JP2024521919A - ネオデグラダー-抗cd33抗体コンジュゲート - Google Patents

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Abstract

本発明は、抗CD33抗体にコンジュゲートしたネオデグラダーを提供する。また提供されるのは、該コンジュゲートを含む、組成物である。化合物および組成物は、処置を必要とする対象における、疾患または状態、例えば、癌の処置に有用である。

Description

電子的に提供した配列表についての言及
本出願と共にASCIIテキストファイル(Name:4547_017PC02_Seqlisting_ST25;サイズ:42、724バイト;および作成日:2022年5月31日)で電子的に提供した配列表の内容を、引用により全体として本明細書に包含させる。
分野
本発明は、ネオデグラダーが抗CD33抗体またはその抗原結合部分にコンジュゲートしている、ネオデグラダーコンジュゲートを提供する。また提供されるのは、該コンジュゲートを含む、組成物である。該コンジュゲートおよび組成物は、処置を必要とする対象における癌の処置に有用である。
背景
タンパク質分解は、免疫調節性イミド薬物の有効性により治療戦略として実証されている。これらの化合物はセレブロン(CRBN)と結合し、CRL4CRBN E3ユビキチンリガーゼにより介在される基質タンパク質の動員およびユビキチン化を促進する能力を有する。免疫調節性イミドは「分子糊」として作用し、リガーゼとネオ基質の間のタンパク質相互作用を再プログラミングする疎水性パッチとして結合接合面を満たすと考えられる。
これらの化合物が新規癌処置として興奮をもたらしたにも関わらず、現在まで多発性骨髄腫および骨髄異形成症候群(MDS)などの血液系腫瘍に使用が限定されている。他の癌タンパク質の分解により機能できる化合物のライブラリーの拡大は、その多くは「アンドラッガブル」と考えられているが、薬物開発の活発な領域である。故に、これら代替癌タンパク質を標的とし、広範な癌を処置できる新規化合物に対する要望は続いている。
概要
小分子GSPT1デグラダーでの急性骨髄性白血病(AML)患者の処置は臨床応答を駆動することが示されているが、重篤な有害事象(AE)が付随している。AMLの患者は、しばしば癌細胞に高レベルのCD33を有する - AMLの処置におけるCD33ターゲティングADC、マイロターグの臨床的承認により支持される。本発明は、GSPT1分解ペイロード分子とCD33ターゲティング抗体の結合が、GSPT1デグラダーの臨床的有効性および忍容性両方を改善できるとの発見に基づく。
第一態様において、本発明は、式(I):
〔式中、
aは1~10の整数であり;
AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
UはNHおよびCFから選択され;
は独立して水素およびハロから選択され;
Xは-NR-、=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
QおよびQ’は各々独立してO、SまたはN(R)であり;
vは1または2であり;
各Rは独立して水素またはC-Cアルキルであり;
nは1~6の整数であり;そして
mは2~6の整数であり;
ここで、各基の左側はLに結合し、右側はAに結合し;但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
Lは開裂可能リンカーまたは開裂不可能リンカーであり;そして
Bmは抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を提供する。
ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号1に示すアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)相補性決定領域(CDR)1(VH-CDR1)、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)CDR1(VL-CDR1)、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVLを含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は定常領域を含み、該定常領域は、ゲムツズマブと少なくとも1個のアミノ酸が異なる。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分はIgG1抗体またはその抗原結合部分である。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は定常領域に対応するアミノ酸297にアラニンを含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖を含む。
ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号19に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR20、配列番号21に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号22に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号23に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号24に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号27に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号28に示すアミノ酸配列を含むVLを含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分はIgG1抗体またはその抗原結合部分である。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号25に示す重鎖および配列番号26に示す軽鎖を含む。
ある態様において、aは2~8の整数である。
ある態様において、Lは開裂不可能リンカーである。ある態様において、Lは
〔式中、
pは1~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、Lは
である。
ある態様において、pは5である。
ある態様において、Lは開裂可能リンカーである。ある態様において、開裂可能リンカーはプロテアーゼにより開裂可能である。ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
、Z、ZおよびZは各々独立して存在しないかまたはLまたはD配置の天然に存在するアミノ酸残基であり、但しZ、Z、ZおよびZの少なくとも2個はアミノ酸残基であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、Z、Z、ZおよびZは独立して存在しないかまたはL-バリン、D-バリン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アラニン、D-アラニン、L-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニン、L-リシン、D-リシンおよびグリシンからなる群から選択され;但し、Z、Z、ZおよびZの少なくとも2個はアミノ酸残基である。
ある態様において、Zは存在しないかまたはグリシンであり;Zは存在しないかまたはL-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アラニン、D-アラニンおよびグリシンからなる群から選択され;Zは、L-バリン、D-バリン、L-アラニン、D-アラニン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンからなる群から選択され;そしてZは、L-アラニン、D-アラニン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-リシン、D-リシン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンからなる群から選択される。
ある態様において、Lは
である。
ある態様において、qは5である。
ある態様において、Lは生体内還元性リンカーである。ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
R、R’、R”およびR”’は各々独立して水素、C-CアルコキシC-Cアルキル、(C-C)NC-CアルキルおよびC-Cアルキルから選択されるかまたは、2個のジェミナルR基は、それらが結合している炭素原子と一体となってシクロブチルまたはシクロプロピル環を形成でき;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、Lは酸開裂可能リンカーである。ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、Lはクリック放出リンカーである。ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択される。
ある態様において、Lはピロホスファターゼ開裂可能リンカーである。ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
である。
ある態様において、Lはベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカーである。ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
----は存在しないかまたは結合であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択される。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
はハロであり;そして
Xは-N(R)(CH)O(CH)-であり;ここで
vは1であり;
mおよびnは2であり;そして
はメチルである、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
はハロであり;そして
Xは-N(R)(CH)O(CH)-であり;ここで
vは2であり;
mおよびnは2であり;そして
各Rはメチルである、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
はハロであり;そして
Xは-O(CH)-であり;ここで
nは2である、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
はハロであり;そして
Xは-S(CH)-であり;ここで
nは2である、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
は水素であり;そして
Xは-NR-であり;ここで
はメチルである、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
はハロであり;そして
Xは-NR-であり;ここで
は水素である、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
Aはフェニルであり;
UはNHであり;
は水素であり;そして
Xは-C(CH)=である、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートであって、ここで
AはC-C10シクロアルキル環であり;
UはNHであり;
は水素であり;そして
Xは-N(R)(CH)O(CH)-であり;ここで
nは1であり;
mは2であり;そして
はメチルである、
コンジュゲートを提供する。
ある態様において、本発明は、式(V):
〔式中、Bmは抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を提供する。抗CD33抗体またはその抗原結合部分は、例えば、(i)配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3、(ii)配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVL、(iii)配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖、(iv)配列番号19に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR20、配列番号21に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号22に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号23に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号24に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3、(v)配列番号27に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号28に示すアミノ酸配列を含むVLまたは(vi)配列番号25に示す重鎖および配列番号26に示す軽鎖を含み得る。
ある態様において、本発明は、式(VI):
〔式中、Bmは抗CD33またはその抗原結合部分である。〕
のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を提供する。抗CD33抗体またはその抗原結合部分は、例えば、(i)配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3、(ii)配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVL、(iii)配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖、(iv)配列番号19に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号20に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号21に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号22に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号23に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号24に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3、(v)配列番号27に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号28に示すアミノ酸配列を含むVLまたは(vi)配列番号25に示す重鎖および配列番号26に示す軽鎖を含み得る。
ある態様において、本発明は、式(VI):
〔式中、Bmは抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を提供する。抗CD33抗体またはその抗原結合部分は、例えば、(i)配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3、(ii)配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVL、(iii)配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖、(iv)配列番号19に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号20に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号21に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号22に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号23に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号24に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3、(v)配列番号27に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号28に示すアミノ酸配列を含むVLまたは(vi)配列番号25に示す重鎖および配列番号26に示す軽鎖を含み得る。
ある態様において、本発明は、ここに提供するコンジュゲートまたは化合物またはその薬学的に許容される塩および1以上の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を提供する。
ある態様において、本発明は、処置を必要とする対象における癌または骨髄異形成症候群を処置する方法であって、該対象に薬学的に許容される量の上記コンジュゲートまたは組成物またはその薬学的に許容される塩を投与することを含む、方法提供する。ある態様において、癌は血液学的/血液癌である。ある態様において、癌は多発性骨髄腫、白血病、悪性リンパ腫、ホジキン疾患または慢性骨髄増殖性疾患である。ある態様において、癌は急性骨髄性白血病またはリンパ腫である。ある態様において、癌は急性骨髄性白血病である。ある態様において、癌はマイロターグに抵抗性または難治性である。
ある態様において、方法は、該対象にコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩の前、後または同時に薬学的に許容される量のさらなる薬剤を投与することをさらに含む。ある態様において、さらなる薬剤は細胞毒性剤または免疫応答修飾剤である。ある態様において、免疫応答修飾剤はチェックポイント阻害剤である。ある態様において、チェックポイント阻害剤はPD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、CTLA-4阻害剤、TIM3阻害剤および/またはLAG-3阻害剤を含む。
ある態様において、本発明は、式(I)のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を製造する方法であって、抗CD33抗体またはその抗原結合部分と式(I-1):
〔式中、
aは1~10の整数であり;
AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
は独立して水素およびハロから選択され;
UはNHおよびCFから選択され;
Xは-N(R)-、=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
vは1または2であり;
QおよびQ’は各々独立してO、SまたはNRであり;
各Rは独立して水素またはC-Cアルキルであり;
nは1~6の整数であり;そして
mは2~6の整数であり;
ここで、各基の左側はL’に結合し、右側はAに結合し;
但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
L’は抗CD33抗体またはその抗原結合部分にコンジュゲートする開裂可能または開裂不可能リンカー前駆体である。〕
の化合物またはその薬学的に許容される塩を反応させることを含む、方法を提供する。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号1に示す重鎖可変領域および配列番号1に示す軽鎖可変領域を含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は定常領域を含み、該定常領域は、ゲムツズマブと少なくとも1個のアミノ酸が異なる。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分はIgG1抗体またはその抗原結合部分である。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は定常領域に対応するアミノ酸297にアラニンを含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖を含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR20、配列番号21に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号22に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号23に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号24に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号27に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号28に示すアミノ酸配列を含むVLを含む。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分はIgG1抗体またはその抗原結合部分である。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号25に示す重鎖および配列番号26に示す軽鎖を含む。
ある態様において、方法は、さらに式(I-1)の化合物との反応前に抗CD33抗体またはその抗原結合部分を還元することを含む。
ある態様において、aは2~8の整数である。ある態様において、L’は開裂不可能リンカー前駆体、開裂可能リンカー前駆体、生体内還元性リンカー前駆体、酸開裂可能リンカー前駆体、クリック放出リンカー前駆体、ピロホスファターゼ開裂可能リンカー前駆体、ベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカー前駆体またはそれらの任意の組み合わせである。
図1は、MV411(CD33+)腫瘍に対する代表的ネオデグラダーコンジュゲートのインビボ活性を示す。X軸は投与後の日数を示す。Y軸は媒体、3mg/kg CD33AB-化合物(Ia)、2.83mg/kg CD33AB-化合物(Ie)、2.99mg/kg CD33AB-化合物(1h)、0.1mg/kgマイロターグ、50mg/kgベネトクラクスおよび5mg/kg CC-90009を投与後の腫瘍体積(mm)を示す。
図2は、CD-33陽性およびCD33陰性悪性腫瘍におけるhuMy9-6(AB1)-化合物(Ia)のインビトロ活性を示す。
図3は、MV4-11(CD33+)腫瘍に対するAB1ベースのコンジュゲートのインビボ活性を示す。X軸は投与後の日数を示す。Y軸は媒体、AB1-化合物(Ia)、AB1-化合物(Ii)、AB1-化合物(Id)、AB1-化合物(Ij)、AB1-化合物(Ie)、AB1-化合物(Ik)、マイロターグ、ゲムツズマブ-化合物I(a)およびCC-90009を投与後の腫瘍体積(mm)を示す。
図4は、ゲムツズマブおよびCD33ABコンジュゲートの安定性を示す。
図5は、MV4-11(CD33+)腫瘍に対するゲムツズマブベースのコンジュゲートのインビボ活性を示す。X軸は投与後の日数を示す。Y軸は媒体、3mg/kg ゲムツズマブ-化合物(Ia)、5mg/kg ゲムツズマブ-化合物(Ia)、3mg/kg CD33AB-化合物(Ia) 5mg/kg CD33AB-化合物(Ia)、3mg/kg ゲムツズマブ IgG1 LALA-化合物(Ia)、5mg/kg ゲムツズマブ IgG1 LALA-化合物(Ia)、5mg/kg ゲムツズマブ-化合物(Ie)、25mg/kgベネトクラクスおよび50mg/kgベネトクラクスを投与後の腫瘍体積(mm)を示す。
図6Aおよび6Bは、マイロターグ非感受性AML細胞に対するAB1-化合物(Ia)コンジュゲートのインビトロ活性を示す(AML-193(図6A)およびKasumi-6(図6B))。X軸は濃度を示し、Y軸は処理後の細胞株のパーセント生存能を示す。
詳細な記載
本発明は、式(I):
〔式中、
aは1~10の整数であり;
AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
は独立して水素およびハロから選択され;
UはNHおよびCFから選択され;
Xは-N(R)=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
QおよびQ’は各々独立してO、SまたはN(R)であり;
vは1または2であり;
各Rは独立して水素またはC-Cアルキルであり;
nは1~6の整数であり;
mは2~6の整数であり;
ここで、各基の左側はLに結合し、右側はAに結合し;
但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
Lは開裂可能リンカーまたは開裂不可能リンカーであり;そして
Bmは抗CD33抗体またはその抗原結合部分、例えば、抗CD33抗体またはその抗原結合部分、配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3;配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVLを含む抗CD33抗体またはその抗原結合部分;または配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖を含む抗CD33抗体である。〕
のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩に関する。
本発明はまた、抗CD33抗体またはその抗原結合部分に融合した上記化合物、該化合物または該コンジュゲートを含む組成物または該化合物または該コンジュゲートを使用または製造する方法を提供する。
VI. 定義
本記載がより容易に理解され得るように、特定の用語をまず定義する。さらなる定義は、詳細な記載をとおして示される。
ある物についての単数表現は、その物の1以上をいうことは理解される;例えば、「あるヌクレオチド配列」は、1以上のヌクレオチド配列を表すと理解される。すなわち、用語「ある」、「1以上」および「少なくとも1個」は、ここでは相互交換可能に使用され得る。特許請求の範囲は、あらゆる任意的要素を除外して起草され得ることはさらに留意される。すなわち、この記載は、請求要素の限定と関連した「単に」、「のみ」などの排他的用語の使用または負の限定の使用についての先行詞として役立つことが意図される。
さらに、「および/または」は、ここで使用されているとき、他方を伴うまたは伴わない2つの特定した特性または成分の各々の特定の開示として解釈されるべきである。故に、ここでの「Aおよび/またはB」などの句において使用する用語「および/または」は、「AおよびB」、「AまたはB」、「A」(単独)および「B」(単独)を含むことを意図する。同様に、「A、Bおよび/またはC」などの句において使用する用語「および/または」は、次の態様の各々を包含することが意図される:A、BおよびC;A、BまたはC;AまたはC;AまたはB;BまたはC;AおよびC;AおよびB;BおよびC;A(単独);B(単独);およびC(単独)。
態様がここで用語「含む」を用いて記載されているとき、「からなる」および/または「本質的にからなる」で記載されるその他は類似する態様も提供されることは理解される。
他に定義されない限り、ここで使用する全ての技術的および科学的用語は、本発明が関連する分野の当業者により共通して理解されるのと同じ意味を有する。例えば、Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology, Juo, Pei-Show, 2nd ed., 2002, CRC Press; The Dictionary of Cell and Molecular Biology, 3rd ed., 1999, Academic Press; およびOxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology, Revised, 2000は、当業者に本明細書において使用する用語の多くの一般的辞書を提供する。
単位、接頭辞および記号は、国際単位系(SI)において認められた形で示す。数値範囲は、該範囲を規定する数値を含む。値の範囲が記載されているとき、その範囲の記載される上限と下限の間の各整数値およびその各分数も、そのような値の各下位範囲と共に具体的に開示されることは理解される。何らかの範囲の上限および下限は、独立してその範囲に含まれるまたは除外されることができ、限度のいずれかが含まれる、どちらもないまたは両方が含まれる各範囲も本発明に含まれる。故に、ここに記載する範囲は、記載する終点を含む、該範囲内の値の全ての省略と理解される。例えば、1~10の範囲は、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10からなる群の何れかの数値、数値の組み合わせまたは下位範囲を含むと理解される
値が明示されるとき、記載される値とほぼ同じ品質または量である値も本発明の範囲内であることは理解される。組み合わせが開示されるときその組み合わせの要素の各下位の組み合わせも具体的に開示され、本発明の範囲内である。逆に、異なる要素または要素の群が個々に開示されるとき、それらの組み合わせも開示される。本発明の何れかの要素が複数の選択肢を有するとして開示されるとき、各選択肢が単一にまたは他の選択肢との任意の組み合わせで除外されるその開示される例も、ここに開示される;本発明の1を超える要素はこのような除外を有し得て、このような除外を有する要素の全組み合わせはここに開示される。
ここで使用する用語「DAR」は、各抗体に連結したネオデグラダー-リンカー複合体の平均数である、コンジュゲートの薬物抗体比をいう。ある態様において、ここに記載するコンジュゲートのDARは1~10である。ある態様において、ここに記載するコンジュゲートのDARは1~8である。ある態様において、ここに記載するコンジュゲートのDARは1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9.0、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9または10である。
ここで使用する用語「抗体」は、完全長免疫グロブリン分子または完全長免疫グロブリン分子の免疫学的活性部分、すなわち、興味ある標的の抗原またはその一部と免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子もいい、このような標的は、癌細胞または自己免疫疾患と関連する自己免疫抗体を産生する細胞を含むが、これらに限定されない。ここに開示する免疫グロブリンは免疫グロブリン分子の任意のタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgDおよびIgA)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1およびIgA2)またはサブクラスであり得る。免疫グロブリンは任意の種に由来し得る。しかしながら、ある態様において、免疫グロブリンはヒト、マウスまたはウサギ起源である
用語「単一ドメイン抗体」は、ナノボディとしても知られ、約12kDa~約15kDaの分子量を有する単一モノマー可変抗体ドメインからなる抗体フラグメントである。単体抗体は重鎖可変ドメインまたは軽鎖に基づき得る。単一ドメイン抗体の例は、VHフラグメントおよびVNARフラグメントを含むが、これらに限定されない。
「抗体フラグメント」は、インタクト抗体の一部、一般にその抗原結合または可変領域を含む。抗体フラグメントの例は、Fab、Fab’、F(ab’).sub.2およびFvフラグメント;二重特異性抗体;線形抗体;癌細胞抗原、ウイルス抗原または微生物抗原に免疫特異的に結合するFab発現ライブラリーにより産生されるフラグメント、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、上記の何れかのCDR(相補性決定領域)およびエピトープ結合フラグメント、一本鎖抗体分子;および抗体フラグメントから形成される多特異的抗体を含む。
「インタクト抗体」は、抗原結合可変領域ならびに軽鎖定常ドメイン(CL)および重鎖定常ドメイン、CH1、CH2およびCH3を含むものである。定常ドメインは、天然配列定常ドメイン(例えば、ヒト天然配列定常ドメイン)またはそのアミノ酸配列バリアントであり得る。
ここで使用する用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均一な抗体、すなわち、集団を構成する個々の抗体が、微量で存在し得る可能性のある天然に存在する変異以外同一である集団から得られる抗体をいう。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一抗原性部位に対して指向される。さらに、種々の決定基(エピトープ)に対する種々の抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は抗原の単一決定基に対する。特異性に加えて、モノクローナル抗体他の抗体に汚染されずに合成され得る点で、有利である。修飾語句「モノクローナル」は、抗体の特徴が抗体の実質的に均一の集団から得られたことを示し、何らかの特定の方法による抗体の産生が必要であることは意図されない。例えば、本発明で使用するモノクローナル抗体はハイブリドーマ方法により産生されてよくまたは組み換えDNA方法により産生されてよい。「モノクローナル抗体」はファージ抗体ライブラリーから単離もされ得る。
ここでのモノクローナル抗体は重および/または軽鎖の一部は特定の種に由来する抗体における対応する配列と同一または相同であるかまたは特定の抗体クラスまたはサブクラスに属し、一方鎖の残りは他の種に由来する抗体における対応する配列と同一または相同であるかまたは他の抗体クラスまたはサブクラスに属する「キメラ」抗体ならびに所望の生物学的活性を示す限り、そのような抗体のフラグメントを特に含む。ここで興味あるキメラ抗体は非ヒト霊長類(例えば、旧世界ザル、類人猿など)およびヒト定常領域配列由来の可変ドメイン抗原結合配列を含む「霊長類化」抗体を含む。
モノクローナル抗体(MAb)を産生するために種々の方法が用いられている。単一タイプの抗体を産生するクローン化細胞株をいうハイブリドーマテクノロジーは、マウス(ネズミ)、ハムスター、ラットおよびヒトを含む種々の種の細胞を使用する。MAbの産生に使用する他の方法は、組み換えDNA技術を含む遺伝子操作を使用する。これらの技術により産生されたモノクローナル抗体はとりわけ、キメラ抗体およびヒト化抗体を含む。キメラ抗体は1を超えるタイプの種からのDNAコード化領域を合わせる。例えば、キメラ抗体はマウスからの可変領域およびヒトからの定常領域に由来し得る。ヒト化抗体は非ヒト部分を含んでも、主にヒトからである。キメラ抗体と同様、ヒト化抗体は完全ヒト定常領域を含み得る。しかしキメラ抗体と異なり、可変領域は一部ヒトに由来し得る。ヒト化抗体の非ヒト、合成部分はしばしばマウス抗体のCDR由来である。いずれにしても、これらの領域は、抗体が特異的抗原を認識し、結合することができるために重要である。診断および短期治療には有用であるが、マウス抗体は有害な免疫原性応答のリスクの増加なしには、ヒトに長期で投与できない。ヒト抗マウス抗体(HAMA)と称されるこの応答は、ヒト免疫系がマウス抗体を外来と認識し、それを抗原するときに起こる。HAMA応答は毒素ショックまたは死さえ引き起こし得る。
キメラおよびヒト化抗体はHAMA応答の可能性を、投与抗体の非ヒト部分を最小化することにより低減する。さらに、キメラおよびヒト化抗体は抗体依存性細胞傷害などの二次的ヒト免疫応答を活性化するさらなる利益を有し得る。
インタクト抗体は抗体のFc領域(天然配列Fc領域またはアミノ酸配列バリアントFc領域)に起因する生物学的活性をいう、1以上の「エフェクター機能」を有し得る。抗体エフェクター機能の例は、C1q結合;補体依存性細胞傷害;Fc受容体結合;抗体依存性細胞傷害(ADCC);食作用;細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体;BCR)の下方制御などを含む。
重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列により、インタクト抗体は異なる「クラス」に割り当てられ得る。IgA、IgD、IgE、IgGおよびIgMのインタクト抗体の5つの主要なクラスがあり、それらのいくつかは「サブクラス」(アイソタイプ)、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgAおよびIgA2にさらに分割され得る。異なるクラスの抗体に対応する重鎖定常ドメインは、それぞれアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマおよびミューと称される。異なるクラスの免疫グロブリンのサブユニット構造および三次元配置は周知である。
用語「約」は、ここでは、おおよそ、大まかに、周辺または領域内を意味するために使用する。用語「約」が数値と共に使用されるとき、示す数値の上および下の境界を伸ばすことにより、その範囲を修飾する。一般に、用語「約」は、数値を、記載される値の、例えば、10パーセント上または下(高いまたは低い)の分散で修飾し得る
用語「投与」、「投与する」およびその文法的異形は、本発明のEV(例えば、エクソソーム)などの組成物の、薬学的に許容される経路を介する対象への導入をいう。対象への本発明のEV(例えば、エクソソーム)などの組成物の導入は、腫瘍内、経口、肺、鼻腔内、非経腸(静脈内、動脈内、筋肉内、腹腔内または皮下)、直腸、リンパ内、髄腔内、眼球周囲または局所を含む、任意の適当な経路による。投与は、自己投与および他者による投与を含む。適当な投与経路により、組成物または薬剤が意図する機能を発揮できる。例えば、適当な経路が静脈内であれば、組成物を、組成物または薬剤を対象の静脈に導入することにより投与する。
ここで使用する用語「抗体」は、天然であれ、一部または全体に合成により産生されたものであれ、免疫グロブリンおよびそのフラグメントを含む。本用語はまた免疫グロブリン結合ドメインと相同である結合ドメインを有するあらゆるタンパク質も包含する。「抗体」は、さらに免疫グロブリン遺伝子からのフレームワーク領域を含むポリペプチドまたは抗原と特異的に結合し、認識するそのフラグメントを含む。用語抗体の使用は完全抗体、ポリクローナル、モノクローナルおよび組み換え抗体、そのフラグメントを含むことを意味し、さらに、一本鎖抗体、ヒト化抗体、マウス抗体、キメラ、マウス-ヒト、マウス-霊長類、霊長類-ヒトモノクローナル抗体、抗イディオタイプ抗体、例えば、scFv、(scFv)、Fab、Fab’およびF(ab’)、F(ab1)、Fv、dAbおよびFdフラグメントなどの抗体フラグメント、二重特異性抗体および抗体関連ポリペプチドを含む。抗体は所望の生物学的活性または機能を示す限り、二特異的抗体および多特異的抗体を含む。本発明のある態様において、生物学的活性分子は抗体またはその抗原結合フラグメントを含む分子である。
用語「抗体-薬物コンジュゲート」および「ADC」は相互交換可能に使用し、治療剤(ここでは薬剤、薬物または活性医薬成分と称することもある)または薬剤に、例えば、共有結合で、結合した抗体をいう。本発明のある態様において、生物学的活性分子は抗体-薬物コンジュゲートである。
ここで使用する用語「おおよそ」は、目的の1以上の値に適用されるとき、記載する参照値に類似する値をいう。ある態様において、用語「おおよそ」は、特に断らない限りまたは文脈から他のことが明らかでない限り、記載する参照値の何れかの方向(大きいまたは小さい)で10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%またはそれ未満に入る値の範囲をいう(そのような値が可能な値の100%を超えるときは例外である)。
「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が類似側鎖を有するアミノ酸残基に置き換えられるものである。類似側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当分野で定義されており、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ分岐側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を含む。故に、ポリペプチドにおけるあるアミノ酸が同じ側鎖ファミリーの他のアミノ酸で置き換えられるとき、置換は保存的と考えられる。他の態様において、アミノ酸のストリングを、側鎖ファミリーメンバーの順番および/または組成が異なる構造的に類似するストリングで保存的に置き換え得る。
ここで使用する用語「保存」は、比較される2以上の配列の同じ位置が変わらない、ポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列のそれぞれヌクレオチドまたはアミノ酸残基をいう。比較的保存されているヌクレオチドまたはアミノ酸は、配列のどこかに現れるヌクレオチドまたはアミノ酸よりも、より関連する配列で保存されているものである。
ある態様において、2以上の配列は、互いに100%同一であるならば、「完全に保存」または「同一」と考えられる。ある態様において、2以上の配列は、互いに少なくとも約70%同一、少なくとも約80%同一、少なくとも約90%同一または少なくとも約95%同一であるならば、「高度に保存」と考えられる。ある態様において、2以上の配列は、互いに少なくとも約30%同一、少なくとも約40%同一、少なくとも約50%同一、少なくとも約60%同一、少なくとも約70%同一、少なくとも約80%同一、少なくとも約90%同一または少なくとも約95%同一であるならば、「保存」と考えられる。配列の保存は、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの全長に適用できまたはその一部、部分、領域または特性に適用できる。
ここで使用する用語「連結」および「コンジュゲート」は相互交換可能に使用され、各々ネオデグラダーおよび抗CD33抗体またはその抗原結合部分を含む2以上の部分の共有または非共有結合をいう。ある態様において、連結またはコンジュゲートはリンカーを含み得る。
用語「アミノ酸配列バリアント」は、天然配列ポリペプチドとある程度異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドをいう。通常、アミノ酸配列バリアントは、天然抗体の少なくとも1個の受容体結合ドメインまたは天然受容体の少なくとも1個のリガンド結合ドメインと少なくとも約70%配列同一性を有し、典型的に、そのような受容体またはリガンド結合ドメインと配列が少なくとも約80%、より典型的に、少なくとも約90%相同である。アミノ酸配列バリアントは、天然アミノ酸配列のアミノ酸配列内のある位置に置換、欠失および/または挿入を有する。アミノ酸は、慣用名、一文字および三文字コードで指定する。
「配列同一性」は、最大パーセント配列同一性を達成するために、配列を整列させ、必要であれば、ギャップを導入した後、同一であるアミノ酸配列バリアントにおける残基のパーセンテージとして定義される。アラインメントのための方法およびコンピュータープログラムは当分野で周知である。一つのコンピュータープログラムは、1991年12月10日に、アメリカ合衆国著作権局(Washington, D.C. 20559)にマニュアルと共にファイルされた、Genentech, Inc.作成の「Align 2」である。
「補体依存性細胞傷害」または「CDC」は、分子が補体存在下で標的を溶解させる能力をいう。補体活性化経路は、補体系第一成分(C1q)の、同族抗原と複合体化している分子(例えば、抗体)への結合により開始される。補体活性化を評価するために、CDCアッセイが実施され得る。
用語「可変」は、可変ドメインのある部分の配列が抗体間で広範に異なり、各特定の抗体のその特定の抗原への結合および特異性に使用される事実をいう。しかしながら、可変性は、抗体の可変ドメインをとおして均一に分散されていない。軽鎖および重鎖可変ドメイン両者において超可変領域と称される3セグメントに濃縮されている。可変ドメインのより高度に保存されている部分はフレームワーク領域(FR)と称される。天然重鎖および軽鎖の可変ドメインの各々は、ベータシート構造を接続し、ある場合、その一部を形成する3個の超可変領域で接続された、主にベータシート配置を採用する4個のFRを含む。各鎖の超可変領域はFRにより近位で互いに維持され、他の鎖の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する。定常ドメインは直接抗体の抗原への結合に関与しないが、抗体の抗体依存性細胞傷害(ADCC)への参加などの種々のエフェクター機能を示す。
用語「超可変領域」は、ここで使用するとき、抗原結合を担う抗体のアミノ酸残基をいう。超可変領域は、一般に「相補性決定領域」または「CDR」からのアミノ酸残基(例えば、軽鎖可変ドメインにおける残基24~34(L1)、50~56(L2)および89~97(L3)および重鎖可変ドメインにおける31~35(H1)、50~65(H2)および95~102(H3); Kabat et al supra)および/または「超可変ループ」からの残基(例えば、軽鎖可変ドメインにおける残基26~32(L1)、50~52(L2)および91~96(L3)および重鎖可変ドメインにおける26~32(H1)、53~55(H2)および96~101(H3))を含む。「フレームワーク領域」または「FR」残基は、ここに定義する超可変領域残基以外の可変ドメイン残基である。
抗体のパパイン消化は、各々単一抗原結合部位を有する「Fab」フラグメントと称される2個の同一抗原結合フラグメントおよび名称が容易に結晶化する能力を反映する残存「Fc」フラグメントを産生する。ペプシン処理は、2個の抗原結合部位を有し、なお架橋結合抗原できるF(ab’)2フラグメントを産生する。
「Fv」は、完全抗原認識および抗原結合部位を含む最小抗体フラグメントである。この領域は、緊密な、非共有結合的会合での1個の重鎖および1個の軽鎖可変ドメインの二量体からなる。各可変ドメインの3個の超可変領域が、VH-VL二量体表面上の抗原結合部位を定義するよう相互作用するのは、この配置においてである。まとめると、6個の超可変領域が抗体の抗原結合特異性に寄与する。しかしながら、単一可変ドメイン(または抗原に特異的な3個の超可変領域のみ含むFvの半分)でさえ、抗原を認識し、結合する能力を有するが、完全結合部位より親和性は低い。
Fabフラグメントはまた軽鎖の定常ドメインおよび重鎖の第一定常ドメイン(CH1)も含む。Fab’フラグメントは、重鎖CH1ドメインのカルボキシ末端に、抗体ヒンジ領域からの1以上のシステインを含む数残基が付加されたことによりFabフラグメントと異なる。Fab’-SHは、ここでは定常ドメインのシステイン残基が少なくとも1個の遊離チオール基を有するFab’の命名である。F(ab’)2抗体フラグメントは、もともと、間にヒンジシステインを有する一対のFab’フラグメントとして産生された。抗体フラグメントの他の化学的カップリングも知られる。
任意の脊椎動物種からの抗体の「軽鎖」は、定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、カッパ(κ)およびラムダ(λ)と称される2個の明確なタイプの一つに割り当てられ得る。
「一本鎖Fv」または「scFv」抗体フラグメントは、抗体のVHおよびVLドメインを含み、ここで、これらドメインは単一ポリペプチド鎖で存在する。Fvポリペプチドは、VHおよびVLドメインの間にポリペプチドリンカーをさらに含み得て、それはscFvが抗原結合のための所望の構造を形成することを可能とする。
用語「二重特異性抗体」は、2個の抗原結合部位を有する小抗体フラグメントをいい、そのフラグメントは可変軽ドメイン(VL)に接続した可変重ドメイン(VH)を同じポリペプチド鎖(VH-VL)に含む。同じ鎖の2個のドメイン間の対合を可能とするには短すぎるリンカーの使用により、ドメインは他方の鎖の相補性ドメインと対合し、2個の抗原結合部位を作ることを強いられる。
「単離」抗体は同定され、かつその天然環境の成分から分離および/または回収されているものである。その天然環境の汚染成分は、抗体の診断または治療用途を妨害する物質であり、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質性または非タンパク質性溶質を含み得る。ある態様において、抗体は(1)ローリー法により決定して95重量%を超えるまたは99重量%を超える抗体の程度まで、(2)ガス相タンパク質シーケンサーの使用によりN末端または内部アミノ酸配列の少なくとも15残基を得るのに十分な程度までまたは(3)クマシーブルーまたは銀染色の使用により、還元または非還元条件下のSDS-PAGEで均一まで精製される。単離抗体は組み換え細胞内のインサイチュの抗体を、抗体の天然環境の少なくとも1個の成分が存在しないため、含む。通常、しかしながら、単離抗体は少なくとも1精製工程により調製される
「癌」は、体内の異常細胞の制御されない増殖により特徴づけられる広範な種々の疾患群をいう。未成魚の細胞分裂および増殖は、近隣組織を侵襲し、リンパ系または血流を介して体の遠位部分に転移もし得る悪性腫瘍の形成をもたらす。ここで使用する「癌」は、原発、転移および再発癌をいう。
ここで使用する用語「免疫応答」は、脊椎動物の外来因子に対する生物学的応答をいい、その応答は生物をこれらの因子およびこれらにより引き起こされる疾患から保護する。免疫応答は、侵襲病原体、病原体に感染した細胞または組織、癌性または他の異常細胞、または、自己免疫または病的炎症の場合、正常ヒト細胞または組織の選択的ターゲティング、結合、損傷、破壊および/または脊椎動物身体からの排除をもたらす、免疫系の細胞(例えば、Tリンパ球、Bリンパ球、ナチュラルキラー(NK)細胞、マクロファージ、好酸球、肥満細胞、樹状細胞または好中球)およびこれら細胞の何れかまたは肝臓により産生される可溶性巨大分子(抗体、サイトカインおよび補体を含む)の作用により介在される。免疫反応は、例えば、T細胞、例えば、エフェクターT細胞またはCD4またはCD8 T細胞などのTh細胞の活性化または阻害またはTreg細胞の阻害を含む。ここで使用する用語「T細胞」および「Tリンパ球」は、相互交換可であり、胸腺により産生または処理されるあらゆるリンパ球をいう。ある態様において、T細胞は、CD4 T細胞である。ある態様において、T細胞は、CD8 T細胞である。ある態様において、T細胞は、NKT細胞である。
「対象」は、あらゆるヒトまたは非ヒト動物を含む。用語「非ヒト動物」は、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌならびにマウス、ラットおよびモルモットなどの齧歯類を含むが、これらに限定されない。ある態様において、対象はヒトである。用語「対象」および「患者」はここでは相互交換可能に使用する。
用語「治療有効量」または「治療的有効投与量」は、所望の生物学的、治療的および/または予防的結果を提供する、薬剤(例えば、ここに開示するネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲート)の量をいう。その結果は、疾患の徴候、症状または原因の1以上の減少、改善、緩和、低減、遅延および/または軽減または生物系の何らかの他の所望の改変であり得る。固形腫瘍について、有効量は、腫瘍を縮小させるおよび/または腫瘍増殖速度を減少させる(例えば腫瘍増殖抑制まで)または他の望まない細胞増殖を予防または遅延する量を含む。ある態様において、有効量は、腫瘍進展の遅延に十分な量である。ある態様において、有効量は、腫瘍再発の予防または遅延に十分な量である。有効量を1回以上で投与し得る。有効量の組成物は、例えば、(i)癌細胞数の減少;(ii)腫瘍サイズの減少;(iii)末梢臓器への癌細胞浸潤をある程度阻害、遅延、減速し、停止できる;(iv)腫瘍転移を阻害(すなわちある程度遅延)し、停止できる;(v)腫瘍増殖の阻害;(vi)腫瘍の発生および/または再発の予防または遅延;および/または(vii)癌に付随する症状の1以上のある程度の軽減をすることができる。
ある態様において、「治療有効量」は、癌の有意な減少または進行固形腫瘍などの癌の進行遅延(退縮)の作用が臨床的に証明されているネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートの量である。治療剤が疾患退縮を促進する能力は、臨床治験中のヒト対象、ヒトの有効性を予測する動物モデル系またはインビトロアッセイにおける薬剤の活性のアッセイなどの、当業者に知られる多様な方法を使用して、評価できる。
ここで使用する用語「標準治療」は、医療専門家によりあるタイプの疾患の適切な処置として認められており、医療従事者により広範に使用される処置をいう。本用語は、次の用語:「最善の方法」、「標準的な医療」および「標準的治療」の何れかと相互交換可能に使用され得る
一例として、「抗癌剤」は対象における癌退縮を促進するまたはさらなる腫瘍増殖を予防する。ある態様において、薬物の治療有効量は、癌を排除する点まで癌退縮を促進する。
処置に関する用語「有効」および「有効性」は、薬理学的有効性および生理学的安全性両方を含む。薬理学的有効性は、薬物が患者における癌退縮を促進する能力をいう。生理学的安全性は、薬物投与に起因する、細胞、臓器および/または生物レベルでの毒性または他の有害生理学的効果(有害効果)のレベルをいう。
ここで使用する用語「免疫チェックポイント阻害剤」は、1以上のチェックポイントタンパク質を完全にまたは一部減少、阻害、妨害または調節する分子をいう。チェックポイントタンパク質はT細胞活性化または機能を制御する。CTLA-4およびそのリガンドCD80およびCD86;およびPD-1とそのリガンドPD-L1およびPD-L2などの多数のチェックポイントタンパク質が知られる。Pardoll, D.M., Nat Rev Cancer 12 (4): 252-64 (2012)。これらのタンパク質は、T細胞応答の共刺激または阻害性相互作用を担う。免疫チェックポイントタンパク質は、自己耐容性ならびに生理学的免疫応答の期間および強度を制御および維持する。免疫チェックポイント阻害剤は抗体を含むまたは抗体に由来する。
用語「処置する」または「処置」は、治療処置および予防または予防的手段両方をいい、ここで、目的は癌の進展または拡散などの望まない生理学的変化または障害の予防または減速(低減)である。本発明の目的で、有益または所望の臨床的結果は、検出可能であれ、検出不可能であれ、症状軽減、疾患の程度低減、疾患状態の安定化(すなわち、非悪化)、疾患進行の遅延または減速、疾患状態の改善または緩和および寛解(部分的であれ完全であれ)を含むが、これらに限定されない。「処置」はまた、処置を受けないときの余命と比較した生存延長も意味し得る。処置を必要とするものは、すでに該状態または障害を有するものならびに該状態または障害の素因があるものまたは該状態または障害を予防すべきものを含む。
VII. 「ネオデグラダー」
本発明は、式(II):
〔式中、
AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
UはNHおよびCFから選択され;
は独立して水素およびハロから選択され;
は-C(O)R、-N(R)、-(CH)OH、-(CH)SH、-(CH)N(R)、-(CH)Q’(CH)OH、-(CH)Q’(CH)SHおよび-(CH)Q’(CH)N(R)から選択され;ここで
は水素またはC-Cアルキルであり;
各Rは独立して水素またはC-Cアルキルであり;
Q’はO、SまたはNRであり;
nは1~6であり;そして
mは2~5であり;
但し、RがNH、-(CH)NHまたは-(CH)OHであるとき、Rはハロである〕
のネオデグラダーまたはその薬学的に許容される塩を提供する。
ある態様において、本発明は、式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を提供し、ここで
Aはフェニル環またはC-C10シクロアルキル環であり;
UはNHであり;
は水素およびハロから選択され;
は-(CH)Q’(CH)N(R)、-(CH)OH、-(CH)SH、-N(R)および-C(O)Rから選択され;ここで
mは2であり;
nは2であり;
Q’は-O-であり;
はメチルであり;そして
各Rは独立して水素およびメチルから選択され;
但し、RがNHまたは-(CH)OHであるとき、Rはハロである。
ここで使用する用語「C-Cアルコキシ」は、酸素原子を介して親分子部分に結合するC-Cアルキル基をいう。
ここで使用する用語「C-CアルコキシC-Cアルキル」は、C-Cアルキル基を介して親分子部分に結合するC-Cアルコキシ基をいう。
ここで使用する用語「C-Cアルキル」は、1~6個の炭素原子を含む、直鎖あmたは分岐鎖飽和炭化水素由来の基をいう。
ここで使用する用語「C-C10シクロアルキル」は、4~10個の炭素原子および0個のヘテロ原子を有する、飽和単環式、炭化水素環系をいう。シクロアルキル基の代表例は、シクロブチル、シクロペンチルおよびシクロヘキシルを含むが、これらに限定されない。7~10個の原子を含むシクロアルキル基は、単環式または縮合、スピロ環状または架橋二環式構造であり得る。
ここで使用する用語「ハロ」は、F、Cl、BrまたはIをいう。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは:
からなる群から選択される化合物である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、式(II)のネオデグラダーは
である。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーまたはその薬学的に許容される塩を提供し、ここで、Aはフェニルであり;UはNHであり;Rはハロであり;そしてRは-(CH)Q’(CH)N(R)であり、ここで、mおよびnは2であり、Q’はOであり、一方のRは水素であり、他方はメチルである。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、AAはフェニルであり;UはNHであり;Rはハロであり;そしてRは-(CH)Q’(CH)N(R)であり、ここで、mおよびnは2であり、Q’はOであり、各Rはメチルである。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、AAはフェニルであり;UはNHであり:Rはハロであり;そしてRは-(CH)OHであり、ここで、nは2である。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、Aはフェニルであり;UはNHであり:Rはハロであり;そしてRは-(CH)SHであり、ここで、nは2である。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、Aはフェニルであり;UはNHであり;Rは水素であり;そしてRは-N(R)であり、ここで、一方のRは水素であり、他方はメチルである。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、Aはフェニルであり;UはNHであり;Rはハロであり;そしてRは-N(R)であり、ここで、各Rは水素である。ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、Aはフェニルであり;Rは水素であり;そしてRは-C(O)Rであり、ここで、Rはメチルである。
ある態様において、本発明は、式(II)のネオデグラダーを提供し、ここで、AAはC-C10シクロアルキル環であり;UはNHであり;Rは水素であり;そしてRは-(CH)Q’(CH)N(R)であり、ここで、mおよびnは2であり、Q’はOであり、一方のRは水素であり、他方はメチルである。
ある態様において、ネオデグラダーは、分解のためにタンパク質をターゲティングできるE3ユビキチンリガーゼと三成分複合体を形成する分子である。
VIII. ネオデグラダーコンジュゲート
本発明は、1以上のここに開示するネオデグラダーおよびここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分のコンジュゲートを提供する。これらコンジュゲートは、セレブロン(CRBN)に結合し、CRL4CRBN E3ユビキチンリガーゼにより介在される基質タンパク質の動員およびユビキチン化を促進することによりタンパク質を分解することができる。これら薬剤は「分子糊」として作用し、リガーゼとネオ基質のタンパク質相互作用を再プログラミングする疎水性パッチとして結合接合面を満たす。
ある態様において、本発明は、式(I)
〔式中、
aは1~10の整数であり;
AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
は水素およびハロから選択され;
UはNHおよびCFから選択され;
Xは-NR-、=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
QおよびQ’は各々独立してO、SまたはNRであり;
は水素またはC-Cアルキルであり;
nは1~6の整数であり;
mは2~6の整数であり;
ここで、各基の左側はLに結合し、右側はAに結合し;
但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
Lは開裂可能リンカーまたは開裂不可能リンカーであり;そして
Bmはここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
の化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。
ある態様において、UはNHである。
ある態様において、ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートは、腫瘍細胞株に対してインビトロ抗増殖性活性を有する。ある態様において、ネオデグラダーおよびここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分を含むネオデグラダーコンジュゲートは、ネオデグラダー単独またはここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分単独より少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%または少なくとも約100%高いインビトロ抗増殖性活性を有する。ある態様において、ネオデグラダーおよびここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分を含むネオデグラダーコンジュゲートは、ネオデグラダー単独またはここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分単独より少なくとも約2倍、少なくとも約3倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、少なくとも約6倍、少なくとも約7倍、少なくとも約8倍、少なくとも約9倍、少なくとも約10倍高いインビトロ抗増殖性活性を有する。
ある態様において、ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートは、ダウディリンパ腫細胞株に対するインビトロ抗増殖性活性、例えば、ネオデグラダー単独または抗CD33抗体またはその抗原結合部分単独と比較して高いダウディリンパ腫細胞株に対する抗増殖性活性を有する。ある態様において、ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートは、HL-60急性骨髄性白血病細胞株に対するインビトロ抗増殖性活性、例えば、ネオデグラダー単独または抗CD33抗体またはその抗原結合部分単独と比較して高いHL-60急性骨髄性白血病細胞株に対する抗増殖性活性を有する。ある態様において、ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートは、ラモス非ホジキンリンパ腫細胞株に対するインビトロ抗増殖性活性、例えば、ネオデグラダー単独または抗CD33抗体またはその抗原結合部分単独と比較して高いラモス非ホジキンリンパ腫細胞株に対する抗増殖性活性を有する。ある態様において、ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートは、ヒト血清存在下で、抗増殖性活性を維持できる。ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートを癌の処置に使用できる。
ある態様において、抗体ネオデグラダーコンジュゲート(AnDC)は1以上のここに開示するネオデグラダーおよびここに開示する抗CD33抗体またはその抗原結合部分のコンジュゲートである。
III.A. リンカー
本発明のネオデグラダーは、リンカーを介して抗CD33抗体またはその抗原結合部分に連結され得る。ここで使用する用語「リンカー」は、抗CD33抗体またはその抗原結合部分(Bm)を式(I)の化合物内の基Xに接続できるあらゆる化学部分をいう。
ある態様において、リンカーは、ヘテロ二官能性基を含み得る。本発明において、用語「ヘテロ二官能性基」は、それが一部であるリンカーを抗CD33抗体またはその抗原結合部分の一部であるに連結する化学部分をいう。ヘテロ二官能性基は、化学部分の何れかの端に異なる反応性基を有するとして特徴づけられる。「Bm」への結合は、化学または酵素コンジュゲーションまたは両者の組み合わせを介して達成され得る。化学コンジュゲーションは、抗CD33抗体またはその抗原結合部分の表面上のアクセス可能なアミノ酸残基と、ヘテロ二官能性基の反応ハンドルの制御された反応を含む。化学コンジュゲーションの例は、リシンアミドカップリング、システインカップリングおよび遺伝子操作により組み込まれた非天然アミノ酸を介するカップリング(ここで、所望の反応ハンドルを有する非天然アミノ酸が「Bm」上に挿入される)を含むが、これらに限定されない。酵素コンジュゲーションにおいて、酵素は、リンカーと抗CD33抗体またはその抗原結合部分上のアクセス可能なアミノ残基のカップリングに介在する。酵素コンジュゲーションの例は、ソルターゼを使用するペプチド転移、微生物トランスグルタミナーゼを使用するペプチド転移およびN-グリカン工学を含むが、これらに限定されない。化学コンジュゲーションおよび酵素コンジュゲーションを連続的に使用もできる。例えば、酵素コンジュゲーションを、その後の化学コンジュゲーションで使用する独特の反応ハンドルを「Bm」上に導入するためにも使用できる。
ある態様において、ヘテロ二官能性基は:
〔式中、
はリンカーの残存部分への結合点であり;そして
はBmへの結合点である。〕
から選択される。
ある態様において、リンカー「L」は開裂不可能である。ここで使用する用語「開裂不可能リンカー」は、抗CD33抗体またはその抗原結合部分をネオデグラダーに安定な、共有結合的方法で連結でき、「開裂可能リンカー」としてここに定義するカテゴリーに入らないあらゆる化学部分である。故に、開裂不可能リンカーは、酸誘導開裂、光誘導開裂、生体内還元性開裂、ペプチダーゼ誘導開裂、エステラーゼ誘導開裂およびジスルフィド結合開裂に実質的に抵抗性である。「開裂に実質的に抵抗性」は、抗体ネオデグラダーコンジュゲート集団の少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、さらにより好ましくは少なくとも95%および最も好ましくは少なくとも99%のリンカーまたは隣接リンカーの化学結合が、酸、光解離性開裂剤、生体内還元剤、ペプチダーゼ、エステラーゼまたは開裂可能リンカーにおける化学結合(例えば、ジスルフィド結合)を開裂する化学的もしくは生理学的化合物により、上記薬剤の何れかでの処理数時間~数日内の間開裂されないままであることを意味する。ある態様において、リンカーは、ネオデグラダーおよび/または抗CD33抗体またはその抗原結合部分が活性のままであり得る条件下、酸誘導開裂、光誘導開裂、生体内還元性開裂、酵素開裂などに感受性ではない。開裂不可能リンカーから産生されるADC異化生成物は、抗体からの残存アミノ酸を含む。これらの異化生成物は、由来する標的細胞に独特かつ予想外の性質を発揮し得る。
当業者は、開裂不可能リンカーと開裂可能リンカーを容易に区別できる。
開裂不可能リンカーの例は、SMCC(スクシンイミジル4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシラート)リンカー、スクシンイミドチオエーテルリンカーおよび:
〔式中、
pは1~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
などのリンカーを含むが、これらに限定されない。
ある態様において、リンカーは:
である。ある態様において、pは5である。
ある態様において、リンカーは開裂可能であり得る。ある態様において、リンカーは、ネオデグラダーおよび/または抗CD33抗体またはその抗原結合部分が活性のままであり得る条件で、酸誘導開裂、光誘導開裂、生体内還元性開裂、酵素開裂などに感受性であり得る。
ある態様において、開裂可能リンカーは酵素により開裂され得る。ある態様において、開裂可能リンカーはプロテアーゼ、ペプチダーゼ、エステラーゼ、ベータ-グルクロニダーゼ、グリコシダーゼ、ホスホジエステラーゼ、ホスファターゼ、ピロホスファターゼまたはリパーゼにより開裂され得る。
ある態様において、開裂可能リンカーはプロテアーゼにより開裂され得る。プロテアーゼの例は、カテプシンB、VAGPテトラペプチドなどを含むが、これらに限定されない。
ある態様において、開裂可能リンカーはペプチドを含む。ある態様において、ペプチドは、リンカーの開裂部位であり、それにより、リソソーム酵素などの細胞内プロテアーゼへの暴露により、薬物の放出が促進される。ペプチドは、特定の酵素、例えば、腫瘍関連プロテアーゼ、カテプシンB、CおよびDまたはプラスミンプロテアーゼによる酵素開裂のために設計され、最適化され得る。2個のアミノ酸を有するペプチドの例は、アラニン-アラニン(ala-ala)、バリン-アラニン(val-ala)、バリン-シトルリン(vcまたはval-cit)、アラニン-フェニルアラニン(afまたはala-phe);フェニルアラニン-リシン(fkまたはphe-lys);フェニルアラニン-ホモリシン(phe-homolys);およびN-メチル-バリン-シトルリン(Me-val-cit)を含むが、これらに限定されない。3個のアミノ酸を有するペプチドの例は、グリシン-バリン-シトルリン(gly-val-cit)、アスパラギン酸-バリン-シトルリン(asp-val-cit)、アラニン-アラニン-アスパラギン(ala-ala-asn)、アラニン-フェニルアラニン-リシン(ala-phe-lys)、グリシン-グリシン-フェニルアラニン(gly-gly-phe)およびグリシン-グリシン-グリシン(gly-gly-gly)を含むが、これらに限定されない。4個のアミノ酸を有するペプチドの例は、グリシン-グリシン-バリン-シトルリン(gly-gly-val-cit)およびグリシン-グリシン-フェニルアラニン-グリシン(gly-gly-phe-gly)を含むが、これらに限定されない。上記アミノ酸の組み合わせは、逆の順でも存在し得る(すなわち、cit-val)。
本発明のペプチドは、L-またはD-異性体のアミノ酸残基を含み得る。用語「天然に存在するアミノ酸」は、Ala、Asp、Asx、Cit、Cys、Glu、Phe、Glx、Gly、His、Ile、Lys、Leu、Met、Asn、Pro、Gln、Arg、Ser、Thr、Val、TrpおよびTyrをいう。「D-」は、天然に存在する(「L-」)アミノ酸の配置とは逆の、「D」(右旋性)配置を有するアミノ酸を指定する。ここに記載するアミノ酸は商業的に購入するか(Sigma Chemical Co., Advanced Chemtech)または当分野で既知の方法を使用して合成することができる。
ある態様において、リンカー(「L」)は、
〔式中、
qは2~10の整数であり;
、Z、ZおよびZは各々独立して存在しないかまたはLまたはD配置の天然に存在するアミノ酸残基であり、但しZ、Z、ZおよびZの少なくとも2個はアミノ酸残基であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択される、プロテアーゼ開裂可能リンカーである。
ある態様において、Z、Z、ZおよびZは独立して存在しないかまたはL-バリン、D-バリン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アラニン、D-アラニン、L-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニン、L-リシン、D-リシンおよびグリシンからなる群から選択され;但し、Z、Z、ZおよびZの少なくとも2個はアミノ酸残基である。
ある態様において、Zは存在しないかまたはグリシンであり;Zは存在しないかまたはL-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アラニン、D-アラニンおよびグリシンから選択され;ZはL-バリン、D-バリン、L-アラニン、D-アラニン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンから選択され;そしてZはL-アラニン、D-アラニン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-リシン、D-リシン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンから選択される。
ある態様において、Lは
である。
ある態様において、qは5である。
ある態様において、Lはピロホスファターゼ開裂可能リンカーである。
ある態様において、Lは:
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
である、ピロホスファターゼ開裂可能リンカーである。
ある態様において、Lはベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカーである。
ある態様において、Lは:
〔式中、
qは2~10の整数であり;
----は存在しないかまたは結合であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択されるベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカーである。
ある態様において、リンカーは生体内還元性である。生体内還元性リンカーは、血漿と異なる細胞内区画における還元能を利用する。腫瘍細胞の細胞質に存在する還元グルタチオンは、正常細胞の細胞質に存在するものの最大1000倍高く、腫瘍細胞はまた細胞区画における還元に寄与し得る酵素も含む。リンカーは、全身循環中コンジュゲートをインタクトに維持し、高細胞内濃度のグルタチオンにより選択的に開裂され、腫瘍部位で活性薬物を非毒性プロドラッグから放出する。
ある態様において、Lは:
〔式中、
qは2~10の整数であり;
R、R’、R”およびR”’は各々独立して水素、C-CアルコキシC-Cアルキル、(C-C)NC-CアルキルおよびC-Cアルキルから選択されるかまたは、2個のジェミナルR基は、それらが結合している炭素原子と一体となってシクロブチルまたはシクロプロピル環を形成でき;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択される、生体内還元性リンカーである。
ある態様において、リンカーは酸開裂可能である。酸開裂可能リンカーは、血液循環の中性pHでは安定なままであるが、酸性環境の細胞区画で加水分解され、細胞毒性薬物を放出するよう特異的に設計される。
ある態様において、Lは
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択される、酸開裂可能リンカーである。
ある態様において、Lは、ネオデグラダーの放出がテトラジンまたは関連化合物により、化学的に誘導される、クリック放出リンカーである。
ある態様において、Lは、
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点であり;そして
は抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
から選択される、クリック放出リンカーである。
III.B. 抗CD33抗体
本発明は、抗CD33抗体またはその抗原結合部分にコンジュゲートしたネオデグラダーを提供する。
CD33は、骨髄およびリンパ系細胞両者で発現される膜貫通受容体である。シアル酸に結合し、故に、シアル酸結合免疫グロブリン型レクチン(SIGLEC)ファミリーのメンバーである。CD33は、細胞相互作用における介在および免疫細胞の静止状態の維持に役割を有する。結合により、タンパク質の細胞質部分に存在するCD33の免疫受容体チロシンベースの抑制性モチーフ(ITIM)がリン酸化され、SHPホスファターゼなどのSrc相同性2(SH2)ドメイン含有タンパク質のドッキング部位として作用する。これにより、細胞の食作用を阻害するカスケードがもたらされ得る。構造的に、CD33の細胞外部分は2個の免疫グロブリンドメインを含み、細胞内部分はITIMを含む。CD33の同義語は、シアル酸結合Ig様レクチン3、SIGLEC3、SIGLEC-3、gp67およびp67を含むが、これらに限定されない。
ヒトCD33のカノニカルアミノ酸配列および既知アイソフォームを表1に示す(UniProtKB- P20138;配列番号13~18)。

CD33は急性骨髄性白血病(AML)症例の約90%で発現され、治療抗体の標的としての有用性が示されている。AML芽球上の高CD33発現が、約30年前に報告された。CD33は、AMLを示す患者の85~90%の芽球ならびに正常骨髄前駆細胞および骨髄球で検出された。CD33は造血細胞に制限されるが、正常造血幹細胞ではなく、よってAML治療の治療として理想的である。
本発明のコンジュゲートのための抗CD33抗体はCD33に特異的に結合できる。ある態様において、ここに記載する抗CD33抗体は高親和性、例えば、10-6以下、10-7以下、10-8以下、10-9以下、10-10以下、10-11以下、10-12以下、10-12M~10-7M、10-11M~10-7M、10-10M~10-7Mまたは10-9M~10-7MのKで、ヒトCD33に結合する。
ある態様において、抗CD33抗体は重鎖および軽鎖を含み、ここで、重鎖は重鎖可変領域(VH)を含み、軽鎖は軽鎖可変領域(VL)を含み;ここで、VHはVH相補性決定領域(CDR)1(VH-CDR1)、VH-CDR2およびVH-CDR3を含み、VLはVL-CDR1、VL-CDR2およびVL-CDR3を含み;ここで、VH-CDR3は、配列番号3に少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH-CDR2を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号1のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH-CDR1を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号5のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL-CDR1を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号6のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL-CDR2を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号7のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。ある態様において、CDRは、下表2に示す配列を含む。

ある態様において、抗CD33抗体重鎖可変領域は、配列番号4のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある態様において、抗CD33抗体軽鎖可変領域は、配列番号8のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
ある態様において、抗CD33抗体は配列番号4のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有する配列を含む重鎖可変領域および配列番号8のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域を含む。
ある態様において、抗CD33抗体重鎖は、配列番号9または配列番号11に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号10または配列番号12に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。

ある態様において、抗CD33抗体は配列番号9に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号10に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
ある態様において、抗CD33抗体は配列番号11に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号12に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
ある態様において、抗CD33抗体は各々引用によりここに明示的に包含させる、米国特許5,585,089、US5,693,762に開示される。
ある態様において、抗CD33抗体は重鎖および軽鎖を含み、ここで、重鎖は重鎖可変領域(VH)を含み、軽鎖は軽鎖可変領域(VL)を含み;ここで、VHはVH相補性決定領域(CDR)1(VH-CDR1)、VH-CDR2およびVH-CDR3を含み、VLはVL-CDR1、VL-CDR2およびVL-CDR3を含み;ここで、VH-CDR3は、配列番号21に少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH-CDR2を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号19のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH-CDR1を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号22のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL-CDR1を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL-CDR2を含む。ある態様において、抗CD33抗体は配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。ある態様において、CDRは、下表4に示す配列を含む。

ある態様において、抗CD33抗体重鎖可変領域は、配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある態様において、抗CD33抗体軽鎖可変領域は、配列番号28のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
ある態様において、抗CD33抗体は配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有する配列を含む重鎖可変領域および配列番号28のアミノ酸配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域を含む。
ある態様において、抗CD33抗体重鎖は、配列番号25に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配を含む。ある態様において、抗CD33抗体は26に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。

ある態様において、抗CD33抗体は配列番号25に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号26に少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。用語「CD33AB」は、配列番号25に示す重鎖および配列番号26に示す軽鎖を含む。
抗CD33抗体は修飾、すなわち、何らかのタイプの分子が共有結合している、アナログおよび誘導体を、そのような共有結合が抗体がその抗原結合免疫特異性を保持することを許容とする限り、含む。例として、しかし、限定するものではないが、抗体の誘導体およびアナログは、例えば、グルコシル化、アセチル化、ペグ化、リン酸化、アミド化、既知保護/遮断基による誘導体化、タンパク質分解開裂、細胞性抗体単位への結合または他のタンパク質などにより、さらに修飾されているものを含む。特異的化学開裂、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシン存在下の代謝合成などを含むが、これらに限定されない既知技術により、多数の化学修飾の何れかを実施し得る。さらに、アナログまたは誘導体は、1以上の非天然アミノ酸を含み得る。
ネオデグラダーコンジュゲートにおける抗CD33抗体は、Fc受容体と相互作用するアミノ酸残基に修飾(例えば、置換、欠失または付加)有する抗体を含み得る。特に、抗体は抗FcドメインとFcRn受容体の間の相互作用に関与するとして同定されているアミノ酸残基に修飾を有する抗体を含む。癌細胞抗原に免疫特異的な抗体は例えば、Genentech(San Francisco, Calif.)から商業的に得ることができまたは例えば、化学合成または組み換え発現技術などの当業者に知られる任意の方法で産生できる。癌細胞抗原に免疫特異的な抗体をコードするヌクレオチド配列は、例えば、GenBankデータベースまたは類似のデータベース、刊行物からまたは日常的クローニングおよびシーケンシングにより得ることができる。
ある態様において、ネオデグラダーコンジュゲートの抗体はモノクローナル抗体、例えばマウスモノクローナル抗体、キメラ抗体またはヒト化抗体であり得る。ある態様において、抗体は抗体フラグメント、例えばFabフラグメントであり得る。
IX. 組成物および使用方法
ここに記載するコンジュゲートおよび/または化合物は、薬学的にまたは薬学的に許容される塩の形態であり得る。ある態様において、このような塩は無機または有機な塩はに由来する。
適当な酸付加塩の例は、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、重硫酸塩、酪酸塩、クエン酸塩、経皮酸塩、カンファースルホン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、シュウ酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニル-プロピオン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トシル酸塩およびウンデカン酸塩を含む。
適当な塩基付加塩の例は、アンモニウム塩;ナトリウム塩およびカリウム塩などのアルカリ金属塩;カルシウム塩およびマグネシウム塩などのアルカリ土類金属塩;ジシクロヘキシルアミン塩、N-メチル-D-グルカミンなどの有機塩基との塩;およびアルギニン、リシンなどのアミノ酸との塩などを含む。
例えば、Bergeは、次のFDA承認市販塩を挙げる:アニオン酢酸塩、ベシル酸塩(ベンゼンスルホン酸塩)、安息香酸塩、炭酸水素塩、二酒石酸塩、ブロマイド、エデト酸カルシウム(エチレンジアミン四酢酸塩)、カムシル酸塩(カンファースルホン酸塩)、炭酸塩、クロライド、クエン酸塩、二塩酸塩、エデト酸塩(エチレンジアミン四酢酸塩)、エジシル酸塩(1,2-エタンジスルホン酸塩)、エストレート(ラウリル硫酸塩)、エシル酸塩(エタンスルホン酸塩)、フマル酸塩、グルセプト酸塩(グルコヘプトン酸塩)、グルコン酸塩、グルタミン酸塩、グリコリルアルサニレート(グリコラミドフェニルアルソン酸塩)、ヘキシルレゾルシン酸塩、ヒドラバミン(N,N’-ジ(デヒドロアビエチル)エチレンジアミン)、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヒドロキシナフトエ酸塩、アイオダイド、イセチオン酸塩(2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩)、乳酸塩、ラクトビオン酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マンデル酸塩、メシル酸塩(メタンスルホン酸塩)、メチルブロマイド、メチル硝酸塩、メチル硫酸塩、ムチン酸塩、ナプシル酸塩(2-ナフタレンスルホン酸塩)、硝酸塩、パモ酸塩(エンボナート)、パントテン酸塩、リン酸塩/二リン酸塩、ポリガラクツロン酸塩、サリチル酸塩、ステアリン酸塩、塩基性酢酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、タンニン酸塩、酒石酸塩、テオクル酸塩(8-クロロテオフィリン酸塩)およびトリエチオジド;有機カチオンベンザチン(N,N’-ジベンジルエチレンジアミン)、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、エチレンジアミン、メグルミン(N-メチルグルカミン)およびプロカイン;および金属カチオンアルミニウム、カルシウム、リチウム、マグネシウム、カリウム、ナトリウムおよび亜鉛。
Bergeは、さらに次の非FDA承認市販(米国外)塩を挙げる:アニオンアジピン酸塩、アルギン酸塩、アミノサリチル酸塩、アンヒドロメチレンクエン酸塩、アレコリン、アスパラギン酸塩、重硫酸塩、ブチルブロマイド、経皮酸塩、ジグルコン酸塩、ジ臭化水素酸塩、二コハク酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヒドロフルオライド、ヨウ化水素酸塩、メチレンビス(サリチル酸塩)、ナパジシル酸塩(1,5-ナフタレンジスルホン酸塩)、シュウ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、フェニルエチルバルビツール酸塩、ピクリン酸塩、プロピオン酸塩、チオシアン酸塩、トシル酸塩およびウンデカン酸塩;有機カチオンベネタミン(N-ベンジルフェネチルアミン)、クレミゾール(1-p-クロロベンジル-2-ピロリジン-1’-イルメチルベンゾイミダゾール)、ジエチルアミン、ピペラジンおよびトロメタミン(トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン);および金属カチオンバリウムおよびビスマス。
ここに記載するネオデグラダーコンジュゲートを含む医薬組成物は、投与方法により異なり得る適当な担体、添加物および助剤も含み得る。
ある態様において、医薬組成物は、適当な非経腸剤形として製剤化し得る。該製剤は、当分野で知られる種々の方法により製造され得る。医薬組成物は、直接血流、筋肉または直接臓器に投与され得る。非経腸投与の適当な手段は、静脈内、動脈内、腹腔内、髄腔内、脳室内、尿道内、胸骨内、頭蓋内、筋肉内および皮下を含む。非経腸投与のための適当なデバイスは、針付注射器、無針注射器および点滴技術を含む。
非経腸組成物は、典型的に塩、炭水化物および緩衝剤などの添加物を含み得る水溶液である。しかしながら、組成物はまた無菌非水溶液または無菌パイロジェンフリー水などの適当な媒体と共に使用される乾燥形態としても製剤化され得る。
例えば、凍結乾燥によるなどの無菌条件下の非経腸組成物の製造は、当業者に周知の標準技術を使用して、容易に達成され得る。
非経腸投与用組成物は、即時および/または修飾放出のために製剤化され得る。修飾放出製剤は、遅延、持続、パルス、制御、標的化およびプログラム化放出を含む。故に、組成物を、活性剤の修飾放出を提供するインプラントされたデポー剤として投与するための固体、半固体またはチキソトロピック液体として製剤化され得る。
非経腸製剤を、防腐剤などの、しかし、これに限定されない非経腸投与形態で使用される他の適当な薬学的に許容される添加物と混合し得る。
他の態様において、医薬組成物を、錠剤、カプセル剤、散剤、ペレット剤、懸濁液剤、溶液剤、エマルジョン剤などの適当な経口投与形態として製剤化し得る。崩壊剤、希釈剤、キレート剤、結合剤、流動促進剤、滑沢剤、充填剤、増量剤、抗付着剤などの他の適当な担体が存在し得る
経口投与製剤はまた甘味剤、媒体/湿潤剤、着色剤、風味剤、防腐剤、増粘剤/濃化剤などの他の適当な医薬添加物も含み得る。
ネオデグラダーまたはここに記載するネオデグラダーコンジュゲートを、種々の癌の処置に使用し得る。本発明のあるコンジュゲートは、有効性発現、薬物動態(例えば、吸収、分布、代謝、排泄)、溶解度(例えば、水溶解度)、他の医薬との相互作用(例えば、薬物代謝酵素阻害作用)、安全性(例えば、急性毒性、慢性毒性、遺伝毒性、生殖毒性、心毒性、発癌性、中枢毒性)および/または安定性(例えば、化学安定性、酵素に対する安定性)の点で優れている可能性があり、医薬として有用であり得る。
本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートは、疾患、例えば、癌- 例えば、結腸直腸癌(例えば、結腸直腸癌、直腸癌、肛門癌、家族性結腸直腸癌、遺伝性非ポリポーシス大腸癌結腸直腸癌、消化器間質腫瘍)、肺癌(例えば、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、悪性中皮腫)、中皮腫、膵臓癌(例えば、膵臓腺管癌、膵臓内分泌腫瘍)、咽頭癌、喉頭癌、食道癌、胃/胃癌(例えば、乳頭腺癌、粘液性腺癌、腺扁平上皮癌腫)、十二指腸癌、小腸癌、乳癌(例えば、侵襲性腺管癌、非侵襲性腺管癌、炎症性乳癌)、卵巣癌(例えば、卵巣上皮性癌、性腺外胚細胞腫瘍、卵巣胚細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍)、精巣腫瘍、前立腺癌(例えば、ホルモン依存性前立腺癌、非ホルモン依存性前立腺癌、去勢抵抗性前立腺癌)、肝臓癌(例えば、肝細胞癌、原発性肝臓癌、肝外胆管癌)、甲状腺癌(例えば、髄様甲状腺癌腫)、腎臓癌(例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)、腎盂および輸尿管移行細胞癌)、子宮癌(例えば、子宮頸癌、子宮体癌、子宮肉腫)、妊娠性絨毛癌、脳腫瘍(例えば、髄芽腫、神経膠腫、松果体星細胞腫瘍、毛様細胞性星状細胞腫、汎発性星状細胞腫、未分化星状細胞腫、下垂体腺腫)、網膜芽細胞腫、皮膚癌(例えば、基底細胞腫、悪性黒色腫)、肉腫(例えば、横紋筋肉腫、平滑筋肉腫、軟組織肉腫、紡錘細胞肉腫)、悪性骨腫瘍、膀胱癌、血液学的/血液癌(例えば、多発性骨髄腫、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、悪性リンパ腫、ホジキン疾患、慢性骨髄増殖性疾患)、原発不明癌の予防または処置用薬剤;癌増殖阻害剤;癌転移阻害剤;アポトーシスプロモーター;前癌病巣処置用薬剤(例えば、骨髄異形成症候群)などの医薬として使用し得る。
ある態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートは乳癌、胃癌、卵巣癌、子宮癌、肺癌、膵臓癌、肝臓癌、リンパ腫または血液学的癌の医薬として使用できる。
さらに、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートを、非薬物療法と同時に使用し得る。正確に言うと、コンジュゲートを、(1)手術、(2)アンギオテンシンIIなどを使用する昇圧療法、(3)遺伝子療法、(4)温熱療法、(5)寒冷療法、(6)レーザー焼灼および(7)放射線療法などの非薬物療法と組み合わせ得る。
例えば、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートを上記手術などの前または後に使用することにより、耐性発現の予防、無進行生存の延長、無疾患生存の延長、癌転移または再発の抑制、寿命の延長などの効果が提供され得る。
さらに、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートでの処置と、(i)種々の感染症の併発に対する抗生物質(例えば、パンスポリンなどのβ-ラクタム系、クラリスロマイシンなどのマクロライド系)投与、(ii)栄養障害改善のための高カロリー点滴、アミノ酸製剤または一般的ビタミン製剤の投与、(iii)疼痛緩和のためのモルヒネ投与、(iv)悪心、嘔吐、摂食障害、下痢、白血球減少症、血小板減少症、ヘモグロビン濃度減少、脱毛、肝障害、腎障害、DIC、発熱などの副作用軽減のための薬剤の投与および(v)癌の多剤耐性を抑制するための薬剤投与などの支持療法を組み合わせることが可能である。
ある態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートを、標準療法、例えば、1以上の治療剤(例えば、抗癌剤および/または免疫調節剤)と組み合わせて使用し得る。従って、ある態様において、ここに開示する腫瘍を処置する方法は、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートと1以上のさらなる治療剤の組み合わせを投与することを含む。ある態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートを、例えば、免疫経路の複数要素が標的化され得るように、1以上の抗癌剤と組み合わせて使用できる。ある態様において、抗癌剤は、免疫チェックポイント阻害剤(すなわち、特定の免疫チェックポイント経路を介するシグナル伝達遮断)を含む。本方法で使用され得る免疫チェックポイント阻害剤の非限定的例は、CTLA-4アンタゴニスト(例えば、抗CTLA-4抗体)、PD-1アンタゴニスト(例えば、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体)、TIM-3アンタゴニスト(例えば、抗TIM-3抗体)またはそれらの組み合わせを含む。組み合わせ処置の包括的および非限定的一覧は、本明細書の組み合わせ処置のセクションに詳細に開示される。
ある態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートは、対象にさらなる治療剤の投与の前または後に投与される。他の態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートは、対象にさらなる治療剤と同時に投与される。ある態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートおよびさらなる治療剤は、薬学的に許容される担体中の一組成物として同時に投与され得る。他の態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートおよびさらなる治療剤は、別々の組成物として同時に投与される。
ある態様において、本発明のネオデグラダーまたはネオデグラダーコンジュゲートで処置され得る対象は、ラットまたはマウスなどの非ヒト動物である。ある態様において、処置され得る対象はヒトである。
X. ネオデグラダーおよび組成物の製造方法
本発明は、ネオデグラダーコンジュゲートを製造する方法であって、抗CD33抗体またはその抗原結合部分と式(I-1):
〔式中、
AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
は独立して水素およびハロから選択され;
UはNHおよびCFから選択され;
Xは-NR-、=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
QおよびQ’は各々独立してO、SまたはNRであり;
は水素またはC-Cアルキルであり;
nは1~6の整数であり;
mは2~6の整数であり;そして
ここで、各基の左側はL’に結合し、右側はAに結合し;
但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
L’は抗CD33抗体またはその抗原結合部分にコンジュゲートする開裂可能または開裂不可能リンカー前駆体である。〕
の化合物またはその薬学的に許容される塩を反応させることを含む、方法を提供する。
ここに記載するとおり、リンカー前駆体は、抗CD33抗体またはその抗原結合部分に接続するヘテロ二官能性基を含む。
ある態様において、L’は開裂不可能リンカー前駆体である。ある態様において、L’は
〔式中、
pは1~10の整数であり;そして
はXへの結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、L’は
である。
ある態様において、pは5である。
ある態様において、L’は開裂可能リンカー前駆体である。
ある態様において、リンカー前駆体はプロテアーゼにより開裂可能である。ある態様において、リンカー前駆体は
〔式中、
qは2~10の整数であり;
、Z、ZおよびZは各々独立して存在しないかまたはLまたはD配置の天然に存在するアミノ酸残基であり、但しZ、Z、ZおよびZの少なくとも2個はアミノ酸残基であり;そして
はXへの結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、Z、Z、ZおよびZは独立して存在しないかまたはL-バリン、D-バリン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アラニン、D-アラニン、L-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニン、L-リシン、D-リシンおよびグリシンからなる群から選択され、但し、Z、Z、ZおよびZの少なくとも2個はアミノ酸残基である。
ある態様において、Zは存在しないかまたはグリシンであり;Zは存在しないかまたはL-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アラニン、D-アラニンおよびグリシンからなる群から選択され;Zは、L-バリン、D-バリン、L-アラニン、D-アラニン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンからなる群から選択され;そしてZは、L-アラニン、D-アラニン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-リシン、D-リシン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンからなる群から選択される。
ある態様において、L’は
である。
ある態様において、qは5である。
ある態様において、L’は生体内還元性リンカー前駆体である。ある態様において、生体内還元性リンカー前駆体は
〔式中、
qは2~10の整数であり;
R、R’、R”およびR”’は各々独立して水素、C-CアルコキシC-Cアルキル、(C-C)NC-CアルキルおよびC-Cアルキルから選択されるかまたは、2個のジェミナルR基は、それらが結合している炭素原子と一体となってシクロブチルまたはシクロプロピル環を形成でき;そして
はXへの結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、L’は酸開裂可能リンカー前駆体である。ある態様において、L’は
〔式中、
qは2~10の整数であり;そして
はXへの結合点である。〕
からなる群から選択される。
ある態様において、L’はクリック放出リンカー前駆体である。ある態様において、L’は
〔式中、
qは2~10の整数であり;そして
はXへの結合点である。〕
から選択される。
ある態様において、L’はピロホスファターゼ開裂可能リンカー前駆体である。ある態様において、L’は
〔式中、
qは2~10の整数であり;
はXへの結合点である。〕
である。
ある態様において、L’はベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカー前駆体である。ある態様において、L’は
〔式中、
qは2~10の整数であり;
----は存在しないかまたは結合であり;そして
はXへの結合点である。〕
から選択される。
ある態様において、式(I-1)の化合物は
から選択される。
ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は式(I-1)の化合物と反応させる前に前処理される。ある態様において、式(I-1)の化合物を、抗CD33抗体またはその抗原結合部分と反応させる。ある態様において、抗CD33抗体またはその抗原結合部分を、式(I-1)の化合物との反応前に鎖間ジスルフィドを還元するために前処理し得る。
一般的合成方法および中間体
本発明の化合物は、本開示および当分野における知識に照らしておよび/または下記スキームおよび合成例を参照して、当業者には製造できる。合成経路例は、下記スキームおよび実施例に示される。次のスキームおよび実施例において用いる可変基(例えば「R」基)は、本明細書の他の箇所に示すものから独立して解釈されることは理解されるべきである。当業者は、下記スキームおよび実施例が、ここに記載する化合物の製造をどのように説明するかを容易に理解する。
スキームで使用する略語は、一般に当分野で使用される慣例に従う。本明細書および実施例で使用する化学的略語は次のとおり定義する:「THF」はテトラヒドロフラン;「DMF」はN,N-ジメチルホルムアミド;「Me」はメチル;「Bu」はブチル;「FA」はギ酸;「PE」は石油エーテル;「MeOH」はメタノール;「EtOH」はエタノール;「DCM」はジクロロメタン;「BOC」または「Boc」「TFA」はトリフルオロ酢酸;「DMSO」はジメチルスルホキシド;「EtOAc」は酢酸エチル;「OAc」は酢酸エステル;「dppf」は1,1’-ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン;「dba」はジベンジリデンアセトン;「CDI」は1,1’-カルボニルジイミダゾール;「TBAF」はテトラブチルアンモニウムフルオライド;「TBSCl」はtert-ブチルジメチルシリルクロライド;「EtO」はジエチルエーテル;「ACN」はアセトニトリル;「h」は時間;「分」は分;「rt」は室温または保持時間(文脈から判断される);「aq」は水性、「sat」は飽和;「分」は分;「HOBt」は1-ヒドロキシベンゾトリアゾール水和物;「HATU」は1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロリン酸またはN-[(ジメチルアミノ)-1H-1,2,3-トリアゾロ-[4,5-b]ピリジン-1-イルメチレン]-N-メチルメタンアミニウムヘキサフルオロリン酸N-オキシド;「DIEA」および「iPrNEt」はジイソプロピルエチルアミン;「EtN」および「TEA」はトリエチルアミン。
スキーム1:化合物(Ia)の製造
実施例1:化合物(Ia)の合成
工程1:化合物2の合成
撹拌中の2-クロロ-4-ニトロフェニル)酢酸(化合物1、5.00g、23.19mmol、1.00当量)のTHF(75.00mL)溶液に、BH-MeS(THF中10M)(5.80mL、58.0mmol、2.50当量)を0℃で窒素雰囲気下に滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、2時間、70℃で撹拌した。混合物を、室温に冷却した。得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EtOAc=1:1)により精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(3g、64%)を黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.26 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.10-8.05 (m, 1H), 7.50 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 3.99-3.91 (m, 2H), 3.16-3.09 (m, 2H)
工程2:化合物3の合成
撹拌中の2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物2、5.00g、24.800mmol、1.00当量)および2-ブロモ酢酸tert-ブチル(29.0mL、148.28mmol、8.00当量)のトルエン(150.00mL)溶液に、BuNHSO(6.74g、19.84mmol、0.80当量)を添加した。上記混合物に、NaOH(HO中5M)(500.00mL)を40分間、0℃で滴下した。得られた混合物を、さらに2時間、25℃で撹拌した。得られた混合物を、EtOAc(3×500mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(400mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EtOAc=4:1)により精製して、tert-ブチル2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]酢酸(8g、65%)を黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.23 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.10-8.04 (m, 1H), 7.60 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 4.09 (s, 2H), 3.83-3.80 (m, 2H), 3.17-3.14 (m, 2H), 1.45 (s, 9H)
工程3:化合物4の合成
撹拌中のtert-ブチル2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]酢酸(化合物3、8.00g、16.14mmol、1.00当量、63.7%)のDCM(80.00mL)溶液に、TFA(16.00mL)を室温で滴下した。得られた混合物を、1時間、室温で撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮した。得られた混合物を、水(500mL)で希釈した。混合物を、EtOAc(3×500mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。これにより、[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]酢酸(6.5g、粗製)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI): 517 (2M-H)-
工程4:化合物5の合成
撹拌中の[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]酢酸(化合物4、6.30g、21.84mmol、1.00当量、90%)およびHATU(12.46g、32.76mmol、1.50当量)のDMF(65.00mL)溶液に、CHNH.HCl(1.77g、26.21mmol、1.20当量)およびDIEA(15.20g、117.8mmol、4.00当量)を室温で滴下した。得られた混合物を、2時間、室温で撹拌した。得られた混合物を、水で希釈した。得られた混合物を、EtOAc(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(50mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM:MeOH=10:1)により精製して、2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]-N-メチルアセトアミド(10g、純度:50%、収率:84%)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI): 273.28 (M+H)+
工程5:化合物6の合成
撹拌中の2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]-N-メチルアセトアミド(化合物5、3.3g、12.10mmol、1.00当量)のTHF(35.00mL)溶液に、BH-THF(THF中1M)(12.10mL、12.10mmol、1.00当量)を室温で窒素雰囲気下に滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、2時間、70℃で撹拌した。MeOHで反応をクエンチした。残渣を1N HClでpH6に酸性化した。得られた混合物を、EtOAc(20mL)で抽出した。水相を飽和NaHCO(飽和、水性)でpH8に塩基性化した。得られた混合物を、EtOAc(3×100mL)で抽出し、塩水(50mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。これにより、[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル](メチル)アミン(2.5g、80%)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI): 259.26 (M+H)+
工程6:化合物7の合成
撹拌中の[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル](メチル)アミン(化合物6、2.50g、9.69mmol、1.00当量)およびBocO(2.53g、11.6mmol、1.20当量)のTHF(40mL)溶液に、TEA(1.17g、11.6mmol、1.20当量)を25℃で滴下した。混合物を、25℃で2時間撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM:MeOH=5:1)により精製して、tert-ブチルN-[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(1.70g、50%)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI): 359.36 (M+H)+
工程7:化合物8の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(化合物7、1.70g、4.74mmol、1.00当量)およびNHCl(750mg、14.2mmol、3.00当量)のEtOH(85mL)およびHO(17mL)溶液に、25℃でFe(1.3g、23.7mmol、5.00当量)を添加した。混合物を、80℃で2時間撹拌した。混合物を、室温に冷却した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをEtOH(3×50mL)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EtOAc=4:1)により精製して、tert-ブチルN-[2-[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(900mg、58%)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI): 329.33 (M+H)+
工程8:化合物9の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[2-[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(化合物8、500mg、1.52mmol、1.00当量)のTHF(10mL)溶液に、ジホスゲン(601mg、3.04mmol、2.00当量)を25℃で滴下した。混合物を、25℃で1時間撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮し、DMF(5mL)に再溶解した。撹拌中の3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、下記のとおり製造、499mg、1.82mmol、1.20当量)およびTEA(1.56g、15.45mmol、10.00当量)のDMF(20mL)中の混合物に、25℃で上記溶液を滴下した。混合物を、25℃で1時間撹拌した。得られた混合物を、40mLの氷水で希釈した。得られた混合物を、EtOAc(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(5×40mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM:MeOH=10:1)により精製して、tert-ブチル(2-(2-クロロ-4-(3-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソイソインドリン-5-イル)メチル)ウレイド)フェネトキシ)エチル)(メチル)カルバメート(670mg、70%)を白色固体として得た。LCMS: (ESI): 628.63 (M+H)+
工程9:ネオデグラダーP1の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル]-N-メチルカルバメート(化合物9、670mg、1.07mmol、1当量)のDCM(10mL)溶液に、TFA(2.5mL)を0℃で滴下した。混合物を、25℃で1時間撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮した。粗製生成物を次の条件を用いる分取HPLCで精製した:カラム、SunFire C18 OBD Prepカラム、100μm、19×250mm;移動相、水(0.05%TFA)およびACN(5%相Bを30分間以内に60%まで);検出器、UV 220nm。集めたフラクションを凍結乾燥して、1-(3-クロロ-4-[2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(500mg、89%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 528.53 (M+H)+. 1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ 7.77 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.57-7.53 (m, 2H), 7.49 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.21 (d, J = 4.0 Hz, 2H), 5.19-5.1 (m, 1H), 4.55-4.41 (m, 4H), 3.75-3.67 (m, 4H), 3.21-3.15 (m,2H), 3.03-3.96 (m, 2H), 2.96-2.84 (m, 1H), 2.83-2.73 (m, 2H), 2.69 (s, 3H), 2.55-2.42 (m, 1H), 2.21-2.12 (m, 1H)
工程10:化合物(Ia)の合成
撹拌中の1-(3-クロロ-4-[2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(ネオデグラダーP1、200mg、0.38mmol、1.00当量)およびルチジン(81mg、0.76mmol、2.00当量)のDMF(10mL)中の混合物に、室温でHOBT(26mg、0.19mmol、0.50当量)および[4-[(2S)-5-(カルバモイルアミノ)-2-[(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタンアミド]ペンタンアミド]フェニル]メチル4-ニトロフェニルカーボネート(279mg、0.38mmol、1.00当量)を少しずつ添加した。反応混合物を、窒素雰囲気下、12時間、40℃で撹拌した。反応物を室温に冷却後、水(30mL)で反応をクエンチした。得られた混合物を、DCM(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2×30mL)、塩水(30mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を、減圧下、濃縮乾固した。残渣を逆相カラム(C18、移動相A:0.1%FA水溶液、B:ACN)で精製した。集めたフラクションを、減圧下、濃縮乾固した。粗製生成物(60mg)を次の条件を用いる分取HPLCで精製した(カラム:Xselect CSH OBDカラム30×150mm 5μm、n;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で33B~50B;220nm;RT1:5.27分)。集めたフラクションを凍結乾燥して、[4-[(2S)-5-(カルバモイルアミノ)-2-[(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタンアミド]ペンタンアミド]フェニル]メチルN-[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル]-N-メチルカルバメート(23.8mg、5%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 1126.11 (M+H)+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.99 (s, 1H), 10.00 (s, 1H), 8.88 (s, 1H), 8.12-8.08 (m, 1H),7.85-7.81 (m, 2H), 7.70-7.67 (m, 2H), 7.60-7.58 (m, 1H), 7.51 (s, 1H), 7.47-7.44 (m, 1H), 7.28-7.25 (m, 2H), 7.18-7.12 (m, 2H), 7.00 (s, 2H), 6.90 (br s, 1H), 5.97-5.95 (m, 1H), 5.42 (s, 2H), 5.12-5.05 (m, 1H), 4.98 (s, 2H), 4.42-4.32 (m, 4H), 4.18-4.15 (m, 1H), 3.56-3.40 (m, 4H), 3.37-3.36 (m, 3H),3.05-2.90 (m, 3H), 2.89-2.85 (m, 5H), 2.72-2.55 (m, 2H), 2.40-2.33 (m, 2H), 2.25-2.15 (m, 2H), 2.00-1.87 (m, 2H), 1.74-1.57 (m, 2H), 1.50-1.42 (m, 5H), 1.22-1.10 (m, 3H), 0.85-0.80 (m, 6H)
スキーム2:化合物(Ib)の製造
実施例2:化合物(Ib)の合成
工程1:化合物11の合成
撹拌中のメチル4-ブロモ-2-(ブロモメチル)ベンゾエート(化合物10、20.0g、64.8mmol、1.00当量)および3-アミノピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩(10.64g、83.0mmol、1.28当量)のDMF(80ml)中の混合物に、窒素雰囲気下、25℃でTEA(22.4mL、162.2mmol、2.50当量)を滴下した。混合物を、25℃で16時間撹拌した。続いて、HO(60mL)、AcOH(23mL)およびEtO(60mL)を連続して25℃で添加した。混合物を、25℃で2時間撹拌した。沈殿固体を濾過により集め、EtO(60mL)で洗浄した。これにより、3-(5-ブロモ-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(9.0g、42%)を明青色固体として得た。LCMS (ESI): 323.32 (M+H)+
工程2:化合物12の合成
撹拌中の3-(5-ブロモ-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物11、1.00g、3.09mmol、1.00当量)およびdppf(51mg、0.093mmol、0.03当量)のDMF(8mL)中の混合物に、窒素雰囲気下、25℃でZn(OAc)(170mg、0.928mmol、0.30当量)、Zn(CN)(545mg、4.64mmol、1.50当量)およびPd(dba)(28mg、0.031mmol、0.01当量)を添加した。最終反応混合物を、2時間、120℃でマイクロ波照射した。混合物を、室温に冷却し、濾過した。フィルターケーキをMeOH(3×30mL)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣をフラッシュクロマトグラフィー(シリカゲル、80g、DCM:MeOH=10:1)に付して、所望の生成物2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-カルボニトリル(400mg、47%)を褐色固体として得た。LCMS (ESI): 270 (M+H)+
工程3:INT1の合成
撹拌中の2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-カルボニトリル(化合物12、3.0g、11.14mmol、1.00当量)およびHCl(12M)(3.6mL)のMeOH(25mL)中の混合物に、25℃でPtO(1.25g、5.5mmol、0.49当量)を添加した。混合物を、水素バルーンを使用して、水素雰囲気下、室温で16時間水素化した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをMeOH(2×30mL)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。得られた固体をDCM:MeOH(3:1)(3×30mL)で洗浄し、乾燥させた。これにより、3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(2.5g、80%)を灰色固体として得た。LCMS (ESI): 274 (M+H)+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.02 (s, 1H), 8.15 (s, 1H), 7.98 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.89 (d, J=8.4 Hz, 1H),5.16-5.11 (m, 1H), 4.52 (d, J=17.2Hz, 1H), 4.40 (d, J=17.2Hz, 1H), 2.96-2.90 (m, 1H), 2.60-2.54 (m, 1H), 2.43-2.34 (m, 1H), 2.06-1.96 (m, 1H)
工程4:化合物14の合成
撹拌中の(2-クロロ-4-ニトロフェニル)酢酸(化合物13、5.00g、22.50mmol、1.00当量)のTHF(75mL)溶液に、窒素雰囲気下、0℃でBH-MeS(THF中10M)(5.60mL、56mmol、2.50当量)を滴下した。混合物を、70℃で2時間撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムに適用し、PE/EtOAc(5:1)で溶出して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(4.44g、88%)を黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.26 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.10-8.05 (m, 1H), 7.50 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 3.99-3.91 (m, 2H), 3.16-3.09 (m, 2H)
工程5:化合物15の合成
撹拌中の2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物14、4.44g、22.02mmol、1.00当量)およびイミダゾール(4.50g、66.06mmol、3.00当量)のDMF(50.00mL)中の混合物に、25℃でTBSCl(6.97g、46.25mmol、2.10当量)を添加した。混合物を、25℃で16時間撹拌した。得られた混合物を、水(100mL)で希釈した。得られた混合物を、EtOAc(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(3×100mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムに適用し、PE/EtOAc(10:1)で溶出して、tert-ブチル[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]ジメチルシラン(6.6g、90%)を無色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.24 (s, 1H), 8.06-8.04 (m, 1H), 7.46 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.89-3.86 (m, 2H), 3.06-0.04 (m, 2H), 0.85 (s, 9H), 0.04 (s, 6H)
工程6:化合物16の合成
tert-ブチル[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]ジメチルシラン(化合物15、5.70g、18.05mmol、1.00当量)およびFe(10.08g、180.45mmol、10.00当量)のEtOH(110mL)/水(55mL)中の混合物に、NHCl(9.65g、180.45mmol、10当量)を添加した。混合物を、80℃で2時間撹拌した。混合物を、室温に冷却した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをEtOH(3×50mL)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣を水(100mL)で希釈し、EtOAc(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下蒸発乾固して、4-[2-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]エチル]-3-クロロアニリン(5.2g、粗製)を薄褐色油状物として得た。LCMS (ESI): 286.29 (M+H)+
工程7:化合物17の合成
4-[2-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]エチル]-3-クロロアニリン(化合物16、200.00mg、0.70mmol、1.00当量)およびTEA(141mg、1.40mmol、2.00当量)のDMF(3mL)溶液に、CDI(113mg、0.70mmol、1.00当量)のDMF(1mL)溶液を、窒素下、0℃で滴下した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。次いで上記溶液およびTEA(141mg、1.40mmol)を、3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、192mg、0.70mmol、1.00当量)のDMF(2mL)溶液に滴下した。同じ反応を2回繰り返した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応物を、水(20mL)で希釈し、EtOAc(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水、塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下蒸発乾固した。残渣をシリカゲルカラム(DCM:MeOH=10:1)で精製して、1-(4-[2-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]エチル]-3-クロロフェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(170mg、21%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 585.59 (M+H)+
工程8:ネオデグラダーP3の合成
1-(4-[2-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]エチル]-3-クロロフェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(化合物17、170.00mg、0.29mmol、1.00当量)のTHF(2.00mL)溶液に、0℃でTBAF(THF中1N、0.58mL、0.58mmol、2.00当量)を添加した。得られた混合物を25℃で8時間撹拌した。反応物を分取TLC(DCM:MeOH=10:1)で精製して、147mgの粗製1-(3-クロロ-4-(2-ヒドロキシエチル)フェニル)-3-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソイソインドリン-5-イル)メチル)尿素を白色固体として得た。LCMS (ESI): 471.47 (M+H)+
工程9:化合物19の合成
2-メチル-2-スルファニルプロパン-1-オール(化合物18、1.4g、13.2mmol、1.00当量)および5-ニトロ-2-[(5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル]ピリジン(化合物120、2.05g、6.67mmol、0.50当量)を、ジクロロメタン(3.50mL)およびMeOH(3.50mL)の溶媒混合物に添加した。得られた混合物を15℃撹拌した。次いで二酸化マンガン(2.29g、26.2mmol、2当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、15℃で15分間撹拌した。LCMSトレースは反応の完了を示した。反応物を蒸発乾固し、残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%NHHCO)、30分間で10%~100%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを減圧下濃縮乾固して、2-メチル-2-[(5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル]プロパン-1-オール(2.2g、58%)を黄色固体として得た。LCMS (ESI): 261 (M+H)+
工程10:化合物20の合成
2-メチル-2-[(5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル]プロパン-1-オール(化合物20、1.0g、3.84mmol、1.00当量)の無水DCM(30mL)溶液に、MeSONa(1.57g、15.4mmol、4.00当量)およびヨウ素(1.95g、7.68mmol、2.00当量)を少しずつ添加した。反応混合物を、45℃で24時間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣をカラムシリカゲルクロマトグラフィー(TLC:PE:EA=3:1、Rf=0.60;0~35%EtOAcの石油エーテル溶液)により精製して、2-(メタンスルホニルスルファニル)-2-メチルプロパン-1-オール(80mg、10%)を黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CD3Cl): δ 3.50 (s, 2H), 3.33 (s, 3H), 2.16 (br s, 1H), 1.47 (s, 6H)
工程11:化合物(Ib)の合成
1-[3-クロロ-4-(2-ヒドロキシエチル)フェニル]-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(ネオデグラダーP3、200.00mg、0.42mmol、1.00当量)およびTEA(129mg、1.26mmol、3.00当量)のDMF(4mL)溶液に、CDI(138mg、0.84mmol、2.00当量)のDMF(1mL)溶液を添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応物を、水(50mL)で希釈し、EtOAc(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(20mL×3)、塩水(20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下蒸発乾固して、粗製生成物(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチルイミダゾール-1-カルボキシラート、200mg)を薄黄色固体として得た。粗製生成物(100.00mg、0.18mmol、1.00当量)およびCsCO(115mg、0.35mmol、2.00当量)のDMF(8mL)溶液に、室温で2-(メタンスルホニルスルファニル)-2-メチルプロパン-1-オール(化合物20、59mg、0.32mmol、1.80当量)のDMF(2mL)溶液を滴下した。反応物を15℃で22時間撹拌した。反応物を、EtOAc(50ml)および氷冷水(100mL)で希釈した。有機層を濾別した。水相を、EtOAc(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(30mL×3)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下蒸発乾固して、粗製生成物(150mg)を黄色固体として得た。粗製生成物を分取HPLC(カラム:Xselect CSH OBDカラム30×150mm 5μm;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で38B~58B;220nm;RT1:5.12分)で精製した。集めたフラクションを凍結乾燥して、1-[3-クロロ-4-[2-([[2-(メタンスルホニルスルファニル)-2-メチルプロポキシ]カルボニル]-オキシ)エチル]フェニル]-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(15.7mg、11%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 681.68 (M+H)+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.99 (s, 1H), 8.86 (s, 1H), 7.70 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 7.51 (s, 1H), 7.44 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.24-7.17 (m, 1H), 6.87-6.84 (m, 1H), 5.76 (s, 2H), 5.13-5.11 (m, 1H), 4.42-4.40 (m, 2H), 4.32-4.28 (m, 4H), 3.54 (s, 3H), 3.00-2.87 (m, 3H), 2.62-2.58 (m, 1H), 2.44-2.34 (m, 1H), 2.01-1.95 (m, 1H), 1.45 (s, 6H)
スキーム3:化合物(Ic)の製造
実施例3:化合物(Ic)の合成
工程1:化合物23の合成
撹拌中のtert-ブチル(2-アミノフェニル)(メチル)カルバメート(化合物22、300mg、1.35mmol、1.00当量)のDMF(20mL)溶液に、CDI(218mg、1.35mmol、1.00当量)およびTEA(68mg、1.35mmol、1.00当量)を0℃で窒素雰囲気下に滴下した。混合物を、0℃で2時間撹拌した。上記混合物に、3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、368mg、1.35mmol、1.00当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、一夜、75℃で撹拌した。次いで反応混合物を、室温に冷却した。得られた混合物を水(30mL)でクエンチし、DCM(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(30mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、濾過し、減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=10:1)により精製して、tert-ブチルN-[2-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]-N-メチルカルバメート(300mg、42%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 522 (M+H)+
工程2:ネオデグラダーP4の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[2-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]-N-メチルカルバメート(化合物23、300mg、1.00当量)のDCM(20mL)溶液に、TFA(5mL)を0℃で添加した。混合物を、0℃で2時間撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮した。粗製生成物を次の条件を用いる逆相で精製した(C18、移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分)。集めたフラクションを減圧下濃縮して、3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-1-[2-(メチルアミノ)フェニル]尿素(210mg、87%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 422 (M+H)+. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 10.99 (s, 1H), 7.69 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 7.60 (s, 1H), 7.53 (s, 1H), 7.45 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.26-7.24 (m, 1H), 6.99-6.93 (m, 1H), 6.76-6.72 (m, 1H), 6.60-6.55 (m, 2H), 5.14-5.08 (m, 1H), 5.00-4.85 (br s, 1H), 4.48-4.28 (m, 4H), 2.92-2.82 (m, 1H), 2.70 (s, 3H), 2.62-2.57 (m, 1H), 2.49-2.41 (m, 1H), 2.02-1.95 (m, 1H)
工程3:化合物(Ic)の合成
撹拌中の3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-1-[2-(メチルアミノ)フェニル]尿素(P4、150.00mg、0.36mmol、1.00当量)、2,6-ルチジン(76mg、0.71mmol、2.00当量)およびHOBT(96mg、0.71mmol、2.00当量)のDMF(3.00mL)中の混合物に、窒素雰囲気下、室温で[4-[(2S)-5-(カルバモイルアミノ)-2-[(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタンアミド]ペンタンアミド]フェニル]メチル4-ニトロフェニルカーボネート(394mg、0.53mmol、1.50当量)を添加した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN)で精製して、粗製生成物(60mg)を白色固体として得た。粗製生成物(60mg)を次の条件を用いる分取HPLCで精製した(カラム:Xselect CSH OBDカラム30×150mm 5μm、n;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で24B~44B;220nm;RT1:6.33;RT2:)。集めたフラクションを凍結乾燥して、[4-[(2S)-5-(カルバモイルアミノ)-2-[(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタンアミド]ペンタンアミド]フェニル]メチルN-[2-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]-N-メチルカルバメート(18.1mg、5%)を白色固体として得た。LCMS (ESI): 1020 (M+H)+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.99 (s, 1H), 9.96 (s, 1H), 8.19-8.06 (m, 3H), 7.79 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 7.70 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.53-7.41 (m, 5H), 7.20-7.05 (m, 4H), 7.00 (s, 2H), 6.95-6.90 (m, 1H), 5.95 (br s, 1H), 5.41 (s, 2H), 5.18-4.89 (m, 3H), 4.44-4.20 (m, 5H), 4.19-4.17 (m, 1H), 3.09 (s, 3H), 3.07-2.85 (m, 3H), 2.22-2.02 (m, 2H), 2.00-1.85 (m, 2H), 1.71-1.25 (m, 10H), 1.20-1.12 (m, 3H), 0.84-0.80 (m, 6H)
スキーム4は、どのように化合物(Id)をネオデグラダーP1から製造したかを示す。
スキーム4:化合物(Id)の製造
化合物(Id)の合成
撹拌中の1-(3-クロロ-4-[2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(P1、40.00mg、0.076mmol、1.00当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノエート(25.00mg、0.081mmol、1.07当量)のDMF(2.00mL)中の混合物に、室温でDIEA(20.00mg、0.16mmol、2.04当量)を滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、3時間、室温で撹拌した。得られた混合物を水(30mL)でクエンチし、DCM(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を水(30mL)、塩水(30mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を、減圧下、濃縮乾固した。残渣を次の条件により精製した:カラム:SunFire C18 OBD Prepカラム、100μm、19mm×250mm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:8.5分間で25B~55B;220nm;RT1:8分;集めたフラクションを凍結乾燥して、N-[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)-N-メチルヘキサンアミド(化合物(Id)、24mg、43%)を白色固体として得た。LCMS: (ES, m/s): 721,723 (M+H)+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.99 (s, 1H), 8.78 (s, 1H), 7.70-7.66 (m, 2H), 7.51 (s, 1H), 7.41 (d, J = 9.6Hz, 1H), 7.18-7.16 (m, 2H), 7.00 (d, J = 5.6Hz, 2H), 6.85-6.80 (m, 1H), 5.12-5.05 (m, 1H), 4.42-4.33 (m, 5H), 3.39-3.36 (m, 3H), 2.91-2.76 (m, 7H), 2.68-2.52 (m, 1H), 2.48-2.35 (m, 1H), 2.33-2.20 (m, 3H), 2.05-1.95 (m, 1H), 1.48-1.44 (m, 5H), 1.28-1.12 (m, 3H)
スキーム5Aおよび5Bは、どのようにネオデグラダーP1と別のトリペプチドリンカーの複合体を製造するかを示す。
スキーム5A:ネオデグラダーP1-トリペプチドリンカー複合体の合成
スキーム5B:ネオデグラダーP1-トリペプチドリンカー複合体の合成(続き)
スキーム6Aおよび6BはどのようにネオデグラダーP1とβ-グルクロニドリンカーの複合体を製造するかを示す。
スキーム6A:ネオデグラダーP1-β-グルクロニドリンカー複合体の合成
工程1:化合物25の合成
撹拌中の3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-プロパン酸(化合物24、5.00g、16.06mmol、1.00当量)の混合物に、SOCl(25mL)を室温で添加した。得られた混合物を16時間、80℃で撹拌した。所望の生成物LCMSはLCMSで検出される(MeOHを伴う誘導体 MS=326)。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-(3-クロロ-3-オキソプロピル)カルバメート(化合物25、7.5g、粗製)を黄色油状物として得た。粗製生成物をさらに精製することなく直接次工程で使用した。H-NMR分析は、それが所望の生成物であることを示した(MeOHを伴う誘導体)。1H-NMR (300 MHz, CDCl3) δ 7.81-7.77 (m, 2H), 7.63-7.59 (m, 2H), 7.46-7.40 (m, 2H), 7.40-7.31 (m, 2H), 5.33 (s, 1H), 4.42 (d, J=3.0 Hz, 2H), 4.24 (t, J=6.0 Hz, 1H), 3.74-3.67 (m, 3H), 3.50 (d, J=3.0 Hz, 2H), 2.59 (t, J=6.0 Hz, 2H)
工程2:化合物28の合成
撹拌中の4-ホルミル-2-ニトロフェノール(化合物27、4.21g、25.19mmol、1.00当量)およびAgO(7.00g、30.20mmol、1.20当量)のACN(100mL、190.24mmol、75.00当量)溶液に、化合物26(10.00g、25.17mmol、1.00当量)を、N雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、一夜、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをDCM(50ml×3)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EA(PE:EA=1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-(4-ホルミル-2-ニトロフェノキシ)オキサン-2-カルボキシラート(化合物28、10.5g、86%)を白色固体として得た。H-NMR分析は、それが所望の生成物であることを示した。LCMS (ES, m/z): 484 [M+1]+. 1H-NMR (300 MHz, CDCl3) δ 10.00 (s, 1H), 8.34 (s, 1H), 8.13-8.09 (m, 1H), 7.52 (d, J=3.0 Hz, 1H), 5.47-5.29 (m, 4H), 4.37-4.35 (m, 1H), 3.75-3.73 (m, 3H), 2.17-2.06 (m, 9H)
工程3:化合物29の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-(4-ホルミル-2-ニトロフェノキシ)オキサン-2-カルボキシラート(化合物28、6.00g、12.41mmol、1.00当量)のMeOH(50mL)溶液に、N雰囲気下、RTでNaBH(0.47g、12.42mmol、1.00当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、2時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温で、水で反応をクエンチした。得られた物質をNaSOで乾燥させた。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをDCMで洗浄した。得られた混合物を減圧下濃縮して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-(ヒドロキシメチル)-2-ニトロフェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物29、5.5g、91%)を固体として得た。LCMS (ES, m/z): 486 [M+H]+
工程4:化合物30の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-(ヒドロキシメチル)-2-ニトロフェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物29、5.50g、11.33mmol、1.00当量)のEA(60mL)中の混合物に、室温でPd/C(1.10g、10%)を少しずつ添加した。得られた混合物を、H雰囲気下、16時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをDCMおよびMeOHで洗浄し、濾液を減圧下濃縮して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-アミノ-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物30、4.0g、77%)を固体として得た。粗製生成物をさらに精製することなく直接次工程で使用した。LCMS (ES, m/z): 456 [M+H]+
工程5:化合物31の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-アミノ-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物30、1.00g、2.19mmol、1.00当量)およびNaHCO(0.20g、2.40mmol、1.1当量)のTHF(10mL)溶液に、化合物25(0.87g、2.62mmol、1.20当量)を、N雰囲気下、0℃で少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、6時間、0℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温で、水で反応をクエンチした。得られた混合物を、DCMで抽出した。合わせた有機層を減圧下濃縮した。残渣をPE/EA(EA=100%)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-プロパンアミド)-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物31、1.1g、66%)を明黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 749 [M+H]+
工程6:化合物33の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物31、1.50g、2.00mmol、1.00当量)および炭酸ビス(4-ニトロフェニル)(化合物32、0.68g、2.24mmol、1.12当量)のDMF(15mL)中の混合物に、N雰囲気下、0℃でDIEA(0.52g、4.01mmol、2.00当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、一夜、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、40分間で10%~90%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを減圧下濃縮乾固して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)-4-[[(4-ニトロフェノキシカルボニル)オキシ]メチル]フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物33、1.4g、48%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 914 [M+H]+
スキーム6B:ネオデグラダーP1-β-グルクロニドリンカー複合体の合成
工程7:化合物34の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)-4-[[(4-ニトロフェノキシカルボニル)オキシ]メチル]フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物33、1.00g、1.09mmol、1.00当量)および1-(3-クロロ-4-[2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(ネオデグラダーP1、0.58g、1.09mmol、1.00当量)のDMF(10mL)中の混合物に、N雰囲気下に、室温でHOBT(1.18g、8.72mmol、8.00当量)および2,4-ジメチルピリジン(1.07g、8.72mmol、8.00当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、16時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物をさらなる精製に使用した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、40分間で10%~80%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを減圧下濃縮して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物34、800mg、56%)を固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1302 [M+H]+
工程8:化合物35の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物34、800.00mg、0.61mmol、1.00当量)のTHF(80mL)中の混合物に、N雰囲気下、室温でHCl(6N、80mL)を少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、3時間、50℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、40分間で0%~80%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを凍結乾燥して、(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物35、230mg、32%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1162 [M+H]+
工程9:化合物36の合成
撹拌中の(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物35、230mg、0.2mmol,1.00当量)のDMF(2mL)溶液に、ピペリジン(0.4mL)を、窒素雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、10分間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を次の条件(カラム:XSelect CSH Prep C18 OBDカラム、19×250mm、5μm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:7分間で20B~40B;220nm;RT 1:5.78分)を用いる分取HPLCによるさらなる精製に直接使用して、(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[2-(3-アミノプロパンアミド)-4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]-エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物36、35mg,18%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 940 [M+H]+
工程10:化合物(Ie)の合成
撹拌中の(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[2-(3-アミノプロパンアミド)-4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物36、30mg、0.03mmol、1.00当量)のDMF(3mL)溶液に、DIEA(13mg、0.10mmol、3.00当量)および化合物37(30mg、0.10mmol、3.00当量)を、窒素雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、1時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を次の条件を用いる分取HPLCで精製した(カラム:Xselect CSH OBDカラム30×150mm 5μm、移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:10分間で21B~36B;220nm;RT 1:11.15分)。集めたフラクションを凍結乾燥して、(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル]-(メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-[3-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]プロパンアミド]フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物(Ie)、10.5mg、28%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1133 [M+H]+. 1H-NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 10.9 (s, 1H), 9.13 (s, 1H), 8.16 (s, 1H), 7.92-7.68 (m, 4H), 7.52 (s, 1H), 7.44 (d, J=3.0 Hz, 1H), 7.18-6.99 (m, 7H), 5.76 (s, 1H), 5.20-5.10 (m, 2H), 4.98 (br s, 2H), 4.76-4.74 (m, 1H), 4.42-4.33 (m, 4H), 3.65 (br s, 1H), 3.58-3.54 (m, 5H), 3.35 (d, J=6 Hz, 2H), 2.90-2.83 (m, 7H), 2.57-2.55 (m, 3H), 2.45-2.30 (m, 1H), 2.02-1.98 (m, 4H), 1.48-1.42 (m, 5H), 1.40-1.20 (m, 3H)
スキーム7は、どのようにネオデグラダーP6とヒドラジンリンカーの複合体を製造するかを示す。
スキーム7:ネオデグラダーP6-ヒドラゾンリンカー複合体の合成
工程1:化合物38の合成
撹拌中の4-アミノアセトフェノン(化合物37、100mg、0.73mmol、1.00当量)のTHF(2.00mL)溶液に、ジホスゲン(0.40mL)を室温で滴下した。得られた混合物を、30分間、0℃で撹拌した。得られた混合物を減圧下濃縮した。得られた固体をDMF(1.50mL)に再溶解した。撹拌溶液に、3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、200mg、0.73mmol、1.00当量)のDMF(3.00mL)およびTEA(0.50mL)溶液を室温で滴下した。得られた混合物を、1時間、0℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物に水(5mL)を添加し、CHCl(3×10mL)で抽出した。有機層を減圧下濃縮した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.05%TFA)、35分間で10%~50%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを濃縮乾固して、1-(4-アセチルフェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(化合物38、80mg、25%)を明黄色固体として得た。LCMS: (ES.m/z): 435 [M+1]+
工程2:化合物(If)の合成
1-(4-アセチルフェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(化合物38、80.00mg、0.18mmol、1.00当量)および6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンヒドラジド;トリフルオロ酢酸(75mg、1.20当量)のメタノール(5.00mL)中の混合物を、一夜、50℃で撹拌した。混合物を、室温に冷却した。LCMSは反応の完了を示した。沈殿固体を濾過により集め、MeOH(2×5mL)で洗浄した。粗製固体を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:C18カラム;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で10%~50%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを、DCM(3×5mL)で抽出し、減圧下濃縮した。これにより、3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-1-[4-[(1E)-1-[[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]i分o]エチル]フェニル]尿素(化合物(If)、4.4mg、3.7%)を灰白色固体として得た。LCMS: (ES.m/z): 642 [M+1]+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.99 (s, 1H), 10.26-10.15 (m, 1H), 8.82 (s, 1H),7.69-7.62 (m, 3H), 7.52-7.43 (m, 4H), 7.01-6.99 (m, 2H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.42-4.33 (m, 4H), 2.98-2.82 (m, 1H), 2.62-2.58 (m, 2H), 2.20-2.12 (m, 2H), 1.58-1.51 (m, 6H), 1.26-1.09 (m, 6H)
スキーム8は、どのようにネオデグラダーP2と4級アミンリンカーの複合体を製造するかを示す。
スキーム8:ネオデグラダーP2-4級アミンリンカー複合体の合成
工程1:化合物40の合成
撹拌中のN-[(1S)-1-[[(1S)-4-(カルバモイルアミノ)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]カルバモイル]ブチル]カルバモイル]-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド(化合物39、100mg、0.18mmol、1.00当量)のDMF(2mL)溶液に、SOCl(20mg、0.18mmol、1当量)のDCM(2mL)溶液を、N下、0℃で滴下した。得られた混合物を、0℃で1時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、氷冷水(20mL)で希釈し、DCM(10mL×3)で抽出し、合わせた有機層を水(10mL)、塩水(10mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、N-[(1S)-1-[[(1S)-4-(カルバモイルアミノ)-1-[[4-(クロロメチル)フェニル]-カルバモイル]ブチル]カルバモイル]-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド(化合物40、80mg、53%)の生成物を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 591,593 [M+H]+
工程2:化合物42の合成
撹拌中の(2-クロロ-4-ニトロフェニル)酢酸(化合物41、8.60g、39.9mmol、1.00当量)のTHF(130mL)中の混合物に、BH-MeS(10.00mL、105.4mmol、2.64当量)を0℃で滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、4時間、70℃で撹拌した。TLC(PE:EA=1:2)は反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(1:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物42、7.7g、96%)を黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.27 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.11-8.07 (m, 1H), 7.53 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 3.99 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.15 (t, J = 8.0 Hz, 2H)
工程3:化合物43の合成
撹拌中の2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール、(化合物42、7.70g、38.2mmol、1.00当量)および2-ブロモ酢酸tert-ブチル(57.74g、296.0mmol、7.75当量)のトルエン(70mL)中の混合物に、BuNHSO(10.37g、30.6mmol、0.80当量)を0℃で少しずつ添加した。上記混合物に、NaOH(15.00g、375.0mmol、9.82当量)のHO(90mL)溶液を30時間、0℃で滴下した。得られた混合物を、さらに4時間、室温で撹拌した。TLC(PE:EA=3:1)は反応の完了を示した。得られた混合物を、EtOAc(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(5:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]アセテート(化合物43、12.2g、91%)を黄色油状物として得た。1H NMR (300 MHz, CDCl3) δ 8.20 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.07-8.03 (m, 1H), 7.61 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 4.11 (s, 2H), 3.83 (t, J = 8.1 Hz, 2H), 3.16 (t, J = 8.1 Hz, 2H), 1.45 (s, 9H)
工程4:化合物44の合成
撹拌中のtert-ブチル2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]アセテート(化合物43、12.20g、38.6mmol、1.00当量)のDCM(120mL)中の混合物に、0℃でTFA(20mL)を滴下した。得られた混合物を、4時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮した。これにより、[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]酢酸(化合物44、8.4g、83%)を黄色固体として得た。LCMS: (ES, m/s): 517 (2M-H)- 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.64 (s, 1H), 8.20 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.11-8.08 (m, 1H), 7.72 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 4.06 (s, 2H), 3.74 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.06 (t, J = 8.0 Hz, 2H)
工程5:化合物45の合成
撹拌中の[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]酢酸、(化合物44、8.40g、32.35mmol、1.00当量)およびHATU(19.19g、50.47mmol、1.56当量)のDMF(80mL)中の混合物に、窒素雰囲気下、0℃でCHNH.HCl(2.69g、39.79mmol、1.23当量)およびDIEA(17.31g、133.93mmol、4.14当量)を添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、4時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。水/iceで反応をクエンチした。得られた混合物を、DCM(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(50mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣を(DCM:MeOH=10:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]-N-メチルアセトアミド(化合物45、7.2g、81%)を黄色油状物として得た。LCMS: (ES, m/s): 273,275 (M+H)+
工程6:化合物46の合成
撹拌中の2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]-N-メチルアセトアミド(化合物45、7.20g、26.40mmol、1.00当量)のTHF(70mL)中の混合物に、室温でBH-THF(THF中10M、52.0mL、520.0mmol、20当量)を滴下した。得られた混合物を、4時間、70℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。MeOHで反応をクエンチした。残渣を1N HClでpH6に酸性化した。得られた混合物を、EtOAc(20mL)で抽出した。水相を飽和NaHCO(飽和、水性)でpH8に塩基性化した。得られた混合物を、EtOAc(3×100mL)で抽出し、塩水(50mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣を(DCM:MeOH=8:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル](メチル)アミン(化合物46、5.4g、79%)を黄色固体として得た。LCMS: (ES, m/s): 259,261 (M+H)+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.26 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.15-8.12 (m, 1H), 7.73 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 3.72 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.61 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.10 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 2.87 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 2.40 (s, 3H)
工程7:化合物47の合成
撹拌中の[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル](メチル)アミン(化合物46、4.00g、15.46mmol、1.00当量)およびBocO(3.80g、17.41mmol、1.13当量)のTHF(20.00mL)中の混合物に、室温でNaHCO(4.00g、47.61mmol、3.08当量)のHO(20.00mL)溶液を滴下した。得られた混合物を、一夜、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を、EtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(20mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣を(DCM:MeOH=12:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(化合物47、4.8g、77%)を黄色固体として得た。
LCMS: (ES, m/s): 359,361 (M+H)+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.24 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 8.13-8.10 (m, 1H), 7.67 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 4.05-4.00 (m, 1H), 3.69 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.50 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.28 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 3.07 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 2.75 (s, 3H), 1.36 (s, 9H)
工程8:化合物48の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[2-[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート、(化合物47、5.60g、15.6mmol、1.00当量)のEtOH(112.00mL)中の混合物に、NHCl(2.50g、46.74mmol、2.99当量)のHO(12.00mL)溶液およびFe(4.40g、78.79mmol、5.05当量)を室温で添加した。得られた混合物を、3時間、80℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。得られた混合物を減圧下濃縮した。得られた混合物を、DCM(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(30mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣を(DCM:MeOH=10:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[2-[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(化合物48、4.2g、81%)を黄色油状物として得た。LCMS: (ES, m/s): 329,331 (M+H)+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 6.96 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 6.59 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 6.46-6.43 (m, 1H), 5.18 (br s, 2H), 3.50-3.45 (m, 4H), 3.29-3.26 (m, 2H), 2.75-2.71 (m, 5H), 1.38 (s, 9H)
工程9:化合物49の合成
tert-ブチルN-[2-[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エトキシ]エチル]-N-メチルカルバメート(化合物48、100mg、0.30mmol、1.00当量)のTHF(3mL)溶液に、窒素雰囲気下、0℃でLiAlH(92mg、2.43mmol、8.00当量)のTHF(2mL)溶液を添加した。得られた混合物を室温で16時間撹拌した。5反応を平衡して行った。LCMSは反応の完了を示した。次いで1N NaOH(10mL)で反応をクエンチし、濾過し、減圧下濃縮乾固し、次いで残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~60%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを濃縮乾固して、3-クロロ-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]エチル]アニリン、49(180mg、44%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 243,245 [M+H]+
工程10:化合物50の合成
3-クロロ-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]エチル]アニリン(化合物49、140mg、0.58mmol、1.00当量)のTHF(9mL)溶液に、窒素雰囲気下、0℃でジホスゲン(137mg、0.69mmol、1.20当量)を添加した。得られた混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで反応溶液を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をDMF(2mL)に再溶解し、次いで3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(158mg、0.58mmol、1.00当量)およびTEA(117mg、1.15mmol、2.00当量)のDMF(4mL)溶液に、窒素雰囲気下滴下した。得られた混合物を、室温で16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、メタノールで希釈し、得られた溶液を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~50%勾配;検出器、UV 254nm)で精製して、100mgの生成物を無色固体として得た。粗製生成物を次の条件を用いる分取HPLCで精製した:カラム:XBridge Shield RP18 OBDカラム、19×250mm、10μm;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:7分間で14%~32%;220nm;RT1:5.25分。集めたフラクションを凍結乾燥して、1-(3-クロロ-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(化合物50、60mg、18%)を無色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 542,544 [M+H]+
工程11:化合物(Ig)の合成
N-[(1S)-1-[[(1S)-4-(カルバモイルアミノ)-1-[[4-(クロロメチル)フェニル]-カルバモイル]ブチル]カルバモイル]-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド、(化合物40、66mg、0.11mmol、1.00当量)、1-(3-クロロ-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(化合物50、60mg、0.11mmol、1.00当量)およびDIEA(29mg、0.22mmol、2.00当量)のDMF(1mL)溶液に、TBAI(4mg、0.01mmol、0.10当量)を、空気中、室温で添加した。得られた混合物を室温で16時間撹拌した。LCMSトレースは反応の完了を示した。得られた混合物を次の条件を用いる逆相カラムクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.05%TFA)、40分間で5%~45%勾配;検出器、UV 254nm)で精製して、90mgの粗製生成物を黄色油状物として得た。次いで粗製生成物を次の条件(カラム:Xselect CSH OBDカラム30×150mm 5μm、n;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で15B~35B;220nm;RT1:6.00分)により再精製して、([4-[(2S)-5-(カルバモイルアミノ)-2-[(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタンアミド]ペンタンアミド]フェニル]メチル)[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル]ジメチルアザニウム化合物(Ig)(19mg、14.8%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1096 [M-FA]+, 549 [1/2 (M-FA)]+; 1H NMR (400 MHz, CD3OD) δ 8.48 (s, 1H), 7.77-7.72 (m, 3H), 7.55 - 7.47 (m, 3H), 7.37-7.35 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.18 - 7.14 (m, 2H), 6.77 (s, 2H), 5.17-5.13 (q, J = 8, 4Hz, 1H), 4.51 - 4.46 (m, 5H), 4.35 (s, 2H), 4.12 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 3.90 (s, 2H), 3.79 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 3.45 (t, J = 7.2 Hz, 4H), 3.22-3.15 (m, 1H), 3.11-3.05 (m, 1H), 3.00 (t, J = 6.0 Hz, 2H), 2.92 (s, 6H), 2.89 - 2.84 (m, 1H), 2.81 - 2.73 (m, 1H), 2.54-2.43 (m, 1H), 2.27 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 2.21 - 2.12 (m, 1H), 2.10 - 2.02 (m, 1H), 1.95 - 1.82 (m, 1H), 1.78-1.69 (m, 1H), 1.64-1.59 (m, 7H), 1.32-1.25 (m, 2H), 0.98-0.96 (m, 6H)
スキーム9Aおよび9Bは、どのようにネオデグラダーP13とペプチド含有リンカーの複合体を製造するかを示す。
スキーム9A:ネオデグラダーP13-ペプチドリンカー複合体の合成
スキーム9B:ネオデグラダーP13-ペプチドリンカー複合体の合成
スキーム10は、式(Ih)の化合物の合成を示す
スキーム10:ネオデグラダーP1-β-グルクロニドリンカー複合体(化合物(Ih))の合成
工程1:化合物63の合成
撹拌中の3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパン酸(化合物62、5.00g、16.06mmol、1.00当量)の混合物に、SOCl(25mL)を室温で添加した。得られた混合物を16時間、80℃で撹拌した。所望の生成物LCMSはLCMSで検出される(MeOHを伴う誘導体 MS=326)。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-(3-クロロ-3-オキソプロピル)カルバメート(化合物63、7.5g、粗製)を黄色油状物として得た。粗製生成物をさらに精製することなく次工程で直接使用した。H NMR分析は、それが所望の生成物であることを示した(MeOHを伴う誘導体)。1H-NMR (300 MHz, CDCl3) δ 7.81-7.77 (m, 2H), 7.63-7.59 (m, 2H), 7.46-7.40 (m, 2H), 7.40-7.31 (m, 2H), 5.33 (s, 1H), 4.42 (d, J=3.0 Hz, 2H), 4.24 (t, J=6.0 Hz, 1H), 3.74-3.67 (m, 3H), 3.50 (d, J=3.0 Hz, 2H), 2.59 (t, J=6.0 Hz, 2H)
工程2:化合物66の合成
撹拌中の4-ホルミル-2-ニトロフェノール(化合物65、4.21g、25.19mmol、1.00当量)およびAgO(7.00g、30.20mmol、1.20当量)のACN(100mL、190.24mmol、75.00当量)溶液に、メチル(2S,3S,4S,5R,6R)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-ブロモオキサン-2-カルボキシラート(化合物64、10.00g、25.17mmol、1.00当量)を、N雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、一夜、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをDCM(50mL×3)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EA(PE:EA=1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-(4-ホルミル-2-ニトロフェノキシ)オキサン-2-カルボキシラート(化合物66、10.5g、86%)を白色固体として得た。H-NMR分析は、それが所望の生成物であることを示した。LCMS (ES, m/z): 484 [M+1]+. 1H-NMR (300 MHz, CDCl3) δ 10.00 (s, 1H), 8.34 (s, 1H), 8.13-8.09 (m, 1H), 7.52 (d, J=3.0 Hz, 1H), 5.47-5.29 (m, 4H), 4.37-4.35 (m, 1H), 3.75-3.73 (m, 3H), 2.17-2.06 (m, 9H)
工程3:化合物67の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-(4-ホルミル-2-ニトロフェノキシ)オキサン-2-カルボキシラート(化合物66、6.00g、12.41mmol、1.00当量)のMeOH(50mL)溶液に、N雰囲気下、室温でNaBH(0.47g、12.42mmol、1.00当量)を添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、2時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温で、水で反応をクエンチした。得られた物質をNaSOで乾燥させた。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをDCMで洗浄した。得られた混合物を減圧下濃縮して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-(ヒドロキシメチル)-2-ニトロフェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート、(化合物67、5.5g、91%)を固体として得た。LCMS (ES, m/z): 486 [M+H]+
工程4:化合物68の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-(ヒドロキシメチル)-2-ニトロフェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物67、5.50g、11.33mmol、1.00当量)のEA(60mL)中の混合物に、室温でPd/C(1.10g、10%)を少しずつ添加した。得られた混合物を、H雰囲気下、16時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをDCMおよびMeOHで洗浄し、濾液を減圧下濃縮して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-アミノ-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物68、4.0g、77%)を固体として得た。粗製生成物をさらに精製することなく直接次工程で使用した。LCMS (ES, m/z): 456 [M+H]+
工程5:化合物70の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-アミノ-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物68、1.00g、2.19mmol、1.00当量)およびNaHCO(0.20g、2.40mmol、1.1当量)のTHF(10mL)溶液に、9H-フルオレン-9-イルメチルN-(3-クロロ-3-オキソプロピル)カルバメート(化合物69、0.87g、2.62mmol、1.20当量)を、N雰囲気下、0℃で少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、6時間、0℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温で、水で反応をクエンチした。得られた混合物を、DCMで抽出した。合わせた有機層を減圧下濃縮した。残渣をPE/EA(EA=100%)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物70、1.1g、66%)を明黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 749 [M+H]+
工程6:化合物72の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)-4-(ヒドロキシメチル)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物70、1.50g、2.00mmol、1.00当量)および炭酸ビス(4-ニトロフェニル)(化合物71、0.68g、2.24mmol、1.12当量)のDMF(15mL)中の混合物に、N雰囲気下に、0℃でDIEA(0.52g、4.01mmol、2.00当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、一夜、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、40分間で10%~90%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを減圧下濃縮乾固して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-アミノ]プロパンアミド)-4-[[(4-ニトロフェノキシカルボニル)オキシ]メチル]フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物72、1.4g、48%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 914 [M+H]+
工程7:化合物73の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)-4-[[(4-ニトロフェノキシカルボニル)オキシ]メチル]フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物72、1.00g、1.09mmol、1.00当量)および1-(3-クロロ-4-[2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(ネオデグラダーP1、0.58g、1.09mmol、1.00当量)のDMF(10mL)中の混合物に、N雰囲気下に、室温でHOBT(1.18g、8.72mmol、8.00当量)および2,4-ジメチルピリジン(1.07g、8.72mmol、8.00当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、N雰囲気下、16時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物をさらなる精製に使用した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、40分間で10%~80%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを減圧下濃縮して、メチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物73(800mg、56%)を固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1302 [M+H]+
工程8:化合物74の合成
撹拌中のメチル(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-トリス(アセチルオキシ)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]オキサン-2-カルボキシラート(化合物73(800.00mg、0.61mmol、1.00当量)のTHF(80mL)中の混合物に、N雰囲気下に、室温でHCl(6N、80mL)を少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、3時間、50℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、40分間で0%~80%勾配;検出器、UV 254nm。集めたフラクションを凍結乾燥して、(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物74、230mg、32%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1162 [M+H]+
工程9:化合物75の合成
撹拌中の(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]-2-(3-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド)フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸、74(230mg、0.2mmol、1.00当量)のDMF(2mL)溶液に、ピペリジン(0.4mL)を、窒素雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、10分間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を次の条件(カラム:XSelect CSH Prep C18 OBDカラム、19×250mm,5μm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:7分間で20B~40B;220nm;RT1:5.78分)を用いる分取HPLCで直接さらに精製して、(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[2-(3-アミノプロパンアミド)-4-[([[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル]オキシ)メチル]フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物75、35mg、18%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 940 [M+H]+
工程10:化合物(Ih)の合成
撹拌中の(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[2-(3-アミノプロパンアミド)-4-[({[2-(2-{2-クロロ-4-[({[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル}カルバモイル)アミノ]フェニル}エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル}オキシ)メチル]フェノキシ]-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物75、110mg、0.12mmol、1.00当量)およびペンタン二酸ビス(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)(化合物76、46mg、0.14mmol、1.2当量)のDMF(2.0mL)溶液に、DIEA(30mg、0.23mmol、2.0当量)を、窒素雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、1時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を次の条件を用いる分取HPLCで精製した(カラム:Kinetex EVO prep C18、30×150、5μm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で21%B~41%B、41%B;波長:254nm;RT1(分):5.8。集めたフラクションを凍結乾燥して、(2S,3S,4S,5R,6S)-6-{4-[({[2-(2-{2-クロロ-4-[({[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル}カルバモイル)アミノ]フェニル}エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル}オキシ)メチル]-2-(3-{5-[(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)オキシ]-5-オキソペンタンアミド}プロパンアミド)フェノキシ}-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸(化合物(Ih)、48mg、34%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 1151 [M+H]+, 1173 [M+Na]+.1H-NMR (300MHz, DMSO-d6): 12.80 (br s, 1H), 10.98 (s, 1H), 9.08 (s, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.18 (s, 1H), 7.96 (s, 1H), 7.68-7.66 (m, 2H), 7.51 (s, 1H), 7.44 (d, J=8.1 Hz,1H), 7.25-7.00 (m, 4H), 6.82-6.80 (m, 1H), 5.86 (s, 1H), 5.39-5.30 (m, 2H), 5.14-5.07 (m, 1H), 4.97 (s, 2H), 4.84 (d, J=7.2 Hz,1H), 4.47-4.27 (m, 4H), 3.90 (d, J=9.6 Hz, 1H), 3.56-3.48 (m, 4H), 3.45-3.36 (m, 6H), 2.95-2.80 (m, 8H), 2.75-2.65 (m, 3H), 2.62-2.55 (m, 2H), 2.49-2.35 (m, 1H), 2.21-2.16 (m, 2H), 2.01-1.95 (m, 1H), 1.85-1..80 (m, 2H)
スキーム11:ネオデグラダーP1-リンカー複合体(化合物(Ii))の合成
工程1:化合物76の合成
撹拌中の1-(3-クロロ-4-[2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エチル]フェニル)-3-[[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]尿素(化合物P1、180mg、0.34mmol、1.00当量)のDMF(8mL)溶液に、TEA(104mg、1.02mmol、3.0当量)および4-(クロロスルホニル)-3-ニトロ安息香酸(181mg、0.68mmol、2.00当量)を、窒素雰囲気下、0℃で少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、4時間、0℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物をさらなる精製に使用した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、10分間で10%~60%勾配;検出器、UV 254nm。混合物を凍結乾燥して、4-[[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)スルファモイル]-3-ニトロ安息香酸、(化合物76、70mg、27%)を明黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 757 [M+1]+
工程2化合物(Ii)の合成
撹拌中の4-[[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)スルファモイル]-3-ニトロ安息香酸、(化合物76、60mg、0.08mmol、1.00当量)のDMF(6mL)中の混合物に、窒素雰囲気下に、室温でHATU(45mg、0.12mmol、1.5当量)、1-(2-アミノエチル)ピロール-2,5-ジオン塩酸塩(化合物77、17mg、0.10mmol、1.20当量)およびDIEA(31mg、0.24mmol、3.0当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、4時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。残渣を分取HPLC(カラム:XBridge Prep Phenyl OBDカラム、19×150mm 5μm 13nm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:10分間で25B~43B;220nm;RT1:11.97分)で精製した。集めたフラクションを凍結乾燥して、4-[[2-(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)エチル](メチル)スルファモイル]-N-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エチル]-3-ニトロベンズアミド(化合物(Ii)、27mg、36%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 879,881 [M+H]. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 11.00 (s, 1H), 9.01 (t, J=6.0 Hz, 1H), 8.82 (s, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.11 (s, 2H), 7.71-7.67 (m, 2H), 7.52 (s, 1H), 7.44 (d, J=3.0 Hz, 1H), 7.21-7.12 (m, 2H), 7.02 (s, 2H), 6.84 (t, J=6.0 Hz, 1H), 5.14-5.08 (m, 1H), 4.48-4.28 (m, 4H), 3.62-3.50 (m, 6H), 3.40-3.28 (m, 2H), 2.95-2.85 (m, 4H), 2.80-2.73 (m, 2H), 2.65-2.60 (s, 1H), 2.41-2.27 (m, 1H), 2.05-1.95 (m, 1H)
スキーム12:ネオデグラダーP1-GGFGリンカー複合体(化合物(Ij))の合成
工程1:化合物79の合成
撹拌中の(2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-アセトアミド)酢酸(化合物78、10.00g、28.22mmol、1.00当量)およびPb(OAc)(15.02g、33.86mmol、1.20当量)のTHF(300mL)およびトルエン(100mL)中の混合物に、ピリジン(2.59g、32.74mmol、1.16当量)を、窒素雰囲気下、室温で滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、一夜、80℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキを酢酸エチル(20mL)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣を酢酸エチル(20mL)に溶解し、水、塩水で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(1:4)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、(2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]アセトアミド)メチルアセテート(化合物79、6.5g、56%)を白色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 391 [M+Na]+. 1H NMR (300MHz, CDCl3) δ 7.80 (d, J=7.5Hz, 2H), 7.62 (d, J=7.5Hz, 2H), 7.45 (t, J =7.5Hz, 2H), 7.36 (d, J =7.5Hz, 2H), 7.18 (br s, 1H),5.48 (br s, 1H), 5.28 (d, J =7.2Hz, 2H), 4.48 (d, J =6.6Hz, 2H), 4.26 (t, J =6.6Hz, 1H), 3.93 (d, 5.4Hz, 2H), 2.08 (s, 3H)
工程2:化合物81の合成
撹拌中の(2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-アミノ]アセトアミド)メチルアセテート、79(2.00g、5.43mmol、1.00当量)および2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物3、3.20g、15.85mmol、2.92当量)のDCM(40mL)混合物に、窒素雰囲気下、0℃でPPTS(400mg、1.59mmol、0.29当量)を滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、一夜、45℃で撹拌した。40%所望の生成物LCMSはLCMSで検出される。混合物を室温に冷却した。水/iceで反応をクエンチした。得られた混合物を、EtOEt(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(30mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣を精製byシリカゲルカラムクロマトグラフィー、PE/EtOAc(1:9)で溶出して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]メチル]カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物81、1.7g、55%)を白色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 510,512 [M+H]+. 1H NMR (300MHz, DMSO-d6): δ 8.58 (t, J=5.1Hz, 1H), 8.22 (dd, J =12, 2.4Hz, 1H), 7.89 (d, J =7.5Hz, 1H), 7.71-7.54 (m, 4H), 7.43-7.29 (m, 4H), 4.56 (d, J =6.9Hz, 2H), 4.30-4.16 (m, 3H), 3.70-3.61 (m, 4H), 3.04 (t, J =6.3Hz, 2H)
工程3:化合物82の合成
撹拌中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]メチル]カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物81、1.60g、3.14mmol、1.00当量)のDMF(5.0mL)中の混合物に、窒素雰囲気下、0℃でピペリジン(1.0mL)を少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、1時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.05%TFA)、40分間で0%~50%勾配;検出器、UV 254nm。これにより、2-アミノ-N-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]メチル]アセトアミド(化合物82、750mg、76%)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI, ms) 288 [M+H]+,329 [M+H+ACN]+
工程4:化合物83の合成
撹拌中の2-アミノ-N-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]-メチル]アセトアミド(化合物82、750mg、2.61mmol、1.00当量)およびBocO(580mg、2.66mmol、1.02当量)のDMF(10.00mL)中の混合物に、NaHCO(477mg、5.68mmol、2.18当量)のHO(10.00mL)溶液を0℃で滴下した。得られた混合物を、3時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。水(20mL)の添加により反応をクエンチした。得られた混合物を、EtOEt(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(20mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]メチル]カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物83、650mg、58%)を黄色油状物として得た。LCMS (ESI, ms), 388 [M+H]+, 332 [M+H-56]+. 1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.21 (d, J=2.4Hz, 1H), 8.04 (d, J=8.4Hz, 2H), 7.46 (d, J=8.4Hz, 1H), 7.05 (br s, 1H), 5.25 (br s, 1H), 4.73 (d, J=7.2Hz, 2H), 3.81-3.73 (m, 4H), 3.34-3.32 (m, 2H), 3.08 (t, J=6.8Hz, 2H), 1.42 (s, 9H)
工程5:化合物84の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エトキシ]メチル]-カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物83、650mg、1.68mmol、1.00当量)およびFe(260mg、4.66mmol、2.78当量)のEtOH(9.00mL)中の混合物に、NHCl(910mg、17.01mmol、10.1当量)のHO(3.00mL)溶液を室温で滴下した。得られた混合物を、4時間、90℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。得られた混合物を減圧下濃縮した。得られた混合物を、EtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(20mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(1:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エトキシ]メチル]-カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物84、500mg、83%)を黄色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 358 [M+H]+, 380 [M+Na]+. 1H NMR (300MHz, CDCl3) δ 7.02-6.96(m, 2H), 6.68 (d, J=2.4Hz, 1H), 6.52-6.49 (m, 1H), 5.29 (br s, 1H), 4.74 (d, J =6.9Hz, 2H), 3.80-3.78 (m, 2H), 3.69-3.63 (m, 2H), 2.88 (t, J =7.2Hz, 2H), 1.45 (s, 9H)
工程6:化合物86の合成
撹拌中の3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩(化合物85、398mg、1.28mmol、0.92当量)およびCDI(450mg、2.78mmol、1.99当量)のDMF(5.00mL)中の混合物に、0℃でTEA(300mg、2.96mmol、2.12当量)を添加した。得られた混合物を、2時間、室温で撹拌した。上記混合物に、tert-ブチルN-[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エトキシ]メチル]カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物84、500mg、1.40mmol、1.00当量)およびDMAP(550mg、4.50mmol、3.22当量)を少しずつ添加した。得られた混合物を、さらに一夜、60℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~50%勾配;検出器、UV 254nm。これにより、tert-ブチルN-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]カルバモイル]メチル)カルバメート(化合物86、550mg、60%)を明褐色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 657 [M+H]+, 601 [M+H-56]+,557 [M+H-100]+
工程7:化合物87の合成
撹拌中のtert-ブチルN-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]カルバモイル]メチル)-カルバメート(化合物86、530mg、0.80mmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中の混合物に、0℃でTFA(1.00mL)を添加した。得られた混合物を、30分間、0℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮した。これにより、2-アミノ-N-[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]アセトアミド;トリフルオロ酢酸(化合物87、(510mg、純度:64%、収率:60%)を灰白色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 557 [M+H-TFA]+
工程8:化合物89の合成
撹拌中の(2S)-2-[2-(2-アミノアセトアミド)アセトアミド]-3-フェニルプロパン酸(化合物88、2.00g、7.16mmol、1.00当量)およびNaHCO(1.80g、21.41mmol、3.00当量)のHO(40.00mL)中の混合物に、BocO(1.86g、8.52mmol、1.20当量)のDMF(40.00mL)溶液を0℃で滴下した。得られた混合物を、一夜、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温で、水で反応をクエンチした。得られた混合物を、EtOEt(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(50mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水(0.05%TFA)、30分間で5%~60%勾配;検出器、UV 220nm。これにより、(2S)-2-(2-[2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]アセトアミド]アセトアミド)-3-フェニルプロパン酸(化合物89、1.8g、60%)を白色半固体として得た。LCMS (ESI, ms): 380 [M+H]+,324 [M+H-56]+. 1H NMR: (300MHz, DMSO-d6) δ 8.17 (d, J=8.1Hz, 1H), 7.93 (t, J =5.7Hz, 1H), 7.31-7.20 (m, 5H), 7.00 (t, J =6.0Hz, 1H), 4.46-4.39 (m, 1H),3.78-3.67 (m, 2H), 3.56 (d, J =5.7Hz, 2H), 3.09-3.02 (m, 1H), 2.92-2.73 (m, 1H), 1.39 (s, 9H)
工程9:化合物90
撹拌中の(2S)-2-(2-[2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]アセトアミド]-アセトアミド)-3-フェニルプロパン酸(化合物89、340mg、0.90mmol、1.00当量)およびHATU(340mg、0.90mmol、1.00当量)のDMF(5.00mL)中の混合物に、HOBT(102mg、0.75mmol、0.84当量)を、0℃で少しずつ添加した。得られた混合物を、30分間、0℃で撹拌した。上記混合物に、2-アミノ-N-[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]アセトアミド;トリフルオロ酢酸(化合物87、511mg、純度:64%、0.48mmol、0.54当量)およびDIEA(340mg、2.63mmol、2.94当量)を0℃で添加した。得られた混合物を、さらに2時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~50%勾配;検出器、UV 220nm。集めたフラクションを減圧下濃縮した。これにより、tert-ブチルN-[[([[(1S)-1-[([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]カルバモイル]メチル)カルバモイル]-2-フェニルエチル]カルバモイル]メチル)カルバモイル]メチル]カルバメート(化合物90、210mg、48%)を灰白色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 918 [M+H]+, 818 [M+H-100]+.1H NMR: (400MHz, DMSO-d6): δ 10.97 (s, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.50 (t, J=6.4Hz, 1H), 8.31 (t, J=4.4Hz, 1H), 8.15 (d, J =9.6Hz, 1H), 7.910 (t, J =8.0Hz, 1H), 7.68-7.64 (m, 2H), 7.49 (s, 1H), 7.43 (d, J =9.6Hz, 1H), 7.24-7.12 (m, 7H), 7.00-6.95 (m, 1H), 6.84 (t, J =6.4Hz, 1H), 5.13-5.06 (m, 1H), 4.55-4.27 (m, 7H), 3.72-3.60 (m, 6H), 3.75-3.67 (m, 3H), 3.59-3.49 (m, 5H), 3.07-3.01 (m, 1H), 2.94-2.73 (m, 4H), 2.62-2.54 (m, 1H), 2.40-2.31 (m, 1H), 2.01-1.94 (m, 1H), 2.00-1.91 (m, 1H), 1.35 (s, 9H)
工程10:化合物91の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[[([[(1S)-1-[([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)-メチル]カルバモイル]メチル)カルバモイル]-2-フェニルエチル]カルバモイル]メチル)カルバモイル]-メチル]カルバメート(化合物90、140mg、0.15mmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中の混合物に、TFA(1.00mL)を0℃で滴下した。得られた混合物を、30分間、0℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を減圧下濃縮した。これにより、(2S)-2-[2-(2-アミノアセトアミド)アセトアミド]-N-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]-カルバモイル]メチル)-3-フェニルプロパンアミド;トリフルオロ酢酸(化合物91、140mg、79%)を灰白色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 818 [M+H-TFA]+
工程11:化合物(Ij)の合成
撹拌中の(2S)-2-[2-(2-アミノアセトアミド)アセトアミド]-N-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]-エトキシ)メチル]カルバモイル]メチル)-3-フェニルプロパンアミド;トリフルオロ酢酸(化合物91、140mg、0.15mmol、1.00当量)およびDIEA(70mg、0.54mmol、3.61当量)のDMF(2.00mL)中の混合物に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノエート(化合物92、70mg、0.23mmol、1.50当量)を0℃で少しずつ添加した。得られた混合物を、2時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を直接次の条件により精製した:カラム:XSelect CSH Prep C18 OBDカラム、19×250mm,5μm;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:7分間で25B~50B;254nm;RT1:6.35分;集めたフラクションを凍結乾燥して、粗製生成物を得た。粗製生成物を次の条件により再精製した:カラム:Kinetex EVO C18カラム、30×150,5μm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で20B~40B、220nm;RT1:6.77分;集めたフラクションを凍結乾燥して、N-[[([[(1S)-1-[([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エトキシ)メチル]カルバモイル]メチル)カルバモイル]-2-フェニルエチル]カルバモイル]メチル)カルバモイル]メチル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド(化合物(Ik)、22.8mg、14%)を灰白色固体として得た。LCMS (ESI, ms): 1011 [M+H]+. 1H NMR: (400MHz, DMSO-d6): δ 10.95 (s, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.51 (t, J=8.4Hz, 1H), 8.29 (t, J =8.0Hz, 1H), 8.12-8.01 (m, 3H), 7.70-7.66 (m, 2H), 7.44 (s, 1H), 7.42 (d, J =8.0Hz, 1H), 7.23-7.16 (m, 7H), 6.99 (s, 2H), 6.82 (t, J=8.0Hz, 1H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.55-4.28 (m, 7H), 3.72-3.60 (m, 6H), 3.55-3.51 (m, 2H), 3.36-3.34 (m, 2H), 3.05-3.00 (m, 1H), 2.94-2.72 (m, 4H), 2.62-2.54 (m, 1H), 2.40-2.32 (m, 1H), 2.12-2.05 (m, 2H), 2.00-1.91 (m, 1H), 1.50-1.38 (m, 4H), 1.19-1.10 (m, 2H)
スキーム13:ネオデグラダーP14-AAAリンカー複合体(化合物(Ik))の合成
工程1:化合物94の合成
撹拌中の(2-クロロ-4-ニトロフェニル)酢酸(化合物93、24.00g、111.32mmol、1.00当量)のTHF(240.00mL)溶液に、BH-MeS(28.00mL、295.23mmol、2.65当量)を、窒素雰囲気下、滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、2時間、70℃で撹拌した。TLC(PE:EtOAc=3:1)は反応の完了を示した。室温に冷却後、得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(3:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物94、18.00g、80%)を明黄色固体として得た。1H NMR (300 MHz, CDCl3) δ 8.27 (s, 1H), 8.10-8.07 (m, 1 H), 7.52 (d, J = 3 Hz, 1H), 3.96 (t, J = 6 Hz, 2H), 3.13 (t, J = 6 Hz, 2H)
工程2:化合物95の合成
撹拌中の2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物94、5.00g、24.80mmol、1.00当量)のDCM(100.00mL)溶液に、NBS(6.62g、1.50当量)およびPPh(9.76g、37.21mmol、1.50当量)を、N下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を一夜、室温で、N下に撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応物を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をPE/EtOAc(4:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、1-(2-ブロモエチル)-2-クロロ-4-ニトロベンゼン(化合物95、5.10g、72%)を赤色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.28 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.18 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.73 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.79 4 (t, J = 6.8 Hz, 2H), 3.38 (t, J = 6.8 Hz, 2H)
工程3:化合物96の合成
1-(2-ブロモエチル)-2-クロロ-4-ニトロベンゼン(化合物95、5.00g、18.90mmol、1.00当量)のDMF(50.00mL)溶液に、チオ酢酸カリウム(2.16g、18.90mmol、1.00当量)を、窒素雰囲気下、室温で添加した。得られた混合物を室温で2時間撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応物を、水(600.00mL)で希釈し、EtOAc(2000mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(200.00mL)、塩水(200.00mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、1-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]エテノン(化合物96、4.50g、85%)を赤色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.24 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.07 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.45 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.20 - 3.05 (m, 4H), 2.34 (s, 3H)
工程4:化合物97の合成
撹拌中の1-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]エテノン(化合物96、2.00g、7.70mmol、1.00当量)のMeOH(300.00mL)溶液に、N下、0℃でMeONa(6.93mL、37.33mmol、5.00当量、30%inMeOH)を添加した。得られた混合物を0℃で、N下、1時間撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応をAcOHでpH値3~4までクエンチした。得られた混合物を減圧下濃縮乾固した。残渣をDCM(50.00mL)で希釈し、濾過した。濾液を分取TLC(PE:EtOAc=10:1)で精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタンチオール(化合物97、1.35g、72%)を明黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.26 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.09 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.45 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.14 (t, J = 8.0Hz, 2H), 2.85 (dt, J = 8.0, 7.2 Hz, 2H), 1.43 (t, J = 7.2 Hz, 1H)
工程5:化合物99の合成
撹拌中の(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパン酸(化合物98、20.00g、64.24mmol、1.00当量)のDMF(200.00mL)溶液に、空気雰囲気下、室温でTSTU(25.18g、83.52mmol、1.30当量)およびDIEA(16.60g、128.48mmol、2.00当量)を添加した。得られた混合物を、1時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(200.00mL)で希釈し、を、EtOAc(100.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(100.00mL)、塩水(100.00mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固した。残渣を(PE:EtOAc=1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパノエート(化合物99、25.00g、83%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 431 [M+Na]+
工程6:化合物100の合成
D-アラニン(1.09g、0.012mmol、1.00当量)およびNaHCO(3.09g、0.04mmol、3.00当量)の水(50.00mL)溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパノエート(化合物99、5.00g、12.24mmol、1.00当量)のDMF(50.00mL)溶液を添加した。得られた混合物を、室温で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を2N HClでpH値2~3に調節した。得られた混合物を、EtOAc(100.00mL×3)で抽出し、合わせた有機層を塩水(100.00mL×3)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、(2R)-2-[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-アミノ]プロパンアミド]プロパン酸(化合物100、4.00g、71%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 383 [M+H]+
工程7:化合物101の合成
グリシン(3.68g、48.97mmol、1.00当量)およびNaHCO(12.34g、146.89mmol、3.00当量)の水(200.00mL)溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパノエート(化合物99、20.00g、48.97mmol、1.00当量)のDMF(200.00mL)溶液を添加した。反応物を、室温で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を2N HClでpH値2~3に調節した。得られた混合物を、EtOAc(500.00mL×3)で抽出し、合わせた有機層を塩水(500.00mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド]酢酸(化合物101、15.00g、71%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 369 [M+H]+
工程8:化合物102の合成
[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド]-酢酸(化合物101、5.00g、13.57mmol、1.00当量)、Pb(OAc)(7.22g、16.28mmol、1.20当量)およびピリジン(1.29g、16.31mmol、1.20当量)のTHF(300.00mL)/トルエン(100.00mL)溶液を、N下、80℃で16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温に冷却後、反応物を濾過した。フィルターケーキをTHF(100.00mL)で洗浄した。合わせた有機層を、減圧下、濃縮乾固した。残渣を(PE:EtOAc=1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド]メチルアセテート(化合物102、2.50g、45%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 405 [M+Na]+. 1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ 7.77 (t, J = 7.6 Hz, 2H), 7.58 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.43 - 7.37 (m, 2H), 7.36 - 7.29 (m, 2H), 7.10 (s, 1H), 5.24 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 4.51 - 4.35 (m, 2H), 4.23-4.09 (m, 2H), 2.04 (s, 3H), 1.39 (d, J = 6.8 Hz, 3H)
工程9:化合物103の合成
撹拌中の[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-プロパンアミド]メチルアセテート(化合物102、2.25g、5.88mmol、1.00当量)および2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタンチオール(化合物97、1.28g、5.88mmol、1.00当量)のDCM(120mL)溶液に、N下、室温で、TFA(0.27mL、2.37mmol、0.62当量)を添加した。得られた混合物を室温で16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を減圧下濃縮乾固した。残渣を(PE:EtOAc=1:4)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物103、3.10g、90%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 540 [M+H]+
工程10:化合物104の合成
9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物103、3.10g、5.74mmol、1.00当量)のDMF(155.00mL)溶液に、N下、0℃でピペリジン(31.00mL)を添加した。得られた混合物を0℃で0.5時間、N下に撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(600.00ml)で希釈した。得られた混合物を、EtOAc(200.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200.00ml)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、3.00gの粗製生成物。粗製生成物を(DCM:MeOH=3:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーで再精製して、(2S)-2-アミノ-N-([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)プロペンアミド、104(1.50g、78%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 318 [M+H]+
工程11:化合物105の合成
(2S)-2-アミノ-N-([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)-プロペンアミド(化合物104、1.50g、4.72mmol、1.00当量)のDMF(75.00mL)溶液に、NaHCO(0.59g、7.08mmol、1.50当量)のHO(10.00mL)およびBocO(1.03g、4.72mmol、1.00当量)溶液を室温で添加した。反応物を、室温で1時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(500.00mL)で希釈し、EtOAc(200.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200.00mL×3)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、tert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物105、(1.82g、83)を赤色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 418 [M+H]+, 318 [M+H-100]+
工程12:化合物106の合成
tert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物105、1.82g、4.36mmol、1.00当量)、鉄粉(2.43g、0.04mmol、10.00当量)およびNHCl(2.33g、0.04mmol、10.00当量)のEtOH(100.00mL)/HO(50.00mL)中のスラリーを、70℃で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を濾過した。濾液を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をDCM(50.00mL)に溶解し、濾過した。濾液を濃縮乾固し、残渣を(DCM:MeOH=13:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]-カルバメート(化合物106、1.20g、68%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 388 [M+H]+
工程13:化合物107
撹拌中の3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、352mg、1.29mmol、1.00当量)のDMF(5.00mL)溶液に、0℃で、CDI(209.00mg、1.29mmol、1当量)およびTEA(260mg、2.58mmol、2当量)を添加した。得られた混合物を、0℃で2時間撹拌した。次いでtert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)-カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物106、500.00mg、1.29mmol、1.00当量)およびDMAP(472mg、3.87mmol、3.00当量)を添加した。得られた混合物を、60℃で24時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温に冷却後、反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~60%勾配;検出器、UV 254nm)で精製して、tert-ブチルN-[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)エチル]カルバメート(化合物107、450.00mg,48%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 687 [M+H]+
工程14:化合物108
撹拌中のtert-ブチルN-[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]-メチル]カルバモイル)エチル]カルバメート(化合物107、440.00mg、0.64mmol、1.00当量)のDCM(22.00mL)溶液に、TFA(2.20mL)を室温で添加した。得られた混合物を、室温で0.5時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を減圧下濃縮乾固して、(2S)-2-アミノ-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]-メチル]プロパンアミド;トリフルオロ酢酸(化合物108、400.00mg、粗製)を赤色油状物として得た。残渣をさらに精製することなく次工程で使用した。LCMS (ES, m/z): 587 [M+H-TFA]+
工程15:化合物109の合成
溶液 of(2R)-2-[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-アミノ]プロパンアミド]プロパン酸(218mg、0.57mmol、1.00当量)、HOBT(77mg、0.57mmol、1.00当量)およびHATU(216mg、0.01mmol、1.00当量)を、室温で空気中1時間撹拌し、次いで(2S)-2-アミノ-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]プロパンアミド;トリフルオロ酢酸(化合物108、400mg、0.57mmol、1.00当量)およびDIEA(663mg、5.14mmol、9.00当量)を室温で添加した。反応物を、室温で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.05%TFA)、30分間で0%~50%勾配;検出器、UV 254nm)で精製して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1R)-1-[[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)エチル]カルバモイル]エチル]カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物109、480.00mg、75%)を緑色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 951 [M+H]+
工程16:化合物110
9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1R)-1-[[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]-エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)エチル]カルバモイル]エチル]カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物109、110.00mg)のDMF(5.00mL)溶液に、0℃でピペリジン(1.00mL)を添加した。得られた混合物を、0℃で0.5時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.05%TFA)、40分間で0%~60%勾配;検出器、UV 254n)で精製して、(2S)-2-[(2R)-2-[(2S)-2-アミノプロパンアミド]プロパンアミド]-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]-フェニル]エチル)スルファニル]メチル]プロペンアミド(化合物110、80.00mg、60%)を赤色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 729 [M+H]+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.00 (br s, 1H), 8.53 br (s, 1H), 8.24 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 8.10 (br s, 1H), 7.69 - 7.62 (m, 2H), 7.49 (s, 1H), 7.42 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.26-7.13 (m, 3H), 7.00 (br s, 1H), 5.11-5.06 (m, 1H), 4.45 - 4.36 (m, 3H), 4.35 - 4.13 (m, 6H), 2.90-2.83 (m, 3H), 2.73-2.71 (m, 2H), 2.05-1.90 (m, 1H), 1.70-1.53 (m, 4H), 1.22-1.17 (m, 6H), 1.14 - 1.05 (m, 3H)
工程17:化合物(Ik)の合成
(2S)-2-[(2R)-2-[(2S)-2-アミノプロパンアミド]プロパンアミド]-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]プロペンアミド(化合物110、63.00mg、0.09mmol、1.00当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノエート(26mg、0.09mmol、1.00当量)のDMF(1.50mL、19.38mmol、224.36当量)溶液に、空気中、室温でDIEA(22.33mg、0.17mmol、2.00当量)を添加した。反応物を、室温で1時間撹拌した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム:Kinetex EVO C18カラム、30×150,5μm;移動相A:xater(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:7分間で23B~43B、254nm;RT1:6.58)。集めたフラクションを凍結乾燥して、N-[(1S)-1-[[(1R)-1-[[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)エチル]カルバモイル]エチル]カルバモイル]エチル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド(化合物(Ik)、16.10mg、20%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 922,924 [M+H]+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.00 (s, 1H), 8.80 (s, 1H), 8.44-8.41 (m, 1H), 8.15 (d, J=7.2Hz, 1H), 8.03-8.00 (m, 2H), 7.7-7.65 (m, 2H), 7.51 (s, 1H), 7.44 (d, J =8.0Hz,1H), 7.22-7.14 (m, 2H), 6.98 (s, 2H), 6.83-6.81 (m, 1H), 5.13-5.08 (m, 1H), 4.48-4.40 (m, 3H), 4.29-4.17 (m, 6H), 2.96-2.85 (m, 3H), 2.75-2.70 (m, 2H), 2.67-2.57 (m, 1H), 2.40-2.33 (m, 1H), 2.09-1.98 (m, 3H), 1.52-1.45 (m, 5H), 1.26-1.16 (m, 12H)
スキーム14:ネオデグラダーP14-GGFGリンカー複合体(化合物(Il))の合成
工程1:化合物112の合成
撹拌中の(2-クロロ-4-ニトロフェニル)酢酸(化合物111、5.00g、23.19mmol、1.00当量)のTHF(50mL)溶液に、BH-MeS(5.50mL、57.99mmol、2.50当量)を、窒素雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、2時間、70℃で撹拌した。TLC(PE:EtOAc=3:1)は反応の完了を示した。残渣をPE/EtOAc(2:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物112、4.8g、92%)を明黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ 8.27 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.10 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.46 (s, 1H), 3.20 -3.09 (m, 4H)
工程2:化合物113の合成
撹拌中の2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物112、4.80g、23.81mmol、1.00当量)のDCM(100mL)溶液に、NBS(6.36g、35.71mmol、1.50当量)およびPPh(9.37g、35.72mmol、1.50当量)を、空気雰囲気下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を、空気雰囲気下、一夜、室温で撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応物を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をPE/EtOAc(4:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、1-(2-ブロモエチル)-2-クロロ-4-ニトロベンゼン(化合物113、3.9g、57%)を赤色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ8.29 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.13 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.50 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.67 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 3.42 (t, J = 7.2 Hz, 2H)
工程3:化合物114の合成
1-(2-ブロモエチル)-2-クロロ-4-ニトロベンゼン(化合物113、3.90g、14.75mmol、1.00当量)のDMF(39mL)溶液に、チオ酢酸カリウム(1.68g、14.75mmol、1.00当量)を室温で添加した。得られた混合物を室温で2時間撹拌した。TLC((PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応物を、水(600mL)で希釈した。得られた混合物を、EA(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(200mL)、塩水(200mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、1-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]エテノン(化合物114、3.7g、85%)を赤色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ 8.27 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.10 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.46 (s, 1H), 3.21 -3.02 (m, 4H), 2.37 (s, 3H)
工程4:化合物115の合成
撹拌中の1-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]エテノン(化合物114、4.00g、15.40mmol、1.00当量)のMeOH(600mL)溶液に、N下、0℃でMeONa(14.31mL、77.00mmol、5.00当量、30%)を1時間添加した。反応混合物を、0℃で1時間撹拌した。TLC(PE:EA=10:1)は反応の完了を示した。AcOHで反応をクエンチした。得られた混合物を減圧下濃縮乾固した。残渣をDCM(100mL)で希釈し、濾過した。濾液を(PE:EtOAc=10:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタンチオール(化合物115、3g、80%)を黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ 8.28 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.11 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.48 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.17 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 2.87 (dt, J = 8.0, 7.2 Hz, 2H), 1.46 (t, J = 8.0Hz, 1H)
工程5:化合物117の合成
撹拌中の(2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-アセトアミド)酢酸(化合物116、10g、28.22mmol、1.00当量)およびPb(OAc)(15g、33.86mmol、1.20当量)のTHF(300mL)およびトルエン(100mL)中の混合物に、窒素雰囲気下、室温でピリジン(2.59g、32.74mmol、1.16当量)を滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、一夜、80℃で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。混合物を室温に冷却した。得られた混合物を濾過し、フィルターケーキをEA(20mL)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮した。残渣をEA(20mL)に溶解した。得られた混合物を水、塩水で洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(1:4)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、(2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]アセトアミド)メチルアセテート(化合物117、6.5g、56%)を白色固体として得た。1H NMR (300MHz, CDCl3) δ7.80 (d, J=7.5Hz, 2H), 7.62 (d, J=7.5Hz, 2H), 7.45 (t, d=7.5Hz, 2H), 7.36 (d, d=7.5Hz, 2H), 7.18 (br s, 1H), 5.48 (br s, 1H), 5.28 (d, J=7.2Hz, 2H), 4.48 (d, J=6.6Hz, 2H), 4.26 (t, J=6.6Hz, 1H), 3.93 (d, 5.4Hz, 2H), 2.08 (s, 3H). LCMS (ESI, ms): 391 [M+Na]+
工程6:化合物118の合成
(2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]アセトアミド)メチルアセテート(化合物117、3.00g、8.14mmol、1.00当量)および2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタンチオール(化合物115、1.77g、8.13mmol、1.00当量))のDCM(300mL)溶液に、TFA(0.56g、4.91mmol、0.60当量)を室温で添加した。得られた混合物を、60℃で16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、減圧下、濃縮乾固した。残渣を(PE:EtOAc=2:3)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]-メチル]カルバメート(化合物118、3.7g、67%)を灰白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 526,528 [M+H]+
工程7:化合物119の合成
9H-フルオレン-9-イルメチルN-[[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]メチル]カルバメート(化合物118、3.70g、7.03mmol、1.00当量)のDMF(40mL)溶液に、0℃でピペリジン(8mL)を添加した。得られた混合物を、0℃で0.5時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を、水(400mL)で希釈し、EA(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(200mL)、塩水(200mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下濃縮乾固した。残渣を(DCM:MeOH=10:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-アミノ-N-([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)アセトアミド(化合物119、1.01g、40%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 304,306 [M+H]+
工程8:化合物120の合成
2-アミノ-N-([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)-アセトアミド(化合物119、1.00g、3.29mmol、1.00当量)のDMF(50mL)溶液に、室温でNaHCO(0.33g、3.92mmol、1.20当量)の水(10mL)溶液、BocO(0.72g、3.30mmol、1.00当量)を添加した。得られた混合物を、室温で1時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(500mL)で希釈し、EtOAc(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固した。残渣を(PE:EtOAc=1:3)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]メチル]カルバメート(化合物120、810mg、54%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 404,406 [M+H]+, 304,306 [M+H-100]+
工程9:化合物121の合成
tert-ブチルN-[[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)カルバモイル]メチル]カルバメート(化合物120、800.00mg、1.98mmol、1.00当量)のEtOH(40)溶液に、室温で鉄粉(1106mg、19.81mmol、10.00当量)およびNHCl(1059mg、19.81mmol、10.00当量)の水(10mL)溶液を添加した。得られた混合物を、70℃で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を濾過した。濾液を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をDCM(50.00mL)に溶解し、濾過した。濾液を(DCM:MeOH=13:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)-カルバモイル]メチル]カルバメート(化合物121、610mg、74%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 374,376 [M+H]+, 374,376 [M+H-100]+
工程10:化合物122の合成
3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、219mg、0.80mmol、1.00当量)のDMF(10mL)溶液に、CDI(130mg、0.80mmol、1.00当量)およびTEA(81mg、0.80mmol、1.00当量)を0℃で空気中添加した。得られた混合物を、室温で2時間撹拌した。次いでtert-ブチルN-[[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)カルバモイル]メチル]カルバメート(化合物121、300mg、0.80mmol、1.00当量)およびDMAP(294mg、2.41mmol、3.00当量)を室温で空気中添加した。得られた混合物を、60℃で48時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.05%TFA)、30分間で0%~60%勾配;検出器、UV 254nm)で精製して、tert-ブチルN-[([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)メチル]カルバメート(化合物122、270mg、49%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 673,675 [M+H]+, 573,575 [M+H-100]+
工程11:化合物123の合成
tert-ブチルN-[([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)メチル]-カルバメート(化合物122、250mg、0.37mmol)の1,4-ジオキサン(12mL)溶液に、N下、0℃でHCl(1,4-ジオキサン中4N、6mL)を添加した。反応物を、室温で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を減圧下濃縮乾固して、2-アミノ-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]アセトアミド(化合物123、260mg、粗製)を褐色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 573,575 [M+H-HCl]+
工程12:化合物125の合成
(2S)-2-[2-(2-アミノアセトアミド)アセトアミド]-3-フェニルプロパン酸(化合物124、500mg、1.79mmol、1.00当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノエート(552mg、1.79mmol、1.00当量)のDMSO(5.00mL)溶液を、室温で、空気中、16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~60%勾配;検出器、UV 220nm)で精製して、(2S)-2-(2-[2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]アセトアミド]アセトアミド)-3-フェニルプロパン酸(化合物125、760mg、83%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 473 [M+H]+
工程13:化合物(Il)の合成
(2S)-2-(2-[2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]アセトアミド]-アセトアミド)-3-フェニルプロパン酸(化合物125、175mg、0.37mmol、1.00当量)のDMF(5.00mL)溶液に、HATU(141mg、0.37mmol、1.00当量)およびHOBT(50mg、0.37mmol、1.00当量)を室温で空気中添加した。得られた混合物を、室温で1時間撹拌した。次いで2-アミノ-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]-カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]アセトアミド(化合物123、250mg、0.37mmol、1.00当量、85%)およびDIEA(240mg、1.85mmol、5.00当量)を添加した。得られた混合物を、室温で1時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を次の条件(カラム:XSelect CSH Prep C18 OBDカラム、19×250mm,5μm;移動相A:水(0.05%FA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:7分間で30B~60B、254nm;RT1:6.67分)により精製して、75mgの粗製生成物を得た。粗製生成物を次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで再精製した:カラム:XBridge Shield RP18 OBDカラム、19×250mm,10μm;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:10分間で25B~44B;254nm;RT1:10.52分。集めたフラクションを凍結乾燥して、化合物(Il)(41.6mg、10%)を白色固体として得た。1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ10.99 (s, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.38 (t, J=6.0Hz, 1H), 8.31 (t, J=6.0Hz, 1H), 8.12 (d, J=8.4Hz, 1H), 8.06 (t, J=5.6Hz, 1H), 8.01 (t, J=6.0Hz, 1H), 7.70-7.66 (m, 2H), 7.51 (s, 1H), 7.44 (d, J=8.0Hz, 1H), 7.25-7.21 (m, 5H), 7.19-7.14 (m, 2H), 6.99 (s, 2H), 6.82 (t, J=6.0Hz,1H), 5.13-5.08 (m, 1H), 4.47-4.40 (m, 4H), 4.33-4.29 (m, 3H), 3.76-3.70 (m, 3H), 3.67-3.55 (m, 3H), 3.38-3.36 (m, 2H), 3.06-3.02 (m, 1H), 2.91-2.86 (m,3H), 2.82-2.70 (m, 3H), 2.62-2.57 (m, 1H), 2.50-2.45 (m, 1H), 2.10 (m, 2H), 2.05-1.95 (m ,1H), 1.50-1.44 (m,4H), 1.20-1.16 (m, 2H). LCMS (ES, m/z): 1027,1029 [M+H]+
スキーム15:ネオデグラダーP14-AAAリンカー複合体(化合物(Im))の合成
工程1:化合物127の合成
撹拌中の(2-クロロ-4-ニトロフェニル)酢酸(化合物126、24.00g、111.32mmol、1.00当量)のTHF(240.00mL)溶液に、窒素雰囲気下、BH-MeS(28.00mL、295.23mmol、2.65当量)を滴下した。得られた混合物を、窒素雰囲気下、2時間、70℃で撹拌した。TLC(PE:EtOAc=3:1)は反応の完了を示した。室温に冷却後、得られた混合物を減圧下濃縮した。残渣をPE/EtOAc(3:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物127、18.00g、80%)を明黄色固体として得た。1H NMR (300 MHz, CD3Cl) δ8.27 (s, 1H), 8.10-8.07 (m, 1 H), 7.52 (d, J = 3 Hz, 1H), 3.96 (t, J = 6 Hz, 2H), 3.13 (t, J = 6 Hz, 2H)
工程2:化合物128の合成
撹拌中の2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタノール(化合物127、5.00g、24.80mmol、1.00当量)のDCM(100.00mL)溶液に、NBS(6.62g、1.50当量)およびPPh(9.76g、37.21mmol、1.50当量)を、N下、室温で少しずつ添加した。得られた混合物を一夜、室温でN下撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応物を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をPE/EtOAc(4:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、1-(2-ブロモエチル)-2-クロロ-4-ニトロベンゼン(化合物128、5.10g、72.31%)を赤色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.28 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.18 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.73 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.79 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 3.38 (t, J = 7.2 Hz, 2H)
工程3:化合物129の合成
1-(2-ブロモエチル)-2-クロロ-4-ニトロベンゼン(化合物128、5.00g、18.90mmol、1.00当量)のDMF(50.00mL)溶液に、窒素雰囲気下、室温でチオ酢酸カリウム(2.16g、18.91mmol、1.00当量)を添加した。得られた混合物を室温で2時間撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応物を、水(600.00mL)で希釈した。得られた混合物を、EtOAc(200.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(200.00mL)、塩水(200.00mL×3)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、1-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]エテノン(化合物129、4.50g、85%)を赤色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.24 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.07 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.45 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.20 - 3.05 (m, 4H), 2.34 (s, 3H)
工程4:化合物130の合成
撹拌中の1-[[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]エテノン(化合物129、2.00g、7.70mmol、1.00当量)のMeOH(300.00mL)溶液に、N下、0℃でMeONa(6.93mL、37.33mmol、5.00当量、30%)を添加した。得られた混合物を0℃でN下、1時間撹拌した。TLC(PE:EtOAc=10:1)は反応の完了を示した。反応をAcOHでpH値3~4にクエンチした。得られた混合物を減圧下濃縮乾固した。残渣をDCM(50.00mL)で希釈し、濾過した。濾液を分取TLC(PE:EtOAc=10:1)で精製して、2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタンチオール(化合物130、1.35g、72%)を明黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.26 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.09 (dd, J = 8.4, 2.4 Hz, 1H), 7.45 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 3.14 (dd, J = 8.0, 6.8 Hz, 2H), 2.85 (dt, J = 8.0, 7.2 Hz, 2H), 1.43 (t, J= 8.0 Hz, 1H)
工程5:化合物132の合成
撹拌中の(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパン酸(化合物131、20.00g、64.24mmol、1.00当量)のDMF(200.00mL)溶液に、空気雰囲気下、室温でTSTU(25.18g、83.52mmol、1.30当量)およびDIEA(16.60g、128.48mmol、2.00当量)を添加した。得られた混合物を、1時間、室温で撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(200.00mL)で希釈し、得られた混合物を、ETOAC(100.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(100.00mL)、塩水(100.00mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固した。残渣を(PE:EtOAc=1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパノエート(化合物132、25.00g、83%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 431 [M+Na]+
工程6:化合物133の合成
グリシン(3.68g、48.97mmol、1.00当量)およびNaHCO(12.34g、146.89mmol、3.00当量)の水(200.00mL)溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパノエート(化合物132、20.00g、48.97mmol、1.00当量)のDMF(200.00mL)溶液を添加した。反応物を、室温で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を2N HClでpH値2~3に調節した。得られた混合物を、EtOAc(500.00mL×3)で抽出し、合わせた有機層を塩水(500.00mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド]酢酸(化合物133、15.00g、71%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 369 [M+H]+
工程7:化合物134の合成
[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-プロパンアミド]酢酸(化合物133、5.00g、13.57mmol、1.00当量)、Pb(OAc)(7.22g、16.28mmol、1.20当量)およびピリジン(1.29g、16.31mmol、1.20当量)のTHF(300.00mL)/トルエン(100.00mL)溶液を、N下、80℃で16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温に冷却後、反応物を濾過した。フィルターケーキをTHF(100.00mL)で洗浄した。合わせた有機層を、減圧下、濃縮乾固した。残渣を(PE:ETOAC=1:2)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]プロパンアミド]メチルアセテート(化合物134、2.50g、45%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 405 [M+Na]+. 1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ 7.77-7.73 (m, 2H), 7.58 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.43 - 7.37 (m, 2H), 7.36 - 7.29 (m, 2H), 7.10 (s, 1H), 5.24 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 4.51 - 4.35 (m, 2H), 4.22 (t, J = 6.8 Hz, 2H), 2.04 (s, 3H), 1.39 (d, J = 6.8 Hz, 3H)
工程8:化合物135の合成
撹拌中の[(2S)-2-[[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ]-プロパンアミド]メチルアセテート(化合物134、2.25g、5.88mmol、1.00当量)および2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エタンチオール(化合物500、1.28g、5.88mmol、1.00当量)のDCM(120mL)溶液に、N下、室温でTFA(0.27mL、2.376mmol、0.62当量)を添加した。得られた混合物を40℃で16時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を減圧下濃縮乾固して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物135、3.10g、90%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 540,542 [M+H]+
工程9化合物136の合成
9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物135、3.10g、5.74mmol、1.00当量)のDMF(155.00mL)溶液に、N下、0℃でピペリジン(31.00mLを添加した。得られた混合物を0℃で0.5時間、N下に撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(600.00ml)で希釈した。得られた混合物を、EA(200.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200.00ml)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、3.00gの粗製生成物を得た。粗製生成物を(DCM:MeOH=3:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより再精製して、(2S)-2-アミノ-N-([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)プロペンアミド(化合物136、1.50g、78%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 318,320 [M+H]+
工程10化合物137の合成
(2S)-2-アミノ-N-([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)プロペンアミド(化合物136、1.50g、4.72mmol、1.00当量)のDMF(75.00mL)溶液に、NaHCO(0.59g、7.08mmol、1.50当量)のHO(10.00mL)およびBocO(1.03g、4.72mmol、1.00当量)溶液を、室温で空気中添加した。反応物を、室温で1時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を、水(500.00mL)で希釈し、EtOAc(200.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(200.00mL×3)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下濃縮乾固して、tert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)-カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物137、1.82g、83%)を赤色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 418,420 [M+H]+, 318,320 [M+H-100]+
工程11:化合物138の合成
tert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(2-クロロ-4-ニトロフェニル)エチル]-スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物137、1.82g、4.36mmol、1.00当量)、鉄粉(2.43g、0.04mmol、10.00当量)およびNHCl(2.33g、0.04mmol、10.00当量)のEtOH(100.00mL)/HO(50.00mL)中のスラリーを、70℃で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を濾過した。濾液を、減圧下、濃縮乾固した。残渣をDCM(50.00mL)に溶解し、濾過した。濾液を(DCM:MeOH=13:1)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エチル]スルファニル]メチル)カルバモイル]エチル]カルバメート(化合物138、1.20g、68%)を黄色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 388,390 [M+H]+, 288,290 [M+H-100]+
工程12:化合物139の合成
撹拌中の3-[5-(アミノメチル)-1-オキソ-3H-イソインドール-2-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(INT1、352mg、1.29mmol、1.00当量)のDMF(5.00mL)溶液に、0℃で、CDI(209.00mg、1.29mmol、1当量)およびTEA(260mg、2.58mmol、2当量)を添加した。得られた混合物を、0℃で2時間撹拌した。次いでtert-ブチルN-[(1S)-1-[([[2-(4-アミノ-2-クロロフェニル)エチル]スルファニル]-メチル)カルバモイル]-エチル]カルバメート(化合物138、500.00mg、1.29mmol、1.00当量)およびDMAP(472mg、3.87mmol、3.00当量)を添加した。得られた混合物を、60℃で24時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。室温に冷却後、反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~60%勾配;検出器、UV 254nm)で精製して、tert-ブチルN-[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)エチル]カルバメート(化合物139、450.00mg、48%)を黄色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 687, 689 [M+H]+, 587,589 [M+H-100]+
工程13:化合物140の合成
撹拌中のtert-ブチルN-[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]-メチル]カルバモイル)エチル]カルバメート(化合物139、440.00mg、0.64mmol、1.00当量)のDCM(22.00mL)溶液に、TFA(2.20mL)を室温で添加した。得られた混合物を、室温で0.5時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応物を減圧下濃縮乾固して、(2S)-2-アミノ-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]プロパンアミド;トリフルオロ酢酸(化合物140、400.00mg)を赤色油状物として得た。LCMS (ES, m/z): 578, 589 [M+H-TFA]+
工程14:化合物142の合成
L-バリン(化合物141、0.50g、4.27mmol、1.00当量)のDMSO(10mL)中のスラリーに2,5-ジオキソピロリジン-1-イル6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノエート(1.32g、4.28mmol、1.00当量)およびDIEA(1103mg、8.54mmol、2.00当量)。得られた混合物を、室温で4時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。反応混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィー(カラム、C18シリカゲル;移動相、ACN水溶液(0.1%FA)、30分間で0%~60%勾配;検出器、UV 220nm)で精製して、(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタン酸(化合物142、1.2g、72%)を褐色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 311 [M+H]+
工程15:化合物(Im)の合成
(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド]-3-メチルブタン酸(化合物142、59mg、0.19mmol、1.00当量)、HOBT(26mg、0.19mmol、1.00当量)およびHATU(72mg、0.19mmol、1.00当量)のDMF(2mL)溶液を、室温で、空気中、1時間撹拌した。次いで(2S)-2-アミノ-N-[[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]フェニル]エチル)スルファニル]メチル]プロパンアミドトリフルオロ酢酸(化合物140、200mg、0.19mmol、1.00当量、66.70%)およびDIEA(197mg、1.52mmol、8.00当量)を室温で添加した。反応混合物を、室温で2時間撹拌した。LCMSは反応の完了を示した。得られた混合物を、次の条件を用いる逆相フラッシュクロマトグラフィーで精製した:カラム:YMC-Actus Triart C18、30mm×150mm、5μm;移動相A:水(0.1%FA)、移動相B:ACN;流速:60mL/分;勾配:10分間で28B~45B、254nm;RT1:9.67分。集めたフラクションを凍結乾燥して、N-[(1S)-1-[[(1S)-1-([[(2-[2-クロロ-4-[([[2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1-オキソ-3H-イソインドール-5-イル]メチル]カルバモイル)アミノ]-フェニル]エチル)スルファニル]メチル]カルバモイル)エチル]カルバモイル]-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサンアミド(化合物(Im)、27.8mg、16%)を白色固体として得た。LCMS (ES, m/z): 879,881 [M+H]+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ10.99 (s, 1H), 8.80 (s, 1H), 8.47 (t, J=6.0Hz, 1H), 8.03 (d, J=7.2Hz, 1H), 7.78 (d, J=8.8Hz,1H), 7.70-7.66 (m, 2H), 7.51 (s, 1H), 7.44 (d, J=8.0Hz, 1H), 7.21-7.14 (m, 2 H), 6.99 (s, 2H), 6.82 (t, J=6.0Hz, 1H), 5.13-5.10 (m,1 H), 4.47-4.40 (m, 3H), 4.33-4.29 (m, 3H), 4.24 (t, J=7.2 Hz, 1H), 4.14 (t, J=6.8Hz, 1H), 3.38-3.36 (m, 1H), 2.97-2.90 (m, 1H), 2.86 (t, J=7.6Hz, 2H), 2.73-2.67 (m, 2H), 2.62-2.57 (m, 1H), 2.40-2.35 (m, 1H), 2.20-2.05 (m, 2H), 2.02-1.96 (m, 1H), 1.95-1.88 (m, 1H), 1.48-1.46 (m, 4H), 1.23-1.16 (m, 6H), 0.83-0.78 (m, 6H)
実施例4:ネオデグラダーコンジュゲートの製造および特徴づけ
抗体溶液を30当量のトリス-(2-カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)で処理し、37℃で1時間インキュベートして、鎖間ジスルフィドを還元させた。還元抗体を、illustra NAPカラム(GE Healthcare)を使用して、50mM EPPS、5mM EDTA pH7.0緩衝液に精製した。
コンジュゲーションを、配列番号9を有する重鎖および配列番号10を有する軽鎖を含む還元抗CD33抗体(「CD33AB」)を、50mM EPPS、5mM EDTA pH7.0中、2~5mg/mLで、N,N-ジメチルアセトアミド(DMA)中の原液としてDMAの最終濃度が15%(v/v)であるように添加した12当量のリンカー-ネオデグラダーで処理することにより実施した。得られた反応混合物を一夜、4℃で静置した。得られたネオデグラダーコンジュゲートを、illustra NAPカラム(GE Healthcare)を使用して20mM コハク酸、8%スクロース、0.01%Tween-20 pH5.5に精製し、Amicon Ultra遠心濃縮機を50kD分子量カットオフ(Millipore)で使用して、濃縮した。
濃度およびモノマーを、5μm粒子を用いる7.8×300mM TSKGel 3000SWXLカラム(Tosoh Bioscience)を使用して、0.5mg/mLで30分間流す、400mM 過塩素酸ナトリウム、50mM リン酸ナトリウム、5%(v/v)イソプロパノール移動相で定組成的に溶出する、サイズ排除クロマトグラフィーにより決定した。ネオデグラダーコンジュゲートを、214nmで検出する、抗体標準曲線から定量した。
薬物対抗体比(DAR)を、2.5μm粒子を用いる4.6×35mm TSKgel Butyl-NPRカラムを使用して、疎水性相互作用クロマトグラフィーにより決定した。移動相Aは1.5M硫酸アンモニウム、25mM リン酸ナトリウムpH7.0であった。移動相Bは25mM リン酸ナトリウムpH7.0、25%(v/v)イソプロパノールであった。検体を、流速0.6mL/分で、12分間の0~100%Bの直線勾配で溶出した。検出は214nmであった。
遊離リンカー-ペイロードを、2.5μm粒子を用いる4.6×250mm HISEPカラム(Supelco)を使用して、混合モードクロマトグラフィーにより決定した。移動相Aは100mM 酢酸アンモニウムであった。移動相Bは100%アセトニトリルであった。検体を、流速0.7mL/分で、25分間25~40%B、次いで2分間で40~100%Bの勾配で溶出した。カラム温度は35℃であった。遊離リンカー-ペイロードを、254nmで検出する、外的標準曲線を使用して定量した。
スキーム16:抗CD33抗体-化合物(Ie)コンジュゲートの製造
スキーム17:抗CD33抗体-化合物(Ih)コンジュゲートの製造
他のコンジュゲートを、適切な抗体を使用して、類似する様式で製造できる。
実施例5:抗CD33抗体-ネオデグラダーコンジュゲートでの急性骨髄性白血病(AML)の処置
抗CD33抗体(CD33AB)-ネオデグラダー化合物を、無胸腺ヌードマウス(Crl:NU(NCr)-Foxn1nu、Charles River)で試験した。1×10MV411ヒト急性単球性白血病細胞(ATCC(登録商標) CRL-5991TM)の50%マトリゲル溶液を、マウスの側腹部に皮下注射した(0.1mL/マウス)。腫瘍が100~150mmの平均サイズに達したら、マウスに抗CD33抗体-ネオデグラダーコンジュゲート、非ターゲティングネオデグラダーコンジュゲートおよび媒体対照を投与した。
CD33AB-化合物(Ia)、CD33AB-化合物(Ie)およびCD33AB-化合物(Ih)の原液を媒体で希釈して、0.3、0.283および0.299mg/mL投与溶液を得て、これは3、2.83および2.99mg/kgで、各動物体重により調節して、10mL/kg(0.2mL/20gマウス)の投与体積となった。この投与戦略により、各試験群で同じ量のペイロードの送達を確実とした。マイロターグを0.9%塩化ナトリウム溶液で0.01mg/mLに希釈し、これにより、3mg/kgで、10mL/kg(0.2mL/20gマウス)の投与体積となった。ベネトクラクスを、超音波処理により60%PG、30%PEG400、10%エタノールからなる溶媒中で製剤化して、5mg/mL投与懸濁液を得て、これにより、10mL/kgの体積で投与時、50mg/kgが送達された。CC-90009を遠心分離して、底の粉末を回収し;次いでN-メチル-2-ピロリジノン(NMP)、PEG400および食塩水を添加し、1個ずつよく混合して、5%NMP、45%PEG400および50%食塩水中0.5mg/mL投与溶液を得て、これにより、10mL/kgの体積で投与時、5mg/kgが送達された。
マウスを次のとおり7処置群(N=9/群)に分けた:1)媒体;2)CD33AB-化合物(Ia)(3mg/kg、iv、qd×1);3)CD33AB-化合物(Ie)(2.83mg/kg、iv、qd×1);4)CD33AB-化合物(Ih)(2.99mg/kg、iv、qd×1);5)マイロターグ(0.1mg/kg、iv、qd×1);6)ベネトクラクス(50mg/kg、po、qd×21);7)CC-90009(5mg/kg、ip、bid×10)。群1~5の試験品を、体重(0.200mL/20gマウス)で調節した体積の単回投与(qd×1)で静脈内(i.v.)投与した。各動物のBWに対して調製した10mL/kg(0.2mL/20gマウス)投与体積で、ベネトクラクスを経口(po)投与し、一方CC-90009を腹腔内(ip)投与した。
腫瘍を週2回カリパスを使用して測定し、各動物を、腫瘍がエンドポイント体積(2,000mm)に達するかまたは試験最終日(45日目)の何れか早い方で、屠殺した。MTV(n)は、腫瘍がエンドポイント体積に減少していない、残存動物数(n)における試験最終日の中央腫瘍体積として定義した。
図1に示すとおり、全ネオデグラダーコンジュゲートは、媒体と比較して、経時的にゆっくりした腫瘍増殖をもたらした。
実施例6:ヒト白血病モデルに対するAB1-化合物(Ia)コンジュゲートの活性
インビトロ細胞毒性を、一団のCD33陽性急性骨髄性白血病細胞株および一団の非AML CD33陰性細胞を使用して測定した。細胞を予定した濃度で96ウェルプレートに播種し、一夜、37℃/5COでインキュベーション後、各試験品(TA)の連続希釈物を細胞に添加した。細胞を試験品と72時間インキュベートし、生存能をCellTiter-Glo(登録商標)試薬(Promega)で検出した。発光値を各細胞株で正規化し、IC50をPrizmソフトウェアを使用して計算した。
結果は、化合物IaにコンジュゲートしたhuMy9-6由来抗体、AB1(「AB--化合物(Ia)」)は、CD33陽性AML細胞でCC-885(既知GSPT1デグラダー)またはマイロターグと同等な全体的インビトロ有効性を示すことを示した - 数例では有効性が優れた(図2参照)。さらに、GSPT1デグラダーペイロードの標的化CD33介在送達の仮説に一致して、AB1-化合物(Ia)はCD33陰性細胞モデルで不活性であった。
実施例7:抗体-ネオデグラダーコンジュゲートでの急性骨髄性白血病(AML)の処置
皮下腫瘍モデルMV4-11ヒト急性骨髄球性白血病細胞(0.1mL中1×10細胞)を、雌無胸腺ヌードマウスの右腹側部に皮下接種した。マウスを腫瘍サイズが150mmに達した時に開始する、側部尾静脈への静脈内注射、腹腔内注射、強制経口投与またはそれらの組み合わせの何れかにより試験品で処置した。腫瘍サイズおよびマウス体重を週2回測定した。
インビトロでの観察に一致して、ネオデグラダーP1を遊離する数種のAB1ベースのコンジュゲートでのCD33陽性AMLモデル腫瘍(MV4-11)のインビボ処置は腫瘍退縮をもたらし、ベータ-グルクロニド放出トリガーおよび天然システインコンジュゲーションを含むコンジュゲートで最もロバストな効果がみられた(図3参照)。
実施例8:CD33AB-化合物(Ia)およびゲムツズマブ-化合物(Ia)コンジュゲートの安定性
抗CD33-化合物(Ia)コンジュゲート(約8DAR)の安定性アッセイを、ゲムツズマブ、IgG1、CD33ABおよびIgG1 L234A/L235A「LALA」Ab形式を使用して、20mM コハク酸、8%スクロース、0.01%Tween-20 pH5.5中2.5mg/mLで40日間にわたり実施し、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)でアッセイした。4℃で、濃度またはモノマーの顕著な変化は何れのコンジュゲートでも観察されなかった(図4)。対照的に、37℃で、天然ゲムツズマブ-化合物(Ia)ならびにIgG1およびIgG1 LALA主鎖を使用する化合物(Ia)コンジュゲートは、39日間に顕著な凝集を示した(20~39日で15~28%に上昇)。しかしながら、CD33AB-化合物(Ia)(IgG1 N297A主鎖を使用)は、37℃で39日にわたり、88%を超えてモノマー状態を維持した(図4)。数日間にわたるCD33AB-化合物(Ia)におけるような高モノマーの維持は、一般に血液循環中の凝集が迅速なクリアランスおよび毒性増加に至り得て、治療指数を狭めるため、ADCの望ましい性質である。さらに、天然SEC-MS分析により、天然ゲムツズマブ-化合物(Ia)は同じモル当量のペイロード-リンカーで製造したCD33AB由来コンジュゲートより遥かに高い非コンジュゲート抗体を示した。一般に、CD33AB-化合物(Ia)におけるような、ADCにおける低レベルの非コンジュゲート抗体は、所望の品質特性である。また、CD33ABより多くのTCEPがゲムツズマブの還元に必要であった(4.5対2.5モル当量)。CD33AB-化合物(Ia)におけるような、ADC製造のために使用する還元剤が少ないことは、商品原価を下げ、精製法を単純化するために望ましい。
実施例9:ヒト白血病モデルに対する抗CD33ネオデグラダーコンジュゲートの活性
皮下腫瘍モデルMV4-11ヒト急性骨髄球性白血病細胞(0.1mL中1×10細胞)を、雌無胸腺ヌードマウスの右腹側部に皮下接種した。マウスを、腫瘍サイズが150mmに達した時開始する、側部尾静脈への静脈内注射、腹腔内注射、強制経口投与またはそれらの組み合わせの何れかにより、試験品で処置した。腫瘍サイズおよびマウス体重を週2回測定した。
インビトロでの観察に一致して、ネオデグラダーP1を遊離する種々のCD33ベースのコンジュゲートでのCD33陽性AMLモデル腫瘍(MV4-11)のインビボ処置は腫瘍退縮をもたらし、最も安定なコンジュゲート(CD33AB-化合物(Ia))がロバストな抗腫瘍有効性を示した(図5)。
実施例10:マイロターグ非感受性細胞株に対する抗CD33ネオデグラダーコンジュゲートの活性
試験品(TA)の細胞毒性を、マイロターグ非感受性(AML-193およびKasumi-6)であることが知られる一団のCD33陽性急性骨髄性白血病細胞株を使用して測定した。細胞を予定した濃度で96ウェルプレートに播種し、一夜、37℃/5COでインキュベーション後、各試験品(TA)の連続希釈物を細胞に添加した。細胞を試験品と72時間インキュベートし、生存能をCellTiter-Glo(登録商標)試薬(Promega)で検出した。発光値を各細胞株で正規化し、IC50をPrizmソフトウェアを使用して計算した。
図6Aおよび6Bに示すとおり、抗CD33ネオデグラダーコンジュゲートは、両細胞株に対して良好な活性を有した。
概要および要約セクションではなく、詳細な記載のセクションが、特許請求の範囲の解釈に使用されることが意図されることは認識される。概要および要約セクションは、発明者らにより意図される本発明の1以上の、しかし全てではない例示的態様を示し得て、故に、いかなる方法でも本発明および添付する特許請求の範囲を限定することは意図されない。
本発明は、上に、特定の機能およびその相関の実行を説明する機能的構成要素の助けを借りて記載している。これらの機能的構成要素の境界は、記載の便宜上ここに任意に定義されている。特定の機能およびその関係が適切に実施される限り、他の境界を定義し得る。
具体的態様の上の記載は、本発明の一般的概念から逸脱することなく過度の実験なしに、当分野における技術の範囲内の知識の適用により、他者が容易にこのような具体的態様の種々の適用への修飾および/または適応ができるように、本発明の一般的性を完全に明する。故に、このような適応および修飾は、ここに示す教示および指針に基づき、開示する態様の等価物の意味および範囲内であることが意図される。ここでの表現または用語は、本明細書の用語または表現が教示および指針に照らして当業者に解釈されるべきであるように、限定ではなく、説明を目的とすることは理解されるべきである。
本発明の幅および範囲は上記例示的態様の何れによっても限定されず、次の特許請求の範囲およびその等価物によってのみ定義されるべきである。

Claims (61)

  1. 式(I):
    〔式中、
    aは1~10の整数であり;
    AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
    UはNHおよびCFから選択され;
    は独立して水素およびハロから選択され;
    Xは-NR-、=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
    QおよびQ’は各々独立してO、SまたはN(R)であり;
    vは1または2であり;
    各Rは独立して水素またはC-Cアルキルであり;
    nは1~6の整数であり;そして
    mは2~6の整数であり;
    ここで、各基の左側はLに結合し、右側はAに結合し;
    但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
    Lは開裂可能リンカーまたは開裂不可能リンカーであり;そして
    Bmは配列番号1に示すアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)相補性決定領域(CDR)1(VH-CDR1)、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)CDR1(VL-CDR1)、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
    のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  2. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVLを含む、請求項1のコンジュゲート。
  3. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が定常領域を含み、該定常領域がゲムツズマブと少なくとも1個のアミノ酸が異なる、請求項1または2のコンジュゲート。
  4. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分がIgG1抗体またはその抗原結合部分である、請求項1~3の何れかのコンジュゲート。
  5. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が定常領域に対応するアミノ酸297にアラニンを含む、請求項1~4の何れかのコンジュゲート。
  6. 抗CD33抗体が配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖を含む、請求項1~5の何れかのコンジュゲート。
  7. aが2~8の整数である、請求項1~6の何れかのコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  8. Lが開裂不可能リンカー、請求項1~7の何れかのコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  9. Lが
    〔式中、
    pが1~10の整数であり;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    からなる群から選択される、請求項8のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  10. Lが
    である、請求項9のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  11. pが5である、請求項9または10のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  12. Lが開裂可能リンカーである、請求項1~7の何れかのコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  13. 開裂可能リンカーがプロテアーゼにより開裂可能である、請求項12のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  14. Lが
    〔式中、
    qが2~10の整数であり;
    、Z、ZおよびZが各々独立して存在しないかまたはLまたはD配置の天然に存在するアミノ酸残基であり、但しZ、Z、ZおよびZの少なくとも2個がアミノ酸残基であり;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    からなる群から選択される、請求項12または13のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  15. 、Z、ZおよびZが独立して存在しないかまたはL-バリン、D-バリン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アラニン、D-アラニン、L-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニン、L-リシン、D-リシンおよびグリシンからなる群から選択され;但し、Z、Z、ZおよびZの少なくとも2個がアミノ酸残基であり、請求項14のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  16. が存在しないかまたはグリシンであり;
    が存在しないかまたはL-グルタミン、D-グルタミン、L-グルタミン酸、D-グルタミン酸、L-アスパラギン酸、D-アスパラギン酸、L-アラニン、D-アラニンおよびグリシンからなる群から選択され;
    がL-バリン、D-バリン、L-アラニン、D-アラニン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンからなる群から選択され;そして
    がL-アラニン、D-アラニン、L-シトルリン、D-シトルリン、L-アスパラギン、D-アスパラギン、L-リシン、D-リシン、L-フェニルアラニン、D-フェニルアラニンおよびグリシンからなる群から選択される、
    請求項15のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  17. Lが
    である、請求項14のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  18. qが5である、請求項17のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  19. Lが生体内還元性リンカーである、請求項12のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  20. Lが
    〔式中、
    qが2~10の整数であり;
    R、R’、R”およびR”’が各々独立して水素、C-CアルコキシC-Cアルキル、(C-C)NC-CアルキルおよびC-Cアルキルから選択されるかまたは2個のジェミナルR基がそれらが結合している炭素原子と一体となってシクロブチルまたはシクロプロピル環を形成でき;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    からなる群から選択される、請求項12または19のコンジュゲート。
  21. Lが酸開裂可能リンカーである、請求項12のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  22. Lが
    〔式中、
    qが2~10の整数であり;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    からなる群から選択される、請求項12または21のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  23. Lがクリック放出リンカーである、請求項12のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  24. Lが
    〔式中、
    qが2~10の整数であり;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    から選択される、請求項12または23のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  25. Lがピロホスファターゼ開裂可能リンカーである、請求項12のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  26. Lが
    〔式中、
    qが2~10の整数であり;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    である、請求項25のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  27. Lがベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカーである、請求項12のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  28. Lが
    〔式中、
    qが2~10の整数であり;
    ----が存在しないかまたは結合であり;
    がXへの結合点であり;そして
    が抗CD33抗体またはその抗原結合部分への結合点である。〕
    から選択される、請求項12または27のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  29. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    がハロであり;そして
    Xが-N(R)(CH)O(CH)-であり;ここで
    vが1であり;
    mおよびnが2であり;そして
    がメチルである、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  30. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    がハロであり;そして
    Xが-N(R)(CH)O(CH)-であり;ここで
    vが2であり;
    mおよびnが2であり;そして
    各Rがメチルである、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  31. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    がハロであり;そして
    Xが-O(CH)-であり;ここで
    nが2である、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  32. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    がハロであり;そして
    Xが-S(CH)-であり;ここで
    nが2である、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  33. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    が水素であり;そして
    Xが-NR-であり;ここで
    がメチルである、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  34. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    がハロであり;そして
    Xが-NR-であり;ここで
    が水素である、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  35. Aがフェニルであり;
    UがNHであり;
    が水素であり;そして
    Xが-C(CH)=である、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  36. AAがC-C10シクロアルキル環であり;
    UがNHであり;
    が水素であり;そして
    Xが-N(R)(CH)O(CH)-であり;ここで
    nが1であり;
    mが2であり;そして
    がメチルである、
    請求項1~28の何れかのコンジュゲート。
  37. 式(V):
    〔式中、Bmは配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
    のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  38. 式(VI):
    〔式中、Bmは配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
    のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  39. 式(VII):
    〔式中、Bmは配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む抗CD33抗体またはその抗原結合部分である。〕
    のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  40. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が(i)配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVLまたは(ii)配列番号9に示すアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号10に示すアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項37-39のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  41. 請求項1~40の何れかの何れかのコンジュゲートまたは化合物またはその薬学的に許容される塩および1以上の薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
  42. 処置を必要とする対象における癌を処置する方法であって、該対象に薬学的に許容される量の請求項1~41の何れかのコンジュゲートまたは組成物またはその薬学的に許容される塩を投与することを含む、方法。
  43. 癌が血液学的/血液癌である、請求項42の方法。
  44. 癌が多発性骨髄腫、白血病、悪性リンパ腫、ホジキン疾患または慢性骨髄増殖性疾患である、請求項42の方法。
  45. 癌が急性骨髄性白血病またはリンパ腫である、請求項42の方法。
  46. 癌が急性骨髄性白血病である、請求項42の方法。
  47. 癌がマイロターグに抵抗性または難治性である、請求項42~46の何れかの方法。
  48. 処置を必要とする対象における骨髄異形成症候群を処置する方法であって、該対象に薬学的に許容される量の請求項1~41の何れかのコンジュゲートまたは組成物またはその薬学的に許容される塩を投与することを含む、方法。
  49. 該対象に、請求項1~40の何れかのコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を投与する前、後または同時に薬学的に許容される量のさらなる薬剤を投与することをさらに含む、請求項42~48の何れかの方法。
  50. さらなる薬剤が細胞毒性剤または免疫応答修飾剤である、請求項49の方法。
  51. 免疫応答修飾剤がチェックポイント阻害剤である、請求項50の方法。
  52. チェックポイント阻害剤がPD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、CTLA-4阻害剤、TIM3阻害剤および/またはLAG-3阻害剤を含む、請求項51の方法。
  53. 請求項1のコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を製造する方法であって、抗CD33抗体またはその抗原結合部分と式(I-1):
    〔式中、
    aは1~10の整数であり;
    AはフェニルまたはC-C10シクロアルキル環であり;
    は独立して水素およびハロから選択され;
    UはNHおよびCFから選択され;
    Xは-N(R)-、=C(CH)-、-Q-(CH)-および-Q(CH)Q’(CH)-から選択され;ここで
    vは1または2であり;
    QおよびQ’は各々独立してO、SまたはNRであり;
    各Rは独立して水素またはC-Cアルキルであり;
    nは1~6の整数であり;そして
    mは2~6の整数であり;
    ここで、各基の左側はL’に結合し、右側はAに結合し;
    但し、XがNHまたは-Q-(CH)-であるとき、Rはハロであり;
    L’は抗CD33抗体またはその抗原結合部分にコンジュゲートする開裂可能または開裂不可能リンカー前駆体であり、ここで、抗CD33抗体またはその抗原結合部分は配列番号1に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR2、配列番号3に示すアミノ酸配列を含むVH-CDR3、配列番号5に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)CDR1、配列番号6に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR2および配列番号7に示すアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。〕
    の化合物またはその薬学的に許容される塩を反応させることを含む、方法。
  54. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が配列番号4に示すアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8に示すアミノ酸配列を含むVLを含む、請求項53の方法。
  55. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が定常領域を含み、該定常領域は、ゲムツズマブと少なくとも1個のアミノ酸が異なる、請求項53または54の方法。
  56. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分がIgG1抗体またはその抗原結合部分である、請求項53~55の何れかの方法。
  57. 抗CD33抗体またはその抗原結合部分が定常領域に対応するアミノ酸297にアラニンを含む、請求項53~56の何れかの方法。
  58. 抗CD33抗体が配列番号9に示す重鎖および配列番号10に示す軽鎖を含む、請求項53または57の方法。
  59. 式(I-1)の化合物と反応させる前に抗CD33抗体またはその抗原結合部分を還元することをさらに含む、請求項53~58の何れかの方法。
  60. aが2~8の整数である、請求項53~59の何れかの方法。
  61. L’が開裂不可能リンカー前駆体、開裂可能リンカー前駆体、生体内還元性リンカー前駆体、酸開裂可能リンカー前駆体、クリック放出リンカー前駆体、ピロホスファターゼ開裂可能リンカー前駆体、ベータ-グルクロニダーゼ開裂可能リンカー前駆体またはそれらの任意の組み合わせである、請求項53~60の何れかの方法。
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