JP2024521748A - 潰瘍性大腸炎に関与する遺伝子の抗ｉｌ－２３ｐ１９抗体調節 - Google Patents

潰瘍性大腸炎に関与する遺伝子の抗ｉｌ－２３ｐ１９抗体調節 Download PDF

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Abstract

本開示は、一般に、潰瘍性大腸炎を治療及び診断する方法に関する。本方法は、潰瘍性大腸炎を有する患者の特定のサブグループを治療及び診断するのに、特に好適である。本方法はまた、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における切迫感を治療及び診断するために、特に好適である。本方法はまた、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度及び腸切迫感を治療及び診断するために、特に好適である。

Description

背景技術
本開示は、一般的に、医薬品に関する。より詳細には、本開示は、潰瘍性大腸炎を治療及び診断する方法に関する。本方法は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者の特定のサブグループを治療及び診断するのに、特に好適である。本方法はまた、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における切迫感を治療及び診断するために、特に好適である。本方法はまた、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度及び腸切迫感を治療及び診断するために、特に好適である。
潰瘍性大腸炎（Ulcerative Colitis、ＵＣ）は、結腸の粘膜炎症を特徴とする、慢性再発性の免疫媒介性炎症性腸疾患（Inflammatory Bowel Disease、ＩＢＤ）である。実質的な罹患率及び生活の質の低下は、下痢、直腸出血、及び切迫感などの典型的な症状から生じる。治療目的としては、症状制御（臨床的寛解）を達成すること、粘膜治癒（内視鏡的寛解）をもたらすように腸炎症を抑制すること、及び腸機能を維持することが挙げられる。現在の治療選択肢としては、５－アミノサリチレート、グルココルチコイド、チオプリン、ヤヌス関連キナーゼ（Janus-Associated Kinase、ＪＡＫ）阻害物質トファシチニブ、並びにＴＮＦα、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３のｐ－４０サブユニット、及びα４ｂ７インテグリンに拮抗する生物学的製剤が挙げられる。しかしながら、患者の３分の１までは誘導治療に応答せず、最初に恩恵を受けた患者の約４０％は、その後応答を失う。抗ＴＮＦ療法は、潜在的に重篤な副作用を伴うことが、最近示された。インテグリンシグナル伝達を遮断し、それによって、腸粘膜へのリンパ球輸送を減少させ、粘膜炎症を減少させる、新しい部類の生物学的製剤は、より好ましい安全性プロファイルを表す。最近の治験において、α４β７インテグリン遮断薬であるベドリズマブは、中等度から重度のＵＣに対して、ＴＮＦ阻害物質アダリムマブよりも有効であることが示された。
インターロイキン－２３（ＩＬ－２３）は、ＩＢＤにおける新規の治療標的であり、ＩＬ－１２と共有するｐ１９サブユニット及びｐ４０サブユニットから構成されるヘテロ二量体サイトカインである。ＩＬ－２３受容体結合は、ＪＡＫ（主にＴＹＫ２及びＪＡＫ２）並びに転写因子３及び４（ＳＴＡＴ３及びＳＴＡＴ４）のシグナル伝達変換器及び活性化因子をもたらし、下流の標的遺伝子の転写を誘発する。ＩＬ－２３は、複数の炎症促進性サイトカイン（例えば、インターフェロン－γ、ＩＬ－１７Ａ、ＩＬ－１７Ｆ及びＩＬ－２２）を同時に産生する集団を含む病原性Ｔ細胞系統の分化、維持及び安定化、並びに先天性リンパ系細胞のエフェクタ機能の活性化及び誘導を促進する。ｐ４０の治療的遮断は、ＵＣ及びＣＤの両方において有効であり、ｐ１９を標的とする薬物は、ＵＣ及びＣＤの両方について研究されている。
単一細胞ＲＮＡＳｅｑ研究からのデータは、炎症を起こした粘膜線維芽細胞、組織常在性単核細胞、及び樹状細胞が、抗ＴＮＦに応答するＵＣ患者と比較して、抗ＴＮＦ耐性（ＴＮＦＲ）療法において濃縮されることを示唆している。これらの研究において、Ｓｍｉｉｌｌｉｅらが、抗ＴＮＦ療法に対する６０人の応答者及び５７人の非応答者からのバルク発現データのメタ分析に基づいて、ＴＮＦＲの遺伝子シグネチャ（ｇｅｎｅ ｓｉｇｎａｔｕｒｅｓ、遺伝子の発現パターン特性）及び感受性について、細胞サブセットをスコアリングした。ＴＮＦＲは、免疫関連線維芽細胞（Immune Associated Fibroblasts、ＩＡＦ）、炎症性単核細胞、及びＤＣ２細胞において濃縮された遺伝子と、強く関連していた。対照的に、抗ＴＮＦ療法に対する好ましい応答は、寛解期のＵＣ患者において優勢な健康な粘膜を表す上皮細胞におけるトランスクリプトームシグネチャにおいて明らかであった。
潰瘍性大腸炎などの炎症性腸疾患を診断及び治療するための代替の組成物及び方法が、依然として必要とされている。
本開示は、一般に、潰瘍性大腸炎を治療及び診断する方法に関する。本方法は、潰瘍性大腸炎を有する患者の特定のサブグループを治療及び診断するのに、特に好適である。本方法はまた、潰瘍性大腸炎を有する患者における切迫感を治療及び診断するのに、特に好適である。本方法はまた、潰瘍性大腸炎を有する患者における排便頻度及び腸切迫感を治療及び診断するために、特に好適である。
本発明者らは、（結腸組織試料又は直腸組織試料における遺伝子転写物バイオマーカの変化を測定することによって決定される）多数の遺伝子の発現が、潰瘍性大腸炎を有するか又は有すると疑われる患者の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体での処置に応答して生じることを結論付けた。本遺伝子転写物は、潰瘍性大腸炎、潰瘍性大腸炎の症状、潰瘍性大腸炎に関連する排便頻度、及び潰瘍性大腸炎に関連する腸切迫感を診断するためのバイオマーカとして使用されてもよい。遺伝子転写物はまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体での処置に対する、成功した応答のバイオマーカとして使用されてもよい。
したがって、本発明の第１の態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
本発明の更なる態様では、潰瘍性大腸炎の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎の治療に使用するための薬剤の製造における抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を治療する方法が提供されるが、当該方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、当該治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する症状の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連した症状の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する症状の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連した症状の治療に使用するための薬剤の製造において抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
好ましくは、症状は、腹痛／腹部不快感、血便、大便中の膿、発熱、体重減少、直腸出血、頻繁な下痢、再発下痢、倦怠感、食欲減退、及びしぶり腹（切迫感）のうちの１種以上である。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、抗腫瘍壊死因子（anti-Tumor Necrosis Factor、抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から試料を得て、ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、試料を分析することによって、患者が抗ＴＮＦＲであるか否かを決定することと、
患者が抗ＴＮＦＲである場合に、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療することと、を含む。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者から試料を得て、患者が抗ＴＮＦＲであるか否かを決定することと、
ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、試料を分析することと、
患者が抗ＴＮＦＲである場合に、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療することと、を含む。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者から試料を得て、患者が抗ＴＮＦＲであるか否かを決定することと、
ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、試料を分析することと、
患者が抗ＴＮＦＲである場合に、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療することと、を含む。
好ましくは、本方法又は本治療は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与前及び抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に得られた試料を分析することを更に含み、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って得られた試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に得られた試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＴＮＦＲ患者における抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表８から選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、上記から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する排便頻度の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表８から選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、表８から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連した排便頻度の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表８から選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、表８から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子（Platelet activating factor receptor）、アポトーシス（細胞自滅、Ａｐｏｐｔｏｓｉｓ）誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子（Colony stimulating factor）３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子（proto-oncogene）、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン（Prokineficin）２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する排便頻度の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する排便頻度の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連した排便頻度の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表９から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、表９からの１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する腸切迫感の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表９から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、表９からの１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連した腸切迫感の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表９から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、表９からの１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）から、１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連する腸切迫感の治療に使用するための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）から、１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎に関連した腸切迫感の治療に使用するための薬剤の製造のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の使用が提供されるが、本治療は、
潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から、第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）から、１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の方法、処置及び使用の好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも２個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも３個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも４個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも５個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも６個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも７個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも８個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも９個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、本方法、本処置又は本使用は、適切な場合、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って及びその後に、前述の遺伝子の少なくとも１０個の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを検出することを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、第１の試料において検出される１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現からの、第２の試料において検出される１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現の変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与が継続されるべきであることを示す。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が増加し、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）は、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後に減少し、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１及びＰＴＧＳ２である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルは、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、遺伝子発現プロファイリングの方法は、ＰＣＲ（Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ、ポリメラーゼ連鎖反応）ベースの方法である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、遺伝子発現プロファイリングの方法は、免疫組織化学である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、遺伝子発現プロファイリングの方法は、プロテオミクス技術である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（単数又は複数）の発現レベルは、１つ以上の参照遺伝子の発現レベル又はそれらの発現産物の発現レベルに対して正規化される。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、試料は、結腸組織生検由来又は直腸組織生検由来である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、結腸組織生検は、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、結腸組織生検は、非炎症結腸領域由来である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、結腸組織生検は、炎症結腸領域由来である。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、第１の試料は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与前又は投与と同時に採取され、ここで、第２の試料は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の最初の投与後、少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体は、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ、又はブラジクマブである。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体は、ミリキズマブである。
好ましくは、本方法、本処置又は本使用は、
ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって患者に投与することであって、最初の維持用量が、最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む。
更に好ましくは、第１の維持用量のミリキズマブは、最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される。
更に好ましくは、その後の維持用量（複数可）のミリキズマブは、最初の維持用量の投与後、４週間間隔で投与される。
あるいは、好ましくは、その後の維持用量（複数可）のミリキズマブは、最初の維持用量の投与後、１２週間間隔で投与される。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体は、グセルクマブである。
好ましくは、本方法、本処置又は本使用は、
ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって患者に投与することであって、最初の維持用量が、最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む。
更に好ましくは、各誘導用量は、２００ｍｇのグセルクマブを含む。
代替的に好ましくは、各誘導用量は、４００ｍｇのグセルクマブを含む。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体は、リサンキズマブである。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体は、チルドラキズマブである。
本発明の方法、処置及び使用の依然として更なる好ましい態様では、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体は、ブラジクマブである。
本発明の更なる態様では、潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法が提供されるが、本方法は、
患者から試料を得ることと、
ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、試料を分析することと、
遺伝子転写物バイオマーカの分析に基づいて、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として同定することと、を含む。
好ましくは、潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者から得られた当該試料別の試料を分析することを更に含む。
本発明の更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法が提供されるが、本方法は、
患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の決定された発現レベルを、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと比較することと、
患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して増加している場合、又は患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して減少している場合、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
本発明の更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体での処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法が提供されるが、本方法は、
（ａ）（ｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、患者から得られた試料を分析することと、
（ｂ）（ｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、
（ｃ）（ｉ）患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）における発現レベルの変化が検出される場合、潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、
又は
（ａ）（ｉｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けていない潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者から得られた試料を分析することと、
（ｂ）（ｉｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）に関して、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、
（ｃ）（ｉｉ）患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）における発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けなかった患者における１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルと比較して検出される場合、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む。
本発明の更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体での処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法が提供されるが、本方法は、
（ａ）（ｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、患者から得られた試料を分析することと、
（ｂ）（ｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、
（ｃ）（ｉ）患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）における発現レベルが増加する場合、潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、
又は
（ａ）（ｉｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けなかった潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から得られた試料を分析することと、
（ｂ）（ｉｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、
（ｃ）（ｉｉ）抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体治療を受けなかった患者における１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルと比較して、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体治療を受けた後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルが増加する場合、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む、方法。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を診断するための方法が提供されるが、本方法は、
表８から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の決定された発現レベルを、上の表から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと比較することと、
患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を診断するための方法が提供されるが、本方法は、
第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の決定された発現レベルと、を比較することと、
患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、表９から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、上の表からの１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
ここで、第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法が提供されるが、本方法は、
患者から第１の試料を得ることと、
第１の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、
患者から第２の試料を得ることと、
第２の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）から、１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
第１の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
本発明の依然として更なる態様では、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカを含む、遺伝子転写物バイオマーカパネルが提供される。
本発明の依然として更なる態様では、ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカを含む、請求項２６０に記載の遺伝子転写物バイオマーカパネルが提供される。
本発明の依然として更なる態様では、表８から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む遺伝子転写物バイオマーカパネルが提供される。
本発明の依然として更なる態様では、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む、遺伝子転写物バイオマーカパネルが提供される。
本発明の依然として更なる態様では、表９から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む遺伝子転写物バイオマーカパネルが提供される。
本発明の依然として更なる態様では、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む、遺伝子転写物バイオマーカパネルが提供される。
本発明の依然として更なる態様では、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を治療する方法が提供される。本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法に関する。本方法は、患者から試料を得ることと、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）の少なくとも１個のバイオマーカについて分析することと、バイオマーカの分析に基づいて、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として同定することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療する方法に関する。本方法は、患者が抗ＴＮＦＲであるか否かを決定することと、患者が抗ＴＮＦＲである場合に、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で処置することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における、潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法に関する。本方法は、患者から第１の試料を得ることと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、試料を分析することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、第２の試料を分析することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法に関する。本方法は、（ａ）患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択された少なくとも１個のバイオメーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択された少なくとも１個のバイオマーカの参照発現レベルと、少なくとも１個のバイオマーカの決定された発現レベルと、を比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して増加している場合に、又は患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、潰瘍性大腸炎を診断する方法に関する。本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの参照発現レベルと、少なくとも１個のバイオマーカの決定された発現レベル（複数可）と、を比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して増加している場合に、又はバイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法に関する。本方法は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、患者から得られた試料を分析することと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、少なくとも１個のバイオマーカにおける発現レベルの変化が検出された場合に、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む。
別の態様では、本開示は、バイオマーカパネルに関する。バイオマーカパネルは、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカを含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢ、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢ、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を診断するための方法に関し、本方法は、（ａ）患者から得られた試料において、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢ、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢ、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの参照発現レベルと、バイオマーカの決定された発現レベルと、を比較することと、（ｃ）患者のバイオマーカ発現レベルが、基準発現レベルと比較して変化した場合に、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカを検出することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を診断する方法であって、本方法は、（ａ）患者から得られた試料において、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの参照発現レベルと、バイオマーカの決定された発現レベルと、を比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合、腸切迫感の診断を提供することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において排便頻度を診断する方法であって、本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料において、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢ、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢ、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの参照発現レベルと、バイオマーカの決定された発現レベル（複数可）と、を比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが、基準発現レベルと比較して変化した場合に、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において腸切迫感を診断する方法であって、本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料において、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカの参照発現レベルと、バイオマーカの決定された発現レベル（複数可）と、を比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが、基準発現レベルと比較して変化した場合に、腸切迫感の診断を提供することと、を含む。
別の態様では、本開示は、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢを含む少なくとも１個のバイオマーカを含むバイオマーカパネルに関する。
別の態様では、本開示は、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３を含む少なくとも１個のバイオマーカを含むバイオマーカパネルに関する。
本特許書類又は本出願書類には、彩色で作成された少なくとも１つの図面が含まれる。色彩図面を含む、本特許又は本特許出願公開書のコピーは、要求と必要な手数料の支払いに応じて、特許庁によって提供される。
以下の詳細な説明を考慮すると、本開示はよりよく理解され、上記以外の特徴、態様、及び利点が明らかになるであろう。このような詳細な説明では、以下の図面が参照される。
ミリキズマブ処理後に差次的に発現された遺伝子を示す。ミリキズマブ処置群における、ベースラインと第１２週目との間で差次的に発現された遺伝子の重複（対数（ｌｏｇ）２倍率変化≧０．５及びＦＤＲ≦０．０５）。プラセボ群において、これらの倍率変化及びＦＤＲ閾値に基づいて差次的発現を示した遺伝子はなかった。 ミリキズマブ処理後に差次的に発現された遺伝子を示す。プラセボに対して正規化する前（図１Ｂ）及び後（図１Ｃ）の、２００ｍｇのミリキズマブ群において差次的に発現された遺伝子は、減少した場合は青色の円として示され、増加した場合はオレンジ色の円として示される。２０個の最も増加及び減少したものが、標識されている。 ミリキズマブ処理後に差次的に発現された遺伝子を示す。プラセボに対して正規化する前（図１Ｂ）及び後（図１Ｃ）の、２００ｍｇのミリキズマブ群において差次的に発現された遺伝子は、減少した場合は青色の円として示され、増加した場合はオレンジ色の円として示される。２０個の最も増加及び減少したものが、標識されている。 ミリキズマブ処理後に差次的に発現された遺伝子を示す。プラセボに対して正規化した後、２００ｍｇのミリキズマブ群において最も差次的に発現された遺伝子を、ＭｅｔａＣｏｒｅデータベースによって定義される遺伝子ネットワークによって、分類した。 ＩＬ－２３経路転写物と疾患活動性スコアの変化との間の相関関係を示す。修正されたメイヨースコア（緑色）、ＲＨＩ（赤色）、及びＵＣＥＩＳ（灰色）における、同じ期間にわたる変化との、第１２週目におけるミリキズマブ調節遺伝子の差次的発現についての、ピアソン相関係数（Ｐｅａｒｓｏｎ’ｓ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ）。ＭｅｔａＣｏｒｅデータベースによって、ＩＬ－２３によって上方制御される際に同定される遺伝子を、標識する。 ＩＬ－２３経路転写物と疾患活動性スコアの変化との間の相関関係を示す。上記で同定された各遺伝子の差次的発現についての、ピアソン相関係数（Ｒｈｏ）のヒートマップ。プラセボ群における変化で正規化した後の、２００ｍｇのミリキズマブ用量群における各遺伝子についての倍率変化値を、縦軸に示す。 ミリキズマブ調節遺伝子の変化と疾患活動性スコアの変化との間の相関を示す。修正されたメイヨースコア（緑色）、ＲＨＩ（赤色）、及びＵＣＥＩＳ（灰色）における、同じ期間にわたる変化との、第１２週目におけるミリキズマブ調節遺伝子の差次的発現についての、ピアソン相関係数。プラセボ群における変化で正規化した後に、２００ｍｇのミリキズマブ用量群において≧２倍の差次的発現を有する遺伝子を標識する。疾患活動性スコアの変化と正に相関した全ての標識遺伝子は、ベースラインと第１２週目との間で減少し、疾患活動性スコアの変化と負に相関したものは、その期間にわたって発現が増加した。 疾患スコアの変化と最も高度に相関するミリキズマブ調節遺伝子を示す。ベースラインと第１２週目との間の各遺伝子の差次的発現についてのピアソン相関係数は、修正されたメイヨースコア（図４Ａ）及びＲＨＩ（図４Ｂ）の同じ期間にわたる変化を伴う。２０個の最も差次的に調節される遺伝子を標識し、経路分析を表３に要約する。 疾患スコアの変化と最も高度に相関するミリキズマブ調節遺伝子を示す。ベースラインと第１２週目との間の各遺伝子の差次的発現についてのピアソン相関係数は、修正されたメイヨースコア（図４Ａ）及びＲＨＩ（図４Ｂ）の同じ期間にわたる変化を伴う。２０個の最も差次的に調節される遺伝子を標識し、経路分析を表３に要約する。 抗ＴＮＦα耐性及び応答に関連する、ミリキズマブ調節遺伝子を示す。ベースラインと第１２週目との間の２００ｍｇのミリキズマブ用量群における各遺伝子の発現の変化を、同じ期間にわたるプラセボ群における発現の変化について正規化した。差次的に発現された遺伝子（対数（ｌｏｇ）２倍率変化≧０．５及びＦＤＲ≦０．０５）は、減少した場合は青色の円で示され、増加した場合はオレンジ色の円で示される。抗ＴＮＦα処置に対する耐性（図５Ａ）及び応答（図５Ｂ）に関連する遺伝子を、標識する。 抗ＴＮＦα耐性及び応答に関連する、ミリキズマブ調節遺伝子を示す。ベースラインと第１２週目との間の２００ｍｇのミリキズマブ用量群における各遺伝子の発現の変化を、同じ期間にわたるプラセボ群における発現の変化について正規化した。差次的に発現された遺伝子（対数（ｌｏｇ）２倍率変化≧０．５及びＦＤＲ≦０．０５）は、減少した場合は青色の円で示され、増加した場合はオレンジ色の円で示される。抗ＴＮＦα処置に対する耐性（図５Ａ）及び応答（図５Ｂ）に関連する遺伝子を、標識する。 ミリキズマブ及びプラセボ（「ＰＢＯ」）応答者に対する第１２週目及び第５２週目の臨床応答者の間の差次的遺伝子発現プロファイルを示す、ヒートマップである。 ミリキズマブ応答者にのみ存在する、ＰＢＯ応答者にのみ存在する、及び両方の群に存在する示差的に発現された遺伝子及び同様に発現された遺伝子の、ベン図である。 上位１０個の、ミリキズマブ特異的な、差次的に発現される遺伝子及び同様に発現される遺伝子（ＤＥＧ－ＳＥＧ遺伝子）を示す。 ミリキズマブ応答者における第１２週目及び第５２週目のベースライン（「ＢＬ」）からの差次的遺伝子発現を示す。 ミリキズマブ応答者における第１２週目及び第５２週目のベースライン（「ＢＬ」）からの差次的遺伝子発現を示す。図９Ｂ及び図９Ｄの矢印は、遺伝子発現の変化の方向性を示す。 プラセボ（「ＰＢＯ」）応答者における第１２週目及び第５２週目のベースライン（「ＢＬ」）からの差次的遺伝子発現を示す。 プラセボ（「ＰＢＯ」）応答者における第１２週目及び第５２週目のベースライン（「ＢＬ」）からの差次的遺伝子発現を示す。図９Ｂ及び図９Ｄの矢印は、遺伝子発現の変化の方向性を示す。 Ａ～Ｄは、ミリキズマブで処置された患者における、遺伝子のクラスタと疾患活動性指数との間の相関を示す。Ａは、第１２週目におけるＲＨＩ ＰＣＣを有するミリキズマブ（「Ｍｉｒｉ」）応答者における、遺伝子のクラスタを示す。Ｂは、第５２週目におけるＲＨＩ ＰＣＣを有するミリキズマブ（「Ｍｉｒｉ」）応答者における、遺伝子のクラスタを示す。Ｃは、第１２週目のメイヨーＰＣＣ指数を有するミリキズマブ（「Ｍｉｒｉ」）応答者における、遺伝子のクラスタを示す。Ｄは、第５２週目のメイヨーＰＣＣ指数を有するミリキズマブ（「Ｍｉｒｉ」）応答者における、遺伝子のクラスタを示す。ＰＣＣ＝ピアソン相関係数であり、灰色ＮＳ＝有意でなく、青色ｐ値であり、赤色ｐ値、及びＰＣＣである。 Ａ及びＢは、ベースライン及びミリキズマブ誘導の第１２週目における患者報告排便頻度（Stool Frequency、ＳＦ）（Ａ）及び腸切迫感（Bowel Urgency、ＢＵ）（Ｂ）を示すグラフである。 ケンダルのタウ（ｔａｕ、τ）対排便頻度及び腸切迫感についてのＲｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（Robarts Histopathology Index、ＲＨＩ）、Ｇｅｂｏｅｓスコア、及び改変メイヨースコア（Modified Mayo Score、ＭＭＳ）を含む臨床測定基準を示すグラフである。 ＳＦに関連する上位２０個の遺伝子についてのタウ（τ）分布を示すグラフである。 選択されたバイオマーカ（Ｓ１００Ａ８、ＭＭＰ３、ＡＱＰ９、及びＣＤＨＲ１）の発現を、ＭＭＳ－ＳＦスコア（修正メイヨースコア－排便頻度）との関係で示すグラフである。 ＳＦに関連する上位２０個の遺伝子についてのタウ（τ）分布を示すグラフである。 腸切迫感スコアに関する、選択されたバイオマーカ（ＣＣＤＣ１７５、ＴＮＦＲＳＦ１７、ＣＦＢ、ＦＢＸＷ７の発現を示すグラフである。ＭＭＳ－ＳＦスコア＝修正メイヨースコア－排便頻度。 排便頻度のみに関連する遺伝子（１４５）、腸切迫感のみに関連する遺伝子（１９８）、並びに排便頻度及び腸切迫感の両方に関連する遺伝子（１２２）を示す、ベン作図である。
別途定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本開示が属する技術分野の当業者によって一般に理解される意味と同じ意味を有する。本明細書に記載のものと同様又は同等の任意の方法及び材料を本開示の実践又は試験に使用し得るが、好ましい方法及び材料を、以下に説明する。
ＵＣは、特徴的な潰瘍を含む、腸、通常は結腸の炎症性疾患である大腸炎の一形態である。活動性疾患の症状には、通常、血液と混じった下痢が含まれ、通常、軽度の不快感から重度の痛みを伴うけいれんまで、様々な程度の腹痛を伴う。
メイヨースコア、改変メイヨースコア（ＭＭＳ）、及び潰瘍性大腸炎疾患活動性指数（ＵＣＤＡＩ）を含む、疾患の重症度を評価するための方法はいくつかある。
メイヨースコアは、以下の４個のサブスコアから構成される複合的な計測手段である。
（ｉ）排便頻度（ＳＦ）：ＳＦサブスコアは、患者が報告する測定値である。この項目は、同じ期間のその患者の通常の排便数と比較して、２４時間の排便数を４ポイントのスケールで報告する。排便とは、患者が便通を有したとき、又は血液のみ、血液及び粘液、又は粘液のみを排泄するときのいずれかにトイレへ行くことと定義される。２４時間の期間内で排泄された排便の合計数が、患者によって記録される。その患者の参照「正常な」ＳＦは、典型的には、研究の開始時又は観察期間に記録される。その患者の正常なＳＦは、患者が寛解したときに報告されたＳＦであるか、患者が寛解を達成したことがない場合は、ＵＣの兆候及び症状が最初に発現する前に報告されたＳＦである。
Figure 2024521748000001
（ｉｉ）直腸出血：ＲＢサブスコアは、患者が報告する測定値である。この項目は、所与の日に経直腸的に排泄された最も重篤な血液量を、４ポイントスケールで報告する。
Figure 2024521748000002
（ｉｉｉ）内視鏡サブスコア（Endoscopic Subscore、ＥＳ）：ＥＳは、医師が報告する測定値であり、軟性Ｓ状結腸鏡検査又は結腸鏡検査における粘膜の最悪の外観を、４ポイントスケールで報告する。現在の臨床診療と一致して、脆弱性は、１のＥＳの定義から除外される。
Figure 2024521748000003
（ｉｖ）医師総合評価（Physician’s Global Assessment）（ＰＧＡ）：ＰＧＡは、医師が報告する測定値であり、患者のＵＣ疾患活動性の評価を、４ポイントスケールで要約する。
Figure 2024521748000004
各サブスコアは、０～３の範囲の４ポイントスケールでスコア付けされ、最大メイヨースコアは、１２になる。
ＭＭＳは、元のメイヨー・インデックス参照に対して行われた修正であり（Ｓｃｈｒｏｅｄｅｒら、Ｎｅｗ Ｅｎｇ Ｊ Ｍｅｄ，３１７（２６）：１６２５－１６２９，１９８７年）、メイヨースコアの４個のサブスコアのうちの３つを含む。医師総合評価は含まれていない。ＭＭＳは、３個のサブスコアを評価し、各々０～３のスケールで、最大合計スコアは９である。メイヨースコアが６～１２又はＭＭＳが４～９で、各々ＥＳが２以上の患者は、中程度～重度の活動性潰瘍性大腸炎を有するものとして定義される。
本明細書で使用される場合、「必要とする対象」は、特定疾患、障害、又は状態を有する、有することが疑われる、罹患しやすい、及びそのリスクがある対象を指す。より具体的には、本開示において、潰瘍性大腸炎を治療する方法及びバイオマーカをスクリーニングする方法は、潰瘍性大腸炎を有する、有することが疑われる、潰瘍性大腸炎に罹患しやすい、及び潰瘍性大腸炎を経験するリスクが高い対象のサブセットに使用される。このような対象としては、潰瘍性大腸炎を有する対象、潰瘍性大腸炎を有することが疑われる対象、潰瘍性大腸炎に罹患しやすい対象及び潰瘍性大腸炎のリスクがある対象が挙げられ得るが、これらに限定されない。対象は、家族歴、年齢、環境、及び／又は生活様式に起因して、潰瘍性大腸炎を有する、有することが疑われる、潰瘍性大腸炎に罹患しやすい、及び潰瘍性大腸炎のリスクがある。その他の実施形態では、潰瘍性大腸炎を有する、有することが疑われる、罹患しやすい、及び罹患するリスクがある対象は、潰瘍性大腸炎のための抗ＴＮＦ治療に対する耐性を有する、又は有することが疑われる対象を含む。対象は、家族歴、年齢、環境、及び／又は生活様式に起因して、潰瘍性大腸炎のための抗ＴＮＦ処置に対する耐性を有し得るか、又は有することが疑われる。
上記に基づいて、本開示の方法の実施形態のいくつかは、特定された対象の特定のサブセット又はサブクラス（すなわち、本明細書に記載の１つ以上の特定の状態に対処する際の支援を「必要とする」対象のサブセット又はサブクラス）に関するので、全ての対象が、本明細書に記載の治療を必要とする対象のサブセット又はサブクラスに含まれるわけではない。
本明細書で使用される場合、「罹患しやすい」及び「リスクがある」とは、特定の疾患、障害又は状態に対してほとんど抵抗性を有さないこと（遺伝的素因があること、疾患、障害又は状態の家族歴を有すること、及び／又は疾患、障害又は状態の症状を有することを含む）を指す。
本明細書で使用される場合、「バイオマーカ」という用語は、生体試料又は生体試料が得られる対象を特徴付けるために使用され得る、生体試料中に見出される任意の分子又は分子の群を指す。例えば、バイオマーカは、その存在、非存在、又は相対的存在量が、特定の細胞若しくは組織の種類若しくは状態の特徴、及び／又は特定の病理学的状態若しくは状態の特徴、及び／又は病理学的状態の重症度、病理学的状態の進行若しくは退行の可能性、及び／又は病理学的状態が特定の処置に応答する可能性を示す分子又は分子群であってもよい。別の例として、バイオマーカは、細胞型若しくは微生物（細菌、マイコバクテリウム、真菌、ウイルスなど）、又はその置換分子若しくは分子群であってもよい。本明細書で提供されるバイオマーカは、潰瘍性大腸炎の存在を検出及び／又は確認するために使用され得る診断バイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカは、潰瘍性大腸炎の状態を評価するために連続的に分析され得るモニタリングバイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に対する患者の応答を決定するために使用され得る、薬力学的バイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置からの好ましい効果又は好ましくない効果を経験する可能性がより高い個体又は個体群を予測又は同定するために使用され得る、予測バイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する毒性の可能性、存在、又は程度を示すために、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の前及び／又は後に測定される、安全性バイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカはまた、潰瘍性大腸炎の進行及び／又は再発を同定するための、予後バイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカは、潰瘍性大腸炎を有すると診断されていない個体が潰瘍性大腸炎を発症する可能性を示し得る、罹患率バイオマーカ／リスクバイオマーカであり得る。本明細書で提供されるバイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後の臨床転帰を説明する、代理バイオマーカであり得る。
本明細書で使用される場合、「遺伝子転写物バイオマーカ」という用語は、特定の遺伝子に対応する遺伝子発現産物、例えば、特定の遺伝子によって発現されるＲＮＡ転写物を指す。遺伝子転写物バイオマーカは、より一般的なバイオマーカに関して上述したように使用されてもよい。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカは、潰瘍性大腸炎の存在を検出及び／又は確認するために使用され得る、診断バイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカは、潰瘍性大腸炎の状態を評価するために連続的に分析され得る、モニタリングバイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に対する患者の応答を決定するために使用され得る、薬力学的バイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置からの好ましい効果又は好ましくない効果を経験する可能性がより高い個体又は個体群を予測又は同定するために使用され得る、予測バイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する毒性の可能性、存在、又は程度を示すために、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の前及び／又は後に測定される、安全性バイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカはまた、潰瘍性大腸炎の進行及び／又は再発を同定するための、予後バイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカはまた、潰瘍性大腸炎を有すると診断されていない個体が潰瘍性大腸炎を発症する可能性を示し得る、罹患率バイオマーカ／リスクバイオマーカであり得る。本明細書で提供される遺伝子転写物バイオマーカはまた、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後の臨床転帰を説明する、代理バイオマーカであり得る。「バイオマーカ」及び「遺伝子転写物バイオマーカ」という用語は、本明細書において互換的に使用される。
本明細書で使用される場合、「バイオマーカ（又は遺伝子転写物バイオマーカ）の発現レベル」は、当業者に周知であるように、バイオマーカをコードする遺伝子から遺伝子産物が合成されるプロセスを指す。遺伝子産物は、例えば、ＲＮＡ（ｒｉｂｏｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ、リボ核酸）及びタンパク質であり得る。発現レベルは、例えば、ノーザンブロット法、増幅、ポリメラーゼ連鎖反応、マイクロアレイ分析、タグ系技術（例えば、遺伝子発現の連続分析及び全トランスクリプトームショットガン配列決定又はＲＮＡ－Ｓｅｑなどの次世代配列決定）、ウェスタンブロット法、酵素結合免疫吸着アッセイ（Enzyme Linked Immunosorbent Assay、ＥＬＩＳＡ）、及びこれらの組合せなどの当業者に周知の方法によって、定量的に測定され得る。
本明細書で使用される場合、バイオマーカ又は遺伝子転写物の「参照発現レベル」とは、潰瘍性大腸炎を有さない対象について確立されたバイオマーカの発現レベル、本明細書に記載される確立された方法を使用して医療専門家及び／若しくは研究専門家によって決定される潰瘍性大腸炎を有さない正常／健康な対象におけるバイオマーカの発現レベル、並びに／又は文献から得られるバイオマーカの周知の発現レベルを指す。バイオマーカの参照発現レベルはまた、潰瘍性大腸炎を有さない対象、潰瘍性大腸炎を有さない正常／健康な対象におけるバイオマーカの発現レベル、及び試料が対象から得られた時点では潰瘍性大腸炎を有さないが、後に潰瘍性大腸炎を有さない対象についてのバイオマーカの発現レベルなどの、対象の任意の組合せについて確立された、バイオマーカの発現レベルを指し得る。バイオマーカの参照発現レベルはまた、本方法が適用される対象から得られたバイオマーカの発現レベルを指し得る。したがって、来診ごとの対象内の変化は、潰瘍性大腸炎のリスクの増加又は減少を示し得る。例えば、バイオマーカの複数の発現レベルは、同じ対象から得られた複数の試料から得られ得るが、各試料における複数の発現レベル間の差異を同定するために使用され得る。したがって、一部の実施形態では、同じ対象から得られた２種以上の試料は、血液バイオマーカの発現レベル（複数可）及び血液バイオマーカの参照発現レベル（複数可）を提供し得る。参照発現レベルはまた、「プラセボ応答者」におけるバイオマーカの発現レベルを指し得る。本明細書で使用される場合、「プラセボ応答者」は、本明細書に記載される確立された方法を使用して医療専門家及び／又は研究専門家によって決定される潰瘍性大腸炎を有し、臨床的改善を示すが、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与されていない対象である。理論に束縛されるものではないが、プラセボ応答者は、潰瘍性大腸炎の診断及び／又はカウンセリング及び／又は医学的経過観察に応答して、プラセボ応答者によってなされた生活様式の変化に起因して、改善を示すと考えられる。
本発明の方法、処置及び使用で使用され得る抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の例としては、グセルクマブ、チルドラキズマブ、リサンキズマブ、ミリキズマブ、及びブラジクマブが挙げられる。
ＣＡＳ登録番号１３５０２８９－８５－８のグセルクマブは、ヒトＩＬ－２３のｐ１９サブユニットに結合する完全ヒトＩｇＧ１ラムダモノクローナル抗体である。抗体及びそれを作製する方法は、米国特許第７，９３５，３４４号に記載されている。
ＣＡＳ登録番号１３２６２４４－１０－３のチルドラキズマブは、ヒトＩＬ－２３のｐ１９サブユニットを標的とするヒト化ＩｇＧ１カッパ（κ）モノクローナル抗体である。抗体及びそれを作製する方法は、米国特許第８，２９３，８８３号に記載されている。
ＣＡＳ登録番号１６１２８３８－７６－２のリサンキズマブは、ヒトＩＬ－２３のｐ１９サブユニットを標的とするヒト化ＩｇＧ１カッパ（κ）モノクローナル抗体である。抗体及びそれを作製する方法は、米国特許第８，７７８，３４６号に記載されている。
ミリキズマブ（本明細書では「ミリ」とも称する）である、ＣＡＳ登録番号１８８４２０１－７１－１は、ヒトＩＬ－２３のｐ１９サブユニットを標的とするヒト化ＩｇＧ４－カッパ（κ）モノクローナル抗体である。抗体及びそれを作製する方法は、米国特許第９，０２３．３５８号に記載されている。ミリキズマブは、本発明の多くの態様における使用に特に好適である。
好適な抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体誘導投与量は、約５０ｍｇ～約６００ｍｇを含む。特に好適な用量は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の３００ｍｇの誘導用量である。抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の誘導用量は、好適には、静脈内投与される。適切には、５０ｍｇ～６００ｍｇ、好ましくは、３００ｍｇの誘導用量を、４週間ごとに１２週間、患者に投与する。誘導用量（複数可）の後に、約１５０ｍｇ～約４００ｍｇの範囲、好ましくは２００ｍｇの抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の、少なくとも１回の維持用量が続いてもよい。特に好適な投薬量は、２００ｍｇの維持用量の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体である。好適には、１５０ｍｇ～４００ｍｇの維持用量を、４週間ごと又は１２週間ごと、患者に投与する。誘導期間中に、必要とする患者に少なくとも１回の誘導用量の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与することは、所望の治療効果を誘導するように意図されており、所望の治療効果は、臨床的寛解、臨床反応、内視鏡的寛解、内視鏡的治癒、及び／又は症候性寛解である。誘導期間の終了時に患者が所望の治療効果を達成した場合、その後、患者は、誘導期間中に得られた治療効果（複数可）のうちの少なくとも１つを維持するために、少なくとも１回の維持用量を投与され、治療効果（複数可）は、臨床的寛解、臨床反応、内視鏡的寛解、内視鏡的治癒、及び／又は症候性寛解である。誘導期間の最小持続期間又は最大持続期間はないが、典型的には、持続期間は、４週間、８週間、又は１２週間であり、誘導期間の終了は、典型的には、最後の誘導用量が投与された４週間又は８週間後に行われる誘導終了評価である。患者が初期誘導期間の終わりに臨床応答を達成しない場合、初期誘導用量と区別するために、誘導用量の投与を延長し得るが、これを「延長誘導用量」と呼ぶ。患者が延長誘導期間の終了時に臨床反応を達成した場合、臨床的寛解、内視鏡的寛解、内視鏡的治癒、及び／又は症候性寛解などの臨床反応又は他の所望の治療効果（複数可）を維持するために、少なくとも１回の維持用量の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が投与される。最初の維持用量は、最後の延長誘導用量が患者に投与された４～１２週間後に投与される。４～１２週間の期間は、最後の延長誘導用量の投与と延長誘導終了評価との間の期間の変動に対応する。維持用量（複数可）は、最初の維持用量の投与後、４週間、８週間、又は１２週間間隔（複数可）で投与される。維持用量（複数可）は、皮下注射によって投与され得る。患者が維持期間中に反応の喪失を起こした場合、１回、２回、又は３回の臨時追加用量の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、患者に投与され、最後の臨時追加用量が投与された４～１２週間後に患者が臨床反応を達成した場合、１回以上の更なる維持用量の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、患者に投与され、反応の喪失は、（ａ）排便頻度（ＳＦ）スコア及び直腸出血（ＲＢ）スコアの組合せにおけるベースラインからの２ポイント超の増加、（ｂ）クロストリジウム・ディフィシル試験（Clostridium difficile testing）の陰性の確認を伴う、８日間以上空いた２回の連続した来診時の４超のＳＦスコア及びＲＢスコアの組合せ、並びに（ｃ）２又は３の内視鏡サブスコア（ＥＳ）として定義され、臨床反応は、直腸出血（ＲＢ）サブスコアの１兆の減少又はＲＢサブスコアが０若しくは１のいずれかを有する、９ポイントの改変メイヨースコア（ＭＭＳ）のサブスコアの２ポイント超の減少及びベースラインからの３０～３５％超の減少を達成するものとして、定義される。
本明細書に開示される方法は、患者から３種以上の試料を得ることを、更に含み得る。バイオマーカの発現レベルが変化するか、経時的に変化したままであるか、経時的に維持されるかなどを決定するための試料の分析のために、患者、参照対象、及びプラセボ応答者から、複数の試料を得ることが、特に好適である。
好適な試料としては、全血、血漿、血清、組織生検、糞便試料、及びこれらの組合せが挙げられる。特に好適な組織生検試料としては、結腸組織生検試料又は直腸組織生検試料が挙げられる。結腸組織生検は、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織に由来する。結腸組織生検は、非炎症結腸領域由来又は炎症結腸領域由来であり得る。生検は、潰瘍の縁から得られてもよく、びらんの縁から得られてもよく、罹患した粘膜全体にわたって間隔を空けて得られてもよく、これらの組合せであってもよい。
患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与される実施形態に関して、第１の試料は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与前又は投与と同時に採取され、第２の試料は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される。あるいは、試料は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の約４週間後、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の約１２週間後、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の約５２週間後、及びこれらの組合せで得られてもよい。試料は更に、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の５２週間後に得られ得る。試料は更に、毎日、毎週、毎月、及び毎年を含むその他の間隔で得られ得る。
発現（及び発現レベル）は、マイクロアレイ分析によって決定され得る。発現を決定するためのその他の好適な方法としては、増幅（ポリメラーゼ連鎖反応）、ノーザンブロット法、サザンブロット法、原位置ハイブリッド形成、ウェスタンブロット法を含む免疫学的検定、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、酵素結合蛍光アッセイ（Enzyme-Linked Fluorescence Aassay、ＥＬＦＡ）、免疫沈降、免疫組織化学、及びこれらの組合せが挙げられる。
本明細書に開示される方法は、組織病理学を使用して組織試料を分析することを、更に含み得る。組織試料を処理し、Ｈ＆Ｅ染色、ロマノフスキー染色、更には未染色組織試料を使用して、明視野観察法のために染色し得る。組織試料はまた、検出されるバイオマーカに特異的に結合する抗体を使用して、染色され得る。抗体は、蛍光標識などの標識を含み得るが、組織は、組織試料を紫外線に曝露することによって調査され得る。バイオマーカ抗体は、蛍光標識で直接標識するか、又はバイオマーカ抗体に特異的に結合する蛍光標識された第２の抗体を使用して検出され得る。組織試料を標識して、単一のバイオマーカ又は複数のバイオマーカを検出し得る。組織ｍＲＮＡの細胞内局在を決定するために、空間的トランスクリプトミクスを使用して、組織試料もまた分析し得る。
一態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、潰瘍性大腸炎を治療する方法に関する。本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。特に好適なバイオマーカは、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、及びこれらの組合せのうちの少なくとも１つを含む。一実施形態では、バイオマーカは、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置の後に増加し、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、ＺＧ１６、及びこれらの組合せのうちの１つを含む。一実施形態では、バイオマーカは、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置の後に減少し、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、及びこれらの組合せのうちの１つを含む。
一実施形態では、第１の試料において検出された発現からの第２の試料において検出された発現の変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与が継続されるべきであることを示す。発現の変化は、第１の試料における発現と比較した、第２の（又は後続の）試料における発現の増加であり得る。発現の変化はまた、第１の試料における発現と比較して、第２の（又は後続の）試料における減少であり得る。抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与された患者から得られた試料（複数可）における発現レベルの変化は、健常な対象（潰瘍性大腸炎を有することが疑われないか又は潰瘍性大腸炎を有する対象）から得られた試料（複数可）における発現レベル、及び抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与されていない潰瘍性大腸炎を有するか又は潰瘍性大腸炎を有することが疑われる患者から得られた試料（複数可）における発現レベルのうちの１つと、更に比較され得る。
別の実施形態では、第１の試料において検出された発現レベルからの第２の試料において検出された発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与が中断されるべきであることを示す。発現レベルの変化は、第１の試料における発現レベルと比較した、第２の（又は後続の）試料における発現レベルの増加であり得る。発現レベルの変化はまた、第１の試料における発現レベルと比較した、第２の（又は後続の）試料における減少であり得る。抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与された患者から得られた試料（複数可）における発現レベルの変化は、健常な対象（潰瘍性大腸炎を有することが疑われないか又は潰瘍性大腸炎を有する対象）から得られた試料（複数可）における発現レベル、及び抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与されていない潰瘍性大腸炎を有するか又は潰瘍性大腸炎を有することが疑われる患者から得られた試料（複数可）における発現レベルのうちの１つと、更に比較され得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法に関する。本方法は、患者から試料を得ることと、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）の少なくとも１個のバイオマーカについて分析することと、バイオマーカの分析に基づいて、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として同定することと、を含む。
抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性の好適なバイオマーカとしては、ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２が挙げられる。
本方法は、患者から得られた試料を、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて分析することを、更に含み得る。
本方法は、本明細書に記載されるように、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を患者に投与することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療する方法に関する。本方法は、患者が抗ＴＮＦＲであるか否かを決定することと、患者が抗ＴＮＦＲである場合に、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で処置することと、を含む。
患者から得られた試料を、ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２を含む抗ＴＮＦＲ転写物について分析する。
本方法は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与前及び抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に得られた試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における、潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法に関する。本方法は、患者から第１の試料を得ることと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、試料を分析することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、第２の試料を分析することと、を含む。
潰瘍性大腸炎の症状は、腹痛／腹部不快感、血便、大便中の膿、発熱、体重減少、直腸出血、頻繁な下痢、再発下痢、倦怠感、食欲減退、及びしぶり腹（切迫感）のうちの少なくとも１種を含む。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、潰瘍性大腸炎を診断するための方法に関する。本方法は、（ａ）患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択された少なくとも１個のバイオメーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択された少なくとも１個のバイオマーカの参照発現レベルと、少なくとも１個のバイオマーカの決定された発現レベルと、を比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して増加している場合に、又は患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、潰瘍性大腸炎を診断する方法に関する。本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの参照発現レベルと、少なくとも１個のバイオマーカの決定された発現レベル（複数可）と、を比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して増加している場合に、又はバイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
本方法は、コンピューティングデバイスを使用して、参照バイオマーカとの比較の結果に基づいて、対象における潰瘍性大腸炎を診断するための支援を確立することを、更に含み得る。
本方法は、コンピューティングデバイスを使用して、試料からのバイオマーカの少なくとも１つの決定された量（複数可）を、バイオマーカの少なくとも１つの参照量（複数可）と比較することを、更に含み得るが、本比較は、自動的に実施される。
本方法は、分析装置ユニットを使用して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６の少なくとも１個のバイオマーカへのリガンドの結合を測定することを、更に含み得る。
本方法は、コンピューティングデバイスを使用して、リガンドの測定された結合の量を計算することを、更に含み得る。
本方法は、分析装置ユニットを使用して、リガンドの測定された結合の計算された量に基づいて、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの量を決定することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法に関する。本方法は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、患者から得られた試料を分析することと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、少なくとも１個のバイオマーカにおける発現レベルの変化が検出された場合に、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む。
本方法は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けなかった潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から得られた試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃを含む少なくとも１個のバイオマーカを分析することを更に含み得るが、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後のＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃの少なくとも１個の発現レベルは、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与された患者における、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置前のＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃの少なくとも１個の発現レベルと比較して、増加する。
本方法は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与されていない患者におけるＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃを含む少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルを分析することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与されていない患者における少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルを、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を投与された患者におけるＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃのうちの少なくとも１個の発現レベルと比較することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を投与された患者におけるバイオマーカ発現レベルが、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けていない患者におけるバイオマーカの発現レベルと比較して増加している場合に、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を投与された患者が治癒していると決定することとを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、バイオマーカパネルに関する。バイオマーカパネルは、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカを含む。
一態様では、バイオマーカパネルは、ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃのうちの少なくとも１つを含む。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、排便頻度を治療する方法に関する。本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、表８から選択されるバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、表８から選択されるバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
表８から選択される特に好適なバイオマーカとしては、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢが挙げられる。
本方法は、本明細書に記載されるように、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を患者に投与することを更に含む。
本方法は、組織試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者内の排便頻度を診断するための方法であって、（ａ）患者から得られた試料における、表８から選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）バイオマーカの決定された発現レベルを、表８から選択されるバイオマーカの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、排便頻度の診断を提供することと、を含む方法に関する。
表８から選択される特に好適なバイオマーカとしては、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、クレアチニンキナーゼＢ、及びこれらの組合せが挙げられる。
本方法は、組織試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、腸切迫感を治療する方法に関する。本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、表９から選択されるバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、表９から選択されるバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出されたバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出されたバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
表９から選択するのに特に好適なバイオマーカとしては、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せが挙げられる。
本方法は、本明細書に記載されるように、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を患者に投与することを更に含む。
本方法は、組織試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、腸切迫感を診断する方法に関する。本方法は、（ａ）患者から得られた試料における、表９から選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）バイオマーカの決定された発現レベルを、表９から選択されるバイオマーカの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、腸切迫感の診断を提供することと、を含む。
表９から選択するのに特に好適なバイオマーカとしては、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せが挙げられる。
本方法は、組織試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、排便頻度を診断する方法に関する。本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料における、表８から選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、バイオマーカの決定された発現レベル（複数可）を、表８から選択されるバイオマーカの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
表８から選択される特に好適なバイオマーカとしては、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、クレアチニンキナーゼＢ、及びこれらの組合せが挙げられる。
本方法は、組織試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において、腸切迫感を診断する方法に関する。本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料における、表９から選択されるバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、バイオマーカの決定された発現レベル（複数可）を、表９から選択されるバイオマーカの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、腸切迫感の診断を提供することと、を含む。
表９から選択するのに特に好適なバイオマーカとしては、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、カルパイン１３、及びこれらの組合せが挙げられる。
本方法は、組織試料を分析することを、更に含み得る。
本方法は、修正メイヨースコア（ＭＭＳ）、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）、及びこれらの組合せを含む臨床測定基準を分析することを、更に含み得る。
別の態様では、本開示は、表８から選択される少なくとも１個のバイオマーカを含むバイオマーカパネルに関する。バイオマーカパネルのために選択するのに特に好適なバイオマーカとしては、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢが挙げられる。
別の態様では、本開示は、表９から選択される少なくとも１個のバイオマーカを含むバイオマーカパネルに関する。バイオマーカパネルのために選択するのに特に好適なバイオマーカとしては、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３が挙げられる。
材料及び方法
研究設計及び参加者
１４カ国（オーストラリア、ベルギー、カナダ、チェコ共和国、デンマーク、ジョージア、ハンガリー、日本、リトアニア、モルドバ、オランダ、ポーランド、英国、及び米国）の７５カ所で、多施設での無作為化二重盲検並行群プラセボ対照試験を行った。患者は、２０１６年１月から２０１７年９月まで登録された。
試験は、良好な臨床診療に関する調和国際会議（International Conference on Harmonisation、ＩＣＨ）ガイドラインに準拠した。全てのインフォームドコンセント用紙及びプロトコールは、試験の開始前に好適な倫理審査委員会によって承認された。全ての患者は、試験薬を受ける前に、書面によるインフォームドコンセントを提出した。
手順及び結果
内視鏡所見は、２人の盲検中央リーダーのうちの１人によって、スコア付けされた。ベースライン及び研究第１２週目の内視鏡検査中に得られた２個の生検試料を使用して、中央リーダーによって組織学的疾患活動性を評価した。全ての生検標本を、肛門縁から少なくとも３０ｃｍで採取した。
別個の病変が存在する場合、生検は、潰瘍の縁で優先的に得られた、又は潰瘍が存在しない場合、びらんの縁から得られた。肉眼で見える疾患が存在するが、別個の病変がない場合、罹患した粘膜全体に間隔を置いて生検を得た。肉眼的疾患が存在しない場合、切片全体から生検を得た。
組織病理学
病理組織学的評価のための２個の内視鏡下生検試料を、各内視鏡検査で、肛門縁から少なくとも３０ｃｍの最も罹患した領域から得た。２人の盲検化された病理学者のうちの１人が、Ｇｅｂｏｅｓスコア及びＲｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）を使用して、各試料について組織学的疾患活動性を評価した。Ｇｅｂｏｅｓスコアは、７つのカテゴリ（又はグレード）から構成され、そのそれぞれは、「構造的（構造的変化）」（グレード０）、「慢性炎症性浸潤」（グレード１）、「固有層好酸球」（グレード２Ａ）、「固有層好中球」（グレード２Ｂ）、「上皮中の好中球」（グレード３）、「陰窩破壊」（グレード４）及び「表面上皮損傷」（グレード５）を含む、組織学的項目を記載する。各グレードは、その組織学的特徴について見られる異常の程度を示すサブスコアを含み、０のサブスコアは正常な外観を示し、より高いサブスコアは異常な外観の増加を示す。ＲＨＩは、４つのＧｅｂｏｅｓスコアカテゴリ（「慢性炎症性浸潤」、「固有層好中球」、「上皮中の好中球」及び「表面上皮損傷」）からの重み付けされた結果を使用して、０（疾患活動性なし）から３３（重度の疾患活動性）までの範囲の連続スコアを導出する。ＲＨＩは、初期の薬物開発における治療効果を検出するための応答手段として、開発された。
本実施例のエンドポイントは、内視鏡的改善（０又は１の内視鏡的サブスコア）及び組織学的寛解（粘膜固有層における好中球、上皮における好中球、及びびらん又は潰瘍形成パラメータについての０のＧｅｂｏｅｓ組織学的サブスコアとして定義される）であった。粘膜治癒を、組織学的寛解及び内視鏡的改善の両方の存在によって、決定した。増加した粘膜固有層好酸球を構成するものの定義については合意されておらず、再現性の欠如及び不十分な予測データを考慮すると、好酸球を正常に減少させることは、組織学的寛解の主要な定義に含まれなかった。Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）スコアを、Ｇｅｂｏｅｓスコアと同時に決定した。
ＲＮＡ抽出及び遺伝子アレイ方法論
遺伝子発現を、ＧｅｎｅＣｈｉｐ ＨＴ Ａ２．０アレイ上で、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＷＴプロトコールを使用して、Ｉ６Ｔ－ＭＣ－ＡＭＡＣからの５５３の結腸組織生検において測定した。各時点について同じ対象からの生検を一緒にプールして、合計２７７個の生検ＲＮＡ試料を得た。これらを品質管理（「Quality Control、ＱＣ」）チェックポイント（例えば、ＲＮＡ試料品質／量、及び増幅）に供し、ＨＴＡ２．０処理に進めた。
ＲＮＡ試料調製及び品質管理
結腸組織試料は、時点ごとに対象あたり２本のチューブに入った。トランスクリプトーム解析に十分な質量が利用可能であることを確実にするために、２０人の対象からの結腸生検をプールすることによって、抽出パイロットを実施した。製造業者推奨のプロトコールに従って、ＲＮＡ抽出を実施した。要約すると、抽出されたＲＮＡ ＱＣは、ＢｉｏＡｎａｌｙｚｅｒ（ＢＡ）ＱＣ及び定量化の両方を含んでいた。ＢＡ系のＱＣ測定基準は、２８Ｓ／１８Ｓ比（０．７５～３．０）、ＲＮＡ Ｉｎｔｅｇｒｉｔｙ Ｎｕｍｂｅｒ（ＲＩＮ）スコア（≧６）であった。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）蛍光色素アッセイを使用して、ＲＮＡ濃度を測定した。５ｎｇ／μｌ未満の濃度を有する試料は、その後のプロファイリング工程から除外した。試料を、Ａｇｉｌｅｎｔ２１００バイオアナライザにかけて、ＲＮＡ品質を評価した。全ての試料はアッセイに十分な質量を有しており、ＨＴＡ２処理に進んだ。
ＣＧＬ ＱＣ測定基準に合格したＲＮＡ試料を、９６ウェルプレートに分注した（１００ｎｇのインプット）。２個の試料は、１人の患者の中止後に除去され、第１２週目からの４個の生検は、０週目の生検が収集された後に試験を離れた対象から収集されず、アレイＱＣに合格した２２４の第０週目の時点及び２２０の第１２週目の時点のデータセットを残した。
遺伝子チップアレイ
ＨＴＡ２プラットフォームからのプローブレベルデータを、標準ＲＭＡ法によるバックグラウンド補正及び分位数正規化で前処理し、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＮＥＴＡＦＦＸ（商標）ＮＡ３５／ＧＲＣｈ３７ヒト参照ゲノムリリースによって定義されるプローブセットのレベルに集約した。次に、データを、以下のように、高度に相関したエクソン系のプローブセットのデータ定義クラスタである「エクソン群」のレベルに集約した。プローブセット発現間の相関マトリックスを計算し、プローブセットの対間の距離メトリックを、１から対の相関を引いたものとして定義した。Ｒｈｃｌｕｓｔ関数を使用して、階層的クラスタ形成を実施し、０．８の距離で樹状図を切断することによって、エクソン群を形成した。一旦エクソン群が定義されると、試料について集約された発現を、二元配置ＡＮＯＶＡモデルにおける試料効果から得た。プローブ及び試料の効果を、そのエクソン群内のプローブレベルデータに適用されるＲ ＭＡＳＳパッケージにおけるｒｌｍ関数によって実装されるロバスト回帰を使用して、推定した。
差次的発現統計分析
上記の手順から生成したエクソン群を、２つの基準に従ってフィルタリングした：１）対数（ｌｏｇ）２（発現）のＳＤが０．２８６より小さい（およそ２０％のＣＶに対応する）エクソン群、及び２）対数（ｌｏｇ）２（発現）の平均が陰性対照（正常遺伝子－＞イントロン）プローブセットについての対数（ｌｏｇ）２発現の中央値の７５パーセンタイル未満であったエクソン群。遺伝子が複数のエクソン群を含有した場合、プローブセットの最大数を有する特徴を選択して、遺伝子の発現を全体として表し、最も高い平均発現レベルを有する特徴によって、連結を破壊した。全てのモデルにおいて、Ｂｅｎｊａｍｉｎｉ－Ｈｏｃｈｂｅｒｇ法を使用して、処置群にわたって、並びに全ての試験されたエクソン群にわたって行われた比較の数を説明するために、得られたｐ値に多重度補正を適用した。
混合効果反復測定モデル（Mixed Effect Repeated Measurements Model、ＭＲＭＭ）を、各フィルタリングされたエクソン群に別々に当てはめて、年齢、性別、バッチ、ベースライン時のＢＭＩ、以前の生物学的製剤療法、及びベースライン時の修正メイヨースコア（ＭＭＳ）を共変量として使用して、第０週目と第１２週目の時点の間の倍率変化を計算した。クロスタイムポイントコントラストモデル（Crossed timepoint contrast model）は、投薬処置群における各エクソン群の差次的発現を、プラセボ群におけるその差次的発現と比較した。０．５の対数（ｌｏｇ）２単位を超える倍率変化（約１．４１×変化）及び０．０５未満の偽発見率（False Discovery Rate、ＦＤＲ）調整ｑ値を有するエクソン群を、差次的に発現されたものとして分類した。
相関統計分析
年齢、性別、及びアレイチップバッチを共変量として使用して、エクソン群のクロスタイム差次的発現と、第０週目と第１２週目の間の臨床測定基準の変化と、の間の、ピアソン相関係数を計算した。臨床測定基準としては、ＭＭＳ、総メイヨースコア、メイヨー内視鏡サブスコア、潰瘍性大腸炎内視鏡重症度指数（ＵＣＥＩＳ）総スコア、Ｇｅｂｏｅｓスコア、及びＲｏｂａｒｔｓ組織病理学指数（ＲＨＩ）が挙げられる。含まれる検査結果は、糞便カルプロテクチン並びにＩＬ－１７Ａ、ＩＬ－２２、及びＣＲＰの末梢血力価であった。
本研究は、ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ、番号ＮＣＴ０２５８９６６５に登録された。
結果
患者、研究の概要及び生物学的試料
２０１５年１２月から２０１７年９月の間に、３５８人の患者を適格性についてスクリーニングし、２４９人を無作為化した。これらのうち、２２４人の患者がベースライン生検を受け、２２０人が第１２週目の生検を受けた。これらの２２０人の患者のうち、６３％超が以前に生物学的製剤による治療を受けており、４７．３％がベースラインでコルチコステロイドを使用していた。ベースライン疾患特徴は、治療群にわたって良好にバランスがとれており、治療群間で同様の疾患活動性（修正メイヨースコア）、粘膜炎症（メイヨー内視鏡検査サブスコア）、及び組織学（Ｇｅｂｏｅｓ指数及びＲＨＩ）であった（表１）。
Figure 2024521748000005
潰瘍性大腸炎における転写物のミリキズマブ媒介変化
２００ｍｇのミリキズマブ処置群は、３つ全ての処置群のプラセボと比較して、第１２週目に最大の効力を示したことに加えて、ベースラインと第１２週目との間で差次的に発現された結腸生検遺伝子の数もまた、最も多かった（図１Ａ）。ミリキズマブ処置の効果を標準治療の効果からよりよく識別するために、遺伝子発現の変化を、プラセボに対する標準化なし（図１Ｂ）及びあり（図１Ｃ）の両方の２００ｍｇのミリキズマブ群において、ベースラインと第１２週目との間で評価した。プラセボに対する正規化は、差次的に調節される転写物の数の減少において、より高い信頼度を提供した。
プラセボ群における変化について正規化した後の、第１２週目に最大の変化を有する転写物を表２に示す。発現の最も有意な増加は、ＡＱＰ８、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＳＬＣ２６Ａ３、及びＧＵＣＡ２Ａを含む、健康な結腸粘膜において見出される上皮細胞において一般的である、タンパク質をコードする遺伝子について見られ、上皮内層及びバリア完全性の回復を反映し得る。これらの強く上方制御された転写物は、健康な結腸粘膜に見られる構造成分及び重要な機能タンパク質の両方を表し、これらの患者における機能への復帰の、いくつかの証拠を提供する場合がある。最も上方制御された転写物はＡＱＰ８（アクアポリン－８）であり、これは、糞便内容物からの水の回収を媒介する、結腸先端表面における重要な水輸送体をコードするが、これは、水様性で頻繁な下痢を経験する患者に、有益な効果をもたらす場合がある。同様に、ＡＢＣＧ２などの排出輸送体は、ＵＣにおいて減少し、正常化される場合に、ＵＣ患者において改善された粘膜機能を提供する。逆に、発現の最大の減少は、組織再構築（ＭＭＰ３、ＭＭＰ１０）、酸化ストレス（ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＮＯＳ２）、及び走化性（ＣＸＣＬ１、ＣＸＣＬ２、ＣＸＣＬ３）におけるそれらの機能によってＩＢＤ活性と関連付けられている遺伝子において、観察される。
ＩＬ－２３経路転写物と疾患活性スコアとの間の相関
ＩＬ－２３受容体活性化によって上方制御される遺伝子の発現レベルの変化は、ＭＥＴＡＣＯＲＥ（商標）（クラリヴェイト社製、ペンシルバニア州、米国）によって定義され、第１２週目の疾患活動性の測定基準ＭＭＳ、ＵＣＥＩＳ、及びＲＨＩの変化と相関した（図２Ａ）。最も高度に相関する遺伝子としては、ＴＧＦＢ１、ＩＬ１Ｂ、及びＩＬ６が挙げられる。これらのうち、ＩＬ１Ｂはまた、プラセボ調整された２００ｍｇのミリキズマブ群において、ベースラインと第１２週目との間で発現が最も減少した遺伝子の１つである。ＩＬ－２３／ＩＬ－２３Ｒ関与によって上方制御され、疾患活動性測定基準の変化と有意に相関する全ての遺伝子は、正の相関を有し、遺伝子発現変化の程度は改善された疾患活動性測定基準と相関するが、ＦＤＲ≦０．０５の有意閾値を通過しなかったＩＬ２２を除く。図２Ｂは、ベースラインと第１２週との間の各遺伝子のプラセボ調整差次的発現のピアソン相関係数（Ｒｈｏ）のヒートマップを示し、修正メイヨースコア、ＲＨＩ、及びＵＣＥＩＳの同じ期間にわたる変化を、これらの遺伝子の倍率変化によって、垂直に分類する。ミリキズマブ調節遺伝子は、内視鏡検査（ＵＣＥＩＳ）よりも組織病理学の疾患指標（ＭＭＳ、ＲＨＩ）とより強く相関しており、これは、これらの転写物のより微妙な見解を提供する場合がある。本発明者らは、ＩＬ１Ｂが疾患活動性との高い相関及びその他の遺伝子と比較して高い差次的発現の両方を有することを、見出した。
ミリキズマブによって変化した転写物と疾患活動性スコアとの間の相関
個々の転写物の変化は、ＭＭＳ、Ｇｅｂｏｅｓ又はＲＨＩによって定義される疾患活動性の変化と相関した。ミリキズマブ処置誘導性調節における最も強い変化（表２）を反映するいくつかの転写物は、疾患活動性における変化と同一であり、病気と正に相関する全ての転写物は、ミリキズマブによって、均一かつ一貫して下方制御される。対照的に、病気と負に関連する全ての転写物は、ミリキズマブ処理で上方制御される。これは、ミリキズマブ調節された転写物の変化が疾患の減衰のプロフィールを示し、治療の開始後第１２週という早い時期に、分子治癒の予備的証拠を示唆するという観察と、一致する。
疾患スコアにおける変化と最も高度に相関した上位ミリキズマブ調節遺伝子の経路解析
図３において同定された転写物の最も高度に調節されたもの（ｒ値の厳密なカットオフが±０．４より大きい）を、更に分析した。選択された２個の疾患指数はＲＨＩ及びＭＭＳであるが、これらは、これらの相関について最も高い－対数（ｌｏｇ）１０ｑ値を提供した。図４及び表２に示すように、これらの転写物は、疾患活動性の変化とともに変化し、細胞接着及び細胞外マトリックス（extracellular matrix、ＥＣＭ）再構築を含む共通の経路への見通しを提供し、その後、線維化促進性経路及び組織修復に見られる特徴が続いた。
遺伝子発現におけるミリキズマブ誘導性変化と全身性バイオマーカとの相関
Ｌ－１β、ＩＬ－６、Ｓ１００Ａ８及びＳ１００Ａ９の転写物と、全身性バイオマーカＩＬ－１７、ＩＬ－２２、Ｃ反応性タンパク質（C-Reactive Protein、ＣＲＰ）及び糞便カルプロテクチン（fecal calprotectin、ｆＣＬＰ）と、の相関関係を、決定した（表２）。Ｓ１００Ａ８／９、ＩＬ－１β、及びＩＬ－６の結腸発現の変化は、ｆＣＬＰ並びに血清ＩＬ－１７Ａのレベルと強く相関し、血清ＣＲＰレベルとはそれほど強くはないが、依然として有意に相関した。ＩＬ－２２の循環レベルは、Ｓ１００Ａ９及びＩＬ－１βの変化と有意に相関したが、Ｓ１００Ａ８又はＩＬ－６とは相関しなかった。これらの相関は、ｆＣＡＬ、ＩＬ－１β及びＩＬ－６などの利用可能なバイオマーカが、これらのタンパク質をコードする転写物のいくつかの変化と相関し、結腸粘膜におけるｐ１９の関与を反映することを示した。
Figure 2024521748000006
ミリキズマブ調節コアＴＮＦ抵抗性転写物
Ｓｍｉｌｉｅらは、炎症関連線維芽細胞、単核細胞、及び樹状細胞が、抗ＴＮＦα療法に対する６０人の応答者及び５７人の非応答者からのバルク発現データのメタ分析を使用して同定された薬物耐性シグネチャの一部である遺伝子の高い相対的発現を示したことを、報告した。薬物耐性表現型とは対照的に、結腸組織における抗ＴＮＦα感受性遺伝子は、上皮細胞において最も濃縮されていた。図５Ａは、ＴＮＦＲの重要な動因を反映するメタ分析に含まれる、転写物を示す。ＴＮＦ感受性クラスタにおいてミリキズマブによって調節された転写物の数（図５Ｂ）は、ＴＮＦＲクラスタにおいて見られたものより少なかった（図５Ａ）。この結果は、ＴＮＦαを標的とする抗体と比較して、ｐ１９－ＩＬ２３タンパク質を標的とするミリキズマブについての異なる作用機序と一致する。ミリキズマブは、ＴＮＦＲ転写物クラスタにおいて優勢である遺伝子を調節した。まとめると、これらの結果は、ミリキズマブ処置が、ＴＮＦＲに関連する転写物を減少させるように働き得、そしてＴＮＦＲ患者において見られるものとは異なる結腸組織における表現型を提供する場合があることを示した。
転写物発現レベルの強い変化が、２００ｍｇのミリキズマブ群で観察された。これらの変化は、ミリキズマブ処理によって誘発される変化へのウィンドウを提供する。ミリキズマブによって上方制御された遺伝子は、健康な粘膜に向かう傾向を示し、上位に制御された転写物は、バリア統合性の改善を表し、それらは、大腸において機能的輸送体を提供する。例えば、水輸送体であるアクアポリン８の増加は、糞便中の含水量を制限する場合がある。陰イオン輸送体ＳＬＣ２６Ａ２及びＳＬＣ１６Ａ９の増加は、ミリキズマブ処置が、処置の開始後第１２週目という早期に機能的輸送体を保持することが可能な粘膜をもたらす場合があることを、再確認する。ＲＥＧ１Ａ及びＲＥＧ１Ｂなどの、ミリキズマブによって最も確実に下方制御される遺伝子のいくつかは、ＵＣ粘膜生検において行われた以前の研究において、ＵＣにおいて増加することが示されている。
結腸粘膜由来のカルプロテクチンタンパク質に寄与するＳ１００Ａ８及びＡ９転写物における変化が、関連する。ミリキズマブ処置が、ｆＣＬＰの用量依存的変化をもたらすことが、以前に報告されている。これらの変化は、結腸粘膜に由来するカルプロテクチン転写物の減少の結果である場合がある。この知見と一致して、統計的に有意な相関が、Ｓ１００Ａ８及びＳ１００Ａ９転写物がミリキズマブ処置で大腸において下方制御された患者におけるｆＣＬＰのレベルの減少とともに、観察された。最も高度にミリキズマブ調節される遺伝子は、炎症シグナル（ＩＬ１β、ＣＸＣＬ１、ＣＸＣＬ２、及びＣＸＣＬ３）の減少、結腸粘膜のマトリックス破壊を媒介する転写物（マトリックスメタロプロテアーゼ１０及び３）の減弱、並びに陰イオン及び水輸送体の増加を反映する。これらの分子変化は、粘膜治癒の開始を示す。
ＩＬ２３経路は、ＵＣの遺伝的素因に関与しており、ＩＬ２３Ｒ遺伝子（ｒｓ１０４８９６２９を除く）における１０個の多型とＵＣリスクとの関連のメタ分析によって、確認されている。疾患活性と相関する転写物の変化に重ね合わせたＩＬ２３調節転写物の分析は、ＩＬ２３経路遺伝子の一貫した下方制御を示した。ＵＣ患者の分析は、炎症関連線維芽細胞、単核細胞及び組織常在性抗原提示細胞が、抗ＴＮＦ療法からの一次的不全及び二次的不全を示す患者からの生検試料において濃縮される遺伝子の高い相対的発現を示すことを、実証した。対照的に、結腸組織における抗ＴＮＦα感受性遺伝子は、上皮細胞に由来した。このようなＴＮＦＲ結腸粘膜において濃縮された転写物のメタ分析において、ミリキズマブによって調節されるとして表２に示される、いくつかの転写物が現れた。これらの転写物は、以前の研究によって同定された細胞型において、潜在的に提示される。重要なのは、ミリキズマブによって下方制御されたＯＳＭＲ発現の変化である。ＯＳＭは、結腸粘膜がＴＮＦＲを獲得するので、分岐の潜在的な代替疾患経路を表すことが以前に仮定されている。抗ＴＮＦ応答性患者と比較して、ＴＮＦＲＵＣ患者の粘膜において有意に増加した発現を示す遺伝子であるＯＳＭは、炎症関連単核細胞及び抗原提示細胞において濃縮されたが、その受容体ＯＳＭＲは、炎症関連線維芽細胞において濃縮された。ミリキズマブがミリキズマブ処置の１２週間以内に結腸粘膜においてＯＳＭＲを下方制御したという知見は、ＴＮＦＲ患者において見られるこの経路の活性化の抑制を示すが、これは、このような患者についてより良好な結果をもたらす場合がある。更に、ＯＳＭ活性に関連する多くの遺伝子は、ミリキズマブによって調節されている。
ミリキズマブ処置の１２週間以内に観察された変化は、ベドリズマブ（vedolizumab、ＶＤＺ）処置後に観察されたものとは異なっていた。しかしながら、トランスクリプトーム変化のベドリズマブ分析は、それらのプラセボ群に対する変化に対して正規化されず、より厳密な方法を提供すると考えられる。これは、ｑ＝０．０５閾値のエッジに関連するいくつかの転写物変化をもたらした可能性がある。したがって、プラセボ調整された２００ｍｇのミリキズマブ群において観察された遺伝子発現の変化は、自発的な粘膜治癒に関連するのではなく、ミリキズマブ治療に関連することがより確実である。対照群に対してＶＤＺによって改変された上位１０個の転写物と、実施例において同定された上位１０個の転写物との間にはほとんど共通していなかったが、これはおそらく、ＶＤＺについての比較が、ＶＤＺ試験に登録された罹患ベースライン患者ではなく、健常対照に対するものであったためである。注目すべきことに、第０週目と比較した第１２週目での発現の変化は、中程度であるようであった。ＶＤＺによる処置後第５２週目における発現の変化は、ミリキズマブによる第１２週目の変化といくらかの重複を示した。ミリキズマブによって誘導された変化の大部分は、Ｔｈ１７経路に由来するシグナル伝達経路内に集中していたが、ＶＤＺによる変化は化学走性に由来しており、α４β７インテグリンを標的とするＶＤＺの作用機序及び得られる化学走性シグナルと一致していた。
実施例２
方法：
第１２週目に臨床応答（９ポイントのメイヨーサブスコア［直腸出血、排便頻度、内視鏡検査］がベースライン［ＢＬ］から≧２ポイント及び≧３５％減少し、ＲＢサブスコアの減少が≧１又はＲＢサブスコアが０若しくは１のいずれか）を達成したミリキズマブ処置患者を、第５２週目まで４週ごと又は１２週ごとに、皮下投与したミリキズマブ２００ｍｇに再無作為化した。臨床応答を達成した誘発においてプラセボ（ＰＢＯ）を与えられた患者は、維持期間においてＰＢＯで継続した。結腸生検を、肛門縁から少なくとも３０ｃｍの最も罹患した領域（ミリキズマブＮ＝３１、ＰＢＯ Ｎ＝７）から、第０週目、第１２週目、及び第５２週目に得た。Ｂａｙｅｓｉａｎ Ｌｉｍｍａ Ｒパッケージを使用して、ＰＢＯ及びミリキズマブアームにおけるベースラインからの第１２週目の転写物変化を、差次的に発現された遺伝子（Differentially Expressed Genes、ＤＥＧ）にクラスタ化した。これらのＤＥＧの中で、同様に発現された遺伝子（Similarly Eexpressed Genes、ＳＥＧ）を、それらの第１２週目の発現レベルを第５２週目まで維持したものとして同定した。
結果：
疾患寛解を維持した第１２週目の応答者における第５２週目での転写物変化の分析により、応答者におけるＤＥＧ－ＳＥＧのプロファイルが同定された（図６参照）。ベースラインで上方制御された遺伝子の１つのクラスタは、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、及びＴＣＮ１を含んだ。ベースラインで上方制御された遺伝子の第２のクラスタは、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、及びＣ４ＢＰＡを含んだ。下方制御された遺伝子のクラスタは、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃを含んでいた。これらの遺伝子のうち、６３（７０．８％）はミリキズマブ反応者にのみ存在し、５（５．６％）はＰＢＯ反応者にのみ存在し、２１（２３．６％）は両群に存在した（図７参照）。転写物変化の大きさは、ＰＢＯ応答者と比較してミリキズマブ応答者の群において、第１２週目でより大きく、第５２週目までより一貫していた。図８の表は、上位１０個のミリキズマブ特異的ＤＥＧ－ＳＥＧ遺伝子を示す。疾患活動性指数と相関するＤＥＧ－ＳＥＧの別のクラスタ（Ｒｏｂａｒｔｓ組織病理学指数［ＲＨＩ］、及び修正メイヨー、両方とも、ｒ＞０．５）は、ミリキズマブ処置患者では持続することが示されたが、プラセボ患者では持続しなかった。ミリキズマブ処置後第１２週目に、ベースラインで上方制御された遺伝子の２つのクラスタは下方制御されたものに変化し、ベースラインで下方制御された遺伝子のクラスタは上方制御されたものに変化した。図９Ａに示すように、遺伝子のクラスタは、第１２週目から第５２週目まで変化したままであった。第１２週目から第５２週目にかけて、発現は、下向きの傾向にあった（図９の矢印方向を参照のこと）。プラセボ患者応答者（「ＰＢＯ」、ミリキズマブ処置の非存在下で自発的改善を示した患者）において、ベースラインで上方制御された遺伝子の２つのクラスタは下方制御されたものに変化した（図９Ｃ）が、ベースラインで下方制御された遺伝子のクラスタは変化しないままであった。図９Ｄに示されるように、ＰＢＯにおけるバイオマーカの変化は一定のままであった（水平方向の矢印によって示される）。図１０Ａ～図１０Ｄに示されるように、ミリキズマブ応答性遺伝子のクラスタは、疾患活動性指標（ＲＨＩ及びメイヨー）と相関した。これらの結果は、ミリキズマブ処理が、ベースラインにおける上方制御された遺伝子の２つのクラスタの発現を下方制御された状態に変化させ、ベースラインにおける下方制御された遺伝子のクラスタの発現を上方制御された状態に変化させたことを実証する。プラセボ応答者において観察された第１の遺伝子クラスタ及び第２の遺伝子クラスタにおける変化は、プラセボ群によってなされた生活様式の変化に対する、これらの遺伝子クラスタの応答を反映している可能性が高い。上記のように、２つのクラスタは、炎症に関与するマーカを含む。ミリキズマブ群において、ベースラインで下方制御された遺伝子のクラスタは、上方制御されるように変化した。重要なことに、プラセボ群では、ベースラインで下方制御された遺伝子のクラスタは下方制御されたままであった。ミリキズマブ処置後第５２週目に、ベースラインで上方制御された遺伝子の２つのクラスタは下方制御されたままであり、ベースラインで下方制御された遺伝子のクラスタは上方制御されたままであった。これらの結果は、誘導の間にミリキズマブによって誘導された遺伝子発現の変化が、５２週間（データ収集のエンドポイント）までの時間にわたって維持されたことを実証する。これらの結果はまた、ミリキズマブ処置された応答者が、ＰＢＯ応答者群における転写物とは倍率変化及び有意性の両方において定量的に異なる、示差的に発現された転写物を有することを実証する。
第１２週目のＰＢＯ及びミリキズマブ応答者のこの試料において、ミリキズマブ応答者は、ＰＢＯ応答者と比較して、第５２週目でより広く、より大きく、より持続的な大きさの変化を示した。転写物の定性的な説明は、ＰＢＯ応答者において生じた自然治癒と比較して、ミリキズマブ処置に関連する明確な分子治癒経路を示した。疾患活動性指標と相関する転写物のクラスタが同定され、潰瘍性大腸炎におけるミリキズマブ媒介治癒の分子指標、内視鏡指標及び臨床指標にわたって一貫性を示した。最も上方制御されたタンパク質は、上皮起源を示す水及びイオン輸送に関連していた。
実施例３
本実施例では、中等度から重度の活動性ＵＣ（ＮＣＴ０２５８９６６５）を有する患者の第２段階試験の、１２週間の誘導期間中の結腸粘膜遺伝子の発現及び疾患活動性を反映する症状である排便頻度（ＳＦ）を調べた。結腸輸送体転写物のミリキズマブ誘導性上方制御は、中等度から重度の潰瘍性大腸炎を有する患者の第２段階試験において、排便頻度を改善した。
方法：
患者を１：１：１：１に無作為化して、静脈内プラセボ、曝露に基づく用量増加の可能性を有する５０ｍｇ若しくは２００ｍｇのミリキズマブ、又は６００ｍｇの固定ミリキズマブを、１２週間にわたって、４週間ごとに投与した。ＳＦは、患者によって毎日報告され、彼らの正常又は健康なベースライン（ＢＬ）を上回る増加したＳＦを表す４レベルの順位尺度［０～３］に変換された（ＳＦ頻度順位尺度：０＝対象についての正常な排便頻度、１＝正常時よりも１～２回排便が多い、２＝正常時よりも３～４回排便が多い、３＝正常時よりも５回以上排便が多い）。患者の結腸生検（ＰＢＯ Ｎ＝５８、５０ｍｇのミリキズマブＮ＝５２、２００ｍｇのミリキズマブＮ＝５１、６００ｍｇのミリキズマブＮ＝５４）を、ＢＬ及び第１２週目に採取し、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＴＡ２．０マイクロアレイワークフローを使用して、遺伝子発現を測定した。ＢＬ及び第１２週目の遺伝子発現又はＳＦ値をプールし、非パラメータ性のケンダルのタウ（τ）に基づいて、関連を同定した。関連遺伝子の経路分析（ホールマーク及びリアクトーム）を、過剰提示分析を使用して実施した。濃縮のｐ値を超幾何分布検定によって決定し、Ｂｅｎｊａｍｉｎｉ－Ｈｏｃｈｂｅｒｇ手法による多重検定のために、調整した。２００ｍｇの処置群からのデータを使用して、ＢＬ及び第１２週目での発現レベルを比較する対応ｔ検定によって、ミリキズマブ処置後の差次的遺伝子発現を決定した。より高い発現がより高いＳＦをもたらす場合、遺伝子発現に対する「正の」相関を考慮した。
合計２６７個の遺伝子が、ＳＦ（タウ（τ）＞０．３及びｑｖａｌ＜０．００１、表８を参照のこと）と相関していた。これらのうち、２１２個は正に関連し（高発現は高ＳＦに関連する）、５５個は負に関連した（高発現は低ＳＦに関連する）。ＳＦと正に関連した２１２個の転写物は、ミリキズマブ処理で均一かつ一貫して下方制御されたが、ＳＦと負に関連した５５個の転写物は、ミリキズマブ処理で一貫して上方制御された（表３、図１７もまた参照のこと）。ＳＦに関連するミリキズマブ応答性転写物に有意に関連する生物学的経路としては、炎症応答、細胞外マトリックス調節不全、好中球消失及びサイトカインシグナル伝達経路、特にＴＮＦ及びＩＬ６経路が挙げられた（表４）。
Figure 2024521748000007
Figure 2024521748000008
ＳＦに関連する上位２０個の遺伝子を、表５に列挙する。図１３は、ＳＦに関連する上位２０個の遺伝子についてのタウ（τ）分布を示す。図１４は、ＭＭＳ－ＳＦスコアに対する、Ｓ１００Ａ８、ＭＭＰ３、ＡＱＰ９、及びＣＤＨＲ１の発現を示す。
Figure 2024521748000009
本実施例は、臨床疾患活動性尺度である排便頻度に関連する大腸系の転写物を同定し、ミリキズマブによる処置が、ＳＦの正常化に関連する遺伝子を上方制御し、ＵＣ患者の大腸組織試料における炎症に関連する遺伝子を下方制御することを実証した。
実施例４
本実施例では、大腸組織転写物と、ベースライン（ＢＬ）及び第１２週目（Ｗ）における患者報告の腸切迫感（ＢＵ）との間の関連を調査し、ＢＵに関連する遺伝子に対するミリキズマブ誘導処置の効果を評価した。
患者を１：１：１：１に無作為化して、静脈内プラセボ（Ｎ＝６３）、曝露に基づく用量増加の可能性を有する５０ｍｇ（Ｎ＝６３）若しくは２００ｍｇ（Ｎ＝６２）のミリキズマブ、又は６００ｍｇ（Ｎ＝６１）の固定ミリキズマブを、１２週間にわたって、４週間ごとに投与した。患者の結腸生検を、ＢＬ及び第１２週目に収集した（プラセボＮ＝５８、５０ｍｇのｍｉｒｉ Ｎ＝５２、２００ｍｇのＮ＝５１、６００ｍｇのＮ＝５４）。Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＴＡ２．０マイクロアレイワークフローを使用して、遺伝子発現を測定した。差次的遺伝子発現を、第１２週目及びＢＬにおける発現値を比較する対応Ｔ検定によって決定した。ＢＵは、患者によって、はい／いいえとして毎日報告された。ＢＬ及び第１２週目でのＢＵの日数の割合を、来院前の３日間について、４段階の順位尺度で計算した（０＝過去３日間の全てで、緊急性がない、３＝過去３日間の全てで、緊急性が存在する）。ＢＬ及び第１２週目の遺伝子発現及びＢＵ値をプールし、非パラメータ性のケンダルのタウ（τ）に基づいて、関連を同定した。相関遺伝子の経路分析を、ＭＳｉｇＤＢからのホールマーク及びリアクトーム遺伝子セットに対する過剰提示分析を使用して実施した。濃縮のｐ値を、超幾何分布検定によって決定し、Ｂｅｎｊａｍｉｎｉ－Ｈｏｃｈｂｅｒｇ（ＢＨ）手法による多重検定のために、調整した。より高い発現がより多くのＢＵをもたらす場合、遺伝子発現に対する「正の」相関を考慮した。
合計２４９人の患者が、ＢＬ及び第１２週目に、ＢＵスコアを報告した。ＢＵの存在は、３２０個の遺伝子（タウ（τ）＞０．２２５及びｑｖａｌ＜０．００１）と関連していた。経路分析により、ＢＵと有意に関連する経路が同定された（表６）。３２０個の相関した転写物のうち、２９６個はＢＵの頻度と正に関連し（より高い遺伝子発現）、２４は負に関連した（より低い遺伝子発現）（図１７を参照のこと）。ミリキズマブ（２００ｍｇ）による処理は、ＢＵと正に関連する２９６個の転写物の統計的に有意な減少、及びＢＵと負に相関する２４個の転写物の増加をもたらした。
Figure 2024521748000010
ＢＵに関連する上位２０個の遺伝子を、表７に列挙する。
図１５は、ＳＦに関連する上位２０個の遺伝子についてのタウ（τ）分布を示す。
図１６は、ＭＭＳ－ＳＦスコアに対する、Ｓ１００Ａ８、ＭＭＰ３、ＡＱＰ９、及びＣＤＨＲ１の発現を示す。
Figure 2024521748000011
本実施例は、腸の切迫性と相関し、ミリキズマブによって一貫して調節される粘膜炎及び治癒に関連する大腸系の転写物を同定した。
Figure 2024521748000012
Figure 2024521748000013
Figure 2024521748000014
Figure 2024521748000015
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Figure 2024521748000019
Figure 2024521748000020
Figure 2024521748000021
Figure 2024521748000022
実施例において提供される結果は、疾患の活性と相関するミリキズマブ処理後の転写変化の明確なパターンを実証した。ミリキズマブによって媒介される変化は、ＴＮＦＲ粘膜において濃縮される転写物を含み、このような患者におけるこのｐ１９媒介経路においてミリキズマブを使用して介入する機会を提供した。ミリキズマブによって媒介される変化は第１２週目で強く、潰瘍性大腸炎を有する患者において第５２週目まで維持された。抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与は、排便頻度及び腸切迫感の両方に関連する遺伝子を正常化した。
上記を考慮すると、本開示のいくつかの利点が達成され、その他の有利な結果が得られることが分かるであろう。本開示の範囲から逸脱することなく、上記の方法において様々な変更を行い得るので、上記の説明に含まれ、添付の図面に示される全ての事項は、例示的なものとして解釈されるべきであり、限定的な意味で解釈されるべきではないことが意図される。
本開示又はその様々なバージョン、実施形態若しくは態様の要素を導入する場合、冠詞「ａ」、「ａｎ」、「ｔｈｅ」及び「ｓａｉｄ」は、１つ以上の要素が存在することを意味することが意図されている。「備える（comprising）」、「含む（including）」及び「有する（having）」という用語は、包括的であることが意図されており、列挙された要素以外の追加の要素が存在し得ることを意味する。
番号付けされた実施形態
１．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
２．別の態様では、本開示は、潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法に関し、本方法は、患者から試料を得ることと、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）の少なくとも１個のバイオマーカについて分析することと、バイオマーカの分析に基づいて、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として同定することと、を含む。
３．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、抗ＴＮＦ処置に対する耐性を有するか有することが疑われる患者を、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で処置する方法であって、本方法は、患者がＴＮＦＲであるか否かを決定することと、患者がＴＮＦＲである場合に、患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で処置することと、を含む。
４．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、本方法は、患者から第１の試料を得ることと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、試料を分析することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される少なくとも１個のバイオマーカについて、第２の試料を分析することと、を含む。
５．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、本方法は、（ａ）患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択された少なくとも１個のバイオメーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択された少なくとも１個のバイオマーカの参照発現レベルと、少なくとも１個のバイオマーカの決定された発現レベルと、を比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して増加している場合に、又は患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
６．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断する方法であって、本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカの参照発現レベルと、少なくとも１個のバイオマーカの決定された発現レベル（複数可）と、を比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して増加している場合に、又はバイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む。
７．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法であって、本方法は、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、患者から得られた試料を分析することと、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカについて、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、少なくとも１個のバイオマーカにおける発現レベルの変化が検出された場合に、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む。
８．ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６を含む少なくとも１個のバイオマーカを含む、バイオマーカパネル。
９．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、表８から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、表８から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
１０．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者内の排便頻度を診断するための方法であって、本方法は、（ａ）患者から得られた試料における、表８から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せの発現レベルを決定することと、（ｂ）バイオマーカの決定された発現レベルを、表８から選択されるバイオマーカの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
１１．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、本方法は、患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、表９及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカを検出することと、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、患者に投与することと、患者から第２の試料を得ることと、第２の試料を分析して、表９及びこれらの組合せから選択されるバイオマーカを検出することと、を含み、第１の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルからの、第２の試料において検出された少なくとも１個のバイオマーカの発現レベルの変化は、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す。
１２．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を診断する方法であって、本方法は、（ａ）表９から選択されるバイオマーカ及びその組合せの発現レベルを決定することと、（ｂ）バイオマーカの決定された発現レベルを、表９から選択されるバイオマーカ及びその組合せの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）患者におけるバイオマーカ発現レベルが参照発現レベルと比較して変化している場合に、腸切迫感の診断を提供することと、を含む。
１３．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を診断する方法であって、本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料における、表８から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、バイオマーカの決定された発現レベル（複数可）を、表８から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、排便頻度の診断を提供することと、を含む。
１４．潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を診断する方法であって、本方法は、（ａ）分析装置ユニットを使用して、患者から得られた試料における、表９から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せの発現レベルを決定することと、（ｂ）コンピューティングデバイスを使用して、バイオマーカの決定された発現レベル（複数可）を、表９から選択されるバイオマーカ及びこれらの組合せの参照発現レベルと比較することと、（ｃ）バイオマーカ発現レベルが、参照発現レベルと比較して変化している場合に、腸切迫感の診断を提供することと、を含む。
１５．表８から選択される少なくとも１個のバイオマーカを含む、バイオマーカパネル。
１６．表９から選択される少なくとも１個のバイオマーカを含む、バイオマーカパネル。

Claims (265)

  1. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、
    前記患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    前記患者から第２の試料を得ることと、前記第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  2. 請求項１に記載の、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、
    前記患者から第１の試料を得ることと、前記第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    前記患者から第２の試料を得ることと、前記第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  3. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  4. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  5. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  6. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  7. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  8. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  9. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  10. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  11. 請求項１又は請求項２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  12. 前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現からの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現の変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与が継続されるべきであることを示す、請求項１～１１のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  13. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が増加し、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６である、請求項１２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  14. １つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後に減少し、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１及びＰＴＧＳ２である、請求項１２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  15. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、請求項１～１４のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  16. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、請求項１５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  17. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、請求項１５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  18. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、請求項１５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  19. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の発現レベルに対して正規化される、請求項１５～１８のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  20. 前記試料が、結腸組織生検由来又は直腸組織生検由来である、請求項１～１９のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  21. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである、請求項２０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  22. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項２０又は請求項２１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  23. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、請求項２０又は請求項２１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  24. 前記第１の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前に又はそれと同時に採取され、前記第２の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の前記最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される、請求項１～２３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  25. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ又はブラジクマブである、請求項１～２４のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  26. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブである、請求項２５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  27. 請求項２６に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む、方法。
  28. 前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される、請求項２７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  29. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、４週間間隔で投与される、請求項２７又は請求項２８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  30. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、１２週間間隔で投与される、請求項２７又は請求項２８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  31. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、グセルクマブである、請求項２５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  32. 請求項３１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む、方法。
  33. 各誘導用量が、２００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項３２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  34. 各誘導用量が、４００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項３２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  35. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項２５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  36. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、チルドラキズマブである、請求項２５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  37. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ブラジクマブである、請求項２５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を治療する方法。
  38. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、
    前記患者から第１の試料を得ることと、第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    前記患者から第２の試料を得ることと、前記第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  39. 前記症状が、腹痛／腹部不快感、血便、大便中の膿、発熱、体重減少、直腸出血、頻繁な下痢、再発下痢、倦怠感、食欲減退、及びしぶり腹（切迫感）のうちの１つ以上である、請求項３８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  40. 請求項３８又は請求項３９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、
    前記患者から第１の試料を得ることと、前記第１の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    前記患者から第２の試料を得ることと、前記第２の試料を分析して、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  41. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は同時に、及び前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  42. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  43. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  44. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  45. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は同時に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  46. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  47. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  48. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は同時に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  49. 請求項３８～４０のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前又は後に、請求項３８又は請求項４０に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  50. 前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現からの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現の変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与が継続されるべきであることを示す、請求項３８～４９のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  51. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が増加し、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６である、請求項５０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  52. １つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後に減少し、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１及びＰＴＧＳ２である、請求項５０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  53. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、請求項３８～５２のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  54. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、請求項５３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  55. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、請求項５３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  56. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、請求項５３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  57. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の前記発現レベルに対して正規化される、請求項５３～５６のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  58. 前記試料が、結腸組織生検由来又は直腸組織生検由来である、請求項３８～５７のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  59. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである、請求項５８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  60. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項５９又は請求項６０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  61. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、請求項５９又は請求項６０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  62. 前記第１の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前に又はそれと同時に採取され、前記第２の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の前記最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される、請求項３８～６１のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  63. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ又はブラジクマブである、請求項３８～６２のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  64. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブである、請求項６３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  65. 請求項６４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む、方法。
  66. 前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される、請求項６５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  67. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、４週間間隔で投与される、請求項６５又は請求項６６に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  68. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、１２週間間隔で投与される、請求項６５又は請求項６６に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  69. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、グセルクマブである、請求項６３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  70. 請求項６９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む、方法。
  71. 各誘導用量が、２００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項７０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  72. 各誘導用量が、４００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項７０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  73. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項６３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  74. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項６３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  75. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ブラジクマブである、請求項６３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎に関連する症状を治療する方法。
  76. 潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法であって、
    前記患者から試料を得ることと、
    ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、前記試料を分析することと、
    前記遺伝子転写物バイオマーカの前記分析に基づいて、前記患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として同定することと、を含む、方法。
  77. 請求項７６に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法であって、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、前記患者から得られた前記試料又は別の試料を分析することを更に含む、方法。
  78. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、請求項７６又は請求項７７に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  79. 請求項７８に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、方法。
  80. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、請求項７８に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  81. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、請求項７８に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  82. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の前記発現レベルに対して正規化される、請求項７８～８１のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  83. 前記試料が、結腸組織生検由来又は直腸組織生検由来である、請求項７６～８３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  84. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである、請求項８３に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  85. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項８３又は請求項８４に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  86. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、請求項８３又は請求項８４に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  87. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ、又はブラジクマブである、請求項７６～８６のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎のための抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けるための候補患者として、抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を同定する方法。
  88. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で処置する方法であって、
    前記患者から試料を得て、ＯＳＭＲ、ＦＣＧＲ３、ＣＸＣＬ６、インターロイキン－１１、インターロイキン－２４、インターロイキン－１３ＲＡ２、ＦＡＰ、ＴＷＩＳＴ１、及びＷＮＴ２から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、前記試料を分析することによって、前記患者が抗ＴＮＦＲであるか否かを決定することと、
    前記患者が抗ＴＮＦＲである場合に、前記患者を抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体で治療することと、を含む、方法。
  89. 請求項８８に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、請求項８８に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  90. 請求項８８に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、請求項８８に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  91. 請求項８８に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、請求項８８に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  92. 請求項８８に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、請求項８８に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  93. 請求項８８～９３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の前及び抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体投与の後に得られた試料を分析することを更に含み、
    前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って得られた前記試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現レベルからの、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に得られた前記試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＴＮＦＲ患者における前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  94. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  95. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  96. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  97. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  98. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  99. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  100. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  101. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  102. 請求項９３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項９３に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  103. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与に先立って採取された前記試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現からの、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に採取された前記試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現の変化が、前記抗ＴＮＦＲ患者への前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与を継続すべきであることを示す、請求項９３～１０２のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  104. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が増加し、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６である、請求項１０３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  105. 請求項１０３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置後に減少し、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）が、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１及びＰＴＧＳ２である、方法。
  106. 請求項８８～１０５のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、方法。
  107. 請求項１０６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、方法。
  108. 請求項１０６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、方法。
  109. 請求項１０６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、方法。
  110. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の前記発現レベルに対して正規化される、請求項１０６～１０９のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  111. 前記試料が、結腸組織生検由来又は直腸組織生検由来である、請求項８８～１１０のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  112. 前記結腸組織生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織に由来する、請求項１１１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  113. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項１１１又は請求項１１２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  114. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、請求項１１１又は請求項１１２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  115. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与後に採取された前記試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の前記最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される、請求項９３～１１４のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  116. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ、又はブラジクマブである、請求項８８～１１５のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  117. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブである、請求項１１６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  118. 請求項１１７に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む、方法。
  119. 前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される、請求項１１８に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  120. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、４週間間隔で投与される、請求項１１８又は請求項１１９に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  121. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、１２週間間隔で投与される、請求項１１８又は請求項１１９に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  122. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、グセルクマブである、請求項１１６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  123. 請求項１２２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む、方法。
  124. 各誘導用量が、２００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項１２３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  125. 各誘導用量が、４００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項１２３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  126. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項１１６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  127. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、チルドラキズマブである、請求項１１６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  128. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ブラジクマブである、請求項１１６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いて、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われ、かつ抗腫瘍壊死因子（抗ＴＮＦ）療法耐性（抗ＴＮＦＲ）を有するか有することが疑われる患者を治療する方法。
  129. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、
    （ａ）前記患者から得られた試料において、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
    （ｂ）前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記決定された発現レベルを、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと比較することと、
    （ｃ）前記患者における前記バイオマーカ発現レベルが、前記参照発現レベルと比較して増加している場合、又は前記患者における前記バイオマーカ発現レベルが、前記参照発現レベルと比較して減少している場合に、潰瘍性大腸炎の診断を提供することと、を含む、方法。
  130. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  131. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  132. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  133. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  134. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  135. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  136. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  137. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  138. 請求項１２９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者において潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、請求項１２９に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  139. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、請求項１２９～１３８のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  140. 請求項１３９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、方法。
  141. 請求項１３９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、方法。
  142. 請求項１３９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、方法。
  143. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の発現レベルに対して正規化される、請求項１３９～１４２のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  144. 前記試料が、結腸組織生検又は直腸組織生検からのものである、請求項１２９～１４３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  145. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである、請求項１４４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  146. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項１４４又は請求項１４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  147. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、請求項１４４又は請求項１４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  148. 請求項１２９に記載の１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写産バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することが、分析装置ユニットを用いて実施され、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記決定された発現レベル（複数可）を、請求項１２９に記載の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと比較することが、コンピューティングデバイスを用いて実施される、請求項１２９～１４７のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  149. 前記コンピューティングデバイスが、前記参照バイオマーカとの前記比較の結果に基づいて、前記対象における潰瘍性大腸炎を診断するための支援を提供する、請求項１４８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  150. 前記分析装置ユニットを使用して、リガンドの測定された結合の計算された量に基づいて、ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される前記１つ以上の遺伝子の前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の量を決定することを更に含む、請求項１４８又は請求項１４９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における潰瘍性大腸炎を診断するための方法。
  151. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法であって、
    （ａ）（ｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、前記患者から得られた試料を分析することと、
    （ｂ）（ｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、前記患者から得られた試料を分析することと、
    （ｃ）（ｉ）前記患者が前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）における発現レベルの変化が検出される場合、潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある前記患者が前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む、
    又は
    （ａ）（ｉｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けていない潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者から得られた試料を分析することと、
    （ｂ）（ｉｉ）ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４、及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）に関して、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、患者から得られた試料を分析することと、
    （ｃ）（ｉｉ）患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）における発現レベルの変化が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けなかった患者における１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルと比較して検出される場合、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む、方法。
  152. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法であって、
    （ａ）（ｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受ける前に、前記患者から得られた試料を分析することと、
    （ｂ）（ｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、前記患者から得られた試料を分析することと、
    （ｃ）（ｉ）前記患者が前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）における前記発現レベルが増加する場合、潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある前記患者が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む、
    又は
    （ａ）（ｉｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けなかった潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者から得られた試料を分析することと、
    （ｂ）（ｉｉ）ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）について、患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置を受けた後に、前記患者から得られた試料を分析することと、
    （ｃ）（ｉｉ）抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体治療を受けなかった前記患者における前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルと比較して、前記患者が抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体治療を受けた後に、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが増加する場合、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる前記患者が前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体処置に応答して治癒していると決定することと、を含む、方法。
  153. 請求項１５１又は請求項１５２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１又は請求項１５２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  154. 請求項１５１又は請求項１５２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１又は請求項１５２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  155. 請求項１５１又は請求項１５２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１又は請求項１５２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  156. 請求項１５１又は請求項１５２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１又は請求項１５２に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  157. 請求項１５１に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  158. 請求項１５１に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  159. 請求項１５１に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  160. 請求項１５１に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  161. 請求項１５１に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  162. 請求項１５１に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）のうちの少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  163. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１～１６２のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  164. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１６３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  165. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１６３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  166. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１６３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  167. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の前記発現レベルに対して正規化される、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１６３～１６６のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  168. 前記試料が、結腸組織生検又は直腸組織生検に由来する、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１～１６７のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体での処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  169. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織に由来する、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１６８に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体での処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  170. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が、請求項１６８又は請求項１６９に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  171. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１６８又は請求項１６９に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による処置に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  172. 抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を投与された前記患者から採取された前記試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の前記最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が請求項１５１～１７１のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して治癒しているか否かを決定する方法。
  173. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ又はブラジクマブである、請求項１５１～１７２のいずれか一項に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  174. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブである、請求項１７３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  175. 請求項１７４に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して、潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が治癒しているか否かを決定する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む、方法。
  176. 前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される、請求項１７５に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  177. ミリキズマブのその後の維持用量（複数可）が、前記第１の維持用量の投与後に４週間間隔で投与される、請求項１７５又は請求項１７６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いた治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  178. ミリキズマブのその後の維持用量（複数可）が、前記第１の維持用量の投与後に１２週間間隔で投与される、請求項１７５又は請求項１７６に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を用いた治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  179. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、グセルクマブである、請求項１７３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  180. 請求項１７９に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者が治癒しているか否かを決定する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む、方法。
  181. 各誘導用量が、２００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項１８０に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  182. 各誘導用量が、４００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項１８０に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  183. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項１７３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  184. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、チルドラキズマブである、請求項１７３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  185. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ブラジクマブである、請求項１７３に記載の抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体による治療に応答して潰瘍性大腸炎を有するか有する疑いのある患者が治癒しているか否かを決定する方法。
  186. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、
    前記患者から第１の試料を得ることと、
    前記第１の試料を分析して、以下の表：
    Figure 2024521748000023
    Figure 2024521748000024
    Figure 2024521748000025
    Figure 2024521748000026
    Figure 2024521748000027
    から選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    前記患者から第２の試料を得ることと、
    前記第２の試料を分析して、上記から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  187. 請求項１８６に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、
    前記患者から第１の試料を得ることと、
    前記第１の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    前記患者から第２の試料を得ることと、
    前記第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  188. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  189. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１又は請求項２に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  190. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  191. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  192. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  193. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  194. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  195. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  196. 請求項１８６又は請求項１８７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項１８６又は請求項１８７に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  197. 前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現からの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現の変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与が継続されるべきであることを示す、請求項１８６～１９６のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  198. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、請求項１８６～１９７のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  199. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、請求項１９８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  200. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、請求項１９８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  201. 前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、請求項１９８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  202. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の発現レベルに対して正規化される、請求項１９８～２０１のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  203. 前記試料が、結腸組織生検又は直腸組織生検からのものである、請求項１８６～２０２のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  204. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである、請求項２０３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  205. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項２０３又は請求項２０４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  206. 前記結腸組織生検が、炎症性結腸領域由来である、請求項２０３又は請求項２０４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  207. 前記第１の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前に又はそれと同時に採取され、前記第２の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の前記最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される、請求項１～２３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  208. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ又はブラジクマブである、請求項１８６～２０７のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  209. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブである、請求項２０８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  210. 請求項２０９に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む、方法。
  211. 前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される、請求項２１０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  212. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、４週間間隔で投与される、請求項２１０又は請求項２１１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  213. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、１２週間間隔で投与される、請求項２１０又は請求項２１１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  214. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、グセルクマブである、請求項２０８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  215. 請求項２１４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む、方法。
  216. 各誘導用量が、２００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項２１５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  217. 各誘導用量が、４００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項２１５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  218. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項２０８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  219. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、チルドラキズマブである、請求項２０８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  220. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ブラジクマブである、請求項２０８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を治療する方法。
  221. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を診断するための方法であって、
    （ａ）以下の表：
    Figure 2024521748000028
    Figure 2024521748000029
    Figure 2024521748000030
    Figure 2024521748000031
    Figure 2024521748000032
     から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
    （ｂ）前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記決定された発現レベルを、上の表から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと比較することと、
    （ｃ）前記患者における前記バイオマーカ発現レベルが、前記参照発現レベルと比較して変化している場合、排便頻度の診断を提供することと、を含む、方法。
  222. 請求項２２１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における排便頻度を診断するための方法であって、
    （ａ）前記第２の試料を分析して、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
    （ｂ）Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記決定された発現レベルと、を比較することと、
    （ｃ）前記患者における前記バイオマーカ発現レベルが、前記参照発現レベルと比較して変化している場合、排便頻度の診断を提供することと、を含む、方法。
  223. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、
    （ａ）前記患者から第１の試料を得ることと、
    （ｂ）前記第１の試料を分析して、以下の表：
    Figure 2024521748000033
    Figure 2024521748000034
    Figure 2024521748000035
    Figure 2024521748000036
    Figure 2024521748000037
    Figure 2024521748000038
     から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカを検出することと、
    （ｃ）抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    （ｄ）前記患者から第２の試料を得ることと、
    （ｅ）前記第２の試料を分析して、上の表からの１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  224. 請求項２２３に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、
    （ａ）前記患者から第１の試料を得ることと、
    （ｂ）前記第１の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、
    （ｃ）抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体を、前記患者に投与することと、
    （ｄ）前記患者から第２の試料を得ることと、
    （ｅ）前記第２の試料を分析して、多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）から、１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を検出することと、を含み、
    前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルからの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルの変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体に対する応答を示す、方法。
  225. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも２つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  226. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも３つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  227. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも４つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  228. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも５つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  229. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも６つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  230. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも７つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  231. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも８つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  232. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも９つの前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  233. 請求項２２３又は請求項２２４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前及び後に、請求項２２３又は請求項２２４に記載の前記遺伝子の前記遺伝子転写物バイオマーカのうちの少なくとも１０の前記発現レベルを検出することを含む、方法。
  234. 前記第１の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現からの、前記第２の試料において検出された前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの前記発現の変化が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与が継続されるべきであることを示す、請求項２２３～２３３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  235. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、遺伝子発現プロファイリングの方法によって決定される、請求項２２３～２３４のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  236. 請求項２３５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、ＰＣＲベースの方法である、方法。
  237. 請求項２３５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、免疫組織化学である、方法。
  238. 請求項２３５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、前記遺伝子発現プロファイリングの方法が、プロテオミクス技術である、方法。
  239. 前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記発現レベルが、１つ以上の参照遺伝子又はそれらの発現産物の発現レベルに対して正規化される、請求項２３５～２３８のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  240. 前記試料が、結腸組織生検又は直腸組織生検からのものである、請求項２２３～２３９のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  241. 前記結腸組織の生検が、回腸終末部、上行結腸、下行結腸、及びＳ状結腸からなる群から選択される組織からのものである、請求項２４０に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  242. 前記結腸組織生検が、非炎症結腸領域由来である、請求項２４０又は請求項２４１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  243. 前記結腸組織生検が、炎症結腸領域由来である、請求項２４０又は請求項２４１に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  244. 前記第１の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の投与の前に又はそれと同時に採取され、前記第２の試料が、前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体の前記最初の投与の少なくとも２週間後、少なくとも４週間後、少なくとも８週間後、少なくとも１２週間後、少なくとも１６週間後、少なくとも２０週間後、少なくとも２４週間後、少なくとも２８週間後、少なくとも３０週間後、少なくとも３２週間後、少なくとも３６週間後、少なくとも４０週間後、少なくとも４４週間後、少なくとも４８週間後、又は少なくとも５２週間後に採取される、請求項２２３～２４３のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  245. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブ、グセルクマブ、リサンキズマブ、チルドラキズマブ又はブラジクマブである、請求項２２３～２４４のいずれか一項に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  246. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ミリキズマブである、請求項２４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  247. 請求項２４６に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のミリキズマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、３００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のミリキズマブを４週間又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与され、各維持用量が、２００ｍｇのミリキズマブを含む、投与することと、を含む、方法。
  248. 前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された４～６週間後に投与される、請求項２４７に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  249. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、４週間間隔で投与される、請求項２４７又は請求項２４８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  250. その後の維持用量（複数可）のミリキズマブが、前記最初の維持用量の投与後、１２週間間隔で投与される、請求項２４７又は請求項２４８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  251. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、グセルクマブである、請求項２４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  252. 請求項２１４に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法であって、
    ａ）３回の誘導用量のグセルクマブを４週間間隔で静脈内注入によって前記患者に投与することであって、各誘導用量が、１００～５００ｍｇのグセルクマブを含む、投与することと、
    ｂ）維持用量のグセルクマブを２週間間隔、４週間間隔、６週間間隔、８週間間隔又は１２週間間隔で皮下注射によって前記患者に投与することであって、前記最初の維持用量が、前記最後の誘導用量が投与された２～８週間後に投与される、投与することと、を含む、方法。
  253. 各誘導用量が、２００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項２５２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  254. 各誘導用量が、４００ｍｇのグセルクマブを含む、請求項２５２に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  255. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、リサンキズマブである、請求項２４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  256. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、チルドラキズマブである、請求項２４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  257. 前記抗ＩＬ－２３ｐ１９抗体が、ブラジクマブである、請求項２４５に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を治療する方法。
  258. 潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を診断する方法であって、
    （ａ）以下の表：
    Figure 2024521748000039
    Figure 2024521748000040
    Figure 2024521748000041
    Figure 2024521748000042
    Figure 2024521748000043
    Figure 2024521748000044
     から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカの発現レベルを決定することと、
    （ｂ）前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記決定された発現レベルを、上の表から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと比較することと、
    （ｃ）前記患者における前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）発現レベル（複数可）が、前記参照発現レベルと比較して変化している場合、腸切迫感の診断を提供することと、を含む、方法。
  259. 請求項２５８に記載の潰瘍性大腸炎を有するか有することが疑われる患者における腸切迫感を診断する方法であって、
    （ａ）多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の発現レベルを決定することと、
    （ｂ）多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の参照発現レベルと、前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）の前記決定された発現レベルと、を比較することと、
    （ｃ）前記患者における前記１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）発現レベル（複数可）が、前記参照発現レベルと比較して変化している場合、腸切迫感の診断を提供することと、を含む、方法。
  260. ＣＸＣＬ８、ＡＱＰ９、ＩＬ１Ｂ、Ｓ１００Ａ９、ＴＲＥＭ１、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１、ＭＭＰ７、ＴＣＮ１、ＤＵＯＸ２、ＤＵＯＸＡ２、ＳＬＣ６Ａ１４、ＶＮＮ１、ＡＢＣＡ１２、ＲＥＧ１Ｂ、Ｃ４ＢＰＡ、ＧＵＣＡ２Ｂ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、ＡＤＨ１Ｃ、ＭＭＰ３、ＲＥＧ３Ａ、ＤＭＢＴ１、ＲＥＧ１Ｐ、Ｓ１００Ａ８、ＩＧＫＶ２Ｄ－４０、ＰＩ３、ＴＮＩＰ３、ＲＥＧ１Ａ、ＩＤＯ１、ＮＯＳ２、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ１、ＰＴＧＳ２、ＡＢＣＧ２、ＨＭＧＣＳ２、ＴＭＩＧＤ１、ＧＵＣＡ２Ａ、ＬＯＣ１０１９２８４０５、ＭＳ４Ａ１２、ＵＧＴ２Ａ３、ＴＲＰＭ６、ＮＸＰＥ４、ＳＬＣ１６Ａ９、ＡＤＨ１Ｃ、ＰＣＫ１、ＣＤＫＮ２Ｂ－ＡＳ１、ＴＭＥＭ２３６、ＣＤ１７７Ｐ１、ＳＬＣ１７Ａ４及びＺＧ１６から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカを含む、遺伝子転写物バイオマーカパネル。
  261. ＧＵＣＡ２Ａ、ＯＴＯＰ２、ＡＱＰ８、ＳＬＣ２６Ａ２、及びＡＤＨ１Ｃから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカを含む、請求項２６０に記載の遺伝子転写物バイオマーカパネル。
  262. 以下の表：
    Figure 2024521748000045
    Figure 2024521748000046
    Figure 2024521748000047
    Figure 2024521748000048
    Figure 2024521748000049
     から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む、遺伝子転写物バイオマーカパネル。
  263. Ｓ１００カルシウム結合タンパク質８、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ１２、カドヘリン関連ファミリーメンバー１、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質Ａ９、Ｔｒｉｐｌｅｓ偽キナーゼ２、血小板活性化因子、アポトーシス誘導因子ミトコンドリア関連３、ＩｇＧ受容体ＩＩｂのＦｃ断片、コロニー刺激因子３受容体、ＬＹＮ癌原遺伝子、Ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ、インターフェロン誘導膜貫通タンパク質２、カルパイン１３、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、プロキネフィシン２、アクアポリン９、インターロイキン１アルファ、ＩｇＧ受容体ＩＩａのＦｃ断片、ＴＩＭＰメタロペプチダーゼ阻害物質１、トランスコバラミン１、及びクレアチンキナーゼＢから選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む、遺伝子転写物バイオマーカパネル。
  264. 以下の表：
    Figure 2024521748000050
    Figure 2024521748000051
    Figure 2024521748000052
    Figure 2024521748000053
    Figure 2024521748000054
    Figure 2024521748000055
     から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカを含む、遺伝子転写物バイオマーカパネル。
  265. 多重コイル領域含有１７５、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーメンバー１７、補体因子Ｂ、Ｆ－ボックス及びＷＤ－反復領域含有７、リパーゼＡ、リソソーム酸型、中心体タンパク質１２８、バキュロウイルスＩＡＰ反復含有３、インターフェロンアルファ及びインターフェロンベータの受容体サブユニット２、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼ１、ソルチンネキシン２５、熱ショックタンパク質ファミリーＡ（Ｈｓｐ７０）メンバー１３、クローディン２、リンパ球抗原９６、ＳＥＣ１１相同体Ｃ、シグナルペプチダーゼ複合体サブユニット、ＤＮＡ損傷調節自己貪食修飾因子１、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質４、ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ１、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ２の延長因子、カテプシンＨ、及びカルパイン１３から選択される１つ以上の遺伝子の１つ以上の遺伝子転写物バイオマーカ（複数可）を含む、遺伝子転写物バイオマーカパネル。
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