JP3245398B2 - ネオスポラのジヒドロフォレートレダクターゼ−チミジレートシンターゼをコードする単離されたポリヌクレオチド分子 - Google Patents

ネオスポラのジヒドロフォレートレダクターゼ−チミジレートシンターゼをコードする単離されたポリヌクレオチド分子

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Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、動物の健康に関す
る分野内にあり、病気に関するワクチン組成物および診
断に関係する。より特別には、本発明は、ネオスポラ
(Neospora)のジヒドロフォレートレダクター
ゼ−チミジレートシンターゼ(DHFR−TS)タンパ
ク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオ
チド分子であって、そのポリヌクレオチド分子がネオス
ポラ症に対するワクチンの製造に、および診断用試薬と
して有用である、前記ポリヌクレオチド分子に関係す
る。
【0002】
【従来の技術】ネオスポラは、哺乳動物の流産、新生児
死亡、先天性感染症、および脳炎疾病の主な原因として
認識された動物の病原性原生動物寄生虫である(Dub
eyおよびLindsay、1996、Vet.Par
asitol.,67,1−59;DubeyおよびL
indsay、1993、ParasitologyT
oday,9,452−458)。N.caninum
は、イヌに感染し、そして先天的に子犬に感染してお
り、時には、麻痺を起こす。N.caninumのタキ
ゾイトを、先天的感染の子犬から単離した(Linds
ayおよびDubey、1989、J.Parasit
ol.,75,163−165)。ネオスポラは、乳牛
の流産の主な原因である。ネオスポラ−関連疾病の症
例、例えばネオスポラ症もまた、ヤギ、ヒツジおよびウ
マで報告されている。
【0003】N.canimunは、病原体、Toxo
plasma gondiiと表面的には類似している
が、N.caninumおよびT.gondiiは、抗
原性および超微細構造の両方で互いに識別された(Du
beyおよびLindsay、1993、上記)。さら
に、流産したウシ胎児の脳から単離されインビトロで連
続的に培養された、ネオスポラ様原生動物寄生虫は、
T.gondiiおよびHammondia hamm
ondiの両方とは異なった、抗原性および超微細構造
であることが示され、N.caninumに最も類似し
ていた(Conradら、1993、Parasito
logy,106,239−249)。さらに、核小サ
ブユニットリボソームRNA遺伝子の分析は、乳牛およ
びイヌから単離されたネオスポラ株間にヌクレオチドの
差を示さなかったが、ネオスポラとT.gondiiの
間では一貫した差が示された(Marshら、199
5、J.Parasitol.,81,530−53
5)。
【0004】ウシの流産および先天性疾病におけるウシ
のネオスポラ単離物の病因的役割が確認された(Bar
rら、1994、J.Vet.Diag.Inves
t.,6,207−215)。中枢神経系ネオスポラ症
の齧歯動物モデルが、N.caninumに感染した同
系のBALB/cマウスを用いて、開発された(Lin
dsayら、1995、J.Parasitol.,8
1,313−315)。さらに、妊娠した異系および同
系のマウス内のN.caninumの移植伝染を研究す
るためのモデルは、それぞれ、Coleら、1995、
J.Parasitol.,81,730−732、お
よびLongら、1996、J.parasito
l.,82,608−611、に記載されている。さら
に、自然に獲得されたネオスポラ誘導の乳牛流産と密接
に類似する実験的N.caninumの子ヤギモデル
は、Lindsayら、1995、Am.J.Vet.
Res.,56,1176−1180、に示されてい
る。
【0005】T.gondiiおよびネオスポラのよう
な原生動物では、主要代謝酵素であるジヒドロフォレー
トレダクターゼ(DHFR)およびチミジレートシンタ
ーゼ(TS)が、2つの別個の酵素ドメイン:即ち、"
DHFRドメイン"および"TSドメイン":の同一タン
パク質分子上に帰属することが知られている。T.go
ndiiでは、DHFRおよびTSドメインは、〜70
アミノ酸の結合領域によって分けられると報告されてい
る(Roos、1993、J.Biol.Chem.,
268,6269−6280)。二価性タンパク質は、
欠失のための標的としての少なくとの一つの原生動物の
種内に提供されて、生ワクチンに用いるための弱毒化さ
れた株を作り出した。このように、Titusら、19
95、Proc.Natl.Acad.Sci.,9
2,10267−10271は、L.majorの毒性
株に対するワクチンに用いるためのdhfr−−ts−
ヌル変異細胞を主に作り出す、原生動物寄生虫であるリ
ーシュマニアからのDHFR−TS遺伝子の同族組換え
による標的化欠失について記載している。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明は、ネオスポラの
DHFR−TSタンパク質をコードするヌクレオチド配
列を含む単離されたポリヌクレオチド分子を提供する。
好ましい実施態様では、ネオスポラのDHFR−TSタ
ンパク質は、配列番号3のアミノ酸配列またはファージ
λNclHDFRTS(ATCC寄託番号20951
2)内に存在するDHFR−TS遺伝子によってコード
されるDHFR−TSタンパク質のアミノ酸配列を含
む。非制限の実施態様では、単離されたポリヌクレオチ
ド分子は、ネオスポラのDHFR−TS遺伝子のヌクレ
オチド配列を含む。好ましい実施態様では、ネオスポラ
のDNFR−TS遺伝子のヌクレオチド配列を含む単離
されたポリヌクレオチド分子は、配列番号1の約240
5から約8199迄のヌクレオチド配列、またはファー
ジλNclHDFRTS(ATCC寄託番号20951
2)内に存在するDHFR−TS遺伝子のヌクレオチド
配列と同一であるヌクレオチド配列を含む。さらなる非
制限の実施態様では、DHFR−TSタンパク質をコー
ドするポリヌクレオチド分子は、配列番号2のヌクレオ
チド配列を含む。
【0007】さらに、本発明は、配列番号1の約nt2
405から約nt8199迄に認められるDHFR−T
S遺伝子のヌクレオチド配列、またはファージλNcl
DHFRTS(ATCC寄託番号209512)内に存
在するDHFR−TS遺伝子のヌクレオチド配列、また
は配列番号2のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチ
ド分子と実質的に相同である単離されたポリヌクレオチ
ド分子を提供する。
【0008】さらに、本発明は、配列番号3のアミノ酸
配列、またはファージλNclHDFRTS(ATCC
寄託番号209512)内に存在するDHFR−TS遺
伝子によってコードされるDHFR−TSタンパク質の
アミノ酸配列を持つ、ネオスポラのDHFR−TSタン
パク質と実質的に相同であるポリヌクレオチドをコード
するヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチ
ド分子を提供する。
【0009】さらに、本発明は、前述の任意のポリヌク
レオチド分子の相当部分であるヌクレオチド配列からな
るポリヌクレオチド分子を提供する。好ましい実施態様
では、ポリヌクレオチド分子は、DHFR−TSタンパ
ク質のDHFRドメインあるいはTSドメインからなる
ポリペプチドのような、任意の前述のネオスポラのDH
FR−TSタンパク質のペプチドフラグメントまたは実
質的に相同なポリペプチド、をコードするヌクレオチド
配列からなる。
【0010】任意の前述のDHFR−TS関連ポリヌク
レオチド分子のヌクレオチド配列に加えて、本発明のポ
リヌクレオチド分子は、例えば、配列番号1に示す隣接
ヌクレオチド配列またはその部分の様な、N.cani
num内のDHFR−TS遺伝子に原位置で生来隣接し
ているヌクレオチド配列を、さらに含むことができる、
または代わりに前記ヌクレオチド配列からなることがで
きる。
【0011】さらに、本発明は、クローニングベクタ
ー、発現ベクターを含む本発明のポリヌクレオチド分子
のクローニングおよび発現するための組成物および方
法、ならびに前記ベクターを含む形質転換された宿主細
胞を提供する。非制限の実施態様では、本発明は、例え
ば、λNclDHFRTS(ATCC209512)と
名付けられたλファージクローニングベクターのよう
な、N.Caninum株NC−1のDHFR−TS遺
伝子のヌクレオチド配列を持つポリヌクレオチド分子を
含むクローニングベクターを提供する。
【0012】さらに、本発明は、ネオスポラのDHFR
−TSタンパク質のアミノ酸配列を含む部分的にまたは
実質的に精製されたタンパク質を提供する。非制限の実
施態様では、タンパク質は、配列番号3のアミノ酸配列
またはファージλNclDHFRTS(ATCC寄託番
号209512)に存在するDHFR−TS遺伝子によ
ってコードされるようなDHFR−TSタンパク質のア
ミノ酸配列を含む。さらに、本発明は、ネオスポラのD
HFR−TSタンパク質と実質的に相同であるポリヌク
レオチドを提供する。さらに、本発明は、例えば単離さ
れたネオスポラのDHFRドメインあるいはTSドメイ
ンからなるポリペプチドのような、前述の任意のタンパ
ク質のペプチドフラグメントまたはポリペプチドを提供
する。
【0013】さらに、本発明は、ネオスポラのDHFR
−TSタンパク質に対する、または前記タンパク質のペ
プチドフラグメントに対する抗体を提供する。
【0014】さらに、本発明は、例えば、配列番号1の
約nt2405から約nt8199迄に示されるよう
な、あるいはファージλNclDHFRTS(ATCC
寄託番号209512)内に存在するような、DHFR
−TS遺伝子のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチ
ド分子、または、任意の前記のヌクレオチド配列の相当
部分であるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
分子、の様な任意の前述のポリヌクレオチド分子を含む
が、一つあるいはそれより多くのヌクレオチドの欠失、
挿入および/または置換によって修飾されたか、また
は、ポリヌクレオチド分子が野生型DHFR−TS遺伝
子内に挿入された場合あるいは野生型DHFR−TS遺
伝子の部分を置換するために用いられた場合、結果とし
て、部分的に欠損したあるいは完全に欠損したタンパク
質をコードするか、またはタンパク質を全くコードしな
いか、あるいは生成しない、修飾されたDHFR−TS
遺伝子配列を生ずるポリヌクレオチド分子のような、
N.caninum内のDHFR−TS遺伝子に原位置
で生来隣接する一つあるいはそれより多くのヌクレオチ
ド配列からなる、遺伝子構築物を提供する。そのような
遺伝子構築物は、DHFR−TS遺伝子またはその部分
が部分的あるいは完全に無力になり、そうすることによ
って結果としてdhfr−またはts−またはdhfr
−−ts−変異体表現型(以後、まとめてdhfr−−
ts−表現型と呼ぶ)のいずれかを示す細胞を生ずる、
修飾されたネオスポラ細胞の作成に有用である。
【0015】さらに、本発明は、天然のDHFR−TS
遺伝子またはその部分が部分的あるいは完全に無力にな
った修飾された生きたネオスポラ細胞を提供する。好ま
しい実施態様では、ネオスポラ細胞は、本発明の遺伝子
構築物での相同組換えを通してのDHFR−TS遺伝子
の崩壊の結果として、dhfr−−ts−変異体表現型
を示す。そのような修飾された生きたネオスポラの細胞
は、ネオスポラ症から哺乳動物を防御するためのワクチ
ン組成物に有用である。さらに、本発明は、修飾された
生きたネオスポラ細胞を調製する方法を提供する。
【0016】さらに、本発明は、ネオスポラ症に対する
ワクチンであって、免疫学的に有効な量の本発明の修飾
された生きたネオスポラ細胞および獣医学的に許容しう
るキャリヤーを含む、上記のワクチンを提供する。さら
に、本発明は、ネオスポラ症、さらに所望であれば哺乳
動物を苦しめる可能性のある一つあるいはそれより多く
の疾病または病的状況から哺乳動物を防御するための組
み合わせワクチンであって、本発明の修飾された生きた
ネオスポラ細胞を含む、免疫学的に有効な量の第一成
分;哺乳動物を苦しめる可能性のある病気または病的状
況に対して予防応答を誘導する能力を持つ免疫学的に有
効な量の第二成分、および獣医学的に許容しうるキャリ
ヤーを含む、上記の組み合わせワクチンを提供する。さ
らに、本発明は、本発明のワクチンを製造する方法であ
って、免疫悪的に有効な量の本発明の修飾された生きた
ネオスポラ細胞を、獣医学的に許容しうるキャリヤーと
組み合わせることを含む、前記のワクチン製造方法を提
供する。さらに、本発明は、哺乳動物にネオスポラ症に
対するワクチンを接種する方法であって、本発明のワク
チンを哺乳動物に投与することを含む、前記のワクチン
接種方法を提供する。
【0017】さらに、本発明は、哺乳動物にネオスポラ
症に対するワクチンを接種するためのキットであって、
免疫学的に有効な量の本発明の修飾された生きたネオス
ポラ細胞を含む組成物を持つ第一の容器、および獣医学
的に許容しうるキャリヤーまたは希釈剤を含む第二の容
器を含む、前記のワクチン接種用キットを提供する。
【0018】
【発明の実施の形態】1.ネオスポラのDHFR−TS
をコードするポリヌクレオチド分子 本発明は、(i)ネオスポラDHFR−TS遺伝子のヌ
クレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチド分子
を含む、ネオスポラのDHFR−TSタンパク質をコー
ドするヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオ
チド分子;(ii)前述の任意のポリヌクレオチド分子と
実質的に相同である単離されたポリヌクレオチド分子;
(iii) ネオスポラのDHFR−TSタンパク質と実質
的に相同であるポリヌクレオチドをコードするヌクレオ
チド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド分子;お
よび(iv)前述の任意のネオスポラDHFR−TSタン
パク質のペプチドフラグメントまたは実質的に相同であ
るポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなる
ポリヌクレオチド分子を含む、前述の任意のポリヌクレ
オチド分子の相当部分であるヌクレオチド配列からなる
ポリヌクレオチド分子:を提供する。
【0019】本明細書中で用いられている、用語「遺伝
子」、「ポリヌクレオチド分子」、「ヌクレオチド配
列」、「コード配列」および「コード領域」は、一本鎖
または二本鎖のいずれかであることのできるDNAおよ
びRNAの両方の分子を含むつもりである。また、本明
細書中で用いられている、用語「遺伝子」、「コード配
列」および「コード領域」は、適当な調節エレメントを
持つ機能的に作用するアソシエーション内に置かれた場
合、宿主細胞発現系内で、ネオスポラのDHFR−TS
タンパク質に、またはネオスポラのDHFR−TSタン
パク質と実質的に相同であるポリペプチドに、または前
述のネオスポラDHFR−TSタンパク質のペプチドフ
ラグメントあるいは実質的に相同なポリペプチドに、転
写され翻訳される(DNA)か、または翻訳される(R
NA)ことのできる、ポリヌクレオチド分子をさすつも
りである。ポリヌクレオチド分子は、限定するわけでは
ないが、一つまたはそれより多くの原核生物の配列、真
核生物の配列、cDNA配列、ゲノムDNA配列(エキ
ソンまたはイントロン)、および化学的に合成されたD
NAおよびRNA配列、またはその任意の組み合わせを
含むことができる。
【0020】本発明の単離されたポリヌクレオチド分子
は、ネオスポラの任意の種または株からのヌクレオチド
配列を持つことができるが、好ましくは、N.cani
numの様なネオスポラの病原性の種からのヌクレオチ
ド配列である。本発明のポリヌクレオチド分子を単離す
るか、または誘導することのできるN.caninum
株の非制限の例としては、NC−1株があげられ、th
e AmericanType Culture Co
llection(ATCC)(12301Parkl
awn Drive,Rockville,MD 20
852,USA)、寄託番号CRL−12231の宿主
MARC−145のサル腎臓細胞内から得ることができ
る。また、NC−1株は、Dubeyら、1988、
J.Am.Vet.Med.Assoc.1983:1
259−63に記載されており、ここに参照として採用
される。別の方法として、本発明の実施に用いられるネ
オスポラの病原性株または種は、上記の文献に記載され
ているような標準的な単離技術を用いて、感染した動物
の器官、組織または体液から、単離することもできる。
【0021】本発明は、ネオスポラのDHFR−TSタ
ンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む単離され
たポリヌクレオチド分子を提供する。好ましい実施態様
では、ネオスポラのDHFR−TSタンパク質は、配列
番号3のアミノ酸配列またはファージλNclDHFR
TS(ATCC寄託番号209512)内に存在する様
なDHFR−TS遺伝子によってコードされたDHFR
−TSタンパク質のアミノ酸配列を含む。非制限の実施
態様では、単離されたポリヌクレオチド分子は、ネオス
ポラのDHFRーTS遺伝子のヌクレオチド配列を含
む。好ましい実施態様では、単離されたポリヌクレオチ
ド分子は、配列番号1の約nt2405から約nt81
99迄のヌクレオチド配列、またはファージλNclD
HFRTS(ATCC寄託番号209512)内に存在
する様なDHFR−TS遺伝子のヌクレオチド配列と同
一であるヌクレオチド配列を含む、N.caninum
NC−1株のDHFR−TS遺伝子のヌクレオチド配
列を含む。配列番号1内に於いて、DHFR−TS遺伝
子の予想されるDHFRドメインは、約nt2405か
ら約nt4664迄にコードされており、DHFR−T
S遺伝子の予想されるTSドメインは、約nt4665
から約nt8199までにコードされている。さらなる
非制限の実施態様では、DHFR−TSタンパク質をコ
ードするポリヌクレオチド分子は、配列番号2のヌクレ
オチド配列を含み、その中での予想されるDHFRドメ
インは、約nt1から約nt969迄にコードされてお
り、予想されるTSドメインは、約nt970から約n
t1836迄にコードされている。
【0022】さらに、本発明は、配列番号1の約nt2
405から約nt8199までに示されるようなDHF
R−TS遺伝子のヌクレオチド配列、またはファージλ
NclDHFRTS(ATCC寄託番号209512)
内に存在する様なDHFR−TS遺伝子のヌクレオチド
配列、または配列番号2のヌクレオチド配列、を含むポ
リヌクレオチド分子と実質的に相同である単離されたポ
リヌクレオチド分子を提供する。DHFR−TS−関連
ポリヌクレオチド分子をさす場合に用いられる用語「実
質的に相同」とは、(a)配列番号1の約nt2405
から約nt8199迄に示された、またはファージλN
clDHFRTS(ATCC寄託番号209512)あ
るいは配列番号2のヌクレオチド配列内に存在する様
な、DHFR−TS遺伝子のヌクレオチド配列のよう
に、同一のタンパク質をコードするが、遺伝子コードの
縮重によるヌクレオチド配列の一つまたはそれより多く
のサイレント変化を含む;または、(B)配列番号1の
約nt2405から約nt8199迄に示された、また
はファージλNclDHFRTS(ATCC寄託番号2
09512)あるいは配列番号2のヌクレオチド配列内
に存在する様な、DHFR−TS遺伝子のヌクレオチド
配列のように、同一のタンパク質をコードするヌクレオ
チド配列を持つポリヌクレオチド分子補体と、中程度の
ストリンジェント条件下、即ち、0.5M NaHPO
4 、7%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、1mM
EDTA中、65゜Cで、フィルター結合させたDN
Aとハイブリダイゼーションさせ、そして0.2xSS
C/0.1%SDS中、42゜Cで洗浄する前記条件下
でハイブリダイズし(Ausubelら編、1989、
Current Protocols in Mole
cular Biology、第一巻、Green P
ublishing Associates,In
c.、およびJohn Wiley & Sons,I
nc.,New York,2.10.3、を参照のこ
と)、そして本発明の実施に有用である:ヌクレオチド
配列を持つポリヌクレオチド分子を意味する。好ましい
実施態様では、実質的に相同なポリヌクレオチド分子
は、配列番号1の約nt2405から約nt8199迄
に示された、またはファージλNclDHFRTS(A
TCC寄託番号209512)あるいは配列番号2のヌ
クレオチド配列内に存在する様な、DHFR−TS遺伝
子のヌクレオチド配列のように、同一のタンパク質をコ
ードするヌクレオチド配列を持つポリヌクレオチド分子
補体と、高いストリンジェント条件下、即ち、0.5M
NaHPO4 、7% SDS、1mM EDTA
中、65゜Cでフィルター結合したDNAへハイブリダ
イゼーションさせ、そして0.1xSSC/0.1%S
DS中、68゜Cで洗浄する前記条件下でハイブリダイ
ズし(Ausubelら、1989、上記)、本発明の
実施に有用である。
【0023】本明細書中に用いられているように、ポリ
ヌクレオチド分子は、ポリヌクレオチド分子をネオスポ
ラに感染した動物からの体液または組織サンプル内のネ
オスポラ特異的ポリヌクレオチドの存在を検出するため
の診断用試薬として用いることができるか、または以下
の4節に記載のように、ポリヌクレオチドを、本発明の
修飾された生きたネオスポラ細胞の調製に有用な遺伝子
構築物を調製するために用いることができ、「本発明の
実施に有用」である。
【0024】本発明の実質的に相同なポリヌクレオチド
分子は、T.gondiiからのDHFR−TSタンパ
ク質をコードするヌクレオチド配列を持つポリヌクレオ
チド分子を含まない。
【0025】さらに、本発明は、配列番号3のアミノ酸
配列、またはファージλNclDHFRTS(ATCC
寄託番号209512)内に存在するようなDHFR−
TS遺伝子によってコードされるようなDHFR−TS
タンパク質のアミノ酸配列、を持つネオスポラのDHF
R−TSタンパク質を実質的に相同であるポリペプチド
をコードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリ
ヌクレオチド分子を提供する。ポリペプチドをさす用語
として本明細書中で用いられている、用語「実質的に相
同」とは、(a)配列番号3のアミノ酸配列、またはフ
ァージλNclDHFRTS(ATCC寄託番号209
512)内に存在するようなDHFR−TS遺伝子によ
ってコードされるようなDHFR−TSタンパク質のア
ミノ酸配列、を持つDHFR−TSタンパク質のアミノ
酸配列と、好ましくは少なくとも約70%、より好まし
くは少なくとも約80%、最も好ましくは少なくとも約
90%、同一であり、そして実質的に相同なポリペプチ
ドが本発明の実施に有用である;および/または(b)
配列番号3のアミノ酸配列、またはファージλNclD
HFRTS(ATCC寄託番号209512)内に存在
するようなDHFR−TS遺伝子によってコードされる
ようなDHFR−TSタンパク質のアミノ酸配列、を持
つネオスポラのDHFR−TSタンパク質内に存在する
一つまたはそれより多くのアミノ酸残基が、別のアミノ
酸残基と保守的に置換され、そしてポリペプチドが本発
明の実施に有用である:アミノ酸配列を持つポリペプチ
ドをさす。
【0026】保守的アミノ酸置換は、この技術分野では
周知である。例えば、ネオスポラのDHFR−TSタン
パク質の一つまたはそれより多くのアミノ酸配列を、類
似のチャージ、サイズまたは極性を持つアミノ酸残基と
保守的に置換することができ、その結果得られたポリペ
プチドは、本発明の実施への有用性を残していると、合
理的に期待できる。そのような置換をす繰り出すルール
は、その他にもいろいろありが、Dayhof,M.
D.,1978、Nat.Biomed.Res.Fo
und.,Washington,D.C.、第5巻、
増補3版、に記載されているそれらに含まれている。よ
り具体的には、保守的アミノ酸置換は、一般的には、ア
ミノ酸側鎖に関連性のあるアミノ酸ファミリー内で置換
する、アミノ酸の置換である。遺伝的にコードされるア
ミノ酸は、一般的には、4つのグループ:(1)酸性=
アスパラギン酸、グルタミン酸;(2)塩基性=リジ
ン、アルギニン、ヒスチジン;(3)非極性=アラニ
ン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェ
ニルアラニン、メチオニン、トリプトファン;および
(4)非電荷極性=グリシン、アスパラギン、グルタミ
ン、システイン、セリン、スレオニン、チロシンに分け
られる。フェニルアラニン、トリプトファンおよびチロ
シンは、芳香族アミノ酸としてもまた、分類される。任
意の特定のグループ内での一つまたはそれより多くの置
換、例えば、イソロイシンまたはバリンでのロイシンの
置換、または、グルタミン酸でのアスパラギン酸の置
換、またはセリンでのスレオニンの置換、または、構造
的に関連するアミノ酸残基によるその他の任意のアミノ
酸残基の置換は、一般的には、得られたポリペプチドの
本発明の実施への有用性に有意の影響を与えないであろ
う。
【0027】本明細書中に用いられているタンパク質ま
たはポリペプチドは、タンパク質またはポリペプチド
を、例えば、ネオスポラのDHFR−TSタンパク質の
2つの酵素的ドメインのいずれかを特異的に標的とする
阻害剤をスクリーニングすること、または全タンパク質
あるいはその中の2つの酵素ドメインの一つのいずれか
に対する抗体の力価を高めること、を含む任意の一つま
たはそれより多くの様々な目的に用いることができ、
「本発明の実施に有用」であると考えられる。
【0028】さらに、本発明は、前述の任意のポリヌク
レオチド分子の相当部分であるヌクレオチド配列からな
るポリヌクレオチド分子を提供する。本明細書中に用い
られている前述の任意のポリヌクレオチド分子の「相当
(substantial) 部分」とは、特定のDHFR−TS関連
ポリヌクレオチド分子の完全より少ないヌクレオチド配
列からなるが、DHFR−TS関連ポリヌクレオチド分
子のヌクレオチド配列の少なくとも約30%、より好ま
しくは少なくとも約50%を含み、さらに、有用性がポ
リヌクレオチド分子に関して上に定義されるように、本
発明の実施に有用である、ポリヌクレオチド分子を意味
する。好まし実施態様では、ポリヌクレオチド分子は、
前述の任意のネオスポラのDHFR−TSタンパク質の
ペプチドフラグメント、または、DHFR−TSタンパ
ク質のDHFRドメインあるいはTSドメインからなる
ポリペプチドのような実質的に相同なポリペプチド、を
コードするヌクレオチド配列からなる。本明細書中に用
いられている用語「ペプチドフラグメント」は、ネオス
ポラのDHFR−TSタンパク質の完全なアミノ酸配列
または実質的に相同なポリペプチドの一つまたはそれよ
り多くのサブ配列からなるポリペプチドをさし、そのサ
ブ配列は全長の分子より短い長さであり、さらに、有用
性がポリヌクレオチド分子に関して上に定義されるよう
に、得られたペプチドフラグメントは本発明の実施に有
用である。それ故、全長の分子を、"n"のアミノ酸残基
を持つとして現すと、そのペプチドフラグメントは、本
発明の実施に有用であるような、n−1のアミノ酸残基
を持つポリペプチドを含む、全長の配列より少ない任意
のポリペプチドであろう。本発明のペプチドフラグメン
トは、好ましくは、長さが少なくとも約10のアミノ酸
残基である。非制限の実施態様では、ペプチドフラグメ
ントは、ネオスポラのDHFR−TSタンパク質のDH
FRドメインまたはTSドメインからなる。
【0029】ペプチドフラグメントがDHFR−TSタ
ンパク質または実質的に相同のポリペプチドの一つより
多くのサブ配列からなる、そのペプチドフラグメントを
コードするポリペプチド分子を作ることができ、その結
果、いくつかのサブ配列を共に持ち、また、全長のタン
パク質またはポリペプチド内では隣接していない相当す
るサブ配列をペプチドフラグメント内で互いに隣接させ
ることができる。さらに、ペプチドフラグメントをコー
ドするポリヌクレオチド分子を作ることができ、そうす
ることによって、ペプチドフラグメントを含む異なるサ
ブ配列が、全長のタンパク質またはポリペプチドと比較
して互いに異なる相対順序に配列されるか、または、コ
ードするペプチドフラグメントは特定のサブ配列の複数
コピーを含むことができる。例えば、ポリヌクレオチド
分子は、DHFRドメインあるいはTSドメインのいず
れかの複数のコピー、そこから選択されたエピトープ領
域、またはその組み合わせ、をコードすることができ
る。
【0030】さらに、本発明は、天然のタンパク質のサ
ブ配列を互いに関連させて再配列した全長(n)のポリ
ペプチドをコードするポリヌクレオチド分子、さらに長
さが最大で約2nのポリペプチドを含む、天然タンパク
質より長いポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
分子、を含む。そのようなポリペプチドは、タンパク質
全体、個々のドメイン、エピトープ領域またはそのいく
つかの組み合わせのいずれかの複数コピーを含むことが
できる。
【0031】前述の任意のDHFR−TS関連ポリヌク
レオチド分子のヌクレオチド配列に加えて、本発明のポ
リヌクレオチド分子は、さらに、例えば、配列番号1に
示した隣接するヌクレオチド配列、またはその部分のよ
うな、N.caninum内でDHFR−TS遺伝子に
原位置で生来隣接する配列から選択された一つまたはそ
れより多くのヌクレオチド配列を含むことができる、ま
たは、からなることができる。
【0032】さらに、本発明のポリヌクレオチド分子の
配列は、増幅技術のプライマーとして、または病気の差
別的診断のプローブとして用いることができ、さらに本
明細書の開示によって当業者らが容易にデザインするこ
とのできる、オリゴヌクレオチド分子の構築に必要な情
報を提供する。そのようなオリゴヌクレオチドは、好ま
しくは、少なくとも約15ヌクレオチドの長さである。
増幅は、例えば、Innisら編、1995、PCR
Strategies,Academic Pres
s,Inc.,San Diego;および、Erli
ch編、1992、PCR Technology,O
xford University Press,Ne
w York(文献はここに参照として採用する)、に
記載されているポリメラーゼ鎖反応(PCR)の様な標
準技術を適用することによって、適当に設計されたオリ
ゴヌクレオチドを用いて行うことができる。診断に関し
ては、本発明のオリゴヌクレオチドをPCR増幅に用い
て、脳組織、肺組織、胎盤組織、血液、脳脊髄液、粘
膜、尿、用水、等のような、動物組織または体液のサン
プル内のネオスポラ特異的ポリヌクレオチド分子の存在
を検出することができる。特異的増幅による生成物は、
ネオスポラに感染しているという診断を支持するものと
して用いられ、それに対して、増幅生成物が存在しない
ことは、感染していないということを指摘するであろ
う。一般的には、PCRに関しては、適当に設計された
プライマー、増幅されるヌクレオチド配列を含む鋳型、
ならびに適当なPCR酵素およびバッファーを含む混合
物、標準的なプロトコールに従って調製し処理して、鋳
型であるネオスポラのDHFR−TSポリヌクレオチド
分子またはその部分を増幅する。この技術分野で知られ
ているその他の増幅技術、例えばリガーゼ鎖反応、もま
た、代わりに用いることができる。
【0033】「ポリヌクレオチド分子」に続く引例のす
べては、 特に示されない限り、配列番号1の約nt2
405から約nt8199迄に示される、あるいはファ
ージλNclDHFRTS(ATCC寄託番号2095
12)内に存在する、DHFR−TS遺伝子のヌクレオ
チド配列、または配列番号2のヌクレオチド配列、を含
むポリヌクレオチド分子;配列番号1の約nt2405
から約nt8199迄に示されるDHFT−TS遺伝子
のヌクレオチド配列、あるいはファージλNclDHF
RTS(ATCC寄託番号209512)内に存在する
DHFR−TS遺伝子のヌクレオチド配列、を含むポリ
ヌクレオチド分子と実質的に相同であるポリヌクレオチ
ド分子;配列番号3のアミノ酸配列、あるいはファージ
λNclDHFRTS(ATCC寄託番号20951
2)内に存在するDHFR−TS遺伝子をコードするよ
うなDHFRーTSタンパク質のアミノ酸配列、を持つ
ネオスポラのDHFR−TSタンパク質と実質的に相同
であるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含
むポリヌクレオチド分子;および、前述の任意のネオス
ポラのDHFR−TSタンパク質のペプチドフラグメン
トまたは実質的に相同なポリペプチドをコードするヌク
レオチド配列からなるポリヌクレオチド分子を含む、前
述の任意のポリヌクレオチド分子の相当部分であるヌク
レオチド配列からなるポリヌクレオチド分子:を含む、
本発明の前述の任意のポリヌクレオチド分子を含むつも
りである。
【0034】「DHFR−TSタンパク質」、「タンパ
ク質」または「ポリペプチド」に続くすべての引例は、
特に示さない限り、配列番号3のアミノ酸配列、または
ファージλNclDHFRTS(ATCC寄託番号20
9512)に存在するDHFR−TS遺伝子によってコ
ードされるDHFRーTSタンパク質のアミノ酸配列、
を持つタンパク質;前述の任意のタンパク質と実質的に
相同であるペプチド;および前述の任意のタンパク質ま
たはポリペプチドのペプチドフラグメント:を含むつも
りである。
【0035】本発明のポリヌクレオチドおよびオリゴヌ
クレオチド分子の作成ならびに操作は、熟練者の内にあ
あるが、さらに、その他にもいろいろあるが、Mani
atisら、1989、Molecular Clon
ing.A Laboratory Manual,C
old Spring Harbor Laborat
ory Press.Cold Spring Har
bor,N.Y.;Ausubelら、1989、上
記;Sambrookら、1989、Molecula
r Cloning,A Laboratory Ma
nual、第二版、Cold Spring Harb
or Laboratory Press,Cold
Spring Harbor,N.Y.;Innis
ら、1995、上記;およびErlich、1992、
上記(これらはここに参照として採用する)に記載の既
知の遺伝子技術に従って行うこともできる。
【0036】2.組換え発現系 2.1.クローニングベクターおよび発現ベクター さらに、本発明は、本発明のポリヌクレオチド分子を含
む、組換えクローニングベクターおよび発現ベクターを
提供する。非制限の実施態様では、本発明によって提供
されるクローニングベクターは、N.caninum
NC−1株の完全なDHFR−TS遺伝子のヌクレオチ
ド配列を持つポリヌクレオチド分子を含む、ファージλ
NclDNFRTS(ATCC寄託番号209512)
である。
【0037】好ましくは、本発明の発現ベクターが構築
され、そうすることによって、ポリヌクレオチド分子
は、転写および翻訳に必要な一つまたはそれより多くの
調節エレメントと共に、機能的に作用するアソシエーシ
ョン内にある。発現ベクターは、形質転換された宿主細
胞のような発現系内で用いられて、組み換えられて発現
したDHFR−TSタンパク質を生成する。
【0038】本明細書中に用いられている、用語「調節
エレメント」は、限定するつもりはないが、誘導および
非誘導プロモーター、エンハンサー、オペレーター、な
らびに、ポリヌクレオチドコード配列の発現の運転およ
び/または調節を提供するこの技術分野で知られている
その他のエレメント、をコードするヌクレオチド配列を
含む。本明細書中に用いられている、DHFR−TSコ
ード配列は、DHFR−TSコード配列の転写またはそ
のmRNAの翻訳またはその両方を有効に調節し提供す
る、一つまたはそれより多くの調節エレメントと共に、
「機能的に作用するアソシエーション」内にある。
【0039】適当な調節エレメントを持つ機能的に作用
するアソシエーション内に特定のコード配列を含む発現
ベクターを構築する方法は、この技術分野では周知であ
り、これらは、本発明を実施するために用いることがで
きる。そのような方法には、その他にもいろいろある
が、Maniatisら、1989、上記;Ausub
elら、1989、上記;およびSambrookら。
1989、上記:に記載の、インビトロでの組換え技
術、合成技術、およびインビボでの遺伝子組換えが含ま
れる。
【0040】本発明のポリヌクレオチド分子のコード配
列を発現するために用いることのできる様々な発現ベク
ターが、この技術分野で知られており、その他にもいろ
いろあるが、細菌または酵母を形質転換するためのDH
FR−TSコード配列を含む組換えバクテリオファージ
DNA、プラスミドDNAおよびコスミドDNA発現ベ
クター;ならびに、例えば、昆虫細胞にトランスフェク
ションするためのDHFR−TSコード配列を含むバキ
ュロウイルス、または、哺乳動物の細胞にトランスフェ
クションするためのDHFR−TSコード配列を含むア
デノウイルスまたは牛痘の様な、組換えウイルス発現ベ
クター:が含まれる。
【0041】本発明のポリヌクレオチド分子を含むよう
に工作できる典型的な原核生物発現ベクターには、その
他にもいろいろあるが、pUC8、pUC9、pBR3
22およびpBR329(Biorad Labora
tories,Richmond,CA)、ならびにp
PLおよびpKK233(Pharmacia,Pis
cataway,NJ)が含まれる。
【0042】本発明のポリヌクレオチド分子を含むよう
に工作できる典型的な真核生物の発現ベクターには、そ
の他にもいろいろあるが、エクジソン誘導の哺乳動物発
現系(Invitrogen,Carisbad,C
A)、シトメガロウイルスのプロモーター−エンハンサ
ーに基づく系(Promega,Madison,W
I;Stratagene,La Jolla,CA;
Invitrogen)、およびバキュロウイルス−基
本発現系(Promega)が含まれる。
【0043】これらおよびその他のベクターの調節エレ
メントは、それらの強度および特異性を変えることがで
きる。用いられる宿主/ベクター系によって、数多くの
任意の適当な転写および翻訳エレメントを用いることが
できる。例えば、哺乳動物細胞系にクローニングする場
合、哺乳動物細胞のゲノムから単離されたプロモーター
(例えばマウスのメタロチオネインプロモーター)、ま
たはこれらの細胞内で増殖するウイルスから単離された
プロモーター(例えばワクチニアウイルス7.5Kプロ
モーターあるいはモノネイ(Moloney) マウスサルコーマ
ウイルスのロングターミナルリピート(long terminal r
epeat)、を用いることができる。また、組換えDNAま
たは合成技術によって得られたプロモーターを用いる
と、挿入された配列の転写を提供することもできる。さ
らに、あるプロモーターからの発現を、特定の誘発物質
の存在下で高めることもできる(例えばメタロチオネイ
ンプロモーターでの亜鉛およびカドミウムイオン)。
【0044】転写調節領域またはプロモーターの非制限
の例としては、細菌では、β−galプロモーター、T
7プロモーター、TACプロモーター、λ左および右プ
ロモーター、trpおよびlacプロモーター、trp
−lac融合プロモーター等;酵母では、ADH−Iお
よび−IIプロモーターのような解糖酵素プロモーター、
GPKプロモーター、PGIプロモーター、TRPプロ
モータ等;哺乳動物細胞では、SV40早期および晩期
プロモーター、アデノウイルスの主要晩期プロモーター
等;が含まれる。
【0045】特定の開始シグナルもまた、挿入されたD
HFR−TSコード配列の充分な翻訳には必要とされ
る。典型的には、これらのシグナルには、ATG開始コ
ドンおよび隣接配列が含まれる。開始コドンそれ自身お
よび隣接配列を含む本発明のポリヌクレオチド分子を適
当な発現ベクター内に挿入する場合、さらなる翻訳調節
シグナルは必要とされないであろう。しかしながら、コ
ード配列の一部分のみを挿入する場合、ATG開始コド
ンを含む外因性の翻訳調節シグナルを必要とするであろ
う。これらの外因性翻訳調節シグナルおよび開始コドン
は、天然および合成の両方の様々な起源から得ることが
できる。さらに、開始コドンは、挿入物全体のインフレ
ーム翻訳を確立するために、DHFR−TSコード領域
のリーディングフレームと共にフェーズ内に存在しなく
てはならない。
【0046】融合タンパク質発現ベクターを用いると、
DHFR−TS融合タンパク質を発現させることができ
る。精製された融合タンパク質を用いると、DHFR−
TSタンパク質に対する抗血清の力価を高めること、D
HFR−TSタンパク質の生化学的性質を研究するこ
と、酵素活性の異なるDHFR−TS融合タンパク質を
加工すること、または発現したDHFR−TSタンパク
質の同定あるいは精製を助けること、ができる。可能性
のある融合タンパク質発現ベクターには、制限するつも
りはないが、β−ガラクトシダーゼおよびtrpE融合
物、マルトース−結合タンパク質融合物、グルタチオン
−S−トランスフェラーゼ融合物ならびにポリヒスチジ
ン融合物(キャリヤー領域)をコードする配列採用ベク
ターが含まれる。この技術分野で知られている方法を用
いると、そのようなDHFR−TS融合タンパク質をコ
ードする発現ベクターを構築することができる。
【0047】上記のように、融合タンパク質は、発現し
たタンパク質の精製を助けるのに有用であることができ
る。例えば、DHFR−TS−マルトース結合タンパク
質融合物は、アミロース樹脂を用いて精製することがで
き;DHFR−TS−グルタチオン−S−トランスフェ
ラーゼ融合タンパク質は、グラタチオン−アガロースビ
ーズを用いて精製することができ;そして、DHFR−
TS−ポリヒスチジン融合物は、二価のニッケル樹脂を
用いて精製することができる。代わりの方法として、キ
ャリヤータンパク質またはペプチドに対する抗体を、融
合タンパク質のアフィニティークロマトグラフィー精製
に用いることもできる。例えば、モノクローナル抗体の
標的エピトープをコードするヌクレオチド配列を、調節
エレメントと共に機能的に作用するアソシエーション内
で、発現ベクター内に工作し位置付けることができ、そ
の結果、発現したエピトープはDHFR−TSタンパク
質と融合する。例えば、親水性マーカーペプチドであ
る、FLAGTMエピトープタグ(Internati
onal Biotechnologies In
c.)をコードするヌクレオチド配列は、標準的技術に
よって、例えばDHFR−TSタンパク質のカルボキシ
末端に相当する部位で、発現ベクター内に挿入すること
ができる。次いで、発現したDHFR−TSタンパク質
−FLAGTMエピトープ融合生成物は、商品として入
手できる抗−FLAGTM抗体を用いて、検出しアフィ
ニティー精製することができる。
【0048】また、発現ベクターを加工して、特定のプ
ロテアーゼ切断部位をコードするポリリンカー配列を含
ませることができ、その結果、発現したDHFR−TS
タンパク質を、特定のプロテアーゼで処置することによ
ってキャリヤー領域または融合パートナーから遊離させ
ることができる。例えば、融合タンパク質ベクターに
は、その他にもいろいろあるが、トロンビンまたはファ
クターXa切断部位をコードするDHA配列を含ませる
ことができる。
【0049】DHFR−TSコード領域から上流、およ
びDHFR−TSコード領域と共にリーディングフレー
ム内にある、シグナル配列を、既知の方法によって発現
ベクター内に加工すると、発現したタンパク質の転送(t
rafficking) および分泌に関わることができる。シグナ
ル配列の非制限の例には、その他にもいろいろあるが、
α−ファクター、イムノグロブリン、外膜タンパク質、
ペニシリナーゼおよびT−細胞レセプターからのそれら
が含まれる。
【0050】本発明の発現ベクターと共にトランスフォ
ームまたはトランスフェクトされた宿主細胞の選択を助
けるために、発現ベクターは、さらにレセプター遺伝子
生成物またはその他の選択可能マーカー用コード配列を
含むように、加工することができる。好ましくは、その
ようなコード配列は、上記のように、調節エレメントコ
ード配列と共に、機能的に作用するアソシエーション内
に存在することができる。本発明に有用なレポーター遺
伝子は、この技術分野では周知であり、その他にもいろ
いろあるが、クロラムフェニコールアセチルトランスフ
ェラーゼ(CAT)、緑色蛍光タンパク質、ホタルのル
シフェラーゼ、およびヒトの成長ホルモンをコードする
それらが含まれる。選択可能マーカーをコードするヌク
レオチド配列は、この技術分野では良く知られており、
抗生物質または抗−代謝物に耐性を授ける遺伝子生成物
をコードする、または栄養素要求性を満たすそれらを含
む。そのような配列の例としては、その他にもいろいろ
あるが、チミジンキナーゼ活性、または、メトトレキセ
ート、アンピシリン、カナマイシン、クロラムフェニコ
ール、ゼオシン、ピリメタミン、アミノグリコシド、あ
るいはヒグロマイシン、に対する耐性をコードする配列
が含まれる。
【0051】2.2.宿主細胞の形質転換 本発明は、本発明のポリヌクレオチド分子または組換え
発現ベクターを含む形質転換された宿主細胞およびそれ
から誘導された細胞系を提供する。本発明の実施に有効
な宿主細胞は、真核生物であるが、原核生物細胞も好ま
しい。そのような形質転換された宿主細胞には、限定す
るわけではないが、その他にもいろいろあるが、組換え
バクテリオファージDNA、プラスミドDNAまたはコ
スミドDNA発現ベクターで形質転換された細菌;ある
いは、組換え発現ベクターで形質転換された酵母のよう
な微生物:または、バキュロウイルスのような組換えウ
イルス発現ベクターに感染させた昆虫細胞、あるいは、
例えばアデノウイルスあるいはワクシニアウイルスのよ
うな組換えウイルス発現ベクターに感染させた哺乳動物
細胞のような動物細胞、が含まれる。
【0052】細菌細胞は、宿主細胞として用いることが
できる。例えば、DH5α株(ATCC,Rockwi
lle,MD.USA、寄託番号31343またはSt
ratagene,La Jolla,CAより入手可
能)の様な大腸菌の株を、用いることができる。真核生
物宿主細胞には酵母細胞が含まれるが、マウス、ハムス
ター、ウシ、サル、またはヒトの細胞系からのような、
哺乳動物細胞もまた、有効に用いることができる。本発
明の組換えタンパク質の発現に用いることのできる真核
生物宿主細胞の例としては、チャイニーズハムスターの
卵巣(CHO)細胞(例えば、ATCC寄託番号CCL
−61)、NIHスイスマウス胎児細胞NIH/3T3
(例えばATCC寄託番号CRL−1658)が含まれ
る。Madin−Darbyウシ腎臓(MDBK)細胞
(ATCC寄託番号CCL−22)ならびにチミジンキ
ナーゼ−欠乏細胞、例えば、L−M(TK)(ATCC
寄託番号CCL−1.3)およびtk'−ts13(A
TCC寄託番号CRL−1632)が含まれる。
【0053】本発明の組換え発現ベクターは、好ましく
は、細胞の実質的に均一な培地の一つまたはそれより多
くの宿主細胞内に形質転換またはトランスフェクトされ
る。発現ベクターは、一般的には、その他にもいろいろ
あるが、例えばリン酸カルシウム沈殿、塩化カルシウム
処理、ミクロインジェクション、エレクトロポレーショ
ン、組換えウイルスとの接触によるトランスフェクショ
ン、リポソーム−仲介トランスフェクション、DEAE
−デキストラントランスフェクション、形質導入、接
合、または微小発射射撃、の様な、既知の技術に従って
宿主細胞内に導入される。形質転換株の選択は、組換え
発現ベクターと関連する、選択可能マーカー(例えば抗
生物質耐性)を発現する細胞を選択することによるよう
な、標準的方法によって行うことができる。
【0054】ひとたび、発現ベクターが宿細胞内に導入
されると、本発明のポリヌクレオチド分子の組込みおよ
び維持は、宿主細胞のゲノムまたはエピソームのいずれ
かの内で、例えばサザンハイブリダイゼーション分析、
制限酵素分析、逆転写酵素PCR(rt−PCR)を含
むPCR分析、または期待されたタンパク質の生成を検
出する免疫学的アッセイによる、標準的技術によって、
確認することができる。
【0055】本発明のポリヌクレオチド分子を含むおよ
び/または発現する宿主細胞は、(i)DNA−DN
A、DNA−RNAまたはRNA−アンチセンスRNA
ハイブリダイゼーション;(ii)「マーカー」遺伝子機
能の存在の検出; (iii)例えば、宿細胞内でのDHF
R−TS特異的mRNA転写物の、発現によって測定さ
れる転写レベルの評価;または(iv)例えば、イムノア
ッセイによる、または、例えば、この技術分野で周知の
NADPH酸化によって触媒されるジヒドロフォレート
のテトラヒドロフォレートへの転化のようなDHFR酵
素活性、あるいは、例えばデオキシウリジンモノホスフ
ェートのデオキシチミジンモノホスフェートへの転化の
ようなTS酵素活性、の検出による、成熟ポリペプチド
生成物の存在の検出:を含む、この技術分野で周知の少
なくとの4つの任意の一般的研究方法によって、同定す
ることができる。
【0056】2.3,組換えポリペプチドの発現および
精製 ひとたび、本発明のポリヌクレオチド分子が適当な宿主
細胞内に安定に導入されると、形質転換された宿主細胞
をクローンで繁殖させ、その結果得られた細胞を、コー
ドされたDHFR−TSタンパク質の最大生成を導く条
件下で増殖させる。そのような条件には、典型的には、
形質転換された細胞の高密度増殖が含まれる。発現ベク
ターが誘導プロモーターを含む場合、例えば、温度シフ
ト、栄養素の涸渇、無償性誘導物質の付加(例えばイソ
プロピル−β−D−チオガラクトピラノシド(IPT
G)のような炭水化物類似体)、過剰な代謝副産物の蓄
積、またはその類似条件等のような、適当な誘導条件
が、発現の誘導に必要な条件として用いられる。
【0057】発現したDHFR−TSタンパク質が宿主
細胞の内側に残留する場合には、細胞を集菌し、溶解
し、そして、生成物は、例えば、4゜Cで、またはプロ
テアーゼ阻害剤存在下で、またはその両方で、のような
タンパク質分解を最少にするこの技術分野で既知の抽出
条件下で溶解物から精製した。発現したDHFR−TS
タンパク質が宿主細胞から分泌される場合には、栄養素
の涸渇した培地を単純に収集し、タンパク質をそこから
単離することができる。
【0058】発現したDHFR−TSタンパク質は、制
限するわけではないが、一つまたはそれより多くの以下
の方法;硫酸アンモニウム沈殿、サイズ分画、イオン交
換クロマトグラフィー、HPLC、密度遠心分離、およ
びアフィニティークロマトグラフィー:を含む適当な標
準的方法を用いて、細胞溶解物または培養液より精製す
ることができる。発現したDHFR−TSタンパク質
が、酵素活性(例えば、NADPH酸化によって触媒さ
れるようなジヒドロフォレートをテトラヒドロフォレー
トに転化する能力(DHFR)、またはデオキシウリジ
ンモノフォスフェートをデオキシチミジンモノホスフェ
ートに転化する能力(TS)のいずれか)を示す場合に
は、この技術分野で知られているような適当なアッセイ
を用いることによって、調製物の純度の増加を精製方法
のそれぞれの段階でモニターすることができる。発現し
たタンパク質が生理活性を持たない場合、例えば、サイ
ズ、またはDHFR−TSタンパク質に特異的な抗体と
の反応性、または融合タグの存在、を基にして、検出す
ることができる。本発明を実施するに当たって使用する
ためには、組換え発現したDHFR−TSタンパク質
は、培地内に生成されても、あるいは細胞溶解物内に存
在しても、非精製状態であっても、または、それから部
分的にあるいは実質的に精製されていても良い。
【0059】従って、本発明は、DHFR−TSタンパ
ク質の調製方法であって、組み換え発現ベクターで形質
転換された宿主細胞を培養し、そして細胞培養液からD
HFR−TSタンパク質を回収することを含み、前記組
み換え発現ベクターがDHFR−TSタンパク質の発現
を誘導する条件下で一つあるいはそれより多くの調節エ
レメントと共に機能的に作用するアソシエーション内に
本発明のポリヌクレオチド分子を含む、前記のDHFR
−TSタンパク質の調製方法を提供する。
【0060】さらに、本発明は、配列番号3に示したア
ミノ酸配列を含む単離されたネオスポラのDHFR−T
Sタンパク質、またはファージλNclDHFRTS
(ATCC209512)に存在するDHFR−TS遺
伝子によってコードされるDHFR−TSタンパク質の
アミノ酸配列を含むタンパク質、それと実質的に相同な
ポリペプチド、ならびに前述のタンパク質およびポリペ
プチドのペプチドフラグメントを提供する。例えば、本
発明のペプチドフラグメントは、ネオスポラのDHFR
−TSタンパク質のDHFRドメインまたはTSドメイ
ンからなることができる。ネオスポラDHFR−TSタ
ンパク質の予想されるDHFRドメインのアミノ酸配列
を、配列番号3のアミノ酸残基約1からアミノ酸残基約
323までに示され;予想されるTSドメインのアミノ
酸配列は、アミノ酸残基約324からアミノ酸残基約6
12迄である。
【0061】3.DHFR−TSタンパク質の用途 ひとたび、充分な純度のDHFR−TSタンパク質が得
られたならば、SDS−PAGE、サイズ排除クロマト
グラフィー、アミノ酸配列分析、生理活性等を含む標準
的方法によって、その特徴を調べることができる。さら
に、DHFR−TSタンパク質を、親水性分析(例え
ば、HoppおよびWoods、1981、Proc.
Natl.Acad.Sci.USA.,78,382
4を参照のこと)または類似のソフトウェアアルゴリズ
ムを用いて特徴を調べると、親油性領域および親水性領
域を同定することができる。構造分析を行うと、特定の
二次構造をとるDHFR−TSタンパク質の領域を同定
することもできる。X線結晶学(Engstrom、1
974、Biochem.Exp.Biol.,11,
7−13)、コンピューターモデリング(Flette
rickおよびZoller編、1986、Curre
nt Communications inMolec
ular Biology,Cold Spring
HarborLaboratory,Cold Spr
ing Harbor,NY)、および核磁気共鳴(N
MR)のような生物物理学的方法を用ると、DHFR−
TSタンパク質と任意のその基質との間の相互作用の部
位をマッピングし研究することができる。これらの研究
から得られた情報を用いると、より効果的な欠失変異体
およびワクチン組成物を設計する、またはインビボでネ
オスポラのDHFR−TSタンパク質のDHFRドメイ
ンあるいはTSドメインのいずれかの酵素活性を特異的
にブロックすることのできる治療化合物あるいは薬理化
合物を設計あるいは選択することができる。
【0062】本発明の単離されたDHFR−TSタンパ
ク質、組換え体またはその他の点で、様々な目的に有用
である。例えば、タンパク質は、DHFRドメインまた
はTSドメインのいずれかの酵素活性を特異的にブロッ
クする阻害剤をスクリーニングするために用いることが
できる。そのようなスクリーニング方法は、この技術分
野では周知である。また、本発明のDHFR−TSタン
パク質を抗原として用いると、下記の方法に従って、タ
ンパク質と特異的に反応する、ポリクローナル抗体また
はモノクローナル抗体のいずれかを作り出すことができ
る。そのような抗体は、例えば、天然または組換えのD
HFR−TSタンパク質を精製するためのアフィニティ
ー試薬として、または動物からの細胞、組織あるいは体
液サンプル内のネオスポラ特異的DHFR−TSタンパ
ク質の存在を例えばELISAあるいはウエスタンブロ
ットアッセイによって検出するための診断用試薬とし
て、有用である。
【0063】抗体は、既知の方法を用いてDHFR−T
Sタンパク質に対して作り出すことができる。ブタ、ウ
シ、ウマ、ウサギ、ヤギ、ヒツジおよびマウスを含む様
々な宿主動物を、部分的または実質的に精製した抗原で
免疫化することができる。下記のようなアジュバントを
用いると、抗体の生成を強化することができる。ポリク
ローナル抗体は、免疫化された動物の血清から得られ、
標準的技術を用いて抗−DHFR−TSタンパク質特異
性について試験することができる。別の方法として、D
HFR−TSタンパク質に対するモノクローナル抗体
は、抗体分子の生成のために提供される任意の技術を用
いて、培養液内の連続細胞系によって、調製することが
できる。これらには、限定するつもりはないが、Koh
lerおよびMilstein,Nature、197
5、256、495ー497に最初に記載されたハイブ
リドーマ技術;ヒトのB細胞ハイブリドーマ技術(Ko
sborら、1983、Immunology Tod
ay,4,72;Coteら、1983、Proc.N
atl.Acad.Sci.USA,80,2026−
2030);およびEBV−ハイブリドーマ技術(Co
leら、1985、Monoclonal Antib
odies and Cancer Therapy,
Alan R.Liss,Inc.,77−96)が含
まれる。別の方法として、一本鎖抗体の生成に関して記
載された技術(合衆国特許第4,946,778号を参
照のこと)を適用して、DHFR−TS抗原−特異的一
本鎖抗体を作り出すことができる。これらの文献は、参
照としてここに採用される。
【0064】DHFR−TS抗原に関する特異的結合部
位を含む抗体フラグメントもまた、本発明内に包含さ
れ、既知の技術によって作成することができる。そのよ
うなフラグメントには、限定するわけではないが、完全
な抗体分子のペプシン消化によって生み出すことのでき
るF(ab')2 フラグメント、およびF(ab')2
フラグメントのジスルフィド架橋を減少させることによ
って生み出すことのできるFabフラグメントが含まれ
る。別の方法としては、Fab発現ライブラリーを構築
する(Huseら、1989,Science,24
6,1275−1281)と、DHFR−TS抗原に対
して所望の特異性を持つFabフラグメントの急速な同
定を可能にすることができる。
【0065】モノクローナル抗体および抗体フラグメン
トを生成する技術は、この技術分野では周知であり、さ
らに、その他にもいろいろあるが、Harlowおよび
Lane,1988、Antibodies:A La
boratory Manual,Cold Spri
ng Harbor Laboratory;ならび
に、J.W.Goding、1986、Monoclo
nal Antibodies;Principles
and Practice,AcademicPre
s,London(ここに参照として採用される)に記
載されている。
【0066】4.ネオスポラのDHFR−TS遺伝子の
標的化変異 4.1.遺伝子構築物 本発明のポリヌクレオチド分子の開示に基づいて、ネオ
スポラのDHFR−TS遺伝子を無力化にする用途に、
遺伝子構築物を調製することができる。ネオスポラのD
HFR−TS遺伝子は、現在知られているまたは今後開
発されるであろう遺伝子技術と組み合わせて、適当に設
計した遺伝子構築物を用いて無力化することができる。
例えば、ネオスポラのDHFR−TS遺伝子は、(a)
DHFR−TS遺伝子の全部または一部分を欠失する;
または(b)DHFR−TS遺伝子の一部分を異なるヌ
クレオチド配列と置き換える;または(c)ネオスポラ
またはその他の起源からのヌクレオチド配列を含むこと
のできる一つまたはそれより多くのヌクレオチド、ある
いはオリゴヌクレオチド分子、あるいはポリヌクレオチ
ド分子をDHFR−TS遺伝子内に挿入する:ように機
能する、本発明の遺伝子構築物を用いて無力化すること
ができる。
【0067】DHFR−TS遺伝子を無力化したネオス
ポラ細胞は、DHFR−TS遺伝子の無力化が、DHF
R−TS遺伝子がそのように無力化されなかったネオス
ポラの同一株の細胞と比較して、無力化されたDHFR
−TS遺伝子を持つネオスポラ細胞の病原性を減少させ
る、および、無力化されたDHFR−TS遺伝子を持つ
そのようなネオスポラ細胞をワクチン組成物、特に修飾
された生ワクチンに用いて、ネオスポラ症に対する防御
応答を哺乳動物に誘導することができる、本発明の実施
に有用である。
【0068】非制限の実施態様では、野生型DHFR−
TS遺伝子またはその一部分のヌクレオチド配列を突然
変異したネオスポラDHFRーTS遺伝子またはその部
分と置き換えることによって、野生型ネオスポラDHF
R−TS遺伝子を無力化するために、本発明の遺伝子構
築物を用いることができる。そのような遺伝子構築物に
用いるための突然変異したネオスポラのDHFR−TS
遺伝子配列は、誤りがちなPCRの使用、またはカセッ
ト突然変異、を含む任意の様々な既知の方法によって、
作り出すことができる。例えば、オリゴヌクレオチド−
関連突然変異は、例えば、配列の特定領域内にフレーム
シフトまたは終止コドンを誘導する、明確な方法で野生
型のネオスポラDHFR−TS遺伝子のORF配列を変
えるために用いることができる。別の方法として、また
はさらなる方法として、本発明の遺伝子構築物に用いる
突然変異したヌクレオチド配列は、一つあるいはそれよ
り多くのヌクレオチド、オリゴヌクレオチド分子または
ポリヌクレオチド分子内に挿入することによって、また
は、一つあるいはそれより多くのヌクレオチド、オリゴ
ヌクレオチド分子またはポリヌクレオチド分子でネオス
ポラのDHFR−TS遺伝子の一部分を置換することに
よって、調製することができる。そのようなオリゴヌク
レオチド分子またはポリヌクレオチド分子は、任意の天
然発生の起源から得ることができる、または合成するこ
とができる。挿入された配列は、単純にネオスポラのD
HFRーTS遺伝子のリーディングフレームを崩壊する
ために提供することができるか、または選択可能マーカ
ーのような外因性遺伝子生成物もまたコードすることが
できる。また、ランダム突然変異は、本発明の遺伝子構
築物に用いるための突然変異したネオスポラのDHFR
−TS遺伝子配列を作り出すために用いることができ
る。ランダム突然変異は、例えば、ネオスポラのDHF
R−TS遺伝子を持つ細胞を蛍光照射あるいはX線に、
またはN−メチル−N'−ニトロソグアニジン、メタン
スルホン酸エチル、亜硝酸あるいはナイトロジェンマス
タードに晒して、次にDHFR−TS遺伝子内に突然変
異を持つ細胞を選択することによるような、現在知られ
ている、または今後開発される任意の技術によって、起
こすことができる。例えば、Ausubel、198
9、上記の突然変異技術のレビューを参照のこと。
【0069】上に定義したように、本発明の実施に有用
である修飾されたネオスポラ細胞を生成するための突然
変異は、ORF内あるいはプロモーター領域内、または
遺伝子あるいはORFに隣接するその他の任意の配列内
に含まれるネオスポラのDHFR−TS遺伝子内のいず
れかに起こすことができる。そのようなネオスポラ細胞
は、ネオスポラDHFRーTS遺伝子によってコードさ
れるタンパク質の修飾型を生成する、またはそのような
タンパク質を全く生成しない、変異株であることができ
る。好ましい実施態様では、そのようなネオスポラ細胞
は、dhfr−、またはts− 、またはDHFR−−
TS−変異体表現型を示す(以後、まとめてdhfr−
−ts−表現型を呼ぶ)。さらに、そのようなネオスポ
ラ細胞は、ヌル、条件変異体または漏出変異体であるこ
とができる。
【0070】別の方法として、本発明の遺伝子構築物
は、それ自身遺伝子のコード領域からのヌクレオチド配
列がほとんどまたは全く存在しない、配列番号1に示す
隣接配列から選択されたような、ネオスポラDHFR−
TS遺伝子またはORFと原位置で生来隣接するヌクレ
オチド配列を含むことができる。そのような遺伝子構築
物は、例えば、全遺伝子またはORFを欠失するため
に、有用であろう。
【0071】好ましい実施態様では、本発明の遺伝子構
築物は、ネオスポラDHFR−TS遺伝子を無力化する
ために用いることのできるポリヌクレオチド分子であっ
て、(a)N.caninumからのDHFR−TSタ
ンパク質をコードするヌクレオチド配列のようにその他
の点で同一であるヌクレオチド配列を持つが、そのヌク
レオチド配列がさらに一つまたはそれより多くの無力化
変異を含む、ポリヌクレオチド分子;または(b)原位
置でネオスポラのDHFR−TS遺伝子のORFと生来
隣接するヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド分
子:を含む、前記のポリヌクレオチド配列を含む。ひと
たび、ネオスポラの一つの株の細胞内に形質転換された
場合、遺伝子構築物のポリヌクレオチド分子は、例えば
相同組換えによって、ネオスポラのDHFR−TS遺伝
子を特異的に標的化し、それによって、遺伝子あるいは
その部分を置換するか、または遺伝子内へ挿入されるか
のいずれかである。この組換えの結果として、ネオスポ
ラの特定の株に対してその他の点で未変性のネオスポラ
のDHFR−TS遺伝子を無力化にする。
【0072】寄生原生動物内で相同遺伝子の置換を実行
する方法は、この技術分野で知られており、その他にも
いろいろあるが、CruzおよびBeverley、1
990、Nature,348,171−173;Cr
uzら、1991、Proc.Natl.Acad.S
ci.USA,88,7170−7174;Donal
dおよびRoos、1994、Mol.Bioche
m.Parasitol.,63,243−253;お
よび、Titusら、1995、Proc.Natl.
Acad.Sci.USA,92,10267−102
71、に記載されており、ここにその全体を参照として
採用する。
【0073】相同組換えを通して標的化遺伝子を突然変
異させるため、遺伝子構築物は、好ましくは、上記のよ
うな変異したヌクレオチド配列を含む、環状または線状
のいずれかのプラスミドである。非制限の実施態様で
は、変異した配列の少なくとも約200ヌクレオチドを
用いると、本発明の遺伝子構築物は相同組換えでネオス
ポラのDHFR−TS遺伝子を特異的に標的化するが、
より短い長さのヌクレオチドもまた有効であることがで
きる。さらに、好ましくは、プラスミドは、構築され、
その結果、天然のネオスポラのDHFR−TS遺伝子の
配列をコードする調節エレメントと機能的に作用するア
ソシエーション内でネオスポラのゲノム内に挿入される
であろう、レポーター遺伝子生成物またはその他の選択
可能マーカーをコードするさらなるヌクレオチド配列を
含む。本発明の実施に用いることのできるレポーター遺
伝子は、この技術分野では周知であり、さらに、その他
にもいろいろあるが、CAT、緑色蛍光タンパク質、お
よびβ−ガラクトシダーゼをコードするそれらを含む。
選択可能マーカーをコードするヌクレオチド配列もま
た、この技術分野では周知であり、抗生物質または抗代
謝生成物に耐性を授ける遺伝子生成物をコードするそれ
ら、または栄養要求性を与えるそれら、を含む。そのよ
うな配列の例としては、ピリメタミン耐性、または(ア
ミノグリコシドに対して耐性を授ける)ネオマイシンホ
スホトランスフェラーゼ、または(ヒグロマイシンに対
して耐性を授ける)ヒグロマイシンホスホトランスフェ
ラーゼ、をコードするそれらが含まれる。
【0074】本発明の遺伝子構築物を創造するために用
いることのできる方法は、この技術分野では周知であ
り、その他にもいろいろあるが、Maniatisら、
1989、上記;Ausubelら、1989、上記;
およびSambrookら、1989、上記:に記載さ
れたような、インビトロでの組換え技術、合成技術、お
よびインビボでの遺伝子組換えが、含まれる。
【0075】ネオスポラ細胞は、例えば、エレクトロポ
レーションのような、既知の技術に従って、本発明の遺
伝子構築物で形質転換またはトランスフェクトすること
ができる。形質転換株の選択は、構築物と関連する選択
可能なマーカーを発現する細胞を選択する様に、標準的
技術を用いて実行することができる。成功裡に組換えら
れ、そして特定の標的遺伝子を無力化された、形質転換
株の同定は、サザンブロット分析、あるいはDHFR−
TSタンパク質をコードするmRNA転写物の欠如を検
出するためのノーザン分析のような遺伝子分析によっ
て、または、例えば免疫学的分析によって決定されるよ
うな、減少した病原性ような新規の表現型あるいはDH
FR−TSタンパク質を欠損した細胞の出現によって、
またはそのいくつかの組み合わせによって、遂行するこ
とができる。
【0076】本発明に従って修飾することのできるネオ
スポラの細胞は、好ましくは、タキゾイトであるが、代
わりにブラディゾイトまたは卵母細胞であることもでき
る。ネオスポラのライフサイクルのある段階における細
胞は二倍体であるが、タキゾイトは一倍体である。この
ように、タキゾイトでは、特定のネオスポラ遺伝子を崩
壊するために、ただ一回の組換えが成功裡に行われるこ
とを要求するのみであるため、適当な変異体表現型を発
現する修飾されたネオスポラ細胞の生産にタキゾイトを
用いることが好ましい。一方、ネオスポラの二倍体細胞
では、2つのアレレをそれぞれの遺伝子について崩壊し
なければならない。このことは、2つの異なる選択可能
マーカーを持つ遺伝子構築物で、第一のアレレ、次いで
第二のアレレを順番に標的化することによって、成し遂
げることができる。
【0077】さらなる非制限の実施態様では、本発明の
遺伝子構築物は、さらに、動物に感染することのできる
ネオスポラあるいは異なる病原体からの異なる遺伝子ま
たはコード領域を含むことができ、その遺伝子またはコ
ード領域は、本発明の修飾された生きたネオスポラ細胞
を持つワクチンの接種時に、動物内の別々の異なった防
御免疫応答を誘導するに有用な抗原をコードする。この
さらなる遺伝子またはコード領域は、さらに、修飾され
た生きたネオスポラ細胞からコードされた抗原の分泌を
誘導する単一配列を含むように加工することができ、そ
れによって抗原がワクチン接種された動物の免疫システ
ムに提示される事を可能にする。
【0078】このように、本発明は、DHFRーTS遺
伝子が崩壊された、修飾された生きたネオスポラ細胞を
提供する。さらに、本発明は、修飾されたネオスポラの
生細胞を調製する方法であって;(a)本発明の遺伝子
構築物でネオスポラの細胞を形質転換し;(b)DHF
R−TS遺伝子が遺伝子構築物によって崩壊された、形
質転換細胞を選択し;そして(c)ネオスポラ症から哺
乳動物を防御するワクチン内で用いることのできる段階
(b)のそれらの細胞の細胞間から選択する:ことを含
む、前記の修飾されたネオスポラの生細胞を調製する方
法を提供する。
【0079】4.2.ネオスポラ細胞の培養 本発明に用いられるネオスポラ細胞は、この技術分野で
記載されている既知技術に従って、インビトロで、タキ
ゾイトの任意の受容細胞系、好ましくは哺乳動物細胞
系、に感染させることによって、培養し、そして保持す
ることができる。ネオスポラのタキゾイトを培養するこ
とのできる哺乳動物細胞には、その他にもいろいろある
が、例えばヒトの包皮繊維芽細胞(Lindayら、1
993、Am.J.Vet.Res.,54,103−
106)、ウシの心筋大動脈内皮細胞(Marshら、
1995、上記)、ウシの単球(Lindsayおよび
Dubey、1989、上記)およびサルの腎臓細胞が
含まれる。例えば、N.caninumのタキゾイト
は、単層のHs68ヒト包皮繊維芽細胞(ATCC寄託
番号CRL−1635)(Lindsayら、199
3、上記)内で培養することができ;および、本発明に
用いられる、N.caninum NC−1株のタキゾ
イトを感染させた、MARC145サル腎臓細胞は、A
TCCに寄託する(寄託番号12231)。ブラディゾ
イトも同様に培養し操作することができる。
【0080】哺乳動物細胞培養物を増殖させ、ネオスポ
ラに感染させた細胞培養物は、この技術分野で記載され
ている任意の様々な型の培地内に、維持することができ
る。例えば、N.caninumのタキゾイトに感染さ
せたウシの心筋大動脈内皮細胞の静置単層培養物は、1
0%(v/v)の熱で不活性化したウシ胎児血清(FB
S)または成熟したウマの血清(ES)、2mM L−
グルタミン、50U/mlペニシリン、および50μg
/mlストレプトマイシンを追加したDulbecco
の最少必須培地(DMEM,Gibco Labora
tories,N.Y.)内で増殖させることができる
(Conradら、1993、上記)。Hs68のヒト
の内皮繊維芽細胞の単層は、2%(v/v)FBS、
1.0mMピルビン酸ナトリウム、1x104U/ml
ペニシリン、1x104μg/mlストレプトマイシ
ン、5x10−2mMの2−メルカプトエタノールおよ
び0.3mg/mlのL−グルタミンを含むRPMI
1640(維持培地)内で、維持することができる。ネ
オスポラに感染したHs68ヒト包皮繊維芽細胞の単層
培養物は、同一培地内に維持することができるが、FB
Sは10%に増加させる(増殖培地)。
【0081】ヒトの細胞のネオスポラに感染した単層の
培養物は、典型的には、例えば、37゜Cおよび5%C
O2 のような、標準組織培養条件下で、維持される。
タキゾイトは、典型的には、培地内の哺乳動物細胞の7
0−90%が感染された場合、感染していない単層培地
に継代される。70−90%の感染は、標準技術を用い
て顕微鏡で定量することができる。タキゾイトは、感染
した哺乳動物細胞培養物から、任意の標準技術を用いて
宿主細胞を溶解し、そして、例えばろ過または遠心分離
によって、タキゾイトを収集することによって、収集す
ることができる。
【0082】本発明に従って修飾され、そしてdhfr
−−ts−表現型を示す、ネオスポラ細胞は、上記のよ
うに、チミジンを含む培地内で、哺乳動物細胞内で、培
養することができる。
【0083】5.抗−ネオスポラワクチン 本発明は、例えば前述のdhfr−−ts−ヌル変異体
の様な、免疫学的に有効な量の修飾された生きたネオス
ポラ細胞および獣医学的に許容しうるキャリヤーを含
む、ネオスポラ症に対するワクチンを提供する。
【0084】さらに、本発明は、例えば、上記の方法に
従って調製されたdhfr−−ts−表現型を示すそれ
らのような、修飾された生きた細胞を含み、そして免疫
学的に有効な量の修飾された生きた細胞を、獣医学的に
許容しうるキャリヤーと共に、哺乳動物への投与に適当
な形で結合させる、ネオスポラ症から哺乳動物を防御す
るワクチンの製造方法を提供する。
【0085】ここに用いられるように、用語「免疫学的
に有効な量」とは、哺乳動物の種の一員に投与した場
合、一回の投与後または複数回の投与後のいずれかに、
ネオスポラ症に対する予防応答を誘導する能力を持つ本
発明の修飾ネオスポラ生細胞のその量をさす。
【0086】用語「予防応答を誘導する能力を持つ」
は、ここではワクチン接種された動物にネオスポラ症か
らの防御を提供する、抗体または細胞仲介免疫応答のい
ずれかを含む、ワクチン接種に応答する動物内の任意の
免疫に基づく応答の誘導または強化を含むように、広く
用いられている。ここに用いられているような、用語
「予防応答」および「防御」は、ネオスポラ症の絶対的
防御またはネオスポラ症原因病原体による感染の絶対的
防御だけではなく、例えば、ワクチン接種した動物をワ
クチン接種していない同種の感染動物と比較した場合、
形成速度あるいは一つまたはそれより多くの組織内に形
成される障害の絶対数の任意の検出可能な減少、また
は、流産の発生、または妊娠した哺乳動物からその胎児
への、あるいは哺乳動物の親からその子孫への感染の伝
達の任意の検出可能な減少を含む、そのような病原体に
よる感染程度または速度の任意の検出可能な減少、また
は、病気の激しさあるいは病原体による感染の結果起こ
る任意の症状または病状の任意の検出可能な減少をもさ
す。
【0087】ワクチンは、単に、培地中に放出されるか
あるいは哺乳動物宿主細胞内に残留しているかのいずれ
かで、またはその両方の組み合わせで、哺乳動物内に直
接投与される、修飾された生きたネオスポラ細胞を含む
培養液のアリコートを含むことができるか、または、代
わりに、投与経路に適当なような、この技術分野で既知
のそれらから選択された獣医学的に許容しうるキャリヤ
ーと組み合わせた修飾された生きたネオスポラ細胞も含
むことができる。修飾された生きたネオスポラ細胞の少
なくともある程度の生命力がワクチン組成物中に保持さ
れていることが好ましい。例えば、本発明のワクチン組
成物を、標準バッファー、キャリヤー、安定剤、希釈
剤、保存剤、および/または溶解剤を用いる認められた
慣習に従って、調合することができ、そして、持続した
放出を容易にするように調合することもできる。希釈剤
は、水、塩類溶液、デキストロース、エタノール、グリ
セロールおよびその類似物等を含むことができる。等張
にするための添加物は、その他にもいろいろあるが、塩
化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビ
トール、およびラクトースを含むことができる。安定化
剤は、その他にもいろいろあるが、アルブミンを含むこ
とができる。修飾された生きたワクチンに特に有用であ
る、適当なその他のワクチンベヒクルおよび添加剤は、
当業者らに知られているか、または、明らかになるであ
ろう。例えば、Remington'sPharmac
euitical Scince、第18版、199
0、Mack Publishing(ここに参照とし
て採用される)を参照のこと。
【0088】本発明のワクチンに用いることのできる修
飾された生きたネオスポラ細胞は、好ましくは、タキゾ
イトであるが、代わりに、ブラディゾイトあるいは卵母
細胞、またはその組み合わせであることもできる。
【0089】さらに、ワクチン組成物中の修飾された生
きたネオスポラ細胞の少なくともある程度の生命力が維
持される限りにおいて、本発明のワクチンは、例えば、
その他にもいろいろあるが、アジュバントまたはサイト
カイン、の様な一つまたはそれより多くのさらなる免疫
活性調節成分を含むことができる。本発明のワクチン内
で用いることのできるアジュバントの非制限例は、RI
BIアジュバントシステム(Ribi Inc.,Ha
milton,MT)、ミョウバン、水酸化アルミニウ
ムゲルのような鉱物ゲル、例えば、フロイントの完全ア
ジュバントおよび不完全アジュバント、ブロックコポリ
マー(CytRx,Atlanta,GA)、QS−2
1(Cambridge Biotech Inc.,
Cambridge MA)およびSAF−M(Chi
ron,EmeryvilleCA)、AMPHIGE
N(登録商標)アジュバント、サポニン、Quil A
またはその他のサポニンフラクション、モノホスホリル
リッピッドA、およびAvridine脂質アミンアジ
ュバントのような、水中油エマルジョン、油中水エマル
ジョンを含む。本発明のワクチンに有用な水中油エマル
ジョンの具体的な非制限例は、修飾されたSEAM62
およびSEAM1/2調合物を含む。修飾されたSEA
M62は、5%(v/v)スクアレン(Sigma)、
1%(v/v)SPAN(登録商標)85界面活性剤
(ICI Surfactants)、0.7%(v/
v)TWEEN(登録商標)80界面活性剤(ICI
Sufractants)、2.5%(v/v)エタノ
ール、200μg/ml Quil A、100μg/
mlコレステロール、および0.5%(v/v)レシチ
ンを含む水中油エマルジョンである。修飾SEAM1/
2は、5%(v/v)スクアレン、1%(v/v)SP
AN(登録商標)85界面活性剤、0.7%(v/v)
Tween 80界面活性剤、2.5%(v/v)エタ
ノール、100μg/ml Quil A、および50
μg/mlコレステロールを含む水中油エマルジョンで
ある。ワクチン内に含ませることのできるその他の免疫
活性調節因子薬剤には、例えば、一つまたはそれより多
くのインターロイキン、インターフェロン、またはその
他の既知のサイトカインが含まれる。ワクチンは、凍結
して保存され、投与前に解凍されることができる。
【0090】ワクチン組成物中に、少なくともある程度
の修飾された生きたネオスポラ細胞の生命力が維持され
ている限りにおいて、本発明のワクチンは、所望によ
り、修飾された生きたネオスポラ細胞を持続的に放出す
るように、調合することができる。そのような持続的放
出調合物の例としては、例えば、ポリ(乳酸)、ポリ
(乳酸−グリコール酸)、メチルセルロース、ヒアルロ
ン酸、コラーゲンおよびその類似物等のような、生物適
合性ポリマーの複合物と組み合わされた、修飾ネオスポ
ラ生細胞が含まれる。構造、選択、および薬剤配達ベヒ
クル内での崩壊されるポリマーの使用は、A.Domb
ら、1992、Polymers forAdvanc
ed Technologies,3,279−292
(ここに参照として採用される)を含む、様々な文献内
で考察されている。医薬調合物内でのポリマーの選択お
よび使用についてのさらなるガイダンスは、M.Cha
sinおよびR.Langer編、1990、"Bio
degradable Polymers as Dr
ug Delivery Systems",Drug
and the Pharmaceuitical
Sciences、第45巻、M.Dekker,NY
(これもまたここに参照として採用される)のテキスト
内に見出すことができる。代わりに、またはさらに、ワ
クチン組成物中に少なくともある程度の修飾ネオスポラ
生細胞の生命力が維持されている限りにおいて、修飾ネ
オスポラ生細胞を、ミクロカプセル化して、投与および
効率を改善することができる。抗原をミクロカプセル化
する方法は、この技術分野では周知であり、例えば、合
衆国特許第3,137,631号;合衆国特許第3,9
59,457号;合衆国特許第4,205,060号;
合衆国特許第4,606,940号;合衆国特許第4,
744,933号;合衆国特許第5,132,117
号;国際特許WO95/28227(そのすべてをここ
に参照として採用する):に記載の技術が含まれる。
【0091】また、リポソームを用いると、ワクチン組
成物中に少なくともある程度の修飾ネオスポラ生細胞の
生命力が維持されている限りにおいて、本発明の修飾ネ
オスポラ生細胞の持続的放出を提供することができる。
リポソーム組成物の作成および使用に関する詳細は、そ
の他にもいろいろあるが、合衆国特許第4,016,1
00号;合衆国特許第4,452,747号;合衆国特
許第4,921,706号;合衆国特許第4,927,
637号;合衆国特許第4,944,948号;合衆国
特許第5.008.050号;および、合衆国特許第
5.009,956号(そのすべてをここに参照として
採用する):内に、認めることができる。
【0092】さらに、本発明は、ネオスポラ症、さら
に、所望するならば、哺乳動物を苦しめうる一つまたは
それより多くのその他の疾病または病状、から哺乳動物
を防御する組み合わせワクチンであって、修飾ネオスポ
ラ生細胞を含む免疫学的に有効な量の第一の成分;哺乳
動物を苦しめる疾病または病状に対する予防応答を誘導
する能力を持つ免疫学的に有効な量の第二の成分;およ
び獣医学的に許容しうるキャリヤーを含む、上記の組み
合わせワクチンを提供する。
【0093】組み合わせワクチンの第二の成分は、この
技術分野で知られているように、ネオスポラ症あるいは
哺乳動物の種の構成員を苦しめるその他の疾病あるいは
病状のいずれかに対して予防応答を誘導する能力に基づ
いて、選択される。得られたワクチン組成物内で少なく
ともある程度の修飾ネオスポラ生細胞の生命力が維持さ
れる限りにおいて、特定の哺乳動物種内でワクチン組成
物として有用であることが知られている任意の免疫原性
組成物を、組み合わせワクチンの第二の成分に用いるこ
とができる。そのような免疫原性組成物には、限定する
つもりはなく、その他にもいろいろあるが、ウシのヘル
ペスウイルス(ウシの感染性鼻気管炎と同義)、ウシの
呼吸合包体ウイルス、ウシのウイルス性下痢ウイルス、
パラインフルエンザウイルスI、II、または III型、レ
プトスピラ種、カンピロバクター種、黄色ブドウ状球
菌、ストレプトコッカス アガラクチアエ(Streptococc
us agalactiae)、マイコプラズマ種、クレプシェラ種、
サルモネラ種、ロタウイルス、コロナウイルス、狂犬
病、パスツレラ ヘモリティカ(Pasteurella hemolytic
a)、パスツレラ ムルトシダ(+asteurella multosida)
、クロストリジウム種、テタナス毒素、大腸菌、クリ
プトスポリディウム(Cryptosporidium) 種、珠虫種、ト
リコモナス種、およびその他の真核生物寄生虫、からな
る群より選択される病原体に対す津防御を提供するそれ
らが含まれる。
【0094】本発明の組み合わせワクチンは、ワクチン
組成物内の細胞の生命力が維持される限りにおいて、さ
らに、例えば、上記のような、アジュバントまたはサイ
トカインを含む、一つまたはそれより多くのさらなる免
疫化性調節成分を含むことができる。組み合わせワクチ
ンの抗原を、凍結型で保存することができ、また投与す
る前に解凍することもできる。
【0095】本発明は、さらに、ネオスポラ症から哺乳
動物を防御する方法であって、免疫学的に有効な量の本
発明の修飾ネオスポラ生細胞、および獣医学的に許容し
うるキャリヤーを含むワクチンを哺乳動物に投与するこ
とを含む、前記の防御方法を提供する。ワクチンは、好
ましくは、非経口で、例えば、皮下または筋肉内注射の
いずれかによって、投与される。しかしながら、代わり
に、腹腔内あるいは静脈内注射によって、または、例え
ば、経口、鼻腔内、直腸内、膣内、眼内を含む、その他
の経路によって、またはそのような経路の組み合わせに
よって、さらにまたこの技術分野で既知の遅滞性放出装
置によって、ワクチンを投与することもできる。当業者
らは、選択された経路に従って、ワクチン組成物を調合
する方法を知っているであろう。
【0096】有効投与量は、影響をモニターしながら、
低投与量の修飾ネオスポラ生細胞で始め、次いで、投与
量を増加させる、慣用的手段で決定することができる。
動物当たりの最適投与量を決定する場合には、多数のフ
ァクターを考慮に入れることができる。これらの中で主
要なものは、種、大きさ、年齢および動物の一般的状
態、動物内のその他の薬剤の存在、動物にワクチン接種
するネオスポラの特定の種または株の毒性、およびその
類似因子である。好ましくは、正確な投与量は、その他
の動物研究から得られた結果を考慮した後に、選択され
る。
【0097】ワクチンレジメンもまた、上記の因子に基
づいて選択することができる。本発明のワクチンは、例
えば、その他の動物の間のネオスポラ症の発症のタイミ
ングを含む、様々な要素に依存して、特定の動物の生存
中の任意の時間に投与することができる。ワクチンは、
例えば、ネオスポラに関連する先天性疾病または流産か
ら防御するための生前ワクチンのように、離乳期あるい
はより若い動物に、またはより成熟した動物にも、投与
することができる。有効な防御には、最初のワクチン接
種のみを必要とすることができるか、または、一回また
はそれより多くの追加ワクチン接種もまた必要であるか
も知れない。適当な免疫防御に到達しているか否かを検
出する一つの方法は、ワクチン接種後の動物内のセロコ
ンバージョンおよび抗体力価を定量することである。好
ましくは、ワクチン接種のタイミングおよび追加接種の
数は、もしあれば、すべての関連要素の分析に基づい
て、獣医によって決定される。
【0098】ワクチン内の修飾ネオスポラ生細胞の量
は、好ましくは、約1x103 から約1x108 /
ml、より好ましくは、約1x105から約1x107
/ml、の範囲である。適当な投与量の大きさは、約
0.5mlから約10ml、より好ましくは、約1ml
から約5ml、の範囲である。
【0099】本発明のワクチンは、ネオスポラ症から哺
乳動物を防御するのに有用である。本明細書中で用いら
れるように、用語「哺乳動物」は、その他にもいろいろ
あるが、イヌ、ウシ、ヤギ、ヒツジおよびウマを含む、
本発明のワクチンを用いるとネオスポラ症から防御され
うる任意の哺乳動物の種をさす。ワクチンは、妊娠した
哺乳動物および妊娠前哺乳動物の両方を防御するのに有
用である。
【0100】さらに、本発明は、ネオスポラ症に対する
ワクチンを哺乳動物に接種するためのキットであって、
免疫学的に有効な量の本発明の修飾ネオスポラ生細胞を
含む第一の容器、および獣医学的に許容しうるキャリヤ
ーまたは希釈剤を含む第二の容器を含む、前記のワクチ
ン接種用キットを提供する。キットの修飾生細胞は、凍
結型で保存し、投与前に解凍することができる。
【0101】生物学的物質の寄託 以下の生物学的物質を、American Tupe
Culture Collection(ATCC)
(12301 Parklawn Drive,Roc
kville,MD,20852,USA)に1997
年12月3日に寄託し、以下の寄託番号を割り当てられ
た。
【0102】 ファージλNclDHFRTS 寄託番号209512 すべての特許、特許明細書、および上記の文献は、その
全体をここに参照として採用する。
【0103】本発明は、本発明の個々の態様の単なる説
明として意図されたものであり、記載された具体的実施
態様によって、範囲を制限されるものではない。機能的
に等価な組成物および方法は本発明の範囲内にある。実
際、ここに示され記載された本発明の修飾に加えて、本
発明の様々な修飾は、前述の記載から当業者らに明らか
になるであろう。そのような修飾は、添付クレイムの範
囲内に入るつもりである。
【0104】
【実施例】以下の実施例は、実例となるのみであって、
本発明の範囲を制限することを意図するものではない。
【0105】ネオスポラDHFR−TS遺伝子の分離 実施例1.N.caninumのDHFRドメインのエ
キソン1の増幅 T.gondiiのDHFR−TS遺伝子のエキソン1
のDNA配列の5'および3'末端に特異的な20−塩基
長のオリゴヌクレオチドプライマーを、T.gondi
iのDHFR−TS遺伝子の公表された配列(Roo
s、1993、J.Biol.Chem.,268,6
269−6280)に基づいて、設計し合成した。N.
caninum NC−1株のゲノムDNAは、製造者
らによって提供された試薬およびプロトコールを用い
て、GNOMETMキット(Bio101,La Jo
lla,CA)を用いて、調製された。PCRは、0.
5μgのゲノムDNA;120pmolのそれぞれのプ
ライマー、Tgdhfrexon1−5'(5'−ATG
CAGAAACCGGTGTGTCT)(配列番号4)
およびTgdhfrexon1−3'(5'−AGGGA
AGAGGAAACGACGAT)(配列番号5);
2.5mMのそれぞれのdATP、dGTP、dCTP
およびdTTP(Perkin−Elmer,Norw
alk,CT);PCRバッファー(Perkin−E
lmer);ならびに1.5UのAMPLITAQTM
DNAポリメラーゼ(Perkin−Elmer)
で、遂行した。PCRサイクルは、94゜Cで1分間を
1サイクル、および94゜Cで1分間、55゜Cで1分
間、72゜Cで1分間を29サイクル、行った。
【0106】約0.3kbのPCR生成物を得、さらに
T4DNAリガーゼを用いてさらに処理することなく、
pCRIIベクター(Invitrogen,Caris
bad,CA)内にクローン化した。クローン化された
−0.3kbフラグメントは、ジデオキシ鎖終止配列決
定法によって配列決定され、配列は、関連するT.go
ndiiのDHFR−TSエキソン1配列と>85%相
同であると決定された。
【0107】実施例2.ネオスポラDHFR−TS遺伝
子のクローニングおよび配列決定 N.caninum NC−1株のライブラリーを、バ
クテリオファージベクターλDASHII(Strat
agene,La Jolla,CA)で作成した。上
からの〜0.3kbフラグメントを、α−32P−dC
TPで放射能標識し、そして、プラークハイブリダイゼ
ーションによって、おおよそ5x105ファージクロー
ンを、標識したフラグメントとの反応性について、スク
リーニングした。反応性クローンに富むスクリーニング
を3回繰り返した後、〜0.3kb配列と反応する12
のファージクローンを同定した。
【0108】λ DNA単離システム(Qiagen,
Chatsworth,CA)を製造者らのプロトコー
ルに従って用い、バクテリオファージλクローンDNA
を、12の陽性クローンの内の3つから作成した。λN
clDHFRTS(ATCC寄託番号209512)
(また、4C13またはλCY50と名付けられる)と
名付けられた、λファージクローンの内の一つからのD
NAを、Notlで消化し、Sambrookら、19
89、上記に記載の方法に従って、サブクローン化した
11kbのDNAフラグメントを遊離させた。以下のオ
リゴヌクレオチド;DHFR−TS配列;5'−CCC
CTCGTGGACCGGCTGAATA(配列番号
6);5'−TCCGTGCGTGCCAAGAGAC
TG(配列番号7);5'−ATGGAGATGGCG
ATGGGAGGAC(配列番号8);および5'−A
GTATGTACACGAAGCCTCAAT(配列番
号9):と名付けられた:を用いて、11kbのDNA
フラグメントを含むプラスミドサブクローンのDNA上
で、PCRを行った。オリゴヌクレオチドは、以下の組
み合わせ:配列番号6および8;配列番号6および9;
配列番号7および8;ならびに配列番号7および9:で
PCRに用いられた。PCRにより、11kbフラグメ
ント内にネオスポラDHFR−TS遺伝子の存在を示唆
する生成物が得られた。11kbフラグメントを含むプ
ラスミドサブクローンのさらなる制限分析から、−1.
5kbの一つのNotl部位内に非対称のHind III
部位の存在が示された。次いで、ジデオキシ鎖終止配列
決定法を応用したプライマーウオーキングによって、一
方の末端のNotl部位から他方末端のHind III部
位まで(〜9.6kb)、DNA配列を決定した。この
ようにして得られたDNA配列を、コンピューターソフ
トウェアプログラムDNASTARTM(DNASTA
R Inc,Madison,WI)を用いて、分析し
た。
【0109】上の配列決定したフラグメントの長さは、
9603bp(配列番号1)であり、N.caninu
m NC−1株からのDHFR−TS遺伝子全体の配列
を含む。ネオスポラDHFRーTS遺伝子のヌクレオチ
ド配列は、エキソンおよびイントロンの所在を予想する
ためにT.gondiiのDHFR−TS遺伝子ならび
にDHFRおよびTSドメインの境界の公表された配列
のそれと、比較された。ネオスポラのDHFR−TS遺
伝子は、以下のように10のエキソンおよび9のイント
ロンを含む;エキソン1、<2405−2724;エキ
ソン2、3212−3348;エキソン3、3925−
4262;エキソン4、4491−4737;エキソン
5、5214−5307;エキソン6、5678−57
50;エキソン7、6129−6270;エキソン8、
685−6777;エキソン9、7264−7574;
およびエキソン10、8116−>8199:と予想さ
れる。共通スプライスシグナルは、イントロン−エキソ
ン結合部に存在する。予想されたDHFRドメインは、
公表されたT.gondiiのDHFR−TS配列との
構造類似性に基づいて、約nt2405から約nt46
64迄であり;予想されたTSドメインは、約nt46
65から約nt8199迄である。
【0110】N.caninum NC−1株からのD
HFR−TSタンパク質をコードする予想されたオープ
ンリーディングフレーム(ORF)は、長さ1,839
bp(配列番号2)である。予想されたDHFRドメイ
ンをコードするORFは、約nt1から約nt969迄
である。予想されたTSドメインをコードするORF
は、約nt970から約nt1836迄である。N.c
aninum NC−1株のDHFR−TSタンパク質
の推定されるアミノ酸配列は、長さが612のアミノ酸
(配列番号3)である。予想されたDHFRドメインを
含むと推定されるアミノ酸配列は、アミノ酸残基が約1
からアミノ酸残基が約323迄であり;予想されるTS
ドメインを含むと推定されるアミノ酸配列は、アミノ酸
残基約324からアミノ酸残基約612迄である。配列
分析は、N.caninumの推定アミノ酸配列および
推定のT.gondii DHFR−TS配列の間で
は、DHFRドメインで73アミノ酸の差を、TSドメ
インで15アミノ酸の差を示す。
【0111】
【配列表】SEQUENCE LISTING <110> Krishnan, B. Rajendra Yoder, S. Christine Durtschi, Becky A. <120> DNA ENCODING NEOSPORA DIHYDROFOLATE REDUCTAS
E THYMIDYLATE SYNTHASE. <130> DHFRTS <140> <141> <150> 60/067,507 <151> 19971204 <160> 9 <170> PatentIn Ver. 2.0 beta <210> 1 <211> 9603 <212> DNA <213> Neospora caninum <220> <221> gene <222> (2405)..(8199) <400> 1 gcggccgccg gcacaatgcc gagggcagcg cagggaaaaa ccggtcgaag ctgcttcacg 60 tgtctgaaaa tagagccagc gctactgtcg cttcaaagaa cgagacttcc gcgccacaaa 120 tcggtagtga cggtggccgg aagcgaaaat tttacgacga gcagctgcca gtcggtgtgt 180 accgtcacca gcagaagtat gtcgcgaact gggtagatcc gaaaacccgg agacaaatca 240 aggtctgttt ccccatcgac gtgtggggag actctcaagc tcgcaacatg gctgccgttg 300 cgaggcgtga gcgctgcgtg gatgttgacg aggtggctgc tattttcaat cgtgaagagc 360 gcaccaagac atcaggacgt catccgagtc cttcgaggga tgacagcaaa cagacagcgt 420 ctttcaatag tgctgttagg atgccagcag tccagggtgt ggattcaaaa acggagacgc 480 actcggctcc ggcgctcgaa agcgcgtaga gcctgaggcc acaccacttc tggttttcag 540 agagggcgtc gcactcacaa tttttttcga cttctttccg cacactgggg ccgtgtgctc 600 gaacactttt tatccgtgtg accatgtgcc cgaacacttt ttatccgtgt gaccatgtgc 660 ccacgaacgc 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tcccttctga cgctcatggt tgcgcacgtc tgcaacctga 7440 agccgaagga gttcattcac ttcatgggca acacgcacgt ctactcgaac cacgtcgagg 7500 ccctgaagga gcagctgcgc agagaaccga gacctttccc catcgtgaac atcctgaaca 7560 aggaacgcat ccaggtgcga agcaactggg aaggaaacgg cacaacggac acgcaaacaa 7620 gcagaagagg cgaaacggac gacggcagcc gaggccccgg ccactgcgag ccgagcgcag 7680 acacgctgct tccagccggc ctatattcgg aaagaaaggg acagtgtcga agggagcaca 7740 cgagacgcaa caacgaaaag gaaacgcgat gcgtcgcaga tcggctcacc tatgtggtgc 7800 gcggtgcggc gcccagatgg cgcggctgca gcgctcgaag gaagactgtc tttgggtgcg 7860 tgtgaacgtt tgtccctgac gcgcggctga cagaacatga gagggctttt ttctgtgttg 7920 cacgctctcc ggatgcatct ctttctgtgc cacgggaagc aaagacgtgt gtgttccccg 7980 ggaattcgga aaagacccga gcatccgctg ccggcgatgg ggggggaggg gccgggcatt 8040 ggatgcctcc cgcctcgtct tgtcgacggc cccaaaaccc gtcagtgcca cgttgtttgt 8100 gagtgtgttc gccaggaaat cgacgacttc accgccgagg atttcgaggt cgtgggctac 8160 gtgccgcatg gacgaatcca gatggagatg gctgtttagt ggaaaaatct gaaatatata 8220 tatatatata tatatatata 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Asn Ile Leu Asn Lys Glu Arg Ile Gln Glu Ile Asp Asp Phe Thr Ala 580 585 590 gag gat ttc gag gtc gtg ggc tac gtg ccg cat gga cga atc cag atg 1824 Glu Asp Phe Glu Val Val Gly Tyr Val Pro His Gly Arg Ile Gln Met 595 600 605 gag atg gct gtt tag 1839 Glu Met Ala Val 610 <210> 3 <211> 612 <212> PRT <213> Neospora caninum <400> 3 Met Gln Lys Pro Val Ser Leu Ile Ala Ala Met Thr Pro Arg Arg Gly 1 5 10 15 Ile Gly Val Asn Asn Gly Leu Pro Trp Pro His Leu Ala Thr Asp Phe 20 25 30 Lys His Phe Ser Arg Val Thr Lys Thr Thr Ala Asp Glu Val Ser Arg 35 40 45 Leu Asn Ala Trp Leu Pro Lys Lys Ile Ala Lys Thr Gly Asp Ser Gly 50 55 60 Leu Pro Ser Pro Ala Phe Gly Val Asn Arg Phe Asn Ala Val Val Met 65 70 75 80 Gly Arg Lys Thr Trp Glu Ser Leu Pro Leu Lys Phe Arg Pro Leu Val 85 90 95 Asp Arg Leu Asn Ile Val Val Ser Ser Ser Leu Lys Glu Glu Asp Ile 100 105 110 Ala Ala Glu Lys Pro Leu Val Glu Gly Gln Gln Arg Val Arg Val Cys 115 120 125 Asp Ser Leu Pro Ala Ala Leu Arg Leu Val Asp Glu Glu Tyr Arg Glu 130 135 140 Ser Val Asp Gln Ile Tyr Val Val Gly Gly Ala Gly Leu Tyr Glu Glu 145 150 155 160 Ala Leu Ser Leu Gly Val Val Ser His Leu Tyr Ile Thr Arg Val Ala 165 170 175 Arg Asp Phe Pro Cys Asp Val Phe Phe Pro Ala Phe Pro Gly Asp Ser 180 185 190 Ile Leu Ser Asn Lys Gln Ala Ala Ser Ala Ser Gln Pro Ser Ala Ala 195 200 205 Ala Glu Pro Val Phe Val Pro Phe Cys Pro Gln Leu Gly Arg Glu Lys 210 215 220 Ser Asn Glu Ala Ser Tyr Arg Pro Ile Phe Ile Ser Lys Thr Tyr Ser 225 230 235 240 Asp Asn Gly Val Pro Tyr Asp Phe Val Val Leu Glu Lys Gly Arg Lys 245 250 255 Ala Asp Ala Cys Ser Ala Thr Glu Ser Cys Glu Leu Arg Gly Pro Trp 260 265 270 Thr Ser Thr Gly Glu Thr Ser Pro Glu Thr Arg Leu Pro Ser Ser Ser 275 280 285 Ala Ser Ala Val Ala Gln Val Leu Ala Trp Met Ala Asp Glu Asp Arg 290 295 300 Lys Lys Cys Glu Lys Lys Glu Ile Ile Arg Ala Val Pro His Val His 305 310 315 320 Phe Arg Gly His Glu Glu Phe Gln Tyr Leu Asp Leu Ile Ala Asp Ile 325 330 335 Ile Asn Asn Gly Ala Thr Met Asp Asp Arg Thr Gly Val Gly Val Ile 340 345 350 Ser Lys Phe Gly Cys Thr Met Arg Phe Ser Leu Asp Lys Ala Phe Pro 355 360 365 Leu Leu Thr Thr Lys Arg Val Phe Trp Lys Gly Val Leu Glu Glu Leu 370 375 380 Leu Trp Phe Ile Arg Gly Asp Thr Asn Ala Asn His Leu Ser Glu Lys 385 390 395 400 Gly Val Lys Ile Trp Asp Lys Asn Val Thr Arg Glu Phe Leu Asp Ser 405 410 415 Arg Asn Leu Ser His Arg Glu Val Gly Asp Ile Gly Pro Gly Tyr Gly 420 425 430 Phe Gln Trp Arg His Phe Gly Ala Thr Tyr Lys Asp Met His Thr Asp 435 440 445 Tyr Thr Gly Gln Gly Val Asp Gln Leu Lys Lys Val Ile Asn Met Leu 450 455 460 Arg Thr Asn Pro Thr Asp Arg Arg Met Leu Met Thr Ala Trp Asn Pro 465 470 475 480 Ala Ala Leu Asp Glu Met Ala Leu Pro Pro Cys His Leu Leu Cys Gln 485 490 495 Phe Tyr Val Glu Asn Asp Arg Asp Leu Ser Cys Val Met Tyr Gln Arg 500 505 510 Ser Cys Asp Val Gly Leu Gly Val Pro Phe Asn Ile Ala Ser Tyr Ser 515 520 525 Leu Leu Thr Leu Met Val Ala His Val Cys Asn Leu Lys Pro Lys Glu 530 535 540 Phe Ile His Phe Met Gly Asn Thr His Val Tyr Ser Asn His Val Glu 545 550 555 560 Ala Leu Lys Glu Gln Leu Arg Arg Glu Pro Arg Pro Phe Pro Ile Val 565 570 575 Asn Ile Leu Asn Lys Glu Arg Ile Gln Glu Ile Asp Asp Phe Thr Ala 580 585 590 Glu Asp Phe Glu Val Val Gly Tyr Val Pro His Gly Arg Ile Gln Met 595 600 605 Glu Met Ala Val 610 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Neospora caninum <400> 4 atgcagaaac cggtgtgtct 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Neospora caninum <400> 5 agggaagagg aaacgacgat 20 <210> 6 <211> 22 <212> DNA <213> Neospora caninum <400> 6 cccctcgtgg accggctgaa ta 22 <210> 7 <211> 21 <212> DNA <213> Neospora caninum <400> 7 tccgtgcgtg ccaagagact g 21 <210> 8 <211> 22 <212> DNA <213> Neospora caninum <400> 8 atggagatgg cgatgggagg ac 22 <210> 9 <211> 22 <212> DNA <213> Neospora caninum <400> 9 agtatgtaca cgaagcctca at 22
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI C12Q 1/68 C12N 5/00 B (72)発明者 スーザン・クリスチーン・ヨーダー アメリカ合衆国コネチカット州06420, セーラム,ミュージック・ヴェール・ロ ード 163 (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12N 15/09 ZNA A61K 35/66 A61K 39/002 C07K 14/44 C12Q 1/68 BIOSIS(DIALOG) GenBank/EMBL/DDBJ MEDLINE

Claims (20)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号3のアミノ酸配列を含む、ネオ
    スポラDHFR−TSタンパク質をコードするヌクレオ
    チド配列を含む単離ポリヌクレオチド分子。
  2. 【請求項2】 配列番号1のnt2405からnt81
    99までのヌクレオチド配列、または配列番号2のヌク
    レオチド配列を含む、請求項1の単離ポリヌクレオチド
    分子。
  3. 【請求項3】 単離ポリヌクレオチド分子がトキソプラ
    ズマ・ゴンジイ(Toxoplasma gondi
    i)からのDHFR−TSタンパク質をコードするヌク
    レオチド配列を持たない場合、適度に厳しい条件下で配
    列番号1のnt2405からnt8199までのヌクレ
    オチド配列、または配列番号2のヌクレオチド配列から
    なるポリヌクレオチド分子の補体にハイブリダイズし、
    単離ポリヌクレオチド分子がネオスポラ感染動物の液体
    または組織試料中のネオスポラ特異性ポリヌクレオチド
    の存在を検出することができる単離ポリヌクレオチド分
    子。
  4. 【請求項4】 非常に厳しい条件下で配列番号1のnt
    2405からnt8199までのヌクレオチド配列、ま
    たは配列番号2のヌクレオチド配列からなるポリヌクレ
    オチド分子の補体にハイブリダイズする請求項3の単離
    ポリヌクレオチド分子。
  5. 【請求項5】 単離ポリヌクレオチド分子がトキソプラ
    ズマ・ゴンジイ(Toxoplasma gondi
    i)からのDHFR−TSタンパク質をコードするヌク
    レオチド配列を持たない場合、少なくとも30%の (a) 配列番号3のアミノ酸配列を含むネオスポラDHF
    R−TSタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含
    むポリヌクレオチド分子; (b) nt2405からnt8199までの配列番号1の
    ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド分子; (c) 配列番号2のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオ
    チド分子; (d) nt2405からnt4664まで、またはnt4
    665からnt8199までの配列番号1のヌクレオチ
    ド配列を含むポリヌクレオチド分子; (e) nt1からnt969まで、またはnt970から
    nt1836までの配列番号2のヌクレオチド配列を含
    むポリヌクレオチド分子;または (f) nt1からnt2404まで、またはnt8200
    からnt9603までの配列番号1のヌクレオチド配列
    を含むポリヌクレオチド分子; である、ヌクレオチド配列から成る単離ポリヌクレオチ
    ド分子。
  6. 【請求項6】 配列番号3のアミノ酸残基1ないし32
    3または配列番号3のアミノ酸残基324ないし612
    をコードするヌクレオチド配列から成る、請求項5のポ
    リヌクレオチド分子。
  7. 【請求項7】 配列番号1のnt1からnt2404ま
    で、またはnt8200からnt9603までを含む、
    単離ポリヌクレオチド分子。
  8. 【請求項8】 請求項1ないし7のいずれかのポリヌク
    レオチド分子を含む、組み換えベクター。
  9. 【請求項9】 ポリヌクレオチド分子が配列番号1のn
    t2405からnt8199までのヌクレオチド配列を
    含む、請求項8の組み換えベクター。
  10. 【請求項10】 ファージλNcIDHFRTS(AT
    CC寄託番号209512)である、請求項9の組換え
    ベクター。
  11. 【請求項11】 請求項8の組換えベクターを含む形質
    転換宿主細胞。
  12. 【請求項12】 配列番号3のアミノ酸配列を含む実質
    的に精製されたタンパク質。
  13. 【請求項13】 配列番号3のアミノ酸残基1ないし3
    23または324ないし612を含む実質的に精製され
    たタンパク質。
  14. 【請求項14】 請求項5のポリヌクレオチド分子を含
    む遺伝子構築物であって、該ポリヌクレオチド分子はネ
    オスポラ(Neospora)細胞に導入された場合、相同組み
    換えによりDHFR−TS遺伝子またはこの遺伝子の1
    部分を無力化する能力をもつ上記構築物。
  15. 【請求項15】 適度に厳しい条件下で配列番号1のn
    t2405からnt8199までのヌクレオチド配列、
    または配列番号2のヌクレオチド配列からなるポリヌク
    レオチド分子にハイブリダイズするポリヌクレオチド分
    子を含み、該ポリヌクレオチド分子はネオスポラ(Neos
    pora)細胞に導入された場合、相同組み換えによりDH
    FR−TS遺伝子またはこの遺伝子の1部分を無力化す
    る能力を持ち、ただし、上記単離されたポリヌクレオチ
    ド分子はトキソプラズマ・ゴンジイ(Toxoplas
    ma gondii)からのDHFR−TS蛋白質をコ
    ードするヌクレオチド配列を持たない、遺伝子構築物。
  16. 【請求項16】 さらに、選択可能なマーカーを含む、
    請求項14または15の遺伝子構築物。
  17. 【請求項17】 DHFR−TS遺伝子のDHFRドメ
    インまたはTSドメインを破壊するのに有用である、請
    求項14または15の遺伝子構築物。
  18. 【請求項18】 請求項14または15の遺伝子構築物
    によって形質転換されたまたはトランスフェクトされた
    ネオスポラ細胞。
  19. 【請求項19】 dhfr-、fs-およびdhfr-
    ts-から成る群より選択された表現型を示す、請求項
    18のネオスポラ細胞。
  20. 【請求項20】 ネオスポラ修飾生細胞の調製法であっ
    て、 (a)ネオスポラ細胞株の細胞を得; (b)上記工程(a)の細胞に適度に厳しい条件下で配列番号
    配列番号1のnt2405からnt8199までのヌク
    レオチド配列、または配列番号2のヌクレオチド配列か
    らなるポリヌクレオチド分子にハイブリダイズするポリ
    ヌクレオチド分子を導入し;そして (c)前記ポリヌクレオチド分子の導入の結果として、d
    hfr-、ts-およびdhfr−ts-から成る群より
    選択した変異体表現型を示す、上記工程(b) からのネ
    オスポラ細胞を選択することを含む前記調製法。
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