nutrition 0.000 description 1
- 108010004539 Chalcone isomerase Proteins 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 241001429175 Colitis phage Species 0.000 description 1
- 241000612152 Cyclamen hederifolium Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- GCPYCNBGGPHOBD-UHFFFAOYSA-N Delphinidin Natural products OC1=Cc2c(O)cc(O)cc2OC1=C3C=C(O)C(=O)C(=C3)O GCPYCNBGGPHOBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010044229 Dihydroflavanol 4-reductase Proteins 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- CWYNVVGOOAEACU-UHFFFAOYSA-N Fe2+ Chemical compound [Fe+2] CWYNVVGOOAEACU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 102000004867 Hydro-Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090001042 Hydro-Lyases Proteins 0.000 description 1
- 101710203526 Integrase Proteins 0.000 description 1
- LTYOQGRJFJAKNA-KKIMTKSISA-N Malonyl CoA Natural products S(C(=O)CC(=O)O)CCNC(=O)CCNC(=O)[C@@H](O)C(CO[P@](=O)(O[P@](=O)(OC[C@H]1[C@@H](OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@@H](n2c3ncnc(N)c3nc2)O1)O)O)(C)C LTYOQGRJFJAKNA-KKIMTKSISA-N 0.000 description 1
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 1
- BAWFJGJZGIEFAR-NNYOXOHSSA-N NAD zwitterion Chemical compound NC(=O)C1=CC=C[N+]([C@H]2[C@@H]([C@H](O)[C@@H](COP([O-])(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]3[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O3)N3C4=NC=NC(N)=C4N=C3)O)O2)O)=C1 BAWFJGJZGIEFAR-NNYOXOHSSA-N 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 101100494423 Oryza sativa subsp. japonica CYP75B3 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 101000932472 Petunia hybrida Flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000490567 Pinctada Species 0.000 description 1
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 1
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 101150006914 TRP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- GAMYVSCDDLXAQW-AOIWZFSPSA-N Thermopsosid Natural products O(C)c1c(O)ccc(C=2Oc3c(c(O)cc(O[C@H]4[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O4)c3)C(=O)C=2)c1 GAMYVSCDDLXAQW-AOIWZFSPSA-N 0.000 description 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 1
- 241000722921 Tulipa gesneriana Species 0.000 description 1
- 244000172533 Viola sororia Species 0.000 description 1
- 241000219094 Vitaceae Species 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 150000003862 amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 229940072107 ascorbate Drugs 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 235000021466 carotenoid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001747 carotenoids Chemical class 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- YTMNONATNXDQJF-UBNZBFALSA-N chrysanthemin Chemical compound [Cl-].O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC2=C(O)C=C(O)C=C2[O+]=C1C1=CC=C(O)C(O)=C1 YTMNONATNXDQJF-UBNZBFALSA-N 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 238000006482 condensation reaction Methods 0.000 description 1
- 235000009508 confectionery Nutrition 0.000 description 1
- 108091036078 conserved sequence Proteins 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 229930186364 cyclamen Natural products 0.000 description 1
- 235000007242 delphinidin Nutrition 0.000 description 1
- JKHRCGUTYDNCLE-UHFFFAOYSA-O delphinidin Chemical compound [O+]=1C2=CC(O)=CC(O)=C2C=C(O)C=1C1=CC(O)=C(O)C(O)=C1 JKHRCGUTYDNCLE-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 229960000633 dextran sulfate Drugs 0.000 description 1
- 229940079919 digestives enzyme preparation Drugs 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 239000002024 ethyl acetate extract Substances 0.000 description 1
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 1
- 229910001448 ferrous ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011790 ferrous sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000003891 ferrous sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 108010060641 flavanone synthetase Proteins 0.000 description 1
- 150000002212 flavone derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000002213 flavones Chemical class 0.000 description 1
- 108010015706 flavonoid 3'-hydroxylase Proteins 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 238000003958 fumigation Methods 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 235000021021 grapes Nutrition 0.000 description 1
- ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N guanidinium thiocyanate Chemical compound SC#N.NC(N)=N ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 210000000554 iris Anatomy 0.000 description 1
- BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L iron(2+) sulfate (anhydrous) Chemical compound [Fe+2].[O-]S([O-])(=O)=O BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000359 iron(II) sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- LTYOQGRJFJAKNA-DVVLENMVSA-N malonyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)CC(O)=O)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 LTYOQGRJFJAKNA-DVVLENMVSA-N 0.000 description 1
- 235000009584 malvidin Nutrition 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000243 mutagenic effect Toxicity 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000001151 other effect Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- HKUHOPQRJKPJCJ-UHFFFAOYSA-N pelargonidin Natural products OC1=Cc2c(O)cc(O)cc2OC1c1ccc(O)cc1 HKUHOPQRJKPJCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000006251 pelargonidin Nutrition 0.000 description 1
- XVFMGWDSJLBXDZ-UHFFFAOYSA-O pelargonidin Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C(C(=C1)O)=[O+]C2=C1C(O)=CC(O)=C2 XVFMGWDSJLBXDZ-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- CAHGSEFWVUVGGL-UBNZBFALSA-N pelargonidin 3-O-beta-D-glucoside chloride Chemical compound [Cl-].O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC2=C(O)C=C(O)C=C2[O+]=C1C1=CC=C(O)C=C1 CAHGSEFWVUVGGL-UBNZBFALSA-N 0.000 description 1
- 229930015721 peonidin Natural products 0.000 description 1
- 235000006404 peonidin Nutrition 0.000 description 1
- XFDQJKDGGOEYPI-UHFFFAOYSA-O peonidin Chemical compound C1=C(O)C(OC)=CC(C=2C(=CC=3C(O)=CC(O)=CC=3[O+]=2)O)=C1 XFDQJKDGGOEYPI-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 229930015717 petunidin Natural products 0.000 description 1
- 235000006384 petunidin Nutrition 0.000 description 1
- AFOLOMGWVXKIQL-UHFFFAOYSA-O petunidin Chemical compound OC1=C(O)C(OC)=CC(C=2C(=CC=3C(O)=CC(O)=CC=3[O+]=2)O)=C1 AFOLOMGWVXKIQL-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000009013 pigment accumulation Effects 0.000 description 1
- 230000019612 pigmentation Effects 0.000 description 1
- 230000008119 pollen development Effects 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 229910000160 potassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000008057 potassium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 235000011009 potassium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000012146 running buffer Substances 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- 229940016590 sarkosyl Drugs 0.000 description 1
- 108700004121 sarkosyl Proteins 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 238000005204 segregation Methods 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M sodium lauroyl sarcosinate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC([O-])=O KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 244000117494 takana Species 0.000 description 1
- 239000001648 tannin Substances 0.000 description 1
- 235000018553 tannin Nutrition 0.000 description 1
- 229920001864 tannin Polymers 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N tris acetate Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000025594 tube development Effects 0.000 description 1
- 210000003934 vacuole Anatomy 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- VHBFFQKBGNRLFZ-UHFFFAOYSA-N vitamin p Natural products O1C2=CC=CC=C2C(=O)C=C1C1=CC=CC=C1 VHBFFQKBGNRLFZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/001—Oxidoreductases (1.) acting on the CH-CH group of donors (1.3)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/825—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving pigment biosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y114/00—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
- C12Y114/11—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14) with 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors (1.14.11)
- C12Y114/11023—Flavonol synthase (1.14.11.23)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Description
本明細書において以後引用する刊行物の書誌的詳細は本明細書の詳細な説明の後にまとめてある。ヌクレオチドおよびアミノ酸の配列について本明細書に引用する配列番号は上記書誌事項の後に示す。
花卉産業界は顕花植物の新しい異なる品種の開発に懸命に努力している。このような新規な品種を創製するのに有効な方法は花色を操作することによる方法であるが、伝統的な育種法を用いて、花の実用品種の大部分については高範囲の色が産生され、ある程度成功している。しかし伝統的な方法は、特定の種の遺伝子給源が制約されているため制限があり、またこの理由によって、単一の種が全スペクトルの着色品種をもっていることはまれである。例えばバラ、キク、カーネーション、ユリ、チューリップおよびガーベラのような主な切花の種のブルー色の品種が開発されれば、切花と観賞花卉の両方の市場に大きな機会を提供するであろう。
花および植物の他の部分の色は、主として2種の色素:フラボノイド類およびカロテノイド類に基づいている。フラボノイド類は最も普通でかつ最も重要な花の色素である。花色に関連する最も重要なクラスのフラボノイド類はアントシアニン類、フラボノール類およびフラボン類である。アントシアニン類は、シアニジン、デルフィニジン、ペチュニジン、ペオニジン、マルビジンおよびペラルゴニジンのグリコシル化誘導体であり、液胞内に局在している。
花色に対する一つの重要な因子は、タンニン類およびある種のフラボンとフラボノールのグリコシドと、アントシニアニン類とのコピグメント化である(Scott-Moncrieff 1936年)。ある範囲のpH値にわたって比較すると、コピグメント化したアントシアニン類は、通常の色素より青味が多いことが常にみとめられる。またアントシアニン類とフラボノールグリコシド類のコピグメント化は果物の色の発生に重要な場合がある(Yoshitamaら1992年)。アントシアニン:コピグメントのモル比も色に強い影響を与えることがある。フラボノールのアグリコン類が花粉の発育と花粉管の発育にとって不可欠であるということが最近実証されている(Moら1992年)。したがってフラボノール類のようなコピグメントの植物内での産生を制御する性能は、花色を変化させたり植物の稔性を操作するのに有用な用途になるであろう。
アントシアニン色素類の生合成経路は充分に確立されている(Ebe1およびHah1brock 1988年;Hah1brockおよびGrisebach 1979年;Wieringおよびde Vlaming 1984;Schramら1984年;Stafford 1990年)。この経路で最初に行われるステップには、3分子のマロニル−CoAと1分子のρ−クマロイル−CoAの縮合反応が含まれている。この反応は酵素のカルコンシンターゼによって触媒される。この反応の生成物である2′,4,4,6−テスラヒドロキシカルコンは通常、酵素のカルコンフラバノンイソメラーゼによって急速に異性化されてナリンゲニンを生成する。ナリンゲニンは次いでフラバノン3−ヒドロキシラーゼによって中央リングの3位がヒドロキシル化されてジヒヒドロケンフェロール(DHK)を産生する。ジヒドロケンフェロールのβリングは、3′位または3′位と5′位の両者をそれぞれヒドロキシル化されてジヒドロケルセチン(DHQ)およびジヒドロミリセチン(DHM)を生成することができる。DHK,DHQおよびDHMは、少なくとも2種の酵素(ジヒドロフラボノール−4−レダクターゼおよびフラボノイド−3−グルコシルトランスフェラーゼ)の作用によって、有色アントシアニン類(ペラルゴニジン−3−グルコシド、シアニジン−3−グルコシドおよびデルフィニジン−3−グルコシド)に変換することができる。
ケンフェロール(K)、ケルセチン(Q)およびミリセチン(M)のようなフラボノール類は、図1に示すように、ジヒドロフラボノール類のC−2とC−3の間に二重結合を導入することによって製造することができる(Forkmann 1991年)。フラボノール類はグリコシル化された形態で蓄積することが多くまたメチル化されることがある。メチル化反応はグリコシル化反応の前後で行うことができる。ジヒドロフラボノール類はフラボノール類への試験管内での変換は、パセリの細胞培養物由来の酵素製剤中に初めて観察された(Britschら1981年)。またフラボノールシンターゼ活性は、マチオラ(Matthiora)属の植物(SpribilleおよびForkmann 1984年)、ペチュニア(Petunia)属の植物(Forkmannら1986年)およびダイアンサス(Dianthus)属の植物(Forkmann 1991年)由来の花の抽出物中に検出されている。フラボノールシンターゼの酵素活性は、2−オキソグルタレート、アスコルベートおよび第一鉄イオンが補因子として必要である。ペチュニア・ハイブリダ(Petunia hybrida)の花では遺伝子座Flがフラボノール類の生成を制御している。すなわちフラボノールの合成は、この遺伝子に対してホモの劣性な変異体では大きく減少する(Wieringら1979年;Forkmannら1986年)。ペチュニア由来のフラボノールシンターゼによる試験管内酵素検定の結果は、DHKとDHQはそれぞれのフラボノールに容易に変換したがDHMは変換しにくい基質であった。顕花植物中のフラボノールシンターゼ活性を制御する性能は、フラボノールの産生を変化させて、単一の種がより広範囲の花色を発現できるようにすることによって、花弁の色を操作する手段を提供するであろう。先に述べたように、フラボノールの産生を制御する性能は、雄性稔性(male ferlitity)にも関連がある。このような制御は固有酵素(indigenous enzyme)の産生レベルを調節するかまたは非固有酵素を導入することによって行うことができる。
本願で“固有”酵素という用語を用いる場合、特定の細胞にとって固有であるか(native)または特定の細胞内で自然に発現される酵素を意味する。“非固有”酵素(“non-indigenous” enzyme)は細胞にとって固有でない酵素であるが植物の植物内に例えば導入遺伝子によって遺伝物質を導入することによって発現される酵素を意味する。“内因性”酵素(“endogenous” enzyme)は、細胞によって産生される酵素であるか、その細胞に対して固有であるがもしくは固有でない酵素である。
本発明によって、フラボノールシンターゼ(以後“FLS”と呼ぶ)をコードする遺伝子配列が同定され、いくつかの起源からクローン化され、そして形質転換植物を生成させるのに使用された。またこれらの組換え配列はフラボノール産生のレベルを調節することが可能で、その結果花弁の色と雄性稔性を操作する手段を提供する。またこれらの組換え配列は、DHKの代謝ならびにDHQおよびDHMのような他の基質の代謝を調節することができる。DHK,DHQおよびDHMは着色アントシアニン類の前駆物質であるから、FLSの配列の発現によってこれら前駆物質の濃度を調節することは花色を操作する他の手段になる。
したがって、本発明の一つの態様は、植物のFLS、または前記FLSの機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体をコードするヌクレオチドの配列;または植物のFLS、またはそのFLSの機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体をコードする配列に相補的なヌクレオチド配列を含んでなる単離された核酸分子を提供する。“FLS”という用語には、FLS活性を有するポリペプチド類とタンパク質類、ならびにこのようなポリペプチド類とタンパク質類の変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体または類似体でFLS活性を有するものが含まれる。またFLS活性を有する分子は、FLS活性を有するポリペプチドもしくはタンパク質と外来性のペプチド、ポリペプチドもしくはタンパク質との融合ポリペプチドもしくは融合タンパク質でもよい。
“単離された核酸分子”という用語は、本願で用いる場合、自然には存在しない状態の遺伝子配列を含むことを意味する。一般に、この用語はその自然の状態からかけはなれているか、またはその自然環境では必ずしも遭遇しない方法で形成されていることを意味する。さらに具体的に述べると、この用語には、ゲノムDNAのフラグメント、組換えもしくは合成の分子、および本発明の遺伝子配列と融合されたかまた作動可能に連結された非相同の核酸ような非同相同核酸と組合わせた核酸を含めて、試験管内で形成されるかまたは維持される核酸分子が含まれる。
また“単離された核酸分子”という用語には、FLSまたはFLSの機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体を、そのプロモーターもしくは他のプロモーターに対して逆の配向でコードするゲノムDNAもしくはゲノムcDNAまたはその一部分を含む。またこの用語にはさらに、他の核酸配列に対して少なくとも部分的に精製された天然に存在する配列が含まれる。本願で用いられる“単離された核酸分子”という用語には、“核酸単離物”(“nucleic acid isolate”)と同じ意味を有すると解される。
“遺伝子配列”という用語は、本願では最も一般的な意味で用いられ、FLS活性を有するポリペプチドまたはタンパク質を含むFLS分子を含んでいるアミノ酸の配列を、直接にまたは塩基の相補鎖によって指定するヌクレオチド塩基のつながりを含んでいる。アミノ酸のこのような配列は、例えば配列番号:1もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5に示すような全長のFLS、またはその末端を切り取った活性の形態、またはその機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体を構成している。あるいはこのアミノ酸配列は、例えばこれらの配列の一部、または配列番号:2もしくは配列番号:3に示す配列のすべてもしくは一部を含んでいてもよい。
本発明の他の態様は、
(i)FLSをコードし、および
(ii)配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示すヌクレオチド配列に対するヌクレオチド配列類似性が少なくとも50%である、
ヌクレオチドの配列を含んでなる単離された核酸分子を提供するものである。
さらに詳しくは本発明は、
(i)FLSをコードし、および
(ii)配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示すヌクレオチド配列に対するヌクレオチド配列類似性が少なくとも65〜75%である、
ヌクレオチドの配列を含んでなる単離されたDNA分子に関する。
好ましい類似性のパーセント値としては80%,85%,90%,92〜95%,96〜98%および99〜100%がある。上記の類似性のパーセント値は、配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示す配列と、他の遺伝子配列を全体にわたって比較することを想定しているが、比較される分子のなかの特定の領域の類似性が50%より低いことがあることは明らかである。この点について、本発明はさらに、
(i)FLSをコードし、および
(ii)配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示す配列の一つ以上の領域に対するヌクレオチド配列類似性が少なくとも50〜75%である、
ヌクレオチドの配列を含んでなる核配分子および特にDNA分子として定義される。
また本発明において目的とする核酸配列には、遺伝子プローブとしてまたは植物内で対応する遺伝子の発現を調節できる“アンチセンス”分子として有用なオリゴヌクレオチドが含まれる。また本発明で用いられる“アンチセンス分子”には、構造のゲノム遺伝子もしくはcDNA遺伝子またはその一部分を、それのプロモーターもしくは他のプロモーターに対して逆の配向で含んでなる遺伝子構築物が含まれる。
本発明のこの態様によって、配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示すヌクレオチド配列を有する分子の一部もしくは領域に実質的に類似しているかまたは相補的な5〜50個のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドが提供される。上記文言中の“実質的に類似しているかまたは相補的な”という用語は、以下に定義するように、低いストリンジェンシー条件下、あるいは好ましくは中位のストリンジェンシー条件下、あるいは最も好ましくは高いストリンジェンシー条件下でハイブリッドを形成しうる類似性を有することを意味する。このようなオリゴヌクレオチドは、例えばFLSの遺伝子の配列を各種の起源から選別する場合とか、または形質転換植物に導入された遺伝子配列を監視するのに有用である。またかようなオリゴヌクレオチドは一般にプライマーもしくはプローブの形態である。好ましくは本発明のオリゴヌクレオチドはFLSの保存遺伝子配列、または植物の属、植物の種および1または植物の系統もしくは変種内に保存された配列に関する。
本発明の一つの態様では、オリゴヌクレオチドはFLS遺伝子配列の5′末端もしくは3′末端に相当する。便宜上、本発明では、5′末端は構造遺伝子の開始コドンと該遺伝子の中央部分の間の領域を実質的に形成しているとみなし、3′末端は構造遺伝子の中央部分と該遺伝子の終止コドンの間の領域を実質的に形成しているとみなす。それ故、オリゴヌクレオチドは、5′末端もしくは3′末端、または5′末端と3′末端の両者に共通の領域とハイブリッドを形成できることは明らかである。本発明にはこのようなオリゴヌクレオチドがすべて含まれる。
本発明の一つの実施態様において、FLSをコードする核酸配列またはその機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体は、例えばコサプレッション(米国特許第5,034,323号)を用いることによって、固有FLS活性を低下させるのに使用できる。あるいは、この酵素をコードする核酸配列またはその機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体は、固有FLS活性を低下させるためアンチセンス配向で用いられる。本発明は一つの理論で限定したくないが、アンチセンスFLS転写物またはそのフラグメントもしくは一部分(例えばオリゴヌクレオチド分子)は、上記酵素に対して指定された自然に存在するmRNAのすべてもしくは一部分と二重らせんを形成して、活性酵素の蓄積またはmRNAから活性酵素への翻訳を妨害する。
他の変形では、標的の核酸配列を不活性化するのにリボザイム類を使用できる。リボザイム類についてはHaseloffおよびGerlach(1988年)の文献に充分に報告されている。この実施態様では、そのリボザイムは好ましくはハイブリッド形成部分と触媒部分を含んでなり、そのハイブリッド形成部分は、配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示すのと実質的に同じヌクレオチド配列を有する遺伝子由来のmRNA転写物とハイブリッドを形成できる一つの好ましくは二つのヌクレオチドアームをもっている。
別の実施態様では、FLSをコードする核酸配列またはその機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体もしくは類似体は、固有FLS活性を通常の内因的もしくは既存のレベルより上方に上昇させるため、または活性の通常の内因的もしくは既存のレベルが無視しうるレベルかもしくはゼロの場合にFLS活性を与えるために用いられる。
本発明においてFLSの活性の変更とは、活性の通常の内因的もしくは既存のレベルの上下に、活性を、30%以上、もしくは好ましくは30〜50%、もしくはさらに好ましくは50〜75%、もしくはさらに一層好ましくは75%以上増減させることを意味する。このような増減をFLS酵素活性の“調節”と呼称する。
一般に調節は、FLS遺伝子配列の転写もしくは翻訳のレベルについて行われる。活性のレベルはForkmannら(1986年)の文献に記載の方法の改変法を用いて検定することができる。
本発明の核酸は、リボ核酸類もしくはデオキシリボ核酸類、一本鎖もしくは共有結合で閉環された環状分子でもよい。
本発明の核酸分子としては、cDNAであるかまたはcDNAを起源とする核酸分子が好ましい。また本発明には、本願に開示されている遺伝子配列とハイブリッドを形成する他の核酸分子も含まれる。
本発明のこの態様によって、
(i)FLSをコードし、および
(ii)低ストリンジェンシー条件下で、配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示すヌクレオチド配列、またはそのそれぞれの相補形とハイブリッドを形成する。
ヌクレオチドの配列を含んでなる単離された核酸分子が提供される。
ストリンジェンシーのレベルを定義するため、便宜上、Maniatisら(1982年)の文献の387〜389頁および特にパラグラフ11を引用することができる。なおこの文献の部分は本願に援用するものである。本願では、低ストリンジェンシーを4〜6×SSC/1%(w/v)SDS中、37〜45℃で2〜3時間と定義する。ハイブリッド形成に関与する核酸の起源と濃度によって、他のストリンジェンシー条件例えば本願で1〜4×SSC/0.5〜1%(w/v)SDS中、45℃以上で2〜3時間とする中位のストリンジェンシー条件、または本願で0.1〜1×SSC/0.1〜1.0%(w/v)SDS中60℃以上で1〜3時間とする高ストリンジェンシー条件を利用することができる。
本発明には、その最も好ましい実施態様として、配列番号:1もしくは配列番号:2もしくは配列番号:3もしくは配列番号:4もしくは配列番号:5の少なくとも一つに示すヌクレオチド配列をもっているかまたは含んでなる核酸分子、または上記の配列にそれぞれ示すヌクレオチドもしくはアミノ酸の配列の少なくとも一つ以上の領域に対し、ヌクレオチドもしくはアミノ酸の配列のレベルで類似性が少なくとも50%、より好ましくは少なくとも55%、さらに好ましくは少なくとも60%、さらに一層好ましくは少なくとも65〜70%、およびさらにより一層好ましくは85%を超える核酸分子であって;その核酸がFLSの活性を有する酵素をコードするかまたは該酵素をコードする配列に対して相補的である核酸分子が含まれる。しかしヌクレオチドもしくはアミノ酸の配列は上記パーセント値より低いかもしくは高い類似性を有ししかもFLS様分子をコードすることがあることに注目すべきであり、そしてこのような分子は、配列保存の領域をもっている場合、本発明の範囲内に含まれるとみなすものである。
本発明で目的とする核酸分子は、いずれかの配向で単独で、またはベクター分子好ましくは発現ベクターと組合わせて存在していてもよい。“ベクター分子”という用語は、最も広い意味で用いられ、核酸を植物細胞内へ転移し易くすることができおよび/または植物ゲノムに組込み易くすることができる。核酸分子に対する中間伝達体が含まれている。中間伝達体は、例えばエレクトロポレーション、マイクロプロジェクタイルボンバードメント、アグロバクテリウム(Agrobacterium)による転移またはDNAウイルスもしくはRNAウイルスによる挿入に用いるよう構成されている。本発明に含まれる中間伝達体および/または核酸分子は植物ゲノム中に安定に組込む必要がある場合とない場合がある。またかようなベクター分子は原核細胞中で複製および/または発現することができる。そのベクター分子またはその一部は植物のゲノムに組込むことができるものが好ましい。また本発明の核酸分子はさらに、植物細胞内で核酸分子の発現を指令することができるプロモーターの配列をもっている。また核酸分子とプロモーターは、先に述べたようないくつもの手段によって細胞内に導入することができる。またこのベクター分子は、FLS mRNAの転写物を切断できると先に定義したリボザイムをコードする遺伝子配列を含有していてもよい。
本発明の核酸またはその相補形は全長の酵素またはその誘導体をコードする。“誘導体”という用語は、天然に存在する酵素に対して単一もしくは複数のアミノ酸を置換、欠失および/または付加ししかもFLS活性を有する酵素を意味する。この点について、本発明の核酸には、FLSをコードし天然に存在するヌクレオチド配列が含まれ、または前記の天然に存在する配列に対して置換、欠失および/または付加がなされた単一もしくは複数のヌクレオチドを含んでいてもよい。また本発明の核酸配列またはその相補形は、活性もしくは不活性にかかわらずFLSの“一部分”をコードし、このような核酸分子は、オリゴヌクレオチドのプローブ、ポリメラーゼ連鎖反応もしくは各種の突然変異原性法のプライマーとして有用であり、または対応する遺伝子の植物内での発現を調節できるアンチセンス分子もしくはリボザイム分子の生成のために有用である。
本発明のFLSのアミノ酸挿入誘導体には、アミノ末端および/またはカルボキシル末端の融合体、ならびに単一もしくは複数のアミノ酸を配列内に挿入したものが含まれる。挿入アミノ酸配列変異体は、1個以上のアミノ酸残基がタンパク質の予め決められた部位に挿入されている変異体であるが、ランダム挿入も、得られる生成物を適切に選別することによって可能である。欠失変異体は、配列から1個以上のアミノ酸を除去されていることを特徴とする変異体である。置換アミノ酸変異体は配列中の少なくとも一つの残基が除かれ、その位置に異なる残基が挿入された変異体である。代表的な置換は後記の表1にしたがって行われる置換である。
FLSがアミノ酸の置換によって誘導体化される場合、そのアミノ酸は一般に、例えば疎水性、親水性、電気陰性度、かさ高な側鎖などのような類似の特性を有する他のアミノ酸で置換される。アミノ酸の置換は一般に単一の残基の置換である。アミノ酸の挿入は通常、約1〜10個のオーダーのアミノ酸残基の挿入であり、そして欠失は約1〜20個の残基の範囲内で行われる。欠失もしくは挿入は、隣接する対すなわち2個の残基の欠失または2個の残基の挿入で行うことが好ましい。
上記のアミノ酸変異体は、当該技術分野で公知のペプチド合成法、例えば固相ペプチド合成法(Merrifield, 1964年)などを用い、または組換えDNA操作法によって容易に製造することができる。公知の配列または部分的に公知の配列を有するDNAの予め決められた部位に置換突然変異を行う方法は公知であり、例えばM13突然変異誘発法がある。置換、挿入もしくは欠失の変異体として発現する変異体タンパク質を製造するためのDNA配列の操作法は、例えばSambrookら(1989年)の文献に便利に記載されている。
本発明のFLS酵素の組換えもしくは合成の変異体および誘導体の他の例としては、炭水化物類、脂質類および/またはタンパク質類もしくはポリペプチド類のような、FLS酵素に関連する分子の単一もしくは複数の置換、欠失および/または付加を行ったものが含まれる。
また“類似体”および“誘導体”という用語には、FLSの化学的機能の均等物および上記のアミノ酸誘導体が含まれる。便宜上、本願において特に以後“FLS”に言及するときは、FLSの機能的変異体、誘導体、一部分、フラグメント、相同体または類似体が含まれる。
本発明は、ペチュニア、タバコ、カーネーションおよびキク由来の核酸配列を使用して例示する。というのはこれらのものは、現在までのところ最も便利で好ましい材料源だからである。しかし、当該技術分野の当業者であれば、類似の配列は、他の植物のようないくつもの起源から単離することができるということは直ちに分かるであろう。FLSを直接もしくは間接的にコードするこのような核酸配列はすべて、その起源にかかわらず本発明に含まれる。FLS酵素をコードする遺伝子の他の適切な起源の例としては、限定されないが、バラ、キンギョソウ、リシアンサス(lisianthus)、シクラメン、ブドウおよびパセリがある。
本発明によれば、FLSをコードする核酸配列は、いずれかの配向が形質転換植物に導入され次いで発現されて、DHKおよび/または他の適切な基質が植物細胞内で合成されている場合はこれら基質を最終的にフラボノール類もしくはその誘導体に変換するか、または代わりに内因性もしくは既存のFLS活性を減少させるかもしくは除去することによって代謝物のかような変換を阻害する手段を提供する。これらのフラボノール類が産生されると、花弁の色が改変され、アトシアニン類とのコピグメント化によって一層青味の強い色の生成に寄与する。植物内での本発明の核酸配列の発現は構成的、誘導的または発育的でありまた組織特異的でもある。“発現”という用語はその最も広い意味で用いられ、RNAの産生またはRNAとタンパク質の両者の産生が含まれる。またこの用語には核酸分子の部分発現も含まれる。
本発明のこの態様によれば、前記核酸配列を最終的に発現できるようにする条件下で、前記FLSをコードするヌクレオチドの配列を含んでなる核酸配列で適切な植物の細胞を安定に形質転換し、その細胞から形質転換植物を再生させ、次いで該核酸配列を発現できるようにする充分な期間と条件下で前記形質転換植物を成長させることを含んでなる、FLSを合成できる形質転換顕花植物の製造方法が提供される。その結果、この形質転換植物は、同等の非形質転換植物で発現される量に比べて高いレベルで外来のFLSを産生することができる。
本発明の他の態様では、FLS活性をコードするヌクレオチドの配列、またはFLS活性をコードする配列に相補的なヌクレオチドの配列を含んでなる核酸分子で、適切な植物の細胞を安定に形質転換し、その細胞から形質転換植物を再生させ、次いで必要な場合に前記形質転換植物を、核酸配列を発現できるようにする充分な条件下で成長させることを含んでなる、固有のもしくは既存のFLS活性を低下させた形質転換植物の製造方法が提供される。
本発明のさらに他の態様では、植物細胞に導入されて適切に変えられたFl遺伝子もしくはその誘導体もしくは一部分からの相同的組換えによって固有配列を修飾することによってFl遺伝子を変化させ、次いでその遺伝子を修飾された植物を該細胞から再生させることを含んでなる、固有のもしくは既存のFLS活性を低下させた、遺伝子を修飾された植物の製造方法が提供される。
好ましい実施態様で、本発明は、本発明の核酸配列で適切な植物の細胞を安定に形質転換し、その細胞から形質転換植物を再生し、次いで前記形質転換植物を、核酸配列がFLSを発現できるようにする充分な期間と条件下で成長させることを含んでなる、変化した花序特性を示す形質転換顕花植物の製造方法を提供するものである。あるいは、前記方法は、本発明の核酸配列またはその相補配列で適切な植物の細胞を安定に形質転換し、その細胞から形質転換植物を再生させ、次いで前記形質転換植物を、固有もしくは既存のFLSの活性のレベルを変えるのに充分な期間と条件下で成長させることを含んでなる方法である。変えられるレベルは、同等の非形質転換植物におけるFLS活性の固有もしくは既存のレベルより低いことが好ましい。本発明を限定したくないが、作用機構の理論は、固有FLSの活性を減少させるには、導入された核酸配列またはその相補配列を発現させる必要があるということである。しかし、所望の作用すなわち変化した花序特性を示す顕花植物を得るのに導入された遺伝子配列またはその相補配列を発現させる必要はない。
関連する実施態様で、本発明は、植物細胞に導入されて適切に変えられたFl遺伝子またはその誘導体もしくは一部分からの相同的組換えによって固有配列を修飾することによってFl遺伝子を変化させ、次いでその細胞から遺伝子を修飾された植物を再生させることを含んでなる、変化した花序特性を示す顕花植物を製造する方法を提供するものである。
好ましくは、その変化した花序には、受容体植物の遺伝子型および生理的状態によって、白、イエロー、ピンク、バイオレットまたはブルーの花の産生が含まれる。
したがって、本発明には、FLSをコードする組換え遺伝子を発現することができる形質転換植物、またはFLSの調節を行う必要がある場合任意に転写可能なmRNA分子のすべてもしくは一部分に実質的に相補的な核酸配列を有する形質転換植物の製造方法であって;FLSをコードするヌクレオチドの配列またはFLSをコードする配列に相補的なヌクレオチドの配列を含んでなる単離された核酸分子で、必要な場合、前記単離された核酸分子が最終的に発現できるようにする条件下にて、適切な植物の細胞を安定に形質転換し、次いでその細胞から形質転換植物を再生させることを含んでなる方法が含まれる。“適切な植物”という用語は、DHKなどのFLSの基質を産生することができ、かつ所望の色を発生するのに必要な適正な生理学的特性を有する植物を意味する。
FLS遺伝子配列を導入されたペチュニアおよびタバコの形質転換植物を生成させることによって本発明を例示する。ペチュニアおよびタバコの植物を用いることは、遺伝子配列を有する形質転換植物を生成させるのに特に便利で有用なモデルであり、このような形質転換植物から得られる結果は、一般に他の植物に適用できる。当該技術分野の当業者は、標的植物中に天然に存在する酵素の発現を増減させるような、本発明の方法に適用できる変種に直ちに気付くであろう。この方法によれば異なる色相の色が得られるであろう。ペチュニアおよびタバコに加えて、他の適切な標的植物としては、限定はないがバラ、カーネーション、キク、ガーベラ、リシアンサス、ユリ、アヤメおよびテンジクアオイがある。
したがって、本発明には、本発明の核酸配列のすべてまたは一部を含有するすべての形質転換植物、またはそのアンチセンス形および/またはその相同体もしくは類縁形および特に変化した花序特性を示す形質転換植物が含まれる。これらの形質転換植物は、FLSをコードするヌクレオチド配列またはFLSをコードする配列に相補的なヌクレオチド配列を含んでなる導入核酸分子を含有している。一般にこの核酸は植物のゲノムに安定に導入されるが、本発明には、植物細胞内で複製できるDNAウイルスもしくはRNAウイルスのような自己複製核酸配列内にFLSヌクレオチド配列を導入することも含まれる。また本発明にはこのような形質転換植物由来の種子も含まれる。このような種子は、特に着色している場合、植物の特性タグとしてとりわけ有用である。さらに本発明には果実、野菜植物、および例えば観賞植物の葉が含まれる。
本発明の他の態様はFLSの組換え産物に関する。この酵素類の組換え産物は、例えば活性が一層大きい酵素を開発するための研究に用いる材料源を提供し、かつフラボノール類および/または着色化合物を産生する試験管内の系を開発するのに有用である。
本発明のさらに別の態様では、植物内で、FLSを発現できるかまたは固有FLS酵素のダウレギュレーションを行うことができる遺伝子構築物を製造する場合の本願に記載の遺伝子配列の用途に関する。
本発明の他の態様は、プラスミドの形態で染色体外に、FLSをコードする遺伝子配列を保有する原核生物もしくは真核生物に関する。一つの実施態様では、そのプラスミドは、大腸菌(Escherichia coli)中に存在するpCGP481である。プラスミドpCGP481を含有する大腸菌の菌株DH5αは、オーストラリア、2037、ニューサウスウェールズ、ピンブル、スアキンストリート1に所在のthe Australian Government Analytical Laboratoriesに、1993年8月5日付けで受託番号N93/33236号で寄託した。
本発明を以下の図面と実施例を参照して説明するが本発明を限定するものではない。
実施例を含めて本明細書を通じて用いられるアミノ酸の略語を以下の表2に示す。
本願で引用する遺伝子配列に割当てた配列番号をまとめて表3に示す。
図面のうち、
図1はペチュニア、ハイブリダ内でのジヒドロフラボノール類のフラボノール類への変換を示す概略図である。この経路の各ステップに関与する酵素は次のとおりである。F3′H=フラボノイド3′−ヒドロキシラーゼ;F3′5′H=フラボノイド3′,5′−ヒドロキシラーゼ;FLS=フラボノールシンターゼ;DHK=ジヒドロケンフェロール;DHQ=ジヒドケルセチン;DHM=ジヒドロミリセチン;K=ケンフェロール;Q=ケルセチン;M=ミリセチン
図2は32pで標識を付けたpDIOXC3 cDNA挿入断片でプローブしたRNAゲルブロットのオートラジオグラフである。各レーンは以下のものから単離した全RNA20μgを含有している。1〜5:五つの発育段階のOGBの花のリムの組織;T:発育段階3〜4のOGBの花のチューブ組織;L:OGBの6週齢実生由来の葉の組織。
図3はpCGP481のcDNA挿入断片の完全ヌクレオチド配列を得るために用いた配列決定法を示す。矢印は個々の配列決定反応から読取られる配列の方向と長さを示す。注文製品のオリゴヌクレオチドプライマー(オリゴ7〜9;配列番号:12〜14)を用いる配列決定反応を示す。
図4はpCGP631の構築を示す概略図である。pCGP631は、発現ベクターpYGA22m内の酵母グリセルアルデヒド3リン酸デヒドロゲナーゼのプロモーターの後にセンス配向でpCGP481 cDNA挿入断片をクローン化して構築した。pCGP481由来のcDNA挿入断片を、EcoRI/XhoIフラグメントとして、pYGA22mをEcoRI/SalIで消化して得られた大きいフラグメントと連結した。
IR=2μmプラスミドの逆方向反復配列、TRP1=TRP1遺伝子、Ap=アンピシリン耐性マーカー。
図5は、DHQを基質として用いる、酵母の抽出物のFLS検定結果を示す。このオートラジオグラスはプラスミドpCGP631で形質転換された酵母の酵素抽出物による〔14C〕-DHQのケルセチンへの変換を示す。未形質転換の酵母に、FLS活性は全く検出されなかった。C=酵母エキスなしの未標識ケルセチン、未標識ケルセチンの泳動位置は丸く囲んである。
実施例1−材料
酵素類
酵素はすべて商業的起源から入手し、そのメーカーの推奨にしたがって使用した。
細菌の菌株
下記の大腸菌の菌株を使用した。
PLK-F′およびSURE、両者ともにStratagene社から入手した;XL1-Blue(Bullockら1987年)およびDH5α(Hanahan 1983年およびBRL 1986年)。使用したアグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)の菌株は無毒化されたAGLO(lazoら1991年)であった。
植物の材料
使用したペチュニア・ハイブリダの品種を下記表4に示す。
ダイアンサス・カリオフィルスcvラグナ(Dianthus caryophyllus cv. Laguna)の花は、ビクトリア州所在のVan Wyk and Son Flower Supply社から入手した。
クリサンセマム・モリホリウム(Chrysanthemum morifolium)の品種は、ビクトリア州所在のBaguley Flower and Plant Growers社から入手した。
実施例2−植物の発育条件と発育段階
植物の発芽
ペチュニア・ハイブリダ植物は、日長14時間、光の強さ10,000ルックスおよび温度22〜26℃で特別の発育室にて発育された。OGBの花を下記定義の発育段階で収穫した。
段階1:着色していない閉じたつぼみ(長さ:<25mm)。
段階2:着色した閉じたつぼみ(長さ:25〜35mm)。
段階3:花冠が現われた暗パープル色のつぼみ(長さ:>35mm)。
段階4:開葯前の暗パープル色の開いた花(長さ:>50mm)。
段階5:すべての葯が開きかつ充分に開いた花。
他の品種のペチュニアの花は、開葯する前、色素の蓄積が最も多い段階に収穫した。
ダイアンサス・カリオフィルスの花の発育段階は以下のように定義した。
段階1:目視可能な花芽なし。
段階2:花芽が開きつつある:小花の先端が目視可能。
段階3:ほとんどすべての小花の先端が暴露されている。外側の小花が開きつつあるがどれも水平ではない。
段階4:外側小花が水平。
クリサンセマム属の花の発育の段階は以下のように定義した。
段階0:目視可能な花芽なし。
段階1:花芽が目視可能。小花はほうによって完全に覆われている。
段階2:花芽が開きつつある。小花の先端が目視可能。
段階3:小花がしっかりと重なっている。
段階4:ほとんどすべての小花の先端が暴露されている。外側の小花が開きつつあるがどれも水平ではない。
段階5:外側の小花が水平。
段階6:花が成熟に近づいている。
実施例3
オリゴヌクレオチドの合成
オリゴヌクレオチドは、Applied Biosystems PCR-Mate DNA合成機を用い、そのメーカーが推奨する方法を利用して合成した。合成したオリゴヌクレオチドは5′−3:
である。2個のヌクレオチドが括弧内に示されている場合は、そのいずれか一方を選択することを示す。“I”という略語はデオキシイノシンを表す。
実施例4−ペチュニア由来のジオキシゲナーゼのクローン化
ペチュニアcDNAライブラリーの構築
TurpenおよびGriffith(1986年)の文献に記載の方法を用いて、ペチュニア・ハイブリダcv OGBの段階3〜4の花の花弁の組織から全RNAを単離した。オリゴ−dTセルロースクロマトグラフィー(AvivおよびLeder 1972年)を3サイクル行い、全RNAからポリ(A)+RNAを選択した。
1×Superscript(登録商標)反応緩衝液、10mMジチオスレイトール、500μM dATP、500μM dGTP、500μM dTTP、500μM5−メチル−dCTP、0.75μgオリゴ1(配列番号:6)および2μL Superscript(登録商標)逆転写酵素(BRL社)を含有する20μLの容積内でポリ(A)+RNA 2μgを逆転写させた。その反応混合物を37℃で50分間次いで44℃で10分間インキュベートし、続いて氷上に置いた。
上記の第一のストランド反応混合物に第二のストランド反応混合物(140μL)を添加した。第二のストランド反応混合物は、21mMトリス−HCl、104mM KCl、5.3M MgCl2、171μM β-NAD、11.4mM(NH4)2SO4、214μM dATP、642μM dCTP、214mM dGTP、214μM dTTP、4mM DTT、10μCi32P-dCTP(3000Ci/mmole)、15単位の大腸菌DNAリガーゼ、40単位の大腸菌DNAポリメラーゼI Boehringer社)および0.8単位RNアーゼHで構成されていた。最終混合物を16℃にて150分間インキュベートした。二本鎖cDNAを平滑末端にするため、単位のT4 DNAポリメラーゼを添加し、反応をさらに15分間16℃で続けた。反応を停止させ、次いでcDNAを、フェノール/クロロホルムで抽出し次にクロロホルムで抽出し次いでタノールで沈澱させることによって精製した。
得られたcDNAにEcoRIアダプター(Promega社)を連結し、次にメーカーが推奨する条件を用いてポリヌクレオチドキナーゼ(Amersham社)でキナーゼ処理を行った。酵素を熱によって変性させ(70℃で20分間加熱)、次いでDNAをフェノール/クロロホルムによる抽出およびエタノールによる沈澱で精製した。cDNAを、メーカーが推奨する条件を使用し、100μLの反応容積中、50単位のXhoI(Boehringer社)で消化した。酵素を熱(70℃で20分間加熱)で失活させ、次いで上記cDNA消化物を、STE緩衝液(Sambrookら1989年)中で予め平衡化させたSephacryl S400スパンカラム(Pharmacia社)を通過させた。得られた溶出液をフェノール/クロロホルムで抽出し、エタノールで沈澱させた。4℃にて30分間微量遠心分離にかけた後、得られたcDNAペレットを70%(v/v)エタノールですすぎ、風乾し、次いで10μLのTE緩衝液(10mMトリス−HCl、1mM EDTA pH7.5)に再懸濁させた。
上記cDNA懸濁液の1/4(2.5μL)を、50mMトリス−HCl(pH7.0)、10mM MgCl2、10mMジチオスレイトール、1mM ATPおよび2単位のT4 DNAリガーゼからなる反応緩衝液5μL中で、λZAPI EcoRI/Xho I/CIAPで処理したベクター(Stratagene社)1μgと連結した。その反応混合物を4℃で4日間インキュベートした。
室温で2時間インキュベートした後、連結反応混合物をPackagene system(Promega社)を用いてパッケージした。組換え体の総数は1×106個であった。大腸菌PLK-F′細胞にトランスフェクトした後、パッケージされたcDNAの1×106プラーク形成単位(pfu)を15cm直径プレートに1枚当り50,000pfuでプレートした。これらのプレートを37℃で8時間インキュベートし、次いで4℃にて一夜貯蔵した。ファージを、プレートからファージ貯蔵緩衝液(8mM MgSO4、100mM NaCl、0.01%(w/v)ゼラチン、50mMトリス−HCl pH8.0)中に溶出させて増幅cDNAライブラリーストックを形成させた。
ジオキシゲナーゼオリゴヌクレオチドプライマーの設計
植物(Matsudaら1991年;Martinら1991年)、真菌および細菌(Cohenら1990年)のごとき多様な生物由来のいくつものジオキシゲナーゼ類の配列が決定されている。これらのすべての酵素の特徴は、配列が保存された小さな領域がいくつも存在していることである。いくつもの異なる植物ジオキシゲナーゼのアミノ酸配列を、HigginsとSharp(1988年)の文献に記載されているCLUSTALプログラムを用いて一列に並べた。使用した配列は、Candi(Martinら1991年)、ヒヨスチアミン6β−ヒドロキシラーゼ(H6H)(Matsmaら1991年)、フラバノン3−ヒドロキシラーゼ(F3H)、E8(DeikmanおよびFisher1988年)、A2(Menssenら1990年)およびTom13(Holdsworthら1987年)であった。この分析によって2個の良好に保存された領域が見出された。その領域を表5に示す。
オリゴヌクレオチドは共通配列に類似の配列をコードする遺伝子とハイブリッドを形成するよう設計した。これらの各オリゴヌクレオチドの配列は、オリゴ2〜6(配列番号:7〜11)と呼称し先に示してある。デオキシイノシン(I)を含有させて、二つ以上のコドンが同じアミノ酸をコードする場合のコドン使用についての異なる可能性をカバーした。デオキシイノシンは、類似の効率で、A,T,GおよびCと塩基対を形成する(Martinら1985年;Ohtsukaら1985年)。
ペチュニアのジオキシゲナーゼ遺伝子のフラグメントのPCRによる増幅
Ba20(flfl)およびV26(FlFl)の段階3〜4の花から全RNAを単離した。25μgの全RNAをエタノールで沈澱させ、ペレット化し次いで10.5μLの水に再懸濁させた。1μL(0.5μg)のオリゴ1(配列番号:6)を添加し、得られた混合物を70℃で10分間加熱し次いで氷上に置いた。次に、4μL Superscript反応緩衝液(5×ストック)、2μLの100mMジチオスレイトール、0.5μLの5mM dATP、0.5μLの5mM dCTP、0.5μLの5mM dGTP、0.5μLの5mM dTTPおよび0.5μLの〔α−32P〕−dCTPを添加した。得られた混合物を37℃で2分間インキュベートした。1μL(200単位)のSuperscript逆転写酵素を添加し、反応混合物を37℃で60分間インキュベートし、次いで80μLのSTEを添加して反応を終止させた。得られたcDNAをSephacryl S200スパンカラムクロマトグラフィにかけ次いでエタノールで沈澱させて精製し、100μLのTE緩衝液に再懸濁させた。このcDNAをPCRの鋳型として用いた。
ペチュニアジオキシゲナーゼ遺伝子フラグメントを増幅するためのPCR反応混合物は、4μLのcDNA、10mMトリス−HCl(pH8.3)、50mM KCl、2mM MgCl2、0.01%(w/v)ゼラチン、0.2mM各dNTP、0.4μM各プライマー、および1.25単位Taqポリメラーゼ(Cetus社)を含有していた。反応混合物(50μL)を、94℃で50秒間、42℃で1分間次いで72℃で1分間の処理を40回行った。各PCR 15μLづつを1.25%(w/v)アガロースゲル上で電気泳動させた。300〜500bpの大きさの範囲内のDNAフラグメントをNA-45膜上に集めた。そのDNAを上記の膜から溶出させ、次いでエタノールで沈澱させ、遠心分離によってペレット化し、25μLのTE緩衝液中に再懸濁させた。各V26PCR由来のDNAフラグメント1μLを集め、オリゴ標識化キット(BRESATEC)を用いて32Pで標識を付けた。Ba20PCR由来のDNAフラグメントに、類似の方式で標識を付けた。
ペチュニアの花弁のcDNAライブラリーからのジオキシゲナーゼ相同体の単離
16,000プラクの二つのリフトを、V26プローブまたはBa20プローブの5×105cpm/μLとハイブリッドを形成させ次のように洗浄した。すなわち高ストリンジェンシー条件〔ハイブリッド形成:50%(v/v)ホルムアミド、6×SSC、1%(w/v)SDS、42℃にて16時間および洗浄:2×SSC、1%(w/v)SDS、65℃にて2×15分間、続いて0.2×SSC、1%(w/v)SDS、65℃にて2×15分間〕を利用して姉妹クローンを検出した。14個のクローンがV26プローブとハイブリッドを形成したが、Ba20プローブとはハイブリッドを形成しなかった。別の12個のクローンは、V26プローブに対してBa20プローブよりも一層強くハイブリッドを形成した。
pBluescript中のプラスミドcDNAクローンは、ヘルパーファージR408(Stratagene社)を用いてλZAPIIクローンからレスキューした。
上記のクローンおよび他のクローンのDNA配列決定は、本質的に、Sequenase酵素(USB、バージョン2.1)を用い、Sangerら(1977年)の文献に記載の方法によって実施した。
実施例5−ノーザン分析
全RNAは、液体窒素中で凍結し、乳鉢と乳棒により微粉末に粉砕した組織から単離した。4Mグアニジウムイソチオシアネート、50mMトリス−HCl(pH8.0)、20mM EDTA、0.1%(v/v)Sarkosylからなる抽出緩衝液を上記組織に添加し、その混合物を、最高速度でポリトロン(poltron)を用いて1分間ホモジナイズした。その懸濁液をMiracloth(Calbiochem社)で濾過し、次にJA20ロータで10分間、10,000rpmで遠心分離にかけた。上澄み液を集め、0.2g/mL CsCl(w/v)にした。次に、試料を、38.5mLのQuic−シール遠心分離管(Beckman社)中に入れた5.7M CsCl、50mM EDTA(pH7.0)からなるクッション液10mL上に重層し、次いで70Tiロータ内で25℃にて16時間、42000rpmで遠心分離を行った。ペレットを、TE/SDS〔10mMトリス−HCl(pH7.5)、1mM EDTA、0.1%(w/v)SDS〕中に再懸濁し、10mM EDTA(pH7.5)中に飽和させたフェノール:クロロホルム:イソアミルアルコール(25:24:1)で抽出した。エタノールで沈澱した後、RNAのペレットをTE/SDS中に再懸濁させた。
20mMモルホリノプロパンスルホン酸(pH7.0)、5mM酢酸ナトリウム、0.1mM EDTA(pH8.0)を含有する泳動緩衝液を用い、2.2Mホルムアルデヒド/1.2%(w/v)アガロースゲルによって、RNA試料(20μg)の電気泳動を実施した。そのRNAを、メーカーが推奨するようにして、Hybond-N膜(Amersham社)に移し、次いで32Pで標識を付けた0.9kbのEcoRI−XhoI pDIOXC3cDNAフラグメント(108cpm/μg、2×106cpm/μL)でプローブした。プレハイブリダイゼーション(42℃で1時間)およびハイブリッド形成(42℃で16時間)を、50%(v/v)ホルムアミド、1M NaCl、1%(w/v)SDS、10%(w/v)デキストラン硫酸中で実施した。分解サケ精子DNA(100μg/mL)を、ハイブリッド形成ステップにおいて、32Pで標識したプローブとともに添加した。フィルターを、2×SSC/1%(w/v)SDS内で65℃にて1〜2時間次いで0.2×SSC/1%(w/v)SDS内で65℃にて30〜60分間洗浄した。フィルターを増感スクリーン付きKodak XARフィルムに−70℃で48時間暴露した(図2)。
RNAゲルブロット分析の結果、cDNAクローンpDIOXC3に対応する遺伝子は、花の発育段階1の期間中に最高レベルで発現され次いで低下したことが明らかになった。その発現のパターンはペチュニアの花におけるFLS酵素の活性のパターン(Forkmannら1986年)に類似している。
実施例6−pDIOXC3のRFLP地図作成
ペチュニア・ハイブリダには、FLSの活性を制御する一つの遺伝子座Flがある。したがって、Fl遺伝子座がFLSの構造遺伝子をコードしているならば、ペチュニア・ハイブリダのFLSをコードするcDNAクローンはFl遺伝子座に対して位置づけられていると予想された。Flはペチュニア・ハイブリダのゲノムの染色体IIにマッピングされて、PAc1遺伝子の2%組換えの範囲で連結される(Cornuら1990年)。同系繁殖系のV23(FlFl)およびR51(flfl)間の交雑種由来の植物のF2集団から単離されたDNAのRFLP分析を利用して、各種のジオキシゲナーゼ相同体の連鎖のデータを得た。
ゲノムDNAの単離
特にDellaportaら(1983年)の文献に記載されているのと同様にして、DNAをV23×R51F2植物の葉の組織から単離した。そのDNAの標品をさらにCsCl浮遊密度遠心分離法(Sambrookら1989年)によって精製した。
サザーンブロット
ゲノムDNA(10μg)を、60単位のXbaIで16時間消化し、次いで泳動緩衝液のTAE(40mMトリス−アセテート、50mM EDTA)中0.7%(w/v)のアガロースゲルによって電気泳動を行った。そのDNAを変性溶液(1.5M NaCl/0.5M NaOH)中で1〜1.5時間変性し、0.5Mトリス−HCl(pH7.5)/1.5M NaCl中で2時間中和し、次いでDNAをHybond-N(Amersham社)フィルター(20×SSC)に移した。
DNAフラグメント(50〜100ng)に、オリゴラベリングキット(Bresatec社)を用いて50μCiの〔α−32P〕−dCTPで放射能標識した。取りこまれなかった〔α−32P〕−dCTPをセファデックスG-50(Fine)カラムのクロマトグラフィで除去した。PAc1プローブを、pPAc1の2.7kbのHindIII/BamHIフラグメントから合成した(BairdおよびMeagher 1987年)。pDIOXC3cDNAプローブをpDIOXC3の0.9kbのEcoRI−XhoIフラグメントから合成した。
XbaIで消化したゲノムDNAの二つのサザーンブロットを、pDIOXC3プローブまたはPAc1プローブとハイブリッドを形成させてRFLPのパターンを検出した。分析された42の植物のうち40については、PAc1についてのV23,VRおよびR51のRFLPパターンとpDIOXC3の対応するRFLPパターンとの同時分離(co-segregation)があったが、これは対応する遺伝子が密接に連鎖していることを示している(4.7%組換え)。
これらのデータは、pDIOXC3に対応する遺伝子がFl遺伝子座に連結しているという強力な証拠を与えた。この連結およびノーザン分析の結果は、pDIOXC3cDNAがFLSをコードしているかもしれないという状況証拠を与えた。
実施例7−pDIOXC3の全長姉妹cDNAクローンの単離
予備的な配列分析の結果、pDIOXC3は対応する転写物の全長のクローンを示さなかったことが分かった。pDIOXC3の全長体を得るため、cDNAライブラリーからの約20,000個の組換え体を、pDIOXC3由来の0.9kbのEcoRI−XhoIフラグメントとハイブリッドを形成したクローンについて選別した。6個のクローンが強いハイブリッド形成シグナルを発したので以後の分析用に選択した。いくつものクローンが、cDNA挿入断片とmRNAとの大きさが一致していることに基づいて全長であるようである。これらのクローンのうちの一つからのcDNA挿入断片の完全配列(pCGP481と命名)を、標準のクローニング法(Sambrookら1989年)を用いて得た異なるpBluescriptサブクローンから配列を並べることによって決定した。いくつかの領域については、オーバーラップ配列のデータを得るため特定のオリゴヌクレオチドプライマー(オリゴ7〜9;S配列番号:12〜14)を合成する必要があった。pCGP481の完全ヌクレオチド配列と推定アミノ酸配列をS配列番号:1に示す。
実施例8−酵母中でのPCGP481cDNAの発現
酵母発現ベクターpYGA22mの構築
M13-mp18をEcoRIとBglIIで消化して、マルチクローニング部位を有する700bpのフラグメントを製造した。このフラグメントをpYGA2269由来の9kbのEcoRI−BglII−フラグメントと連結した(Ashikariら1989年)。得られた構築物(pYGA22mと命名)は、酵母グリセルアルデヒド3−リン酸デヒドロゲナーゼのプロモーターの下流に挿入されたマルチクローニング部位を含有していた。
pCGP631の構築
pCGP481由来の完全cDNA挿入断片を含有する1.3kbのEcoRI−XhoIフラグメントを、pYGA22m由来の9kbのEcoRI/SalIフラグメントと連結した。得られたプラスミド〔pCGP631と命名(図4)〕は、グリセルアルデヒド3−リン酸デヒドロゲナーゼプロモーターの後にセンス配向で連結したpCGP481cDNAフラグメントを含有していた。
酵母の形質転換
酵母株G-1315(Matα,typ1)(Ashikaraら1989年)を、Itoら(1983年)の文献にしたがってpCGP631で形質転換した。その形質転換体を、G-1315をトリプトファン栄養要求性を回復するそれらの能力によって選択した。
FLS活性の検定を行うための酵母抽出物の製造
G-1315/pCGP631の単一単離物およびトリプトファンを欠いた培地で増殖したG-1315の復帰変異体を用いて、10mLのYNBS{1.2%(w/v)のアミノ酸なしのイーストナイトロジェンベース(Difco社)および0.3%(w/v)カザミノ酸(Difco社)}に接種し、次いで振盪して2日間30℃でインキュベートした。
酵母細胞を遠心分離によって収穫し、TE緩衝液で一回洗浄し、チモリアーゼ(zymolyse)(0.1mg/mL)(生化学工業、日本)を含有する緩衝液B(10mMトリス−HCl(pH7.5)、1.2Mソルビトール、0.1mM DTT、0.1mM EDTA)100μL中に再懸濁させ、次いで30℃に1時間保持した。スフェロプラストを遠心分離で集めて、1mM 2−メルカプトエタノールおよび1mM PMSFを含有する0.1Mリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)500μL中に再懸濁させた。その懸濁液をガラスビーズ(直径=0.4mm)とともに激しく振とうさせた。遠心分離を行った後、上澄み液を粗抽出液として使用した。
酵母の酵素抽出物のFLS検定
FLS活性を、改変したForkmannら(1986年)の方法で測定した。反応液は、合計200μL中に、0.1Mリン酸カリウム(pH7.0)、1.4mM 2−メルカプトエタノール、250μM 2−オキソグルタレート、5mMアスコルビン酸、50μM硫酸第一鉄、5000cpmの14C-DHQおよび40μLの粗抽出液を含有していた。インキュベーションは30℃で10分間または1時間行った。その混合物を500μLの酢酸エチルで直ちに抽出し、次に標識していないDHQとケルセチンとともに、Forestal(酢酸:HCl:水=30:3:10)を用い、セルロースプレート(Merck Art 5577、ドイツ)のクロマトグラフィーに付した。オートラジオグラフィーによって放射能の位置を求めた。G-1315/pCGP631から調製した酵素抽出物はFLS活性を有することを示したが、形質転換されていない酵母から調製した同等画分はFLS活性が全くなかった(図5)。
酵母の発現結果から、pCGP481由来のcDNA挿入断片がFLS酵素をコードしていることが確認された。Forkmannら(1986年)の文献には二つの酵素の2−ヒドロキシラーゼとデヒドラターゼがジヒドロフラボノール類をフラボノール類に変換するのに必要であると示唆されている。しかし、上記の試験結果は、ペチュニアFLSのcDNAクローンによってコードされている酵素の酵母内での発現は上記の変換を行うのに充分であり、このことは、ジヒドロフラボノール類をフラボノール類に変換するのに1種の酵素しか必要でないことを示唆している。
実施例9−形質転換植物内でのフラボノールとアントシアニンの合成の操作
バイナリー構築物
pCGP293(Bruglieraら1993年)由来のマルチプルクローニング部位のXbaI−KpnIフラグメントを、XbaI,BamHI,ApaIおよびAsp718に対する部位を含有する合成ポリリンカーで置換することによって、バイナリー発現ベクターpCGP478を構築した。この合成ポリリンカーは二つのオリゴヌクレオチドのオリゴ10とオリゴ11(配列番号:15と16)をアニールすることによって製造した。pCGP478のMACプロモーターとmasターミネーターの間のこれら制限酵素部位の順序によって、方向性λZAPIIクローン由来のcDNA挿入断片のアンチセンス配向での直接クローニングが容易になる。
pCGP481由来の完全cDNAを含有する1.2kbのXbaI/Asp718フラグメントを、pCGP478のMACプロモーターとmasターミネーターの間に、アンチセンス配向でクローン化してpCGP479を創製した。Gynheungら1988年の文献に記載の方法を用いて、プラスミドpCGP479をアグロバクテリウム・ツメファシエンス菌株AGLO(Lazoら1991年)中に導入した。pCGP479を保有するアグロバクテリウム・ツメファシエンスの細胞を、100μg/mLのゲンタマイシンを含有するMG/L寒天プレート上で選択した。
pCGP481由来のcDNAを含有する1.2kbのXbaI/Asp718フラグメントを、pCGP293のMACプロモーターとmasターミネーターの間にセンス配向でクローン化してpCGP482を創製した。このプラスミドpCGP482を、Gynheungら(1988年)の文献に記載の方法を用いてアグロバクテリウム・ツメファシエンス菌株AGLO(Lazoら1991年)中に導入した。pCGP482を保有するアグロバクテリウム・ツメファシエンスの細胞を、100μg/mLのゲンタマイシンを含有するMG/L寒天プレート上で選択した。
形質転換植物の産生
Horshら(1985年)の文献に記載の方法を用い、葉のディスクをAGLO/pCGP479と共生培養することによって、ペチュニアcv.VR(Flfl)植物を形質転換した。形質転換植物を成長させて開花させ、形質転換されていないVRの花と比較して変化した花色を評価した。12の形質転換植物のうち4が、形質転換されていない対照植物より赤味が多い花を産生した。形質転換ペチュニアの花色の変化以外に、FLScDNAのアンチセンス発現の他の影響は全く観察されなかった。
Horschら(1985年)の文献に記載の方法を用い、葉のディスクをAGLO/pCGP482と共生培養することによって、ペチュニアcv Old Glory Blue植物を形質転換した。形質転換植物を成長させて開花させ、形質転換されていないOld Glory Blueの花と比べて変化した花色を評価した。15の形質転換植物のうち3が形質転換されていない対照植物より赤味が多い花を産生した。形質転換されていないOld Glory Blueの花は一般にブルーバイオレット色であるが、pCGP482で形質転換されたOld Glory Blueの花の色はブルーバイオレットからパープルの範囲の色であった。
Horschら(1985年)の文献に記載の方法を用い、葉のディスクをAGLO/pCGP479と共生培養することによって、タバコ植物〔ニコチアナ・タバカムcv.キサンシ(Nicotiana tabacum cv. Xanthi)〕を形質転換した。タバコの花は通常うすいピンク色であり、花冠のリムに低いレベルのシアニジン誘導体を産生する。タバコをアンチセンスFLS遺伝子構造体で形質転換すると、フラボノールの産生の減少が起こって赤色の花を産生するようになった。赤色の発色は花系でも増大した。この赤色の花色は、花冠のリム内のアントシアニンの産生が3倍増大したためであった。
観察された色の変化は、下記表6に示すようにthe Royal Horticultural Society's Colour Chartの数値によって示す。
しかし、他の生化学的および生理学的条件が個々の結果に影響を与えるので、FLSのセンスおよびアンチセンスの構造体の形質転換植物内での発現によって達成された特定の色の変化を引用しても、観察しうる色の変化の可能な範囲を限定すると解すべきではないことに留意しなければならない。
花由来のフラボノイド類の抽出と分析
1個の花冠を1mLの2M HCl中で30分間煮沸し次いでフラボノイド類を150μLの酢酸エチルで抽出することによって、フラボノールアグリコン類をペチュニアの花から単離した。薄層クロマトグラフィー(TLC)を行うために、4μLの酢酸エチル抽出液および4μLのフラボノール標品(ケンフェロール、ケルセチンおよびミリセチン)をTLCプレートに塗布し、上記のようにして展開させた。フラボノール類は、アンモニアで燻蒸した後紫外線下で目視可能になった。
ペチュニアVRおよびペチュニアVR/pCGP479の花から抽出したフラボノール類を薄層クロマトグラフィーで分析した。VR/pCGP479の赤色の花は、フラボノール類の産生が形質転換されていないVRの花より著しく少なかった。pCGP479で形質転換されたタバコ植物由来の花を同様に分析した結果、フラボノール含有量が減少していることが見出された。
0.5%HClを含むメタノール溶液を用いて、ペチュニアとタバコの花からアントシアニン類を抽出した。アントシアニン類の濃度は、Gerats(1985年)の文献に記載されているようにして、抽出液のA530測定値から推定した。
実施例10−ニコチアナ属の植物からのcDNA相同体の単離
ニコチアナ・アラータ(Nicotiana alata)のcDNAライブラリーの構築と選択
ベクターλZAPのcDNAライブラリーを、Chenら(1992年)の文献に記載されているようにして、S6S6ニコチアナ・アラータの花柱から単離したRNAから単離した。
6×SSC、35%(v/v)ホルムアミド、1%(w/v)SDS中、42℃で16時間加熱することによって、約36,000個のcDNAクローンを32P標識化pCGP481cDNAフラグメントとハイブリッドを形成した。これらのフィルターを、2×SSC、1%SDS中65℃の中位のストリンジェンシー条件下で洗浄し次いでオートラジオグラフにかけた。ハイブリッドを形成しているプラークを取出してPSB中に入れてファージを溶出させた。一本鎖ヘルパーファージVCSM13(Stratagene社)を用いて8個のプラスミドクローンをレスキューした。最大のcDNA挿入断片を含有するクローンのpCGP489は、配列が決定され(配列番号:2)、ペチュニアFLSの遺伝子配列に対してヌクレオチドレベルで88%の類似性を示し、そしてpCGP481でコードされたペチュニアFLS配列に対して241個のアミノ酸にわたって91%の類似性を示した。
ニコチアナ・シルベストリス(Nicotiana sylvestris)cDNAライブラリーの構築と選択
ベクターλZAPIIのcDNAライブラリーをChenら(1992年)の文献に記載されている方法を用いてニコチアナ・シルベストリスの花柱から単離したRNAから製造した。
低ストリンジェンシーハイブリッド形成緩衝液(6×SSC、35%(v/v)ホルムアミド、1%(w/v)SDS)中、16時間42℃にて、約120,000個のcDNAクローンを32Pで標識をつけたpCGP481cDNAフラグメントとハイブリッドを形成させた。それらのフィルターを2×SSC、1%(w/v)SDS中65℃で洗浄し、次いでオートラジオグラフにかけた。ハイブリッドを形成するプラークを取り出してPSBに入れてファージを溶出させた。3個のプラスミドクローンを、一本鎖ヘルパーファージVCSM13を用いてレスキューした。最大のcDNA挿入断片を含有するクローンであるpCGP490は、配列が決定され(配列番号:3)、ペチュニアFLS遺伝子配列に対してヌクレオチドレベルで84%の類似性を示しそしてpCGP481でコードされたペチュニアFLS配列に対し、45個のアミノ酸配列にわたって93%の類似性を示した。
二つのニコチアナcDNAクローン:pCGP489(配列番号:2)およびpCGP490(配列番号:3)のアミノ酸配列を、ペチュニアFLScDNAクローン(配列番号:1)のアミノ酸配列と比べて下記の表7に示す。
TurpenおよびGriffith(1986年)の文献に記載の方法を用い、ディー・カリオフィルスcv. ラグナ(D.Caryophyllus cv. Laguna)の段階3の花の花弁の組織から全RNAを単離した。メーカーのプロトコルにしたがってOligotex dT-30(Takana、日本)によって、上記全RNAからポリ(A)+RNAを選択した。
cDNAを作製し、ペチュニアライブラリーについて用いたプロトコルにしたがってライブラリーをλZAPII中に構築した。
一次ライブラリー(150,000pfuを含有していた)を、大腸菌SURE細胞にトランスフェクトした後、37,500pfu/15cm直径プレートでプレートした。これらのプレートを37℃で8時間インキュベートし次いで4℃で一夜貯蔵した。ファージを、プレートから、ファージ貯蔵緩衝液(8mM MgSO4、100mM NaCl、0.01%(w/v)ゼラチン、50mMトリス−HCl、pH8.0)中に溶出させて、増幅されたcDNAライブラリーストックを形成させた。
ダイアンサスcDNAライブラリーからのFLS相同体の単離
合計100,000のプラークを、2回、32Pで標識を付けた1.1kbのEcoRI−HindII pDIOXC3cDNAフラグメント(5×105cpm/μL)で選択した。ハイブリッド形成は低ストリンジェンシー緩衝液〔6×SSC、0.5%(w/v)SDS、5×デンハート溶液、0.01M EDTA、100μg/mL〕中42℃で16時間行った。それらのフィルターを2×SSC/1%(w/v)SDS中65℃で洗浄し次にオートラジオグラフにかけた。ハイブリッドを形成したcDNAクローンを一本鎖ヘルパーファージExassist(Stratagene社)を用い、メーカーの指示にしたがってλZAPIIからレスキューした。
配列決定後、単離されたクローンのうちの一つのpCGP777(配列番号:4)は、pCGP481がコードするペチュニアFLSの配列に対してヌクレオチドおよびアミノ酸の両方のレベルで65%の類似性を示した。
実施例12−クリサンセマム属植物からのcDNA相同体の単離
クリサンセマム属植物のcDNAライブラリーの構築
やはりTurpenおよびGriffith(1986年)の文献記載の方法を用い、クリサンセマム・モリホリウムcv. ダークピンクポンポン(参照番号5999)の段階2と3の花の花弁組織から全RNAを単離した。cDNA合成の鋳型として30μgの量の全RNAを使用した。
分画と連結を行い、続いてcDNA反応混合物をPackagene system(Promega社)を用いてパッケージした。未増幅ライブラリーのタイターは3.7×104pfu/mLであった。
クリサンセマム属植物cDNAライブラリーからのFLS相同体の単離
上記のパッケージされたcDNAの90,000pfu(増幅されたライブラリー;2.6×107pfu/mL)を、XL1-Blue細胞にトランスフェクトした後、10,000pfu/15cm直径プレートでプレートした。これらのプレートを37℃で一夜インキュベートし次いで4℃で貯蔵した。Colony/Plaque Screen(登録商標)(Dupont社)上にプラークを写し取り、メーカーが推奨するとおりに処理し、次に32Pで標識を付けたEcoRI−XhoI pCGP481cDNAフラグメントで選別した。ハイブリッド形成を、低ストリンジェンシー緩衝液〔6×SSC、1.0%(w/v)SDS、20%(v/v)ホルムアミド)中、42℃にて16時間行った。それらフィルターを、2×SSC/1%SDS中、65℃で30分間づつ2回洗浄し次いでオートラジオグラフにかけた。
単離されたクローンpCGP874(配列番号:5)は、配列決定により、pCGP481がコードするペチュニアFLS配列に対し、ヌクレオチドレベルで70%の類似性を示し、そしてアミノ酸レベルで72%の類似性を示した。
実施例13−pCGP874cDNAの酵母中での発現
酵母の発現ベクターpYGA22mおよびpCGP492の構築
酵母発現ベクターpYGA22mを、上記実施例8に記載されているようにして構築した。pCGP874由来の完全cDNA挿入断片を含有する1.3kbのEcoRI−XhoIフラグメントを、前記pCGP631を構築したときと同じ方式で、pYGA22m由来の9kbのEcoRI/SalIフラグメントと連結し、それを図4に示す。得られたプラスミド(pCGP492と命名)は、グリセルアルデヒド3−リン酸デヒドロゲナーゼプロモーターの後にセンス配向で連結されたpCGP874cDNAフラグメントを含有していた。
酵母の形質転換とFLS活性の検定
酵母の形質転換と、FLS活性の検定するのに用いる抽出物の調製は実施例8にすでに記載したようにして実施した。FLSの活性は、やはり、標識されていないDHKとDHQを基質として用い、改変したForkmannら(1986年)の方法で実施した。その試験結果によって、pCGP874 cDNAがキクの機能的FLS酵素をコードしていることが確認された。
当該技術分野の当業者は、本願に記載された発明は、具体的に記載された発明以外に変形と改変を行うことができることが分かるであろう。本発明にはこのような変形と改変がすべて含まれると解すべきである。また本発明には、本明細書に、個々にもしくはまとめて引用もしくは提示されたステップ、特徴、組成物および化合物のすべて、ならびに前記ステップまたは特徴の二つ以上を組合わせたもののすべてが含まれる。
引用文献
配列の一覧表
(1)一般情報:
(ii)発明の名称:フラボノールシンターゼ酵素をコードする遺伝子配列およびその用途
(iii)配列の数:16
(iv)通信の宛先:
(A)受信者:ディビズ・コリソン・ケイブ
(B)ストリート:リトル・コリンズ・ストリート 1
(C)市:メルボルン
(D)州:ビクトリア
(E)国:オーストラリア
(F)ZIP:3000
(v)コンピュータが読み取り可能な形態:
(A)媒体の種類:フロッピーディスク
(B)コンピュータ:IBM PC compatible
(C)オペレーティングシステム:PC-DOS/MS-DOS
(D)ソフトウエア:PatentIn Release #1.0, Version #1.25
(vi)本出願のデータ:
(A)出願番号:オーストラリア国際特許願
(B)出願日:1993年8月5日
(C)分 類:
(viii)弁護士/弁理士の情報:
(A)氏名:スラッタリー,ジョン エム.
(B)参照/名簿番号:EJH/JMS/EK
(ix)電気通信の情報:
(A)電話:61 3 254 2777
(B)テレファックス:61 3 254 2770
(C)テレックス:AA 31787
(2)配列番号:1に関する情報:
(i)配列の特徴:
(A)長さ:1211個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:cDNA
(iii)ハイポセティカル:NO
(ix)特徴:
(A)名称/キー:CDS
(B)位置:59..1101
(xi)配列の記載:配列番号:1:
(2)配列番号:2に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:890個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:cDNA
(iii)ハイポセティカル:NO
(ix)特徴:
(A)名称/キー:CDS
(B)位置:3..725
(xi)配列の記載:配列番号:2:
(2)配列番号:3に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:236個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:cDNA
(iii)ハイポセティカル:NO
(ix)特徴:
(A)名称/キー:CDS
(B)位置:1..135
(xi)配列の記載:配列番号:3:
(2)配列番号:4に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:1236個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:cDNA
(iii)ハイポセティカル:NO
(ix)特徴:
(A)名称/キー:CDS
(B)位置:70..1068
(xi)配列の記載:配列番号:4:
(2)配列番号:5に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:1250個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:cDNA
(iii)ハイポセティカル:NO
(ix)特徴:
(A)名称/キー:CDS
(B)位置:11..1065
(xi)配列の記載:配列番号:5:
(2)配列番号:6に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:45個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(xi)配列の記載:配列番号:6:
(2)配列番号:7に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:26個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(ix)特徴:
(A)(X,Y)=XまたはY
(B)I=イノシン
(xi)配列の記載:配列番号:7:
(2)配列番号:8に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:19個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(ix)特徴:
(A)(X,Y)=XまたはY
(B)I=イノシン
(xi)配列の記載:配列番号:8:
(2)配列番号:9に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:26個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(ix)特徴:
(A)(X,Y)=XまたはY
(B)I=イノシン
(xi)配列の記載:配列番号:9:
(2)配列番号:10に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:20個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(ix)特徴:
(A)(X,Y)=XまたはY
(B)I=イノシン
(xi)配列の記載:配列番号:10:
(2)配列番号:11に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:20個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(ix)特徴:
(A)(X,Y)=XまたはY
(B)I=イノシン
(xi)配列の記載:配列番号:11:
(2)配列番号:12に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:20個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(xi)配列の記載:配列番号:12:
(2)配列番号:13に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:18個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(xi)配列の記載:配列番号:13:
(2)配列番号:14に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:19個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(xi)配列の記載:配列番号:14:
(2)配列番号:15に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:18個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(xi)配列の記載:配列番号:15:
(2)配列番号:16に関する情報:
(i)配列の特性:
(A)長さ:34個の塩基対
(B)種類:核酸
(C)ストランデッドネス:一本鎖
(D)トポロジー:線状
(ii)分子の種類:オリゴヌクレオチドDNA
(xi)配列の記載:配列番号:16:
Claims (15)
- 配列番号:1、2、3、4又は5に示されるアミノ酸配列を有するフラボノールシンターゼをコードする核酸分子。
- 配列番号:1、2、3、4又は5に示されるヌクレオチド配列に対して90%以上の類似性を有するヌクレオチド配列を有する、フラボノールシンターゼ活性を持つタンパク質をコードする核酸分子。
- 配列番号:1、2、3、4又は5に示されるアミノ酸配列において、1〜数個のアミノ酸の付加、除去及び/又は置換により修飾されたアミノ酸配列を有し、フラボノールシンターゼ活性を持つタンパク質をコードする核酸分子。
- 配列番号:1、2、3、4又は5に示されるヌクレオチド配列またはそれに相補的なヌクレオチド配列に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、フラボノールシンターゼ活性を持つタンパク質をコードする核酸分子。
- ペチュニア、タバコ、カーネーション及びキクからなる群から選択された植物に由来する請求項1〜4のいずれか1項に記載の核酸分子。
- ペチュニア、タバコ、カーネーションおよびキクからなる群から選択された植物に由来する請求項5に記載の核酸分子。
- 請求項1〜6のいずれか1項に記載の核酸分子を含んでなるベクター。
- 前記核酸分子が作用可能にプロモーターに連結されている請求項7に記載のベクター。
- 真核細胞内で複製及び発現を行うことができる請求項7又は8に記載のベクター。
- 原核細胞内で複製及び発現を行うことができる請求項7又は8に記載のベクター。
- 請求項7〜10のいずれか1項に記載のベクターにより形質転換されたトランスジェニック双子葉植物。
- 前記遺伝子配列が発現することができかつ当該発現が任意に調節可能である、請求項11に記載のトランスジェニック双子葉植物。
- 発現が発育中に調節される、請求項12に記載のトランスジェニック双子葉植物。
- ペチュニア及びタバコからなる群から選択される、請求項11〜13のいずれか1項に記載のトランスジェニック双子葉植物。
- 請求項1〜6のいずれか1項に記載の核酸分子を、ペチュニア又はタバコ植物の細胞内に導入し、その細胞からトランスジェニック植物を再生させ、次いで核酸配列がフラボノールシンターゼを発現できるようにするのに充分な時間および条件下、前記トランスジェニック質転換植物を成長させることを含んでなる、変化した花色特性を示すことができるペチュニア又はタバコ植物の製造方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
AUPL394492 | 1992-08-05 | ||
PCT/AU1993/000400 WO1994003606A1 (en) | 1992-08-05 | 1993-08-05 | Genetic sequences encoding flavonol synthase enzymes and uses therefor |
AU3944 | 1996-11-29 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH07509606A JPH07509606A (ja) | 1995-10-26 |
JP3808498B2 true JP3808498B2 (ja) | 2006-08-09 |
Family
ID=3776339
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP50483394A Expired - Fee Related JP3808498B2 (ja) | 1992-08-05 | 1993-08-05 | フラボノールシンターゼ酵素をコードする遺伝子配列およびその用途 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5859329A (ja) |
EP (1) | EP0656951B1 (ja) |
JP (1) | JP3808498B2 (ja) |
AT (1) | ATE321140T1 (ja) |
CA (1) | CA2140770A1 (ja) |
DE (1) | DE69333996T2 (ja) |
NZ (1) | NZ254673A (ja) |
WO (1) | WO1994003606A1 (ja) |
Families Citing this family (24)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH10508186A (ja) * | 1994-08-16 | 1998-08-18 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | Ga4 dna、タンパク質および使用方法 |
GB9801598D0 (en) | 1998-01-26 | 1998-03-25 | Unilever Plc | Methods and compositions for modulating flavonoid content |
WO2000004175A1 (en) * | 1998-07-14 | 2000-01-27 | Unilever Plc | Methods and composition for modulating flavonoid content |
US6380464B1 (en) * | 1998-12-04 | 2002-04-30 | E. I. Du Pont De Nemours & Company | Plant flavonol synthase homologs |
MXPA03003854A (es) * | 2000-10-30 | 2004-10-15 | Exelixis Plant Sciences Inc | Identificacion y caracterizacion de un mutante de antocianina (ant1) en jitomate. |
EP1254960A1 (en) * | 2001-05-02 | 2002-11-06 | Unilever Plc | A process for increasing the flavonoid content of a plant and plants obtainable thereby |
US7208659B2 (en) * | 2001-05-02 | 2007-04-24 | Conopco Inc. | Process for increasing the flavonoid content of a plant and plants obtainable thereby |
EP1419269A2 (en) * | 2001-05-08 | 2004-05-19 | Paradigm Genetics Inc. | Methods for the identification of inhibitors of flavanone 3-hydroxylase expression or activity in plants |
US7304207B2 (en) * | 2001-10-29 | 2007-12-04 | Exelixis, Inc. | Identification and characterization of an Anthocyanin mutant (ANT1) in tomato |
US20040072814A1 (en) | 2002-10-11 | 2004-04-15 | Solvay Pharmaceuticals Gmbh | Method for obtaining a natural mixture of conjugated equine estrogens depleted in non-conjugated lipophilic compounds |
AR041121A1 (es) * | 2002-10-11 | 2005-05-04 | Solvay Pharm Gmbh | Procedimiento para la obtencion de una mezcla natural de estrogenos conjugados |
US20050198710A1 (en) * | 2003-04-10 | 2005-09-08 | Mcgonigle Brian | Method of improving soybean protein color by reducing levels of flavonol |
AU2004235352A1 (en) * | 2003-04-25 | 2004-11-11 | Exelixis Plant Sciences, Inc. | Genes upregulated in a tomato plant having an increased anthocyanin content phenotype |
DK1786908T3 (da) * | 2004-08-18 | 2010-06-07 | Bayer Cropscience Ag | Planter med forøget plastidisk aktivitet af stivelsesphosphorylerende R3-enzym |
CA2653627A1 (en) | 2006-06-01 | 2007-12-06 | Vereniging Voor Christelijk Hoger Onderwijs, Wetenschappelijk Onderzoek En Patientenzorg | Plant nucleic acids associated with cellular ph and uses thereof |
US9052304B2 (en) | 2009-03-13 | 2015-06-09 | Terrasep, Llc | Methods and apparatus for centrifugal liquid chromatography |
EP2701777B1 (en) | 2011-04-28 | 2017-05-17 | Sanofi-Aventis Deutschland GmbH | Z-shaped fluid channel arrangement |
CN103756982B (zh) * | 2013-12-16 | 2015-10-28 | 上海交通大学 | 郁金香黄酮醇合成酶TfFLS蛋白及其编码基因 |
WO2017002945A1 (ja) | 2015-07-01 | 2017-01-05 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 | 青系花色を有するキクの作出方法 |
WO2017169699A1 (ja) | 2016-03-31 | 2017-10-05 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 | 青系花色を有する植物及びその作出方法 |
US20190208807A1 (en) | 2018-01-05 | 2019-07-11 | Mead Johnson Nutrition Company | Nutritional compositions containing milk-derived peptides and uses thereof |
CN108048415B (zh) * | 2018-02-01 | 2021-02-26 | 浙江大学 | 两个杨梅黄酮醇合成酶MrFLSs蛋白及其编码基因的应用 |
CN110714092B (zh) * | 2019-09-04 | 2020-09-08 | 广东省农业科学院茶叶研究所 | 一种位于黄酮醇合成酶基因中与茶树(+)-儿茶素含量连锁的分子标记位点及其应用 |
CN112662685A (zh) * | 2021-01-11 | 2021-04-16 | 浙江万里学院 | 比利时杜鹃花fls基因、用于克隆该基因的引物组及其克隆方法和荧光定量引物组 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
NL8800756A (nl) * | 1988-03-25 | 1989-10-16 | Vereniging Voor Christelijk Wetenschappelijk Onderwijs | Genetisch gemanipuleerde plantecellen en planten, alsmede daarvoor bruikbaar recombinant dna. |
US5034323A (en) * | 1989-03-30 | 1991-07-23 | Dna Plant Technology Corporation | Genetic engineering of novel plant phenotypes |
GB9027616D0 (en) * | 1990-12-20 | 1991-02-13 | Ici Plc | Dna,dna constructs,cells and plants derived therefrom |
CA2112373C (en) * | 1991-07-11 | 2010-04-20 | Timothy A. Holton | Genetic sequences encoding flavonoid pathway enzymes and uses therefor |
-
1993
- 1993-08-05 NZ NZ254673A patent/NZ254673A/en unknown
- 1993-08-05 CA CA002140770A patent/CA2140770A1/en not_active Abandoned
- 1993-08-05 US US08/379,556 patent/US5859329A/en not_active Expired - Lifetime
- 1993-08-05 DE DE69333996T patent/DE69333996T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1993-08-05 EP EP93917438A patent/EP0656951B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1993-08-05 WO PCT/AU1993/000400 patent/WO1994003606A1/en active IP Right Grant
- 1993-08-05 AT AT93917438T patent/ATE321140T1/de not_active IP Right Cessation
- 1993-08-05 JP JP50483394A patent/JP3808498B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP0656951B1 (en) | 2006-03-22 |
EP0656951A1 (en) | 1995-06-14 |
US5859329A (en) | 1999-01-12 |
CA2140770A1 (en) | 1994-02-17 |
ATE321140T1 (de) | 2006-04-15 |
DE69333996D1 (de) | 2006-05-11 |
JPH07509606A (ja) | 1995-10-26 |
NZ254673A (en) | 1996-05-28 |
DE69333996T2 (de) | 2006-11-02 |
EP0656951A4 (en) | 1996-04-17 |
WO1994003606A1 (en) | 1994-02-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP3808498B2 (ja) | フラボノールシンターゼ酵素をコードする遺伝子配列およびその用途 | |
JP3585932B2 (ja) | 変更された花の色を示すトランスジェニック植物及びその製造方法 | |
US5861487A (en) | Genetic sequences encoding flavonoid pathway enzymes and uses therefor | |
JP4798574B2 (ja) | フラボノイド3’,5’ヒドロキシラーゼ遺伝子配列およびその使用法 | |
US6232109B1 (en) | Plant genes | |
US20060248609A1 (en) | DNAs coding for flavone synthases, methods of using flavone synthase DNAs, and plants, flowers, and vectors containing flavone synthase DNAs | |
US5639870A (en) | Genetic sequences encoding flavonoid pathway enzymes and uses therefor | |
WO1994003591A1 (en) | Genetic sequences encoding glycosyltransferase enzymes and uses therefor | |
JP2003528603A (ja) | 植物のアントシアニジンルチノシド芳香族アシルトランスフェラーゼ | |
AU667392B2 (en) | Genetic sequences encoding flavonol synthase enzymes and uses therefor | |
JPH05184370A (ja) | フラボノイド水酸化酵素遺伝子 | |
AU672020B2 (en) | Genetic sequences encoding glycosyltransferase enzymes and uses therefor |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20040720 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20041015 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20041129 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20050120 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20050719 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20051017 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20051104 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20060307 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20060317 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20060418 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20060518 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20100526 Year of fee payment: 4 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110526 Year of fee payment: 5 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |